View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12728_high_5 (Length: 552)

Name: NF12728_high_5
Description: NF12728
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12728_high_5
NF12728_high_5
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (53-534)||(3886356-3886837)
chr5 (1-438)||(3886908-3887345)
chr5 (53-431)||(2474315-2474693)
chr5 (53-414)||(22556446-22556808)
chr5 (68-438)||(22556894-22557265)
chr5 (53-433)||(2473869-2474239)
chr5 (52-438)||(188989-189363)
chr5 (141-438)||(8641886-8642182)
chr5 (54-397)||(1821817-1822160)
chr5 (142-438)||(34371611-34371907)
chr5 (142-414)||(17445330-17445602)
chr5 (142-441)||(42788494-42788793)
chr5 (142-438)||(34372067-34372363)
chr5 (142-369)||(21886066-21886293)
chr5 (142-438)||(34867789-34868073)
chr5 (142-438)||(2193815-2194099)
chr5 (137-406)||(8391205-8391473)
chr5 (142-414)||(10927278-10927550)
chr5 (142-397)||(27646727-27646982)
chr5 (142-432)||(15512869-15513160)
chr5 (137-397)||(20039367-20039626)
chr5 (157-406)||(18750079-18750328)
chr5 (142-365)||(10926870-10927093)
chr5 (53-400)||(30684445-30684792)
chr5 (143-414)||(18304431-18304702)
chr5 (53-400)||(30719694-30720041)
chr5 (153-406)||(29679990-29680236)
chr5 (197-438)||(20858393-20858633)
chr5 (138-397)||(39146934-39147186)
chr5 (143-421)||(24182114-24182391)
chr5 (75-219)||(22975080-22975224)
chr5 (127-438)||(2058508-2058819)
chr5 (223-425)||(11757145-11757347)
chr5 (142-315)||(42429145-42429317)
chr5 (273-439)||(30720110-30720276)
chr5 (271-397)||(8366594-8366719)
chr5 (143-397)||(1880081-1880330)
chr5 (137-433)||(4657852-4658144)
chr5 (145-423)||(16370578-16370852)
chr5 (364-433)||(21883941-21884010)
chr5 (287-439)||(30684861-30685013)
chr5 (179-315)||(32574632-32574767)
chr5 (314-395)||(187729-187810)
chr5 (313-393)||(38063725-38063804)
chr5 (142-396)||(5066781-5067038)
chr5 (148-257)||(11160713-11160822)
chr5 (192-294)||(4673466-4673568)
chr5 (272-341)||(4102925-4102994)
chr5 (145-258)||(43356651-43356762)
chr5 (288-404)||(5785990-5786106)
chr5 (267-315)||(39801025-39801073)
chr5 (221-253)||(39801498-39801530)
chr5 (351-438)||(11160605-11160692)
chr5 (356-411)||(21041405-21041460)
chr5 (288-395)||(26341169-26341276)
chr5 (68-112)||(34371969-34372013)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (53-433)||(30966144-30966524)
chr2 (53-438)||(30966600-30966985)
chr2 (53-438)||(24818236-24818620)
chr2 (53-405)||(29259504-29259856)
chr2 (53-438)||(5399668-5400053)
chr2 (138-438)||(25337848-25338148)
chr2 (179-440)||(33771037-33771298)
chr2 (142-438)||(33174957-33175251)
chr2 (142-397)||(16379392-16379647)
chr2 (144-413)||(16378938-16379207)
chr2 (138-375)||(41754284-41754521)
chr2 (179-393)||(8256562-8256776)
chr2 (138-397)||(1912520-1912778)
chr2 (142-406)||(25433939-25434203)
chr2 (68-427)||(30961745-30962111)
chr2 (75-438)||(82952-83312)
chr2 (142-342)||(11388188-11388386)
chr2 (142-394)||(15619897-15620149)
chr2 (142-331)||(29804681-29804870)
chr2 (145-438)||(30963114-30963407)
chr2 (142-413)||(33174504-33174772)
chr2 (142-391)||(1707041-1707289)
chr2 (275-438)||(32377758-32377921)
chr2 (53-392)||(1953067-1953403)
chr2 (179-342)||(11394571-11394732)
chr2 (142-397)||(27882818-27883073)
chr2 (190-439)||(15639781-15640030)
chr2 (249-430)||(32377575-32377756)
chr2 (187-421)||(13191018-13191252)
chr2 (152-406)||(30963603-30963857)
chr2 (143-331)||(38898870-38899058)
chr2 (142-293)||(18098874-18099025)
chr2 (153-421)||(8073902-8074170)
chr2 (170-297)||(20502050-20502176)
chr2 (192-422)||(16542034-16542263)
chr2 (142-253)||(18447954-18448065)
chr2 (315-396)||(8181254-8181335)
chr2 (367-438)||(29804871-29804942)
chr2 (291-400)||(18875874-18875983)
chr2 (335-397)||(36924373-36924435)
chr2 (351-406)||(20502172-20502227)
chr2 (153-286)||(9909102-9909235)
chr2 (337-414)||(11389677-11389754)
chr2 (337-414)||(11406338-11406415)
chr2 (154-246)||(8181394-8181486)
chr2 (194-258)||(36924453-36924519)
chr2 (200-321)||(26864785-26864905)
chr2 (181-422)||(37552606-37552844)
chr2 (273-425)||(3804249-3804401)
chr2 (353-400)||(26865142-26865189)
chr2 (358-397)||(38898817-38898856)
chr2 (53-85)||(30963466-30963498)
chr2 (68-112)||(33174859-33174903)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (51-430)||(13124994-13125374)
chr7 (53-430)||(9124869-9125246)
chr7 (52-430)||(18833195-18833573)
chr7 (77-440)||(2941606-2941969)
chr7 (53-406)||(42515002-42515355)
chr7 (142-439)||(28495853-28496150)
chr7 (142-438)||(2193255-2193551)
chr7 (142-438)||(36422251-36422546)
chr7 (53-281)||(11517397-11517624)
chr7 (142-433)||(2189143-2189434)
chr7 (142-420)||(42515543-42515821)
chr7 (142-414)||(34405466-34405738)
chr7 (53-398)||(5406478-5406823)
chr7 (142-439)||(6718925-6719221)
chr7 (142-444)||(28495464-28495755)
chr7 (179-438)||(2465960-2466218)
chr7 (77-438)||(25182296-25182656)
chr7 (239-439)||(7646328-7646528)
chr7 (142-413)||(22529111-22529382)
chr7 (138-397)||(679812-680071)
chr7 (227-430)||(13122363-13122567)
chr7 (142-397)||(35474013-35474268)
chr7 (138-413)||(2611535-2611803)
chr7 (67-233)||(13124757-13124923)
chr7 (183-363)||(2465773-2465953)
chr7 (137-406)||(29038903-29039172)
chr7 (140-438)||(6747457-6747747)
chr7 (242-438)||(7646514-7646710)
chr7 (138-397)||(29357348-29357606)
chr7 (142-350)||(46425740-46425947)
chr7 (86-397)||(31406481-31406787)
chr7 (261-400)||(43776179-43776318)
chr7 (142-340)||(35527070-35527268)
chr7 (261-406)||(3305231-3305376)
chr7 (137-395)||(9623202-9623459)
chr7 (167-406)||(26421643-26421882)
chr7 (146-344)||(1628719-1628914)
chr7 (147-327)||(20966055-20966235)
chr7 (323-438)||(43233137-43233252)
chr7 (143-296)||(36015404-36015557)
chr7 (131-279)||(31743834-31743982)
chr7 (142-264)||(43233412-43233534)
chr7 (142-243)||(26957603-26957704)
chr7 (193-397)||(11372501-11372697)
chr7 (179-307)||(26421287-26421415)
chr7 (346-406)||(6747959-6748019)
chr7 (334-438)||(36422573-36422677)
chr7 (178-400)||(37672195-37672417)
chr7 (356-420)||(26419104-26419168)
chr7 (265-396)||(37671654-37671785)
chr7 (179-281)||(16192355-16192457)
chr7 (352-413)||(7461258-7461319)
chr7 (142-227)||(3305374-3305459)
chr7 (455-502)||(4162602-4162649)
chr7 (173-321)||(6585638-6585787)
chr7 (379-438)||(43776321-43776380)
chr7 (351-397)||(31743781-31743827)
chr7 (181-240)||(2490077-2490136)
chr7 (137-247)||(33316721-33316832)
chr7 (351-397)||(36015361-36015407)
chr7 (59-124)||(1628648-1628713)
chr7 (215-296)||(7461344-7461424)
chr7 (273-322)||(30572413-30572462)
chr7 (68-112)||(2189501-2189545)
chr7 (179-235)||(16811900-16811956)
chr7 (68-112)||(34405792-34405836)
[»] chr4 (89 HSPs)
chr4 (53-423)||(35871538-35871907)
chr4 (52-439)||(23350127-23350514)
chr4 (53-413)||(44471195-44471555)
chr4 (52-430)||(49998545-49998923)
chr4 (53-444)||(44470714-44471099)
chr4 (142-375)||(12691907-12692140)
chr4 (142-438)||(50398383-50398679)
chr4 (179-438)||(7678467-7678726)
chr4 (142-438)||(24629281-24629574)
chr4 (76-430)||(14572007-14572357)
chr4 (53-423)||(27578317-27578683)
chr4 (142-413)||(1645619-1645890)
chr4 (142-438)||(4127739-4128030)
chr4 (53-438)||(13266002-13266381)
chr4 (142-397)||(23942675-23942930)
chr4 (53-322)||(15306052-15306326)
chr4 (142-438)||(50398839-50399134)
chr4 (142-393)||(9423748-9423999)
chr4 (192-438)||(23943087-23943333)
chr4 (142-438)||(31817699-31817993)
chr4 (142-438)||(3169205-3169501)
chr4 (142-438)||(51331128-51331422)
chr4 (54-397)||(27578795-27579137)
chr4 (142-425)||(4127276-4127578)
chr4 (142-406)||(21067281-21067545)
chr4 (142-433)||(1464146-1464436)
chr4 (142-331)||(24628929-24629121)
chr4 (76-302)||(14571702-14571928)
chr4 (209-378)||(50814730-50814899)
chr4 (137-397)||(14351789-14352049)
chr4 (114-408)||(8467688-8467966)
chr4 (178-400)||(27026538-27026759)
chr4 (164-397)||(21067755-21067985)
chr4 (53-400)||(41869830-41870175)
chr4 (142-343)||(21220272-21220472)
chr4 (192-420)||(17628560-17628788)
chr4 (136-383)||(17029323-17029570)
chr4 (126-395)||(17028858-17029126)
chr4 (142-406)||(29628531-29628808)
chr4 (137-395)||(13613786-13614043)
chr4 (142-308)||(53996090-53996256)
chr4 (273-397)||(27578172-27578296)
chr4 (187-398)||(33764904-33765115)
chr4 (203-382)||(20306063-20306241)
chr4 (272-426)||(14571545-14571699)
chr4 (197-300)||(27029331-27029434)
chr4 (318-427)||(15268029-15268138)
chr4 (142-305)||(31817376-31817539)
chr4 (179-406)||(23976095-23976323)
chr4 (137-413)||(52048547-52048813)
chr4 (346-438)||(35477863-35477955)
chr4 (145-384)||(4185717-4185956)
chr4 (283-406)||(40607071-40607194)
chr4 (314-440)||(31816981-31817107)
chr4 (145-389)||(24271445-24271690)
chr4 (154-320)||(43928927-43929092)
chr4 (314-406)||(7381438-7381530)
chr4 (126-315)||(17628951-17629139)
chr4 (216-326)||(23091468-23091578)
chr4 (338-406)||(4414264-4414332)
chr4 (261-372)||(11828396-11828507)
chr4 (149-258)||(45682209-45682318)
chr4 (272-397)||(53854733-53854858)
chr4 (126-371)||(26200205-26200444)
chr4 (192-292)||(44831046-44831146)
chr4 (200-291)||(4186224-4186315)
chr4 (88-207)||(20309594-20309710)
chr4 (51-206)||(2682707-2682861)
chr4 (181-304)||(42838661-42838787)
chr4 (197-315)||(34554483-34554601)
chr4 (142-232)||(53854858-53854948)
chr4 (373-438)||(50399334-50399399)
chr4 (360-413)||(53996000-53996053)
chr4 (348-400)||(5810039-5810091)
chr4 (366-438)||(13265859-13265931)
chr4 (126-190)||(33987164-33987227)
chr4 (142-213)||(10165953-10166024)
chr4 (239-397)||(33294778-33294936)
chr4 (221-259)||(39902477-39902515)
chr4 (146-264)||(53391890-53392008)
chr4 (290-355)||(50399270-50399335)
chr4 (248-324)||(52299826-52299902)
chr4 (147-242)||(17506389-17506484)
chr4 (358-413)||(33987019-33987074)
chr4 (356-427)||(34801230-34801301)
chr4 (359-397)||(2499388-2499426)
chr4 (141-195)||(35477801-35477855)
chr4 (71-112)||(27029182-27029223)
chr4 (68-112)||(50398733-50398777)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (53-438)||(10210-10594)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (53-441)||(107311-107699)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (53-438)||(105630-106015)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (53-438)||(31284127-31284512)
chr3 (79-438)||(8067216-8067575)
chr3 (77-430)||(27187188-27187542)
chr3 (138-440)||(28561741-28562042)
chr3 (138-438)||(39653159-39653459)
chr3 (151-433)||(11179890-11180172)
chr3 (53-438)||(25248021-25248407)
chr3 (142-438)||(16811380-16811674)
chr3 (142-433)||(13149955-13150246)
chr3 (142-438)||(32227072-32227368)
chr3 (187-438)||(13150405-13150656)
chr3 (142-440)||(50347745-50348043)
chr3 (56-343)||(41472214-41472500)
chr3 (178-428)||(32386595-32386845)
chr3 (142-438)||(16810924-16811220)
chr3 (142-438)||(32227500-32227795)
chr3 (138-396)||(30529682-30529939)
chr3 (142-438)||(14813948-14814244)
chr3 (53-413)||(7477102-7477461)
chr3 (53-413)||(7493792-7494151)
chr3 (142-438)||(14820153-14820449)
chr3 (53-395)||(41473907-41474249)
chr3 (143-406)||(20885000-20885263)
chr3 (143-413)||(25230124-25230394)
chr3 (143-413)||(25237711-25237981)
chr3 (143-406)||(25230588-25230851)
chr3 (143-406)||(25238175-25238438)
chr3 (142-443)||(37045034-37045332)
chr3 (195-406)||(4067243-4067454)
chr3 (187-397)||(25238576-25238786)
chr3 (53-214)||(12820554-12820715)
chr3 (50-176)||(32388844-32388970)
chr3 (142-413)||(2911094-2911354)
chr3 (142-331)||(39640936-39641125)
chr3 (182-339)||(29224363-29224520)
chr3 (179-406)||(25802431-25802658)
chr3 (142-383)||(25802910-25803151)
chr3 (142-296)||(25239070-25239224)
chr3 (232-406)||(53150695-53150869)
chr3 (215-406)||(3899872-3900063)
chr3 (345-438)||(41473743-41473836)
chr3 (203-397)||(15392570-15392764)
chr3 (203-397)||(15405606-15405800)
chr3 (142-281)||(32796943-32797082)
chr3 (203-397)||(15388203-15388397)
chr3 (203-397)||(15417431-15417625)
chr3 (203-397)||(15411015-15411209)
chr3 (170-397)||(31103850-31104079)
chr3 (190-438)||(26309840-26310088)
chr3 (346-413)||(25239003-25239070)
chr3 (203-395)||(15377344-15377536)
chr3 (203-397)||(15376056-15376250)
chr3 (356-397)||(25230989-25231030)
chr3 (176-315)||(47518296-47518432)
chr3 (348-397)||(18318860-18318909)
chr3 (285-384)||(32745994-32746093)
chr3 (273-391)||(26436022-26436140)
chr3 (233-295)||(43736715-43736777)
chr3 (336-400)||(26436241-26436305)
chr3 (215-260)||(3890050-3890095)
chr3 (68-109)||(13150302-13150343)
chr3 (146-231)||(45047071-45047156)
chr3 (272-340)||(15410630-15410698)
chr3 (68-112)||(25238872-25238916)
chr3 (75-111)||(33466910-33466946)
chr3 (359-399)||(36763837-36763877)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (53-439)||(35759458-35759844)
chr1 (142-438)||(20054387-20054683)
chr1 (142-438)||(20054843-20055139)
chr1 (142-438)||(20055299-20055595)
chr1 (142-438)||(20055755-20056051)
chr1 (142-438)||(20056211-20056507)
chr1 (142-438)||(20057114-20057410)
chr1 (76-439)||(46693585-46693950)
chr1 (142-438)||(20053931-20054227)
chr1 (138-438)||(20057570-20057870)
chr1 (142-438)||(38340905-38341201)
chr1 (142-438)||(50002926-50003222)
chr1 (55-358)||(35760845-35761148)
chr1 (142-440)||(20845510-20845808)
chr1 (142-438)||(50002558-50002854)
chr1 (179-438)||(20056667-20056926)
chr1 (142-443)||(52250205-52250506)
chr1 (142-438)||(16451784-16452080)
chr1 (142-438)||(16460937-16461233)
chr1 (67-292)||(20061188-20061413)
chr1 (53-291)||(2328225-2328463)
chr1 (198-430)||(20060199-20060431)
chr1 (153-431)||(51372732-51373010)
chr1 (142-397)||(43057415-43057670)
chr1 (241-443)||(52250641-52250843)
chr1 (241-443)||(52250978-52251180)
chr1 (142-406)||(43056948-43057211)
chr1 (61-397)||(23180649-23180984)
chr1 (142-328)||(50002246-50002432)
chr1 (142-397)||(12883523-12883776)
chr1 (127-328)||(2634909-2635109)
chr1 (178-439)||(16907269-16907531)
chr1 (143-372)||(31822577-31822809)
chr1 (142-342)||(30872897-30873097)
chr1 (137-343)||(7548085-7548291)
chr1 (126-397)||(2634449-2634720)
chr1 (179-308)||(12728027-12728157)
chr1 (181-401)||(16410611-16410831)
chr1 (317-438)||(31822970-31823091)
chr1 (350-438)||(35759915-35760003)
chr1 (181-398)||(16440470-16440687)
chr1 (142-307)||(10820591-10820758)
chr1 (225-438)||(7229794-7230007)
chr1 (297-413)||(7547791-7547907)
chr1 (356-438)||(49996531-49996613)
chr1 (364-432)||(28181350-28181418)
chr1 (166-315)||(2739545-2739694)
chr1 (215-276)||(31823097-31823158)
chr1 (355-406)||(39582553-39582604)
chr1 (275-341)||(7067867-7067933)
chr1 (267-329)||(8278081-8278143)
chr1 (215-397)||(46411030-46411208)
chr1 (267-331)||(35009954-35010018)
chr1 (154-315)||(842907-843068)
chr1 (49-90)||(2328150-2328191)
chr1 (356-413)||(35168718-35168775)
chr1 (452-487)||(918330-918365)
chr1 (68-112)||(20054281-20054325)
chr1 (68-112)||(20054737-20054781)
chr1 (68-112)||(20055193-20055237)
chr1 (68-112)||(20055649-20055693)
chr1 (68-112)||(20056105-20056149)
chr1 (68-112)||(20056561-20056605)
chr1 (68-112)||(20057008-20057052)
chr1 (68-112)||(20057464-20057508)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (48-413)||(12100597-12100960)
chr8 (53-427)||(25147446-25147819)
chr8 (53-438)||(34308330-34308715)
chr8 (53-438)||(34308786-34309175)
chr8 (68-438)||(25147892-25148261)
chr8 (53-438)||(21315961-21316345)
chr8 (143-438)||(22548400-22548695)
chr8 (142-438)||(22548846-22549142)
chr8 (148-438)||(17103086-17103377)
chr8 (53-328)||(25144682-25144957)
chr8 (142-438)||(22026378-22026675)
chr8 (142-438)||(27022190-27022485)
chr8 (142-406)||(41658988-41659252)
chr8 (142-438)||(12827105-12827401)
chr8 (142-438)||(27925898-27926193)
chr8 (146-438)||(10844466-10844758)
chr8 (138-397)||(8080234-8080493)
chr8 (142-406)||(2044057-2044321)
chr8 (52-432)||(27819105-27819482)
chr8 (142-397)||(32292396-32292651)
chr8 (139-433)||(28453334-28453628)
chr8 (218-438)||(31283503-31283722)
chr8 (138-397)||(33852150-33852409)
chr8 (178-413)||(41913005-41913240)
chr8 (142-303)||(10844882-10845043)
chr8 (52-392)||(22705089-22705424)
chr8 (142-327)||(6464872-6465057)
chr8 (294-438)||(32292092-32292236)
chr8 (154-301)||(28375042-28375189)
chr8 (138-413)||(30527358-30527630)
chr8 (192-400)||(15818905-15819112)
chr8 (168-400)||(3744663-3744895)
chr8 (143-406)||(6466711-6466969)
chr8 (146-397)||(3745104-3745355)
chr8 (138-331)||(22840488-22840680)
chr8 (142-413)||(30334786-30335055)
chr8 (178-378)||(1297042-1297242)
chr8 (141-433)||(6466255-6466546)
chr8 (153-264)||(27021904-27022015)
chr8 (53-199)||(9250913-9251057)
chr8 (137-329)||(15567516-15567708)
chr8 (242-390)||(10729722-10729870)
chr8 (232-406)||(25307855-25308027)
chr8 (53-129)||(31283356-31283432)
chr8 (155-400)||(15567898-15568139)
chr8 (143-254)||(17429501-17429611)
chr8 (346-395)||(6463438-6463487)
chr8 (356-440)||(9251098-9251182)
chr8 (239-372)||(10729603-10729736)
chr8 (295-404)||(28374008-28374116)
chr8 (266-393)||(29971323-29971448)
chr8 (138-240)||(29971450-29971552)
chr8 (351-413)||(34688044-34688106)
chr8 (249-338)||(44041986-44042075)
chr8 (351-397)||(29117444-29117490)
chr8 (361-397)||(22840441-22840477)
chr8 (353-400)||(12119226-12119273)
chr8 (137-207)||(25307759-25307829)
chr8 (188-250)||(36968434-36968496)
chr8 (200-237)||(3508790-3508827)
chr8 (68-112)||(10844784-10844828)
chr8 (233-313)||(34687920-34688000)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (53-441)||(13492699-13493088)
chr6 (68-433)||(7912235-7912600)
chr6 (52-431)||(9351972-9352350)
chr6 (53-430)||(13191372-13191749)
chr6 (77-438)||(7911812-7912173)
chr6 (135-438)||(17027382-17027685)
chr6 (65-440)||(17730958-17731337)
chr6 (142-430)||(20850320-20850608)
chr6 (53-343)||(16519879-16520168)
chr6 (138-438)||(23776436-23776735)
chr6 (142-440)||(20896536-20896835)
chr6 (142-438)||(23986168-23986464)
chr6 (142-438)||(2681071-2681363)
chr6 (204-427)||(13492393-13492617)
chr6 (142-413)||(2890715-2890985)
chr6 (126-413)||(9440185-9440472)
chr6 (140-397)||(20126074-20126331)
chr6 (106-438)||(9440708-9441037)
chr6 (138-439)||(21311966-21312267)
chr6 (142-397)||(17850917-17851172)
chr6 (151-396)||(2720456-2720702)
chr6 (142-438)||(21311514-21311810)
chr6 (242-439)||(28780209-28780406)
chr6 (142-391)||(6330811-6331059)
chr6 (142-397)||(14771611-14771866)
chr6 (142-397)||(17851373-17851628)
chr6 (142-380)||(11062285-11062522)
chr6 (138-281)||(27334156-27334299)
chr6 (138-281)||(27394896-27395039)
chr6 (179-425)||(20735731-20735977)
chr6 (181-329)||(15929620-15929768)
chr6 (178-406)||(1991588-1991816)
chr6 (142-373)||(33774918-33775151)
chr6 (142-291)||(3652485-3652634)
chr6 (115-315)||(32292858-32293055)
chr6 (77-201)||(13490055-13490179)
chr6 (177-400)||(20732612-20732834)
chr6 (102-232)||(9440485-9440614)
chr6 (137-277)||(31821704-31821844)
chr6 (286-413)||(3652666-3652793)
chr6 (137-395)||(12194324-12194580)
chr6 (136-428)||(28582957-28583249)
chr6 (242-406)||(2891177-2891340)
chr6 (182-397)||(3884984-3885194)
chr6 (145-380)||(28065745-28065982)
chr6 (289-397)||(3653048-3653152)
chr6 (170-395)||(30729735-30729958)
chr6 (188-402)||(17205384-17205597)
chr6 (355-414)||(27334305-27334364)
chr6 (355-414)||(27395045-27395104)
chr6 (145-213)||(3652981-3653049)
chr6 (346-397)||(11062032-11062083)
chr6 (351-406)||(31415972-31416026)
chr6 (348-438)||(15929344-15929434)
chr6 (221-329)||(34660468-34660576)
chr6 (363-438)||(6331219-6331294)
chr6 (357-439)||(21312453-21312534)
chr6 (187-304)||(33470882-33470998)
chr6 (68-112)||(11062187-11062231)
chr6 (451-506)||(21246925-21246980)
chr6 (335-397)||(1663999-1664061)
chr6 (351-413)||(26380920-26380982)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (53-438)||(2061-2446)
scaffold0040 (52-105)||(2554-2607)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (53-433)||(162533-162914)
scaffold0022 (239-441)||(163167-163369)
scaffold0022 (242-438)||(162985-163181)
scaffold0022 (84-438)||(69666-70019)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (135-438)||(18958-19261)
scaffold0322 (71-207)||(18203-18339)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (142-439)||(1219-1516)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (142-414)||(1926-2198)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (142-438)||(2741-3037)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (142-433)||(154756-155047)
scaffold0002 (346-438)||(154505-154597)
scaffold0002 (68-109)||(154659-154700)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (142-413)||(4560-4830)
scaffold0333 (142-438)||(5015-5315)
scaffold0333 (346-397)||(5325-5377)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (76-430)||(245019-245369)
scaffold0005 (76-302)||(245448-245674)
scaffold0005 (272-426)||(245677-245831)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (52-258)||(142305-142511)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (229-440)||(13382-13593)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (142-394)||(17493-17745)
scaffold0047 (138-397)||(18027-18285)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (242-439)||(14552-14749)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (286-441)||(1549-1704)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (192-441)||(2154-2394)
scaffold0557 (142-190)||(749-797)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (254-439)||(421-606)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (142-400)||(14740-14998)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (141-278)||(3993-4130)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (142-255)||(23672-23785)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (147-404)||(26074-26329)
scaffold0036 (261-406)||(16163-16307)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (203-397)||(44613-44807)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (143-254)||(45387-45497)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (272-413)||(7071-7211)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (339-397)||(37205-37263)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (366-428)||(62968-63030)
scaffold0065 (366-438)||(67214-67286)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (369-433)||(1-65)
[»] scaffold1138 (2 HSPs)
scaffold1138 (143-252)||(734-843)
scaffold1138 (226-264)||(271-309)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (259-343)||(246711-246795)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3886837 - 3886356
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3886837 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggaatggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 3886738  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886737 gaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgcatggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 3886638  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3886637 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacgtggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcg 3886538  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactttgatcctcgtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3886537 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcattctgggatgttacactttgatcctcgct 3886438  T
Q  453 ctaatgagatatcactacccaagatgtttgtaaagtatttctcaacccaagaatgtcgtcctaagacactcaacccttggcc 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886437 ctaatgagatatcactacccaagatgtttgtaaagtatttctcaacccaagaatgtcgtcctaagacactcaacccttggcc 3886356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3887345 - 3886908
Alignment:
Q  1 tgtcactctacgcacaatgagatcataaaagaaatcaaaagagaaagttttgtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3887345 tgtcactctacgcacaatgagatcataaaagaaatcaaaagagaaagttttgtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaggg 3887246  T
Q  101 cggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttga 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3887245 cggggagtggtccagctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttga 3887146  T
Q  201 aggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttg 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3887145 aggaagacttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttg 3887046  T
Q  301 acttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3887045 acttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgacaagactcgtgttggtttgtggg 3886946  T
Q  401 atcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3886945 gtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 3886908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 53 - 431
Target Start/End: Original strand, 2474315 - 2474693
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2474315 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2474414  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2474415 gaatgagagagatcctaaggtcgtacagatatgggactgcatggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2474514  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||  ||||||     
T  2474515 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgacctaccggaaagtttcccggtaagca 2474614  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggga 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  2474615 tgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctggga 2474693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 53 - 414
Target Start/End: Original strand, 22556446 - 22556808
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556446 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 22556545  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556546 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 22556645  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||   |||||||    
T  22556646 tcttttcggtagctcattctttaagaacttcacagttaagcgtggctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccaggaagtttctcggtaagcg 22556745  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctg-aaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  22556746 tgcgagtgaggacaaaacacgctgtaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatc 22556808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 68 - 438
Target Start/End: Original strand, 22556894 - 22557265
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  22556894 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttcttggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagttca 22556993  T
Q  168 tgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctc 267  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22556994 tgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 22557093  T
Q  268 atttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaa 367  Q
    |||   ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22557094 attctttaagaacttcacagttaagcgtgcctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaa 22557193  T
Q  368 aacacgctg-aaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| ||||    
T  22557194 aacacgctgtaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatcctgaatgtcgtctgggatgttaca 22557265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 53 - 433
Target Start/End: Original strand, 2473869 - 2474239
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2473869 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaagctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttttaggaaaaactgaatcacatcg 2473968  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2473969 gaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 2474068  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||  |||||||    
T  2474069 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccta----------tcccggtaagcg 2474158  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||| |||||||    
T  2474159 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtatgggatg 2474239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 52 - 438
Target Start/End: Original strand, 188989 - 189363
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||            ||||||||||||||||||||||||    
T  188989 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatataacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccgg------------ttctaggcaaaactgaatcacatc 189076  T
Q  152 ggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  189077 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgtatc 189176  T
Q  252 ttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagc 351  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  |||| |    
T  189177 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcccggtaaac 189276  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  189277 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtccgcaatcctgaaagtagtctgggatgttaca 189363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 141 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8642182 - 8641886
Alignment:
Q  141 tgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaa 240  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8642182 tgaatcacatcagaatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaa 8642083  T
Q  241 caagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtt 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  8642082 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttaagatgggtgacctac-gggaagtt 8641984  T
Q  341 tcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8641983 tctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 8641886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 54 - 397
Target Start/End: Original strand, 1821817 - 1822160
Alignment:
Q  54 gtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcgg 153  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  1821817 gtaatgcctctgcttggtgggcatgtaacgtctgaggctgacgagggtggggagtggtccggctcatggcatgcttctaggcaaagttgaattacatcgg 1821916  T
Q  154 aatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1821917 aatgagagagatcttaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 1822016  T
Q  254 cttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgt 353  Q
    |||||  ||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  1822017 ctttttggtagcccattccataagaactccacatttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgt 1822116  T
Q  354 gcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1822117 gtgaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 1822160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 34371611 - 34371907
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34371611 gaatcacaccggaatgagagggttcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaac 34371710  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34371711 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacaccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagttt 34371810  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34371811 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34371907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 142 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17445602 - 17445330
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17445602 gaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 17445503  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17445502 aagatgcatcttcttatcggtagctcattccataagaaatccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 17445403  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17445402 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatc 17445330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 42788793 - 42788494
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |||  ||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42788793 gaatcacaacggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 42788694  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  42788693 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccacaagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagttt 42788594  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactt 441  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  42788593 ctcggtaagcttgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggagtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttacactt 42788494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 34372067 - 34372363
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| | ||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34372067 gaatcacaccagaatgagagggttcccaaggccgtacaagtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaac 34372166  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  34372167 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggattggtgacctaccgggaagttt 34372266  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  34372267 tccgataagcgtgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaatactcgtgttggtttatggcgtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggaatgttaca 34372363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21886293 - 21886066
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21886293 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacatatatcaac 21886194  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21886193 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaaagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagttt 21886094  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaa 369  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21886093 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaa 21886066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 34867789 - 34868073
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34867789 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 34867888  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||| |            
T  34867889 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccatagttaagcgtgcttaactttgagcaattttgggataggtgacttaccg-------- 34867980  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
        |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34867981 ----gtaagcgtgcaagtaaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttgatttgtgggatccgtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34868073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 2193815 - 2194099
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2193815 gaatcacgccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 2193914  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |            
T  2193915 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccg-------- 2194006  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  2194007 ----gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 2194099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 137 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8391473 - 8391205
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  8391473 aaaccgaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtact-cctgta 8391375  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8391374 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 8391275  T
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8391274 agtttctcgataaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggtcagt 8391205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 10927550 - 10927278
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10927550 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 10927451  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  10927450 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccgaccgggaagttt 10927351  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
        ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  10927350 ttcggtaagcgtgtgaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcggtcgacaatc 10927278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27646982 - 27646727
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  || |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27646982 gaatcacatcggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctataacaac 27646883  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27646882 aagatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgtcttggagtagtctttgcatgggtgacctaccgggaagttt 27646783  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27646782 cccaataaacgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcatgttggtttgt 27646727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 142 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15513160 - 15512869
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaag--gcttatatgaattatttggtactacctatatca 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||  ||  |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  15513160 gaatcacatcggaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattgtt-ggtactaccaatatca 15513062  T
Q  240 acaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagt 339  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  15513061 acaagatgcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacaattaaacgtgcttgacttgaagcaattttgggatggatgacctaccgggaagt 15512962  T
Q  340 ttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggat 432  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  15512961 ttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggat 15512869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 137 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20039626 - 20039367
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20039626 aaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 20039527  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| |||||    
T  20039526 tcaacaagatgcattttcttttg-gtagcccattccataagaactctacagttaagtgtgcttgacttagagtagtctttggattggtgacctattggga 20039428  T
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20039427 agtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt 20039367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 157 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18750328 - 18750079
Alignment:
Q  157 gagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 256  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18750328 gagagagatcctgaagtcgtgcaggtttggaactgcatggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcatcttctt 18750229  T
Q  257 ttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcg 356  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  ||| ||| |||||    
T  18750228 ttcggtagcttattccataagaactccataattaatcgtacttgacttggagcaattttaggatgggtgaccttctaggaagttttttagaaagtgtgcg 18750129  T
Q  357 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18750128 agtgaggacaaaacacactgaaaagactcgagttggtttgtggggtcagt 18750079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10927093 - 10926870
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10927093 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 10926994  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||| |||  ||||  |||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10926993 aagatgcatcttccttttggtagtccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagttt 10926894  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggac 365  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||    
T  10926893 cctggtaagcgtgtgagtgaggac 10926870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30684792 - 30684445
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||  | ||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  30684792 tgtaatgcctctgcttggtggtcatgtaacgtccgagactgacaagggcaggtagtggtccgactcctggcatgcttataggcaaaaccaaatcacatcg 30684693  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||| | ||||||||||| || || |||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30684692 gaatgagggggatcctgaggttgtgcaagtatggaacatcattgttgaagggaggcttatatgaattgtttggtactatctataaaaacaagatgcatct 30684593  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||| |||   |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||     |||||    
T  30684592 tcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacagttaagcgtgctcaacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgaaaagtttctcgaaaagcg 30684493  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    ||||||| ||||||||| |  || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  30684492 tgcgagtaaggacaaaatatactaaaaagactcatattgatttgtggg 30684445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 143 - 414
Target Start/End: Original strand, 18304431 - 18304702
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| | || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18304431 aatcacaacggaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgtttggtactacctatatcaaca 18304530  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||    
T  18304531 agatgcatattcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcatgtttgacttggagcaattttgtgatgggtgaccttttgagaagtttc 18304630  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
      || ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||| || |||||    
T  18304631 acagaaattgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaacaaactcgtgttgatttctggggtcagatggcaatc 18304702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30720041 - 30719694
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  | |||  | ||||||| | |||||| || |||| | |||||||| ||||||||||     
T  30720041 tgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgtccgagactgacaagggcatgtagtggtccgactcctgacacgcttattggcaaaaccgaatcacatca 30719942  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30719941 gaatgagagggatcctgaggttgtgcaagtatgggacatcattgttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctataaaaacaagatgcatct 30719842  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||| |||   |||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||   ||||||| |   |||||    
T  30719841 tcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacaattaagcgtgctcaacttggagcaattttgggacgggtgacattctaaaaagtttcttgaaaagcg 30719742  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    |||||| ||| ||||||||  || ||||||||||| ||  ||||||||    
T  30719741 tgcgagagagaacaaaacatactaaaaagactcgtattaatttgtggg 30719694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29680236 - 29679990
Alignment:
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29680236 gaatgagagagatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataag-------tggtaatacctatatcaacaagatgcatct 29680144  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| | | |||||||||   ||||||    
T  29680143 tctttttggtagcccattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgaccttccgagaagtttcccgataagcg 29680044  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29680043 tgcaaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagt 29679990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20858633 - 20858393
Alignment:
Q  197 ttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtg 296  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||    
T  20858633 ttgaagaaaggcttataagaattgtttggtattttctatatcaacaagatgcttcttcttttctgtagctcattccataagaactccatagttaaggttg 20858534  T
Q  297 cttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20858533 cttgacttggagcaactttgggat-ggtgaccttctgggaagttttctgaaaagcatgctagtgaggacaaaacacgctgaaaatactcgtgttgatttg 20858435  T
Q  397 tgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |  | ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  20858434 ttaggtcagtcgacaatcctgaaagaagtttgggatgttaca 20858393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 397
Target Start/End: Original strand, 39146934 - 39147186
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  39146934 aactgaatcacatcgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtttgatactacttatat 39147033  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  |  ||||||||||||||||||||    
T  39147034 taacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcgtatgatgggtgacctactgggaa 39147133  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
           |||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  39147134 -------agtaagcgtgcgagagaggacaaaaaacgctagaaagactcatgttggtttgt 39147186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 143 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24182391 - 24182114
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24182391 aatcacattagaatgagagggatcttgagaacgtgcaagtatgagacgaaatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaaca 24182292  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||   ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  24182291 agatgcatcttcttt-cggtaccccaaaccataataacttaacagttaagcgtggttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctaaaaagtttc 24182193  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaag 421  Q
       | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  24182192 tcggaaagtgtgcgagtgaggataaaacacgttgaaaagattcgtgttggtttgtggggttagtcgacaatcctgaaag 24182114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22975224 - 22975080
Alignment:
Q  75 catgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22975224 catgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccagctcttggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 22975125  T
Q  175 gtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaatt 219  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  22975124 gtgcaggtatgtgactgcatggttgaagaaaagcttataagaatt 22975080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2058819 - 2058508
Alignment:
Q  127 cttctaggcaaaa-ctgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttgg 225  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2058819 cttctaggcaaaaaccgaatcacatcggattgagagagatcctgaagtcatgcagctatgagactggatgattgaaggaagacttatatgaattgtttgg 2058720  T
Q  226 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaac-ttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||| |||| ||||||||| || | | |   |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2058719 tactacctatatcaacaagatgcaaattctgttaaatagcacattccataagaactttgagact---ggatgcttgacttggagcaattttgggatgagt 2058623  T
Q  325 gacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt-gggatcagttgacaatcgtgaaagca 423  Q
    ||||| ||  ||||| |||    || |||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  2058622 gaccttctaagaagtctcccgaaaaacgtgtgagtgagtacaaaatacattgaaaaaactcgtgttagtttgtgggggtcaatagacaatcctgaaagca 2058523  T
Q  424 gtctgggatgctaca 438  Q
    || || |||| ||||    
T  2058522 gtttgagatgttaca 2058508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11757347 - 11757145
Alignment:
Q  223 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgg 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||   |||||    
T  11757347 tggtactacttatatcaacaaaatgcatcttcttttcggtagttcaatccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttacagcaatttcgagatgg 11757248  T
Q  323 gtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagc 422  Q
    ||||||||| ||||| |||    ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||| | |||||    
T  11757247 gtgacctaccgggaaatttttcggtaagcgtgtgagtgaggacgaaatccgcttaaaagactcttgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctaaaagc 11757148  T
Q  423 agt 425  Q
    |||    
T  11757147 agt 11757145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 315
Target Start/End: Original strand, 42429145 - 42429317
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||  ||||||| ||   ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42429145 gaatcacatcggaataagag-gatcctgagaccgtgtaggtatgtgaacacatggttgaaggaggacttataagaattgtttggtactacctttatcaac 42429243  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    || |||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  42429244 aatatgcatattcttttccgtagcccgttacataagaacttcatagttaagggtgcttgacttaaagcaatttt 42429317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 30720276 - 30720110
Alignment:
Q  273 ataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaaca 371  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | || | ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  30720276 ataagaactctacagttaatcgtgcttgacttggaacaattttgggatggatgactttcttgaaagctttccgaa-aagcgtgcgagcgaggacaaaaca 30720178  T
Q  372 cgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30720177 cgctgaaaagactcctgttggtttgtggagtcaatcgacaatcttgaaagcagtctgggatgttacac 30720110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 397
Target Start/End: Original strand, 8366594 - 8366719
Alignment:
Q  271 tcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||| ||||||||    
T  8366594 tcataagaactctatagttaagcgtgtttgatttgaagtagtatttggatgggtgacctactgggaagttttccaataagcg-gtgagtgacgacaaaac 8366692  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8366693 acgttgaaaagactcgtgttggtttgt 8366719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 397
Target Start/End: Original strand, 1880081 - 1880330
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||  |||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||     || ||||| |   ||||| ||||||| ||||    
T  1880081 aatcacaccagaatgagagggatctcgagaccgtgcagttatgtgactgcatggttgaaggaagt----taagaattgtccagtacttcctatattaaca 1880176  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    | |||||| |||||||  ||||   ||| || |||||||  | |||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||| | |||| |||| ||||||||     
T  1880177 a-atgcatattctttttggtagtctattccacaagaactctacagttaagcgtgcatgagttggtgtaatatttggatagatgacttactaggaagtttt 1880275  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1880276 atggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 1880330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4658144 - 4657852
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||| |||   ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||| || || |||| |||||||||||    
T  4658144 aaactgaatcacatcgaaataagagggatcttgaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaacgaaga-ttataagacttgtttgatactacctata 4658046  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
     |||||| ||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||   ||||| | ||||||||| |   || |    
T  4658045 acaacaacatgcatcttctttttggtagtccattccataagaacttcacagtt-atcatgcttgacttagatatattttggaatgggtgacatttgggaa 4657947  T
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    ||||| ||   || | ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  4657946 agttttctgaaaaacatgcaagtaaggacaaaatacgctgaaaagact--tgttgatttgtgggatcggtcaacaatcgtgaaagaagtttgggatg 4657852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16370852 - 16370578
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| | | |  ||||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16370852 tcacatcgaaatgagagggttcctgatgccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaag 16370753  T
Q  245 atgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcct 344  Q
    | | ||||||||||  |||||    |  || |||||  |  |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||      
T  16370752 acgtatcttctttttggtagc---ctaaatcagaaccccgcagttaagcatgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacattctgaaaagtttctc 16370656  T
Q  345 agtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagca 423  Q
    |  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |   |||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  16370655 ataaagcgtgcgaatgaggaaaaaacacactgaaaagatttacgttgatatgtggg-tcagttgacaatcctaaaagca 16370578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21884010 - 21883941
Alignment:
Q  364 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21884010 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcttgaaagcagtctgggatg 21883941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 30685013 - 30684861
Alignment:
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 386  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | || | |||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30685013 gttaagtgtgcttgacttggaacaattttgagatggatgactttcttgaaagttttccgaaaagcgtgcaagcgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 30684914  T
Q  387 tgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||| || |||| |||||    
T  30684913 tgttggtttgtggggtcaatcggcaatcttgaaagcagtttgagatgttacac 30684861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32574767 - 32574632
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||  ||||| ||    |||| |    
T  32574767 aggtatgagactgcacggttaaag-aaggcttataggaattgtttggtactacctatacaaacaaaatgcatctttcttttggtagcccaaactataata 32574669  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32574668 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 32574632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 395
Target Start/End: Original strand, 187729 - 187810
Alignment:
Q  314 tttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  187729 tttgaatgtgtgacatactgagaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 187810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 313 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 38063804 - 38063725
Alignment:
Q  313 ttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38063804 ttttggatgggtgacctactgggaagttttccggtaagcgtgcgaatgaggacaaaatacgctgaaaa-actcgtgttggt 38063725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5067038 - 5066781
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||| || ||||||  |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||    
T  5067038 gaatcacaccagaatgagagagatcccgaggccgtgcatgtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttggtattatctatatcaac 5066939  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt----tggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    ||||||||| |||||||  ||||   ||||||||| |||| || | |||| |||| ||| ||||||| | | ||    ||||||  ||| ||| | | ||    
T  5066938 aagatgcattttctttttggtagtctatttcataaaaactccacaattaaacgtgtttgccttggagtagtctttgaatggatgaatgatcta-ttgaaa 5066840  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    ||||  |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5066839 gttttttgataaacgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagattcatgttggtttg 5066781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11160822 - 11160713
Alignment:
Q  148 catcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatg 247  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  11160822 catcggaatgagagggatcatgaagtcgtgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgtttggtactatctatgtcaacaagatg 11160723  T
Q  248 catcttcttt 257  Q
    ||| ||||||    
T  11160722 catattcttt 11160713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4673568 - 4673466
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaa 291  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||  |||  ||||| |||||||||| || ||||||    
T  4673568 catgattgaaggaagtcttataagaattatttggtagcacctgtatcaacaagatgcatattctttttggtatttcattccataagaactccacagttaa 4673469  T
Q  292 gcg 294  Q
    |||    
T  4673468 gcg 4673466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Original strand, 4102925 - 4102994
Alignment:
Q  272 cataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||    
T  4102925 cataagaacttcacagttaaacgtgcttgacttggagcaattttgagatgagtgaccttctgagaagttt 4102994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43356762 - 43356651
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||     
T  43356762 tcacatcggaatgagaggg-tcctgagatcatgcaggtatgagactgcatgattga-ggatgacttataagaattgtttggtacaacctaaaccaacaat 43356665  T
Q  245 atgcatcttctttt 258  Q
    ||||||||||||||    
T  43356664 atgcatcttctttt 43356651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 404
Target Start/End: Original strand, 5785990 - 5786106
Alignment:
Q  288 ttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgt 387  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| ||||||   |  ||   | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5785990 ttaagcgtgtttgacttggagcaattttaggatgagtgatcttctggaaagtttttaaaaaattatacgaatgaggacaaaacacattgaaaagactcgt 5786089  T
Q  388 gttggtttgtgggatca 404  Q
     ||||||||| ||||||    
T  5786090 attggtttgtaggatca 5786106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39801073 - 39801025
Alignment:
Q  267 catttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  39801073 catttcataagaacttcatagttaaacgtacttaacttggagaaatttt 39801025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39801530 - 39801498
Alignment:
Q  221 tttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39801530 tttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 39801498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11160692 - 11160605
Alignment:
Q  351 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||    
T  11160692 cgtgcaagtgagaacaaaacacgttgaaaagactcgtgttaatttatggaattagtcgacaatcataaaagcagtttgagatgttaca 11160605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21041460 - 21041405
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgaca 411  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||    
T  21041460 gagttaggacaaaacatgctgaaaagactcgagttggtgtgtgtggtcagttgaca 21041405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26341276 - 26341169
Alignment:
Q  288 ttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgt 387  Q
    ||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||  || ||||| || || | || ||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  26341276 ttaagtgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgaccttttgaaaaatttcccagaaaacatgtgagtgaggacaaaacacgtctaaaagactggt 26341177  T
Q  388 gttggttt 395  Q
    ||||||||    
T  26341176 gttggttt 26341169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 34371969 - 34372013
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  34371969 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 34372013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 53 - 433
Target Start/End: Original strand, 30966144 - 30966524
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30966144 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcg 30966243  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966244 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 30966343  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||     
T  30966344 tcttttcggtatctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggaccaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaagca 30966443  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  30966444 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatg 30966524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 30966600 - 30966985
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30966600 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcg 30966699  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966700 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 30966799  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||    
T  30966800 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaagcg 30966899  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30966900 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 30966985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 24818236 - 24818620
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24818236 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 24818335  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24818336 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 24818435  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24818436 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa-ttttggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcg 24818534  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |||| |||||| ||||    
T  24818535 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttaca 24818620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 53 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29259856 - 29259504
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29259856 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaagactgaatcacatcg 29259757  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29259756 gaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatct 29259657  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  29259656 tcttttcggtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagca 29259557  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcag 405  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29259556 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcag 29259504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5400053 - 5399668
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5400053 tgtaacgcctccgcttggtgagcatgtaatgcctgaggctgatgagggcagggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 5399954  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5399953 gaatgagagggatcttgaggtcgtgcaagtatgggagtgtatggtttaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 5399854  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| |  |||||||    
T  5399853 tcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccaggaagttttccggtaagcg 5399754  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  5399753 tgcgagtgagaacaaaacacgctggaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 5399668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25338148 - 25337848
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25338148 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatat 25338049  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25338048 caacaagatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 25337949  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctac 437  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||    
T  25337948 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgagatgttac 25337849  T
Q  438 a 438  Q
    |    
T  25337848 a 25337848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 179 - 440
Target Start/End: Original strand, 33771037 - 33771298
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33771037 aggtatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataaga 33771136  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  33771137 actccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacactgaa 33771236  T
Q  379 aagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  33771237 aagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaattctgaaagcaatctgggatgttacact 33771298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 33174957 - 33175251
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33174957 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 33175056  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | | ||  |||||||||||||| |||||  ||    
T  33175057 aagatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtg-ttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaa-att 33175154  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33175155 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttagtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 33175251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Original strand, 16379392 - 16379647
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16379392 gaatcaaattggaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactacctatatcaac 16379491  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16379492 aagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtaatctttggatgggtgacctaccgggaagttt 16379591  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379592 cactgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 16379647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 144 - 413
Target Start/End: Original strand, 16378938 - 16379207
Alignment:
Q  144 atcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaa 243  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16378938 atcacaccggaatgagagggattccgaggccgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaa 16379037  T
Q  244 gatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcc 343  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16379038 gatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcgggaagtttcc 16379137  T
Q  344 tagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16379138 gggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 16379207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 138 - 375
Target Start/End: Original strand, 41754284 - 41754521
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41754284 aactgaatcacaccggaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatat 41754383  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||    
T  41754384 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccggaaa 41754483  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgct 375  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41754484 gtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgct 41754521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 179 - 393
Target Start/End: Original strand, 8256562 - 8256776
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8256562 aggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 8256661  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8256662 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgctgggaagttttccgataagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaa 8256761  T
Q  379 aagactcgtgttggt 393  Q
    ||||||| |||||||    
T  8256762 aagactcatgttggt 8256776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 138 - 397
Target Start/End: Original strand, 1912520 - 1912778
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1912520 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgtaggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggtactacctatat 1912619  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||    
T  1912620 caacaagatgcatcttcttttg-gtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtactctttggatgggttacctaccgggaa 1912718  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1912719 gtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgt 1912778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 142 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25434203 - 25433939
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  25434203 gaatcacaccggaatgagagggatcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaac 25434104  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||| ||||   ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  25434103 aagatgcatctcctttctggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtggtctttggatgggtgaccaacagggaagttt 25434004  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
     || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  25434003 tctggtaagcgtgtgagtaaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagt 25433939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30962111 - 30961745
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  30962111 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgtcaagggtggggagtggttcagctcctggca-gcttctaggaaaaatcgaatcacatcagaatgagagagatcc 30962013  T
Q  168 tgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaagga--------aggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 259  Q
    ||| | |||  |||||||||| |||||||||||||||        || |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30962012 tgaagccgtgtaggtatgggattgcatggttgaaggatttaaggaagtcttataagatttgattggtactacctatatcaacaagatgcatatttttttc 30961913  T
Q  260 agtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagt 359  Q
     |||||  |   |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  30961912 ggtagccgaaaccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttagagcaattttgggatgggtgaccttctgggtagtttctcagaaagcgtgcgagt 30961813  T
Q  360 gaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtct 427  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||||    
T  30961812 gaggacaaaacacagtgaaaagacttgtgttagtttgtggggtcaatcggcaatcatgaaaggagtct 30961745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 438
Target Start/End: Original strand, 82952 - 83312
Alignment:
Q  75 catgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtc 174  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |     
T  82952 catgtaacgcccgaagctgacgagggcggagagtggtctggctcctggca-gcttctaggcaa--ctgaatcacgtcgaaatgagagggatcctgagatt 83048  T
Q  175 gtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcat 274  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||    
T  83049 gtgcaggtatgagactacatggttgaaggtatgcttataagaatcgtttggtactacctataccaacaagatgaatcttttttttggtagctcattccat 83148  T
Q  275 aagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgc 374  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||| ||||| |||||||  |||  |||||||   ||| | |||   || ||| ||||||||||||||||||||||     
T  83149 aagaactctacagttaagcgtgtttgatttggaacaattttgtgatatgtgacctttagggtaatttttcagaaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgt 83248  T
Q  375 tgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||| | | | | ||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  83249 tgataagacttatgttggtttgtggggttattcggcaatcatgaaagtagtctgagatgttaca 83312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 342
Target Start/End: Original strand, 11388188 - 11388386
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  11388188 gaatcacatcggaatgagag-gatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaac 11388285  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11388286 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactaggaagttt 11388385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 394
Target Start/End: Original strand, 15619897 - 15620149
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| || | ||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15619897 gaattacatcagaatgagagggatcccgatgccgtgcaagtatgagactgcatagttgaaggcaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 15619996  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||| |||||||||||  | | | || | |||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15619997 aagatacatcttctttttggaaacccaatccataagaactccacaattaagcgtgcttgactttgagtagtctttggatgggtgacctactgggaagttt 15620096  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtt 394  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15620097 ctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaactcgctgaaaagactcgtgttggtt 15620149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Original strand, 29804681 - 29804870
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  29804681 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 29804780  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctac 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  29804781 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgtttgacctac 29804870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30963407 - 30963114
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30963407 tcacatcagaatgagagggatcatgaagccgcacatgtatatgaatgcatgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaag 30963308  T
Q  245 atgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcct 344  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||  ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||      
T  30963307 atgcatcttatttttggtagcccaaatcataagaattcaacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgaccttcttggaagtttctc 30963208  T
Q  345 agtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  30963207 ggaaagcgtgcgagtgaggataaaatacgttgaaaagactcgtgttggtttgtgaggtcaatcggcaatcatgaaagcagttttggatgttaca 30963114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Original strand, 33174504 - 33174772
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33174504 gaatcacatcggaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 33174601  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||| ||| |||||  ||    
T  33174602 aagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacataccgggaa-att 33174700  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    ||  |||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  33174701 cccggtaagcgtgcgagttaggaaaaaacatgctagaaagacccgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaat 33174772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 391
Target Start/End: Original strand, 1707041 - 1707289
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   ||  ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1707041 gaatcacatcggaatgagag-gatcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 1707139  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1707140 aagatgcatcttctttttggtagcccatctcataagaactccacagttaagagtgtttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagttt 1707239  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
    ||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  1707240 cccggtaagcgtgcgagtgaatacaaaacacgctaaaaagattcgcgttg 1707289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32377921 - 32377758
Alignment:
Q  275 aagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgc 374  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377921 aagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgatctactgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgc 32377822  T
Q  375 tgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32377821 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 32377758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 392
Target Start/End: Original strand, 1953067 - 1953403
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||| |||| ||| || |||| | |||||||| |||||||||||    
T  1953067 tgtaacgtccccgcttggtgggcatgtagcactcgaggatgatgagggcaaggagtggtccggcttctgaca-gctttt-ggcaaaaccgaatcacatcg 1953164  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1953165 gaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacctatatcaactagatgcatct 1953264  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||  ||||  ||   |||||  ||||||| ||||||| ||||| |||| | || ||||| |||||||| ||||  | |||||| ||  || |||      
T  1953265 tctttttggtagtccaaaccataattacttcatggttaagcatgcttaactttgcgctattttgggatgggttaccttttaggaagtatctcagaaagta 1953364  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 392  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  1953365 tgcgagtgaggacaaaatacg-tgaaaaaactcatgttgg 1953403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 11394571 - 11394732
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  11394571 aggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct-attccataaga 11394668  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11394669 acttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactaggaagtttc 11394732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27883073 - 27882818
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||     
T  27883073 gaatcacaccgaaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaat 27882974  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27882973 aagatgcatcttcttttttgtaggccgttccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttggagtagtctttggataggtgacctactgagaagttt 27882874  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
        ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27882873 ttcggtaagtgtgcaagtcaggacaaaacacgctgaaaagaatcttgttggtttgt 27882818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 439
Target Start/End: Original strand, 15639781 - 15640030
Alignment:
Q  190 tgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagtt 289  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | | | || | || ||||||| || | ||    
T  15639781 tgcatagttgaaggcacgcttataggaattgtttggtactacctatatcaacaacatacatcttctttttggaaacccaatccacaagaactccacaatt 15639880  T
Q  290 aagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgt 389  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15639881 aagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgggaagtttctcgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgt 15639980  T
Q  390 tggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    ||||| || || ||||| | ||||  | ||||  |||||||||| |||||    
T  15639981 tggttggtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttacac 15640030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 249 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 32377756 - 32377575
Alignment:
Q  249 atcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagta 348  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |  |||    
T  32377756 atcttgttttcggtagctcattccaaaagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccggaaagttttccggta 32377657  T
Q  349 agcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  32377656 agcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaaactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctggg 32377575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 187 - 421
Target Start/End: Original strand, 13191018 - 13191252
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcata 286  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  13191018 gactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttctttttggtagtccattttataagaactccata 13191117  T
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 386  Q
    |||| | |||||||||||| || ||||||  ||| |||||||| |||| |||||||  |  ||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  13191118 gttatgtgtgcttgacttgaagaaattttgagataggtgaccttctggaaagtttctcaaaaagcgtgtgaatgcggacaaaacacgctaaaaagactag 13191217  T
Q  387 tgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaag 421  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  13191218 tgttggtttatggagtcagtcgacaatcttgaaag 13191252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30963857 - 30963603
Alignment:
Q  152 ggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30963857 ggaatgagagggatcatgaagccgtgcaggtaagagaatgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcatc 30963758  T
Q  252 ttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagc 351  Q
    ||||||   ||||| ||   ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| || ||||||||    | || |    
T  30963757 ttctttctggtagcccaaaccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggcggagttttgggataggtgaccttctaggaagtttgtcggaaacc 30963658  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30963657 gtgcgagtgaggacaaaacacagtgaaaagactcgttttggtttgtgggatcagt 30963603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38899058 - 38898870
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||  |||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38899058 aatcacatcggaaggagagtgatcttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 38898959  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctac 331  Q
    |||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||    
T  38898958 agatgcattttctttttggtaacacatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagtagtctttggataggtgacctac 38898870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18099025 - 18098874
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18099025 gaatcacatcggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 18098926  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagc 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18098925 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccatagttaagc 18098874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 421
Target Start/End: Original strand, 8073902 - 8074170
Alignment:
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| |||| | || |||||||||| ||  | ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8073902 gaatgagagggatcatgagattgtgcaggtatgggtctataaggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatct 8074001  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    |||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||   |||||| ||||| ||||||| |  | |||||||     ||| |    
T  8074002 tctttcttgtagcccatttcataagaactccatagataagccttcttgacttggttaaattttgggatgagtgaccttccagaaagtttctcgaaaagtg 8074101  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaag 421  Q
    || || |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8074102 tgtgattgagaacaaaacacgatgaaaaaacttgtgtttgtttgtgggatcagtcgacaatcttgaaag 8074170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 297
Target Start/End: Original strand, 20502050 - 20502176
Alignment:
Q  170 aggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcat 269  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||    
T  20502050 aggtcgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaacaagatgcttctt-tttttggtagcccat 20502148  T
Q  270 ttcataagaacttcatagttaagcgtgc 297  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  20502149 ttcataagaacttcacaattaaacgtgc 20502176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 16542034 - 16542263
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcag-tagctcatttcataagaacttcatagtta 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    ||||||||| ||||| ||||  | |||||    
T  16542034 catggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaacaagatgtatcttttttttttatagctcattccataaaaactctacagtta 16542133  T
Q  291 agcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtt 390  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||| | | |||| ||| ||| |||  ||||||  || ||| || |||||||    
T  16542134 aatgtgtttgacttggagcaattttaggatgagtgctctactaggaagtttcttggaaagcttgcaagtaagg--aaaacattctaaaatgattcgtgtt 16542231  T
Q  391 ggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagc 422  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  16542232 ggtttgtaggatgagtcgacaatcttgaaagc 16542263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18448065 - 18447954
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||    
T  18448065 gaatcacatcggaatgatagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaac 18447966  T
Q  242 aagatgcatctt 253  Q
    ||||||||||||    
T  18447965 aagatgcatctt 18447954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8181335 - 8181254
Alignment:
Q  315 ttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8181335 ttggatgggtgacctactgggaagttttccgataaacgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 8181254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 367 - 438
Target Start/End: Original strand, 29804871 - 29804942
Alignment:
Q  367 aaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  29804871 aaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 29804942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18875983 - 18875874
Alignment:
Q  291 agcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtt 390  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || |||  ||||||| |   || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  18875983 agcgtgcttgattttgagcaattttgggatgggtgatcttctgaaaagtttcttgaaaatcgtgcgagtgaggacaaaacacactgtaaagacacgtgtt 18875884  T
Q  391 ggtttgtggg 400  Q
    ||||||||||    
T  18875883 ggtttgtggg 18875874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 36924435 - 36924373
Alignment:
Q  335 gaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36924435 gaagttttctggttagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgt 36924373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 406
Target Start/End: Original strand, 20502172 - 20502227
Alignment:
Q  351 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  20502172 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtagggtcagt 20502227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 286
Target Start/End: Original strand, 9909102 - 9909235
Alignment:
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| ||||  |||||||||||| || |||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  9909102 gaatgagagggatcctgaaatcgtataagtatgagactatatggttgaaggagggtttataatgattaattggtactacctataccaacaagattcaact 9909201  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcata 286  Q
    ||||||  ||||| ||   |||||||||||||||    
T  9909202 tctttttggtagcccaacacataagaacttcata 9909235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 414
Target Start/End: Original strand, 11389677 - 11389754
Alignment:
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11389677 agtttcctggtaagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatc 11389754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 414
Target Start/End: Original strand, 11406338 - 11406415
Alignment:
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11406338 agtttcctggtaagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatc 11406415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8181486 - 8181394
Alignment:
Q  154 aatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagat 246  Q
    |||||||| ||||| |||  | || ||||||||||||   ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8181486 aatgagagggatcccgagaccttataggtatgggactttgtggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 8181394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36924519 - 36924453
Alignment:
Q  194 tggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactac--ctatatcaacaagatgcatcttctttt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  36924519 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtattacttatatatcaacaagatgcatcttctttt 36924453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26864905 - 26864785
Alignment:
Q  200 aaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgctt 299  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||  |||| |||  |  |||||||||||| |||||||||| ||    
T  26864905 aaggaaggcttgtaagaactctttggtactacctacatcgacaagatgcatcttccatttggtaggtca-atgttaagaacttcatcgttaagcgtgatt 26864807  T
Q  300 gacttggagcaatttttggatg 321  Q
    ||||| || |||||||| ||||    
T  26864806 gacttagaacaatttttagatg 26864785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 422
Target Start/End: Original strand, 37552606 - 37552844
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaac 280  Q
    |||||||||||||||||  || || | |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||  | ||| |||| | ||||||     
T  37552606 gtatgggactgcatggtcaaacga-gacttataagaattgtttggtactacatata-caaaatgatgc-tcttctttttggcagcgcattccgtaagaat 37552702  T
Q  281 ttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    | || |||||||| ||||||||||  | ||||| | ||| |||  |||| |||  ||||||||    || | ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  37552703 tccacagttaagcatgcttgactttaatcaattctgggacgggaaaccttctgaaaagtttcccgaaaatcatgcgattgaggaaaaaacacgcttaaaa 37552802  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagc 422  Q
     || ||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||    
T  37552803 tacccgtgttggtttgtagggtcagtcgacagtcttgaaagc 37552844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3804401 - 3804249
Alignment:
Q  273 ataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacac 372  Q
    |||||| || |||||||||| |||  |||||| ||| ||| ||||||||| | | || | || |||||| |||  ||| ||  |||| |||||||| |||    
T  3804401 ataagacctccatagttaagtgtgtctgacttagagtaatatttggatggataagcttccggaaagttttctataaagtgtttgagtaaggacaaagcac 3804302  T
Q  373 gctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagt 425  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||    
T  3804301 actgaaatgactcttgttggtttgtggggtcaatcgacaattatgaaagcagt 3804249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26865189 - 26865142
Alignment:
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26865189 tgcgagtgaggacaaagcatgctgaaaagatccgtgttggtttgtggg 26865142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 38898856 - 38898817
Alignment:
Q  358 gtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38898856 gtgaggacaaaacacgctgaaaagactcaagttggtttgt 38898817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30963498 - 30963466
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcc 85  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30963498 tgtaacgcctacgcttggtgggcatgtaacgcc 30963466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 33174859 - 33174903
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  33174859 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 33174903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 51 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13125374 - 13124994
Alignment:
Q  51 tgtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacat 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13125374 tgtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggcggatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatat 13125275  T
Q  151 cggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13125274 cggaatgagagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcat 13125175  T
Q  251 cttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaag 350  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13125174 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaag 13125075  T
Q  351 cgtgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  13125074 cgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaggactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggg 13124994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 53 - 430
Target Start/End: Original strand, 9124869 - 9125246
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9124869 tgtaacgccttcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 9124968  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9124969 gaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 9125068  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||    
T  9125069 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactcggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcg 9125168  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  9125169 tgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggg 9125246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 52 - 430
Target Start/End: Original strand, 18833195 - 18833573
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18833195 gtgtaacgcccccgcttggtgggcatgtaacgctcagggctgatgagggcggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 18833294  T
Q  152 ggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18833295 ggaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgcatggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatc 18833394  T
Q  252 ttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagc 351  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |    
T  18833395 ttcttttcggtagctaattacataagaactccacagttaagcgtgtttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaaac 18833494  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  18833495 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtgggataagtcggcaatcctgaaagcagtctggg 18833573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 77 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2941969 - 2941606
Alignment:
Q  77 tgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgt 176  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  2941969 tgtaacgcccaaggctgatgagggcgaggagtggcccggctcccgccatgcttctaggcaaaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgt 2941870  T
Q  177 acaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2941869 acaggtatgggactgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 2941770  T
Q  277 gaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 376  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2941769 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctg 2941670  T
Q  377 aaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2941669 aaaagactcgtgttggtttgtgcggtcagtcggcaatcacgaaagcagtctgggatgttacact 2941606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 406
Target Start/End: Original strand, 42515002 - 42515355
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42515002 tgtaacgtctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 42515101  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42515102 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattt 42515201  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||  |||| |||    |||||||    
T  42515202 tctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacataccaggaactttttcggtaagcg 42515301  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42515302 tgcgggtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagt 42515355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Original strand, 28495853 - 28496150
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  28495853 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttgggtactacctatatcaac 28495952  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28495953 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctattgggaagttt 28496052  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||| ||| ||| |||||    
T  28496053 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaaacagtttggaatgttacac 28496150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 2193255 - 2193551
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2193255 gaatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 2193354  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2193355 aagatgcatcttctattcggtagctcatttcataggaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 2193454  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  2193455 cccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 2193551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 36422251 - 36422546
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  36422251 gaatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 36422350  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36422351 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa-tttgggatgggtgacctaccgggaagttt 36422449  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  36422450 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 36422546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 53 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11517624 - 11517397
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517624 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggttgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 11517525  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517524 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatgg-tgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 11517426  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaact 281  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11517425 acttttcggtagctcattccataagaact 11517397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 433
Target Start/End: Original strand, 2189143 - 2189434
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2189143 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaac 2189242  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  2189243 aagatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgacctaccgggaagttt 2189342  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  2189343 cccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggacagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatg 2189434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 142 - 420
Target Start/End: Original strand, 42515543 - 42515821
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  42515543 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgtttggtactacctatatcaac 42515642  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||    
T  42515643 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacatggaaattt 42515742  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaa 420  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||    
T  42515743 tccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaa 42515821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 34405738 - 34405466
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  34405738 gaatcacaccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 34405639  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34405638 aggatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 34405539  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  34405538 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatc 34405466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5406823 - 5406478
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5406823 tgtaacgcctccgcttcgtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcatgaca-gcttctaagcaaaactgaatcacatcg 5406725  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||| || |||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5406724 gaatgatagggatcctaaagtcgtgccggtatgggactgcatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatct 5406625  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagc 351  Q
    | ||||  || || ||   |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||| ||| ||||| |  || |    
T  5406624 tatttttggttgcccaaaccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatggatgactttctggaaagttttccgaaaaaac 5406525  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtg 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  5406524 gtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaacactcgtgttggtctgtg 5406478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 6719221 - 6718925
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6719221 gaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6719122  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||  ||||| |||    
T  6719121 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccagagttaagcgtgcttgacttggagtaa-tttgggatgggtgacatatcgggaacttt 6719023  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||| | ||||  |||||||||| |||||    
T  6719022 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagaatcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctaaaagtcgtctgggatgttacac 6718925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28495755 - 28495464
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||    
T  28495755 gaatcccatcggaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttgagttttacctatatcaac 28495656  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         
T  28495655 aagatgcatcttcttttaggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga----- 28495561  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactt 441  Q
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||    
T  28495560 ------aagcgtgcgagtgaggacaaaacccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcgatgttacagtt 28495467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 179 - 438
Target Start/End: Original strand, 2465960 - 2466218
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2465960 aggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagttgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 2466059  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2466060 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcaagtgaggacaaaacacgctgaa 2466159  T
Q  379 aagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||  | ||||  |||||||||| ||||    
T  2466160 aagactcgtgttagtttgtagg-tcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 2466218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 25182296 - 25182656
Alignment:
Q  77 tgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgt 176  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  25182296 tgtaacgcccgaggatgacaaaggcggggagtggtcaggctcctagca-gcttctaggcaaagacgagtcacatcggaatgagagagatcctgagactgt 25182394  T
Q  177 acaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataa 276  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  25182395 gcaagtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttattttcggtaactcattccataa 25182494  T
Q  277 gaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 376  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||||  ||||| ||||||||||||  |  |||||| ||||||||| |||||||||||     
T  25182495 gaacttcacagttaagtgtgtttgacttggagtagtctttggatggaggaccttctgggaagtttctcaaaaagcgttcgagtgagggcaaaacacgcta 25182594  T
Q  377 aaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| ||| | || |||| | |||||| || |||||| ||||    
T  25182595 aaaaaactcgtattgggttgtggggtcaatcgaaaatcctaaaagcactcagggatgttaca 25182656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 239 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 7646528 - 7646328
Alignment:
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7646528 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 7646429  T
Q  339 tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  7646428 tttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 7646329  T
Q  439 c 439  Q
    |    
T  7646328 c 7646328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22529382 - 22529111
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||    
T  22529382 gaatcatatccgaatgagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatggttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactatctatataaac 22529283  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22529282 aagatgcatcttcttttcagtaactcattacaaaagaacttcacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgagaagttt 22529183  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  22529182 ctcggtaagcgtgtgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcatgttggtttgtagggtcagtcgacaat 22529111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 397
Target Start/End: Original strand, 679812 - 680071
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  679812 aactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattgtt-ggtactacctatat 679910  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||    
T  679911 caacaagatgcatattctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctgccgggaa 680010  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||   |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  680011 gtttcgcggtaaacatgcgagtgagaacaaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt 680071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 227 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13122567 - 13122363
Alignment:
Q  227 actacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtga 326  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13122567 actacatatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtga 13122468  T
Q  327 cctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagt 425  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||    
T  13122467 cctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcctgaaagcagt 13122368  T
Q  426 ctggg 430  Q
    |||||    
T  13122367 ctggg 13122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 35474268 - 35474013
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  35474268 gaatcacaccggaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaac 35474169  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  35474168 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacgtaccgggaatttt 35474069  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35474068 ctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaatgacttgtgttggtttgt 35474013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 138 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2611803 - 2611535
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||     
T  2611803 aactgaatcacatcggaatgagaggggtcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataa 2611704  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |    
T  2611703 caacaagatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccatagttaagcgtgctttacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggta 2611604  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
           | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2611603 -------actaagcgtgcgagtgaggacaaaacactctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 2611535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13124923 - 13124757
Alignment:
Q  67 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  13124923 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatattggaatgagagggatc 13124824  T
Q  167 ctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacct 233  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  13124823 ttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtactacct 13124757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 183 - 363
Target Start/End: Original strand, 2465773 - 2465953
Alignment:
Q  183 atgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaactt 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  2465773 atgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactc 2465872  T
Q  283 catagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgagg 363  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  2465873 cacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcgagtgagg 2465953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29039172 - 29038903
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  || |||| |||| |||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  29039172 aaaccgaatcacatcggaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctata 29039073  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||   |||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| || |    
T  29039072 tcaacaacatgcatcttctttttgataatccattccataagaactctacatttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggta 29038973  T
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29038972 agtttcccggtaagcgtgtgactgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagt 29038903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 140 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6747747 - 6747457
Alignment:
Q  140 ctgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatca 239  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6747747 ctgaatcacattggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatca 6747648  T
Q  240 acaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagt 339  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||   | | | |||||||||||||||||  |||||||    
T  6747647 acaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttatcgtagtctttggatgggtgacctatcgggaagt 6747548  T
Q  340 ttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||        || ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  6747547 tt--------gcttgcgagtgaggacaaaacaagttgaaaagacttgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagcagtctgggatgttaca 6747457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Original strand, 7646514 - 7646710
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  7646514 aagatgcatcttgttttcggtaactcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttt 7646613  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     |   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||  |||||||||| ||||    
T  7646614 tccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 7646710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 29357606 - 29357348
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29357606 aactgaatcacaccg-aatgagaggtatcccgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactaactatat 29357508  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||| | | ||  ||||| |||||| | || ||    
T  29357507 caacaagatgcatcttcttttcgatagcccgtttcataagaactacacagttaaccgtgtttgacttagagtagtcttaagatggatgaccttccggtaa 29357408  T
Q  338 gtttcctag-taagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    | ||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29357407 g-ttcctcgaaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcgtgttggtttgt 29357348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 350
Target Start/End: Original strand, 46425740 - 46425947
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  | |  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  46425740 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataagaattgtttggtattacctatatcaac 46425839  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||| | |||||||    
T  46425840 aagatgcatcttcttttcggtatcttattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctac-gagaagttt 46425938  T
Q  342 cctagtaag 350  Q
    ||| |||||    
T  46425939 cctcgtaag 46425947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 31406787 - 31406481
Alignment:
Q  86 cgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaact-gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtat 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||| ||| | |||||||  ||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||| | ||| ||| | |    
T  31406787 cgaggctgatgagggcggggagtggttcagctcttggaa-gcttctaaacaaaaatcgaatcacatcaaaatgagagggatcctgaagccgtgcagatct 31406689  T
Q  185 gggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttca 284  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||    
T  31406688 gggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccgtttcataagaactcca 31406589  T
Q  285 tagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagact 384  Q
     |||||||||||||    |||||| | | |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  31406588 cagttaagcgtgct----ttggagtagtctttggatgggtggccttct-agacgtttcttagaaagcgtgtgagtgaggacaaaacatgctgaaaagaca 31406494  T
Q  385 cgtgttggtttgt 397  Q
     ||||||||||||    
T  31406493 tgtgttggtttgt 31406481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43776318 - 43776179
Alignment:
Q  261 gtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtg 360  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  43776318 gtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgcggggaagttttccagtaagcgtgcgaatg 43776219  T
Q  361 aggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43776218 aagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 43776179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35527268 - 35527070
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35527268 gaatcacaccgaaatgagagggatcccgaggtcgtgcaaatatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaac 35527169  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtt 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35527168 aagatgcatattcttttcagtagtccattccataggaactccacagttaagcatgcttgacttggagtagtctttgcatgggtgacctactgagaagtt 35527070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3305376 - 3305231
Alignment:
Q  261 gtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtg 360  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  3305376 gtagctcattacataaaaacttcacagttaagcgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctaccggaaagtttcctggtaagagtgcgagtg 3305277  T
Q  361 aggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3305276 agaacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatcagt 3305231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 395
Target Start/End: Original strand, 9623202 - 9623459
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || || | ||| |||| |||||| ||||||   |||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  9623202 aaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctata 9623301  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| | ||| ||    
T  9623302 tcaacaagatgcatcttcttt-cggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggactagtctttggatgggtgacgttctgaga 9623400  T
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||||| ||   |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  9623401 agttttctgaaaagccttcgagtgaggacaaagcacgctgtaaagactcatgttggttt 9623459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26421882 - 26421643
Alignment:
Q  167 ctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagct 266  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||     
T  26421882 ctgaggccgtgcatgtatgagactgcatggttgaagtaaggctcataagaattgttaggtactccctataccaacaagatgaatcttcttttcggtagcc 26421783  T
Q  267 catttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggaca 366  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| | | ||||||| ||||||||  ||||||||||| | | || | || |||||||||||    
T  26421782 cattccataagaactacacagttaagcgtgtttggcttcgagtagtctttggattggtgaccttatgggaagtttcttggaaaacatgtgagtgaggaca 26421683  T
Q  367 aaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||  | || ||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  26421682 aagaatgccgaaaatactcgtgttggtatgtagggtcagt 26421643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 344
Target Start/End: Original strand, 1628719 - 1628914
Alignment:
Q  146 cacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaaga 245  Q
    ||||| |||||||||| |||  ||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  1628719 cacattggaatgagagggatgttgaagccgtgcagatatgggattgcatggttgaagaaaggcttata---attgtttggtactatcgatatcaacaaga 1628815  T
Q  246 tgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcct 344  Q
    |||||||||||||  | ||| |||  |||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1628816 tgcatcttcttttttgaagcccataccataagaactccatagttaagtgtatttggcttggagcaattttgggatgggtgacctcctgcgaagtttcct 1628914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 327
Target Start/End: Original strand, 20966055 - 20966235
Alignment:
Q  147 acatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagat 246  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | |  ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20966055 acatcggaatgagagtggtcttgaggccatctaggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagat 20966154  T
Q  247 gcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgac 327  Q
    | || || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  20966155 gtatattattttcggtagctcattccataagaacttcacagttaaacatgcatgacttgtatcaattttgggatgggtgac 20966235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 323 - 438
Target Start/End: Original strand, 43233137 - 43233252
Alignment:
Q  323 gtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagc 422  Q
    ||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  43233137 gtgacctaccgagaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagc 43233236  T
Q  423 agtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||    
T  43233237 agattgggatgctaca 43233252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36015557 - 36015404
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36015557 aatcacaccggaatgagagggatcccaaggcagtgcaagtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactacatatatcaaca 36015458  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtg 296  Q
    |||||| ||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  36015457 agatgcctcttcttttaaatagcccattccataagaacttcacagttaaacgtg 36015404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31743982 - 31743834
Alignment:
Q  131 taggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtacta 230  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||  |||| |||  |||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||    
T  31743982 taggaaaaactgaatcatatcgaaatgagatggatcttgaaatcgtgcaagcatgagactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgcta 31743883  T
Q  231 cctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaa 279  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  31743882 tctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaa 31743834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 264
Target Start/End: Original strand, 43233412 - 43233534
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || |||||||| |||| ||||| |||  ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43233412 gaatcacaccgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaac 43233511  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtag 264  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  43233512 aagatgcatctttttttcggtag 43233534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26957704 - 26957603
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26957704 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 26957605  T
Q  242 aa 243  Q
    ||    
T  26957604 aa 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 397
Target Start/End: Original strand, 11372501 - 11372697
Alignment:
Q  193 atggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaag 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||  ||||||||   |||||||||| || |||||||    
T  11372501 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaacatgatgcatgttatttttggtagctcaaaccataagaactccaaagttaag 11372600  T
Q  293 cgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 392  Q
    |  | |||||||  ||||||||| ||||| |||||   | | ||||||| |  | || |     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11372601 cacgtttgacttatagcaattttgggatgagtgac---ccgagaagttttccggaaatc-----agtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttgg 11372692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26421415 - 26421287
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||| |||||||    
T  26421415 aggtatgggtcagtatggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaagatgcatatttttttcggtagtccattccataaga 26421316  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttgga 307  Q
    ||| || |||||| |||| |||| |||||    
T  26421315 actccacagttaaacgtgtttgaattgga 26421287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6748019 - 6747959
Alignment:
Q  346 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6748019 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagt 6747959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 438
Target Start/End: Original strand, 36422573 - 36422677
Alignment:
Q  334 ggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  | |||| | |||||||||    
T  36422573 ggaagtttcccggcaagtgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagtaatctgggatg 36422672  T
Q  434 ctaca 438  Q
     ||||    
T  36422673 ttaca 36422677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 400
Target Start/End: Original strand, 37672195 - 37672417
Alignment:
Q  178 caggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataag 277  Q
    |||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||  |||| ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||   ||| | ||||||||||    
T  37672195 caggtataagactgcatggttgcaaaaaggtttataataattgtttggtactacttgtaccaacaagatgcaacttctttttgttagttgatttcataag 37672294  T
Q  278 aacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctga 377  Q
    || | || ||||||||||| ||||||| || |||||||   ||||| ||||| ||||||| ||||   | ||   || ||||||||| |||| ||| |||    
T  37672295 aaatacacagttaagcgtgtttgactttgaacaattttataatgggcgaccttctgggaaatttctcggaaaatatgtgagtgaggataaaatacgttga 37672394  T
Q  378 aaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    ||| || ||||||||||| ||||    
T  37672395 aaatacccgtgttggtttatggg 37672417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 356 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 26419168 - 26419104
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaa 420  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  26419168 gagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaa 26419104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 37671785 - 37671654
Alignment:
Q  265 ctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgagga 364  Q
    ||||||||||| ||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||  ||  |||||||  |  ||||||| |||||||||    
T  37671785 ctcatttcatatgaaatccacatttaagcgtgcttgaattggagcaattttgtgatgggtcaccttttgaaaagtttctcataaagcgtgtgagtgagga 37671686  T
Q  365 caaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    | |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  37671685 ccaaacacactaaaaagtctcgtgttggtttg 37671654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 281
Target Start/End: Original strand, 16192355 - 16192457
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||||    
T  16192355 aggtataggaattcatgattgaatgaaggattataagaattgtttggtattacctacatcaacaagatgcatcttcgttttggtagcccattccataaga 16192454  T
Q  279 act 281  Q
    |||    
T  16192455 act 16192457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7461319 - 7461258
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  7461319 gtgcgagtgaagataaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtgggatcaatcgacaat 7461258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3305459 - 3305374
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggta 227  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  3305459 gaatcacatcgaaatgagggggatcctgaggccgtgtaagtatgggactacatggttgaatgaaggcttatgagaattgtttggta 3305374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 455 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4162649 - 4162602
Alignment:
Q  455 aatgagatatcactacccaagatgtttgtaaagtatttctcaacccaa 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  4162649 aatgagatatcactacccaagatatttgtgaagtatttatcaacccaa 4162602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 321
Target Start/End: Original strand, 6585638 - 6585787
Alignment:
Q  173 tcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac--aagatgcatcttcttttcagtagctcatt 270  Q
    |||| ||| |||| || |||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||||  ||      
T  6585638 tcgtgcagatatgagattgcatgattgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaagatacatcttccttttggtag-gcaaa 6585736  T
Q  271 tcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatg 321  Q
     ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  6585737 acataaaaactttatagttaagtgtgcttgacttgaagcaaatttaggatg 6585787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 438
Target Start/End: Original strand, 43776321 - 43776380
Alignment:
Q  379 aagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43776321 aagactcgtgttggtttgtggggttagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 43776380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 31743827 - 31743781
Alignment:
Q  351 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31743827 cgtgcgagtgaggtcaacgcacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 31743781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 2490077 - 2490136
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaa 240  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  2490077 gtatgtgactgcatgattgaaggaatgcttataagaagtgtttgttactacctatatcaa 2490136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 247
Target Start/End: Original strand, 33316721 - 33316832
Alignment:
Q  137 aaactgaatc-acatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctat 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||   ||||| ||||| ||||  | ||| |||    
T  33316721 aaactgaatccacatcggaatgagataaattttgatgtcgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaaaaattataagaattgtttgacaatacttat 33316820  T
Q  236 atcaacaagatg 247  Q
    ||||||||||||    
T  33316821 atcaacaagatg 33316832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 36015407 - 36015361
Alignment:
Q  351 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36015407 cgtgtgagtgaggacaaaatacgctaaaaagactcgtgttagtttgt 36015361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 124
Target Start/End: Original strand, 1628648 - 1628713
Alignment:
Q  59 gcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggca 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||| || ||||| || ||||||||    
T  1628648 gcctccgcttggtggacatgtaacgctcaaggctgatgagagcggagaatggtccggatcctggca 1628713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7461424 - 7461344
Alignment:
Q  215 gaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtg 296  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  7461424 gaattgtttgatactaactatataaacaagatacatcttctttttggtagttca-ttcataagaactctacagttaagcgtg 7461344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30572462 - 30572413
Alignment:
Q  273 ataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgg 322  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  30572462 ataagaatttcatacttaagcgtgcttaactttgaacaatttttggatgg 30572413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 2189501 - 2189545
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  2189501 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 2189545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16811956 - 16811900
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctat 235  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  16811956 aggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttttgtactatctat 16811900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 34405836 - 34405792
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  34405836 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 34405792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 89)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 53 - 423
Target Start/End: Original strand, 35871538 - 35871907
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35871538 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 35871637  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35871638 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatatcaacaagatgcat-t 35871736  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||  |||| ||    
T  35871737 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctatcggaaagtttcccggtaaacg 35871836  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagca 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  35871837 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtcggcaatcctgaaagca 35871907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 52 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23350514 - 23350127
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23350514 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 23350415  T
Q  152 ggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23350414 ggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatatcaacaagatgcatc 23350315  T
Q  252 ttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagc 351  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||   ||||||    
T  23350314 ttcttttcggtagctccttccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgagaagtttctctgtaagc 23350215  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| || |||||    
T  23350214 gtgtgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtctggggtgttacac 23350127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 44471555 - 44471195
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44471555 tgtaacacctctgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 44471456  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44471455 gaatgagagagatcttgaggccgtacaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 44471356  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  44471355 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcg 44471256  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  44471255 ggcgagtgaggacaaaacatgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 44471195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 52 - 430
Target Start/End: Original strand, 49998545 - 49998923
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49998545 gtgtaacgcctccccttggtgggcatgtaaagctcaaggctgatgagggcggggagtggtccagctcttggcatgcttctagacaaaactaaatcacatc 49998644  T
Q  152 ggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998645 ggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 49998744  T
Q  252 ttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagc 351  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||     
T  49998745 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 49998844  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||  |||||||||| ||||    
T  49998845 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggacagtcggcaattctgaaagcagtttggg 49998923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44471099 - 44470714
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44471099 tgtaacgcctccgcttggt-----tgtaacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 44471005  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| ||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44471004 gaatgagagagatcatgacgctgtacaagtatgtgactgtatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 44470905  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||| ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  44470904 tctgttc-gtaactcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggttgacctaccgggaagtttcccggtaagcg 44470806  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactttga 444  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||  | ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  44470805 tgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcaacaattcttaaagtcgtctggggtgttacactttga 44470714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 142 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12692140 - 12691907
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12692140 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 12692041  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12692040 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagttt 12691941  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgct 375  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12691940 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgct 12691907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50398679 - 50398383
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  50398679 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50398580  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  50398579 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaagttt 50398480  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     |  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  50398479 accggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacactggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 50398383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 179 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7678726 - 7678467
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  7678726 aggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcttattccataaga 7678627  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7678626 actccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 7678527  T
Q  379 aagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  7678526 aagactcgtgtaggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 7678467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24629574 - 24629281
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24629574 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 24629475  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        
T  24629474 aagatgcatcttcttttcggtacctcgttccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa---a 24629378  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  24629377 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgtgatgttaca 24629281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 76 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 14572357 - 14572007
Alignment:
Q  76 atgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcg 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  14572357 atgtaacgcccaaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctagaaaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcca 14572258  T
Q  176 tacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcata 275  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |   ||||    
T  14572257 tgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccata 14572159  T
Q  276 agaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgct 375  Q
    |||||| || |   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  14572158 agaactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttctcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggt 14572062  T
Q  376 gaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  14572061 gaaaagactcgtgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatggg 14572007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27578683 - 27578317
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||     
T  27578683 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagcggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaaccgaatcatatca 27578585  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||  |   |||| |||||  |||| || |||||  |||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27578584 gaatgagatgg---ctgaagtcgtggaggtgtgagactgtgtggttgaatgatggtttataagaattatttggtgctacctatatcaacaagatgcatct 27578488  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| ||| | ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |    |||||    
T  27578487 tcttttcggtatcccaaaccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttcgaacaattttgggatgagcgaccttctgggaagttttccgacaagcg 27578388  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagca 423  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  27578387 tgcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgatggtttgtgggatcagtcaacaatcctgaaagca 27578317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1645890 - 1645619
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1645890 gaatcacatcggaatgagaggaatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaac 1645791  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1645790 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagttt 1645691  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  1645690 ctttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaat 1645619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4128030 - 4127739
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4128030 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 4127931  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||    
T  4127930 aagatgcatcttcttttcggtagccaattccataagaacttcagagttaagcgtgcttggcttagagcaattttgggatgggtgacctaccgaaaagttt 4127831  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4127830 tccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgg-----gtcggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 4127739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 13266002 - 13266381
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     |||||||||| | || ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||      
T  13266002 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctggtga-----gggagtggtccgacttctggcaa-cttctgggcaaaattgaatcacatta 13266095  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| | | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13266096 gaatgagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaaggaaggcttataataattttttagtactccctatatcaataagatgcatct 13266195  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    | ||||| ||||| ||  ||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |    ||| |    
T  13266196 tattttcggtagcccaaatcacaagaaccccacagttaagcgtgcttgactttgagaaattttaggatgggtgaccttttgggaagttttccgaaaagtg 13266295  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  13266296 tgcgagtgaggagaaaacatgttgaaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 13266381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23942930 - 23942675
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23942930 gaatcacatcggaatgagagggatcctggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 23942831  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  23942830 aagatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggaaagttt 23942731  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  23942730 ccaaataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaggacccgtgttggtttgt 23942675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 53 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15306326 - 15306052
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||     
T  15306326 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtctggctcctggca-gcttctaggcaaaacagaaccacatca 15306228  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaatt------atttggtactacctatatcaacaagat 246  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||| || ||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15306227 gaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggtcgaaagaagacttataagatttgagcaattttggtactacctatataaacaagat 15306128  T
Q  247 gcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgg 322  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  15306127 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaatcttgggatgg 15306052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50399134 - 50398839
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  50399134 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50399035  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | | ||  |||||||||||||| ||| |  ||    
T  50399034 acgatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggga-att 50398936  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50398935 cccggtaaacgtgcaagtgaggacaaaacacgttggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 50398839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9423999 - 9423748
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  9423999 gaatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaac 9423900  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||| |||||| | | || ||||||||||||||| ||||| |||    
T  9423899 aagatgcatcttctttctagtagcccattccataagaatttcacaattaagtgtgcttgaattggagtagtcttaggatgggtgacctaccgggaaattt 9423800  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 393  Q
    ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9423799 cccgttaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 9423748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 192 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23943333 - 23943087
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaa 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  23943333 catggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 23943234  T
Q  292 gcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23943233 gcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccaaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 23943134  T
Q  392 gtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||| || ||||| ||||||  | ||||  |||||||||| ||||    
T  23943133 gtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 23943087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31817993 - 31817699
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  31817993 gaatcacatcggaataagagggattatgaggtcatgcatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaac 31817894  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||| | | |||||||    
T  31817893 aagatgcatcttcttttcggtagtccatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttgtagtagttttaggatgggcgaccttcggtgaagttt 31817794  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |   | ||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31817793 cgcggaaagcgtgcgagtgaggacaaatcatgttg-aatgactcgtgttggtttgagggatcagtcagcaatcctgaaagcagtct-ggatgctaca 31817699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 3169205 - 3169501
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  3169205 gaatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaac 3169304  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||| | || | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  | ||||||    
T  3169305 aagatgcatcttctttttggtaacccaatccataagaactccacacttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgacctaccagaaagttt 3169404  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||||    
T  3169405 cttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaatactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaatacttaaagtcgtctaggatgctaca 3169501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 51331422 - 51331128
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  51331422 gaatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaac 51331323  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  51331322 aagatacatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaaattt 51331223  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     | | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| || ||||| | ||||| | |||| ||||| ||||| ||||    
T  51331222 tcga-taagcgtgcgaatgaggacaaaacacactg-aaagactcgtattagtttgtagggtcagtcggcaatcctaaaagtagtctaggatgttaca 51331128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27579137 - 27578795
Alignment:
Q  54 gtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcgg 153  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27579137 gtaacgccttcgtttggtgggcatgtaatgctcgaggctggtgagggtggggagtggtccgactcttgaca-gcttctaggtaaaaccgaatcacatcgg 27579039  T
Q  154 aatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    ||| |||| |||| | | |||||  |||||||  ||| | |||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||  ||||||    
T  27579038 aataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgactgaagacttataagaattgtttggtactacatatatcaattagacacatctt 27578939  T
Q  254 cttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgt 353  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  27578938 cttttcagtagccctatccataagaactacacagttaagcgtgcttaacttggagcgattttgggatgcgtgaccttctgggaagtttcccagaaagcgt 27578839  T
Q  354 gcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  27578838 gcgagtgaggacaaatcatgctgaaaagacttgtgttgatttgt 27578795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4127578 - 4127276
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4127578 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 4127479  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctca-------------------tttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgg 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||                   || |||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  4127478 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttccataagaactccacagttaagcatgattggcttggagcaattttgggatgg 4127379  T
Q  323 gtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagc 422  Q
    |||| |||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  4127378 gtgagctatcgggaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagc 4127279  T
Q  423 agt 425  Q
    |||    
T  4127278 agt 4127276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 406
Target Start/End: Original strand, 21067281 - 21067545
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  21067281 gaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcatgtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattatttggtactacatatatcaac 21067380  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| ||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  21067381 aagatgcatcttctttccggtagctcattctaaaagtactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggaggggtgacctaccggaaagttt 21067480  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  21067481 ctcggtaagcgtgcgagtggggacaaaacacactgaaaagactcgtgttagtttgttgggtcagt 21067545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 433
Target Start/End: Original strand, 1464146 - 1464436
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |  |||  ||||||| || | ||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1464146 gaatcacatcagaatgagagggatcatgcgaccgtgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 1464245  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  1464246 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcacaatttagcgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgagaagttt 1464345  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
     | |  || ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || || |||| | ||||||||||||||||    
T  1464346 tccaaaaaacgtgcgagttaggacacaacacgctgaaaa-actcgtgttgatttgtggggtcggtcgataatcctaaaagcagtctgggatg 1464436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24629121 - 24628929
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaa---ggcttatatgaattatttggtactacctatatc 238  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24629121 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacctatatc 24629022  T
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctac 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24629021 aacaagatgcatcttcttttcagtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctac 24628929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14571928 - 14571702
Alignment:
Q  76 atgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcg 175  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||  ||    
T  14571928 atgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccg 14571829  T
Q  176 tacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcata 275  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||    
T  14571828 tgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccata 14571729  T
Q  276 agaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  14571728 agaactccacagttaagcgtgcttgac 14571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50814899 - 50814730
Alignment:
Q  209 ttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggag 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  50814899 ttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 50814800  T
Q  309 caatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50814799 caattttgggatggatgacctaccgggaagtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 50814730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 397
Target Start/End: Original strand, 14351789 - 14352049
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||||    
T  14351789 aaaccgaatcacaccagaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagttttttggtactatctata 14351888  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |  ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||  |    
T  14351889 tcaacaagatgcatcttctttttggtatcctattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttcgagtagtctttggatggatgacctactgcaa 14351988  T
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  14351989 agttttccagtaagcgtgcaagtgaagacaaaatatgctgaaaagactcatgttggtttgt 14352049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8467966 - 8467688
Alignment:
Q  114 ggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttata 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||| |||||| || |||||||||   || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8467966 ggctcctggca-gcttctaggcaa--ccgaaccacatcagaatgaaagggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttata 8467870  T
Q  214 tgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatt 313  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||        ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8467869 agaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagccca--------gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatt 8467778  T
Q  314 tttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttg 408  Q
    ||     |||||||||  |||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8467777 tt-----gggtgaccttatgggaagtttctcggaaagcatgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagttg 8467688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 178 - 400
Target Start/End: Original strand, 27026538 - 27026759
Alignment:
Q  178 caggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataag 277  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||    
T  27026538 caggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatctttttttg-gtagcccattccataag 27026636  T
Q  278 aacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctga 377  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| | |  ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  27026637 aactacgtagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggaagggtgaccttctaggaagtttaccaaaaagcgtgtgactgaggaaaaaacacgctga 27026736  T
Q  378 aaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  27026737 aaagactcgtgtttgtttgtggg 27026759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 397
Target Start/End: Original strand, 21067755 - 21067985
Alignment:
Q  164 atcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagta 263  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||    |||    
T  21067755 atcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatacatttttttg---gta 21067851  T
Q  264 gctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgagg 363  Q
    |  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  21067852 gtccattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttaccggtaaacgtgcgagtgagg 21067951  T
Q  364 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  21067952 acaaaacacactgaaaaaattcgtgttggtttgt 21067985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 400
Target Start/End: Original strand, 41869830 - 41870175
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||  | ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41869830 tgtaacgcctccgcttggtggacatgtaacgctcaaggctggtgacgg-ggggagtggtacgtctcctgtaa-gcttctaggcaaaactaaatcacatcg 41869927  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    || |||||| |||||||||   |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41869928 gagtgagagggatcctgagactgtacatatatgggactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtatgatactacctatatcaacaagacgcatct 41870027  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| | ||| || || ||||| | |||||||||| ||||||  ||||| |||  ||||||      |||||    
T  41870028 tcttttcagtaacccaaatcataagaacttcacaattatgcatgtttgacatagagcaattttgggatggaagaccttctgaaaagtttttcgaaaagcg 41870127  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    ||  || || |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41870128 tgtaagggatgacagaacacgctgaaaagactcgtgtttatttgtggg 41870175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21220472 - 21220272
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |  |||||||  |||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21220472 gaatcacatcagaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 21220373  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  21220372 aagatgcatcttctttttggtaactcattctataagaactacacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggacgggtgacctact-ggaagttt 21220274  T
Q  342 cc 343  Q
    ||    
T  21220273 cc 21220272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 420
Target Start/End: Original strand, 17628560 - 17628788
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaa 291  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||| | || |||| |    
T  17628560 catggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcgatagcccaacccataagaattccacagttga 17628659  T
Q  292 gcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  17628660 gcgtgcctgacttggagcaattttgagatgggtgaccttctaggaagattcccataaagcgtgtgagtgaggacaaaacacactggaaagacttgtgttg 17628759  T
Q  392 gtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaa 420  Q
    || |||||  ||||| | ||||| |||||    
T  17628760 gtatgtggagtcagtcggcaatcctgaaa 17628788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 383
Target Start/End: Original strand, 17029323 - 17029570
Alignment:
Q  136 aaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctat 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||  |||| ||| |||||||||||    
T  17029323 aaaactgaattacatcggaatgagagggatctagaggtcgtgcaagtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctat 17029422  T
Q  236 atcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggg 335  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  ||| || ||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||||    
T  17029423 atcaacaagatgcatattacttttggtaccttattccataagaactccacagttaagagtgcttaacttggagcatttttgggttgggtgaccttctggg 17029522  T
Q  336 aagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagac 383  Q
    |||||||| || ||||| || | ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  17029523 aagtttcccagaaagcgggcaaatgacgacaaaacatgctaaaaagac 17029570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 395
Target Start/End: Original strand, 17028858 - 17029126
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttgg 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | | | || |||||||||||||| ||||||||| |  || || ||||| || ||    
T  17028858 gcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaagaattgttagg 17028956  T
Q  226 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtg 325  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  17028957 tgctacctatatcaacaagatgcgtcttattttacctagcttattccataagaacttcatagttaagagtgcttgacttggagcaatttcgggatgggta 17029056  T
Q  326 acctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    | ||  |||||||||||     ||| |||| | |||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  17029057 aacttatgggaagtttctcgaaaagtgtgctaatgaggagaaaacatgttgaaaagacttctgttggttt 17029126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29628808 - 29628531
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29628808 gaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 29628709  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa---- 337  Q
    ||||||  |||| | ||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||| |||||        
T  29628708 aagatgtgtctt-tgtttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacttaccgggaaactc 29628610  T
Q  338 ----------gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
              |||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  29628609 cagaaagtttgtttcccagtaagtgtacgagtgaggataaaatacgctgaaaaaactcgtgttgatttgtaggatcagt 29628531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13614043 - 13613786
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || || | ||| |||| |||||| ||||||   |||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  13614043 aaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctata 13613944  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| | ||| ||    
T  13613943 tcaacaagatgcatcttcttt-cggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggactagtctttggatgggtgacgttctgaga 13613845  T
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||||| ||   |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  13613844 agttttctgaaaagccttcgagtgaggacaaagcacgctgtaaagactcatgttggttt 13613786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53996256 - 53996090
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||   |  || ||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  53996256 gaatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtagatatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgtttggtactacctatatcaac 53996157  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggag 308  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  53996156 aagattcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggag 53996090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27578296 - 27578172
Alignment:
Q  273 ataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacac 372  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  27578296 ataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcagttttgggatgagtgaccttatgggaagtttccctgaaaacgtgcgagtgaggacaaaacac 27578197  T
Q  373 gctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  27578196 gctgaaaagactcgtgttgggttgt 27578172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 398
Target Start/End: Original strand, 33764904 - 33765115
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcata 286  Q
    |||| |||||||| | |||| ||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |    
T  33764904 gactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatgcatcttcttttttgtagctcattttataagaacttcaca 33765003  T
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 386  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | || |||  |||   |  |||| || ||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  33765004 cttaagcgtgcttgatttggatcaattttgggatgggtgactttctaggagttttttcaaaaagcatgtgagcgaggtcaaaacacactaaaaagactcg 33765103  T
Q  387 tgttggtttgtg 398  Q
    ||||||||||||    
T  33765104 tgttggtttgtg 33765115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20306241 - 20306063
Alignment:
Q  203 gaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    ||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20306241 gaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatctttttg---gtatcccatttcataagaactacacggttaagcgtgcttgac 20306145  T
Q  303 ttggagcaatttttggatgggtgacctac--tgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaga 382  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||    || ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20306144 ttggagcaatttttagatgggtgccctactataggaagtttcccgaaaaacgtgcaagtgaggacaaaacactctgaaaaga 20306063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 272 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 14571699 - 14571545
Alignment:
Q  272 cataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaaca 371  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  |||||||||||   | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  14571699 cataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaaca 14571600  T
Q  372 cgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtc 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||    
T  14571599 cgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgggaatcctgaaagcagtc 14571545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 300
Target Start/End: Original strand, 27029331 - 27029434
Alignment:
Q  197 ttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtg 296  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||| |||    
T  27029331 ttgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtg 27029430  T
Q  297 cttg 300  Q
    ||||    
T  27029431 cttg 27029434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 318 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15268138 - 15268029
Alignment:
Q  318 gatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtg 417  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  15268138 gatgggtgagctaccgggaaatttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctg 15268039  T
Q  418 aaagcagtct 427  Q
    ||||||||||    
T  15268038 aaagcagtct 15268029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31817539 - 31817376
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  31817539 gaatcacatcgaaataagagggatcatgaggtcgtgcatgtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaac 31817440  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttg 305  Q
    || ||||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||  | | ||||||||| ||||||||    
T  31817439 aaaatgcatcttcttttccgcagcccattccttaagaactctacaattaagcgtgtttgacttg 31817376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23976323 - 23976095
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc--ttttcagtagctcatttcataa 276  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||  |  ||||||    
T  23976323 aggtatgggtctgcatgattgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttcttttttca-tagccaaaatcataa 23976225  T
Q  277 gaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 376  Q
     |||| || |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||  || || |||||| |  || | ||||  |||||| |||||||||||    
T  23976224 aaactccacagttaaacgtgcttgacttggaataattttgggatgagtgagcttatgtgatgtttcccaaaaaacatgcggctgaggaaaaaacacgctg 23976125  T
Q  377 aaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  23976124 aaaagactaatgttggtttatggggtcagt 23976095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 52048813 - 52048547
Alignment:
Q  137 aaactgaat-cacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctat 235  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||   ||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  52048813 aaactgaattcacgtcggaatgagagggttcctaaggccgtacaggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtat 52048714  T
Q  236 atcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggg 335  Q
    |  |||||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||| || ||||||         ||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  52048713 actaacaagatgcatcttcatttt-gtaagtcattccataagaactccacagttaa---------acttggagcaattttag-atggatgaccttctagg 52048625  T
Q  336 aagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |||||||     ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52048624 aagtttctcgaaaagagtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagattcatgttggtttgtgagatcagtcgacaat 52048547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 346 - 438
Target Start/End: Original strand, 35477863 - 35477955
Alignment:
Q  346 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  35477863 gtaaacgtgcgagagaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 35477955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 384
Target Start/End: Original strand, 4185717 - 4185956
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||| | | |||||||| ||| |||||||| ||||||  | |||| ||||| |||| ||| || |||| |||||||    
T  4185717 tcacatcaaaatgagagggttcatgaggccatgcaggtatgagacggcatggttaaaggaatacatataagaattgtttgataccacatataccaacaag 4185816  T
Q  245 atgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcct 344  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || ||| ||||      
T  4185817 atgcatcttctttttggtagctcattctacaagaactctacagttaagtatgcttgacttggagcaattttgggataggtgaccttatgcgaaatttctc 4185916  T
Q  345 agtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagact 384  Q
       ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  4185917 gaaaagcgtgtgaatgaggacaaaacacactaaaaagact 4185956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 406
Target Start/End: Original strand, 40607071 - 40607194
Alignment:
Q  283 catagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaga 382  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  40607071 catagttaaacgtgtttgatttggagcaaatttgggatgggtgacctaccggaaagtttatcggtaagcgttcgagtgaggacaaaatacgctgaaaaaa 40607170  T
Q  383 ctcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  40607171 ctcgtgttgatttgtggaatcagt 40607194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31817107 - 31816981
Alignment:
Q  314 tttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||    
T  31817107 tttggatgggtgacattctgggaagtttcccagaaagcgtacgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcgtgctggtttgtggggccaatcgacaat 31817008  T
Q  414 cgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    | ||| || ||| ||||||| ||||||    
T  31817007 cctgatagtagtatgggatgttacact 31816981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24271690 - 24271445
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgta--caggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||| ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||  ||||    
T  24271690 tcacatcggaatgagagggttcctgaggtcgtgtgcaggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaaca 24271591  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    |||||||| || ||||  ||||| |||| ||||||||||    |  ||| | ||||||| || || ||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||     
T  24271590 agatgcatatt-ttttgggtagcccattccataagaactctgcaaataaacatgcttgagttagaacaattttgggatgcgtgaccttctgaaaagtttt 24271492  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgt 389  Q
     ||| ||||||| |||||| || |||||||| | ||||||| |||||    
T  24271491 gtagaaagcgtgtgagtgaagaaaaaacacgttaaaaagacccgtgt 24271445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43929092 - 43928927
Alignment:
Q  154 aatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    |||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||   |||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43929092 aatgagagggttcctgaagccgtgcaggtatgagactatttggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctt 43928993  T
Q  254 cttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggat 320  Q
    |||||  |||| | |||||||||||| | || | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43928992 ctttttggtag-ttatttcataagaaatccacaattaaacgtgcttgactttgagcaattttgggat 43928927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 314 - 406
Target Start/End: Original strand, 7381438 - 7381530
Alignment:
Q  314 tttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  7381438 tttggatgagcgacctaccgagaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtagggtcagt 7381530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 315
Target Start/End: Original strand, 17628951 - 17629139
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatc-acatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttg 224  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||    
T  17628951 gcttctaggcaaatc-gaatccacatcagaatgagtgggatcctaaggtcgtgcaggtatgtgaatgtatggttgaataaaaacttataagaattgtttg 17629049  T
Q  225 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||||||||| || ||| || | || ||||| | || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17629050 gtactacctatactaataagatgcctcttctttttagaagcccaatccaaaagaattccaca-ttaagcatgcttgacttggagcaatttt 17629139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23091578 - 23091468
Alignment:
Q  216 aattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||  |||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23091578 aattgtttggtactacatatattaacaagatgcatcttctttctggtagcttattctataaaaactccacagttaagcatgcttgacttgtagcaatttt 23091479  T
Q  316 tggatgggtga 326  Q
     ||||||||||    
T  23091478 gggatgggtga 23091468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4414332 - 4414264
Alignment:
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4414332 gtttcctggtaagcgtgcgagtcaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagt 4414264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11828507 - 11828396
Alignment:
Q  261 gtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtg 360  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||| |  ||  |||||||||    
T  11828507 gtagctccttccataagaactccacagttaagcgtgctttacttggagcatttttgggatgggtgaccttctggaaaatttcccaaaaaatgtgcgagtg 11828408  T
Q  361 aggacaaaacac 372  Q
    ||| ||||||||    
T  11828407 agggcaaaacac 11828396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 258
Target Start/End: Original strand, 45682209 - 45682318
Alignment:
Q  149 atcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgc 248  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | | ||  ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45682209 atcggaatgagagagatcttgaggccatgcatatatgggactacatgattgaatgaaggtttataagaattatttggtattatctataccaacaagatgc 45682308  T
Q  249 atcttctttt 258  Q
    || |||||||    
T  45682309 attttctttt 45682318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 53854858 - 53854733
Alignment:
Q  272 cataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaaca 371  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | |||||| || | |||||||||| |||||||||    |||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| |    
T  53854858 cataagaactccatagttaagcatgttagacttgaagtagtttttggatgtgtgacctaccaaaaagtttaccggtaaacgtgcgagtgatgacaaaata 53854759  T
Q  372 cgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  53854758 cgttgaaaagactcgtgttgatttgt 53854733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26200444 - 26200205
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaat-cacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaag--gcttatatgaattatt 222  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | ||  |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||  |||| ||    
T  26200444 gcttctaggcaaa-ctgaattcacatcagaatgagagggatcctgatattgtgtaggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtt 26200346  T
Q  223 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgg 322  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||| ||||||   |||||  |   |||||||||||        | | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26200345 tgatactaactatacaaacaagatgcatattctttgtggtagccgaaaccataagaactt--------aacatgcttgacttggagcaattttgggatgg 26200254  T
Q  323 gtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaaca 371  Q
    ||||||| | | ||||||||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  26200253 gtgaccttcagcgaagtttcacgaaaagcgtgtgagtgaggacaaaaca 26200205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Original strand, 44831046 - 44831146
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaa 291  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  44831046 catggttgaagggaagcttataaaaattgtttggtactacctaaactaacaagatgtatattcttttcggtagcccatttcatatgaacttcacagttaa 44831145  T
Q  292 g 292  Q
    |    
T  44831146 g 44831146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 291
Target Start/End: Original strand, 4186224 - 4186315
Alignment:
Q  200 aaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaa 291  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  4186224 aaggaatgcttataagaatgatttggtactacctacatgaacaagattcatcttctttttggtagcccattgcataagaactacacagttaa 4186315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20309710 - 20309594
Alignment:
Q  88 aggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatggg 187  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    | |||||||| |    
T  20309710 aggctgacgagggcggggattggtctggctcatgaca-gcttctagg--aaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgagactttgcaggtatgtg 20309614  T
Q  188 actgcatggttgaaggaagg 207  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  20309613 actacatggttgaaggaagg 20309594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2682861 - 2682707
Alignment:
Q  51 tgtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacat 150  Q
    |||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| | ||| ||||||| |||| |||  | |||| || |||||| ||||||||||    
T  2682861 tgtgtaacacattcgcttgatgggcatgtaacgcccgaagctaacgaaagtgggaagtggtccggctgctgata-gcttttaagcaaaattgaatcacat 2682763  T
Q  151 cggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaag 206  Q
    || |||||||| ||||||||   ||| || ||||| || |||||| ||||||||||    
T  2682762 cgaaatgagagggatcctgaaaccgtgcatgtatgtgattgcatgattgaaggaag 2682707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 304
Target Start/End: Original strand, 42838661 - 42838787
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatctt--cttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||  ||| ||||| |||||||    
T  42838661 gtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatctttctttttcgatagttcattccataaga 42838760  T
Q  279 ac-ttcatagttaagcgtgcttgactt 304  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||    
T  42838761 actttcacagttaagcgtgtttgactt 42838787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 315
Target Start/End: Original strand, 34554483 - 34554601
Alignment:
Q  197 ttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtg 296  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||| || |||||||||| || ||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  34554483 ttgaaagaatgcttataagaattgtttgacactacctataccagcaagatgcattttatttttggtagaccattccataagaacttcatagttaaacatg 34554582  T
Q  297 cttgacttggagcaatttt 315  Q
     ||||||| ||| ||||||    
T  34554583 tttgacttagagaaatttt 34554601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 53854948 - 53854858
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacc 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  53854948 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacc 53854858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 438
Target Start/End: Original strand, 50399334 - 50399399
Alignment:
Q  373 gctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  50399334 gctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcgatgttaca 50399399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 53996053 - 53996000
Alignment:
Q  360 gaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  53996053 gaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtggacaat 53996000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 400
Target Start/End: Original strand, 5810039 - 5810091
Alignment:
Q  348 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5810039 aagcgtgtgagtgaggataaaacacgctgaaaagactcatgttgatttgtggg 5810091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 438
Target Start/End: Original strand, 13265859 - 13265931
Alignment:
Q  366 aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  13265859 aaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtgcggtcagtcggtaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 13265931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33987227 - 33987164
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggact 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||||    
T  33987227 gcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcatgagatcgtgcaggtatgtgact 33987164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Original strand, 10165953 - 10166024
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttata 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||   | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10165953 gaatcacatcggaatgagaaagatcatgaggcattgcaggtatgggactgcattgttgaatgaaggcttata 10166024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 33294936 - 33294778
Alignment:
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgactt-ggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||| || | |  ||| ||    
T  33294936 aacaaaatgcatcttcttttttgtagttcactccataagaactccacagtaaagcgtgctcgactttggaacaattttggaatggatgccattatggaaa 33294837  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
     ||||  |  ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33294836 atttctcaa-aagtgtgcaagtgagaacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgggttgt 33294778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39902515 - 39902477
Alignment:
Q  221 tttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39902515 tttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttc 39902477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 264
Target Start/End: Original strand, 53391890 - 53392008
Alignment:
Q  146 cacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaaga 245  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| || |||   ||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||| |||| ||| | ||||||||||||||    
T  53391890 cacatcagaatgagagagatcttgaagttgtaagagtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaaga 53391989  T
Q  246 tgcatcttcttttcagtag 264  Q
    | ||| || ||||| ||||    
T  53391990 tacatatttttttcggtag 53392008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 355
Target Start/End: Original strand, 50399270 - 50399335
Alignment:
Q  290 aagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgc 355  Q
    |||||||| |||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50399270 aagcgtgcctgacttggagtattcttatgatgggtgacctactgggaagtttcccggtaagcgtgc 50399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52299902 - 52299826
Alignment:
Q  248 catcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggt 324  Q
    |||||||||||  |||||  |||  ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  52299902 catcttcttttttgtagcctattcaataagaacttcatagttaaacatgcttgattttgagcaattttaggatgggt 52299826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 242
Target Start/End: Original strand, 17506389 - 17506484
Alignment:
Q  147 acatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| | || ||||| || |||||| || || |||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||    
T  17506389 acatcagaatgagagggatcatgaggtcatgcatgtatgagagtgcatgattaaaagaagacttataagaattgtatagtactacctatatcaaca 17506484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33987074 - 33987019
Alignment:
Q  358 gtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33987074 gtgatgacaaaacacgctgaaagaacttgtgttggtttgtggaatcagtcgacaat 33987019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34801301 - 34801230
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtct 427  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||    
T  34801301 gagtgaagacaaaactggctgaaaaaactcatgttggtttgtgaaatcagccgacaatcgtgaaaggagtct 34801230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2499426 - 2499388
Alignment:
Q  359 tgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2499426 tgaggacaaaacacgttgaaaagacgcgtgttggtttgt 2499388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 195
Target Start/End: Original strand, 35477801 - 35477855
Alignment:
Q  141 tgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| | |||||||||    
T  35477801 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgcaagtacgagactgcatg 35477855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 112
Target Start/End: Original strand, 27029182 - 27029223
Alignment:
Q  71 tgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27029182 tgggcatgtaacacccgaggctgacgagggcggggagtggtc 27029223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 50398777 - 50398733
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  50398777 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 50398733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10594
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10210 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 10309  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10310 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 10409  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10410 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa-ttttggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcg 10508  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |||| |||||| ||||    
T  10509 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttaca 10594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 53 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 107699 - 107311
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  107699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 107600  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  107599 gaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatatcaacaagatgcatct 107500  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  107499 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacgtaccgggaagtttcccggtaagcg 107400  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactt 441  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  107399 tgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggctattctgaaagcagtctgggatgttacactt 107311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 105630 - 106015
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  105630 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtggtctggttcctggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 105729  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  105730 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgcagggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatct 105829  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  105830 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgtgtgacctaccgagaagtttcctggtaagcg 105929  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  105930 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttatagggtcagtcggcaattctgaaagcagtctgagatgttaca 106015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31284512 - 31284127
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284512 tgtaacgcctccgcttagtgggcatgtatcgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 31284413  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284412 gaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 31284313  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |    |||||    
T  31284312 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgccgggaagttttccgacaagcg 31284213  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  31284212 tgcgagtggggacaaaacacgccgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcatgaaagcaatctgggatgttaca 31284127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 79 - 438
Target Start/End: Original strand, 8067216 - 8067575
Alignment:
Q  79 taacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtac 178  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  8067216 taacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaagcaaaattgaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgc 8067315  T
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  8067316 aggtatgggattgcatggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatctttttttcggtagctcattccataaga 8067415  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8067416 actccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 8067515  T
Q  379 aagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  8067516 aagactcgtgttggtttgtgaggtcaatcggcaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 8067575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 77 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27187542 - 27187188
Alignment:
Q  77 tgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgt 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||    
T  27187542 tgtaacgcccgaggctgatgagggcggcaagtggtccggctcctagcaagcttctaggaaaaattgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgt 27187443  T
Q  177 acaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataa 276  Q
     || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27187442 gcatgtatgggactgcatggttaaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcactaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataa 27187343  T
Q  277 gaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggac-aaaacacgct 375  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27187342 gaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgct 27187243  T
Q  376 gaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  27187242 gaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaaacagtctggg 27187188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 138 - 440
Target Start/End: Original strand, 28561741 - 28562042
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28561741 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 28561840  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  28561841 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggat-ggtgacctacggggaa 28561939  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctac 437  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||| || |||| |||    
T  28561940 gtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggtaatcttgaaagcagtatgagatgttac 28562039  T
Q  438 act 440  Q
    |||    
T  28562040 act 28562042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 39653159 - 39653459
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  39653159 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatat 39653258  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39653259 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccatgagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 39653358  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctac 437  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  39653359 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagcagtctgggatgttac 39653458  T
Q  438 a 438  Q
    |    
T  39653459 a 39653459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 151 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11180172 - 11179890
Alignment:
Q  151 cggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11180172 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 11180073  T
Q  251 cttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaag 350  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||    
T  11180072 cttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggatgtttcccggtaag 11179973  T
Q  351 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  11179972 tgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatg 11179890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 25248021 - 25248407
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248021 tgtaacgcctccgcttgatgggttagtaacgcccgaggctaatgagggtggggagtggtcaggctcctggcatgcttataggcaaaactgaatcacatcg 25248120  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248121 gaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 25248220  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||| | | ||  ||||| |||||||| ||||||||||   |||||||    
T  25248221 tctttttggtagcccattccataataactccacggttcagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatggatgacctaccgggaagtttcacggtaagcg 25248320  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctg-aaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  25248321 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaaagactcgtgttgatttgtgaggttagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 25248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 16811380 - 16811674
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  16811380 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaac 16811479  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16811480 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 16811579  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||   ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16811580 cccgataagcatgcgagtgaggacaaa--acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16811674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13150246 - 13149955
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  13150246 gaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaac 13150147  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  13150146 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagttt 13150047  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    |   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  13150046 ctcggtaagtgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatg 13149955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32227368 - 32227072
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  32227368 gaatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaac 32227269  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32227268 aagatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 32227169  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32227168 cccggtaagtgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 32227072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 187 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13150656 - 13150405
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcata 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |    
T  13150656 gactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 13150557  T
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150556 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 13150457  T
Q  387 tgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  13150456 tgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 13150405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 142 - 440
Target Start/End: Original strand, 50347745 - 50348043
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||| | |  | ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  50347745 gaatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 50347844  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  50347845 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaagttt 50347944  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  50347945 cccgataagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacact 50348043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 56 - 343
Target Start/End: Original strand, 41472214 - 41472500
Alignment:
Q  56 aacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaa 155  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41472214 aacgcctctgattggtgggcatgtaacgcccaaggctgaagagggtggtgagtggtccggctcctggcatgcatctaggcaagactgaatcacatcggaa 41472313  T
Q  156 tgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttct 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41472314 tgagagggatcctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaa-gcttataagaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatcttct 41472412  T
Q  256 tttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcc 343  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  41472413 tttcggtagatcattccataagaactccacggttaaacgtgcttgacttgaaacaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcc 41472500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 178 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32386845 - 32386595
Alignment:
Q  178 caggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataag 277  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32386845 caggtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcagtagctaattccataag 32386746  T
Q  278 aacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctga 377  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  32386745 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacccaccggaaagtttcttggtaagcgtccgagtgaggacaaaacacgctaa 32386646  T
Q  378 aaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctg 428  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  32386645 aaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctg 32386595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 16810924 - 16811220
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||| ||    
T  16810924 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctac 16811023  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16811024 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacatttaagtgtgcttgacttgtagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 16811123  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  16811124 ccccgtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggggtcggtcggcaatcctgaaagcaatctgggatgttaca 16811220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 32227500 - 32227795
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  32227500 gaatcacgccggaatgagagggatc-tgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaac 32227598  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32227599 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 32227698  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||   |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32227699 cccgataagtgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 32227795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 138 - 396
Target Start/End: Original strand, 30529682 - 30529939
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30529682 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatat 30529781  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  30529782 caacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctact-ggaa 30529880  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30529881 gtttcccagtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttg 30529939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 14813948 - 14814244
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  14813948 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaat 14814047  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||    
T  14814048 aagatgcatcttcttttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgtgatgggtgacctaccgaaaggttt 14814147  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  14814148 cccggtaagcgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcggcaatactgaaagcagtctgggatgttaca 14814244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Original strand, 7477102 - 7477461
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  7477102 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 7477200  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7477201 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 7477300  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| ||||| ||   |||||||||| || | |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||   | |||||    
T  7477301 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttagagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 7477400  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7477401 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 7477461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Original strand, 7493792 - 7494151
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  7493792 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccggcttctggcg-gcttctaggcaaaacataatcacatcg 7493890  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7493891 gaatgagagagatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatgcatct 7493990  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| ||||| ||   |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||   | || | |||| |||||| || |||| |||||    |||||    
T  7493991 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagttgtcttagcatggctgaccttctaggaaatttcccgtaaagcg 7494090  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7494091 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 7494151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 14820153 - 14820449
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || |||||||| | |||||||  |||  ||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14820153 gaatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacggctaaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaac 14820252  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||    
T  14820253 aagatgcatcttattttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggaacaattttgggatgggtgacctatcggaaagttt 14820352  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14820353 cccggtaagcatgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 14820449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Original strand, 41473907 - 41474249
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41473907 tgtaacgcctccgcttgatgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctcggcaagactgaatcacatcg 41474006  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
     |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||  || |    
T  41474007 aaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactggatggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatcaacaagattgatat 41474106  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||  || | |||||  |||| |||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  | |||||||| ||||| ||    
T  41474107 tctttttggtggatcattctataaaaactccacagtcaagcgtgcttgacttggaacaattttgggatgggtgacataccagaaagtttcccagtaatcg 41474206  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    |||| ||||  |||||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  41474207 tgcgggtgaatacaaaacatgttgaaaagactcatgttagttt 41474249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 143 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20885263 - 20885000
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20885263 aatcacatcgcaatgagagggatcttgaggtcgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaaca 20885164  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20885163 agatgcatcttctttttagtagcacattccataagaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtatttggatgggtgacctaccgggaaatttc 20885064  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20885063 ccgttaagcgtgcaagttaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagt 20885000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 143 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25230394 - 25230124
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25230394 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25230295  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||   ||||||||     
T  25230294 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagtttt 25230195  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  25230194 ccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 25230124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 143 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25237981 - 25237711
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237981 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25237882  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||   ||||||||     
T  25237881 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagtttt 25237782  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  25237781 ccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 25237711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25230851 - 25230588
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25230851 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25230752  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  25230751 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttc 25230652  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  25230651 ccggtaagcgtgcgagtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagt 25230588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25238438 - 25238175
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25238438 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25238339  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  25238338 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttc 25238239  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  25238238 ccggtaagcgtgcgagtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagt 25238175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 443
Target Start/End: Original strand, 37045034 - 37045332
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37045034 gaatcacatctgaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaac 37045133  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||| |||||||||||||  ||| |  ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||   ||    
T  37045134 aaggtgcatcttctttttggtaccctattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccggga---tt 37045230  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactt 441  Q
    ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  | ||||  |||||||||| |||| ||    
T  37045231 cccgataagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacagtt 37045330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 195 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067243
Alignment:
Q  195 ggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcg 294  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcattacataagaactccacagttaagcg 4067355  T
Q  295 tgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtt 394  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| || |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4067354 tgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggaaagttttctggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagaccagtgttggtt 4067255  T
Q  395 tgtgggatcagt 406  Q
    ||| || |||||    
T  4067254 tgtagggtcagt 4067243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 25238786 - 25238576
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcata 286  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || |    
T  25238786 gactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccaca 25238687  T
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 386  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25238686 gttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggattggtgacctatcgggaagttttttggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 25238587  T
Q  387 tgttggtttgt 397  Q
    |||||||||||    
T  25238586 tgttggtttgt 25238576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 12820554 - 12820715
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12820554 tgtaacgctcccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctccttgcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 12820653  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatat 214  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12820654 gaatgagagggattctaaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaagaaaggctaatat 12820715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32388970 - 32388844
Alignment:
Q  50 ttgtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcaca 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32388970 ttgtgtaacgcctccgcttagtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcaca 32388871  T
Q  150 tcggaatgagagtgatcctgaggtcgt 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32388870 tcggaatgagagggatcctgaggtcgt 32388844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Original strand, 2911094 - 2911354
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  2911094 gaatcacacctgaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattacctatatcaac 2911193  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| || |           
T  2911194 aagatgcatattctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgaccttctcg------- 2911286  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  2911287 ----gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtaggatcaatcgacaat 2911354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Original strand, 39640936 - 39641125
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  39640936 gaatcacatcagaatgagagagatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgtttggtactacctatatcaat 39641035  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctac 331  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  39641036 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcagtctttggattggtgacctac 39641125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 182 - 339
Target Start/End: Original strand, 29224363 - 29224520
Alignment:
Q  182 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaact 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||    
T  29224363 tatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttcttttcggtagcccaaaccataagaact 29224462  T
Q  282 tcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagt 339  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  29224463 tcacaattaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgagaagt 29224520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25802658 - 25802431
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  25802658 aggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgatagcccattccataaga 25802559  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    | | || ||||||||||| ||||||||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||||     ||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25802558 aatccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtcttaggacgggtgaccttctaggaagtttctcgaaaagagtgcgagtaaggtcaaaacacgctgaa 25802459  T
Q  379 aagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |||||  |||||||||||| || |||||    
T  25802458 aagacgtgtgttggtttgtagggtcagt 25802431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25803151 - 25802910
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||| |||||||| |||| | |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||  |||    
T  25803151 gaatcatatcggaataagagggttcctaatgtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctataaaaac 25803052  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | | || |||||||||||||  || || ||||    
T  25803051 aagatgtatcttcttttcggtatcccatttcataagaactccgtagttaagcgtgcttgacttggactagtcttaggatgggtgaccttatgagatgttt 25802952  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagac 383  Q
     || | ||||||| || |||||| ||| || |||||||||||    
T  25802951 tctggaaagcgtgtgaatgaggaaaaatcatgctgaaaagac 25802910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25239224 - 25239070
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25239224 gaatcacaccggtatgagagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaac 25239125  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtg 296  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||    
T  25239124 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtg 25239070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 232 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 53150869 - 53150695
Alignment:
Q  232 ctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctac 331  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||      
T  53150869 ctatattaacaagatgcatatttttttcggtagccaatttcataagaacttcacagttaaccgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgacctta 53150770  T
Q  332 tgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    || ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  53150769 tgagaagtttcccaaaaagcgggcgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcatgttagtttgtggggtcagt 53150695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 406
Target Start/End: Original strand, 3899872 - 3900063
Alignment:
Q  215 gaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 314  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||   | | ||  ||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  3899872 gaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctttttttcgacaacacaaatcataagaactccacaataaagcatgcttgacttggagcaattt 3899971  T
Q  315 ttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    | | ||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  3899972 tggtatgggtgaccttctggaaagtttcccaaaaagcgtgtgagtatggacaaaacaaggtgaaaagactcgtgttgatctgtggggtcagt 3900063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 438
Target Start/End: Original strand, 41473743 - 41473836
Alignment:
Q  345 agtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  41473743 agtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgccaatcgtgaaagcagtatgagatgttaca 41473836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15392570 - 15392764
Alignment:
Q  203 gaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||  || |||||||||||  |||||||||||||||      ||| |||||| || ||||||  |||||||||    
T  15392570 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15392669  T
Q  303 ttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15392670 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgt 15392764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15405606 - 15405800
Alignment:
Q  203 gaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||  || |||||||||||  |||||||||||||||      ||| |||||| || ||||||  |||||||||    
T  15405606 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15405705  T
Q  303 ttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  15405706 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaagaacccgtgttggtttgt 15405800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32797082 - 32796943
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||  | |  |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32797082 gaatcacatcgaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 32796983  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaact 281  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  32796982 aagatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaact 32796943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15388203 - 15388397
Alignment:
Q  203 gaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||  || |||||||||||  |||||||||||||||      ||| |||||| || ||||||  |||||||||    
T  15388203 gaaggcttataagaattgtttcgtattaccagtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15388302  T
Q  303 ttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15388303 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgt 15388397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15417431 - 15417625
Alignment:
Q  203 gaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||  || |||||||||||  |||||||||||||||      ||| |||||| || ||||||  |||||||||    
T  15417431 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15417530  T
Q  303 ttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  15417531 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaagaacccgtattggtttgt 15417625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15411015 - 15411209
Alignment:
Q  203 gaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||  || |||||||||||  |||||||||||||||      ||| |||||| || ||||||  |||||||||    
T  15411015 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15411114  T
Q  303 ttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||    
T  15411115 ttggatcaattttgggatgggtgaccttttgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacaaagcacggtgaaagaacccgtgttggtttgt 15411209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 31104079 - 31103850
Alignment:
Q  170 aggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtag--ctc 267  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||  ||||  |||    
T  31104079 aggttgtacaggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcattttctttttggtagctctc 31103980  T
Q  268 atttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaa 367  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||   | ||  |||| |  || ||||||||| |  || || ||||||||| ||||    
T  31103979 attccataagaacttcacatttaagtgtctttgactttgagtaatttggagttgaatgactttatgagaagtttcccaaaaaacgcgcgagtgagaacaa 31103880  T
Q  368 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  31103879 aacatgctgaaacgactcgtgttgatttgt 31103850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 26310088 - 26309840
Alignment:
Q  190 tgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagtt 289  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||  | ||||    
T  26310088 tgcatggttgaaggacgatttataagaattttttgttactacatataccaaaaagatgcatcttctttatggtagctcattccattagaactcgacagtt 26309989  T
Q  290 aagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgt 389  Q
    ||  ||  |||||||  | ||||||| |||||||||| ||    ||| ||||||| |  ||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||| |||    
T  26309988 aaatgtatttgacttaaaacaattttgggatgggtgatctttcaggatgtttcctggatagcgtgcaagtgaagacaaaatacactcaaaagactcatgt 26309889  T
Q  390 tggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||| | |||| |||||  | ||||  |||||||||| ||||    
T  26309888 tggtttgtggggttagttaacaataattaaagtcgtctgggatgttaca 26309840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25239070 - 25239003
Alignment:
Q  346 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  25239070 gtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 25239003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 395
Target Start/End: Original strand, 15377344 - 15377536
Alignment:
Q  203 gaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||   || |||||||||||  ||||||||||||| |      ||| |||||| || ||||||  |||||||||    
T  15377344 gaaggcttataagaattgtttggtattactggtaccaacaagatgccacttcttttcagtacccaggaccattagaactccacagttaaatgtgcttgac 15377443  T
Q  303 ttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||    
T  15377444 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgttgaaagaacccgtgttggttt 15377536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15376056 - 15376250
Alignment:
Q  203 gaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||   || |||||||||||  ||||||||||||| |      ||| |||||| || ||||||  |||||||||    
T  15376056 gaaggcttataagaattgtttggtattacaggtaccaacaagatgccacttcttttcagtacccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15376155  T
Q  303 ttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  15376156 ttggatcaattttgggatgggtgaacttttgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgatgacaaagcacgctgaaagaacccgtgttggtttgt 15376250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 25231030 - 25230989
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25231030 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 25230989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47518432 - 47518296
Alignment:
Q  176 tacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcata 275  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||  |||| || || ||||||||||||   | |||| ||||||||||| ||||    
T  47518432 tacaggtatggaattgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttgaaactatctctaccaacaagatgca---tttttttagtagctcattccata 47518336  T
Q  276 agaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    | ||||| | | ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  47518335 ataactttacaattaagtgagcttgatttggagcaatttt 47518296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 397
Target Start/End: Original strand, 18318860 - 18318909
Alignment:
Q  348 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18318860 aagcgtgcgagtgagaacaaaacacgctgaaaagattcgggttggtttgt 18318909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 384
Target Start/End: Original strand, 32745994 - 32746093
Alignment:
Q  285 tagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagact 384  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||| || |  | || |||| | |||||| ||||||||||||    
T  32745994 tagttaagcgttcttgacttggatcaatttttggataagtgaccttttgggaagtctcctagaaaacacgtgaatgagaataaaacatgctgaaaagact 32746093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26436140 - 26436022
Alignment:
Q  273 ataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacac 372  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | | |||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| || |||||   ||||||  ||    
T  26436140 ataagaacttcatagttaagtgttcttgaattagagtagtatttggatgggtgaccttccaggaagtttcctaaaaagtgtacgagtagtgacaaagtac 26436041  T
Q  373 gctgaaaagactcgtgttg 391  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  26436040 gttgaaaagactcttgttg 26436022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43736777 - 43736715
Alignment:
Q  233 tatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgt 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  43736777 tatatcaacaatatgcatcttcttgttggtagctcatttcataagaatttcactgttaagcgt 43736715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Original strand, 26436241 - 26436305
Alignment:
Q  336 aagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    |||||| |||| || |||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26436241 aagttttctagaaaacgtgtgattgagaacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttttggg 26436305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 260
Target Start/End: Original strand, 3890050 - 3890095
Alignment:
Q  215 gaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttca 260  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3890050 gaattgtttgctactacatatatcaacaagatgcatctttttttca 3890095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13150343 - 13150302
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtg 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  13150343 tggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtg 13150302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45047156 - 45047071
Alignment:
Q  146 cacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactac 231  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| || |||| |  ||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  45047156 cacatcgaaatgatagtgatcctcagatcgtgcgagtatgagactgtatgattgaagaaaaacttataagaattatttggtactac 45047071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 340
Target Start/End: Original strand, 15410630 - 15410698
Alignment:
Q  272 cataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtt 340  Q
    |||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||  |||| ||||||||||    
T  15410630 cataagaactccacatttaagtgtgcttgacttggatcaattttgagatgggaaaccttctgggaagtt 15410698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25238916 - 25238872
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  25238916 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 25238872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 33466946 - 33466910
Alignment:
Q  75 catgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33466946 catgtaatgcccgaggctgatgagggcggggagtggt 33466910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 359 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36763877 - 36763837
Alignment:
Q  359 tgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgg 399  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36763877 tgaggaaaaaacacgctgataagactcatgttggtttgtgg 36763837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 53 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 35759844 - 35759458
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35759844 tgtaacgcctccacttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgacggcggggagtggtctggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 35759745  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35759744 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 35759645  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||    |||||||    
T  35759644 tcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaaacgtgcttgacttggagctattttgggattggtgacctaccgggaagtttttcggtaagcg 35759545  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  35759544 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttttggggtcagtcggcaatcatgaaagtagtctggggtgttacac 35759458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20054683 - 20054387
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20054683 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20054584  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20054583 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20054484  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20054483 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20054387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20055139 - 20054843
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20055139 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20055040  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20055039 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20054940  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20054939 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20054843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20055595 - 20055299
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20055595 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20055496  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20055495 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20055396  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20055395 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20055299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20056051 - 20055755
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20056051 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20055952  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20055951 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20055852  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20055851 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20055755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20056507 - 20056211
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20056507 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20056408  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20056407 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20056308  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20056307 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20056211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20057410 - 20057114
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20057410 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20057311  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20057310 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20057211  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20057210 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20057114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 76 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 46693950 - 46693585
Alignment:
Q  76 atgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaact-gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtc 174  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  46693950 atgtaacacccgaggctgatgagggctaggagtggtccgactcttgtcatgcttctaggcaaaagttgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtc 46693851  T
Q  175 gtacaggtatgggactgc-atggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttca 273  Q
    || || |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  46693850 gtgcatgtatgggactgtgatggttgaaggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatctcatttca 46693751  T
Q  274 taagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacg 373  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46693750 taataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcccggtatgcgtgcgagtgaggacaaaacacg 46693651  T
Q  374 ctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  46693650 ctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtttgggatgttacac 46693585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20054227 - 20053931
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20054227 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20054128  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20054127 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactaggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20054028  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20054027 tctggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20053931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20057870 - 20057570
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20057870 aactgaatcacaccgaaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 20057771  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20057770 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 20057671  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctac 437  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20057670 gtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttac 20057571  T
Q  438 a 438  Q
    |    
T  20057570 a 20057570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 38340905 - 38341201
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38340905 gaatcacaccggaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 38341004  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38341005 aagatgcatcttcatttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagttt 38341104  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38341105 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcggaaaagactcgtgttggtttatggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 38341201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50003222 - 50002926
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  50003222 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctatatcaac 50003123  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50003122 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccaaaagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagttt 50003023  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50003022 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 50002926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35761148 - 35760845
Alignment:
Q  55 taacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcgga 154  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35761148 taacgcctccgcttggtgggtatgtaacgtccgaggctgatgagggtggcgagtggtctggctcctggcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcgga 35761049  T
Q  155 atgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 254  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35761048 atgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 35760949  T
Q  255 ttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtg 354  Q
    ||||  |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||    
T  35760948 tttttggtagctcattccatgagaactccgtagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtaacctatcgggaagtttcccggtaagcgtg 35760849  T
Q  355 cgag 358  Q
    ||||    
T  35760848 cgag 35760845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 142 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20845808 - 20845510
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20845808 gaatcacaccggaatgagacggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaac 20845709  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20845708 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20845609  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  20845608 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctgagatgttacact 20845510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50002854 - 50002558
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  50002854 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50002755  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||     
T  50002754 aagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgggaagttc 50002655  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| ||||    
T  50002654 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagtcgtctaggatgttaca 50002558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 179 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20056926 - 20056667
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20056926 aggtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 20056827  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056826 actccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 20056727  T
Q  379 aagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20056726 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20056667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 142 - 443
Target Start/End: Original strand, 52250205 - 52250506
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||| | |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  52250205 gaatcacaccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 52250304  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  52250305 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagttt 52250404  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactt 441  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||    
T  52250405 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacattt 52250504  T
Q  442 tg 443  Q
    ||    
T  52250505 tg 52250506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16452080 - 16451784
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  16452080 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 16451981  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  16451980 aagatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttt 16451881  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16451880 tccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16451784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16461233 - 16460937
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  16461233 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 16461134  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  16461133 aagatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttt 16461034  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16461033 tccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16460937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20061413 - 20061188
Alignment:
Q  67 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20061413 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcaatcttctaggctaaactgaatcacatcagaatgagagggatc 20061314  T
Q  167 ctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagct 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20061313 ctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 20061214  T
Q  267 catttcataagaacttcatagttaag 292  Q
    |||| |||||||||| || |||||||    
T  20061213 cattccataagaactccacagttaag 20061188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 291
Target Start/End: Original strand, 2328225 - 2328463
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2328225 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggagagtggtctggctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacattg 2328324  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2328325 gaatgagagaaattatgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 2328424  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaa 291  Q
    ||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  2328425 tctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 2328463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 198 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20060431 - 20060199
Alignment:
Q  198 tgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgc 297  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||    
T  20060431 tgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgc 20060332  T
Q  298 ttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20060331 ttgacttggatcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgatggaaagactcgtgttggtttgt 20060232  T
Q  398 gggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  20060231 ggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggg 20060199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 51373010 - 51372732
Alignment:
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51373010 gaatgagagggatcccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcatct 51372911  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||    |||||||    
T  51372910 tattttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctatcaggaagtttttcggtaagcg 51372811  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggga 431  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||| |||||    
T  51372810 tgcgagtgaggacaaaatccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcttgaaagcagtatggga 51372732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 43057670 - 43057415
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43057670 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaac 43057571  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43057570 aagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtggtctttggatcggtgacctactgggaagttt 43057471  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||  |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43057470 cccggtaagcatgtgagtgagaacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttgt 43057415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 241 - 443
Target Start/End: Original strand, 52250641 - 52250843
Alignment:
Q  241 caagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtt 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52250641 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52250740  T
Q  341 tcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| |    
T  52250741 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacatt 52250840  T
Q  441 ttg 443  Q
    |||    
T  52250841 ttg 52250843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 241 - 443
Target Start/End: Original strand, 52250978 - 52251180
Alignment:
Q  241 caagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtt 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52250978 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52251077  T
Q  341 tcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| |    
T  52251078 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacatt 52251177  T
Q  441 ttg 443  Q
    |||    
T  52251178 ttg 52251180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 142 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 43057211 - 43056948
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43057211 gaatcacatcagaatgaggg-gatcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaac 43057113  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057112 aagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttagagtggtctttggatgggtgacctactgggaagttt 43057013  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||    
T  43057012 cccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacactgaaaaaacttgtgttggtttgtagggtcagt 43056948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 61 - 397
Target Start/End: Original strand, 23180649 - 23180984
Alignment:
Q  61 ctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgaga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  23180649 ctccgcttggtgggcatgtaacgctcgtggctgatgaaggcggggagtggtccgactcctagta-gcttataggaaaaattgaatcacattggaatgaga 23180747  T
Q  161 gtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttca 260  Q
    | |||| ||| | |||  ||| |||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  23180748 gggatcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaaggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaacaagatgtatcttctattcg 23180847  T
Q  261 gtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtg 360  Q
     |||| |||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||   |  ||  |||||||||    
T  23180848 ctagcccattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggttaccttctggaaagtttttcaaaaaatgtgcgagtg 23180947  T
Q  361 aggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  23180948 acgacaaaacatgctgaaaagactaatgttggtttgt 23180984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 50002432 - 50002246
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  50002432 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctttatcaac 50002333  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacc 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50002332 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttgagtgtgcttgacttggagcaattttgggattggtgacc 50002246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Original strand, 12883523 - 12883776
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12883523 gaatcacaccggaatgagatggatcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 12883622  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||| || ||||||| ||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12883623 aagatgcattttctttttggtagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgacttgaagtagtttttggatggatgacctactgggaagttt 12883722  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    || ||||||| ||    || |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  12883723 cccagtaagcatg-ttttgtggacaaaacatgctgaaaa-actcgtgttgatttgt 12883776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 328
Target Start/End: Original strand, 2634909 - 2635109
Alignment:
Q  127 cttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggt 226  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||||| ||||||    
T  2634909 cttctaggcaaatc-gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggt 2635007  T
Q  227 actacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtga 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  2635008 actacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattcaataagaactccacagttaagcgtgtttggcttggagtaatctttggatgagtga 2635107  T
Q  327 cc 328  Q
    ||    
T  2635108 cc 2635109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 178 - 439
Target Start/End: Original strand, 16907269 - 16907531
Alignment:
Q  178 caggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataag 277  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||  | |||    
T  16907269 caggtatgaaactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttcttttcagtggtccattctacaag 16907368  T
Q  278 aacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagt-gaggacaaaacacgctg 376  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||| |   |||| ||| |||  ||||||||| || |||    
T  16907369 aactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgagatgggtgaccttttgagaagtttcttgaaaagcatgcaagtaaaggacaaaatacactg 16907468  T
Q  377 aaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| | |||||||  ||||||| |||||    
T  16907469 gaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccaacaatccttaaagcagcatgggatgttacac 16907531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31822809 - 31822577
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31822809 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaaca 31822710  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtt-- 340  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||      
T  31822709 atatgcatcttcttttcggtagctcaatccaaaagaactccacagttaagcgtttttgacttggaacaattttgggatggacgacctactcggaagttat 31822610  T
Q  341 -tcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacac 372  Q
     |||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  31822609 ttccctgtagacgtgcgagtgaggacaaaacac 31822577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30873097 - 30872897
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30873097 gaatcacaccggaatgagagggattctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaac 30872998  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||  ||||||||| || | |||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  30872997 aagatgcatcttctttttggtagtccattctataagaactccacaattaagcatgcttgacttgcagtagtctttggatgggtgacctactgaaaagttt 30872898  T
Q  342 c 342  Q
    |    
T  30872897 c 30872897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 343
Target Start/End: Original strand, 7548085 - 7548291
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| |||| || ||||||| ||||||  |||| ||||||| || |||||    
T  7548085 aaactgaatcacattgcaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactata 7548184  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| | ||    
T  7548185 tcaacaagatgcatattctttttggtagcccatttgataagaactccacaattaagcgtacttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgaga 7548284  T
Q  337 agtttcc 343  Q
    |||||||    
T  7548285 agtttcc 7548291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 397
Target Start/End: Original strand, 2634449 - 2634720
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtg-atcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttg 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||  | ||||| || |||||| || |||||||||||  | ||||| ||||    
T  2634449 gcttctagg-aaaaccgaatcacatcgaaatgagaggggatcctgaggttgtgtatgtatgagattgcatgattaaaggaaggcttgcaagaattgtttg 2634547  T
Q  225 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggt 324  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||   |||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| |    
T  2634548 gtactagctatacaaacaagatgcatcttcttttcgatagtctattcaataagaacttcactgttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatggat 2634647  T
Q  325 gacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||| | ||||||||||| | |  |||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2634648 gacattctgggaagttttccaaaaagcatgcgaatgaggatgaagcacgctgaaaagactcttgtttgtttgt 2634720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 308
Target Start/End: Original strand, 12728027 - 12728157
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggt-actacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataag 277  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  12728027 aggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcacattccataag 12728126  T
Q  278 aacttcatagttaagcgtgcttgacttggag 308  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  12728127 aactccacagttaagcatgcttgacttggag 12728157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16410831 - 16410611
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaac 280  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  |||||  |||  | ||||||    
T  16410831 gtatgggaatgcattgttgaaggaaagcttataagaattatttactactaccaataccaacaagatgcatcttgtttttggtagcctattctagaagaac 16410732  T
Q  281 ttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    |||| |||||| | || |||||||||||||| ||| |||||  | || | ||| ||||||||| || |||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  16410731 ttcaaagttaaacatgtttgacttggagcaagtttgggatgtttaacattctgagaagtttccaagaaagcgtacgagtgatgataaaacatgttgaaaa 16410632  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggga 401  Q
     ||| ||||| ||||||||||    
T  16410631 aacttgtgttagtttgtggga 16410611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31823091 - 31822970
Alignment:
Q  317 ggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||      
T  31823091 ggatgggtgacctactgggaagtttctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcagcaatcca 31822992  T
Q  417 gaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  31822991 gaaagcattctgggatgttaca 31822970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 350 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35760003 - 35759915
Alignment:
Q  350 gcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35760003 gcgtgcgagcgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcatgaaagcagtctgggatgttaca 35759915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16440687 - 16440470
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaac 280  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||| |||    
T  16440687 gtatgggaatacatggttgaagaaagacttataagaactgtttgctactaccgataacaacaagatgcatattctttttggtagctcattctataataac 16440588  T
Q  281 ttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||| || |  | ||  |||  ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16440587 ttcaaagttaagtgtgattgactcgaagcaattttgggatgagtaaggttctaagaaacttcctagaaagcgtacgagtgaggattaaacacgctaaaaa 16440488  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtg 398  Q
     ||  |||||||||||||    
T  16440487 aacatgtgttggtttgtg 16440470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 307
Target Start/End: Original strand, 10820591 - 10820758
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||  ||  | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  10820591 gaatcacatcggagtgagagggattatgaggcggtgtatgtattggactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtactacctatatcaat 10820690  T
Q  242 aagatgcatc--ttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttgga 307  Q
    ||||| ||||  || |||||  |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10820691 aagatacatctttttttttcgatgactcatttcataagaaattcacagttaagcgtgcttgacttgga 10820758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7230007 - 7229794
Alignment:
Q  225 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggt 324  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||    
T  7230007 gtactaactatatcaacacgaagcatcttcatttcggtagttcattacataagaactccatagataagcatgtttgacttggagcaattttaggattggt 7229908  T
Q  325 gacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcag 424  Q
    |||||  |   ||||||      |||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||| | |||||  |||| |||    
T  7229907 gaccttatataaagtttttcgaaaagcgtgaaagtgaggataaaacatgctgaaaaaactcgtgttgctttgtggggtgagtcgtcaatcaagaaaacag 7229808  T
Q  425 tctgggatgctaca 438  Q
    ||| ||||| ||||    
T  7229807 tctaggatgttaca 7229794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 413
Target Start/End: Original strand, 7547791 - 7547907
Alignment:
Q  297 cttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||| || ||||||     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  7547791 cttgacttggagtagtgtttggatgggtgacctaccggaaagtttttcgataagcgtgcgagtaaggacaaaacacactgaaaagtctcgtgttgatttg 7547890  T
Q  397 tgggatcagttgacaat 413  Q
    | || ||||| ||||||    
T  7547891 tagggtcagtcgacaat 7547907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 49996613 - 49996531
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  49996613 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcttgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgagatgttaca 49996531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28181418 - 28181350
Alignment:
Q  364 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggat 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28181418 acaaaacactctgaaaagactcgtgttggtttgtggaggcagttgacaatcctgaaagcagtatgggat 28181350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 315
Target Start/End: Original strand, 2739545 - 2739694
Alignment:
Q  166 cctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagc 265  Q
    |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||| | | ||| |||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   |||     
T  2739545 cctggggttgtataggtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaatatgtatcttcttttttatagt 2739644  T
Q  266 tcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
      ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  2739645 ctattccataagaacttcatggttaagtgtgtttgactttgagcaatttt 2739694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31823158 - 31823097
Alignment:
Q  215 gaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  31823158 gaattatttggtactacctatatcaataaaatgcatcttctttttggtagctcattccataa 31823097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 39582553 - 39582604
Alignment:
Q  355 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39582553 cgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgttttggtttgtaggatcagt 39582604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7067933 - 7067867
Alignment:
Q  275 aagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7067933 aagaacttcatagttaagcgtgttttacttggagtagtatttggatgggtgaccttctgagaagttt 7067867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Original strand, 8278081 - 8278143
Alignment:
Q  267 catttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacct 329  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8278081 catttcataaagactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacct 8278143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 46411208 - 46411030
Alignment:
Q  215 gaattatttggtactacctatatcaacaagatgca-tcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    ||    
T  46411208 gaattatttggtactacctatatcaataagatgcattatttttttttgtag-tccattcataagaacttcatagttaagcatgattgatttggatatgtt 46411110  T
Q  314 tttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    || ||||| ||||||| || | ||||||   |  || |||    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  46411109 ttgggatgagtgaccttctagaaagtttttcaaaaaacgt----gtgaggacaaaacaaattgaaaagactcgtgttggtttgt 46411030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35010018 - 35009954
Alignment:
Q  267 catttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctac 331  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  35010018 cattccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctac 35009954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 843068 - 842907
Alignment:
Q  154 aatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    |||||||| |||| |||| ||||  ||||||| | ||||||| |||||||||| | | || ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||| ||    
T  843068 aatgagagggatcatgagatcgtgtaggtatgtgtctgcatgattgaaggaagtcgtgtaagaattgtttggtactatccattccaacaagatgcatgtt 842969  T
Q  254 cttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    |||||   ||| || |  ||||||||||  | |||| | |||||||||||| || |||||||    
T  842968 ctttttgatagatcgtcacataagaactcaacagttgaacgtgcttgactttgaacaatttt 842907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 90
Target Start/End: Original strand, 2328150 - 2328191
Alignment:
Q  49 tttgtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgagg 90  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2328150 tttgtgtaacgcctccgctttgtgggcatgtaatgcccgagg 2328191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 356 - 413
Target Start/End: Original strand, 35168718 - 35168775
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  35168718 gagtgaggacaaaatacgcgggaaagactcgtattgatttgtggggtcagttgacaat 35168775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 918365 - 918330
Alignment:
Q  452 tctaatgagatatcactacccaagatgtttgtaaag 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  918365 tctaatgagatctcactacccaagatgtttgtaaag 918330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20054325 - 20054281
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20054325 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20054281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20054781 - 20054737
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20054781 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20054737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20055237 - 20055193
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20055237 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20055193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20055693 - 20055649
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20055693 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20055649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20056149 - 20056105
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20056149 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20056105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20056605 - 20056561
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20056605 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20056561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20057052 - 20057008
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20057052 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20057008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20057508 - 20057464
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20057508 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20057464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 48 - 413
Target Start/End: Original strand, 12100597 - 12100960
Alignment:
Q  48 ttttgtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatca 147  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12100597 ttttctgtaacgcctccgctcggtgtgcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatca 12100696  T
Q  148 catcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatg 247  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12100697 catcgaaatgagaa-gatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggcaagcttataagatttgtttggtactacctatatcaataagatg 12100795  T
Q  248 catcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagt 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12100796 catcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaa-ttttggatgggtgacctaccgggaagtttcctcgt 12100894  T
Q  348 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12100895 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaat 12100960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 53 - 427
Target Start/End: Original strand, 25147446 - 25147819
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25147446 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 25147545  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25147546 gaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcatct 25147645  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  25147646 tcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaatcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcctgataagcg 25147745  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtct 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  25147746 tgcgagtgagtacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg-tcagtcggcaatcctgaaagcagtct 25147819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34308715 - 34308330
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34308715 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgataagggcggggagtggtccggctcctggcgtgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 34308616  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34308615 gaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 34308516  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  34308515 tcttttcggtagcctattccataagaactccacacttaagcgtgcttggcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagca 34308416  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34308415 tgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgctggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34308330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34309175 - 34308786
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34309175 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 34309076  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacct----atatcaacaagatgc 248  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    |||||||||||||||    
T  34309075 gaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatatatcaacaagatgc 34308976  T
Q  249 atcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagta 348  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  34308975 atcttcttttcggtagcctattccataagaactccacagttaagcgtgcttggcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggta 34308876  T
Q  349 agcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34308875 agcatgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34308786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 68 - 438
Target Start/End: Original strand, 25147892 - 25148261
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  25147892 tggtgggcatgtaacgctcgagtatgatgagggcggggagtggtttggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacataagaatgagagggatcc 25147991  T
Q  168 tgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctc 267  Q
     ||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25147992 cgaggtcgtgtaggtatgggactgtgtcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatatcaacaagatgcatattcttttcggtagctc 25148091  T
Q  268 atttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaa 367  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  25148092 attccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttccga-taaacgtgcgagtgaggtcaa 25148190  T
Q  368 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||    
T  25148191 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtatgagatgttaca 25148261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21316345 - 21315961
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  21316345 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggcttctggcaagcatctaggaaaaattgaatcacatcg 21316246  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
      ||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| || ||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21316245 cgatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcg 21316146  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  21316145 tcttttcagtagctcatttcataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtaattttggtaagggtgacctaccgcgaagtttcc-ggtaagcg 21316047  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  21316046 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 21315961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 143 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22548695 - 22548400
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22548695 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22548596  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22548595 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 22548496  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  22548495 ccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 22548400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22549142 - 22548846
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22549142 gaatcacaccggaatgagaggcttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 22549043  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22549042 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 22548943  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  22548942 cccagtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaacagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 22548846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 148 - 438
Target Start/End: Original strand, 17103086 - 17103377
Alignment:
Q  148 catcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatg 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17103086 catcggaatgagagagatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagctg 17103185  T
Q  248 catcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatggg-tgacctactgggaagtttcctag 346  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  |    
T  17103186 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggttgacctaccgggaagtttcccgg 17103285  T
Q  347 taagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||  |||||||||| ||||    
T  17103286 taagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 17103377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 25144682 - 25144957
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25144682 tgtaacacccccgcttggtaggcatgtaacgttcgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatca 25144781  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25144782 gaatgagagagatctcgaggtcgtgcaggtatgggattgcatgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatatcagcaagatgcatct 25144881  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacc 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25144882 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 25144957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 22026378 - 22026675
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22026378 gaatcacaccggaatgagagggttcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 22026477  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||    
T  22026478 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatattgggatgggtaacctatcgggaagttt 22026577  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22026578 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 22026675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27022485 - 27022190
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27022485 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 27022386  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27022385 aacatgcatcttattttcggcagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactggaaagttt 27022286  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27022285 -ttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 27022190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 41659252 - 41658988
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41659252 gaatcacaccggaatgagagggttcctgatgtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 41659153  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  41659152 aagatgcatcttcttttcgatagctcattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagttt 41659053  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41659052 ccctgtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagt 41658988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12827401 - 12827105
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  12827401 gaatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 12827302  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12827301 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 12827202  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||| ||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12827201 cccggtaagtgtgcgagtgaggttaaaacacttttaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 12827105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 27925898 - 27926193
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27925898 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaac 27925997  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  27925998 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa-tttgggatgggtgaggtaccgggaagttt 27926096  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  | ||||  |||||||||| ||||    
T  27926097 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 27926193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 146 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10844758 - 10844466
Alignment:
Q  146 cacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaaga 245  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10844758 cacaccggaatgagagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaaga 10844659  T
Q  246 tgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttccta 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||       
T  10844658 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcg 10844559  T
Q  346 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||| | ||||  |||||||||| ||||    
T  10844558 gtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 10844466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 138 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8080493 - 8080234
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8080493 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatat 8080394  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  8080393 caacaagatgcattttctttttggtagcccattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtaacctactaggaa 8080294  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8080293 gtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 8080234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 142 - 406
Target Start/End: Original strand, 2044057 - 2044321
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2044057 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaac 2044156  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2044157 aagatgcattttctttttggtagcccattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaatgggaagttt 2044256  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  2044257 tccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtattggtttgtagggtcagt 2044321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27819482 - 27819105
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||  || ||||||| | ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27819482 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaaggctcgaggttgatgagggtaggaagtggtccgactcctggaa-gcttttaggcaaaaccgaatcacatc 27819384  T
Q  152 ggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
     ||||||||| |||| ||| ||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27819383 agaatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaaggctaataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatc 27819284  T
Q  252 ttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagc 351  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||  |||||| | || ||||    
T  27819283 ttcttttcaatagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgactttgagtagtatttggatgggtgaccttctgataagttttccagaaagc 27819184  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggat 432  Q
    ||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  27819183 gtgtgagtgaggac-aagcacactgaaaagacccgtgtt-gattgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctaggat 27819105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Original strand, 32292396 - 32292651
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32292396 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactatctatatcaac 32292495  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||| |||||||||||||   |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32292496 aagttgcatcttctttttgctagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgatctaccgggaagttt 32292595  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292596 tccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 32292651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 139 - 433
Target Start/End: Original strand, 28453334 - 28453628
Alignment:
Q  139 actgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||| ||||| |||  ||||||||||||     
T  28453334 actgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatatt 28453433  T
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  28453434 aacaagatgcatcttctttatggtagcccattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctactcggaag 28453533  T
Q  339 tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  28453534 tttcctaataagactgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagagtcgtgtttgtttgtaagatcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatg 28453628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31283722 - 31283503
Alignment:
Q  218 ttatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttg 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  31283722 ttatttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtgcttgactttgagcaatttt-g 31283624  T
Q  318 gatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtg 417  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||    
T  31283623 gatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacgcgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgttg 31283524  T
Q  418 aaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||  |||||||||| ||||    
T  31283523 aaagtcgtctgggatgttaca 31283503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 138 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 33852409 - 33852150
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33852409 aactgaatcacaccagaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatat 33852310  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
     ||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  || ||    
T  33852309 taacaagatgtatcttctttttggtagcccattccataagaacttcacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcggaaa 33852210  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  33852209 gtttcatgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcatgttgatttgt 33852150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 413
Target Start/End: Original strand, 41913005 - 41913240
Alignment:
Q  178 caggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataag 277  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  41913005 caggtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttctttttggtagcccattccataag 41913104  T
Q  278 aacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctga 377  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41913105 aactccgcagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgagtgacctactagaaagtttcttggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgttga 41913204  T
Q  378 aaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    ||| ||||||||| |||| | || ||||| ||||||    
T  41913205 aaaaactcgtgttagtttatagggtcagtcgacaat 41913240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 303
Target Start/End: Original strand, 10844882 - 10845043
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10844882 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 10844981  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgact 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10844982 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 10845043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 392
Target Start/End: Original strand, 22705089 - 22705424
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||           
T  22705089 gtgtaacgcctccgctcggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgaggacggggagtggtcaggctcctggca-gcttcaaggcaaaaccgaa------- 22705180  T
Q  152 ggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  22705181 ggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggatgattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgca-- 22705278  T
Q  252 ttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt--------------tggatgggtgacctactgggaa 337  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||        | ||||||||||||||||||||||| | | ||              |||| ||||||||||| |||||    
T  22705279 -tctttttggtaacccattccata--------acagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttgaatgagtagctttggacgggtgacctaccgggaa 22705369  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 392  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22705370 gttttccagtaagcgtgccagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 22705424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6465057 - 6464872
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6465057 gaatcacattggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6464958  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgac 327  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  6464957 aagatgcattttctttttggtagctcattccataacaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgac 6464872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 438
Target Start/End: Original strand, 32292092 - 32292236
Alignment:
Q  294 gtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 393  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292092 gtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 32292191  T
Q  394 ttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32292192 ttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 32292236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28375189 - 28375042
Alignment:
Q  154 aatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28375189 aatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctacatcaacaagatgcatctt 28375090  T
Q  254 cttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttga 301  Q
    |||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28375089 cttttcggtagctctttccataacagcttcatagttaagcgtgcttga 28375042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 138 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30527630 - 30527358
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| | |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||  | | |||||| ||||| |||||||| || || ||    
T  30527630 aactgaatcacactggaatgagagggattccgaggccgtac--gtatgagactgcatgtttgaacca-gacttataagaattgtttggtaccacttacat 30527534  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    ||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||  || ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||  | ||    
T  30527533 caataagatacatcttcttttgggtagcccatttcataagaactccacagttaagattgtttgactttgagtaatctttggatgggtgatctacctgaaa 30527434  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
      ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30527433 acttcccggtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatcagtcgacaat 30527358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15819112 - 15818905
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaa 291  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  15819112 catggttgaaggaatgcttagaaaaattgtttggtactacatatatcaacatgatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaac-tcacagttaa 15819014  T
Q  292 gcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
       |||||||||||||| |   |||||||||| ||||| |||||||||||||    ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15819013 atttgcttgacttggagtaggctttggatgggcgaccttctgggaagtttcccgaaaagtgtgcgagtgaggacaaagcacactgaaaagacttgtgttg 15818914  T
Q  392 gtttgtggg 400  Q
    |||||||||    
T  15818913 gtttgtggg 15818905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 168 - 400
Target Start/End: Original strand, 3744663 - 3744895
Alignment:
Q  168 tgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctc 267  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||| |    
T  3744663 tgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgcaccttctttttggtagcac 3744762  T
Q  268 atttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaa 367  Q
    ||||||||||||||  | | |||||| |  || |||| |||||||||| |||| ||||||    || ||||||||  || ||| |||  | |||| ||||    
T  3744763 atttcataagaactctacaattaagctttattaactttgagcaattttgggattggtgactatttgagaagtttctcagaaagtgtgttaatgagaacaa 3744862  T
Q  368 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3744863 aacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggg 3744895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 406
Target Start/End: Original strand, 6466711 - 6466969
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||   || | ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  6466711 aatcatatcagaatgagagggattctgagactgtgcgggtatggaactgcatggttaaagga-gacttataaaaattgtttggtactacctataccaaca 6466809  T
Q  243 agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttc 342  Q
    |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| || | ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||     
T  6466810 agatgcatctt--tttca-tagc-catttcataagaactacaaatttaagtgtacttgacttggagcaattttggtatgggtgaccttcttggaagtttt 6466905  T
Q  343 ctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |||| |||| | |||||||  ||||| ||| || |||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  6466906 ctagaaagcatacgagtgaaaacaaagcacactaaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagt 6466969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 397
Target Start/End: Original strand, 3745104 - 3745355
Alignment:
Q  146 cacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaaga 245  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||||||| |||||| |    
T  3745104 cacatcgaaatgagagggatcctaaggtcgtgcaggctaaggactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaata 3745203  T
Q  246 tgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttccta 345  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||  |    
T  3745204 tgcatcttctttttggtagcccattccataataactccacagtcaagcgtgcttgacttagagcaattttgggatggctgaccatctgagaagtttctca 3745303  T
Q  346 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
      ||||||| || |||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  3745304 aaaagcgtgtgaatgataataaaacatgctgaaaagactcatgttgatttgt 3745355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22840680 - 22840488
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22840680 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatat 22840581  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctac 331  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| || || ||| | |||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||    
T  22840580 caacaagatgcatcttctttttgttagctcattccataagaactccacag-taatcatgcttgacttagattagtctttggatgggtgacctac 22840488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30335055 - 30334786
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||   || |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  30335055 gaatcacatcggaattagatggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaac 30334956  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| |  | | ||||||| |||||| |  || |||||||    
T  30334955 aagatacatcttcttttcgatagctcaattcataataacttcatagttaaatgtgtttgacttgaaatattatttggataggtgacattatgagaagttt 30334856  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    || |  || |||  ||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  30334855 cccataaaacgt--gagtgaaaacaaaacacgttaaaaagactcatgttgatttgtgggatcaatcgacaat 30334786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 1297042 - 1297242
Alignment:
Q  178 caggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataag 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||| | ||||  |||||    
T  1297042 caggtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatttatattcttttcggtatcccattatataag 1297141  T
Q  278 aacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctga 377  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||  |||||| | || ||| |||| | |||||||||| |||| |||    
T  1297142 aactccatagttaagtgtgtttgacttgaagtaatctttggatgagtgaccttctgaaaagttttcaagaaagtgtgcaaatgaggacaaagcacgttga 1297241  T
Q  378 a 378  Q
    |    
T  1297242 a 1297242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 433
Target Start/End: Original strand, 6466255 - 6466546
Alignment:
Q  141 tgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaa 240  Q
    ||||||||||| |||||||||  || |||||   || || |||||||||| |||| || || | |  || ||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  6466255 tgaatcacatcagaatgagaggaattctgagagagtgcatgtatgggactacatgtttaaaagtatactaatatgaattgtttggtactacttataccaa 6466354  T
Q  241 caagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtt 340  Q
    |||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||| |||||||||  |||  ||| |||  |||||||||    
T  6466355 caagttgcatcttccttttggtag-tcatttcataagaaatccattgttaggtgtgcttgacttgaagcaattttgagataagtggccttttgggaagtt 6466453  T
Q  341 tcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    ||  |  |||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||  ||||||  ||||||||||    
T  6466454 tctcaaaaagcatacgagtgaggacaaagcacgctaaaaagacttgtgttggtttgtggggccagtcggcaatactgaaagtcgtctgggatg 6466546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27022015 - 27021904
Alignment:
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27022015 gaatgagagggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatct 27021916  T
Q  253 tcttttcagtag 264  Q
    ||||||| ||||    
T  27021915 tcttttcggtag 27021904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 199
Target Start/End: Original strand, 9250913 - 9251057
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||     
T  9250913 tgtaacacctccgcttggtggatatgtaacgttcgaggctgatgaaggcgaggagtggtctgcctcctagca-acttttaggcaaaaccgaatcacatca 9251011  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttg 199  Q
    ||||||||| |||||||| | | || |||||||||||||||||||||    
T  9251012 gaatgagagggatcctgaag-cctagaggtatgggactgcatggttg 9251057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15567708 - 15567516
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||  || ||||  |||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  15567708 aaactgaatcacatcggaatgagagagatcttgacatcgcgcaagtattagacatcatggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatata 15567609  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacct 329  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||| | |||| | |||| ||||||    
T  15567608 ccaacaagatacatcttctttttggtagttcatttcataagaactccgcagttaatcgtgtttgacttggagtagttttggaatggatgacct 15567516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 390
Target Start/End: Original strand, 10729722 - 10729870
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||| ||  | |||| |||||||||| || | ||||||||| | ||||||||| | | ||| ||||||||||||  |||||| | |    
T  10729722 aagatgcatcttgttttctgttacccattccataagaactccacaattaagcgtgatagacttggagtagtcttttgatgggtgaccttatgggaaatat 10729821  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtt 390  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10729822 cctagaaagcgtgcgagtgtggacaaagcacgctgaaaagactcgtgtt 10729870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 406
Target Start/End: Original strand, 25307855 - 25308027
Alignment:
Q  232 ctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctac 331  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||   ||||| ||||   |||||||| || |||||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||| |||    
T  25307855 ctatatcaacaagatacatcttttttg--gtagcccattctgtaagaactccacagttaagcttgcttgacttggtgtagtctttggatgggtgacgtac 25307952  T
Q  332 tgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    | | ||||||    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25307953 ttgaaagtttttcggcaagcgtgcgagtgaggacaaagtacgctgaaaagactcgtgttgatttatgggatcagt 25308027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31283432 - 31283356
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgctt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  31283432 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcctagcatgctt 31283356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15568139 - 15567898
Alignment:
Q  155 atgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 254  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||| | ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  15568139 atgagagagatcctgagaccgtacaaatatgtgacttcttggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcatcttt 15568040  T
Q  255 ttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtg 354  Q
    |||    |   |  ||| ||||||||| || | |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||  | || |||||||||   | ||  |||    
T  15568039 ttt----ttttttttttaataagaactccacaattaagcgtacttgactcagagcaattttgggatgggtgaatttctaggaagtttctcggaaaatgtg 15567944  T
Q  355 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || ||||||    
T  15567943 agagtgaggacaaaacacgttaaaaagacccgtgttagtatgtggg 15567898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Original strand, 17429501 - 17429611
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17429501 aatcacatcggaatgagag-gatcttgagaccgtgcatatatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaaca 17429599  T
Q  243 agatgcatcttc 254  Q
    ||||| ||||||    
T  17429600 agatgtatcttc 17429611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6463487 - 6463438
Alignment:
Q  346 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6463487 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 6463438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 440
Target Start/End: Original strand, 9251098 - 9251182
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  9251098 gagtgaggacaaaacacgctgaaaaaacttgtgttggtttgtggggtcaatcgacaatcctgaaagcagtctatgatgttacact 9251182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10729736 - 10729603
Alignment:
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||| ||| || | ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||  ||| |||    
T  10729736 aacaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaggactccacaattaagggtgcttggcttgaagcaattttgggatgactgaccttatggaaag 10729637  T
Q  339 tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacac 372  Q
    |||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  10729636 tttcatgaaaagcgtgcgagtgaagacaaaacac 10729603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28374116 - 28374008
Alignment:
Q  295 tgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtt 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||    
T  28374116 tgcttgacttggagcaatttt-ggatgagcgaccttctgagtagttttctagaaagtgtgtgagtgaggataaaacacgctgaaaaaacttgtattgatt 28374018  T
Q  395 tgtgggatca 404  Q
    |||| |||||    
T  28374017 tgtgagatca 28374008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29971448 - 29971323
Alignment:
Q  266 tcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggac 365  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||  | | |||| |||||||||||||||  || ||||  | ||| | ||| |||||||||    
T  29971448 tcattccataaaaacttcacagttaaacgtgtttgacttggaatagtctttgtatgggtgacctactg--aaatttctcaataaacatgcaagtgaggac 29971351  T
Q  366 aaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 393  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29971350 aaaacatgctgaaaaaactcgtgttggt 29971323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29971552 - 29971450
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||| ||||  ||  |||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  29971552 aactgaatcacatcagaattggaaggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatactatctatat 29971453  T
Q  238 caa 240  Q
    |||    
T  29971452 caa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 351 - 413
Target Start/End: Original strand, 34688044 - 34688106
Alignment:
Q  351 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  34688044 cgtgcgaatgaggacaaaacacgttgaaaagactcatgttggtttgtaggaccagtggacaat 34688106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 338
Target Start/End: Original strand, 44041986 - 44042075
Alignment:
Q  249 atcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag 338  Q
    ||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | | |||| ||| |||||||  |||||||    
T  44041986 atcttcttttcagtaacacattccacaagaacttcattgttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttgaatgagtgaccttttgggaag 44042075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 397
Target Start/End: Original strand, 29117444 - 29117490
Alignment:
Q  351 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29117444 cgtgcgagtgaggacaaatcatcctgaaaagactcgtgttggtttgt 29117490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22840477 - 22840441
Alignment:
Q  361 aggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22840477 aggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgt 22840441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12119273 - 12119226
Alignment:
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  12119273 tgcgagtgaggacaaagcacattgaaaatactcgtgttggtttgtggg 12119226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 25307759 - 25307829
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagg 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| |  ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25307759 aaactgaatcacactggaatgagagcgattccaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagg 25307829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36968496 - 36968434
Alignment:
Q  188 actgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36968496 actgtatggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagatgcat 36968434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Original strand, 3508790 - 3508827
Alignment:
Q  200 aaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3508790 aaggaaggtttataagaattatttggtactacctatat 3508827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 10844784 - 10844828
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  10844784 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 10844828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 313
Target Start/End: Original strand, 34687920 - 34688000
Alignment:
Q  233 tatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatt 313  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||| | |||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  34687920 tataccaaaaagatgcatcttctttttggtaggttattccataagaattccatagttaaatgtgtctgacttggagcaatt 34688000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 53 - 441
Target Start/End: Original strand, 13492699 - 13493088
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13492699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatcg 13492798  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||  ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492799 gaatgagaaggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 13492898  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||    
T  13492899 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttacccggtaagcg 13492998  T
Q  353 tgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactt 441  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||   ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  13492999 tgcgagtgaggacaaaaacatgctgaaaagactcgtgttgatttgtagggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctggggtgttacactt 13493088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Original strand, 7912235 - 7912600
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcc 167  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7912235 tggtgggcatgtaacgcccgacgcagatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatct 7912334  T
Q  168 tgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctc 267  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7912335 cgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctc 7912434  T
Q  268 atttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaa 367  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  7912435 attccataagaactccatagttaaacgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgctgggaagtttcccgttaagcgtacgagtgaggacaa 7912534  T
Q  368 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  7912535 aacacgctgaaaagactcatgttggtttgtggggttagtcggcaatcctgaaagcaatctgggatg 7912600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 52 - 431
Target Start/End: Original strand, 9351972 - 9352350
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  9351972 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaacataatcacatc 9352070  T
Q  152 ggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||  ||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9352071 gaaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaacaagatgcatc 9352170  T
Q  252 ttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagc 351  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||||    
T  9352171 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacctggaagtttctcggtaagc 9352270  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggga 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  9352271 gtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggga 9352350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13191749 - 13191372
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  13191749 tgtaatgcctccgcttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggcgagtagtccggctcttggtatgcttcgaggaaaaactaaatcacatcg 13191650  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||| ||    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191649 gaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 13191550  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||   ||||||    
T  13191549 tcttttcggtagctcgttccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgaccaaccgggaagtttcccgataagcg 13191450  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  13191449 tgcgagtgaggacaaaatacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctggg 13191372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 7911812 - 7912173
Alignment:
Q  77 tgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgt 176  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||    
T  7911812 tgtaacacccgaggctgatgagagcggggagtggtccgactcctggcatgtttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgt 7911911  T
Q  177 acaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataa 276  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7911912 gcaggtataggactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 7912011  T
Q  277 gaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 376  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7912012 gaactccacagttatgcttgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagattctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctg 7912111  T
Q  377 aaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7912112 aaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 7912173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 135 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17027685 - 17027382
Alignment:
Q  135 caaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactaccta 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17027685 caaaactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 17027586  T
Q  235 tatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgg 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17027585 tatcaacaagattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgg 17027486  T
Q  335 gaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgc 434  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||     
T  17027485 gaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgt 17027386  T
Q  435 taca 438  Q
    ||||    
T  17027385 taca 17027382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 65 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17731337 - 17730958
Alignment:
Q  65 gcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtga 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  17731337 gcttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcggaatgagaggga 17731238  T
Q  165 tcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca----agatgcatcttcttttca 260  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  17731237 tcctgaggccgttcaggtatgggactgcatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatagatgcatcttcttttcg 17731138  T
Q  261 gtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtg 360  Q
    ||||||||||   |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||    |||||||||| ||||    
T  17731137 gtagctcattctttaagaactccacatttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagataggtgacctaccggaaagtttatcggtaagcgtgcaagtg 17731038  T
Q  361 aggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||    
T  17731037 aggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatcctgagagtcgtctaggatgttacact 17730958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 142 - 430
Target Start/End: Original strand, 20850320 - 20850608
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20850320 gaatcacaccggaatgagagggttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaac 20850419  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20850420 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20850519  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  20850520 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatggg 20850608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 53 - 343
Target Start/End: Original strand, 16519879 - 16520168
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16519879 tgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaacagaatcacatcg 16519977  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16519978 gaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 16520077  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcc 343  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  16520078 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgacctgccgggaagtttcc 16520168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 23776436 - 23776735
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  23776436 aactgaatcacgccggaatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgtctggtactacctatat 23776535  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23776536 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcaca-ttaagcgtacttgacttggagcaattttgggatggatgacctactgggaa 23776634  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctac 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  23776635 gtttcctagtaaacgtgcgagtgacgacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttac 23776734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20896835 - 20896536
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20896835 gaatcacatcggaatgagagggatccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20896736  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  20896735 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttggcttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaattt 20896636  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgagga-caaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacact 440  Q
    ||  ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20896635 cccggtaagtgtgcgagtgaggagaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaatcttgaaagcagtctgggatgttacact 20896536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23986464 - 23986168
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23986464 gaatcacatcggaatgagagggatccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaac 23986365  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23986364 aagatgcatcttcttttcggtagctcaaaccataagaacttcacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttt 23986265  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |   | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  23986264 cacggaaagcgtgcgagtgaggagaagacacgctgaaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtatgggatgttaca 23986168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2681363 - 2681071
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2681363 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaac 2681264  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||    |||||||||||||    
T  2681263 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacaattaagcgtgcttaatttggaacaattttgggatgggt----tactgggaagttt 2681168  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  2681167 cctagtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgttgagaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagctgtctgggatgttaca 2681071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 204 - 427
Target Start/End: Original strand, 13492393 - 13492617
Alignment:
Q  204 aaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgact 303  Q
    |||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13492393 aaggcttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 13492492  T
Q  304 tggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgagg-acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggat 402  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13492493 tggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcgtgcgagtgaggaaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggt 13492592  T
Q  403 cagttgacaatcgtgaaagcagtct 427  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||    
T  13492593 cagtcggcaatcttgaaagcagtct 13492617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2890985 - 2890715
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||     
T  2890985 gaatcacattagaatgagag-gatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaaa 2890887  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |  | |  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  2890886 aagatgcttcttcttttcagtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaaatagtactaggatgggtgacctactgagaagttt 2890787  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2890786 cccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 2890715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 126 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9440472 - 9440185
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttgg 225  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  9440472 gcttctagggaagaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattgttcgg 9440373  T
Q  226 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtg 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9440372 tactacttatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctcactccataagaacttcacagttaagtgtgcttgatttggagcaatttttggatgggtg 9440273  T
Q  326 acctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    ||||  |||||||||||  |  || |||| || ||| ||||||| |  || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9440272 accttatgggaagtttctaaaaaaacgtgtgaatgatgacaaaatatactaaaaaaactcgtgttgatttgtgggatcagtcgacaat 9440185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 140 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20126331 - 20126074
Alignment:
Q  140 ctgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatca 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||    
T  20126331 ctgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatca 20126232  T
Q  240 acaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagt 339  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||| |||||||   |||||    
T  20126231 acaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttgaatgggcgacctacctagaagt 20126132  T
Q  340 ttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20126131 ttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgt 20126074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9441037 - 9440708
Alignment:
Q  106 agtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaa 205  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   || |||||| |  |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  9441037 agtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaactgaatcacatcaaaatagaagggatcctaa--tcgtgcaggcatggaactacatggttgaaggaa 9440941  T
Q  206 ggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttg 305  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||     
T  9440940 tgcttataagaattctttggtactacttttatcaacaagatgcattttcttttcagtagcccaaaccataagaacttcacagttaagtgtgtttgacttt 9440841  T
Q  306 gagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcag 405  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    ||  |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9440840 gagcaattttgggatgggtgaccttcttggaagtttcccgaaaaatgtgcaagtgatgacaaaatacgctgaaaaaactcgtgctggtttgtggggtcag 9440741  T
Q  406 ttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9440740 tcggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 9440708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 439
Target Start/End: Original strand, 21311966 - 21312267
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | || |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21311966 aactgaatcacaccagaatgagagggttcatgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatat 21312065  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||| |||||    
T  21312066 caacaagatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaaatccatagttaaacgtgcttgacttggagcagtcttatgatgagtgacctaccgggaa 21312165  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctac 437  Q
    ||||||  ||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||  | ||||  |||||||||| |||    
T  21312166 gtttcccggtaagtgtgtaagtgaagacaaaacacattgaaaagactggtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttac 21312265  T
Q  438 ac 439  Q
    ||    
T  21312266 ac 21312267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Original strand, 17850917 - 17851172
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||  | ||||||||||||| |||||||    
T  17850917 gaatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgtttggtactacctttatcaac 17851016  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  17851017 aagatgcatcttctttctggtagcccattctataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgggagacctactgggaagttt 17851116  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  17851117 cctagtacgcgtgcgagttaggacaaaacaagtcgaaaagactcgtgttggtttgt 17851172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 151 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2720702 - 2720456
Alignment:
Q  151 cggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  2720702 cggaatgagagggatcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagacacat 2720603  T
Q  251 cttcttttcag-tagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaa 349  Q
    ||| ||||  | ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||   |||    
T  2720602 ctttttttttggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacatattgggaagtttcccgataa 2720503  T
Q  350 gcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2720502 gcgtgcgagtgagaacaaaacacgctgagaagactcgtgtcggtttg 2720456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 21311514 - 21311810
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| || |||    
T  21311514 gaatcacatcggaatgagagggttcatgaggccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaac 21311613  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| | | ||  |||||||||||||| |||| ||||    
T  21311614 aagatccatcttctttttggaagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgactttgagtagtcttatgatgggtgacctaccgggatgttt 21311713  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
     |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| | ||||||  | ||||  |||||||||| ||||    
T  21311714 tccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgtaaggactcgtgttggtttgtagggtcaatcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 21311810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 242 - 439
Target Start/End: Original strand, 28780209 - 28780406
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28780209 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 28780308  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
     || ||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  28780309 tctggtaagtgtgcgagtgaggataaaacattttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacac 28780406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6331059 - 6330811
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6331059 gaatcacatcggaatgagatggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6330960  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | | ||  ||| ||||||||||  | ||  ||    
T  6330959 aatatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagtattcttatgattggtgacctac-cgaaaaatt 6330861  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6330860 ctcagtaagcgtgcaagtgatgacaaaacacgcgagaaagactcgtgttg 6330811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 14771866 - 14771611
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| || | |||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14771866 gaatcacgccggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 14771767  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||| ||| |||||||  |||    ||| |||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||| | | |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14771766 aagatccatattctttttggtaatctattccataagaactccacagttaagtgtgctagacgtggagtagtctttggatgagtgacctactcggaagttt 14771667  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
     | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14771666 accagtaaacgtacgagcgaggacaaaacacgctgataagactcatgttggtttgt 14771611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Original strand, 17851373 - 17851628
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||    
T  17851373 gaatcacaccggaatgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagatatgtttggtactacctttatcaac 17851472  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  17851473 aagatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgggtgatctattgggaggttt 17851572  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
     |  || |||||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  17851573 tcccgttagcgtgcgagcgagggcaaaacacggtaaaaagaatcgtattggtttgt 17851628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 380
Target Start/End: Original strand, 11062285 - 11062522
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  11062285 gaatcacatcgacatgagag-gatcctgaggctgtgtaggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactacctatatcaac 11062383  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  || ||||||    
T  11062384 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcggaaagttt 11062483  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    ||   ||| |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  11062484 cccgataaacccgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 11062522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 281
Target Start/End: Original strand, 27334156 - 27334299
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27334156 aactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 27334255  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaact 281  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27334256 caacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaact 27334299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 281
Target Start/End: Original strand, 27394896 - 27395039
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27394896 aactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 27394995  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaact 281  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27394996 caacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaact 27395039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 425
Target Start/End: Original strand, 20735731 - 20735977
Alignment:
Q  179 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||| |    
T  20735731 aggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagtccattctataaaa 20735830  T
Q  279 acttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    ||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |   ||||||||||| |||| |  ||||||||||  | |||| ||| | ||||||||||||||||| ||    
T  20735831 actccatagttaagtgtggttggcttggagtagcctttggatgggtaaccttcaaggaagtttccaggaaagcatgcaattgaggacaaaacacgctaaa 20735930  T
Q  379 aagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagt 425  Q
    |||||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20735931 aagacttgcgtcggtttgtggggtcagttgacaatcctgaaagcagt 20735977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 329
Target Start/End: Original strand, 15929620 - 15929768
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaac 280  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15929620 gtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaacaaaatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 15929719  T
Q  281 ttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacct 329  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||||    
T  15929720 tccacagttaagcgtgtttaacatgaagcaattttgggatgggtgacct 15929768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 406
Target Start/End: Original strand, 1991588 - 1991816
Alignment:
Q  178 caggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataag 277  Q
    |||||||| |||| |||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1991588 caggtatgagactacatggttggaagaaggcttacaagaattgtttggtattacatatctaaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataag 1991687  T
Q  278 aacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctga 377  Q
    ||||||| |||||| | |  |||| |||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||| |    |||| || |||||| ||||||  |||||||    
T  1991688 aacttcacagttaaacattattgatttggagtagtttttggatgggtgaccttctgaaaagttttccgaaaagcatgtgagtgaagacaaagtacgctga 1991787  T
Q  378 aaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1991788 aaaaactcgtgttgatttgtgggatcagt 1991816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33775151 - 33774918
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  |||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||    
T  33775151 gaatcacactggaatgagagtgatcgcgaggccgtgcaagtatgtgaccgcatggttgaaggaaggattataagaattgtctggtgctacctatatcaac 33775052  T
Q  242 a--agatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagt 339  Q
    |  ||||||||||||||||   |||  |||| |||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  33775051 aagagatgcatcttctttttgatagtccattccataagaactccacagttaagtgtgtttgacttgcagtagtctttggatgggtgacctactgagaagt 33774952  T
Q  340 ttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacg 373  Q
    ||    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33774951 ttttcggtaagcgtgcgagtgaggaaaaaacacg 33774918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 291
Target Start/End: Original strand, 3652485 - 3652634
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  3652485 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaac 3652584  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaa 291  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  3652585 aagatgcatcttctttttggtagttcattccataagaactccacagttaa 3652634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Original strand, 32292858 - 32293055
Alignment:
Q  115 gctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatat 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  | |||||| ||||||||||  ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  32292858 gctcctggcat-cttctaggcaaaccaaattcacattggaatgagagaaatccttagatcgtgcaggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataa 32292956  T
Q  215 gaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  32292957 gaattgtttggtactacctataccaacaaaatacatcttgtttttagtaacacatt--ataagaactccatagttaagcgaacttgactttgagcaattt 32293054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 201
Target Start/End: Original strand, 13490055 - 13490179
Alignment:
Q  77 tgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||  ||    
T  13490055 tgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtccggctcctgacatgcttctaggaaaaacttaatcacatcgaaatgagagagatcatgaggctgt 13490154  T
Q  177 acaggtatgggactgcatggttgaa 201  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  13490155 gcaggtataggactgcatggttgaa 13490179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Original strand, 20732612 - 20732834
Alignment:
Q  177 acaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataa 276  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||| ||||| ||||  ||||    
T  20732612 acaggtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattcttttcggtagcccattcaataa 20732711  T
Q  277 gaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 376  Q
     ||||  |  |||||| ||||||||||||||| | | |||   |||||||| |  || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  20732712 aaactctacggttaagagtgcttgacttggagtagtcttttattgggtgacattgtgagaagtttcctagaaagcttgcgagtgaggaaaaaacacactg 20732811  T
Q  377 aaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    |||||  | |||||||||||||||    
T  20732812 aaaag-tttgtgttggtttgtggg 20732834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9440614 - 9440485
Alignment:
Q  102 ggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9440614 ggggagtggtccggctctttgca-gcttctagggaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatggttgaa 9440516  T
Q  202 ggaaggcttatatgaattatttggtactacc 232  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9440515 tgaaggcttataagaattgtttggtactacc 9440485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31821844 - 31821704
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31821844 aaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattatttggtactaactata 31821745  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataag 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  31821744 tcaacaagatgcatcttttttttggtagctcattccataag 31821704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 286 - 413
Target Start/End: Original strand, 3652666 - 3652793
Alignment:
Q  286 agttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactc 385  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3652666 agttaagcttgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagcttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaaaagctgaaaagactc 3652765  T
Q  386 gtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3652766 ttgttggtttgtagggtcagttgacaat 3652793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 395
Target Start/End: Original strand, 12194324 - 12194580
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||||  | || ||||| |||| |||||    
T  12194324 aaaccgaatcacattggaatgagaggaatcctgagaccgtgcagatatga-actgcatgattgaagaaagacttataa-atttttttggcactatctata 12194421  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||  | | |    
T  12194422 tcaacaagatgcatcttcttttttataattcattccataagaactccacagttaagcatgtttgacatggagcaattttaggatggatgaccttttagaa 12194521  T
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||||| | || || |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12194522 agttttccagaaaacgtgtgagtttggacaaaacacactgaaaagactcatgttggttt 12194580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 428
Target Start/End: Original strand, 28582957 - 28583249
Alignment:
Q  136 aaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctat 235  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||||||   | ||||| ||||||| | | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||    
T  28582957 aaaaccgaatcacatcggaatagaagtgatctaaaagtcgtgcaggtatag-attgtatggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctat 28583055  T
Q  236 atcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttgg-agcaatttttggatgggtgacctactgg 334  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||| | || || |||| || |||||| ||| |  | | |||| ||| || || | ||||    
T  28583056 atcaacaagatgcatcatctttccggtagttcattccataagaaatccacagctaagtgtccttgacatggaattagtctttgtatgagttactttctgg 28583155  T
Q  335 gaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctg 428  Q
     |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||    
T  28583156 aaagtttcccagaaagcgtgtgagtggggacaaaacatactgaaaagactcatgttagtttgtggggtcagtcggcaatctcgaaagcagtctg 28583249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2891340 - 2891177
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| |||| ||||| |||| || ||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||  || ||||    
T  2891340 aagatgcatctttgttttggtagcccattccataaaaactccacagttaaatgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctactacgatgttt 2891241  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2891240 ccg-gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagt 2891177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 3885194 - 3884984
Alignment:
Q  182 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaact 281  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||| ||    |||||| ||| ||||||||||    
T  3885194 tatgagactgcatagttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacatatactaacaaaatacatctttttg---gtagcttattccataagaact 3885098  T
Q  282 tcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaag 381  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  | | ||||| || || |||| || |||||||||||||||||| || ||||    
T  3885097 tcaaagttgaacgtgcttgacttggagcaattttgagataggtgacat-ttcgaaagttcccaag-aagcatgtgagtgaggacaaaacacgatgtaaag 3885000  T
Q  382 actcgtgttggtttgt 397  Q
    ||| ||||||||||||    
T  3884999 acttgtgttggtttgt 3884984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28065982 - 28065745
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||  ||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  28065982 tcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgtagaaatgagactgtatgattgaatgaaagcttataagaattgtttggtactatctctatcaacaag 28065883  T
Q  245 atgcatcttcttttca---gtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||| ||||     |||||| ||| |||||||||| || | |||||| || ||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||   | |||||||    
T  28065882 atgcatctttttttttttggtagcttattccataagaactccacaattaagcatgtttgactttgagcagttttgtgatgggtaacctttcgagaagttt 28065783  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    || |  ||||||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  28065782 ccgaa-aagcgtgtgaatgatgacaaaacacgctaaaaa 28065745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 397
Target Start/End: Original strand, 3653048 - 3653152
Alignment:
Q  289 taagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtg 388  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  | |||||||||   |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3653048 taagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcgagaagtttcccgataagcgtgc----gaggacaaaacacgctgaaaagactcgta 3653143  T
Q  389 ttggtttgt 397  Q
    |||||||||    
T  3653144 ttggtttgt 3653152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 30729958 - 30729735
Alignment:
Q  170 aggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcat 269  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| | || |||  |||| ||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||  |||| |||     
T  30729958 aggtcgtgcaagtatgagacagcatggttgaaggaggactcataaaaattgtttggtactacgtatataaacatgattgatcttcttttgggtag-tcaa 30729860  T
Q  270 ttc-ataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaa 368  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||| || |   | |||| ||| |||    
T  30729859 ttctataagaactttatagttaagcgttcttgaatttgagcaattttgggat--gtgaccttttgggaagtttcctagaaaacagacaagtgcggataaa 30729762  T
Q  369 acacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||| | | |||||||| ||||||||||    
T  30729761 acaagataaaaagacttgtgttggttt 30729735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 402
Target Start/End: Original strand, 17205384 - 17205597
Alignment:
Q  188 actgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatag 287  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||  ||||| |||| |||||||||| ||| |    
T  17205384 actgcatgattgaatgaagaattataagaattgtttggtactacctttaccaacaagattcatcttgtttt-ggtagcccattccataagaactccattg 17205482  T
Q  288 ttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgt 387  Q
    |||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||    | ||||||    | || | |||||||||| ||||||||| | |||||||||||     
T  17205483 ttaaacatgcttgatttggagtaattttgggatgggagacctttatgaaagtttttcggaaaacatgcgagtgagaacaaaacacaccgaaaagactcgc 17205582  T
Q  388 gttggtttgtgggat 402  Q
    |||| |||| |||||    
T  17205583 gttgatttgcgggat 17205597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 414
Target Start/End: Original strand, 27334305 - 27334364
Alignment:
Q  355 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  27334305 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatc 27334364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 414
Target Start/End: Original strand, 27395045 - 27395104
Alignment:
Q  355 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  27395045 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatc 27395104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 3652981 - 3653049
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3652981 tcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttata 3653049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 397
Target Start/End: Original strand, 11062032 - 11062083
Alignment:
Q  346 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11062032 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaaaactcgtgttggtttgt 11062083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31416026 - 31415972
Alignment:
Q  351 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31416026 cgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaaga-tcgtgttggtttgtgggatcagt 31415972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 438
Target Start/End: Original strand, 15929344 - 15929434
Alignment:
Q  348 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | | ||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  15929344 aagcgtgtgagtgaggacaaaatacgctaaaaagacttgtgttgatttgtggggtcactcggcaatccttaaagcagtctgggatgttaca 15929434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34660576 - 34660468
Alignment:
Q  221 tttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggat 320  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |||||||||| ||   ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||    
T  34660576 tttggtattatctatatcgacaatatgcatcttccttctggtagctcaaatcatacgaactccatagttaagcatacttgacttgaagcaagttttagat 34660477  T
Q  321 gggtgacct 329  Q
    |||||||||    
T  34660476 gggtgacct 34660468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6331294 - 6331219
Alignment:
Q  363 gacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  6331294 gacaaaacatgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctgagatgttaca 6331219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 439
Target Start/End: Original strand, 21312453 - 21312534
Alignment:
Q  357 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| || ||||  |||||||||| |||||    
T  21312453 agtgaagacaaaaca-gctgaaaagactggtgttggtttgtagggtcagtcgacaatggttaaagtcgtctgggatgttacac 21312534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 33470882 - 33470998
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcata 286  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||  || ||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||| | || |    
T  33470882 gacttcatggttaaaggaagacttattaga-ttacttggtattacctatactaacaagatgcatattcttttttgtagttcattacataagaattccaca 33470980  T
Q  287 gttaagcgtgcttgactt 304  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  33470981 gttatgcgtgtttgactt 33470998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 11062187 - 11062231
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  11062187 tggtgggcatgtaacgcccaaggcttacgaaggcggggagtggtc 11062231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21246980 - 21246925
Alignment:
Q  451 ttctaatgagatatcactacccaagatgtttgtaaagtatttctcaacccaagaat 506  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21246980 ttctaatgagatatcactattcaaagtgtttgtgaagtgtttctcaacccaagaat 21246925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 397
Target Start/End: Original strand, 1663999 - 1664061
Alignment:
Q  335 gaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| || |||||||||||    
T  1663999 gaagtttcttagaaagcgtgcgagtgagaacaaaatatgctaaaaagattcatgttggtttgt 1664061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 413
Target Start/End: Original strand, 26380920 - 26380982
Alignment:
Q  351 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  26380920 cgtgtgagttaggacaaaacacactaaaaagactcgagttggtttatgtggtcagttgacaat 26380982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2446 - 2061
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2446 tgtaatgcctccgcttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccagcttctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2347  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2346 gaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2247  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||    
T  2246 tcttttcggtagcttattccataagaactcaatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcg 2147  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||  |||||||||| ||||    
T  2146 tgcgagtgaggacaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctgggatgttaca 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2554
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcgggg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2607 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgggg 2554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 53 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 162914 - 162533
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  162914 tgtaacgcctcctcttggtggacatgtaatgcccgaggctgatgagggtggggagtggtctggctcctgacatgcttctaggcaaaactgaattacatcg 162815  T
Q  153 gaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  162814 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 162715  T
Q  253 tcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||||    ||||||    
T  162714 tcttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttggagcaactttgggatgagtgacctacctggaagtttcgcgataagcg 162615  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctg-aaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||    
T  162614 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatg 162533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 239 - 441
Target Start/End: Original strand, 163167 - 163369
Alignment:
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  163167 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaag 163266  T
Q  339 tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  163267 tttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtctgtcgacaatcctgaaagtcgtctgggatgttaca 163366  T
Q  439 ctt 441  Q
    |||    
T  163367 ctt 163369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 163181 - 162985
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  163181 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctatcgggaagttt 163082  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  163081 ctcggtaagcgttcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggccagtcggcaatcctgaaaacagtctgggatgttaca 162985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 84 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 70019 - 69666
Alignment:
Q  84 cccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggta 183  Q
    ||||||||||  || || || |||||||||| || |||| | ||||||||| ||| | || |||||||  |||||||| |||||| ||    | ||||||    
T  70019 cccgaggctggcgagggtggagagtggtctgacttctggaa-gcttctaggtaaagccgattcacatcataatgagagggatcctaagactatgcaggta 69921  T
Q  184 tgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttc 283  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  69920 tgagactgcatcgttgaaggaatgcttataataattgtttggtactacctatatcaacatgatgcatctttttttcattagctcattccataagaactcc 69821  T
Q  284 atagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagac 383  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||| | |||||||||    | ||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||    
T  69820 acagttatgcgggcttgactaggagtagtctttggatgggtgaccttcagggaagtttatgggaaagcgtgtgagtgatgacaaaccacgctaaaaagac 69721  T
Q  384 tcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  69720 tcgtgttggtttgttggttcagtcggcaatcctgaaagcagtttgggatgttaca 69666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 135 - 438
Target Start/End: Original strand, 18958 - 19261
Alignment:
Q  135 caaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactaccta 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18958 caaaactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 19057  T
Q  235 tatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgg 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19058 tatcaacaagattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgg 19157  T
Q  335 gaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgc 434  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||     
T  19158 gaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgt 19257  T
Q  435 taca 438  Q
    ||||    
T  19258 taca 19261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18339 - 18203
Alignment:
Q  71 tgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctga 170  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18339 tgggcatgtaacgctcgaggcggatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaacactgaatcacatcggaatgagagggatccaga 18240  T
Q  171 ggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagg 207  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239 ggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagg 18203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Original strand, 1219 - 1516
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1219 gaatcacaccggaatgagacggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaac 1318  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1319 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 1418  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1419 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggcgtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttacac 1516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 142 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2198 - 1926
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| | |||||| || | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2198 gaatcacaccagaatgaaagggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 2099  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2098 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 1999  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatc 414  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1998 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatc 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 2741 - 3037
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2741 gaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 2840  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2841 aagatgcatattcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggagacctaccgggaagttt 2940  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  2941 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagcagtctcggatgttaca 3037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 433
Target Start/End: Original strand, 154756 - 155047
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  154756 gaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaac 154855  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  154856 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagttt 154955  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    |   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  154956 ctcggtaagtgtgctagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatg 155047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 346 - 438
Target Start/End: Original strand, 154505 - 154597
Alignment:
Q  346 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  154505 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 154597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Original strand, 154659 - 154700
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtg 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  154659 tggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtg 154700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 168; Significance: 9e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Original strand, 4560 - 4830
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4560 gaatcacatcggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtttggtactacctatatcaac 4659  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4660 aagatgcatcttcttttcggtagctcattttataagaactccacagttaagtgtgcttaacttggagcaa-tttgggatgggtgacctaccgggaagttt 4758  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  4759 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 4830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 5015 - 5315
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatga-----attatttggtactacctata 236  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||     ||| ||||||||||||||||    
T  5015 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaattgtttggtactacctata 5114  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactggga 336  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||    
T  5115 ttaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaa-tttgggatgggtgacctacctgga 5213  T
Q  337 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgcta 436  Q
    | |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  | ||||  |||||||||| ||    
T  5214 aatttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgtta 5313  T
Q  437 ca 438  Q
    ||    
T  5314 ca 5315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 397
Target Start/End: Original strand, 5325 - 5377
Alignment:
Q  346 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaa-cacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5325 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 76 - 430
Target Start/End: Original strand, 245019 - 245369
Alignment:
Q  76 atgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcg 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  245019 atgtaacgcccaaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctagaaaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcca 245118  T
Q  176 tacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcata 275  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |   ||||    
T  245119 tgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccata 245217  T
Q  276 agaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgct 375  Q
    |||||| || |   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  245218 agaactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttctcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggt 245314  T
Q  376 gaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctggg 430  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  245315 gaaaagactcgtgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatggg 245369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 302
Target Start/End: Original strand, 245448 - 245674
Alignment:
Q  76 atgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcg 175  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||  ||    
T  245448 atgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccg 245547  T
Q  176 tacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcata 275  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||    
T  245548 tgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccata 245647  T
Q  276 agaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  245648 agaactccacagttaagcgtgcttgac 245674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 272 - 426
Target Start/End: Original strand, 245677 - 245831
Alignment:
Q  272 cataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaaca 371  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  |||||||||||   | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  245677 cataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaaca 245776  T
Q  372 cgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtc 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||    
T  245777 cgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgggaatcctgaaagcagtc 245831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 142511 - 142305
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  142511 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaggacggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatc 142412  T
Q  152 ggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142411 ggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 142312  T
Q  252 ttctttt 258  Q
    |||||||    
T  142311 ttctttt 142305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 229 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13593 - 13382
Alignment:
Q  229 tacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13593 tacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacc 13494  T
Q  329 tactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctg 428  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  13493 taccgggaagtttctttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtccg 13394  T
Q  429 ggatgctacact 440  Q
    ||||| ||||||    
T  13393 ggatgttacact 13382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17745 - 17493
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17745 gaatgacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 17646  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    | |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17645 aggatgtatcttctttttggtagctcaattcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtactctttggatgggtgacctactcgaaagttt 17546  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtt 394  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17545 ttcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtt 17493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18285 - 18027
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18285 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatat 18186  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaa 337  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||    
T  18185 caacaagatgcatctt-tttttggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctattggaaa 18087  T
Q  338 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18086 gtttttcggtaaacgtgcgagtgaggacacaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgt 18027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 242 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 14749 - 14552
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14749 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 14650  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  14649 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacac 14552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 286 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1704 - 1549
Alignment:
Q  286 agttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1704 agttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgtgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactc 1605  T
Q  386 gtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactt 441  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1604 gtgttggtttgtggggtcagtcgataatcctgaaagcagtctgggatgttacactt 1549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 441
Target Start/End: Original strand, 2154 - 2394
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||| || ||||||    
T  2154 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccttaagaactccacagttaa 2253  T
Q  292 gcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcct-agtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtt 390  Q
    || |||||||| ||||| | | ||  ||||||||||||||          |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2254 gcatgcttgacatggagtagtcttatgatgggtgacctac----------cctcggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctgaaaagactcgtgtt 2343  T
Q  391 ggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacactt 441  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||  |||||||    
T  2344 ggtttgtaggatcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggattttacactt 2394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Original strand, 749 - 797
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggact 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||    
T  749 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggact 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 439
Target Start/End: Original strand, 421 - 606
Alignment:
Q  254 cttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgt 353  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |    
T  421 cttttcggtagctcattccataaaatctccatagttaagcgtgcttgacatggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcat 520  T
Q  354 gcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctacac 439  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||| ||||| ||||| |||||    
T  521 gtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagtagtctcggatgttacac 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 400
Target Start/End: Original strand, 14740 - 14998
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| |  |||| || |||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||     
T  14740 gaatcacatcggaacaagagggatcctaatatcgtgcatgtataggactgcagtgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaat 14839  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagttt 341  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||  |||||||||||| |||||||| || |||||||||||   | |||||||||||||||   ||||||||||    
T  14840 aagatgcatcgtcttttcggtaattcattgaataagaacttcacagttaagcatgtttgacttggagtggtctttggatgggtgaccatatgggaagttt 14939  T
Q  342 cctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
     |    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  14940 tccgaaaaacgtgcgagtgatgacaaaacacgctaaaaagacacgagtatgtttgtggg 14998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4130 - 3993
Alignment:
Q  141 tgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaa 240  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4130 tgaatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaa 4031  T
Q  241 caagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataaga 278  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  4030 caagatgcatcttctttttggtagcccattttataaga 3993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Original strand, 23672 - 23785
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || |||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23672 gaatcacaccgaaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 23771  T
Q  242 aagatgcatcttct 255  Q
    ||||||||||||||    
T  23772 aagatgcatcttct 23785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 404
Target Start/End: Original strand, 26074 - 26329
Alignment:
Q  147 acatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagat 246  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| || |||| |||||||| |  | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  26074 acatcagaaagagagggatcctaaggccgtgcaggtgtgagacttcatggttgcataatggcttatacaaattttttggtactacatatatcaacatgat 26173  T
Q  247 gcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctag 346  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| |||| ||  | | |||||||        
T  26174 gcatcttctttttggtagctcattttataagaactcc--agttaagtgtgcttgacttggagtatttttaggatgagtgagcttatagaaagtttctcga 26271  T
Q  347 taagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatca 404  Q
     |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26272 aaagcttgcgagggagaacataacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatca 26329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 16163 - 16307
Alignment:
Q  261 gtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtg 360  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||  |   |||||| |  | |||| ||| ||||    
T  16163 gtagcccattttataaaaacttcatagttaaacgtgcttgacttgaaacagttttaggatgagtgaccttatataaagttttccggaaagcttgcaagtg 16262  T
Q  361 aggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagt 406  Q
    | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16263 atgacaaaacatgctg-aaaggctcgtgttggtttgtagggtcagt 16307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 44807 - 44613
Alignment:
Q  203 gaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||  || |||||||||||  |||||||||||||||      ||| |||||| || ||||||  |||||||||    
T  44807 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 44708  T
Q  303 ttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  44707 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaagaacccgtattggtttgt 44613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Original strand, 45387 - 45497
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||  |||| |||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45387 aatcacatcggaatgagag-gatcttgagaccgtgcatatatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaaca 45485  T
Q  243 agatgcatcttc 254  Q
    ||||| ||||||    
T  45486 agatgtatcttc 45497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 413
Target Start/End: Original strand, 7071 - 7211
Alignment:
Q  272 cataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaaca 371  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||    |||| || ||||| |||| |||||    
T  7071 cataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttggtatgggtgaccttttggaaagtttcccgaaaagcatgtgagtggggac-aaaca 7169  T
Q  372 cgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaat 413  Q
     | ||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||    
T  7170 aggtgaaaagactcgtgttggcctgtggggtcaatcgacaat 7211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 37263 - 37205
Alignment:
Q  339 tttcctagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37263 tttcctagtaaacgtgcgagtgagggaaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgt 37205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 63030 - 62968
Alignment:
Q  366 aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctg 428  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  63030 aaaacacgctgaaaagactcgtattggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagtagtctg 62968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 67286 - 67214
Alignment:
Q  366 aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatgctaca 438  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  67286 aaaagacgctaaaaacacttgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcctgaaagcagtctgtgatgttaca 67214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 433
Target Start/End: Original strand, 1 - 65
Alignment:
Q  369 acacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagttgacaatcgtgaaagcagtctgggatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| | |||||||| |||||||    
T  1 acacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtaggcaatcctaaaagcagtttgggatg 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold1138
Description:

Target: scaffold1138; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 843 - 734
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagtgatcctgaggtcgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattatttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | | || ||||| ||||||| || |  |||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||| || |||||||    
T  843 aatcacatcagaatgagagggtgcataagatcgtataggtatgagattatatggttgaaggaggacttatatggattaatcggtactacatacatcaaca 744  T
Q  243 agatgcatct 252  Q
    ||||||||||    
T  743 agatgcatct 734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 309 - 271
Alignment:
Q  226 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtag 264  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  309 tactacatatatcaacaagatgcttcttcttttcagtag 271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 246795 - 246711
Alignment:
Q  259 cagtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcc 343  Q
    ||||||| || | ||||||||||  ||| |||| ||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  246795 cagtagcccaatccataagaactctataattaatcgtgcttaatttggagtagtctttggatgggtgacctactggtaagtttcc 246711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University