View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1272_high_27 (Length: 419)

Name: NF1272_high_27
Description: NF1272
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1272_high_27
NF1272_high_27
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (27-407)||(12692485-12692866)
chr5 (34-407)||(12686383-12686757)
chr5 (26-407)||(32094425-32094808)
chr5 (25-407)||(32097226-32097609)
chr5 (26-407)||(28525590-28525971)
chr5 (18-407)||(7389751-7390141)
chr5 (27-407)||(28531686-28532066)
chr5 (26-407)||(41296853-41297238)
chr5 (63-391)||(19059991-19060322)
chr5 (27-391)||(20499712-20500078)
chr5 (51-391)||(30771882-30772221)
chr5 (27-407)||(30384589-30384969)
chr5 (27-391)||(19066332-19066693)
chr5 (189-407)||(14609909-14610124)
chr5 (28-370)||(33753476-33753815)
chr5 (26-207)||(14609706-14609888)
chr5 (26-385)||(26509431-26509781)
chr5 (28-370)||(33849110-33849446)
chr5 (89-379)||(26318492-26318765)
chr5 (35-141)||(25408435-25408539)
chr5 (82-249)||(8706749-8706916)
chr5 (85-171)||(22647928-22648014)
chr5 (86-247)||(33021223-33021383)
chr5 (90-209)||(11640662-11640780)
chr5 (358-391)||(8706639-8706672)
chr5 (85-141)||(38548009-38548065)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (26-407)||(11839929-11840312)
chr3 (26-408)||(10238415-10238799)
chr3 (26-407)||(42191424-42191807)
chr3 (27-407)||(42197366-42197748)
chr3 (27-408)||(10244537-10244920)
chr3 (27-407)||(17055997-17056377)
chr3 (27-389)||(26429639-26430003)
chr3 (27-407)||(10769173-10769554)
chr3 (26-407)||(10760854-10761236)
chr3 (26-407)||(38449267-38449649)
chr3 (27-407)||(38455754-38456135)
chr3 (26-407)||(49151186-49151567)
chr3 (26-407)||(49157253-49157634)
chr3 (24-407)||(55003616-55003990)
chr3 (27-405)||(8331362-8331740)
chr3 (27-407)||(30051306-30051685)
chr3 (40-391)||(28964468-28964811)
chr3 (26-266)||(17601879-17602120)
chr3 (27-249)||(23138779-23139001)
chr3 (27-248)||(11846340-11846562)
chr3 (198-391)||(48128260-48128451)
chr3 (67-388)||(46656306-46656610)
chr3 (27-378)||(2982458-2982812)
chr3 (64-413)||(12108868-12109214)
chr3 (219-391)||(53069279-53069443)
chr3 (235-391)||(13444840-13444997)
chr3 (312-407)||(13837534-13837629)
chr3 (26-210)||(24643890-24644077)
chr3 (70-225)||(53071638-53071793)
chr3 (26-134)||(9586490-9586598)
chr3 (215-335)||(13367114-13367233)
chr3 (27-151)||(8474595-8474721)
chr3 (215-335)||(9760481-9760600)
chr3 (335-407)||(11846267-11846340)
chr3 (61-209)||(34300047-34300197)
chr3 (310-391)||(34300348-34300429)
chr3 (349-391)||(24643773-24643815)
chr3 (262-327)||(24643817-24643879)
chr3 (65-163)||(52063295-52063392)
chr3 (123-165)||(17000868-17000910)
chr3 (89-147)||(52222937-52222995)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (34-407)||(28421163-28421537)
chr7 (26-407)||(351361-351742)
chr7 (26-407)||(3811373-3811756)
chr7 (27-407)||(3817515-3817895)
chr7 (27-407)||(5979378-5979762)
chr7 (24-407)||(338953-339335)
chr7 (26-384)||(35148236-35148595)
chr7 (27-391)||(5849106-5849469)
chr7 (33-391)||(22742149-22742508)
chr7 (26-352)||(26383241-26383569)
chr7 (27-391)||(43539567-43539919)
chr7 (26-291)||(35152849-35153114)
chr7 (264-407)||(20238762-20238906)
chr7 (236-406)||(15843730-15843901)
chr7 (236-406)||(15860839-15861010)
chr7 (95-391)||(26380751-26381023)
chr7 (287-391)||(35150761-35150865)
chr7 (62-267)||(8824421-8824614)
chr7 (128-381)||(18656883-18657132)
chr7 (176-311)||(42767505-42767636)
chr7 (64-390)||(7608060-7608381)
chr7 (93-209)||(18666883-18667006)
chr7 (88-185)||(30219503-30219598)
chr7 (316-392)||(3677889-3677965)
chr7 (27-92)||(18667724-18667790)
chr7 (184-286)||(24690652-24690749)
chr7 (346-391)||(12803893-12803938)
chr7 (358-391)||(24690848-24690881)
chr7 (75-105)||(42767656-42767686)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (26-407)||(25381739-25382122)
chr1 (27-407)||(1077818-1078200)
chr1 (27-407)||(50305771-50306145)
chr1 (27-407)||(25387708-25388088)
chr1 (27-407)||(31051119-31051500)
chr1 (25-407)||(34739559-34739941)
chr1 (26-405)||(31057618-31057998)
chr1 (27-391)||(8093066-8093431)
chr1 (51-391)||(44409599-44409940)
chr1 (26-391)||(24926981-24927355)
chr1 (34-237)||(25275421-25275625)
chr1 (27-391)||(38152184-38152541)
chr1 (27-380)||(24963940-24964289)
chr1 (27-380)||(27954735-27955088)
chr1 (26-372)||(33458149-33458493)
chr1 (26-261)||(12183962-12184183)
chr1 (83-152)||(4280189-4280258)
chr1 (140-267)||(23253826-23253956)
chr1 (333-380)||(12183820-12183867)
chr1 (92-185)||(27396209-27396301)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (27-407)||(4580525-4580907)
chr6 (27-407)||(25343201-25343580)
chr6 (45-407)||(25353806-25354167)
chr6 (26-407)||(8651007-8651389)
chr6 (26-408)||(21191069-21191456)
chr6 (26-391)||(21770787-21771150)
chr6 (26-391)||(21197250-21197627)
chr6 (26-384)||(21783545-21783911)
chr6 (27-372)||(30905821-30906166)
chr6 (27-407)||(31756422-31756796)
chr6 (176-384)||(21789768-21789982)
chr6 (27-261)||(12801890-12802124)
chr6 (26-152)||(17581177-17581304)
chr6 (198-391)||(17581384-17581572)
chr6 (29-206)||(6096887-6097067)
chr6 (215-388)||(28728047-28728218)
chr6 (64-345)||(1105925-1106206)
chr6 (45-254)||(13007308-13007516)
chr6 (289-392)||(20745394-20745497)
chr6 (96-378)||(17900378-17900656)
chr6 (226-261)||(12801646-12801681)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (25-407)||(13455671-13456055)
chr2 (26-407)||(13461613-13461996)
chr2 (27-407)||(36749988-36750370)
chr2 (26-397)||(35084893-35085266)
chr2 (27-397)||(35090866-35091238)
chr2 (26-407)||(28683149-28683530)
chr2 (27-407)||(44717009-44717390)
chr2 (27-407)||(31001951-31002332)
chr2 (26-407)||(30964901-30965283)
chr2 (27-407)||(13149888-13150274)
chr2 (30-391)||(23343140-23343493)
chr2 (87-407)||(31007989-31008310)
chr2 (29-389)||(19879170-19879536)
chr2 (26-311)||(35439671-35439956)
chr2 (176-386)||(11048776-11048988)
chr2 (42-257)||(35442187-35442402)
chr2 (31-164)||(23283821-23283955)
chr2 (302-391)||(35438925-35439014)
chr2 (76-277)||(7771521-7771722)
chr2 (118-379)||(28765248-28765508)
chr2 (124-391)||(29832877-29833142)
chr2 (176-391)||(31651357-31651564)
chr2 (27-92)||(11049012-11049078)
chr2 (328-390)||(29034697-29034759)
chr2 (157-260)||(16361738-16361841)
chr2 (187-279)||(23284680-23284772)
chr2 (176-267)||(1388363-1388454)
chr2 (128-186)||(8342614-8342671)
chr2 (65-148)||(38731147-38731231)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (34-407)||(11976-12351)
scaffold0208 (27-407)||(6096-6478)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (26-407)||(32896585-32896968)
chr8 (26-407)||(32890461-32890844)
chr8 (27-407)||(36818546-36818927)
chr8 (27-407)||(42993207-42993585)
chr8 (26-407)||(5542364-5542747)
chr8 (27-407)||(9934857-9935234)
chr8 (27-407)||(10699604-10699985)
chr8 (26-407)||(22219931-22220312)
chr8 (27-391)||(42033372-42033740)
chr8 (26-407)||(10705412-10705793)
chr8 (26-407)||(14417535-14417896)
chr8 (27-391)||(39735768-39736122)
chr8 (26-269)||(1883185-1883424)
chr8 (26-253)||(39727643-39727870)
chr8 (45-260)||(17954099-17954316)
chr8 (282-391)||(1883039-1883148)
chr8 (283-391)||(39727528-39727637)
chr8 (110-168)||(30890535-30890593)
chr8 (85-193)||(45365390-45365497)
chr8 (307-391)||(1171215-1171285)
chr8 (70-139)||(33630872-33630941)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (27-407)||(24287561-24287942)
chr4 (22-407)||(10739543-10739926)
chr4 (22-407)||(10953312-10953695)
chr4 (26-407)||(48166752-48167134)
chr4 (26-407)||(10733556-10733935)
chr4 (26-407)||(10947325-10947704)
chr4 (27-407)||(48160534-48160915)
chr4 (27-407)||(6257409-6257789)
chr4 (26-391)||(26957023-26957389)
chr4 (27-342)||(26971824-26972139)
chr4 (26-390)||(50168168-50168532)
chr4 (26-391)||(49976175-49976524)
chr4 (71-403)||(44831827-44832155)
chr4 (216-407)||(33461596-33461787)
chr4 (26-389)||(17627002-17627361)
chr4 (216-407)||(33458471-33458662)
chr4 (75-407)||(35177413-35177754)
chr4 (78-381)||(19686551-19686854)
chr4 (176-390)||(50155687-50155897)
chr4 (263-407)||(4632192-4632337)
chr4 (27-129)||(33461797-33461899)
chr4 (27-129)||(33458672-33458774)
chr4 (90-260)||(28704170-28704340)
chr4 (84-151)||(50426879-50426946)
chr4 (64-206)||(4631987-4632128)
chr4 (27-96)||(532100-532170)
chr4 (276-392)||(32284504-32284620)
chr4 (350-407)||(10733450-10733507)
chr4 (350-407)||(10947219-10947276)
chr4 (316-391)||(3769434-3769509)
chr4 (149-334)||(9237081-9237262)
chr4 (292-392)||(33045085-33045185)
chr4 (29-109)||(19686851-19686936)
chr4 (333-413)||(50427238-50427318)
chr4 (293-391)||(45236444-45236542)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (27-407)||(173094-173475)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (27-407)||(1398-1772)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (26-407)||(823-1184)
[»] scaffold1114 (2 HSPs)
scaffold1114 (27-338)||(637-949)
scaffold1114 (318-391)||(950-1023)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (26-300)||(13846-14121)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (27-308)||(5541-5824)
scaffold0185 (333-396)||(5826-5889)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (27-372)||(38002-38347)
[»] scaffold0449 (1 HSPs)
scaffold0449 (61-109)||(1281-1329)
[»] scaffold1064 (1 HSPs)
scaffold1064 (149-376)||(1067-1298)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12692866 - 12692485
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692866 tgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 12692767  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12692766 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 12692667  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcc 325  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12692666 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctcc 12692567  T
Q  326 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692566 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 12692485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12686757 - 12686383
Alignment:
Q  34 atattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686757 atattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 12686658  T
Q  133 tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  12686657 tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcc 12686558  T
Q  233 cattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12686557 cattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctg 12686458  T
Q  333 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686457 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 12686383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32094808 - 32094425
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32094808 ttgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagccttaa 32094709  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  32094708 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtgtatgtcc 32094609  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttct 323  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  32094608 ggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatctaatataaaagaggctatggtcccaaatacaccgtacacgacaatactctctcttct 32094509  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094508 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaactctattgtgtgtttca 32094425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 25 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32097609 - 32097226
Alignment:
Q  25 tttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097609 tttgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 32097510  T
Q  124 attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097509 attggttagtgatcaaattaaataataag-ctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 32097411  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||    
T  32097410 cggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggaaatactctctattc 32097311  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097310 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 32097226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28525971 - 28525590
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  28525971 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagt 28525872  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28525871 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-gttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 28525775  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28525774 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttc 28525675  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28525674 tccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgactctattgtgtgtttca 28525590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7390141 - 7389751
Alignment:
Q  18 agtatattttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7390141 agtatattttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacgataattatattagctatttatcaattgtga 7390042  T
Q  118 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatga 214  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  7390041 gtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atga 7389945  T
Q  215 gtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggc-aaac 313  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||    
T  7389944 gtggatgttcggatgacccattaacggaataatgggaaactctaatggccatccaatataaaagaggctatggttcccaatatactgtacacggcaaaac 7389845  T
Q  314 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7389844 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtttca 7389751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28532066 - 28531686
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28532066 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagtt 28531967  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28531966 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-gttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtc 28531870  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28531869 cggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtctccaatataccgtacatggcaaactctctcttct 28531770  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28531769 ccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtactggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgactctattgtgtgtttca 28531686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 41296853 - 41297238
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41296853 ttgttggaatattttatattttattatattacaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagt 41296952  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41296953 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactca--atgagtggatgt 41297049  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  41297050 ccggatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctctt 41297149  T
Q  322 ctccccatctgaagaga---acttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297150 ctccccatctgaagagaactacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 41297238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 63 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19060322 - 19059991
Alignment:
Q  63 cattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattaga 162  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19060322 cattatgtgggcaaatatctccataataattatattagctatttgtcaatttggagacttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattaga 19060223  T
Q  163 tttctattttaga----taattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaacccta 258  Q
    ||||||||| |||    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19060222 tttctattt-agaatattaattaattaattaattaatggatatggactcaatatgagtggatgtctggatgtcccattaacggaataatgggaaacccta 19060124  T
Q  259 atgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtacc 358  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19060123 atggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacatcagacacgacaaactctctcttctcccgatatgaagagaacttgaggcataaaagtacc 19060024  T
Q  359 ggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19060023 agttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 19059991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 27 - 391
Target Start/End: Original strand, 20499712 - 20500078
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20499712 tgttggaatattttattatttaattatatttcaacatcattatatggacaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaat 20499811  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20499812 tgattagtgatcaaattaagtaataagact-attagatttcta-gtaagataattaattaaatatttaattaattgatatggactca--atgagtggatg 20499907  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggc-aaactctctct 320  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  20499908 tctggatggcccattaacgaaataatggaaaaccctaatggtcatccaataaataagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctgt 20500007  T
Q  321 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20500008 tctctccatttgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttaaggaagaaccaaatcaaccgctgctaac 20500078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 51 - 391
Target Start/End: Original strand, 30771882 - 30772221
Alignment:
Q  51 atattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaata 150  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30771882 atatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagct---tatcagttgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaata 30771978  T
Q  151 aggctaattagatttctattttaga--taattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatg 248  Q
    ||||||   || ||  ||||  | |  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30771979 aggctataaagtttcttattggataattaattaaataattaattagttgatatggactcaatatgagtggatgtctggatgacccattaacagaataatg 30772078  T
Q  249 ggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggca 348  Q
      ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30772079 aaaaaccctgatgatcatccaatatagaagagactatggtccacaatatatcagacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggca 30772178  T
Q  349 taaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30772179 taaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaac 30772221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30384969 - 30384589
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatta-ataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30384969 tgttggaatattttattattttattatattccgatatcattatgtggacaaatattgtaataataattatattagctatttatcagttgtgagccttaat 30384870  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||    ||||| |||| | |||||||| |||  |||||||||||    
T  30384869 tgattagtgattaaattaagtaataaggct-attggatttcta-attagataattaattaaatatttcattaatagatatggattca--atgagtggatg 30384774  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctctt 321  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  30384773 tctggatgactcattaacggaataat-ggaaaatctaatagtcatccaatataaaagagactatggt-cccaatacaccgtacacggcaaacattctctt 30384676  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa-ctctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  30384675 ctccccatctgaagagaactcgaggtataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaagctatgttgtgtgtttca 30384589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19066693 - 19066332
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||    
T  19066693 tgttggaatattttaatatttaattatattcccataatattatgtgggcaaatatctccataataattatattaattatttgtcaatctggagccttaat 19066594  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||| | ||||||||    | |||||||||||||||    
T  19066593 tgattagtgatcaaattaagtaacaaggcttattagatttctattt-agaatattaattgattaattaatggatatggat---atatgagtggatgtctg 19066498  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcc 325  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19066497 gatgacccattaacgaaataatggaaaaccctaatgaccatccaatataaaataggttgtggtccccaatacaccggacacgacaaactctctcttctcc 19066398  T
Q  326 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19066397 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagctgccgctaac 19066332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 407
Target Start/End: Original strand, 14609909 - 14610124
Alignment:
Q  189 aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggt 288  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||    
T  14609909 aattaattgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgg-aaaccctaatggtcatctaatgtaaaagaggttatggt 14610005  T
Q  289 ccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgct 388  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610006 ccccaatacaccgaacacggcaaactttcttttctccccatctgaagagaactttaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgct 14610105  T
Q  389 aactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||| || |||| |||||||    
T  14610106 aacccttttgtttgtttca 14610124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33753815 - 33753476
Alignment:
Q  28 gttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  33753815 gttggattattttattatttaattatatttcaatatcattatgtgggtaaatattattatcataattatattagctatttatcaatttggagctttaatt 33753716  T
Q  127 gattag-----tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatgga-ctcaacatgagtggat 220  Q
    ||||||     |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |         || || ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  33753715 gattagattagtgatcaaactaagtaataagtttgattagatttctatct---------aaataattaattaattgatatgaaactcaatatgagtggat 33753625  T
Q  221 gtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctct 320  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||| || |||||||||||   || |||||||||    
T  33753624 ttatggatgatacattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatcatat-taaaagagcctatgttcctcagtacaccgtacacaccatactctctct 33753526  T
Q  321 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 370  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  33753525 tctccccatccaaggagaacttgaggcataaaaataccgtttgagaaaga 33753476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 207
Target Start/End: Original strand, 14609706 - 14609888
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14609706 ttgttggaatattttattattta-aatattccaatatcattatgtgtgcaaatatcgtaataataattatattagttacttatcaattgtgagccttaat 14609804  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaatt----atttaattagttgatatggactc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  | ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||    
T  14609805 tgattagtgatcaaattaagtaataaaact-attagatttcta-gtaagataattaattaaacatttaattaattgatatggactc 14609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 385
Target Start/End: Original strand, 26509431 - 26509781
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatta-ataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||   |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  26509431 ttgttggaatattttattattttattatattccattgtcattaagtgggcaaatatcttg-taataattatattaactatttatcaatttggagccttaa 26509529  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattattt-aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
         ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||     
T  26509530 -----tagtgatcaaattaagtaacaagaatgattagatttcta-tttggataattaattatttaaaataattgatatgaactc--tatgagtggatgtt 26509621  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||| | |  ||   || |||||  |||||||| | ||| |||||||| || |||||||| ||| |    
T  26509622 tggatggtccatcaacggaatattgagaaactttaatggcaaatcacactataagaggttatggtccacgatataccgtacacggtaaactctccctttt 26509721  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgcc 385  Q
      |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  26509722 --ccatctgatgagaactagaggcataaaggtaccgattgaggaagtatcaaatcagccgcc 26509781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33849446 - 33849110
Alignment:
Q  28 gttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  33849446 gttggattattttattatttaattatatttcaatatcactatatgggtaaatatttttatcataattatattagctatttattaatttggagctttaatt 33849347  T
Q  127 gattag-----tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatgga-ctcaacatgagtggat 220  Q
    ||||||     |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||         || || ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  33849346 gattagattagtgatcaaactaagtaataagtttgattagatttctattt---------aaataattaattaattgatatgaaactcaatatgagtggat 33849256  T
Q  221 gtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctct 320  Q
     | |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| ||||| ||| || ||||| |||||   || |||||||||    
T  33849255 ttatggatgataca---acggaataatgggaaaccctaatgactatcatat-taaaagagcctatgttcctcagtacactgtacacaccatactctctct 33849160  T
Q  321 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 370  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  33849159 tctccccatccaaggagaacttgaggcataaaaataccgtttgagaaaga 33849110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26318765 - 26318492
Alignment:
Q  89 taattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattattt 188  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||            
T  26318765 taattatattagttatctatcaattctgagacttaattgattagtgattaaattaattaataaagata-ttagatttttattt-agataatt-------- 26318676  T
Q  189 aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaa-ccctaatgaccatc-caatataaaagagtctatg 286  Q
            |||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||  ||| ||||||||  |||| || |||| ||||| |||||    
T  26318675 --------gatatggactcaatttgagtgaatgtctagatggtccattaatgaaataatgaaaaaaccctaatggtcatcacactatataagaggctatg 26318584  T
Q  287 gtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatca 379  Q
     ||||||||| | || | | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26318583 atccccaatatatcggaaacgacaaactctctcttctccc-atctgaagagaacttatggtataaatgtaccggttgagaaagaaccaaatca 26318492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25408539 - 25408435
Alignment:
Q  35 tattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagt 133  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25408539 tattttattatttaataatatttcgatatcattatgtggacaaatatcgtaaaagtaattatata---tatttatcaattgtgagccttaattgattagt 25408443  T
Q  134 gatcaaat 141  Q
    ||||||||    
T  25408442 gatcaaat 25408435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8706916 - 8706749
Alignment:
Q  82 gtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagata---- 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||  |||||||        
T  8706916 gtaataataattatattagctatttatcaactgtgggtcttaattgattagtgatcaaattaagtgataagac-gattaaatttcta-attagataattt 8706819  T
Q  178 attaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgg 249  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||  || ||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||    
T  8706818 attaaatatttaattaattgatatggatcca--ataagtggatatgcagatgacccattaacggaataatgg 8706749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22648014 - 22647928
Alignment:
Q  85 ataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt 171  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22648014 ataataattatattaattatttataaatttggagtcttaattaattagttatcaaattaagtaataagactaattagatttctattt 22647928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33021383 - 33021223
Alignment:
Q  86 taataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaatta 185  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  33021383 taataattatattaattatttatcaactatgagatttgattgattagtgatcaaataaagtaa-aaaactaattagatttaca-tttggataattaatta 33021286  T
Q  186 t-ttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataat 247  Q
    | ||||||| |||||||  | |||| | ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  33021285 tcttaattaattgatataaattcaataagagtgaatgtttggatgacccattaacagaataat 33021223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11640780 - 11640662
Alignment:
Q  90 aattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattattta 189  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||  ||    
T  11640780 aattataatagctatttaacaattaggagttttaattgattagttatcaaattatgtaataaagctaattatatttctaattta-ataatgaattaaata 11640682  T
Q  190 attagttgatatggactcaa 209  Q
    | ||||| ||||||| ||||    
T  11640681 actagtttatatggattcaa 11640662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8706672 - 8706639
Alignment:
Q  358 cggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8706672 cggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaac 8706639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 141
Target Start/End: Original strand, 38548009 - 38548065
Alignment:
Q  85 ataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaat 141  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38548009 ataatgattatattatttatttatcaactaggagacttaattgattagtgatcaaat 38548065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11840312 - 11839929
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840312 ttgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 11840213  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11840212 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtcc 11840113  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttct 323  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11840112 ggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttct 11840013  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840012 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 11839929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10238799 - 10238415
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238799 ttgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 10238700  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10238699 ttgattagtgttcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtcc 10238600  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttct 323  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10238599 ggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttct 10238500  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcat 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238499 ccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcat 10238415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42191807 - 42191424
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191807 ttgttagaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 42191708  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42191707 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtcc 42191608  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttct 323  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42191607 ggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttct 42191508  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42191507 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttca 42191424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42197748 - 42197366
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197748 tgttagaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 42197649  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42197648 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 42197549  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42197548 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctc 42197449  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42197448 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttca 42197366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10244920 - 10244537
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244920 tgttggaatattttattatttaataatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 10244821  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10244820 tgattagtgttcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 10244721  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10244720 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctc 10244621  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244620 cccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcat 10244537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17056377 - 17055997
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17056377 tgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattatctatttatcaattgtgagccttaat 17056278  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17056277 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 17056178  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcc 325  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17056177 gatg-cctattaacggaataatgggaaaccctaatggacatccaatataaaagaggctatggtccccaatacatcgtacacggcaaactctctcttctcc 17056079  T
Q  326 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17056078 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 17055997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 27 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26430003 - 26429639
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26430003 tgttggaatgttttattatttaataatattctaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 26429904  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26429903 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatgggctcaacatgagtggatgtccg 26429804  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26429803 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccagtataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctc 26429704  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgcta 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26429703 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgcta 26429639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10769554 - 10769173
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10769554 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagtt 10769455  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10769454 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtc 10769358  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  10769357 cggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttc 10769258  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10769257 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtatttca 10769173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10761236 - 10760854
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10761236 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagt 10761137  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10761136 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 10761040  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  10761039 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctctt 10760940  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10760939 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtttca 10760854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38449649 - 38449267
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  38449649 ttgttggaatatttttttatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagt 38449550  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  38449549 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgt 38449453  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  38449452 ccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctctt 38449353  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449352 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 38449267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38456135 - 38455754
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  38456135 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtgttagtt 38456036  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  38456035 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgtc 38455939  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  38455938 cggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttc 38455839  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455838 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 38455754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 49151186 - 49151567
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  49151186 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagt 49151285  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49151286 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-gttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 49151382  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49151383 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttc 49151482  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49151483 tccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttca 49151567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 49157253 - 49157634
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  49157253 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagt 49157352  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49157353 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-gttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 49157449  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49157450 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttc 49157549  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49157550 tccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttca 49157634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 24 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 55003990 - 55003616
Alignment:
Q  24 ttttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  55003990 ttttgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtggacaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagcctt 55003891  T
Q  123 aattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55003890 aatttattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 55003791  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  55003790 ccggatgacccattaacggaataatgggaaac-------gtcatccaatataaaagaggttatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttc 55003698  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55003697 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgag---gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtatttca 55003616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 27 - 405
Target Start/End: Original strand, 8331362 - 8331740
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8331362 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtggaccttagtt 8331461  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  8331462 gattagtgatcaaattaagtaataaggat-ataagatttctaattggataattaattaaatatttaatcagttgatatggactta--atgagtggatgtc 8331558  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8331559 cggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacactgtacacggcaaactctctcttct 8331658  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331659 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 8331740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30051685 - 30051306
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30051685 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagtt 30051586  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  30051585 gattagtgatcaaattaagtaataaagat-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaac--gagtggatgtc 30051489  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
     |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30051488 cggatggcccattaacggaataat-ggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttct 30051390  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30051389 gcccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttca 30051306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 40 - 391
Target Start/End: Original strand, 28964468 - 28964811
Alignment:
Q  40 tattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaa 139  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28964468 tattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttataaattgtgagccttagttgattagtgatcaa 28964567  T
Q  140 attaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccatt 236  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28964568 attaagtaataaag-ttattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtccggatggtccatt 28964664  T
Q  237 aacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaaga 336  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28964665 aacggaataatgagaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggaaaactctctcttctccccatctgaaga 28964764  T
Q  337 gaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||| |||||||        |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28964765 gaactcgaggcat--------cggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaac 28964811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17602120 - 17601879
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| | ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  17602120 ttgttgaaatattttattatttaataatattcaaatatcactatgtgcgtaaatatcatagtaataattatattagttatttatcaatttagagccttaa 17602021  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17602020 ttgattagtggtcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgattggatgtcc 17601921  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccat 266  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17601920 gaatgacccattaacggaataatgacaaaccctaatggccat 17601879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23139001 - 23138779
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  23139001 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagtt 23138902  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  23138901 gattagtgatcaaattaagtaataagact-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgtc 23138805  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgg 249  Q
     |||||| ||||||||||||||||||    
T  23138804 cggatgacccattaacggaataatgg 23138779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11846562 - 11846340
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  11846562 tgttggaatattttattatttaataatattccat-atcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaat 11846464  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  11846463 ggattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatattgagtca--atgagtggatgt 11846366  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatg 248  Q
    | |||||  |||||||||||||||||    
T  11846365 ccggatggcccattaacggaataatg 11846340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 198 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 48128451 - 48128260
Alignment:
Q  198 atatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatac 297  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  48128451 atatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatggaaaaccttaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatat 48128354  T
Q  298 accgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48128353 accgtacacggcaaacattctcttctccctgtctgaagagaactaaaggcataaaggtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaac 48128260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 388
Target Start/End: Original strand, 46656306 - 46656610
Alignment:
Q  67 atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  46656306 atgtgggcaaatatcgtaataataattatattaact-----------gtgagctttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagct-attagatttc 46656393  T
Q  167 tattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgac 263  Q
    || ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  46656394 taattggataattaattaaatatttaattagttgatatgtactc--gatgagtggatgtccggatgacctattaacggaataatgggaaaccctattggt 46656491  T
Q  264 catccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttg 363  Q
     ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||      ||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||     
T  46656492 tatccaatataaaagaggttatggttcccaatacaccgta------aaacattctcttctccccatctgaatagaattagagacataaaggtgccggtta 46656585  T
Q  364 aggaagaaccaaatcagccgccgct 388  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||    
T  46656586 aggaagagccaaatcaatcgccgct 46656610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2982812 - 2982458
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |    
T  2982812 tgttggtatattttattatttaattatatttcgatatcattatgcgaacaaatattgtaataataattatataatctatttatcaatagcgagccttatt 2982713  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttaga---taattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || | |   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||  ||||    
T  2982712 tgattagtgatcaaattaaataataaagatatttagatttctaattgaaaaattaattaaatatttaattagttgatataaactcaatacgagtatatgt 2982613  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | |||||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||   |||||||| |||| ||| || | ||| |||||||| |||    
T  2982612 caggatgacccattaaaagaataatga-aaatcctaatgaccaacaaatataaaagaggtcatggtcccaaatataccatatacggcgaactctcttttc 2982514  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatc 378  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||   |||| |||||||||||||    
T  2982513 tccctatctgaagagaacttaagacataaagatacttattgaagaagaaccaaatc 2982458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12109214 - 12108868
Alignment:
Q  64 attatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagat 163  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||  ||  |    
T  12109214 attatgtgagtaaatatcgtaataataattgtattagttatttatcaattgtgatctttaattgattagtgataaaattaagtgataatgtta--taagt 12109117  T
Q  164 ttctattttagataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaa 259  Q
    ||||| || |||||||| ||||    ||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||    ||    
T  12109116 ttctaatt-agataattgattaaacatttgattaattgatatggactcaatatgagttgatgtctagatgactcgttaacggaataatgagaaataacaa 12109018  T
Q  260 tgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccg 359  Q
    ||  ||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||| || |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  12109017 tggtcattcaatataaaagagagtacggtcctcaatacatcgtacacggcaaactatcttttcttccgatctgaa-----cttgaggcataaaggtaccg 12108923  T
Q  360 gttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa-ctctattgtgtgtttcatctcac 413  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||| ||||    
T  12108922 gttaaagaagaaccaaatcagtcgccgctaacctatgttgtgtgtttcatatcac 12108868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 53069443 - 53069279
Alignment:
Q  219 atgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaa--gagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactct 316  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53069443 atgtccggatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatgatcgtccaatataaaaaagaggctatggtcctcaatacaccgtacatggcaaactct 53069344  T
Q  317 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53069343 ctcttctccccatctgaagagaact----------aggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 53069279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 235 - 391
Target Start/End: Original strand, 13444840 - 13444997
Alignment:
Q  235 ttaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctccccatctga 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||   | | | ||||||||||||||||||||    
T  13444840 ttaacgaaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaataggttatggtccccaatacaccgtacacaacgatattctctcttctccccatctga 13444939  T
Q  334 agagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13444940 agagaacttgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaac 13444997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 312 - 407
Target Start/End: Original strand, 13837534 - 13837629
Alignment:
Q  312 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837534 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 13837629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24644077 - 24643890
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatta-ataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  24644077 ttgttggaatattttattattttattatattccaatattattatgtgggcaaatatcctaacaataattacattagttatttatcaattgtgagtcttag 24643978  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24643977 ttgattagtgatcaaattaagtaacaaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaac 24643890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53071793 - 53071638
Alignment:
Q  70 tgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctat 169  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  53071793 tgggcaaatatcataacaataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta- 53071696  T
Q  170 tttagataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
     || ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  53071695 attggataattaattgaatatttaattagttgatatgaactca--atgagtggatgtctg 53071638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9586598 - 9586490
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9586598 ttgttggaatattttatattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagt 9586499  T
Q  126 tgattagtg 134  Q
    |||||||||    
T  9586498 tgattagtg 9586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 215 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13367233 - 13367114
Alignment:
Q  215 gtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaact 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||      
T  13367233 gtggatgtctggatggtccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatat-aaagaggctatggtccccaatataccgtacatagcaaaac 13367135  T
Q  315 ctctcttctccccatctgaag 335  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  13367134 cgctcttctccccatctgaag 13367114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8474721 - 8474595
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcc-ttaa 124  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||    
T  8474721 tgtttgaatattttattatttaattatatttcgatatcattatgtgaacaaatatcgtaataataattatattaacttttaatcaattgtgggcctttaa 8474622  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8474621 ttgattagtgatcaaattaagtaataa 8474595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 335
Target Start/End: Original strand, 9760481 - 9760600
Alignment:
Q  215 gtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaact 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||      
T  9760481 gtggatgtctggatggtccattaaaggaataataggaaaccctaatggtcatccaatat-aaagaggatatggtccccaatataccgtacatagtaaaac 9760579  T
Q  315 ctctcttctccccatctgaag 335  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  9760580 cgctcttctccccatctgaag 9760600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 335 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11846340 - 11846267
Alignment:
Q  335 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaa-tcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846340 gagaacttgcggcataaaggttccggttgaggaagaaccaaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 11846267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 34300047 - 34300197
Alignment:
Q  61 atcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaatta 160  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||    
T  34300047 atcattacgtgggcaaacatcataataataattatattaactatttatcaattgtgagaattaattgattagtaattgaattaagtaataagact-atta 34300145  T
Q  161 gatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaa 209  Q
     |||| || ||   ||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  34300146 aatttttaattggataattaattaaatatttaattaattgatatgaactcaa 34300197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 391
Target Start/End: Original strand, 34300348 - 34300429
Alignment:
Q  310 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  34300348 aaactctctcatctcctcgtatgaagagaacttgaggcatgaaagtaccggttgaagaataaccaaataagtcgccgctaac 34300429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24643815 - 24643773
Alignment:
Q  349 taaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24643815 taaaggtaccggttgagaaagaaccaaatcagccgccgctaac 24643773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24643879 - 24643817
Alignment:
Q  262 accatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcccc 327  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  24643879 accatccaatataaaagaggctatgg-ccccaatacaccgtac--gacaaactctctcttctcccc 24643817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 52063392 - 52063295
Alignment:
Q  65 ttatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagat 163  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  52063392 ttatgtgggcaaatatcgtca-aataattaaattagctatttatcagttagtattctttattgattaatgatcaaaataagtaataagactaactagat 52063295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17000910 - 17000868
Alignment:
Q  123 aattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagattt 165  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  17000910 aattgattagtgatcacattaagaaataaggctaattatattt 17000868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52222995 - 52222937
Alignment:
Q  89 taattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagta 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  52222995 taattatattatctatttatcaatttggggccttaattaattagtgatataattaagta 52222937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28421537 - 28421163
Alignment:
Q  34 atattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421537 atattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 28421438  T
Q  133 tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  28421437 tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcc 28421338  T
Q  233 cattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28421337 cattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctg 28421238  T
Q  333 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421237 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 28421163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 351361 - 351742
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  351361 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtcagccttagt 351460  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  351461 tgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgt 351557  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  351558 ccggatggcccattactggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttc 351657  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351658 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 351742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3811756 - 3811373
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagat--cattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 123  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3811756 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcctta 3811657  T
Q  124 attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggat 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3811656 gttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggat 3811560  T
Q  221 gtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctct 320  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3811559 gtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctct 3811460  T
Q  321 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811459 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 3811373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3817895 - 3817515
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3817895 tgttggaatattttattatttattatatttcaatatcattatgtaggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagtt 3817796  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3817795 gattagtgatgaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtc 3817699  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3817698 cggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttct 3817599  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817598 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 3817515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5979762 - 5979378
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcc-ttaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||    
T  5979762 tgttggaatattttattatttaataatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagcccttaa 5979663  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||      
T  5979662 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatggatggatgttc 5979563  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaat-ataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
    |||||  | |||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  5979562 ggatggccaattaacagaataatgggaaagtctaatggtcatccaataataaaagaggttatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttc 5979463  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5979462 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttca 5979378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 24 - 407
Target Start/End: Original strand, 338953 - 339335
Alignment:
Q  24 ttttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  338953 ttttgttggaatattttattatttcttatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtcagcctta 339052  T
Q  124 attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggat 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  339053 gttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggat 339149  T
Q  221 gtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctct 320  Q
    ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  339150 gtccggatggcccattactggaataatgggaaacc-taatggccatccaatataaaagaggtcatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctct 339248  T
Q  321 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339249 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 339335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35148595 - 35148236
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtggg-caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  35148595 ttgttggaatattttattatttattatattctaatatcattatgtggggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattatgagccttag 35148496  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35148495 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attggatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatg 35148399  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctctt 321  Q
    || |||||   ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148398 tccggatggctcattaacagaataatgggaaactctaatggccatccaatataaaagaggctatgatccccaatacaccgtacatggcaaactctctctt 35148299  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgc 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148298 ctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgc 35148236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 27 - 391
Target Start/End: Original strand, 5849106 - 5849469
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  5849106 tgttggaatattttattattatta-tattctaatatcattatgtgggtaaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagccttagtt 5849204  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  5849205 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtt 5849301  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5849302 cggatggtccattaacggaataatgagaaaccttaatggtcatccaatataaaagaggctatggtcctcaatataccgtacacggcaaactctcttttct 5849401  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5849402 ccccatctgaagataacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagacgccgctaac 5849469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 33 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22742508 - 22742149
Alignment:
Q  33 aatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22742508 aatattttattatttattatattccaatattattatgtaggcaaataccgtaacaataattatattagttatttatcaactgtgagccttagttgattag 22742409  T
Q  133 tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggat 228  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22742408 tgataaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attagataattaattaaatatataagtagttgatatggactca--atgagtggatgtccggat 22742313  T
Q  229 gatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggc-aaactctctcttctcccc 327  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22742312 ggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagagactatggtctccaatataccgtacatggcaaaactctctcttctccca 22742213  T
Q  328 atctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22742212 atctgaagagaacttgaggcataaaggtaccagttgatgaaaaaccaaatcagccgccgctaac 22742149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 352
Target Start/End: Original strand, 26383241 - 26383569
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt--aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 123  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383241 ttgttggaatattttattattttaattatatttcaatatcattttgtgggcaaatatcataataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 26383340  T
Q  124 attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggat 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||    
T  26383341 gttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattaatgaatatggactca--atgagtggat 26383437  T
Q  221 gtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctct 320  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26383438 gtccggatgacccattaatggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccctaatacaccggacacggcaaactctctct 26383537  T
Q  321 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaa 352  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26383538 tctccctatttgaagagaacttgaggcataaa 26383569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 391
Target Start/End: Original strand, 43539567 - 43539919
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaa---taatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 123  Q
    ||||||||| |||||||||| |   | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  43539567 tgttggaatgttttattatttaattttatattccaatatcattatgtgtgcaaatatcgtaaaaataattatattaattatttatcatttgtgagcctta 43539666  T
Q  124 attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||         |||||     ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43539667 attgattagtgatcaaattaagtaataaggtt--ttagattt---------ataat-----atttaattaattgatatggactcaa--tgagtggatgtc 43539748  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  43539749 tggatgacccattaacggaataacggaaaaccctaatggtcacccaatataaaagaggttatggtccccaatataccgtgcacggcaaactctctcttct 43539848  T
Q  324 c---cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43539849 ccttcccatctgaagagaactttaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac 43539919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35153114 - 35152849
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  35153114 ttgttggaatattttattatttattatattccaatgtcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagatatttatcaattgtgagccttagt 35153015  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35153014 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attcgatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 35152918  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccc 291  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35152917 ccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccc 35152849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 264 - 407
Target Start/End: Original strand, 20238762 - 20238906
Alignment:
Q  264 catccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggtt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238762 catccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggtt 20238861  T
Q  363 gaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238862 gaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 20238906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 406
Target Start/End: Original strand, 15843730 - 15843901
Alignment:
Q  236 taacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccg-tacatggcaaactctctcttctccccatctgaa 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15843730 taacggaataatgggaaactctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtctccaatacaccggtacacggcaaactctctattctccccatctgaa 15843829  T
Q  335 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttc 406  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15843830 gagaacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttc 15843901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 406
Target Start/End: Original strand, 15860839 - 15861010
Alignment:
Q  236 taacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccg-tacatggcaaactctctcttctccccatctgaa 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15860839 taacggaataatgggaaactctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtctccaatacaccggtacacggcaaactctctattctccccatctgaa 15860938  T
Q  335 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttc 406  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860939 gagaacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttc 15861010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 391
Target Start/End: Original strand, 26380751 - 26381023
Alignment:
Q  95 tattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||              
T  26380751 tattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaaataataaggcta-ttagatttctaattg-gataattaatt---------- 26380838  T
Q  195 ttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaa 294  Q
      |||||| ||||||  |||||| ||||| |||||| ||||       ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26380839 --gatatgaactcaa--tgagtgcatgtccggatgacccat-------ataatgggaaatcttaatggtcatccaatataaaagag-ctatggtccccag 26380926  T
Q  295 tacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||| |  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26380927 tacatcagacacgacaaactctctcttctcccgatctgaagaaaactttaggcataaaggtagcagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 26381023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35150865 - 35150761
Alignment:
Q  287 gtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccg 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35150865 gtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaagaataaccaaatcagccgccg 35150766  T
Q  387 ctaac 391  Q
    |||||    
T  35150765 ctaac 35150761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 267
Target Start/End: Original strand, 8824421 - 8824614
Alignment:
Q  62 tcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattag 161  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||    
T  8824421 tcattatgtaggcaaatatctttataataattatattagctatttatcaattgtgaggcttaattgattaatgatcgaattaggtaataaggat-attag 8824519  T
Q  162 atttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatg 261  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  8824520 atttc--ttttagataattaattaatta--------atatggactcaatatgagtggatgtctggatgactca-taacggaataatgagaaaccttaatg 8824608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 128 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18657132 - 18656883
Alignment:
Q  128 attagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattattt-aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctgg 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  18657132 attagtgatcacattaagtaataaggctaattagattttta-tttggataattaattatttaaattaattaatatggactc--tatgagtggatgtctgg 18657036  T
Q  227 atgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatc-caatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcc 325  Q
    |||| |||||||   |||||||| ||| |||||||  |||| || | |  ||||| |||| ||| ||||| |||| |||| | |||||| |||||||||     
T  18657035 atgacccattaatacaataatggtaaatcctaatg-gcatcacactgt--aagaggctattgtctccaatgcaccatacacgacaaactttctcttctct 18656939  T
Q  326 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagc 381  Q
    || |||||||||||||  || |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18656938 ccgtctgaagagaactaaagacataaaagtaacagttgaggaagaaccaaatcagc 18656883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42767636 - 42767505
Alignment:
Q  176 taattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataa 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||    
T  42767636 taattaaatatttaattagttgatatggacttca-atgagtggatgtctggatgatccattaacggaataataggaaaccctaatggccat---atataa 42767541  T
Q  276 aagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa 311  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  42767540 aagaggctatggtcccgaatataccgtacacggcaa 42767505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 390
Target Start/End: Original strand, 7608060 - 7608381
Alignment:
Q  64 attatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagat 163  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7608060 attatatgggcaaatatcataataataattatatcagttatttatcaattgtgag----------ttaatgatcaaattaagtaataaagcta-ttagat 7608148  T
Q  164 ttctattttagataattaattattt-aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatga 262  Q
             |  ||||||| ||||| |||||||||||||||  | |  ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  7608149 ---------aattaattaaatattttaattagttgatatggggtta--atgagtggatgtccggatgacccattaatgaaataatgaaaaaccctaatga 7608237  T
Q  263 ccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggca----aact-----------ctctcttct-ccccatctgaagagaacttgagg 346  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||    ||||            |||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  7608238 ccatccaatataaaagatgttatggtccccaatacaccggacaagacaagagaacttgagtcataaagtctcttctcccccatcggaagagaacttgagt 7608337  T
Q  347 cataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa 390  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  7608338 cataaaggtaccgatttaggaagtaccaaatcagtcgccgctaa 7608381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18667006 - 18666883
Alignment:
Q  93 tatattagctatttatcaattgtgagcctta--attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tag---ataattaatt 184  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||    ||||||| |    
T  18667006 tatattagttatttatcaaccgtgagccttataattgataagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattgtatagttattaattaaat 18666908  T
Q  185 atttaattagttgatatggactcaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  18666907 ttttaattagttgatatggactcaa 18666883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30219598 - 30219503
Alignment:
Q  88 ataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaatta 185  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  30219598 ataataatagtagttatttattaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagttataaag-ttattagatttcta-attagatagttaatta 30219503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 392
Target Start/End: Original strand, 3677889 - 3677965
Alignment:
Q  316 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaact 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  3677889 tctcttctctccatctgaagagaaattgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaacaaatcaactgccggtaact 3677965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18667790 - 18667724
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataat 92  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18667790 tgttggaatattttattatttaattatattccaatatcattgtgtgtgcaaatatcgtaataataat 18667724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 286
Target Start/End: Original strand, 24690652 - 24690749
Alignment:
Q  184 tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtct 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    ||| |||||||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |    
T  24690652 tatttaattagttaatatggactcaatatgagtggatgtc----tgacccattaacagaataatgagaaa-cctaacgatcatctaatataaaagagttt 24690746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 391
Target Start/End: Original strand, 12803893 - 12803938
Alignment:
Q  346 gcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  12803893 gcataaaggtaccggttgaggaagaacctaatcagtcgtcgctaac 12803938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 391
Target Start/End: Original strand, 24690848 - 24690881
Alignment:
Q  358 cggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24690848 cggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 24690881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42767686 - 42767656
Alignment:
Q  75 aaatatcgtaataataattatattagctatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42767686 aaatatcgtaataataattatattagctatt 42767656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25382122 - 25381739
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25382122 ttgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 25382023  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25382022 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtcc 25381923  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttct 323  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25381922 ggatggcccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttct 25381823  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381822 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 25381739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 1077818 - 1078200
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077818 tgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 1077917  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1077918 tgattagtgatcaaattaagtaataagactaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 1078017  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1078018 gatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctc 1078117  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1078118 accatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagcggccgctaactctattgtgtgtttca 1078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 50305771 - 50306145
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50305771 tgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 50305870  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50305871 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 50305970  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcc 325  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50305971 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaattctctcttctcc 50306070  T
Q  326 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50306071 ccatctgaagagaacttgaggc-------taccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 50306145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25388088 - 25387708
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttatta-ttaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25388088 tgttggaatattttattaattaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattatttatttatcaattgtgagccttaat 25387989  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |    
T  25387988 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgtccg 25387891  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25387890 gatggcccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctc 25387791  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387790 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 25387708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 31051119 - 31051500
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31051119 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagtt 31051218  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31051219 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtc 31051315  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  31051316 cggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttc 31051415  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051416 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 31051500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 407
Target Start/End: Original strand, 34739559 - 34739941
Alignment:
Q  25 tttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||     
T  34739559 tttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttataaattgagggccttag 34739658  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34739659 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatg 34739755  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctctt 321  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  34739756 tccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctgtggtccccaatataccgtacacgacaaactctctctt 34739855  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739856 ctcccaatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 34739941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 26 - 405
Target Start/End: Original strand, 31057618 - 31057998
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31057618 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagt 31057717  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31057718 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 31057814  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  31057815 ccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatacaatataaaagaggctatgatccccaatataccgtacacgacaatactctctctt 31057914  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31057915 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgttt 31057998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 27 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8093431 - 8093066
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  8093431 tgttggaatattttattatttaattatattccaatatcattatccgggcaaatgccgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagt 8093332  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8093331 tgattaataatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattg-gataattaattaaatgtttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatg 8093236  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctctt 321  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  8093235 tccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaacgatcatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgaacacggcaaactctctttt 8093136  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8093135 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 8093066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 51 - 391
Target Start/End: Original strand, 44409599 - 44409940
Alignment:
Q  51 atattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaata 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44409599 atattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgattaaattaggtaata 44409698  T
Q  151 aggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataat 247  Q
    ||||| ||||| |||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  44409699 aggct-attaggtttctaattggataattaattaaatatttaattagttaatatggactca--atgagtggatgtccggatggcccattaacggaataat 44409795  T
Q  248 gggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgagg 346  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44409796 gagaaaccctaatggccatccaatataaaagaggttatggtccccaatacactatacacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgagg 44409895  T
Q  347 cataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44409896 cataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 44409940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24927355 - 24926981
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||   |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  24927355 ttgttggaatattttaatatttaattatattccaatgacattatgtgggcaaatatctctataataattatattagctatttatcaatttggagtcttaa 24927256  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt-----------tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||           ||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||    
T  24927255 ttgattagtgatcaaattaagtaacaaggcttataagatttctatttagaatattaattaattaattaattaattaattaatggatatggactcaa--tg 24927158  T
Q  214 agtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaac 313  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||| ||||    
T  24927157 -gtggatgtctggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggttcccaatactccatacgtggaaaac 24927059  T
Q  314 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24927058 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcatataggtaccggttgaggaagaaccaaatcagctgccactaac 24926981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25275625 - 25275421
Alignment:
Q  34 atattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25275625 atattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 25275526  T
Q  133 tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25275525 tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgacc 25275426  T
Q  233 catta 237  Q
    |||||    
T  25275425 catta 25275421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 38152541 - 38152184
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||  || ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||    
T  38152541 tgttgaaatattttattctttattatatttcaatatcattatc-ggacaaatattgtaacaataattatattaattatttatcaattgtgggccttagtt 38152443  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||        ||||||    
T  38152442 gattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgaactcaat-------gatgtc 38152351  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||    
T  38152350 cggatgacccattaacggaataatgggaaacc-taatgaccatccaatataaaagaggctatggttcccaatacaccgtacacgacaaactcgttcttct 38152252  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  38152251 ccccatctaaagaaaacttgaagcataaaggtaccggttgaagaagaaccaaattagctgccgctaac 38152184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24964289 - 24963940
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaa-gatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  24964289 tgttggaatgttttaatattaattatattccaatgat-attatgtgggtaaatatctctataataattatattagctatttatcaatttgaagccttaat 24964191  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||  |||||||| ||||||| | |||||| ||||||  || |||||||||||    
T  24964190 tgattagtgatcaaattaagtaataaagcttataagatttctattt-agaatattaattaattaattaatggatatgaactcaa--tgggtggatgtctg 24964094  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcc 325  Q
     |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||   |||| |||||||||||  ||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24964093 aatgacccattaacggaaaaatgg-aaaccctaattgtcatctaatataaaagatgctatgatcaccaagacaccgtatgtggcaaactctctcttctcc 24963995  T
Q  326 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcag 380  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24963994 ccatctgaagaggacttgaggcataaatgtactggttgaggaagaaccaaatcag 24963940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 27954735 - 27955088
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27954735 tgttgaaatattttattatttaattatattctgatatcattacgtgggcaaaaatcgtaatactaattatattagttatttatcaattgtgaggcttaat 27954834  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27954835 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattt-gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatatgagtggatg 27954932  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctct 320  Q
    | ||||||   |||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||   ||| | ||| ||  |||||    
T  27954933 tatggatggctcattagtggaataatgggaaatcataatggtcatccaatataaaagatgttatgatccccaatacac---acacgacaatacattctct 27955029  T
Q  321 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcag 380  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27955030 tctccccatctg-agagaacttaagacataaaggtaccggttgaggaataactaaatcag 27955088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33458493 - 33458149
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||||||| ||||||||   |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33458493 ttgttggaatattttattatttaattatattctgatatcagtatgtggacaaatatc---ataatagttatattggttatttatcaattgtgagccttaa 33458397  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataa----ttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||    |||| ||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||    
T  33458396 ttgattagtgatcaaattaagtaataatgct-attagatttcta-actagataattacttaaatatttaattaactgatatggact-aatgtgagtggat 33458300  T
Q  221 gtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaata-taaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctc 319  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |   ||||||||   ||| |||||||||||||    
T  33458299 gtccggatgatccattaatgaaataacgagaaaccctaatgaccat--aatactataagaggctatgattttcaatacactagacacggcaaactctctc 33458202  T
Q  320 ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 372  Q
    |||| |||||  ||| ||||||  || ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  33458201 ttcttcccatacgaatagaactatagacataaagctaccagttgagaaagaac 33458149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12184183 - 12183962
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  12184183 ttgttggaatattttattatttaataatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaa 12184084  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||| ||                  ||||||||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12184083 ttgagta------------------aaggctaattagatttctatttggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatatgagtagatg 12184002  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatg 261  Q
    || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12184001 tccggatggccaattaacggaataatgagaaaccctaatg 12183962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4280258 - 4280189
Alignment:
Q  83 taataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataag 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4280258 taataataattatattaactatttatcaattgtgaaccttaattgattagtgatcaaattaagtaataag 4280189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Original strand, 23253826 - 23253956
Alignment:
Q  140 attaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatcc----at 235  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| |  |||| ||    ||    
T  23253826 attaagtgataagactaattgaatttctattt-agataattaattaattaattaattgatatggactcgatatgagtagatgtataaatgacccattaat 23253924  T
Q  236 taacggaataatgggaaaccctaatgaccatc 267  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23253925 taatggaataatggtaaaccctaatgaccatc 23253956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12183867 - 12183820
Alignment:
Q  333 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12183867 aagagaacttgaggcataaaggtagcggttgagaaataaccaaatcag 12183820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27396301 - 27396209
Alignment:
Q  92 ttatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaatta 185  Q
    ||||||||| ||||||| ||||   || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27396301 ttatattagttatttattaatttgaagtcttaattaattaatgatcaatttaagtaataatacttattagattttta-tttagataattaatta 27396209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4580907 - 4580525
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttatta-ttaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580907 tgttggaatattttattaattaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 4580808  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4580807 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 4580708  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4580707 gatgacccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctc 4580608  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4580607 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgcgtgtttca 4580525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 25343201 - 25343580
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25343201 tgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgaaccttaat 25343300  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25343301 tgattagtgattaaattaagtaataaggctaattagatt--tattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgttcg 25343398  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  25343399 gatggtccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctat-gtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctc 25343497  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343498 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 25343580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 45 - 407
Target Start/End: Original strand, 25353806 - 25354167
Alignment:
Q  45 ttaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaa 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25353806 ttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaa 25353905  T
Q  145 gtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaat 244  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  25353906 gtaataaggctaattagatt--tattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatatccggatggcccattaacggaat 25354003  T
Q  245 aatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttg 343  Q
    |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354004 aatgggaaactctaatggtcatctaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttg 25354103  T
Q  344 aggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354104 aggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 25354167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8651389 - 8651007
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  8651389 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagt 8651290  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  8651289 tgattagtgatcaaattaagtaataagact-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgt 8651193  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  8651192 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctctt 8651093  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651092 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 8651007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 26 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21191456 - 21191069
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  21191456 ttgttggaatattttattatttaataatattccat-atcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaa 21191358  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  21191357 ttgattagtgatcaaattaagtaatatggctaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggattca--atgagtggatg 21191260  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctct 320  Q
    |  |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||    
T  21191259 ttcggatggcccattaacggaataatgtgaaaccataatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccttacacggcaatactctctct 21191160  T
Q  321 tctccccatctgaagagaact---tgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcat 408  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191159 tctccccatctgaagagaacttgatgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcat 21191069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21771150 - 21770787
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21771150 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 21771051  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21771050 tgattagtgatcaaattaagtaataaaact-attagatttctaattgaataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgt 21770954  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggc-aaactctctctt 321  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21770953 ccggatga-ccattaacggaataatgggaaaccctaatggccaaccaatataaaagaggctacggtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctctt 21770855  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21770854 ct--ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaac 21770787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21197627 - 21197250
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  21197627 ttgttggaatatttttttatttaataatattccat-atcattatgtgggtaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaa 21197529  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21197528 ctgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatg 21197431  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa---------- 311  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||              
T  21197430 tccggatggcccattaacggaataatgggaaaacctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactcggcaa 21197331  T
Q  312 -actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21197330 tactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 21197250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21783911 - 21783545
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||| |||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  21783911 ttgttagaatatttaattatttattatattctaatattattatgtgggtaaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagtcttagt 21783812  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21783811 ggattagtgatcaaattaagtaataaaact-attaaatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgt 21783715  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatg--gtccccaatacaccgtacatggc-aaactctctc 319  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21783714 ccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatg-gcatccaatataaaagaggctatggtgtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctc 21783616  T
Q  320 ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggta------ccggttgaggaagaaccaaatcagccgc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21783615 ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaaaggtgccggttgaggaagaaccaaatcagccgc 21783545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30906166 - 30905821
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatta-ataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  30906166 tgttggaatattttattattttattatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttagt 30906067  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||    
T  30906066 tgattagtaaccaaataaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc--tatgagtagatgt 30905970  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  30905969 ctggatgatcctttaacagaataatgggaaaccataatggtcatccaatataaaagaggctatggttcccaatacaccgtactcgacaaactctctcttc 30905870  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 372  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  30905869 -ccccatctgaagagaacttgaggcataaatataccaattgaggaagaac 30905821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31756796 - 31756422
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||| | |||| ||    
T  31756796 tgttcgaatattttattatttattatatttcaatattattatgtggataaatattgtaacaataattatatt-------tatcaattgtgggtcttagtt 31756704  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31756703 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaataattaattagttgatatggactca--atgagtggatgtc 31756607  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||| | |||||||||||||||    
T  31756606 cggatgacccattaa-ggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatatatcaaacacgacaaactctctcttct 31756508  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa--ctctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  31756507 ccccatctgaagagaacttgaggtataaaggtacctgttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatattgtgtgtttca 31756422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21789982 - 21789768
Alignment:
Q  176 taattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataa 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21789982 taattaaatatttaattagttgatatggacttaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggc-atccaatataa 21789886  T
Q  276 aagagtctatggt--ccccaatacaccgtacatggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggta------ccggttgagg 366  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||    
T  21789885 aagaggctatggtgtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaaaggtgccggttgagg 21789786  T
Q  367 aagaaccaaatcagccgc 384  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21789785 aagaaccaaatcagccgc 21789768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12802124 - 12801890
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  12802124 tgttggaatattttaatatttaattatattccaatgacattacgtgggcaaatatctctataataattatattagctatttgtcaatttggagccttaat 12802025  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12802024 tgattagtgatcaatttaagtaataaagcttattagatttcta-tttagaatattaattaattatttaatggatttggactcaatatgagtggatgtctg 12801926  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatg 261  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12801925 gatgacccattaatggaataatgggaaaccctaatg 12801890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 152
Target Start/End: Original strand, 17581177 - 17581304
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  17581177 ttgttggaatattttattatttaattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagcctcaa 17581276  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataag 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17581277 ttgattagtgatcaaattaagtaataag 17581304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 198 - 391
Target Start/End: Original strand, 17581384 - 17581572
Alignment:
Q  198 atatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatac 297  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||       
T  17581384 atatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaa-cctaataaccgtccaatataaaagaggctatggtccccaa--- 17581477  T
Q  298 accgtacatggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    || ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17581478 actgtacacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtacaagttgaggaagaaccaaatcagctgccactaac 17581572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 6096887 - 6097067
Alignment:
Q  29 ttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 128  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  6096887 ttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatagtaacaataattatattacttatttgtcaattgtcagccttacttga 6096986  T
Q  129 ttagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaat----tatttaattagttgatatggact 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  6096987 ttagtgatgaaattaagtaataaggct-attaaatttctaattttgataattaattaaatatttaattagttgatatggact 6097067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 215 - 388
Target Start/End: Original strand, 28728047 - 28728218
Alignment:
Q  215 gtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaact 314  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||      
T  28728047 gtggatgtccggatggtccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcctatat-aatgaggctatggtccccaatataccgtacacagcaaaac 28728145  T
Q  315 ctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgct 388  Q
    | ||||||||||||||||||| | | ||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28728146 cgctcttctccccatctgaagcgca-ttagggcatcgaggtaccggttgaggaagaacctaactagccgccgct 28728218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 345
Target Start/End: Original strand, 1105925 - 1106206
Alignment:
Q  64 attatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagat 163  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||    
T  1105925 attatgtgggcaaatatggtagtaataattatatttgatatttatcaattgtaagttttatttgattagtgttcaaattaaatgataaggct-attaaat 1106023  T
Q  164 ttctattt---tagataattaattattt-aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaa 259  Q
    || ||  |   ||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  1106024 ttttaactacataattaattaaatatttaaattaattaatatggattca--atgagtggatgtccggatgactcattaacgaaataatggaaaaccgtaa 1106121  T
Q  260 tgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgag 345  Q
    ||| |||  | |||||| |||  |||||||||||||  || ||||| | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1106122 tgatcattgagtataaatgaggatatggtccccaat--actgtacacgtcaaaactttctcttctccctatgtgaagagaacttgag 1106206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Original strand, 13007308 - 13007516
Alignment:
Q  45 ttaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaa 144  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| | |||| | | | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13007308 ttaattatattccaatgtcattatgtagacaaaaaactttataataattatattagttatttatcaatttggagccctaattgattaatgatcaaattaa 13007407  T
Q  145 gtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaat 244  Q
      |||||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||| | |||| || || |||||| ||||| |||  | ||||||| || |||||||||| | |||    
T  13007408 acaataagactaattaaatttcta-gttagataataaataaattaagtaattaatatgggctcaatatggatagatgtctagaagatccattaaagaaat 13007506  T
Q  245 aatgggaaac 254  Q
    ||||||||||    
T  13007507 aatgggaaac 13007516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 392
Target Start/End: Original strand, 20745394 - 20745497
Alignment:
Q  289 ccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgct 388  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || | |||||    
T  20745394 ccccaatacaccgtacatggcatattctcacttatttccatctgaagagaacttggggcttaaaagtaccgattgaggaaaaaccaaattagtcaccgct 20745493  T
Q  389 aact 392  Q
    ||||    
T  20745494 aact 20745497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17900656 - 17900378
Alignment:
Q  96 attagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagt 195  Q
    ||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||| |||||| ||||||    |||| |    
T  17900656 attagttattgatcaatttggagtcttaattgattggtgatcaaattaagtaattagacttgttagatttttattt-agataactaatta----attatt 17900562  T
Q  196 tgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaat-gaccatc-caatataaaagagtctatggtcccca 293  Q
     |||||||| |||| |||  || | ||||  ||||   |||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||  || ||||| ||  | |||||||||||    
T  17900561 cgatatggattcaatatggatgcacgtctaaatgacttattaacggaaaaatgagaaactcgaattgaccattacactataagaggctatatggtcccca 17900462  T
Q  294 atacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatc 378  Q
    ||||| |||||||| ||   |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||    
T  17900461 atacatcgtacatgacatgttctctcttcttcggatatgaagagaacttgaggcataaa-gcaccagtagaggaagaaccgaatc 17900378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12801681 - 12801646
Alignment:
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatg 261  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12801681 gatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatg 12801646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 407
Target Start/End: Original strand, 13455671 - 13456055
Alignment:
Q  25 tttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455671 tttgttagaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 13455770  T
Q  124 attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455771 attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 13455870  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13455871 cggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttc 13455970  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13455971 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttca 13456055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 13461613 - 13461996
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461613 ttgttagaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 13461712  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13461713 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtcc 13461812  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttct 323  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13461813 ggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttct 13461912  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13461913 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttca 13461996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 36749988 - 36750370
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36749988 tgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 36750087  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36750088 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 36750187  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  36750188 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtctccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctc 36750287  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750288 cccatctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 36750370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 35085266 - 35084893
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085266 ttgttggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 35085167  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35085166 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtcc 35085067  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttct 323  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  35085066 ggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttct 35084967  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35084966 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatt 35084893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 27 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 35091238 - 35090866
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091238 tgttggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatgtgggtaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 35091139  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35091138 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatagactcaacatgagtggatgtccg 35091039  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35091038 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctc 35090939  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35090938 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatt 35090866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28683530 - 28683149
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  28683530 ttgttggaatattttattatttattatatcttaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgggccttagt 28683431  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28683430 tgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataaataattaaacatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgt 28683334  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28683333 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttc 28683234  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28683233 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgttaactctattgtgtgtttca 28683149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44717390 - 44717009
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  44717390 tgttggaatattttatgatttattatattccaatatcattatgtgggcacatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagtt 44717291  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  44717290 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatataattagttgatatggactta--atgagtggatgtc 44717194  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  44717193 cggatggcccattaacggaataatggaaaaccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactatctcttc 44717094  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44717093 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 44717009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 31001951 - 31002332
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31001951 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagtt 31002050  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31002051 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtc 31002147  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||    
T  31002148 cggatgacccattaacggaataatgggaaaccataatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacaacaatactctctcttc 31002247  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31002248 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttca 31002332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 30964901 - 30965283
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  30964901 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagt 30965000  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  30965001 tgattagtgatcaaattaagtaataagact-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggattca--atgagtggatgt 30965097  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  30965098 ccggatggcccattaacggaataatgggaaatcctaatggccatctaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctctt 30965197  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30965198 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttca 30965283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13150274 - 13149888
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  13150274 tgttggaatattttattatttattatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcattagtt 13150175  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  13150174 gattattgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgta 13150078  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  13150077 cggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatctaatataaaagaggttatggtccccaatataccgtacacggcaatattctctcttc 13149978  T
Q  323 tc-----cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149977 tcctcatctcatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 13149888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 391
Target Start/End: Original strand, 23343140 - 23343493
Alignment:
Q  30 tggaatattttattatta-ataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 128  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  23343140 tggaatattttattattttattatattctaatatcattatgtggacaaatatcataataataattatattaactatttatcaatttggagccttaattga 23343239  T
Q  129 ttagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||        || ||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  23343240 ttagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttctattt-agag-------taattaattaatggatatggactcaatataggtggatgtccggat 23343331  T
Q  229 gatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcccca 328  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23343332 gacccattaacagaataatgg-aaaccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgggaaactctctcttctcccca 23343430  T
Q  329 tctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23343431 tctgaagagaacttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaac 23343493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 87 - 407
Target Start/End: Original strand, 31007989 - 31008310
Alignment:
Q  87 aataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  |||||||     
T  31007989 aataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaa 31008087  T
Q  184 tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtct 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  31008088 tatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtccgaatgacccattaacggaataatgggaaaccataatggccatccaatataaaagaggct 31008185  T
Q  284 atggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagcc 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  31008186 atggtccccaatataccgtacacaacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaattagtc 31008285  T
Q  383 gccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31008286 gccgctaactctattgtgtgtttca 31008310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 389
Target Start/End: Original strand, 19879170 - 19879536
Alignment:
Q  29 ttggaatattttattatta-ataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattg 127  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19879170 ttggaatattttaatattttattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaataataactatattagctatttattaattgtgagccttagttg 19879269  T
Q  128 attagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||     
T  19879270 attagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataaataattaaatatttaattaattgatattgactcaa--tgagtgaatgtcc 19879366  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataa-----aagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaa-ctctct 318  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||     |||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  19879367 agatgacccattaacggaataatgggaaact-taatggccatccaatataacataaaagaggttatggtcgccaatacatcgtacacggcaaaactctct 19879465  T
Q  319 cttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgcta 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19879466 cttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaagaagaatcaaatcagccgccgcta 19879536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35439956 - 35439671
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  35439956 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattcgttatttatcaattgtgagccttgat 35439857  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  35439856 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgaactta--atgagtggatgt 35439760  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa 311  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35439759 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaa 35439671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 176 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11048988 - 11048776
Alignment:
Q  176 taattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataa 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11048988 taattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgggtggatgtctggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggcgatccaatataa 11048891  T
Q  276 aagagtctatggtccccaatacaccgtacatggca----aactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaa 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11048890 aagaggctatggtccccaatacatcgtacacggcaaaccaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccagttgaggaagaa 11048791  T
Q  372 ccaaatcagccgccg 386  Q
    |||||| || |||||    
T  11048790 ccaaattagtcgccg 11048776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35442402 - 35442187
Alignment:
Q  42 ttattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaat 141  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35442402 ttatttattatattccaatatcattatgtgggtaaatatcgtaacaataattatattcgctatttatcaattgtgagccttgattgattagtgatcaaat 35442303  T
Q  142 taagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaa 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35442302 taagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgtccggatgacccattaa 35442206  T
Q  239 cggaataatgggaaaccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  35442205 cggaataatggaaaaccct 35442187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 164
Target Start/End: Original strand, 23283821 - 23283955
Alignment:
Q  31 ggaatattttattatta-ataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgat 129  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23283821 ggaatattttattattttattatatttcaatatcattatgtggacaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttggagtcttaattgat 23283920  T
Q  130 tagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23283921 tagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatt 23283955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 302 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35439014 - 35438925
Alignment:
Q  302 tacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35439014 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 35438925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7771722 - 7771521
Alignment:
Q  76 aatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---t 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||   |    
T  7771722 aatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtaagtcttagttgattactgatcaaattaagtaataaagct-attagatttctaattggat 7771624  T
Q  173 agataattaattatttaattagttgata-tggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaat 271  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||   ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  7771623 aattaattaaatatttaattagttgatacgggactc--gatgagtggacgtccggatgacccattaacagaataatgggaaa-cctaatcgtcatccaat 7771527  T
Q  272 ataaaa 277  Q
    ||||||    
T  7771526 ataaaa 7771521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 379
Target Start/End: Original strand, 28765248 - 28765508
Alignment:
Q  118 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatt-taattagttgatatggactcaacatgagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| || | ||| || |||||||| |||| | ||||||    
T  28765248 gccttaattgattagtgatcaaattaaatgataaggctaattatatttttatttg-gataattaactaatataaataattgatatgaactcgatatgagt 28765346  T
Q  217 ggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactct 316  Q
    | |||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||| | |||||  |    
T  28765347 gaatgtatggatgactcatcaacggaataatggaaaactctaatggcgattcaatataaaagaggcaatggtccc-attacaccatacacgacaaacatt 28765445  T
Q  317 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatca 379  Q
     | ||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28765446 atattctctcattccgaagagaatttgaggcatcaaggtacctattgaggaagaaccaaatca 28765508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 391
Target Start/End: Original strand, 29832877 - 29833142
Alignment:
Q  124 attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaac----atgagt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || || ||   ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||     ||||||    
T  29832877 attgattagtgataaaattaagtaataagacta-ttagacttttaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgggaatgagt 29832975  T
Q  217 ggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactct 316  Q
    | ||||| | |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| |   ||||||||||||||||||   |||    |||||||    
T  29832976 gaatgtcagaatgacccatcaacagaataatgagaaaccctaatggtcattcgatataaatg---ctatggtccccaatacacg--aca----aaactct 29833066  T
Q  317 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaa-tcagccgccgctaac 391  Q
     | ||||| |  |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  29833067 atattctctctgtctgaagagaacttgaaggataaatgtatcggttgaggaagaaccaaatttagccgccgctaac 29833142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 391
Target Start/End: Original strand, 31651357 - 31651564
Alignment:
Q  176 taattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatc-caatata 274  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||     
T  31651357 taattaaatatttaattaattgatatggactcaa--tgagtcgatgtctagatgatccattaaaagaataatgggaaaccttaatgaccatcacaccat- 31651453  T
Q  275 aaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacca 374  Q
     |||||  || ||||||||||| ||||     |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||   ||| || ||||||||    
T  31651454 -aagaggttacggtccccaatataccg-----gcaaaactctttcttctccccatctgaagataacttgatatttaaaggtattagttaagaaagaacca 31651547  T
Q  375 aatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||| || ||||||||    
T  31651548 aatcaccctccgctaac 31651564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11049078 - 11049012
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataat 92  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11049078 tgttggaatattttattatttaattatattccaatattattatgtgggcaaatatcgtaataataat 11049012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 390
Target Start/End: Original strand, 29034697 - 29034759
Alignment:
Q  328 atctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29034697 atctgaagagaacttgagacataaaggtaccagttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaa 29034759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 260
Target Start/End: Original strand, 16361738 - 16361841
Alignment:
Q  157 attagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaaca-tgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaacc 255  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| | ||| |  || |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  16361738 attagatttctattt-agataattaattatataattaattgatatgaactcaatattgaatcaatatctggatgactcattaacggaacaatgtgaaacc 16361836  T
Q  256 ctaat 260  Q
    |||||    
T  16361837 ctaat 16361841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 279
Target Start/End: Original strand, 23284680 - 23284772
Alignment:
Q  187 ttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaaga 279  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23284680 ttaattaatggatattgactcaatatgggtggatgttctgatgacccattaacggaataatgtgaaactctaatggccatcaaatataaaaga 23284772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1388454 - 1388363
Alignment:
Q  176 taattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatc 267  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  1388454 taattaattttttaattaattgatatgaactcaatatgatttgatgtctagatgacacgttaacggaataatgagaaactccaatgatcatc 1388363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8342671 - 8342614
Alignment:
Q  128 attagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattat 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8342671 attagtgatcaaattaaataataagattaattagatttcta-attagataattaattat 8342614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 38731147 - 38731231
Alignment:
Q  65 ttatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgag-ccttaattgattagtgatcaaattaagtaa 148  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | || ||||||||||| || ||||||||||    
T  38731147 ttatgtggtcaaatatctttataataattatattagtcatttatcaatttggagtctttgattgattagtggtcgaattaagtaa 38731231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 407
Target Start/End: Original strand, 11976 - 12351
Alignment:
Q  34 atattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11976 atattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 12075  T
Q  133 tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  12076 tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcc 12175  T
Q  233 cattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctccccatct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12176 cattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatct 12275  T
Q  332 gaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12276 gaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 6096 - 6478
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  6096 tgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttaaagccttaat 6195  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6196 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 6295  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6296 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctc 6395  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6396 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 6478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 32896585 - 32896968
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896585 ttgttggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 32896684  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32896685 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtcc 32896784  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttct 323  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32896785 ggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttct 32896884  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896885 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 32896968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 32890461 - 32890844
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32890461 ttgttggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgacccttaa 32890560  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32890561 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtcc 32890660  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttct 323  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32890661 ggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttct 32890760  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890761 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 32890844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 36818546 - 36818927
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36818546 tgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 36818645  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36818646 tgattagtgatcaaattaagtaataaggttaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 36818745  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcc 325  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36818746 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctcc 36818845  T
Q  326 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36818846 ccatctgatgagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 36818927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42993585 - 42993207
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42993585 tgttggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatatgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaat 42993486  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  42993485 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc-c 42993387  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||   |||||    
T  42993386 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatcgccatccaatataaaagaggttatggtccccaatataccgaacacggcaatactct---ttctc 42993290  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993289 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 42993207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5542747 - 5542364
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  5542747 ttgttggaatattttattatttaataatattctat-atcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaa 5542649  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5542648 ttgattagtgatcaaattaagtaataagactaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatg 5542551  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctct 320  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5542550 tccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctct 5542451  T
Q  321 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542450 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 5542364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 9934857 - 9935234
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9934857 tgttggaatattttattatttaataatatttcaatatgattatgtgggtaaatattgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttaat 9934956  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9934957 tgattagtgatcaaattaagtaataaagctaattagatttctattttggataattaattatttaatttattgatatggactcaacatgagtggatatccg 9935056  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctcc 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  9935057 gatgacccattaacggaataatgggaaa-cctaatggccatccaa-ataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaaa--ctctcttctcc 9935152  T
Q  326 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9935153 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaatctattgtgtgtttca 9935234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 10699604 - 10699985
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    ||||||||||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10699604 tgttggaatagcttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatactagttatttatcaattgtgagccttaatt 10699703  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10699704 gattagtgatcaaattaagtaattaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtc 10699800  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  10699801 cggatgacccattaacggagtaatgggaaaccctaatggtcatcaaatataaaagagactatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttc 10699900  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699901 tctccatctgacgaaaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 10699985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22220312 - 22219931
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  22220312 ttgttggaatattttattactatta-tattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaatagttatattagctatttatcaatcgtaagccttagt 22220214  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  22220213 tgattagtgatcaaattaagtaataagggt-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgaatggatgt 22220117  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22220116 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctctt 22220017  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  22220016 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaactttattgtttgtttca 22219931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 391
Target Start/End: Original strand, 42033372 - 42033740
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033372 tgttggaatattttattatttattatatttcaatatcattatgcgggtaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 42033471  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42033472 gattagtgatcaaattaagtaataaggtta-ttagatttctaatt-agataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgt 42033567  T
Q  223 ctggatgatcc----attaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctct 318  Q
    | |||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  42033568 ccggatggcccgcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaggaggctatggtccccaatacattgtacacggcaaactctct 42033667  T
Q  319 cttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033668 cttctctccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 42033740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 10705412 - 10705793
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705412 ttgttggaatagtttgttatttattatattccaatatcattttgtgggcgaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 10705511  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10705512 tgattagtgatcaaattaagtaataaaact-attagatttctaattgaataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 10705608  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
    | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  10705609 ccggatggcccattaacggaataat-ggaaaccctaatagtcatcaaatataaaagaggctatggtctccaatataccgtacacgacaatactctctctt 10705707  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705708 ctccccatctgaagagaacttaagccataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 10705793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 14417535 - 14417896
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  14417535 ttgttggaatattttattatttattatataccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagt 14417634  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14417635 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattgaatatttaattagttgatatgggctca--atgagtggatg 14417730  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctctt 321  Q
    |  |||||  ||||||||| ||||||||||||                    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14417731 ttcggatgtcccattaacgaaataatgggaaa--------------------aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctctt 14417810  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14417811 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaaactattgtgtgtttca 14417896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 39736122 - 39735768
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39736122 tgttggaatattttattatttattatattccat-attattatgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagcattagtt 39736024  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  39736023 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atcagtggatgtc 39735927  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggc-aaactctctcttc 322  Q
     |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||         |||||||| | | |||||||||||||    
T  39735926 cggatgacccattaacggaataa-gggaaaccctaatggccatctaatataaaagaggctctggt---------accgtacacgacaaaactctctcttc 39735837  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  39735836 tccccatctgaagagtacttgaggcataaatgtaccagttaaggaagaatcaaatcagccgccgctaac 39735768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1883424 - 1883185
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  1883424 ttgttggaatattttattatttaattatattccaataatattatgcgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaatttggagccttac 1883325  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||  |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||     
T  1883324 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttctattt---agaat--attaattaattaatggatatggactcaatatgagtggatgtcc 1883230  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatcca 269  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1883229 ggatgacccattaacgaaataatgggaaaccttaatggccatcca 1883185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39727870 - 39727643
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  39727870 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagacttagt 39727771  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39727770 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attaaatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactca--atgagtggatgt 39727674  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaa 253  Q
    | ||||   |||||||||||| |||||||||    
T  39727673 ccggatagcccattaacggaacaatgggaaa 39727643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 17954099 - 17954316
Alignment:
Q  45 ttaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaatta- 143  Q
    ||||| ||||| |||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  17954099 ttaattatatttcaatgtcattttgtgggaaaatatctttataataattatattagctatttatcaatttggagacttaattgattagtgatcagattac 17954198  T
Q  144 ---agtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacg 240  Q
       ||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||| |||||    
T  17954199 taaagtaataagccta-ttagatttctatttaat-taattaattaattaattagttgatatggactcaaaatgagtggatgttcagatgacccactaacg 17954296  T
Q  241 gaataatgggaaaccctaat 260  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  17954297 gaataatggaaaaccctaat 17954316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 282 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1883148 - 1883039
Alignment:
Q  282 ctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagc 381  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1883148 ctatggtccccaatacacaatacacggcaaactttctcttctccccatctgaagagaacttgagacataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagc 1883049  T
Q  382 cgccgctaac 391  Q
    ||||||||||    
T  1883048 cgccgctaac 1883039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 283 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 39727637 - 39727528
Alignment:
Q  283 tatggtccccaatacaccgtacatggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagc 381  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727637 tatggtccccaatataccgtacacaacaaaactctctcttctccccatctcaagagtacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagc 39727538  T
Q  382 cgccgctaac 391  Q
     |||||||||    
T  39727537 agccgctaac 39727528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30890593 - 30890535
Alignment:
Q  110 aattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttcta 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30890593 aattgtgagtcttaattgattagtgatcaaattaattaataagactaattagatttcta 30890535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 193
Target Start/End: Original strand, 45365390 - 45365497
Alignment:
Q  85 ataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaatt 184  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  | |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  45365390 ataataattatattagttatctatcatatatgagtcttgattgattagtgattgaattaactaacaagtctaattagatttccattcga-ataattaatt 45365488  T
Q  185 atttaatta 193  Q
    |||||||||    
T  45365489 atttaatta 45365497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 391
Target Start/End: Original strand, 1171215 - 1171285
Alignment:
Q  307 ggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171215 ggcaaactctctcttctccccatctgaagagaact--------------accggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 1171285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 139
Target Start/End: Original strand, 33630872 - 33630941
Alignment:
Q  70 tgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaa 139  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||| ||||| |||||||    
T  33630872 tgggcaaatatctttataatatttatattagttatttataatttgagagtcttaatcgattaatgatcaa 33630941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 24287561 - 24287942
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24287561 tgttggaatattttattatttaataatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttataaattgtgagccttaat 24287660  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24287661 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaaatatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccg 24287760  T
Q  226 gatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctc 324  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24287761 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctat-gtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctc 24287859  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287860 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 24287942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10739926 - 10739543
Alignment:
Q  22 tattttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcct 121  Q
    |||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739926 tattttgttggaatattttatattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcct 10739827  T
Q  122 taattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtgg 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  10739826 tagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctgattggataattaattaagtatttgattagttgatatggactta--atgagtgg 10739730  T
Q  219 atgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctct 318  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10739729 atgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggtaaactctct 10739632  T
Q  319 cttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739631 cttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 10739543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10953695 - 10953312
Alignment:
Q  22 tattttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcct 121  Q
    |||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953695 tattttgttggaatattttatattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcct 10953596  T
Q  122 taattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtgg 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  10953595 tagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctgattggataattaattaagtatttgattagttgatatggactta--atgagtgg 10953499  T
Q  219 atgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctct 318  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10953498 atgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggtaaactctct 10953401  T
Q  319 cttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953400 cttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 10953312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Original strand, 48166752 - 48167134
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  48166752 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagt 48166851  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48166852 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 48166948  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  48166949 tcggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctctt 48167048  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  48167049 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttca 48167134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10733935 - 10733556
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10733935 ttgttggaatattttatattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagt 10733836  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10733835 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaagtatttgattagttgatatggactta--atgagtggatgt 10733739  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10733738 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttc 10733641  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10733640 tccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttca 10733556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10947704 - 10947325
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10947704 ttgttggaatattttatattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagt 10947605  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10947604 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaagtatttgattagttgatatggactta--atgagtggatgt 10947508  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10947507 ccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttc 10947410  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10947409 tccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttca 10947325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Original strand, 48160534 - 48160915
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48160534 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagtt 48160633  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  48160634 gattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtt 48160730  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  48160731 cggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttc 48160830  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  48160831 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttca 48160915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6257789 - 6257409
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6257789 tgttggaatattttatattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagtt 6257690  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||    
T  6257689 gattagtgatcaaattaagtaataaagct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatgggctca--atgagtggatatc 6257593  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6257592 cggatggcccattaacggaataat-ggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttc 6257494  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257493 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 6257409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 26 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26957389 - 26957023
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957389 ttgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 26957290  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26957289 taattagtgatcaaattaagtaataagact-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 26957193  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctctt 321  Q
    | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  26957192 ccggatggctcattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctctt 26957093  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26957092 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac 26957023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 27 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26972139 - 26971824
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26972139 tgttggaatattttattatttattatattccaatatcattatgtgggcaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaatt 26972040  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26972039 gattagtgatcaaattaagtgataaggat-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtc 26971943  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  26971942 tggatggtccattaacggaataat-ggaaaccctaatggccatccaatataaaagagactatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttc 26971844  T
Q  323 tccccatctgaagagaactt 342  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26971843 tccccatctgaagagaactt 26971824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 50168168 - 50168532
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50168168 ttgttggaatattttattatttaattatattccaataacattacgtcggaaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaa 50168267  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50168268 ttgattagtggtcaaatcaagtaacaaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatg 50168364  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctctt 321  Q
     | | |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  50168365 accgaatgacccattaacgaaataatggaaaaccctaatggtcattcaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgcaaaactctctttt 50168464  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  50168465 ctctccatctgaagagaacttgaggcataaaggtacc-gttgaggaagaactaaatcaaccgccgctaa 50168532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 391
Target Start/End: Original strand, 49976175 - 49976524
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||   |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  49976175 ttgtttgaatattttaatatttaattatatttcaatgacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaa 49976273  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||  |||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  49976274 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttttgttt-agaatattaattaattaattaatggatatggattcaatatgggtggatgtct 49976372  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctc 324  Q
    ||||||        || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||     | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49976373 ggatga--------cgtaataatggaaaaccctaatggccatccaatataaaagaggttatggtc-----tccaccgtacacggcaaactctctcttctc 49976459  T
Q  325 cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49976460 cccatctgaagagaacttgaggcataaa-gtacc-gttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 49976524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44832155 - 44831827
Alignment:
Q  71 gggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctatt 170  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||      
T  44832155 gggcaaatattgtaacaataattatattagttatttatcaattatagatcttagttgattagtgatcaaattaagtaataagg-ttataagattttta-a 44832058  T
Q  171 ttagataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccat 266  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  44832057 ttagataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtgcatgtccggatggtccattaacggaataattggaaaccctaatggtcat 44831960  T
Q  267 ccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgagg 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44831959 ccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgaaca----caactctctcttctccgcatccgaagagaacttgaggcataaaaataccggttgagg 44831864  T
Q  367 aagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgt 403  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  44831863 aagaaccacatcagccgtcgctaaccctattttgtgt 44831827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33461787 - 33461596
Alignment:
Q  216 tggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactc 315  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  33461787 tggatgtccggatgactcattaacgggataatgggaaaccctgatgatcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggtaaactc 33461688  T
Q  316 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33461687 tctcttctccccatctgaaaagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 33461596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 17627361 - 17627002
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  17627361 ttgttgaaatattttattatttaataatatttcgatatcattatgtgggaaaatatcgtaataataattatattagctatttatcgattgtgagtctgaa 17627262  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||    ||||| |||| || |||||||||||  ||||| ||||    
T  17627261 ttgattagtgattaaattaagtaataagcct-attagatttcca-attagataattaattaaatatttgattaattaatatggactca--atgaggggat 17627166  T
Q  221 gtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctct 320  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    |  |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||     || ||  |||||    
T  17627165 gtcaggatgacccattaacggaataattgaaaaccctaatggttgttaaatataaaagaggccatgatccccaatacacagta-----cacacattctct 17627071  T
Q  321 tctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgcta 389  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  17627070 tctccccatctgaagagaactagaagcataaaagtaccggttgaggaagaacaaaactagccgtcgcta 17627002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 216 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33458662 - 33458471
Alignment:
Q  216 tggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactc 315  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||     
T  33458662 tggatgtctggatggcccattaacgaaataatgcgaaaccctaacggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaaactt 33458563  T
Q  316 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33458562 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtatcggttgagaaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 33458471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 407
Target Start/End: Original strand, 35177413 - 35177754
Alignment:
Q  75 aaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtga----gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctatt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||      
T  35177413 aaatatcgtaataataattatattagatatttatcaattatgaacgagcattaattgattagtgatcaaattaagtaataaggct-gttagttttcta-a 35177510  T
Q  171 ttagataa----ttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccat 266  Q
    ||||||||    |||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||    
T  35177511 ttagataattatttaaatatttaatttgttgacatggactcaatacgagtgtatgtctggatgacctattaaaggaataatgagaaaccctaatggtcat 35177610  T
Q  267 ccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctc-tcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgag 365  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||   |||    || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  35177611 ccaatataaaagaggttatagtcctcaatacaccgtacacaacaataaatcatggtctcctcatctgaagagaacttgaggcataaatgtatcggttgag 35177710  T
Q  366 gaagaaccaaatcagccgccgctaactcta--ttgtgtgtttca 407  Q
     || || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35177711 aaataatcaaatcaggcgccgctaactctatgttgtgtgtttca 35177754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19686854 - 19686551
Alignment:
Q  78 tatcgtaataataattatat---tagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttag 174  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||| || |  |     
T  19686854 tatcgtaataataattatataattagctatttatcgattgtgtgtcttaattgattagtgatcaaattaaataataagactg-ttaaatttataataaa- 19686757  T
Q  175 ataattaatt----atttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaa 270  Q
    ||||||||||    ||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19686756 ataattaattgaatatttaattaattgatatgaactcaagc--agtggatgtctggatgacccattaacgaaataatgagaaaccctactgaccatccaa 19686659  T
Q  271 tataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 370  Q
    |||||||||| |||| || | ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  19686658 tataaaagagactatagt-ctcaatacatc--acaaggcaaactctctcttctcctcatcccaagagaaattgaggcataatggtaccggttgagaacga 19686562  T
Q  371 accaaatcagc 381  Q
    |||||||||||    
T  19686561 accaaatcagc 19686551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 176 - 390
Target Start/End: Original strand, 50155687 - 50155897
Alignment:
Q  176 taattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataa 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  50155687 taattaaatatttaattagttgatatggactc-----gagtggatgtccggatgatccattaacgaactaatgagaaaccataatgatcatccaatataa 50155781  T
Q  276 aagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctc-ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacca 374  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||    
T  50155782 aagaagttatggtccccaatacaccgtacacgcaaaactctctctttctcctcatctgaaaagaacttaaggcataaaggtaccagtcgagaaagaatca 50155881  T
Q  375 aatcagccgccgctaa 390  Q
    ||||||||||||||||    
T  50155882 aatcagccgccgctaa 50155897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 407
Target Start/End: Original strand, 4632192 - 4632337
Alignment:
Q  263 ccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggt 361  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4632192 ccatccaatataaaagaggttatggtccccaatatacagtacatgacaatactttctcttcttctcatctgaagagaacttgaggcataaagataccggt 4632291  T
Q  362 tgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||    
T  4632292 tgaggaagaaccaaatcagaagccgctaactatgttttgtgtttca 4632337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33461899 - 33461797
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33461899 tgttggaatattttattatttattatattccaatatctttatgtgggcaattatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagtt 33461800  T
Q  127 gat 129  Q
    |||    
T  33461799 gat 33461797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33458774 - 33458672
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  33458774 tgttggaatattttattatttattatattccaatatccttatgtgggcaattatcgtaacaataattatattaactatttatcaattgtgagccttagtt 33458675  T
Q  127 gat 129  Q
    |||    
T  33458674 gat 33458672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Original strand, 28704170 - 28704340
Alignment:
Q  90 aattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaattattt- 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||     
T  28704170 aattagattagctatttatcaattttaaccttttattgattactgatccaataaagcaaaattgctaattagatttttatttg-gataattaattatttt 28704268  T
Q  189 aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaat 260  Q
    |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28704269 aattaactgatatgaactcaatatgagtggatgtctggatgactcattaactgaataatgagaaaccctaat 28704340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 151
Target Start/End: Original strand, 50426879 - 50426946
Alignment:
Q  84 aataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50426879 aataataattatattagttatttatcaagtgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 50426946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 4631987 - 4632128
Alignment:
Q  64 attatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagat 163  Q
    |||||||| ||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4631987 attatgtgagcatatatctctatagtaattatattagttatttatcaatttgaagtcttaattgattagtaatcaaattaagtaataaggtttattagat 4632086  T
Q  164 ttctattttagataattaattatttaattagttgatatggact 206  Q
    |||||  |||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4632087 ttcta-cttagagtattaattaattaattagtggatatggact 4632128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 532170 - 532100
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattata 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  532170 tgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtaggcaaatatcgtaataataattata 532100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 392
Target Start/End: Original strand, 32284504 - 32284620
Alignment:
Q  276 aagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaa 375  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | ||||||  | | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  32284504 aagattctatggtccctaatacatcatacatgatatattctctattctcctcatctgaagaaaacttgaggcctaaaggtaccgatcgaggaagaaccaa 32284603  T
Q  376 atcagccgccgctaact 392  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  32284604 atcagtcgccactaact 32284620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 350 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10733507 - 10733450
Alignment:
Q  350 aaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10733507 aaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttca 10733450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 350 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10947276 - 10947219
Alignment:
Q  350 aaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10947276 aaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttca 10947219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Original strand, 3769434 - 3769509
Alignment:
Q  316 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3769434 tctcttctccctatctgaaaagaactataggcataaatatacgggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaac 3769509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Original strand, 9237081 - 9237262
Alignment:
Q  149 taaggctaattagatttctattttagataattaattatttaatt-agttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataat 247  Q
    |||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  9237081 taagactaattatatttctattgg-gataattaattatttaattgaagtgatatggactcta--tgagtggatgtctggatgaccaattaacgggataat 9237177  T
Q  248 gggaaaccctaatgaccatc-caatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaa 334  Q
     ||||||| ||||||||||| || |||  ||||| ||||| | |||||||||  ||||| | |||||||| | |||| ||||| ||||    
T  9237178 -ggaaaccttaatgaccatcacactat--aagaggctatgattcccaatacattgtacacgacaaactctttgttcttcccatttgaa 9237262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 392
Target Start/End: Original strand, 33045085 - 33045185
Alignment:
Q  292 caatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||| || | | || |||||||||||| |   |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  33045085 caatacaccgttcacgacgaattctctcttctccgcgattgaagagaacttgagatataaaagtaccggttgagaaagaactaaatcagccgccgttaac 33045184  T
Q  392 t 392  Q
    |    
T  33045185 t 33045185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19686936 - 19686851
Alignment:
Q  29 ttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattat-gtgggcaaatatcgtaataataattat---attagctatttatc 109  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  19686936 ttggagtattttattatttaattatatttcgatatcattattgtgggcaaatatcgtaataataattatataattagctatttatc 19686851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 413
Target Start/End: Original strand, 50427238 - 50427318
Alignment:
Q  333 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcatctcac 413  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  || |||||||| | || | |||||||| ||||    
T  50427238 aagagaagttgaggcataaatgtaccggttgagtaagaaccaaaccaatcgtcgctaactttgttctttgtttcatatcac 50427318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 391
Target Start/End: Original strand, 45236444 - 45236542
Alignment:
Q  293 aatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    ||||||||||||||| |  | | |||| |||| | ||||||| |||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  45236444 aatacaccgtacatgacgtattttctcgtctctctatctgaatagaacttgaaacagaaatgtatcggttgaggaagaaccaaattagctgccactaac 45236542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 173475 - 173094
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatta-ataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |    
T  173475 tgttggaatattttattattttattatattccaatattattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagcgatttatcaattgtgggtcttagt 173376  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  173375 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgt 173279  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 322  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  173278 ccggatgttctattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtatacggcaaactctctcttc 173179  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173178 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 173094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1772 - 1398
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaatt 126  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1772 tgttgaaatattttattatttattatatttcaatattattatgtgggtaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagtt 1673  T
Q  127 gattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1672 gattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtc 1576  T
Q  224 tggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttct 323  Q
     |||||| ||      |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||    
T  1575 cggatgaccc------ggaataatggaaaatcctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttct 1482  T
Q  324 ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1481 ccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtttca 1398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1184 - 823
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattattaataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  1184 ttgttggaatattttattatttattatataccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagt 1085  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  1084 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattgaatatttaattagttgatatgggctca--atgagtggatg 989  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctctt 321  Q
    |  |||||  ||||||||| ||||||||||||                    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  988 ttcggatgtcccattaacgaaataatgggaaa--------------------aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctctt 909  T
Q  322 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  908 ctccccatctgaagagaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaaactattgtgtgtttca 823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 338
Target Start/End: Original strand, 637 - 949
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  637 tgttggaatattttattatttaattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcataataataattatattagttatttatcaattgtgagcctcaat 736  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttagata----attaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  | |||||    ||||| ||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||    
T  737 tgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagattt-aaaatcagataattgattaaatatttaattaactgatatgtactca--atgagtgaatg 832  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctctt 321  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  833 tctagatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacactgtacacgacaaactctctctt 932  T
Q  322 ctccccatctgaagaga 338  Q
    |||||||||||||||||    
T  933 ctccccatctgaagaga 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 391
Target Start/End: Original strand, 950 - 1023
Alignment:
Q  318 tcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  950 tcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataacggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaac 1023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 13846 - 14121
Alignment:
Q  26 ttgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13846 ttgttggaatattttattatttaattatattccaatatcattatgtgggaaaatatagtaataataattatattagctatttatcaatcgtgagccttaa 13945  T
Q  125 ttgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  13946 ttgactagtgatcaaattaagtaataattct-attagatttgtaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggattca--atgagtggatg 14042  T
Q  222 tctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacacc 300  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14043 tccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtccccaatacacc 14121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 308
Target Start/End: Original strand, 5541 - 5824
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattatt-aataatattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5541 tgttggaatatttaattatttaattatattccgaaatcattttgtaggcaaatatcgctataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaat 5640  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5641 tgattagtgatcaaattaagtaatatgact-attagatttctaattcgataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatatgagtggatgt 5739  T
Q  223 ctggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatgg 308  Q
      |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5740 tcggatgacccattaacagaataatgggaaa-cctaacggccattcaatataaaagaggctatggttcccaatacatcgtacatgg 5824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 396
Target Start/End: Original strand, 5826 - 5889
Alignment:
Q  333 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 396  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  5826 aagataacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgtcgctaaccctat 5889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 372
Target Start/End: Original strand, 38002 - 38347
Alignment:
Q  27 tgttggaatattttattattaata-atattccaagatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaat 125  Q
    ||||| |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||| || || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | |||||||    
T  38002 tgttgaaatattttattatttaaacatattccaatgtcattatgtgagcgaaaatcataataataattttattagttatttatcaatttgaaaccttaat 38101  T
Q  126 tgattagtgatcaaattaagtaataaggctaa-ttagatttctattttagataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtct 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  38102 tgaatagtgatcaaattaagtaacaaggttaatttagatttctattcga-ataattaattatttaattaattgatatggacttaatatg-gtggatgtct 38199  T
Q  225 ggatgatccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatc-caatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaa-actctctcttc 322  Q
     ||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||  || || |||| |||    
T  38200 agatgaccgattaacggaataatagaaaaccctaatgatcatcacactat--aagaggttatggtctccaatacaccgtacatgataatacactctattc 38297  T
Q  323 tccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 372  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  38298 ttcccatctgaagagaacttgagacataaaggtatcagttgaggaagaac 38347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0449 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0449
Description:

Target: scaffold0449; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1329 - 1281
Alignment:
Q  61 atcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatc 109  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1329 atcattatatggacaaatatcgtaataataattatattagctatttatc 1281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1064 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1064
Description:

Target: scaffold1064; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 376
Target Start/End: Original strand, 1067 - 1298
Alignment:
Q  149 taaggctaattagatttctattttagataattaattatttaatt-agttgatatggactcaacatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataat 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||   |||| | ||||||| || || | |||||||| |||||    
T  1067 taaggctaattagatttcta-ttgggataattaattatttaattgaagtgatatggactc--tatgaatagatgtctagacgaccaattaacgggataat 1163  T
Q  248 gggaaaccctaatgaccatc-caatataaaagagtctatggtccccaatacaccgtacatggcaaactctctc--ttctcccc------atctgaagaga 338  Q
      |||||| ||||||||||| || |||  ||||| ||||| |  ||||||||  ||||| | |||||||||||  |||| |||      || ||||||||    
T  1164 -agaaaccttaatgaccatcacactat--aagagactatgatttccaatacattgtacacgacaaactctctctgttcttcccatttgaatatgaagaga 1260  T
Q  339 acttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaa 376  Q
    ||||||  |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  1261 acttgaaacataaatgtaccgattaaggaagaaccaaa 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University