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Alignment Overview

Query: NF1272_low_77 (Length: 267)

Name: NF1272_low_77
Description: NF1272
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1272_low_77
NF1272_low_77
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (22-262)||(17835428-17835668)
chr7 (22-262)||(27453100-27453340)
chr7 (22-262)||(47672566-47672806)
chr7 (22-262)||(47776686-47776926)
chr7 (45-262)||(10517332-10517549)
chr7 (22-262)||(39460880-39461120)
chr7 (22-262)||(9494277-9494516)
chr7 (22-262)||(34738718-34738958)
chr7 (22-262)||(36977950-36978190)
chr7 (22-262)||(37340656-37340896)
chr7 (35-262)||(15073723-15073949)
chr7 (35-262)||(42507522-42507748)
chr7 (36-262)||(14689553-14689779)
chr7 (95-228)||(556200-556333)
chr7 (97-228)||(5541096-5541227)
chr7 (109-228)||(41880876-41880995)
chr7 (109-228)||(35609984-35610103)
chr7 (97-228)||(46740103-46740234)
chr7 (109-228)||(48403743-48403862)
chr7 (97-214)||(16675186-16675303)
chr7 (97-214)||(17649554-17649671)
chr7 (112-228)||(17741019-17741135)
chr7 (109-228)||(45257374-45257492)
chr7 (109-228)||(9370958-9371073)
chr7 (149-228)||(17465329-17465408)
chr7 (149-228)||(17587806-17587885)
chr7 (109-146)||(17462862-17462899)
chr7 (109-146)||(17590315-17590352)
chr7 (167-218)||(41734559-41734610)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (22-262)||(42165514-42165754)
chr3 (22-262)||(4007804-4008044)
chr3 (22-262)||(47073688-47073928)
chr3 (22-260)||(3976060-3976298)
chr3 (22-262)||(44230065-44230305)
chr3 (22-262)||(50963306-50963545)
chr3 (22-262)||(30255483-30255723)
chr3 (22-262)||(42756505-42756743)
chr3 (22-262)||(20917496-20917738)
chr3 (22-262)||(20926458-20926700)
chr3 (22-262)||(42805742-42805983)
chr3 (22-262)||(49195928-49196168)
chr3 (22-240)||(48563301-48563519)
chr3 (61-262)||(50216398-50216599)
chr3 (22-262)||(48889095-48889326)
chr3 (126-260)||(3501477-3501611)
chr3 (106-262)||(597110-597266)
chr3 (97-228)||(16611463-16611594)
chr3 (97-228)||(22047659-22047790)
chr3 (95-228)||(17567618-17567751)
chr3 (97-228)||(41612753-41612884)
chr3 (170-262)||(51807321-51807413)
chr3 (109-228)||(52390964-52391083)
chr3 (97-228)||(20351030-20351161)
chr3 (109-228)||(2274482-2274601)
chr3 (109-228)||(29009245-29009364)
chr3 (97-228)||(36127822-36127953)
chr3 (109-228)||(42903758-42903877)
chr3 (109-228)||(46389347-46389466)
chr3 (109-228)||(50480352-50480471)
chr3 (109-228)||(54386509-54386628)
chr3 (109-228)||(49144031-49144149)
chr3 (109-228)||(34045762-34045880)
chr3 (109-228)||(46701593-46701712)
chr3 (112-218)||(4178199-4178305)
chr3 (112-226)||(31045165-31045279)
chr3 (112-218)||(4172201-4172307)
chr3 (22-71)||(54681980-54682029)
chr3 (22-55)||(49268749-49268782)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (22-262)||(39947952-39948192)
chr2 (22-260)||(28468995-28469232)
chr2 (22-260)||(45428945-45429182)
chr2 (22-262)||(32955840-32956075)
chr2 (35-260)||(17420921-17421145)
chr2 (66-260)||(21998544-21998737)
chr2 (126-262)||(25965172-25965308)
chr2 (22-205)||(45136784-45136956)
chr2 (162-262)||(7185381-7185481)
chr2 (97-228)||(29401160-29401291)
chr2 (103-228)||(45284558-45284683)
chr2 (103-228)||(45291921-45292046)
chr2 (97-228)||(10828581-10828712)
chr2 (109-228)||(20938282-20938401)
chr2 (97-228)||(25515366-25515496)
chr2 (97-228)||(36655906-36656037)
chr2 (109-228)||(3940297-3940416)
chr2 (109-228)||(5352351-5352470)
chr2 (109-228)||(15831514-15831633)
chr2 (109-228)||(30496515-30496634)
chr2 (109-228)||(43978906-43979025)
chr2 (22-145)||(22686849-22686970)
chr2 (109-228)||(43539306-43539425)
chr2 (212-262)||(45137103-45137153)
chr2 (140-226)||(31367427-31367513)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (22-262)||(43211857-43212097)
chr8 (22-262)||(5303702-5303942)
chr8 (22-262)||(43188401-43188641)
chr8 (22-262)||(39938697-39938937)
chr8 (22-262)||(15036209-15036449)
chr8 (40-262)||(39846485-39846707)
chr8 (73-262)||(39602067-39602256)
chr8 (22-262)||(39252363-39252594)
chr8 (22-262)||(34822497-34822738)
chr8 (35-262)||(489124-489350)
chr8 (22-262)||(40076740-40076971)
chr8 (22-260)||(45064595-45064822)
chr8 (35-262)||(42485024-42485259)
chr8 (22-262)||(41249570-41249794)
chr8 (59-228)||(2984508-2984677)
chr8 (105-234)||(37327163-37327292)
chr8 (97-228)||(35552051-35552182)
chr8 (97-228)||(20857671-20857802)
chr8 (97-262)||(24249835-24249999)
chr8 (109-228)||(25095-25214)
chr8 (109-228)||(1052910-1053029)
chr8 (109-228)||(23021889-23022008)
chr8 (109-228)||(26659832-26659951)
chr8 (102-228)||(45128135-45128261)
chr8 (97-200)||(34371450-34371553)
chr8 (97-228)||(5677456-5677587)
chr8 (210-262)||(25864609-25864661)
chr8 (112-226)||(22495305-22495419)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (23-258)||(31783210-31783445)
chr1 (22-262)||(35258354-35258594)
chr1 (22-262)||(45825228-45825469)
chr1 (22-262)||(19527024-19527264)
chr1 (22-262)||(23275585-23275825)
chr1 (22-262)||(51321066-51321305)
chr1 (35-262)||(19925094-19925320)
chr1 (35-262)||(30890413-30890639)
chr1 (23-262)||(52802483-52802722)
chr1 (22-262)||(47502667-47502895)
chr1 (59-262)||(49857464-49857664)
chr1 (97-228)||(21141413-21141544)
chr1 (97-228)||(50343525-50343656)
chr1 (109-228)||(2365622-2365741)
chr1 (109-228)||(19156401-19156520)
chr1 (97-228)||(47656256-47656386)
chr1 (97-228)||(2424924-2425053)
chr1 (97-228)||(97504-97635)
chr1 (112-228)||(17514267-17514383)
chr1 (97-228)||(22524521-22524650)
chr1 (109-228)||(3731949-3732068)
chr1 (109-228)||(13639591-13639710)
chr1 (109-228)||(26876043-26876162)
chr1 (104-218)||(38127045-38127160)
chr1 (140-228)||(8474171-8474259)
chr1 (22-74)||(19526837-19526889)
chr1 (222-260)||(29622105-29622143)
chr1 (29-74)||(19524674-19524719)
chr1 (29-74)||(19524861-19524906)
chr1 (29-74)||(19525522-19525567)
chr1 (29-74)||(19526657-19526702)
chr1 (157-226)||(23935581-23935650)
chr1 (126-185)||(16243106-16243165)
chr1 (140-187)||(25166976-25167023)
chr1 (140-218)||(25147698-25147776)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (22-262)||(21022370-21022609)
chr4 (22-262)||(51683554-51683794)
chr4 (22-262)||(50275086-50275326)
chr4 (22-262)||(37021559-37021804)
chr4 (22-262)||(48256052-48256292)
chr4 (22-262)||(55407268-55407508)
chr4 (22-260)||(40357762-40357999)
chr4 (35-262)||(30726236-30726462)
chr4 (23-262)||(50901832-50902070)
chr4 (35-262)||(1089079-1089305)
chr4 (35-262)||(1308609-1308835)
chr4 (105-258)||(67947-68100)
chr4 (105-259)||(46436599-46436753)
chr4 (59-228)||(11050041-11050210)
chr4 (97-262)||(21538008-21538183)
chr4 (97-228)||(50023099-50023230)
chr4 (71-262)||(14315726-14315927)
chr4 (97-228)||(50030217-50030348)
chr4 (97-228)||(10752983-10753114)
chr4 (97-228)||(10966752-10966883)
chr4 (97-262)||(14297477-14297652)
chr4 (109-228)||(9892836-9892955)
chr4 (117-228)||(41798571-41798682)
chr4 (97-228)||(3184342-3184473)
chr4 (97-228)||(3185440-3185571)
chr4 (97-228)||(3185648-3185779)
chr4 (109-228)||(6181358-6181477)
chr4 (109-228)||(49090806-49090925)
chr4 (109-228)||(49165419-49165538)
chr4 (105-218)||(30704419-30704532)
chr4 (97-226)||(41933179-41933308)
chr4 (97-228)||(44679631-44679762)
chr4 (97-262)||(11083562-11083737)
chr4 (109-228)||(31422083-31422203)
chr4 (108-228)||(50193864-50193985)
chr4 (112-218)||(4719949-4720055)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (22-262)||(15103-15344)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (22-262)||(6320044-6320284)
chr6 (22-262)||(31769057-31769297)
chr6 (22-262)||(24088263-24088503)
chr6 (97-228)||(24722314-24722445)
chr6 (97-228)||(3501555-3501686)
chr6 (97-227)||(26423384-26423514)
chr6 (112-228)||(21600990-21601106)
chr6 (109-228)||(6201534-6201653)
chr6 (109-228)||(11688501-11688620)
chr6 (109-228)||(22301566-22301685)
chr6 (109-228)||(30829220-30829339)
chr6 (109-228)||(27617101-27617220)
chr6 (71-216)||(3381182-3381315)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (23-262)||(19228154-19228393)
chr5 (22-262)||(7757676-7757916)
chr5 (29-260)||(8579994-8580224)
chr5 (22-262)||(17658674-17658914)
chr5 (22-262)||(42537501-42537741)
chr5 (22-262)||(42941968-42942207)
chr5 (22-262)||(8701705-8701945)
chr5 (22-258)||(28876999-28877234)
chr5 (22-262)||(38968449-38968690)
chr5 (22-262)||(512253-512493)
chr5 (35-262)||(28241294-28241520)
chr5 (112-258)||(14260-14406)
chr5 (97-228)||(5197359-5197490)
chr5 (95-262)||(40624468-40624645)
chr5 (109-228)||(19040685-19040804)
chr5 (100-228)||(20422335-20422463)
chr5 (112-228)||(27673224-27673340)
chr5 (109-228)||(30705522-30705641)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (45-260)||(233-447)
[»] scaffold0634 (2 HSPs)
scaffold0634 (107-262)||(7770-7925)
scaffold0634 (29-62)||(7899-7932)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (97-227)||(18489-18619)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (105-207)||(10761-10863)
scaffold0155 (231-262)||(8555-8586)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (97-228)||(4210-4341)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (140-188)||(246180-246228)
scaffold0007 (121-226)||(251056-251161)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17835668 - 17835428
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17835668 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataacctaaactaact 17835569  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835568 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 17835469  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835468 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 17835428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 27453100 - 27453340
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  27453100 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactgact 27453199  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27453200 aaataatcaataaaattgtcaatgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 27453299  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27453300 acattatgatttaaacaacataggtaacaactacattcatt 27453340  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 47672566 - 47672806
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  47672566 catcataattctcataacctaaactaactagaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 47672665  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672666 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 47672765  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672766 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 47672806  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47776926 - 47776686
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  47776926 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccagactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 47776827  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47776826 aaataatcaataaatttgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgtcaccattcaaagcc 47776727  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776726 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 47776686  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 45 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10517549 - 10517332
Alignment:
Q  45 ctaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcatt 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517549 ctaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcatt 10517450  T
Q  145 gaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatag 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517449 gagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatag 10517350  T
Q  245 gcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10517349 gcaacaactacattcatt 10517332  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39461120 - 39460880
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  39461120 catcataattcttgtaacctaaactaactaaaacatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctaccatatccataacctaaactaact 39461021  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461020 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 39460921  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39460920 acattatgatttaaacaaaataggcaacaactacattcatt 39460880  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 9494277 - 9494516
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  9494277 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatt-ccataacctaaactaact 9494375  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494376 aaataatcaatataattttcattgacgcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 9494475  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494476 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 9494516  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34738958 - 34738718
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34738958 catcataattctcgtaacttacactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 34738859  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34738858 acataatcaataaaattgtcatcgagacattttatcaaacactttgtgagcaaagcataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 34738759  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34738758 acattatgatttaaacaacataggtaacaactacattcatt 34738718  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36978190 - 36977950
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36978190 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 36978091  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  36978090 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttaccaccattcaaagtc 36977991  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36977990 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 36977950  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37340896 - 37340656
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37340896 catcataattctcataacctaaactaactaacaaattaatatactcttaaccaaactataattaacagcatttctatcatttccataacctaaactaact 37340797  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340796 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 37340697  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37340696 acattatgatttaaacaacataggcaacaagtacattcatt 37340656  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 15073723 - 15073949
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15073723 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 15073821  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073822 aattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 15073921  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15073922 aactacataggcaacaactacattcatt 15073949  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 42507522 - 42507748
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42507522 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 42507620  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507621 aattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 42507720  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42507721 aactacataggcaacaactacattcatt 42507748  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 262
Target Start/End: Original strand, 14689553 - 14689779
Alignment:
Q  36 taacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaa 135  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  14689553 taacataaactaactaaataatcaatatacacttaaccaaacaataattaacatcatttttatcatttccataacataaactaactaaataatcaatata 14689652  T
Q  136 attgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaa 235  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  14689653 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtatgcaaagtataaaagatattcaaattgtgtttatttgccactattcaaagctacattatcatttaa 14689752  T
Q  236 acaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14689753 acaacatagacaacaactacattcatt 14689779  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Original strand, 556200 - 556333
Alignment:
Q  95 atatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaat 194  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||     
T  556200 atataattttcataacataaactaactaaataataaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtatgcaaagtatcaaacatactcaaaa 556299  T
Q  195 tgtgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  556300 tatgttcatttgccaccattcaaaaccacattat 556333  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 5541096 - 5541227
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |     
T  5541096 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacaatttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaata 5541195  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    || || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  5541196 tgatcttttgccaccattcaaaaccacgttat 5541227  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41880995 - 41880876
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  41880995 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 41880896  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  41880895 accattcaaaaccacattat 41880876  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 35609984 - 35610103
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  35609984 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 35610083  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  35610084 accaatcaaaaccacattat 35610103  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 46740103 - 46740234
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  46740103 atcatatccatgacctaaactaattaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaatcactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 46740202  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  46740203 tgttcttttgccaccattcaaaatcacattat 46740234  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48403862 - 48403743
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  48403862 acctaaactaactaaataatcaataaaattatcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 48403763  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  48403762 accattcaaaaccacattat 48403743  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16675303 - 16675186
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  16675303 atcatatccataacctaaactaacaaaataatcaataaaattgtcattgagacattttattaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 16675204  T
Q  197 tgttcatttgccaccatt 214  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  16675203 tattcttttgccaccatt 16675186  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17649671 - 17649554
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  17649671 atcatatccataacctaaactaacaaaataatcaataaaattgtcattgagacattttattaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 17649572  T
Q  197 tgttcatttgccaccatt 214  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  17649571 tattcttttgccaccatt 17649554  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Original strand, 17741019 - 17741135
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17741019 taaactaactaaataatcaatataattctcatttgggaattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttcatatggcacc 17741118  T
Q  212 attcaaagccacattat 228  Q
    ||||||| |||||||||    
T  17741119 attcaaaaccacattat 17741135  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45257492 - 45257374
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||    
T  45257492 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt-ttttacc 45257394  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  45257393 accattcaaaaccacattat 45257374  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 9370958 - 9371073
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||| ||||||  ||||||    
T  9370958 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtat----catactcaaaatgtgttattttgcc 9371053  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  9371054 accaatcaaaaccacattat 9371073  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Original strand, 17465329 - 17465408
Alignment:
Q  149 cattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  17465329 cattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgccaccattcaaaaccacattat 17465408  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17587885 - 17587806
Alignment:
Q  149 cattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  17587885 cattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgccaccattcaaaaccacattat 17587806  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 146
Target Start/End: Original strand, 17462862 - 17462899
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattga 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462862 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattga 17462899  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17590352 - 17590315
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattga 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590352 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattga 17590315  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41734610 - 41734559
Alignment:
Q  167 gtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaa 218  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41734610 gtgtgcaaagtatcaaacatactaaaaatgtgttcttttgccaccattcaaa 41734559  T

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Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 42165754 - 42165514
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42165754 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataacctaaactaact 42165655  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165654 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaatatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 42165555  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165554 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 42165514  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 4007804 - 4008044
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4007804 catcataattcttgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcctttatatcatttccataacctaaactaact 4007903  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4007904 aaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 4008003  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4008004 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 4008044  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 47073688 - 47073928
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  47073688 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 47073787  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47073788 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaatatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 47073887  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47073888 acattatgatttaaacaatataggcaacaactacattcatt 47073928  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3976298 - 3976060
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3976298 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcctttatatcatttccataacctaaactaact 3976199  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976198 aaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 3976099  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3976098 acattatgatttaaactacataggcaacaactacattca 3976060  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44230305 - 44230065
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  44230305 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaaccaact 44230206  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44230205 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacacattgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccgttcaaagcc 44230106  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44230105 acattatgttttaaacaacataggcaacaactacattcatt 44230065  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 50963545 - 50963306
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50963545 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat-attaacatcatttatatcatttccataacctaaactaact 50963447  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963446 aaataatttataaaattgtcactgaggcattttatcaaacactttgtgtgtaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 50963347  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963346 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 50963306  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 30255483 - 30255723
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    
T  30255483 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccttaacctgaactaact 30255582  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255583 aaataatcaatataaatttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 30255682  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255683 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 30255723  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 42756743 - 42756505
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42756743 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 42756644  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42756643 aaataatcaataa--ttttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcg 42756546  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42756545 acattatgatttaaacaacatagacaacaactacatccatt 42756505  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 20917496 - 20917738
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacac--ttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaa 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||    
T  20917496 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacacttaaccaaactataattaacatcatttcaatcatttccataacttaaactaa 20917595  T
Q  120 ctaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaag 219  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917596 ctaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaag 20917695  T
Q  220 ccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917696 ccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatt 20917738  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 20926458 - 20926700
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacac--ttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaa 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||    
T  20926458 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacacttaaccaaactataattaacatcatttcaatcatttccataacttaaactaa 20926557  T
Q  120 ctaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaag 219  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926558 ctaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaag 20926657  T
Q  220 ccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926658 ccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatt 20926700  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 42805742 - 42805983
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaatt-aatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaac 120  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42805742 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaaatcaatatacacctaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaac 42805841  T
Q  121 taaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 220  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805842 taaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacattttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 42805941  T
Q  221 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42805942 cacattatcatttaaacaacatagacaacaactacattcatt 42805983  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 49195928 - 49196168
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  49195928 catcataattcttgtaagctaaactaactaaaaaatcaatatacaattaaccaaactataattaacatcatttctatcattttcataacctaaactaact 49196027  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49196028 aaataatcaatataattttcattgaagcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 49196127  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49196128 acattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatt 49196168  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48563519 - 48563301
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  48563519 catcataattcttgtaatctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 48563420  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48563419 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacattttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagac 48563320  T
Q  222 acattatgatttaaacaac 240  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48563319 acattatgatttaaacaac 48563301  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 61 - 262
Target Start/End: Original strand, 50216398 - 50216599
Alignment:
Q  61 tatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaa 160  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50216398 tatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaaccacataatcaataaaattgtcattgaagcattttatcaaa 50216497  T
Q  161 cactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216498 cactttgtgtgcaaagcataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaaaccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 50216597  T
Q  261 tt 262  Q
    ||    
T  50216598 tt 50216599  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48889326 - 48889095
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         |||||||||||| |||||    
T  48889326 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcattt---------ccataacctaaactaact 48889236  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  48889235 aaataatcaatataattttcattgaggcctttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttaccaccattcaaagtc 48889136  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889135 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 48889095  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 126 - 260
Target Start/End: Original strand, 3501477 - 3501611
Alignment:
Q  126 aatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacat 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3501477 aatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaacccacat 3501576  T
Q  226 tatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501577 tatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 3501611  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 597266 - 597110
Alignment:
Q  106 ataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcattt 205  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||    
T  597266 ataacctaagctaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacataatcaaaatgtgttctttt 597167  T
Q  206 gccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  597166 gccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatgggcaacaactacattcatt 597110  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16611594 - 16611463
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  16611594 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 16611495  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16611494 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 16611463  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 22047659 - 22047790
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  22047659 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 22047758  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22047759 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 22047790  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Original strand, 17567618 - 17567751
Alignment:
Q  95 atatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaat 194  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  17567618 atatcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaa 17567717  T
Q  195 tgtgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17567718 tgtgttcttttgccaccattgaaaaccacattat 17567751  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41612884 - 41612753
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  41612884 atcatatccataaactaaactaactagataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 41612785  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  41612784 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 41612753  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 170 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 51807413 - 51807321
Alignment:
Q  170 tgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51807413 tgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatt 51807321  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 52390964 - 52391083
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  52390964 acctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttattttgcc 52391063  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  52391064 accattcaaaaccacattat 52391083  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20351161 - 20351030
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcatttt-atcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaatt 195  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  20351161 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttaatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaa-t 20351063  T
Q  196 gtgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  20351062 gtgttcttttgccaccattcaaaaccaaattat 20351030  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 2274482 - 2274601
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  2274482 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttccc 2274581  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  2274582 accattcaaaaccacattat 2274601  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29009364 - 29009245
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  29009364 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 29009265  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  29009264 accattcaaaaccacattat 29009245  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36127953 - 36127822
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  36127953 atcatatccatagcctaaactaaccaaataatcaagaaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 36127854  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36127853 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 36127822  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 42903758 - 42903877
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  42903758 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 42903857  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  42903858 accaatcaaaaccacattat 42903877  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46389466 - 46389347
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  46389466 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 46389367  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  46389366 accaatcaaaaccacattat 46389347  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 50480352 - 50480471
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  50480352 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 50480451  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  50480452 accaatcaaaaccacattat 50480471  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54386628 - 54386509
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  54386628 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 54386529  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  54386528 accaatcaaaaccacattat 54386509  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 49144031 - 49144149
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  49144031 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaa-atattcaaaatgtgttattttgcc 49144129  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  49144130 accaatcaaaaccacattat 49144149  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34045880 - 34045762
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||  ||||||    
T  34045880 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaa-atactcaaaatgtgttattttgcc 34045782  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  34045781 accaatcaaaaccacattat 34045762  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 46701593 - 46701712
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||  ||||||    
T  46701593 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatgctcaaaatgtcttattttgcc 46701692  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  46701693 accaatcaaaaccacattat 46701712  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4178305 - 4178199
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||| ||||    
T  4178305 taaactaactaaataatcaataaaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaaagtattcaaattatcttcatttgacacc 4178206  T
Q  212 attcaaa 218  Q
    |||||||    
T  4178205 attcaaa 4178199  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Original strand, 31045165 - 31045279
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||| |||||||||||| |||  |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  31045165 taaactaactaaataataaatgcaattctcattttggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcacattgtgttattttgacacc 31045264  T
Q  212 attcaaagccacatt 226  Q
    ||||||| |||||||    
T  31045265 attcaaaaccacatt 31045279  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4172307 - 4172201
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||  ||||    
T  4172307 taaactaactaaataatcaataaaattctcatttgggcattttgtcaaacactttttgtgcaaagtatcaaaagtattcaaattatcttcatttaacacc 4172208  T
Q  212 attcaaa 218  Q
    |||||||    
T  4172207 attcaaa 4172201  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 54682029 - 54681980
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaa 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54682029 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaa 54681980  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 55
Target Start/End: Original strand, 49268749 - 49268782
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaa 55  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49268749 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaa 49268782  T

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Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39948192 - 39947952
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39948192 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataacctaaactaact 39948093  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39948092 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcttttgccaccattcaaagcc 39947993  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39947992 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 39947952  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28469232 - 28468995
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  28469232 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaact 28469134  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469133 aaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 28469034  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28469033 acattatgatttaaacaacataggcaacaattacattca 28468995  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45429182 - 45428945
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45429182 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaact 45429084  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429083 aaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 45428984  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  45428983 acattatgatttaaactacgtaggcaacaactacattca 45428945  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 32955840 - 32956075
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32955840 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttac-caaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 32955938  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32955939 aaataatcaa----attgtcattgaggcattttatcaaacactttgcgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 32956034  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32956035 acattataatttaaacaacataggcaacaagtacattcatt 32956075  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17421145 - 17420921
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17421145 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 17421047  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17421046 aattgtcattgagacattttatcaaacacttgatgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaacccacattatgattta 17420947  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17420946 aacaacataggcaacaactacattca 17420921  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 66 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21998737 - 21998544
Alignment:
Q  66 acttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactt 165  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21998737 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactt 21998639  T
Q  166 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  21998638 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatagacaacaaataaattca 21998544  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25965308 - 25965172
Alignment:
Q  126 aatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacat 225  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25965308 aatcaataaaattatcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaacattcaaagccacat 25965209  T
Q  226 tatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25965208 tatgatttaaacaacataggaaacaactacattcatt 25965172  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Original strand, 45136784 - 45136956
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||       
T  45136784 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacatttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaacta--- 45136880  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcattt 205  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45136881 --------aataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaatatatttaaattgtgttcattt 45136956  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 162 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7185481 - 7185381
Alignment:
Q  162 actttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7185481 actttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcat 7185382  T
Q  262 t 262  Q
    |    
T  7185381 t 7185381  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 29401160 - 29401291
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  29401160 atcatatccataagctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 29401259  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29401260 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 29401291  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45284683 - 45284558
Alignment:
Q  103 tccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttca 202  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||     
T  45284683 tccataatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagccattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatacttaaaatgtgttct 45284584  T
Q  203 tttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  45284583 tttgccaccattcaaaaccacattat 45284558  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45292046 - 45291921
Alignment:
Q  103 tccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttca 202  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||     
T  45292046 tccataatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagccattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatacttaaaatgtgttct 45291947  T
Q  203 tttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  45291946 tttgccaccattcaaaaccacattat 45291921  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 10828581 - 10828712
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  10828581 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtccaaagtatcaaacatactcaaaatg 10828680  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
     |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  10828681 cgttcttttgccacaattcaaaaccacattat 10828712  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20938401 - 20938282
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  20938401 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 20938302  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  20938301 accattcaaaaccacattat 20938282  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 25515366 - 25515496
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  25515366 atcatttccataacctaaactaactcaataatcaatataattctcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaatcg 25515465  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  25515466 tgctc-tttgccaccattcaaaaccacattat 25515496  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 36655906 - 36656037
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  36655906 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaatgttcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 36656005  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  36656006 tgttcttttgccaccattgaaaaccacattat 36656037  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 3940297 - 3940416
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  3940297 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 3940396  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  3940397 accaatcaaaaccacattat 3940416  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5352470 - 5352351
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  5352470 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 5352371  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  5352370 accaatcaaaaccacattat 5352351  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15831633 - 15831514
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  15831633 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaagactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 15831534  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  15831533 accattcaaaaccacattat 15831514  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 30496515 - 30496634
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  30496515 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 30496614  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  30496615 accaatcaaaaccacattat 30496634  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43979025 - 43978906
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  43979025 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 43978926  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  43978925 accaatcaaaaccacattat 43978906  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22686970 - 22686849
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  22686970 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctaccatttccataa-ctaaactaact 22686872  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattg 145  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  22686871 aaataatcact-aaattgtcattg 22686849  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 43539306 - 43539425
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  43539306 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaaaacattgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 43539405  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| ||| |||||    
T  43539406 accaatcaaaaccatattat 43539425  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 45137103 - 45137153
Alignment:
Q  212 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  45137103 attcaaggccacattatgatttaaataacataggcaagaactacattcatt 45137153  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31367513 - 31367427
Alignment:
Q  140 tcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacatt 226  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| || |   ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  31367513 tcatttaggcattttaacaaacactttttgtgcaaaatatgaaacttaatatcattatgttgatttgacaccattcaaaaccacatt 31367427  T

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Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43212097 - 43211857
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43212097 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccttaacctaaactaact 43211998  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43211997 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttcccaccattcaaagcc 43211898  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43211897 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 43211857  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 5303702 - 5303942
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5303702 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 5303801  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303802 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 5303901  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5303902 acattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatt 5303942  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43188641 - 43188401
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43188641 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttatatcatttccataacataaactaact 43188542  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43188541 aaataatcaataaaattgtcattgaaacattttatcaaacactttgtatgcaaagtataaaacatattcaaatcgtgttcatttgccaccattcaaagcc 43188442  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43188441 acattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatt 43188401  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 39938697 - 39938937
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39938697 catcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 39938796  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39938797 acataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaatactttgtgtgcaaagtataaaacttattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 39938896  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39938897 ccattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 39938937  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 15036209 - 15036449
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaaca-tcatttatatcatttccataacctaaattaac 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  15036209 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaaccctaatttctatcatttccataac-taaactaac 15036307  T
Q  121 taaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036308 taaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 15036407  T
Q  221 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036408 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 15036449  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 262
Target Start/End: Original strand, 39846485 - 39846707
Alignment:
Q  40 ctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattg 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39846485 ctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattg 39846584  T
Q  140 tcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaa 239  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846585 tcatggagacagtttatcaaacactttgtgtacaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaa 39846684  T
Q  240 cataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39846685 cataggcaacaactacattcatt 39846707  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39602256 - 39602067
Alignment:
Q  73 caaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgc 172  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602256 caaaatataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgc 39602157  T
Q  173 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602156 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 39602067  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39252594 - 39252363
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||         |||||||||||| |||||    
T  39252594 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttgaccaaactataattaacatcattt---------ccataacctaaactaact 39252504  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39252503 aaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtattcatttgccaccattcaaagcc 39252404  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39252403 acattatgatttaaacaacatatgcaacaactacattcatt 39252363  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 34822497 - 34822738
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaatt-aatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaac 120  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34822497 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaac 34822596  T
Q  121 taaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 220  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  34822597 taaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcagagtataaaacatatttaaattgtgttcatttgcagtcattcaaagc 34822696  T
Q  221 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34822697 cacattatgatttaaccaacataggcaacaactacattcatt 34822738  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 489124 - 489350
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  489124 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 489222  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  489223 aattgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatatttaaattgtgttcatttgcaaccattcaaagccacattataattta 489322  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  489323 aactacataggcaacatctacattcatt 489350  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 40076740 - 40076971
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | |         |||||||| |||||    
T  40076740 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattatcatcatttctgt---------aacctaaactaact 40076830  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076831 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaattataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 40076930  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40076931 acattatgatttaaacaacataggcaacagctacattcatt 40076971  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45064822 - 45064595
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  45064822 catcataattctcctaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataa-ctaaactaact 45064724  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45064723 aaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaa----------aaattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 45064634  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45064633 acattaagatttaaacaacataggcaacaactacattca 45064595  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 42485024 - 42485259
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttc---------cataacctaaattaactaaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||         |||||| |||| |||||||||    
T  42485024 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaat 42485122  T
Q  126 aatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacat 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42485123 aatcaataaaattgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacat 42485222  T
Q  226 tatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42485223 tataatttaaactacataggcaacatctacattcatt 42485259  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 41249570 - 41249794
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41249570 catcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 41249669  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||                 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41249670 acataatcaataaaattgtcattgcggca----------------atgtgcaaagtataaagcatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 41249753  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41249754 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 41249794  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2984677 - 2984508
Alignment:
Q  59 aatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatca 158  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2984677 aatatacactttatcaaactataattaacatcattttcatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattgtcgttgaggcattttatca 2984578  T
Q  159 aacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  2984577 aacactttgtgtgcaaagtatgaaacttattcaaattgtgtttatttggcatcattcaaaaccacattat 2984508  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37327292 - 37327163
Alignment:
Q  105 cataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37327292 cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 37327193  T
Q  205 tgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  37327192 tgccaccattcaaaatcacattatcattta 37327163  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35552182 - 35552051
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  35552182 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 35552083  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  35552082 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 35552051  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20857802 - 20857671
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  20857802 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacaatttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 20857703  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  20857702 tgttcttttgcaaccattcaaaaccacattat 20857671  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24249999 - 24249835
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24249999 atcatttccataacctaaactgactaaataatcaatataattctcattggggcattttatcaaatactttatgtgcaaagtatcaaacatattcaaaatg 24249900  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    |||||||||||||||||    
T  24249899 tgctcatttgacaccattcaaaaccacattat-acttaaacatcaattacaacaactacattcatt 24249835  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 25095 - 25214
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  25095 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 25194  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  25195 accaatcaaaaccacattat 25214  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1053029 - 1052910
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  1053029 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgatacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 1052930  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  1052929 accaatcaaaaccacattat 1052910  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 23021889 - 23022008
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  23021889 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 23021988  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  23021989 accaatcaaaaccacattat 23022008  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26659951 - 26659832
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  26659951 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 26659852  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  26659851 accaatcaaaaccacattat 26659832  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45128261 - 45128135
Alignment:
Q  102 ttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttc 201  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  45128261 ttccataacctaaactaactcaataatcaatacaattcacattggggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaacgtgttc 45128162  T
Q  202 atttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
     |||||||||||||||| |||||||||    
T  45128161 ttttgccaccattcaaaaccacattat 45128135  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 34371450 - 34371553
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  34371450 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaaaaaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 34371549  T
Q  197 tgtt 200  Q
    ||||    
T  34371550 tgtt 34371553  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5677587 - 5677456
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| ||    
T  5677587 atcatttccataacctaaacttactcgataatcaatataattttcattggggcattttatcaaacactttctgtgcaaaacatcaaacatactcaaaatg 5677488  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    | ||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  5677487 tattcttttgctaccattcaaaaccacattat 5677456  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 262
Target Start/End: Original strand, 25864609 - 25864661
Alignment:
Q  210 ccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25864609 ccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 25864661  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22495419 - 22495305
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| |   | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  22495419 taaactaagtaaataatcaatgcaattttcatttgggcattttatcaaaaaacatttgtgcaaagtatcaaacatattctcattgtgttaatttgacacc 22495320  T
Q  212 attcaaagccacatt 226  Q
    ||||||| |||||||    
T  22495319 attcaaaaccacatt 22495305  T

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Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 31783210 - 31783445
Alignment:
Q  23 atcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaacta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31783210 atcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataatctaaactaacta 31783309  T
Q  123 aataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783310 aataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcca 31783409  T
Q  223 cattatgatttaaacaacataggcaacaactacatt 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31783410 cattatgatttaaagaacataggcaacaactacatt 31783445  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 35258354 - 35258594
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  35258354 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttctataacctaaactaact 35258453  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258454 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 35258553  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35258554 acattatgatttaaacaacataggcaacaactaaattcatt 35258594  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45825469 - 45825228
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45825469 catcataattctcgtaacttaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaattaact 45825370  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgc-aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 220  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825369 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 45825270  T
Q  221 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825269 cacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatt 45825228  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 19527024 - 19527264
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19527024 catcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataactaacatcatttctatcattttcataacctaaattaact 19527123  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19527124 acataatcaataaaattgttattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaaacataaaacatattcaaattgtgtccatttgccaccattcaaagcc 19527223  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19527224 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 19527264  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 23275585 - 23275825
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||    
T  23275585 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat-attaacatcatttctatcatttccataacttaaactgact 23275683  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcca-ccattcaaagc 220  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  23275684 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgtcacccattcaaagt 23275783  T
Q  221 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275784 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 23275825  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 51321305 - 51321066
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  51321305 catcataattctcataacctaaactaactaaaaa-tcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 51321207  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  51321206 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaaatataaaacatattcaaattgtgttcatttgccactattcaaagtc 51321107  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51321106 acattatgatttaaacaatataggcaacaactacattcatt 51321066  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19925320 - 19925094
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19925320 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 19925222  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19925221 aattgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattataattta 19925122  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19925121 aactacataggcaacatctacattcatt 19925094  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30890639 - 30890413
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30890639 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 30890541  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30890540 aattgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattataattta 30890441  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30890440 aactacataggcaacatctacattcatt 30890413  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 52802722 - 52802483
Alignment:
Q  23 atcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaacta 122  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  52802722 atcataattctcttaacctaaactaacaaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccatagcctaaactaacta 52802623  T
Q  123 aataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcca 222  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  52802622 aacaatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaagatattcaaattgtgttattttgccaccattcaaaatca 52802523  T
Q  223 cattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52802522 cattatgacttaaacaacataagcaacaactacattcatt 52802483  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47502895 - 47502667
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||         |||||    |||||    
T  47502895 catcataattcttgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctat---------aacctc---taact 47502808  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502807 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttaccaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 47502708  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502707 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 47502667  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 262
Target Start/End: Original strand, 49857464 - 49857664
Alignment:
Q  59 aatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatca 158  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |   |||||||||| ||||    
T  49857464 aatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataatttt---tgaggcatttgatca 49857560  T
Q  159 aacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacatt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857561 aacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattctcatttaaacaacataggcaacaactacatt 49857660  T
Q  259 catt 262  Q
    ||||    
T  49857661 catt 49857664  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21141544 - 21141413
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  21141544 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 21141445  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  21141444 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 21141413  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 50343525 - 50343656
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  50343525 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 50343624  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  50343625 tgttcttttgccaccattcaaaaccatattat 50343656  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2365741 - 2365622
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2365741 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 2365642  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  2365641 accattcaaaaccacattat 2365622  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19156520 - 19156401
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19156520 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 19156421  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  19156420 accattcaaaaccacattat 19156401  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47656386 - 47656256
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  47656386 atcatatccataacc-aaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 47656288  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  47656287 tgttcttttgccaccattcaaaatcacattat 47656256  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 2424924 - 2425053
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2424924 atcatatccataacctaaactaaataaataatcaataaaattgttattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaac--attcaaattg 2425021  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| | |||||| || |||||||||    
T  2425022 tgtttatttggctccattccaaaccacattat 2425053  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 97504 - 97635
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  97504 atcatatccataacctaaactaactaaataaacaataaaattatcattgaggcattttctcaaacactttgtgtacaaagtatcaaacatactcaaaatg 97603  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  97604 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 97635  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Original strand, 17514267 - 17514383
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17514267 taaattaactaaataatcaatataatttttatttgggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagaatcaaacatattcaaattgtgttcatttggcacc 17514366  T
Q  212 attcaaagccacattat 228  Q
    ||||||| |||||||||    
T  17514367 attcaaaaccacattat 17514383  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22524650 - 22524521
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  22524650 atcatatccatgatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaac--attcaaatta 22524553  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| | |||||| || |||||||||    
T  22524552 tgtttatttggctccattccaaaccacattat 22524521  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 3731949 - 3732068
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  3731949 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 3732048  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  3732049 accaatcaaaaccacattat 3732068  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 13639591 - 13639710
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  13639591 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 13639690  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  13639691 acaattcaaaaccacattat 13639710  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26876162 - 26876043
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  26876162 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 26876063  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  26876062 accaatcaaaaccacattat 26876043  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Original strand, 38127045 - 38127160
Alignment:
Q  104 ccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtg-ttca 202  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||      
T  38127045 ccataacctaaactaactaagtaatcaataaaattttcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactaaaaatgtgttttt 38127144  T
Q  203 tttgccaccattcaaa 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  38127145 tttgccaccattcaaa 38127160  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8474259 - 8474171
Alignment:
Q  140 tcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8474259 tcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgccaccaatcaaaaccacattat 8474171  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 19526837 - 19526889
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatca 74  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19526837 catcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatca 19526889  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 260
Target Start/End: Original strand, 29622105 - 29622143
Alignment:
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29622105 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 29622143  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Original strand, 19524674 - 19524719
Alignment:
Q  29 attctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatca 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19524674 attctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatca 19524719  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Original strand, 19524861 - 19524906
Alignment:
Q  29 attctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatca 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19524861 attctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatca 19524906  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Original strand, 19525522 - 19525567
Alignment:
Q  29 attctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatca 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19525522 attctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatca 19525567  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Original strand, 19526657 - 19526702
Alignment:
Q  29 attctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatca 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19526657 attctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatca 19526702  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 226
Target Start/End: Original strand, 23935581 - 23935650
Alignment:
Q  157 caaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacatt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  23935581 caaacactttgagtgcaaagtatgaaacttattaccattgtgttaatttgacaccattcaaaaccacatt 23935650  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 185
Target Start/End: Original strand, 16243106 - 16243165
Alignment:
Q  126 aatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaaca 185  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  16243106 aatcaatgaaatattcatttaggcattttatcaaacactttgtatgcaaaagataaaaca 16243165  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25167023 - 25166976
Alignment:
Q  140 tcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacata 187  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25167023 tcatttaggaattttatcaaacactttgagtgcaaagtatgaaacata 25166976  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25147776 - 25147698
Alignment:
Q  140 tcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaa 218  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||| | |||||||||||    
T  25147776 tcatttaggtattttaacaaacactttgagtgcaaagtatgaaacttattggcattgtgttaattggacaccattcaaa 25147698  T

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Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 21022370 - 21022609
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  21022370 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaact 21022468  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022469 aaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 21022568  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022569 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 21022609  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 51683794 - 51683554
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  51683794 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 51683695  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683694 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 51683595  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51683594 acattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatt 51683554  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 50275326 - 50275086
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  50275326 catcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacatttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 50275227  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275226 acataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagcataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 50275127  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275126 acattctgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 50275086  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 37021559 - 37021804
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaat-----atacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaat 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  37021559 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatataatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcattttcataacctaaac 37021658  T
Q  117 taactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021659 taactaaataatcaataaaattgtcattgaagcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaagatattcaaattgtgttcatttgccaccattca 37021758  T
Q  217 aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37021759 aagccacattatgatttaaacaacatatgcaacaactacattcatt 37021804  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 48256052 - 48256292
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  48256052 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacttaaactaact 48256151  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48256152 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgttttcatttgccaccattcaaagcc 48256251  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48256252 acattatgatttaaactacataggcaacaactacattcatt 48256292  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 55407268 - 55407508
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  55407268 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaacgaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 55407367  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407368 aaataatcaatataattttcaatgaggcattcgatcaaacattttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 55407467  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407468 acattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatt 55407508  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 260
Target Start/End: Original strand, 40357762 - 40357999
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  40357762 catcataattctcgtaacttaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaact 40357860  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40357861 aaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacacttggtgtgcaaagtataaaacatattcaaactgtgttcatttgccaccattcaaatcc 40357960  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357961 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 40357999  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 30726236 - 30726462
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30726236 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaagtataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 30726334  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726335 aattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 30726434  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30726435 aactacataggcaacaactacattcatt 30726462  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 50902070 - 50901832
Alignment:
Q  23 atcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaacta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  50902070 atcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacttaaactaacta 50901971  T
Q  123 aataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcca 222  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50901970 aa-aatcaataaaattgtcattgaaacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatataaaacatattcaaattgtgttcatttaacaccattcaaagcca 50901872  T
Q  223 cattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50901871 cattatgaattaaacaacatagacaacaactacattcatt 50901832  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 1089079 - 1089305
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1089079 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 1089177  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1089178 aattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattattattta 1089277  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  1089278 aactacatatgcaacatctacattcatt 1089305  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 1308609 - 1308835
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1308609 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 1308707  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1308708 aattgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattataattta 1308807  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  1308808 aactacatatgcaacatctacattcatt 1308835  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 105 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 68100 - 67947
Alignment:
Q  105 cataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68100 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttatgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 68001  T
Q  205 tgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacatt 258  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  68000 tgctaccattcaaagccacattatcatttaaacaacataggcaacaactacatt 67947  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 46436753 - 46436599
Alignment:
Q  105 cataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436753 cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgccattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 46436654  T
Q  205 tgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattc 259  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  46436653 tgccaccattcagaaccacaatatcatttaaacagcataagcaacaactacattc 46436599  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 228
Target Start/End: Original strand, 11050041 - 11050210
Alignment:
Q  59 aatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatca 158  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  11050041 aatatacactttatcaaactatcattaacatcctctccatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgatgcattttatca 11050140  T
Q  159 aacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11050141 aatactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttcatttggcaccattcaaaaccacattat 11050210  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 262
Target Start/End: Original strand, 21538008 - 21538183
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21538008 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacagattcaaattg 21538107  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacatt----------atgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||          || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21538108 tgttcatttggcatcattcaaaaccacattatcattaaacatcatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 21538183  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 50023099 - 50023230
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  50023099 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 50023198  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50023199 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 50023230  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14315927 - 14315726
Alignment:
Q  71 atcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgt 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||    
T  14315927 atcaaactataattaacatcatttcaatcatttccataacctaaactaactcaataatcaatacaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgcgt 14315828  T
Q  171 gcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacatt----------atgatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||          || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14315827 gcaaagtataaaacatactcaaaatgtgttcatttggcaccattcaaaaccacatttttattatacatcatttaaacaacataggcaacaactacattca 14315728  T
Q  261 tt 262  Q
    ||    
T  14315727 tt 14315726  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 50030217 - 50030348
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  50030217 atcatatccataacctaaactaactaaataatcagtaaaattgtcattgatgcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 50030316  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50030317 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 50030348  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 10752983 - 10753114
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  10752983 atcatttcaataacctaaactaattaaataatcaatataattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatatttaaagag 10753082  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10753083 tgtccatttgccaccattcaaaaccacattat 10753114  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 10966752 - 10966883
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  10966752 atcatttcaataacctaaactaattaaataatcaatataattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatatttaaagag 10966851  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10966852 tgtccatttgccaccattcaaaaccacattat 10966883  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14297652 - 14297477
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14297652 atcatttccataacctaaactaactcaataatcaatacaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgcgtgcaaagtataaaacatactcaaaatg 14297553  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacatt----------atgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||          || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14297552 tgttcatttggcaccattcaaaaccacatttttattatacatcatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 14297477  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 9892836 - 9892955
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9892836 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 9892935  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  9892936 accattcaaaaccacattat 9892955  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Original strand, 41798571 - 41798682
Alignment:
Q  117 taactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41798571 taactaaataatcaataaatttgtcgttgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgctaccattca 41798670  T
Q  217 aagccacattat 228  Q
    || |||||||||    
T  41798671 aacccacattat 41798682  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3184473 - 3184342
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3184473 atcatatccataacccaaactaactaaataaaaaataaaattgtcattgaggcattttctcaaacactttgggtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3184374  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  3184373 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 3184342  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 3185440 - 3185571
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3185440 atcatatccataacccaaactaactaaataaaaaataaaattgtcattgaggcattttctcaaacactttgggtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3185539  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  3185540 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 3185571  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 3185648 - 3185779
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3185648 atcatatccataacccaaactaactaaataaaaaataaaattgtcattgaggcattttctcaaacactttgggtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3185747  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  3185748 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 3185779  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 6181358 - 6181477
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  6181358 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 6181457  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  6181458 accaatcaaaaccacattat 6181477  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49090925 - 49090806
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  49090925 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 49090826  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  49090825 accaatcaaaaccacattat 49090806  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49165538 - 49165419
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  49165538 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaactatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 49165439  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  49165438 accattcaaaaccacattat 49165419  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30704532 - 30704419
Alignment:
Q  105 cataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||    
T  30704532 cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagatattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactaaaaatgtgttcttt 30704433  T
Q  205 tgccaccattcaaa 218  Q
    | ||||||||||||    
T  30704432 tcccaccattcaaa 30704419  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 41933179 - 41933308
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  41933179 atcatttccataatctaaactaactcaataatcaatataattttcattggggctttttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaataa 41933278  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacatt 226  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41933279 tcttcatttgacaccattcaaaaccacatt 41933308  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 44679631 - 44679762
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||    
T  44679631 atcatatctataacctaaactaactaaataatcaatgaaatggtcattgaaacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatatcaaacatactcaaaatg 44679730  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  44679731 tgttcttttgccaccattcaaaatcacattat 44679762  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 262
Target Start/End: Original strand, 11083562 - 11083737
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||    
T  11083562 atcattttcataacctaaactaactcaataatcagtacaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagcatcaaacatactcaaaatg 11083661  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacatt----------atgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||          || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11083662 tgttcatttgacaccattcaaaaccacatttttattatacatcatttaaacagcataggcaacaactacattcatt 11083737  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31422203 - 31422083
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttat-caaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgc 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  31422203 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttattcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgc 31422104  T
Q  208 caccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  31422103 caccaatcaaaaccacattat 31422083  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50193985 - 50193864
Alignment:
Q  108 aacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtg-ttcatttg 206  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||  ||||    
T  50193985 aacctaaactaagtaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttatgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttttttttg 50193886  T
Q  207 ccaccattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  50193885 ccactattcaaaaccacattat 50193864  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Original strand, 4719949 - 4720055
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  4719949 taaactaagtaaataatcaatgcaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattctcattgtgttaatttgacacc 4720048  T
Q  212 attcaaa 218  Q
    |||||||    
T  4720049 attcaaa 4720055  T

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Target: scaffold0180 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 15103 - 15344
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaatt-aatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaac 120  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15103 catcataattcttgtaacctaaactaaccaaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataacctaaactaac 15202  T
Q  121 taaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203 taaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 15302  T
Q  221 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15303 cacattatgatttaaacaacataggcaataactacattcatt 15344  T

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Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 6320044 - 6320284
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6320044 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 6320143  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320144 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacgctttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 6320243  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320244 acattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatt 6320284  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31769297 - 31769057
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31769297 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 31769198  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31769197 aaataatcaataaatttgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcttttgccaccattcaaaacc 31769098  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31769097 acattatgatttaaacaacataagcaacaactacattcatt 31769057  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 24088263 - 24088503
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24088263 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacctaatcaaactatcattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 24088362  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24088363 aaataatcaatataattttcattgagacatttgatcaaacactttgtgtacaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 24088462  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24088463 acattatcatttaaacaacatagacaacaactacattcatt 24088503  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24722445 - 24722314
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  24722445 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacgcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 24722346  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||||||||    
T  24722345 tgttcttttgacaccattcaaaaacacattat 24722314  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3501686 - 3501555
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3501686 atcatatccataacctaaactaactaaataaacaataaaattgtccttgaggcattttctcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3501587  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  3501586 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 3501555  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26423514 - 26423384
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  26423514 atcatatccataacataaactaactaaataaacaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 26423415  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacatta 227  Q
    || || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26423414 tgatcttttgccaccattcaaaaccatatta 26423384  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21601106 - 21600990
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21601106 taaactaactaaataatcaatataattctcatttgggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttcatttgtcacc 21601007  T
Q  212 attcaaagccacattat 228  Q
    ||||||| |||||||||    
T  21601006 attcaaaaccacattat 21600990  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6201653 - 6201534
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  6201653 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 6201554  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  6201553 accaatcaaaaccacattat 6201534  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11688620 - 11688501
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  11688620 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 11688521  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  11688520 accaatcaaaaccacattat 11688501  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22301685 - 22301566
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  22301685 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 22301586  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  22301585 acaattcaaaaccacattat 22301566  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 30829220 - 30829339
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  30829220 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 30829319  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  30829320 accaatcaaaaccacattat 30829339  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27617220 - 27617101
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  27617220 acctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtattcttttgcc 27617121  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  27617120 accattcaaaaccatattat 27617101  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3381315 - 3381182
Alignment:
Q  71 atcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgt 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||            ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3381315 atcaaactataattaacatcattttaatcatttccataacataaactaattaaataatca------------ttgaggcattttatcaaccactttgtgt 3381228  T
Q  171 gcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca 216  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3381227 gcaatatataaaacatattcaaattgtgttcatttgacaccattca 3381182  T

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Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 262
Target Start/End: Original strand, 19228154 - 19228393
Alignment:
Q  23 atcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaacta 122  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19228154 atcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttttatcattttcataacctaaactaacta 19228253  T
Q  123 aataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcca 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19228254 aataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttgccaccattcaaagcca 19228353  T
Q  223 cattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228354 cattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 19228393  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7757916 - 7757676
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7757916 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataatttctatcatttctatcatttccataacctaaactaact 7757817  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7757816 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatgttcaaattgtgttcatttgccaccattcaaaacc 7757717  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757716 acattataatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 7757676  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Original strand, 8579994 - 8580224
Alignment:
Q  29 attctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8579994 attctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataat 8580092  T
Q  129 caataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8580093 caataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagctacattat 8580192  T
Q  229 gatttaaacaacataggcaacaactacattca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580193 gatttaaacaacataggcaacaactacattca 8580224  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17658914 - 17658674
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17658914 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 17658815  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17658814 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtatgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaaacc 17658715  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17658714 acattatgatttaaacaacataggccacaactacattcatt 17658674  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 42537741 - 42537501
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42537741 catcataattctcgtaaccttaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 42537642  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42537641 aaataatcaatataaatttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttgccaccattcaaagcc 42537542  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537541 acattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatt 42537501  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 42941968 - 42942207
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42941968 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccagactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 42942067  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  42942068 aaa-aatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttgccacaattcaaagcc 42942166  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42942167 atattatgatttaaacagcataggcaacaactacattcatt 42942207  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 8701705 - 8701945
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  8701705 catcataattttcataacctaaactaactaaacaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaacaaact 8701804  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701805 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 8701904  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8701905 acattatgatttaaacaacatatgcaactactacattcatt 8701945  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28877234 - 28876999
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  28877234 catcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc-aaactaact 28877136  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28877135 aaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacacttggtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaaccc 28877036  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacatt 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28877035 acattatgatttaaacaatataggcaacaactacatt 28876999  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38968690 - 38968449
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38968690 catcataattcccgtaacctaaactaaccaaaaaaacaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaact 38968591  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagc 220  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38968590 aaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagt 38968491  T
Q  221 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968490 cacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatt 38968449  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Original strand, 512253 - 512493
Alignment:
Q  22 catcatcattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaact 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||    
T  512253 catcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaactaaactataattaacatcatttctataattttcataacctaaactaact 512352  T
Q  122 aaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 221  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512353 aaataagcaatataattttcattgaggtatttgatcaaacactttgggtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagcc 512452  T
Q  222 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  512453 acattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatt 512493  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 28241294 - 28241520
Alignment:
Q  35 gtaacctaaactaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28241294 gtaacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataa 28241392  T
Q  135 aattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgattta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28241393 aattgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattataattta 28241492  T
Q  235 aacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28241493 aactacataggcaacatctacattcatt 28241520  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 112 - 258
Target Start/End: Original strand, 14260 - 14406
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14260 taaactaactaaataatcaataaaattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 14359  T
Q  212 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacatt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14360 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacatt 14406  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5197490 - 5197359
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  5197490 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 5197391  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5197390 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 5197359  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 262
Target Start/End: Original strand, 40624468 - 40624645
Alignment:
Q  95 atatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaat 194  Q
    |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40624468 atataattttcataatctaaactaactaaataatcaataaaattgttattaaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaat 40624567  T
Q  195 tgtgttcatttgccaccattcaaagccacatt----------atgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||          || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40624568 tgtgttcatttgtcaccattcaaaaccacattatcattaaacatcatttaaacagcataggcaacaactacattcatt 40624645  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 19040685 - 19040804
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19040685 acctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 19040784  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  19040785 accattcaaacccacattat 19040804  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20422463 - 20422335
Alignment:
Q  100 atttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgt 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20422463 atttccataacctaaactaactaaataatcaaaataattgtcattggggcattttatcaaacactttgtgtgaaaagtatcaaacatattcaaaatgtgt 20422364  T
Q  200 tcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  20422363 tcatttggcaccatttaaaactacattat 20422335  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Original strand, 27673224 - 27673340
Alignment:
Q  112 taaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  27673224 taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgccacc 27673323  T
Q  212 attcaaagccacattat 228  Q
    ||||||| |||||||||    
T  27673324 attcaaaaccacattat 27673340  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30705641 - 30705522
Alignment:
Q  109 acctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  30705641 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatatcaaacatactaaaaatgtgttcttttgcc 30705542  T
Q  209 accattcaaagccacattat 228  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  30705541 accattgaaaaccacattat 30705522  T

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Target: scaffold0293 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 233 - 447
Alignment:
Q  45 ctaactaaaaaattaatatacacttaatcaaactattattaacatcatttatatcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcatt 144  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  233 ctaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcattttcataac-taaactaactaaataattaataaaattgtcatt 331  T
Q  145 gaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatag 244  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  332 gagacattttatcaaacacgttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaactacatag 431  T
Q  245 gcaacaactacattca 260  Q
    ||||||||||||||||    
T  432 gcaacaactacattca 447  T

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Target: scaffold0634 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7925 - 7770
Alignment:
Q  107 taacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 206  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7925 taacctaaactaactaaaaaatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaatactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 7826  T
Q  207 ccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7825 ccatcattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 7770  T

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Target: scaffold0634; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7932 - 7899
Alignment:
Q  29 attctcgtaacctaaactaactaaaaaattaata 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7932 attctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaata 7899  T

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Target: scaffold0238 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 227
Target Start/End: Original strand, 18489 - 18619
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  18489 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgcgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 18588  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacatta 227  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18589 tgttcttttgccaccattcaaaaccacatta 18619  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10863 - 10761
Alignment:
Q  105 cataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10863 cataacctaaactaactaaataatcaatataattgtcattgagacattttttcaaacactttgtgtgtaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 10764  T
Q  205 tgc 207  Q
    |||    
T  10763 tgc 10761  T

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Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8586 - 8555
Alignment:
Q  231 tttaaacaacataggcaacaactacattcatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8586 tttaaacaacataggcaacaactacattcatt 8555  T

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Target: scaffold0877 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 4210 - 4341
Alignment:
Q  97 atcatttccataacctaaattaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 196  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||    
T  4210 atcattttcataccctaaactaactcaataatcaatataattctcattggggcactttatcaaacactttgtgtgcaaaacatcaaacatactcaaaatg 4309  T
Q  197 tgttcatttgccaccattcaaagccacattat 228  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  4310 tgttcttttgccaccattaaaaaccacattat 4341  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 246228 - 246180
Alignment:
Q  140 tcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatat 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  246228 tcatttaggcattttatcaaacactttgggtgcaaagtataaaacatat 246180  T

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Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 251056 - 251161
Alignment:
Q  121 taaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagc 220  Q
    ||||||||||||  |||| |||||   ||||||| |||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  251056 taaataatcaatgcaattttcatttgagcattttgtcaatcactttatgtgtaaaatatcaaacatattcttattgtgttaatttgacaccattcaaaac 251155  T
Q  221 cacatt 226  Q
    ||||||    
T  251156 cacatt 251161  T

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