View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12731_low_10 (Length: 261)

Name: NF12731_low_10
Description: NF12731
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12731_low_10
NF12731_low_10
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (1-246)||(10873372-10873617)
chr7 (1-246)||(8200730-8200975)
chr7 (1-246)||(11234556-11234801)
chr7 (1-246)||(14335078-14335323)
chr7 (1-246)||(44788694-44788939)
chr7 (1-246)||(8710287-8710532)
chr7 (1-246)||(13688723-13688968)
chr7 (1-246)||(18587514-18587759)
chr7 (1-246)||(15158400-15158645)
chr7 (1-246)||(17703798-17704043)
chr7 (1-246)||(18180427-18180670)
chr7 (1-246)||(11550445-11550690)
chr7 (1-246)||(14957236-14957481)
chr7 (1-246)||(12690184-12690429)
chr7 (1-246)||(9591050-9591291)
chr7 (84-246)||(14149862-14150024)
chr7 (1-221)||(14042402-14042622)
chr7 (1-221)||(14352432-14352652)
chr7 (120-246)||(16726845-16726971)
chr7 (1-145)||(15146266-15146410)
chr7 (36-219)||(15627233-15627416)
chr7 (190-238)||(15146416-15146464)
chr7 (1-148)||(19149792-19149939)
chr7 (1-148)||(20749191-20749338)
chr7 (33-169)||(18051306-18051442)
chr7 (33-121)||(26092151-26092239)
chr7 (33-120)||(26115943-26116030)
chr7 (30-196)||(13676184-13676350)
chr7 (30-220)||(15099953-15100143)
chr7 (30-142)||(12798851-12798963)
chr7 (1-121)||(13024153-13024273)
chr7 (1-169)||(14261567-14261734)
chr7 (1-169)||(16947793-16947961)
chr7 (33-121)||(49155109-49155197)
chr7 (60-126)||(12459431-12459497)
chr7 (60-126)||(21755215-21755281)
chr7 (36-118)||(40925173-40925255)
chr7 (1-126)||(11385750-11385875)
chr7 (1-126)||(14283695-14283820)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (1-246)||(29589918-29590163)
chr6 (1-246)||(27189993-27190238)
chr6 (1-246)||(27259002-27259247)
chr6 (1-246)||(25115109-25115354)
chr6 (1-246)||(27559448-27559693)
chr6 (1-246)||(28312187-28312432)
chr6 (1-246)||(28260676-28260921)
chr6 (1-246)||(28284995-28285240)
chr6 (1-246)||(28339425-28339670)
chr6 (1-246)||(2872281-2872527)
chr6 (8-246)||(22827841-22828079)
chr6 (1-246)||(16574447-16574692)
chr6 (1-246)||(16620688-16620933)
chr6 (1-246)||(19867244-19867489)
chr6 (1-246)||(24293261-24293506)
chr6 (1-246)||(16925119-16925364)
chr6 (1-246)||(22436426-22436671)
chr6 (7-246)||(5836713-5836952)
chr6 (1-238)||(18405423-18405660)
chr6 (1-246)||(23080980-23081225)
chr6 (30-246)||(20135531-20135747)
chr6 (30-246)||(22197122-22197338)
chr6 (1-246)||(18182846-18183091)
chr6 (137-246)||(16961097-16961206)
chr6 (1-148)||(30678503-30678650)
chr6 (1-105)||(23085304-23085408)
chr6 (30-169)||(19455657-19455796)
chr6 (1-169)||(18797324-18797492)
chr6 (30-178)||(19437627-19437775)
chr6 (1-126)||(34643065-34643190)
chr6 (60-246)||(10466386-10466572)
chr6 (33-235)||(15461904-15462106)
chr6 (111-163)||(5295513-5295565)
chr6 (1-169)||(21567470-21567638)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (1-246)||(16359127-16359372)
chr5 (1-246)||(34569119-34569364)
chr5 (1-246)||(22330403-22330648)
chr5 (1-246)||(27521031-27521276)
chr5 (1-246)||(27666006-27666251)
chr5 (1-246)||(40711405-40711650)
chr5 (1-246)||(20803222-20803467)
chr5 (1-246)||(27612981-27613226)
chr5 (1-246)||(29473589-29473834)
chr5 (1-246)||(14997255-14997500)
chr5 (1-246)||(22137293-22137538)
chr5 (1-246)||(22350544-22350789)
chr5 (1-246)||(41773467-41773712)
chr5 (1-246)||(18781739-18781984)
chr5 (1-246)||(19772585-19772830)
chr5 (1-246)||(37289012-37289257)
chr5 (1-246)||(27682916-27683161)
chr5 (1-246)||(21882399-21882644)
chr5 (1-238)||(21342930-21343167)
chr5 (1-246)||(25429046-25429291)
chr5 (1-246)||(26736243-26736488)
chr5 (26-235)||(23473831-23474040)
chr5 (29-234)||(21336838-21337043)
chr5 (7-91)||(23525867-23525951)
chr5 (1-148)||(20311573-20311720)
chr5 (30-220)||(23563713-23563903)
chr5 (1-246)||(21983693-21983938)
chr5 (1-148)||(21561541-21561688)
chr5 (30-235)||(28892487-28892692)
chr5 (58-126)||(22505406-22505474)
chr5 (1-220)||(20824086-20824305)
chr5 (33-118)||(14884539-14884624)
chr5 (1-126)||(22464677-22464802)
chr5 (33-235)||(17266882-17267084)
chr5 (1-235)||(20778531-20778765)
chr5 (33-118)||(25850807-25850892)
chr5 (111-163)||(24618639-24618691)
chr5 (111-163)||(24714870-24714922)
chr5 (111-163)||(24747898-24747950)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (1-246)||(16638085-16638330)
chr3 (1-246)||(43164987-43165232)
chr3 (1-246)||(3688255-3688500)
chr3 (1-246)||(12889021-12889266)
chr3 (1-246)||(13255002-13255247)
chr3 (1-246)||(15586965-15587210)
chr3 (1-246)||(16754274-16754519)
chr3 (1-246)||(26790986-26791231)
chr3 (1-246)||(5422503-5422748)
chr3 (1-246)||(15713629-15713874)
chr3 (1-246)||(20059627-20059872)
chr3 (1-246)||(48427759-48428004)
chr3 (1-246)||(6603048-6603292)
chr3 (1-246)||(10908522-10908767)
chr3 (1-246)||(53382591-53382836)
chr3 (1-246)||(10007912-10008157)
chr3 (1-246)||(15345818-15346063)
chr3 (1-246)||(24185502-24185747)
chr3 (1-246)||(15400090-15400335)
chr3 (1-246)||(15358395-15358640)
chr3 (1-246)||(16804520-16804765)
chr3 (1-229)||(15065400-15065628)
chr3 (1-246)||(16694476-16694721)
chr3 (1-246)||(14874141-14874386)
chr3 (49-232)||(26190937-26191120)
chr3 (1-220)||(14578981-14579200)
chr3 (1-246)||(17492163-17492408)
chr3 (1-246)||(15261942-15262187)
chr3 (1-246)||(12843676-12843921)
chr3 (102-246)||(18437452-18437596)
chr3 (33-121)||(47126391-47126479)
chr3 (30-235)||(13318093-13318298)
chr3 (33-121)||(10408415-10408503)
chr3 (1-234)||(12858057-12858290)
chr3 (30-235)||(31941236-31941441)
chr3 (33-169)||(13944423-13944559)
chr3 (30-169)||(12272737-12272876)
chr3 (1-148)||(14291094-14291241)
chr3 (117-246)||(11888042-11888172)
chr3 (33-126)||(12510077-12510170)
chr3 (33-118)||(28756769-28756854)
chr3 (30-235)||(31692776-31692981)
chr3 (30-169)||(17494045-17494184)
chr3 (30-196)||(11949499-11949665)
chr3 (30-196)||(18131937-18132103)
chr3 (30-235)||(10417636-10417841)
chr3 (30-151)||(12358118-12358239)
chr3 (102-187)||(13969783-13969868)
chr3 (1-148)||(15013331-15013476)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (1-246)||(9337906-9338151)
chr2 (1-246)||(9486540-9486785)
chr2 (1-246)||(21142915-21143160)
chr2 (1-246)||(16983564-16983809)
chr2 (1-246)||(17001324-17001569)
chr2 (1-246)||(10871174-10871419)
chr2 (1-246)||(22323216-22323461)
chr2 (1-246)||(24874624-24874869)
chr2 (1-246)||(27220340-27220585)
chr2 (1-246)||(44383444-44383689)
chr2 (1-246)||(24712358-24712603)
chr2 (1-246)||(24264694-24264939)
chr2 (1-246)||(24705356-24705601)
chr2 (1-246)||(27373593-27373838)
chr2 (1-220)||(11351585-11351804)
chr2 (1-246)||(24657532-24657777)
chr2 (1-246)||(24677811-24678056)
chr2 (1-246)||(41606260-41606504)
chr2 (1-246)||(21323140-21323385)
chr2 (1-246)||(23204638-23204883)
chr2 (1-246)||(23105602-23105847)
chr2 (1-246)||(23074187-23074432)
chr2 (1-163)||(23029335-23029497)
chr2 (1-246)||(22733648-22733893)
chr2 (1-127)||(45673886-45674012)
chr2 (1-217)||(24817714-24817930)
chr2 (1-148)||(19817269-19817416)
chr2 (1-169)||(23097892-23098060)
chr2 (1-148)||(19716891-19717038)
chr2 (1-148)||(23113145-23113292)
chr2 (30-196)||(23279150-23279316)
chr2 (207-246)||(11351800-11351839)
chr2 (30-152)||(23274011-23274133)
chr2 (33-169)||(12576754-12576890)
chr2 (26-148)||(30208819-30208941)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-246)||(16348001-16348246)
chr1 (1-246)||(51330898-51331143)
chr1 (2-246)||(41351075-41351319)
chr1 (1-246)||(19109076-19109321)
chr1 (1-246)||(24785263-24785508)
chr1 (1-246)||(33388435-33388680)
chr1 (1-246)||(21833010-21833255)
chr1 (1-246)||(17042421-17042666)
chr1 (45-246)||(21233181-21233382)
chr1 (57-244)||(22502751-22502938)
chr1 (1-235)||(16378813-16379047)
chr1 (96-246)||(21839658-21839808)
chr1 (26-246)||(21751645-21751865)
chr1 (1-115)||(20081782-20081896)
chr1 (29-169)||(429591-429731)
chr1 (1-100)||(21842066-21842165)
chr1 (102-244)||(22359751-22359893)
chr1 (102-244)||(21861880-21862022)
chr1 (30-196)||(19857063-19857229)
chr1 (130-246)||(20140791-20140907)
chr1 (33-121)||(38910264-38910352)
chr1 (33-121)||(12200382-12200470)
chr1 (30-169)||(20833335-20833474)
chr1 (1-44)||(22496662-22496705)
chr1 (33-118)||(31537435-31537520)
chr1 (33-121)||(48425737-48425825)
chr1 (33-121)||(52988605-52988693)
chr1 (1-148)||(21739442-21739589)
chr1 (30-169)||(22016180-22016319)
chr1 (33-120)||(37679914-37680001)
chr1 (1-235)||(20854166-20854400)
chr1 (35-126)||(20297240-20297331)
chr1 (2-169)||(24097022-24097189)
chr1 (111-163)||(23196483-23196535)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-246)||(10090-10335)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (1-246)||(17671799-17672044)
chr8 (1-246)||(18859336-18859581)
chr8 (1-246)||(19115159-19115404)
chr8 (1-246)||(20016040-20016285)
chr8 (2-246)||(19481850-19482094)
chr8 (1-246)||(30310921-30311166)
chr8 (2-246)||(22126737-22126981)
chr8 (1-246)||(22129394-22129639)
chr8 (1-246)||(19980726-19980971)
chr8 (1-246)||(22117952-22118197)
chr8 (1-246)||(21164315-21164560)
chr8 (1-246)||(32602904-32603149)
chr8 (1-246)||(15536142-15536387)
chr8 (1-246)||(22042586-22042831)
chr8 (1-246)||(22030862-22031107)
chr8 (3-246)||(21391640-21391883)
chr8 (3-246)||(21780966-21781209)
chr8 (3-246)||(21786134-21786377)
chr8 (1-246)||(22989804-22990049)
chr8 (1-246)||(21253704-21253949)
chr8 (1-246)||(22421669-22421914)
chr8 (1-246)||(22246210-22246455)
chr8 (1-246)||(22375231-22375475)
chr8 (1-246)||(22523305-22523550)
chr8 (123-246)||(21920003-21920126)
chr8 (1-235)||(22028057-22028291)
chr8 (1-246)||(20390845-20391090)
chr8 (60-148)||(22053720-22053808)
chr8 (1-77)||(22245792-22245868)
chr8 (84-148)||(22373726-22373790)
chr8 (33-121)||(28983795-28983883)
chr8 (33-121)||(28989014-28989102)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (1-246)||(12479293-12479538)
chr4 (1-246)||(16234066-16234311)
chr4 (1-246)||(17092223-17092468)
chr4 (1-246)||(23958440-23958685)
chr4 (1-246)||(8050697-8050942)
chr4 (1-246)||(8389105-8389350)
chr4 (1-246)||(19634829-19635074)
chr4 (1-246)||(27714029-27714274)
chr4 (1-246)||(40475733-40475978)
chr4 (1-246)||(14301053-14301298)
chr4 (1-246)||(19775867-19776112)
chr4 (1-246)||(18224520-18224765)
chr4 (1-246)||(14683260-14683505)
chr4 (1-246)||(16250924-16251169)
chr4 (1-246)||(15144966-15145212)
chr4 (94-246)||(16352697-16352849)
chr4 (1-246)||(16218923-16219168)
chr4 (1-246)||(16222243-16222488)
chr4 (1-246)||(16109-16354)
chr4 (1-246)||(14188199-14188444)
chr4 (1-246)||(14696794-14697039)
chr4 (1-246)||(14162163-14162408)
chr4 (1-98)||(16350628-16350725)
chr4 (111-246)||(22632393-22632528)
chr4 (105-246)||(14848543-14848684)
chr4 (33-121)||(29450903-29450991)
chr4 (1-148)||(15073150-15073297)
chr4 (33-121)||(3262160-3262248)
chr4 (33-120)||(44659232-44659319)
chr4 (33-235)||(51604158-51604360)
chr4 (33-126)||(11204598-11204691)
chr4 (1-126)||(27903198-27903323)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-246)||(21969-22214)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (1-237)||(36229-36465)
scaffold0079 (102-246)||(28800-28944)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (1-246)||(1369-1614)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-246)||(10495-10740)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-246)||(40877-41122)
scaffold0109 (1-246)||(13461-13706)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-246)||(3146-3391)
scaffold0044 (1-246)||(16882-17127)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-246)||(11191-11436)
scaffold0028 (1-246)||(53449-53694)
scaffold0028 (1-246)||(17659-17904)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (1-246)||(29265-29510)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-246)||(7980-8225)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-246)||(17403-17648)
scaffold0017 (1-238)||(195175-195412)
scaffold0017 (1-148)||(24126-24273)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-238)||(50682-50919)
scaffold0102 (30-148)||(42518-42636)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1-246)||(21326-21571)
scaffold0081 (1-246)||(36750-36995)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-246)||(31606-31850)
scaffold0080 (1-246)||(37072-37316)
scaffold0080 (1-246)||(10575-10820)
scaffold0080 (1-246)||(13230-13475)
scaffold0080 (1-242)||(54363-54604)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-246)||(37157-37402)
scaffold0042 (1-245)||(26075-26319)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-246)||(35052-35296)
scaffold0022 (1-246)||(41354-41599)
scaffold0022 (1-246)||(75074-75319)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-246)||(11693-11938)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (1-246)||(12385-12630)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (49-246)||(15379-15576)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-245)||(10509-10753)
scaffold0476 (33-169)||(914-1050)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-189)||(14203-14391)
scaffold0010 (1-246)||(4637-4882)
scaffold0010 (30-169)||(44793-44932)
scaffold0010 (33-121)||(39702-39790)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (69-246)||(8146-8323)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-246)||(25049-25294)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-218)||(18400-18617)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (5-220)||(3349-3564)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-246)||(103949-104194)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (71-246)||(551-726)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (1-246)||(4156-4401)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-246)||(111244-111489)
scaffold0040 (1-246)||(17600-17845)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-246)||(151803-152048)
scaffold0023 (66-246)||(1907-2087)
scaffold0023 (102-246)||(47402-47546)
scaffold0023 (29-81)||(47347-47399)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (1-245)||(24282-24526)
scaffold0243 (1-152)||(10109-10260)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-246)||(8672-8917)
scaffold0358 (49-246)||(17868-18065)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-246)||(7945-8190)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (96-246)||(9662-9812)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (1-159)||(817-975)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-235)||(6606-6840)
scaffold0270 (1-235)||(13736-13970)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-246)||(13816-14061)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-246)||(1174-1419)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-246)||(17686-17925)
scaffold0114 (1-246)||(39780-40025)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-246)||(55807-56052)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-234)||(23870-24103)
scaffold0011 (1-246)||(151289-151534)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (1-235)||(5846-6080)
scaffold0074 (30-169)||(14922-15061)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-246)||(216757-217002)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-187)||(13865-14051)
scaffold0120 (127-220)||(8770-8863)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (93-246)||(1-154)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (26-234)||(4317-4525)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-235)||(14603-14837)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (28-246)||(495742-495960)
scaffold0001 (1-114)||(441507-441620)
scaffold0001 (33-119)||(514722-514808)
scaffold0001 (165-217)||(441441-441493)
scaffold0001 (102-169)||(452651-452718)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (1-246)||(715-960)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (26-246)||(12576-12795)
scaffold0324 (1-92)||(1865-1956)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-217)||(15316-15532)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-246)||(40844-41087)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (121-246)||(27952-28077)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (1-169)||(781-949)
scaffold0993 (72-246)||(604-778)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (66-246)||(6489-6669)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-217)||(23635-23851)
scaffold0018 (1-217)||(9688-9904)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-144)||(11217-11360)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-108)||(1-108)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (29-169)||(819-959)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (1-144)||(2600-2743)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (6-100)||(8123-8217)
scaffold0130 (84-148)||(4309-4373)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (26-218)||(4838-5030)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (118-246)||(231-361)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (107-246)||(7102-7241)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-133)||(15257-15389)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (127-246)||(1196-1315)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (169-246)||(52430-52507)
scaffold0031 (30-220)||(110358-110548)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (1-109)||(57951-58059)
scaffold0077 (103-220)||(19073-19190)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (111-246)||(20963-21098)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (103-217)||(5328-5442)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (1-220)||(60487-60706)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (1-63)||(7141-7203)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (32-169)||(5550-5687)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (33-121)||(11656-11744)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (30-196)||(355-521)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (30-220)||(221-411)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (30-196)||(20586-20752)
scaffold0222 (1-148)||(824-971)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (30-235)||(94260-94465)
scaffold0029 (1-126)||(115404-115529)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-178)||(83858-84035)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (102-246)||(114476-114620)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-169)||(200805-200973)
scaffold0004 (30-235)||(325440-325645)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (30-169)||(919-1058)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (30-169)||(98949-99088)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-235)||(53760-53994)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-126)||(1220-1345)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (30-246)||(5215-5431)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (1-168)||(11630-11797)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (77-148)||(8459-8530)
scaffold0083 (77-148)||(7146-7217)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (1-148)||(49517-49664)
scaffold0067 (1-148)||(58551-58698)
scaffold0067 (1-148)||(64939-65086)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (30-169)||(21921-22060)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (118-217)||(175799-175898)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (30-196)||(991-1157)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (2-148)||(1610-1756)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-171)||(2668-2838)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (2-148)||(28623-28769)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (1-126)||(25954-26079)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (33-126)||(303-396)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (84-148)||(4670-4734)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-121)||(3507-3627)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-169)||(43756-43924)
scaffold0104 (1-169)||(25015-25183)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-148)||(11780-11927)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (1-148)||(1819-1966)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (30-169)||(49904-50043)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-92)||(21522-21613)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-148)||(63856-64003)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (30-148)||(1677-1795)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (30-152)||(6854-6976)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (30-148)||(7564-7682)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (36-118)||(41585-41667)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-218)||(4426-4643)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (87-148)||(5422-5483)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (84-169)||(49297-49382)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-126)||(70214-70339)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-126)||(251464-251589)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (58-126)||(228-296)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-49)||(8329-8377)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (84-148)||(29347-29411)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (33-121)||(29781-29869)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10873617 - 10873372
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10873617 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 10873518  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10873517 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 10873418  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873417 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 10873372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8200975 - 8200730
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8200975 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 8200876  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8200875 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 8200776  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8200775 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 8200730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 11234556 - 11234801
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11234556 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 11234655  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11234656 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 11234755  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11234756 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 11234801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14335323 - 14335078
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14335323 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 14335224  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14335223 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 14335124  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14335123 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 14335078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 44788694 - 44788939
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44788694 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 44788793  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44788794 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 44788893  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44788894 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 44788939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8710532 - 8710287
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8710532 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8710433  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8710432 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 8710333  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8710332 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 8710287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13688968 - 13688723
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13688968 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 13688869  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13688868 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 13688769  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13688768 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 13688723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 18587514 - 18587759
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587514 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 18587613  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18587614 gggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 18587713  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18587714 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 18587759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 15158400 - 15158645
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15158400 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 15158499  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15158500 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 15158599  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15158600 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 15158645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 17703798 - 17704043
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17703798 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 17703897  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17703898 gggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttctta 17703997  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17703998 tctactaagaagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 17704043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18180670 - 18180427
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18180670 ctacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattct 18180571  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18180570 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttctcatcaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag--tttg 18180473  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18180472 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 18180427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 11550445 - 11550690
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11550445 ctacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 11550544  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  11550545 gggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtattcctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttctta 11550644  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  11550645 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 11550690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14957481 - 14957236
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14957481 ctacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatttt 14957382  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  14957381 gggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttctta 14957282  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  14957281 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 14957236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12690429 - 12690184
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690429 ctacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 12690330  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||     
T  12690329 gggtatgaattggttggagtacaagcatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaagaatgtggtgcagagttctta 12690230  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  12690229 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 12690184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9591291 - 9591050
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9591291 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagttt----acctttgagcggtatggatgtgattct 9591196  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  9591195 aggtatgaattggttagagtacaaccatgtacatatcaattgttttagcaagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttctta 9591096  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9591095 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 9591050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 84 - 246
Target Start/End: Original strand, 14149862 - 14150024
Alignment:
Q  84 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14149862 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccattttcatatcaattgttttagcaagtgagtgtatttctcttccgctgaagaggaaa 14149961  T
Q  184 gtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14149962 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggagcgcgatggtattttgatgt 14150024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14042622 - 14042402
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||  | || ||||||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||| || |     
T  14042622 ctacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccc 14042523  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
      | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  14042522 tagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttg 14042423  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14042422 tctactaagcagctgaagcaa 14042402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14352652 - 14352432
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||  | || ||||||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||| || |     
T  14352652 ctacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccc 14352553  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
      | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  14352552 tagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttg 14352453  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14352452 tctactaagcagctgaagcaa 14352432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 16726845 - 16726971
Alignment:
Q  120 tacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagc 219  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  16726845 tacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagc 16726944  T
Q  220 aactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    || |||||||||||||||| |||||||    
T  16726945 aaatggaacgcgatggtattttgatgt 16726971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 15146266 - 15146410
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||  |    
T  15146266 ctacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatagt 15146365  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttt 145  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15146366 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttt 15146410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15627416 - 15627233
Alignment:
Q  36 atgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcaga 135  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  15627416 atgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgcatttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcata 15627317  T
Q  136 ttaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagc 219  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  15627316 ttaattgttttaataagtcggtgtatttttcttctgcggaagaagagagtggagcggagttcttaactactaagcagctgaagc 15627233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 15146416 - 15146464
Alignment:
Q  190 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146416 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 15146464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19149939 - 19149792
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || |||||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    
T  19149939 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttt 19149840  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  19149839 tgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttag 19149792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20749338 - 20749191
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || |||||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    
T  20749338 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttt 20749239  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  20749238 tgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttag 20749191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 169
Target Start/End: Original strand, 18051306 - 18051442
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttc 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  18051306 tctatgtttggtagagattttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttc 18051405  T
Q  133 agattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    | || ||||| |||| |||| | ||| |||| |||||    
T  18051406 atatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 18051442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Original strand, 26092151 - 26092239
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26092151 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 26092239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 120
Target Start/End: Original strand, 26115943 - 26116030
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 120  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  26115943 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 26116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13676350 - 13676184
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  13676350 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 13676251  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 196  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  13676250 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 13676184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 220
Target Start/End: Original strand, 15099953 - 15100143
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |    
T  15099953 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtataaccgag 15100052  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 220  Q
    |||| || ||||| |||| |||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  15100053 ttcatatcaattgctttaacaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctatctactaaacagttgaagca 15100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Original strand, 12798851 - 12798963
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| ||    
T  12798851 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtg 12798950  T
Q  130 ttcagattaattg 142  Q
    |||| ||||||||    
T  12798951 ttcatattaattg 12798963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 13024273 - 13024153
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || || ||||  | ||| ||||||||||||||| | ||||||    | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |    
T  13024273 ctacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtagggattttttggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttt 13024174  T
Q  101 gggtatgaattggttagagta 121  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13024173 tggtatgaattggttagagta 13024153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 14261567 - 14261734
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || || ||| | ||| |||| ||||| || |||   ||||||||||||||| |    
T  14261567 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagaatt-gaagtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttt 14261665  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  14261666 tgggatgaactggttagagtataaccgtattcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 14261734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 16947793 - 16947961
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || || |||| || ||| ||||||||||||||| | || |||| | | || ||||||||  | || ||||  ||||||||||| ||| |    
T  16947793 ctacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttt 16947892  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  16947893 tggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 16947961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 49155197 - 49155109
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  49155197 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 49155109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12459497 - 12459431
Alignment:
Q  60 gatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  12459497 gatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 12459431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21755281 - 21755215
Alignment:
Q  60 gatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  21755281 gatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagtataacc 21755215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Original strand, 40925173 - 40925255
Alignment:
Q  36 atgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 118  Q
    ||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  40925173 atgtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 40925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 11385750 - 11385875
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| |    
T  11385750 ctacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttt 11385849  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  11385850 tgggatgaattggttagagtataacc 11385875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 14283695 - 14283820
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| |    
T  14283695 ctacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttt 14283794  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  14283795 tgggatgaattggttagagtataacc 14283820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 29589918 - 29590163
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29589918 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 29590017  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29590018 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 29590117  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29590118 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 29590163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27190238 - 27189993
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190238 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 27190139  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190138 gggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 27190039  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190038 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 27189993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 27259002 - 27259247
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259002 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 27259101  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259102 gggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 27259201  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259202 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 27259247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25115354 - 25115109
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25115354 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattct 25115255  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  25115254 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcaaagttttta 25115155  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115154 tccactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 25115109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 27559448 - 27559693
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27559448 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattct 27559547  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  27559548 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttctta 27559647  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27559648 tctactaagcaggtgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 27559693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28312432 - 28312187
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28312432 ctacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 28312333  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28312332 gggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 28312233  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312232 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 28312187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 28260676 - 28260921
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28260676 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 28260775  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28260776 gggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 28260875  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28260876 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttgatgt 28260921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28285240 - 28284995
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28285240 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 28285141  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28285140 gggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 28285041  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28285040 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttgatgt 28284995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 28339425 - 28339670
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28339425 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 28339524  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28339525 gggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 28339624  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28339625 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttgatgt 28339670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 2872281 - 2872527
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2872281 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 2872380  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag-ttttt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2872381 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttt 2872480  T
Q  200 gtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2872481 atctactaagcagctgaagcaactagaacgcgacggtatcttgatgt 2872527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 22827841 - 22828079
Alignment:
Q  8 tctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22827841 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatg 22827940  T
Q  108 aattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctacta 207  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22827941 aattgcttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgaagagtttttatctacta 22828040  T
Q  208 agcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828041 agcaggtgaagcaactggaacgcgatgatatcttgatgt 22828079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16574692 - 16574447
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16574692 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattct 16574593  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16574592 gggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 16574493  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16574492 tctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 16574447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16620688 - 16620933
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16620688 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattct 16620787  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16620788 gggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 16620887  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16620888 tctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 16620933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19867489 - 19867244
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19867489 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 19867390  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19867389 gggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttg 19867290  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19867289 tctaccaagcagctgaaacaactagaacgcgatggtattttgatgt 19867244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 24293261 - 24293506
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24293261 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 24293360  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24293361 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattagttgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 24293460  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  24293461 tctactaagcagctgatgcaactggaacgtgacggtatcttgatgt 24293506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16925119 - 16925364
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||    
T  16925119 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatcct 16925218  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16925219 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgcagagttctta 16925318  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  16925319 tctactaagcagctgaagcaaatgtagcgcgatggtattttgatgt 16925364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22436671 - 22436426
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||  | ||||||||||||||||  || |||||    
T  22436671 ctacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattct 22436572  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22436571 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 22436472  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22436471 tctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttgatgt 22436426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 5836713 - 5836952
Alignment:
Q  7 ctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 106  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||     
T  5836713 ctctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtag 5836812  T
Q  107 gaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  5836813 gaattggttagagtacaatcatgttcatattaattgtgctagcaagtcagtgtatttctcttcagtcgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctact 5836912  T
Q  207 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5836913 aaacagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 5836952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 18405423 - 18405660
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18405423 ctacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtgattttgaaattaatttggtttgtctgcctttgagtggtatggatgtaattct 18405522  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18405523 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttg 18405622  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 238  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  18405623 tctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtat 18405660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23081225 - 23080980
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||||| || ||    
T  23081225 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattatgaaattgacttggtttgtttacctttgattggtatggatgtaatcct 23081126  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||| | |||| |    
T  23081125 tggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttcttctgaagaggaaagtggcgcaaaattttgg 23081026  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  23081025 tctaccaagcagttgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 23080980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20135747 - 20135531
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| | | |||||||||||||||||    
T  20135747 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 20135648  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  20135647 ttcatattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaaca 20135548  T
Q  230 cgatggtatcttgatgt 246  Q
     ||||| || |||||||    
T  20135547 tgatggaattttgatgt 20135531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 22197122 - 22197338
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| | | |||||||||||||||||    
T  22197122 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 22197221  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  22197222 ttcatattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaaca 22197321  T
Q  230 cgatggtatcttgatgt 246  Q
     ||||| || |||||||    
T  22197322 tgatggaattttgatgt 22197338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 18182846 - 18183091
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||    
T  18182846 ctacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttggtcgagattttgaaattgatacgttttgtttacctttgtgtggaatggatgtaatcct 18182945  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  18182946 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattattttagtaagtcagtgtacttttcttctgctgaagaagaaagtggagcagagttcttg 18183045  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||| || |||||||    
T  18183046 tctactaagtagctgaagcaattaggacgtgatggaattttgatgt 18183091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Original strand, 16961097 - 16961206
Alignment:
Q  137 taattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggt 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16961097 taatagttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgtgatggt 16961196  T
Q  237 atcttgatgt 246  Q
    || |||||||    
T  16961197 atattgatgt 16961206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 30678503 - 30678650
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||| |||| | | | ||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||    
T  30678503 ctacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtctgttttcctttgagtggaatggatgtaatact 30678602  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30678603 tggtatgaattggttggagtataaccatgttcacattaattgttttag 30678650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 23085304 - 23085408
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  23085304 ctacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattct 23085403  T
Q  101 gggta 105  Q
     ||||    
T  23085404 tggta 23085408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19455796 - 19455657
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  19455796 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 19455697  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| |||||    
T  19455696 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 19455657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18797492 - 18797324
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| ||||  |||  ||||||||||| ||| |    
T  18797492 ctacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtagggattttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttt 18797393  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  18797392 tgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaactgctttagcaagacagtgcatttttcttc 18797324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19437775 - 19437627
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    |||| |||||||| | | || |||||| | || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |    
T  19437775 ttgtttatgtttgttagagactttgaagtcgacttagtttgttttcctttgactggtatggatgttatttttgggatgaacttgttagagtataaccgag 19437676  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaaga 178  Q
    |||| || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| || |||||    
T  19437675 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgtggaaga 19437627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 34643065 - 34643190
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||| | |||||||||||| | ||||||||| | ||  |||||||  |||||||||  || |||||||| ||  |    
T  34643065 ctacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatggatgttatatt 34643164  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  34643165 tgggatgaattggttagagtataacc 34643190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 246
Target Start/End: Original strand, 10466386 - 10466572
Alignment:
Q  60 gatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgt 159  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||  ||||| || || || ||||| ||| | |||     
T  10466386 gatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagtaagacggtgc 10466485  T
Q  160 atttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||| ||||| |  ||||| ||| |||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  10466486 atttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacaaaacagatgaaacagctggaacgtgatggaattttgatgt 10466572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15462106 - 15461904
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttc 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || |||||||||||||| || ||||  |||     
T  15462106 tctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatcttcgggatgaattggttagaatataaccgagttt 15462007  T
Q  133 agattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 232  Q
      ||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| ||    
T  15462006 gtattaattgttttaacaagacggtgcatttttcttctatggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgaga 15461907  T
Q  233 tgg 235  Q
    |||    
T  15461906 tgg 15461904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Original strand, 5295513 - 5295565
Alignment:
Q  111 tggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtattt 163  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5295513 tggttggagtataaccatgttcatgttaattgttttagtaagtcggtgtattt 5295565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 21567470 - 21567638
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |    
T  21567470 ctacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttt 21567569  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     || ||||| | ||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  21567570 tggaatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 21567638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16359372 - 16359127
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16359372 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 16359273  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16359272 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 16359173  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16359172 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 16359127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34569364 - 34569119
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34569364 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 34569265  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34569264 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 34569165  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34569164 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 34569119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22330403 - 22330648
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22330403 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 22330502  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22330503 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 22330602  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22330603 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22330648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27521276 - 27521031
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27521276 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 27521177  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27521176 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggcgcagagttttta 27521077  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27521076 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 27521031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 27666006 - 27666251
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27666006 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 27666105  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27666106 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 27666205  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27666206 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 27666251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40711650 - 40711405
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40711650 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 40711551  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40711550 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 40711451  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40711450 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 40711405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20803467 - 20803222
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20803467 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 20803368  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20803367 tggtatgaagtggttagagtacaaccatgttcatatcaattgctttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttctta 20803268  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20803267 tctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgaaggtatcttgatgt 20803222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27613226 - 27612981
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27613226 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgatttt 27613127  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27613126 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 27613027  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27613026 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 27612981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 29473589 - 29473834
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29473589 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 29473688  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29473689 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 29473788  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29473789 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttgatgt 29473834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 14997255 - 14997500
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14997255 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 14997354  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14997355 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 14997454  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14997455 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttgatgt 14997500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22137538 - 22137293
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22137538 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatttt 22137439  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22137438 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 22137339  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22137338 tctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22137293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22350789 - 22350544
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22350789 ctacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 22350690  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22350689 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaatttttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttta 22350590  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350589 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 22350544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41773712 - 41773467
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41773712 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 41773613  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41773612 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 41773513  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41773512 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 41773467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18781984 - 18781739
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18781984 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 18781885  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  18781884 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttctta 18781785  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18781784 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 18781739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19772830 - 19772585
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19772830 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatcct 19772731  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19772730 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 19772631  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19772630 tctactaagcagttgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 19772585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 37289012 - 37289257
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37289012 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 37289111  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37289112 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttttta 37289211  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37289212 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 37289257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 27682916 - 27683161
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27682916 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 27683015  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27683016 gggtatgaactgtttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 27683115  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  27683116 tctactaagcagctgaaggaactggaacgcaacggtatcttgatgt 27683161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21882644 - 21882399
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21882644 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgattct 21882545  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  21882544 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcggtgtatttctcctccgtctaggaggaaagtggtgcagagttcttg 21882445  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21882444 tctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttgatgt 21882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 21342930 - 21343167
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  21342930 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattct 21343029  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  21343030 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtttatttctattccgttgaagaggaaagtggtgcagagttctta 21343129  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21343130 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtat 21343167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25429291 - 25429046
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25429291 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattct 25429192  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25429191 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 25429092  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  25429091 tctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 25429046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 26736243 - 26736488
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26736243 ctacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatcct 26736342  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  26736343 tggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaatttttg 26736442  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||  ||||||||||||||| | ||||| | ||| || |||||||    
T  26736443 tctatgaagcagctgaagcaattagaacgtggtggaattttgatgt 26736488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23474040 - 23473831
Alignment:
Q  26 tcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||||    
T  23474040 tcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagtacaac 23473941  T
Q  126 catgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactgg 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |    
T  23473940 catgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggtgcagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattag 23473841  T
Q  226 aacgcgatgg 235  Q
    |||| |||||    
T  23473840 aacgtgatgg 23473831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 21336838 - 21337043
Alignment:
Q  29 tttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || || | |||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21336838 tttgtctatgtttggtcgcgattttgaaattgacttggattgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccat 21336937  T
Q  129 gttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaac 228  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21336938 gttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaac 21337037  T
Q  229 gcgatg 234  Q
    | ||||    
T  21337038 gtgatg 21337043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23525951 - 23525867
Alignment:
Q  7 ctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 91  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23525951 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 23525867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20311720 - 20311573
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||| |  | |||||||||||||||||||| ||    
T  20311720 ctacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgtcgttgagtggtatggatgtgatact 20311621  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     |||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||    
T  20311620 aggtatgaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttag 20311573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 220
Target Start/End: Original strand, 23563713 - 23563903
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  23563713 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 23563812  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 220  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| |||||    ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  23563813 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctacagaagaagagagtggagcagagttgctatctactaaacagttgaagca 23563903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 21983693 - 21983938
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||| |||| |||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |    
T  21983693 ctacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctt 21983792  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| |  || || ||  ||   || ||||| |||    
T  21983793 tgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaggaagagggtaaagctgagttcttg 21983892  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
     ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21983893 actactaaacagctgaagcaattagaacgtgatgggatcttaatgt 21983938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 21561541 - 21561688
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||| ||||||| ||  |    
T  21561541 ctacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccattgacgggtgtggatgtaatctt 21561640  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21561641 tgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttag 21561688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 28892487 - 28892692
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  28892487 ttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagtataaccgag 28892586  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |    ||||||||||||| |||| | ||| | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  28892587 tctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacg 28892686  T
Q  230 cgatgg 235  Q
     |||||    
T  28892687 agatgg 28892692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22505474 - 22505406
Alignment:
Q  58 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  22505474 tggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 22505406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20824305 - 20824086
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| |    
T  20824305 ctacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatttt 20824206  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||    ||||||||||||| |||| | ||| | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |     
T  20824205 cgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttcta 20824106  T
Q  201 tctactaagcagctgaagca 220  Q
     ||||||| ||| |||||||    
T  20824105 actactaaacagttgaagca 20824086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 118
Target Start/End: Original strand, 14884539 - 14884624
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 118  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  14884539 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 14884624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22464802 - 22464677
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| |    
T  22464802 ctacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatggatgttatttt 22464703  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||||||||||||||||||||    
T  22464702 cgggatgaattggttagagtacaacc 22464677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Original strand, 17266882 - 17267084
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttc 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||   ||||    
T  17266882 tctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataactgagttc 17266981  T
Q  133 agattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 232  Q
    | || || |||||||| ||| | ||  |||| ||||||| |||||| || ||||  |  |||||||||  ||| |||||  |||||||  ||||||| ||    
T  17266982 atatcaactgttttagtaagacggtacatttttcttccgccgaagaagagagtgaagttgagtttttgaatacgaagcaaatgaagcagttggaacgtga 17267081  T
Q  233 tgg 235  Q
    |||    
T  17267082 tgg 17267084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20778765 - 20778531
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| |    
T  20778765 ctacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatttt 20778666  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||    ||||||||||||| |||| | ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||| ||||| |     
T  20778665 cgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgcggaagaagagagtggagcacagtttcta 20778566  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 235  Q
     ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  20778565 actactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 20778531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25850892 - 25850807
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 118  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||    
T  25850892 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatgaattggttaga 25850807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Original strand, 24618639 - 24618691
Alignment:
Q  111 tggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtattt 163  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24618639 tggttggagtataaccatgttcatgttaattgttttagtaagtcggtgtattt 24618691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Original strand, 24714870 - 24714922
Alignment:
Q  111 tggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtattt 163  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24714870 tggttggagtataaccatgttcatgttaattgttttagtaagtcggtgtattt 24714922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Original strand, 24747898 - 24747950
Alignment:
Q  111 tggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtattt 163  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24747898 tggttggagtataaccatgttcatgttaattgttttagtaagtcggtgtattt 24747950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16638330 - 16638085
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16638330 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 16638231  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16638230 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 16638131  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16638130 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 16638085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43165232 - 43164987
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43165232 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 43165133  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43165132 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 43165033  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43165032 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 43164987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3688500 - 3688255
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3688500 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 3688401  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3688400 gggtatgaactggttacagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 3688301  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688300 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 3688255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12889266 - 12889021
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12889266 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 12889167  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12889166 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 12889067  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12889066 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 12889021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13255247 - 13255002
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13255247 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 13255148  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13255147 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 13255048  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13255047 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 13255002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 15586965 - 15587210
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15586965 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattct 15587064  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15587065 gggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 15587164  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15587165 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 15587210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16754274 - 16754519
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754274 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 16754373  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16754374 gggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcagagtttttg 16754473  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754474 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 16754519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 26790986 - 26791231
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26790986 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 26791085  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26791086 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 26791185  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26791186 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 26791231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 5422503 - 5422748
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5422503 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 5422602  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5422603 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 5422702  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5422703 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 5422748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 15713629 - 15713874
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15713629 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 15713728  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15713729 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 15713828  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15713829 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttgatgt 15713874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 20059627 - 20059872
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20059627 ctacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 20059726  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20059727 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 20059826  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20059827 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 20059872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48428004 - 48427759
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48428004 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 48427905  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48427904 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattattttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 48427805  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48427804 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 48427759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6603292 - 6603048
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603292 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 6603193  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603192 gggtatgaactggtt-gagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcaatacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 6603094  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6603093 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 6603048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10908767 - 10908522
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10908767 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtcatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatttt 10908668  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10908667 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 10908568  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10908567 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 10908522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 53382591 - 53382836
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53382591 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 53382690  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382691 gggtatgaactggttggagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 53382790  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382791 tctaccaaacagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 53382836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10008157 - 10007912
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10008157 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatttt 10008058  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10008057 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 10007958  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10007957 tctactaagcaactgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 10007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 15345818 - 15346063
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15345818 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtaaggatgtgattct 15345917  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15345918 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 15346017  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15346018 tctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 15346063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24185747 - 24185502
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24185747 ctacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 24185648  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  24185647 gggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttctta 24185548  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  24185547 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 24185502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 15400090 - 15400335
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15400090 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattct 15400189  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  15400190 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagtaagtcagtgcatttttcttccgtcgaagagaagagtggtgcagagttttta 15400289  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400290 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 15400335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15358640 - 15358395
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15358640 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattct 15358541  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15358540 gggtatgaactagttagagtgcaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttttcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttta 15358441  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15358440 tctactaagcagctgaagcaactggaacacgatggtatcttgatgt 15358395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16804520 - 16804765
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||| |||  || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16804520 ctacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 16804619  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16804620 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattattttaccaagtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagttttta 16804719  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16804720 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 16804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15065628 - 15065400
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15065628 ctacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 15065529  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  15065528 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagaaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttctta 15065429  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15065428 tctaccaagcagctgaagcaactggaacg 15065400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16694721 - 16694476
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |    
T  16694721 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatttaattat 16694622  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  16694621 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttctta 16694522  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16694521 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 16694476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 14874141 - 14874386
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14874141 ctacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgtatgtgattct 14874240  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14874241 gggtatgaactggttcgagtagaaccatgttcatattaattattttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaattggtgcagagttcttg 14874340  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14874341 tttactaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtatattgatgt 14874386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 26190937 - 26191120
Alignment:
Q  49 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26190937 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 26191036  T
Q  149 caagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 232  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191037 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 26191120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 14578981 - 14579200
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||| | |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14578981 ctacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattct 14579080  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||     
T  14579081 aggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagaattttta 14579180  T
Q  201 tctactaagcagctgaagca 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14579181 tctactaagcagctgaagca 14579200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17492408 - 17492163
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17492408 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattct 17492309  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  17492308 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcggagtttttg 17492209  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  17492208 tctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 17492163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15262187 - 15261942
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15262187 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 15262088  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15262087 tggtgtgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctactgaagaagaaagtggcgcagagtttttg 15261988  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  15261987 tctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 15261942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 12843676 - 12843921
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  12843676 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcct 12843775  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| | || |||    
T  12843776 gggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtggcgcataattcttg 12843875  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  12843876 tctactaagcagcagaagcagttagaacgtgatggaattttgatgt 12843921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18437596 - 18437452
Alignment:
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18437596 ggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatagtaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 18437497  T
Q  202 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18437496 ctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttaatgt 18437452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47126479 - 47126391
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47126479 tctatgtttggtagagattttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 47126391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 13318093 - 13318298
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  | ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  13318093 ttgtctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgag 13318192  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |||| || |||||||||| |||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| | ||||||  |  ||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  13318193 ttcatataaattgttttaacaagacggtgtatttttcttctgcggaagaagagagtggaggagagttcctaactactaaacagttgaagcagttggaacg 13318292  T
Q  230 cgatgg 235  Q
     |||||    
T  13318293 agatgg 13318298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10408503 - 10408415
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10408503 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 10408415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 12858057 - 12858290
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |    
T  12858057 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtgactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctt 12858156  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| || || ||  |||||    | ||||| |||    
T  12858157 tgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacggtacatttctcttctgttgaggaaaaaagtaaaactgagttcttg 12858256  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 234  Q
     |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  12858257 actactaagcagctgaaacaattagaacgtgatg 12858290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31941441 - 31941236
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||  | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  31941441 ttgtctatgtttggcagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 31941342  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||| |||| ||    
T  31941341 ttcatataaattgttttagcaagacagtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattggagcg 31941242  T
Q  230 cgatgg 235  Q
    ||||||    
T  31941241 cgatgg 31941236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13944559 - 13944423
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttc 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  13944559 tctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttc 13944460  T
Q  133 agattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    | || ||||| |||| |||| | ||| |||| |||||    
T  13944459 atatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 13944423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12272876 - 12272737
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  12272876 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 12272777  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| |||||    
T  12272776 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 12272737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 14291094 - 14291241
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || |||   ||||||||||||||| |    
T  14291094 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttt 14291193  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14291194 tgggatgaactggttagagtataaccatgttcatattaattgctttag 14291241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 246
Target Start/End: Original strand, 11888042 - 11888172
Alignment:
Q  117 gagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttct-cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctg 215  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  || || || ||||| | |||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11888042 gagtataaccatgttcatattaattgttttaataaatcggtatattttttcttctgttgaagaagagagtggagcagagtttttgactactaagcagctg 11888141  T
Q  216 aagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    || ||  | || || ||||| ||||||||||    
T  11888142 aaacagttagagcgggatggaatcttgatgt 11888172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 126
Target Start/End: Original strand, 12510077 - 12510170
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
    |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  12510077 tctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 12510170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28756854 - 28756769
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 118  Q
    |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  28756854 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 28756769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 31692776 - 31692981
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||||  |    
T  31692776 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataaccgag 31692875  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |||| || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || |||| |||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||| |||| ||    
T  31692876 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtgttgcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattggagcg 31692975  T
Q  230 cgatgg 235  Q
    ||||||    
T  31692976 cgatgg 31692981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17494184 - 17494045
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  17494184 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 17494085  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| |||||    
T  17494084 ttcatatcaattgctttagcaagacggtggatttttcttc 17494045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 11949499 - 11949665
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | |  ||||| ||||| ||||| ||||  |    
T  11949499 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgatgggaatggatgttatttttgcgatgaactggttcgagtataaccgag 11949598  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 196  Q
    |||| || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  11949599 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 11949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 18131937 - 18132103
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || | |||| | || ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||| ||||  |    
T  18131937 ttgtctatgtttggtagagactatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatggatgttattttttggatgaattggttagagtataaccgag 18132036  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 196  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  18132037 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 18132103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 10417636 - 10417841
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||   |    
T  10417636 ttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataactgag 10417735  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    ||   ||||||||||||| |||| | ||| | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  10417736 tttgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacg 10417835  T
Q  230 cgatgg 235  Q
     |||||    
T  10417836 agatgg 10417841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Original strand, 12358118 - 12358239
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| || | ||||  ||||||||||| ||| | |  ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  12358118 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagtataaccgag 12358217  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaa 151  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  12358218 ttcatatcaattgttttagcaa 12358239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 187
Target Start/End: Original strand, 13969783 - 13969868
Alignment:
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 187  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||| || |||||    
T  13969783 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgctttaacaagacagtgcatttttcttccgccgaagaagagagtgg 13969868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 15013331 - 15013476
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||| | |||| ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  15013331 ctacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagag-ttttgcagtggacttagtat-tctgccgttgagtggaatggatgtgatact 15013428  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     |||||||| |  || ||||  ||| ||||||| || |||||||||||    
T  15013429 aggtatgaactacttggagtttaactatgttcatataaattgttttag 15013476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9338151 - 9337906
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9338151 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 9338052  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9338051 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 9337952  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9337951 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 9337906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9486785 - 9486540
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9486785 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 9486686  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9486685 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 9486586  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9486585 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 9486540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 21142915 - 21143160
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21142915 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 21143014  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21143015 aggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 21143114  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143115 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 21143160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16983809 - 16983564
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16983809 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 16983710  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16983709 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 16983610  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16983609 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 16983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17001569 - 17001324
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17001569 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 17001470  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17001469 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 17001370  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17001369 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 17001324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10871419 - 10871174
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10871419 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 10871320  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  10871319 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 10871220  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871219 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 10871174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22323216 - 22323461
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22323216 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 22323315  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22323316 aggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 22323415  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22323416 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22323461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 24874624 - 24874869
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24874624 ctacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 24874723  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24874724 gggtatgaactggttagagtacaaccacattcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttta 24874823  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874824 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 24874869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27220585 - 27220340
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27220585 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 27220486  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27220485 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacgtttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 27220386  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27220385 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 27220340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 44383444 - 44383689
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44383444 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 44383543  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  44383544 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttttta 44383643  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44383644 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 44383689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24712603 - 24712358
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24712603 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 24712504  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24712503 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaaatcagtacatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttta 24712404  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24712403 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 24712358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24264939 - 24264694
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24264939 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 24264840  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  24264839 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttcta 24264740  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24264739 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 24264694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 24705356 - 24705601
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  24705356 ctacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtattaatatgattct 24705455  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24705456 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttctta 24705555  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24705556 tctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 24705601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27373838 - 27373593
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27373838 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattct 27373739  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27373738 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 27373639  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27373638 tctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 27373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 11351585 - 11351804
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11351585 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattct 11351684  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11351685 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttctta 11351784  T
Q  201 tctactaagcagctgaagca 220  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  11351785 tctaccaagcagctgaagca 11351804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 24657532 - 24657777
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24657532 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 24657631  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  24657632 tgatatgaattgggtagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagtcagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggagcagagttctta 24657731  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24657732 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 24657777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24678056 - 24677811
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24678056 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 24677957  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  24677956 gggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttctta 24677857  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24677856 tctaccaagcagctgaagcaactggaacacgatggtattttgatgt 24677811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 41606260 - 41606504
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  41606260 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctt-gtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatggatgtgattct 41606358  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  41606359 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtctgtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 41606458  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41606459 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 41606504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 21323140 - 21323385
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21323140 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtgtggatgtgattct 21323239  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21323240 gggtatgaattggttgcaatacaaccatgttcatatgaactgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggcgcagagttcttg 21323339  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21323340 tctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 21323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23204883 - 23204638
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||| | |  || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23204883 ctacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtgattttgtaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 23204784  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||     
T  23204783 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggagagtgatgcagagttctta 23204684  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23204683 tctactaagcagttgaagcaaatggaacgcgatggtatcttgatgt 23204638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 23105602 - 23105847
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  23105602 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgatcggtatggatgtgtttct 23105701  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23105702 gggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgatgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 23105801  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| || |||||||    
T  23105802 tctactaagcagctgaagtagttggaacgtgatggcattttgatgt 23105847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23074432 - 23074187
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23074432 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattct 23074333  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||     
T  23074332 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagttttta 23074233  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  23074232 tctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 23074187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 23029335 - 23029497
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23029335 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 23029434  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtattt 163  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23029435 gggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtattt 23029497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22733648 - 22733893
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||| | | || ||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22733648 ctacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatggatgtaattct 22733747  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22733748 tggtatgacctggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtttttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 22733847  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  22733848 tctactaagcagctgaagcagtaagaacgtgatggtattttgatgt 22733893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 45673886 - 45674012
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45673886 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 45673985  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  45673986 gggtatgaattggttagagtacaacca 45674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 24817714 - 24817930
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||| | | || |||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| |||||    
T  24817714 ctacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattct 24817813  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||| |||    
T  24817814 tggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataagtcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttg 24817913  T
Q  201 tctactaagcagctgaa 217  Q
    |||||||| || |||||    
T  24817914 tctactaatcaactgaa 24817930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19817416 - 19817269
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || |||||| | ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||| ||    
T  19817416 ctacttctctagtatgcttgaagtttcctttgtcgatatttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatact 19817317  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     |||||||| ||||| || |  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19817316 aggtatgaactggttggaatttaactatgttcatattaattgttttag 19817269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 23097892 - 23098060
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |    
T  23097892 ctacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttt 23097991  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     || ||||| ||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  23097992 tggaatgaactgggtagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 23098060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 19716891 - 19717038
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || || |||| || ||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| |    
T  19716891 ctacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttt 19716990  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||    
T  19716991 tggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 19717038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23113292 - 23113145
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |    
T  23113292 ctacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctt 23113193  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||    
T  23113192 tgggatgaactggttagagtataaccgtgtttatataaattgttttag 23113145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23279316 - 23279150
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| | ||||||||||| ||||  |    
T  23279316 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgag 23279217  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 196  Q
    |||| || ||||||||||||||| | ||| |||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||    
T  23279216 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctacggaagaagaaagtggagcagagtt 23279150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 246
Target Start/End: Original strand, 11351800 - 11351839
Alignment:
Q  207 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11351800 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 11351839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23274133 - 23274011
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| | ||||||||||| ||||  |    
T  23274133 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgag 23274034  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaag 152  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  23274033 ttcatatcaattgttttagcaag 23274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12576890 - 12576754
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttc 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  12576890 tctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttc 12576791  T
Q  133 agattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    | || ||||| |||| |||| | ||| |||| |||||    
T  12576790 atatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 12576754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 148
Target Start/End: Original strand, 30208819 - 30208941
Alignment:
Q  26 tcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaac 125  Q
    ||||||||| ||||||| | | ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  || || |  |||    
T  30208819 tcctttgtcgatgtttgatagagattttgcagtggacttagtctgtttgccattgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactaattggaatttaac 30208918  T
Q  126 catgttcagattaattgttttag 148  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  30208919 tatgttcatattaattgttttag 30208941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16348001 - 16348246
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16348001 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 16348100  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16348101 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 16348200  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 16348246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 51330898 - 51331143
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51330898 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 51330997  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51330998 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttcttttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 51331097  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331098 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 51331143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 41351075 - 41351319
Alignment:
Q  2 tacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351075 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctg 41351174  T
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41351175 ggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 41351274  T
Q  202 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351275 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 41351319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19109321 - 19109076
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19109321 ctacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 19109222  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19109221 gggtatgaattggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 19109122  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19109121 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 19109076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 24785263 - 24785508
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  24785263 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattat 24785362  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24785363 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaaatcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttctta 24785462  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24785463 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 24785508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 33388435 - 33388680
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33388435 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 33388534  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33388535 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 33388634  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33388635 tctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 33388680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21833255 - 21833010
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21833255 ctacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 21833156  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21833155 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 21833056  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21833055 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 21833010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 17042421 - 17042666
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17042421 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 17042520  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17042521 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttctta 17042620  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||    
T  17042621 tctgctaagcagctgaagcaaatggaacacgatagtattttgatgt 17042666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 246
Target Start/End: Original strand, 21233181 - 21233382
Alignment:
Q  45 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgtt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21233181 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgtt 21233280  T
Q  145 ttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  21233281 ttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaagttcgtatctactatgcagctgaagcaaatgaaacgcgatggtattttgat 21233380  T
Q  245 gt 246  Q
    ||    
T  21233381 gt 21233382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Original strand, 22502751 - 22502938
Alignment:
Q  57 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcag 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22502751 atggatttagtttgtctacctttgagcggaatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcaa 22502850  T
Q  157 tgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 244  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22502851 tgtatttctcctccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttgat 22502938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16379047 - 16378813
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || ||    
T  16379047 ctacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcct 16378948  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || || ||||| ||| ||||||||    
T  16378947 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttctgctgaggaagagagtggagcaaagtttttg 16378848  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 235  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16378847 tctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16378813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21839808 - 21839658
Alignment:
Q  96 attctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839808 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 21839709  T
Q  196 ttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21839708 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 21839658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21751865 - 21751645
Alignment:
Q  26 tcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaac 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || | |||||||||||||    
T  21751865 tcctttgtctatgtttgatcgtaattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatcaactcgttagagtacaac 21751766  T
Q  126 catgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactgg 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |    
T  21751765 catgttcacattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaaacagctgaagcagttag 21751666  T
Q  226 aacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||| ||||| ||||| ||||    
T  21751665 aacgtgatggaatcttaatgt 21751645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 20081782 - 20081896
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081782 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 20081881  T
Q  101 gggtatgaattggtt 115  Q
    ||||||||| |||||    
T  20081882 gggtatgaactggtt 20081896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 169
Target Start/End: Original strand, 429591 - 429731
Alignment:
Q  29 tttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccat 128  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  429591 tttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatacaaccat 429690  T
Q  129 gttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    || || ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  429691 gtgcacattaattgttacagtaagtcggtgtatttctcttc 429731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21842165 - 21842066
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21842165 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtgattct 21842066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Original strand, 22359751 - 22359893
Alignment:
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 201  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22359751 ggtatgaactggttagagtataaccatgttcatattatttgctttagtaaatcagtgtatatctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgt 22359850  T
Q  202 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 244  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||| |||||    
T  22359851 ctactaagcagctgaagtagttagaacgtgatggtattttgat 22359893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Original strand, 21861880 - 21862022
Alignment:
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 201  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||| || |    
T  21861880 ggtatgaactggttggagtacaaccatgttaatattaattgttttattaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaatgtggcgcagagttcttat 21861979  T
Q  202 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 244  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  21861980 ctacgaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttgat 21862022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19857229 - 19857063
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |    
T  19857229 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtataaccgag 19857130  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 196  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  19857129 ttcatatcaattgttttagcaagacagtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 19857063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20140907 - 20140791
Alignment:
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  20140907 ttcacattaattgctttagtaagtcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtggcgcataattcatgtctactaagcagctgaagcagttagaacg 20140808  T
Q  230 cgatggtatcttgatgt 246  Q
     |||||||| |||||||    
T  20140807 tgatggtattttgatgt 20140791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Original strand, 38910264 - 38910352
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38910264 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 38910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12200470 - 12200382
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12200470 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 12200382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Original strand, 20833335 - 20833474
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  20833335 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 20833434  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  20833435 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 20833474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 22496662 - 22496705
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggt 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22496662 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 118
Target Start/End: Original strand, 31537435 - 31537520
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 118  Q
    |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  31537435 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 31537520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48425825 - 48425737
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  48425825 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 48425737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 52988693 - 52988605
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  52988693 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 52988605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 21739442 - 21739589
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||| ||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| |    
T  21739442 ctacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttt 21739541  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  21739542 tgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttag 21739589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Original strand, 22016180 - 22016319
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  22016180 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 22016279  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| |||||    
T  22016280 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 22016319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 37680001 - 37679914
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 120  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  37680001 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 37679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20854166 - 20854400
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| |    
T  20854166 ctacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttatttt 20854265  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||    || |||||||||| |||| | ||| | || ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||| |     
T  20854266 cgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtataaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggagcagagtttcta 20854365  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 235  Q
     ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  20854366 actactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 20854400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20297331 - 20297240
Alignment:
Q  35 tatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
    |||||||||| | |||||||   | |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||    
T  20297331 tatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagtataacc 20297240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 24097022 - 24097189
Alignment:
Q  2 tacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 101  Q
    ||||||||| || || |||| || ||| ||||||||||||||| | || |||| | | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| |     
T  24097022 tacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttattttt 24097121  T
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     | ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  24097122 agaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 24097189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Original strand, 23196483 - 23196535
Alignment:
Q  111 tggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtattt 163  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23196483 tggttggagtataaccatgttcatgttaattgttttagtaagtcggtgtattt 23196535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10335 - 10090
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10335 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 10236  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10235 gggtatgaactggttagagtacaaccacgtttttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccctcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 10136  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10135 tctactaagcagctgaagcaactgggacgcgatggtatcttgatgt 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 17671799 - 17672044
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17671799 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 17671898  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17671899 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 17671998  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17671999 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 17672044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18859581 - 18859336
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18859581 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggaagtgattct 18859482  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859481 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 18859382  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859381 tcaactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 18859336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19115404 - 19115159
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19115404 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 19115305  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19115304 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 19115205  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19115204 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 19115159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 20016040 - 20016285
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20016040 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 20016139  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20016140 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 20016239  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20016240 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 20016285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 19481850 - 19482094
Alignment:
Q  2 tacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481850 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctg 19481949  T
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19481950 ggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 19482049  T
Q  202 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482050 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 19482094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 30310921 - 30311166
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30310921 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 30311020  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  30311021 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttctta 30311120  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30311121 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 30311166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 22126737 - 22126981
Alignment:
Q  2 tacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  22126737 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttg 22126836  T
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22126837 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 22126936  T
Q  202 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22126937 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22126981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22129394 - 22129639
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22129394 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 22129493  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||     
T  22129494 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattctta 22129593  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22129594 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 22129639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19980971 - 19980726
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19980971 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattct 19980872  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19980871 gggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagttagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 19980772  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19980771 tctaccaagcagctgaagcaactggaacgggatggtattttgatgt 19980726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22117952 - 22118197
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22117952 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattct 22118051  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22118052 gggtatgaactggttagagtacaaccacatttttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 22118151  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22118152 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22118197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 21164315 - 21164560
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21164315 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggacttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 21164414  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21164415 gggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 21164514  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  21164515 tctactaagcagctgaagcaattggaacgcgatgatattttgatgt 21164560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32603149 - 32602904
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32603149 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 32603050  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  32603049 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaggtggtgcagagttctta 32602950  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32602949 tctactaaacagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 32602904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15536387 - 15536142
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  15536387 ctacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgatttt 15536288  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  15536287 gggtacgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttctta 15536188  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15536187 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 15536142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22042831 - 22042586
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22042831 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattct 22042732  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  22042731 aggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagttagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttctta 22042632  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22042631 actactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 22042586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22031107 - 22030862
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||    
T  22031107 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatgatttcgaaatggatttagtttgtctacatttaagcggtatggatgtaattct 22031008  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||     
T  22031007 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtgtttctcttccgctgaggaggaaagtggtgcatagttttta 22030908  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22030907 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 22030862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 21391640 - 21391883
Alignment:
Q  3 acttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgg 102  Q
    |||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391640 acttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgg 21391739  T
Q  103 gtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtc 202  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21391740 gtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtc 21391839  T
Q  203 tactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  21391840 tactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttgatgt 21391883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 21780966 - 21781209
Alignment:
Q  3 acttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgg 102  Q
    |||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21780966 acttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgg 21781065  T
Q  103 gtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtc 202  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21781066 gtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtc 21781165  T
Q  203 tactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  21781166 tactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttgatgt 21781209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 21786134 - 21786377
Alignment:
Q  3 acttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgg 102  Q
    |||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21786134 acttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgg 21786233  T
Q  103 gtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtc 202  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21786234 gtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtc 21786333  T
Q  203 tactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  21786334 tactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 21786377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22990049 - 22989804
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  22990049 ctacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcct 22989950  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||  ||| |||| |||    
T  22989949 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtgacgcatagttcttg 22989850  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  22989849 tctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttgatgt 22989804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21253949 - 21253704
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21253949 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggtttgtctacctttgagtggtatgcatgtgattct 21253850  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21253849 tggtatgagctggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcgctgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 21253750  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||    
T  21253749 tctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatggcattttgatgt 21253704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22421669 - 22421914
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22421669 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaattct 22421768  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  22421769 tggcatgaactagttagtgtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggtaagtggcgcagagttcttg 22421868  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  22421869 tctactaagcagctgaagcaattggaacgtgatggaattttgatgt 22421914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22246210 - 22246455
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || || || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| || ||    
T  22246210 ctacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacctttgagtgaaatggatgtaatcct 22246309  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| | || |||    
T  22246310 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattagttgttttagtaagtcgatgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggtgcataattcttg 22246409  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  22246410 tctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 22246455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22375231 - 22375475
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  22375231 ctacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 22375329  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  22375330 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgccgacgaggaaagtggcgcagaattcttg 22375429  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| || || || |||||||    
T  22375430 tctactaagtagctgaatcaattagaacgtgaaggaattttgatgt 22375475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22523550 - 22523305
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  22523550 ctacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcct 22523451  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |  ||||| |||||| | ||| |||| |||    
T  22523450 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtagcgcaaagttcttg 22523351  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||| || |||||||    
T  22523350 tctaccaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaattttgatgt 22523305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Original strand, 21920003 - 21920126
Alignment:
Q  123 aaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaac 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21920003 aaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcttttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagt 21920102  T
Q  223 tggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    | ||||| || ||||| |||||||    
T  21920103 tagaacgtgacggtattttgatgt 21920126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22028057 - 22028291
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| |    
T  22028057 ctacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttt 22028156  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||| ||  |||  |  ||||| |||    
T  22028157 tgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgttgaagaagagggtgaagtggagttcttg 22028256  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 235  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  22028257 tctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 22028291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20391090 - 20390845
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||  ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |    
T  20391090 ctacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctt 20390991  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||| |  || |||| ||||| |  || || || |||   || ||||| |||    
T  20390990 tgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattattttagtaagacgatgcatttttcttctgctgaggaagagagtaaagctgagttcttg 20390891  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
     ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  20390890 actactaaacagctgaagcaattagaacgtgatgggatcttaatgt 20390845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22053808 - 22053720
Alignment:
Q  60 gatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||    
T  22053808 gatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttag 22053720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 22245792 - 22245868
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacct 77  Q
    |||||||||| || || || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  22245792 ctacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacct 22245868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22373790 - 22373726
Alignment:
Q  84 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  22373790 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttag 22373726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28983883 - 28983795
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  28983883 tctatgtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 28983795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28989102 - 28989014
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  28989102 tctatgtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 28989014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12479538 - 12479293
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12479538 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 12479439  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12479438 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 12479339  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12479338 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 12479293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16234066 - 16234311
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16234066 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 16234165  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16234166 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 16234265  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16234266 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 16234311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 17092223 - 17092468
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17092223 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 17092322  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17092323 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 17092422  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17092423 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 17092468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23958685 - 23958440
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23958685 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 23958586  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23958585 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 23958486  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23958485 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 23958440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 8050697 - 8050942
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8050697 ctacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8050796  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8050797 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 8050896  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8050897 tctactaagcagctgaagcaactggaacacgacggtatcttgatgt 8050942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8389350 - 8389105
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8389350 ctacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 8389251  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8389250 gggaatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 8389151  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8389150 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 8389105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19635074 - 19634829
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19635074 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 19634975  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19634974 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttttta 19634875  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19634874 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 19634829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27714274 - 27714029
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27714274 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 27714175  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27714174 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 27714075  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27714074 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 27714029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40475978 - 40475733
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40475978 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 40475879  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  40475878 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttatagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttgta 40475779  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40475778 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 40475733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 14301053 - 14301298
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14301053 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 14301152  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14301153 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagttttta 14301252  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14301253 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 14301298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 19775867 - 19776112
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19775867 ctacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 19775966  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19775967 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 19776066  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19776067 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttgatgt 19776112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 18224520 - 18224765
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  18224520 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttatttt 18224619  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  18224620 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcataacaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagttctta 18224719  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18224720 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 18224765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14683505 - 14683260
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14683505 ctacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattct 14683406  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  14683405 gggaatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcatgtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttctta 14683306  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  14683305 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 14683260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16250924 - 16251169
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16250924 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 16251023  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  16251024 gggtataaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttctta 16251123  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16251124 actactaaatagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 16251169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 15144966 - 15145212
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  15144966 ctacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tct 15145064  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag-caagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagt-ggtgcagagtttt 198  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15145065 gggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagtcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtaggtgcagagttct 15145164  T
Q  199 tgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15145165 tgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 15145212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Original strand, 16352697 - 16352849
Alignment:
Q  94 tgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352697 tgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 16352796  T
Q  194 gtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16352797 gttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 16352849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16219168 - 16218923
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  16219168 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 16219069  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||    
T  16219068 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttg 16218969  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  16218968 tctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 16218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16222488 - 16222243
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  16222488 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 16222389  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||    
T  16222388 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttg 16222289  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  16222288 tctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 16222243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16109 - 16354
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  16109 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcct 16208  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16209 tggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttg 16308  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  16309 tctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 16354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14188444 - 14188199
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14188444 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctttgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatgaatgtgattct 14188345  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| || ||||  | ||| || |  ||||| |||||||| |  ||||| |||    
T  14188344 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcttatcaactgttttagcaattcggtgtcctcctcctctgctgaagaagaaagtggagtggagttcttg 14188245  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  14188244 tctactaagcagctgaagcaactagaacgagatggaattttgatgt 14188199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14697039 - 14696794
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || || || | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  14697039 ctacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 14696940  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || ||     
T  14696939 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaattcttt 14696840  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  14696839 tctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 14696794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14162408 - 14162163
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14162408 ctacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattct 14162309  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || ||||| ||||| || | |||||| |||    
T  14162308 tggcatgaactggttagagtacaaccatgttcttattaattgttttagcaagtcggtgtccttctcctctgttgaagaagaaagcggagtagagttcttg 14162209  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  14162208 tctaccaagcaactgaagcaactagaacgtgatggaattttgatgt 14162163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 16350628 - 16350725
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16350628 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgatttcgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 16350725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22632528 - 22632393
Alignment:
Q  111 tggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagc 210  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22632528 tggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagc 22632429  T
Q  211 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    || |||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  22632428 agttgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 22632393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 246
Target Start/End: Original strand, 14848543 - 14848684
Alignment:
Q  105 atgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcta 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| |  | |||||||    
T  14848543 atgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattattttattaaatcggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaactcttgtcta 14848642  T
Q  205 ctaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  14848643 ctaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 14848684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Original strand, 29450903 - 29450991
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29450903 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 29450991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15073297 - 15073150
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||  ||||||  | ||||||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||||| || ||||  ||||||||||| ||  |    
T  15073297 ctacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctt 15073198  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  15073197 tgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttag 15073150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Original strand, 3262160 - 3262248
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  3262160 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 3262248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 120
Target Start/End: Original strand, 44659232 - 44659319
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 120  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  44659232 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 44659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Original strand, 51604158 - 51604360
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttc 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| | ||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  51604158 tctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttc 51604257  T
Q  133 agattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 232  Q
    | || ||||| |||| |||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| |  ||  |||| ||||| |||||| |||||||| | ||||| ||    
T  51604258 atatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaattttatctacaaagcagatgaagcaattagaacgtga 51604357  T
Q  233 tgg 235  Q
    |||    
T  51604358 tgg 51604360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 126
Target Start/End: Original strand, 11204598 - 11204691
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
    |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  11204598 tctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 11204691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27903323 - 27903198
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| |    
T  27903323 ctacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttatttt 27903224  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  27903223 agggatgaattggttagagtataacc 27903198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22214 - 21969
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22214 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatttt 22115  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22114 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaaaaggaaagtggtgcagagttttta 22015  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22014 tctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 21969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36465 - 36229
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36465 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 36366  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36365 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 36266  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 237  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36265 tttaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 36229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28944 - 28800
Alignment:
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28944 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgt 28845  T
Q  202 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28844 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 28800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 1369 - 1614
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1369 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 1468  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |     
T  1469 gggtatgaattggttacagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgtagagtttcta 1568  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1569 tctactaagcagctgaagcaactgcaacgcgatggtattttgatgt 1614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 10495 - 10740
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10495 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattct 10594  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10595 gggtatgaattggttagagtacaatcatgttcatattagttgttttagcaagtcagtgtatttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 10694  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10695 tctactaagaagctgaagcaactggaacgcgatggtatattgatgt 10740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41122 - 40877
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41122 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatttt 41023  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41022 gggtatgaactggttagagtacaaccacattcttataaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 40923  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922 tctactaggcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 40877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 13461 - 13706
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  13461 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgatttt 13560  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||     
T  13561 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattctta 13660  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13661 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 13706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3391 - 3146
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3391 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 3292  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  3291 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcgaagttttta 3192  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3191 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17127 - 16882
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17127 ctacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 17028  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17027 gggtatgaattggttagagtacaaccgtgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtacttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttctta 16928  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  16927 tctactaagcagctgaagcaaatggaatgcgatggtattttgatgt 16882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11436 - 11191
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11436 ctacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 11337  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  11336 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttta 11237  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11236 tctactaagcagctgaagcgactggaacgcgatggtatcttgatgt 11191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53694 - 53449
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53694 ctacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 53595  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  53594 gggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttttta 53495  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53494 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 53449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17904 - 17659
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17904 ctacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 17805  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17804 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagttttta 17705  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17704 tctactaagcagctgaagcgactggaatgcgatggtatcttgatgt 17659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 29265 - 29510
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29265 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacatttgagcggtatggatgtgattct 29364  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  29365 ggatatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttctta 29464  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29465 tctactaagcagctgaagaaactggagcgcgatggtattttgatgt 29510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8225 - 7980
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8225 ctacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8126  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||     
T  8125 gggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggatagtggtgcagagttctta 8026  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  8025 tctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 7980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 17403 - 17648
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17403 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattct 17502  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17503 tggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttctta 17602  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17603 tctactaagaagctgaagcaattggaacgcgatggtattttgatgt 17648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 195175 - 195412
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  195175 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtgatttcgagatggatttagtttctctacctttgagcggtgtggatgtgattct 195274  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  195275 gggtatgaactgattgcaatacaaccatgttcacattaattgtttcagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 195374  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 238  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  195375 tctaccaagcagctgaagcaattagaacgcgatggtat 195412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24273 - 24126
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| |||||  |||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||  |||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||    
T  24273 ctacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgtagtggacctagtctgtttgtcgttgagtgggatggatgtgatact 24174  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24173 aggtatgaactggttggagtttaaccatgttcatattaattgctttag 24126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 50682 - 50919
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  50682 ctacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattat 50781  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50782 gggtatgaactggttaaaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 50881  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50882 tctactaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtat 50919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 42636 - 42518
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  42636 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 42537  T
Q  130 ttcagattaattgttttag 148  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  42536 ttcatattaattgctttag 42518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21571 - 21326
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21571 ctacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 21472  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    | ||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21471 gcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 21372  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21371 tctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattgatgt 21326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36995 - 36750
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36995 ctacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 36896  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    | ||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36895 gcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 36796  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36795 tctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattgatgt 36750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31850 - 31606
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31850 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattct 31751  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31750 aggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtaagtgt-tttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 31652  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  31651 tctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttgatgt 31606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37316 - 37072
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37316 ctacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattct 37217  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37216 aggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtaagtgt-tttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 37118  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  37117 tctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttgatgt 37072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10820
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10575 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattat 10674  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||     
T  10675 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattctta 10774  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10775 tctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 10820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 13230 - 13475
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13230 ctacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattat 13329  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||     
T  13330 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattctta 13429  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13430 tctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54604 - 54363
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54604 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattct 54505  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54504 tggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 54405  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 242  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  54404 tctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttg 54363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 37157 - 37402
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37157 ctacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaagatggacttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 37256  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37257 gggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 37356  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37357 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 37402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26319 - 26075
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||| | | || |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||    
T  26319 ctacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatcct 26220  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||||||||    
T  26219 tggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataagtcggtatatttttcttctgttaaagaagagagtggggcggagtttttg 26120  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatg 245  Q
     ||||||||||||| |||||  | || || ||||| |||||||||    
T  26119 actactaagcagctaaagcagttagagcgtgatggaatcttgatg 26075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 35052 - 35296
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  35052 ctacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgat-ct 35150  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35151 gggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttg 35250  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35251 tctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 35296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41599 - 41354
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  41599 ctacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcct 41500  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||    
T  41499 tgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttg 41400  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||    
T  41399 tctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttgatgt 41354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 75319 - 75074
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  75319 ctacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcct 75220  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||    
T  75219 tgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttg 75120  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||    
T  75119 tctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttgatgt 75074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 11693 - 11938
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  11693 ctacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattat 11792  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  11793 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgtagagttctta 11892  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11893 tctactaagcagctgaagtaactggaacgcgatggtattttgatgt 11938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12630 - 12385
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||  | ||||||||||||||||| || |||||    
T  12630 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattct 12531  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  12530 tggtctgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcaaagaggaaagtggtgcagagttcttg 12431  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12430 tctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttgatgt 12385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 246
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15576
Alignment:
Q  49 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15379 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaactgttttag 15478  T
Q  149 caagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15479 caagtcggtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttgatgt 15576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10753 - 10509
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  10753 ctacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 10654  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | ||||||||||    
T  10653 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtagcgtagagtttttg 10554  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||    
T  10553 tctactaagcagctgaagcagttggaacctgatggaattttgatg 10509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 169
Target Start/End: Original strand, 914 - 1050
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttc 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||  | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  914 tctatgtttggtagggattttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttc 1013  T
Q  133 agattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    | || || |  ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  1014 atataaactactttagcaagacagtgcatttttcttc 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14391 - 14203
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14391 ctacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 14292  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  14291 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttttcttccgctgaagaggaaagtggtg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4882 - 4637
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || |||||||||| |||||||||  || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  4882 ctacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggtcaagagtttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 4783  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| || ||||| ||||| || |||    
T  4782 gggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtatatttttcttctaccgaagaagagagtggagcagaattcttg 4683  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  4682 tctactaagcagctgaagcaattagaacgcgatggaattttgatgt 4637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Original strand, 44793 - 44932
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |    
T  44793 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgag 44892  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  44893 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 44932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Original strand, 39702 - 39790
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  39702 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 39790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 246
Target Start/End: Original strand, 8146 - 8323
Alignment:
Q  69 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctctt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8146 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccacgttcttattcattgttttagcaagtcagtgcatttctctt 8245  T
Q  169 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8246 tcgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagaaactggaacgcgatggtatcttgatgt 8323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 25049 - 25294
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||| ||||| || ||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25049 ctacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattct 25148  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25149 gggtatgaactagttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 25248  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| || |||||||    
T  25249 tctactaagcagctgaagcagttggaatgtgatggcattttgatgt 25294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18617 - 18400
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  18617 ctacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcct 18518  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18517 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 18418  T
Q  201 tctactaagcagctgaag 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18417 tctactaagcagctgaag 18400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3564 - 3349
Alignment:
Q  5 ttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggt 104  Q
    |||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3564 ttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggt 3465  T
Q  105 atgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcta 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3464 atgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtggcgcagagtttttatcta 3365  T
Q  205 ctaagcagctgaagca 220  Q
    |||| |||||||||||    
T  3364 ctaaacagctgaagca 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 104194 - 103949
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  104194 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggcatggatgtaatcat 104095  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  104094 gggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagcaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 103995  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  103994 tctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 103949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 726 - 551
Alignment:
Q  71 tctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttcc 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  726 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgaatttctcctca 627  T
Q  171 gtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  626 gtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4401 - 4156
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4401 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatcgatttggtttgtttacctttgagtggtatgaatgtgattct 4302  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4301 tggcaaaaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagtttttg 4202  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||    
T  4201 tctactaagcagctgaagcagttagaacatgatggaatcttgatgt 4156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 111244 - 111489
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  111244 ctacttctcttgtgtgtttaagatgccctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattct 111343  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  111344 tggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaaaaggaaagtggcgcagagtttttg 111443  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  111444 tctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttaatgt 111489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17845 - 17600
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  17845 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 17746  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||| |||||    | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  17745 tggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttgttaagtcggtgtatttttcttctactgtagaagaaagtggagcagagtttttg 17646  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  17645 tctactaagtagctgaagcaattagaacgcgatggaattttgatgt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 152048 - 151803
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  152048 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtgattct 151949  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  151948 tggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttcgcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 151849  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||    
T  151848 tctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatggcattttgatgt 151803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 246
Target Start/End: Original strand, 1907 - 2087
Alignment:
Q  66 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttct 165  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  1907 gtttgtttccctttgagtggtatggatgtaatccagggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattttt 2006  T
Q  166 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||| |  ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  2007 cttctgctgaagaagacagtgacgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatggtattttgatgt 2087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Original strand, 47402 - 47546
Alignment:
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  47402 ggtatgaactggttagagtacaatcatgttcacattaattgttttagtaagtcaatgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttagt 47501  T
Q  202 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  47502 ctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttaatgt 47546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Original strand, 47347 - 47399
Alignment:
Q  29 tttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttga 81  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47347 tttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtctacctttga 47399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 24282 - 24526
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24282 ctacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttaggattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattct 24381  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24382 tggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttg 24481  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||    
T  24482 tctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaattttgatg 24526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 10109 - 10260
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||| | | || ||| |||||||||||| || | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |    
T  10109 ctacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttt 10208  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaag 152  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  10209 tgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 10260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8917 - 8672
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8917 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattct 8818  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8817 tggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttg 8718  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||| || |||||||    
T  8717 tctactaagcagtcgaagtagttggaacgtgatggcattttgatgt 8672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17868
Alignment:
Q  49 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18065 attttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatag 17966  T
Q  149 caagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
     ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||| || |||||||    
T  17965 taagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcagtcgaagtagttggaacgtgatggcattttgatgt 17868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8190 - 7945
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  8190 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattcatttggtttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattct 8091  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8090 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaattctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 7991  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    || | |||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  7990 tcaattaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9812 - 9662
Alignment:
Q  96 attctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9812 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 9713  T
Q  196 ttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9712 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 817 - 975
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  817 ctacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 916  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgt 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  917 gggtatgaattggttagagtgcaaccatgttcatatcaattgtttcagcaagtcagtgt 975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6840 - 6606
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  6840 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 6741  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||| ||     
T  6740 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttctta 6641  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 235  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6640 tctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13970 - 13736
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  13970 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 13871  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||| ||     
T  13870 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttctta 13771  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 235  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  13770 tctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 13736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 13816 - 14061
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || || || | || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  13816 ctacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagattttaaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 13915  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || |||    
T  13916 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttg 14015  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| || |||||||    
T  14016 tctactaagcagctgaagctattagaacgtgatggaattttgatgt 14061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1419 - 1174
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| |  ||||| | || ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1419 ctacttctcttgcgtgtttaagatgtcctttgtctatgcttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagtggtacggatgtgattct 1320  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||    
T  1319 tggcatgaactggttagagtacaaccatgtccatattaattgttttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgtagagtttttg 1220  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  1219 tctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttgatgt 1174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 17686 - 17925
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17686 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctt-gtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgattat 17784  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||| |||     ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17785 tggtatgaactggttggag-----ccatgttcacattaattgttatagtaagtcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttg 17879  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||    
T  17880 tctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatggcattttgatgt 17925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40025 - 39780
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | |    
T  40025 ctacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttt 39926  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||||  ||||| ||  ||| ||  ||||| |||    
T  39925 tggaatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgctttagtaagacggtgcatttttcttccgatgaagaagagggtgatgtggagttcttg 39826  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  39825 tctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaattttgatgt 39780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 55807 - 56052
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || || || | || ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  55807 ctacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcct 55906  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  55907 tggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttg 56006  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  56007 tctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 56052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 23870 - 24103
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  23870 ctacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 23969  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||    
T  23970 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtatatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttg 24069  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24070 tctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 24103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 151534 - 151289
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||| | | || ||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | || ||||||||| |||  ||||  ||||||||||| ||| |    
T  151534 ctacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattgaagtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttt 151435  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||  |     
T  151434 tgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagttccta 151335  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| || ||| |||||||  |||| || ||||| ||||| ||||    
T  151334 tctacgaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaatcttaatgt 151289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6080 - 5846
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  6080 ctacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 5981  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||     
T  5980 gggtatgaactggttagagtgcaacaacgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttcggttgaagaagaaagtggagcagagttctta 5881  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 235  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  5880 tctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15061 - 14922
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  15061 ttgtctatgtttcgtagagattttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgag 14962  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  14961 ttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 14922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 216757 - 217002
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  216757 ctacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagattttaaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 216856  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||| | || |||    
T  216857 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagcggaaagtggcgcaaaattcttg 216956  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||    
T  216957 tctactaagcagctgaaacaattagaacgcgatgggattttgatgt 217002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14051 - 13865
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14051 ctacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtgactttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattct 13952  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 187  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13951 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgttgaagaggaaagtgg 13865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8863 - 8770
Alignment:
Q  127 atgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 220  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8863 atgttcacattaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagca 8770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 1 - 154
Alignment:
Q  93 gtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcag 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1 gtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcatcagacgaagaggaaagtggtgcag 100  T
Q  193 agtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  101 agttcatatctactaagcagctgaagcaaatggaacgagatggtatattgatgt 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4525 - 4317
Alignment:
Q  26 tcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaac 125  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  4525 tcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgtgtggtatggatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaac 4426  T
Q  126 catgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactgg 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||| | |    
T  4425 catgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagttgcgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattag 4326  T
Q  226 aacgcgatg 234  Q
    |||| ||||    
T  4325 aacgtgatg 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14603 - 14837
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || | ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||    
T  14603 ctacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggaagtaatcct 14702  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || |||    
T  14703 tggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagttggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttg 14802  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 235  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14803 tctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 495960 - 495742
Alignment:
Q  28 ctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacca 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  495960 ctttgtctatgtttggtcgagatttttaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaacca 495861  T
Q  128 tgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  495860 tgttcatattaattgttttagtaagtcggtttatttttcttcttctgaagatgaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaa 495761  T
Q  228 cgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    || ||||| || |||||||    
T  495760 cgtgatggaattttgatgt 495742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 441620 - 441507
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||| | | || |||||| |||||||||||| | |||||| | || ||||| |||||| | |||| |||||| |||||||| |||||    
T  441620 ctacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattgatttggtttgtttgccttagagtggaatggatgtaattct 441521  T
Q  101 gggtatgaattggt 114  Q
     |||||||||||||    
T  441520 tggtatgaattggt 441507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 514722 - 514808
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagag 119  Q
    |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  514722 tctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagag 514808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 441493 - 441441
Alignment:
Q  165 tcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 217  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  441493 tcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaa 441441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 169
Target Start/End: Original strand, 452651 - 452718
Alignment:
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| || |||||    
T  452651 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaagacggtgtacttttcttc 452718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 715 - 960
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||| || || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  715 ctacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgtttacctttgggtggtatggatgtgattat 814  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| | | |||||||     
T  815 gggtatgaactggttagagtacatccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgaaaagttttta 914  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  915 tctacaaagcagctgaagcagttagaacgtgatggcattttgatgt 960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 12576 - 12795
Alignment:
Q  26 tcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaac 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| | ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  12576 tcctttgtctatgtttgatcgtaattttgaaattgatttggtttgcttacctttgagtggtatggatataattcttggcatgcactggttagagtacaac 12675  T
Q  126 catgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactgg 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  | |    
T  12676 catgttcatattaattgttttagtaaattggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagag-ttctatctactaagcagctgaagcagttag 12774  T
Q  226 aacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  12775 aacgtgatggaatcttgatgt 12795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1956 - 1865
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 92  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  1956 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagcggtatggat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15316 - 15532
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||| | || ||||| | ||||||||| |||||||||||| |  ||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15316 ctacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattct 15415  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  15416 tggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtcagtgtatttttcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttg 15515  T
Q  201 tctactaagcagctgaa 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  15516 tctactaagcagctgaa 15532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 40844 - 41087
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||  ||||||||| || ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  40844 ctacttctcttgtgtgtttaatatgtccttt--ctatgtttgatcctgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatttaattct 40941  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40942 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaaatgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttg 41041  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||| ||  ||||| |  | ||||| |||||||| |||||||    
T  41042 tctactaaacatttgaagtagttagaacgtgatggtattttgatgt 41087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 246
Target Start/End: Original strand, 27952 - 28077
Alignment:
Q  121 acaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27952 acaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtagaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 28051  T
Q  221 actggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  28052 actgaaacgcgatggtattttgatgt 28077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 949 - 781
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||| |||||||||||| || || || |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||    
T  949 ctacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgaattggtttgtttacgtttgagtggtatggatgtaatcct 850  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  849 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttc 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 604
Alignment:
Q  72 ctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccg 171  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  778 ctacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaactatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctg 679  T
Q  172 tcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
       ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  678 ctaaagaggagagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaattttgatgt 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 246
Target Start/End: Original strand, 6489 - 6669
Alignment:
Q  66 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttct 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6489 gtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttatagtacaaccatgttcatattaattgtttaagtaagtcggtgtatttct 6588  T
Q  166 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||| |  |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  6589 cttctgctgaagaggaaagtggcgtagagttcttatctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaattttgatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 23635 - 23851
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || || ||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  23635 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattct 23734  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||| |||    
T  23735 tggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtcggtgtatttttcttctgtcgaataagagagtggagcagagttcttg 23834  T
Q  201 tctactaagcagctgaa 217  Q
    || ||||||||||||||    
T  23835 tcaactaagcagctgaa 23851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 9688 - 9904
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||| | | || |||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| |||||    
T  9688 ctacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattct 9787  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||| |||    
T  9788 tggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataagtcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttg 9887  T
Q  201 tctactaagcagctgaa 217  Q
    |||||||| || |||||    
T  9888 tctactaatcaactgaa 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 11217 - 11360
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11217 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggtttgtctacctttcagtggtatggatgtgattct 11316  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgtt 144  Q
     |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  11317 tggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgtt 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 108 - 1
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  108 ctacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 9  T
Q  101 gggtatga 108  Q
    ||||||||    
T  8 gggtatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 959 - 819
Alignment:
Q  29 tttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccat 128  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  959 tttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatacaaccat 860  T
Q  129 gttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    || || ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  859 gtgcacattaattgttacagtaagtcggtgtatttctcttc 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 2600 - 2743
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2600 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatagatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattct 2699  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgtt 144  Q
     |||||||| ||||| || ||||||||| || | ||||||||||    
T  2700 tggtatgaactggttggaatacaaccatattaacattaattgtt 2743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Original strand, 8123 - 8217
Alignment:
Q  6 tctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8123 tctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 4309 - 4373
Alignment:
Q  84 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  4309 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttag 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5030 - 4838
Alignment:
Q  26 tcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaac 125  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  5030 tcctttgtcgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataac 4931  T
Q  126 catgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 218  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  4930 catgttcatattaattgtttcaataagtcggtatatttttcttctgctgaagaagagagtggagcaaagttattgactactaagcagctgaag 4838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 231 - 361
Alignment:
Q  118 agtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag--tttttgtctactaagcagctg 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  231 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttttgtctaccaagcagctg 330  T
Q  216 aagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  331 aagcaactagaacgcaatggtattttgatgt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 246
Target Start/End: Original strand, 7102 - 7241
Alignment:
Q  107 gaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  7102 gaattggttggagtacaaccatgttcacatgaattgttctagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcggagaatttttgtctact 7201  T
Q  207 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  7202 aagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 7241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15389 - 15257
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15389 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 15290  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttca 133  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15289 tggtatgaactggttagagtacaaccatgttca 15257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 246
Target Start/End: Original strand, 1196 - 1315
Alignment:
Q  127 atgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactgga 226  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||    
T  1196 atgttcatattatttgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctaaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagtagctgaagcagttaga 1295  T
Q  227 acgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  1296 acgtgatggtattttgatgt 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Original strand, 52430 - 52507
Alignment:
Q  169 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  52430 ccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaagcagctggaacgcgatggtatgttgatgt 52507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 110548 - 110358
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| |  |  |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  110548 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 110449  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 220  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  110448 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcagaagaagagagtggagccgagttcctatctactaaacagttgaagca 110358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 57951 - 58059
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  57951 ctacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtgatcct 58050  T
Q  101 gggtatgaa 109  Q
     ||||||||    
T  58051 tggtatgaa 58059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 19073 - 19190
Alignment:
Q  103 gtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtc 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  19073 gtatgaattggttacagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagttcctgtc 19172  T
Q  203 tactaagcagctgaagca 220  Q
    ||| || ||| |||||||    
T  19173 tacgaaacagttgaagca 19190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21098 - 20963
Alignment:
Q  111 tggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagc 210  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  21098 tggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctactgaataggaaagtggcgcaaaatttttgtctactaagc 20999  T
Q  211 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    ||||||| ||  ||||||  || ||||| |||||||    
T  20998 agctgaaacagttggaacatgacggtattttgatgt 20963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 217
Target Start/End: Original strand, 5328 - 5442
Alignment:
Q  103 gtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtc 202  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  5328 gtatgaactggttggagtataaccatgttcacattcattgttatagtaagtcggtgtatttttcttctgtcgaagaagatagtggagcagagttcttgtc 5427  T
Q  203 tactaagcagctgaa 217  Q
    ||||||  |||||||    
T  5428 tactaactagctgaa 5442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 60706 - 60487
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| |    
T  60706 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttt 60607  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||| |||| ||||| |  ||||| |||||||  || ||||| |||    
T  60606 tgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaagtgaagctgagttcttg 60507  T
Q  201 tctactaagcagctgaagca 220  Q
     ||||||| ||| |||||||    
T  60506 actactaaacagttgaagca 60487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 7203 - 7141
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  7203 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctgagattggtcgtgattttgaaatggatt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5687 - 5550
Alignment:
Q  32 gtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgtt 131  Q
    ||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||    
T  5687 gtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgggtt 5588  T
Q  132 cagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    || || ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  5587 catatcaattgctttagcaagacagtgcatttttcttc 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11744 - 11656
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11744 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 11656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 521 - 355
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  521 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccggg 422  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 196  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  421 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 220
Target Start/End: Original strand, 221 - 411
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||| ||||  |    
T  221 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagggtataaccgag 320  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 220  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  321 ttcatattaattgctttagcaaaacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcggagttcctatctactaaacagttgaagca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20752 - 20586
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |    
T  20752 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgag 20653  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 196  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  20652 ttcatatcaattgttttagcaagacagtgcatttttcttctgcggaacaagaaagtggagcagagtt 20586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 824 - 971
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||| || | || |||||| | || |||||| || | || ||||  ||||||||||| ||| |    
T  824 ctacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttt 923  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||    
T  924 tggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 94260 - 94465
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||  |    
T  94260 ttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagaatataaccgag 94359  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |    ||||||||||||| |||| | ||| | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  94360 tctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggggcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacg 94459  T
Q  230 cgatgg 235  Q
     |||||    
T  94460 agatgg 94465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 115529 - 115404
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||| | |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||  |    
T  115529 ctacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccactgacggggatggatgttatatt 115430  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  115429 tgggatgaattggttagagtataacc 115404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 83858 - 84035
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||  | || || ||||| ||||||||||  ||    
T  83858 ctacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttagtctgcttgccgttaagtgggatggatgtgaaact 83957  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaaga 178  Q
     || ||||| |||||  |||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||| ||||||||    
T  83958 aggaatgaactggttgaagtttaactatgttcacattaattgttttagaaagacagtgcgtttttcttctgtcgaaga 84035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Original strand, 114476 - 114620
Alignment:
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 201  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||  ||  ||||||||     
T  114476 ggtatgaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctaagtttttga 114575  T
Q  202 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||||    
T  114576 ctactaagcagctgaagcagttagagcgtgatggaatcttgatgt 114620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 200805 - 200973
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||  ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |    
T  200805 ctacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctt 200904  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  200905 tgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttc 200973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 325645 - 325440
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  325645 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 325546  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |||| || |||| |||||| ||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||  |||| ||    
T  325545 ttcatatcaattattttagaaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaagcagttggagcg 325446  T
Q  230 cgatgg 235  Q
    ||||||    
T  325445 cgatgg 325440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1058 - 919
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  1058 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 959  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| |||||    
T  958 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Original strand, 98949 - 99088
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  98949 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 99048  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  99049 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 99088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 53760 - 53994
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || || |||| || ||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| |    
T  53760 ctacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttt 53859  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||||| ||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| ||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||  |  ||||| |||    
T  53860 tggaatgaattagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagttgagttcttg 53959  T
Q  201 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 235  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  53960 tctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 53994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 1220 - 1345
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||| | | || ||| ||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |    
T  1220 ctacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttt 1319  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||    
T  1320 tgggatgaactggttagagtataacc 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 5215 - 5431
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  5215 ttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgag 5314  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 229  Q
    |||| || | ||| ||||| ||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |||||    
T  5315 ttcatatcagttgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaacttgaacg 5414  T
Q  230 cgatggtatcttgatgt 246  Q
     ||||| || |||||||    
T  5415 tgatggaattttgatgt 5431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11797 - 11630
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| | || ||| | |  |||   ||||||||||| ||| |    
T  11797 ctacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgctgttgtcgggtatggatgtaatttt 11698  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctctt 168  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| |||| ||||    
T  11697 tgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaactgttttagtaagacagtgcatttttctt 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 148
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8530
Alignment:
Q  77 tttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  8459 tttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattagttgttttag 8530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 7146
Alignment:
Q  77 tttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  7217 tttgagtggaatggatgtaatacttggtattaactggttggagtataaccatgttcatattagttgttttag 7146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 49517 - 49664
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| |    
T  49517 ctacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttt 49616  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||    
T  49617 tggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 49664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 58551 - 58698
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| |    
T  58551 ctacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttt 58650  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||    
T  58651 tggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 58698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 64939 - 65086
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| |    
T  64939 ctacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttt 65038  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||    
T  65039 tggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 65086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22060 - 21921
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||| | ||  |||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  22060 ttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgag 21961  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  21960 ttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 21921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Original strand, 175799 - 175898
Alignment:
Q  118 agtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 217  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  175799 agtataaccatgttcattataattgttttagtaagtcggtatatttttcttctgttgaagaagagagtggagcagggttcttgactactaagcagctgaa 175898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 991
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || |  |    
T  1157 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataatcgag 1058  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 196  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  1057 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Original strand, 1610 - 1756
Alignment:
Q  2 tacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 101  Q
    ||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |     
T  1610 tacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatcttt 1709  T
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  1710 gggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttag 1756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2838 - 2668
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||| ||||| ||| |    
T  2838 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttt 2739  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccg 171  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||||    
T  2738 tgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttccg 2668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Original strand, 28623 - 28769
Alignment:
Q  2 tacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 101  Q
    ||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |     
T  28623 tacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatcttt 28722  T
Q  102 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  28723 gggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttag 28769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26079 - 25954
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||| |    
T  26079 ctacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttatttt 25980  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  25979 cgggatgaattggttagagtataacc 25954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 396 - 303
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
    |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  396 tctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 4670 - 4734
Alignment:
Q  84 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  4670 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttag 4734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 3507 - 3627
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||| | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||  ||||  |||  || |||||||||||  |    
T  3507 ctacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatt 3606  T
Q  101 gggtatgaattggttagagta 121  Q
     || |||||||||||||||||    
T  3607 tgggatgaattggttagagta 3627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 43756 - 43924
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| |  | |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| |    
T  43756 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagatactttgaactcgatctagtatgtttgccattgacgggtatgaatgtaatttt 43855  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  43856 tgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaatttctttagtaagacagtgcatttttcttc 43924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25183 - 25015
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||| | || |||||||  | ||| |||||||||| |||| | ||||||||  |  | || |||||| |||| ||||  || |||||||| || ||    
T  25183 ctacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggtttgtttaccgttgacgggaatggatgtaatcct 25084  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
     |||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  25083 tggtatgaactggttgaagtataaccatgttcatattaattgctttagtaagaccgtgcatttttcttc 25015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11927 - 11780
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| |  | |||||  | ||| | |||||| | || ||||  ||||||||||| ||| |    
T  11927 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagatactttgaggttgatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttt 11828  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  11827 tgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttag 11780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1966 - 1819
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||| | ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || | ||||| ||  | || || ||||| ||||||||||| ||    
T  1966 ctacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtgaacttagtctgcttgccattcagtgggatggatgtgatact 1867  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     ||||| || ||||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||    
T  1866 aggtataaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttag 1819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50043 - 49904
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | |||||  |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  50043 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaaatggttagagtataaccaag 49944  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    |||| || ||||| ||||| ||| | ||| |||| |||||    
T  49943 ttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 49904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 21522 - 21613
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 92  Q
    |||||||||| || ||| |||| | ||| || || ||||||||||| || |||||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  21522 ctacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtttgtttgcctttgagtggaatggat 21613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 63856 - 64003
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| |    
T  63856 ctacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatggatgtgatttt 63955  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||    
T  63956 tgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 64003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Original strand, 1677 - 1795
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  1677 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 1776  T
Q  130 ttcagattaattgttttag 148  Q
    |||| || ||||| |||||    
T  1777 ttcatatcaattgctttag 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6976 - 6854
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  6976 ttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 6877  T
Q  130 ttcagattaattgttttagcaag 152  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  6876 ttcatatcaattgttttagcaag 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7682 - 7564
Alignment:
Q  30 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatg 129  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  7682 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 7583  T
Q  130 ttcagattaattgttttag 148  Q
    |||| || ||||| |||||    
T  7582 ttcatatcaattgctttag 7564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 41667 - 41585
Alignment:
Q  36 atgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 118  Q
    ||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  41667 atgtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 41585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 4426 - 4643
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||| | || |||||||  | ||||||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||| ||||||| || ||    
T  4426 ctacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtttggatgtaatcct 4525  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 200  Q
     || ||||| |||||||| || |||| |||||| || || |||||||| ||| | ||  |||||||||| |  || || ||||||   || ||||| |||    
T  4526 tgggatgaactggttagaatataaccgtgttcatatcaactgttttagtaagacggtacatttctcttctgctgaggaagaaagtaaagctgagttcttg 4625  T
Q  201 tctactaagcagctgaag 218  Q
     |||||||||||||||||    
T  4626 actactaagcagctgaag 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 5483 - 5422
Alignment:
Q  87 atggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  5483 atggatgtaatttttgggatgaattggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttag 5422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 49297 - 49382
Alignment:
Q  84 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttc 169  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  49297 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagtaagacagtgcatttttcttc 49382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 70339 - 70214
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| |    
T  70339 ctacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttt 70240  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  70239 tgggatgaattggttagagtataacc 70214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 251589 - 251464
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 100  Q
    |||||||||| || || |||| || ||| ||||||||||||||| | || |||| | | ||| |||||||| | || |||   ||||||||||| ||| |    
T  251589 ctacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttt 251490  T
Q  101 gggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  251489 tgggatgaattggttagagtataacc 251464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 126
Target Start/End: Original strand, 228 - 296
Alignment:
Q  58 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 126  Q
    |||||||||||||| | || |||   |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  228 tggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagtataacc 296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 8377 - 8329
Alignment:
Q  1 ctacttctctcgtatgtttgaaatatcctttgtctatgtttggtcgtga 49  Q
    |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8377 ctacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29411 - 29347
Alignment:
Q  84 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcagattaattgttttag 148  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  29411 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttag 29347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 29869 - 29781
Alignment:
Q  33 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 121  Q
    |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  29869 tctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagta 29781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University