View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1274_low_38 (Length: 397)

Name: NF1274_low_38
Description: NF1274
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1274_low_38
NF1274_low_38
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (13-274)||(49434054-49434315)
chr3 (13-231)||(2357161-2357380)
chr3 (13-232)||(33247987-33248208)
chr3 (13-232)||(26335116-26335326)
chr3 (13-232)||(3588399-3588619)
chr3 (13-239)||(1232434-1232665)
chr3 (13-232)||(7653165-7653385)
chr3 (13-232)||(8615502-8615722)
chr3 (13-232)||(10386013-10386233)
chr3 (10-232)||(20837093-20837315)
chr3 (13-232)||(45527646-45527865)
chr3 (13-232)||(52308028-52308248)
chr3 (29-232)||(9989395-9989599)
chr3 (13-232)||(27850494-27850712)
chr3 (29-232)||(22097666-22097870)
chr3 (13-232)||(23193922-23194141)
chr3 (29-232)||(36469394-36469597)
chr3 (13-232)||(37471630-37471849)
chr3 (13-232)||(23385395-23385615)
chr3 (13-232)||(48168137-48168356)
chr3 (13-208)||(4742945-4743138)
chr3 (59-232)||(27030672-27030846)
chr3 (268-368)||(49433932-49434032)
chr3 (137-232)||(17405127-17405223)
chr3 (171-232)||(20963754-20963816)
chr3 (170-232)||(25804981-25805044)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (13-231)||(1454796-1455015)
chr6 (13-231)||(1466488-1466707)
chr6 (20-239)||(9518393-9518613)
chr6 (13-212)||(15642436-15642636)
chr6 (13-232)||(5988945-5989165)
chr6 (13-231)||(25976950-25977168)
chr6 (13-232)||(26604338-26604558)
chr6 (13-231)||(34006502-34006721)
chr6 (13-239)||(14270664-14270891)
chr6 (13-232)||(3539046-3539266)
chr6 (13-232)||(24878864-24879084)
chr6 (13-232)||(26515371-26515591)
chr6 (13-232)||(9932748-9932968)
chr6 (13-232)||(21596471-21596694)
chr6 (13-232)||(24161199-24161418)
chr6 (13-232)||(32806706-32806925)
chr6 (13-232)||(21631179-21631401)
chr6 (13-274)||(13173767-13174020)
chr6 (13-274)||(13182300-13182553)
chr6 (59-232)||(14479559-14479733)
chr6 (13-221)||(32821812-32822018)
chr6 (13-117)||(34913803-34913907)
chr6 (13-230)||(6867995-6868213)
chr6 (178-231)||(34913449-34913502)
chr6 (171-232)||(26510413-26510475)
chr6 (13-76)||(25541255-25541317)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (20-274)||(39655987-39656242)
chr5 (13-231)||(37251848-37252065)
chr5 (13-232)||(7314964-7315184)
chr5 (13-232)||(9404423-9404643)
chr5 (13-232)||(11723219-11723439)
chr5 (13-232)||(34456296-34456516)
chr5 (13-232)||(30607019-30607239)
chr5 (13-232)||(16904552-16904772)
chr5 (13-232)||(27167041-27167260)
chr5 (29-232)||(11766754-11766958)
chr5 (13-232)||(24835734-24835954)
chr5 (13-232)||(34869689-34869909)
chr5 (29-232)||(31845979-31846183)
chr5 (29-232)||(33434602-33434806)
chr5 (13-232)||(14344468-14344680)
chr5 (13-142)||(6269980-6270108)
chr5 (13-78)||(7315358-7315423)
chr5 (171-231)||(32226833-32226893)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (13-231)||(29032726-29032945)
chr7 (13-232)||(2477657-2477878)
chr7 (28-231)||(22909118-22909322)
chr7 (13-232)||(3544822-3545043)
chr7 (13-232)||(2797506-2797726)
chr7 (13-232)||(10346248-10346468)
chr7 (10-232)||(2631395-2631618)
chr7 (13-231)||(1274588-1274806)
chr7 (13-232)||(31158219-31158439)
chr7 (13-232)||(8107831-8108051)
chr7 (28-232)||(12183865-12184070)
chr7 (13-232)||(31878600-31878818)
chr7 (13-232)||(12090404-12090623)
chr7 (32-232)||(12190842-12191043)
chr7 (20-232)||(23795093-23795306)
chr7 (20-232)||(22321750-22321963)
chr7 (13-232)||(24482743-24482965)
chr7 (13-232)||(22818411-22818630)
chr7 (13-232)||(31664438-31664657)
chr7 (13-142)||(6172606-6172734)
chr7 (13-142)||(19472133-19472261)
chr7 (13-232)||(1953956-1954175)
chr7 (13-232)||(45500654-45500873)
chr7 (101-232)||(19472294-19472426)
chr7 (171-232)||(33160181-33160243)
chr7 (172-232)||(6172526-6172587)
chr7 (171-231)||(19063514-19063574)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (13-230)||(35225-35443)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (28-231)||(22233808-22234012)
chr8 (10-231)||(22243183-22243406)
chr8 (20-232)||(16958549-16958763)
chr8 (13-231)||(13509964-13510182)
chr8 (13-231)||(13599494-13599712)
chr8 (56-231)||(22222650-22222828)
chr8 (56-231)||(22228992-22229170)
chr8 (13-232)||(8743226-8743446)
chr8 (13-232)||(9068110-9068330)
chr8 (13-232)||(16580084-16580304)
chr8 (13-232)||(22180600-22180820)
chr8 (13-238)||(11308930-11309156)
chr8 (13-232)||(28370092-28370312)
chr8 (13-232)||(28926086-28926306)
chr8 (13-232)||(41577274-41577494)
chr8 (13-231)||(1607285-1607504)
chr8 (13-232)||(4861894-4862113)
chr8 (13-232)||(27348025-27348245)
chr8 (29-232)||(3298801-3299005)
chr8 (42-239)||(17992886-17993085)
chr8 (13-142)||(34006715-34006843)
chr8 (13-232)||(12538156-12538376)
chr8 (13-232)||(24040715-24040933)
chr8 (171-232)||(34006861-34006923)
chr8 (170-232)||(21692166-21692229)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (14-231)||(14185-14402)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (13-232)||(20948744-20948965)
chr4 (24-232)||(30218344-30218554)
chr4 (13-239)||(33110645-33110873)
chr4 (13-232)||(21677610-21677830)
chr4 (13-232)||(4839079-4839299)
chr4 (13-211)||(53895400-53895596)
chr4 (13-231)||(1187965-1188183)
chr4 (20-233)||(6639975-6640189)
chr4 (13-232)||(19247771-19247990)
chr4 (13-232)||(22047680-22047900)
chr4 (13-232)||(323437-323657)
chr4 (13-232)||(26069724-26069946)
chr4 (13-232)||(42532830-42533050)
chr4 (20-232)||(55326773-55326988)
chr4 (20-142)||(5273512-5273634)
chr4 (13-229)||(46691980-46692196)
chr4 (13-232)||(52618513-52618721)
chr4 (13-232)||(26373573-26373792)
chr4 (13-232)||(40995490-40995712)
chr4 (59-239)||(8894923-8895105)
chr4 (10-122)||(35416636-35416746)
chr4 (171-232)||(5273652-5273714)
chr4 (77-232)||(44432060-44432216)
chr4 (171-232)||(35416784-35416846)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (13-232)||(24663073-24663294)
chr2 (13-232)||(28457819-28458040)
chr2 (14-232)||(36557465-36557685)
chr2 (13-232)||(14700640-14700861)
chr2 (13-222)||(9787048-9787258)
chr2 (13-232)||(27257384-27257603)
chr2 (13-232)||(29223714-29223933)
chr2 (13-232)||(29337013-29337232)
chr2 (13-232)||(36040206-36040425)
chr2 (13-232)||(36667812-36668032)
chr2 (13-238)||(13230285-13230510)
chr2 (13-222)||(21159975-21160184)
chr2 (39-232)||(42702175-42702369)
chr2 (13-232)||(23924975-23925194)
chr2 (13-229)||(43991533-43991743)
chr2 (59-232)||(5784513-5784687)
chr2 (166-252)||(492718-492804)
chr2 (29-232)||(32522928-32523132)
chr2 (39-116)||(41977710-41977788)
chr2 (171-238)||(8687774-8687842)
chr2 (170-232)||(11651815-11651878)
chr2 (319-368)||(492568-492617)
chr2 (170-232)||(31758273-31758336)
chr2 (319-368)||(492952-493001)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (14-232)||(16416-16636)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (13-157)||(36083833-36083976)
chr1 (13-231)||(8996205-8996423)
chr1 (13-205)||(9268662-9268854)
chr1 (13-232)||(38121875-38122095)
chr1 (13-232)||(12168159-12168379)
chr1 (13-232)||(39001124-39001344)
chr1 (13-232)||(13830287-13830506)
chr1 (13-232)||(33492141-33492361)
chr1 (13-232)||(11738741-11738960)
chr1 (39-239)||(15161095-15161296)
chr1 (29-232)||(432299-432503)
chr1 (29-232)||(9667654-9667858)
chr1 (13-232)||(16832726-16832945)
chr1 (13-233)||(39454101-39454325)
chr1 (13-232)||(13217989-13218208)
chr1 (13-232)||(44505211-44505433)
chr1 (13-232)||(49249071-49249283)
chr1 (13-232)||(41000047-41000266)
chr1 (166-274)||(36080178-36080285)
chr1 (13-233)||(6244199-6244414)
chr1 (43-232)||(16129658-16129848)
chr1 (43-122)||(16130323-16130402)
chr1 (170-232)||(7612389-7612452)
chr1 (320-368)||(36080049-36080097)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (13-239)||(927-1153)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (13-232)||(28842-29062)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (13-231)||(12147-12363)
scaffold0298 (13-231)||(15917-16133)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (13-231)||(12195-12411)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (13-232)||(25593-25813)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (13-232)||(8741-8961)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (28-232)||(116525-116730)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (13-232)||(6731-6950)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (13-233)||(9393-9617)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (13-232)||(76395-76614)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (59-232)||(1563-1737)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (28-90)||(7205-7267)
scaffold0447 (28-90)||(11819-11881)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (28-90)||(9814-9876)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (13-81)||(12423-12491)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (101-232)||(1-133)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49434315 - 49434054
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttgatgtagctaca 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||    
T  49434315 aatattaaataaataagttagaactatatattaaaagatgaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagataaatgtagctaca 49434216  T
Q  113 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49434215 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcataatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca 49434116  T
Q  213 ccttgctttgtgtttctctcaagaaatagtatctttctctcataaaccaaaaatctccaaaa 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49434115 ccttgctttgtgtttctctctagaaatagtatctttctctcataaaccaaaaatctccaaaa 49434054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2357380 - 2357161
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2357380 aatattgaataaataagctagaaccatatattagaagatcaagagtttacatcatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaatgttagatgtagctac 2357281  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2357280 atatgtctatacaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 2357181  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  2357180 atcttgctttgtgtttctct 2357161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33248208 - 33247987
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  33248208 aatattgaataaattagctagaatcatatattaaaatatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgcagctac 33248109  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||| ||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33248108 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaaaagagatgaagattcaatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 33248009  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  33248008 taccttgctttgtgtttctctc 33247987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26335326 - 26335116
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26335326 aatattgaataaataagctaaaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 26335227  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||           |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  26335226 atatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaac 26335138  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  26335137 taccttgctttgtgtttttctc 26335116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3588619 - 3588399
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  3588619 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 3588521  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  3588520 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 3588421  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  3588420 taccttgctttgtgtttctctc 3588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Original strand, 1232434 - 1232665
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1232434 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagaaattacataatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 1232532  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  1232533 atatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaagagataaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcctaac 1232632  T
Q  212 acc-----ttgctttgtgtttctctcaagaaat 239  Q
    |||     |||||||||||||||||| ||||||    
T  1232633 accttattttgctttgtgtttctctctagaaat 1232665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 7653165 - 7653385
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  7653165 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 7653263  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  7653264 atatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 7653363  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  7653364 taccttgctttgtgtttctctc 7653385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8615722 - 8615502
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  8615722 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 8615624  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||    | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  8615623 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 8615524  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  8615523 taccttgctttgtgtttctctc 8615502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 10386013 - 10386233
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  10386013 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaggattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 10386111  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  10386112 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctcgaatctactcctaac 10386211  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  10386212 taccttgctttgtgtttctctc 10386233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20837315 - 20837093
Alignment:
Q  10 aataatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagc 108  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  20837315 aataatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagc 20837218  T
Q  109 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  20837217 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcct 20837118  T
Q  209 aac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  20837117 aactaccttgccttgtatttctctc 20837093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45527865 - 45527646
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||     
T  45527865 aatattgaataaata-gctagaaccatgtattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctag 45527768  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||   |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  45527767 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgatgaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 45527668  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  45527667 taccttgctttgtgtttctctc 45527646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 52308028 - 52308248
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  52308028 aatattgaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 52308126  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  52308127 atatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctaaacaaatattggctagaatctactcctaac 52308226  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  52308227 taccttgctttgtgtttctctc 52308248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9989599 - 9989395
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||    
T  9989599 gctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagc 9989501  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || ||||||| ||||  || | | ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9989500 tttgcaaaggttgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 9989401  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  9989400 tctctc 9989395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 27850494 - 27850712
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  27850494 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttaaatacctcaaaa-ccacaagattggatgtagctac 27850591  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || ||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  27850592 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatgatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 27850691  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  27850692 taccttgc-ttgtgtttctctc 27850712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22097870 - 22097666
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||    
T  22097870 gctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagc 22097772  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  22097771 tttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttactttgtgtt 22097672  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  22097671 tctctc 22097666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23194141 - 23193922
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||| |||||||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23194141 aatattgaataaata-gatagaaccatatattaaatgatcaaaagattacgtaatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 23194043  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||| ||  || || ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||  ||||    
T  23194042 atatgtctctgatag-tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaac 23193944  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  23193943 taccttgccttgtgtttctctc 23193922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 36469394 - 36469597
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||  |||    
T  36469394 gctagaaccatgtattaaaagatctaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagttgtagctacatatgtctatgatagc 36469492  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || ||||||||||||  |||||| ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  36469493 tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc-ttgtgtt 36469591  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  36469592 tctctc 36469597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 37471630 - 37471849
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  37471630 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaa-ccacaagagtagatatagctac 37471727  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  ||||   ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||    
T  37471728 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgtcgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaac 37471827  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  37471828 tactttgctttgtgtttctctc 37471849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23385615 - 23385395
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  | ||||||||||     
T  23385615 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctaaaaact-acaagaatagatgtagctaa 23385517  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |  |||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  23385516 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgtagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 23385417  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  23385416 taccttgctttttgtttctctc 23385395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 48168137 - 48168356
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  48168137 aatattgaataaata-gctaaaacaatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 48168234  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||| ||||||||   |||||  ||||| |||    | |  | |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  48168235 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagtgaagatgcagattccatgataagatccctgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 48168334  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  48168335 taccttgcttcgtgtttctctc 48168356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 4742945 - 4743138
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  4742945 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaat-gatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 4743041  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttct 208  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4743042 atatgtctatgatagctttgcaaacgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatctctcaacaaatcttggcttgaatctacttct 4743138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Original strand, 27030672 - 27030846
Alignment:
Q  59 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagatt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | ||||||    
T  27030672 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 27030770  T
Q  158 acatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27030771 ccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 27030846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 268 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49434032 - 49433932
Alignment:
Q  268 tccaaaacatcattccctccccctgtgttgcgtagcttccnnnnnnncctagctccttaatcctctccatttcatttttgggtcagctagatggtttctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49434032 tccaaaacatcattccctccccatgtgttgcgcagcttcctttttttcctagctccttaatcctctccatttcatttttgggtcagctagatagtttctt 49433933  T
Q  368 g 368  Q
    |    
T  49433932 g 49433932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 232
Target Start/End: Original strand, 17405127 - 17405223
Alignment:
Q  137 gatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaaca-ccttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||| ||||||||| || |||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17405127 gatggaagaaagatgaatattacatgtcaagactcatgatatctctacaaatcttgaaaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttctctc 17405223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 20963754 - 20963816
Alignment:
Q  171 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20963754 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 20963816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25805044 - 25804981
Alignment:
Q  170 tcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacac-cttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  25805044 tcatgatttctctacaaatcttgggaagaatcaacttctaacactcttgcttcatgtttctctc 25804981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1455015 - 1454796
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  1455015 aatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttac 1454916  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1454915 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 1454816  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1454815 accttgctttgtgtttctct 1454796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1466707 - 1466488
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  1466707 aatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttac 1466608  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1466607 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 1466508  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1466507 accttgctttgtgtttctct 1466488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 9518393 - 9518613
Alignment:
Q  20 aataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctacatatgtc 118  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9518393 aataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 9518492  T
Q  119 tatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgc 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||       
T  9518493 tatgcaaacttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaaaattcatgatgtctcaacaaatcttcataagaatctacttctaacatctcat 9518592  T
Q  219 tttgtgtttctctcaagaaat 239  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  9518593 tttgtgtttctctctagaaat 9518613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15642636 - 15642436
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  15642636 aatattcaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttatttgaatacctcaaaacccacaagggtagatttagctac 15642537  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |  | | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  15642536 atatgtctatgcaagcttagcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtaagaatctactcctaac 15642437  T
Q  212 a 212  Q
    |    
T  15642436 a 15642436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 5988945 - 5989165
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  5988945 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtaaatgtagctac 5989044  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||  || |||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5989045 atatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaa-aaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 5989143  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  5989144 taccttgctttgtgtttctctc 5989165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25977168 - 25976950
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25977168 aatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 25977069  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||| |||||| |||| | | | ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  25977068 atatgtctatgatagctttgcaaa-gatgaagaaaagatgaagattccataacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaac 25976970  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25976969 accttgctttgtgtttctct 25976950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26604558 - 26604338
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  26604558 aatattgaataaataagctagaatcttatattaaatgatcaa-agattacataatagcttttttgaatacctcaatacccacaaggatagatgtagctac 26604460  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |  | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26604459 atatgtctatgaaagctttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctacttctaac 26604360  T
Q  212 a-ccttgctttgtgtttctctc 232  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  26604359 acccttgctttgtgtttctctc 26604338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34006721 - 34006502
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  34006721 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 34006623  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  34006622 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggtttgaatctactcctaac 34006523  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctct 231  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  34006522 taccttgctttgtgtttctct 34006502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14270891 - 14270664
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||    
T  14270891 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaaaatcaagaaattacataattgcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtatatatagctac 14270792  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  || || ||||| ||||||  |||||| ||||||   | |||| |   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14270791 atatgtctatgatagttttgcaaaagatgaagaaaagatgaagattcactgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 14270692  T
Q  212 accttgctttgtgtttctctcaagaaat 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14270691 accttgctttgtgtttctctctagaaat 14270664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3539266 - 3539046
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  3539266 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 3539168  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  3539167 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 3539068  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  3539067 taccttgctttgtgtttctctc 3539046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24879084 - 24878864
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||    
T  24879084 aatattgaataaataagctatagccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaact-acaagagtatatgtagctac 24878986  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||| | ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  24878985 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaac 24878886  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  24878885 taccttgttttgtgtttctctc 24878864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 26515371 - 26515591
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  26515371 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 26515469  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  26515470 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 26515569  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  26515570 taccttgctttgtgtttctctc 26515591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 9932748 - 9932968
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  9932748 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 9932846  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  9932847 atatgtatatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgccttgaatctactcctaac 9932946  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  9932947 taccttgttttgtgtttctctc 9932968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 21596471 - 21596694
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  21596471 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagtttagatgtagctac 21596568  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacct---aaactc-atgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttc 207  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||| | |   ||  || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  21596569 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 21596668  T
Q  208 taac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||    
T  21596669 taactaccatgctttgtgtttctctc 21596694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 24161199 - 24161418
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  24161199 aatattgaataaataa-ctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 24161296  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||    
T  24161297 atatgtctatgatagctttgccaagaatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctttgcttgaatctactcctaac 24161396  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  24161397 taccttgctttgtgtttctctc 24161418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 32806706 - 32806925
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||    
T  32806706 aatattgaataaata-gctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtaggtgtagatac 32806803  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  32806804 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 32806903  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  32806904 taccttgctttgtgtttctctc 32806925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21631401 - 21631179
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||    
T  21631401 aatattgaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctc-aaatccacaagagtagatgtaactac 21631303  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatga--aagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttcta 209  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||  || | |||| ||||||  ||  ||| |  |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||    
T  21631302 atatgtctatgatagctttacaaaggatgaagaaaagagatgaagattctatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttaaatctactctta 21631203  T
Q  210 ac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  21631202 actaccttgctttatgtttctctc 21631179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Original strand, 13173767 - 13174020
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttgatgtagctaca 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     |||| |       
T  13173767 aatattgaataaata-gctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagg-----gtagatg-- 13173858  T
Q  113 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagata--aagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaa 210  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |  |||||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13173859 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgccga--ctcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaa 13173956  T
Q  211 caccttgctttgtgtttctctcaagaaatagtatctttctctcataaacc-aaaaatctccaaaa 274  Q
    |||||| |||||||||| |||  |||||| | |||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  13173957 caccttactttgtgtttttctatagaaat-gcatctttctctaagaacccaaaaaatctccaaaa 13174020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Original strand, 13182300 - 13182553
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttgatgtagctaca 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     |||| |       
T  13182300 aatattgaataaata-gctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagg-----gtagatg-- 13182391  T
Q  113 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagata--aagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaa 210  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |  |||||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13182392 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgccga--ctcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaa 13182489  T
Q  211 caccttgctttgtgtttctctcaagaaatagtatctttctctcataaacc-aaaaatctccaaaa 274  Q
    |||||| |||||||||| |||  |||||| | |||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  13182490 caccttactttgtgtttttctatagaaat-gcatctttctctaagaacccaaaaaatctccaaaa 13182553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14479733 - 14479559
Alignment:
Q  59 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagatt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||  || || ||||||||||||  |||||| ||||||    
T  14479733 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt 14479635  T
Q  158 acatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||  | | | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14479634 ccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 14479559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32822018 - 32821812
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttgatgtagctaca 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32822018 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa-atctaaagattacataattgcttatttgaatacctcaaaacccacaa-gtagatgtagctaca 32821921  T
Q  113 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaaca 212  Q
    | ||||||||  |||||   |||||||| |  | |||| ||||||  || | || |  |||||| | |||||||||||||||| ||||||| | |||| |    
T  32821920 tttgtctatgatagcttttaaaaggatggagaagagatgaagattcaatgcatagatccatgatttatcaacaaatcttgggttgaatctattcctaata 32821821  T
Q  213 ccttgcttt 221  Q
    |||||||||    
T  32821820 ccttgcttt 32821812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 34913907 - 34913803
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34913907 aatattgaataaata-gatagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 34913809  T
Q  112 atatgt 117  Q
    ||||||    
T  34913808 atatgt 34913803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 6867995 - 6868213
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6867995 aatatcaaaaaaatgagctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaacccacaagggtagatgtagctac 6868094  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    | || |  ||   ||| | ||||| |||| |||||| || |||| | |||  | | | ||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  6868095 aaattttcatagtagccttgcaaaagatggaagaaatatgaagactccatgacaagattcatgatat-tctacatatcttgggaggaatctacttctaac 6868193  T
Q  212 a-ccttgctttgtgtttctc 230  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  6868194 acccttgttttgtgtttctc 6868213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34913502 - 34913449
Alignment:
Q  178 tctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtttctct 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34913502 tctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctct 34913449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 26510413 - 26510475
Alignment:
Q  171 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26510413 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 26510475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25541317 - 25541255
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgttt 76  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  25541317 aatatttaataaataagctagaaccttatatgaaatgatcaa-agattacataatagcttgttt 25541255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Original strand, 39655987 - 39656242
Alignment:
Q  20 aataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctacatatgtc 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39655987 aataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 39656086  T
Q  119 tatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgc 218  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |    
T  39656087 tttgcaagcttgacaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttttgtagaatctactcctaacaccttac 39656186  T
Q  219 tttgtgtttctctcaagaaatagtatctttctctcataaaccaaaaatctccaaaa 274  Q
     ||||||||||||| ||||||   |||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  39656187 gttgtgtttctctctagaaatgtcatctttctccaagaaaccaaaaatctccaaaa 39656242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 37251848 - 37252065
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37251848 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 37251946  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||  ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||    
T  37251947 atatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccat-ccttgactcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctacacctaac 37252045  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  37252046 accttgttttgtgtctctct 37252065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7315184 - 7314964
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  7315184 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 7315086  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  7315085 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 7314986  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  7314985 taccttgctttgtgtttctctc 7314964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9404643 - 9404423
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  9404643 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 9404545  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9404544 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 9404445  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  9404444 taccttgctttgtgtttctctc 9404423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 11723219 - 11723439
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  11723219 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 11723317  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  11723318 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 11723417  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  11723418 taccttgctttgtgtttctctc 11723439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34456516 - 34456296
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  34456516 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 34456418  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  34456417 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 34456318  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  34456317 taccttgctttgtgtttctctc 34456296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 30607019 - 30607239
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  30607019 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 30607117  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||    
T  30607118 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatattggcttgaatctactcctaac 30607217  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  30607218 taccttgctttgtgtttctctc 30607239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 16904552 - 16904772
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  16904552 aatattgaataaataggctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 16904650  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  16904651 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacccctaac 16904750  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  16904751 taccttgctttgtgtttctctc 16904772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 27167041 - 27167260
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  27167041 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 27167138  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  27167139 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtcccaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 27167238  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  27167239 taccttgctttgtgtttctctc 27167260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11766958 - 11766754
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||    
T  11766958 gctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagc 11766860  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11766859 tttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 11766760  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  11766759 tctctc 11766754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24835954 - 24835734
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  24835954 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 24835856  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||| ||  | ||||||||| |||||    
T  24835855 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcctgacttgaatctactcctaac 24835756  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  24835755 taccttgatttgtgtttctctc 24835734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 34869689 - 34869909
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34869689 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 34869787  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||||  | |||| ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  34869788 atatgtctatgatagctttgcaaagaatgaataagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 34869887  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  34869888 taccttgttttgtgtttctctc 34869909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31846183 - 31845979
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||    
T  31846183 gctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagattaaatgtagctacatatgtctatgatagc 31846085  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31846084 tttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 31845985  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  31845984 tctctc 31845979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33434806 - 33434602
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||    
T  33434806 gctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgagtacctcaaaa-ctacaagaggagatgtagctacatatgtctatgatagc 33434708  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33434707 tttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 33434608  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  33434607 tctctc 33434602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14344680 - 14344468
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  14344680 aatattgaataaataagttagaaccatatattaaaagat--------tacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 14344590  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  14344589 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 14344490  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  14344489 taccttgctttgagtttctctc 14344468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6270108 - 6269980
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  6270108 aatattgaataaata-gctagaaatatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctac 6270011  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaa 142  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  6270010 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 6269980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 7315423 - 7315358
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttga 78  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7315423 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 7315358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32226893 - 32226833
Alignment:
Q  171 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtttctct 231  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32226893 catgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctct 32226833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 29032726 - 29032945
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29032726 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttagatgtagctac 29032825  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  29032826 atatgtctatgcaagcttggcaaatgatgaaagaaagatgaagattccatgtctagactcatgatgtctcaacaaatcttgaatagaatctactcctaac 29032925  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  29032926 accttactttgtgtttctct 29032945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2477878 - 2477657
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  2477878 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatggagctac 2477779  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||   |||||| ||||||  || |||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2477778 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 2477679  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  2477678 taccttgctttgtgtttctctc 2477657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22909322 - 22909118
Alignment:
Q  28 agctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaag 126  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  22909322 agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatag 22909223  T
Q  127 cttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtt 226  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  ||  ||| |  |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22909222 ctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgactagatccatgatgtctcaacaaatcttagattgaatctactcctaacaccttgctttgtgtt 22909123  T
Q  227 tctct 231  Q
    |||||    
T  22909122 tctct 22909118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 3544822 - 3545043
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3544822 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagtaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 3544921  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| |  | |||| ||||||  || |||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3544922 atatgtctatgatagctttgcaaaggatggagaagagatgaagatttaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 3545021  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||| |||| ||||||||||    
T  3545022 tacctttctttttgtttctctc 3545043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 2797506 - 2797726
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2797506 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 2797604  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  2797605 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaac 2797704  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  2797705 taccttgttttgtgtttctctc 2797726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 10346248 - 10346468
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  10346248 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 10346346  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  10346347 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 10346446  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  10346447 taccttgctttgtgtttctctc 10346468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2631618 - 2631395
Alignment:
Q  10 aataatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagc 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  2631618 aataatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagc 2631520  T
Q  109 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttct 208  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  2631519 tacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcct 2631420  T
Q  209 aac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  2631419 aactaccttgctttgtgtttctctc 2631395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1274806 - 1274588
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  1274806 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataataacttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctac 1274708  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||  || || | |  |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||    
T  1274707 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagataaagattcaatgccgagatccatgatgtctcaacaaatcttgagttaaatctactcataac 1274608  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  1274607 accttactttgtgtttctct 1274588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 31158219 - 31158439
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  31158219 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaggttacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 31158317  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacat-acctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaa 210  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| ||| || | | | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  31158318 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacatgatc-catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaa 31158416  T
Q  211 c-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  31158417 ctaccttgctttgtgtttctctc 31158439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 8107831 - 8108051
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||    
T  8107831 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ttacaagagtagatgtagctac 8107929  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  8107930 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 8108029  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  8108030 taccttgctttgtgtttctctc 8108051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12184070 - 12183865
Alignment:
Q  28 agctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttgatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||  |||    
T  12184070 agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaaaagtagatgtagctacatatgtctatgatagc 12183971  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |   ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12183970 tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 12183871  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  12183870 tctctc 12183865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31878818 - 31878600
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  31878818 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 31878721  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||| ||  || || ||||||||||||| |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  31878720 atatgtctttgatagttttgcaaaggatgaaa-aaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaac 31878622  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  31878621 taccttgctttgtgtttctctc 31878600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 12090404 - 12090623
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  12090404 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacatattagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagattagatgtagctac 12090501  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  12090502 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatttactcctaac 12090601  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  12090602 taccttgctttgtgtttctctc 12090623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12191043 - 12190842
Alignment:
Q  32 agaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttg 130  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||  |||||     
T  12191043 agaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtaaatacatatgtctatgatagcttt 12190945  T
Q  131 gcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttct 229  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12190944 gcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttct 12190845  T
Q  230 ctc 232  Q
    |||    
T  12190844 ctc 12190842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23795306 - 23795093
Alignment:
Q  20 aataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtc 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||    
T  23795306 aataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatggagctacatatgtc 23795208  T
Q  119 tatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttg 217  Q
    |||   ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  23795207 tataatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 23795108  T
Q  218 ctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||| |||||||||    
T  23795107 ctttgagtttctctc 23795093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 22321750 - 22321963
Alignment:
Q  20 aataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtc 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  22321750 aataaataagctagaaccatatattaaaggatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtc 22321848  T
Q  119 tatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttg 217  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||  || ||| ||||||  ||    | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||    
T  22321849 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattcaatgaaaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaacttg 22321948  T
Q  218 ctttgtgtttctctc 232  Q
    |||||| ||||||||    
T  22321949 ctttgtatttctctc 22321963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24482965 - 24482743
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctc-aaaacccacaa-ggttgatgtagcta 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  24482965 aatattgaataaataaactagaaccatattttaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctctaaaatccacaagggtagatgtagcta 24482866  T
Q  111 catatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaa 210  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||  ||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||||   |||||||  |||    
T  24482865 catatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggtttgatctactcataa 24482766  T
Q  211 c-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  24482765 ctcccttgctttgtgtttctctc 24482743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22818630 - 22818411
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||    
T  22818630 aatattgaataaata-gctagaaccatacattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctac 22818533  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  22818532 atatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 22818433  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||||| |||| ||||||||    
T  22818432 taccttgccttgtatttctctc 22818411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 31664438 - 31664657
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||     
T  31664438 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcctgttcgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctag 31664535  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||| ||||  ||||| | ||||||| ||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  31664536 atatgtttatgatagctttgtaaaggattaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 31664635  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  31664636 taccttgctttgtgtttctctc 31664657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6172734 - 6172606
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||||    
T  6172734 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatatagctac 6172637  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaa 142  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  6172636 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 6172606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Original strand, 19472133 - 19472261
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  19472133 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 19472230  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaa 142  Q
    |||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  19472231 atatgtctatgatagctttacaaaggatgaa 19472261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1954175 - 1953956
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||| |||||||    
T  1954175 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaa-ccacaatagtagatatagctac 1954078  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  |||||  |||||||||||  | |  | ||||||  ||  | | |  |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  1954077 atatgtctatgatagcttttcaaaggatgaagaagaattgaagattcaatgacaagatccatgatgtcttaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 1953978  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  1953977 tacattgctttgtgtttctctc 1953956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 45500654 - 45500873
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||    
T  45500654 aatattgaataaataa-ctataaccatatattaaatggtcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactac 45500751  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||  | | || ||||||  ||  | | |   ||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||    
T  45500752 atatgtctgtgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcataac 45500851  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  45500852 taccttgctttgtgtttctctc 45500873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Original strand, 19472294 - 19472426
Alignment:
Q  101 gatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |  || ||| |||||| ||   | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  19472294 gatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaaggatgaagattccaagacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 19472393  T
Q  201 ctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19472394 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 19472426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33160243 - 33160181
Alignment:
Q  171 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33160243 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 33160181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6172587 - 6172526
Alignment:
Q  172 atgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6172587 atgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 6172526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19063574 - 19063514
Alignment:
Q  171 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtttctct 231  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19063574 catgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaacaccttactttgtgtttctct 19063514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 35225 - 35443
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  35225 aatattgaataaataagctataaccatatattaaaaaatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaatggtggatgtacctac 35324  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35325 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcataccgagactcataatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 35424  T
Q  212 accttgctttgtgtttctc 230  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35425 accttgctttgtgtttctc 35443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 22233808 - 22234012
Alignment:
Q  28 agctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctacatatgtctatgcaag 126  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||    
T  22233808 agctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatag 22233907  T
Q  127 cttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtt 226  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22233908 ctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtt 22234007  T
Q  227 tctct 231  Q
    |||||    
T  22234008 tctct 22234012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 22243183 - 22243406
Alignment:
Q  10 aataatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccac-aaggttgatgtagc 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22243183 aataatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagc 22243282  T
Q  109 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||  || |||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22243283 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttct 22243382  T
Q  209 aac-accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||| |||||| |||||||||||||    
T  22243383 aactaccttgttttgtgtttctct 22243406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16958763 - 16958549
Alignment:
Q  20 aataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctacatatgtc 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16958763 aataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattaaataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 16958664  T
Q  119 tatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttg 217  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  16958663 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttg 16958564  T
Q  218 ctttgtgtttctctc 232  Q
    |||||||||||||||    
T  16958563 ctttgtgtttctctc 16958549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13510182 - 13509964
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13510182 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 13510084  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||  || |||| |  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13510083 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaac 13509984  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  13509983 atcttgctttgtgtttctct 13509964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13599712 - 13599494
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13599712 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 13599614  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||  || |||| |  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13599613 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaac 13599514  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  13599513 atcttgctttgtgtttctct 13599494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 22222650 - 22222828
Alignment:
Q  56 agtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagata--a 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |  |    
T  22222650 agtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatga 22222749  T
Q  153 agattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22222750 agattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctct 22222828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 22228992 - 22229170
Alignment:
Q  56 agtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagata--a 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |  |    
T  22228992 agtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatga 22229091  T
Q  153 agattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22229092 agattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctct 22229170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 8743226 - 8743446
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  8743226 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 8743324  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  8743325 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 8743424  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  8743425 taccttgctttgtgtttctctc 8743446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 9068110 - 9068330
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  9068110 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 9068208  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9068209 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 9068308  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  9068309 taccttgctttgtgtttctctc 9068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16580304 - 16580084
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  16580304 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 16580206  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  16580205 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 16580106  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  16580105 taccttgctttgtgtttctctc 16580084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22180820 - 22180600
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22180820 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctac 22180722  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || ||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  22180721 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 22180622  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  22180621 taccttgctttttgtttctctc 22180600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 11308930 - 11309156
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  11308930 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 11309028  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |  ||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  11309029 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtggagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 11309128  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctcaagaaa 238  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11309129 taccttgctttgtgtttctctctagaaa 11309156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28370312 - 28370092
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||    
T  28370312 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaact-acaagagtaaatgtagctac 28370214  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  28370213 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 28370114  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  28370113 taccttgctttgtgtttctctc 28370092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 28926086 - 28926306
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  28926086 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 28926184  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  28926185 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 28926284  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  28926285 taccttgctttgtgtttctctc 28926306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 41577274 - 41577494
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||    
T  41577274 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctc-aaagctacaagagtagatgtagctac 41577372  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  41577373 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 41577472  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  41577473 taccttgctttgtgtttctctc 41577494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1607504 - 1607285
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaa-agatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagcta 110  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  1607504 aatatttaataaataaggtagaaccatatattaaataaataaaga--ttacataatagtttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagcta 1607407  T
Q  111 catatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaa 210  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |  | | ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  |||    
T  1607406 catatgcctatgaaagctttgcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttaggaagaatatactcttaa 1607307  T
Q  211 ca-ccttgctttgtgtttctct 231  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  1607306 cacccttgctttgtgtttctct 1607285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 4861894 - 4862113
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  4861894 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 4861991  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||  ||||    
T  4861992 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaac 4862091  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||| | |||||||||||||    
T  4862092 taccttaccttgtgtttctctc 4862113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27348245 - 27348025
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||    
T  27348245 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaga-ctacaagagtagatgtagctac 27348147  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  27348146 atatgtctatgataactttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 27348047  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  27348046 taccttgctttgtgtttctctc 27348025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3299005 - 3298801
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||    
T  3299005 gctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagc 3298907  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || |||| |||||||  || | | ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3298906 tttgcaatggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 3298807  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  3298806 tctctc 3298801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17993085 - 17992886
Alignment:
Q  42 attaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatg 140  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  17993085 attaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 17992986  T
Q  141 aaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctcaagaaat 239  Q
    ||  |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17992985 aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttggattgaatctactcttaactaccttgccttgtgtttctctctagaaat 17992886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Original strand, 34006715 - 34006843
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  34006715 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 34006812  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaa 142  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  34006813 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 34006843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12538376 - 12538156
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  12538376 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctac 12538278  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||  | |||| ||||||  ||  | | | ||||||| |||||||||||| | | | ||||||| | |||||    
T  12538277 atatgtctaagatagctttgcaaatgatgaagaagagatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcatagcttgaatctaatcctaac 12538178  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  12538177 taccttgatttgtgtttctctc 12538156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24040933 - 24040715
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||    
T  24040933 aatattgaataaata-gctaaaaccatatattaaat-atcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccataagagtagatatagctac 24040837  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||   | | || ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24040836 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttctaac 24040737  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     || ||| ||| ||||||||||    
T  24040736 tacattgatttatgtttctctc 24040715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 34006861 - 34006923
Alignment:
Q  171 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34006861 catgatgtctcaacaaatcttggctttaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 34006923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21692229 - 21692166
Alignment:
Q  170 tcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacac-cttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  21692229 tcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctc 21692166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14402 - 14185
Alignment:
Q  14 atattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctaca 112  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14402 atattgaataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttac-taatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctaca 14304  T
Q  113 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaaca 212  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  14303 tatgtatatgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagattccatccctaaactcatgatgtctcaacaaatcttgagttgaatctactcctaaca 14204  T
Q  213 ccttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  14203 ccttgctttgtgtctctct 14185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20948965 - 20948744
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg-ttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20948965 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggatagatgtagctac 20948866  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||| | ||||  |||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| |||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20948865 atatatttatgatagcttgacaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcgacaaatcttgggttgaatctacttttaac 20948766  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  20948765 taccttgctttgtgtttctctc 20948744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 30218344 - 30218554
Alignment:
Q  24 aataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctacatatgtctatg 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30218344 aataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatg 30218443  T
Q  123 caagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgcttt 221  Q
      ||||| || |||||||||  |||||| |||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  30218444 atagctttgctaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgacgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgcttt 30218543  T
Q  222 gtgtttctctc 232  Q
    |||||||||||    
T  30218544 gtgtttctctc 30218554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Original strand, 33110645 - 33110873
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  || || ||||    
T  33110645 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatggcttgtgtgaatacctcaaaacccacaagggtatatataactac 33110744  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  33110745 atatgtctacgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagatgtcatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaac 33110844  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctcaagaaat 239  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33110845 taccttgccttgtgtttctctctagaaat 33110873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 21677610 - 21677830
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  21677610 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 21677708  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||  || |||| | ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| | |||||    
T  21677709 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattttatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctattcctaac 21677808  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  21677809 tactttgctttgtgtttctctc 21677830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 4839079 - 4839299
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  4839079 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 4839177  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4839178 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 4839277  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  4839278 taccttgctttgtgtttctctc 4839299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 53895596 - 53895400
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  53895596 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaata---agagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctac 53895500  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||| |||| | ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  53895499 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagactccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttttaac 53895400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1188183 - 1187965
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  1188183 aatattaaataaataa-ctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 1188086  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  1188085 atatgcctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaac 1187986  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctct 231  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  1187985 taccttgctttgtgtttctct 1187965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6640189 - 6639975
Alignment:
Q  20 aataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctacatatgtc 118  Q
    |||||||||  ||||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6640189 aataaataaattagaaccttatattaaatgatcaa-agattccataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 6640091  T
Q  119 tatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaaca-ccttg 217  Q
    |||| |||||| | ||| |||  ||||||||| |||||||||| |  | | ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  6640090 tatgaaagctttggaaaagatagaagaaagatgaagattacatgctaagattcaagatgtctcaacaaattttgggaagaatctactcctaacacccttg 6639991  T
Q  218 ctttgtgtttctctca 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  6639990 ctttgtgtttctctca 6639975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 19247771 - 19247990
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  19247771 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 19247868  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| | |||    
T  19247869 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatattggtttgaatctactcccaac 19247968  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  19247969 taccttgctttgtgtttctctc 19247990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22047900 - 22047680
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  22047900 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 22047802  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  ||| || |||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  22047801 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccataatgtctcaacaaatcttggcttgaatcttctcctaac 22047702  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  22047701 taccttgctttgtgtttctctc 22047680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 323657 - 323437
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||    
T  323657 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 323559  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  323558 atatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 323459  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  323458 tatcttgctttgtgtttctctc 323437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26069946 - 26069724
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt---gatgtagct 109  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||    
T  26069946 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatatgtagct 26069848  T
Q  110 acatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttcta 209  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | || | ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26069847 acatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagttgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttcta 26069748  T
Q  210 ac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  26069747 actaccttgctttgtgtttctctc 26069724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 42532830 - 42533050
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaact-atatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagcta 110  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  42532830 aatattgaataaata-gctagaacccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagcta 42532927  T
Q  111 catatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaa 210  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||  ||||||||||||| || | ||||||||| ||||    
T  42532928 catatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgacgtctcaacaaatctaggcttgaatctactcctaa 42533027  T
Q  211 -caccttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  42533028 ccaccttgctttgtgtttctctc 42533050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55326988 - 55326773
Alignment:
Q  20 aataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctacatatgtc 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  55326988 aataaataagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgcttgaatacctcaaaacc-acaagggtagatgtagctacatatgtc 55326890  T
Q  119 tatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtaga--atctacttctaac-acct 215  Q
    ||||  ||||| | || |||||||  |||||| |||||| ||| |||| | ||||||| ||||||  |||||||||| ||  ||||||| ||||| | ||    
T  55326889 tatgatagctttggaatggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatatctactcctaactatct 55326790  T
Q  216 tgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||| ||||||||||||    
T  55326789 tgctatgtgtttctctc 55326773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Original strand, 5273512 - 5273634
Alignment:
Q  20 aataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtc 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  5273512 aataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtc 5273610  T
Q  119 tatgcaagcttggcaaaggatgaa 142  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||    
T  5273611 tatgatagctttgcaaaggatgaa 5273634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 46691980 - 46692196
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||    
T  46691980 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactac 46692077  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||   | | || ||||||  ||  | | | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  46692078 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 46692177  T
Q  212 -accttgctttgtgtttct 229  Q
     ||||||||||||||||||    
T  46692178 taccttgctttgtgtttct 46692196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52618721 - 52618513
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  52618721 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaatagtagatgtagctac 52618624  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||           |||||| |||  | | | ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  52618623 atatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaac 52618535  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  52618534 taccttgctttgtgtttctctc 52618513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 26373573 - 26373792
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| ||||||     
T  26373573 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacatgaggtgatatagctat 26373670  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaa-agataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaa 210  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| | || ||||||  ||    | |  |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  26373671 atatgtctatgatagctttgcaaaggat-aaagaagaaatgaagattcaatgataagatccatgatatctcaacaaatattggcttgaatctactcctaa 26373769  T
Q  211 c-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  26373770 ctaccttgctttgtgtttctctc 26373792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 40995490 - 40995712
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatatta---aaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagc 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||   || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  40995490 aatattgaataaata-gctagaaccatatattattaaatgatcaaaagattacataatagcttttttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagc 40995587  T
Q  109 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||  ||    | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  40995588 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcct 40995687  T
Q  209 aac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  40995688 aactaccttgatttgtgtttctctc 40995712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8895105 - 8894923
Alignment:
Q  59 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctacatatgtct-atgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagat 156  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||| ||| ||   ||| | ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8895105 ttacataatagcttgcttaagtacctctaaacccacaagggcagatttagctacatat-tctcatagtagccttgcaaaagatggaagaaagatgaagat 8895007  T
Q  157 tacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaaca-ccttgctttgtgtttctctcaagaaat 239  Q
    | |||  | | | ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8895006 ttcatgacaagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctacttctaacacccttgcattgtgtttctctctagaaat 8894923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 35416636 - 35416746
Alignment:
Q  10 aataatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagc 108  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||| |    
T  35416636 aataatattgaataaatt-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttg-ttgaatacatcaaaa-ccacaagagtagatgtaac 35416732  T
Q  109 tacatatgtctatg 122  Q
    ||||||||||||||    
T  35416733 tacatatgtctatg 35416746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 5273652 - 5273714
Alignment:
Q  171 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5273652 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 5273714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 232
Target Start/End: Original strand, 44432060 - 44432216
Alignment:
Q  77 gaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatga 175  Q
    ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||    
T  44432060 gaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaagggtgaagattccatggcaagatccatga 44432158  T
Q  176 tatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    | |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44432159 tgtctcaagaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgagtttctctc 44432216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 35416784 - 35416846
Alignment:
Q  171 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  35416784 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatctttctttgtgtttctctc 35416846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 24663073 - 24663294
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  24663073 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaaactcacaagcgtagatgtagctac 24663172  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |  | | ||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||    
T  24663173 atatgtctatgcaagcttcgcaaaggatgaaagaaagatgaagattcaatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtatgaaactactcctaac 24663272  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  24663273 aaccttgctttgtgtttctctc 24663294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 28457819 - 28458040
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28457819 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 28457918  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||||  |||||| ||||||  || |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  28457919 atatgtctatgatagcattgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcttaacaaatcttgagttgaatctactcctaac 28458018  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  28458019 taccttgctttgtgtttctctc 28458040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 36557465 - 36557685
Alignment:
Q  14 atattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctaca 112  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  36557465 atattgaataaataagttagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtacctaca 36557564  T
Q  113 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac- 211  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| || |||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  36557565 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattaaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaact 36557664  T
Q  212 accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  36557665 accttgctatgtgtttctctc 36557685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14700861 - 14700640
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  14700861 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatagttagtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtaactac 14700762  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| || ||| || | | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  14700761 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagtttccttgcctagactcaagatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaac 14700662  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  14700661 taccttgctttgtgtttttctc 14700640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 9787048 - 9787258
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||    
T  9787048 aatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaatggtagatatacttac 9787147  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| || |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  9787148 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatgcctagattcatgatatctcaacaaatcttgataagaatctactcctaac 9787247  T
Q  212 accttgctttg 222  Q
    | |||||||||    
T  9787248 atcttgctttg 9787258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27257603 - 27257384
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  27257603 aatattgaataaata-gctagaactatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 27257506  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||  ||||| || | |||    
T  27257505 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttaaatctcctccaaac 27257406  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  27257405 taccttgttttgtgtttctctc 27257384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29223933 - 29223714
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||    
T  29223933 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctac 29223836  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29223835 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 29223736  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  29223735 taccttgctttgtgtttctctc 29223714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29337232 - 29337013
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||    
T  29337232 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctac 29337135  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29337134 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 29337035  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  29337034 taccttgctttgtgtttctctc 29337013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 36040206 - 36040425
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  36040206 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 36040303  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  36040304 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 36040403  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  36040404 taccttgctttgtgtttctctc 36040425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 36667812 - 36668032
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36667812 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 36667910  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| |  | |||||| |||||    
T  36667911 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttaagtctactcctaac 36668010  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  36668011 taccttgctttgtgtttctctc 36668032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 13230285 - 13230510
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||    
T  13230285 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaa-ccacaagagtagatgtagctac 13230382  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||||||  |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||  ||||    
T  13230383 atatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcataac 13230482  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctcaagaaa 238  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13230483 taccttgctttgtgtttctctctagaaa 13230510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21160184 - 21159975
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21160184 aatattgaataaata-gctagaatcatatattgaatgatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 21160086  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| ||||||  | |||| |||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  21160085 atatgtctatgatagctttgcaaaagatgaagaagagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcctaac 21159986  T
Q  212 accttgctttg 222  Q
    ||||| |||||    
T  21159985 accttactttg 21159975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 232
Target Start/End: Original strand, 42702175 - 42702369
Alignment:
Q  39 tatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaagg 137  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  42702175 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttatttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 42702273  T
Q  138 atgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    | |||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42702274 aggaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 42702369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 23924975 - 23925194
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||    
T  23924975 aatattgaataaata-gctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-caacaagagtagatgtagatac 23925072  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacat-acctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaa 210  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||| || | | | |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  23925073 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatc-catgatgtctcaacaaatcttcgcttgaatctactcctaa 23925171  T
Q  211 c-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  23925172 ctaccttgctttgtgtttctctc 23925194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43991743 - 43991533
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  43991743 aatattgaataaata-gctagcaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 43991646  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||     ||||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  43991645 atatgtctatgatagctttgcaaaggatg-aaga-----aaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 43991552  T
Q  212 -accttgctttgtgtttct 229  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  43991551 taccttgccttgtgtttct 43991533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Original strand, 5784513 - 5784687
Alignment:
Q  59 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagatt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | ||||||    
T  5784513 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 5784611  T
Q  158 acatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  5784612 ccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaacttccttgctttgtgtttctctc 5784687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 492804 - 492718
Alignment:
Q  166 aaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtttctctcaagaaatagtatctttctct 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  492804 aaactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgatttgtgtttctctctagaaatgccatctttctct 492718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32523132 - 32522928
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||| |||  |||    
T  32523132 gctataaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagggtagaaatagctacatatgtccatgatagc 32523034  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || |||||||| |||  | | || ||||||  ||  | | |  |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32523033 tttgcaaaggacgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaataaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 32522934  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  32522933 tctctc 32522928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 41977788 - 41977710
Alignment:
Q  39 tatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctacatatg 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  41977788 tatattaaaatatcaaaagtttacataatggcttgtttgaataccttaaaacccacaatggtagatgtagctatatatg 41977710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 238
Target Start/End: Original strand, 8687774 - 8687842
Alignment:
Q  171 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctcaagaaa 238  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8687774 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctagaaa 8687842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11651878 - 11651815
Alignment:
Q  170 tcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaaca-ccttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11651878 tcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctactcataacacccttgctttgtgtttctctc 11651815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 492617 - 492568
Alignment:
Q  319 gctccttaatcctctccatttcatttttgggtcagctagatggtttcttg 368  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  492617 gctccttaatcctctccattccatttacgggtcagctaaatggtttcttg 492568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31758336 - 31758273
Alignment:
Q  170 tcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacac-cttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  31758336 tcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctc 31758273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 368
Target Start/End: Original strand, 492952 - 493001
Alignment:
Q  319 gctccttaatcctctccatttcatttttgggtcagctagatggtttcttg 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  492952 gctccttaatcctcttcatttcatttacggatcagctaaatggtttcttg 493001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 16416 - 16636
Alignment:
Q  14 atattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctaca 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  16416 atattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagggtttacataatagcttatttaaatacctcaaaacccacaagggtatatgtagataca 16515  T
Q  113 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac- 211  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  16516 tatgtctaagatagcttggcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcttaact 16615  T
Q  212 accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16616 accttactttgtgtttctctc 16636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36083976 - 36083833
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttgatgtagctaca 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36083976 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagat-aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtagatgtaactaca 36083878  T
Q  113 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagatt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36083877 tatgtctatgcaagcttgacaaaggatgaaagaaagataaagatt 36083833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 8996205 - 8996423
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8996205 aatattgaataaata-gctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacatcaaaacccacaagggtagatgtagctac 8996303  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||  || |||| |  |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8996304 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcgcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 8996403  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8996404 accttgctttgtgtttctct 8996423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9268854 - 9268662
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9268854 aatattgaataaata-gctagaaacatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttggttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctac 9268756  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctact 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||    
T  9268755 atatgtctttgcaagtttggcaaaggataaaagaaagatgaagatttcatgtctagactcatgatgtctcaataaatattaggaagaatctact 9268662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 38121875 - 38122095
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  38121875 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 38121973  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  38121974 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 38122073  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  38122074 taccttgctttgtgtttctctc 38122095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 12168159 - 12168379
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  12168159 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 12168257  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  12168258 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacacctaac 12168357  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  12168358 taccttgctttgtgtttctctc 12168379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 39001124 - 39001344
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  39001124 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 39001222  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  39001223 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 39001322  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  39001323 taccttgctttgtgtttctctc 39001344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13830506 - 13830287
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  13830506 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaatgatcaag-taatacataatagcttgtttgaatacctaaaaacccacaagggtaaatgtagctac 13830408  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| |  | | ||||||  |||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  13830407 atatgtctatgaaaactttgcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcatgctaagattcatgacgtctcaacaaatcttaggaagaatctactcctaac 13830308  T
Q  212 accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||| | | |||||||||||||    
T  13830307 acccttccttgtgtttctctc 13830287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 33492141 - 33492361
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||| |||||    
T  33492141 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaa-ctacaagagtagatgtggctac 33492239  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  33492240 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 33492339  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  33492340 taccttgctttgtgtttctctc 33492361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 11738741 - 11738960
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  11738741 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctac 11738838  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| | |||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  11738839 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtgtcaacaaatcttggcttgaatttactcctaac 11738938  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  11738939 taccttgctttgtgtttctctc 11738960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15161296 - 15161095
Alignment:
Q  39 tatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaagg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||    
T  15161296 tatattaaaaaatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccataagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcagagg 15161197  T
Q  138 atgaaagaaagataaagattacatacctaa-actcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtttctctcaaga 236  Q
    |||||  ||| || |||||| || | |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  15161196 atgaagaaaatatgaagattcca-agctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctactcctaatatcttgctttgtgtttctctctaga 15161098  T
Q  237 aat 239  Q
    |||    
T  15161097 aat 15161095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 432299 - 432503
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||    
T  432299 gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagc 432397  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | | ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||| |||| ||    
T  432398 tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgagtctactcctaactaccttgccttgtatt 432497  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  432498 tctctc 432503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 9667654 - 9667858
Alignment:
Q  29 gctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttg-atgtagctacatatgtctatgcaagc 127  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||  |||    
T  9667654 gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatgtatgtagctacatatgtctatgatagc 9667752  T
Q  128 ttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtt 226  Q
    || ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||    
T  9667753 tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgccttgtatt 9667852  T
Q  227 tctctc 232  Q
    ||||||    
T  9667853 tctctc 9667858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 16832726 - 16832945
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  16832726 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctac 16832823  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||    | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  16832824 atatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 16832923  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  16832924 taccttactttgtgtttctctc 16832945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39454325 - 39454101
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttaca---taatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||| || |||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  39454325 aatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaa-agattacaaattaatagcttgtttgaataccttaaaaaccacaagcgtagatgtagc 39454227  T
Q  109 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttct 208  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |||||  | | |||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||    
T  39454226 tacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatactaagattcatgatatctctacaaatcctaggaagaatctacttct 39454127  T
Q  209 aaca-ccttgctttgtgtttctctca 233  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||    
T  39454126 aacatgcttgatttgtgtttctctca 39454101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 13217989 - 13218208
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  13217989 aatattgaataaata-gctagaaccgtatattaaattatcaaaagattacataatatcttgtttgaatgcctcaaaacc-acaagagtagatgtagctac 13218086  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaa- 210  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | |    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||     
T  13218087 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagttccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 13218186  T
Q  211 caccttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13218187 caccttgctttgtgtttctctc 13218208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 44505211 - 44505433
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaact-atatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgttt-gaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagct 109  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  44505211 aatattgaataaata-gctagaacccatatattaaataatcaaaagattacataatagcttgttttgaatacctcaaaaaccacaagtttagatgtagct 44505309  T
Q  110 acatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacat-acctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttct 208  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||| || | | | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||    
T  44505310 acatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatc-catgatgtctcaacaaattttggcttgaatctactcct 44505408  T
Q  209 aac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  44505409 aactaccttgctttgtgtttctctc 44505433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49249283 - 49249071
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  49249283 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagat--------tacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 49249193  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  49249192 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 49249093  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  49249092 taccttactttgtgtttctctc 49249071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 41000047 - 41000266
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||    
T  41000047 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactac 41000144  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  || || |||||||||||   | | || ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  41000145 atatgtctatgatagatttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 41000244  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  41000245 taccttgctttgtgtttctctc 41000266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36080285 - 36080178
Alignment:
Q  166 aaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacaccttgctttgtgtttctctcaagaaatagtatctttctctcataaaccaaaaa 265  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| | || |||||||    
T  36080285 aaactcatgatgtctcaacaagtcttggatagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctttctct-aaaacccaaaaa 36080187  T
Q  266 tctccaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  36080186 tctccaaaa 36080178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6244414 - 6244199
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  6244414 aatattgaataaaagagctggaaccatatattaaatgatcaagagtttacat-------tgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctat 6244322  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    || | |  ||   ||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||| |||  | | | |||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||    
T  6244321 atgttttcatagtagctttgcaaaagatggaagaaggatgaagattccatgacaatattcatgatatctctacaaatctttagaagaatctactcctaac 6244222  T
Q  212 a-ccttgctttgtgtttctctca 233  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  6244221 acccttgctttgtgtttctctca 6244199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16129848 - 16129658
Alignment:
Q  43 ttaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatga 141  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  16129848 ttaaatgatcaaaagattacataatagattgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatga 16129750  T
Q  142 aagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    |  | | || ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16129749 agaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttgctttgtgtttctctc 16129658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16130402 - 16130323
Alignment:
Q  43 ttaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatg 122  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  16130402 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-tcacaagagtagatatagctacatatgtctatg 16130323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Original strand, 7612389 - 7612452
Alignment:
Q  170 tcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaacac-cttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7612389 tcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctc 7612452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36080097 - 36080049
Alignment:
Q  320 ctccttaatcctctccatttcatttttgggtcagctagatggtttcttg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||||||    
T  36080097 ctccttaatcctctccatttcatttacgggtcaactaaattgtttcttg 36080049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Original strand, 927 - 1153
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccac-aaggttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  927 aatattgaataaataagctacacc-atatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctac 1025  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||| ||  | ||| |||||||| |||  | | || || ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1026 atatgtctgtgataactttgcaaaggacgaagaagatatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttggatagaatctactcctaac 1125  T
Q  212 accttgctttgtgtttctctcaagaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1126 accttactttgtgtttctctctagaaat 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 28842 - 29062
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  28842 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 28940  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  28941 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 29040  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  29041 taccttgctttgtgtttctctc 29062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 12147 - 12363
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||     
T  12147 aatattgaataaata-gctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagcta- 12244  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
     ||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||  || |||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12245 -tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac 12343  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12344 accttgctttgtgtttctct 12363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 15917 - 16133
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||     
T  15917 aatattgaataaata-gctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagcta- 16014  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
     ||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||  || |||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16015 -tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac 16113  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16114 accttgctttgtgtttctct 16133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12411 - 12195
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggtt-gatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||     
T  12411 aatattgaataaata-gctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagcta- 12314  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
     ||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||  || |||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12313 -tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac 12215  T
Q  212 accttgctttgtgtttctct 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12214 accttgctttgtgtttctct 12195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 25593 - 25813
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  25593 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 25691  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||||||||  || | | |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  25692 atatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 25791  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  25792 taccttgctttgtgtttctctc 25813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8961 - 8741
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  8961 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 8863  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  8862 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 8763  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  8762 taccttgccttgtgtttctctc 8741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 116525 - 116730
Alignment:
Q  28 agctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaag 126  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  116525 agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatag 116623  T
Q  127 cttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgt 225  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| | |||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  116624 ctttgcaaaggatgaagaaaagatgaggattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgt 116723  T
Q  226 ttctctc 232  Q
    |||||||    
T  116724 ttctctc 116730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6950 - 6731
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||    
T  6950 aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctac 6853  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  6852 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 6753  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     ||||||| |||| ||||||||    
T  6752 taccttgccttgtatttctctc 6731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 9393 - 9617
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttaca---taatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||| || |||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  9393 aatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaa-agattacaaattaatagcttgtttgaataccttaaaaaccacaagcgtagatgtagc 9491  T
Q  109 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttct 208  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |||||  | | |||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||    
T  9492 tacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatactaagattcatgatatctctacaaatcctaggaagaatctacttct 9591  T
Q  209 aaca-ccttgctttgtgtttctctca 233  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||    
T  9592 aacatgcttgatttgtgtttctctca 9617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 76395 - 76614
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctac 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||    
T  76395 aatattgaataaata-gctagaaccatacattaaatgatcaaaagattacataataacttgtttgaatacctcaaaa-tcacaagagtagatgtatctac 76492  T
Q  112 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  |  | | ||||||  ||  | | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  76493 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaattgttgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 76592  T
Q  212 -accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  76593 taccttgctttgtgtttctctc 76614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1737 - 1563
Alignment:
Q  59 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag-gttgatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagatt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | | ||||||    
T  1737 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 1639  T
Q  158 acatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
     |||    | |  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1638 ccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctc 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7267 - 7205
Alignment:
Q  28 agctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 90  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7267 agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 7205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11881 - 11819
Alignment:
Q  28 agctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 90  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11881 agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9876 - 9814
Alignment:
Q  28 agctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 90  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9876 agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 9814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 12423 - 12491
Alignment:
Q  13 aatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaata 81  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12423 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Original strand, 1 - 133
Alignment:
Q  101 gatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||  ||||||  || |||| |  |||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  1 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagaggaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttgaat 100  T
Q  201 ctacttctaac-accttgctttgtgtttctctc 232  Q
    ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  101 ctactcccaactaccttgctttgtctttctctc 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University