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Alignment Overview

Query: NF1272_high_49 (Length: 313)

Name: NF1272_high_49
Description: NF1272
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1272_high_49
NF1272_high_49
[»] chr8 (102 HSPs)
chr8 (11-284)||(8762637-8762910)
chr8 (11-284)||(25834142-25834415)
chr8 (11-284)||(1944812-1945085)
chr8 (11-284)||(8160564-8160835)
chr8 (11-284)||(32846833-32847093)
chr8 (12-273)||(41531915-41532176)
chr8 (11-273)||(9473757-9474020)
chr8 (11-273)||(36778114-36778377)
chr8 (19-273)||(24055474-24055729)
chr8 (11-273)||(42244480-42244743)
chr8 (11-273)||(44380857-44381120)
chr8 (26-273)||(40586601-40586849)
chr8 (11-273)||(41158281-41158541)
chr8 (11-273)||(7390952-7391215)
chr8 (11-273)||(4464499-4464762)
chr8 (11-273)||(25618644-25618907)
chr8 (11-273)||(25345628-25345891)
chr8 (19-227)||(18375710-18375919)
chr8 (19-247)||(25361175-25361404)
chr8 (19-270)||(41978482-41978748)
chr8 (63-270)||(4465281-4465503)
chr8 (63-270)||(8162071-8162293)
chr8 (63-270)||(8761271-8761493)
chr8 (63-270)||(25835559-25835781)
chr8 (137-270)||(41157548-41157682)
chr8 (99-270)||(1943336-1943522)
chr8 (99-270)||(36777478-36777664)
chr8 (99-269)||(7390208-7390393)
chr8 (63-270)||(32844721-32844944)
chr8 (99-270)||(32846099-32846285)
chr8 (137-270)||(1944079-1944213)
chr8 (137-270)||(8161416-8161550)
chr8 (63-270)||(8761903-8762125)
chr8 (63-270)||(12761127-12761349)
chr8 (137-270)||(25835015-25835149)
chr8 (101-281)||(44381634-44381829)
chr8 (137-270)||(32845466-32845600)
chr8 (63-270)||(41532643-41532865)
chr8 (57-237)||(34894080-34894261)
chr8 (99-270)||(9473122-9473308)
chr8 (137-270)||(25619679-25619812)
chr8 (101-226)||(38295306-38295426)
chr8 (57-168)||(37588311-37588422)
chr8 (145-237)||(34894267-34894359)
chr8 (183-270)||(25346579-25346667)
chr8 (57-158)||(34894565-34894666)
chr8 (63-153)||(1944211-1944301)
chr8 (63-153)||(8161328-8161418)
chr8 (63-153)||(25834927-25835017)
chr8 (101-153)||(25619629-25619681)
chr8 (101-153)||(34894843-34894895)
chr8 (58-163)||(37588037-37588142)
chr8 (238-277)||(4465692-4465731)
chr8 (238-277)||(25615728-25615767)
chr8 (57-153)||(37588140-37588236)
chr8 (243-277)||(41533059-41533093)
chr8 (145-216)||(34894771-34894837)
chr8 (236-273)||(44381893-44381930)
chr8 (112-153)||(44428472-44428513)
chr8 (238-277)||(1943108-1943147)
chr8 (238-273)||(1943854-1943889)
chr8 (238-273)||(1944598-1944633)
chr8 (238-273)||(4465582-4465617)
chr8 (238-273)||(7390841-7390876)
chr8 (238-273)||(8161015-8161050)
chr8 (238-273)||(8161740-8161775)
chr8 (238-277)||(8162482-8162521)
chr8 (238-277)||(8761043-8761082)
chr8 (238-273)||(8762422-8762457)
chr8 (238-273)||(9473009-9473044)
chr8 (238-273)||(9473646-9473681)
chr8 (238-277)||(12760899-12760938)
chr8 (238-273)||(12761013-12761048)
chr8 (238-273)||(24250712-24250747)
chr8 (238-273)||(24254641-24254676)
chr8 (238-273)||(25345518-25345553)
chr8 (238-273)||(25618982-25619017)
chr8 (238-273)||(25619254-25619289)
chr8 (238-277)||(25620001-25620040)
chr8 (238-273)||(25834595-25834630)
chr8 (238-277)||(25835970-25836009)
chr8 (238-277)||(32844493-32844532)
chr8 (238-277)||(32845871-32845910)
chr8 (238-273)||(32846618-32846653)
chr8 (238-273)||(34893766-34893801)
chr8 (238-273)||(34893877-34893912)
chr8 (238-273)||(36777253-36777288)
chr8 (238-273)||(36777364-36777399)
chr8 (238-273)||(36778003-36778038)
chr8 (238-273)||(44381307-44381342)
chr8 (238-277)||(44381995-44382034)
chr8 (243-273)||(7390093-7390123)
chr8 (243-273)||(24250413-24250443)
chr8 (243-273)||(25345407-25345437)
chr8 (243-273)||(41532250-41532280)
chr8 (238-271)||(4464837-4464870)
chr8 (238-271)||(9473538-9473571)
chr8 (238-271)||(32845243-32845276)
chr8 (63-137)||(32845614-32845688)
chr8 (238-271)||(41157328-41157361)
chr8 (204-237)||(44428549-44428582)
chr8 (161-216)||(34894680-34894736)
[»] chr5 (106 HSPs)
chr5 (11-284)||(43136419-43136692)
chr5 (14-273)||(33704903-33705163)
chr5 (11-273)||(36884925-36885188)
chr5 (11-284)||(752200-752487)
chr5 (19-271)||(25695690-25695943)
chr5 (11-269)||(34719095-34719355)
chr5 (11-273)||(42975534-42975797)
chr5 (11-269)||(41692779-41693039)
chr5 (14-273)||(17636833-17637093)
chr5 (11-270)||(34725405-34725664)
chr5 (99-273)||(42976253-42976428)
chr5 (11-273)||(3086578-3086823)
chr5 (11-213)||(30181105-30181308)
chr5 (63-270)||(12419376-12419597)
chr5 (63-270)||(753742-753964)
chr5 (99-270)||(6304772-6304958)
chr5 (99-273)||(42976875-42977064)
chr5 (63-270)||(43137836-43138058)
chr5 (14-273)||(2182475-2182748)
chr5 (99-270)||(30180317-30180503)
chr5 (137-270)||(753087-753221)
chr5 (137-270)||(17637711-17637845)
chr5 (137-270)||(43137292-43137426)
chr5 (99-270)||(36885748-36885934)
chr5 (63-270)||(33705571-33705793)
chr5 (63-270)||(34717818-34718040)
chr5 (63-270)||(41691502-41691724)
chr5 (63-270)||(25696351-25696573)
chr5 (157-273)||(30755374-30755491)
chr5 (58-237)||(38937343-38937517)
chr5 (99-229)||(39915370-39915501)
chr5 (137-270)||(3087440-3087574)
chr5 (137-273)||(2181734-2181871)
chr5 (99-270)||(34726229-34726415)
chr5 (137-270)||(6304080-6304214)
chr5 (99-241)||(26601516-26601673)
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chr5 (57-168)||(16683415-16683526)
chr5 (57-225)||(16679796-16679959)
chr5 (61-223)||(16679639-16679796)
chr5 (205-273)||(36886005-36886073)
chr5 (63-153)||(752999-753089)
chr5 (63-153)||(43137204-43137294)
chr5 (106-153)||(3087395-3087442)
chr5 (61-153)||(3890316-3890408)
chr5 (58-153)||(3890198-3890293)
chr5 (116-153)||(6304045-6304082)
chr5 (60-153)||(41289947-41290040)
chr5 (106-153)||(17637667-17637713)
chr5 (238-277)||(25696763-25696802)
chr5 (238-277)||(30180089-30180128)
chr5 (238-277)||(34717590-34717629)
chr5 (238-277)||(34726604-34726643)
chr5 (98-153)||(41289874-41289929)
chr5 (236-273)||(18241912-18241949)
chr5 (234-271)||(30181060-30181097)
chr5 (105-153)||(35394124-35394172)
chr5 (238-273)||(752667-752702)
chr5 (238-273)||(753411-753446)
chr5 (238-277)||(754153-754192)
chr5 (238-273)||(2181624-2181659)
chr5 (238-273)||(3086899-3086934)
chr5 (238-273)||(3087017-3087052)
chr5 (238-273)||(3087127-3087162)
chr5 (238-273)||(3087653-3087688)
chr5 (238-273)||(6304404-6304439)
chr5 (238-277)||(6305147-6305186)
chr5 (238-273)||(12419198-12419233)
chr5 (238-273)||(12419676-12419711)
chr5 (57-153)||(16679546-16679641)
chr5 (136-217)||(16683529-16683605)
chr5 (238-273)||(17637169-17637204)
chr5 (238-273)||(17637397-17637432)
chr5 (238-273)||(19123720-19123755)
chr5 (238-273)||(19123830-19123865)
chr5 (238-273)||(25696022-25696057)
chr5 (238-273)||(25696132-25696167)
chr5 (238-273)||(30180203-30180238)
chr5 (238-273)||(30180726-30180761)
chr5 (238-273)||(33705239-33705274)
chr5 (238-277)||(33705980-33706019)
chr5 (238-273)||(34725743-34725778)
chr5 (238-273)||(39914611-39914646)
chr5 (238-273)||(41290254-41290289)
chr5 (238-273)||(42692374-42692409)
chr5 (238-273)||(42976614-42976649)
chr5 (238-273)||(43136872-43136907)
chr5 (238-277)||(43138247-43138286)
chr5 (99-141)||(2181881-2181923)
chr5 (243-273)||(2182364-2182394)
chr5 (58-153)||(3890086-3890181)
chr5 (243-273)||(25696657-25696687)
chr5 (243-273)||(34717704-34717734)
chr5 (243-273)||(34725859-34725889)
chr5 (243-273)||(41691390-41691420)
chr5 (243-273)||(42976509-42976539)
chr5 (236-273)||(6304512-6304549)
chr5 (238-271)||(30180838-30180871)
chr5 (238-271)||(30180949-30180982)
chr5 (238-271)||(35393330-35393363)
chr5 (238-271)||(35393955-35393988)
chr5 (238-271)||(42975990-42976023)
chr5 (238-270)||(33705870-33705902)
chr5 (245-273)||(34718337-34718365)
chr5 (245-273)||(41692021-41692049)
chr5 (238-270)||(42692597-42692629)
[»] chr4 (128 HSPs)
chr4 (11-284)||(8988825-8989098)
chr4 (11-284)||(37351725-37351998)
chr4 (11-273)||(37356635-37356897)
chr4 (11-284)||(29713449-29713722)
chr4 (11-262)||(50042983-50043234)
chr4 (11-229)||(8964513-8964731)
chr4 (11-273)||(17741297-17741560)
chr4 (11-273)||(47555570-47555832)
chr4 (11-271)||(39713640-39713901)
chr4 (11-270)||(13172586-13172846)
chr4 (11-273)||(3758914-3759177)
chr4 (19-270)||(36741952-36742204)
chr4 (11-269)||(52802571-52802831)
chr4 (11-273)||(24549057-24549320)
chr4 (14-270)||(12680782-12681039)
chr4 (11-284)||(39404736-39405023)
chr4 (11-273)||(46106056-46106319)
chr4 (11-270)||(9887415-9887688)
chr4 (11-273)||(2117824-2118087)
chr4 (11-284)||(43023642-43023924)
chr4 (52-273)||(5755232-5755454)
chr4 (14-282)||(24944281-24944564)
chr4 (99-270)||(39405567-39405739)
chr4 (14-269)||(50118215-50118471)
chr4 (11-273)||(8531847-8532124)
chr4 (19-257)||(20590653-20590893)
chr4 (63-270)||(20589956-20590178)
chr4 (63-270)||(9888209-9888431)
chr4 (101-270)||(29712957-29713127)
chr4 (63-257)||(43022423-43022619)
chr4 (63-270)||(8987459-8987681)
chr4 (63-270)||(37350359-37350581)
chr4 (99-273)||(50118924-50119113)
chr4 (63-270)||(2117084-2117306)
chr4 (137-270)||(24548307-24548441)
chr4 (63-270)||(24947566-24947788)
chr4 (63-270)||(46105159-46105381)
chr4 (63-270)||(47556239-47556461)
chr4 (58-229)||(37061523-37061695)
chr4 (63-270)||(8988091-8988313)
chr4 (63-270)||(37350991-37351213)
chr4 (63-270)||(39714357-39714578)
chr4 (100-227)||(37061777-37061905)
chr4 (61-229)||(42349534-42349703)
chr4 (99-273)||(43022917-43023099)
chr4 (137-270)||(3758272-3758406)
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chr4 (58-237)||(26602642-26602816)
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[»] chr7 (91 HSPs)
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[»] chr2 (75 HSPs)
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Alignment Details
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Name: chr8
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Target: chr8; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 8762910 - 8762637
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||    
T  8762910 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatttttccctagatttaac 8762811  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8762810 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 8762711  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8762710 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 8762637  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 25834142 - 25834415
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  25834142 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 25834241  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834242 ctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 25834341  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834342 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 25834415  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1945085 - 1944812
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  1945085 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 1944986  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1944985 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaatcgttcctaat 1944886  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944885 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 1944812  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 8160564 - 8160835
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  8160564 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 8160663  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8160664 ctaacttatttgcttaatttta--gcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 8160761  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8160762 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 8160835  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32847093 - 32846833
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||       || ||||||||||||    
T  32847093 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaactcgaaagcaaaaattttccctagatttaac 32846994  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32846993 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgtta-------------gggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 32846907  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32846906 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 32846833  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 41531915 - 41532176
Alignment:
Q  12 acagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||       |  |||| |||||||     
T  41531915 acagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctaaatttaacc 41532014  T
Q  112 taacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41532015 taacttctttgcttaattttattgtattaaccttatttaatttaattaaaatgtaaacgttaattgttagggaaatcaacataaaaaatcgctcctaatt 41532114  T
Q  212 tttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41532115 tttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 41532176  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9474020 - 9473757
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |       |  || |||||||||    
T  9474020 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttgcccaagatttaac 9473921  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9473920 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 9473821  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473820 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9473757  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36778377 - 36778114
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || |||||||||    
T  36778377 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaac 36778278  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36778277 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 36778178  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36778177 tttttctccttaattttactatacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36778114  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24055729 - 24055474
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||       |  || ||||||||| |||||||    
T  24055729 ctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaactcgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttc 24055630  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24055629 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctc 24055530  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24055529 cttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24055474  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 42244480 - 42244743
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||        |  || |||||||||    
T  42244480 cacagagtctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaaccggaacgtaaaattttacccaagatttaac 42244579  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42244580 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgtcaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 42244679  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42244680 tttttctccttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 42244743  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 44380857 - 44381120
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |   |||||||||||    
T  44380857 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgctctagatttaac 44380956  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44380957 ctaacttttttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttacggaaatcaaactaaacaaatcgctcctaa 44381056  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44381057 tttttctccttaattttactaagcaaattatattaaccctagatttaatttattcaaaatgtca 44381120  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 40586601 - 40586849
Alignment:
Q  26 actacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgctt 125  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||       |  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  40586601 actacatgaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaactcgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgctt 40586700  T
Q  126 aattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaatt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40586701 aattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgcttctaatttttctccttaatt 40586800  T
Q  225 ttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40586801 ttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 40586849  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41158541 - 41158281
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  41158541 cacagagcctaaagcactacataaaaaacaacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 41158442  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41158441 ctaacttctttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatg--aacgttaatt-ttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataa 41158345  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41158344 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 41158281  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7391215 - 7390952
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |  | ||||||||||    
T  7391215 cacagagcctagagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccatagatttaac 7391116  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  7391115 ttaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 7391016  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7391015 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctatatttaatttatgcaaaatgtca 7390952  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 4464499 - 4464762
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||        |  | ||||||||||    
T  4464499 cacagagcctaaagcactgcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaattcgaacgtaaaattttgccatagatttaac 4464598  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  4464599 ataacttctctgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattggtagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 4464698  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4464699 tttttctccttaattttactaatcaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 4464762  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 25618644 - 25618907
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||  | || ||       |  ||||||||||||    
T  25618644 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaattcaaatgcaaaattttgccctagatttaac 25618743  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  25618744 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgtaaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 25618843  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25618844 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 25618907  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25345891 - 25345628
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||| ||||||| | |||| |       |  ||||||||||||    
T  25345891 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttgaagttaatctgaacacaaaattttgccctagatttaac 25345792  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||    
T  25345791 ctaacttctttgcttaattttactgtattaacactatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcaaataa 25345692  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25345691 attttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatgtatgcaaaatgtca 25345628  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 18375710 - 18375919
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||||    
T  18375710 ctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttc 18375809  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18375810 tttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctc 18375909  T
Q  218 cttaatttta 227  Q
    ||||||||||    
T  18375910 cttaatttta 18375919  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25361404 - 25361175
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||       |  || | ||||||| |||||||    
T  25361404 ctaaaacactacataaaaaataacataacaactgttctaatatcttattccttaaagttaacccgaaggcaaaattttgcccaaaatttaacctaacttc 25361305  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25361304 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctc 25361205  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25361204 cttaattttactaaacaaattatattaacc 25361175  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41978748 - 41978482
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |       |  ||||  |||||| |||||||    
T  41978748 ctaaagcactacataaaaaattacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacacagaattttgccctaattttaacctaacttc 41978649  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgc 203  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41978648 ttcgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgc 41978549  T
Q  204 tcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978548 tcataatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 41978482  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 4465281 - 4465503
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  4465281 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 4465380  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4465381 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 4465480  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4465481 ctatatttaatttatgcaaaatg 4465503  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 8162071 - 8162293
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  8162071 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 8162170  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8162171 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 8162270  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8162271 ctagatttaatttatgcaaaatg 8162293  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8761493 - 8761271
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  8761493 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 8761394  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8761393 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 8761294  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8761293 ctagatttaatttatgcaaaatg 8761271  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 25835559 - 25835781
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  25835559 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 25835658  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25835659 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 25835758  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25835759 ctagatttaatttatgcaaaatg 25835781  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41157682 - 41157548
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41157682 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 41157583  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41157582 attatattaaccttagatttaatttatgcaaaatg 41157548  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1943522 - 1943336
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||              |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1943522 cctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 1943423  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1943422 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 1943336  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36777664 - 36777478
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta--------------atcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36777664 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 36777565  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36777564 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 36777478  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7390393 - 7390208
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7390393 cctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 7390294  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7390293 aatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaat 7390208  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32844944 - 32844721
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  32844944 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 32844845  T
Q  154 -----taatcaaaa-tgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaac 246  Q
         ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32844844 taatttaatcaaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaac 32844745  T
Q  247 cctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32844744 cctagatttaatttatgcaaaatg 32844721  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32846285 - 32846099
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||              |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32846285 cctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 32846186  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32846185 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttttctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 32846099  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1944213 - 1944079
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  1944213 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcttaatttttctctttaattttattaaacat 1944114  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944113 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 1944079  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 8161416 - 8161550
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  8161416 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacat 8161515  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8161516 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 8161550  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8762125 - 8761903
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctattt------------- 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  8762125 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 8762026  T
Q  150 -aatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  8762025 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaacc 8761926  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8761925 ctagatttaatttatgcaaaatg 8761903  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12761349 - 12761127
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctattt------------- 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||                 
T  12761349 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttgtttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 12761250  T
Q  150 -aatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12761249 taatttaattaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 12761150  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12761149 ctagatttaatttatgcaaaatg 12761127  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 25835015 - 25835149
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  25835015 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacat 25835114  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25835115 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 25835149  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 281
Target Start/End: Original strand, 44381634 - 44381829
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaa 186  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  44381634 tagatttaacctaatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaacctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggata 44381733  T
Q  187 tcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcattt 281  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||    
T  44381734 tcaaaataaacaaatcggtcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgtaaaatggcatctcattt 44381829  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32845600 - 32845466
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  32845600 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacat 32845501  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32845500 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 32845466  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 41532643 - 41532865
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||       | || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41532643 ttatttcttaaaattaacccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttttttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 41532742  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41532743 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgtttctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 41532842  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  41532843 ttatatttaatttatgcaaaatg 41532865  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34894261 - 34894080
Alignment:
Q  57 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||       |  | || ||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34894261 aatctcttattccttaaagttaaaccgaacgcaaaattttgccttaaatttaacctaatttccttgcttaaatttactatattaacactatttaatttaa 34894162  T
Q  157 tcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34894161 tcaaaatcttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgctcataatttttctccttaattttactaaacaaat 34894080  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9473308 - 9473122
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta--------------atcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |              |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9473308 cctagaattaacttaacttctttgcttaattttattgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttcggga 9473209  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9473208 aatcaaaataaacaaatcgttcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaagttatgcaaaatg 9473122  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 25619679 - 25619812
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  25619679 attaaccctgtttaatttaatcgaa-tgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaatag 25619777  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25619778 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatg 25619812  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38295426 - 38295306
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaa 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||| | |||||     
T  38295426 tagatttaacctaacttctttgctgaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatg------ttaattgttatggaaatcaaagtaaacaat 38295333  T
Q  200 tcgctcctaatttttctccttaatttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38295332 tcgctcctaatttttctccttaatttt 38295306  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Original strand, 37588311 - 37588422
Alignment:
Q  57 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37588311 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgccaaattttgccctagatttaacctaactcctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaa 37588410  T
Q  157 tcaaaatgttaa 168  Q
    ||||||||||||    
T  37588411 tcaaaatgttaa 37588422  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34894359 - 34894267
Alignment:
Q  145 tatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34894359 tatttaatttaatcaaaattttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 34894267  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25346667 - 25346579
Alignment:
Q  183 gaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25346667 gaaatcaaaataaacaaatatctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 25346579  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34894666 - 34894565
Alignment:
Q  57 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||        |  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34894666 aatctcttattccttaaagttaacctgaacgtaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaaccctatttaatttaa 34894567  T
Q  157 tc 158  Q
    ||    
T  34894566 tc 34894565  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1944301 - 1944211
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944301 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 1944211  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 153
Target Start/End: Original strand, 8161328 - 8161418
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8161328 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 8161418  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 153
Target Start/End: Original strand, 25834927 - 25835017
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834927 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 25835017  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 25619629 - 25619681
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25619629 tagatttaacctaacttatttgcttaagtttactgtattaaccctatttaatt 25619681  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34894895 - 34894843
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34894895 tagatttaacctaacttctttgtttaaatttactatattaaccctatttaatt 34894843  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Original strand, 37588037 - 37588142
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaat 157  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||        | || |||||||||| |||||  ||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  37588037 atctcttattcattaaagttaatccgaacgtaaaattttgtcatagatttaacctaactctttttcttaattttattatattaaccttatttaatttaat 37588136  T
Q  158 caaaat 163  Q
    ||||||    
T  37588137 caaaat 37588142  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 4465692 - 4465731
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4465692 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 4465731  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 25615728 - 25615767
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25615728 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 25615767  T

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Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 153
Target Start/End: Original strand, 37588140 - 37588236
Alignment:
Q  57 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||       |  |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37588140 aatctcttattcattaaagttaatccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaactcattttcttaattttactatattaaccatatttaatt 37588236  T

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Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Original strand, 41533059 - 41533093
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41533059 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 41533093  T

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Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34894837 - 34894771
Alignment:
Q  145 tatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34894837 tatttaatttaatcaaaatgttaa------ttgttatggaaatcaaaatgaacaaattgctcctaatttttct 34894771  T

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Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Original strand, 44381893 - 44381930
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44381893 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 44381930  T

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Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 153
Target Start/End: Original strand, 44428472 - 44428513
Alignment:
Q  112 taacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44428472 taacttctttgcttaattttactatattaaccatatttaatt 44428513  T

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Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1943147 - 1943108
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1943147 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 1943108  T

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Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1943889 - 1943854
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1943889 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 1943854  T

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Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1944633 - 1944598
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944633 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 1944598  T

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Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 4465582 - 4465617
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4465582 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4465617  T

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Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7390876 - 7390841
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7390876 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 7390841  T

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Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 8161015 - 8161050
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8161015 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8161050  T

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Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 8161740 - 8161775
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8161740 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8161775  T

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Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 8162482 - 8162521
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8162482 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 8162521  T

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Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8761082 - 8761043
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761082 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 8761043  T

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Target: chr8; HSP #69
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8762457 - 8762422
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8762457 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8762422  T

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Target: chr8; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9473044 - 9473009
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473044 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9473009  T

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Target: chr8; HSP #71
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9473681 - 9473646
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473681 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9473646  T

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Target: chr8; HSP #72
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Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12760938 - 12760899
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12760938 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcagctc 12760899  T

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Target: chr8; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12761048 - 12761013
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12761048 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 12761013  T

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Target: chr8; HSP #74
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 24250712 - 24250747
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250712 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24250747  T

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Target: chr8; HSP #75
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 24254641 - 24254676
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24254641 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24254676  T

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Target: chr8; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25345553 - 25345518
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25345553 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 25345518  T

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Target: chr8; HSP #77
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 25618982 - 25619017
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25618982 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 25619017  T

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Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 25619254 - 25619289
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25619254 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 25619289  T

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Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 25620001 - 25620040
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25620001 tatattaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcagctc 25620040  T

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Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 25834595 - 25834630
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834595 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 25834630  T

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Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 25835970 - 25836009
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25835970 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 25836009  T

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Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32844532 - 32844493
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32844532 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 32844493  T

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Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32845910 - 32845871
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32845910 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 32845871  T

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Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32846653 - 32846618
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32846653 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 32846618  T

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Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34893801 - 34893766
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34893801 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 34893766  T

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Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34893912 - 34893877
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34893912 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 34893877  T

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Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36777288 - 36777253
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36777288 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36777253  T

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Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36777399 - 36777364
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36777399 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36777364  T

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Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36778038 - 36778003
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36778038 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36778003  T

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Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 44381307 - 44381342
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44381307 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 44381342  T

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Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 44381995 - 44382034
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44381995 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcggctc 44382034  T

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Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7390123 - 7390093
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7390123 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 7390093  T

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Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 24250413 - 24250443
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250413 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24250443  T

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Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25345437 - 25345407
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25345437 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 25345407  T

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Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 41532250 - 41532280
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41532250 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 41532280  T

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Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Original strand, 4464837 - 4464870
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4464837 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 4464870  T

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Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9473571 - 9473538
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473571 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 9473538  T

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Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32845276 - 32845243
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32845276 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 32845243  T

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Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32845688 - 32845614
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgta 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  32845688 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgta 32845614  T

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Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41157361 - 41157328
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157361 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 41157328  T

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Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 237
Target Start/End: Original strand, 44428549 - 44428582
Alignment:
Q  204 tcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44428549 tcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 44428582  T

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Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34894736 - 34894680
Alignment:
Q  161 aatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttct 216  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  34894736 aatgttaatgttaattgttatggaaatcaaaatgaacaaattgctcctcatttttct 34894680  T

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Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 106)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 43136419 - 43136692
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  43136419 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 43136518  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43136519 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 43136618  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43136619 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 43136692  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 33704903 - 33705163
Alignment:
Q  14 agagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||    
T  33704903 agagtctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccta 33705002  T
Q  114 acttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaattt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33705003 acttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 33705102  T
Q  213 ttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33705103 ttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 33705163  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 36884925 - 36885188
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || |||||||||    
T  36884925 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaac 36885024  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36885025 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaaggttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 36885124  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36885125 tttttctccttaattttactaaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36885188  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 752200 - 752487
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  752200 cacagagtctaaaacactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 752299  T
Q  111 ataacttcttt--------------gcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataac 196  Q
     |||||| |||              |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  752300 ctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaataac 752399  T
Q  197 aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  752400 aaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgccagctcatttata 752487  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 271
Target Start/End: Original strand, 25695690 - 25695943
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||||    
T  25695690 ctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttc 25695789  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25695790 tttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctc 25695889  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25695890 cttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 25695943  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34719355 - 34719095
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  34719355 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 34719256  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34719255 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 34719156  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34719155 tttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 34719095  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 42975534 - 42975797
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || | |||||||    
T  42975534 cacagagcctaaaatactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaaaatttaac 42975633  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42975634 ctaacttctttgcttaattttattgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 42975733  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42975734 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 42975797  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41693039 - 41692779
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  41693039 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 41692940  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41692939 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 41692840  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41692839 tttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 41692779  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 17636833 - 17637093
Alignment:
Q  14 agagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacata 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| | || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||       |  || ||||||||||||    
T  17636833 agagcctaaaacactacataaaaaataacatgacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaattttgcccaagatttaacata 17636932  T
Q  114 acttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaattt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17636933 acttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttcgggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaattt 17637032  T
Q  213 ttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17637033 ttctccttaattttactaaacaagttatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 17637093  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Original strand, 34725405 - 34725664
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |       | || ||||||||||    
T  34725405 cacagagcctaaagcactgcataaaaa-taacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaatccgaacacaaaattttgtcatagatttaac 34725503  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  34725504 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 34725603  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  34725604 tttttctccttaattttactaagcaaattatattaactctggatctaatttatgcaaaatg 34725664  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Original strand, 42976253 - 42976428
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42976253 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaca 42976352  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42976353 aatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 42976428  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 3086578 - 3086823
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||             | |||||||    
T  3086578 cacagagtctaaaacactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgca------------aaatttaac 3086665  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3086666 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa------ttgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 3086759  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3086760 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 3086823  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30181308 - 30181105
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  30181308 cacagagcctaaaacactgcataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 30181209  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30181208 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaattaaacaaatcgctcctaa 30181109  T
Q  210 tttt 213  Q
    ||||    
T  30181108 tttt 30181105  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 12419376 - 12419597
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  12419376 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaacccattt 12419475  T
Q  154 ----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccc 248  Q
        |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12419476 aatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccc 12419575  T
Q  249 tagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12419576 tagatttaatttatgcaaaatg 12419597  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 753742 - 753964
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  753742 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 753841  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  753842 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 753941  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  753942 ctagatttaatttatgcaaaatg 753964  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 6304772 - 6304958
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6304772 cctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccatatttaattaacattgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 6304871  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304872 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 6304958  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Original strand, 42976875 - 42977064
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta--------------atcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42976875 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 42976974  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42976975 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 42977064  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 43137836 - 43138058
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  43137836 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaactttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 43137935  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43137936 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 43138035  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43138036 ctagatttaatttatgcaaaatg 43138058  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2182748 - 2182475
Alignment:
Q  14 agagtctaaagcactacataaaaaa-taacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacat 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||       |  |||||||||||| |    
T  2182748 agagcctaaagcactacagaaaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaatatgaacgcaaaattttgccctagatttaacct 2182649  T
Q  113 aacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2182648 aacttctttgcttaattttcctgtattaaccctatttaattaactctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaaca 2182549  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  2182548 aatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaa-tctagatttaa-ttatgtaaaatgtca 2182475  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30180503 - 30180317
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30180503 cctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtttaacttaaacaaaatgttaacgttaattgttaggga 30180404  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30180403 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatttaatttatgcaaaatg 30180317  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 753087 - 753221
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  753087 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacat 753186  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  753187 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 753221  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 17637711 - 17637845
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17637711 attaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 17637810  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17637811 attatattaaccctagatttaatttgtgcaaaatg 17637845  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 43137292 - 43137426
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  43137292 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacat 43137391  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137392 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 43137426  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 36885748 - 36885934
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta--------------atcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36885748 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttgatcaaaatgttaatgttaattgttaggga 36885847  T
Q  185 aatcaaaataac-aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36885848 aatcaaaataaataaatcgctcctaatttttctctttaattttactcaataaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 36885934  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 33705571 - 33705793
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaa----------- 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||        || | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  33705571 ttatttcttaaagttaacccgaacgtaaaatttttccatagattaaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaaataaccatgtt 33705670  T
Q  152 ---tttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
       |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33705671 taatttaatcaaaatgtaaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 33705770  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  33705771 ttatatttaatttatgcaaaatg 33705793  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34718040 - 34717818
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  34718040 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 34717941  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||    
T  34717940 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaataaattatattaacc 34717841  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  34717840 ttagatttaatttatgcaaaatg 34717818  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41691724 - 41691502
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41691724 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttgacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtt 41691625  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  41691624 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 41691525  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  41691524 ttagatttaatttatgcaaaatg 41691502  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 25696351 - 25696573
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  25696351 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaaatttgtcctagatttaacctaatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtt 25696450  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||    
T  25696451 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctcttaaaatttactaaacaaattatattaacc 25696550  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  25696551 ttagatttaatttatgcaaaatg 25696573  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30755491 - 30755374
Alignment:
Q  157 tcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagattt 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30755491 tcaaaatgttaacgttaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagattt 30755392  T
Q  256 aatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30755391 aatttatgcaaaatgtca 30755374  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38937517 - 38937343
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |  | |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38937517 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttacttaattttactatattaaccctatttaatttaat 38937418  T
Q  158 caaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    |||||||      |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38937417 caaaatg------ttaattgttatggaaatcgaaataaacaaatcgcccctaatttttctccttaattttactaaacaaat 38937343  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39915501 - 39915370
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39915501 cctagatttaacataacttatttgcttaaatttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgctaatgttaattggtagggaaatcaaaatgaaca 39915402  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttact 229  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39915401 aatcgctcctaattttttttcttaattttact 39915370  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 3087440 - 3087574
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3087440 attaaccatgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttggggaaatcaaaataaacaaatcactcttaatttttctctttaattttactaaacaa 3087539  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3087540 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 3087574  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2181871 - 2181734
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2181871 attaatcctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctctttaattttactaaacaa 2181772  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2181771 attatattagtcctggatttaatttatacaaaatgtca 2181734  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 34726229 - 34726415
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  34726229 cctagatttaacctaacttctttgctaaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaattttaacgttaattattaggga 34726328  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  34726329 aatcaaaataaacaaatcacttctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttatatttaatttatgcaaaatg 34726415  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 6304080 - 6304214
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataac-aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  6304080 attaatcctgtttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaataaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacat 6304179  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304180 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 6304214  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 241
Target Start/End: Original strand, 26601516 - 26601673
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctattta--------------atttaatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26601516 cctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaagga 26601615  T
Q  185 aatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattata 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26601616 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattata 26601673  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Original strand, 27440850 - 27440952
Alignment:
Q  136 tattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaaca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27440850 tattaaccctatttaatttaatcaaaatattaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgctcttaatttttctccttaattttactaaaca 27440949  T
Q  235 aat 237  Q
    |||    
T  27440950 aat 27440952  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16683526 - 16683415
Alignment:
Q  57 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16683526 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcataattttgccctagatttaacctaactcctttgcttaattttactatattaaccctatttaagttaa 16683427  T
Q  157 tcaaaatgttaa 168  Q
    ||||||||||||    
T  16683426 tcaaaatgttaa 16683415  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16679959 - 16679796
Alignment:
Q  57 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||       |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16679959 aatctcttattccttaaagttaatatgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaactcctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaa 16679860  T
Q  157 tcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattt 225  Q
    | ||||||      ||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16679859 ttaaaatg------ttaattgatgtggaaatcaaaataaacaaattgctcctaatttttctccttaattt 16679796  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16679796 - 16679639
Alignment:
Q  61 tcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaa 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||       |  ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16679796 tcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagattttacctaaatcgtttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaa 16679697  T
Q  161 aatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaat 223  Q
    ||||      ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16679696 aatg------ttaattgatgtggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaat 16679639  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 273
Target Start/End: Original strand, 36886005 - 36886073
Alignment:
Q  205 cctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36886005 cctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36886073  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 153
Target Start/End: Original strand, 752999 - 753089
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  752999 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 753089  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 153
Target Start/End: Original strand, 43137204 - 43137294
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137204 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 43137294  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 153
Target Start/End: Original strand, 3087395 - 3087442
Alignment:
Q  106 ttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3087395 ttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 3087442  T

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Target: chr5; HSP #45
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Q  61 tcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||       | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  3890316 tcttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttctttgcttaattttattattttaaccttatttaatt 3890408  T

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Target: chr5; HSP #46
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    |||||||||||||||| ||||||||||||||       |   |||||||||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3890198 atctcttattccttaatgttaacccgaacgcaaaattttgctctagatttaacccaaattctttgcttaattttactattttaaccctatttaatt 3890293  T

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Target: chr5; HSP #47
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    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
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Target: chr5; HSP #48
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Q  60 ctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||       |  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41289947 ctcttattctttaaagttaacccgaatgcaaatttttgccctatatttaacctaatttctttgcttaattttactattttaaccctatttaatt 41290040  T

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Target: chr5; HSP #49
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Q  106 ttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17637667 ttaacctaacttctttgcttaattttact-tattaaccctatttaatt 17637713  T

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Target: chr5; HSP #50
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    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25696763 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 25696802  T

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Target: chr5; HSP #51
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30180128 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 30180089  T

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Target: chr5; HSP #52
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717629 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 34717590  T

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Target: chr5; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 34726604 - 34726643
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34726604 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 34726643  T

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Target: chr5; HSP #54
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Query Start/End: Original strand, 98 - 153
Target Start/End: Original strand, 41289874 - 41289929
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Q  98 tcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  41289874 tcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactattttaactatatttaatt 41289929  T

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Target: chr5; HSP #55
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Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18241949 - 18241912
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Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18241949 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 18241912  T

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Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30181097 - 30181060
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Q  234 aaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181097 aaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 30181060  T

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Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35394172 - 35394124
Alignment:
Q  105 tttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35394172 tttaacataaattctatgcttacttttactgtattacccctatttaatt 35394124  T

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Target: chr5; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 752667 - 752702
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  752667 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 752702  T

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Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 753411 - 753446
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  753411 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 753446  T

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Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 754153 - 754192
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  754153 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 754192  T

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Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2181659 - 2181624
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181659 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 2181624  T

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Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 3086899 - 3086934
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3086899 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 3086934  T

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Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 3087017 - 3087052
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3087017 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 3087052  T

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Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 3087127 - 3087162
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3087127 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 3087162  T

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Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 3087653 - 3087688
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3087653 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 3087688  T

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Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 6304404 - 6304439
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304404 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 6304439  T

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Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 6305147 - 6305186
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6305147 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 6305186  T

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Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12419233 - 12419198
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12419233 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 12419198  T

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Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 12419676 - 12419711
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12419676 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 12419711  T

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Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16679641 - 16679546
Alignment:
Q  57 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||       |  |||||||||||  | | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16679641 aatctcttattccttaaagttaacccaaacgcaaaattttgccctagatttaaactta-tcatttgcttaattttactatattaaccctatttaatt 16679546  T

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Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16683605 - 16683529
Alignment:
Q  136 tattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16683605 tattaaccctatttaatttaattaaaatg------ttaattgatgtggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttctc 16683529  T

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Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 17637169 - 17637204
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17637169 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 17637204  T

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Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 17637397 - 17637432
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17637397 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 17637432  T

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Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19123755 - 19123720
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19123755 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19123720  T

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Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19123865 - 19123830
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19123865 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19123830  T

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Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 25696022 - 25696057
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25696022 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 25696057  T

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Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 25696132 - 25696167
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25696132 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 25696167  T

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Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30180238 - 30180203
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30180238 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 30180203  T

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Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30180761 - 30180726
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30180761 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 30180726  T

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Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 33705239 - 33705274
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33705239 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 33705274  T

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Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 33705980 - 33706019
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33705980 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 33706019  T

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Target: chr5; HSP #82
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 34725743 - 34725778
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725743 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 34725778  T

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Target: chr5; HSP #83
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39914646 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39914611  T

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Target: chr5; HSP #84
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 41290254 - 41290289
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41290254 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 41290289  T

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Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42692409 - 42692374
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42692409 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 42692374  T

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Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 42976614 - 42976649
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42976614 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 42976649  T

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Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 43136872 - 43136907
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43136872 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 43136907  T

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Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 43138247 - 43138286
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43138247 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 43138286  T

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Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2181923 - 2181881
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Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaa 141  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2181923 cctagatttaacctaacttatttgcttaattttaatgtattaa 2181881  T

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Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2182394 - 2182364
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2182394 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 2182364  T

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Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 153
Target Start/End: Original strand, 3890086 - 3890181
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||        |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  3890086 atctcttatttcttaaagttaatccaaacgtaaaaaaatttcatagatttgacctaacttttttgcttaattttactattttaaccctaattaatt 3890181  T

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Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 25696657 - 25696687
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25696657 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 25696687  T

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Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34717734 - 34717704
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717734 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 34717704  T

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Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 34725859 - 34725889
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725859 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 34725889  T

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Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41691420 - 41691390
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41691420 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 41691390  T

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Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 42976509 - 42976539
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42976509 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 42976539  T

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Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Original strand, 6304512 - 6304549
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6304512 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtca 6304549  T

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Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30180871 - 30180838
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30180871 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 30180838  T

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Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30180982 - 30180949
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30180982 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 30180949  T

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Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35393363 - 35393330
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35393363 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 35393330  T

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Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35393988 - 35393955
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35393988 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 35393955  T

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Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Original strand, 42975990 - 42976023
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42975990 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 42976023  T

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Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 270
Target Start/End: Original strand, 33705870 - 33705902
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33705870 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 33705902  T

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Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34718365 - 34718337
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34718365 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 34718337  T

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Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41692049 - 41692021
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41692049 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 41692021  T

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Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42692629 - 42692597
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42692629 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 42692597  T

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Target: chr4 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 128)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8989098 - 8988825
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  8989098 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 8988999  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8988998 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 8988899  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8988898 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 8988825  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37351998 - 37351725
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  37351998 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 37351899  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351898 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 37351799  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351798 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 37351725  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37356897 - 37356635
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  37356897 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 37356798  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356797 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 37356698  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356697 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 37356635  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29713722 - 29713449
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |  ||||||||||||    
T  29713722 cacagagtctaaaacactacataaaaaataaaataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccctagatttaac 29713623  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29713622 gtaacttctttgcttaattttattgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 29713523  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29713522 ttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 29713449  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 50043234 - 50042983
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  50043234 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 50043135  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50043134 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataataaatcgctcctaat 50043035  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttat 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50043034 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttat 50042983  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8964731 - 8964513
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  8964731 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 8964632  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8964631 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 8964532  T
Q  211 ttttctccttaattttact 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8964531 ttttctccttaattttact 8964513  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17741560 - 17741297
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||       || |||| |||||||    
T  17741560 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaaccggaacgcaaaatttttccctaaatttaac 17741461  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17741460 ctaacttctttgattaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 17741361  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17741360 tttttcttcttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgaaaattgtca 17741297  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 47555570 - 47555832
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||       | || ||||||||||    
T  47555570 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatcttttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgtcatagatttaac 47555669  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  47555670 ctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatattaacgttaattgtaagggaaataaaataaacaaatcgcttctaat 47555769  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47555770 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 47555832  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 39713640 - 39713901
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||    
T  39713640 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatttggccctagatttaac 39713739  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39713740 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 39713839  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39713840 tttatctccttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 39713901  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13172846 - 13172586
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || |||||||||    
T  13172846 cacagagcctaaaacattacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaac 13172747  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13172746 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 13172647  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13172646 tttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 13172586  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3759177 - 3758914
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || |||||||||    
T  3759177 cacagagcgtaaaacactaaataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaac 3759078  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3759077 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 3758978  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3758977 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 3758914  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 270
Target Start/End: Original strand, 36741952 - 36742204
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || ||||||||| |||||||    
T  36741952 ctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttc 36742051  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  36742052 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacttctaatttttctc 36742151  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36742152 cttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 36742204  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 52802831 - 52802571
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||       |  ||||||||||||    
T  52802831 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccaaacgctaaattttgccctagatttaac 52802732  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52802731 ctaacttctttgcttaattttacggtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 52802632  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52802631 tttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 52802571  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24549320 - 24549057
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||       || || |||||||||    
T  24549320 cacagagcctaaaacactacataacaaatgacataacaactattataatatcttattccttaaatttaacccgaatgcaaaatttttcccaagatttaac 24549221  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24549220 ctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 24549121  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549120 tttttctccttaattttactgaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24549057  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 12680782 - 12681039
Alignment:
Q  14 agagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacata 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |  | |||||||||| ||    
T  12680782 agagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccatagatttaaccta 12680881  T
Q  114 acttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaattt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  12680882 acttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcgcacgtaattt 12680981  T
Q  213 ttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12680982 ttctccttaattttactaaacaaattatattaactctatatttaatttatgcaaaatg 12681039  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 39404736 - 39405023
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||       |  ||||||||||||    
T  39404736 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgcaatcttttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttaccctagatttaac 39404835  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtatta--------------accctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataac 196  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  39404836 ctaatttctttgcttaattttactgtattacctctatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataat 39404935  T
Q  197 aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404936 aaattgttcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 39405023  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46106319 - 46106056
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |       |  ||||||||||||    
T  46106319 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacacaaaattttgccctagatttaac 46106220  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| | | |||    
T  46106219 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcacacataa 46106120  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  46106119 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatggaaaatgtca 46106056  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Original strand, 9887415 - 9887688
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  9887415 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 9887514  T
Q  111 ataacttcttt--------------gcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataac 196  Q
     |||||| |||              |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9887515 ctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaataac 9887614  T
Q  197 aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9887615 aaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 9887688  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2118087 - 2117824
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||       | || ||||||||||    
T  2118087 cacagagcctaaagcactgcataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaattcgaacgcaaaattttgtcatagatttaac 2117988  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  2117987 ataacttctctgcttaatattactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattggtagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 2117888  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2117887 tttttcttcttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 2117824  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43023924 - 43023642
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaa--taacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagattta 108  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||    
T  43023924 cacagagcctaaaacactacataaaaaaaataacataacaactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagattta 43023825  T
Q  109 acataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatca----aa---atgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatc 201  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |     ||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43023824 acctaacttctttgcttaatattactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatc 43023725  T
Q  202 gctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43023724 gctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattattttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctaatttata 43023642  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5755454 - 5755232
Alignment:
Q  52 attgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||       || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5755454 attgtaatctcttattccttaaagttaacttgaacgcaaattttttccctagatttaacctaacttctttgcttaactttactgtattaaccttatttaa 5755355  T
Q  152 tttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacccta 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5755354 tttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacccta 5755255  T
Q  251 gatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  5755254 ggtttaatttatgcaaaatgtca 5755232  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 24944281 - 24944564
Alignment:
Q  14 agagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacata 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||    
T  24944281 agagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctttaattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaaccta 24944380  T
Q  114 acttctttgcttaattttactgta--------------ttaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24944381 acttctttgcttaattttacagtactaaccctatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataagcaa 24944480  T
Q  199 atcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcattta 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24944481 atcgctcctaatttttatccttaattttactaaaaaaattatattaaccctacatttaatttatgcaaaatgtcagctcattta 24944564  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 39405567 - 39405739
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39405567 cctagatttaacctaaattctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaca 39405666  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39405667 aatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 39405739  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 50118215 - 50118471
Alignment:
Q  14 agagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacata 113  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||       |  || ||||||||| ||    
T  50118215 agagcctaaaacactatataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaatttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaaccta 50118314  T
Q  114 acttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaattt 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  50118315 acttctttacttaattttactgtattaaccctttttaatttaatgaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaattt 50118414  T
Q  213 ttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  50118415 ttctccttaattttactaaacaaatgatattaaccctatatttaatttatgcaaaat 50118471  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8532124 - 8531847
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||       |  ||||||||||||    
T  8532124 cacagagcctaaagtactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccctaaagttaactcgaacgcaaaattttgccctagatttaac 8532025  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa- 195  Q
     |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  8532024 ctaacttatttgtttaattttattgtattaaccctatttaattaacactatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaa 8531925  T
Q  196 caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8531924 caaatcgctcataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8531847  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20590893 - 20590653
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaa-taacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataactt 117  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||        |  || ||||||||| ||||||    
T  20590893 ctaaaacactacataaaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaaattaacccgaacgtaaaattttgcccaagatttaacctaactt 20590794  T
Q  118 ctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20590793 ctttgcttaattttactgtattaactctatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttct 20590694  T
Q  217 ccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaa 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20590693 ccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaa 20590653  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20590178 - 20589956
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  20590178 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 20590079  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20590078 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 20589979  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20589978 ctagatttaatttatgcaaaatg 20589956  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 9888209 - 9888431
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  9888209 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacattgtt 9888308  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9888309 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 9888408  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9888409 ctagatttaatttatgcaaaatg 9888431  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29713127 - 29712957
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaa 199  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29713127 tagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaa 29713028  T
Q  200 tcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||    
T  29713027 tcgctcctaatttttcactttaatgttactaaacaaattttattaaccctagatttaatttaagccaaatg 29712957  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43022619 - 43022423
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaa 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43022619 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatgtaacctaacttctttgtttaattttactgtattaaccctgtttaatttaatcaaaa 43022520  T
Q  163 tgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa--caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaa 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43022519 tgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaaatcgctcctaatttttcactttaattatactaaacaaattatattaaccctagatttaa 43022423  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8987681 - 8987459
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  8987681 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 8987582  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8987581 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 8987482  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8987481 ctagatttaatttatgcaaaatg 8987459  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37350581 - 37350359
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  37350581 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 37350482  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37350481 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 37350382  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37350381 ctagatttaatttatgcaaaatg 37350359  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Original strand, 50118924 - 50119113
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||              |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50118924 cctagaattaacataacttctttgcttaattttaccgtatcaaccctatttaattaaccatgtgtaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 50119023  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50119024 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 50119113  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2117306 - 2117084
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  2117306 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 2117207  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  2117206 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattgtactaaacaaattatattaacc 2117107  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  2117106 ctatatttaatttatgcaaaatg 2117084  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24548441 - 24548307
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24548441 attaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 24548342  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24548341 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 24548307  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 24947566 - 24947788
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  24947566 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctctt 24947665  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24947666 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgttcctaatttttctctttaattttactaaataaattatattaacc 24947765  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  24947766 ctatatttaatttatgcaaaatg 24947788  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 46105381 - 46105159
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  46105381 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 46105282  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaa-tcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  46105281 taatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 46105182  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  46105181 ctatatttaatttatgcaaaatg 46105159  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 47556239 - 47556461
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaa----------- 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||        || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  47556239 ttatttcttaaagttaacccgaacgtaaattttttccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaaataaccatgtt 47556338  T
Q  152 ---tttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47556339 taatttaatcaaaatattaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 47556438  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  47556439 ttatatttaatttatgcaaaatg 47556461  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 229
Target Start/End: Original strand, 37061523 - 37061695
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  37061523 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttatttgcttaattttactatattaatcatatttaatttaat 37061622  T
Q  158 caaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 229  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37061623 caaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 37061695  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8988313 - 8988091
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctattt------------- 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  8988313 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 8988214  T
Q  150 -aatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  8988213 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaacc 8988114  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8988113 ctagatttaatttatgcaaaatg 8988091  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37351213 - 37350991
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctattt------------- 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  37351213 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 37351114  T
Q  150 -aatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  37351113 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaacc 37351014  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37351013 ctagatttaatttatgcaaaatg 37350991  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 39714357 - 39714578
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  39714357 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 39714456  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccc 248  Q
         |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||     
T  39714457 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaatcgctcctaatttttctcttaaaatttactaaacaaattatattaacct 39714556  T
Q  249 tagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39714557 tagatttaatttatgcaaaatg 39714578  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 37061777 - 37061905
Alignment:
Q  100 ctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaa 198  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37061777 ctagatttaacctaaattctttgcttaattttactatattaatcctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaataa 37061876  T
Q  199 atcgctcctaatttttctccttaatttta 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37061877 atcgctcctaatttttctccttaatttta 37061905  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 229
Target Start/End: Original strand, 42349534 - 42349703
Alignment:
Q  61 tcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42349534 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaaccctatttaatttaatcaa 42349633  T
Q  161 aatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 229  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42349634 aatcttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcactcataatttttctccttagttttact 42349703  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43023099 - 43022917
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatca----aa---atgttaactttaattgttagggaaatcaaa 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |     ||   |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43023099 cctagatttaacctaacttctttgcttaatattactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttatgttaatgttaattgttagggaaatcaaa 43023000  T
Q  192 ataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43022999 ataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 43022917  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3758406 - 3758272
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3758406 attaaccatgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 3758307  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3758306 attatattagccctagatttaatttatgcaaaatg 3758272  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 52801474 - 52801252
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||             
T  52801474 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaatcctgtt 52801375  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  52801374 taatttaaataaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 52801275  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  52801274 ttagatttaatttatgcaaaatg 52801252  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26602816 - 26602642
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26602816 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttctttgcttaattttattatattaaccctatttaatttaat 26602717  T
Q  158 caaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    |||||||       ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26602716 caaaatg------gtaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctccaaatttttctccttaattttactaaacaaat 26602642  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 235
Target Start/End: Original strand, 46419554 - 46419745
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaacccta----------- 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||               
T  46419554 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaagttttccctagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaatcctattcaattaacc 46419653  T
Q  147 --tttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  46419654 tatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaatcaacaaatcgctcctaatctttctccttaattttactaaacaa 46419745  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 24944850 - 24945028
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctattta------------ 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  24944850 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 24944949  T
Q  151 --atttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaatttt 226  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24944950 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaatttt 24945028  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Original strand, 54866759 - 54866933
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaat 157  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||       |  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  54866759 atctcttattccttaaagctaatccgaacgcaaaattttggcttagatttaacctaatttctttgcttaattttactatattaatcctatttaatttaat 54866858  T
Q  158 caaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    |||||||      |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54866859 caaaatg------ttaattgttatgaaaatcaaaatgaacaaatcactcataatttttctccttaattttactaaacaaat 54866933  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16653092 - 16653018
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653092 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaa 16653018  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 239
Target Start/End: Original strand, 42348277 - 42348372
Alignment:
Q  145 tatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaatta 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42348277 tatttaatttaatcaaaatgttaatgttaagtgttagggaaatcaaaatgaacaaatagctcctaatttttctccttaattttactaaacaaatta 42348372  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 237
Target Start/End: Original strand, 42348557 - 42348652
Alignment:
Q  145 tatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaa--atcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42348557 tatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 42348652  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26603585 - 26603397
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta-- 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||       |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |      
T  26603585 atctcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaacc 26603486  T
Q  156 --atcaaa----atgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
      ||| ||    ||   ||  |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26603485 ctatctaatttaatcaaaatgttaattgttatggaaatcgaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 26603397  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 42348384 - 42348484
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||       | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42348384 atctcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaaccctatttaatttaat 42348483  T
Q  158 c 158  Q
    |    
T  42348484 c 42348484  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 30527733 - 30527853
Alignment:
Q  12 acagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaaca 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || |||||||||     
T  30527733 acagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacc 30527832  T
Q  112 taacttctttgcttaatttta 132  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30527833 taacttctttgcttaatttta 30527853  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 237
Target Start/End: Original strand, 49355354 - 49355443
Alignment:
Q  148 ttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49355354 ttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttatg-aaatcaaaataaacagatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 49355443  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16904793 - 16904665
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16904793 cctagatttaacctaacttttttgcttaattttaatgtattaaccctatttaattaaccttgtttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttaggga 16904694  T
Q  185 aatcaaaat-aacaaatcgctcctaattt 212  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  16904693 aatcaaaataaacaaatcattcctaattt 16904665  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 42348141 - 42348200
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatc 158  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42348141 cctagatttaacctaacttctttacttaaatttactatattaaccctatttaatttaatc 42348200  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Original strand, 8120418 - 8120494
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttact 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8120418 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcaagattttgacatagatttaacctaacttctttgcttaattttact 8120494  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3758458 - 3758404
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3758458 cctagaattaacctaaattttttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 3758404  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2116895 - 2116856
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2116895 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 2116856  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17741111 - 17741072
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17741111 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 17741072  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 52801063 - 52801024
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52801063 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 52801024  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 152
Target Start/End: Original strand, 48808272 - 48808325
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaat 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  48808272 cctagatttaacctaacttctttgcttagttttattattttaaccctatttaat 48808325  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 146
Target Start/End: Original strand, 49355293 - 49355338
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaacccta 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  49355293 tagatttaacctaacttctttgcttaatttgactatattaacccta 49355338  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 5759239 - 5759195
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattg 55  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5759239 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattg 5759195  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2117005 - 2116970
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2117005 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 2116970  T

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Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2117751 - 2117716
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2117751 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 2117716  T

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Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 2526685 - 2526720
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2526685 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 2526720  T

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Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3758193 - 3758158
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3758193 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 3758158  T

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Target: chr4; HSP #73
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Target Start/End: Complemental strand, 5755036 - 5755001
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5755036 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 5755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5755147 - 5755112
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5755147 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 5755112  T

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Target: chr4; HSP #75
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Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8987270 - 8987231
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8987270 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 8987231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8988645 - 8988610
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8988645 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8988610  T

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Target: chr4; HSP #77
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 9060878 - 9060913
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9060878 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9060913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 9060989 - 9061024
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9060989 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9061024  T

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Target: chr4; HSP #79
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 9887878 - 9887913
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9887878 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9887913  T

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Target: chr4; HSP #80
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 12681118 - 12681153
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12681118 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 12681153  T

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Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 12681916 - 12681951
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12681916 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 12681951  T

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Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13172507 - 13172472
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13172507 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 13172472  T

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Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20589877 - 20589842
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589877 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 20589842  T

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Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20590400 - 20590365
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20590400 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 20590365  T

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Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20590510 - 20590475
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20590510 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 20590475  T

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Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20590628 - 20590593
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20590628 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 20590593  T

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Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 22454015 - 22454050
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22454015 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 22454050  T

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Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24548228 - 24548193
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24548228 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24548193  T

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Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24548981 - 24548946
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24548981 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24548946  T

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Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 24947977 - 24948016
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24947977 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 24948016  T

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Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 36742282 - 36742317
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36742282 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36742317  T

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Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 36742393 - 36742428
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36742393 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36742428  T

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Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37350170 - 37350131
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37350170 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 37350131  T

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Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37351545 - 37351510
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351545 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 37351510  T

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Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37356448 - 37356413
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356448 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 37356413  T

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Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37356559 - 37356524
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356559 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 37356524  T

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Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 39405086 - 39405121
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39405086 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39405121  T

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Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 39405197 - 39405232
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39405197 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39405232  T

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Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 39713980 - 39714015
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39713980 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39714015  T

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Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 39714090 - 39714125
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39714090 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39714125  T

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Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 39714767 - 39714806
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39714767 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcagctc 39714806  T

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Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 42350581 - 42350616
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42350581 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 42350616  T

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Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 46104970 - 46104931
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46104970 tatattaaccctagatttaatttatacaaaatgtcagctc 46104931  T

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Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46105080 - 46105045
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46105080 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 46105045  T

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Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46105870 - 46105835
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46105870 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 46105835  T

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Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 47555907 - 47555942
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47555907 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 47555942  T

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Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 47556017 - 47556052
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47556017 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 47556052  T

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Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 47556648 - 47556687
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47556648 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtaagctc 47556687  T

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Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 48808864 - 48808899
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808864 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 48808899  T

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Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 48808974 - 48809009
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808974 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 48809009  T

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Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 49752138 - 49752103
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49752138 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 49752103  T

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Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50034025 - 50033986
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50034025 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 50033986  T

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Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 50118551 - 50118586
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50118551 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 50118586  T

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Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 50118661 - 50118696
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50118661 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 50118696  T

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Target: chr4; HSP #115
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Query Start/End: Original strand, 101 - 147
Target Start/End: Original strand, 24528013 - 24528059
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24528013 tagatttaacctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 24528059  T

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Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24548493 - 24548451
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaa 141  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24548493 cctagaattaatctaacttctttgcttaattttactgtattaa 24548451  T

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Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29712763 - 29712729
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29712763 taactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 29712729  T

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Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 39714662 - 39714692
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39714662 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39714692  T

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Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Original strand, 48808441 - 48808471
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808441 attaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 48808471  T

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Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52801168 - 52801138
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52801168 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 52801138  T

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Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2117633 - 2117604
Alignment:
Q  244 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2117633 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 2117604  T

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Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 49751068 - 49751031
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49751068 attatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtca 49751031  T

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Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 1325592 - 1325640
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1325592 cctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 1325640  T

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Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3758824 - 3758796
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3758824 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 3758796  T

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Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 24527923 - 24527971
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24527923 cctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 24527971  T

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Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 270
Target Start/End: Original strand, 47556538 - 47556570
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47556538 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 47556570  T

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Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 163
Target Start/End: Original strand, 49355469 - 49355509
Alignment:
Q  123 cttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaat 163  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49355469 cttaattttattatattaaccctatttaatttaaacaaaat 49355509  T

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Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52801799 - 52801771
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52801799 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 52801771  T

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Target: chr1 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1828335 - 1828062
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||    
T  1828335 cacaaagtctaaagcactgcataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaattttccctagatttaac 1828236  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1828235 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 1828136  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1828135 ttttatccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 1828062  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 33074376 - 33074649
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |  ||||||||||||    
T  33074376 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccctagatttaac 33074475  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33074476 ctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctccaaat 33074575  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33074576 ttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 33074649  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1375879 - 1375606
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       |  ||||||||||||    
T  1375879 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccaaacacaaaattttaccctagatttaac 1375780  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1375779 ctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 1375680  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1375679 ttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 1375606  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47137755 - 47137492
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  47137755 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataataactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 47137656  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47137655 ctaacttctttgcctaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatagctcctaa 47137556  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47137555 tttttctccttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 47137492  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28573057 - 28572770
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  28573057 cacagagtctaaaacactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 28572958  T
Q  111 ataacttcttt--------------gcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataac 196  Q
     |||||| |||              |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28572957 ctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaataac 28572858  T
Q  197 aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28572857 aaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgccagctcatttata 28572770  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 19320565 - 19320826
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  19320565 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 19320664  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19320665 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 19320764  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19320765 tttatctccttaattttactaaaaaaactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgt 19320826  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4893865 - 4893605
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  4893865 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 4893766  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4893765 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 4893666  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4893665 tttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 4893605  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 29184622 - 29184882
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  29184622 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 29184721  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29184722 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 29184821  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29184822 tttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 29184882  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 51964622 - 51964867
Alignment:
Q  25 cactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgct 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51964622 cactacataaaaaataacataacaattattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaaggcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgct 51964721  T
Q  125 taattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaat 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51964722 taattttattgtattaaccctatttaatttaatcaaaatattaacgttaattgtta-ggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 51964820  T
Q  224 tttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51964821 tttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 51964867  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 22194612 - 22194824
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       |  ||||||||||||    
T  22194612 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccaaacacaaaattttaccctagatttaac 22194711  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194712 ctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 22194811  T
Q  211 ttttctccttaat 223  Q
    |||||||||||||    
T  22194812 ttttctccttaat 22194824  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50563369 - 50563106
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |  ||||||||||||    
T  50563369 cacagagcctaaaacactacataaaaactaacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgtaaaattttgacctagatttaac 50563270  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||    
T  50563269 ctaacttctttgtttaattttactgtattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatttctcttaa 50563170  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50563169 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtca 50563106  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5428212 - 5427949
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||        |  | ||||||||||    
T  5428212 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaattcgaacgtaaaattttgccatagatttaac 5428113  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  5428112 ataatttctctgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 5428013  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5428012 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 5427949  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 46623521 - 46623784
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |   | |||||||||    
T  46623521 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgctcaagatttaac 46623620  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  46623621 ctaacttctttgcttaattttattgtattaatcctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggagatcaaaataaacaaatcgcttctaa 46623720  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46623721 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaacgtca 46623784  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38896697 - 38896449
Alignment:
Q  26 actacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgctt 125  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||       |  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  38896697 actacatgaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaaattaactcgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgctt 38896598  T
Q  126 aattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaatt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38896597 aattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaatt 38896498  T
Q  225 ttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38896497 ttactaaacaaattatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtca 38896449  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33363469 - 33363208
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  33363469 cacagagcctaaaatactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 33363370  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33363369 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatagctcctaa 33363270  T
Q  210 tttttctccttaattttact--caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| |||||||||||||| |   || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33363269 tttatctccttaattttattaaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 33363208  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5427392 - 5427220
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5427392 cctagatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaca 5427293  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5427292 aatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatg 5427220  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38895884 - 38895709
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38895884 cctagaattaacctaacttctttacttaattttattgtattaacactatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaatgaaca 38895785  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38895784 aatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 38895709  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52312099 - 52311860
Alignment:
Q  32 taaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaatttt 131  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || ||       |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52312099 taaaaaataacataacaactattgtaatttcttattctttaaagttaacccaaatgcaaaattttgccctagatttaaactaacttctttgcttaatttt 52312000  T
Q  132 actgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactc 230  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  52311999 cctgtattaaccttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgcacctaatttttctccttaattttacta 52311900  T
Q  231 aacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    || ||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  52311899 aataaatta---taactgtagatttaatttatgcaaaatgtca 52311860  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47136974 - 47136809
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaa 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47136974 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaa 47136875  T
Q  163 tgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaatttta 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47136874 tgttaacgttaattgttagggaaatcaatataaacaaatcgctcctaatttttctctttaatttta 47136809  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 19321236 - 19321458
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta------- 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |           
T  19321236 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 19321335  T
Q  156 -------atcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
           |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19321336 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 19321435  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19321436 ctagatttaatttatgcaaaatg 19321458  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28571515 - 28571293
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  28571515 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 28571416  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28571415 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 28571316  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28571315 ctagatttaatttatgcaaaatg 28571293  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 49586945 - 49586800
Alignment:
Q  126 aattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaatt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  49586945 aattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatcgttcctagtttttctctttaatt 49586846  T
Q  225 ttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49586845 ttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 49586800  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 46624339 - 46624490
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46624339 cctagaattaatctaacttctttgcttaattttaccgtgttaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaca 46624438  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccct 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  46624439 aatcgcttctaatttttctccttaattttactaaaaaaattatattaaccct 46624490  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1827524 - 1827338
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1827524 cctagatttaacctaacttctttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttaggga 1827425  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1827424 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatg 1827338  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4892550 - 4892328
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  4892550 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 4892451  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  4892450 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 4892351  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  4892350 ttagatttaatttatgcaaaatg 4892328  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16301398 - 16301176
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctattt------------- 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  16301398 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 16301299  T
Q  150 -aatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16301298 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctttttaattttactaaacaaattatattaacc 16301199  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  16301198 ctatatttaatttatgcaaaatg 16301176  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16302039 - 16301765
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||       |  |||||||||||     
T  16302039 cacagagcctaaaacactacataaaaaacaacataacaactattgtaatatcttgttccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaat 16301940  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aa 195  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  16301939 caaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaa 16301840  T
Q  196 caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16301839 caaatcgccccaaatttttctttttaattttactaaacaaattatatcaaccctatatttaatttatgcataatg 16301765  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28572258 - 28572036
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctattt------------- 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  28572258 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 28572159  T
Q  150 -aatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  28572158 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaacc 28572059  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28572058 ctagatttaatttatgcaaaatg 28572036  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 29185937 - 29186159
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  29185937 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 29186036  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  29186037 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 29186136  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  29186137 ttagatttaatttatgcaaaatg 29186159  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50562478 - 50562289
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  50562478 cctatatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccttgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgtttggta 50562379  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50562378 aattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 50562289  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33362153 - 33361931
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctattta------------ 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  33362153 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttagttaatcctgtt 33362054  T
Q  151 --atttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
      ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  33362053 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 33361954  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  33361953 ttagatttaatttatgcaaaatg 33361931  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Original strand, 33075021 - 33075148
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  33075021 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaacaa 33075120  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatg 263  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  33075121 attttattaaccctagatttaatttatg 33075148  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 22198270 - 22198404
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  22198270 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaaaaa 22198369  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22198370 attttattaaccctagatttaatttatgccaaatg 22198404  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 237
Target Start/End: Original strand, 33373539 - 33373665
Alignment:
Q  112 taacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  33373539 taacttctttgcttaattttactatattaaccctacttaatttaatgaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgttcttaat 33373638  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33373639 ttttctccttaattttactaaacaaat 33373665  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 24289346 - 24289518
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctag------- 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || |||||           
T  24289346 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 24289445  T
Q  104 -------atttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaac 169  Q
           ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24289446 ctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaac 24289518  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Original strand, 21056081 - 21056254
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaat 157  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||       |  | |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21056081 atctcttattccttacaattaacccgaacgcaaaattttaccatagatttaacctagcttctttgcttaattttactatatta-ccctatttaatttaat 21056179  T
Q  158 caaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    |||||||||||      |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21056180 caaaatgttaa------ttgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 21056254  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28950734 - 28950633
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  28950734 attaaccctacttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattgttttccttaattttactaaacaa 28950635  T
Q  236 at 237  Q
    ||    
T  28950634 at 28950633  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20130746 - 20130618
Alignment:
Q  103 gatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||      ||||||| || |||||||||||| |||||| |    
T  20130746 gatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaatcctatttaatttaatcaaaatg------ttaattg-tatggaaatcaaaataaacaaaac 20130654  T
Q  202 gctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20130653 tctcctaatttttctccttagttttactaaacaaat 20130618  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 52311258 - 52311078
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||              ||||||| || ||||| ||      ||||||    
T  52311258 cctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaatatattaacgtt------taggga 52311165  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  52311164 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatctttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttgcatttaatttatgcaaaatg 52311078  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 168
Target Start/End: Original strand, 35599365 - 35599432
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 168  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35599365 tagatttaacctaatttctttgcttaattttattatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 35599432  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 229
Target Start/End: Original strand, 8256533 - 8256620
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttact 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8256533 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa------ttgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttccctttaattttact 8256620  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 168
Target Start/End: Original strand, 35598774 - 35598841
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 168  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35598774 tagatttaacctaacttatttgcttaattttactatattaaccctatttaattgaatcaagatgttaa 35598841  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Original strand, 22198218 - 22198272
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22198218 cctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatt 22198272  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Original strand, 33074969 - 33075023
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33074969 cctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatt 33075023  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4892139 - 4892100
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4892139 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 4892100  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5427031 - 5426992
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5427031 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 5426992  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16301098 - 16301059
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16301098 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 16301059  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 29186348 - 29186387
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29186348 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 29186387  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33361742 - 33361703
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361742 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 33361703  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50562103 - 50562064
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50562103 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 50562064  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 51965055 - 51965094
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51965055 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 51965094  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28947367 - 28947330
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947367 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 28947330  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5427874 - 5427839
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5427874 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 5427839  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 19320904 - 19320939
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19320904 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19320939  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 19321014 - 19321049
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19321014 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19321049  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28571104 - 28571065
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28571104 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 28571065  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28571846 - 28571811
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28571846 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 28571811  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28572590 - 28572555
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28572590 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 28572555  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32575780 - 32575745
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32575780 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 32575745  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 168
Target Start/End: Original strand, 35598308 - 35598339
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35598308 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 35598339  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38896373 - 38896338
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38896373 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 38896338  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 46623977 - 46624012
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46623977 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 46624012  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 46625946 - 46625981
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46625946 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 46625981  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47137195 - 47137160
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47137195 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 47137160  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47137305 - 47137270
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47137305 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 47137270  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47137416 - 47137381
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47137416 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 47137381  T

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Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 49586611 - 49586572
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49586611 tatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 49586572  T

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Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50562919 - 50562884
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50562919 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 50562884  T

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Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 51964946 - 51964981
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51964946 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 51964981  T

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Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 52310890 - 52310851
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52310890 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcagctc 52310851  T

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Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52310999 - 52310964
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52310999 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 52310964  T

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Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4892244 - 4892214
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4892244 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4892214  T

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Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16301725 - 16301695
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16301725 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 16301695  T

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Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Original strand, 22198598 - 22198632
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22198598 taactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 22198632  T

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Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 29186243 - 29186273
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29186243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 29186273  T

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Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Original strand, 33075349 - 33075383
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33075349 taactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 33075383  T

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Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33361847 - 33361817
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361847 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 33361817  T

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Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 33375357 - 33375406
Alignment:
Q  186 atcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaaca 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33375357 atcaaaataaacaaatcactcctaatttttctgcttaattttactaaaca 33375406  T

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Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4892875 - 4892847
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4892875 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 4892847  T

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Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Original strand, 29185612 - 29185640
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29185612 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 29185640  T

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Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33362478 - 33362450
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33362478 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 33362450  T

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Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 91)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29469115 - 29468842
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |  ||||||||||||    
T  29469115 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccctagatttaac 29469016  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29469015 ctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 29468916  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29468915 ttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 29468842  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 27733098 - 27733361
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  27733098 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatcttttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 27733197  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27733198 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgcttctaa 27733297  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27733298 tttttctccttaattttactaaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 27733361  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 24682422 - 24682709
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  24682422 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 24682521  T
Q  111 ataacttcttt--------------gcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataac 196  Q
     |||||| |||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  24682522 ctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaa 24682621  T
Q  197 aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24682622 aaatcgttcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 24682709  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9151316 - 9151053
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  9151316 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttaatacttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 9151217  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9151216 ctaacttctttgcttaattttactgtattaactctatttaatttaatcaaaatgttaacgtttattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 9151117  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9151116 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9151053  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 35155633 - 35155896
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || |||||||||    
T  35155633 cacagagtctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaac 35155732  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35155733 ctaacttctttggttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 35155832  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35155833 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 35155896  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 691183 - 690922
Alignment:
Q  13 cagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||       |  | |||||||||| |    
T  691183 cagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacttgaacgcaaaattttgccttagatttaacct 691084  T
Q  113 aacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatt 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  691083 aacttctttacttaattttactgtattaacccaatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaattgcttctaatt 690984  T
Q  212 tttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  690983 tttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 690922  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 31896958 - 31897219
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  31896958 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 31897057  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31897058 ctaacttttttgcttaattttacagtagtaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 31897157  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31897158 tttatctccttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 31897219  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17172791 - 17172531
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  17172791 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 17172692  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17172691 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 17172592  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17172591 tttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 17172531  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44806474 - 44806215
Alignment:
Q  12 acagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaaca 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||       |  || |||||||||     
T  44806474 acagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacc 44806375  T
Q  112 taacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44806374 taacttctttgcttaattttaatgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaat 44806275  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806274 ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 44806215  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 271
Target Start/End: Original strand, 48527557 - 48527816
Alignment:
Q  12 acagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaaca 111  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||       |  ||||||||||||     
T  48527557 acagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaacc 48527656  T
Q  112 taacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48527657 taacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 48527756  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    || |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48527757 ttatctccttaattttact-aaaaatttatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgt 48527816  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 7855108 - 7855371
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |   | |||||||||    
T  7855108 cacagagcctaaaacactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgctcaagatttaac 7855207  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7855208 ctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 7855307  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7855308 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 7855371  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34873717 - 34873454
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |   | |||||||||    
T  34873717 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgctcaagatttaac 34873618  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaa-taacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  34873617 ctaacttctttgcttaattttattgtattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaacaaacaaatcgcttctaa 34873518  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34873517 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 34873454  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4850345 - 4850082
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||||       |  |||| |||||||    
T  4850345 cacagagcctaaagtactacataaaaaataacataataactattgtaatatcatattccctaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctatatttaac 4850246  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  4850245 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 4850146  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4850145 attttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 4850082  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 21669384 - 21669639
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||| |||||||| |||||||    
T  21669384 ctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctggatttaacctaacttc 21669483  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  21669484 ttttcttaattttattgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatagctcctgatttttctc 21669583  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21669584 cttaattttaccaaacaaatttcattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtca 21669639  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 49144179 - 49144442
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||       |  ||||||||||||    
T  49144179 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttaccctagatttaac 49144278  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||    
T  49144279 ctaatttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacacataa 49144378  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  49144379 tttttctccttagttttactaaacaaattatattaactctagttttaatttatgcaaaatgtca 49144442  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34872887 - 34872715
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34872887 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaagttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaca 34872788  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34872787 aatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 34872715  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39278117 - 39277884
Alignment:
Q  41 acataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtatta 140  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39278117 acataaaaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctggatttaacctaacttcttttcttaattttactgtatta 39278018  T
Q  141 accctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaatta 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  39278017 accctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatagctcctgatttttctccttaattttaccaaacaaattt 39277918  T
Q  240 tactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39277917 cattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtca 39277884  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 39648126 - 39648329
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  39648126 cacagagtctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 39648225  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39648226 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaattaaacaaatcgctcctaa 39648325  T
Q  210 tttt 213  Q
    ||||    
T  39648326 tttt 39648329  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 273
Target Start/End: Original strand, 11835201 - 11835382
Alignment:
Q  107 taacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatt--------------taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaa 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11835201 taacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctattaaatcatccatatttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaa 11835300  T
Q  193 taa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11835301 taaacaaatcgctcctaatttttctccataattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 11835382  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 24683950 - 24684172
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  24683950 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 24684049  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  24684050 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttagttttactaaacaaattatattaacc 24684149  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24684150 ctagatttaatttatgcaaaatg 24684172  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 7855937 - 7856123
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta--------------atcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |              |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7855937 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaacattgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 7856036  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7856037 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 7856123  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 35156345 - 35156531
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta--------------atcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35156345 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 35156444  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35156445 aatcaaaataaacaaatcgatcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 35156531  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44805653 - 44805467
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta--------------atcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44805653 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 44805554  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805553 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 44805467  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4849475 - 4849341
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4849475 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 4849376  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4849375 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatg 4849341  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17171476 - 17171254
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  17171476 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 17171377  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  17171376 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 17171277  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  17171276 ttagatttaatttatgcaaaatg 17171254  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 24683295 - 24683429
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  24683295 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcttaatttttctctttaattttattaaacat 24683394  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24683395 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 24683429  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 39648784 - 39649006
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  39648784 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtt 39648883  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  39648884 taacttaaacaaaatgttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 39648983  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  39648984 ttagatttaatttatgcaaaatg 39649006  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 49145089 - 49145314
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  49145089 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaattaccct 49145188  T
Q  154 --------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatacta 244  Q
            |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  49145189 gtttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttacggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatatta 49145288  T
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  49145289 accctatatttaatttatgcaaaatg 49145314  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 31897625 - 31897847
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  31897625 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtt 31897724  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||    
T  31897725 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctcttaaaatttactaaacaaattatattaacc 31897824  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  31897825 ttagatttaatttatgcaaaatg 31897847  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29468470 - 29468336
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  29468470 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaacaa 29468371  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29468370 attttattaaccctagatttaatttatgccaaatg 29468336  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 27733921 - 27734042
Alignment:
Q  104 atttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcg 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27733921 atttaacctaacttttttgcttaattttactgtattaaccctgtttaatttattcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatct 27734020  T
Q  203 ctcctaatttttctccttaatt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  27734021 ctcctaatttttctctttaatt 27734042  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 33637584 - 33637806
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             
T  33637584 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaatttctttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaactctgtt 33637683  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat--aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaac 246  Q
         |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  33637684 taatttaatcaaaatattaacgttaatttttagggaaatcaaaaataaacaaat-gctcctaatttttctctttaattttattaaacaaattatattaac 33637782  T
Q  247 cctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  33637783 cctagatttaatttatgcagaatg 33637806  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9150668 - 9150567
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9150668 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctctttaattttactaaacaa 9150569  T
Q  236 at 237  Q
    ||    
T  9150568 at 9150567  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34989530 - 34989419
Alignment:
Q  113 aacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||      ||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  34989530 aacttctttgcttaatttttctatattcaccctatttaatttaatcaaaatg------ttaatagttacggaaattaaaataaacaaattgctcttaatt 34989437  T
Q  212 tttctccttaattttact 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34989436 tttctccttaattttact 34989419  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 153
Target Start/End: Original strand, 49144961 - 49145051
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49144961 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 49145051  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 21598194 - 21598306
Alignment:
Q  107 taacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatt--------------taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaa 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21598194 taacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctattaaatcatccatatttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaa 21598293  T
Q  193 t-aacaaatcgct 204  Q
    | |||||||||||    
T  21598294 taaacaaatcgct 21598306  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4849152 - 4849113
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4849152 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 4849113  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17171065 - 17171026
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17171065 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 17171026  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 31898036 - 31898075
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31898036 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 31898075  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Original strand, 33637028 - 33637075
Alignment:
Q  20 taaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttatt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  33637028 taaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttatt 33637075  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 33637885 - 33637924
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33637885 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 33637924  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 39649195 - 39649234
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39649195 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 39649234  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 48528005 - 48528044
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48528005 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 48528044  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 49145503 - 49145542
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49145503 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 49145542  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Original strand, 31897401 - 31897438
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31897401 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 31897438  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 271
Target Start/End: Original strand, 39648337 - 39648374
Alignment:
Q  234 aaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39648337 aaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 39648374  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9150377 - 9150341
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcag 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9150377 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcag 9150341  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4849896 - 4849861
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4849896 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4849861  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4850007 - 4849972
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4850007 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4849972  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 7855565 - 7855600
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855565 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 7855600  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 7855675 - 7855710
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855675 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 7855710  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9150978 - 9150943
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9150978 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9150943  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 20073757 - 20073792
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20073757 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 20073792  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 46
Target Start/End: Original strand, 21598097 - 21598132
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataa 46  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21598097 cacagagtctaaaacactacataaaaaataacataa 21598132  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 21670280 - 21670315
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21670280 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 21670315  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24396855 - 24396820
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24396855 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24396820  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 24682888 - 24682923
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24682888 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24682923  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 24683619 - 24683654
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24683619 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24683654  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 24684361 - 24684400
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24684361 tatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 24684400  T

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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 27733437 - 27733472
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27733437 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 27733472  T

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Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 27733548 - 27733583
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27733548 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 27733583  T

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Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 27733658 - 27733693
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27733658 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 27733693  T

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Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 27734153 - 27734188
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27734153 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 27734188  T

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Target: chr7; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 31897293 - 31897328
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31897293 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 31897328  T

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Target: chr7; HSP #65
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 33637363 - 33637398
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33637363 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 33637398  T

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Target: chr7; HSP #66
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34873150 - 34873115
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34873150 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 34873115  T

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Target: chr7; HSP #67
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34873260 - 34873225
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34873260 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 34873225  T

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Target: chr7; HSP #68
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Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 35156082 - 35156117
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35156082 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 35156117  T

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Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 35156610 - 35156645
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35156610 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 35156645  T

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Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 36158310 - 36158345
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36158310 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36158345  T

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Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 36158421 - 36158456
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36158421 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 36158456  T

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Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 39649085 - 39649120
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39649085 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39649120  T

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Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 40107103 - 40107138
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40107103 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 40107138  T

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Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44805388 - 44805353
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805388 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 44805353  T

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Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44805916 - 44805881
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805916 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 44805881  T

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Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44806137 - 44806102
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806137 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 44806102  T

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Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 48527895 - 48527930
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48527895 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 48527930  T

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Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 49144517 - 49144552
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49144517 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 49144552  T

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Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 49145393 - 49145428
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49145393 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 49145428  T

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Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17171170 - 17171140
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17171170 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 17171140  T

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Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 277
Target Start/End: Original strand, 27734271 - 27734301
Alignment:
Q  247 cctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27734271 cctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 27734301  T

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Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29468142 - 29468108
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29468142 taactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 29468108  T

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Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 31897931 - 31897961
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31897931 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 31897961  T

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Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39277196 - 39277166
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39277196 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39277166  T

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Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 40107328 - 40107358
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40107328 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 40107358  T

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Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 690729 - 690696
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  690729 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 690696  T

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Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 273
Target Start/End: Original strand, 32200867 - 32200896
Alignment:
Q  244 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32200867 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 32200896  T

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Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Original strand, 39648452 - 39648485
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39648452 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 39648485  T

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Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4849527 - 4849495
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaatttt 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4849527 cctagatttaacctaacttctttgcttaatttt 4849495  T

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Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17171801 - 17171773
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17171801 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 17171773  T

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Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 270
Target Start/End: Original strand, 39648562 - 39648594
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39648562 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 39648594  T

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Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 75)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17838371 - 17838098
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |       |   |||||||||||    
T  17838371 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcagtctcttattcgttaaagttaacccgaacacaaaattttacgctagatttaac 17838272  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17838271 ctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 17838172  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17838171 ttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 17838098  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 18090757 - 18091020
Alignment:
Q  12 acagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcc-tagatttaac 110  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  || ||||||||||    
T  18090757 acagagcctaaagtactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccctagatttaac 18090856  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||    
T  18090857 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatctcttttaa 18090956  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18090957 tttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 18091020  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 4289172 - 4289432
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  4289172 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 4289271  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4289272 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 4289371  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4289372 tttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 4289432  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6931803 - 6931543
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||         || | ||||||||    
T  6931803 cacatagtataaagtactacataaaaaataacataacaattattt-aatctcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaatttagtcattgatttaac 6931705  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6931704 ctaacttctttgcttaatttgactgtattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 6931605  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6931604 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgt 6931543  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42782571 - 42782308
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||       |  || |||||||||    
T  42782571 cacagagcctaaaacactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccataaagttaacccgaacgcaaaattttacccaagatttaac 42782472  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42782471 ctaacttctttgcttaattttattgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 42782372  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42782371 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 42782308  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 32675888 - 32676175
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |       |  | || |||||||    
T  32675888 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatatcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccttacatttaac 32675987  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtatta--------------accctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataac 196  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32675988 ctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaataaaccctatttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttagggaaattaaaataac 32676087  T
Q  197 aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32676088 aaatcgctcctaatttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccttagatttaatttatacaaaatgtcagctcatttata 32676175  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19488174 - 19487911
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||        |  || | |||||||    
T  19488174 cacagagcctaaaacaatacataaaaaataacataacaactattataatagcttattccttaaagttaacccaaacgtaaaattttgcccaaaatttaac 19488075  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19488074 ctaacttcttttcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 19487975  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19487974 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19487911  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 10874551 - 10874806
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| |       |   | ||||||||| |||||||    
T  10874551 ctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccaaacacaaatttttgctcaagatttaacctaacttc 10874650  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  10874651 tttgcttaattttattgtattaagcctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggagatcaaaataaacaaatcgtttctaatttttctc 10874750  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10874751 cttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10874806  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 9542774 - 9543040
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  9542774 cacagagtctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 9542873  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9542874 ctaacttctttgcttaattttacggtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttcacattaatttttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 9542973  T
Q  210 t-----ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |     ||  ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9542974 tataagttaactccttaattttactaaaaaatttatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgt 9543040  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Original strand, 10875374 - 10875549
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10875374 cctagaattcacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaca 10875473  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10875474 aatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10875549  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28609791 - 28609566
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             
T  28609791 ttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattatccctgtt 28609692  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28609691 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaattgcttctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 28609592  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28609591 ctagatttaatttatgcaaaatgtca 28609566  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 1513689 - 1513911
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  1513689 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 1513788  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1513789 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcggtcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 1513888  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1513889 ctagatttaatttatgcaaaatg 1513911  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 18091566 - 18091752
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18091566 cctagatttaacataacttcttttcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttaggga 18091665  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18091666 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttagatttaatttatgcaaaatg 18091752  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6931244 - 6931022
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||             
T  6931244 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttttttgcttaattttaatgtattaactctatttaattaactttgtt 6931145  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6931144 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 6931045  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6931044 ctagatttaatttatgcaaaatg 6931022  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 147 - 272
Target Start/End: Original strand, 1513139 - 1513266
Alignment:
Q  147 tttaatttaatcaaaatgttaactttaattgtta-gggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatacta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1513139 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatatta 1513238  T
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1513239 accctagatttaatttatgcaaaatgtc 1513266  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 4290485 - 4290707
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  4290485 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 4290584  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  4290585 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 4290684  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  4290685 ttagatttaatttatgcaaaatg 4290707  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19487344 - 19487158
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaat--------------ttaatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19487344 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatcaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 19487245  T
Q  185 aatcaaaataac-aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19487244 aatcaaaataaataaatcgctcctaatttttatctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 19487158  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28609024 - 28608838
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  28609024 cctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattattaggaa 28608925  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28608924 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatttaatttatgcaaaatg 28608838  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Original strand, 19485153 - 19485342
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta--------------atcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19485153 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaggaa 19485252  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485253 aatcaaaataaacaaatcgctgctaatttttctctttaattttactaaacaaattatatcaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19485342  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 32676551 - 32676685
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  32676551 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaacaa 32676650  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32676651 attatattaaccctatatttaatttatgccaaatg 32676685  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42781698 - 42781564
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42781698 attaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 42781599  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  42781598 attatattaaccataaatttaatttatgcaaaatg 42781564  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 9543452 - 9543674
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             
T  9543452 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttaatgtattaaccctatttaattaatcctgtt 9543551  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  9543552 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagtgaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctttttaaatttactaaacaaattatattaacc 9543651  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  9543652 ttagatttaatttatgcaaaatg 9543674  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Original strand, 25235104 - 25235298
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaa------ 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||          
T  25235104 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgtcctagatttaacttaacttctttgtttaattttactatattaaccctatttaattaacc 25235203  T
Q  152 --------tttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
            |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25235204 ctacttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaataaaaataaaaaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaat 25235298  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15783546 - 15783430
Alignment:
Q  122 gcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctcctt 220  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15783546 gcttaaatttactatattaatcctatttaatttaatcaaaatattaatgttaattattagggaaatcaaaatgaacaaattgcttctaatttttctcctt 15783447  T
Q  221 aattttactcaacaaat 237  Q
    ||||||||| |||||||    
T  15783446 aattttactaaacaaat 15783430  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 153
Target Start/End: Original strand, 1501623 - 1501719
Alignment:
Q  57 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1501623 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 1501719  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 152
Target Start/End: Original strand, 1501514 - 1501625
Alignment:
Q  41 acataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtatta 140  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1501514 acataacaactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaattttgccctagatttaacttaacttttttgcttaattttactgtatta 1501613  T
Q  141 accctatttaat 152  Q
    ||||||||||||    
T  1501614 accctatttaat 1501625  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Original strand, 44940751 - 44940852
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  44940751 attaaccttatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgttcctaacttttctctttaattttgctgaacaa 44940850  T
Q  236 at 237  Q
    ||    
T  44940851 at 44940852  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 273
Target Start/End: Original strand, 19484744 - 19484810
Alignment:
Q  207 taatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19484744 taatttttatctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19484810  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Original strand, 25234466 - 25234564
Alignment:
Q  55 gcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||       | ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25234466 gcaatctcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgtcctagatttaacgtaatttatttgcttaattttactattttaaccctatttaatt 25234564  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Original strand, 32676499 - 32676553
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32676499 cctagatgtaacctaacttctttgtttaattttactgtattaaccctatttaatt 32676553  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 692975 - 692907
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 167  Q
    |||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  692975 cctagatttaacctaattttaatgattaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgtta 692907  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 44940701 - 44940753
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44940701 tagatttaacctaacttctttgcttaattttacgatattaaccctatttaatt 44940753  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 153
Target Start/End: Original strand, 25234784 - 25234879
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  25234784 atctcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttcttttcttcattttactattttaaccatatttaatt 25234879  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 153
Target Start/End: Original strand, 25234896 - 25234991
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||       | || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25234896 atctgttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttatcatagatttaacctaacttctttgttgaattttactattttaaccctatttaatt 25234991  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 153
Target Start/End: Original strand, 25234684 - 25234774
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||       | || |||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25234684 ttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttctttcctgaattttactattttaaccctatttaatt 25234774  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 1514195 - 1514234
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1514195 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 1514234  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 9543862 - 9543901
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543862 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 9543901  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Original strand, 25235322 - 25235369
Alignment:
Q  121 tgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25235322 tgcttaattttactatattaaccctatttaatttaaacaaaatattaa 25235369  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 276
Target Start/End: Original strand, 4290896 - 4290934
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagct 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4290896 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagct 4290934  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 274
Target Start/End: Original strand, 18091943 - 18091979
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcag 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18091943 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcag 18091979  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39087844 - 39087796
Alignment:
Q  105 tttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39087844 tttaacataaattctatgcttacttttactgtattacccctatttaatt 39087796  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 1513467 - 1513502
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1513467 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 1513502  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 1514078 - 1514113
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1514078 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 1514113  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6930833 - 6930794
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6930833 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 6930794  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6931466 - 6931431
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6931466 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 6931431  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 9543119 - 9543154
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543119 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9543154  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 10048128 - 10048163
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048128 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10048163  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 10048238 - 10048277
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10048238 tatattaaccctagacttaatttatgcaaaatgtcagctc 10048277  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 10875001 - 10875036
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10875001 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10875036  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 10875111 - 10875146
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10875111 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10875146  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 10875737 - 10875772
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10875737 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10875772  T

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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 10875848 - 10875883
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10875848 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10875883  T

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Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 10875959 - 10875994
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10875959 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10875994  T

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Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 10876189 - 10876224
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10876189 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10876224  T

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Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 18091308 - 18091343
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18091308 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 18091343  T

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Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 18091832 - 18091867
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18091832 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 18091867  T

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Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 237
Target Start/End: Original strand, 25235412 - 25235455
Alignment:
Q  194 aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25235412 aacaaatcactcctaatttttctgcttaattttactaaacaaat 25235455  T

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Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 42781743 - 42781708
Alignment:
Q  106 ttaacataacttctttgcttaattttactgtattaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42781743 ttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 42781708  T

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Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42782233 - 42782198
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42782233 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 42782198  T

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Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 692504 - 692474
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Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  692504 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 692474  T

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Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 692691 - 692661
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  692691 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 692661  T

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Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 156
Target Start/End: Original strand, 1378677 - 1378735
Alignment:
Q  98 tcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    ||||||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1378677 tcctagatttaacctaactttaatgattaattttactatattacccctatttaatttaa 1378735  T

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Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 1513355 - 1513385
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1513355 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 1513385  T

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Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 4290791 - 4290821
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Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4290791 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4290821  T

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Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8909804 - 8909774
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8909804 attaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 8909774  T

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Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 9543758 - 9543788
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543758 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9543788  T

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Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23456493 - 23456452
Alignment:
Q  115 cttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaat 157  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23456493 cttctttgct-aattttactatattaaccctatttaatttaat 23456452  T

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Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 25235980 - 25236010
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25235980 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 25236010  T

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Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28608753 - 28608723
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28608753 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 28608723  T

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Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Original strand, 32676878 - 32676912
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32676878 taactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 32676912  T

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Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 272
Target Start/End: Original strand, 37995099 - 37995133
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37995099 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 37995133  T

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Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19487079 - 19487038
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcat 279  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19487079 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcat 19487038  T

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Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28609378 - 28609345
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28609378 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 28609345  T

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Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Original strand, 4290160 - 4290188
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4290160 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 4290188  T

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Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 25235036 - 25235087
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  25235036 tagatttaacctaacttctttgcttaa-tttactattttaaccttatttaatt 25235087  T

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Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 4896106 - 4896379
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |  | ||||||||||    
T  4896106 cacagagtctaaagcaccacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccttagatttaac 4896205  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4896206 ctaacttctttacttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataacagatcgctcctaat 4896305  T
Q  211 ttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4896306 ttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcagctcatttata 4896379  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 9978853 - 9979116
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||        |  ||||||||||||    
T  9978853 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatcttttattccttaaagttaacccgaacgaaaaattttgccctagatttaac 9978952  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9978953 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 9979052  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9979053 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9979116  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 9735841 - 9736104
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||       |  || |||||||||    
T  9735841 cacagagcctaaaacactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaaccctaacgcaaaattttgcccaagatttaac 9735940  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9735941 ctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 9736040  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9736041 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9736104  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1222281 - 1222021
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  1222281 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 1222182  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1222181 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 1222082  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| |||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1222081 tttatctccttaattttattaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 1222021  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24447692 - 24447432
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  24447692 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 24447593  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24447592 ctaacttctttacttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 24447493  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24447492 tttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 24447432  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4109953 - 4109690
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||       | |||||||||||||    
T  4109953 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgtcctagatttaac 4109854  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||    
T  4109853 ctaacttcattgcttaactttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacacataa 4109754  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4109753 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 4109690  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 6966382 - 6966645
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||       |  ||||||||||||    
T  6966382 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacttgaacgcaaaattttgccctagatttaac 6966481  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6966482 ctaacttttttgcttaattgtactgtattaaccccatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 6966581  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6966582 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctaggtttaatttatgcaaaatgtca 6966645  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 15043980 - 15044235
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||       |  ||| |||||||| |||||||    
T  15043980 ctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccctggatttaacctaacttc 15044079  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  15044080 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatagctcctgatttttctc 15044179  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15044180 cttaattttaccaaacaaatttcattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtca 15044235  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 35160020 - 35159755
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttat--tccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagattta 108  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| | | |||       |  |||| |||||    
T  35160020 cacagagcctaaaacacaacataaaaaataacatatcaactattgtaatctcttatattccttaaagttaactcaatcgcaaaattttgccctaaattta 35159921  T
Q  109 acataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcct 207  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35159920 acctaacttctttacttagttttactgtatcaaccctatttaatttaatgaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcct 35159821  T
Q  208 aatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35159820 aatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccataaatttaatttatgcaaaatgtca 35159755  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14832946 - 14832676
Alignment:
Q  14 agagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacata 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  | |||||||||| ||    
T  14832946 agagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgacatagatttaaccta 14832847  T
Q  114 acttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caa 198  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  14832846 acttttttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgtttgggaaattaaaataaacaa 14832747  T
Q  199 atcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14832746 atcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttaga-ttaatttatgcaaaatg 14832676  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18320624 - 18320430
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  18320624 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatttcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 18320525  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgct 204  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18320524 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgct 18320430  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35159302 - 35159080
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta------- 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  35159302 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgacctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttactctgtt 35159203  T
Q  156 -------atcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
           |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35159202 taatttaatcaaaatgttaacgttaatttttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 35159103  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  35159102 ctagatttaatttatgtaaaatg 35159080  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 33320362 - 33320584
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||             
T  33320362 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattgaccctatttaattaactctgtt 33320461  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33320462 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 33320561  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  33320562 ctagatttaatttatgtaaaatg 33320584  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4109169 - 4108947
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  4109169 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 4109070  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |    
T  4109069 taatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatatttatc 4108970  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4108969 ctatatttaatttatgcaaaatg 4108947  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24446377 - 24446155
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  24446377 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 24446278  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  24446277 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 24446178  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  24446177 ttagatttaatttatgcaaaatg 24446155  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1220970 - 1220748
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  1220970 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 1220871  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  1220870 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 1220771  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  1220770 ttagatttaatttatgcaaaatg 1220748  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 4896860 - 4896994
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  4896860 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaacaa 4896959  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4896960 attttattaaccctagatttaatttatgccaaatg 4896994  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 155 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21059368 - 21059249
Alignment:
Q  155 aatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagat 253  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21059368 aatcaaaatgttaatgtaaactgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagat 21059269  T
Q  254 ttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21059268 ttaatttatgcaaaatgtca 21059249  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 273
Target Start/End: Original strand, 33319846 - 33319960
Alignment:
Q  160 aaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataac-aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaat 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33319846 aaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaataaatcgctcataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaat 33319945  T
Q  259 ttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||    
T  33319946 ttatgcaaaatgtca 33319960  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21055567 - 21055477
Alignment:
Q  184 aaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21055567 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 21055477  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21078609 - 21078490
Alignment:
Q  155 aatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagat 253  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || | ||||||    
T  21078609 aatcaaaatgttaatgtaaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaactttaccaaacaaattatattatctctagat 21078510  T
Q  254 ttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  21078509 ttaatttaagcaaaatgtca 21078490  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 4621319 - 4621504
Alignment:
Q  60 ctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtatta-------------acccta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | || |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||             ||||||    
T  4621319 ctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaatttttgtcatagatttaacctagcttctttgcttaattttactatattaccctatttaattaacccta 4621418  T
Q  147 tttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||      |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4621419 tttaatttaatcaaaatattaa------ttgttatggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaat 4621504  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 33319711 - 33319780
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaac 80  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33319711 cacagagcctaaaacacaacataaaaaataacatatcaattattgtaatctcttattccttaaagttaac 33319780  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Original strand, 4896808 - 4896862
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4896808 cctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatt 4896862  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31426282 - 31426227
Alignment:
Q  98 tcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  31426282 tcctaaatttaacataacttctttgcttaattttactatattaatcatatttaatt 31426227  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 284
Target Start/End: Original strand, 4896442 - 4896488
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctcatttata 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4896442 tatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcagctcatttata 4896488  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1220559 - 1220520
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220559 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 1220520  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4108757 - 4108718
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4108757 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 4108718  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 9979309 - 9979348
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9979309 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 9979348  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24445966 - 24445927
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445966 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 24445927  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 33320662 - 33320701
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33320662 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 33320701  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35159002 - 35158963
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35159002 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 35158963  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14832510 - 14832476
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14832510 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 14832476  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21078410 - 21078373
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21078410 attataataaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 21078373  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4108867 - 4108832
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4108867 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4108832  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4109500 - 4109465
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4109500 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4109465  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4109615 - 4109580
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4109615 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4109580  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 6966730 - 6966765
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6966730 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 6966765  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 9979199 - 9979234
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9979199 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9979234  T

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Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21078297 - 21078262
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21078297 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 21078262  T

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Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1220664 - 1220634
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220664 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 1220634  T

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Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Original strand, 4897188 - 4897222
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4897188 taactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 4897222  T

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Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24446071 - 24446041
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446071 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24446041  T

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Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Original strand, 31497221 - 31497251
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31497221 attaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 31497251  T

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Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Original strand, 31502607 - 31502637
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31502607 attaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 31502637  T

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Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14832584 - 14832551
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14832584 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 14832551  T

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Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21055406 - 21055369
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21055406 attatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtca 21055369  T

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Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21059179 - 21059142
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21059179 attatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtca 21059142  T

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Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1221295 - 1221267
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1221295 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 1221267  T

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Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24446702 - 24446674
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446702 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 24446674  T

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Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 19893323 - 19893586
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||       |  ||||||||||||    
T  19893323 cacagagtttaaagcactacataaaaaataacataacaattattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaattttgacctagatttaac 19893422  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19893423 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 19893522  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19893523 tttttctccttaattttactaaacaatttatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtca 19893586  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 55290549 - 55290802
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||||    
T  55290549 ctaaaacactacataaaaaataacataacagctattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttc 55290648  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  55290649 tttgcttaattttact--attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaaggttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgcttctaatttttctc 55290746  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55290747 cttaattttactaaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 55290802  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Original strand, 29528896 - 29529156
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || | |||||||    
T  29528896 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaaaatttaac 29528995  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29528996 ctaacttcttttcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 29529095  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29529096 attttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 29529156  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39094429 - 39094185
Alignment:
Q  30 cataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaatt 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39094429 cataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatt 39094330  T
Q  130 ttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttac 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  39094329 ttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctccttaattgtac 39094230  T
Q  229 tcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39094229 taaacaaattatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtca 39094185  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8396662 - 8396403
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||       |   |||||||||||    
T  8396662 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacttaaacgcaaaattttgctctagatttaac 8396563  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  8396562 ctaacttctttacttaattttactgtattaacccaatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaattgcttctaa 8396463  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8396462 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 8396403  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 26776580 - 26776843
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||    
T  26776580 cacagagcctaaaacactgcataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacgcaaaatttttccctagatttaac 26776679  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||    
T  26776680 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 26776779  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26776780 tttttctccttaattttactaaacaaattatatcaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 26776843  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52843074 - 52842820
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||||    
T  52843074 ctaaaacactacataaaaa-taatataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacttaacttc 52842976  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52842975 tttgcttaattttactgtattaatcttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctc 52842876  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52842875 cttaattttactaaacaaattatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtca 52842820  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Original strand, 48519800 - 48520058
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |  ||||||||||||    
T  48519800 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacataaaattttgccctagatttaac 48519899  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48519900 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaagtcaaaataaacaaatcgctcctaa 48519999  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  48520000 tttttctctttaattttactaaacaaattatattaacctta-atttaa-ttatgcaaaatg 48520058  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 53802260 - 53801997
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||       | || ||||||||||    
T  53802260 cacagagcctaaagcactgcataaaaaataacataacaactattttaatatcttattccttaaagttaattcgaacgcaaaattttgtcatagatttaac 53802161  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  53802160 ataacttctctgcttaatattactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattggtagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 53802061  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53802060 tttttcttcttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 53801997  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35860900 - 35860688
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |  | ||||||||||    
T  35860900 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgcaatctcttattccttcaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaac 35860801  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35860800 ttaacttttttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaaataacaaatcgctcctaat 35860701  T
Q  211 ttttctccttaat 223  Q
    |||||||||||||    
T  35860700 ttttctccttaat 35860688  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 4137555 - 4137810
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||       |  ||| |||||||| |||||||    
T  4137555 ctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgcccttgatttaacctaacttc 4137654  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  4137655 tttgcttaattttactgtattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgcacataatttttctc 4137754  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4137755 cttaattttactaaaaaaattatattaactctaaatttaatttatgcaaaatgtca 4137810  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 19360879 - 19361142
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||       |  |  |||||||||    
T  19360879 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactcttataatatcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccaaagatttaac 19360978  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  19360979 ctaacttctttgcttaattttattgtattaatcttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacttctaa 19361078  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19361079 tttttctccttagttttattaaagaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19361142  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 26101643 - 26101811
Alignment:
Q  106 ttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgct 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26101643 ttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgct 26101742  T
Q  205 cctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26101743 tttaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 26101811  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 26100923 - 26101185
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||        |  || |||||||||    
T  26100923 cacagagcttaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgtaaaattttgcccaagatttaac 26101022  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | | | | |     
T  26101023 ttaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaactggtttc-at 26101121  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26101122 attttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 26101185  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 28979751 - 28979970
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||       |  ||||||||||||    
T  28979751 cacagagcttaaagcattacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctagatttaac 28979850  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28979851 ctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 28979950  T
Q  210 tttttctccttaattttact 229  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  28979951 tttttctccttaatcttact 28979970  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 113 - 273
Target Start/End: Original strand, 19361606 - 19361767
Alignment:
Q  113 aacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatt 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19361606 aacttctttgcttaattttaccatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatt 19361705  T
Q  212 tttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19361706 tttctccttaattttactaaacaaattatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtca 19361767  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 40821913 - 40822143
Alignment:
Q  64 tattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt---------- 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||              
T  40821913 tattccttaaagctaacccgaacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctattt 40822012  T
Q  154 ----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccc 248  Q
        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40822013 aatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcaccttaattttactaaacaaattatattaaccc 40822112  T
Q  249 tagatttaatttatgcaaaatgtcagctcat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40822113 tagatttaatttatgcaaaatgtcatctcat 40822143  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35855972 - 35855787
Alignment:
Q  100 ctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaa 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35855972 ctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaa 35855873  T
Q  186 atcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35855872 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 35855787  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22522068 - 22521887
Alignment:
Q  107 taacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatt--------------taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaa 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22522068 taacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctattaaatcatccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaa 22521969  T
Q  193 taa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22521968 taaacaaatcgctcctaatttttctccataattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 22521887  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 53801664 - 53801479
Alignment:
Q  100 ctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaa 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53801664 ctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccttgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaa 53801565  T
Q  186 atcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  53801564 atcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatg 53801479  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 29529717 - 29529903
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattta--------------atcaaaatgttaactttaattgttaggga 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29529717 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacattaattgttaggga 29529816  T
Q  185 aatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29529817 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatg 29529903  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 8527084 - 8527218
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8527084 attaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatagctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 8527183  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8527184 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 8527218  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 19368350 - 19368484
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  19368350 attaaccatatttaattttatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaataa 19368449  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19368450 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 19368484  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39093696 - 39093569
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataacaaa-tcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39093696 attaaccctgtttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 39093597  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatg 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39093596 attatattaaccctagatttaatttatg 39093569  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9374127 - 9373953
Alignment:
Q  57 aatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||       |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9374127 aatctcttattccttaaagttaatc-gaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttattatattaaccctatttaatttaa 9374029  T
Q  157 tcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    ||||||||      |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9374028 tcaaaatg------ttaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 9373953  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Original strand, 51656422 - 51656555
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  51656422 cctagatttaacctaaattctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatg------ttaattgttatggaaatcaaaataaaca 51656515  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51656516 aatcgctcttaatttttctccttaattttactaaacaaat 51656555  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9373622 - 9373449
Alignment:
Q  59 tctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  9373622 tctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaaatttcactagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaatccggtttaatttaatc 9373523  T
Q  159 aaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    ||||||      ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9373522 aaaatg------ttaattgttatagaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 9373449  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 4138636 - 4138769
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  4138636 attaatcctgtttaatttaatcaaaatgttaatgttaatcgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact-aaaaa 4138734  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4138735 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatg 4138769  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 19367744 - 19367847
Alignment:
Q  171 ttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19367744 ttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccatagatttaatttatgcaaaat 19367843  T
Q  270 gtca 273  Q
    ||||    
T  19367844 gtca 19367847  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53521902 - 53521737
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |       |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53521902 atctcttattccttaaagttaacctgaacacattttttttta-taaatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaat 53521804  T
Q  158 caaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 229  Q
    |||||||      |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53521803 caaaatg------ttaattgttatggaaatcgaaataaacaaatcgctcctaatttttttccttaattttact 53521737  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46489403 - 46489283
Alignment:
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aac-aaatcgctcctaatttttct 216  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  46489403 tttgcttaaatttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaattaaaatgaactaagtagctcctaatttttct 46489304  T
Q  217 ccttaattttactcaacaaat 237  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  46489303 ccttaattttactaaacaaat 46489283  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 224
Target Start/End: Original strand, 55293679 - 55293767
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaatt 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55293679 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaatt 55293767  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36006666 - 36006479
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtatta-------------accc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       | || |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||             ||||    
T  36006666 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaatttgtcatagatttaacctagcatctttgcttaattttactatattaccctatttaattaaccc 36006567  T
Q  145 tatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaat 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||      |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36006566 tatctaatttaatcaaaatgttaa------ttgttatgaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 36006479  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9373890 - 9373768
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||| ||||||      |||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  9373890 cctagatttaacctaacttctttgcttaattatactatattaatccgatttagtttaataaaaatg------ttaagtgttatgaaaatcaaaataaaca 9373797  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaatttt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9373796 aatcactcctaatttttctccttaatttt 9373768  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9373310 - 9373136
Alignment:
Q  59 tctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt----- 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||       |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         
T  9373310 tctctttttccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctaaatttaacttaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccc 9373211  T
Q  154 taatcaa---aatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaatt 224  Q
    || | ||   |||   ||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9373210 tatttaatttaatcaaaatgttaattgtttaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatt 9373136  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 156
Target Start/End: Original strand, 16036426 - 16036486
Alignment:
Q  96 tttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16036426 tttcctagatttaacttaatttctctgcttaattttactatattaaccctatttaatttaa 16036486  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Original strand, 19368298 - 19368352
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19368298 cctagaattaacctaacttctttacttaattttactgtattaaccctatttaatt 19368352  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 153
Target Start/End: Original strand, 14555601 - 14555698
Alignment:
Q  57 aatctcttattc-cttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||       | | ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14555601 aatctcttattttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttattctagatttaacctaacttttttgtttaattttactatattaaccctatttaatt 14555698  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 156
Target Start/End: Original strand, 16047010 - 16047070
Alignment:
Q  96 tttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16047010 tttcctatatttaacttaatttctctgcttaattttactatattaaccctatttaatttaa 16047070  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 141
Target Start/End: Original strand, 55293591 - 55293669
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55293591 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctatatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 55293669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 49453877 - 49453788
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Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||       ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  49453877 atctcttattacttaaagttaacccgtaagcaatattttttcctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 49453788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 4137994 - 4138033
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4137994 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 4138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 26777139 - 26777178
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26777139 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 26777178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Original strand, 40817322 - 40817377
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Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttat 66  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  40817322 cacagagcctaaagcactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttat 40817377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 48520247 - 48520286
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48520247 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 48520286  T

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Target: chr3; HSP #46
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Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 55293988 - 55294027
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Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55293988 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 55294027  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 141
Target Start/End: Original strand, 8527032 - 8527074
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Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaa 141  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8527032 cctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 8527074  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9374196 - 9374144
Alignment:
Q  118 ctttgcttaattttac--tgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 168  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9374196 ctttgcttacttttacaatatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 9374144  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Original strand, 19893655 - 19893692
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19893655 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19893692  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 18688571 - 18688527
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattg 55  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18688571 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattg 18688527  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 4138846 - 4138881
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138846 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4138881  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8396314 - 8396279
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8396314 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8396279  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 8526542 - 8526577
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8526542 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8526577  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 8526770 - 8526805
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8526770 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8526805  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 19361218 - 19361253
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19361218 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19361253  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 19361952 - 19361987
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19361952 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19361987  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 19368032 - 19368067
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19368032 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19368067  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 19368562 - 19368597
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19368562 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 19368597  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 26777029 - 26777064
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26777029 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 26777064  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 29529234 - 29529269
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29529234 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 29529269  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 29529455 - 29529490
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29529455 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 29529490  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 35855708 - 35855673
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35855708 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 35855673  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39094109 - 39094074
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094109 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39094074  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 55293878 - 55293913
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55293878 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 55293913  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39093883 - 39093853
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39093883 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 39093853  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 55291103 - 55291133
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55291103 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 55291133  T

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Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8396203 - 8396170
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8396203 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 8396170  T

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Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Original strand, 26101261 - 26101298
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26101261 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 26101298  T

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Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Original strand, 40823768 - 40823801
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40823768 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 40823801  T

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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 53801805 - 53801776
Alignment:
Q  244 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53801805 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 53801776  T

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Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Original strand, 55290989 - 55291022
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55290989 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 55291022  T

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Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Original strand, 8526667 - 8526695
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8526667 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 8526695  T

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Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Original strand, 16040663 - 16040715
Alignment:
Q  104 atttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaa 156  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16040663 atttaacctaatttctctacttaattttactatattaatcctatttaatttaa 16040715  T

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Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 272
Target Start/End: Original strand, 19361841 - 19361877
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 272  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19361841 attatattaaccctagatctaatttatgcaaaatgtc 19361877  T

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Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 272
Target Start/End: Original strand, 19367921 - 19367957
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 272  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19367921 attatattaaccctagatctaatttatgcaaaatgtc 19367957  T

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Target: scaffold0115 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 7)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14897 - 14646
Alignment:
Q  23 agcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||        || |||||||||||  |||||||||||    
T  14897 agcactacataaaaaataacataacaactattgttatctcttattccttaaagttaacccaaacgtaaaaattttccctagatttaagctaacttctttg 14798  T
Q  123 cttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctcctta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14797 cttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctcctta 14698  T
Q  222 attttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697 attttactaaacaaattatattacccctagatttaatttatgcaaaatgtca 14646  T

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Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3856 - 3649
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaa 162  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||       || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3856 ttatttcttaaggttaacccgaacgcaaaatttttccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctgtttaatttaaacaaaa 3757  T
Q  163 tgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaattta 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3756 tgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctgtttaattttactaaac-aattatattaaccctagatttaattta 3658  T
Q  262 tgcaaaatg 270  Q
    |||||||||    
T  3657 tgcaaaatg 3649  T

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Target: scaffold0115; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11596 - 11389
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaa 162  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||       || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11596 ttatttcttaaggttaacccgaacgcaaaatttttccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctgtttaatttaaacaaaa 11497  T
Q  163 tgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaattta 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11496 tgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctgtttaattttactaaac-aattatattaaccctagatttaattta 11398  T
Q  262 tgcaaaatg 270  Q
    |||||||||    
T  11397 tgcaaaatg 11389  T

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Target: scaffold0115; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3460 - 3421
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3460 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 3421  T

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Target: scaffold0115; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14573 - 14536
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14573 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 14536  T

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Target: scaffold0115; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4082 - 4049
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4082 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 4049  T

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Target: scaffold0115; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11822 - 11789
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11822 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 11789  T

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Target: scaffold0051 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55456 - 55193
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||       | |||||||||||||    
T  55456 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatataatattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgtcctagatttaac 55357  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||    
T  55356 ctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacacataa 55257  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55256 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtca 55193  T

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Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 55007 - 54968
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55007 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 54968  T

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Target: scaffold0230 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 26171 - 26431
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||||||    
T  26171 cacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 26270  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26271 ctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 26370  T
Q  210 tttttctccttaattttact-caacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||| |||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26371 tttatctccttaattttattaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 26431  T

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Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 273
Target Start/End: Original strand, 27161 - 27189
Alignment:
Q  245 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161 accctagatttaatttatgcaaaatgtca 27189  T

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Target: scaffold0381 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11129 - 10856
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||    
T  11129 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaac 11030  T
Q  111 ataacttcttt--------------gcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataac 196  Q
     |||||| |||              |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11029 ctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaataac 10930  T
Q  197 aaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10929 aaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 10856  T

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Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10335 - 10113
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||             
T  10335 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacattgtt 10236  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10235 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 10136  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10135 ctagatttaatttatgcaaaatg 10113  T

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Target: scaffold0381; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10666 - 10631
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10666 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 10631  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 5)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 17545 - 17807
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaa-taacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaa 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  | |||||||||    
T  17545 cacagagcctaaaacactacataaaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaa 17644  T
Q  110 cataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaata-acaaatcgctccta 208  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17645 tctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaatagacaaatcgctccta 17744  T
Q  209 atttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 271  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17745 atttatctccttaattttactaaaataattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 17807  T

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Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 18217 - 18439
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |       | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  18217 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 18316  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaacc 247  Q
         |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  18317 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 18416  T
Q  248 ctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  18417 ttagatttaatttatgcaaaatg 18439  T

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Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 18628 - 18667
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 18667  T

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Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 17886 - 17921
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17886 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 17921  T

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Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 18523 - 18553
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 18553  T

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Target: scaffold0484 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 5)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 8328 - 8583
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||       |  || | ||||||| |||||||    
T  8328 ctaaaacactacataaaaaataacataacaactgttataatatcttatttcttaaagttaacccgaaggcaaaattttgcccaaaatttaacctaacttc 8427  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8428 tttgcttaattttattgtattaaccctattaaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctc 8527  T
Q  218 cttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8528 cttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8583  T

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Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 9078 - 9212
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9078 attaaccatgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatatctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 9177  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9178 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 9212  T

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Target: scaffold0484; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 9024 - 9076
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9024 tagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 9076  T

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Target: scaffold0484; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Original strand, 8767 - 8804
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8767 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 8804  T

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Target: scaffold0484; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 270
Target Start/End: Original strand, 8659 - 8691
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 8691  T

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Target: scaffold0069 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14537 - 14328
Alignment:
Q  19 ctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| |||||||    
T  14537 ctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttc 14438  T
Q  119 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14437 tttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctc 14338  T
Q  218 cttaatttta 227  Q
    ||||||||||    
T  14337 cttaatttta 14328  T

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Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13772 - 13733
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13772 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 13733  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 7)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 2989 - 3248
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||       |  |||| |||||||    
T  2989 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctaaatttaac 3088  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 209  Q
     ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3089 ctaatttctatgcttaattttattgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgctacggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 3188  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    ||||| |||    ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3189 tttttatcc----ttttactaaaaaaattatattattcctagatttaatttatacaaaatgtca 3248  T

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Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 3853 - 3987
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||||    
T  3853 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctttttatttttattaaacaa 3952  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 3987  T

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Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 270
Target Start/End: Original strand, 10336 - 10436
Alignment:
Q  171 ttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaat 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10336 ttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 10435  T
Q  270 g 270  Q
    |    
T  10436 g 10436  T

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Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 3802 - 3855
Alignment:
Q  100 ctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3802 ctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatt 3855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 3546 - 3581
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3546 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 3581  T

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Target: scaffold0032; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 4176 - 4215
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4176 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 4215  T

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Target: scaffold0032; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 10625 - 10664
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10625 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 10664  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 6)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 139472 - 139226
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaac 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |  || |||||||||    
T  139472 cacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaac 139373  T
Q  111 ataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaa 209  Q
     |||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  139372 ctaacttctttgcttaattttact--------------taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 139287  T
Q  210 tttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  139286 tttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 139226  T

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Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 233057 - 232831
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatt-------------- 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  233057 ttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaattttctctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctattaaattatccctatt 232958  T
Q  149 taatttaatcaaaa-tgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaac 246  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||    
T  232957 taatttaatcaaaaatgttaatgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccataattctactaaacaaattaaattaac 232858  T
Q  247 cctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  232857 cctagatttaatttatgcaaaatgtca 232831  T

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Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 232335 - 232201
Alignment:
Q  137 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaa 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  232335 attaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaa 232236  T
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  232235 attatattaacctttgatttaatttatgcaaaatg 232201  T

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Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 232387 - 232333
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  232387 cctagatttaacctaacttccttgcttaatttgactgtattaaccctatttaatt 232333  T

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Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 233121 - 233078
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattatt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  233121 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaactatt 233078  T

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Target: scaffold0009; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 232012 - 231973
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  232012 tatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 231973  T

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Target: scaffold0079 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 7)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Original strand, 8823 - 8998
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aaca 197  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8823 cctagatttgacctaatttctttgcataattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagagaaatcaaaataaaca 8922  T
Q  198 aatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8923 aatcactcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 8998  T

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Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 270
Target Start/End: Original strand, 9564 - 9746
Alignment:
Q  103 gatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------------taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatc 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  9564 gatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattatccatgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaaaa 9663  T
Q  189 aaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactcaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatg 270  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  9664 taaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattataatagccttagatttaatttatgcaaaatg 9746  T

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Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 9942 - 9981
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9942 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc 9981  T

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Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 9085 - 9120
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9085 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9120  T

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Target: scaffold0079; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 9189 - 9224
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9189 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9224  T

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Target: scaffold0079; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 9307 - 9337
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9307 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9337  T

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Target: scaffold0079; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 9836 - 9866
Alignment:
Q  243 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9836 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9866  T

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Target: scaffold2127 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold2127
Description:

Target: scaffold2127; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 816 - 637
Alignment:
Q  63 ttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt--------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  816 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 717  T
Q  154 -----taatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaatttta 227  Q
         |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  716 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaatataaacaaatcgctcctaatttttctctttaatttta 637  T

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Target: scaffold2127; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1037 - 1002
Alignment:
Q  238 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1037 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 1002  T

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Target: scaffold0368 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 790 - 670
Alignment:
Q  101 tagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaa 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||| | |||||     
T  790 tagatttaacttaacttctttgctgaattttactatattaaccntatttaatttaatcaaaatg------ttaattgttatggaaatcaaagtaaacaat 697  T
Q  200 tcgctcctaatttttctccttaatttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  696 tcgctcctaatttttctccttaatttt 670  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 200977 - 200914
Alignment:
Q  105 tttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 168  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  200977 tttaacttaatttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttattcaaaatgttaa 200914  T

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Target: scaffold0432 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0432
Description:

Target: scaffold0432; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5613 - 5518
Alignment:
Q  58 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcnnnnnnntttcctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5613 atctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatattgccctagatttaacctaactttaatgattaattttactgtattacccatatttaatt 5518  T

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Target: scaffold0759 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0759
Description:

Target: scaffold0759; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Original strand, 3569 - 3613
Alignment:
Q  11 cacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataattattg 55  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3569 cacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattg 3613  T

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Target: scaffold0180 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 153 - 105
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  153 cctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 105  T

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Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4473 - 4425
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4473 cctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 4425  T

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Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4156 - 4109
Alignment:
Q  100 ctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4156 ctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 4109  T

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Target: scaffold0180; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4365 - 4317
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4365 cctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 4317  T

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Target: scaffold0089 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 141
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  189 cctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 141  T

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Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 21551 - 21599
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21551 cctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 21599  T

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Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 21967 - 22015
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21967 cctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 22015  T

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Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 81 - 33
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctat 147  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  81 cctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 33  T

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Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 20704 - 20748
Alignment:
Q  99 cctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaacc 143  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20704 cctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaacc 20748  T

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Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 273
Target Start/End: Original strand, 86518 - 86555
Alignment:
Q  236 attatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 273  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  86518 attatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtca 86555  T

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