View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1274_low_85 (Length: 258)

Name: NF1274_low_85
Description: NF1274
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1274_low_85
NF1274_low_85
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (1-241)||(22001753-22001993)
chr8 (1-241)||(1484402-1484642)
chr8 (1-241)||(5853214-5853454)
chr8 (1-241)||(20403227-20403467)
chr8 (1-241)||(4483281-4483520)
chr8 (1-241)||(14409366-14409606)
chr8 (1-241)||(4542295-4542535)
chr8 (1-241)||(15203153-15203393)
chr8 (1-241)||(20046117-20046357)
chr8 (1-237)||(16413238-16413474)
chr8 (1-241)||(19896265-19896509)
chr8 (1-237)||(45290616-45290853)
chr8 (1-241)||(14823774-14824015)
chr8 (1-247)||(19936925-19937174)
chr8 (62-241)||(41598188-41598367)
chr8 (1-228)||(15070571-15070800)
chr8 (49-241)||(25484245-25484430)
chr8 (67-225)||(19801370-19801527)
chr8 (62-243)||(26223917-26224098)
chr8 (1-128)||(24485966-24486093)
chr8 (79-244)||(16092297-16092463)
chr8 (79-247)||(6759255-6759421)
chr8 (1-118)||(32810054-32810171)
chr8 (79-244)||(18818364-18818530)
chr8 (92-244)||(7372778-7372931)
chr8 (79-243)||(28648999-28649164)
chr8 (79-244)||(20536208-20536374)
chr8 (123-241)||(26225292-26225409)
chr8 (79-244)||(21918955-21919121)
chr8 (79-244)||(22875065-22875230)
chr8 (123-241)||(26219717-26219834)
chr8 (96-244)||(21923900-21924049)
chr8 (132-244)||(23406379-23406492)
chr8 (79-244)||(22626736-22626901)
chr8 (73-226)||(13597566-13597720)
chr8 (79-244)||(18879191-18879352)
chr8 (83-244)||(38855212-38855372)
chr8 (73-226)||(13508034-13508188)
chr8 (79-244)||(31971257-31971421)
chr8 (73-244)||(17612059-17612231)
chr8 (83-244)||(6520368-6520528)
chr8 (83-240)||(21285601-21285758)
chr8 (73-225)||(20498581-20498734)
chr8 (1-58)||(38550033-38550090)
chr8 (145-244)||(45131019-45131117)
chr8 (1-242)||(32121734-32121968)
chr8 (64-244)||(5866217-5866395)
chr8 (64-244)||(17140916-17141094)
chr8 (64-244)||(21490995-21491173)
chr8 (62-225)||(37116366-37116532)
chr8 (1-242)||(18677987-18678221)
chr8 (145-244)||(16199666-16199765)
chr8 (116-243)||(23648554-23648682)
chr8 (1-77)||(1326959-1327041)
chr8 (64-244)||(21249384-21249563)
chr8 (64-244)||(21255222-21255401)
chr8 (62-163)||(17439443-17439544)
chr8 (62-163)||(17266930-17267031)
chr8 (130-244)||(21389458-21389571)
chr8 (130-244)||(21395988-21396101)
chr8 (130-244)||(21778784-21778897)
chr8 (130-244)||(21790481-21790594)
chr8 (83-244)||(23760805-23760962)
chr8 (1-58)||(27472339-27472395)
chr8 (66-229)||(983347-983512)
chr8 (1-45)||(16401952-16401996)
chr8 (1-58)||(20982649-20982710)
chr8 (83-230)||(21673718-21673864)
chr8 (191-240)||(26355766-26355815)
chr8 (62-114)||(37515835-37515888)
chr8 (63-114)||(14103163-14103215)
chr8 (80-163)||(22364745-22364826)
chr8 (32-77)||(35026849-35026894)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (1-241)||(14949044-14949284)
chr7 (1-241)||(456321-456561)
chr7 (1-241)||(15376635-15376875)
chr7 (1-241)||(16232520-16232760)
chr7 (1-241)||(20385045-20385285)
chr7 (1-241)||(21189517-21189757)
chr7 (1-241)||(32125491-32125731)
chr7 (1-241)||(41522917-41523157)
chr7 (1-241)||(41525379-41525619)
chr7 (1-240)||(11393209-11393448)
chr7 (1-241)||(16410059-16410299)
chr7 (1-241)||(18640272-18640512)
chr7 (1-241)||(27216860-27217100)
chr7 (1-244)||(18430709-18430952)
chr7 (1-241)||(24702238-24702478)
chr7 (1-241)||(11972496-11972736)
chr7 (1-241)||(24704688-24704925)
chr7 (1-241)||(16213684-16213924)
chr7 (1-241)||(26355903-26356156)
chr7 (1-241)||(26358355-26358608)
chr7 (1-241)||(13869346-13869588)
chr7 (62-241)||(44116509-44116688)
chr7 (71-241)||(3386333-3386503)
chr7 (49-244)||(13647325-13647521)
chr7 (92-237)||(24275175-24275320)
chr7 (62-241)||(17061898-17062077)
chr7 (67-241)||(20110556-20110720)
chr7 (69-237)||(38898366-38898535)
chr7 (62-225)||(12756654-12756817)
chr7 (122-241)||(48273392-48273512)
chr7 (1-148)||(15081869-15082019)
chr7 (115-241)||(13831373-13831499)
chr7 (79-241)||(3564319-3564482)
chr7 (79-244)||(12698831-12698998)
chr7 (1-96)||(13841157-13841252)
chr7 (79-241)||(18456368-18456530)
chr7 (79-244)||(9509189-9509355)
chr7 (79-244)||(38227481-38227646)
chr7 (73-244)||(2280068-2280238)
chr7 (1-77)||(14269984-14270060)
chr7 (73-244)||(26211995-26212168)
chr7 (1-77)||(8468804-8468880)
chr7 (130-244)||(10589039-10589154)
chr7 (123-229)||(15144037-15144143)
chr7 (1-90)||(18627717-18627806)
chr7 (83-244)||(67745-67904)
chr7 (1-77)||(11303411-11303487)
chr7 (123-244)||(22072913-22073036)
chr7 (64-244)||(34200786-34200964)
chr7 (1-77)||(16108611-16108687)
chr7 (83-240)||(18005650-18005806)
chr7 (83-244)||(47831807-47831968)
chr7 (62-244)||(16495402-16495581)
chr7 (83-229)||(16056343-16056488)
chr7 (1-77)||(8940336-8940414)
chr7 (1-77)||(38898150-38898228)
chr7 (145-244)||(16386268-16386369)
chr7 (73-244)||(19486693-19486865)
chr7 (1-77)||(23664875-23664951)
chr7 (183-244)||(28505357-28505419)
chr7 (79-242)||(40443393-40443555)
chr7 (62-229)||(1867932-1868101)
chr7 (83-244)||(16219677-16219835)
chr7 (73-222)||(12255740-12255892)
chr7 (73-157)||(15113031-15113114)
chr7 (83-240)||(811091-811248)
chr7 (62-244)||(15754828-15755008)
chr7 (1-77)||(29796772-29796850)
chr7 (1-77)||(29800591-29800669)
chr7 (191-240)||(44014182-44014231)
chr7 (1-58)||(45847683-45847739)
chr7 (73-157)||(15116568-15116651)
chr7 (62-163)||(20220127-20220225)
chr7 (183-238)||(18154901-18154956)
chr7 (73-226)||(10063772-10063921)
chr7 (139-240)||(14932749-14932851)
chr7 (139-240)||(15356184-15356286)
chr7 (139-240)||(15360298-15360400)
chr7 (191-244)||(11996095-11996148)
chr7 (194-244)||(27847901-27847951)
chr7 (186-243)||(2832504-2832561)
chr7 (198-229)||(14044761-14044792)
chr7 (198-229)||(14354791-14354822)
chr7 (62-163)||(15008436-15008536)
chr7 (186-240)||(19649552-19649606)
chr7 (183-240)||(12187019-12187076)
chr7 (183-240)||(17138120-17138177)
[»] chr6 (78 HSPs)
chr6 (1-241)||(18334514-18334754)
chr6 (1-241)||(24422547-24422787)
chr6 (1-241)||(33861794-33862034)
chr6 (1-241)||(33864278-33864518)
chr6 (4-241)||(12742317-12742554)
chr6 (1-241)||(2291102-2291342)
chr6 (1-241)||(8055029-8055269)
chr6 (1-241)||(19005046-19005286)
chr6 (1-241)||(19858841-19859081)
chr6 (1-241)||(26924562-26924802)
chr6 (1-241)||(1540833-1541073)
chr6 (1-241)||(22782227-22782467)
chr6 (1-243)||(34963371-34963613)
chr6 (1-243)||(30676632-30676874)
chr6 (27-241)||(1595549-1595763)
chr6 (1-241)||(25656629-25656869)
chr6 (1-241)||(25688502-25688742)
chr6 (49-241)||(25754809-25755001)
chr6 (49-241)||(20556864-20557054)
chr6 (62-225)||(18456735-18456898)
chr6 (71-241)||(3852009-3852179)
chr6 (66-238)||(16448513-16448686)
chr6 (89-225)||(18461895-18462031)
chr6 (79-244)||(25629310-25629476)
chr6 (82-244)||(29060540-29060703)
chr6 (79-243)||(18409782-18409947)
chr6 (119-244)||(20593773-20593899)
chr6 (96-244)||(17287768-17287917)
chr6 (79-244)||(20360915-20361081)
chr6 (79-244)||(16496244-16496410)
chr6 (119-244)||(19303536-19303661)
chr6 (79-229)||(25644335-25644487)
chr6 (79-225)||(18821801-18821946)
chr6 (132-244)||(20076700-20076812)
chr6 (96-244)||(22780199-22780348)
chr6 (62-242)||(19847932-19848114)
chr6 (139-244)||(20638298-20638404)
chr6 (1-74)||(18913994-18914067)
chr6 (5-74)||(18937252-18937321)
chr6 (73-244)||(20109140-20109312)
chr6 (183-244)||(25714417-25714478)
chr6 (1-77)||(12942365-12942441)
chr6 (83-244)||(23019408-23019567)
chr6 (1-58)||(31630569-31630626)
chr6 (1-77)||(15875470-15875546)
chr6 (1-77)||(28289257-28289333)
chr6 (183-244)||(27333277-27333339)
chr6 (183-244)||(27394017-27394079)
chr6 (73-244)||(8227460-8227632)
chr6 (64-244)||(28496414-28496592)
chr6 (64-244)||(29808825-29809003)
chr6 (1-57)||(23992604-23992663)
chr6 (62-244)||(1561303-1561483)
chr6 (197-244)||(22080799-22080846)
chr6 (83-229)||(9098473-9098620)
chr6 (1-42)||(19847890-19847931)
chr6 (1-45)||(17377770-17377814)
chr6 (130-229)||(19668386-19668488)
chr6 (132-242)||(23992429-23992540)
chr6 (145-244)||(35245586-35245684)
chr6 (191-244)||(16920698-16920751)
chr6 (62-114)||(18696617-18696670)
chr6 (191-240)||(19652199-19652248)
chr6 (191-225)||(11185524-11185558)
chr6 (183-244)||(22831503-22831565)
chr6 (62-114)||(23076862-23076915)
chr6 (203-247)||(19008799-19008843)
chr6 (183-223)||(33443068-33443108)
chr6 (1-32)||(1598266-1598297)
chr6 (116-217)||(15041542-15041644)
chr6 (186-240)||(18907111-18907165)
chr6 (186-240)||(19862978-19863032)
chr6 (186-240)||(19873120-19873174)
chr6 (62-114)||(18706435-18706488)
chr6 (62-114)||(18896253-18896306)
chr6 (183-240)||(21766695-21766752)
chr6 (62-114)||(35008280-35008333)
chr6 (183-230)||(4185880-4185928)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (1-241)||(39363384-39363624)
chr5 (1-241)||(264690-264930)
chr5 (1-241)||(20909012-20909252)
chr5 (1-241)||(42245287-42245527)
chr5 (4-241)||(10732865-10733102)
chr5 (1-241)||(29345980-29346220)
chr5 (1-241)||(29348453-29348693)
chr5 (1-241)||(29350926-29351166)
chr5 (1-241)||(39245136-39245376)
chr5 (1-241)||(32027393-32027633)
chr5 (1-241)||(29329934-29330171)
chr5 (4-241)||(20917877-20918110)
chr5 (1-241)||(38619434-38619676)
chr5 (1-240)||(23064512-23064753)
chr5 (67-241)||(11581187-11581361)
chr5 (62-241)||(2154596-2154776)
chr5 (62-241)||(36154766-36154942)
chr5 (66-238)||(18319020-18319193)
chr5 (62-241)||(20901991-20902172)
chr5 (74-241)||(10775670-10775838)
chr5 (67-238)||(24067110-24067282)
chr5 (62-241)||(31061068-31061248)
chr5 (79-244)||(23390451-23390617)
chr5 (79-244)||(9077952-9078118)
chr5 (79-244)||(25421532-25421698)
chr5 (79-244)||(1096467-1096633)
chr5 (137-244)||(21997547-21997655)
chr5 (119-241)||(24529223-24529346)
chr5 (79-244)||(21729019-21729185)
chr5 (79-244)||(21808344-21808510)
chr5 (79-244)||(24493569-24493734)
chr5 (79-244)||(8286797-8286964)
chr5 (79-244)||(25431395-25431560)
chr5 (123-241)||(22412187-22412305)
chr5 (79-244)||(13025311-13025476)
chr5 (79-244)||(13095495-13095660)
chr5 (79-225)||(22144068-22144215)
chr5 (79-244)||(22075018-22075185)
chr5 (73-240)||(21565546-21565713)
chr5 (83-244)||(21329457-21329618)
chr5 (83-244)||(21502116-21502277)
chr5 (1-242)||(17517086-17517320)
chr5 (123-186)||(20766119-20766181)
chr5 (63-225)||(20026879-20027043)
chr5 (145-244)||(21292992-21293090)
chr5 (1-77)||(9776522-9776598)
chr5 (83-244)||(26011995-26012154)
chr5 (1-77)||(37804825-37804901)
chr5 (182-241)||(20806845-20806904)
chr5 (183-244)||(19660894-19660956)
chr5 (73-163)||(40725935-40726025)
chr5 (83-240)||(22959495-22959649)
chr5 (67-225)||(22178162-22178323)
chr5 (183-244)||(36314577-36314639)
chr5 (1-42)||(20901949-20901990)
chr5 (96-225)||(37723922-37724050)
chr5 (146-234)||(18418590-18418678)
chr5 (73-244)||(19668898-19669066)
chr5 (186-240)||(26704075-26704129)
chr5 (186-240)||(26973808-26973862)
chr5 (5-42)||(2154558-2154595)
chr5 (183-225)||(26740705-26740747)
chr5 (183-228)||(26732892-26732937)
chr5 (183-240)||(22032323-22032380)
chr5 (62-107)||(36314685-36314730)
chr5 (145-240)||(21873254-21873350)
[»] chr3 (94 HSPs)
chr3 (1-241)||(34159326-34159566)
chr3 (1-241)||(55476491-55476731)
chr3 (1-241)||(16454203-16454443)
chr3 (1-241)||(17463178-17463418)
chr3 (1-241)||(45606829-45607069)
chr3 (1-241)||(13154177-13154418)
chr3 (1-241)||(7781269-7781509)
chr3 (1-241)||(28848533-28848773)
chr3 (1-241)||(6469056-6469296)
chr3 (1-241)||(8899094-8899334)
chr3 (1-241)||(10247645-10247885)
chr3 (1-239)||(16282733-16282971)
chr3 (1-241)||(9707529-9707769)
chr3 (1-241)||(38961813-38962053)
chr3 (1-241)||(13151712-13151953)
chr3 (1-239)||(41123892-41124127)
chr3 (1-242)||(13544024-13544265)
chr3 (1-237)||(12567564-12567800)
chr3 (38-241)||(17446614-17446816)
chr3 (1-241)||(8499518-8499760)
chr3 (1-241)||(15412429-15412671)
chr3 (79-241)||(29172583-29172745)
chr3 (49-241)||(50242822-50243014)
chr3 (62-241)||(17672626-17672805)
chr3 (62-225)||(53070636-53070799)
chr3 (62-241)||(12119707-12119887)
chr3 (1-241)||(27165250-27165492)
chr3 (49-244)||(43550448-43550644)
chr3 (110-241)||(15977515-15977646)
chr3 (1-241)||(53301426-53301669)
chr3 (130-241)||(55500942-55501053)
chr3 (79-244)||(14972854-14973020)
chr3 (79-241)||(40213676-40213838)
chr3 (79-244)||(17487856-17488022)
chr3 (79-244)||(17499338-17499504)
chr3 (123-241)||(36166598-36166715)
chr3 (123-241)||(21618449-21618566)
chr3 (79-244)||(25476340-25476506)
chr3 (79-244)||(43840932-43841098)
chr3 (79-226)||(42386428-42386576)
chr3 (138-241)||(10556985-10557088)
chr3 (130-244)||(18438534-18438649)
chr3 (79-244)||(13442274-13442440)
chr3 (79-244)||(20698391-20698556)
chr3 (79-244)||(23083316-23083482)
chr3 (79-244)||(26686887-26687053)
chr3 (116-244)||(12399209-12399338)
chr3 (142-241)||(44494809-44494908)
chr3 (79-230)||(14576788-14576939)
chr3 (79-241)||(24153164-24153326)
chr3 (143-241)||(17737236-17737337)
chr3 (73-244)||(24340672-24340844)
chr3 (79-244)||(11424718-11424880)
chr3 (116-230)||(14572603-14572717)
chr3 (73-225)||(52523676-52523831)
chr3 (1-77)||(15977697-15977773)
chr3 (1-77)||(54520986-54521062)
chr3 (73-226)||(23274705-23274859)
chr3 (1-76)||(29544764-29544839)
chr3 (83-244)||(15470927-15471085)
chr3 (1-242)||(46822267-46822501)
chr3 (83-244)||(14234487-14234648)
chr3 (73-163)||(2051148-2051238)
chr3 (1-59)||(12305327-12305385)
chr3 (73-240)||(16097332-16097499)
chr3 (73-244)||(37642214-37642386)
chr3 (188-241)||(45577947-45578000)
chr3 (1-77)||(11913972-11914050)
chr3 (73-244)||(13210280-13210448)
chr3 (183-241)||(28194693-28194752)
chr3 (1-58)||(10557091-10557148)
chr3 (73-240)||(16103784-16103950)
chr3 (73-170)||(22147474-22147571)
chr3 (73-240)||(12174212-12174376)
chr3 (62-125)||(17248224-17248287)
chr3 (62-225)||(37251105-37251270)
chr3 (119-230)||(32307691-32307802)
chr3 (81-225)||(43925977-43926123)
chr3 (116-243)||(30029841-30029968)
chr3 (183-240)||(49668135-49668193)
chr3 (130-242)||(12511059-12511172)
chr3 (183-243)||(14665398-14665458)
chr3 (79-225)||(22110307-22110454)
chr3 (1-36)||(17444738-17444773)
chr3 (183-240)||(9512924-9512982)
chr3 (183-240)||(9520899-9520957)
chr3 (183-240)||(856140-856197)
chr3 (186-243)||(14668554-14668611)
chr3 (32-65)||(15977667-15977700)
chr3 (183-240)||(23077537-23077594)
chr3 (62-114)||(23318653-23318706)
chr3 (183-223)||(13919350-13919390)
chr3 (186-240)||(15878114-15878168)
chr3 (192-240)||(26196500-26196548)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (1-241)||(23130862-23131102)
chr2 (1-241)||(23133329-23133569)
chr2 (1-241)||(34402444-34402684)
chr2 (1-241)||(18808943-18809183)
chr2 (1-241)||(23709454-23709694)
chr2 (1-241)||(23711935-23712175)
chr2 (1-241)||(39682313-39682553)
chr2 (1-241)||(24898117-24898358)
chr2 (1-241)||(24900600-24900841)
chr2 (1-241)||(24903077-24903318)
chr2 (1-241)||(24905554-24905795)
chr2 (1-241)||(24908029-24908270)
chr2 (1-241)||(6725995-6726235)
chr2 (1-238)||(21154982-21155219)
chr2 (1-241)||(571397-571637)
chr2 (1-241)||(23135590-23135830)
chr2 (1-241)||(26505379-26505619)
chr2 (1-241)||(26507857-26508097)
chr2 (1-241)||(28577099-28577339)
chr2 (1-241)||(24367774-24368014)
chr2 (1-241)||(32039420-32039660)
chr2 (1-243)||(32214843-32215085)
chr2 (1-241)||(22105412-22105653)
chr2 (9-241)||(45029784-45030016)
chr2 (1-241)||(38967374-38967614)
chr2 (71-239)||(43137301-43137469)
chr2 (62-241)||(24529511-24529691)
chr2 (1-156)||(24642776-24642933)
chr2 (79-244)||(22337115-22337281)
chr2 (79-244)||(23060513-23060679)
chr2 (79-244)||(23076442-23076608)
chr2 (79-244)||(22731189-22731355)
chr2 (67-244)||(19671830-19672007)
chr2 (79-244)||(22738135-22738300)
chr2 (79-244)||(23285865-23286027)
chr2 (79-241)||(298769-298933)
chr2 (163-238)||(24643034-24643109)
chr2 (79-244)||(23660023-23660188)
chr2 (145-244)||(38136-38235)
chr2 (79-244)||(23654341-23654507)
chr2 (73-244)||(23708568-23708738)
chr2 (1-77)||(20261383-20261459)
chr2 (1-237)||(25616192-25616421)
chr2 (62-225)||(7670-7835)
chr2 (116-244)||(23103389-23103516)
chr2 (183-244)||(23040249-23040310)
chr2 (49-118)||(22173799-22173868)
chr2 (1-77)||(23707244-23707322)
chr2 (1-77)||(24918197-24918275)
chr2 (83-239)||(28405981-28406137)
chr2 (183-244)||(8946657-8946718)
chr2 (183-240)||(7679589-7679647)
chr2 (130-244)||(20309108-20309221)
chr2 (62-163)||(23791357-23791458)
chr2 (62-225)||(23207296-23207461)
chr2 (73-149)||(22459511-22459587)
chr2 (1-77)||(10684685-10684763)
chr2 (1-77)||(24671082-24671160)
chr2 (62-163)||(24697543-24697644)
chr2 (64-244)||(23071892-23072070)
chr2 (183-243)||(22134266-22134326)
chr2 (83-240)||(25175854-25176010)
chr2 (79-225)||(20520148-20520295)
chr2 (1-77)||(24681501-24681579)
chr2 (191-229)||(18786971-18787009)
chr2 (90-225)||(32451894-32452031)
chr2 (1-42)||(24529469-24529510)
chr2 (62-151)||(22413073-22413161)
chr2 (183-223)||(23287384-23287424)
chr2 (183-223)||(26392403-26392443)
chr2 (81-114)||(25109019-25109052)
chr2 (89-157)||(23004838-23004905)
chr2 (62-102)||(29601478-29601518)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-241)||(20747-20987)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-241)||(37821-38061)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-241)||(136680-136920)
scaffold0028 (1-241)||(139149-139389)
scaffold0028 (1-241)||(144087-144327)
scaffold0028 (1-241)||(134211-134451)
scaffold0028 (1-241)||(141618-141858)
scaffold0028 (119-240)||(132662-132784)
scaffold0028 (83-226)||(62216-62355)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-241)||(94411-94651)
scaffold0023 (1-237)||(17362-17598)
scaffold0023 (82-241)||(44454-44614)
scaffold0023 (83-240)||(100378-100534)
scaffold0023 (183-244)||(119875-119937)
scaffold0023 (83-240)||(40135-40291)
scaffold0023 (191-240)||(101503-101552)
scaffold0023 (186-240)||(38542-38596)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (1-241)||(15118274-15118514)
chr4 (1-241)||(44615288-44615528)
chr4 (1-241)||(12229-12469)
chr4 (1-241)||(18239341-18239581)
chr4 (1-241)||(50222261-50222501)
chr4 (1-241)||(52312510-52312750)
chr4 (1-241)||(18215196-18215436)
chr4 (1-241)||(1837431-1837671)
chr4 (1-241)||(44773005-44773249)
chr4 (1-243)||(19618094-19618336)
chr4 (1-237)||(15355246-15355483)
chr4 (1-241)||(3515007-3515247)
chr4 (1-247)||(19242693-19242940)
chr4 (1-243)||(14970629-14970871)
chr4 (49-241)||(23803235-23803427)
chr4 (49-241)||(51463838-51464030)
chr4 (26-241)||(7641139-7641344)
chr4 (62-241)||(44102214-44102393)
chr4 (49-241)||(12610950-12611135)
chr4 (73-241)||(44928873-44929042)
chr4 (62-244)||(15367690-15367873)
chr4 (62-244)||(15402703-15402886)
chr4 (62-225)||(21815568-21815731)
chr4 (62-244)||(15371202-15371385)
chr4 (62-244)||(15373483-15373666)
chr4 (62-244)||(15370018-15370200)
chr4 (67-244)||(16223532-16223710)
chr4 (67-238)||(20149832-20150004)
chr4 (123-241)||(54798753-54798872)
chr4 (123-241)||(14280316-14280434)
chr4 (79-244)||(7088877-7089043)
chr4 (79-244)||(7798774-7798940)
chr4 (79-239)||(14038653-14038814)
chr4 (79-241)||(16377478-16377639)
chr4 (79-242)||(22636437-22636601)
chr4 (79-244)||(7893703-7893869)
chr4 (79-244)||(12902757-12902923)
chr4 (132-244)||(52873375-52873488)
chr4 (123-241)||(8574868-8574985)
chr4 (62-242)||(22353835-22354016)
chr4 (79-244)||(16270191-16270356)
chr4 (79-244)||(44052829-44052995)
chr4 (79-244)||(6899891-6900056)
chr4 (1-78)||(52873100-52873177)
chr4 (1-77)||(15496993-15497069)
chr4 (81-244)||(16239927-16240090)
chr4 (57-225)||(13783-13953)
chr4 (73-229)||(43198502-43198661)
chr4 (73-229)||(52243143-52243302)
chr4 (79-237)||(23374314-23374473)
chr4 (159-244)||(3096293-3096379)
chr4 (1-77)||(15534345-15534421)
chr4 (1-77)||(36038034-36038110)
chr4 (1-77)||(49547696-49547772)
chr4 (1-58)||(362268-362325)
chr4 (1-77)||(14048741-14048817)
chr4 (191-244)||(39706356-39706409)
chr4 (1-77)||(14746539-14746617)
chr4 (81-170)||(15464888-15464977)
chr4 (79-225)||(46640411-46640558)
chr4 (73-244)||(15551817-15551985)
chr4 (62-229)||(12288147-12288316)
chr4 (62-225)||(53082089-53082254)
chr4 (119-240)||(12774011-12774132)
chr4 (26-77)||(19857608-19857659)
chr4 (145-244)||(14053323-14053422)
chr4 (183-244)||(17046487-17046549)
chr4 (73-152)||(8846465-8846543)
chr4 (145-225)||(6190481-6190563)
chr4 (183-240)||(8846360-8846418)
chr4 (186-243)||(20157522-20157579)
chr4 (183-223)||(17333298-17333338)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (1-241)||(13988866-13989106)
chr1 (1-241)||(21923213-21923453)
chr1 (1-241)||(21475009-21475249)
chr1 (1-241)||(29776688-29776928)
chr1 (1-241)||(29298137-29298376)
chr1 (1-241)||(31612313-31612553)
chr1 (1-241)||(23593656-23593897)
chr1 (1-242)||(21840766-21841007)
chr1 (1-241)||(22122989-22123230)
chr1 (1-243)||(16361915-16362158)
chr1 (1-241)||(16275285-16275526)
chr1 (1-247)||(15859930-15860177)
chr1 (62-244)||(13212844-13213027)
chr1 (62-241)||(21707167-21707346)
chr1 (62-241)||(21711709-21711888)
chr1 (62-241)||(21346961-21347141)
chr1 (49-244)||(45574812-45575008)
chr1 (62-247)||(21342090-21342276)
chr1 (67-238)||(40389157-40389329)
chr1 (73-241)||(433012-433178)
chr1 (79-243)||(50210168-50210333)
chr1 (119-241)||(34509783-34509906)
chr1 (79-244)||(27250684-27250850)
chr1 (79-244)||(22532269-22532435)
chr1 (56-225)||(21896187-21896358)
chr1 (73-225)||(21861519-21861672)
chr1 (79-243)||(22468651-22468816)
chr1 (143-244)||(20847173-20847275)
chr1 (79-244)||(21026680-21026846)
chr1 (183-243)||(20454613-20454673)
chr1 (62-225)||(35261018-35261180)
chr1 (1-56)||(22050811-22050866)
chr1 (73-244)||(33681010-33681178)
chr1 (73-229)||(16758664-16758822)
chr1 (62-244)||(14295493-14295672)
chr1 (83-244)||(22237630-22237788)
chr1 (116-243)||(20135188-20135316)
chr1 (25-77)||(43543215-43543267)
chr1 (119-230)||(21754059-21754170)
chr1 (83-240)||(22921830-22921986)
chr1 (1-45)||(27161561-27161605)
chr1 (73-228)||(20918620-20918772)
chr1 (79-225)||(50614071-50614219)
chr1 (79-225)||(50621899-50622047)
chr1 (186-240)||(21714546-21714600)
chr1 (79-225)||(41049991-41050138)
chr1 (67-163)||(50686695-50686791)
chr1 (191-229)||(52928038-52928076)
chr1 (183-244)||(38801447-38801508)
chr1 (191-240)||(20248283-20248332)
chr1 (79-168)||(22354527-22354616)
chr1 (186-243)||(24783155-24783212)
chr1 (73-157)||(12271642-12271725)
chr1 (62-113)||(16368224-16368276)
chr1 (169-240)||(21161720-21161792)
chr1 (54-163)||(22130840-22130946)
chr1 (62-163)||(51130646-51130743)
chr1 (183-240)||(42865273-42865330)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-241)||(13392-13632)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-241)||(13947-14187)
scaffold0230 (1-32)||(23453-23484)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-241)||(40400-40640)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-242)||(10772-11013)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-242)||(9241-9482)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-241)||(4694-4934)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-237)||(501088-501324)
scaffold0001 (62-241)||(85562-85742)
scaffold0001 (73-240)||(160688-160854)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-243)||(11286-11529)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (24-243)||(12194-12413)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (61-241)||(158432-158612)
scaffold0003 (79-241)||(339905-340065)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (49-241)||(106-298)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (49-241)||(82072-82264)
scaffold0037 (73-229)||(22620-22776)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (62-246)||(9744-9929)
scaffold0145 (79-244)||(32942-33107)
scaffold0145 (79-244)||(38761-38926)
scaffold0145 (1-40)||(9932-9971)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (62-241)||(16784-16963)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (49-241)||(12064-12250)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (62-241)||(29931-30111)
scaffold0149 (1-42)||(30112-30153)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (49-238)||(1250-1440)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (62-225)||(79267-79430)
scaffold0056 (79-243)||(17170-17337)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (62-238)||(4300-4476)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (62-241)||(2111-2291)
scaffold0247 (73-244)||(17976-18148)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (74-241)||(4214-4382)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (73-225)||(20373-20524)
scaffold0031 (79-244)||(128751-128916)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-241)||(38578-38820)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (70-241)||(161080-161252)
scaffold0007 (62-162)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (79-241)||(22886-23048)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (123-241)||(44706-44825)
scaffold0122 (79-237)||(26020-26179)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (79-244)||(3106-3271)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (79-244)||(16555-16721)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (123-241)||(116430-116547)
scaffold0022 (1-77)||(53794-53872)
scaffold0022 (62-225)||(128907-129072)
scaffold0022 (62-113)||(78453-78505)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-118)||(6070-6187)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (79-244)||(4508-4673)
scaffold0228 (79-244)||(12090-12255)
scaffold0228 (79-244)||(22042-22207)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (79-244)||(13211-13377)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (79-244)||(1851-2017)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (79-244)||(51913-52079)
scaffold0011 (79-244)||(167934-168099)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (79-243)||(3141-3306)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (79-242)||(39479-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (79-242)||(75170-75333)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (79-244)||(1004-1169)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (79-244)||(4849-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (79-244)||(3470-3636)
scaffold0292 (79-244)||(343-508)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (79-244)||(32913-33077)
scaffold0120 (79-244)||(45928-46092)
scaffold0120 (80-244)||(16113-16278)
scaffold0120 (182-244)||(17388-17450)
[»] scaffold0046 (6 HSPs)
scaffold0046 (130-244)||(28414-28529)
scaffold0046 (64-244)||(11292-11470)
scaffold0046 (64-244)||(1997-2175)
scaffold0046 (191-244)||(4552-4605)
scaffold0046 (59-114)||(26013-26069)
scaffold0046 (59-114)||(16853-16909)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (79-244)||(25896-26061)
scaffold0026 (79-244)||(39858-40023)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (79-244)||(6076-6245)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (79-244)||(8488-8650)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (130-244)||(8479-8594)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (73-229)||(8481-8640)
scaffold0621 (83-244)||(6535-6695)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (79-226)||(24257-24406)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (79-179)||(3485-3585)
scaffold0327 (186-240)||(289-343)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (94-244)||(1952-2103)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (72-229)||(27697-27855)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (1-72)||(27958-28029)
scaffold0114 (145-244)||(15485-15584)
scaffold0114 (183-240)||(7295-7352)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (79-244)||(39913-40078)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (154-244)||(4712-4803)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (57-225)||(53481-53651)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (58-225)||(12587-12755)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (73-244)||(11464-11636)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (65-241)||(15664-15838)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (84-157)||(13092-13165)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (73-244)||(38205-38377)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (72-225)||(13147-13302)
scaffold0357 (72-229)||(16048-16206)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (79-244)||(32067-32230)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (73-229)||(10491-10647)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (1-77)||(35987-36064)
scaffold0100 (183-244)||(23942-24001)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (73-170)||(225482-225578)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (83-230)||(129919-130066)
scaffold0010 (79-225)||(60670-60818)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (1-77)||(1592-1668)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (5-77)||(10813-10885)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (165-225)||(11982-12042)
scaffold0503 (71-135)||(12039-12103)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (145-244)||(13497-13596)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-77)||(3187-3263)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (145-244)||(11464-11564)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (83-240)||(19268-19424)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (83-244)||(6083-6244)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (96-243)||(174767-174913)
scaffold0021 (183-244)||(121766-121827)
scaffold0021 (79-155)||(124675-124751)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (94-244)||(10395-10544)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (62-244)||(1011-1190)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (191-244)||(1102-1155)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (191-244)||(6611-6664)
scaffold0333 (191-244)||(13991-14044)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (73-240)||(45742-45909)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (191-244)||(15845-15898)
scaffold0020 (186-240)||(178898-178952)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (79-179)||(13158-13258)
scaffold0175 (188-244)||(273-329)
scaffold0175 (191-244)||(34123-34176)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (83-244)||(32538-32696)
scaffold0034 (79-225)||(51839-51985)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (83-240)||(133-290)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-77)||(646-724)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (1-77)||(4225-4303)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-77)||(1248-1326)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-77)||(6858-6936)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (1-77)||(15084-15162)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (1-77)||(15194-15272)
scaffold0106 (183-241)||(15298-15356)
scaffold0106 (183-244)||(1289-1351)
scaffold0106 (191-244)||(7266-7319)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (83-230)||(5657-5803)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (62-225)||(6220-6386)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (183-244)||(4893-4954)
scaffold0395 (79-168)||(918-1006)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (79-164)||(27911-27996)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (62-229)||(25121-25289)
scaffold0123 (62-163)||(620-720)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (83-240)||(14658-14814)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (83-170)||(8090-8176)
scaffold0556 (64-230)||(6826-6990)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (130-244)||(16282-16395)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (62-229)||(8011-8180)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (62-163)||(97089-97190)
scaffold0006 (62-163)||(106367-106468)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (191-240)||(1086-1135)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (130-244)||(20910-21026)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (123-240)||(2805-2923)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (79-221)||(38339-38483)
scaffold0139 (191-240)||(19980-20029)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (73-163)||(8008-8098)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (65-244)||(12766-12946)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (186-240)||(23843-23897)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (67-152)||(18180-18265)
scaffold0138 (83-244)||(12942-13100)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (191-240)||(2713-2762)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (191-240)||(36454-36503)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (143-225)||(1051-1134)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (83-229)||(10542-10688)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (79-225)||(267679-267826)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (119-240)||(32102-32224)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (191-241)||(5196-5246)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (94-223)||(4545-4675)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (183-244)||(51582-51644)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (79-163)||(1753-1835)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (191-244)||(46995-47048)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (192-240)||(28839-28887)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (62-163)||(88-189)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (198-244)||(1124-1170)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (139-240)||(29558-29660)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (59-112)||(57948-58002)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (94-179)||(6676-6761)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (63-114)||(10603-10655)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (63-114)||(600-652)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (1-32)||(416-447)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (186-240)||(159-213)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (186-240)||(21866-21920)
scaffold0210 (186-240)||(29758-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (186-240)||(69794-69848)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (83-163)||(2179-2257)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (183-240)||(1881-1938)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (183-240)||(10582-10639)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (183-223)||(206584-206624)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22001993 - 22001753
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001993 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 22001894  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001893 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 22001794  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001793 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1484642 - 1484402
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1484642 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 1484543  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484542 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 1484443  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484442 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 5853214 - 5853454
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5853214 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 5853313  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853314 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 5853413  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853414 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20403467 - 20403227
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20403467 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20403368  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403367 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 20403268  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403267 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4483520 - 4483281
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483520 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 4483421  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4483420 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-tta 4483322  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483321 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14409366 - 14409606
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14409366 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 14409465  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14409466 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 14409565  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409566 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 4542295 - 4542535
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542295 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 4542394  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4542395 tacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttattta 4542494  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542495 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15203153 - 15203393
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203153 atattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15203252  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203253 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 15203352  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203353 actaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 20046117 - 20046357
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20046117 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20046216  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046217 tacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 20046316  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046317 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16413238 - 16413474
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16413238 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 16413337  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16413338 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 16413437  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413438 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19896509 - 19896265
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19896509 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 19896410  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta---ttatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19896409 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgtta 19896310  T
Q  197 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896309 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 45290616 - 45290853
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45290616 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcat 45290715  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45290716 taattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttattt 45290815  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290816 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14824015 - 14823774
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14824015 atattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 14823916  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14823915 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatt 14823816  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14823815 taactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 19936925 - 19937174
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  19936925 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgc 19937024  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 197  Q
    |||   |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19937025 attgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttat 19937124  T
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19937125 ttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598188
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15070800 - 15070571
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  15070800 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgca 15070701  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15070700 tcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatt 15070601  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070600 taactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484430
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 19801370 - 19801527
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 166  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19801370 atgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg 19801469  T
Q  167 tttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801470 -ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223917
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||| |||||||||| || | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 24485966 - 24486093
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24485966 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24486065  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgaga 128  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24486066 tacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092463
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| | ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759255
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||  ||||||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 247  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32810171 - 32810054
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32810171 atattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32810072  T
Q  101 tacatgaattatatgtga 118  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  32810071 tacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 18818364 - 18818530
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818364 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18818463  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18818464 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7372931 - 7372778
Alignment:
Q  92 tatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg 190  Q
    |||| ||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  7372931 tataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 7372832  T
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7372831 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649164
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| ||||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536208
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Original strand, 26225292 - 26225409
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225292 ttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26225390  T
Q  223 aagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26225391 aagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 21918955 - 21919121
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 177  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  || || |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918955 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 21919053  T
Q  178 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21919054 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875065
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22875132  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26219834 - 26219717
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219834 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26219736  T
Q  223 aagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  26219735 aagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924049
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 194  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  195 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406379
Alignment:
Q  132 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T
Q  231 taagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||||||    
T  23406392 gaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626736
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Original strand, 13597566 - 13597720
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  13597566 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttg 13597664  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
     || ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597665 cattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879352
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855372
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Original strand, 13508034 - 13508188
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  13508034 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtg 13508132  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
     ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508133 catattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31971421 - 31971257
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31971421 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 31971324  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31971323 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6520528 - 6520368
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6520528 atataattgtatatacattacatgaattat--gttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6520432  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520431 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21285758 - 21285601
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  |    
T  21285758 atataattgtatatacattacatgaactatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 21285661  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21285660 atgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20498734 - 20498581
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||     
T  20498734 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-atttta 20498636  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
     ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498635 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 38550033 - 38550090
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550033 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131117
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32121968 - 32121734
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  ||       | ||| |||||    
T  32121968 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattg-------tttatgtgcat 32121877  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||    
T  32121876 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattt 32121777  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32121776 aactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Original strand, 5866217 - 5866395
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  5866217 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 5866312  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5866313 gatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17141094 - 17140916
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||| ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  17141094 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcat 17140999  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | ||  || | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17140998 gatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21491173 - 21490995
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || ||||  |||||||||| ||||    
T  21491173 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcat 21491078  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21491077 gatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  ||| |||| | |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116433 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 18677987 - 18678221
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  ||       | ||| |||||    
T  18677987 atattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattg-------tttatgtgcat 18678078  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||    
T  18678079 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattt 18678178  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18678179 aactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199765
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23648682 - 23648554
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 1326959 - 1327041
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttata------tgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1326959 atattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgagatgttgattattatttgatgttgttata 1327041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21249563 - 21249384
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  21249563 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 21249468  T
Q  163 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | ||  || | |||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21249467 gatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21255401 - 21255222
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  21255401 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 21255306  T
Q  163 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | ||  || | |||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21255305 gatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 17439443 - 17439544
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17439443 atttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17439541  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  17439542 atg 17439544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267031
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  17267029 atg 17267031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389571
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  228 gattaagatgatgatgt 244  Q
    | | |||||||||||||    
T  21389555 gttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396101
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21396084  T
Q  228 gattaagatgatgatgt 244  Q
    | | |||||||||||||    
T  21396085 gttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778897
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21778880  T
Q  228 gattaagatgatgatgt 244  Q
    | | |||||||||||||    
T  21778881 gttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790594
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21790577  T
Q  228 gattaagatgatgatgt 244  Q
    | | |||||||||||||    
T  21790578 gttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 23760805 - 23760962
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| |||  ||||| |||| ||||| || |||   ||||||  |    
T  23760805 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttac-atactgcct 23760901  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23760902 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 27472339 - 27472395
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472339 atattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 983347 - 983512
Alignment:
Q  66 aatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 164  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||     
T  983347 aatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatga 983444  T
Q  165 tgtt-tttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
      || |||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983445 acttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 16401952 - 16401996
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 45  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16401952 atattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttt 16401996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 20982649 - 20982710
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20982649 atattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagatgttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21673864 - 21673718
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||  |    
T  21673864 atataattgtatatacattaaataaattatat-tga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 21673768  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
     ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673767 atgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355815
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37515888 - 37515835
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37515888 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 37515835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Original strand, 14103163 - 14103215
Alignment:
Q  63 tttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14103163 tttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatat 14103215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22364826 - 22364745
Alignment:
Q  80 gtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| || | ||||||||| |||| |||||    
T  22364826 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatg 22364745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 77
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026894
Alignment:
Q  32 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttata 35026894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14949044 - 14949284
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949044 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 14949143  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949144 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 14949243  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949244 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 456561 - 456321
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  456561 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 456462  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456461 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 456362  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456361 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15376635 - 15376875
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15376635 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15376734  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376735 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 15376834  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376835 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16232760 - 16232520
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16232760 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 16232661  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232660 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 16232561  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232560 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 20385045 - 20385285
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20385045 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20385144  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385145 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 20385244  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385245 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21189517 - 21189757
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21189517 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21189616  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189617 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 21189716  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189717 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32125731 - 32125491
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32125731 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32125632  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125631 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 32125532  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125531 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41523157 - 41522917
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41523157 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 41523058  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523057 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 41522958  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522957 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41525619 - 41525379
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41525619 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 41525520  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525519 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 41525420  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525419 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 11393209 - 11393448
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11393209 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 11393308  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393309 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 11393408  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393409 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16410299 - 16410059
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16410299 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtat 16410200  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410199 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 16410100  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410099 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18640512 - 18640272
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18640512 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 18640413  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640412 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 18640313  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640312 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27217100 - 27216860
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27217100 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 27217001  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217000 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 27216901  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27216900 actaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18430952 - 18430709
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430952 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 18430853  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430852 tacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttattta 18430753  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430752 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24702478 - 24702238
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24702478 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24702379  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702378 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24702279  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702278 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11972736 - 11972496
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11972736 atattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 11972637  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972636 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 11972537  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972536 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24704925 - 24704688
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24704925 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24704826  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704825 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24704729  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704728 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16213924 - 16213684
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16213924 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcat 16213825  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16213824 tacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 16213725  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213724 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26355903 - 26356156
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26355903 atattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 26356002  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgttgtgttg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||||    
T  26356003 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttg 26356102  T
Q  188 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26356103 ttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26358355 - 26358608
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26358355 atattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 26358454  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgttgtgttg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||||    
T  26358455 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttg 26358554  T
Q  188 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26358555 ttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13869588 - 13869346
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  13869588 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgca 13869489  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  13869488 tcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatt 13869389  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869388 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116509
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 71 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3386503 - 3386333
Alignment:
Q  71 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3386503 tgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttt 3386404  T
Q  171 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386403 tgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647325
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275175
Alignment:
Q  92 tatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  192 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062077
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20110720 - 20110556
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110720 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 20110621  T
Q  167 tttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110620 tttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 38898366 - 38898535
Alignment:
Q  69 gttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898366 gttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 38898465  T
Q  168 ttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898466 ttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273392
Alignment:
Q  122 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  221 ctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 15081869 - 15082019
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15081869 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 15081968  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttga 148  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15081969 attaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  115 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564482
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698831
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 177  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  178 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13841252 - 13841157
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13841252 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456530
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 18456466  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509189
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227481
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||  |||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 38227548  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 2280068 - 2280238
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2280068 ttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttg 2280166  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280167 catactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 14269984 - 14270060
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14269984 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 14270060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26211995
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag-atgatgatgt 244  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 8468880 - 8468804
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8468880 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttata 8468804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589039
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T
Q  229 attaagatgatgatgt 244  Q
       |||||||||||||    
T  10589054 tcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144143
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 15144136  T
Q  223 aagttga 229  Q
    |||||||    
T  15144137 aagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18627806 - 18627717
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataatt 90  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18627806 atattttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 67904 - 67745
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||   ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  67904 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat--attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 67809  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67808 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11303487 - 11303411
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  11303487 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 11303411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072913
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  221 ctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34200964 - 34200786
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  34200964 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 34200869  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34200868 gatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 16108611 - 16108687
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  16108611 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttata 16108687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005650
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||| ||    
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47831968 - 47831807
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || | | | ||||||| |    
T  47831968 atataattgtatatacattatatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtct 47831871  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831870 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495402
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    || || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16495485 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| ||| |    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtct 16056392  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056391 atgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 8940414 - 8940336
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8940414 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 8940336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 38898150 - 38898228
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38898150 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 38898228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386369
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T
Q  243 gt 244  Q
    ||    
T  16386368 gt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 19486693 - 19486865
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  19486693 ttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 19486791  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  19486792 catactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 23664875 - 23664951
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  23664875 atattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 23664951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 28505357 - 28505419
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28505357 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40443555 - 40443393
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  40443555 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttact 40443459  T
Q  179 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  40443458 gcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868101
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||| | ||||| |||||||| |||| ||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatc 1868029  T
Q  161 at--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    ||  |||| |||| |||||||  | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868030 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219835
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  || ||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16219774  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16219775 atgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 222
Target Start/End: Original strand, 12255740 - 12255892
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-ctgttttt 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||| |||||  |   |||    
T  12255740 ttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgattt 12255839  T
Q  172 gtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    | ||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255840 gcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Original strand, 811091 - 811248
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  811091 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 811188  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  811189 atgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 15754828 - 15755008
Alignment:
Q  62 atttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  15754828 atttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatc 15754923  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||| || ||| | |||||   | | ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  15754924 atgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29796850 - 29796772
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  29796850 atattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 29796772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29800669 - 29800591
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  29800669 atattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 29800591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014182
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 45847683 - 45847739
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45847683 atattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220225
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 238
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154956
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Original strand, 10063772 - 10063921
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  10063772 ttataatgtgatataattgtatatg--tt---tgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtg 10063865  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
     |||| |  | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10063866 cataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932851
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  14932849 atg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356286
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  15356284 atg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360400
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  15360398 atg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996148
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 244
Target Start/End: Original strand, 27847901 - 27847951
Alignment:
Q  194 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  27847901 ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832561
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008536
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  15008534 atg 15008536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Original strand, 19649552 - 19649606
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649552 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12187076 - 12187019
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12187076 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Original strand, 17138120 - 17138177
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  17138120 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 78)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18334514 - 18334754
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334514 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 18334613  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334614 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 18334713  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334714 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24422787 - 24422547
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24422787 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24422688  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422687 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24422588  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422587 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33862034 - 33861794
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33862034 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 33861935  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861934 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 33861835  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861834 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33864518 - 33864278
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33864518 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 33864419  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864418 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 33864319  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864318 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12742554 - 12742317
Alignment:
Q  4 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12742554 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 12742455  T
Q  104 atgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742454 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 12742355  T
Q  204 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742354 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 2291102 - 2291342
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291102 atattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 2291201  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291202 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 2291301  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291302 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8055269 - 8055029
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8055269 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 8055170  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055169 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttattta 8055070  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055069 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19005286 - 19005046
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19005286 atattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 19005187  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005186 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 19005087  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005086 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 19858841 - 19859081
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19858841 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 19858940  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858941 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 19859040  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859041 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26924562 - 26924802
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924562 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 26924661  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924662 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattta 26924761  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924762 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 1540833 - 1541073
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1540833 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcat 1540932  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540933 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 1541032  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1541033 actaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22782467 - 22782227
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22782467 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 22782368  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22782367 tacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 22782268  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782267 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34963613 - 34963371
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34963613 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 34963514  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963513 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 34963414  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34963413 actaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 30676632 - 30676874
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30676632 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 30676731  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676732 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 30676831  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30676832 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595549
Alignment:
Q  27 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattga 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  127 gacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1595663 gacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 1595564  T
Q  227 tgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||    
T  1595563 tgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25656869 - 25656629
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  25656869 atattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtat 25656770  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25656769 tagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttattta 25656670  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656669 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25688742 - 25688502
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||    
T  25688742 atattgtccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtat 25688643  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25688642 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttattta 25688543  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25688542 actaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754809
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557054
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 71 - 241
Target Start/End: Original strand, 3852009 - 3852179
Alignment:
Q  71 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3852009 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttt 3852108  T
Q  171 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852109 tgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 16448513 - 16448686
Alignment:
Q  66 aatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448513 aatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 16448612  T
Q  165 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16448613 tgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  89 ttgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgc 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgc 18461932  T
Q  189 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461931 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629476
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060540
Alignment:
Q  82 gatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 180  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  181 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409947
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||| ||||  ||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593773
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  218 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287917
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 194  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  195 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361081
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496244
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303661
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  218 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  179 g-ttgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  178 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076700
Alignment:
Q  132 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  231 taagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||||||    
T  20076713 gaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Original strand, 22780199 - 22780348
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 194  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||  ||||||    
T  22780199 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgt 22780298  T
Q  195 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22780299 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 242
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848114
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||     
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtg 19848031  T
Q  161 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
     |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19848032 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 244
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638404
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T
Q  238 atgatgt 244  Q
    |||||||    
T  20638398 atgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18914067 - 18913994
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18914067 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18937321 - 18937252
Alignment:
Q  5 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937321 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20109312 - 20109140
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataat--tgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| | ||| || |||    
T  20109312 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttt 20109214  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    || ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109213 tgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12942441 - 12942365
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  12942441 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 12942365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019408
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||    
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgctt 23019470  T
Q  182 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  23019469 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 31630569 - 31630626
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630569 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15875546 - 15875470
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15875546 atattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 15875470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 28289257 - 28289333
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||    
T  28289257 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttata 28289333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333339
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394079
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 8227460 - 8227632
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  8227460 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 8227558  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  |  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  8227559 catactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Original strand, 28496414 - 28496592
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  28496414 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 28496509  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28496510 gatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Original strand, 29808825 - 29809003
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  29808825 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 29808920  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  29808921 gatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23992663 - 23992604
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat---gatgttttaagatgttgat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23992663 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1561483 - 1561303
Alignment:
Q  62 atttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  1561483 atttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatc 1561388  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||| || ||| | |||||   | | ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  1561387 atgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 244
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  197 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Original strand, 9098473 - 9098620
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt- 180  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| ||||||      
T  9098473 atataattatatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcc 9098570  T
Q  181 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098571 tttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 19847890 - 19847931
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847890 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 19847931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 17377770 - 17377814
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 45  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377770 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | ||||| | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  226 ttga 229  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992429
Alignment:
Q  132 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  231 taagatgatgat 242  Q
    ||||||| ||||    
T  23992440 taagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35245684 - 35245586
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  35245684 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 35245588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920751
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18696670 - 18696617
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18696670 atttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 18696617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652199
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831503
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23076915 - 23076862
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23076915 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 23076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  203 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 247  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 1598297 - 1598266
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598297 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 15041542 - 15041644
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||  | || | || |||||||||||||||| |||||||    
T  15041542 tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T
Q  215 gtc 217  Q
    |||    
T  15041642 gtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18907165 - 18907111
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  18907165 tgctattgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19863032 - 19862978
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863032 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19873174 - 19873120
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873174 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18706488 - 18706435
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18706488 atttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatat 18706435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 18896253 - 18896306
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18896253 atttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatat 18896306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766695
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35008333 - 35008280
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35008333 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatat 35008280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 230
Target Start/End: Original strand, 4185880 - 4185928
Alignment:
Q  183 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185880 tgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39363624 - 39363384
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363624 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 39363525  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363524 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 39363425  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363424 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 264690 - 264930
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  264690 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 264789  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264790 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 264889  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264890 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20909252 - 20909012
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909252 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 20909153  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909152 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttattta 20909053  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909052 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 42245287 - 42245527
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245287 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 42245386  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245387 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 42245486  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245487 actaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 10732865 - 10733102
Alignment:
Q  4 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10732865 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattac 10732964  T
Q  104 atgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732965 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 10733064  T
Q  204 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733065 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29346220 - 29345980
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29346220 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29346121  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29346120 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttattta 29346021  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346020 actaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29348693 - 29348453
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29348693 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29348594  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29348593 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttattta 29348494  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348493 actaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29351166 - 29350926
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29351166 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29351067  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29351066 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttattta 29350967  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350966 actaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39245376 - 39245136
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39245376 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcat 39245277  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245276 tacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 39245177  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245176 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32027633 - 32027393
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32027633 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32027534  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32027533 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttattta 32027434  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027433 actaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29330171 - 29329934
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29330171 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatg---attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29330075  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330074 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 29329975  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329974 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 20917877 - 20918110
Alignment:
Q  4 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  20917877 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttac 20917976  T
Q  104 atgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 203  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917977 ttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgact----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 20918072  T
Q  204 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918073 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38619676 - 38619434
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  38619676 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgca 38619577  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  38619576 tcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatt 38619477  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619476 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23064753 - 23064512
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  23064753 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgca 23064654  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  23064653 tcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatt 23064554  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064553 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Original strand, 11581187 - 11581361
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11581187 atgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttg 11581286  T
Q  167 tttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581287 tttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154776
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtc 2154695  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154696 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154942
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 18319020 - 18319193
Alignment:
Q  66 aatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319020 aatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 18319119  T
Q  165 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18319120 tgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902172
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 10775670 - 10775838
Alignment:
Q  74 tatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10775670 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggtttta 10775769  T
Q  173 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775770 tatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067110
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  166 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061068
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390617
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077952
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421532
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096467
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 244
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  137 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  236 tgatgatgt 244  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529223
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 217  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  218 ggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729185
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808510
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493569
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| ||||| || |||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286964
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 177  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  || | ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  178 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431395
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22412305 - 22412187
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22412305 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtc 22412207  T
Q  222 taagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22412206 taagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025311
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||  |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095495
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||  |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 22144117  T
Q  179 -gttgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
       | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075018
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag-atgatgatgt 244  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21565713 - 21565546
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  21565713 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg 21565615  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21565614 -atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 21329457 - 21329618
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||| ||| |||||| |||| | ||| || ||| | ||||||  |    
T  21329457 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcct 21329554  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329555 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 21502116 - 21502277
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  || ||| | || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  |    
T  21502116 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcct 21502213  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502214 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 17517086 - 17517320
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  || |       ||| |||||    
T  17517086 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattgtt-------tatgtgcat 17517177  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| ||||||||     
T  17517178 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatta 17517277  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17517278 aactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 186
Target Start/End: Original strand, 20766119 - 20766181
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtt 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766119 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Original strand, 20026879 - 20027043
Alignment:
Q  63 tttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20026879 tttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatca 20026976  T
Q  162 tg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||  ||||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026977 tgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293090
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 9776598 - 9776522
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  9776598 atattgtcaatgattggtgaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 9776522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012154
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcct 26012092  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26012093 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 37804825 - 37804901
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  37804825 atattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttata 37804901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806904
Alignment:
Q  182 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660956
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40726025 - 40725935
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||||    
T  40726025 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatg 40725935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Original strand, 22959495 - 22959649
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  22959495 atataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 22959589  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22959590 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 22178162 - 22178323
Alignment:
Q  67 atgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--g 163  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |    
T  22178162 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgag 22178260  T
Q  164 ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||| |||| |||||||  | ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178261 ctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314577
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 20901949 - 20901990
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901949 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 20901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723922
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgt-tg 193  Q
    |||||||| ||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  194 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  146 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19669066 - 19668898
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||| ||| | || ||| |    
T  19669066 ttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-g 19668972  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19668971 catactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704075
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973808
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Original strand, 2154558 - 2154595
Alignment:
Q  5 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154558 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 2154595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 225
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22032380 - 22032323
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  22032380 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 36314730 - 36314685
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatga 107  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36314730 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatga 36314685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21873350 - 21873254
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| |||  | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21873350 ttgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21873254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 94)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34159566 - 34159326
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159566 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 34159467  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159466 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 34159367  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159366 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 55476731 - 55476491
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476731 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 55476632  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476631 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 55476532  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476531 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16454203 - 16454443
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454203 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 16454302  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454303 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 16454402  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454403 actaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17463418 - 17463178
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17463418 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 17463319  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463318 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 17463219  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463218 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 45606829 - 45607069
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45606829 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 45606928  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606929 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 45607028  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607029 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 13154177 - 13154418
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154177 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 13154276  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154277 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13154376  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154377 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 7781269 - 7781509
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7781269 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 7781368  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781369 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 7781468  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781469 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 28848533 - 28848773
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28848533 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 28848632  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848633 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 28848732  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848733 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 6469056 - 6469296
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6469056 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 6469155  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469156 tacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 6469255  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469256 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8899334 - 8899094
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8899334 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 8899235  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899234 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 8899135  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899134 actaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10247645 - 10247885
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10247645 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 10247744  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10247745 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttattta 10247844  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247845 actaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 16282733 - 16282971
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16282733 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 16282832  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282833 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 16282932  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282933 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 9707529 - 9707769
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9707529 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 9707628  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9707629 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 9707728  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707729 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 38961813 - 38962053
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961813 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 38961912  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961913 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 38962012  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38962013 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 13151712 - 13151953
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151712 atattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 13151811  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151812 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13151911  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151912 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41124127 - 41123892
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41124127 atattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 41124028  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41124027 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttattta 41123931  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123930 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13544265 - 13544024
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13544265 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 13544166  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13544165 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattta 13544066  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13544065 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12567800 - 12567564
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12567800 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 12567701  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12567700 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattta 12567601  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567600 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446816
Alignment:
Q  38 tgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  138 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatg 17446812  T
Q  238 atga 241  Q
    ||||    
T  17446813 atga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8499760 - 8499518
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8499760 atattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgca 8499661  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    |||  |  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  8499660 ttaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatt 8499561  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499560 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15412671 - 15412429
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  15412671 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgca 15412572  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15412571 tcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatt 15412472  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412471 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172683 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242822
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672626
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119887
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27165492 - 27165250
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27165492 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgca 27165393  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttat 197  Q
     ||| | |||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||||| | | |||||| |||||||    
T  27165392 atacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttat 27165294  T
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165293 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550644
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977515
Alignment:
Q  110 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  210 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 53301426 - 53301669
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |    
T  53301426 atattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgta 53301525  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgtta 196  Q
     ||| |||||||||| |||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  53301526 atacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgtta 53301624  T
Q  197 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301625 tttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 130 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500942
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  230 ttaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||    
T  55500953 ttaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972854
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213838
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| || |||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487856
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499338
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36166715 - 36166598
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166715 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 36166617  T
Q  223 aagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36166616 aagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21618566 - 21618449
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618566 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 21618468  T
Q  223 aagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  21618467 aagttgattgagaagatga 21618449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476506
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  179 -gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43841098 - 43840932
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841098 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 43840999  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  43840998 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42386576 - 42386428
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42386576 tgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatact 42386477  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386476 gcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556985
Alignment:
Q  138 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  238 atga 241  Q
    ||||    
T  10556988 atga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438534
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  229 attaagatgatgatgt 244  Q
    || |||||||||||||    
T  18438549 atgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442274
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 20698391 - 20698556
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20698391 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatact 20698489  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20698490 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083482
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||  ||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26687053 - 26686887
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||   ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687053 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26686954  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26686953 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 116 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12399338 - 12399209
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399338 tgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 12399239  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12399238 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  142 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153326
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||  |||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 24153262  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
       | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  143 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17737238  T
Q  240 ga 241  Q
    ||    
T  17737237 ga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 24340672 - 24340844
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  24340672 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtg 24340770  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  24340771 catactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424880
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14572717 - 14572603
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572717 tgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14572619  T
Q  215 gtcggtctaagttgat 230  Q
    ||||||||||||||||    
T  14572618 gtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 52523676 - 52523831
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||    
T  52523676 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactg-ttt 52523774  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523775 tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15977773 - 15977697
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15977773 atattgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttata 15977697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 54521062 - 54520986
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  54521062 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 54520986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23274859 - 23274705
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  23274859 ttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttg 23274761  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
     ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274760 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 29544764 - 29544839
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttat 76  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  29544764 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470927
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 15470988  T
Q  182 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15470987 atgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46822501 - 46822267
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  ||       | ||| |||||    
T  46822501 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattg-------tttatgtgcat 46822410  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||    
T  46822409 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattt 46822310  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46822309 aactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14234648 - 14234487
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  14234648 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 14234551  T
Q  182 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14234550 atgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Original strand, 2051148 - 2051238
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2051148 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 12305385 - 12305327
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 59  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305385 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 12305327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16097499 - 16097332
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||| || ||| |    
T  16097499 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-g 16097402  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||| ||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16097401 catattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 37642214 - 37642386
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  37642214 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 37642312  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  37642313 catactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  188 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 11913972 - 11914050
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11913972 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 11914050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 13210280 - 13210448
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || || ||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  13210280 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-g 13210374  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13210375 catactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194693
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 10557148 - 10557091
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557148 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16103950 - 16103784
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  16103950 ttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 16103854  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16103853 catactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 170
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 240
Target Start/End: Original strand, 12174212 - 12174376
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||  ||||||   ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  12174212 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 12174306  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12174307 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 125
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattg 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251270
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37251202  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  ||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251203 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307691
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  217 cggtctaagttgat 230  Q
    ||||||||||||||    
T  32307704 cggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925977
Alignment:
Q  81 tgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtact 43926026  T
Q  179 g-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926025 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029841
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| | || |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  30029869 gtcagtctaagttgaatgagatgttgatg 30029841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Original strand, 49668135 - 49668193
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  49668135 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511059
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  229 attaagatgatgat 242  Q
    ||||||||| ||||    
T  12511072 attaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665398
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 22110307 - 22110454
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||    |||||| | |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  22110307 tgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatga--tgttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 22110403  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110404 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 17444738 - 17444773
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444738 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9512982 - 9512924
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9512982 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9520957 - 9520899
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9520957 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 856197 - 856140
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  856197 tgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668554
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977667
Alignment:
Q  32 tatatatgatgttttaagatgttgattattattt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattattt 15977667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077594
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 23318653 - 23318706
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23318653 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 23318706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Original strand, 15878114 - 15878168
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878114 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 240
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  192 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23131102 - 23130862
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131102 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 23131003  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131002 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23130903  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130902 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23133569 - 23133329
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133569 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 23133470  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133469 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23133370  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133369 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 34402444 - 34402684
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402444 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 34402543  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402544 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 34402643  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402644 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18809183 - 18808943
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18809183 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 18809084  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809083 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 18808984  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808983 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 23709454 - 23709694
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23709454 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 23709553  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709554 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23709653  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709654 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 23711935 - 23712175
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23711935 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 23712034  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712035 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23712134  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712135 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39682553 - 39682313
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39682553 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 39682454  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682453 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 39682354  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682353 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24898117 - 24898358
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898117 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24898216  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898217 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24898316  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898317 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24900600 - 24900841
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900600 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24900699  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900700 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24900799  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900800 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24903077 - 24903318
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903077 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24903176  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903177 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24903276  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903277 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24905554 - 24905795
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905554 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24905653  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905654 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24905753  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905754 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24908029 - 24908270
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908029 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24908128  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908129 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24908228  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908229 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6726235 - 6725995
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6726235 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 6726136  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726135 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 6726036  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726035 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 21154982 - 21155219
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21154982 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21155081  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155082 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 21155181  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155182 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 571637 - 571397
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  571637 atattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 571538  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571537 tacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 571438  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571437 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23135830 - 23135590
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23135830 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 23135731  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135730 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23135631  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135630 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26505619 - 26505379
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505619 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 26505520  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26505519 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 26505420  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505419 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26508097 - 26507857
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508097 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 26507998  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26507997 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 26507898  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507897 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28577339 - 28577099
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28577339 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 28577240  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28577239 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttattta 28577140  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577139 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24368014 - 24367774
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24368014 atattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24367915  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367914 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24367815  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24367814 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 32039420 - 32039660
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32039420 atattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32039519  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32039520 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttattta 32039619  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32039620 actaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 32214843 - 32215085
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32214843 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 32214942  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32214943 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttattta 32215042  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32215043 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22105653 - 22105412
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22105653 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 22105554  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  22105553 tacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttattt 22105454  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105453 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45030016
Alignment:
Q  9 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaa 45029883  T
Q  109 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45029884 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagct 45029983  T
Q  209 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029984 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38967614 - 38967374
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38967614 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcat 38967516  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38967515 taattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttattt 38967416  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967415 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43137469 - 43137301
Alignment:
Q  71 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43137469 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 43137370  T
Q  171 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 239  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137369 tgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529691
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtc 24529610  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529611 atgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 24642776 - 24642933
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24642776 atattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 24642875  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642876 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337115
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060513
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076442
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731355
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19672007 - 19671830
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  19672007 atgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 19671909  T
Q  167 tttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||| ||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  19671908 -ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738300
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285865
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298933
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  179 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  163 gctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660023
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38235
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654507
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 23708568 - 23708738
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |    
T  23708568 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-g 23708666  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23708667 catactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20261459 - 20261383
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  20261459 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 20261383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25616421 - 25616192
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  ||||       ||| |||||    
T  25616421 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattgat-------tatgtgcat 25616330  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||| ||||    
T  25616329 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaattt 25616230  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25616229 aactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 7670 - 7835
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  7670 atttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 7769  T
Q  161 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7770 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 244
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103516
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatga 23103486  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||    
T  23103487 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040310
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 118
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtga 118  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 23707244 - 23707322
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23707244 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 23707322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24918275 - 24918197
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24918275 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 24918197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28406137 - 28405981
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||   ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  28406137 atataattgtatatacattttatgaattaa--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcct 28406040  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 239  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28406039 atgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8946718 - 8946657
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8946718 tgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679589
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20309221 - 20309108
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20309221 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 20309125  T
Q  228 gattaagatgatgatgt 244  Q
    | | |||||||||||||    
T  20309124 gttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791357
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  23791359 atg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207296
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aat-gttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatc 23207364  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  ||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207363 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 10684685 - 10684763
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  10684685 atattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 10684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24671160 - 24671082
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  24671160 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 24671082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697644
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaa-gtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  24697642 atg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Original strand, 23071892 - 23072070
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||| ||| ||  ||| ||||||||||| ||||    
T  23071892 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgctgatttatattcgatattattatatcat 23071987  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  23071988 gatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134326
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175854
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 20520148 - 20520295
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  20520148 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 20520244  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520245 ctgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24681579 - 24681501
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  24681579 atattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttata 24681501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Original strand, 32451894 - 32452031
Alignment:
Q  90 tgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttg 187  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||  | |||||    
T  32451894 tgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttg 32451992  T
Q  188 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451993 ctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 24529469 - 24529510
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529469 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatg 24529510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 151
Target Start/End: Original strand, 22413073 - 22413161
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatat 151  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22413073 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatat 22413161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 25109052 - 25109019
Alignment:
Q  81 tgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25109052 tgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 25109019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23004905 - 23004838
Alignment:
Q  89 ttgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23004905 ttgtatatgcattatgtggattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 23004838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcatta 102  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20987 - 20747
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20987 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20888  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20887 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 20788  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20787 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38061 - 37821
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38061 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 37962  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37961 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 37862  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37861 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 136920 - 136680
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136920 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 136821  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136820 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 136721  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136720 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 139389 - 139149
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139389 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 139290  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139289 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 139190  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139189 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 144327 - 144087
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144327 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 144228  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144227 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 144128  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144127 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 134451 - 134211
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134451 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 134352  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134351 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 134252  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134251 actaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 141858 - 141618
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141858 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 141759  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141758 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 141659  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141658 actaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132662
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  217 cggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  132685 cggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 62355 - 62216
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||   |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||  |    
T  62355 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcct 62262  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62261 atgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 94651 - 94411
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  94651 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 94552  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94551 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 94452  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94451 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 17362 - 17598
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17362 atattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcat 17461  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17462 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttattta 17561  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17562 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  82 gatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt 180  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  181 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100378
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119875
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40291
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||  |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  182 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101503
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38596
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15118274 - 15118514
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15118274 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15118373  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118374 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 15118473  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118474 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44615528 - 44615288
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615528 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 44615429  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615428 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 44615329  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615328 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 12229 - 12469
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12229 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 12328  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12329 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 12428  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12429 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18239341 - 18239581
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18239341 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 18239440  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18239441 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttattta 18239540  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239541 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 50222261 - 50222501
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222261 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcat 50222360  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50222361 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttattta 50222460  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222461 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52312750 - 52312510
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52312750 atattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 52312651  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312650 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 52312551  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312550 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18215196 - 18215436
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18215196 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 18215295  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18215296 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 18215395  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215396 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 1837431 - 1837671
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1837431 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcat 1837530  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837531 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 1837630  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837631 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 44773005 - 44773249
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat----gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44773005 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 44773104  T
Q  97 gcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 196  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773105 gcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 44773204  T
Q  197 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773205 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19618094 - 19618336
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19618094 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 19618193  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19618194 tacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 19618293  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19618294 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15355246 - 15355483
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15355246 atattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15355345  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15355346 taattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttattt 15355445  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355446 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3515247 - 3515007
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3515247 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 3515148  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3515147 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtttttta 3515048  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515047 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19242940 - 19242693
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  19242940 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgca 19242841  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19242840 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttattt 19242741  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19242740 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 14970629 - 14970871
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  14970629 atattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtat 14970728  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  14970729 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttattta 14970828  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14970829 actaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803427
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464030
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 7641139 - 7641344
Alignment:
Q  26 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattg 125  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7641139 tatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattg 7641238  T
Q  126 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641239 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt----------ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7641328  T
Q  226 ttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||    
T  7641329 ttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102214
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610950
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttt-------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 241
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929042
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367690
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402703
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371202
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373483
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370018
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16223710 - 16223532
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16223710 atgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgct 16223611  T
Q  166 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  16223610 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149832
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  166 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Original strand, 54798753 - 54798872
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54798753 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtc 54798852  T
Q  222 taagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  54798853 taagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280316
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  223 aagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088877
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7798940 - 7798774
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798940 tgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7798841  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7798840 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038653
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| |||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 239  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377639
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893703
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902757
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873488
Alignment:
Q  132 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  231 taagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||||||    
T  52873475 gaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Original strand, 8574868 - 8574985
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574868 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8574966  T
Q  223 aagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  8574967 aagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22354016 - 22353835
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  22354016 atttattgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtca 22353917  T
Q  162 tgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    || ||||  |  |  |||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  22353916 tgttgttgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270356
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052829
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899891
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 52873100 - 52873177
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatac 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52873100 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatac 52873177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 15496993 - 15497069
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15496993 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 15497069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 244
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240090
Alignment:
Q  81 tgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 179  Q
    |||||||||  ||| |||||||| | || ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  180 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     | | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 13783 - 13953
Alignment:
Q  57 ttattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 155  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  13783 ttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtt 13882  T
Q  156 atgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883 atatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 43198502 - 43198661
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-ctgttttt 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||  |  ||||    
T  43198502 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgtttt 43198601  T
Q  172 gtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    | ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198602 gcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 52243143 - 52243302
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  52243143 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-att 52243241  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    || ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243242 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 237
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374473
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  159 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15534421 - 15534345
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  15534421 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 15534345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 36038110 - 36038034
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  36038110 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 36038034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 49547696 - 49547772
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  49547696 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttata 49547772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 362325 - 362268
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362325 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14048817 - 14048741
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  14048817 atattgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 14048741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706409
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 14746539 - 14746617
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14746539 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 14746617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 170
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  81 tgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 46640411 - 46640558
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    |||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||    
T  46640411 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatata 46640507  T
Q  177 ctgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640508 ctgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15551985 - 15551817
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  15551985 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggatt-g 15551891  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15551890 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 12288147 - 12288316
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  12288147 atttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 12288244  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |||  ||| ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288245 atgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082254
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 53082186  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082187 atgaactg-ttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774011
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  217 cggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857608
Alignment:
Q  26 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 19857608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053422
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || || || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046487
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8846543 - 8846465
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 152  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8846543 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 8846465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || |||  | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846360
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 20157522 - 20157579
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20157522 tgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17333338 - 17333298
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333338 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13989106 - 13988866
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13989106 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 13989007  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989006 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13988907  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988906 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21923213 - 21923453
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21923213 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21923312  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923313 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 21923412  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923413 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21475009 - 21475249
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21475009 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21475108  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475109 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 21475208  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21475209 actaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29776928 - 29776688
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29776928 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29776829  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776828 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 29776729  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776728 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29298376 - 29298137
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29298376 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcat 29298277  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298276 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 29298178  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298177 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31612553 - 31612313
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31612553 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 31612454  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31612453 tacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattta 31612354  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612353 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 23593656 - 23593897
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23593656 atattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgca 23593755  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593756 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23593855  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593856 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21841007 - 21840766
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21841007 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 21840908  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21840907 tacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 21840808  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21840807 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22122989 - 22123230
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22122989 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 22123088  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgttattt 199  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22123089 tacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctattt 22123188  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22123189 aactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16362158 - 16361915
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  16362158 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgca 16362059  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16362058 ttacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttattt 16361959  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16361958 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16275285 - 16275526
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16275285 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcat 16275384  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||    
T  16275385 taattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttattt 16275484  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275485 aactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 15859930 - 15860177
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15859930 atattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcat 15860029  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |   |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15860030 tgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttattt 15860129  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15860130 aactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213027
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707167
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711709
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346961
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45575008
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342090
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 247  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389157
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  166 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 433178 - 433012
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  433178 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttg 433079  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433078 tatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210333
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509783
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 217  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  218 ggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250850
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532269
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   |||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 225
Target Start/End: Original strand, 21896187 - 21896358
Alignment:
Q  56 attattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 154  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  21896187 attatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgt 21896286  T
Q  155 tatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896287 tatatcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 21861519 - 21861672
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21861519 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttg 21861617  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
     ||||||  | |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861618 catactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468816
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||  |||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 244
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  143 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  242 tgt 244  Q
    |||    
T  20847273 tgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026680
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454673
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 22050811 - 22050866
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050811 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33681178 - 33681010
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  33681178 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 33681081  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33681080 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtt 16758725  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    || ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758724 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295672
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    || || ||| | |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  14295589 tgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237630
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||| ||  |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcataatgcct 22237691  T
Q  182 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135188
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | || |||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543215
Alignment:
Q  25 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 43543215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754059
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  217 cggtctaagttgat 230  Q
    ||||||||||||||    
T  21754072 cggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Original strand, 22921830 - 22921986
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  22921830 atataattgtatatacattatatgaatttt--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 22921926  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  22921927 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 27161561 - 27161605
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161561 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20918772 - 20918620
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  20918772 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 20918678  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
     ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918677 catactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 50614071 - 50614219
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  50614071 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 50614168  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614169 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 50621899 - 50622047
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  50621899 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 50621996  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621997 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714546
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 41049991 - 41050138
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||   | |||| |||||    
T  41049991 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatac 41050088  T
Q  178 tg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||  | |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050089 tgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50686791 - 50686695
Alignment:
Q  67 atgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  50686791 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 38801447 - 38801508
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  38801447 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248283
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 168  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783212
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| | | ||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Original strand, 16368224 - 16368276
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattata 113  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16368224 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161720
Alignment:
Q  169 tttgtatactgttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 22130840 - 22130946
Alignment:
Q  54 tgattattatttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 152  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||    
T  22130840 tgattatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatatt 22130935  T
Q  153 attatgtcatg 163  Q
    ||||| |||||    
T  22130936 attatatcatg 22130946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51130743 - 51130646
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  51130743 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 51130648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Original strand, 42865273 - 42865330
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  42865273 tgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13632 - 13392
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13632 atattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 13533  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13532 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13433  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13432 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14187 - 13947
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14187 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 14088  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13988  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13987 tctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 23453 - 23484
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23453 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40640 - 40400
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40640 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 40541  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40540 tacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 40441  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40440 actaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11013 - 10772
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11013 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 10914  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10913 tacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 10814  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10813 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9482 - 9241
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9482 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 9383  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382 tacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttattta 9283  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9282 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4934 - 4694
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4934 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 4835  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4834 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 4735  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4734 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 501324 - 501088
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  501324 atattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 501225  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  501224 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattta 501125  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501124 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85742
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 160854 - 160688
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||| || |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| |    
T  160854 ttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-g 160758  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  160757 catactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11529 - 11286
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11529 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgca 11430  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11429 ttacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 11330  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11329 aactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 243
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12413
Alignment:
Q  24 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  124 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T
Q  224 agttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  12394 agttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Original strand, 158432 - 158612
Alignment:
Q  61 tatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158432 tatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 158531  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158532 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340065
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 106
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82072
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 22620 - 22776
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  22620 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 22717  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22718 catactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9744
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 9830  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcc 246  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9829 attctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32942
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38761
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 38828  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 9971 - 9932
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 40  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9971 atattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16784
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12064
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29931
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt-gattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaagatgatga 29931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 30153 - 30112
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 30112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1440
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 147  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  148 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17337
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt--gtata 176  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  177 ctgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4300
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 238  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2291
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 17976 - 18148
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  17976 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtg 18074  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  18075 cataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4382 - 4214
Alignment:
Q  74 tatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4382 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttg 4283  T
Q  173 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4282 tatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 20373 - 20524
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20373 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttg 20471  T
Q  173 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20472 tatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128751
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 38578 - 38820
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  38578 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgca 38677  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttat 197  Q
     ||| |||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||||    
T  38678 atacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttat 38776  T
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38777 ttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 161080 - 161252
Alignment:
Q  70 ttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  161080 ttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtt 161179  T
Q  169 tttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  161180 tttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  161 at 162  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22886
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Original strand, 44706 - 44825
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44706 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 44805  T
Q  222 taagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44806 taagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 237
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3271
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 3204  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16721
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 116547 - 116430
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116547 ttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 116449  T
Q  223 aagttgattaagatgatga 241  Q
    |||||||||||||||||||    
T  116448 aagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 53794 - 53872
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  53794 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttata 53872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129072
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  161 atg-ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  |  |||| | |||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129006 atgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 78505 - 78453
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattata 113  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  78505 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6187 - 6070
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  6187 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcat 6088  T
Q  101 tacatgaattatatgtga 118  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  6087 tacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4508
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12090
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22042
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13211
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1851
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 52079 - 51913
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52079 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 51980  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51979 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 167934 - 168099
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  167934 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 168032  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  168033 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3306
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39479
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75333
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 242  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 1004 - 1169
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1004 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 1102  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1103 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4849
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3470
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 343
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33077
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||  ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45928
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||  ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16113
Alignment:
Q  80 gtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 179  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  180 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 244
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17450
Alignment:
Q  182 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 6)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28414
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  229 attaagatgatgatgt 244  Q
    || |||||||||||||    
T  28429 atgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11470 - 11292
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  11470 ttaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 11375  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11374 gatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2175 - 1997
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  2175 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 2080  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    | || ||| | ||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2079 gatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 114
Target Start/End: Original strand, 26013 - 26069
Alignment:
Q  59 attatttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26013 attatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 26069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 114
Target Start/End: Original strand, 16853 - 16909
Alignment:
Q  59 attatttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16853 attagttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 16909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25896
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatact 25963  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39858
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatact 39925  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6245
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  179 g----ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
         |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8650
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8488 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atact 8586  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8587 gcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8479
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8594 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 8495  T
Q  229 attaagatgatgatgt 244  Q
    || |||||||||||||    
T  8494 atgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8640 - 8481
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataat--tgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8640 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8541  T
Q  171 tgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540 -gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6535
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 177  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  178 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 179
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3585
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  179 g 179  Q
    |    
T  3585 g 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 289
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  343 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1952
Alignment:
Q  94 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 192  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  | ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  193 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 27697 - 27855
Alignment:
Q  72 gttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  27697 gttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctg-tttt 27795  T
Q  172 gtatact-gttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    | |||||   | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27796 gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 28029 - 27958
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttg 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28029 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15584
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7295
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  7352 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39913
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4712
Alignment:
Q  154 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 53481 - 53651
Alignment:
Q  57 ttattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 155  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  53481 ttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtt 53580  T
Q  156 atgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53581 atatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12755 - 12587
Alignment:
Q  58 tattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 156  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  12755 tattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 12657  T
Q  157 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    | |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12656 tatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11636 - 11464
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  11636 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 11538  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  11537 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15838 - 15664
Alignment:
Q  65 taatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  15838 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatg 15743  T
Q  164 ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
     ||  |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742 atg-gtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  84 tataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Original strand, 38205 - 38377
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  38205 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 38303  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  38304 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13302 - 13147
Alignment:
Q  72 gttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  13302 gttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttt 13204  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13203 tgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 16048 - 16206
Alignment:
Q  72 gttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  16048 gttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttg-tttt 16146  T
Q  172 gtatact-gttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    | |||||   | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16147 gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32230 - 32067
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||||    
T  32230 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttact 32134  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32133 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 10491 - 10647
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  10491 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttg 10588  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10589 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 35987 - 36064
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  35987 atattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttgatgttcttata 36064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 23942 - 24001
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23942 tgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 225578 - 225482
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  225578 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  182 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 60670 - 60818
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||    
T  60670 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctg-ttttgtata 60767  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60768 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1668 - 1592
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  1668 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 1592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 10813 - 10885
Alignment:
Q  5 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10813 tgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttgagtattatttgatgttgttata 10885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  165 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12103 - 12039
Alignment:
Q  71 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12103 tgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13497
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatg 13498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 3263 - 3187
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  3263 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 3187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11564
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatg 11563  T
Q  244 t 244  Q
    |    
T  11564 t 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19268
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 6083 - 6244
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6083 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6180  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6181 atgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174767
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-g 193  Q
    |||||||| ||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  194 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121766
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 155  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Original strand, 10395 - 10544
Alignment:
Q  94 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 192  Q
    |||||||||| ||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10395 tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 10491  T
Q  193 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10492 tgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1190
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    || || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1107 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1155
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6611
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13991
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 240
Target Start/End: Original strand, 45742 - 45909
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  45742 ttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-g 45839  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||||  | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45840 catactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15898
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178898
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13258 - 13158
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13258 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13159  T
Q  179 g 179  Q
    |    
T  13158 g 13158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  188 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34123
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32696 - 32538
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  |    
T  32696 atatagttgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 32600  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32599 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 51839 - 51985
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51839 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgc 51936  T
Q  178 tg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||  | || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51937 tgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 133
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||  |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 193  T
Q  182 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 724 - 646
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  724 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 4225 - 4303
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4225 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 4303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 1248 - 1326
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1248 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 1326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 6858 - 6936
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6858 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttata 6936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15162 - 15084
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15162 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 15084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 15194 - 15272
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15194 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 15272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 241
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15356
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1351 - 1289
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1351 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7266
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6386
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  161 at--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||  |||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6319 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4954
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 168  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 164  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatca 25192  T
Q  162 t--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |  |||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 620
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 623  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  622 atg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 240
Target Start/End: Original strand, 14658 - 14814
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||  |    
T  14658 atataatagtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcct 14754  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14755 atgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6990 - 6826
Alignment:
Q  64 ttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||    
T  6990 ttaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcat 6895  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6894 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16282
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16299  T
Q  228 gattaagatgatgatgt 244  Q
    | | |||||||||||||    
T  16298 gttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8180
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||| ||    
T  8011 atttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatg--ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatc 8108  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |||  ||| ||| ||||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8109 atgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97089
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  97091 atg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106367
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  106369 atg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1086
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21026 - 20910
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  21026 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtc 20927  T
Q  228 gattaagatgatgatgt 244  Q
    | | |||||| ||||||    
T  20926 gttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2923
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  221 ctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||| |||| | |||||||    
T  2904 ctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| |||| ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatata 38386  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 221  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Original strand, 8008 - 8098
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  8008 ttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12946 - 12766
Alignment:
Q  65 taatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  12946 taatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 12848  T
Q  164 ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     || ||| | ||| ||  | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12847 atgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23843
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 18180 - 18265
Alignment:
Q  67 atgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 152  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18180 atgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13100 - 12942
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||  |    
T  13100 atataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcct 13003  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
     ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13002 atgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2762
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  143 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10688 - 10542
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  10688 atataattgtatatacattacatgaattatgttcga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 10591  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10590 atgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 267826 - 267679
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||    
T  267826 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatata 267730  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267729 ctgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32102
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  217 cggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  32125 cggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5246
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  94 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 192  Q
    |||||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||  | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  193 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51644 - 51582
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  51644 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 1753 - 1835
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  1753 tgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 1835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47048 - 46995
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47048 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 240
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28887
Alignment:
Q  192 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 88
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  189 atttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatc 91  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  90 atg 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 244
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1170
Alignment:
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1124 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29558
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  29560 atg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 58002 - 57948
Alignment:
Q  59 attatttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattat 112  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  58002 attatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattat 57948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6676
Alignment:
Q  94 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 179  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactg 6676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10655 - 10603
Alignment:
Q  63 tttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10655 tttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatat 10603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Original strand, 600 - 652
Alignment:
Q  63 tttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  600 tttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatat 652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 447 - 416
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  447 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 159
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  213 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Original strand, 21866 - 21920
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  21866 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Original strand, 29758 - 29812
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29758 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 69848 - 69794
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69848 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 2179 - 2257
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  |   ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2179 atataattgtatatacattatatgaattat--gctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1938 - 1881
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  1938 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Original strand, 10582 - 10639
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10582 tgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 206584 - 206624
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206584 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University