View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12721_low_4 (Length: 527)

Name: NF12721_low_4
Description: NF12721
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12721_low_4
NF12721_low_4
[»] chr4 (158 HSPs)
chr4 (1-511)||(11434784-11435308)
chr4 (1-511)||(7941148-7941677)
chr4 (1-511)||(51015055-51015599)
chr4 (7-503)||(22800847-22801356)
chr4 (1-422)||(37089351-37089789)
chr4 (1-422)||(22044370-22044804)
chr4 (1-422)||(22046665-22047099)
chr4 (1-422)||(38409117-38409558)
chr4 (3-422)||(5198338-5198772)
chr4 (1-420)||(47274647-47275079)
chr4 (1-422)||(31849578-31850014)
chr4 (7-422)||(22802719-22803148)
chr4 (3-494)||(9148086-9148604)
chr4 (9-422)||(24888714-24889142)
chr4 (9-411)||(48486248-48486665)
chr4 (7-420)||(24880371-24880800)
chr4 (92-511)||(5637549-5637991)
chr4 (7-420)||(24878909-24879338)
chr4 (7-422)||(36919569-36920002)
chr4 (3-511)||(11006218-11006766)
chr4 (7-412)||(40091400-40091820)
chr4 (4-370)||(18847123-18847503)
chr4 (1-343)||(8631398-8631759)
chr4 (7-511)||(36921478-36922018)
chr4 (1-422)||(9174125-9174561)
chr4 (92-511)||(3824654-3825097)
chr4 (1-343)||(6764836-6765198)
chr4 (3-343)||(24348211-24348570)
chr4 (1-343)||(2484852-2485209)
chr4 (7-343)||(40637071-40637422)
chr4 (1-370)||(11008547-11008933)
chr4 (7-420)||(619433-619860)
chr4 (1-370)||(16934122-16934506)
chr4 (1-343)||(14633317-14633672)
chr4 (4-343)||(44599820-44600174)
chr4 (1-370)||(16931768-16932152)
chr4 (1-343)||(47868398-47868755)
chr4 (1-370)||(9176453-9176837)
chr4 (7-343)||(17662230-17662574)
chr4 (1-343)||(22132370-22132735)
chr4 (1-302)||(22134597-22134909)
chr4 (7-342)||(38928162-38928513)
chr4 (7-341)||(33415473-33415821)
chr4 (92-420)||(52942543-52942860)
chr4 (4-302)||(18709146-18709458)
chr4 (7-342)||(12395830-12396180)
chr4 (7-388)||(36378244-36378641)
chr4 (4-302)||(22780355-22780668)
chr4 (4-302)||(22782720-22783033)
chr4 (7-342)||(12400792-12401142)
chr4 (1-343)||(14787410-14787769)
chr4 (25-343)||(47210755-47211082)
chr4 (7-342)||(19095880-19096231)
chr4 (1-267)||(26085956-26086236)
chr4 (7-343)||(16453306-16453658)
chr4 (92-420)||(8756336-8756663)
chr4 (92-341)||(37313150-37313400)
chr4 (1-343)||(53405124-53405487)
chr4 (26-341)||(56030443-56030770)
chr4 (92-341)||(13543953-13544208)
chr4 (30-338)||(41997494-41997817)
chr4 (92-336)||(19322701-19322942)
chr4 (113-342)||(3937314-3937543)
chr4 (92-342)||(18409431-18409681)
chr4 (92-342)||(18537559-18537806)
chr4 (123-342)||(6132871-6133090)
chr4 (7-264)||(36380425-36380698)
chr4 (92-342)||(18534917-18535164)
chr4 (184-342)||(38270162-38270321)
chr4 (1-147)||(11437557-11437716)
chr4 (204-343)||(5100994-5101133)
chr4 (1-146)||(5635455-5635614)
chr4 (184-342)||(24446760-24446914)
chr4 (223-342)||(2891314-2891434)
chr4 (92-227)||(16455354-16455490)
chr4 (92-393)||(15032633-15032923)
chr4 (92-260)||(38890310-38890476)
chr4 (7-164)||(4215483-4215654)
chr4 (7-257)||(27499128-27499390)
chr4 (7-193)||(13547302-13547502)
chr4 (408-511)||(16932243-16932345)
chr4 (408-511)||(22780835-22780937)
chr4 (408-511)||(22783200-22783302)
chr4 (92-196)||(2891436-2891540)
chr4 (408-511)||(9176918-9177020)
chr4 (408-511)||(16934597-16934699)
chr4 (7-92)||(5101191-5101276)
chr4 (108-341)||(28453686-28453915)
chr4 (415-495)||(22803162-22803241)
chr4 (270-393)||(25357583-25357713)
chr4 (129-398)||(40999072-40999338)
chr4 (414-511)||(36920015-36920110)
chr4 (130-336)||(9863712-9863917)
chr4 (7-92)||(47563023-47563109)
chr4 (414-511)||(24888605-24888701)
chr4 (414-511)||(37089802-37089899)
chr4 (420-511)||(9174580-9174669)
chr4 (347-422)||(11008932-11009007)
chr4 (1-86)||(14789409-14789495)
chr4 (270-343)||(16186099-16186173)
chr4 (360-422)||(18847049-18847111)
chr4 (92-252)||(30136640-30136798)
chr4 (92-204)||(47150978-47151092)
chr4 (92-342)||(12102088-12102336)
chr4 (414-511)||(38409008-38409104)
chr4 (7-86)||(6133105-6133185)
chr4 (414-475)||(22044817-22044879)
chr4 (416-502)||(18846949-18847034)
chr4 (129-190)||(7050379-7050439)
chr4 (347-412)||(9176836-9176901)
chr4 (129-190)||(11853549-11853609)
chr4 (129-190)||(16185957-16186018)
chr4 (7-60)||(52942473-52942526)
chr4 (271-343)||(16455284-16455356)
chr4 (46-86)||(31300540-31300580)
chr4 (420-484)||(31850033-31850096)
chr4 (16-86)||(16455510-16455581)
chr4 (26-85)||(31985663-31985722)
chr4 (26-73)||(54867192-54867239)
chr4 (129-187)||(4556181-4556238)
chr4 (129-187)||(4558314-4558371)
chr4 (129-187)||(8529270-8529327)
chr4 (129-286)||(9022362-9022515)
chr4 (129-187)||(15316961-15317018)
chr4 (129-187)||(16689062-16689119)
chr4 (129-187)||(18586969-18587026)
chr4 (129-187)||(31300427-31300484)
chr4 (314-368)||(52043737-52043791)
chr4 (129-190)||(5336904-5336964)
chr4 (408-469)||(11009014-11009075)
chr4 (313-370)||(22780687-22780744)
chr4 (313-370)||(22783052-22783109)
chr4 (129-190)||(55822265-55822325)
chr4 (314-394)||(4569899-4569978)
chr4 (26-85)||(10047387-10047447)
chr4 (7-86)||(37313050-37313130)
chr4 (26-85)||(39246002-39246062)
chr4 (46-86)||(55822380-55822420)
chr4 (7-69)||(2891577-2891640)
chr4 (426-493)||(48486146-48486212)
chr4 (15-66)||(49088860-49088911)
chr4 (7-57)||(3937259-3937309)
chr4 (129-187)||(15831144-15831201)
chr4 (313-343)||(22134936-22134966)
chr4 (129-187)||(25699752-25699809)
chr4 (99-140)||(5101130-5101171)
chr4 (46-86)||(11853664-11853705)
chr4 (46-87)||(16489464-16489505)
chr4 (46-86)||(18587082-18587123)
chr4 (7-86)||(19322962-19323043)
chr4 (129-205)||(31983650-31983727)
chr4 (211-286)||(54906631-54906702)
chr4 (26-85)||(5269220-5269280)
chr4 (26-85)||(5396700-5396760)
chr4 (26-85)||(6743444-6743504)
chr4 (46-86)||(15317074-15317114)
chr4 (26-85)||(36315258-36315318)
chr4 (26-85)||(36329467-36329527)
[»] chr5 (139 HSPs)
chr5 (1-511)||(25921452-25921977)
chr5 (3-511)||(2174695-2175216)
chr5 (3-494)||(38881877-38882403)
chr5 (1-511)||(4236385-4236928)
chr5 (7-422)||(16776021-16776451)
chr5 (7-402)||(21947911-21948320)
chr5 (7-501)||(2818320-2818822)
chr5 (1-422)||(21684431-21684876)
chr5 (4-370)||(31544996-31545377)
chr5 (6-370)||(31542651-31543029)
chr5 (7-511)||(36402313-36402830)
chr5 (7-343)||(39854427-39854777)
chr5 (1-343)||(10529077-10529435)
chr5 (1-370)||(31179352-31179734)
chr5 (107-444)||(6756336-6756674)
chr5 (1-341)||(18466625-18466984)
chr5 (99-511)||(31466070-31466481)
chr5 (100-481)||(12556016-12556396)
chr5 (1-343)||(18468950-18469309)
chr5 (1-302)||(25804009-25804324)
chr5 (1-343)||(27912473-27912836)
chr5 (3-343)||(27910388-27910748)
chr5 (7-343)||(6747247-6747598)
chr5 (1-302)||(34477032-34477349)
chr5 (1-302)||(34479397-34479714)
chr5 (7-340)||(18511197-18511547)
chr5 (7-302)||(6745053-6745362)
chr5 (7-343)||(26097676-26098025)
chr5 (11-343)||(40221465-40221813)
chr5 (7-342)||(1189592-1189949)
chr5 (7-339)||(10474308-10474655)
chr5 (7-342)||(25904047-25904397)
chr5 (13-342)||(17072827-17073172)
chr5 (7-340)||(18509303-18509652)
chr5 (4-302)||(15552229-15552542)
chr5 (8-343)||(18596590-18596939)
chr5 (7-342)||(24126800-24127150)
chr5 (7-342)||(31472597-31472948)
chr5 (316-511)||(39797864-39798058)
chr5 (7-334)||(2954368-2954710)
chr5 (7-264)||(658341-658610)
chr5 (7-342)||(695833-696172)
chr5 (100-302)||(16092292-16092495)
chr5 (92-342)||(34530750-34531001)
chr5 (7-342)||(39397978-39398327)
chr5 (7-335)||(17818477-17818817)
chr5 (129-342)||(20042994-20043208)
chr5 (210-418)||(20507665-20507873)
chr5 (92-343)||(37705864-37706116)
chr5 (129-342)||(20044954-20045168)
chr5 (3-343)||(10586782-10587130)
chr5 (2-219)||(4410090-4410321)
chr5 (7-335)||(21288715-21289055)
chr5 (160-343)||(26098403-26098587)
chr5 (3-210)||(39798123-39798345)
chr5 (92-337)||(6661270-6661512)
chr5 (7-207)||(20505828-20506041)
chr5 (351-511)||(34479799-34479957)
chr5 (4-191)||(10749796-10749996)
chr5 (7-219)||(41585729-41585956)
chr5 (4-191)||(3373119-3373320)
chr5 (4-191)||(23665140-23665340)
chr5 (4-191)||(23793247-23793447)
chr5 (246-343)||(4410000-4410101)
chr5 (4-191)||(10757273-10757472)
chr5 (4-191)||(15354557-15354757)
chr5 (4-191)||(38960114-38960314)
chr5 (7-224)||(2723964-2724187)
chr5 (4-191)||(15356833-15357033)
chr5 (408-511)||(34477515-34477617)
chr5 (4-171)||(23741841-23742020)
chr5 (408-511)||(31542457-31542559)
chr5 (408-511)||(31544813-31544915)
chr5 (92-341)||(9020167-9020413)
chr5 (12-342)||(36208524-36208865)
chr5 (389-511)||(659728-659848)
chr5 (360-511)||(38960440-38960589)
chr5 (105-299)||(20053834-20054020)
chr5 (119-369)||(42770690-42770934)
chr5 (427-511)||(18186489-18186572)
chr5 (247-343)||(41585946-41586042)
chr5 (408-511)||(10749520-10749622)
chr5 (408-511)||(10756975-10757077)
chr5 (408-511)||(15354948-15355050)
chr5 (408-511)||(15357224-15357326)
chr5 (299-370)||(23665054-23665125)
chr5 (299-370)||(23793462-23793533)
chr5 (298-343)||(3373332-3373377)
chr5 (302-370)||(15354777-15354845)
chr5 (302-370)||(15357053-15357121)
chr5 (299-370)||(23667329-23667400)
chr5 (299-370)||(38960334-38960405)
chr5 (92-286)||(17413251-17413441)
chr5 (305-370)||(10757180-10757245)
chr5 (462-511)||(21684905-21684954)
chr5 (299-343)||(23742057-23742101)
chr5 (7-92)||(26098273-26098360)
chr5 (314-370)||(34477379-34477435)
chr5 (92-204)||(15143547-15143661)
chr5 (7-68)||(20043222-20043284)
chr5 (92-146)||(42770951-42771005)
chr5 (129-190)||(1170811-1170871)
chr5 (314-367)||(29748260-29748313)
chr5 (129-190)||(35385574-35385634)
chr5 (7-74)||(6756718-6756786)
chr5 (360-412)||(31542576-31542628)
chr5 (314-370)||(34479740-34479796)
chr5 (306-369)||(10749704-10749767)
chr5 (408-511)||(23664849-23664951)
chr5 (408-511)||(23667124-23667226)
chr5 (408-511)||(23793636-23793738)
chr5 (7-76)||(12555908-12555978)
chr5 (129-187)||(25452498-25452555)
chr5 (129-190)||(2298123-2298183)
chr5 (129-182)||(25445504-25445556)
chr5 (408-469)||(31179837-31179897)
chr5 (7-86)||(16092184-16092264)
chr5 (29-92)||(23667526-23667590)
chr5 (409-471)||(659869-659929)
chr5 (314-368)||(2144899-2144954)
chr5 (93-187)||(4897828-4897923)
chr5 (133-286)||(29748352-29748502)
chr5 (7-73)||(31465974-31466041)
chr5 (292-342)||(2723911-2723961)
chr5 (238-272)||(13295755-13295789)
chr5 (129-187)||(28786407-28786464)
chr5 (360-422)||(31179769-31179830)
chr5 (46-86)||(1170926-1170967)
chr5 (129-190)||(1240428-1240488)
chr5 (314-343)||(15552178-15552207)
chr5 (46-86)||(22672950-22672991)
chr5 (46-86)||(25445612-25445653)
chr5 (314-343)||(25803959-25803988)
chr5 (129-190)||(31782579-31782639)
chr5 (46-86)||(35385477-35385518)
chr5 (16-92)||(37705774-37705851)
chr5 (26-85)||(9353361-9353421)
chr5 (46-86)||(15445291-15445331)
chr5 (26-85)||(36932379-36932439)
[»] chr1 (135 HSPs)
chr1 (9-511)||(6822790-6823306)
chr1 (1-511)||(51749793-51750339)
chr1 (1-511)||(13761592-13762136)
chr1 (1-511)||(51752119-51752663)
chr1 (1-422)||(28840542-28840979)
chr1 (1-422)||(10399809-10400245)
chr1 (3-422)||(20302323-20302756)
chr1 (7-422)||(15823410-15823840)
chr1 (1-422)||(28842357-28842794)
chr1 (7-493)||(38925468-38925965)
chr1 (12-420)||(13214947-13215375)
chr1 (92-506)||(6823643-6824087)
chr1 (7-420)||(41646786-41647214)
chr1 (7-484)||(14097956-14098447)
chr1 (7-419)||(39462385-39462813)
chr1 (1-342)||(2617460-2617816)
chr1 (7-420)||(28207055-28207481)
chr1 (4-368)||(16226085-16226464)
chr1 (1-343)||(31735502-31735863)
chr1 (1-353)||(20291390-20291756)
chr1 (4-368)||(47179627-47180009)
chr1 (7-343)||(27336927-27337280)
chr1 (1-294)||(46431687-46431996)
chr1 (1-340)||(39932017-39932374)
chr1 (1-343)||(24325599-24325963)
chr1 (4-368)||(47177276-47177658)
chr1 (9-420)||(3579606-3580033)
chr1 (1-340)||(15294815-15295183)
chr1 (56-340)||(21948225-21948526)
chr1 (7-343)||(27339118-27339472)
chr1 (7-343)||(47906207-47906564)
chr1 (26-422)||(47451512-47451917)
chr1 (7-343)||(17324623-17324974)
chr1 (3-343)||(9463227-9463588)
chr1 (3-343)||(2510308-2510666)
chr1 (3-343)||(9459400-9459761)
chr1 (7-341)||(18307054-18307403)
chr1 (14-342)||(50307540-50307884)
chr1 (7-343)||(6995687-6996038)
chr1 (7-343)||(12302492-12302848)
chr1 (7-342)||(50076659-50077009)
chr1 (7-342)||(17186114-17186465)
chr1 (92-343)||(48665114-48665373)
chr1 (7-369)||(16428569-16428948)
chr1 (7-389)||(9241072-9241470)
chr1 (7-342)||(18839531-18839882)
chr1 (7-343)||(28998240-28998591)
chr1 (7-343)||(29003956-29004307)
chr1 (7-342)||(31489859-31490206)
chr1 (7-342)||(50078807-50079158)
chr1 (7-342)||(11457462-11457812)
chr1 (7-321)||(31425002-31425335)
chr1 (7-343)||(2949219-2949569)
chr1 (7-302)||(4131362-4131676)
chr1 (7-341)||(25251261-25251611)
chr1 (7-341)||(17318838-17319181)
chr1 (100-342)||(50248666-50248909)
chr1 (100-379)||(31422967-31423248)
chr1 (92-343)||(6756470-6756721)
chr1 (7-302)||(25127856-25128167)
chr1 (92-342)||(17324009-17324258)
chr1 (92-381)||(42922138-42922425)
chr1 (7-293)||(40133937-40134239)
chr1 (1-195)||(51757623-51757830)
chr1 (92-343)||(8347359-8347607)
chr1 (92-342)||(14183678-14183923)
chr1 (246-370)||(16231517-16231641)
chr1 (93-343)||(15669481-15669729)
chr1 (92-343)||(18800659-18800907)
chr1 (30-219)||(16231630-16231834)
chr1 (7-295)||(16432396-16432690)
chr1 (330-482)||(49687345-49687496)
chr1 (270-419)||(30790658-30790808)
chr1 (92-369)||(8349138-8349414)
chr1 (4-191)||(23785935-23786136)
chr1 (7-197)||(16429047-16429252)
chr1 (92-343)||(49495297-49495537)
chr1 (347-499)||(16231368-16231518)
chr1 (9-219)||(25248540-25248766)
chr1 (7-146)||(23816027-23816180)
chr1 (247-341)||(25248756-25248850)
chr1 (1-89)||(13358784-13358873)
chr1 (92-336)||(13125544-13125787)
chr1 (408-511)||(16225902-16226004)
chr1 (408-511)||(47179443-47179545)
chr1 (99-336)||(26520206-26520449)
chr1 (408-511)||(47177093-47177194)
chr1 (7-206)||(6115089-6115304)
chr1 (420-511)||(20291295-20291386)
chr1 (421-511)||(20302213-20302303)
chr1 (408-511)||(23783253-23783355)
chr1 (304-370)||(23783467-23783533)
chr1 (129-368)||(27916415-27916652)
chr1 (271-368)||(26613503-26613603)
chr1 (129-204)||(155788-155864)
chr1 (424-511)||(10400268-10400354)
chr1 (408-494)||(28842265-28842350)
chr1 (92-204)||(30738716-30738830)
chr1 (129-190)||(2232597-2232657)
chr1 (92-196)||(30790487-30790591)
chr1 (28-86)||(15916605-15916665)
chr1 (11-74)||(31422851-31422915)
chr1 (270-309)||(6115344-6115383)
chr1 (1-48)||(13447254-13447301)
chr1 (291-369)||(16431017-16431096)
chr1 (129-187)||(2401343-2401400)
chr1 (129-187)||(9526469-9526526)
chr1 (129-187)||(21353468-21353525)
chr1 (129-187)||(25134074-25134131)
chr1 (92-204)||(26613326-26613440)
chr1 (314-391)||(43104053-43104131)
chr1 (211-336)||(13127837-13127959)
chr1 (129-190)||(14997040-14997100)
chr1 (421-494)||(28840450-28840522)
chr1 (46-86)||(2393308-2393348)
chr1 (7-66)||(50248557-50248617)
chr1 (426-493)||(13214854-13214920)
chr1 (16-86)||(17324278-17324349)
chr1 (328-419)||(46782919-46783010)
chr1 (44-86)||(155921-155963)
chr1 (314-387)||(2401494-2401568)
chr1 (7-86)||(6756741-6756822)
chr1 (129-187)||(9521718-9521775)
chr1 (11-86)||(14183581-14183658)
chr1 (46-86)||(21353373-21353414)
chr1 (46-86)||(27916711-27916752)
chr1 (270-342)||(30738890-30738963)
chr1 (314-343)||(46432037-46432066)
chr1 (314-367)||(49958963-49959016)
chr1 (26-85)||(9476269-9476329)
chr1 (26-85)||(13598406-13598466)
chr1 (26-85)||(16124545-16124605)
chr1 (26-85)||(29651819-29651879)
chr1 (26-85)||(37069778-37069838)
chr1 (26-85)||(47703965-47704025)
[»] chr7 (141 HSPs)
chr7 (9-494)||(1049283-1049781)
chr7 (1-511)||(40836722-40837246)
chr7 (1-422)||(35503-35939)
chr7 (104-511)||(26804360-26804765)
chr7 (16-421)||(27306224-27306643)
chr7 (1-422)||(3878446-3878887)
chr7 (1-422)||(44438-44874)
chr7 (1-422)||(25542404-25542838)
chr7 (7-418)||(31435031-31435458)
chr7 (1-343)||(38393935-38394296)
chr7 (1-340)||(7470001-7470359)
chr7 (1-340)||(7471959-7472317)
chr7 (1-343)||(48457602-48457963)
chr7 (7-342)||(44724533-44724883)
chr7 (3-366)||(31155892-31156271)
chr7 (1-343)||(3035670-3036034)
chr7 (7-340)||(20625990-20626342)
chr7 (7-340)||(20629881-20630233)
chr7 (7-340)||(20642300-20642652)
chr7 (2-343)||(20299407-20299769)
chr7 (4-343)||(40946277-40946635)
chr7 (9-302)||(1046912-1047219)
chr7 (1-302)||(1849975-1850291)
chr7 (1-343)||(18345490-18345851)
chr7 (7-343)||(13099459-13099812)
chr7 (7-342)||(20137094-20137444)
chr7 (3-343)||(20297311-20297670)
chr7 (7-341)||(37412110-37412462)
chr7 (4-343)||(7351634-7351994)
chr7 (92-342)||(21679981-21680232)
chr7 (7-342)||(11355212-11355562)
chr7 (7-343)||(42330982-42331335)
chr7 (7-343)||(443548-443900)
chr7 (4-343)||(28487502-28487860)
chr7 (36-343)||(7349287-7349615)
chr7 (1-343)||(43253496-43253860)
chr7 (7-342)||(24748548-24748899)
chr7 (1-343)||(28485515-28485875)
chr7 (92-343)||(11757177-11757435)
chr7 (7-342)||(4295919-4296271)
chr7 (179-418)||(18567491-18567731)
chr7 (7-341)||(21990106-21990454)
chr7 (92-342)||(25276095-25276346)
chr7 (99-342)||(21678020-21678264)
chr7 (7-309)||(21592128-21592445)
chr7 (9-341)||(9679009-9679361)
chr7 (7-342)||(9680768-9681124)
chr7 (99-358)||(22251641-22251893)
chr7 (92-342)||(39146071-39146322)
chr7 (92-391)||(22828717-22829018)
chr7 (91-342)||(27832716-27832969)
chr7 (1-226)||(7092192-7092431)
chr7 (1-218)||(38396713-38396944)
chr7 (92-336)||(24258423-24258668)
chr7 (7-342)||(42223110-42223462)
chr7 (152-412)||(22392357-22392606)
chr7 (99-393)||(7188445-7188737)
chr7 (1-226)||(7094439-7094678)
chr7 (92-391)||(20091629-20091926)
chr7 (92-340)||(24817438-24817682)
chr7 (4-191)||(2935374-2935575)
chr7 (4-191)||(22137184-22137384)
chr7 (102-267)||(24813593-24813755)
chr7 (4-191)||(40552211-40552411)
chr7 (4-191)||(22108173-22108373)
chr7 (4-191)||(40549933-40550133)
chr7 (99-341)||(24465503-24465735)
chr7 (4-191)||(1606486-1606686)
chr7 (4-191)||(9027176-9027376)
chr7 (408-511)||(1047386-1047488)
chr7 (247-340)||(7094662-7094759)
chr7 (247-340)||(7092414-7092512)
chr7 (242-296)||(38396316-38396370)
chr7 (414-511)||(3878337-3878433)
chr7 (316-396)||(45366446-45366526)
chr7 (408-511)||(2935085-2935187)
chr7 (408-511)||(9027570-9027672)
chr7 (294-343)||(1606423-1606472)
chr7 (2-73)||(11759364-11759436)
chr7 (299-370)||(22108087-22108158)
chr7 (408-511)||(22136893-22136995)
chr7 (299-370)||(22137098-22137169)
chr7 (7-143)||(22393876-22394027)
chr7 (299-370)||(40549847-40549918)
chr7 (408-511)||(40551920-40552022)
chr7 (299-370)||(40552125-40552196)
chr7 (152-286)||(11081522-11081651)
chr7 (299-370)||(9027396-9027467)
chr7 (408-511)||(22107882-22107984)
chr7 (408-511)||(40549642-40549744)
chr7 (300-370)||(2935279-2935349)
chr7 (92-146)||(6348933-6348987)
chr7 (92-146)||(26295598-26295652)
chr7 (414-511)||(27306657-27306752)
chr7 (26-85)||(55956-56015)
chr7 (274-341)||(3677235-3677301)
chr7 (129-286)||(6048885-6049038)
chr7 (414-484)||(25542322-25542391)
chr7 (129-190)||(2120899-2120959)
chr7 (129-190)||(3320172-3320232)
chr7 (129-190)||(3324920-3324980)
chr7 (129-190)||(7069780-7069840)
chr7 (129-190)||(7074787-7074847)
chr7 (128-204)||(16297145-16297222)
chr7 (129-190)||(25351353-25351413)
chr7 (129-190)||(25357047-25357107)
chr7 (129-190)||(25405393-25405453)
chr7 (129-190)||(25410130-25410190)
chr7 (129-190)||(42006663-42006723)
chr7 (299-343)||(1849918-1849962)
chr7 (7-59)||(26804762-26804814)
chr7 (211-336)||(6348778-6348903)
chr7 (284-343)||(30906327-30906386)
chr7 (408-494)||(35411-35496)
chr7 (129-187)||(30246973-30247030)
chr7 (129-187)||(44512647-44512704)
chr7 (313-370)||(1047238-1047295)
chr7 (129-190)||(8378626-8378686)
chr7 (129-190)||(15541117-15541177)
chr7 (139-187)||(44143997-44144045)
chr7 (26-85)||(46516339-46516399)
chr7 (26-84)||(9190038-9190097)
chr7 (26-84)||(20284097-20284156)
chr7 (16-90)||(21678286-21678361)
chr7 (36-86)||(24258691-24258742)
chr7 (129-342)||(26210500-26210709)
chr7 (7-54)||(39145971-39146018)
chr7 (92-343)||(6332179-6332425)
chr7 (31-92)||(21680245-21680307)
chr7 (129-187)||(34546985-34547042)
chr7 (316-394)||(42006468-42006545)
chr7 (46-86)||(2121015-2121056)
chr7 (46-86)||(3320076-3320117)
chr7 (46-86)||(3324824-3324865)
chr7 (31-84)||(5817300-5817353)
chr7 (46-86)||(25405508-25405549)
chr7 (314-343)||(38396239-38396268)
chr7 (4-86)||(6067180-6067264)
chr7 (26-85)||(21983292-21983352)
chr7 (26-85)||(29159811-29159871)
chr7 (46-86)||(44143892-44143932)
[»] chr3 (184 HSPs)
chr3 (7-478)||(11170193-11170678)
chr3 (1-422)||(5191497-5191931)
chr3 (3-422)||(3859372-3859805)
chr3 (7-511)||(18096883-18097407)
chr3 (1-511)||(22114282-22114827)
chr3 (1-502)||(38889782-38890320)
chr3 (7-511)||(18099153-18099692)
chr3 (1-422)||(10084366-10084806)
chr3 (1-422)||(5522604-5523028)
chr3 (102-511)||(35777178-35777587)
chr3 (7-420)||(45882785-45883214)
chr3 (3-468)||(6065775-6066254)
chr3 (1-422)||(10956004-10956440)
chr3 (198-494)||(11162923-11163218)
chr3 (1-422)||(10958300-10958736)
chr3 (1-422)||(26720392-26720827)
chr3 (7-343)||(4308264-4308615)
chr3 (7-438)||(18162492-18162937)
chr3 (1-422)||(10191289-10191726)
chr3 (7-420)||(32264021-32264454)
chr3 (7-343)||(43228214-43228565)
chr3 (1-343)||(4103873-4104233)
chr3 (7-493)||(48361654-48362153)
chr3 (16-343)||(43226009-43226350)
chr3 (1-343)||(51726984-51727340)
chr3 (3-370)||(6063425-6063809)
chr3 (7-421)||(24979552-24979982)
chr3 (3-343)||(25533357-25533720)
chr3 (4-370)||(50493895-50494276)
chr3 (7-391)||(12267958-12268348)
chr3 (7-302)||(30005805-30006115)
chr3 (7-302)||(42990268-42990578)
chr3 (7-343)||(1313333-1313683)
chr3 (7-342)||(1626666-1627016)
chr3 (99-379)||(15780747-15781039)
chr3 (7-343)||(27101164-27101519)
chr3 (4-343)||(458203-458561)
chr3 (4-343)||(746674-747034)
chr3 (7-342)||(3314608-3314959)
chr3 (7-343)||(53917647-53917998)
chr3 (7-342)||(43423446-43423796)
chr3 (92-336)||(6561740-6561985)
chr3 (4-343)||(455826-456184)
chr3 (7-511)||(32218851-32219359)
chr3 (1-370)||(25388794-25389185)
chr3 (1-262)||(1321483-1321759)
chr3 (7-343)||(9604590-9604946)
chr3 (7-342)||(28101985-28102335)
chr3 (7-341)||(43421398-43421747)
chr3 (7-343)||(53915479-53915830)
chr3 (4-302)||(10621510-10621823)
chr3 (7-342)||(880434-880785)
chr3 (5-369)||(38210265-38210646)
chr3 (7-343)||(51943294-51943644)
chr3 (92-343)||(35918025-35918283)
chr3 (15-342)||(5926755-5927097)
chr3 (7-342)||(36011751-36012101)
chr3 (92-302)||(29956650-29956861)
chr3 (7-342)||(53468436-53468788)
chr3 (92-343)||(39715393-39715644)
chr3 (4-276)||(28413011-28413299)
chr3 (3-244)||(7606567-7606822)
chr3 (112-342)||(28100143-28100374)
chr3 (92-342)||(47148977-47149233)
chr3 (7-302)||(47148878-47149188)
chr3 (92-393)||(28761511-28761813)
chr3 (7-341)||(51674749-51675087)
chr3 (107-342)||(28180948-28181182)
chr3 (7-393)||(23633332-23633727)
chr3 (7-343)||(42992205-42992544)
chr3 (30-342)||(889779-890104)
chr3 (266-422)||(1321285-1321441)
chr3 (92-342)||(54691656-54691906)
chr3 (7-215)||(25688143-25688367)
chr3 (163-419)||(24177126-24177380)
chr3 (7-205)||(5886261-5886472)
chr3 (7-205)||(5899734-5899945)
chr3 (105-342)||(31151271-31151507)
chr3 (92-393)||(23636899-23637198)
chr3 (26-342)||(53591119-53591438)
chr3 (7-253)||(6484372-6484634)
chr3 (119-342)||(28137415-28137628)
chr3 (1-196)||(11168172-11168381)
chr3 (92-343)||(13420268-13420506)
chr3 (212-342)||(47701798-47701928)
chr3 (92-342)||(54884081-54884329)
chr3 (175-301)||(41849117-41849244)
chr3 (347-511)||(6719471-6719636)
chr3 (7-303)||(4666488-4666788)
chr3 (212-341)||(27635830-27635959)
chr3 (213-341)||(6231374-6231502)
chr3 (99-387)||(53597119-53597404)
chr3 (99-343)||(1673898-1674140)
chr3 (7-218)||(6231849-6232074)
chr3 (223-341)||(3306724-3306842)
chr3 (408-511)||(38210082-38210184)
chr3 (408-511)||(50493691-50493793)
chr3 (99-295)||(561866-562058)
chr3 (99-259)||(25635391-25635549)
chr3 (408-511)||(53896637-53896739)
chr3 (92-259)||(17795269-17795433)
chr3 (92-259)||(19103709-19103873)
chr3 (3-87)||(35919094-35919179)
chr3 (129-336)||(36871421-36871624)
chr3 (7-92)||(27635641-27635727)
chr3 (288-370)||(53896475-53896557)
chr3 (442-511)||(7606880-7606948)
chr3 (129-343)||(4560403-4560599)
chr3 (7-92)||(41849247-41849333)
chr3 (414-511)||(5191388-5191484)
chr3 (4-87)||(53894037-53894121)
chr3 (408-511)||(6063889-6063991)
chr3 (408-511)||(10192413-10192514)
chr3 (7-140)||(47701654-47701801)
chr3 (99-149)||(24181498-24181548)
chr3 (408-511)||(10085493-10085594)
chr3 (312-391)||(13893269-13893347)
chr3 (92-189)||(3306839-3306936)
chr3 (309-370)||(5886181-5886242)
chr3 (408-509)||(5899476-5899576)
chr3 (294-355)||(6719396-6719457)
chr3 (314-398)||(46966940-46967024)
chr3 (309-370)||(5899656-5899717)
chr3 (7-62)||(42992605-42992660)
chr3 (426-511)||(32264481-32264565)
chr3 (278-343)||(6484308-6484373)
chr3 (129-190)||(10094196-10094256)
chr3 (129-190)||(10201076-10201136)
chr3 (129-190)||(16462203-16462263)
chr3 (129-190)||(22626106-22626166)
chr3 (408-469)||(25388654-25388714)
chr3 (129-190)||(47883004-47883064)
chr3 (414-478)||(5523041-5523104)
chr3 (46-86)||(54188625-54188665)
chr3 (270-368)||(1618916-1619018)
chr3 (408-471)||(5886039-5886101)
chr3 (7-69)||(15781090-15781153)
chr3 (129-187)||(10897008-10897065)
chr3 (129-187)||(29914075-29914132)
chr3 (129-187)||(47878293-47878350)
chr3 (129-187)||(54193229-54193286)
chr3 (129-190)||(4535614-4535674)
chr3 (129-190)||(10100213-10100273)
chr3 (129-190)||(10208122-10208182)
chr3 (26-85)||(1736324-1736384)
chr3 (142-190)||(6303310-6303358)
chr3 (26-85)||(18552902-18552962)
chr3 (26-85)||(30709809-30709869)
chr3 (28-86)||(36871304-36871364)
chr3 (414-481)||(10956453-10956519)
chr3 (163-287)||(13419864-13419983)
chr3 (304-343)||(25690651-25690690)
chr3 (129-187)||(20031440-20031497)
chr3 (163-259)||(25633930-25634024)
chr3 (314-368)||(26762863-26762917)
chr3 (38-76)||(28181192-28181230)
chr3 (31-85)||(40844665-40844719)
chr3 (129-187)||(54188512-54188569)
chr3 (46-86)||(1620483-1620524)
chr3 (7-68)||(3306974-3307034)
chr3 (46-86)||(6303425-6303466)
chr3 (46-86)||(10094100-10094141)
chr3 (46-86)||(10100117-10100158)
chr3 (46-86)||(10200980-10201021)
chr3 (46-86)||(10208026-10208067)
chr3 (314-343)||(10621847-10621876)
chr3 (46-86)||(10897121-10897162)
chr3 (314-391)||(16996681-16996758)
chr3 (46-86)||(27544388-27544429)
chr3 (7-86)||(28761410-28761491)
chr3 (59-92)||(29956874-29956907)
chr3 (312-341)||(31021450-31021479)
chr3 (46-86)||(31151538-31151579)
chr3 (314-343)||(42990205-42990234)
chr3 (46-86)||(54193342-54193383)
chr3 (316-391)||(562069-562144)
chr3 (129-204)||(1620581-1620657)
chr3 (26-85)||(8370505-8370565)
chr3 (28-84)||(25929463-25929519)
chr3 (307-343)||(27101558-27101594)
chr3 (26-85)||(27974971-27975031)
chr3 (26-85)||(27986465-27986525)
chr3 (130-182)||(38002877-38002928)
chr3 (26-85)||(48438222-48438282)
[»] chr8 (104 HSPs)
chr8 (1-422)||(27829217-27829652)
chr8 (1-422)||(27826906-27827341)
chr8 (1-478)||(4423883-4424374)
chr8 (7-422)||(14807672-14808111)
chr8 (7-422)||(28251552-28251981)
chr8 (7-420)||(15072632-15073061)
chr8 (8-420)||(15067903-15068330)
chr8 (1-370)||(18810680-18811063)
chr8 (1-370)||(44720815-44721199)
chr8 (1-343)||(32339304-32339665)
chr8 (3-343)||(3874005-3874364)
chr8 (1-343)||(28283200-28283561)
chr8 (1-343)||(15809214-15809574)
chr8 (1-370)||(18812865-18813237)
chr8 (1-333)||(608735-609091)
chr8 (1-343)||(22684632-22685002)
chr8 (11-343)||(27911014-27911359)
chr8 (11-343)||(27957433-27957778)
chr8 (242-505)||(3886153-3886419)
chr8 (9-342)||(27106884-27107232)
chr8 (7-393)||(14419175-14419578)
chr8 (7-342)||(30480488-30480838)
chr8 (7-343)||(1225165-1225517)
chr8 (1-343)||(43530123-43530471)
chr8 (6-294)||(43079650-43079953)
chr8 (4-302)||(43082013-43082326)
chr8 (99-342)||(14477276-14477520)
chr8 (36-343)||(24873195-24873523)
chr8 (102-365)||(13858578-13858842)
chr8 (129-342)||(33541509-33541723)
chr8 (7-341)||(36865538-36865887)
chr8 (7-343)||(41384744-41385094)
chr8 (7-343)||(41382672-41383012)
chr8 (7-342)||(25952521-25952871)
chr8 (231-422)||(12517248-12517441)
chr8 (99-342)||(5372269-5372512)
chr8 (166-343)||(26775200-26775378)
chr8 (7-391)||(15185699-15186095)
chr8 (152-342)||(5622882-5623073)
chr8 (270-420)||(2468361-2468511)
chr8 (92-389)||(31162165-31162460)
chr8 (92-342)||(21482322-21482561)
chr8 (184-342)||(35872559-35872713)
chr8 (7-252)||(15956051-15956308)
chr8 (92-309)||(3005716-3005929)
chr8 (92-309)||(21480547-21480753)
chr8 (247-343)||(181536-181632)
chr8 (408-511)||(18812683-18812785)
chr8 (129-309)||(37214321-37214512)
chr8 (408-511)||(18810498-18810600)
chr8 (173-389)||(31035021-31035236)
chr8 (92-219)||(181622-181753)
chr8 (416-511)||(43079362-43079456)
chr8 (408-511)||(43081737-43081839)
chr8 (7-92)||(33541395-33541481)
chr8 (414-494)||(27826814-27826893)
chr8 (414-494)||(27829125-27829204)
chr8 (414-511)||(14807563-14807659)
chr8 (129-286)||(31573848-31574000)
chr8 (9-76)||(37214251-37214319)
chr8 (314-369)||(17847501-17847556)
chr8 (347-422)||(44720742-44720816)
chr8 (92-207)||(31035252-31035369)
chr8 (129-204)||(31578400-31578476)
chr8 (408-511)||(44720632-44720735)
chr8 (92-137)||(2468214-2468259)
chr8 (129-190)||(9021229-9021289)
chr8 (417-494)||(15072538-15072614)
chr8 (129-190)||(16752644-16752704)
chr8 (129-190)||(16757389-16757449)
chr8 (129-190)||(28327908-28327968)
chr8 (129-190)||(28895502-28895562)
chr8 (414-494)||(12517454-12517533)
chr8 (129-187)||(590797-590854)
chr8 (408-494)||(28252009-28252094)
chr8 (129-187)||(33032657-33032714)
chr8 (129-190)||(4812609-4812669)
chr8 (28-76)||(21482591-21482640)
chr8 (129-190)||(28332631-28332691)
chr8 (130-187)||(29554908-29554964)
chr8 (299-343)||(6375988-6376032)
chr8 (15-74)||(13858477-13858537)
chr8 (46-86)||(16752549-16752589)
chr8 (139-187)||(23179692-23179740)
chr8 (314-370)||(43079558-43079614)
chr8 (314-370)||(43081930-43081986)
chr8 (6-86)||(5372160-5372242)
chr8 (6-60)||(14477547-14477602)
chr8 (28-74)||(21480785-21480832)
chr8 (129-187)||(3276347-3276404)
chr8 (129-190)||(13985200-13985262)
chr8 (420-482)||(15067821-15067882)
chr8 (129-191)||(17847677-17847739)
chr8 (46-86)||(4812513-4812554)
chr8 (46-86)||(16757293-16757334)
chr8 (46-86)||(25684758-25684799)
chr8 (46-86)||(28890881-28890922)
chr8 (46-86)||(29554810-29554851)
chr8 (317-365)||(31574054-31574100)
chr8 (26-85)||(4696625-4696685)
chr8 (26-85)||(9765848-9765908)
chr8 (142-190)||(17799558-17799606)
chr8 (26-85)||(23799606-23799666)
chr8 (26-85)||(26403259-26403319)
[»] chr2 (112 HSPs)
chr2 (1-511)||(27104530-27105073)
chr2 (1-511)||(19501990-19502535)
chr2 (1-422)||(19504325-19504760)
chr2 (4-422)||(42064355-42064788)
chr2 (1-419)||(13910024-13910456)
chr2 (1-511)||(24162202-24162737)
chr2 (7-511)||(40032038-40032571)
chr2 (7-511)||(43623565-43624070)
chr2 (7-484)||(6264133-6264621)
chr2 (7-420)||(21520678-21521108)
chr2 (7-412)||(6258802-6259220)
chr2 (7-420)||(22287321-22287749)
chr2 (3-343)||(42452702-42453054)
chr2 (3-343)||(45279965-45280321)
chr2 (1-343)||(23452216-23452577)
chr2 (7-342)||(19007560-19007910)
chr2 (196-420)||(22407598-22407822)
chr2 (7-343)||(42923494-42923847)
chr2 (4-343)||(35215568-35215932)
chr2 (7-342)||(11739544-11739895)
chr2 (4-302)||(35217945-35218258)
chr2 (99-341)||(15539566-15539809)
chr2 (7-342)||(28196557-28196905)
chr2 (92-476)||(18800398-18800769)
chr2 (7-342)||(17849037-17849387)
chr2 (92-342)||(31732861-31733100)
chr2 (7-334)||(34979562-34979906)
chr2 (92-339)||(3022086-3022334)
chr2 (7-342)||(17848365-17848710)
chr2 (7-342)||(14837193-14837538)
chr2 (92-342)||(44289152-44289403)
chr2 (92-342)||(11578193-11578439)
chr2 (45-302)||(45239000-45239271)
chr2 (178-342)||(22163117-22163282)
chr2 (7-212)||(5375331-5375550)
chr2 (163-302)||(38020162-38020302)
chr2 (209-343)||(5377631-5377769)
chr2 (3-191)||(36558845-36559047)
chr2 (4-191)||(36561123-36561324)
chr2 (106-410)||(35107152-35107452)
chr2 (92-389)||(22874015-22874301)
chr2 (92-341)||(20146693-20146941)
chr2 (4-191)||(45332163-45332364)
chr2 (92-252)||(28459274-28459435)
chr2 (99-343)||(17897337-17897578)
chr2 (7-149)||(22407439-22407595)
chr2 (97-343)||(37963028-37963263)
chr2 (248-341)||(38020064-38020157)
chr2 (414-511)||(19504773-19504869)
chr2 (271-394)||(12342673-12342797)
chr2 (21-137)||(7462946-7463077)
chr2 (408-511)||(36559241-36559343)
chr2 (7-92)||(22163007-22163093)
chr2 (92-190)||(20589763-20589862)
chr2 (408-511)||(36561560-36561662)
chr2 (416-511)||(45332566-45332660)
chr2 (7-71)||(3022377-3022442)
chr2 (92-226)||(27136209-27136343)
chr2 (299-370)||(36559067-36559138)
chr2 (299-370)||(36561344-36561415)
chr2 (299-354)||(45332384-45332439)
chr2 (314-372)||(28462593-28462651)
chr2 (129-206)||(40699429-40699507)
chr2 (417-494)||(21521126-21521202)
chr2 (7-128)||(22707736-22707873)
chr2 (121-219)||(38414194-38414291)
chr2 (312-391)||(45156922-45157001)
chr2 (129-190)||(2736205-2736265)
chr2 (129-190)||(17462436-17462496)
chr2 (129-190)||(20054887-20054947)
chr2 (129-190)||(22712638-22712698)
chr2 (129-190)||(22717347-22717407)
chr2 (129-190)||(39686983-39687043)
chr2 (129-190)||(45567409-45567469)
chr2 (247-342)||(38414281-38414365)
chr2 (294-393)||(40699178-40699278)
chr2 (129-191)||(17921769-17921832)
chr2 (7-54)||(44289052-44289099)
chr2 (414-511)||(6259243-6259339)
chr2 (129-187)||(12781343-12781400)
chr2 (129-187)||(17932637-17932694)
chr2 (129-187)||(17943540-17943597)
chr2 (299-341)||(20147040-20147082)
chr2 (129-187)||(27517761-27517818)
chr2 (314-368)||(35028473-35028527)
chr2 (26-85)||(14699036-14699096)
chr2 (46-86)||(17921887-17921927)
chr2 (7-86)||(18800298-18800378)
chr2 (46-86)||(37170778-37170818)
chr2 (129-286)||(43139356-43139508)
chr2 (26-85)||(21629952-21630011)
chr2 (7-86)||(28459175-28459254)
chr2 (7-92)||(23871000-23871086)
chr2 (129-187)||(37170874-37170931)
chr2 (106-144)||(38020311-38020349)
chr2 (214-286)||(39287188-39287256)
chr2 (360-422)||(45332490-45332551)
chr2 (46-86)||(2736320-2736361)
chr2 (46-86)||(2741056-2741097)
chr2 (46-86)||(17462551-17462592)
chr2 (129-190)||(28458950-28459011)
chr2 (36-76)||(31732790-31732831)
chr2 (46-86)||(33670992-33671033)
chr2 (245-286)||(41304627-41304667)
chr2 (46-86)||(45679838-45679879)
chr2 (26-85)||(8390179-8390239)
chr2 (26-85)||(13569336-13569396)
chr2 (26-85)||(20522228-20522288)
chr2 (314-342)||(20589581-20589609)
chr2 (7-74)||(22874333-22874401)
chr2 (316-368)||(33603818-33603870)
chr2 (142-190)||(38190997-38191045)
[»] chr6 (115 HSPs)
chr6 (1-511)||(14507155-14507701)
chr6 (7-422)||(11983014-11983444)
chr6 (1-343)||(28241300-28241657)
chr6 (7-422)||(9019826-9020255)
chr6 (1-343)||(1230228-1230585)
chr6 (7-490)||(32279829-32280326)
chr6 (114-422)||(19227514-19227824)
chr6 (9-420)||(30728811-30729241)
chr6 (1-335)||(14458746-14459093)
chr6 (7-420)||(15541125-15541553)
chr6 (1-370)||(4816210-4816608)
chr6 (4-343)||(12195497-12195851)
chr6 (1-343)||(30967176-30967536)
chr6 (92-422)||(15530207-15530537)
chr6 (14-411)||(15532674-15533085)
chr6 (1-337)||(19704546-19704905)
chr6 (1-370)||(20915336-20915721)
chr6 (1-343)||(2628865-2629226)
chr6 (9-343)||(30034590-30034943)
chr6 (7-302)||(26065005-26065310)
chr6 (7-302)||(26084974-26085279)
chr6 (7-342)||(13057173-13057524)
chr6 (7-342)||(3629850-3630199)
chr6 (197-511)||(1072067-1072380)
chr6 (11-343)||(3390357-3390705)
chr6 (9-340)||(3631926-3632271)
chr6 (92-342)||(25477253-25477504)
chr6 (7-342)||(13039733-13040084)
chr6 (4-343)||(26932543-26932906)
chr6 (222-422)||(8995379-8995578)
chr6 (100-342)||(3233822-3234065)
chr6 (92-342)||(22490618-22490870)
chr6 (92-342)||(24338531-24338783)
chr6 (92-342)||(12161641-12161889)
chr6 (26-222)||(5273220-5273431)
chr6 (92-343)||(3027938-3028186)
chr6 (196-342)||(32447504-32447651)
chr6 (213-343)||(17852520-17852650)
chr6 (92-383)||(16455510-16455800)
chr6 (4-191)||(26066106-26066307)
chr6 (92-309)||(15719666-15719872)
chr6 (4-191)||(26068377-26068578)
chr6 (196-335)||(13870611-13870749)
chr6 (4-191)||(29754691-29754892)
chr6 (4-191)||(33308988-33309188)
chr6 (4-191)||(33311257-33311457)
chr6 (92-342)||(14466312-14466553)
chr6 (92-196)||(1069803-1069907)
chr6 (92-336)||(17012029-17012270)
chr6 (177-391)||(15346320-15346524)
chr6 (28-226)||(15367129-15367340)
chr6 (408-511)||(33308700-33308802)
chr6 (408-511)||(33310969-33311071)
chr6 (408-511)||(26068765-26068867)
chr6 (414-494)||(8995287-8995366)
chr6 (414-494)||(9019734-9019813)
chr6 (414-494)||(19227837-19227916)
chr6 (298-370)||(26068590-26068662)
chr6 (92-368)||(19696394-19696670)
chr6 (408-511)||(26066494-26066596)
chr6 (408-511)||(29755162-29755264)
chr6 (298-368)||(26066319-26066389)
chr6 (414-511)||(11983457-11983551)
chr6 (7-368)||(12186056-12186431)
chr6 (230-342)||(10584105-10584212)
chr6 (347-419)||(24192635-24192707)
chr6 (7-86)||(10584245-10584325)
chr6 (347-419)||(24191538-24191610)
chr6 (294-370)||(29754983-29755059)
chr6 (92-196)||(26945269-26945374)
chr6 (28-93)||(15346589-15346655)
chr6 (129-190)||(13878727-13878787)
chr6 (129-190)||(13883475-13883535)
chr6 (129-190)||(16785919-16785979)
chr6 (129-190)||(26887346-26887406)
chr6 (129-190)||(31248836-31248896)
chr6 (309-370)||(33308905-33308966)
chr6 (309-370)||(33311174-33311235)
chr6 (129-190)||(35201448-35201508)
chr6 (7-74)||(25477543-25477611)
chr6 (47-86)||(12937219-12937258)
chr6 (7-76)||(1069703-1069773)
chr6 (129-190)||(3577637-3577696)
chr6 (270-391)||(12911710-12911835)
chr6 (129-187)||(17036058-17036115)
chr6 (129-187)||(17694973-17695030)
chr6 (408-469)||(4816689-4816749)
chr6 (129-182)||(12166268-12166320)
chr6 (46-86)||(3577515-3577555)
chr6 (46-86)||(13467492-13467532)
chr6 (299-343)||(18318004-18318048)
chr6 (270-368)||(12937457-12937559)
chr6 (7-54)||(14466606-14466653)
chr6 (26-85)||(22963708-22963767)
chr6 (26-85)||(23824626-23824685)
chr6 (93-147)||(15346522-15346576)
chr6 (129-187)||(22351974-22352031)
chr6 (36-86)||(24338462-24338511)
chr6 (129-182)||(25941652-25941703)
chr6 (360-422)||(26068697-26068758)
chr6 (7-86)||(3233710-3233795)
chr6 (46-86)||(13878842-13878883)
chr6 (46-86)||(13883590-13883631)
chr6 (278-393)||(15366963-15367086)
chr6 (46-86)||(16786034-16786075)
chr6 (130-187)||(19701985-19702041)
chr6 (28-84)||(24436001-24436058)
chr6 (46-86)||(35201352-35201393)
chr6 (26-85)||(5572270-5572330)
chr6 (26-85)||(5757507-5757567)
chr6 (26-85)||(10077194-10077254)
chr6 (47-86)||(12911471-12911511)
chr6 (211-281)||(17904566-17904632)
chr6 (26-85)||(21356044-21356104)
chr6 (46-86)||(26887252-26887291)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (1-422)||(2753-3188)
scaffold0250 (414-494)||(2661-2740)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-420)||(3872-4304)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (1-422)||(69271-69709)
scaffold0025 (196-511)||(73212-73529)
scaffold0025 (418-511)||(69726-69818)
scaffold0025 (184-230)||(73163-73210)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-343)||(41462-41819)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-422)||(29034-29479)
scaffold0068 (462-511)||(28956-29005)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (92-412)||(14902-15223)
scaffold0131 (16-330)||(14376-14707)
scaffold0131 (31-92)||(15236-15298)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (4-370)||(6124-6505)
scaffold0472 (408-511)||(5942-6044)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (1-343)||(183620-183975)
scaffold0005 (1-343)||(51961-52320)
scaffold0005 (1-86)||(50235-50321)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (7-340)||(79140-79488)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (7-343)||(11458-11809)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (3-302)||(34-348)
[»] scaffold0511 (2 HSPs)
scaffold0511 (92-343)||(1988-2245)
scaffold0511 (56-92)||(2258-2294)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (1-228)||(1432-1673)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (116-342)||(35593-35819)
scaffold0011 (7-86)||(35817-35897)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (11-342)||(79812-80158)
scaffold0004 (129-190)||(188364-188424)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (92-342)||(85184-85434)
scaffold0045 (7-86)||(85454-85534)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (92-381)||(15906-16193)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (92-341)||(16735-16981)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (229-343)||(1053-1167)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (92-333)||(1727-1958)
[»] scaffold0140 (7 HSPs)
scaffold0140 (4-191)||(22221-22421)
scaffold0140 (4-191)||(24496-24696)
scaffold0140 (408-511)||(21930-22032)
scaffold0140 (408-511)||(24205-24307)
scaffold0140 (299-370)||(22135-22206)
scaffold0140 (299-370)||(24410-24481)
scaffold0140 (26-85)||(8448-8508)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (408-511)||(12937-13039)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (92-336)||(4773-5014)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (4-75)||(4661-4733)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (129-190)||(224819-224879)
scaffold0006 (26-85)||(5691-5751)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (1-56)||(1430-1485)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (129-187)||(16328-16385)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (46-86)||(3095-3136)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (46-86)||(17011-17052)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 158)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11435308 - 11434784
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  11435308 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 11435209  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11435208 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtg 11435109  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435108 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 11435009  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11435008 cagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgttt 11434909  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctca-aaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgta 485  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434908 ctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcctcaaaaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgcccagccatcgta 11434810  T
Q  486 tcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  11434809 ccacgattctgcagaaacctgatttt 11434784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 7941677 - 7941148
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  7941677 aagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgt 7941578  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  7941577 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagt 7941478  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtg--tttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941477 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 7941378  T
Q  284 tttcagccccctctatctcaaa--gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 381  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941377 tttcagccccctctatctctcccggtttgctctgatacaacgtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 7941278  T
Q  382 cgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctca-aaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagcca 480  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7941277 cgtttctgttattcgtcaccagcgcaccatcgtgccaccatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgcccagcca 7941179  T
Q  481 tcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7941178 tcgtgccacgattctgcagaaacctgatttt 7941148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 51015599 - 51015055
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||           
T  51015599 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactatatgatgagtattgt 51015500  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  51015499 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 51015400  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015399 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 51015300  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  51015299 cagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactgaaaaatatgttt 51015200  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg---------------------atttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgc 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||                     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51015199 ctgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacaatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaa-cctccatcgtgc 51015101  T
Q  466 cacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  51015100 cacgttgccttgccatcatgccacgattctgcagaaatctgatttt 51015055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 7 - 503
Target Start/End: Original strand, 22800847 - 22801356
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||                 
T  22800847 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 22800946  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  22800947 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttc 22801046  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22801047 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcc 22801146  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22801147 ccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgaaacaaatctgcactc-aaaatacgtttctgtt 22801245  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacga 491  Q
    ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||||| |||||||  |||||    
T  22801246 atttgctgccggcgcaccatcgtgccacgatttttccagttccttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgtcacgttgcccaaccatcgtgccacga 22801344  T
Q  492 ttctgcagaaac 503  Q
    ||||| ||||||    
T  22801345 ttctgtagaaac 22801356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 37089351 - 37089789
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  37089351 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgt 37089450  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  37089451 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtg 37089550  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37089551 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 37089650  T
Q  287 cagccccctctatctc---aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacg 383  Q
    ||||||||||||||||    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37089651 cagccccctctatctctctcaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatacg 37089750  T
Q  384 tttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37089751 tttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgat 37089789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 22044370 - 22044804
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22044370 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 22044469  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22044470 tacaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 22044569  T
Q  188 tttcccaagtg-aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044570 tttcccaaggggaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 22044669  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  22044670 cagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgca-ctaaaaatatgttt 22044768  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  22044769 ctgtttttccctgccagcacaccatcgtgccacgat 22044804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 22046665 - 22047099
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22046665 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 22046764  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22046765 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 22046864  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046865 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 22046964  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  22046965 cagccccctctatctccaagtttgctccgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgca-ctaaaaatatgttt 22047063  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  22047064 ctgtttttccctgccagcacaccatcgtgccacgat 22047099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 38409558 - 38409117
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38409558 aagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 38409459  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38409458 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 38409359  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38409358 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccattgttt 38409259  T
Q  287 cagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaat 380  Q
    ||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38409258 cagccccctctatctccctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaat 38409159  T
Q  381 acgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38409158 atgtttctgtttttcgccgccaacgcaccatcgtgccacgat 38409117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 3 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5198772 - 5198338
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  5198772 gagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgtta 5198673  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  5198672 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 5198573  T
Q  189 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198572 ttcccaaagtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 5198473  T
Q  288 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5198472 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttc 5198373  T
Q  388 tgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5198372 tgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 5198338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 47275079 - 47274647
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||            
T  47275079 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacttt 47274980  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  47274979 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 47274880  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274879 tttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 47274781  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47274780 cagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 47274681  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
     |||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  47274680 atgttattcgctgccatcgcaccatcgtgccacg 47274647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 31849578 - 31850014
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  31849578 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 31849677  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  31849678 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtg 31849777  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccct-agtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849778 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 31849877  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31849878 tcagccccctctatctcctagtttgctctgatacaagacctatatttctagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtt 31849977  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31849978 tctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 31850014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 422
Target Start/End: Original strand, 22802719 - 22803148
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||                 
T  22802719 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactatatgatgagtaacattacaaa 22802818  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22802819 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 22802918  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22802919 caaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 22803018  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22803019 ccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtttttgtt 22803117  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22803118 attcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 22803148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 9148604 - 9148086
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  9148604 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgtta 9148505  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9148504 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 9148405  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9148404 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttca 9148305  T
Q  289 gccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9148304 gccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgttt 9148206  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcg-------------caccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgc 473  Q
    |||||||| || |||| ||             | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||  | |||| ||||||||||    
T  9148205 ctgttatttgctgccatcgtgccacgatgcaaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcctc-aaacttgaaacctccaatcgcgccacgttgc 9148107  T
Q  474 ccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  9148106 ccagcaatcgtaccacgattc 9148086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24889142 - 24888714
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 94  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |             ||    
T  24889142 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaag 24889043  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24889042 agatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 24888943  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888942 aggtgaatcaaccctcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 24888843  T
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttat 393  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  24888842 ctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttt 24888743  T
Q  394 tcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  24888742 tcgctgccagcacaccatcgtgccacgat 24888714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 48486665 - 48486248
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 94  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||             ||    
T  48486665 aacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaag 48486566  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48486565 agatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 48486466  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48486465 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccc 48486366  T
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttat 393  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486365 ctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttat 48486266  T
Q  394 tcgccgccagcgcaccat 411  Q
    |||| |||||||||||||    
T  48486265 tcgctgccagcgcaccat 48486248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24880800 - 24880371
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------- 91  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||                  
T  24880800 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaa 24880701  T
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24880700 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 24880601  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  24880600 ccaaggtgaaccaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagtttacgc 24880501  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24880500 cccctctatctccaagtttactccgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatacgtttctgt 24880401  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24880400 tattcgctgccagcgcaccatcgtgccacg 24880371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 92 - 511
Target Start/End: Original strand, 5637549 - 5637991
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5637549 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 5637648  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5637649 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagc 5637748  T
Q  291 cccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    ||||||||    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5637749 cccctctatctctctcaaagtttgctcttatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgttt 5637847  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccac---------------------gatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgc 465  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5637848 ctgtttttcgctgccagctcaccatcatgccacgatgcgatcccatcgtgacatgatttttccagtgccttgcctc-aaaactgaaa-cctccatcgtgc 5637945  T
Q  466 cacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  5637946 cacgttgcccagcaatcgtgccacgattccgcagaaacctgatttt 5637991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24879338 - 24878909
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------- 91  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||                  
T  24879338 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaa 24879239  T
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24879238 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 24879139  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24879138 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagtttcagc 24879039  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24879038 cccctctatctccaagtttactcggatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcacccaaaaatacgtttctgt 24878939  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    ||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  24878938 tattcgatgccagcgtaccatcgtgccacg 24878909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 422
Target Start/End: Original strand, 36919569 - 36920002
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa------------ 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||                
T  36919569 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactatatgatgaataacgttacaaa 36919668  T
Q  94 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36919669 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 36919768  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919769 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 36919868  T
Q  291 cccctctatct--caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    ||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919869 cccctatatctatcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 36919968  T
Q  389 gttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
      ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36919969 actattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 36920002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 511
Target Start/End: Original strand, 11006218 - 11006766
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  11006218 gagaagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccatta 11006317  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 188  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  11006318 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 11006417  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006418 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 11006517  T
Q  288 agccccctctatctc-----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatac 382  Q
    |||||||||||||||      ||  | | | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  11006518 agccccctctatctctctctcaaaatag-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatat 11006616  T
Q  383 gtttctgttattcgccgccagcgca---------------------ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatc 461  Q
    ||||||||| || || |||||||||                     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11006617 gtttctgttttttgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaattgaaa-cctccatc 11006715  T
Q  462 gtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgca-gaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11006716 gtgccacgttgcccagcgatcgtgccacgattctgcataaaacctgatttt 11006766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 412
Target Start/End: Original strand, 40091400 - 40091820
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||                 
T  40091400 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacattacaaa 40091499  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  40091500 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 40091599  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40091600 caaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcc 40091699  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||    
T  40091700 ccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcactgaaaaatacgtttacgtt 40091799  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatc 412  Q
    |||||| | ||| ||||||||    
T  40091800 attcgctgtcagtgcaccatc 40091820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18847503 - 18847123
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga----------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||               
T  18847503 agaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttaca 18847404  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgttt 190  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||    
T  18847403 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgttt 18847304  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18847303 cccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaa 18847204  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  18847203 ccccctctatctcaaagtttgttttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 18847123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 8631398 - 8631759
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8631398 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 8631497  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  8631498 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 8631597  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631598 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 8631697  T
Q  286 tcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8631698 tcagccccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaagtctatatttatagtgaaagt 8631759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 511
Target Start/End: Original strand, 36921478 - 36922018
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||                 
T  36921478 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 36921577  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36921578 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 36921677  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36921678 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttca-c 36921776  T
Q  291 cccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36921777 cccctctatctctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttattgtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatacgtttct 36921876  T
Q  389 gttattcgccgccagcgca---------------------ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgcca 467  Q
    ||||||||| ||||  |||                     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||    
T  36921877 gttattcgctgccaatgcaccatcgtgccacaatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgacttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgcca 36921975  T
Q  468 cgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  36921976 tgttgcccagccatcgtaccacgattttgcag-aacctgatttt 36922018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 9174125 - 9174561
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||           
T  9174125 aagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactatatgatgagtaccgt 9174224  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagt 186  Q
         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||    
T  9174225 tacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagt 9174324  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9174325 gtttcccaaggtgaatcaactcacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtt 9174424  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||    
T  9174425 tcagccccctctatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaaactgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtt 9174524  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  9174525 tctgtttttccctgccagcgcaccatcgtgccacgat 9174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 92 - 511
Target Start/End: Original strand, 3824654 - 3825097
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  3824654 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttc 3824753  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  3824754 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacc--tgtttcagc 3824851  T
Q  291 cccctcta----tctcaaag-tttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||    ||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824852 cccctctatctctctcaaagaaatactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 3824951  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccac---------------------gatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtg 464  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||                     |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||    
T  3824952 tctgttattcgtcgccaacgcaccatcgtgccacgatgcgaccccattgtgccatgatttttccagtgctttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtg 3825050  T
Q  465 ccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3825051 ccatgttgcccagccatcgtgtcacgattctgcagaaacctgatttt 3825097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6765198 - 6764836
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  6765198 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaacgt 6765099  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6765098 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagt 6764999  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaa-----gagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764998 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 6764899  T
Q  281 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6764898 ttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 6764836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24348570 - 24348211
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  24348570 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 24348471  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24348470 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 24348371  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348370 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 24348271  T
Q  288 agccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348270 agccccctctatctctctcaaagtttagcttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24348211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 2484852 - 2485209
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  2484852 aagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 2484951  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2484952 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 2485051  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485052 tttcccaaggtgaatcaacccagaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 2485151  T
Q  287 cagccccc-tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2485152 tagcccccttctagctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 2485209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40637422 - 40637071
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||                 
T  40637422 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 40637323  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  40637322 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcc 40637223  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637222 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 40637123  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40637122 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 40637071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 11008547 - 11008933
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  11008547 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccat 11008646  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 188  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  11008647 tacaaagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 11008746  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008747 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 11008846  T
Q  288 agccccctctatctc-----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||      ||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  11008847 agccccctctatctctctctcaaaatagc-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 11008933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 619433 - 619860
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 93  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||             |    
T  619433 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagttaggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaa 619532  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  619533 gagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttccc 619632  T
Q  194 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  619633 aaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgttgtctttataaacccttgtttcagccc 619732  T
Q  293 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtta 392  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  619733 cctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgtttaaaatttggaaaaaatctctacccaaaaatatgtttctgtta 619832  T
Q  393 ttcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||    
T  619833 ttcgccgccagcgcaccattgtgccacg 619860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 16934122 - 16934506
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  16934122 aagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgt 16934221  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagt 186  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  16934222 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagt 16934321  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16934322 gtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgta 16934421  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  16934422 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 16934506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14633672 - 14633317
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||           
T  14633672 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacat 14633573  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  14633572 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccg-taaccaagagactcaatcctaatagt 14633474  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14633473 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtt 14633374  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14633373 tcag-cccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 14633317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Original strand, 44599820 - 44600174
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  44599820 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 44599919  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  44599920 aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 44600019  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44600020 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 44600119  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600120 gccccctctatctcaaagtttgctttaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 44600174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 16931768 - 16932152
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  16931768 aagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgt 16931867  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagt 186  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  16931868 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagt 16931967  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16931968 gtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgta 16932067  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  16932068 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 16932152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47868755 - 47868398
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||           
T  47868755 aagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtatcgt 47868656  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  47868655 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 47868556  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47868555 gttttccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctt 47868456  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47868455 tcagccctctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 47868398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 9176453 - 9176837
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  9176453 aagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgt 9176552  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagt 186  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  9176553 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagt 9176652  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9176653 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtt 9176752  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  || |||||||||||    
T  9176753 tcagccccctctatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaatgtcttgcttaaaaactgtaacaaatctgc 9176837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 17662230 - 17662574
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  17662230 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 17662329  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17662330 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 17662429  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662430 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 17662518  T
Q  292 ccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662519 ccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17662574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 22132370 - 22132735
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttat-gacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------ 92  Q
    |||||||||| || |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          
T  22132370 aagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccg 22132469  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  22132470 ttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 22132569  T
Q  187 gtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132570 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-cgaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 22132668  T
Q  286 tcagcccc---------ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||         |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132669 tcagcccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22132735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 22134597 - 22134909
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    |||||||||| |||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||            
T  22134597 aagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgtt 22134696  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22134697 acaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgt 22134796  T
Q  189 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134797 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 22134895  T
Q  288 agccccctctatctc 302  Q
    || ||||||||||||    
T  22134896 ag-cccctctatctc 22134909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 38928162 - 38928513
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||                 
T  38928162 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactatatgatgagtaacgttacaaa 38928261  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38928262 agagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 38928361  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38928362 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagc 38928461  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  38928462 cccctctatctcaaggtttactctaatacaaagcctatatttatagtaaaag 38928513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Original strand, 33415473 - 33415821
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  33415473 agaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 33415572  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||    
T  33415573 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttcc 33415672  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33415673 caaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagcc 33415771  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  33415772 ccctctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttgtagtaaaa 33415821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 92 - 420
Target Start/End: Original strand, 52942543 - 52942860
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             || |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  52942543 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 52942629  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52942630 ccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag- 52942728  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttg--atacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    |||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  52942729 cccctctatctcaaagtttagtctgatatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcaccaaaaaatatgtttat 52942828  T
Q  389 gttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  52942829 gttattcgctgccagcgcatcatcgtgccacg 52942860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 18709146 - 18709458
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||              
T  18709146 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactatatgatgagtttcgttac 18709245  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18709246 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt 18709345  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709346 cccaaggtgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 18709445  T
Q  290 ccccctctatctc 302  Q
    |||||||||||||    
T  18709446 ccccctctatctc 18709458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 12395830 - 12396180
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||                 
T  12395830 agaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 12395929  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12395930 agagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 12396029  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12396030 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcc 12396129  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || |||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12396130 ccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12396180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36378641 - 36378244
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  36378641 agaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaa 36378542  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||     
T  36378541 gagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgtttt 36378442  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378441 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 36378342  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    ||| |||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||  | || | ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36378341 cccgtctatctcaaggtttattctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtaaccctcataaaattgtaacaaatctg-gcccaaaaatacgtttct 36378244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 22780355 - 22780668
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  22780355 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac 22780454  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22780455 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtt 22780554  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22780555 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttca 22780654  T
Q  289 gccccctctatctc 302  Q
    ||||||||||||||    
T  22780655 gccccctctatctc 22780668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 22782720 - 22783033
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  22782720 agaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac 22782819  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22782820 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtt 22782919  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22782920 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttca 22783019  T
Q  289 gccccctctatctc 302  Q
    ||||||||||||||    
T  22783020 gccccctctatctc 22783033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 12400792 - 12401142
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||                 
T  12400792 agaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 12400891  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  12400892 agagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcc 12400991  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12400992 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcc 12401091  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || |||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12401092 ccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12401142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 14787410 - 14787769
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg---agagagcagccctccgatccactatatgatga----- 92  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||         
T  14787410 aagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaac 14787507  T
Q  93 --------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaaca 184  Q
            |||||  |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  14787508 gttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 14787607  T
Q  185 gtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 283  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14787608 gtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttg 14787707  T
Q  284 tttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787708 tttcagccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 14787769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 343
Target Start/End: Original strand, 47210755 - 47211082
Alignment:
Q  25 atgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatcaatgggtta 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||    
T  47210755 atgactcagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggtta 47210854  T
Q  111 caagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagtgaatcaacccaca 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||           ||||    
T  47210855 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa-----------caca 47210943  T
Q  211 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaa 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  47210944 aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccctctcaa 47211043  T
Q  305 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211044 agtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 47211082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19096231 - 19095880
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |                 
T  19096231 agaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaa 19096132  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  | |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  19096131 agagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttca 19096032  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19096031 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 19095932  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19095931 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 19095880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 26085956 - 26086236
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||           
T  26085956 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactatatgatgagtatcgt 26086055  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26086056 tacaaagagaaaacaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 26086155  T
Q  188 tttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttg 267  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26086156 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 26086236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16453658 - 16453306
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | | ||||||| ||||||                
T  16453658 agaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 16453559  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16453558 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 16453459  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16453458 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaactctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagc 16453359  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16453358 cccctctatctctcggtttgctctgatacaaagcctatatttatagcaaaagt 16453306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 420
Target Start/End: Original strand, 8756336 - 8756663
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaa-gagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  8756336 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgttt 8756435  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-ca 288  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  8756436 cccaaggtgaatcaacccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttgactt-ctaaacccttgttttca 8756531  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    ||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  8756532 gccccttctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgtttataatttggaacaaatctgcaccgagaaatatgtttct 8756631  T
Q  389 gttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8756632 gttattcgcctccagcgcaccaacatggcacg 8756663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 37313150 - 37313400
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37313150 aagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 37313249  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
     |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313250 tcaaggtgaatcaactctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 37313349  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  37313350 cccctctatctcaaggtttactttgatacaaaacctatatttatagtaaaa 37313400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 53405487 - 53405124
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||            
T  53405487 aagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-gagagcagctctctgttccactatatgatgagtatcgtt 53405389  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataag------tctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 181  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  53405388 tcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatctta 53405289  T
Q  182 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 280  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405288 atagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 53405190  T
Q  281 ttgtttcagccccc---tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405189 ttgtttcagcccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 53405124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 56030770 - 56030443
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaaga-----------gaaat--caatgggttac 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||   ||||||||| |           |||||  ||||| |||||    
T  56030770 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttac 56030674  T
Q  112 aagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccaca 210  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  56030673 aagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 56030574  T
Q  211 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttg 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  56030573 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaggttta 56030474  T
Q  311 ctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  56030473 ctctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 56030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13544208 - 13543953
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13544208 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 13544109  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  13544108 ccaaggtgaatcaatcctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcag 13544010  T
Q  290 ccccctctatctc----aaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||||    ||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13544009 ccccctctatctctctcaaagtttacatctgatacaagatctatatttatagtaaaa 13543953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41997817 - 41997494
Alignment:
Q  30 ccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat-atgatga-------------agagaaatcaatgggttacaaga 115  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||             ||||| || || |||||||||||    
T  41997817 ccagttcggtccaaattaacctagtctggggagagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaaga 41997718  T
Q  116 ataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacc 214  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||  || |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  41997717 ataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacc 41997618  T
Q  215 ctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgcttt 314  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |    
T  41997617 ctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgtttcctttctgaacacttgtttcagccccctttatctcaaggtttactct 41997518  T
Q  315 gatacaaggtctatatttatagta 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  41997517 gatacaaagtctatatttatagta 41997494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 92 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19322942 - 19322701
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19322942 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 19322843  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  19322842 ccaaggtgaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcatc 19322747  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 336  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  19322746 cccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatag 19322701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937543
Alignment:
Q  113 agaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaa 211  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  212 accctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc 311  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  3937414 accctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctcaaggtttac 3937513  T
Q  312 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3937514 tctgata-aaagtctatatttatagtaaaag 3937543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 18409431 - 18409681
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |    
T  18409431 aagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcc 18409530  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18409531 cgaaggttaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag- 18409629  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || ||||||||||  |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18409630 cctctctatctcattgtttacactgatacaaattctatatttatagtaaaag 18409681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 18537559 - 18537806
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18537559 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18537658  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 289  Q
    | || |||||||||||  | |||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  18537659 ctaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcag 18537753  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18537754 ccccctctatctcaatgtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 18537806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132871
Alignment:
Q  123 tcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgt 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  222 ttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaa 321  Q
    ||||| | || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |   |||||||    
T  6132990 ttgttgccaatagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaacccttg-ttcagcctcctctatctcaatgtttacaccgatacaa 6132892  T
Q  322 ggtctatatttatagtaaaag 342  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6132891 tgtctatatttatagtaaaag 6132871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36380698 - 36380425
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||                
T  36380698 agaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaa 36380599  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  36380598 aagatatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttc 36380499  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttg 264  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| || || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36380498 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatggtttttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 36380425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 18534917 - 18535164
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18534917 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18535016  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 289  Q
     ||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||| ||||||    
T  18535017 tcaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttttaaacacttgttttcag 18535111  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||  | |||||||||||||| |||||||    
T  18535112 ccccctctatctcaaggtttactctgaatcgaggtctatatttattgtaaaag 18535164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 38270162 - 38270321
Alignment:
Q  184 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 282  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270162 agtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 38270261  T
Q  283 gtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38270262 gtttcagcctcttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 38270321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11437716 - 11437557
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------- 91  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  11437716 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 11437617  T
Q  92 ----aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcc 147  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11437616 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 11437557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5100994
Alignment:
Q  204 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctctatctca 5101034  T
Q  304 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    | |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5101033 aggtttaccctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 5100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 5635455 - 5635614
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------- 91  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  5635455 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 5635554  T
Q  92 -----aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 146  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5635555 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 24446760 - 24446914
Alignment:
Q  184 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  24446760 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaaccctt 24446854  T
Q  283 gtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24446855 gtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24446914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2891434 - 2891314
Alignment:
Q  223 tgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttga-tacaa 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||| |||||    
T  2891434 tgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacactgattacaa 2891335  T
Q  322 ggtctatatttatagtaaaag 342  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  2891334 tgtctatatttatagtaaaag 2891314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16455490 - 16455354
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16455490 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 16455391  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16455390 ccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttc 16455354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 393
Target Start/End: Original strand, 15032633 - 15032923
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |  || |||  ||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15032633 aagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttc 15032732  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    | ||  ||||||||||  ||          |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15032733 caaatatgaatcaacct-ca----------tttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgactt-ctaaacccttgtttcagc 15032819  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    ||||| |||||||| |||| || || ||| | ||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   ||||||||| || |||||    
T  15032820 cccctttatctcaaggtttactctggtaccaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctcagcccaaaaattcgattctg 15032919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 260
Target Start/End: Original strand, 38890310 - 38890476
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38890310 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttc 38890409  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagtttt 260  Q
    ||||  ||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  38890410 ccaatatgaatcaacc--ccaaccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttt 38890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4215654 - 4215483
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||             |    
T  4215654 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 4215555  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  4215554 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27499390 - 27499128
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-----------ag 94  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| ||||||           |     
T  27499390 agaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggaaagagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaa 27499291  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    ||| || | | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||   |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  27499290 agagat-attaggttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctca 27499192  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagt 257  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27499191 ggatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 27499128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13547502 - 13547302
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||                 
T  13547502 agaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaa 13547403  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13547402 agatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 13547303  T
Q  193 c 193  Q
    |    
T  13547302 c 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 16932243 - 16932345
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  16932243 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 16932341  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  16932342 tttt 16932345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 22780835 - 22780937
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22780835 ccatcgtgccatgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagctatcgtaccacgattctgcagaaacctga 22780933  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  22780934 tttt 22780937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 22783200 - 22783302
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22783200 ccatcgtgccatgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagctatcgtaccacgattctgcagaaacctga 22783298  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  22783299 tttt 22783302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2891540 - 2891436
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2891540 aagagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 2891441  T
Q  192 ccaag 196  Q
    |||||    
T  2891440 ccaag 2891436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 9176918 - 9177020
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  9176918 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcctaaccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 9177016  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  9177017 tttt 9177020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 16934597 - 16934699
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  16934597 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccatgttgcccagccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 16934695  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  16934696 tttt 16934699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 5101276 - 5101191
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5101276 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagatagcagccctccgttttactatatgatga 5101191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28453915 - 28453686
Alignment:
Q  108 ttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacc 206  Q
    |||||||||| ||||| |   |||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28453915 ttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc 28453816  T
Q  207 cacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctcaaa 305  Q
      | ||||||||||||| || | ||||| ||||  || | ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||     
T  28453815 --ccaaccctagtgtttcttgccaagag-caaa--ctctgcaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgttttcag-actctctacctcaag 28453723  T
Q  306 gtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453722 gttcacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 28453686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 495
Target Start/End: Original strand, 22803162 - 22803241
Alignment:
Q  415 gccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattct 495  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22803162 gccacgatttttccagtgcctttcctcaaaa-ctgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagccatcgtaccacgattct 22803241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25357713 - 25357583
Alignment:
Q  270 tttctaaacccttgttt-cagcccc-----ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgct--taaaatttggaa 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||     |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||    
T  25357713 tttctaaacccttgttttcagcccctctcactctctctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcgtaaaa-ttggaa 25357615  T
Q  362 caaatctgcacccaaaaatacgtttctgttat 393  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25357614 caaatctgagcccaaaaatacgattctgttat 25357583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 398
Target Start/End: Original strand, 40999072 - 40999338
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||| || || |||||||| |    || |||||||||||||     
T  40999072 ctaattctacccaaagtctcgatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaatctc--aatcctagtgtttgttg 40999169  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtct 326  Q
      ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||| ||||| |||| || ||||| ||||| |    
T  40999170 tcaagag-caaactctatacaacccctagttttcttgttgacgt-ctaaacccttgttttcagactc-tctacctcaaggtttactctgatataaggttt 40999266  T
Q  327 atatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgcc 398  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||   |  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  40999267 atatttatagtaaaaataacccttaaaatttggaacaaatctatcctgaaagatacgtttctgtttttcgcc 40999338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Original strand, 36920015 - 36920110
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  36920015 tgccacgatttttccagtgacttgcctcaaaat-tgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagccatcgtgccacgattttgcag-aacctgatttt 36920110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9863917 - 9863712
Alignment:
Q  130 taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 228  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |  | |||| ||||||||||| |    
T  9863917 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggtgaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgc 9863820  T
Q  229 aaagagacaaattctatacaaaccctag-ttttgttgttgcctttctaaacccttg--tttcagccccct-ctatctcaaagtttgctttgatacaaggt 324  Q
     |||| |||||  || |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||| | || ||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  9863819 caaga-acaaa--ctctacaaaccctagtttttgtttttggc-ttctaaacccttgtttttcagctctctactatctcaaggtttcatctgatacaaggt 9863724  T
Q  325 ctatatttatag 336  Q
    ||||||||||||    
T  9863723 ctatatttatag 9863712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 47563109 - 47563023
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  47563109 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataagatga 47563023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24888701 - 24888605
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24888701 tgccacgatttttccagtgctttgcctcaaact-tgaaacctccaatcgtgccacgttgcctagccatcgtgccacaattctgcagaaatctgatttt 24888605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Original strand, 37089802 - 37089899
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||    |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  37089802 tgccacgatttttccagtgcctcacctaaaaaactaaaacatctcatcgtgccacgttgccttgccatcgtgccacgattctgcagaaatctgatttt 37089899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 511
Target Start/End: Original strand, 9174580 - 9174669
Alignment:
Q  420 gatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  9174580 gatttttccagtgccttgcctaataaactaaaacc-tccatcgtgctacgttgcctagccgtcgtgccacgattctgcag-aacctgatttt 9174669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 422
Target Start/End: Original strand, 11008932 - 11009007
Alignment:
Q  347 gcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||    
T  11008932 gcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttttttgctgccagtgcaccatcgtgccacgat 11009007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 14789409 - 14789495
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg---gagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||    
T  14789409 aagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Original strand, 16186099 - 16186173
Alignment:
Q  270 tttctaaacccttgtttc-agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16186099 tttctaaacccttgtttttagccccctctctctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 16186173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18847111 - 18847049
Alignment:
Q  360 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  18847111 aacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccccgcgagcgcaccatcgtgccacgat 18847049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30136798 - 30136640
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||   |||||  || |||||||||  ||||| ||  ||||||||    
T  30136798 aagagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttc 30136699  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaacc 252  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||    
T  30136698 ccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 204
Target Start/End: Original strand, 47150978 - 47151092
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| || ||  ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47150978 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 47151077  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaa 204  Q
    ||||| |||||||||    
T  47151078 cccaaggtgaatcaa 47151092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12102336 - 12102088
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||  || ||||  | ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  12102336 aagagatatcagtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgttt 12102237  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaat-tctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttc 287  Q
    ||||| |||||||||  ||  |||||||  |||| | ||    ||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  12102236 cccaaggtgaatcaa--caacaacccta--gtttctcccgcttagagaaatctctcta-aaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttc 12102144  T
Q  288 ag-ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || ||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12102143 agcccccctctatctcaaggttttatctgatacaagatctatatttatagtaaaag 12102088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 38409104 - 38409008
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  38409104 tgccacgatttttccagtgctttgcctcaaact-tgaaacctccaatcgtgccacgatgcccagcaatcgtgccacgattctgcagaaatctaatttt 38409008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6133185 - 6133105
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  6133185 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactata 6133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 475
Target Start/End: Original strand, 22044817 - 22044879
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctc--aaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgccc 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22044817 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaaaatgaaa-cctccatcgtgccacgttgccc 22044879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18847034 - 18846949
Alignment:
Q  416 ccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaa 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| | |||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  18847034 ccacgatttttccagtaccttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccacgattcccaacaatcgtgccacgattctgcagaaa 18846949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 7050379 - 7050439
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7050379 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 412
Target Start/End: Original strand, 9176836 - 9176901
Alignment:
Q  347 gcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatc 412  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  9176836 gctttaaatttataacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatc 9176901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11853609 - 11853549
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11853609 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 16185957 - 16186018
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16185957 ctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 52942473 - 52942526
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg 60  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52942473 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg 52942526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16455356 - 16455284
Alignment:
Q  271 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  16455356 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctctcggtttgctctgatacaaagcctatattaatagcaaaagt 16455284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 31300580 - 31300540
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31300580 tgacctagtctggggagagagcagccctccgttccactata 31300540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 31850033 - 31850096
Alignment:
Q  420 gatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgt 484  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  31850033 gatttttccagtgccttgcc-ccaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagcaatcgt 31850096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16455581 - 16455510
Alignment:
Q  16 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||    
T  16455581 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactata 16455510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 31985722 - 31985663
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31985722 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactat 31985663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Original strand, 54867192 - 54867239
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccct 73  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54867192 tgacccagttcggtccaatatgacctagtctggggagagagcagccct 54867239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 4556181 - 4556238
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  4556181 ctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4556238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4558371 - 4558314
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  4558371 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8529327 - 8529270
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  8529327 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9022515 - 9022362
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc-ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 226  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||||||| || ||||||| | || ||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||    
T  9022515 ctaattcaacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaatccc--aaccatagtgtttgtt 9022418  T
Q  227 ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
     | ||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  9022417 gccaagaga---attctctacaaaccctagttttgatgttgac-ttctaaacccttgttt 9022362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15317018 - 15316961
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15317018 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15316961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 16689062 - 16689119
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  16689062 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18587026 - 18586969
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  18587026 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 18586969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31300484 - 31300427
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  31300484 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 368
Target Start/End: Original strand, 52043737 - 52043791
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||    
T  52043737 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctaaaaaattggaacaaatct 52043791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 5336904 - 5336964
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5336904 ctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 408 - 469
Target Start/End: Original strand, 11009014 - 11009075
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||    
T  11009014 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaaattgaaacctccattgtgccacg 11009075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Original strand, 22780687 - 22780744
Alignment:
Q  313 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  22780687 ttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 22780744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Original strand, 22783052 - 22783109
Alignment:
Q  313 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  22783052 ttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 22783109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 55822325 - 55822265
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  55822325 ctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4569978 - 4569899
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttatt 394  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  4569978 tgatacaaggcttatatttatagtgaaagtaacccttaaaatatggaacaaatcttca-ctgaaaatacgtttctgttatt 4569899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 10047387 - 10047447
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10047387 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10047447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 37313050 - 37313130
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37313050 agaaaacaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactata 37313130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 39246002 - 39246062
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39246002 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 39246062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 55822420 - 55822380
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55822420 tgacctagtatggggagagagcagctctccgatccactata 55822380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2891640 - 2891577
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 69  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||    
T  2891640 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcag 2891577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 48486212 - 48486146
Alignment:
Q  426 tccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgatt 493  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  48486212 tccagtgacttgcctcaaaa-ctgaaacctccaatcgtgccacgttgctcagccatcgtgccacgatt 48486146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 49088911 - 49088860
Alignment:
Q  15 aaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagag 66  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  49088911 aaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagag 49088860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 3937259 - 3937309
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg 57  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3937259 agaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctg 3937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15831201 - 15831144
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15831201 ctaattctacgcaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15831144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 343
Target Start/End: Original strand, 22134936 - 22134966
Alignment:
Q  313 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134936 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22134966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25699809 - 25699752
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  25699809 ctaattctacc-aaagtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5101171 - 5101130
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5101171 atcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11853705 - 11853664
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11853705 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 11853664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16489505 - 16489464
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatat 87  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16489505 tgacctagtctagggagagagcagctctccgttccactatat 16489464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18587123 - 18587082
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18587123 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 18587082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19323043 - 19322962
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  19323043 agaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactata 19322962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Original strand, 31983650 - 31983727
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaac 205  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||  | ||||||||| | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31983650 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 54906702 - 54906631
Alignment:
Q  211 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||   || |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  54906702 aaccctagtgtttgttgcaaagagaaaa---ctttacaaaccctagttttattgttggc-ttctaagcccttgttt 54906631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5269280 - 5269220
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5269280 tgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 5269220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5396760 - 5396700
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  5396760 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 6743504 - 6743444
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6743504 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactat 6743444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15317114 - 15317074
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  15317114 tgacctagtctggggagagagcagctctctgttccactata 15317074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36315318 - 36315258
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36315318 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36315258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36329527 - 36329467
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36329527 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36329467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 139)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 25921452 - 25921977
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||           
T  25921452 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgt 25921551  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  25921552 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 25921651  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25921652 gtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtt 25921751  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921752 tcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 25921851  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctc-aaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgt 484  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25921852 tctgttattcgctgtcagcgcaccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgtccaaccatcgt 25921950  T
Q  485 atcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  25921951 gccacgattctgcagaaacctgatttt 25921977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2175216 - 2174695
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |             
T  2175216 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgataagtaacgtta 2175117  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  2175116 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 2175017  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175016 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 2174917  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2174916 gccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctgtatttatagtaaaagcatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttct 2174817  T
Q  389 gttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatca 488  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  2174816 gtttttcgctgccagtgcaccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgccttgccatcgtgcca 2174718  T
Q  489 cgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2174717 cgattctgcagaaacctgatttt 2174695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 38882403 - 38881877
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  38882403 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 38882304  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38882303 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 38882204  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882203 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 38882104  T
Q  289 gccccc-tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttc 387  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882103 gcccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttc 38882004  T
Q  388 tgttattcgccgccagcgcac---------------------catcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgcc 466  Q
    |||||||||||||||||||||                     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38882003 tgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaact-aaaacctccatcgtgcc 38881905  T
Q  467 acgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||    
T  38881904 acgttgcccagcaatcgtgccacgattc 38881877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 4236928 - 4236385
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  4236928 aagagaagaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 4236830  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  4236829 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 4236730  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4236729 gttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtt 4236630  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4236629 tcagccccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtt 4236531  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatc---------------------atgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtg 464  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  4236530 tctgtttttccctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccattgtgccacgatttttccagtgccttgcct-taaaactgaaacctccaatcgtg 4236432  T
Q  465 ccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  4236431 ccacgttgcccagccatcgtgccacaattctgcagaaatctgatttt 4236385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16776451 - 16776021
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |                 
T  16776451 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaa 16776352  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16776351 agagaaatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 16776253  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16776252 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgtttcagcc 16776153  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctata-tttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  16776152 ccctctatctcaaagtttgctcagatacaaggtctatattttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatcttcactcaaaaatatgtttctgt 16776053  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    | ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16776052 ttttcgatgccagcgcaccatcgtgccacgat 16776021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21948320 - 21947911
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  21948320 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 21948221  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21948220 agagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 21948121  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21948120 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcc 21948021  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    || ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21948020 cc-tctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtt 21947922  T
Q  392 attcgccgcca 402  Q
    |||||| ||||    
T  21947921 attcgctgcca 21947911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 501
Target Start/End: Original strand, 2818320 - 2818822
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||                 
T  2818320 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 2818419  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |    
T  2818420 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttc 2818519  T
Q  193 caag-tgaatcaa-cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2818520 caaggtgaatcaaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagc 2818619  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  2818620 cccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccgaaaatacgtttttgt 2818719  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacg 490  Q
    ||||||| |        ||||| ||||||||    ||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  2818720 tattcgctg--------ccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccatgttgcctagccatcgtgccacg 2818810  T
Q  491 a-ttctgcagaa 501  Q
    | ||||||||||    
T  2818811 atttctgcagaa 2818822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 21684431 - 21684876
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  21684431 aagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgt 21684530  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21684531 tacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 21684630  T
Q  188 tttcccaagt-gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21684631 tatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgttt 21684730  T
Q  287 cagccccctcta----------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaa 376  Q
    ||||||||||||          |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21684731 cagccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttgtaacaaatctgcactcaa 21684830  T
Q  377 aaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21684831 aaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 21684876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31545377 - 31544996
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  31545377 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttac 31545278  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  31545277 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtt 31545178  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545177 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 31545078  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  31545077 gccccctttatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 31544996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31543029 - 31542651
Alignment:
Q  6 aagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------ 92  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||                
T  31543029 aagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaa 31542930  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttc 191  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  31542929 agagaaatcaatgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 31542831  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542830 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 31542731  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  31542730 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 31542651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 511
Target Start/End: Original strand, 36402313 - 36402830
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| | || | | |||||||||||||                 
T  36402313 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 36402412  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |    
T  36402413 agagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtattttc 36402512  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  36402513 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcgtgattgtcattctaaacccttgtttcagcc 36402612  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402613 ccctctatctcaacgtttactctgatataaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaattt-gaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 36402711  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacga 491  Q
    |||||  |||| ||||||||| ||||||||     |||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||  |  ||    
T  36402712 attcgttgccaacgcaccatcgtgccacgaaaaaaccagtgacttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgctatgttgcccagccatcgtgcctaga 36402810  T
Q  492 ttctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  36402811 ttctgcagaaacctaatttt 36402830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39854777 - 39854427
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  39854777 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaa 39854678  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  39854677 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcc 39854578  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39854577 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-c 39854479  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39854478 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 39854427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 10529077 - 10529435
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaa-gaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------ 92  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||          
T  10529077 aagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactatatgatgagtaacg 10529176  T
Q  93 -------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacag 185  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  10529177 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 10529276  T
Q  186 tgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529277 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 10529376  T
Q  285 ttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10529377 ttcaacccactctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 10529435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 31179352 - 31179734
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  31179352 aagagaagaacacagaa--atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgt 31179449  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagt 186  Q
         |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  31179450 tacaaagagaaatgaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagt 31179549  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179550 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 31179649  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  31179650 tcagctccctctatctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 31179734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 107 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6756674 - 6756336
Alignment:
Q  107 gttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagt-gaatcaac 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  6756674 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggagaatcaac 6756575  T
Q  206 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaa 305  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6756574 cctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcagctccctctatctcaaa 6756475  T
Q  306 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcg 405  Q
    ||||  | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6756474 gtttaatatgatacaagatctatattaatagtaaaagtataacttaaaatttggaataaatctgcaccaaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcg 6756375  T
Q  406 caccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaa 444  Q
    ||||||| ||||||||    ||||||| |||||||||||    
T  6756374 caccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttgcctcaaa 6756336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18466984 - 18466625
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||           
T  18466984 aagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgt 18466885  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    
T  18466884 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 18466785  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466784 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 18466685  T
Q  286 tcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466684 tcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 18466625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 99 - 511
Target Start/End: Original strand, 31466070 - 31466481
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| |    
T  31466070 atcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttctcaaggt 31466168  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||| | |    
T  31466169 gaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtcgttacttttttaaacctttgtttcagcccctttt 31466268  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgc 397  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |    
T  31466269 atctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacatttatggtattccc 31466368  T
Q  398 cgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgatt-ctg 496  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||    ||||||||||||||||||  | |||||  ||||||| |||    
T  31466369 tgccagtgcaccatcgtgccaagatttttccagtgacttgcctc-ataactgaaacatctcatcgtgccacgttgcccttcaatcgtgccacgattcctg 31466467  T
Q  497 cagaaacctgatttt 511  Q
    || ||||||||||||    
T  31466468 ca-aaacctgatttt 31466481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 100 - 481
Target Start/End: Original strand, 12556016 - 12556396
Alignment:
Q  100 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tg 198  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||| | | |||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12556016 tcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaactccaatc-tcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtg 12556114  T
Q  199 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 298  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12556115 aatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttcagccccctcta 12556214  T
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgcc 398  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||     
T  12556215 tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaattttgaaacaaatctgtacacaaaaatacatttctgttattcgct 12556314  T
Q  399 gccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccat 481  Q
    ||||||||| |||| ||||||||    ||||||| |||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  12556315 gccagcgcatcatcgtgccacgaaaaatccagtgacttgcctc-aaaactgaaacctccaattgtgccacgttgcccagccat 12556396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18469309 - 18468950
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||            
T  18469309 aagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctggg-agagagcagctcttcgttccactagatgatgagtatcgtt 18469211  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18469210 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 18469111  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469110 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18469011  T
Q  287 cagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469010 cagccccctctatctctctcaaagtttatcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18468950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25804324 - 25804009
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  25804324 aagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgtt 25804225  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25804224 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 25804125  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25804124 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 25804025  T
Q  287 cagccccctctatctc 302  Q
     |||||||||||||||    
T  25804024 gagccccctctatctc 25804009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27912836 - 27912473
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||           
T  27912836 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactatatgatgagtatcgt 27912737  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||    
T  27912736 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagt 27912637  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912636 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 27912537  T
Q  286 tcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||| |||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912536 tcagcaccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27912473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27910748 - 27910388
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||             
T  27910748 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgtta 27910649  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27910648 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 27910549  T
Q  189 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27910548 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaa-ccttgtttc 27910450  T
Q  288 agcccc------ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||      |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910449 agcccccgctatctctctctcaaagtttaacctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27910388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6747598 - 6747247
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||            |    
T  6747598 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaa 6747499  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6747498 aagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 6747399  T
Q  194 aa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6747398 aaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaactctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccc 6747300  T
Q  293 cctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6747299 cctctatctctttctctttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 6747247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 34477032 - 34477349
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  34477032 aagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 34477131  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacag 185  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  34477132 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatag 34477231  T
Q  186 tgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477232 tgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 34477331  T
Q  285 ttcagccccctctatctc 302  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34477332 ttcagccccctctatctc 34477349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 34479397 - 34479714
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  34479397 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 34479496  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacag 185  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  34479497 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatag 34479596  T
Q  186 tgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479597 tgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 34479696  T
Q  285 ttcagccccctctatctc 302  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34479697 ttcagccccctctatctc 34479714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 18511197 - 18511547
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  18511197 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 18511296  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18511297 agagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18511396  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18511397 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcc 18511496  T
Q  292 ccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    |||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18511497 ccctctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatattaaa 18511547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6745362 - 6745053
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  6745362 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 6745263  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6745262 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 6745163  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6745162 caaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttcagcc 6745064  T
Q  292 ccctctatctc 302  Q
    |||| ||||||    
T  6745063 ccctttatctc 6745053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26098025 - 26097676
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||                 
T  26098025 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 26097927  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  26097926 agagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgtttcc 26097827  T
Q  193 caagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
     | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  26097826 aaggtgaatcaaccctctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgccattctaaacctttatttcagccc 26097727  T
Q  293 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26097726 cctctatctcaaagtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 26097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40221813 - 40221465
Alignment:
Q  11 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------aga 95  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||             |||    
T  40221813 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 40221714  T
Q  96 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  40221713 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 40221614  T
Q  196 g-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 294  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40221613 ggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccc 40221514  T
Q  295 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||| |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  40221513 tctatctcaaggtttactctgagtcaatgtctatatttatagtaaaagt 40221465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 1189592 - 1189949
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg--gagagagcagccctccgatccactata-tgatga----------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||               
T  1189592 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttaca 1189691  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
      ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  1189692 aaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 1189791  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1189792 cccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccgtagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcag 1189891  T
Q  290 ccccctcta----tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||    |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189892 ccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 1189949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Original strand, 10474308 - 10474655
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||                 
T  10474308 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaa 10474407  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10474408 agagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcc 10474507  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10474508 caaggtgtatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcc 10474607  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaa 339  Q
    |||||||| |||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10474608 ccctctatttcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaa 10474655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25904397 - 25904047
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||| |                 
T  25904397 agaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgataagtaacgttacaat 25904298  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25904297 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 25904198  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25904197 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcc 25904098  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25904097 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 25904047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17073172 - 17072827
Alignment:
Q  13 caaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------agaga 97  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||             |||||    
T  17073172 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 17073073  T
Q  98 aatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag- 196  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  17073072 tatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagg 17072973  T
Q  197 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17072972 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctc 17072873  T
Q  297 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17072872 tatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 17072827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 18509303 - 18509652
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||                 
T  18509303 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 18509402  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18509403 atagatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18509502  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18509503 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcc 18509602  T
Q  292 cc-ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    || || | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18509603 cctctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 18509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15552542 - 15552229
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  15552542 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 15552443  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  15552442 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtt 15552343  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15552342 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 15552243  T
Q  289 gccccctctatctc 302  Q
    | ||||||||||||    
T  15552242 gtcccctctatctc 15552229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18596939 - 18596590
Alignment:
Q  8 gaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||                 
T  18596939 gaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 18596840  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18596839 agagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttc 18596740  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  18596739 caaggtgaatcaaccctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctt--tatacccttgtttcagcc 18596642  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18596641 ccctctatcccaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 18596590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24127150 - 24126800
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  24127150 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 24127051  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24127050 agagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcc 24126951  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| | |||||| |  ||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24126950 caaggtcaatcaatcttcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcc 24126851  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || |||||||||| |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24126850 ccatctatctcaaggtttacactgatataatgtctatatttatagtaaaag 24126800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 31472597 - 31472948
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||                
T  31472597 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 31472696  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| | |  ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31472697 aagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 31472796  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31472797 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagc 31472896  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31472897 cccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 31472948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 316 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 39798058 - 39797864
Alignment:
Q  316 atacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  39798058 atacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgcaccatcgtg 39797959  T
Q  416 ccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  39797958 ccatgatttttccggtgccttgcctcaaaaactgaaa-cctccatcatgccacgttgcccagccatcgtgccacgattatgcagaaacctgatttt 39797864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2954710 - 2954368
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||            |    
T  2954710 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactatatgatgagtaactttacaaa 2954611  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  2954610 gagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttcc 2954511  T
Q  194 aa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  2954510 aaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcatac 2954411  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttat 334  Q
     ||||||||||||||||| |  |||||||| | ||||||||||    
T  2954410 tcctctatctcaaagtttacactgatacaaagcctatatttat 2954368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Original strand, 658341 - 658610
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||             |    
T  658341 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagag--cagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaa 658438  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |    
T  658439 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttctc 658538  T
Q  194 aa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttg 264  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  658539 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 696172 - 695833
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatgaa----------- 93  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||               
T  696172 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaa 696073  T
Q  94 --gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  696072 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 695973  T
Q  192 ccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  695972 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaag-----------atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatcc 695884  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||| |||||||| |||| |  | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  695883 ccctttatctcaaggtttacactcatacaatgtctatattcatagtaaaag 695833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 100 - 302
Target Start/End: Original strand, 16092292 - 16092495
Alignment:
Q  100 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16092292 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 16092391  T
Q  199 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16092392 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctcta 16092491  T
Q  299 tctc 302  Q
    ||||    
T  16092492 tctc 16092495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 34530750 - 34531001
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34530750 aagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctaatagtgtttc 34530849  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34530850 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacacttgtttcagc 34530949  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  34530950 cccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttacagtaaaag 34531001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 39397978 - 39398327
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 92  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||| ||              |    
T  39397978 agaacacaaaagaatgttttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaa 39398077  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39398078 agagatatcaatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 39398177  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39398178 caaggtgaatcaaccctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag- 39398275  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |   | ||||| || |||||||||||||||||    
T  39398276 cccctctatctcaaggtttacaccggtacaatgtttatatttatagtaaaag 39398327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 17818477 - 17818817
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||| ||||||||             |    
T  17818477 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggg-gagagaagccctctgttccactgtatgatgagtaactttacaaaa 17818575  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  17818576 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttccc 17818675  T
Q  194 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17818676 aaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcag-cc 17818774  T
Q  293 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 335  Q
    ||||| |||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  17818775 cctctttctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttata 17818817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20042994
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 327  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  20043108 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctatgatacaaagccta 20043009  T
Q  328 tatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||||    
T  20043008 tatttatagtaaaag 20042994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 210 - 418
Target Start/End: Original strand, 20507665 - 20507873
Alignment:
Q  210 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagttt 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20507665 aaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagttt 20507764  T
Q  310 gctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcacc 409  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20507765 actctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaatcttggaacaaatctgctcccaaaaatatgtttctgttattcgctgctagcgcacc 20507864  T
Q  410 atcatgcca 418  Q
     || |||||    
T  20507865 ttcgtgcca 20507873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Original strand, 37705864 - 37706116
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  || |  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37705864 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 37705963  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  37705964 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaaccctagatttgtcgttgcctttctaaacctttatttcagc 37706063  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37706064 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagt 37706116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20045168 - 20044954
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20045168 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 20045069  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 327  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  20045068 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtctcaaggtttgctctgatacaaagccta 20044969  T
Q  328 tatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||||    
T  20044968 tatttatagtaaaag 20044954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10587130 - 10586782
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg--agagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  10587130 gagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt 10587031  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  10587030 acaaagagaaatcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgt 10586931  T
Q  189 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||           |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10586930 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctatcgtttgttcccaaagag-----------acaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 10586842  T
Q  287 cagcccc---ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||    ||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586841 cagcccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10586782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4410321 - 4410090
Alignment:
Q  2 agagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||            
T  4410321 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtatcgtt 4410222  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4410221 acaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 4410122  T
Q  189 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410121 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21289055 - 21288715
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgaagaga-----aat 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||  |       ||     
T  21289055 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaacgttacaaa 21288956  T
Q  101 caatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagtgaa 200  Q
      ||| |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| | | |||||    
T  21288955 agatgagttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttttcaaggtgaa 21288856  T
Q  201 tcaacccacaaacccta------gtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 294  Q
    ||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  21288855 tcaaccctcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctatttttattgttgctattctaaacccttatttcaaccccc 21288756  T
Q  295 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 335  Q
    |||||||||| |||| || | || |||||||||||||||||    
T  21288755 tctatctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttata 21288715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 343
Target Start/End: Original strand, 26098403 - 26098587
Alignment:
Q  160 gtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagtt 258  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  26098403 gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtc 26098502  T
Q  259 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26098503 ttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 26098587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39798345 - 39798123
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  39798345 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatacgatgagtatcatta 39798246  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39798245 taaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 39798146  T
Q  189 ttcccaa-gtgaatcaacccaca 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  39798145 ttcccaaggtgaatcaacccaca 39798123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 337
Target Start/End: Original strand, 6661270 - 6661512
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||   |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6661270 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 6661369  T
Q  192 cca-agtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||  |||||||||||  | ||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  6661370 ccatggtgaatcaacc--ccaactctagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacataccctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaac 6661465  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 337  Q
    || ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6661466 cctctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagt 6661512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Original strand, 20505828 - 20506041
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||             |    
T  20505828 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaa 20505926  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20505927 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20506026  T
Q  194 aa-gtgaatcaaccc 207  Q
    || ||||||||||||    
T  20506027 aaggtgaatcaaccc 20506041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 351 - 511
Target Start/End: Original strand, 34479799 - 34479957
Alignment:
Q  351 aaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactga 450  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| | || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34479799 aaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaa 34479897  T
Q  451 aaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34479898 aacc-tccatcgtgccacgttgcccagccatcgtgccacgattctgcagaaacctgatttt 34479957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10749996 - 10749796
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  10749996 agaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 10749898  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10749897 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 10749798  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  10749797 tc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 41585729 - 41585956
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  41585729 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaa 41585828  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  41585829 agagatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcc 41585928  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 219  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41585929 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 3373119 - 3373320
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||              
T  3373119 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 3373218  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga-gtcaatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  3373219 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtt 3373318  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  3373319 tc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23665340 - 23665140
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  23665340 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 23665241  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23665240 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 23665142  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  23665141 tc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 23793247 - 23793447
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  23793247 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 23793346  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23793347 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 23793445  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  23793446 tc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410000
Alignment:
Q  246 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 4410002  T
Q  342 gt 343  Q
    ||    
T  4410001 gt 4410000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10757472 - 10757273
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  10757472 agaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 10757374  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10757373 aaagaaaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc-gtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 10757275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 15354557 - 15354757
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||              
T  15354557 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac 15354656  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  15354657 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 15354755  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  15354756 tc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 38960114 - 38960314
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  38960114 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 38960213  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  38960214 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 38960312  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  38960313 tc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2724187 - 2723964
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||             |    
T  2724187 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaaa 2724088  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||         |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  2724087 agagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattcta---------ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcc 2723997  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 224  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2723996 caaggtgaatcatccctcaaaccctagtgtttg 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 15356833 - 15357033
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||              
T  15356833 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac 15356932  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  15356933 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 15357031  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  15357032 tc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 34477515 - 34477617
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  34477515 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagccatcgtgccacgattctgcagaaacttga 34477613  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  34477614 tttt 34477617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 171
Target Start/End: Original strand, 23741841 - 23742020
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg----------- 91  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  23741841 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 23741940  T
Q  92 -aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 171  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||    
T  23741941 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagaga 23742020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 31542559 - 31542457
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31542559 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagctatcgtgtcacgattttgcagaaacctga 31542461  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  31542460 tttt 31542457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 31544915 - 31544813
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31544915 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccacgttgcccagctatcgtgccacgattttgcagaaacctga 31544817  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  31544816 tttt 31544813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9020413 - 9020167
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||  ||||||| || ||||||| | |||||| ||| |||||||     
T  9020413 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgtttt 9020314  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 289  Q
    |||| |||||||||  |   |||||||||||||||| | |||||   || ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||    
T  9020313 ccaaggtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgttgccaagag--caactctatacaaaccctacttttg-tgttgcc-tcccaaacccttgttttcag 9020220  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    | ||||||| | ||| |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9020219 ctccctctagcacaaggtttacatctgatacaaggtatgtatttatagtaaaa 9020167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36208865 - 36208524
Alignment:
Q  12 acaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------agaga 97  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||             |||||    
T  36208865 acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatggggaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagaga 36208766  T
Q  98 aatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag 196  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||  | |||||||||||    
T  36208765 tatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaag 36208666  T
Q  197 -tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaat-tctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagcccc 293  Q
     |||||||||  |  |||||||||  || | ||    ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  36208665 gtgaatcaac--aacaaccctagt--ttctcccgcttagagaaatctctcta-aaaccctagttt-gttgtttg-tttctaaacccttgttttcagcccc 36208573  T
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208572 ctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 36208524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 389 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 659848 - 659728
Alignment:
Q  389 gttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatca 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  659848 gttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatttttccagtgacttgcctc--aaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcctagccatcgtgcca 659751  T
Q  489 cga-ttctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  659750 cgatttctgcag-aacctgatttt 659728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 360 - 511
Target Start/End: Original strand, 38960440 - 38960589
Alignment:
Q  360 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctcca 459  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  38960440 aacaaatctgctcccaaaaatatgttt-tatttttatccgccaacgcaccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctcca 38960537  T
Q  460 tcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||| |   |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  38960538 tcgtgccgcaaagcccagccgtcgtgccacgattgtgcagaaacctgatttt 38960589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20054020 - 20053834
Alignment:
Q  105 gggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  |||       |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20054020 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatctcca-----aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 20053926  T
Q  204 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 299  Q
    |||    |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20053925 acc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaactctagtttttgtgttgcc-ttctaaacccttgtttcagcgccctctat 20053834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770690
Alignment:
Q  119 agtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacccta 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||  |||||| | ||||| |||||   |||| ||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaatagt--ttcccatggtgaatgaacccc--aacctta 42770839  T
Q  218 gtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttga 316  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||  ||    
T  42770838 gtgtttgttgccaagag-caaattctatataaacc-taattttgt-gttgccttcc-aaacccttgttttcagtcccctctatctcaaggtttactc-ga 42770744  T
Q  317 tacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctg 369  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  42770743 tacaaagtttatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctg 42770690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 427 - 511
Target Start/End: Original strand, 18186489 - 18186572
Alignment:
Q  427 ccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18186489 ccagtgacttgcctcaaaa-ctgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagccatcgtaccacgattctgcagaaacttgatttt 18186572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 41585946 - 41586042
Alignment:
Q  247 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41585946 caaaccctagttttgttcttgttattctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctgatacaaaacctatatttatagtaaaagt 41586042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 10749622 - 10749520
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10749622 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagccgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 10749524  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  10749523 tttt 10749520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 10757077 - 10756975
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||   |||||| |||||||||||||    
T  10757077 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagccgtcgtgctacgattgtgcagaaacctga 10756979  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  10756978 tttt 10756975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 15354948 - 15355050
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15354948 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 15355046  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  15355047 tttt 15355050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 15357224 - 15357326
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15357224 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 15357322  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  15357323 tttt 15357326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23665125 - 23665054
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  23665125 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 23665054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Original strand, 23793462 - 23793533
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  23793462 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 23793533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 343
Target Start/End: Original strand, 3373332 - 3373377
Alignment:
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373332 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3373377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 370
Target Start/End: Original strand, 15354777 - 15354845
Alignment:
Q  302 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  15354777 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 15354845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 370
Target Start/End: Original strand, 15357053 - 15357121
Alignment:
Q  302 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  15357053 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 15357121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23667400 - 23667329
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  23667400 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagttaaagtcatgcttaaaatctataacaaatctgc 23667329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Original strand, 38960334 - 38960405
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  38960334 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 38960405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 286
Target Start/End: Original strand, 17413251 - 17413441
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |   | |||||||||| |||||| ||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17413251 aagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17413350  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| ||||  || |||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  17413351 cccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaa--ctctacaaaccatagttttagtgctgcc-ttctaaacccttgttt 17413441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10757245 - 10757180
Alignment:
Q  305 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  10757245 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 10757180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 511
Target Start/End: Original strand, 21684905 - 21684954
Alignment:
Q  462 gtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21684905 gtgccacgttgcccagccatcgtgccacgattctgcagaaacctgatttt 21684954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Original strand, 23742057 - 23742101
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23742057 tctcaaagtttgctttgacacaaggtctatatttatagtaaaagt 23742101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 26098273 - 26098360
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  26098273 agaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccatatgatga 26098360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Original strand, 34477379 - 34477435
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  34477379 tgatacaaggtctatttttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 34477435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15143661 - 15143547
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| ||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15143661 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgctt 15143562  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaa 204  Q
    || || |||||||||    
T  15143561 ccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20043284 - 20043222
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagca 68  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20043284 agaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42771005 - 42770951
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 146  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42771005 aagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 42770951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1170871 - 1170811
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1170871 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29748313 - 29748260
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatc 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||    
T  29748313 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctcaaaatttggaacaaatc 29748260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 35385574 - 35385634
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35385574 ctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6756786 - 6756718
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 74  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6756786 agaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc 6756718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31542628 - 31542576
Alignment:
Q  360 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatc 412  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31542628 aacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttatccgccagcgcaccatc 31542576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Original strand, 34479740 - 34479796
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  34479740 tgatacaaggtctatttttatagtaaaggtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 34479796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10749767 - 10749704
Alignment:
Q  306 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |  ||||||||||    
T  10749767 gtttgctttgatacaaggtctatatttatactaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctg 10749704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23664951 - 23664849
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||| | ||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23664951 ccatcgtgccacgatttttccagtgcctttcccaaaaaaataaaaac-tccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 23664853  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  23664852 tttt 23664849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23667226 - 23667124
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||| | ||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23667226 ccatcgtgccacgatttttccagtgcctttcccaaaaaaataaaaac-tccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 23667128  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  23667127 tttt 23667124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 23793636 - 23793738
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||  |||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23793636 ccatcgtgccacgatttttccagtgcctttcc-caaaaaaataaaaactccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 23793734  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  23793735 tttt 23793738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 12555908 - 12555978
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  12555908 agaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccg 12555978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25452555 - 25452498
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  25452555 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25452498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 2298123 - 2298183
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2298123 ctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25445556 - 25445504
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  25445556 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 25445504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 408 - 469
Target Start/End: Original strand, 31179837 - 31179897
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31179837 ccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccacg 31179897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 16092184 - 16092264
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16092184 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactata 16092264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23667590 - 23667526
Alignment:
Q  29 cccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23667590 cccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatga 23667526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 471
Target Start/End: Original strand, 659869 - 659929
Alignment:
Q  409 catcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgtt 471  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||    
T  659869 catcgtgccacgatttttccagtgacttgcctc--aaactgaaacctccaatcgtgccacgtt 659929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 368
Target Start/End: Original strand, 2144899 - 2144954
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaa-atttggaacaaatct 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||    
T  2144899 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcaaataattggaacaaatct 2144954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4897923 - 4897828
Alignment:
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctccc-gtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||    
T  4897923 agagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29748502 - 29748352
Alignment:
Q  133 ttctacccaaagtccc-agcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc-ccaagt-gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcca 229  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| || ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  ||||||| ||   ||||||| |||||||| |     
T  29748502 ttctacccaaagtcccgaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatcct--aaccctactgtttgttgcc 29748405  T
Q  230 aagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  29748404 aagaga---attctctacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgttt 29748352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 31465974 - 31466041
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccct 73  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31465974 agaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagccct 31466041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2723961 - 2723911
Alignment:
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2723961 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 2723911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13295789 - 13295755
Alignment:
Q  238 aattctatacaaaccctagttttgttgttgccttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13295789 aattctatacaaaccctagttttgttgttggcttt 13295755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28786464 - 28786407
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  28786464 ctaattctgcccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 28786407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Original strand, 31179769 - 31179830
Alignment:
Q  360 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  31179769 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttacccgccagcgcaccatcgtgccacgat 31179830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1170967 - 1170926
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1170967 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 1170926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1240488 - 1240428
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| |||||||    
T  1240488 ctaattctacccaaa-tcccagcctcttcccgtgcctaagagactcaatcctaatagtgttt 1240428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15552207 - 15552178
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552207 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15552178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22672991 - 22672950
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22672991 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 22672950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25445653 - 25445612
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25445653 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 25445612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25803988 - 25803959
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803988 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25803959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 31782579 - 31782639
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31782579 ctaattctacccaat-tcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 31782639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 35385477 - 35385518
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35385477 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 35385518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 37705774 - 37705851
Alignment:
Q  16 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | || | |||||||||||||    
T  37705774 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactatatgatga 37705851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9353421 - 9353361
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9353421 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9353361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 15445291 - 15445331
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  15445291 tgacctagtctgggaagagagcagcccttcgttccactata 15445331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36932439 - 36932379
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36932439 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36932379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 135)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6822790
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 94  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             ||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaag 6823207  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  6823206 agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttccca 6823107  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823106 aggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 6823008  T
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttat 393  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6823007 ctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacatttctattat 6822908  T
Q  394 tcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctca-aaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgat 492  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6822907 tcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtgccacgat 6822809  T
Q  493 tctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6822808 tctgcagaaacctgatttt 6822790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 51750339 - 51749793
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  51750339 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 51750240  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  51750239 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 51750140  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750139 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 51750040  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750039 tcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 51749940  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgca---------------------ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctc-aaaaactgaaaccctccatcgt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||                     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51749939 tctgttattcgccgccagcgcactatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaa-cctccatcgt 51749841  T
Q  464 gccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
     |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  51749840 accacgttgcccaaccatcgtgccacgattctgcagaaacttgatttt 51749793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 13762136 - 13761592
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||           
T  13762136 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactatatgatgagtaacgt 13762037  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13762036 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 13761937  T
Q  188 tttcccaagt-gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13761936 ttttccaagttgaatcaacccccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttgttgcctttctaaacccttgttt 13761837  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761836 cagccctctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 13761737  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgca---------------------ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgc 465  Q
    |||||||||||||||||| ||                     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  13761736 ctgttattcgccgccagcacaccatcgtgccgcgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaa-cctccatcatgc 13761638  T
Q  466 cacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13761637 cacgttgcccagccatcgtgccacgattctgcagaaacctgatttt 13761592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 51752663 - 51752119
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||           
T  51752663 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgt 51752564  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  51752563 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatc-taatagtg 51752465  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51752464 tttcacaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaagccctaattttgttgttacctttctaaactcttgttt 51752365  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752364 cagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 51752265  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcac---------------------catcatgccacgatttttccagtgccttgcctc-aaaaactgaaaccctccatcgtg 464  Q
     |||||||||||||||||||||                     |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51752264 atgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcggccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaa-cctccatcgtg 51752166  T
Q  465 ccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51752165 ccacgttgcccaaccatcgtgccacgattctgcagaaacctgatttt 51752119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28840979 - 28840542
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  28840979 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 28840880  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28840879 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 28840780  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28840779 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttcctttctaaacccttgttt 28840680  T
Q  287 cagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgt 384  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28840679 catccccctgtatctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgt 28840580  T
Q  385 ttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  28840579 ttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgat 28840542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 10399809 - 10400245
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  10399809 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 10399908  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  10399909 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 10400008  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10400009 gtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtt 10400108  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400109 tcagccccctctatctcccagtttgctctgatacaaggtctatatttatagaaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 10400208  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  10400209 tatgttatttgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 10400245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 3 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20302756 - 20302323
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||             
T  20302756 gagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatctgatgagtatcgtta 20302657  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20302656 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtt 20302557  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302556 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 20302457  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20302456 gccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaaagtttcacttaaaatttggaacaaatatgcacccaaaaatatgtttct 20302357  T
Q  389 gttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20302356 gttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgat 20302323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15823840 - 15823410
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||                 
T  15823840 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaat 15823741  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  15823740 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcc 15823641  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823640 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 15823541  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15823540 ccctttatctctaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatatgtttctgtt 15823441  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  15823440 atttgctgctagcgcaccatcgtgccacgat 15823410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28842794 - 28842357
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||           
T  28842794 aagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactatatgatgagtaacgt 28842695  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  28842694 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtg 28842595  T
Q  188 tttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842594 tttcccaatgtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 28842495  T
Q  287 cagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgt 384  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  28842494 cagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactcaaaaatatgt 28842395  T
Q  385 ttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  28842394 ttctgtttttcgctgccaggacaccatcgtgccacgat 28842357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 493
Target Start/End: Original strand, 38925468 - 38925965
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgaa----------ga 95  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||  ||          ||    
T  38925468 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgttttactatgatgagtaacgttacaaaaga 38925567  T
Q  96 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  38925568 gatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 38925667  T
Q  196 g-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 294  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38925668 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaactcttgtttcagccccc 38925767  T
Q  295 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttatt 394  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  38925768 tctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaataaatctgcacccaaaaatacacttctgttgtt 38925867  T
Q  395 cgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgatt 493  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||||| |    ||||||  |||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38925868 cgctgccaacgccccatcgtgccacaaaaaatccagtaacttgtctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagccatcgtaccacgatt 38925965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13215375 - 13214947
Alignment:
Q  12 acaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------agag 96  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||             ||||    
T  13215375 acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagag 13215276  T
Q  97 aaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13215275 aaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 13215176  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215175 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 13215076  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13215075 ccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttttgtt 13214976  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    ||| || |||| | ||||||| |||||||    
T  13214975 atttgctgccaacacaccatcgtgccacg 13214947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 92 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 6824087 - 6823643
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaacc-------aagagagtcaatcctaaca 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||       |||||| |||||| ||| |    
T  6824087 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgtaata 6823988  T
Q  185 gtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823987 gtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 6823888  T
Q  284 tttcagccccc-tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatac 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823887 tttcagcccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatac 6823788  T
Q  383 gtttctgttattcgccgccagcgcac---------------------catcatgccacgatttttccagtgccttgcctc-aaaaactgaaaccctccat 460  Q
    |||| |||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6823787 gtttatgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaa-cctccat 6823689  T
Q  461 cgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctg 506  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||    
T  6823688 cgtgccacgttgcccaaccatcgtgccatgattctgcaaaaacctg 6823643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 41647214 - 41646786
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  41647214 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 41647115  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  41647114 agagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcc 41647015  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41647014 caaggtgaatcaaccataaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagcc 41646915  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  41646914 ccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatatgtttctgtt 41646815  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  41646814 attcgctgccagtgcaccatcgtgccacg 41646786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 484
Target Start/End: Original strand, 14097956 - 14098447
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  14097956 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaa 14098055  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  14098056 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 14098155  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||     
T  14098156 ccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgtttcagt 14098255  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14098256 cccctctatctcaaagtttagtttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaac-aatctgcacccaaaaatacgtttatgt 14098354  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgt 484  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||    ||||||| ||||| || ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| || |||||||    
T  14098355 tattcgctgccagcgcaccatcgtgcaacgaaaaatccagtgacttgcgtc-aaagctgaaacctccaatcgtgccacggtgctcaaccatcgt 14098447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 39462813 - 39462385
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgaa------------ 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||                
T  39462813 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgaataacttttcaaa 39462714  T
Q  94 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39462713 agagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 39462614  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  39462613 caaggtgaatcaaccctaaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcatttctaaacctttgtttcagcc 39462514  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccca-aaaatacgtttctgt 390  Q
      |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39462513 ttctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaaatacgtttctgt 39462414  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccac 419  Q
    ||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  39462413 tattcactgcaagcgcaccatcgtgccac 39462385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2617816 - 2617460
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  2617816 aagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 2617717  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  2617716 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 2617617  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2617616 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtt 2617517  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2617516 tcagcctcctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 2617460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 28207055 - 28207481
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat-atgatgaa----------g 94  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||  ||          |    
T  28207055 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatgatgagtaacgttacaaaag 28207154  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    |||  |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  28207155 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttccca 28207254  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28207255 aggtgaataaactctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcccc 28207354  T
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttat 393  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28207355 ctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaaaacgtttatgttat 28207454  T
Q  394 tcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28207455 tcgccgccagcgcaccatcgtgccacg 28207481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16226464 - 16226085
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  16226464 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 16226365  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  16226364 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 16226265  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16226264 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttta 16226165  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  16226164 gacccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatct 16226085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 31735502 - 31735863
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  31735502 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 31735601  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||    
T  31735602 tacaaaagagaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagt 31735701  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735702 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 31735801  T
Q  286 tcagccccctctatc----tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    | |||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735802 ttagccccctctatctcattcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31735863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20291756 - 20291390
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||           
T  20291756 aagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactatatgatgagaatcgt 20291657  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  20291656 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 20291557  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291556 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 20291457  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaa 353  Q
    || | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291456 catctccctctatctcaaaatttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaa 20291390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47180009 - 47179627
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga----------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||               
T  47180009 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttaca 47179910  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgttt 190  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  47179909 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgttt 47179810  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47179809 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcag 47179710  T
Q  290 ccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||    
T  47179709 ccccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatct 47179627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 27336927 - 27337280
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |    
T  27336927 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 27337026  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27337027 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttccc 27337126  T
Q  194 aa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337127 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa-tctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 27337225  T
Q  293 cctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||    |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337226 cctctatctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27337280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 46431687 - 46431996
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg---agagagcagccctccgatccactatatgatga----- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  46431687 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatc 46431786  T
Q  93 -------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacag 185  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  46431787 gttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 46431886  T
Q  186 tgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431887 tgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctacttttgttgttgcctttctaaacccttgt 46431986  T
Q  285 ttcagccccc 294  Q
    ||||||||||    
T  46431987 ttcagccccc 46431996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39932374 - 39932017
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg--agagagcagccctccgatccactatatgatga------ 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||          
T  39932374 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactatatgatgagtatcg 39932275  T
Q  93 -------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacag 185  Q
           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  39932274 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatag 39932175  T
Q  186 tgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932174 tgtttcccaaggttaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 39932075  T
Q  285 ttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  39932074 ttcagccccctctatctctcaaagttttgtctcatacaaggtctatatttatagtaaa 39932017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24325963 - 24325599
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||           
T  24325963 aagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactatatgatgagtaacat 24325864  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  24325863 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 24325764  T
Q  187 gtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24325763 gtttcctaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttct-aacccttgtt 24325665  T
Q  286 tcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325664 tcagccccctctatctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24325599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47177658 - 47177276
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga----------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||               
T  47177658 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttaca 47177559  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtca-atcctaacagtgttt 190  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  47177558 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgttt 47177459  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47177458 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcag 47177359  T
Q  290 ccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||    
T  47177358 ccccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatct 47177276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 420
Target Start/End: Original strand, 3579606 - 3580033
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 94  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| | ||||| |||||||             ||    
T  3579606 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atgatgagtaactttacaaaag 3579704  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||| | |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  3579705 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttccta 3579804  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3579805 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgctgcctttctgaacccttgtttcagcccc 3579904  T
Q  294 --ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
      |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || |    
T  3579905 ccctctatctcaaattttacgctgatacaaggtctatatttaaagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactctaaaatacgtttatgat 3580004  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3580005 attcgccgccagcgcaccatcgtgccacg 3580033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 15294815 - 15295183
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||           
T  15294815 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgt 15294914  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  15294915 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 15295014  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295015 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 15295114  T
Q  286 tcagccccctcta--------------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    ||||||| |||||              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15295115 tcagccctctctatctctctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 15295183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 56 - 340
Target Start/End: Original strand, 21948225 - 21948526
Alignment:
Q  56 tggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21948225 tggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 21948324  T
Q  143 agtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattc 242  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21948325 agtcccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactc 21948424  T
Q  243 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagta 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  21948425 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagta 21948524  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  21948525 aa 21948526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 27339118 - 27339472
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||            |    
T  27339118 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 27339217  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||    
T  27339218 gagaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttccc 27339317  T
Q  194 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27339318 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaagcccttgtttcagccc 27339417  T
Q  293 cctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||    |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339418 cctctatctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27339472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47906564 - 47906207
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||                 
T  47906564 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaa 47906465  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  47906464 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttct 47906365  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47906364 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 47906265  T
Q  292 ccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906264 ccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 47906207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47451917 - 47451512
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------aagagaaatcaatgggttac 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | || | ||||||||||||             ||||||  |||||| |||||    
T  47451917 tgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttac 47451818  T
Q  112 aagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcct-aacagtgtttcccaagtgaatcaacccaca 210  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||      |  | |||||||||||| ||    
T  47451817 aagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaaaca------ctaatgtgaatcaaccctca 47451724  T
Q  211 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttg 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  47451723 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattccaaacccttgtttaagccccctctatctcaaagttta 47451624  T
Q  311 ctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcacca 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  47451623 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaatatttggaacaaatctgcaccaaaaaatacgtttctgttattcgctgtcagcgcacca 47451524  T
Q  411 tcatgccacgat 422  Q
    || |||||||||    
T  47451523 tcgtgccacgat 47451512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 17324623 - 17324974
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  17324623 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 17324722  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17324723 agagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 17324822  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17324823 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgttttagcc 17324922  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||| |||||  | |||| || || | |||||||||||||||||||||||||    
T  17324923 ccctgtatcttcaggtttactctggttcaaggtctatatttatagtaaaagt 17324974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 9463227 - 9463588
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  9463227 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgtta 9463326  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgt 188  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9463327 caaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgt 9463426  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463427 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 9463526  T
Q  288 agccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463527 agccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 9463588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 2510308 - 2510666
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||             
T  2510308 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacttta 2510407  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  2510408 caagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 2510506  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2510507 ttccaaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgtttc 2510606  T
Q  288 agccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510607 agccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2510666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 9459400 - 9459761
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  9459400 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgtta 9459499  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgt 188  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9459500 caaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgt 9459599  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9459600 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgtttc 9459699  T
Q  288 agccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459700 agccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 9459761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18307403 - 18307054
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||                 
T  18307403 agaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaa 18307304  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18307303 agagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18307204  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307203 cgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 18307104  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18307103 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaa 18307054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 50307540 - 50307884
Alignment:
Q  14 aaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaa 99  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||             |||||      
T  50307540 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatg 50307639  T
Q  100 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tg 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50307640 tcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 50307739  T
Q  199 aatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  50307740 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttttttcagccccatat 50307839  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  50307840 atctcaaggtttactttgatacaaagcttatatttatagtaaaag 50307884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 6995687 - 6996038
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  6995687 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaa 6995786  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  6995787 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcc 6995886  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6995887 caaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcggcc 6995986  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6995987 ccctctatctcaagatttactctgattcaaggtctatatttataataaaagt 6996038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 12302492 - 12302848
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  12302492 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 12302591  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12302592 agagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 12302691  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12302692 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagcc 12302791  T
Q  292 ccctcta----tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||    |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302792 ccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 12302848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 50076659 - 50077009
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||                 
T  50076659 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 50076758  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  50076759 agagatatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 50076858  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50076859 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagcc 50076958  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |  |||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50076959 ctttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50077009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 17186114 - 17186465
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||                
T  17186114 agaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaa 17186213  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  17186214 aagagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttc 17186313  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17186314 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagc 17186413  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  17186414 cccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaatctatatttatattaaaag 17186465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48665373 - 48665114
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttcc-ggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48665373 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 48665274  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca- 288  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48665273 ctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaa 48665174  T
Q  289 -----gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
          |||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48665173 ccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 48665114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16428948 - 16428569
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||                
T  16428948 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaa 16428849  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  16428848 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 16428749  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428748 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 16428649  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctg 369  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||    
T  16428648 cccctctatctaatggtttgctctgatataaaacctatatttatagtaaaagtatcccttataaaattcgaacaaatctg 16428569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 389
Target Start/End: Original strand, 9241072 - 9241470
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  9241072 agaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 9241171  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| | |||||     
T  9241172 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttt 9241271  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag- 289  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9241272 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagc 9241370  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||  | |  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9241371 ccccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagtaacccccataaaattggaacaaatctg-acccaaaaatacgtttct 9241469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18839882 - 18839531
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | ||||||| ||||||                
T  18839882 agaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 18839783  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18839782 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18839683  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18839682 ccaaggtgaatcaaccctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctatctaaacccttgtttcagc 18839583  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||  |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18839582 cccctctatctcatggtttacaataatacaatgtctatatttatagtaaaag 18839531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 28998240 - 28998591
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||| |||||||||                 
T  28998240 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaa 28998339  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28998340 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28998439  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28998440 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcc 28998539  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
     ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28998540 tcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 28998591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 29003956 - 29004307
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||| |||||||||                 
T  29003956 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaa 29004055  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29004056 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 29004155  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29004156 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcc 29004255  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
     ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29004256 tcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 29004307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31490206 - 31489859
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa------------- 93  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||                 
T  31490206 agaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggggagagcagccctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaa 31490107  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  31490106 gagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttccc 31490007  T
Q  194 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31490006 aaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaa--ctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcaaccc 31489909  T
Q  293 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31489908 cctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 31489859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 50078807 - 50079158
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatgaa----------- 93  Q
    |||||||||||||||||  | ||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||               
T  50078807 agaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaataactttacaa 50078906  T
Q  94 --gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||     
T  50078907 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttt 50079006  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  50079007 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcagc 50079106  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50079107 cccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 50079158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 11457462 - 11457812
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||                 
T  11457462 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 11457561  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  11457562 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 11457661  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11457662 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcagcc 11457761  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11457762 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 11457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 321
Target Start/End: Original strand, 31425002 - 31425335
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||                 
T  31425002 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggagagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaa 31425101  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag---tcaatcctaacagtgtt 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||    |||||||||| ||||||    
T  31425102 agagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgtt 31425201  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425202 ttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 31425301  T
Q  288 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaa 321  Q
    |||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  31425302 agccccctttatctcaaggtttacattgatacaa 31425335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 2949219 - 2949569
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||             |    
T  2949219 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaa 2949318  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    ||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2949319 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttccc 2949418  T
Q  194 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2949419 aaggtgaatcaaccatcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccc 2949518  T
Q  293 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  2949519 cctctatctcaaggttttctcggattcaatatctatatttattgtaaaagt 2949569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Original strand, 4131362 - 4131676
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  4131362 agaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 4131461  T
Q  93 -agagaaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
     |||||||    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4131462 aagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 4131560  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4131561 tttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaatccttgttt 4131660  T
Q  287 cagccccctctatctc 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  4131661 cagccccctctatctc 4131676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Original strand, 25251261 - 25251611
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | | ||||||| |||| |                
T  25251261 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaa 25251360  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  25251361 aagatatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttc 25251460  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25251461 ctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacctttgtttcagc 25251560  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25251561 cccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 25251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17319181 - 17318838
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||                 
T  17319181 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaa 17319082  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| ||||||||      ||||||    
T  17319081 agagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatcct------gtttcc 17318988  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318987 caaggtgaatcaaccttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 17318888  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||||||    
T  17318887 ccctctatctcaaggtttactatgatacaaaacctatatttatagtaaaa 17318838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 100 - 342
Target Start/End: Original strand, 50248666 - 50248909
Alignment:
Q  100 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  50248666 tcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 50248765  T
Q  199 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  50248766 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaatcatagttttgttgttgtctttttaaacctttgtttcagctccctcta 50248865  T
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50248866 tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50248909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 100 - 379
Target Start/End: Original strand, 31422967 - 31423248
Alignment:
Q  100 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  31422967 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtg 31423066  T
Q  199 aatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    |||||||   |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423067 aatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 31423166  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 379  Q
    ||||||| |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||| || |  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31423167 atctcaaggtttacactgatacaatgcttatatttatagtaaaagtatctcccataaaattggaacaaatctg-acccaaaaa 31423248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6756721 - 6756470
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  6756721 aagagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagac--tcaatcctaatagtgtttc 6756624  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6756623 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttcag 6756524  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
     ||||||||| |||| |||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6756523 tcccctctatttcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagcaaaagt 6756470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25128167 - 25127856
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || |||| ||||||                
T  25128167 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaa 25128068  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  25128067 aagagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttc 25127968  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25127967 acaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagg 25127868  T
Q  291 cccctctatctc 302  Q
    ||||||||||||    
T  25127867 cccctctatctc 25127856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17324258 - 17324009
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||  ||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17324258 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttc 17324159  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  17324158 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataaaaatc--agttttgttgtggcctttctgaacccttgttttagc 17324061  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || ||||||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17324060 cctctctatctcaaggtttactctaatacaaagtctatatttataataaaag 17324009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 42922425 - 42922138
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  42922425 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 42922326  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
     ||| |||||||||||    |||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  42922325 gcaaggtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaac 42922230  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 381  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  42922229 cccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaatctcagcccaaaaata 42922138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40134239 - 40133937
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||                
T  40134239 agaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 40134140  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||  ||| ||||    
T  40134139 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttc 40134040  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40134039 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaattctatacaaaccttcgttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 40133940  T
Q  291 ccc 293  Q
    |||    
T  40133939 ccc 40133937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51757830 - 51757623
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||           
T  51757830 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgt 51757731  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  51757730 tacaaagagaaatcgataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 51757631  T
Q  188 tttcccaa 195  Q
    ||||||||    
T  51757630 tttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Original strand, 8347359 - 8347607
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||| || | ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8347359 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttc 8347458  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    | || |||||||||||  | |||| | ||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  8347459 ctaaggtgaatcaacc--ctaaccttggtgtttgttgccaagag-caatctctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaac 8347554  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8347555 cccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctat-tttatagtaaaagt 8347607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 14183678 - 14183923
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |  ||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||     
T  14183678 aagagatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgtttt 14183777  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14183778 ccaaggtgaatcaacccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagtttg--tgttgcatt-ctaaacccttgtttcagc 14183871  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14183872 cctctctatctcaaggtttactctgatacatggtctatatttatagtaaaag 14183923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16231641 - 16231517
Alignment:
Q  246 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttt 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16231641 acaaaccctagttttcttgttgcttttctagacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtct 16231542  T
Q  346 cgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  16231541 tgcttaaaatctgtaacaaatctgc 16231517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 343
Target Start/End: Original strand, 15669481 - 15669729
Alignment:
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15669481 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 15669580  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagc 290  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| || |||| | | ||||||| | |||||||    
T  15669581 caaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctacttttg-tgctgcc-tcccaaaccctagttttcagc 15669675  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||| ||| |||| | | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15669676 cccctctatcccaatgtttacatctgctacaaggtctgtatttatagtaaaagt 15669729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Original strand, 18800659 - 18800907
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |  |||| || || ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  18800659 aagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttc 18800758  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
     || | |||||||||||   ||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  18800759 tcagggtgaatcaacccc--aaccctagtatttgtggccaagag-caaactctatacaaaccgtagttttcttgttgactt-ctaaacctttgtttcagc 18800854  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800855 cccttgtatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18800907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16231834 - 16231630
Alignment:
Q  30 ccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaa 116  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||    
T  16231834 ccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaa 16231735  T
Q  117 taagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaacc 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16231734 taagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 16231635  T
Q  215 ctagt 219  Q
    |||||    
T  16231634 ctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16432690 - 16432396
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga----------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||               
T  16432690 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattaca 16432591  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  16432590 aaagagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgttt 16432491  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16432490 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtcgccaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttctg 16432402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 330 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 49687496 - 49687345
Alignment:
Q  330 tttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttcca 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    ||||    
T  49687496 tttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgtcagcgcaccatcgtgccacgaaaaatcca 49687397  T
Q  430 gtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatc 482  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
T  49687396 gtgacttgcctc-aaaactgaaacctccaattgtgccacgttgcccagccatc 49687345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 270 - 419
Target Start/End: Original strand, 30790658 - 30790808
Alignment:
Q  270 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30790658 tttctaaactcttgttttcagctccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatct 30790757  T
Q  369 gcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccac 419  Q
    ||||  |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  30790758 gcactgaaaaatacgtttatgtttttcccctccagcgcaccatcgtgccac 30790808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 369
Target Start/End: Original strand, 8349138 - 8349414
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||| || ||||  | | |||||||||| ||||||||    
T  8349138 aagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgtttc 8349237  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8349238 ccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccttaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagc 8349333  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctg 369  Q
    || ||||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||| | || || | ||| ||||||||||||||    
T  8349334 cctctctatctcaaggtttgcatctaatacaagatctatatttataataaaattatccctcataaaattggaacaaatctg 8349414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23786136 - 23785935
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||   |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  23786136 agaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 23786037  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23786036 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 23785937  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  23785936 tc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16429252 - 16429047
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||                
T  16429252 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaa 16429153  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  16429152 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttc 16429053  T
Q  192 ccaagt 197  Q
    ||||||    
T  16429052 ccaagt 16429047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Original strand, 49495297 - 49495537
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| | || ||||| ||| |||||  ||  ||||||||    
T  49495297 aagagatatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttc 49495396  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||| ||   ||| ||||||||||| | ||||| |||| | ||| |||||||||||||  ||        | |||||||||||||||||    
T  49495397 ccaaggtgaatcaactca---accatagtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaaccctagtttgatt--------tataaacccttgtttcagc 49495484  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49495485 cccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 49495537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16231518 - 16231368
Alignment:
Q  347 gcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaa 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| | || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  16231518 gcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcccaaaaaa 16231420  T
Q  447 ctgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcag 499  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  16231419 ct-aaaacctccatcgtgccacgttgcccagccgtcgtgccacgattctgcag 16231368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 25248540 - 25248766
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------a 93  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||| | ||||             |    
T  25248540 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaa 25248639  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  25248640 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttcc 25248739  T
Q  194 aa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 219  Q
    || |||||||||||| |||||||||||    
T  25248740 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23816180 - 23816027
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||             |    
T  23816180 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaa 23816081  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23816080 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 247 - 341
Target Start/End: Original strand, 25248756 - 25248850
Alignment:
Q  247 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  25248756 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttctagaaaaa 25248850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13358873 - 13358784
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatga 89  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358873 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatga 13358784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 336
Target Start/End: Original strand, 13125544 - 13125787
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  13125544 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgttt 13125643  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctata-caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||| |||||||||||    |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||    
T  13125644 cccaatgtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgtcgccaagag-caaactctataccaaaccctagtttccttgttggc-ttcttaacccttgtttca 13125739  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 336  Q
    ||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  13125740 gccccctttctctcaagttttactctgatacaaggtttctatttatag 13125787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16226004 - 16225902
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  16226004 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccaaccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 16225906  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  16225905 tttt 16225902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 47179545 - 47179443
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  47179545 ccatcgtgccacgattttttcagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 47179447  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  47179446 tttt 47179443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 336
Target Start/End: Original strand, 26520206 - 26520449
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaac------caagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||      ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  26520206 atcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 26520305  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cag 289  Q
    ||||| ||||||||||    || | ||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  26520306 ccaaggtgaatcaacctc--aatcttagtgtttgttgccaagag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttgactt-ctaaaccgttgttttcag 26520401  T
Q  290 cccc-ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 336  Q
    |||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  26520402 cccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatag 26520449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 47177194 - 47177093
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  47177194 ccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcc-caaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagtcgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 47177097  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  47177096 tttt 47177093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 6115089 - 6115304
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||                
T  6115089 agaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttacaa 6115188  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  6115189 aagagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 6115288  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacc 206  Q
     ||| |||||||||||    
T  6115289 tcaaggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 420 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20291386 - 20291295
Alignment:
Q  420 gatttttccagtgccttgcctcaaaaa-ctgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  20291386 gatttttccagtgccatgcctcaaaaaactgaaacc-tccaccgtgccacgttgccttgccatcgtgccacgattctgcagaaatctgatttt 20291295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 421 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20302303 - 20302213
Alignment:
Q  421 atttttccagtgccttgcctca-aaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |  | |||||||||||||| ||||||||    
T  20302303 atttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgccttgccatcatgccgcgattctgcagaaatctgatttt 20302213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23783355 - 23783253
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23783355 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 23783257  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  23783256 tttt 23783253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23783533 - 23783467
Alignment:
Q  304 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  23783533 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 23783467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27916652 - 27916415
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  |   ||||||||||||||||     
T  27916652 ctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaatcaattcc--aaccctagtgtttgttg 27916555  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca--gccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggt 324  Q
    | ||||| |||| ||||  |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    || | || | ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  27916554 ccaagag-caaactcta--caaaccctagttttcttgctggctt-ctaaacccttgttttctggctctctgtttctcacagtttacatttgatacaatgt 27916459  T
Q  325 ctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||    
T  27916458 ctatatttatagtaaaagtatccctccaaaattggaacaaatct 27916415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 368
Target Start/End: Original strand, 26613503 - 26613603
Alignment:
Q  271 ttctaaacccttgttt-cagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatc 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||| ||||||||||||    
T  26613503 ttctaaacccttgttttcagccccctctatctctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatagcaaaagaatccctcaaaaattggaacaaatc 26613602  T
Q  368 t 368  Q
    |    
T  26613603 t 26613603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 155864 - 155788
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  155864 ctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 511
Target Start/End: Original strand, 10400268 - 10400354
Alignment:
Q  424 tttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  10400268 tttccagtgctttgcctcaaact-tgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagcaatcgtgccacgattccgcagaaacctgatttt 10400354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 408 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 28842350 - 28842265
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||    
T  28842350 ccatcgtgccacgatttttccagtaccttgcct-aaaaactgaaacctccaatcgtgccacgtagccttgccatcgtgccacgattc 28842265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 204
Target Start/End: Original strand, 30738716 - 30738830
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| |||||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30738716 aagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 30738815  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaa 204  Q
     |||| |||||||||    
T  30738816 tccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2232657 - 2232597
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2232657 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 196
Target Start/End: Original strand, 30790487 - 30790591
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||| |   ||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  30790487 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaaccaaaagactc-atcctaacagtgttt 30790585  T
Q  191 cccaag 196  Q
    ||||||    
T  30790586 cccaag 30790591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15916665 - 15916605
Alignment:
Q  28 acccagtccggtccaaa-ttgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15916665 acccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 15916605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 31422851 - 31422915
Alignment:
Q  11 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctc 74  Q
    |||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31422851 cacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctc 31422915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 309
Target Start/End: Original strand, 6115344 - 6115383
Alignment:
Q  270 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagttt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6115344 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttt 6115383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 13447254 - 13447301
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattga 48  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  13447254 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16431096 - 16431017
Alignment:
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctg 369  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  16431096 cccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaacctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctg 16431017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 2401343 - 2401400
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  2401343 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2401400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9526526 - 9526469
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  9526526 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 9526469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 21353468 - 21353525
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  21353468 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25134131 - 25134074
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  25134131 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 204
Target Start/End: Original strand, 26613326 - 26613440
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||| | ||  ||||||| || |||||| || ||||||| || |||||||    
T  26613326 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtgttt 26613425  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaa 204  Q
    ||||| |||||||||    
T  26613426 cccaaggtgaatcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 43104131 - 43104053
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgct-taaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||||||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  43104131 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcaaaaaactggaacaaatctaagcccaaaaatatgtttctgtt 43104053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 336
Target Start/End: Original strand, 13127837 - 13127959
Alignment:
Q  211 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttg 310  Q
    |||||||||||||||| | || ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||     
T  13127837 aaccctagtgtttgttgccaaaagg-aaactctatataaaccctacttttcttgttggctt-ctaaacccttgtttca-acccctctctctaaaggttta 13127933  T
Q  311 ctttgatacaaggtctatatttatag 336  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||    
T  13127934 ctccgatacaaggtttatatttatag 13127959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14997100 - 14997040
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14997100 ctaattctacccaa-gtctcaatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 28840522 - 28840450
Alignment:
Q  421 atttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  28840522 atttttccagtaccttgcct-aaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgccttgccatcgtgccacgattc 28840450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 2393308 - 2393348
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2393308 tgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 2393348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Original strand, 50248557 - 50248617
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 66  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50248557 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagag 50248617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13214920 - 13214854
Alignment:
Q  426 tccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgatt 493  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  13214920 tccagtgacttgcctcaaaa-ctgaaacctccaatcgtgccacgttgcccaaccatcgtgccacgatt 13214854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17324349 - 17324278
Alignment:
Q  16 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  17324349 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactata 17324278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 46783010 - 46782919
Alignment:
Q  328 tatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccac 419  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||  |||| | | |||||||| || |||  |||||  ||||||||||||    
T  46783010 tatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatatgcacttaaaagtgcatttctgttttttgccttcagcgttccatcatgccac 46782919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155921
Alignment:
Q  44 attgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  155963 attgacctagtttggggagagagcagccatccgttccactata 155921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 2401494 - 2401568
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagta-aaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttc 387  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  2401494 tgatacaaggcttatatttatagtggaaagtatcccttaaaatatggaacaaatcttcactgaaaaatacgtttc 2401568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6756822 - 6756741
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||| | |||||||    
T  6756822 agaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactata 6756741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9521775 - 9521718
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||    
T  9521775 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 9521718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 14183581 - 14183658
Alignment:
Q  11 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||| |||||  | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  14183581 cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata 14183658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 21353373 - 21353414
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21353373 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 21353414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27916752 - 27916711
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27916752 tgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 27916711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 342
Target Start/End: Original strand, 30738890 - 30738963
Alignment:
Q  270 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30738890 tttctaaacccttgttttcagtcacctgtatctcaaggtttcatctgatacaaggactatgtttatagtaaaag 30738963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 46432037 - 46432066
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432037 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 46432066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49959016 - 49958963
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||||||||||||||    
T  49959016 tgatacaaggtctatatttatagcaaaagcatcccacaaaatttggaacaaatc 49958963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 9476269 - 9476329
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9476269 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 9476329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 13598406 - 13598466
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  13598406 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 13598466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16124605 - 16124545
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    |||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16124605 tgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 16124545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 29651819 - 29651879
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  29651819 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactat 29651879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 37069778 - 37069838
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  37069778 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactat 37069838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 47704025 - 47703965
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  47704025 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 47703965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 141)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 494
Target Start/End: Original strand, 1049283 - 1049781
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------aga 95  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||            |||    
T  1049283 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaga 1049382  T
Q  96 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  1049383 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaa 1049482  T
Q  196 g-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 294  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049483 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 1049582  T
Q  295 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttatt 394  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049583 tctatctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttatt 1049682  T
Q  395 cgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  1049683 cgccgccagcgcaccttcgtgccacgatttttccagtaccttgcttc-aaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagcaatcgtgccacgattc 1049781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 40836722 - 40837246
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  40836722 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 40836821  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40836822 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 40836921  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40836922 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttcttt 40837021  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaaatacgtt 385  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  40837022 cagccccctcaatctccaaatttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaaatatgtt 40837121  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgta 485  Q
    ||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  40837122 tctatttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgtccgaccatcgtg 40837220  T
Q  486 tcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  40837221 ccacgattctgcagaaacctgatttt 40837246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35939 - 35503
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||           
T  35939 aagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgt 35840  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||    
T  35839 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagt 35740  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35739 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgtctttctgaacccttgtt 35640  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35639 tcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 35540  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||| |||| || |||||||||| |||  ||||||||    
T  35539 tctgctatttgctgccagcgcacgatcgggccacgat 35503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 104 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 26804765 - 26804360
Alignment:
Q  104 tgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26804765 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 26804666  T
Q  203 aacccacaaacccta---gtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 299  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804665 aaccctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 26804566  T
Q  300 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccg 399  Q
    |||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  26804565 ctcaaagtttact----cacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtttctgttatttgctg 26804471  T
Q  400 ccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcag 499  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  26804470 ccagcgcaccatcgtgccacgatttttccactgccttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtaccacgttgcccagccatcgtgccacgattctgtag 26804372  T
Q  500 aaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||    
T  26804371 aaacctgatttt 26804360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 421
Target Start/End: Original strand, 27306224 - 27306643
Alignment:
Q  16 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatc 101  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||             ||||| |||    
T  27306224 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatc 27306323  T
Q  102 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaa 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27306324 aatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27306423  T
Q  201 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 300  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306424 tcaaccctcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctata-aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27306522  T
Q  301 tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgc 400  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27306523 tcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgc 27306622  T
Q  401 cagcgcaccatcatgccacga 421  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  27306623 tagcgcaccatcgtgccacga 27306643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3878887 - 3878446
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  3878887 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 3878788  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  3878787 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 3878688  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3878687 gtttaccaaggtgaatcaacccacaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtt 3878588  T
Q  286 tcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctat----atttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 379  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3878587 tcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatattaatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaa 3878489  T
Q  380 tacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  3878488 tacgtttctgttattcgctgccagcgtaccatcgtgccacgat 3878446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44874 - 44438
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||           
T  44874 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactatatgatgagtaacgt 44775  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||    
T  44774 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagt 44675  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44674 gtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 44575  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44574 tcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggtacaaatctgcacccaaaaatatgtt 44475  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  44474 tatgttatttgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 44438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25542838 - 25542404
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  25542838 aagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgt 25542739  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||     
T  25542738 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtc 25542639  T
Q  188 tttcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25542638 tttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacctttgtttc 25542539  T
Q  288 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcac-ccaaaaatacgttt 386  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||    
T  25542538 ag-cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaataaatctacactcaaaaaatatgttt 25542440  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25542439 ctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 25542404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 418
Target Start/End: Original strand, 31435031 - 31435458
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  31435031 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 31435130  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31435131 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 31435230  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435231 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 31435330  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacc-caaaaatacgtttctg 389  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  31435331 cccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaac-aatttgcaccaaaaaaatacgtttctg 31435429  T
Q  390 ttattcgccgccagcgcaccatcatgcca 418  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  31435430 ttattcgttgccagcgcaccatcgtgcca 31435458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38394296 - 38393935
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38394296 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 38394197  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  38394196 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 38394097  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394096 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 38393997  T
Q  286 tcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393996 tcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38393935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 7470001 - 7470359
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           
T  7470001 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 7470100  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  7470101 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 7470200  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470201 gtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 7470300  T
Q  286 tcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    |||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7470301 tcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7470359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 7471959 - 7472317
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||           
T  7471959 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgt 7472058  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  7472059 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 7472158  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7472159 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtt 7472258  T
Q  286 tcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    |||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7472259 tcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7472317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48457963 - 48457602
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  48457963 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgt 48457864  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  48457863 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 48457764  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457763 gtttccctaggtgaatgaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 48457664  T
Q  286 tcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48457663 tcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 48457602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44724883 - 44724533
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  44724883 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 44724784  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44724783 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 44724684  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724683 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 44724584  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||| |||||| | |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44724583 ccctatatctccaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 44724533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 366
Target Start/End: Original strand, 31155892 - 31156271
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||             
T  31155892 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgtta 31155991  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 188  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  31155992 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgt 31156091  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156092 ttcccaaggtgaatcaacccacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 31156191  T
Q  288 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaat 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  31156192 agccccctctatctcaaagtttgccttgatacaagctctatatttatagtaaaagtatagctcataaatttggaacaaat 31156271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3036034 - 3035670
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  3036034 aagagaggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgt 3035935  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttc---cggtaaccaagagagtcaatcctaac 183  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||     
T  3035934 tgcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 3035835  T
Q  184 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035834 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 3035735  T
Q  283 gtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035734 gtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3035670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20626342 - 20625990
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20626342 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 20626243  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20626242 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20626143  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626142 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 20626043  T
Q  292 ccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    |||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20626042 ccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaa 20625990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20630233 - 20629881
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20630233 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 20630134  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20630133 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20630034  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630033 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 20629934  T
Q  292 ccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    |||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20629933 ccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaa 20629881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20642652 - 20642300
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20642652 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 20642553  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20642552 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20642453  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642452 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 20642353  T
Q  292 ccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    |||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20642352 ccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaa 20642300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20299769 - 20299407
Alignment:
Q  2 agagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||            
T  20299769 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactatatgatgagtaacgtt 20299670  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20299669 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 20299570  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaa-ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc-ttgt 284  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  20299569 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgt 20299470  T
Q  285 ttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299469 ttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 20299407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40946635 - 40946277
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||              
T  40946635 agaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtaacgttac 40946536  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  40946535 aaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtt 40946436  T
Q  190 tcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946435 ttccaaagtaaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 40946336  T
Q  289 gccccctct----atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||     |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  40946335 gccccctctgtccctctcaaagtttgctatgaaacaaggtttatatttatagtgaaagt 40946277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Original strand, 1046912 - 1047219
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------aga 95  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||            |||    
T  1046912 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaga 1047011  T
Q  96 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1047012 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 1047111  T
Q  196 g-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1047112 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccc 1047211  T
Q  295 tctatctc 302  Q
    ||||||||    
T  1047212 tctatctc 1047219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1850291 - 1849975
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  1850291 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 1850192  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |||    
T  1850191 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagt 1850092  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1850091 gttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtt 1849992  T
Q  286 tcagccccctctatctc 302  Q
    |||||||||||||||||    
T  1849991 tcagccccctctatctc 1849975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18345851 - 18345490
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||           
T  18345851 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 18345752  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||    
T  18345751 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagt 18345652  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345651 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 18345552  T
Q  286 tcagccccctctat----ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||| ||||||||||    |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345551 tcaaccccctctatctccctcaaagttcagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 13099459 - 13099812
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||                
T  13099459 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 13099558  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  13099559 aaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgttt 13099658  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  13099659 cccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaa 13099758  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13099759 ccccctctatctcaaggtttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 13099812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 20137094 - 20137444
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||                 
T  20137094 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaa 20137193  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  20137194 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttcc 20137293  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137294 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 20137393  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  20137394 ccctctatctcaaggtttactctgatacaaagccaatatttatagtaaaag 20137444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20297670 - 20297311
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  20297670 gagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgtta 20297571  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20297570 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 20297471  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20297470 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgccattctaaacccttgtttc 20297371  T
Q  288 agccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||    |||||||    |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20297370 agccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtccatatttttagtaaaagt 20297311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Original strand, 37412110 - 37412462
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||                
T  37412110 agaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaa 37412209  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
      ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37412210 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 37412309  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc-aaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37412310 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttca 37412409  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||| |||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37412410 gccccctatatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 37412462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Original strand, 7351634 - 7351994
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  7351634 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 7351733  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  7351734 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 7351833  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351834 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 7351933  T
Q  289 gccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||      |||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7351934 gccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 7351994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21680232 - 21679981
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21680232 aagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 21680133  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680132 ccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 21680033  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21680032 cccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 21679981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11355562 - 11355212
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||                 
T  11355562 agaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactatatgatgagaaacgttacaaa 11355463  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11355462 aaagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 11355363  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355362 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 11355263  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11355262 ccctctatctcaaggtttacactgatacaaagcctatatttatagtaaaag 11355212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 42330982 - 42331335
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| | |||||||| ||||                 
T  42330982 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactatataatgagtaactttacaaa 42331081  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggt--aaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42331082 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42331181  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42331182 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag 42331281  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42331282 ccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 42331335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 443900 - 443548
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg--agagagcagccctccgatccactatatgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || | |||||||||||||                
T  443900 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttataa 443801  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  443800 aagagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttc 443701  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  443700 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccattgttttagc 443601  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
     ||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  443600 tccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 443548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28487860 - 28487502
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||              
T  28487860 agaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactatatgatgagtaacgttac 28487761  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28487760 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 28487661  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28487660 tccaaaggtgaatcaacccacgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttca 28487561  T
Q  289 gccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||    |||||||    ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28487560 gccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacatggtctatatttataggaaaagt 28487502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 343
Target Start/End: Original strand, 7349287 - 7349615
Alignment:
Q  36 cggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtc 122  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349287 cggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc 7349386  T
Q  123 tcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7349387 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtg 7349486  T
Q  221 tttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgcttt 314  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||    |    
T  7349487 tttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcct 7349586  T
Q  315 gatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349587 gatacaaggtctatatttatagtaaaagt 7349615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 43253496 - 43253860
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||           
T  43253496 aagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgt 43253595  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||    
T  43253596 tacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagagactcaatcctaatagt 43253695  T
Q  187 gtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  43253696 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaaccttgtt 43253794  T
Q  286 tcagcc--------ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||        | |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253795 tcagccctctttctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43253860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24748899 - 24748548
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||                
T  24748899 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 24748800  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  24748799 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttc 24748700  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24748699 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagc 24748600  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||  ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24748599 cccctctaagtcaaagtttacactgatacaatgtctatatttataataaaag 24748548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28485875 - 28485515
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||            
T  28485875 aagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgaggagagagcaaccctctgattcattatatgatgagtaacgtt 28485776  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28485775 acaaaagagaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 28485676  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485675 tttccaaaggtgaatcaacccgcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 28485576  T
Q  287 cagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    || |||| ||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485575 caaccccttctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 28485515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11757435 - 11757177
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11757435 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 11757336  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaa-ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc-ttgtttca 288  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  11757335 ccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgtttca 11757236  T
Q  289 gccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757235 gccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11757177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 4295919 - 4296271
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||||                 
T  4295919 agaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 4296018  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4296019 agagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 4296118  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4296119 caaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 4296218  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatac-aaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4296219 cccctctatctcaaggtttacactgatacaaatgtctatatttatagtaaaag 4296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 179 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567491
Alignment:
Q  179 ctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 277  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 18567632  T
Q  278 cccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacc-caa 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||    
T  18567631 cccttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaac-aatttgcaccaaaa 18567533  T
Q  377 aaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgcca 418  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  18567532 aaatacgtttctgttattcgttgccagcgcaccatcgtgcca 18567491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21990454 - 21990106
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||                 
T  21990454 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 21990355  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  21990354 agagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttct 21990255  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  21990254 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-c 21990156  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21990155 ccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 21990106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25276346 - 25276095
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25276346 aagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 25276247  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||    
T  25276246 ccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaattattgttttagc 25276147  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25276146 cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 25276095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21678264 - 21678020
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  21678264 atcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 21678165  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678164 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgatgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 21678065  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21678064 atctcaaggtttacattgatacaatatctatatttatagtaaaag 21678020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Original strand, 21592128 - 21592445
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  21592128 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 21592227  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| | |||||||| |||| || |    
T  21592228 agagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgc 21592327  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21592328 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctttgtttcagcc 21592427  T
Q  292 ccctctatctcaaagttt 309  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21592428 ccctctatctcaaagttt 21592445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9679361 - 9679009
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 94  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||||             ||    
T  9679361 aacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaag 9679262  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9679261 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 9679162  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    || |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  9679161 aggtgaatcaatcctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccc 9679063  T
Q  293 cctctatctc----aaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||||||    ||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9679062 cctctatctctctcaaagtttacatctgatacaagatctatatttatagtaaaa 9679009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9681124 - 9680768
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||                 
T  9681124 agaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaa 9681025  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9681024 agatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 9680925  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9680924 cgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaac 9680825  T
Q  291 cccctcta----tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||    |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680824 cccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 9680768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 358
Target Start/End: Original strand, 22251641 - 22251893
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||| |    
T  22251641 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta--------tcccaaggt 22251732  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22251733 gaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcctcctct 22251832  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttg 358  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22251833 atctcaaagtttactctgattcaaggtttatatttatagtaaaagtgtcgcttaaaatttg 22251893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 39146071 - 39146322
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||     
T  39146071 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttt 39146170  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39146171 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgtttcagc 39146270  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||| ||||||| |||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39146271 cccctccatctcaaggtttacactgatacagtgtctatatttatagtaaaag 39146322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 92 - 391
Target Start/End: Original strand, 22828717 - 22829018
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  22828717 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 22828816  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    | ||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828817 ctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagc 22828916  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    |||||||||||||| |||| ||  ||||||| | ||||||||||||||||||| || || | |||  ||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  22828917 cccctctatctcaaggtttactcggatacaaagcctatatttatagtaaaagtatccctcataaaactggaacaaatctaggcccgaaaatacgtttctg 22829016  T
Q  390 tt 391  Q
    ||    
T  22829017 tt 22829018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 27832716 - 27832969
Alignment:
Q  91 gaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27832716 gaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27832815  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27832816 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatgttgccaagagacaaactctatacaaaccttagttctgttgttgcctttttaaacccttgtttcag 27832915  T
Q  290 c-cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    | || ||||||| ||| ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||    
T  27832916 ctccactctatcacaaggtttgctctgatacacaacctatatttatagtaaaag 27832969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 7092192 - 7092431
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            
T  7092192 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacatt 7092291  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||     
T  7092292 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagta 7092391  T
Q  188 tttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 226  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7092392 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 7092431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38396944 - 38396713
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||           
T  38396944 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactatatgatgagtaaagt 38396845  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  38396844 tacaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtg 38396745  T
Q  188 tttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctag 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38396744 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 92 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24258668 - 24258423
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||  || |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  24258668 aagagatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 24258569  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258568 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 24258469  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 336  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||||||||    
T  24258468 cccctctatctcaatgtttactctgatacaaaacctatatttatag 24258423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42223462 - 42223110
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||                 
T  42223462 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgagtaacgttacaaa 42223363  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  42223362 agagatatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 42223263  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  42223262 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcatc 42223163  T
Q  291 cc-cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || | |||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42223162 ccacatctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 42223110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22392606 - 22392357
Alignment:
Q  152 ctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaa 250  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| | || || |||||||||||||||    
T  22392606 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca---accctagtgtttgttgccaatag-caaattctatacaaa 22392511  T
Q  251 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctt 350  Q
    |||||||||  ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22392510 ccctagtttgatt--------tataaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgctt 22392419  T
Q  351 aaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatc 412  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22392418 acaatttggaacaaatctgcactgaaaaatacatttctgttttttgcctccagcgcaccatc 22392357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7188737 - 7188445
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  7188737 atcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggt 7188638  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7188637 gaatcaacccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaaccctatacaaaccctatttttattgttgactt-ctaaacccttgtttcagccccctct 7188542  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttat 393  Q
    ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  7188541 atctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctcagcccaaaaatacgtttatgttat 7188445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 7094439 - 7094678
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||           
T  7094439 aagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacat 7094538  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||    
T  7094539 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagt 7094638  T
Q  187 gtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 226  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7094639 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta-tgtttgtt 7094678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 391
Target Start/End: Original strand, 20091629 - 20091926
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  20091629 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttc 20091728  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 289  Q
    |||| |||||||||||  | ||||||| | |||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||    
T  20091729 ccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcc-tccgaaacccttgttttcag 20091823  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   ||  |||||||||||||    
T  20091824 ccccctctatctcaaggtttactctgataaaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctaggcctgaaaatacgtttct 20091923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 340
Target Start/End: Original strand, 24817438 - 24817682
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg-ttt 190  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| | || |||    
T  24817438 aagagacatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgcttt 24817537  T
Q  191 cccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    || | ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||     
T  24817538 ccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttgac-ttctaaacccttgtttcag- 24817631  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24817632 cccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatattaaa 24817682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2935575 - 2935374
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||   |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  2935575 agaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 2935476  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  2935475 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 2935376  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  2935375 tc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22137384 - 22137184
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  22137384 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 22137285  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22137284 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 22137186  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  22137185 tc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 267
Target Start/End: Original strand, 24813593 - 24813755
Alignment:
Q  102 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  24813593 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaa 24813692  T
Q  201 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttg 267  Q
    |||||||   ||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24813693 tcaaccc---aaccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 24813755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40552411 - 40552211
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  40552411 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 40552312  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  40552311 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 40552213  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  40552212 tc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22108373 - 22108173
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg----------- 91  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  22108373 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 22108274  T
Q  92 -aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22108273 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 22108175  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  22108174 tc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40550133 - 40549933
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg----------- 91  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  40550133 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 40550034  T
Q  92 -aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  40550033 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 40549935  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  40549934 tc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24465735 - 24465503
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gt 197  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  24465735 atcaatgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggt 24465636  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    |||||||  |   |||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24465635 gaatcaattc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctct 24465548  T
Q  298 atctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||| |||| | | |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24465547 atctcaaggtttacatctgatacaaagtctatatctatagtaaaa 24465503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1606686 - 1606486
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||   |||||  ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  1606686 agaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 1606587  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1606586 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 1606488  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  1606487 tc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 9027176 - 9027376
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||| |  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||              
T  9027176 agaagaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttac 9027275  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  9027276 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 9027374  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  9027375 tc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 1047386 - 1047488
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  1047386 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 1047484  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  1047485 tttt 1047488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 340
Target Start/End: Original strand, 7094662 - 7094759
Alignment:
Q  247 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7094662 caaaccctatgtttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaa 7094759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 340
Target Start/End: Original strand, 7092414 - 7092512
Alignment:
Q  247 caaaccctagt-tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7092414 caaaccctagtgtttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctccatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7092512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38396370 - 38396316
Alignment:
Q  242 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396370 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 38396316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3878433 - 3878337
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  3878433 tgccacgatttttccagtgctttgcctcaaact-tgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagccatcgtgccacgattctgcagaaatctgatttt 3878337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 45366526 - 45366446
Alignment:
Q  316 atacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcg 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  45366526 atacaaggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcactgaaaaatacgtttctgtttttcg 45366446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2935187 - 2935085
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2935187 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagccgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 2935089  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  2935088 tttt 2935085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 9027570 - 9027672
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  9027570 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagccgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 9027668  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  9027669 tttt 9027672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1606472 - 1606423
Alignment:
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606472 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 1606423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 11759436 - 11759364
Alignment:
Q  2 agagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccct 73  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11759436 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccct 11759364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22108158 - 22108087
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  22108158 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 22108087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22136995 - 22136893
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22136995 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 22136897  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  22136896 tttt 22136893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22137169 - 22137098
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  22137169 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 22137098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22394027 - 22393876
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||                
T  22394027 agaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 22393928  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaa 143  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22393927 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 22393876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40549918 - 40549847
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  40549918 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 40549847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 40552022 - 40551920
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40552022 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 40551924  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  40551923 tttt 40551920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40552196 - 40552125
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  40552196 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 40552125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11081651 - 11081522
Alignment:
Q  152 ctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaa 250  Q
    ||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    |||||||||||||||| | ||||||   ||||| ||||||    
T  11081651 ctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaatctc--aaccctagtgtttgttgccaagaga---attctctacaaa 11081557  T
Q  251 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11081556 ccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgttt 11081522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Original strand, 9027396 - 9027467
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  9027396 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 9027467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22107984 - 22107882
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22107984 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctgcatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 22107886  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  22107885 tttt 22107882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 40549744 - 40549642
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40549744 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctgcatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 40549646  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  40549645 tttt 40549642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2935349 - 2935279
Alignment:
Q  300 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  2935349 ctcagagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 2935279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6348987 - 6348933
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 146  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6348987 aagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 6348933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26295652 - 26295598
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26295652 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 26295598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Original strand, 27306657 - 27306752
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||    
T  27306657 tgccacgatttttccaatgacttgcctcaaaa-ctgaaacctccaatcgtgccacgttgtccagccatcgtgccacgattttgca-aaaccttatttt 27306752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 55956 - 56015
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55956 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctccaatccactat 56015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3677301 - 3677235
Alignment:
Q  274 taaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3677301 taaacccttgtttcagcccc-tctatctccaagtttactctgattcaagatctatatttatagtaaaa 3677235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6049038 - 6048885
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc--ccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 226  Q
    ||||||||| |||||||| ||   |||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||  | | ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  6049038 ctaattctatccaaagtctcaatatcttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcc-caaacc-tagtgtttgtt 6048941  T
Q  227 ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
     | ||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  6048940 gccaagaga---attctttacaaaccctagttttgatgttggc-ttctaaacccttgttt 6048885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25542391 - 25542322
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgt 484  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  25542391 tgccacgatttttcaagtgccttgccttaaaa-ctgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagcaatcgt 25542322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2120959 - 2120899
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2120959 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2120899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 3320172 - 3320232
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3320172 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 3324920 - 3324980
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3324920 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7069840 - 7069780
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7069840 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7074847 - 7074787
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7074847 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 204
Target Start/End: Original strand, 16297145 - 16297222
Alignment:
Q  128 tctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  16297145 tctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25351413 - 25351353
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25351413 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25357107 - 25357047
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25357107 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25405453 - 25405393
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25405453 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25410190 - 25410130
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25410190 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42006723 - 42006663
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42006723 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1849962 - 1849918
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1849962 tctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtaaaagt 1849918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 26804814 - 26804762
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg 59  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26804814 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctggg 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6348903 - 6348778
Alignment:
Q  211 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagttt 309  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  6348903 aaccctaatgtttgttgccaagag-caaactcgatacaaaccctagttttcttttttactt-ctaaacccttgttttcagtcctctctatctcaatgttt 6348806  T
Q  310 gctt-tgatacaaggtctatatttatag 336  Q
     | | ||||||||||| |||||||||||    
T  6348805 acatctgatacaaggtttatatttatag 6348778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 343
Target Start/End: Original strand, 30906327 - 30906386
Alignment:
Q  284 tttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30906327 tttcagccccctctatctcaagatttactcttatacaaggtctatatttatagcaaaagt 30906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 35496 - 35411
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  35496 ccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcctc-aaacttgaaacctccaatcgtgccacgttgcctagcaatcgtgccacgattc 35411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30247030 - 30246973
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  30247030 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 30246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 44512647 - 44512704
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  44512647 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44512704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Original strand, 1047238 - 1047295
Alignment:
Q  313 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  1047238 ttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 1047295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 8378626 - 8378686
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  8378626 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 15541117 - 15541177
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15541117 ctaattatacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 187
Target Start/End: Original strand, 44143997 - 44144045
Alignment:
Q  139 ccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  44143997 ccaaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44144045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 46516399 - 46516339
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46516399 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 46516339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 9190097 - 9190038
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 84  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9190097 tgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccacta 9190038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Original strand, 20284097 - 20284156
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 84  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20284097 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 20284156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21678361 - 21678286
Alignment:
Q  16 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgat 90  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  21678361 aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactatatgat 21678286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24258742 - 24258691
Alignment:
Q  36 cggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24258742 cggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactata 24258691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26210709 - 26210500
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtccc-agcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc-ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 225  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||| ||    
T  26210709 ctaattctaccgaaagtcccgaatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaatc-acaa-ccctagtgtt-gt 26210613  T
Q  226 tccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggt 324  Q
    | | ||||||   ||||| |||||||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||  ||||| || |||||| |||| | ||||||||||| |    
T  26210612 tgccaagaga---attctctacaaaccctagttttgaggttggatt-ctaaaaccttgtttcctccccc-ctctctcaaggtttacatttgatacaagtt 26210518  T
Q  325 ctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  26210517 ctatatttatactaaaag 26210500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 39145971 - 39146018
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagt 54  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39145971 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagt 39146018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6332425 - 6332179
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccc-gtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg-tt 189  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||| ||  ||||||  || ||||||||| |||||| ||| |||| ||    
T  6332425 aagagatattaaagggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 6332326  T
Q  190 tcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgt-tgcctttctaaacccttgttt-c 287  Q
    ||| || |||||||| |    || ||||||||||||| | |||||  ||| |||||  ||||||||| | |||||| ||  ||| ||||||||||||| |    
T  6332325 tccaaactgaatcaatc--tcaatcctagtgtttgttgccaagag-taaactctat--aaaccctag-tctgttgtatg--tttataaacccttgtttcc 6332234  T
Q  288 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||| |||| ||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6332233 agccccctctctctc-aaggttactctgatacaagttttatatttatagtaaaagt 6332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21680307 - 21680245
Alignment:
Q  31 cagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  21680307 cagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactatatgatga 21680245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 34546985 - 34547042
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  34546985 ctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 34547042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 42006545 - 42006468
Alignment:
Q  316 atacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttatt 394  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  42006545 atacacggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatatggaacaaatcttca-ctgaaaatacgtttatgttatt 42006468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2121056 - 2121015
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2121056 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 2121015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 3320076 - 3320117
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3320076 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3320117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 3324824 - 3324865
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3324824 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3324865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 5817353 - 5817300
Alignment:
Q  31 cagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 84  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5817353 cagttcggtccaatatgacctactctggggagagagcagctctccaatccacta 5817300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25405549 - 25405508
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25405549 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 25405508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38396268 - 38396239
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396268 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38396239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Original strand, 6067180 - 6067264
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  6067180 agaagaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactata 6067264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 21983292 - 21983352
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  21983292 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 21983352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 29159811 - 29159871
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29159811 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 29159871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 44143892 - 44143932
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  44143892 tgacctagtctggggagagagcaactctccgttccactata 44143932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 184)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170193
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 11170579  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  11170578 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcc 11170479  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170478 caaggtgaatcaatccgcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 11170379  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11170378 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtt 11170279  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagc 478  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11170278 attcgccgccagcgcacaatcgagccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaccgaaa-cctccatcgtgccacgttgcccagc 11170193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5191931 - 5191497
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||            
T  5191931 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagaacagccctctgatccactatatgatgagtatcgtt 5191832  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5191831 acaaagagaaatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 5191732  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191731 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 5191632  T
Q  288 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttc 387  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5191631 agccccctctatctccaagtttgcttagatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttc 5191532  T
Q  388 tgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5191531 tgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 5191497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 3 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3859805 - 3859372
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||             
T  3859805 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactatatgatgagtattgtta 3859706  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3859705 caaagagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3859606  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859605 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 3859506  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3859505 gccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttat 3859406  T
Q  389 gttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3859405 attattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgat 3859372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 7 - 511
Target Start/End: Original strand, 18096883 - 18097407
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||                 
T  18096883 agaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 18096982  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18096983 agggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18097082  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18097083 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagcc 18097182  T
Q  292 ccctctatctc-aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097183 ccctctatctctcaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 18097282  T
Q  391 tattcgccgcca----gcg-caccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgta 485  Q
    ||||||||||||    ||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||     
T  18097283 tattcgccgccactatgcgaccccatcgtgccacgatttttcctatgccttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagccatcgtg 18097381  T
Q  486 tcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
T  18097382 ccacgattttgcagaaacctgatttt 18097407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 22114282 - 22114827
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | || ||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||           
T  22114282 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattatatgatgagtaacgt 22114381  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  22114382 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 22114481  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22114482 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtt 22114581  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114582 tcagccccttctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 22114681  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg---------------------atttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtg 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22114682 tctgttattcgccgccatcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacaatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaa-cctccatcgtg 22114780  T
Q  465 ccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  22114781 ccacgttgcccaaccatcgtgccacgattctacagaaacctgatttt 22114827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 38890320 - 38889782
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38890320 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 38890221  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  38890220 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 38890121  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890120 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtt 38890021  T
Q  286 tcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgg---------------------- 359  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
T  38890020 tcagccccctctatctctctcaaagtttgct---atacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcttaaaatctgt 38889924  T
Q  360 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctcca 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38889923 aacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatttttccaatgccttgcctaaaaaactgaaa-cctcca 38889825  T
Q  460 tcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaa 502  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38889824 tcgtgccacgttgccttgccatcgtaccacgattctgcagaaa 38889782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 7 - 511
Target Start/End: Original strand, 18099153 - 18099692
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  18099153 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaa 18099252  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18099253 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18099352  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18099353 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 18099452  T
Q  292 ccctctatctc-aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18099453 ccctctatctctcaagtttactctgatacaaggtctata-ttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctat 18099551  T
Q  391 tattcgccgccagcgca---------------------ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacg 469  Q
    | |||||||||||||||                     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  18099552 tgttcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccacg 18099650  T
Q  470 ttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  18099651 ttgcccagccatcgtgccacgattttgcagaaacctgatttt 18099692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 10084366 - 10084806
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  10084366 aagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 10084465  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||    
T  10084466 tacaaaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagt 10084565  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10084566 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgtt 10084665  T
Q  286 tcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 381  Q
     ||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10084666 ccagccccctctatctctctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaata 10084765  T
Q  382 cgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10084766 tgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 10084806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 5522604 - 5523028
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  5522604 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 5522703  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5522704 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 5522803  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522804 tttcccaaggtaaatcaacccacaaacccgagtgtttgttccgaagagacaa-----------accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 5522892  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5522893 cagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgcactcaaaaatatgttt 5522992  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5522993 ctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 5523028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 102 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777178
Alignment:
Q  102 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tga 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  200 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777487 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 35777388  T
Q  300 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccg 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| || || |    
T  35777387 ctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttatgtt-tttgctg 35777289  T
Q  400 ccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcag 499  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  35777288 ccagcgcaccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccacgttgcccagctgtcgtgccacgattctgcag 35777190  T
Q  500 aaacctgatttt 511  Q
    ||| || |||||    
T  35777189 aaatctaatttt 35777178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 45883214 - 45882785
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||                
T  45883214 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 45883115  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45883114 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 45883015  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883014 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 45882915  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45882914 cccctctatctcatagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaattttcaacaaatctgcacccaaaaataggtttctgt 45882815  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    ||||||  | |||||||||||| |||||||    
T  45882814 tattcgttgtcagcgcaccatcgtgccacg 45882785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 468
Target Start/End: Original strand, 6065775 - 6066254
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||             
T  6065775 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtttcgtta 6065874  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 188  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  6065875 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 6065974  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065975 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 6066074  T
Q  288 ag-ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6066075 agcccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctgtaacaaatctgctcccaaaaatacattt 6066174  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccac 468  Q
     | || ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6066175 -tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgtttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccac 6066254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 10956004 - 10956440
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  10956004 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgt 10956103  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |    
T  10956104 tacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataat 10956203  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10956204 gtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtt 10956303  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10956304 tcagccccctctatcttcatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattgcttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatacgtt 10956403  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10956404 tatgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 10956440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 198 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11162923
Alignment:
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 11163119  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgc 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163118 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatcgtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgc 11163019  T
Q  398 cgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  11163018 cgccagcgcaccatcgtgccacaatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgcccagcaatcgtgccacgattc 11162923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 10958300 - 10958736
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||           
T  10958300 aagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgaagagtaacgt 10958399  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  10958400 tacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagt 10958499  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10958500 gtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtt 10958599  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10958600 tcagccccctctatctttatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattgcttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatacgtt 10958699  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  10958700 tctgttattggctgccagcgcaccatcgtgccacgat 10958736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26720827 - 26720392
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||           
T  26720827 aagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactatatgatgagtatcgt 26720728  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||    
T  26720727 tacaaaagagaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt 26720628  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
     |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26720627 -taacccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatt 26720529  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  26720528 tcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcactaaaaaatatgtt 26720429  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  26720428 tctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgat 26720392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 4308264 - 4308615
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  4308264 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 4308363  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4308364 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 4308463  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308464 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 4308563  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4308564 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 4308615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18162937 - 18162492
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  18162937 agaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaa 18162839  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     | | | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18162838 aataaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18162739  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18162738 ccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttcaaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatc 18162639  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    ||  |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162638 cc--tctatctccaagtttactcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 18162541  T
Q  390 ttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgc 438  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  18162540 ttattcgctgccagcgcaccatcgtggcacgatttttccagtgacttgc 18162492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 10191289 - 10191726
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  10191289 aagagaagaacacaata--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 10191386  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          |||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||    
T  10191387 tacaaaagagaaatgaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagt 10191485  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10191486 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgtt 10191585  T
Q  286 tcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 381  Q
     ||||||||| ||||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10191586 ccagccccctttatctctctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactcaaaaata 10191685  T
Q  382 cgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10191686 tgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 10191726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 32264021 - 32264454
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  32264021 agaacacaaaagaattgt-tgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 32264119  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32264120 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttt 32264219  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32264220 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgag 32264319  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtt----tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    |||||||||||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  32264320 ccccctctatctcaaagttaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatatgtt 32264419  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32264420 tctgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacg 32264454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43228565 - 43228214
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  43228565 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 43228466  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43228465 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 43228366  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43228365 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcc 43228266  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43228265 ccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagt 43228214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 4103873 - 4104233
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||           
T  4103873 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 4103972  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4103973 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 4104072  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104073 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 4104172  T
Q  287 cagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104173 cagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 4104233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 493
Target Start/End: Original strand, 48361654 - 48362153
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||| ||||                 
T  48361654 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatattatgagtaacgttgcaaa 48361753  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  48361754 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcc 48361853  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  48361854 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacc-ttgtttcagcc 48361952  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  48361953 ccctgtatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatacgtttctgct 48362052  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacga 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    || |||  |||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  48362053 attcgctgccagcgcaccatcatgccacgaaaaatctagttacttgcctc-aaaactgaaacttccaatcgtgccacgttgcccaaccatcgtgccacga 48362151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43226350 - 43226009
Alignment:
Q  16 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatc 101  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||    
T  43226350 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 43226251  T
Q  102 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43226250 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 43226151  T
Q  201 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226150 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaa-cgtagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 43226052  T
Q  301 tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43226051 tccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagt 43226009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 51726984 - 51727340
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||           
T  51726984 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgt 51727083  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    
T  51727084 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 51727183  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727184 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc-agtgtttgttccaaagagacaaactctatacataccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 51727282  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51727283 tcagccccctttatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 51727340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 370
Target Start/End: Original strand, 6063425 - 6063809
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    ||||||||||||||  |||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  6063425 gagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgtta 6063524  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 188  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  6063525 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 6063624  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063625 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 6063724  T
Q  288 agccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  6063725 agccccctctatctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 6063809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24979982 - 24979552
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||                 
T  24979982 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaa 24979883  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     | ||| || |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  24979882 aaaagatattaatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttc 24979783  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24979782 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagc 24979683  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  24979682 cccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtatatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcaccaaaaaatatgtttatgt 24979583  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacga 421  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  24979582 tattcgctaccagcgtaccatcgtgccacga 24979552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25533720 - 25533357
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  25533720 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 25533621  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  25533620 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 25533521  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533520 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 25533421  T
Q  288 agccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||        |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533420 agccccctctatctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25533357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50494276 - 50493895
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  50494276 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 50494177  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  50494176 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 50494077  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50494076 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 50493977  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  50493976 gccccctctatctctcagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 50493895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 391
Target Start/End: Original strand, 12267958 - 12268348
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgaaga--gaaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  |  |  |  ||    
T  12267958 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 12268057  T
Q  104 tgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatc 202  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  12268058 agagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatc 12268157  T
Q  203 aacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagtttt-gttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12268158 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagctccctctatc 12268257  T
Q  301 tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  12268258 tcaaagtttactctgatacaagttctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactgaaaaatacgtctctgtt 12268348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 30006115 - 30005805
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  30006115 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 30006016  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30006015 agagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcc 30005916  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005915 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 30005816  T
Q  292 ccctctatctc 302  Q
    |||||||||||    
T  30005815 ccctctatctc 30005805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42990578 - 42990268
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||                 
T  42990578 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaaa 42990479  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42990478 agagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 42990379  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990378 caaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 42990279  T
Q  292 ccctctatctc 302  Q
    |||||||||||    
T  42990278 ccctctatctc 42990268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1313683 - 1313333
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  1313683 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 1313584  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  1313583 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcc 1313484  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  1313483 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattgtaaa-ccttgtttcagcc 1313385  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1313384 ccctctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 1313333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 1626666 - 1627016
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  1626666 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 1626765  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  1626766 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 1626865  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1626866 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 1626965  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1626966 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 1627016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 99 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15781039 - 15780747
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |    
T  15781039 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccaaggt 15780940  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaatt-----------ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15780939 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 15780840  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 379  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780839 cagccccctctatctccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 15780747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 27101164 - 27101519
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||                 
T  27101164 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaa 27101263  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27101264 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 27101363  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101364 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 27101463  T
Q  292 ccctctatctcaa----agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
     |||||||||| |    | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27101464 tcctctatctctatctcaatttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 27101519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 458561 - 458203
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  458561 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 458462  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  458461 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 458362  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458361 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 458262  T
Q  289 gccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||    |||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458261 gccccctctatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 458203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 747034 - 746674
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||              
T  747034 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttac 746935  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  746934 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 746835  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  746834 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 746735  T
Q  289 gccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746734 gccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 746674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3314959 - 3314608
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatgaa----------- 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||               
T  3314959 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaa 3314860  T
Q  94 --gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3314859 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 3314760  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3314759 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttatttcagc 3314660  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3314659 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 3314608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 53917647 - 53917998
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  53917647 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 53917746  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  53917747 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 53917846  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  53917847 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccattgtttcagcc 53917946  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||| ||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53917947 ccctccatctcaaggtttaatctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 53917998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 43423446 - 43423796
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||                 
T  43423446 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 43423545  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43423546 agagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 43423645  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423646 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 43423745  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||| |||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43423746 ccctctttctcaaggtttacagtgatacaatgtctatatttatagtaaaag 43423796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 92 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6561985 - 6561740
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6561985 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 6561886  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561885 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 6561786  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 336  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6561785 cccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 6561740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 456184 - 455826
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  456184 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 456085  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  456084 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 455985  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455984 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 455885  T
Q  289 gccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||    |||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455884 gccccctctatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 455826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 32219359 - 32218851
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||                 
T  32219359 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaa 32219260  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  32219259 aaaagatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttc 32219160  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32219159 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttacaaagagacaaactcta-----------gttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagc 32219071  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32219070 cccctctatctcaaagtttagtcagatacaaggtctatatttatactgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctct 32218971  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacg 490  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||     ||||| | |||||||| |||  |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  32218970 tattcgctgccagcgcaccatcgtgccacggaaaatccagcgacttgcctc-aaagttgaaacctccaatcgtgccacgttgcccaatcatcgtgccacg 32218872  T
Q  491 a-ttctgcagaaacctgatttt 511  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  32218871 atttctgcag-aacctgatttt 32218851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25389185 - 25388794
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  25389185 aagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 25389086  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagt 186  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  25389085 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagt 25388986  T
Q  187 gtttcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25388985 gtttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 25388886  T
Q  287 cagccccctctatctc---------aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| | |||| ||||          ||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  25388885 cagctctctctctctctctctctctcaaaatagc-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 25388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1321759 - 1321483
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  1321759 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 1321660  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  1321659 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagt 1321560  T
Q  187 gtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgt 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1321559 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccgagttttgt 1321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 9604590 - 9604946
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  9604590 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 9604689  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9604690 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 9604789  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9604790 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagcc 9604888  T
Q  292 ccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||      ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9604889 ccctctatctctctctcagagttttctctaatacaaggtctatatttatagtgaaagt 9604946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 28101985 - 28102335
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctag-tctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |                 
T  28101985 agaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactatatgataagtaactttacaaa 28102084  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  28102085 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcc 28102184  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102185 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 28102284  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||| | || || | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  28102285 ccctctatctcaagggttactctaatacaacgcttatatttatagtaaaag 28102335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Original strand, 43421398 - 43421747
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | |||||||||||||                 
T  43421398 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 43421497  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  43421498 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcc 43421597  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43421598 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacc 43421697  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    || |||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43421698 ccttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 43421747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 53915479 - 53915830
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||                 
T  53915479 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaa 53915578  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||     
T  53915579 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttca 53915678  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  53915679 caaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgtcatcctaaacccttgtttcagcc 53915778  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||| || |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53915779 ccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 53915830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 10621510 - 10621823
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  10621510 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac 10621609  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  10621610 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 10621709  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10621710 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 10621809  T
Q  289 gccccctctatctc 302  Q
    || |||||||||||    
T  10621810 gcaccctctatctc 10621823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 880434 - 880785
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||                 
T  880434 agaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactatatgatgagtaactttacaaa 880533  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  880534 agagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttcc 880633  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  880634 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaactcttgtttcaga 880733  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  880734 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 880785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38210646 - 38210265
Alignment:
Q  5 gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga----------- 92  Q
    ||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||               
T  38210646 gaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttaca 38210547  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgttt 190  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  38210546 aagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgttt 38210447  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38210446 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcag 38210347  T
Q  290 ccccctctatctc---aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctg 369  Q
    |||||||||||||    ||  | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||    
T  38210346 ccccctctatctctctcaaaatagc-ctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctg 38210265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 51943644 - 51943294
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||                 
T  51943644 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 51943545  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  51943544 agagacgtcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 51943446  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  51943445 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagca 51943346  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51943345 ccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 51943294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Original strand, 35918025 - 35918283
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  35918025 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttc 35918124  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgt------ttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 284  Q
     |||| ||||||||||| ||||| |||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918125 gcaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 35918224  T
Q  285 ttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35918225 ttcagccccctctatctcaaaatttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 35918283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 5926755 - 5927097
Alignment:
Q  15 aaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaat 100  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | || ||||||||||             ||| | ||    
T  5926755 aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatat 5926854  T
Q  101 caatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagt-ga 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  5926855 aaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcga 5926954  T
Q  200 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5926955 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccctctctat 5927054  T
Q  300 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||| |||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5927055 ctcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaag 5927097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36012101 - 36011751
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||                 
T  36012101 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 36012002  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  36012001 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttcc 36011902  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36011901 caacgtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccttagtttcgttgttgtctttctaaatccttgtttcagcc 36011802  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||| |||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36011801 ccctttatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 36011751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 92 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29956861 - 29956650
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29956861 aagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 29956762  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29956761 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgtttcagc 29956662  T
Q  291 cccctctatctc 302  Q
    ||||||||||||    
T  29956661 cccctctatctc 29956650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 53468436 - 53468788
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagt--ctggggag-agagcagccctccgatccactata-tgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||              
T  53468436 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttac 53468535  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53468536 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtt 53468635  T
Q  190 tcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    |||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53468636 tcccaaggtgaatcaatgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaa-cctggttttgttgttgccattctaaacccttgtttca 53468734  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||| ||||| || |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53468735 gccccctttatctaaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 53468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39715644 - 39715393
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39715644 aagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 39715545  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  39715544 tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaaccctagttttggtgttgcctctctaaacccttatttcag- 39715446  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39715445 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagt 39715393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Original strand, 28413011 - 28413299
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttat-gacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| | | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  28413011 agaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgtta 28413110  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgt 188  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  28413111 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgt 28413210  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28413211 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaa 28413299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 7606567 - 7606822
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||             
T  7606567 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgtta 7606666  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7606667 caaatagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 7606766  T
Q  190 tcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattcta 244  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7606767 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100374
Alignment:
Q  112 aagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccaca 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  211 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttg 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  28100243 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaagggtta 28100342  T
Q  311 ctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  28100343 ctctgatacaacgcttatatttatagtaaaag 28100374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 47148977 - 47149233
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  47148977 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 47149076  T
Q  192 ccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    | | |||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149077 caaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 47149176  T
Q  291 cccctctatctc----aaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||    || |  | | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149177 cccctctatctccctcaaggcctacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 47149233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Original strand, 47148878 - 47149188
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 92  Q
    |||||||| || |||||  ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||             |    
T  47148878 agaacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaaa 47148977  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  47148978 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 47149077  T
Q  193 caagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg-ttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
     | |||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149078 aaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 47149177  T
Q  292 ccctctatctc 302  Q
    |||||||||||    
T  47149178 ccctctatctc 47149188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 92 - 393
Target Start/End: Original strand, 28761511 - 28761813
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||   |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  28761511 aagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 28761610  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28761611 ccaaggtgaatcaactctcaaacccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcaac 28761709  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaac-aaatctgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| || || | || ||||||| ||||||   |||||||||| |||| ||    
T  28761710 cccctctatctcaaggtttactctgatgcaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaatctcagcccaaaaatatgtttttg 28761809  T
Q  390 ttat 393  Q
    ||||    
T  28761810 ttat 28761813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Original strand, 51674749 - 51675087
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||                 
T  51674749 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtatatgatgagtaacattacaaa 51674848  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  51674849 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 51674948  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |           ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51674949 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaaggg-----------acaaaccttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcc 51675037  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51675038 ccctctatctcaacgtttacattgatacaacgtctatatttatagtaaaa 51675087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 107 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28180948
Alignment:
Q  107 gttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaac 205  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaac 28181083  T
Q  206 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaa 305  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||     
T  28181082 cctcaaatcccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc--tatttcagccccctctatctcaag 28180985  T
Q  306 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28180984 gtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 28180948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23633727 - 23633332
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||            |    
T  23633727 agaacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctggggagagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaa 23633628  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23633627 gagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 23633528  T
Q  194 aagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
      || ||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||||     
T  23633527 -ggtaaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaatccttgttttagccct 23633433  T
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtta 392  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   | | |||||||||||||||||    
T  23633432 ctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctaggctcgaaaatacgtttctgtta 23633333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42992544 - 42992205
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||                 
T  42992544 agaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaa 42992445  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||               ||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  42992444 agagaaatcaatgagttacaagaataa---------------ctacccaaagtcc-actctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttct 42992361  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42992360 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagcc 42992261  T
Q  292 ccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42992260 ccctctatctctcttaaagtttagcatgatacaaggtatatatttatagtaaaagt 42992205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 342
Target Start/End: Original strand, 889779 - 890104
Alignment:
Q  30 ccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaaga 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||||             ||||| |||| ||||||||||||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaaga 889878  T
Q  116 ataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacc 214  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  889879 ataactctcctgcctaattctacccaaagccccaac-tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacc 889977  T
Q  215 ctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctt 313  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |      
T  889978 ccagtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaaccctaggttt--tgttgccattctaaacccttgtttcagcttcctctatctcaaggtttacac 890075  T
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  890076 tgatacaatatctatatttatagtaaaag 890104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 266 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1321441 - 1321285
Alignment:
Q  266 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1321441 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaa 1321342  T
Q  366 tctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  1321341 tctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgat 1321285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 54691656 - 54691906
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || |  |||||||  ||||||| | | |||||||||| ||||||||    
T  54691656 aagagatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttc 54691755  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |    
T  54691756 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtcgcctttctaaaaccttgtttta-c 54691854  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54691855 cccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 54691906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Original strand, 25688143 - 25688367
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------- 91  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||                  
T  25688143 agaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaa 25688242  T
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25688243 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 25688342  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccc 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||    
T  25688343 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 163 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177126
Alignment:
Q  163 accaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttg 261  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccc--aaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttc 24177284  T
Q  262 ttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgga 360  Q
    |||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  24177283 ttgttgacat-ctaaactcttgttttcagccccctctagctcaatgtttactatgatacaaggtctatatttataataaaagtatcccttaaaatttgga 24177185  T
Q  361 acaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccac 419  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  24177184 acaaatctgcacttaaaaatacgtttatgtttttcgcctccaacgcaccatcgtgccac 24177126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5886472 - 5886261
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |    
T  5886472 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtttcaaa 5886373  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||     
T  5886372 gacaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcca 5886273  T
Q  194 aagtgaatcaac 205  Q
    | ||||||||||    
T  5886272 aggtgaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5899945 - 5899734
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |    
T  5899945 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttgcaaa 5899846  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||     
T  5899845 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcca 5899746  T
Q  194 aagtgaatcaac 205  Q
    | ||||||||||    
T  5899745 aggtgaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31151507 - 31151271
Alignment:
Q  105 gggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatca 203  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31151507 gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 31151408  T
Q  204 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 302  Q
    |||  | |||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31151407 acc--ccaaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttctaaacccttgttttcagccccctctatctc 31151312  T
Q  303 aaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
     | |||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31151311 gaggtttacatctgatacaaagtctatatttatagtaaaag 31151271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23637198 - 23636899
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||  | | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23637198 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtttc 23637099  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
     ||| || ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  23637098 tcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgttttagc 23637003  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    | |||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||| ||||| | || || | ||| ||| |||||||||   || ||||||| |||||||    
T  23637002 ctcctctatctcaaggtttactctgatacaaagtatatatttatattaaaattatccctcataaaattgaaacaaatctaggccgaaaaatatgtttctg 23636903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 53591438 - 53591119
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa-------------gagaaatcaatgggttaca 112  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||              |||| |||||||| ||| |    
T  53591438 tgacctagttcgatccaaattgacctagtctggggagagagcatcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatggattaga 53591339  T
Q  113 agaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  || |||  |||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  53591338 agaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 53591239  T
Q  212 accctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  53591238 accctagtgtttgttctaaagaga-----------caaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctcaaggtttac 53591150  T
Q  312 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
      | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53591149 acttatacaatgtctatatttatagtaaaag 53591119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6484634 - 6484372
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  6484634 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 6484535  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  6484534 aaagatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcc 6484435  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccc 253  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  || |||||| || |||||||||| |||| ||||||||    
T  6484434 caaggtgaatcaaccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaaccc 6484372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 342
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137628
Alignment:
Q  119 agtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacccta 217  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  218 gtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgat 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  28137515 gtgtttgttcccaagagacaaactcta-----------gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgat 28137603  T
Q  318 acaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||| |  |||||||||||||||||    
T  28137604 acaacgcatatatttatagtaaaag 28137628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11168381 - 11168172
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |           
T  11168381 aagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatatatgataagtaacgt 11168282  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||    
T  11168281 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagt 11168182  T
Q  187 gtttcccaag 196  Q
    ||||||||||    
T  11168181 gtttcccaag 11168172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Original strand, 13420268 - 13420506
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13420268 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 13420367  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||||||| |   |||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||          |||||||||||||||||    
T  13420368 ccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgttgcctagaga-aaactctatacaaaccctagtttgatt----------taaacccttgtttcagc 13420453  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13420454 ctcctatatctcaaggtttgctttgatacaaaacctatatttatagtaaaagt 13420506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 212 - 342
Target Start/End: Original strand, 47701798 - 47701928
Alignment:
Q  212 accctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc 311  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  47701798 accctggtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttac 47701897  T
Q  312 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47701898 actgatacaatgtctatatttatagtaaaag 47701928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 54884329 - 54884081
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||  ||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  54884329 aagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 54884231  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54884230 ccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactcta--caaattctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttcgagc 54884133  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
     ||||||||||||| |||| |  |||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  54884132 tccctctatctcaaggtttacaatgatccaatgtttatatttatggtaaaag 54884081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849117
Alignment:
Q  175 aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc 273  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttattc 41849145  T
Q  274 taaacccttgtttcagccccctctatct 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849144 taaacccttgtttcagccccctctatct 41849117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 347 - 511
Target Start/End: Original strand, 6719471 - 6719636
Alignment:
Q  347 gcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaa 446  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6719471 gcttaaaatctgtatcaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatttttccagtgcattgcct-aaaaa 6719569  T
Q  447 ctgaaacc-ctcc-atcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||  | |||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  6719570 ctgaaacctctccaatcgtgccacgatgcccttcaatcgtgccacgattaagcagaaacctgatttt 6719636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4666788 - 4666488
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||                 
T  4666788 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctggggagag--cagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaa 4666691  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataag--tctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||    
T  4666690 agagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgttt 4666591  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||           |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  4666590 cccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtctgttgtcaagag-----------acaaaccctatttttgttgttgtcttactagacccttctttcag 4666502  T
Q  290 ccccctctatctca 303  Q
    ||||||||||||||    
T  4666501 ccccctctatctca 4666488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 341
Target Start/End: Original strand, 27635830 - 27635959
Alignment:
Q  212 accctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27635830 accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttac 27635929  T
Q  312 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    | | || |||||||||||||| ||||||||    
T  27635930 tctaattcaaggtctatatttgtagtaaaa 27635959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231374
Alignment:
Q  213 ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgct 312  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |     
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctcaagatttaca 6231403  T
Q  313 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6231402 ctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 6231374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 53597404 - 53597119
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| || ||  || |||   | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  53597404 atcaacgggttacaagaataagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 53597305  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    ||||||||     |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  53597304 gaatcaacttc--aaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaacccctagttttcttgttgactta-taaacccttgtttcatcccc-tct 53597210  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttc 387  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||| || |   ||||||||||||||||    
T  53597209 atctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacatatttcagcccaaaaatacgtttc 53597119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1674140 - 1673898
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca-agt 197  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||||||  ||    
T  1674140 atcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggt 1674041  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt-gtttcagccccctc 296  Q
    ||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||  ||||||  | |||    
T  1674040 gaatcaatc--ctaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaacactagttttcttgttaac-ttctaaacccttattttcag-actctc 1673946  T
Q  297 tatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||  |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1673945 tacatcaaggtttacttttgatacaagttctatatttatagtaaaagt 1673898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6232074 - 6231849
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccctccgatccactat-atgatg------------- 91  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||                 
T  6232074 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccg-ttcactgtaatgatgagtagctttacaa 6231976  T
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  6231975 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgtttc 6231877  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctag 218  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6231876 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3306842 - 3306724
Alignment:
Q  223 tgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaag 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |  ||||||||     
T  3306842 tgttccaaagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgtttcagccccctatatctctaggtttacactgatacaat 3306743  T
Q  323 gtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3306742 gtctatatttatagtaaaa 3306724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 38210184 - 38210082
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  38210184 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 38210086  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  38210085 tttt 38210082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 50493793 - 50493691
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  50493793 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagctatcgtgccacgattctgcagaaacctga 50493695  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  50493694 tttt 50493691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 295
Target Start/End: Original strand, 561866 - 562058
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gt 197  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  561866 atcaatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgt 561965  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 295  Q
    |||||||||    |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  561966 gaatcaacc--tgaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaaccctag-tttcatgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccccct 562058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25635549 - 25635391
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  25635549 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggt 25635450  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttt 259  Q
    ||| ||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  25635449 gaaccaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttt 25635391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 53896637 - 53896739
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  53896637 ccatcgtgccacgatttttccagtaccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagcaatcgtgccacgattctgcagaaacctga 53896735  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  53896736 tttt 53896739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17795433 - 17795269
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||  ||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  17795433 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 17795334  T
Q  192 cc-aagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttt 259  Q
    || ||||||||||||||   |||||||||||||||| | || || |||| |||||||| || |||||||    
T  17795333 ccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 17795269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19103873 - 19103709
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||  ||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  19103873 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 19103774  T
Q  192 cc-aagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttt 259  Q
    || ||||||||||||||   |||||||||||||||| | || || |||| |||||||| || |||||||    
T  19103773 ccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 19103709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 87
Target Start/End: Original strand, 35919094 - 35919179
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatat 87  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35919094 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatat 35919179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 336
Target Start/End: Original strand, 36871421 - 36871624
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  | |||||| |||||||||     
T  36871421 ctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaatc--ctaaccctggtgtttgttg 36871518  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 327  Q
    | ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||  | | | |||| || ||||||||||| ||    
T  36871519 ccaagag-caaactctatacaagccctagttttcttgttggc-ttgtaaacccttgtttcagccccc-ctccccctaggtttactatgatacaaggttta 36871615  T
Q  328 tatttatag 336  Q
    |||||||||    
T  36871616 tatttatag 36871624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 27635641 - 27635727
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27635641 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatga 27635727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Original strand, 53896475 - 53896557
Alignment:
Q  288 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  53896475 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 53896557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 511
Target Start/End: Original strand, 7606880 - 7606948
Alignment:
Q  442 aaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7606880 aaaaactgaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagccatcgtgtcacgattctgcagaaacctgatttt 7606948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 343
Target Start/End: Original strand, 4560403 - 4560599
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||         
T  4560403 ctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt----- 4560497  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 327  Q
       ||||||||| ||||           ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||    
T  4560498 ---agagacaaactcta-----------gttttgttgttacctttataaaccattgtttcagccccctctatctcaatgtttactatgatacatagtcta 4560583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 41849333 - 41849247
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  41849333 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatga 41849247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5191484 - 5191388
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  5191484 tgccacgatttttccagtaccttgcctcaaaa-ctgaaacctccaatcgtgccacgatgcccagcaatcgtgccacgattctgcagaaatctgatttt 5191388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Original strand, 53894037 - 53894121
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatat 87  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  53894037 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatatat 53894121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 6063889 - 6063991
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  6063889 ccatcgtgccacgattttttcagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccattgtgccacgttgccttgccatcgtgccacgattctgcataaacctga 6063987  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  6063988 tttt 6063991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 10192413 - 10192514
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  10192413 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctc-aaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgccttgcgatcgtgccacgattccgcataaatctga 10192510  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  10192511 tttt 10192514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 47701654 - 47701801
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 92  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||             |    
T  47701654 agaacgcaaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 47701753  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccc 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47701754 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24181548 - 24181498
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtccca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181548 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtccca 24181498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 10085493 - 10085594
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||| |  |||||||| ||| ||| ||||    
T  10085493 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctc-aaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgccttgcgatcatgccacgattccgcataaatctga 10085590  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  10085591 tttt 10085594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13893347 - 13893269
Alignment:
Q  312 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13893347 tttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgca-ctgaaaatacgtttctgtt 13893269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3306936 - 3306839
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||   |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3306936 aagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5886242 - 5886181
Alignment:
Q  309 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5886242 tgctctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 5886181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 408 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5899576 - 5899476
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  | |||||  || |||| |||||||||||||    
T  5899576 ccatcgtgccatgatttttccagtgccttgcctaaaaaact-aaaacatccatcgtgccacgttgcccttcaatcgtgccatgattatgcagaaacctga 5899478  T
Q  508 tt 509  Q
    ||    
T  5899477 tt 5899476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Original strand, 6719396 - 6719457
Alignment:
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaat 355  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6719396 ctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaat 6719457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 398
Target Start/End: Original strand, 46966940 - 46967024
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgcc 398  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||    
T  46966940 tgatacaatgtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcattgaaaaatatgtttctgtttttcgcc 46967024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5899717 - 5899656
Alignment:
Q  309 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5899717 tgctctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 5899656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 42992660 - 42992605
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggag 62  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42992660 agaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggag 42992605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 426 - 511
Target Start/End: Original strand, 32264481 - 32264565
Alignment:
Q  426 tccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacga-ttctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32264481 tccagtgacttgcctcaaaaactgaaacctccaatcgtgccacgtt-cccagccatcgtgccacgatttctgca-aaacctgatttt 32264565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6484373 - 6484308
Alignment:
Q  278 cccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  6484373 cccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagcaaaagt 6484308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 10094196 - 10094256
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10094196 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 10201076 - 10201136
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10201076 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16462263 - 16462203
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16462263 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 22626106 - 22626166
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22626106 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25388714 - 25388654
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25388714 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccacg 25388654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 47883004 - 47883064
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47883004 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 478
Target Start/End: Original strand, 5523041 - 5523104
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagc 478  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  5523041 tgccacgatttttccagtaccttgcctc-aaaactgaaaccaccaatcgtgccatgttgcccagc 5523104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 54188665 - 54188625
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54188665 tgacctagtctggggagagagcagctctccgatccactata 54188625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 368
Target Start/End: Original strand, 1618916 - 1619018
Alignment:
Q  270 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaa 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| || || | ||| ||||||||||    
T  1618916 tttctaaacccttgttttcagccccctctgtctctcaaggtttactatggtacaaggtctatatttatagtcaaagtatccctcataaaattggaacaaa 1619015  T
Q  366 tct 368  Q
    |||    
T  1619016 tct 1619018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5886101 - 5886039
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgtt 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  5886101 ccatcgtgccacgatttttccagtaccttgcctaaaaaact-aaaacatccatcgtgccacgtt 5886039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15781153 - 15781090
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 69  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15781153 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcag 15781090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10897065 - 10897008
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  10897065 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagaatcaatcctaatagtg 10897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 29914075 - 29914132
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  29914075 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 47878293 - 47878350
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  47878293 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 54193286 - 54193229
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  54193286 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 54193229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4535674 - 4535614
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4535674 ctaattctacccaat-tcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacggtgttt 4535614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 10100213 - 10100273
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10100213 ctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 10208122 - 10208182
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  10208122 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1736384 - 1736324
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1736384 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 1736324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6303358 - 6303310
Alignment:
Q  142 aagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6303358 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18552962 - 18552902
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18552962 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 18552902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30709869 - 30709809
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30709869 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 30709809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 36871304 - 36871364
Alignment:
Q  28 acccagtccggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36871304 acccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 36871364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 481
Target Start/End: Original strand, 10956453 - 10956519
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccat 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||    
T  10956453 tgccacgatttttccagtgccttgcc-ccaaaactgaaacctccaatcgtgccatgatgtccagccat 10956519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13419983 - 13419864
Alignment:
Q  163 accaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttg 261  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||  ||||||||||||||     
T  13419983 accaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta--caaaccctagttttc 13419889  T
Q  262 ttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||    
T  13419888 ttgttggcttt-taaacctttgtttc 13419864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 343
Target Start/End: Original strand, 25690651 - 25690690
Alignment:
Q  304 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25690651 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 25690690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 20031440 - 20031497
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  20031440 ctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 20031497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25634024 - 25633930
Alignment:
Q  163 accaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttt 259  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||   | |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25634024 accaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatccc--agccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt 25633930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26762917 - 26762863
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||    
T  26762917 tgatacaaggtttatatttatagtaaaagcatccctaaaaaattggaacaaatct 26762863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 28181230 - 28181192
Alignment:
Q  38 gtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccg 76  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28181230 gtccaaattgacctagtctagggagagagcagccttccg 28181192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Original strand, 40844665 - 40844719
Alignment:
Q  31 cagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40844665 cagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctcaaatccactat 40844719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 54188569 - 54188512
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  54188569 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaattctaatagtg 54188512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 1620483 - 1620524
Alignment:
Q  46 tgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1620483 tgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata 1620524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 3307034 - 3306974
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagca 68  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3307034 agaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtct-aggagagagca 3306974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6303466 - 6303425
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6303466 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 6303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 10094100 - 10094141
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10094100 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10094141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 10100117 - 10100158
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10100117 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10100158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 10200980 - 10201021
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10200980 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10201021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 10208026 - 10208067
Alignment:
Q  46 tgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10208026 tgacctagtctgcgggagagagcagctctccgatccactata 10208067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 10621847 - 10621876
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621847 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10621876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10897162 - 10897121
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10897162 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10897121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16996758 - 16996681
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||   || || |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  16996758 tgatacaaggtttatatttatattaaaaccatccctaaaaatttggaacaaatccaggcccaaaaatatgtttctgtt 16996681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27544429 - 27544388
Alignment:
Q  46 tgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27544429 tgacctagtctgagggagagagcagctctccgatccactata 27544388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 28761410 - 28761491
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaa-ttgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  28761410 agaaaacaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactata 28761491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956874
Alignment:
Q  59 ggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactatatgatga 29956874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 341
Target Start/End: Original strand, 31021450 - 31021479
Alignment:
Q  312 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021450 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 31021479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 31151579 - 31151538
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31151579 tgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 31151538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42990234 - 42990205
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990234 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 42990205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 54193383 - 54193342
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  54193383 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 54193342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Original strand, 562069 - 562144
Alignment:
Q  316 atacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  562069 atacaaagtctatatttatagtaaaattatcccttataaaaatggaacaaatctg-gcccgaaaatacgtttctgtt 562144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Original strand, 1620581 - 1620657
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||   |||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1620581 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 8370565 - 8370505
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8370565 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8370505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25929519 - 25929463
Alignment:
Q  28 acccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 84  Q
    ||||||| ||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25929519 acccagttcggtccaatacgacctactctggggggagagcagccctccaatccacta 25929463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 343
Target Start/End: Original strand, 27101558 - 27101594
Alignment:
Q  307 tttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27101558 tttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 27101594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27975031 - 27974971
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27975031 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27986525 - 27986465
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27986525 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27986465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38002928 - 38002877
Alignment:
Q  130 taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  38002928 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaaacctaa 38002877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 48438222 - 48438282
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48438222 tgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 48438282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 104)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27829652 - 27829217
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  27829652 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgt 27829553  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27829552 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 27829453  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829452 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 27829353  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27829352 cagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgttt 27829253  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
     |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27829252 ttgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 27829217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27827341 - 27826906
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  27827341 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgt 27827242  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27827241 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 27827142  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827141 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 27827042  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27827041 cagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgttt 27826942  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
     |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27826941 ttgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 27826906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4424374 - 4423883
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||           
T  4424374 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaatgt 4424275  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  4424274 tacaaaagataaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 4424175  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4424174 gtttcccacggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtt 4424075  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4424074 tcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctgtatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtt 4423975  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagc 478  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  4423974 tctatttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct-taaaactgaaacctccaattgtgccacgttgcccagc 4423883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14808111 - 14807672
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-----------agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  14808111 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagta 14808012  T
Q  93 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 182  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14808011 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 14807912  T
Q  183 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 281  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807911 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 14807812  T
Q  282 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14807811 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaata 14807713  T
Q  382 cgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  14807712 cgtttatgtttttcgctgccagcgcaccaccgtgccacgat 14807672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 422
Target Start/End: Original strand, 28251552 - 28251981
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  28251552 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacattacaaa 28251651  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28251652 agagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28251751  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  28251752 caaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaacc 28251851  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28251852 cactctatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtttctgtt 28251950  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
     ||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  28251951 tttcgctgccaacgcaccatcgtaccacgat 28251981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15073061 - 15072632
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||                 
T  15073061 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaa 15072962  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcc-tcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  15072961 agagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 15072862  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072861 ccaaggtgaatcaaccctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 15072762  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15072761 cccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcacccaaaaatacgtttctgt 15072662  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15072661 tattcgctgccagcgcaccatcatgccacg 15072632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15068330 - 15067903
Alignment:
Q  8 gaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 93  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||             |    
T  15068330 gaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaa 15068231  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  15068230 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttccc 15068131  T
Q  194 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068130 aaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 15068031  T
Q  293 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtta 392  Q
    | |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15068030 cttctatctcaaagtttaggttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttttgtta 15067931  T
Q  393 ttcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15067930 ttcgctgccagcgcaccatcgtgccacg 15067903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18811063 - 18810680
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  18811063 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgt 18810964  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18810963 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 18810864  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810863 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18810764  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18810763 cagccccctctatctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttgtaacaaatctgc 18810680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44721199 - 44720815
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||           
T  44721199 aagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaccgt 44721100  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44721099 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 44721000  T
Q  188 ttt-cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720999 ttttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 44720900  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  44720899 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatataaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 44720815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32339665 - 32339304
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  32339665 aagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 32339566  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  32339565 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 32339466  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339465 gtttaccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 32339366  T
Q  286 tcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339365 tcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 32339304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3874364 - 3874005
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  3874364 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 3874265  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  3874264 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgt 3874165  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3874164 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 3874065  T
Q  288 agccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||| |||||||    |||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3874064 agcccccgctatctctctcaaagtttagcctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 3874005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 28283200 - 28283561
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  28283200 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt 28283299  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28283300 acaaagagaaatcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 28283399  T
Q  189 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28283400 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 28283499  T
Q  288 agccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283500 agccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 28283561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15809574 - 15809214
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||           
T  15809574 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgt 15809475  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  15809474 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 15809375  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809374 gttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaa-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 15809276  T
Q  286 tcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||| ||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809275 tcagccccctttatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15809214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18813237 - 18812865
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  18813237 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgt 18813138  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18813137 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtg 18813038  T
Q  188 tttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813037 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagag-----------acaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18812949  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18812948 cagcctcctctatctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttgtaacaaatctgc 18812865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 609091 - 608735
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaa-gaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------ 92  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  609091 aagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacg 608992  T
Q  93 -------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacag 185  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||    
T  608991 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatag 608892  T
Q  186 tgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 284  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  608891 tgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcatttctaaacccttgt 608792  T
Q  285 ttcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatattta 333  Q
    ||||||||||||||        |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  608791 ttcagccccctctatctctctctctcaaagtttgctatgatataaggtctatattta 608735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 22684632 - 22685002
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  22684632 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgt 22684731  T
Q  93 ------agagaaatcaat---gggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaac 183  Q
          ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  22684732 tacaatagagaaatcaatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 22684831  T
Q  184 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22684832 agtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctt 22684931  T
Q  283 gtttcagccccctcta----------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||| ||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22684932 gtttcagcctcctctatctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 22685002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27911359 - 27911014
Alignment:
Q  11 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agaga 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||             |||||    
T  27911359 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagaga 27911260  T
Q  98 aatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-g 196  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  27911259 tatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 27911160  T
Q  197 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911159 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctc 27911061  T
Q  297 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  27911060 tatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagt 27911014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27957778 - 27957433
Alignment:
Q  11 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agaga 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||             |||||    
T  27957778 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagaga 27957679  T
Q  98 aatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-g 196  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  27957678 tatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 27957579  T
Q  197 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27957578 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctc 27957480  T
Q  297 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  27957479 tatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagt 27957433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 242 - 505
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886419
Alignment:
Q  242 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 3886252  T
Q  342 gtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc---aaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgc 438  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  3886253 gtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcacccaaaaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcacaccatcgtaccacgatttttccagtgtcttgc 3886352  T
Q  439 ctc-aaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacct 505  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3886353 ctcaaaaaactgaaa-cctccatcgtgccacgttgtccagccatcatgtcacgattctgcagaaacct 3886419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 27106884 - 27107232
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 94  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||             ||    
T  27106884 aacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaag 27106983  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27106984 agatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 27107083  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107084 aggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 27107183  T
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27107184 ctctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 27107232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 14419175 - 14419578
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||| ||||||                
T  14419175 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 14419274  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14419275 aagacatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttc 14419374  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419375 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 14419474  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaac-aaatctgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| || || | || ||||||| ||||||   |||||||||| |||||||    
T  14419475 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcactcataaattggaacaaaatctcagcccaaaaatatgtttctg 14419574  T
Q  390 ttat 393  Q
    ||||    
T  14419575 ttat 14419578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 30480488 - 30480838
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||                 
T  30480488 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgactaacgttacaaa 30480587  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30480588 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 30480687  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30480688 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacc 30480787  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || |||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30480788 ccttctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 30480838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1225517 - 1225165
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||                 
T  1225517 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 1225418  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1225417 aagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 1225318  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1225317 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagc 1225218  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1225217 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagtaaaagt 1225165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43530471 - 43530123
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||           
T  43530471 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgt 43530372  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||    
T  43530371 tacaaaagagaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagt 43530272  T
Q  187 gtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||             |||||||| ||||||||||||||||    
T  43530271 gtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacac-------------gttgttgcttttctaaacccttgtt 43530185  T
Q  286 tcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530184 tcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43530123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43079953 - 43079650
Alignment:
Q  6 aagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------ 92  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||                
T  43079953 aagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaa 43079854  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  43079853 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 43079754  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43079753 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 43079654  T
Q  291 cccc 294  Q
    ||||    
T  43079653 cccc 43079650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43082326 - 43082013
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  43082326 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 43082227  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  43082226 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtt 43082127  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43082126 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 43082027  T
Q  289 gccccctctatctc 302  Q
    ||||||||||||||    
T  43082026 gccccctctatctc 43082013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 99 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14477520 - 14477276
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |    
T  14477520 atcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggt 14477421  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477420 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctct 14477321  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14477320 atctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 14477276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 343
Target Start/End: Original strand, 24873195 - 24873523
Alignment:
Q  36 cggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||            |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24873195 cggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatcggttacaagaataagtc 24873294  T
Q  123 tcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24873295 tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacaaaccctagtg 24873394  T
Q  221 tttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgcttt 314  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    |    
T  24873395 tttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcct 24873494  T
Q  315 gatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873495 gatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24873523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 102 - 365
Target Start/End: Original strand, 13858578 - 13858842
Alignment:
Q  102 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaa 200  Q
    |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13858578 aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 13858677  T
Q  201 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13858678 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctctatc 13858777  T
Q  301 tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaa 365  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || || | || ||||||||||    
T  13858778 tcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaa 13858842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 33541509 - 33541723
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33541509 ctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttc 33541608  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||    
T  33541609 caaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtttacactgatacaatgtcta 33541708  T
Q  328 tatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||||    
T  33541709 tatttatagtaaaag 33541723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36865887 - 36865538
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga----------- 92  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||               
T  36865887 agaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttaca 36865788  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
      ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| || |   ||||| |||||||||| |||||||    
T  36865787 aaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtga---agagactcaatcctaatagtgttt 36865691  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865690 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 36865591  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||| || |||| | | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36865590 ccccctctatcttaaggtttacatctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 36865538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41385094 - 41384744
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||                 
T  41385094 agaacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 41384995  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  41384994 agagatgtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcc 41384895  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  41384894 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-c 41384796  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41384795 ccctctatctcaatttttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 41384744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41383012 - 41382672
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||                 
T  41383012 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 41382913  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||           
T  41382912 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag------- 41382820  T
Q  193 caagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
       ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  41382819 ---gtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttttagccc 41382723  T
Q  293 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    | |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41382722 catctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 41382672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25952871 - 25952521
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  25952871 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaa 25952772  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||   |||||  |||||||||||| |||||||||| | |||||     
T  25952771 aagagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttt 25952672  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25952671 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatacaa-ccctaattttattgttgcctttctaaacccttgtttcagc 25952573  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25952572 cccctctatctcaaggtttcctctgatacaaagcttatatttatagtaaaag 25952521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 231 - 422
Target Start/End: Original strand, 12517248 - 12517441
Alignment:
Q  231 agagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctat 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
T  12517248 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtatat 12517347  T
Q  329 atttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  12517348 atatatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgat 12517441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 342
Target Start/End: Original strand, 5372269 - 5372512
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  5372269 atcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 5372368  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5372369 gaattaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctct 5372467  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5372468 atctcaagatttacactgatacaatgtctataattatagtaaaag 5372512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 166 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775200
Alignment:
Q  166 aagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttg 264  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgttg 26775279  T
Q  265 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26775278 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaagt 26775200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 391
Target Start/End: Original strand, 15185699 - 15186095
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||                
T  15185699 agaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaa 15185798  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag--tcaatcctaacagtgtt 189  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  15185799 aagagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaat-------ctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgtt 15185891  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  15185892 ttacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccatagttttgttattttctttctaaacccttgtttca 15185991  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttc 387  Q
    | | ||| |||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  15185992 gtcacctttatctcaaggtttactctgatacaaagtttatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctaggcccgaaaatacgtttc 15186091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 342
Target Start/End: Original strand, 5622882 - 5623073
Alignment:
Q  152 ctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaa 250  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  5622882 ctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctatacaaa 5622981  T
Q  251 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5622982 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttattctgatacaaaacctatatttatagtaaaag 5623073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 270 - 420
Target Start/End: Original strand, 2468361 - 2468511
Alignment:
Q  270 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctg 369  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2468361 tttctaaatccttgtttcagctccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaacatttggaacaaatctg 2468460  T
Q  370 cacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  2468461 cactaaaaaatacgtttctgttattcgcatccagcgcaccatcgtgccacg 2468511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31162460 - 31162165
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31162460 aagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 31162361  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttg-ttgcctttctaaacccttg-tttca 288  Q
    |||| |||||||||||  | |||  ||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||| ||| ||| |    
T  31162360 ccaaggtgaatcaacc--ctaacgttagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacacta-atttgttgcttg--tttctaaacctttgttttta 31162267  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttc 387  Q
    ||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   | |||||||| |||||    
T  31162266 gccccctctttctcaaggtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctcagctcaaaaatatgtttc 31162167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21482561 - 21482322
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  21482561 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttc 21482462  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||     
T  21482461 ccaaggtgactcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagt 21482374  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21482373 ccactctatctcaaagtttactctgatacaaattctatatttatagtaaaag 21482322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 35872559 - 35872713
Alignment:
Q  184 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  35872559 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaaccctt 35872653  T
Q  283 gtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35872654 gtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 35872713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15956308 - 15956051
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactat-atgatg------------- 91  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| | |||||| ||||||                 
T  15956308 agaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 15956209  T
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15956208 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttc 15956109  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaacc 252  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||    
T  15956108 ccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 309
Target Start/End: Original strand, 3005716 - 3005929
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||| ||||| |||| |||||||     
T  3005716 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgtttt 3005815  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc-ag 289  Q
    |||| ||||||||| |||   |||||| ||||||||   ||||| |||| ||||||||||| |||||||  |  |||  |||||||||||||||||| ||    
T  3005816 ccaaagtgaatcaatcca---accctattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaactctagtttgttatttg--tttctaaacccttgtttccag 3005909  T
Q  290 ccccctctatctcaaagttt 309  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  3005910 ccccctctatctcaaggttt 3005929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21480753 - 21480547
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21480753 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttc 21480654  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||||||   || ||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||    
T  21480653 ccaaggtgaatcaaccc---aaacctagtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagc 21480566  T
Q  291 cccctctatctcaaagttt 309  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  21480565 cccatctatctcaaggttt 21480547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 181632 - 181536
Alignment:
Q  247 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  181632 caaaccctagttttattgttgccattctaagcccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 181536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18812785 - 18812683
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||    
T  18812785 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaact-aaaacctccatcgtgccacgttgcccagccgtcgtgccacgattcttcagaaacctga 18812687  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  18812686 tttt 18812683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 309
Target Start/End: Original strand, 37214321 - 37214512
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||| |||||         |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37214321 ctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttc 37214411  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccct-------------------agttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtt 308  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37214412 caaagagacaaactctatacaaaccctcaatctcttcccgtaaccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtt 37214511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18810600 - 18810498
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  18810600 ccatcgtgccgcaatttttccagtgccttgcctaaaaaaataaaacc-tccatcgtgccacgttgcccagccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 18810502  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  18810501 tttt 18810498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31035236 - 31035021
Alignment:
Q  173 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 271  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31035236 tcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgactt 31035140  T
Q  272 tctaaacccttgttt-cagccccctcta--tctcaaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatc 367  Q
     ||||||| |||||| ||| | | ||||  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||| ||||||||||||    
T  31035139 -ctaaaccattgttttcagactc-tctacctctcaaagtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc-ctaaaaaattggaacaaatc 31035043  T
Q  368 tgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    ||  |||||||||||| |||||    
T  31035042 tgagcccaaaaatacgattctg 31035021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 181753 - 181622
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttcc--ggtaaccaagagagtcaatcct-aacagtgt 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| |||||| | |||||| || |||||    
T  181753 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccattctcttcccgcgtaactaagagacttaatcctaaatagtgt 181654  T
Q  189 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 219  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  181653 ttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 43079456 - 43079362
Alignment:
Q  416 ccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43079456 ccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgccttgccgtcgtgccacgattctgcagaaacctgatttt 43079362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 43081839 - 43081737
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  43081839 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccactttgccttgccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 43081741  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  43081740 tttt 43081737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 33541395 - 33541481
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  33541395 agaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactatatgatga 33541481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 27826893 - 27826814
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  27826893 tgccacgatttttccagtgctttgcttcaaaaaatgaaa-cctccatcgtgccacgttgcccagcaatcgtgccacgattc 27826814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 27829204 - 27829125
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  27829204 tgccacgatttttccagtgttttgcctcaaaaaatgaaa-cctccatcgtgccacgttgcccagcaatcgtgccacgattc 27829125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14807659 - 14807563
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  | |||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  14807659 tgccacgatttttccagtgctttgcctcaaact-tgaaacctccaatcgtgtcacgttgcccaaccatcatgccacgattctgcagaaacctgatttt 14807563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 286
Target Start/End: Original strand, 31573848 - 31574000
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||| |||||||||||     
T  31573848 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttg 31573945  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    | |||||| ||   || |||||| |||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||    
T  31573946 ccaagagaaaa---ctctacaaatcctagttttcgtgttggc-ttctaaacctttgttt 31574000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 37214251 - 37214319
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccg 76  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37214251 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17847556 - 17847501
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  17847556 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcaaaatttggaacaaatctg 17847501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44720816 - 44720742
Alignment:
Q  347 gcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  44720816 gcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtt-tttgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 44720742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31035369 - 31035252
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | |||||||||| |||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  31035369 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgttt 31035270  T
Q  191 cccaa-gtgaatcaaccc 207  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  31035269 cccaaggtgaatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Original strand, 31578400 - 31578476
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31578400 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaatcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 44720735 - 44720632
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcag-aaacctg 506  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | | ||||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  44720735 ccatcgtgccacgatttttccagtaccttgcctc-aaaactgaaacctccaaacgtgccacaatgcccagcaatcatgccacgattctgcagaaaacctg 44720637  T
Q  507 atttt 511  Q
    |||||    
T  44720636 atttt 44720632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 137
Target Start/End: Original strand, 2468214 - 2468259
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattcta 137  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2468214 aagagatatcaatgggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 9021229 - 9021289
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9021229 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15072614 - 15072538
Alignment:
Q  417 cacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15072614 cacgatttttctagtggcttgcttcaaaa-ctgaaacctccaatcgtgtcacgttgcccagccatcgtgtcacgattc 15072538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 16752644 - 16752704
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16752644 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 16757389 - 16757449
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16757389 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28327968 - 28327908
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28327968 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28895562 - 28895502
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28895562 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 494
Target Start/End: Original strand, 12517454 - 12517533
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  12517454 tgccacgatttttccagtacattgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgccttgccatcgtgccacgattc 12517533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 590854 - 590797
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  590854 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 590797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 494
Target Start/End: Original strand, 28252009 - 28252094
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  28252009 ccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcctc-aaacttgaaacctccaatcgtaccacgttgcctagccatcgtgccacgattc 28252094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33032714 - 33032657
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  33032714 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 4812609 - 4812669
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  4812609 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagtgttt 4812669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21482640 - 21482591
Alignment:
Q  28 acccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccg 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21482640 acccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccg 21482591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28332691 - 28332631
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28332691 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 187
Target Start/End: Original strand, 29554908 - 29554964
Alignment:
Q  130 taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  29554908 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29554964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6376032 - 6375988
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6376032 tctcaatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6375988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 13858477 - 13858537
Alignment:
Q  15 aaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 74  Q
    |||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13858477 aaagaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 13858537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 16752549 - 16752589
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16752549 tgacctagtctggggagagagtagctctccgatccactata 16752589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 187
Target Start/End: Original strand, 23179692 - 23179740
Alignment:
Q  139 ccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  23179692 ccaaagtcacagcctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtg 23179740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43079614 - 43079558
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  43079614 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 43079558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43081986 - 43081930
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  43081986 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 43081930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 5372160 - 5372242
Alignment:
Q  6 aagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||| |||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  5372160 aagaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactata 5372242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14477602 - 14477547
Alignment:
Q  6 aagaacacaaaagaattttatgacc-cagtccggtccaaattgacctagtctgggg 60  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14477602 aagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctgggg 14477547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21480832 - 21480785
Alignment:
Q  28 acccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 74  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21480832 acccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 21480785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3276404 - 3276347
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  3276404 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 3276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 13985200 - 13985262
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtccc-agcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13985200 ctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15067882 - 15067821
Alignment:
Q  420 gatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatc 482  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  15067882 gatttttccagtggcttgcttcaaaa-ctgaaacctccaatcgtgccatgttgcccagccatc 15067821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17847739 - 17847677
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17847739 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttc 17847677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 4812513 - 4812554
Alignment:
Q  46 tgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4812513 tgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 4812554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 16757293 - 16757334
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16757293 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 16757334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25684799 - 25684758
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25684799 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 25684758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28890922 - 28890881
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28890922 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 28890881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 29554810 - 29554851
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29554810 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 29554851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 365
Target Start/End: Original strand, 31574054 - 31574100
Alignment:
Q  317 tacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  31574054 tacaaggtctatatttatagtaaaag--tctctcaaaatttggaacaaa 31574100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 4696685 - 4696625
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4696685 tgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 4696625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9765908 - 9765848
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9765908 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Original strand, 17799558 - 17799606
Alignment:
Q  142 aagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17799558 aagtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23799666 - 23799606
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23799666 tgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactat 23799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26403319 - 26403259
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  26403319 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 26403259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 112)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27105073 - 27104530
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  27105073 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaatgt 27104974  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27104973 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 27104874  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27104873 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgttt 27104775  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27104774 cagccccctctatctcaaagttttctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgttt 27104675  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcac---------------------catcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgc 465  Q
     |||| ||| | ||||||||||                     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27104674 atgtttttccctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaa-cctccatcgtgc 27104576  T
Q  466 cacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  27104575 cacgttgcccttcaatcgtgccacgattctgcagaaatctgatttt 27104530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 19501990 - 19502535
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||           
T  19501990 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtatcgt 19502089  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  19502090 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 19502189  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19502190 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtt 19502289  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  19502290 tcagccccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaattttcccttaaaatttggatcaaatctgcaaccaaaaatatgtt 19502389  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgca---------------------ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtg 464  Q
    ||||||||||| ||||||||||                     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19502390 tctgttattcgtcgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaa-cctccatcgtg 19502488  T
Q  465 ccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19502489 ccacgttgccttgccatcgtgccacgattctgcagaaacctgatttt 19502535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 19504325 - 19504760
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||           
T  19504325 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 19504424  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  19504425 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccg-taaccaagagactcaatcctaatagt 19504523  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504524 gtttcccaaggtgaatcaaccaacaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 19504623  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  19504624 tcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatgtgtt 19504723  T
Q  386 tctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19504724 tctgttattcgtcgccagcgcaccatcgtgccacgat 19504760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42064788 - 42064355
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaatt-gacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  42064788 agaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgtta 42064689  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42064688 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 42064589  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064588 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 42064489  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 388  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  42064488 gctccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactaaaaaatatgtttct 42064389  T
Q  389 gttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42064388 gtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 42064355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 13910024 - 13910456
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||           
T  13910024 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactatatgatgagtattgt 13910123  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||    
T  13910124 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattg 13910223  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910224 tttcccaaggtgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 13910323  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13910324 cagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgttt 13910423  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccac 419  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13910424 ctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccac 13910456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 24162202 - 24162737
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||           
T  24162202 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtagcat 24162301  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  24162302 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc----------aaccaagagactcaatcttaatagtg 24162391  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162392 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24162491  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24162492 cagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 24162591  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgca---------------------ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctc-aaaaactgaaaccctccatcgtg 464  Q
    ||  ||||||| |||||||||                     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24162592 ctaatattcgcagccagcgcacaatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaa-cctccatcgtg 24162690  T
Q  465 ccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  24162691 ccacgttgcccaaccattgtgccacgattctgcagaaacttgatttt 24162737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 511
Target Start/End: Original strand, 40032038 - 40032571
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||                
T  40032038 agaatacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaa 40032137  T
Q  93 -agagaaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
     |||||||    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40032138 aagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 40032237  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032238 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 40032337  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032338 cagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaacttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 40032437  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgca----------ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgccca 476  Q
    ||||||||||| |||||||||          ||||| ||||||||    ||||||| |||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  40032438 ctgttattcgctgccagcgcaccatcgtatcccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttgtctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgccca 40032536  T
Q  477 gccatcgtatcacga-ttctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40032537 gccatcgtgccacgatttctgcag-aacctgatttt 40032571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 511
Target Start/End: Original strand, 43623565 - 43624070
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  43623565 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 43623664  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  43623665 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcc 43623764  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43623765 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtg------------agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcaccc 43623852  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43623853 ccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatttttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtttatgtt 43623951  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacga 491  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||  || ||    
T  43623952 atttgctgccagcgcaccatcgtgccacgattttttcagtgccttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccatgttgcccagccatcgtgccatga 43624050  T
Q  492 ttctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43624051 ttctgcagaaacctgatttt 43624070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 7 - 484
Target Start/End: Original strand, 6264133 - 6264621
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||                
T  6264133 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 6264232  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||   |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  6264233 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttc 6264332  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6264333 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaaccct----ttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagc 6264428  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6264429 cccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgt 6264528  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgt 484  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  6264529 tattcgccgctaatgcaccatcgtgccacgatttttccagtgacttgcctc-aaaactgaaacatccaatcatgccacgttgcccaaccatcgt 6264621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 21520678 - 21521108
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||                 
T  21520678 agaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 21520777  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21520778 agagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 21520877  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520878 taaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 21520977  T
Q  292 ccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    || ||||  |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21520978 ccatctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaattttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 21521077  T
Q  390 ttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21521078 ttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacg 21521108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 412
Target Start/End: Original strand, 6258802 - 6259220
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||                 
T  6258802 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggagagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaa 6258901  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6258902 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaa--tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 6258999  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6259000 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaaactcttgtttcatcc 6259099  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
     |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6259100 tcctctatctcaaagtttagtctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaagtctgcacccaaaaatatgtttctgtt 6259199  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatc 412  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  6259200 attcaccgccagcgcaccatc 6259220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 22287321 - 22287749
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||                 
T  22287321 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaa 22287420  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |  ||||||    
T  22287421 agagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcc 22287520  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287521 caaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 22287620  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  22287621 ccctatatctcaaagtttactttaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcacccaaacatacatttttgtt 22287720  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  22287721 attcgctgccagcgcaccatggtgccacg 22287749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42453054 - 42452702
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  42453054 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 42452955  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 189  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42452954 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 42452855  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452854 tcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttaca--gagacaaactttatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 42452757  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42452756 gccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttataataaaagt 42452702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 45279965 - 45280321
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  45279965 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 45280064  T
Q  93 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 188  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45280065 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 45280164  T
Q  189 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc-ctttctaaacccttgttt 286  Q
     |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45280165 atcccaaggtgaatcaaccctctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgttt 45280264  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45280265 cagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtatatatttatagtgaaagt 45280321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 23452216 - 23452577
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  23452216 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgt 23452315  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  23452316 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 23452415  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452416 gtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 23452515  T
Q  286 tcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||| ||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452516 tcagccccctctgtctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 23452577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19007910 - 19007560
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||                 
T  19007910 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 19007811  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  19007810 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcc 19007711  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007710 caaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccataattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 19007611  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19007610 ccctctatctcaaggtttactatgatacaaagcctatatttatagtaaaag 19007560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 196 - 420
Target Start/End: Original strand, 22407598 - 22407822
Alignment:
Q  196 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22407598 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcaccct 22407697  T
Q  296 ctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattc 395  Q
     ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407698 atatctcacagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaattttgaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattc 22407797  T
Q  396 gccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    || |||| ||||||||| |||||||    
T  22407798 gctgccaacgcaccatcgtgccacg 22407822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 42923494 - 42923847
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||                 
T  42923494 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactatatgacgagtaactttacaaa 42923593  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  42923594 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 42923693  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42923694 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 42923793  T
Q  292 ccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
     ||||||  |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42923794 tcctctatctctcaaggtttactatgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 42923847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Original strand, 35215568 - 35215932
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  35215568 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 35215667  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  35215668 aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 35215767  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35215768 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 35215867  T
Q  289 gccccctctatctc----------aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||          |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215868 gccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 35215932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 11739544 - 11739895
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||                
T  11739544 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaa 11739643  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11739644 aagagatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttc 11739743  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11739744 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtctttctaaacccttgttccagc 11739843  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11739844 cccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 11739895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 35217945 - 35218258
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  35217945 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 35218044  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  35218045 aaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 35218144  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35218145 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 35218244  T
Q  289 gccccctctatctc 302  Q
    ||||||||||||||    
T  35218245 gccccctctatctc 35218258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 341
Target Start/End: Original strand, 15539566 - 15539809
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  15539566 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggt 15539665  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |    
T  15539666 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcaaccccctat 15539765  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    ||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15539766 atctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 15539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28196905 - 28196557
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||                 
T  28196905 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactatatgatgagtaatgttacaaa 28196808  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28196807 agagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28196708  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28196707 caaggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagcc 28196608  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  28196607 ccctctatctcaatgtttactctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 28196557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 92 - 476
Target Start/End: Original strand, 18800398 - 18800769
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18800398 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18800497  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||| ||  ||        |||||||||||||||||||    
T  18800498 ccaaggtgaatcaaccca---accctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagcttgatt--------tctaaacccttgtttcagc 18800585  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    ||||| |||||| | |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  18800586 cccctatatctccatgtttaccctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgtttaaaatttggaacaaatctgcacttaaaaatatgtttctgt 18800685  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgccca 476  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||   | |||||| |||||||||||    
T  18800686 t-ttcgcctctagcgcaccatcgtgccacaatttttccagtgacttgcttc-ataactgaaacatccaatcgtgtcacgttgccca 18800769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17849387 - 17849037
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||                
T  17849387 agaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 17849289  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  17849288 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttc 17849189  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17849188 tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttcttccaaagaggcaaactctatacgaactctagttttgttgttatctttctaaacccttgtttcagc 17849089  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  17849088 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttatatttatagtaaaag 17849037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 31732861 - 31733100
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||            |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31732861 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca------------aaccaagagactcaatcctaacagtgtttc 31732948  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732949 ccaacgtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 31733048  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31733049 cccctctatctcaatgtttactctgttacaaagtctatatttatagtaaaag 31733100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 34979562 - 34979906
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggag--agagcagccctccgatccactata-tgatga----------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||| || ||||||||| ||||||               
T  34979562 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttaca 34979661  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
      ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  34979662 aaagagatataaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgttt 34979761  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34979762 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttcag 34979861  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttat 334  Q
    ||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||    
T  34979862 ccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttat 34979906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 92 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3022334 - 3022086
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3022334 aagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 3022235  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    | ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3022234 ctaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttataaacccttgtttcagc 3022135  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaa 339  Q
    | ||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  3022134 ctcctatatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaa 3022086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17848710 - 17848365
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||                 
T  17848710 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 17848611  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17848610 agagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 17848515  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  17848514 caaagtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctcgtttgagc 17848415  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| | || |  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17848414 cccctctatctcaaggattac--tgatacaaagcctatatttatagtaaaag 17848365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14837538 - 14837193
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||| ||||||                
T  14837538 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 14837439  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||  |||||||      ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14837438 aagagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttcc------caagagactcaatcctaatagtgtttc 14837345  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  14837344 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaaccctagttttgttgttgtcttttttaacccttgtttcagc 14837245  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
     ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14837244 tccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 14837193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 44289152 - 44289403
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  44289152 aagagatatcaacgggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttc 44289251  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  44289252 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacagactctatacaaactctagttttgttgttgccttcctaaacctttgttttagt 44289351  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44289352 cccctctatatcaaggtttgctatgatacaaaacctatatttatagtaaaag 44289403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 11578193 - 11578439
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11578193 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 11578292  T
Q  192 cc-aagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    || | |||||||||||  | |||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11578293 ccgaggtgaatcaacc--ccaacccta--gtttgttgccaagagaaaaattctatacaaaccctagtttttttgttgac-ttctaaacccttgtttcagc 11578387  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    || |||||||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11578388 ccactctatctcaagatttaccctgatataaggtctatatttatagtaaaag 11578439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 302
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239271
Alignment:
Q  45 ttgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtct 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgctt 45239099  T
Q  131 aattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-cc 228  Q
    ||||||||| |||  ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  45239100 aattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc 45239199  T
Q  229 aaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 302  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45239200 aaagag--aaagtctatacaaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttcagccccctctatctc 45239271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 342
Target Start/End: Original strand, 22163117 - 22163282
Alignment:
Q  178 cctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 276  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22163117 cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttgttgcctttctaa 22163216  T
Q  277 acccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22163217 atccttgtttcagccccctctatctcaaagtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 22163282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 5375331 - 5375550
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  5375331 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaa 5375430  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5375431 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcc-gcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 5375529  T
Q  193 caa-gtgaatcaacccacaaa 212  Q
     || |||||||||||| ||||    
T  5375530 taaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 38020302 - 38020162
Alignment:
Q  163 accaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttg 261  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38020302 accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaaccctagttttg 38020203  T
Q  262 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020202 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38020162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 209 - 343
Target Start/End: Original strand, 5377631 - 5377769
Alignment:
Q  209 caaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaa 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||    
T  5377631 caaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctctctcaa 5377730  T
Q  305 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5377731 agtttgctctgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 5377769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Original strand, 36558845 - 36559047
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||             
T  36558845 gagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgtta 36558944  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgt 188  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  36558945 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 36559044  T
Q  189 ttc 191  Q
    |||    
T  36559045 ttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 36561123 - 36561324
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  36561123 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 36561222  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  36561223 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 36561322  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  36561323 tc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35107452 - 35107152
Alignment:
Q  106 ggttacaagaataagtctcccg--tctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatc 202  Q
    |||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| |||| ||||||    
T  35107452 ggttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaatc 35107353  T
Q  203 aacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatct 301  Q
    || ||   ||||||   ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||| || | | |||| ||    
T  35107352 aatccc--aaccct---gtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgactt-ctaaactcttggttttagactc-tctacct 35107261  T
Q  302 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgcc 401  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||  |    
T  35107260 caaggtttactatgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcccttaaaatttggaacaaatctgcattgaaaaatacgattatgttattcgccttc 35107161  T
Q  402 agcgcacca 410  Q
    |||||||||    
T  35107160 agcgcacca 35107152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22874301 - 22874015
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||  ||||||| || || |||||| |||||||||| | |||||     
T  22874301 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgtttt 22874202  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||    
T  22874201 ccaaggtgaatcaaccc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagc 22874114  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||  | || | ||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22874113 cccctctatctccaggtttgctctgatacaaagcctgtatttatagcaaaagtaaccctcataaaattgaaacaaatctg-gcccaaaaatacgtttctg 22874015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 20146693 - 20146941
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||| |||||||||  | ||||||    
T  20146693 aagagatatcaaagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttc 20146792  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||| |  | |||| ||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||        
T  20146793 ccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaag-ggcaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttttcaa 20146888  T
Q  291 cccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
     | |||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146889 actctctacctcttaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 20146941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 45332163 - 45332364
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||              
T  45332163 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactatatgatgagtacctttac 45332262  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  45332263 aaagagaaatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 45332362  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  45332363 tc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Original strand, 28459274 - 28459435
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  28459274 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttg 28459373  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaacc 252  Q
    |||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  28459374 ccaaggtgaatccaccctcaaatcctagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaacc 28459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 343
Target Start/End: Original strand, 17897337 - 17897578
Alignment:
Q  99 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||  || |||   | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  17897337 atcaaagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 17897436  T
Q  198 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt-tcagccccctc 296  Q
    ||||||| |  |||  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||  | |||    
T  17897437 gaatcaatct-caa--cctagtgtttgttgcgaagag-caaactctatacaaaccctagttttattgttgac-ttctaaacccttgttctcag-actctc 17897530  T
Q  297 tatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    || |||||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897531 tacctcaagttttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17897578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Original strand, 22407439 - 22407595
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||             |    
T  22407439 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 22407538  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtccca 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  22407539 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaagtccca 22407595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 343
Target Start/End: Original strand, 37963028 - 37963263
Alignment:
Q  97 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||  || | ||||| | |||    
T  37963028 aaatcaatggattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaag 37963127  T
Q  197 tg-aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 295  Q
     | ||||||| ||   ||| | |||||||||   ||||| |||| | || ||||||||||||||  ||        ||||||||||||||||||||||||    
T  37963128 gggaatcaacaca---accatggtgtttgttgtcaagag-caaactatacacaaaccctagtttgatt--------tctaaacccttgtttcagccccct 37963215  T
Q  296 ctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37963216 ctatctcaaggtttactcttatacaaagtctatatttatagtaaaagt 37963263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38020157 - 38020064
Alignment:
Q  248 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| |   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38020157 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttccaaccccctctatctccaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaa 38020064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Original strand, 19504773 - 19504869
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  19504773 tgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaattaaaacc-tccatcgtgccacgttgccttgccatcgtgccatgattctgctgaaacctgatttt 19504869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 271 - 394
Target Start/End: Original strand, 12342673 - 12342797
Alignment:
Q  271 ttctaaaccctt-gtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctg 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||||    
T  12342673 ttctaaaccctttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtgtatatttatagtaaaagtatcctaaaaaaattggaacaaatctg 12342772  T
Q  370 cacccaaaaatacgtttctgttatt 394  Q
      |||||||||| | || |||||||    
T  12342773 accccaaaaatatgattatgttatt 12342797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 7462946 - 7463077
Alignment:
Q  21 ttttatgacccagtccggtccaaa-ttgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------aagagaaatcaatg 105  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||             ||||||||||||||    
T  7462946 ttttttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatg 7463045  T
Q  106 ggttacaagaataagtctcccgtctaattcta 137  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7463046 agttacaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 36559241 - 36559343
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  36559241 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagccgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 36559339  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  36559340 tttt 36559343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 22163007 - 22163093
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  22163007 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatga 22163093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20589862 - 20589763
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20589862 aagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 36561560 - 36561662
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||  |  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  36561560 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgtgaagcccagccgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 36561658  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  36561659 tttt 36561662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 416 - 511
Target Start/End: Original strand, 45332566 - 45332660
Alignment:
Q  416 ccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45332566 ccacgatttttccagttccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccgcgaagcccagccgtcgtgccacgattctgcagaaacctgatttt 45332660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3022442 - 3022377
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 71  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3022442 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 3022377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 226
Target Start/End: Original strand, 27136209 - 27136343
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||   |||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27136209 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 27136308  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 226  Q
     ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27136309 tccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgtt 27136343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Original strand, 36559067 - 36559138
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  36559067 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 36559138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Original strand, 36561344 - 36561415
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  36561344 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 36561415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 354
Target Start/End: Original strand, 45332384 - 45332439
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaa 354  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45332384 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaa 45332439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 372
Target Start/End: Original strand, 28462593 - 28462651
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcac 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  28462593 tgatacaaggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcac 28462651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40699507 - 40699429
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacc 206  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40699507 ctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 494
Target Start/End: Original strand, 21521126 - 21521202
Alignment:
Q  417 cacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21521126 cacgatttttccagtggcttgcttcaaaa-ctgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagccatcgtgccacgattc 21521202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 22707736 - 22707873
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct---ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg------------ 91  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| | | ||||||||||||                
T  22707736 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaaccttaca 22707835  T
Q  92 -aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgt 128  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22707836 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgt 22707873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 219
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414291
Alignment:
Q  121 tctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttccg-tgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 45157001 - 45156922
Alignment:
Q  312 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||    
T  45157001 tttgatataaggtctatatttatagtaaaagcatccctcaaaatttggaacaaatccacgcctaaaaatacgtttatgtt 45156922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2736265 - 2736205
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2736265 ctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17462496 - 17462436
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17462496 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 20054887 - 20054947
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20054887 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 22712638 - 22712698
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22712638 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 22717347 - 22717407
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22717347 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39687043 - 39686983
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39687043 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45567469 - 45567409
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45567469 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 342
Target Start/End: Original strand, 38414281 - 38414365
Alignment:
Q  247 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||| |     ||||| | ||||||||||||||||||    
T  38414281 caaaccctagttttgttgttgcctttctaa------gtttcagccccctctatctcaaggtttac-----tacaaagcctatatttatagtaaaag 38414365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 40699278 - 40699178
Alignment:
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtta 392  Q
    |||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||   |||||||||| | ||||||||    
T  40699278 ctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcagaaaattggaacaaatctcagcccaaaaatatgattctgtta 40699179  T
Q  393 t 393  Q
    |    
T  40699178 t 40699178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17921832 - 17921769
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtccc-agcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17921832 ctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 17921769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 44289052 - 44289099
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagt 54  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44289052 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt 44289099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Original strand, 6259243 - 6259339
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacga-ttctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   | || |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6259243 tgccacgatttttccagtgactttcctc-aaaactgaaacatccaatagtgccacgttgcacagccatcgtgccacgatttctgcag-aacctgatttt 6259339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 12781343 - 12781400
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  12781343 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 12781400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17932694 - 17932637
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  17932694 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17943597 - 17943540
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  17943597 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 341
Target Start/End: Original strand, 20147040 - 20147082
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147040 tctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 20147082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 27517761 - 27517818
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  27517761 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 35028527 - 35028473
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||    
T  35028527 tgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctaaaaaattggaacaaatct 35028473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14699096 - 14699036
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14699096 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 14699036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17921927 - 17921887
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17921927 tgacctagtctgggtagagagcagccctccgttccactata 17921887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 18800298 - 18800378
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaat-tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  18800298 agaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctggggagagagtagccctccgtttcactata 18800378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 37170778 - 37170818
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37170778 tgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 37170818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43139508 - 43139356
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 227  Q
    ||||||||||| |||||| ||   |||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||     
T  43139508 ctaattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttg 43139411  T
Q  228 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    | ||||| ||||  || ||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  43139410 ccaagag-caaa--ctctacaaacccaagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgttt 43139356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 21629952 - 21630011
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21629952 tgacccagttcagtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactat 21630011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 28459175 - 28459254
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||||||  | | | ||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||    
T  28459175 agaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctaggtagagagaagccctccgtttcactata 28459254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23871086 - 23871000
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  23871086 agaactcaaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactatatgatga 23871000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 37170874 - 37170931
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  37170874 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 37170931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38020349 - 38020311
Alignment:
Q  106 ggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaag 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38020349 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaag 38020311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39287256 - 39287188
Alignment:
Q  214 cctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||||||| | ||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  39287256 cctagtgtttgttgctaagaga---attctctacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgttt 39287188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Original strand, 45332490 - 45332551
Alignment:
Q  360 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  45332490 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 45332551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2736361 - 2736320
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2736361 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 2736320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2741097 - 2741056
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2741097 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 2741056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17462592 - 17462551
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17462592 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 17462551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 28458950 - 28459011
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28458950 ctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 31732790 - 31732831
Alignment:
Q  36 cggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccg 76  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31732790 cggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccg 31732831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 33670992 - 33671033
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33670992 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 33671033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Original strand, 41304627 - 41304667
Alignment:
Q  245 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41304627 tacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgttt 41304667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45679879 - 45679838
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45679879 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 45679838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 8390239 - 8390179
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8390239 tgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactat 8390179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 13569336 - 13569396
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  13569336 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 13569396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 20522228 - 20522288
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  20522228 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactat 20522288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 314 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20589609 - 20589581
Alignment:
Q  314 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589609 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 20589581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22874401 - 22874333
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctc 74  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  22874401 agaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctc 22874333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33603870 - 33603818
Alignment:
Q  316 atacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || | || |||||||||||||    
T  33603870 atacaaggtttatatttatagtaaaagtatccctaacaaattggaacaaatct 33603818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38191045 - 38190997
Alignment:
Q  142 aagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  38191045 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 115)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 14507155 - 14507701
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |           
T  14507155 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgataagtatcgt 14507254  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14507255 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 14507354  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507355 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 14507454  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  14507455 tagccccctctatctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctacactcaaaaatatgttt 14507554  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg---------------------atttttccagtgccttgcctc--aaaaactgaaaccctccatcgt 463  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||                     |||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14507555 ctgtttttcgctggcagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccaccatttttccagtgccttgtatcaaaaaaactgaaa-cctccatcgt 14507653  T
Q  464 gccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14507654 gccacgttgcccagccatcgtgccacgattctgcagaaatctgatttt 14507701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 7 - 422
Target Start/End: Original strand, 11983014 - 11983444
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  11983014 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 11983113  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11983114 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 11983213  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11983214 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcctttgtttcagcc 11983313  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11983314 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgtttaaaatttgaaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 11983413  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11983414 tttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 11983444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 28241300 - 28241657
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||           
T  28241300 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgt 28241399  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  28241400 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 28241499  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241500 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 28241599  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28241600 tcagccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 28241657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9020255 - 9019826
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||                 
T  9020255 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 9020156  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9020155 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 9020056  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9020055 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcc 9019956  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9019955 ccctctatctctcagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtttctgtt 9019857  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  9019856 atttgctgtcagcgcaccatcgtgccacgat 9019826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 1230228 - 1230585
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||           
T  1230228 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgt 1230327  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  1230328 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagt 1230427  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230428 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 1230527  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1230528 tcaaccctctctatctcaaagtttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 1230585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 32280326 - 32279829
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatat-gatga------------ 92  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||||                
T  32280326 agaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaa 32280227  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  32280226 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 32280127  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32280126 ccaaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagc 32280027  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    ||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  32280026 ccc-tctatctccaagtttactatgatacaaggtctatatatataggaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatacatttatgt 32279928  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacg 490  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| | |||||||||   | |||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  32279927 tattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgacttttccagcgacttgcctc-agaactgaaacatccaatcgtgccacgttgcccaacaatcgtgtcacg 32279829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 114 - 422
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227824
Alignment:
Q  114 gaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  213 ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgct 312  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19227614 ccctagtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctttatctcaaagtttgct 19227713  T
Q  313 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccat 411  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227714 ctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccat 19227813  T
Q  412 catgccacgat 422  Q
    | |||||||||    
T  19227814 cgtgccacgat 19227824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 420
Target Start/End: Original strand, 30728811 - 30729241
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 94  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||             ||    
T  30728811 aacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataatatgagtaactttacaaaag 30728910  T
Q  95 agaaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30728911 agaaagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgttt 30729010  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  30729011 cccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcag 30729110  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 389  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30729111 ccccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtaccgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 30729210  T
Q  390 ttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  30729211 ttattcgctgccagcgcactatcgtgccacg 30729241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 14458746 - 14459093
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||           
T  14458746 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgt 14458845  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  14458846 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 14458945  T
Q  187 gtttcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14458946 gtttcccaag-gaatcagccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttattt 14459044  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14459045 cagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 14459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 15541125 - 15541553
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa------------ 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||||||||||||||                
T  15541125 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactatatgatgaataactttacaaa 15541224  T
Q  94 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||  || ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  15541225 agagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttcc 15541324  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15541325 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagcc 15541424  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  15541425 ccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtaacttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatatgtttctgct 15541524  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  15541525 attcgctgccagcgtaccatcgtgccacg 15541553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 4816210 - 4816608
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  4816210 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgt 4816309  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  4816310 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 4816409  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816410 gttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 4816509  T
Q  286 tcagccccctcta--------------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||              |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  4816510 tcagccccctctatctctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 4816608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Original strand, 12195497 - 12195851
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  || ||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  12195497 agaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 12195596  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12195597 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 12195696  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12195697 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 12195796  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195797 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 12195851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30967536 - 30967176
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  30967536 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgt 30967437  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  30967436 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 30967337  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30967336 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgtctttctaaacccttgtt 30967237  T
Q  286 tcagccccctcta----tctcaaagttt-gctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||    ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967236 tcagccccctctatctctctcaaagtttagcct--atacaaggtctatatttatagtaaaagt 30967176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 92 - 422
Target Start/End: Original strand, 15530207 - 15530537
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15530207 aagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 15530305  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  15530306 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaagcccttgcttcagc 15530405  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  15530406 cccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaacctgcacccaaaaatatgtttctat 15530505  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
     |||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  15530506 aattcactgccagcacaccatcgtgccacgat 15530537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 411
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15533085
Alignment:
Q  14 aaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaat 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||             ||||| ||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctagggatagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatat 15532773  T
Q  101 caatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  15532774 caatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtga 15532873  T
Q  200 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 299  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532874 atcaaccctcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctat 15532973  T
Q  300 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccg 399  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||      
T  15532974 ctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataacttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatatgtttctcttatttgcta 15533073  T
Q  400 ccagcgcaccat 411  Q
    ||||||||||||    
T  15533074 ccagcgcaccat 15533085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 19704546 - 19704905
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  19704546 aagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgt 19704645  T
Q  93 -------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaaca 184  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |    
T  19704646 tacaaagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaata 19704745  T
Q  185 gtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704746 gtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 19704845  T
Q  284 tttcagcccc------ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 337  Q
    ||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19704846 tttcagccccctccatctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 19704905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 20915336 - 20915721
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  20915336 aagagaagaacacaga-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgt 20915434  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagt 186  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||| || |||||||| |||    
T  20915435 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagt 20915534  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915535 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 20915634  T
Q  286 tcagccccctctatctc---aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||    || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  20915635 tcagccccctctatctctctcaatttagc-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 20915721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 2628865 - 2629226
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  2628865 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccgt 2628964  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2628965 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 2629064  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629065 tttcccaaggtgaatcaacccttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 2629164  T
Q  287 cagcccc-----ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||     |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629165 cagcccctctatctctctctcaaagtttaacatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2629226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 30034590 - 30034943
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 94  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||             ||    
T  30034590 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctatatgatgagtaacgttacaaaag 30034689  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||| |||||||||||    
T  30034690 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattgactcaatcctaatagtgtttccca 30034789  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30034790 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttttagctcc 30034889  T
Q  294 ctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034890 ctctatctctcttaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 30034943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26065310 - 26065005
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------ag 94  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||            ||    
T  26065310 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaag 26065211  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26065210 agaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 26065111  T
Q  195 a-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26065110 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccc 26065014  T
Q  294 ctctatctc 302  Q
    |||||||||    
T  26065013 ctctatctc 26065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26085279 - 26084974
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------ag 94  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||            ||    
T  26085279 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaag 26085180  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26085179 agaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 26085080  T
Q  195 a-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26085079 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccc 26084983  T
Q  294 ctctatctc 302  Q
    |||||||||    
T  26084982 ctctatctc 26084974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13057524 - 13057173
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||                
T  13057524 agaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 13057425  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  13057424 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttc 13057325  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13057324 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagc 13057225  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13057224 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 13057173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 3629850 - 3630199
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| || |             |    
T  3629850 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggagagagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaaaa 3629949  T
Q  94 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3629950 gagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttccc 3630049  T
Q  194 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 292  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3630050 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgatgtttcagccc 3630149  T
Q  293 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3630150 cctctatctcaagttttacattgatacaatgtctatatttatagtaaaag 3630199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 197 - 511
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072380
Alignment:
Q  197 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccttc 1072166  T
Q  297 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcg 396  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072167 tatctcaaagtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcg 1072266  T
Q  397 ccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacga-ttct 495  Q
    | |||  || |||||| ||||||||    |||| || |||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  1072267 ctgcctacgtaccatcgtgccacgaaaaatccaatgacttgcctc-aaaacttaaacctccaatcgtgccacgttgcccaaccatcgtaccacgatttct 1072365  T
Q  496 gcagaaacctgatttt 511  Q
    |||| |||||||||||    
T  1072366 gcag-aacctgatttt 1072380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3390705 - 3390357
Alignment:
Q  11 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat-atgatg-------------aaga 95  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||             ||||    
T  3390705 cacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaaga 3390606  T
Q  96 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3390605 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 3390506  T
Q  196 -gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 294  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3390505 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccg 3390406  T
Q  295 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3390405 tctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 3390357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 3631926 - 3632271
Alignment:
Q  9 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------ag 94  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||             ||    
T  3631926 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-acagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaag 3632024  T
Q  95 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3632025 agatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttccca 3632124  T
Q  195 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 293  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3632125 agatgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaactcc 3632224  T
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3632225 ctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 3632271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25477504 - 25477253
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25477504 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 25477405  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477404 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 25477305  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25477304 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 25477253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13040084 - 13039733
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||                
T  13040084 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 13039985  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||     
T  13039984 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttt 13039885  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13039884 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagc 13039785  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    | ||| |||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13039784 ctcctatatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 13039733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Original strand, 26932543 - 26932906
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttat-gacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||             
T  26932543 agaagaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgtta 26932642  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 188  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  26932643 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 26932742  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  26932743 ttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcttttctaagcccttgtttc 26932842  T
Q  288 agccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    | |||||||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26932843 aaccccctctatctctctctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 26932906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 222 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8995578 - 8995379
Alignment:
Q  222 ttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaa 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  8995578 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctcagtttactctgatacaa 8995479  T
Q  322 ggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacga 421  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||    
T  8995478 gatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtttctgttatttgctgtcagcgcaccatcgtgccacga 8995380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 342
Target Start/End: Original strand, 3233822 - 3234065
Alignment:
Q  100 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  3233822 tcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 3233921  T
Q  199 aatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3233922 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaaccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctct 3234021  T
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||| || |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3234022 atcttaaggtttacactgatacaa-gtctatatttatagtaaaag 3234065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22490870 - 22490618
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22490870 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 22490771  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc-taaacccttgtttcag 289  Q
     |||| || ||    || |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22490770 gcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttcaaaaacccttgtttcag 22490671  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||| |||||||    
T  22490670 ccccctctatctcaaggtttacactaattcaatgtctatatttatggtaaaag 22490618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 24338531 - 24338783
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  |  ||||| |  ||||||| ||| |||||| ||| |||||||     
T  24338531 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgtttt 24338630  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccc-tagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338631 ccaaggtaaatcaaccctcaaacccctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 24338730  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24338731 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24338783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 12161641 - 12161889
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||  ||||||| |||||||| ||| || ||| ||| ||||||||    
T  12161641 aagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttc 12161740  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12161741 ccaacgtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcca--gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcag- 12161837  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||| |||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12161838 cccctttatctcaaggtttacaatgatacaatgtctatatttaaagtaaaag 12161889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Original strand, 5273220 - 5273431
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------agagaaatcaatgggttaca 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||            ||||||||||||||||||||    
T  5273220 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttaca 5273319  T
Q  113 agaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5273320 agaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 5273419  T
Q  211 aaccctagtgtt 222  Q
    ||||||||||||    
T  5273420 aaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Original strand, 3027938 - 3028186
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||  ||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3027938 aagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 3028037  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 289  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  3028038 ccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcc-ttccaaacccttgttttcag 3028132  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028133 ccccttttatctcatggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3028186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 32447504 - 32447651
Alignment:
Q  196 gtgaatcaacccacaaacc-ctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 294  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447504 gtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 32447603  T
Q  295 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32447604 tctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 32447651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852520
Alignment:
Q  213 ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgct 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17852650 ccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttact 17852551  T
Q  313 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17852550 ctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 17852520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 383
Target Start/End: Original strand, 16455510 - 16455800
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | || | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  16455510 aagagatatcaaagggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttc 16455609  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 289  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  16455610 ccaaggtgaatcaa-ccac-aaccctagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaaccctagtttttgtgttgac-ttctaaacccttgttttcag 16455705  T
Q  290 ccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacg 383  Q
      | |||||  |||||| |||| |   |||||||||| ||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16455706 -actctctacctctcaaggtttacaccgatacaaggtatatatttatagtaaaggtatccctgaaaaattggaacaaatctgagcccaaaaatacg 16455800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 26066106 - 26066307
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |              
T  26066106 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttac 26066205  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  26066206 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 26066305  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  26066306 tc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15719872 - 15719666
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  15719872 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 15719773  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||||||| |   |||||||||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||    
T  15719772 ccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagc 15719685  T
Q  291 cccctctatctcaaagttt 309  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  15719684 cccctctatctcaaggttt 15719666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 26068377 - 26068578
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg----------- 91  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  26068377 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttac 26068476  T
Q  92 -aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  26068477 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtt 26068576  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  26068577 tc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 196 - 335
Target Start/End: Original strand, 13870611 - 13870749
Alignment:
Q  196 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 295  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13870611 gtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag-cccct 13870709  T
Q  296 ctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 335  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  13870710 ctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttata 13870749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 29754691 - 29754892
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  29754691 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 29754790  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  29754791 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 29754890  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  29754891 tc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33309188 - 33308988
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  33309188 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 33309089  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  33309088 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 33308990  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  33308989 tc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33311457 - 33311257
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||              
T  33311457 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 33311358  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  33311357 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 33311259  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  33311258 tc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14466553 - 14466312
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14466553 aagagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 14466454  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccac-aaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 289  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| | ||           || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  14466453 ccaagatgaatcaatcctcaaaaccctagtgtttgttgccaa-----------tagacaaactctagttttgctgttgtctttctaaactcttgtttcaa 14466365  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||| ||||||||||| ||||  | | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14466364 ccctctctatctcaaggtttattctaatacaaagtctatatctatagtaaaag 14466312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 196
Target Start/End: Original strand, 1069803 - 1069907
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1069803 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 1069902  T
Q  192 ccaag 196  Q
    |||||    
T  1069903 ccaag 1069907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17012270 - 17012029
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||  ||||||  || ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  17012270 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatattgtttc 17012171  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt-ttcag 289  Q
      || |||||||||||    |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||    
T  17012170 agaaggtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag-tttgttgtttac-ttctaaacccttttattcag 17012076  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 336  Q
     |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  17012075 acccctctatctcaaggtttactccgatacaaggtctatatttatag 17012029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346320
Alignment:
Q  177 tcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 275  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||   |        ||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccca---accctagtgtttgttgccaagag-caaattttatacaaaccctagtttgaat--------tcta 15346437  T
Q  276 aacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaac-aaatctgcaccc 374  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| || || | || ||||||| ||||||   | |    
T  15346436 aacccttggttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaatctcagctc 15346337  T
Q  375 aaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||||||||||||||||    
T  15346336 aaaaatacgtttctgtt 15346320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15367340 - 15367129
Alignment:
Q  28 acccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagag--cagccctccgatccactatatgatgaa-------------gagaaatcaatgggttaca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||             |||| || |||||||||||    
T  15367340 acccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaatgggttaca 15367241  T
Q  113 agaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaa 211  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||  ||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |    
T  15367240 agaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---a 15367144  T
Q  212 accctagtgtttgtt 226  Q
    |||||||||||||||    
T  15367143 accctagtgtttgtt 15367129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 33308802 - 33308700
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  33308802 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgaagcccagccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 33308704  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  33308703 tttt 33308700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 33311071 - 33310969
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  33311071 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgaagcccagccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 33310973  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  33310972 tttt 33310969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 26068765 - 26068867
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  26068765 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcatgccacgttgccttgccgtcgtgccacgattctgcagaaacctga 26068863  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  26068864 tttt 26068867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 8995366 - 8995287
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8995366 tgccacgatttttccagtgccttgcc-caaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagccatcgtgccacgattc 8995287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 9019813 - 9019734
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9019813 tgccacgatttttccagtgccttgcc-caaaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcccagccatcgtgccacgattc 9019734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 494
Target Start/End: Original strand, 19227837 - 19227916
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  19227837 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaattgaaa-cctccatcatgccacgttgcccaaccatcgtgccacgattc 19227916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 370
Target Start/End: Original strand, 26068590 - 26068662
Alignment:
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  26068590 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 26068662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19696670 - 19696394
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||| |   | |||||||| |||||||| ||  ||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  19696670 aagagatatcaaaggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgttt 19696571  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-ca 288  Q
    |||||| ||||||||      |||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  19696570 cccaaggtgaatcaatttg--aaccctagtgattgttgccaagag-caaactctatacaaaccctaattt-gttgtttg-tttctaaacccttgttttca 19696476  T
Q  289 gccc--cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||  |   |||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||||    
T  19696475 gccctccctctctctcaaggtttcatcatatacaaggtctatatttatagtaaaagaatccttcaaaaattggaacaaatct 19696394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 26066494 - 26066596
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||||||||    
T  26066494 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaataactaaaacc-tccatcgtgccacgttgccttgccgtcgtgccacgattctacagaaacctga 26066592  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  26066593 tttt 26066596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 29755162 - 29755264
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29755162 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagccgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 29755260  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  29755261 tttt 29755264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 368
Target Start/End: Original strand, 26066319 - 26066389
Alignment:
Q  298 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||    
T  26066319 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatct 26066389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 511
Target Start/End: Original strand, 11983457 - 11983551
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11983457 tgccacgatttttccagtgc-ttacctcacaa-ctgaaacc-tccatcgtaccatgttgcccaaccatcgtaccacgattctgcagaaacctgatttt 11983551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 368
Target Start/End: Original strand, 12186056 - 12186431
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 92  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  12186056 agaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 12186155  T
Q  93 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||  ||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  12186156 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgttt 12186255  T
Q  191 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgt-tgcctttctaaacccttgttt-c 287  Q
    |||||| |||||||||  |  |||||||||  || | ||    ||| |||| || |  ||| ||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||| |    
T  12186256 cccaaggtgaatcaac--aacaaccctagt--ttctcccgcttagagaaat-ctctctaaaaccttggtttgttgtctg--tttctaaacccttgttttc 12186348  T
Q  288 agccccctctatctcaaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt-ttcgcttaaaatttggaacaaatct 368  Q
    |||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  12186349 agccccttctatctcaaggtttacatgtgatacaaggtttatatttatagtaaaagtaatcgctaaaaaattggaacaaatct 12186431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10584212 - 10584105
Alignment:
Q  230 aagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctata 329  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||     ||||||||||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  10584212 aagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcttttataaacctttgttt-----ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttata 10584118  T
Q  330 tttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||||||    
T  10584117 tttatagtaaaag 10584105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Original strand, 24192635 - 24192707
Alignment:
Q  347 gcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccac 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24192635 gcttaaaatttggaacaaatttgcactgaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgccccatcatgccac 24192707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10584325 - 10584245
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  10584325 agaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactata 10584245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Original strand, 24191538 - 24191610
Alignment:
Q  347 gcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccac 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  24191538 gcttaaaatttggaacaaatttgcactgaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgccccatcataccac 24191610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 29754983 - 29755059
Alignment:
Q  294 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  29754983 ctctctctcagagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 29755059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26945374 - 26945269
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |   | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  26945374 aagagatatcaatgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtgttt 26945275  T
Q  191 cccaag 196  Q
    ||||||    
T  26945274 cccaag 26945269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15346655 - 15346589
Alignment:
Q  28 acccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  15346655 acccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactatatgatgaa 15346589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13878787 - 13878727
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13878787 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13883535 - 13883475
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13883535 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16785979 - 16785919
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16785979 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 26887346 - 26887406
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26887346 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 31248836 - 31248896
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31248836 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33308966 - 33308905
Alignment:
Q  309 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  33308966 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 33308905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33311235 - 33311174
Alignment:
Q  309 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  33311235 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 33311174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 35201448 - 35201508
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35201448 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25477611 - 25477543
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 74  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25477611 agaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctc 25477543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 86
Target Start/End: Original strand, 12937219 - 12937258
Alignment:
Q  47 gacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12937219 gacctagtctggggagagagcagccctccgttccactata 12937258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 1069703 - 1069773
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccg 76  Q
    |||||| ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1069703 agaacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccg 1069773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 3577637 - 3577696
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3577637 ctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 391
Target Start/End: Original strand, 12911710 - 12911835
Alignment:
Q  270 tttctaaacccttgtttcagcccc-ctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctata--tttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaa 365  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||   |||||||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  12911710 tttctaaaccctgttttcagcccctctgtatctcaaggtttatatttgatacaatgtctatatatttatagtaaaagtatccctaaaaatttggaataaa 12911809  T
Q  366 tctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||   | |||||||||| |||||||    
T  12911810 tctaagcacaaaaatacgattctgtt 12911835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17036115 - 17036058
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  17036115 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17036058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 17694973 - 17695030
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  17694973 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 408 - 469
Target Start/End: Original strand, 4816689 - 4816749
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacg 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  4816689 ccatcgtgccacgatttttccagtaccttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccacg 4816749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Original strand, 12166268 - 12166320
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  12166268 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 12166320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 3577515 - 3577555
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3577515 tgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 3577555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 13467492 - 13467532
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13467492 tgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 13467532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18318048 - 18318004
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18318048 tctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 18318004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 368
Target Start/End: Original strand, 12937457 - 12937559
Alignment:
Q  270 tttctaaacccttgtttcagcccc-ctctatctcaaagtttgctt-tgatacaaggtctata--tttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaa 365  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||| | | |||||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  12937457 tttctaaaccctgttttcagcccctctgtatctcaaggtttacatctgatacaatgtctatatatttatagtaaaagtatccctaaaaatttggaataaa 12937556  T
Q  366 tct 368  Q
    |||    
T  12937557 tct 12937559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 14466653 - 14466606
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagt 54  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14466653 agaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagt 14466606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 22963708 - 22963767
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22963708 tgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactat 22963767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23824685 - 23824626
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23824685 tgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactat 23824626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15346576 - 15346522
Alignment:
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcc 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||    
T  15346576 agagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcttaattttactcaaagtcc 15346522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 22351974 - 22352031
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  22351974 ctaattctacccaaa-tctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 86
Target Start/End: Original strand, 24338462 - 24338511
Alignment:
Q  36 cggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  24338462 cggtccaaattgacatagtctgggg-gagagcagccctccgtttcactata 24338511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25941703 - 25941652
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 182  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  25941703 ctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 25941652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Original strand, 26068697 - 26068758
Alignment:
Q  360 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  26068697 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 26068758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 3233710 - 3233795
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtcc-----ggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |     |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  3233710 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactata 3233795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13878883 - 13878842
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13878883 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 13878842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13883631 - 13883590
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13883631 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 13883590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15367086 - 15366963
Alignment:
Q  278 cccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc-------tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |       | |||||||| ||||||||||||||||||||| || || | || ||||||||||    |    
T  15367086 cccttggttcagccccctctatctcaaggtttacaccgatgtctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaatatc 15366987  T
Q  371 a-cccaaaaatacgtttctgttat 393  Q
    | ||||||||||||||| ||||||    
T  15366986 agcccaaaaatacgtttatgttat 15366963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16786075 - 16786034
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16786075 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 16786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 187
Target Start/End: Original strand, 19701985 - 19702041
Alignment:
Q  130 taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  19701985 taattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24436058 - 24436001
Alignment:
Q  28 acccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 84  Q
    ||||||| || |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24436058 acccagttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccacta 24436001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 35201352 - 35201393
Alignment:
Q  46 tgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35201352 tgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 35201393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5572330 - 5572270
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5572330 tgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 5572270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5757567 - 5757507
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  5757567 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 5757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 10077254 - 10077194
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10077254 tgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10077194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 86
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911511
Alignment:
Q  47 gacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 12911511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 281
Target Start/End: Original strand, 17904566 - 17904632
Alignment:
Q  211 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 281  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17904566 aaccttagtgtttgttgcaaagagaaaa---ctctacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaaccct 17904632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 21356044 - 21356104
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21356044 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 26887252 - 26887291
Alignment:
Q  46 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26887252 tgacctagtctgggg-gagagcagctctccgatccactata 26887291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3188 - 2753
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||           
T  3188 aagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgt 3089  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3088 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtg 2989  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2988 ttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 2889  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2888 cagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaagttctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 2789  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2788 atgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 2753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 2740 - 2661
Alignment:
Q  414 tgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||    
T  2740 tgccacgatttttccagtaccttgcctc-aaaactgaaacctccaatcgtgccacgttgcctagcaatcgtgtcacaattc 2661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4304 - 3872
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||            
T  4304 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacttt 4205  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4204 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 4105  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104 tttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 4006  T
Q  287 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 386  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4005 cagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 3906  T
Q  387 ctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacg 420  Q
     |||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  3905 atgttattcgctgccatcgcaccatcgtgccacg 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 69271 - 69709
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  69271 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgt 69370  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  69371 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 69470  T
Q  188 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69471 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 69570  T
Q  287 cagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatac 382  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  69571 cagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatataaggtctatatttattgtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatat 69669  T
Q  383 gtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  69670 gtttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgcaacgat 69709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 196 - 511
Target Start/End: Original strand, 73212 - 73529
Alignment:
Q  196 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73212 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 73311  T
Q  296 cta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 391  Q
    |||    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  73312 ctatctctctcaaagtttcctttgatacacggtctatatttatagtaaaagtatctcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatatgtttctgtt 73410  T
Q  392 attcgccgccagcgcaccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacga 491  Q
     ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||  | |||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  73411 tttcgctgccagcacaccatcgtgccacaatttttccagtgctttgcctc-aaacttgaaacctccaatcgtgccacgttgcctagccatcgtgccacga 73509  T
Q  492 ttctgcagaaacctgatttt 511  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  73510 ttctgcataaatctgatttt 73529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 418 - 511
Target Start/End: Original strand, 69726 - 69818
Alignment:
Q  418 acgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  69726 acgatttttccagtgctttgcctcaaact-tgaaacctccaatcgtgccacgttgcctagccatcgtgccacgattctgcagaaatctgatttt 69818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Original strand, 73163 - 73210
Alignment:
Q  184 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaa 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  73163 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttttttccaa 73210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 41462 - 41819
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||           
T  41462 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgt 41561  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  41562 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 41661  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41662 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 41761  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41762 tcagccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 41819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29479 - 29034
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  29479 aagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgt 29380  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29379 tacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 29280  T
Q  188 tttcccaagt-gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 286  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29279 tatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgttt 29180  T
Q  287 cagccccctcta----------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaa 376  Q
    ||||||||||||          |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  29179 cagccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttgtaacaaatctgcactcaa 29080  T
Q  377 aaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcatgccacgat 422  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29079 aaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 29034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 29005 - 28956
Alignment:
Q  462 gtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctgatttt 511  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29005 gtgccacgttgcccagccatcgtgccacgattctgcagaaacctgatttt 28956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 92 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15223 - 14902
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15223 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 15124  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15123 ccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatcattgtttcagc 15024  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15023 cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgt 14924  T
Q  391 tattcgccgccagcgcaccatc 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  14923 tattcgctgccagcgcaccatc 14902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 330
Target Start/End: Original strand, 14376 - 14707
Alignment:
Q  16 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatc 101  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||             ||||| |||    
T  14376 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatc 14475  T
Q  102 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14476 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 14575  T
Q  201 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||      
T  14576 tcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcatccccctctatc 14675  T
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatat 330  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  14676 tctcaaagtttgctctaaaacaaggtctatat 14707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15298 - 15236
Alignment:
Q  31 cagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15298 cagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatga 15236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6505 - 6124
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 92  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  6505 agaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 6406  T
Q  93 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  6405 aaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtt 6306  T
Q  190 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6305 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttca 6206  T
Q  289 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||||||||    
T  6205 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaaactgtaacaaatctgc 6124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6044 - 5942
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6044 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagccgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 5946  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  5945 tttt 5942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 183620 - 183975
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||           
T  183620 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacat 183719  T
Q  93 ------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagt 186  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  183720 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccg-taaccaagagactcaatcctaatagt 183818  T
Q  187 gtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  183819 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtt 183918  T
Q  286 tcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  183919 tcag-cccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 183975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52320 - 51961
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg---agagagcagccctccgatccactatatgatga----- 92  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||         
T  52320 aagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaac 52223  T
Q  93 --------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaaca 184  Q
            |||||  |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  52222 gttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 52123  T
Q  185 gtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 283  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52122 gtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttg 52023  T
Q  284 tttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52022 tttcagccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 51961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 50321 - 50235
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg---gagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||    
T  50321 aagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 79488 - 79140
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  79488 agaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 79389  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  79388 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 79289  T
Q  193 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  79288 caaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcc 79189  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 340  Q
    |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  79188 ccctctatctcaagttttactctgattcaaggtctatatttatagtaaa 79140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 11458 - 11809
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 92  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||                 
T  11458 agaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaa 11557  T
Q  93 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11558 agagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 11657  T
Q  193 caagtgaa-tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 291  Q
    ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  11658 caaggaaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaatccctgtttcagcc 11757  T
Q  292 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11758 ccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 11809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 348 - 34
Alignment:
Q  3 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 92  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  348 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgtta 249  T
Q  93 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 188  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  248 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 149  T
Q  189 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  148 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttc 49  T
Q  288 agccccctctatctc 302  Q
    |||||||||||||||    
T  48 agccccctctatctc 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2245 - 1988
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2245 aagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 2146  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaactctgtacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 2047  T
Q  291 cccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 343  Q
    ||||| ||      |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2046 cccctatatctttctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 2294 - 2258
Alignment:
Q  56 tggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 92  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2294 tggggagagagtagccctccgattcactatatgatga 2258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 1432 - 1673
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------- 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  1432 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgt 1531  T
Q  93 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1532 tacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 1631  T
Q  188 tttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1632 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 1673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35593
Alignment:
Q  116 ataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  215 ctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgcttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |   |||||   |    
T  35719 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cgcctctatcacccggtttgtact 35621  T
Q  315 gatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35620 gatacaatgtctatatttatagtaaaag 35593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 35897 - 35817
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  35897 agaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 80158 - 79812
Alignment:
Q  11 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agag 96  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||             ||||    
T  80158 cacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagag 80059  T
Q  97 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag 196  Q
    |  |||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  80058 atgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaat-ctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaag 79960  T
Q  197 -tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 294  Q
     ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  79959 gtgaatcaaccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccc 79860  T
Q  295 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  79859 tctatctcaaggtttacactgatacaaaaactatatttatagtaaaag 79812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 188364 - 188424
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  188364 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 85434 - 85184
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||  |||||||| ||| |||||||||  |||||||     
T  85434 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgtttt 85335  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |    
T  85334 ccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttttaaatccttgtttc-tc 85236  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 342  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  85235 ctcttctatctcaaggtttactttgatacaaagcctatatttatagtaaaag 85184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 85534 - 85454
Alignment:
Q  7 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 86  Q
    |||||||||||||||||  | |||  || | || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  85534 agaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactata 85454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Original strand, 15906 - 16193
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15906 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 16005  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
     ||| |||||||||||    |||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  16006 gcaaggtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaac 16101  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgctta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 381  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16102 cccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaatctcagcccaaaaata 16193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 16735 - 16981
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  16735 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgtttc 16834  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 289  Q
    | || ||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  16835 ctaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgtctttc-aaacccttgttttcag 16929  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 341  Q
    || |||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16930 cctcctctatctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatattaaaa 16981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 229 - 343
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1167
Alignment:
Q  229 aaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctat 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1053 aaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctat 1152  T
Q  329 atttatagtaaaagt 343  Q
    ||||||||| |||||    
T  1153 atttatagtgaaagt 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 333
Target Start/End: Original strand, 1727 - 1958
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  1727 aagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttc 1826  T
Q  192 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 290  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||          ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1827 ccaaggtgaatcaa-ccac-aaccctagtgtttgtt---------gaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagc 1914  T
Q  291 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatattta 333  Q
    | |||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  1915 cacctctatctctaggtttacatctgatacaaggtctatattta 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 7)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22421 - 22221
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg----------- 91  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  22421 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 22322  T
Q  92 -aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22321 aaagagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 22223  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  22222 tc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24696 - 24496
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg----------- 91  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  24696 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 24597  T
Q  92 -aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 189  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  24596 aaagagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 24498  T
Q  190 tc 191  Q
    ||    
T  24497 tc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22032 - 21930
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22032 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 21934  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  21933 tttt 21930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24307 - 24205
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24307 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact-aaaacctccatcgtgccgcgaagcccagctgtcgtgccacgattgtgcagaaacctga 24209  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  24208 tttt 24205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22206 - 22135
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  22206 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 22135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24481 - 24410
Alignment:
Q  299 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  24481 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 24410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 8508 - 8448
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8508 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 408 - 511
Target Start/End: Original strand, 12937 - 13039
Alignment:
Q  408 ccatcatgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaaccctccatcgtgccacgttgcccagccatcgtatcacgattctgcagaaacctga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12937 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacc-tccatcgtgccacgttgccttgacatcgtgccacgattctgcagaaacctga 13035  T
Q  508 tttt 511  Q
    ||||    
T  13036 tttt 13039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5014 - 4773
Alignment:
Q  92 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||  ||||||   | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5014 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 4915  T
Q  192 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cag 289  Q
    ||||  |||||||| |    ||| |||||||||||| |  ||||| |||  ||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |||| ||| |||    
T  4914 ccaacatgaatcaaactc--aactctagtgtttgttgctgagaga-aaacgctatataaaccctagttt-gttgcttactt-ctaaatcctttttttcag 4820  T
Q  290 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 336  Q
     |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4819 acccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 4773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Original strand, 4661 - 4733
Alignment:
Q  4 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctcc 75  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4661 agaacaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 224879 - 224819
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  224879 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 5691 - 5751
Alignment:
Q  26 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 85  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  5691 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1485
Alignment:
Q  1 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct 56  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1430 aagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16385 - 16328
Alignment:
Q  129 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  16385 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3136
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3095 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 17011 - 17052
Alignment:
Q  46 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17011 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 17052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University