View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12751_high_1 (Length: 1155)

Name: NF12751_high_1
Description: NF12751
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12751_high_1
NF12751_high_1
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (19-1139)||(41764572-41765701)
chr7 (291-674)||(29173540-29173922)
chr7 (290-683)||(48928057-48928466)
chr7 (308-683)||(31520519-31520893)
chr7 (319-672)||(26980325-26980678)
chr7 (319-651)||(32592996-32593326)
chr7 (290-701)||(12390409-12390818)
chr7 (312-704)||(18797299-18797706)
chr7 (315-701)||(30055499-30055903)
chr7 (290-699)||(5657240-5657667)
chr7 (319-701)||(9355615-9356014)
chr7 (819-1139)||(41757298-41757618)
chr7 (323-701)||(32820846-32821241)
chr7 (312-699)||(4582894-4583298)
chr7 (286-698)||(24211717-24212147)
chr7 (319-662)||(35353120-35353480)
chr7 (319-700)||(31578853-31579256)
chr7 (319-683)||(37347013-37347393)
chr7 (319-699)||(8861260-8861657)
chr7 (319-700)||(21991610-21991999)
chr7 (315-699)||(37109847-37110250)
chr7 (360-673)||(12165753-12166074)
chr7 (315-702)||(17842369-17842775)
chr7 (319-699)||(15612548-15612944)
chr7 (315-699)||(27283719-27284122)
chr7 (319-699)||(6546494-6546891)
chr7 (315-683)||(7334785-7335169)
chr7 (321-699)||(10359005-10359400)
chr7 (323-683)||(22687230-22687599)
chr7 (312-683)||(23111181-23111571)
chr7 (319-700)||(32432431-32432824)
chr7 (315-515)||(37703283-37703483)
chr7 (435-704)||(48928469-48928754)
chr7 (312-619)||(10481660-10481984)
chr7 (336-617)||(11071263-11071558)
chr7 (323-683)||(25691337-25691715)
chr7 (319-515)||(46480918-46481114)
chr7 (321-499)||(44411331-44411509)
chr7 (401-700)||(43686015-43686330)
chr7 (319-581)||(15672548-15672830)
chr7 (424-683)||(38258536-38258812)
chr7 (385-683)||(33688117-33688431)
chr7 (319-515)||(26587881-26588069)
chr7 (315-486)||(37704387-37704558)
chr7 (401-620)||(38053540-38053751)
chr7 (327-599)||(43925177-43925459)
chr7 (323-603)||(44598737-44599034)
chr7 (506-697)||(27421373-27421563)
chr7 (321-475)||(34361967-34362123)
chr7 (550-703)||(26524364-26524517)
chr7 (505-697)||(44413371-44413564)
chr7 (505-590)||(37704241-37704326)
chr7 (290-403)||(38258867-38258980)
chr7 (569-699)||(34362205-34362334)
chr7 (40-146)||(41756651-41756757)
chr7 (461-515)||(37704333-37704387)
chr7 (505-555)||(26588076-26588126)
chr7 (384-447)||(27421219-27421282)
chr7 (635-697)||(8299192-8299254)
chr7 (560-602)||(34362149-34362191)
chr7 (506-566)||(46481122-46481182)
chr7 (654-705)||(40381934-40381985)
chr7 (654-683)||(3953747-3953776)
chr7 (654-683)||(23402374-23402403)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (319-683)||(14758053-14758425)
chr1 (308-701)||(15168083-15168500)
chr1 (323-701)||(11742155-11742532)
chr1 (323-700)||(2959743-2960137)
chr1 (336-701)||(16415639-16416022)
chr1 (323-683)||(47279201-47279578)
chr1 (319-683)||(31621331-31621717)
chr1 (310-667)||(40884841-40885216)
chr1 (289-701)||(34012135-34012559)
chr1 (323-683)||(4330291-4330670)
chr1 (283-697)||(15752027-15752458)
chr1 (324-621)||(27227273-27227587)
chr1 (291-662)||(32216088-32216476)
chr1 (286-683)||(27532732-27533144)
chr1 (319-699)||(38823210-38823607)
chr1 (315-701)||(15382927-15383331)
chr1 (319-683)||(27266984-27267361)
chr1 (312-680)||(10922742-10923127)
chr1 (289-700)||(19899521-19899950)
chr1 (323-697)||(33725398-33725778)
chr1 (323-683)||(7078850-7079238)
chr1 (315-683)||(37451298-37451682)
chr1 (312-703)||(8222123-8222528)
chr1 (318-680)||(9902836-9903215)
chr1 (315-701)||(32267028-32267431)
chr1 (321-700)||(10181792-10182189)
chr1 (323-697)||(238300-238690)
chr1 (315-683)||(28564562-28564945)
chr1 (319-700)||(30254419-30254816)
chr1 (330-617)||(25160710-25161015)
chr1 (323-631)||(27563692-27564017)
chr1 (328-699)||(3309144-3309538)
chr1 (323-701)||(3534926-3535312)
chr1 (319-683)||(47682277-47682657)
chr1 (288-660)||(46931446-46931834)
chr1 (312-699)||(42721035-42721435)
chr1 (359-699)||(30326775-30327132)
chr1 (315-670)||(51128884-51129254)
chr1 (315-683)||(23999359-23999745)
chr1 (315-701)||(39393377-39393781)
chr1 (315-697)||(28769651-28770050)
chr1 (377-700)||(18422646-18422986)
chr1 (315-599)||(27763089-27763391)
chr1 (319-701)||(1547281-1547664)
chr1 (336-697)||(41926161-41926532)
chr1 (323-515)||(48353740-48353931)
chr1 (364-701)||(37618729-37619078)
chr1 (288-599)||(22170807-22171135)
chr1 (341-515)||(1359740-1359914)
chr1 (440-701)||(48620631-48620900)
chr1 (308-498)||(21289817-21290004)
chr1 (319-477)||(31962851-31963010)
chr1 (551-699)||(21289661-21289816)
chr1 (398-515)||(38759730-38759847)
chr1 (1065-1139)||(26973161-26973235)
chr1 (319-379)||(48620922-48620982)
chr1 (63-145)||(26973807-26973889)
chr1 (653-701)||(4150489-4150537)
chr1 (319-355)||(38759847-38759883)
chr1 (654-699)||(43579242-43579287)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (319-683)||(11357169-11357534)
chr3 (325-704)||(22450954-22451350)
chr3 (290-701)||(33378544-33378969)
chr3 (308-701)||(48354930-48355340)
chr3 (312-683)||(43975673-43976054)
chr3 (319-683)||(52040710-52041092)
chr3 (315-688)||(40935993-40936365)
chr3 (314-697)||(46297545-46297945)
chr3 (291-700)||(26941020-26941446)
chr3 (319-699)||(4015451-4015847)
chr3 (315-676)||(44186301-44186663)
chr3 (319-699)||(37203058-37203456)
chr3 (323-683)||(53228944-53229322)
chr3 (319-700)||(40552047-40552445)
chr3 (319-702)||(39282641-39283040)
chr3 (319-699)||(37157699-37158096)
chr3 (315-651)||(42505859-42506212)
chr3 (319-702)||(21193594-21193995)
chr3 (323-683)||(29099362-29099730)
chr3 (319-651)||(2007972-2008327)
chr3 (359-701)||(34132924-34133283)
chr3 (315-667)||(3362276-3362647)
chr3 (282-652)||(21009552-21009940)
chr3 (323-700)||(7327274-7327669)
chr3 (321-701)||(4761438-4761838)
chr3 (312-641)||(24707896-24708242)
chr3 (319-683)||(22445853-22446234)
chr3 (315-683)||(25579746-25580131)
chr3 (319-683)||(44891514-44891885)
chr3 (319-578)||(33698265-33698541)
chr3 (315-701)||(47481511-47481915)
chr3 (323-576)||(22622510-22622780)
chr3 (323-683)||(32373479-32373853)
chr3 (312-700)||(3654980-3655388)
chr3 (319-640)||(14586468-14586796)
chr3 (315-675)||(54505823-54506200)
chr3 (319-515)||(1089886-1090081)
chr3 (360-599)||(46994490-46994746)
chr3 (319-700)||(11466814-11467198)
chr3 (315-683)||(24488745-24489131)
chr3 (319-596)||(29163912-29164190)
chr3 (315-515)||(27480142-27480350)
chr3 (505-683)||(27480370-27480548)
chr3 (392-677)||(45174516-45174821)
chr3 (359-602)||(38591786-38592046)
chr3 (312-503)||(51212558-51212743)
chr3 (505-699)||(51212972-51213166)
chr3 (505-701)||(35844315-35844512)
chr3 (319-515)||(11356946-11357134)
chr3 (376-599)||(54828546-54828786)
chr3 (319-512)||(36012333-36012528)
chr3 (401-621)||(43348327-43348563)
chr3 (319-515)||(20373051-20373228)
chr3 (518-683)||(20373300-20373465)
chr3 (326-497)||(50475021-50475199)
chr3 (504-617)||(53176127-53176240)
chr3 (392-588)||(11835494-11835702)
chr3 (394-502)||(53811597-53811701)
chr3 (548-613)||(53811696-53811767)
chr3 (315-377)||(35844577-35844639)
chr3 (516-583)||(36012244-36012312)
chr3 (654-701)||(40640637-40640684)
chr3 (81-146)||(36806094-36806159)
chr3 (93-147)||(49301577-49301631)
chr3 (477-515)||(53176246-53176284)
chr3 (635-701)||(55343405-55343471)
chr3 (605-698)||(11835702-11835790)
chr3 (293-346)||(13498678-13498731)
chr3 (308-353)||(34133312-34133357)
chr3 (81-146)||(36515067-36515132)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (291-699)||(28002772-28003197)
chr4 (308-677)||(32579466-32579854)
chr4 (320-683)||(5047781-5048160)
chr4 (291-701)||(35020817-35021248)
chr4 (289-699)||(19089237-19089664)
chr4 (315-697)||(36493499-36493897)
chr4 (308-701)||(25700859-25701270)
chr4 (312-700)||(25184112-25184517)
chr4 (319-683)||(49375982-49376364)
chr4 (335-683)||(34947925-34948292)
chr4 (319-699)||(55240919-55241315)
chr4 (319-683)||(7703533-7703906)
chr4 (315-700)||(37663551-37663951)
chr4 (336-702)||(55477722-55478109)
chr4 (289-683)||(19440432-19440843)
chr4 (319-697)||(33341397-33341795)
chr4 (319-682)||(23761089-23761468)
chr4 (315-683)||(37775685-37776059)
chr4 (315-701)||(29584010-29584411)
chr4 (319-697)||(47253751-47254137)
chr4 (321-683)||(50764748-50765115)
chr4 (312-683)||(879355-879743)
chr4 (290-681)||(6864053-6864461)
chr4 (282-701)||(30002418-30002837)
chr4 (401-701)||(38011852-38012169)
chr4 (319-515)||(33816330-33816526)
chr4 (319-683)||(46887972-46888352)
chr4 (319-683)||(4598009-4598379)
chr4 (314-689)||(32592103-32592486)
chr4 (319-673)||(17167739-17168110)
chr4 (319-673)||(17173316-17173687)
chr4 (312-591)||(1815409-1815704)
chr4 (319-701)||(34361305-34361704)
chr4 (319-701)||(32912393-32912793)
chr4 (330-702)||(27396613-27397000)
chr4 (319-705)||(9139241-9139624)
chr4 (315-515)||(3042820-3043020)
chr4 (319-700)||(37287732-37288126)
chr4 (319-621)||(50697320-50697639)
chr4 (312-515)||(7152011-7152214)
chr4 (505-683)||(33816550-33816728)
chr4 (315-705)||(42199723-42200131)
chr4 (315-599)||(17272068-17272365)
chr4 (440-700)||(35025531-35025800)
chr4 (319-645)||(4934026-4934360)
chr4 (319-488)||(39400236-39400405)
chr4 (315-515)||(26896288-26896489)
chr4 (319-484)||(4205216-4205381)
chr4 (319-454)||(35025381-35025515)
chr4 (323-512)||(46883932-46884116)
chr4 (505-674)||(54499254-54499425)
chr4 (319-437)||(23431834-23431952)
chr4 (323-410)||(38012568-38012655)
chr4 (505-699)||(39397918-39398103)
chr4 (654-703)||(38812263-38812312)
chr4 (605-701)||(4205114-4205210)
chr4 (412-475)||(56050171-56050234)
chr4 (633-702)||(17272008-17272077)
chr4 (521-577)||(3042741-3042797)
chr4 (654-697)||(20097494-20097537)
chr4 (654-703)||(2704508-2704557)
chr4 (624-701)||(7152242-7152319)
chr4 (654-699)||(38811813-38811858)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (308-683)||(33908249-33908640)
chr5 (323-699)||(14409123-14409501)
chr5 (319-701)||(24886100-24886484)
chr5 (319-683)||(699166-699547)
chr5 (319-683)||(22980809-22981190)
chr5 (319-699)||(31786424-31786821)
chr5 (365-700)||(1428983-1429321)
chr5 (291-699)||(40133385-40133810)
chr5 (319-701)||(19119857-19120256)
chr5 (323-701)||(38528019-38528413)
chr5 (291-699)||(36866762-36867187)
chr5 (320-701)||(8741664-8742064)
chr5 (319-701)||(12910348-12910752)
chr5 (319-683)||(35511260-35511636)
chr5 (312-702)||(36860420-36860828)
chr5 (315-698)||(31705386-31705785)
chr5 (319-680)||(5837574-5837952)
chr5 (315-706)||(27330299-27330705)
chr5 (319-698)||(32563150-32563537)
chr5 (323-700)||(9200232-9200617)
chr5 (323-705)||(8466739-8467119)
chr5 (319-675)||(22019656-22020020)
chr5 (319-699)||(7693230-7693618)
chr5 (319-683)||(22255197-22255579)
chr5 (319-700)||(39572818-39573208)
chr5 (312-701)||(22973853-22974259)
chr5 (323-683)||(30969106-30969483)
chr5 (319-699)||(23116008-23116397)
chr5 (319-621)||(7208642-7208960)
chr5 (319-620)||(15992318-15992636)
chr5 (312-683)||(27318259-27318646)
chr5 (319-700)||(8436965-8437362)
chr5 (309-701)||(35826254-35826660)
chr5 (323-697)||(25500708-25501099)
chr5 (312-515)||(2888216-2888419)
chr5 (315-621)||(35504443-35504766)
chr5 (312-515)||(5830093-5830296)
chr5 (323-700)||(35933901-35934289)
chr5 (319-579)||(42342851-42343118)
chr5 (308-618)||(43308427-43308746)
chr5 (323-699)||(15724490-15724881)
chr5 (315-515)||(17157805-17158005)
chr5 (323-546)||(25669739-25669969)
chr5 (281-631)||(23954542-23954897)
chr5 (308-645)||(21088535-21088887)
chr5 (457-683)||(26268090-26268333)
chr5 (319-701)||(14919317-14919706)
chr5 (281-511)||(13956104-13956332)
chr5 (319-502)||(25889584-25889767)
chr5 (508-701)||(5112297-5112490)
chr5 (319-460)||(28416329-28416470)
chr5 (389-641)||(6824329-6824598)
chr5 (315-417)||(43254154-43254256)
chr5 (505-660)||(28416508-28416663)
chr5 (319-456)||(26269069-26269206)
chr5 (550-641)||(25668707-25668798)
chr5 (562-683)||(11898018-11898139)
chr5 (605-706)||(13956426-13956527)
chr5 (530-577)||(13956368-13956415)
chr5 (521-660)||(17158028-17158166)
chr5 (518-638)||(5829962-5830073)
chr5 (624-699)||(16004476-16004552)
chr5 (654-701)||(22616492-22616539)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (283-706)||(7234783-7235225)
chr6 (315-683)||(33618850-33619234)
chr6 (287-698)||(20768087-20768511)
chr6 (323-700)||(3879730-3880124)
chr6 (319-700)||(8513232-8513618)
chr6 (336-701)||(4318626-4319009)
chr6 (319-702)||(1945830-1946233)
chr6 (291-638)||(6090941-6091306)
chr6 (326-697)||(6088910-6089286)
chr6 (319-699)||(33892799-33893186)
chr6 (321-705)||(29182157-29182556)
chr6 (323-701)||(5627389-5627785)
chr6 (330-683)||(21016916-21017280)
chr6 (505-683)||(15491631-15491809)
chr6 (430-697)||(30353256-30353540)
chr6 (319-463)||(7054559-7054704)
chr6 (505-700)||(7055205-7055400)
chr6 (568-701)||(18498431-18498565)
chr6 (457-515)||(7055140-7055198)
chr6 (335-390)||(33724062-33724117)
chr6 (654-701)||(19631747-19631794)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (323-700)||(27082636-27083030)
chr8 (291-699)||(33906223-33906634)
chr8 (291-701)||(34894964-34895386)
chr8 (319-700)||(16446669-16447067)
chr8 (319-683)||(37970313-37970694)
chr8 (319-699)||(5299740-5300137)
chr8 (319-701)||(38643975-38644374)
chr8 (312-701)||(43643382-43643788)
chr8 (290-683)||(1204942-1205352)
chr8 (323-705)||(36694764-36695163)
chr8 (315-683)||(11727039-11727425)
chr8 (336-701)||(16222860-16223242)
chr8 (319-700)||(34951851-34952223)
chr8 (343-699)||(6098331-6098709)
chr8 (315-618)||(1149422-1149742)
chr8 (323-683)||(465857-466224)
chr8 (323-683)||(23854229-23854606)
chr8 (312-683)||(10554991-10555377)
chr8 (315-701)||(40862416-40862820)
chr8 (319-617)||(7890751-7891066)
chr8 (319-699)||(12876108-12876506)
chr8 (359-701)||(9864145-9864504)
chr8 (308-616)||(35459494-35459819)
chr8 (319-704)||(31933680-31934082)
chr8 (323-621)||(1953786-1954103)
chr8 (319-573)||(4132480-4132750)
chr8 (315-672)||(8803606-8803974)
chr8 (319-619)||(44869576-44869893)
chr8 (323-700)||(30654381-30654775)
chr8 (323-621)||(39098917-39099232)
chr8 (319-489)||(35859160-35859330)
chr8 (401-699)||(13307622-13307936)
chr8 (308-485)||(12587812-12587989)
chr8 (361-515)||(1149756-1149906)
chr8 (505-710)||(1150102-1150306)
chr8 (315-473)||(18259321-18259479)
chr8 (325-467)||(24823194-24823336)
chr8 (440-591)||(7998401-7998553)
chr8 (315-460)||(33198057-33198202)
chr8 (506-699)||(41362517-41362707)
chr8 (505-672)||(41910985-41911153)
chr8 (319-414)||(41362723-41362818)
chr8 (449-647)||(43025753-43025968)
chr8 (291-415)||(43025974-43026099)
chr8 (443-515)||(41910907-41910978)
chr8 (575-699)||(4133077-4133199)
chr8 (550-600)||(33197947-33197997)
chr8 (394-485)||(34463704-34463792)
chr8 (631-702)||(24823395-24823466)
chr8 (659-700)||(7998361-7998402)
chr8 (308-353)||(9864533-9864578)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (308-699)||(41465509-41465909)
chr2 (291-702)||(4166919-4167347)
chr2 (319-618)||(7006744-7007043)
chr2 (291-683)||(26357593-26358002)
chr2 (319-697)||(33660183-33660569)
chr2 (319-697)||(43770654-43771039)
chr2 (319-701)||(18494087-18494473)
chr2 (315-662)||(43648047-43648411)
chr2 (330-683)||(4763644-4764017)
chr2 (291-701)||(2325156-2325575)
chr2 (290-599)||(41960940-41961266)
chr2 (364-699)||(4478368-4478717)
chr2 (319-673)||(3176965-3177336)
chr2 (330-705)||(33550800-33551195)
chr2 (312-700)||(11366179-11366585)
chr2 (308-673)||(19289118-19289500)
chr2 (312-701)||(39167168-39167568)
chr2 (363-700)||(4263926-4264281)
chr2 (381-699)||(19313852-19314182)
chr2 (324-703)||(29241956-29242345)
chr2 (286-700)||(19424415-19424832)
chr2 (359-667)||(27349794-27350109)
chr2 (311-667)||(37905740-37906116)
chr2 (293-701)||(31570514-31570939)
chr2 (323-667)||(33709042-33709403)
chr2 (323-700)||(5881533-5881922)
chr2 (323-699)||(44913662-44914060)
chr2 (308-698)||(13711465-13711867)
chr2 (314-515)||(35959097-35959294)
chr2 (411-705)||(36641980-36642293)
chr2 (319-598)||(31861953-31862249)
chr2 (411-618)||(45327801-45328025)
chr2 (381-683)||(44285965-44286284)
chr2 (337-512)||(19500739-19500914)
chr2 (424-700)||(17071648-17071941)
chr2 (442-697)||(41463779-41464051)
chr2 (424-700)||(17054007-17054300)
chr2 (513-675)||(33902092-33902252)
chr2 (325-474)||(41051112-41051260)
chr2 (323-413)||(33902317-33902407)
chr2 (423-515)||(18258197-18258289)
chr2 (554-672)||(41051263-41051382)
chr2 (319-428)||(18257344-18257453)
chr2 (319-378)||(45328028-45328087)
chr2 (323-435)||(41463400-41463512)
chr2 (516-596)||(19501760-19501839)
chr2 (518-683)||(35958925-35959077)
chr2 (463-515)||(33902267-33902319)
chr2 (654-683)||(6177791-6177820)
chr2 (342-387)||(17053960-17054005)
chr2 (342-387)||(17071601-17071646)
chr2 (505-558)||(18258296-18258349)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (315-697)||(7889-8288)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (327-700)||(133-517)
scaffold0002 (325-598)||(408223-408512)
scaffold0002 (324-487)||(93894-94056)
scaffold0002 (505-678)||(94374-94547)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (321-697)||(11908-12303)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (319-697)||(43959-44353)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (319-697)||(154434-154828)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (315-683)||(145799-146185)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (319-651)||(267331-267673)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (371-555)||(100894-101058)
scaffold0009 (608-700)||(42347-42439)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 854; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 854; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 1139
Target Start/End: Original strand, 41764572 - 41765701
Alignment:
Q  19 actctcgtgcttatgacctcttaaggataaccgtcaaagactacatcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41764572 actctcgtgcttatgacctcttaaggataaccgtcaaagactacatcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatca 41764671  T
Q  119 tttcatacttgcttgccatgattgggtaaatctatcactagccnnnnnnncttaaaaatcttagtacatgcattctagtctagagtaagtgaacacttct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  41764672 tttcatacttgcttgccatgattgggtaaatctatcactagcatttttttcttaaaaatcttagtacatgcattctag-----agtaagtgaacacttct 41764766  T
Q  219 tagcattttcctaaaagatatcatacatacatttattgtagtcaannnnnnnnattctatccattaattaatgggagcttccacactggagttagaaaat 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||  | ||||    
T  41764767 tagcattttcttaaaagatatcatacatacatttattgtagtcaattttttttattctatcaattaattaatgggagtttctacggtggagtcgggaaat 41764866  T
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41764867 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgctt 41764966  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt--- 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  41764967 gcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttct 41765066  T
Q  516 --------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
                  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41765067 ggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgcc 41765166  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41765167 accgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatggaattttcctt 41765266  T
Q  702 aattattaacattgcaatattg---atgttacacaaacgcttttttaaaatgttgtgacctacactgtggtatacaatttttgtgctgcttctattttca 798  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||    
T  41765267 aattat-aacattgcaatattgcacatgttacacaaaagcttttttaaaatgttgtgacctacattgtggtatacaatttttg-----cttctattttca 41765360  T
Q  799 ggggccagaggtctcgaatgcagttccaaacttgtacaagaattcgattcgtgcgttttgcaatgccaacacctcagaggaattcaagccagtaaaagat 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41765361 ggggccagaggtctcgaatgcagttccaaacttgtacaagaattcgattcgtgcgttttgcaatgccaacacctcagagggattcaagccagtaaaagat 41765460  T
Q  899 gtatctattccagaaatcaatgttcgaaccggcataattgatgatcttcttggtggaccatcaccatctaagagatcaattttggctttcttcgctggtg 998  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765461 gtatctattccagaaatcaatgttcgaaccggcataattgatgatcttcttggcggaccatcaccatctaagagatcaattttggctttcttcgctggtg 41765560  T
Q  999 ggcttcatggggatattaggaatgttctacttgaacattgggaacacaaagatgaagatcttcaagttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttacta 1098  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765561 ggcttcatggggatattaggaatgttctacttgaacattgggaacacaaagatgaagatattcaagttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttacta 41765660  T
Q  1099 tgatatgttgagaaaaagcaagttctgtctttgtcccagtg 1139  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41765661 tgctatgttgagaaaaagcaagttttgtctttgtcctagtg 41765701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 291 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 29173922 - 29173540
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  29173922 gggagcttctacgatgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatg 29173823  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29173822 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatatta 29173724  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173723 tgtgatagtcttaagtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaa 29173624  T
Q  591 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 674  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  29173623 cttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 290 - 683
Target Start/End: Original strand, 48928057 - 48928466
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48928057 tgggagcttctacggtgcagttagaaaattgacttttttaaaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaat 48928156  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928157 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatatt 48928256  T
Q  490 atgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 572  Q
    ||| |||||||||||                 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48928257 atgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgat 48928356  T
Q  573 gatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 672  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48928357 aatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcat 48928455  T
Q  673 tctcatgactt 683  Q
    |||||||||||    
T  48928456 tctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 308 - 683
Target Start/End: Original strand, 31520519 - 31520893
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  31520519 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatc 31520618  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520619 gagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 31520718  T
Q  508 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 607  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  31520719 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgta 31520817  T
Q  608 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||| ||| |||  |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31520818 caaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgactt 31520893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 319 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 26980678 - 26980325
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  26980678 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatactt 26980579  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26980578 gcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 26980479  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 618  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26980478 acaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggg 26980379  T
Q  619 gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 672  Q
    |||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  26980378 gtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 319 - 651
Target Start/End: Original strand, 32592996 - 32593326
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||    
T  32592996 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatattt 32593094  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32593095 gtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttaaa 32593194  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 618  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  32593195 acaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgataccaccatataaacagtggg 32593293  T
Q  619 gtgccactcactacacttttgatactatagtgt 651  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  32593294 gtgctactcactacacttttaatgctatagtgt 32593326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 290 - 701
Target Start/End: Original strand, 12390409 - 12390818
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  12390409 tgggagcttctacggtgaagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaat 12390508  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12390509 gataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatatt 12390608  T
Q  490 atgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 589  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |    
T  12390609 atgtg--agtcttaagtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacata 12390706  T
Q  590 acttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaat 689  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || ||    
T  12390707 acttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccat 12390806  T
Q  690 ggaattttcctt 701  Q
     |||||||||||    
T  12390807 agaattttcctt 12390818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 312 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 18797706 - 18797299
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18797706 agaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 18797607  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797606 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 18797507  T
Q  512 -----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 594  Q
                     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18797506 actttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttt 18797407  T
Q  595 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaat 694  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  ||   ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  18797406 tgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt--tatgttagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaat 18797309  T
Q  695 tttccttaat 704  Q
    ||||||||||    
T  18797308 tttccttaat 18797299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 315 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 30055903 - 30055499
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30055903 aaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 30055804  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30055803 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 30055704  T
Q  513 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                   |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30055703 ttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttga 30055604  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 696  Q
    || ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| | | |||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  30055603 tgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 30055504  T
Q  697 tcctt 701  Q
    |||||    
T  30055503 tcctt 30055499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 290 - 699
Target Start/End: Original strand, 5657240 - 5657667
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatctt-aatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    |||||||||| ||| || |||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |   |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  5657240 tgggagcttctacaatgcagttatgaaactgacatttttgaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaa 5657339  T
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5657340 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatat 5657439  T
Q  489 tatgtgatagtcttaag-----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 571  Q
     ||| ||||||||||||                 ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  5657440 catgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattga 5657539  T
Q  572 tgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtca 671  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  5657540 tgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtca 5657639  T
Q  672 ttctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||||||||||| || || |||||||||    
T  5657640 ttctcatgacttcaccatagaattttcc 5657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Original strand, 9355615 - 9356014
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9355615 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgctt 9355714  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||                  
T  9355715 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt 9355814  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| |    
T  9355815 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtc 9355914  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    || ||||||||||||||||    ||||||||| |||| || |||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  9355915 actgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgacttcaccataaaattttcctt 9356014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 819 - 1139
Target Start/End: Original strand, 41757298 - 41757618
Alignment:
Q  819 cagttccaaacttgtacaagaattcgattcgtgcgttttgcaatgccaacacctcagaggaattcaagccagtaaaagatgtatctattccagaaatcaa 918  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41757298 cagttccaaacttgtacaaaaattcaatccgagcgctttgcaatgcgaacacatcagagggattcaagcctgcaaaggatgtatctattccagaaaccaa 41757397  T
Q  919 tgttcgaaccggcataattgatgatcttcttggtggaccatcaccatctaagagatcaattttggctttcttcgctggtgggcttcatggggatattagg 1018  Q
    | ||| |||||| | |||  ||| | || |||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||||    
T  41757398 tcttcaaaccggtacaatacatggtattgttggcgggccatcaccatctaagcgatcagttttggctttcttcgccggtggggttcatgggcccgttagg 41757497  T
Q  1019 aatgttctacttgaacattgggaacacaaagatgaagatcttcaagttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttactatgatatgttgagaaaaagca 1118  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41757498 cctgttctacttgaacattgggaacacaaagatgaagatcttcaagttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttactatgatatgttaagaaaaagca 41757597  T
Q  1119 agttctgtctttgtcccagtg 1139  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  41757598 agttctgtctttgtcctagtg 41757618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 323 - 701
Target Start/End: Original strand, 32820846 - 32821241
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32820846 tttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 32820945  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca---------- 512  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||              
T  32820946 catcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatgggg 32821045  T
Q  513 -------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
           |||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  32821046 tgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattg 32821145  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  32821146 tacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 32821241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 312 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 4583298 - 4582894
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  4583298 agaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagt 4583199  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4583198 aatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttac 4583099  T
Q  512 -----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 594  Q
                     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4583098 actttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttt 4582999  T
Q  595 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaat 694  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||    
T  4582998 tgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaat 4582899  T
Q  695 tttcc 699  Q
    |||||    
T  4582898 tttcc 4582894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 286 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24212147 - 24211717
Alignment:
Q  286 ttaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat 385  Q
    |||||| ||||||| ||  || ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24212147 ttaatgagagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 24212048  T
Q  386 taatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatg 484  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  24212047 taatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatg 24211948  T
Q  485 atattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaa 567  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||                 ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24211947 atattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaa 24211848  T
Q  568 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 667  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  24211847 ttgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 24211748  T
Q  668 gtcattctcatgacttgacaatggaattttc 698  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  24211747 gtcattcttatgacttcaccatagaattttc 24211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 319 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 35353480 - 35353120
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35353480 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgctt 35353381  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta-------- 510  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||            
T  35353380 gcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttct 35353281  T
Q  511 ---------cacttaaaacaaggtagg-gtaaaat-tagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa-cttttgat 598  Q
             |||||||||||||||| | || | || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  35353280 ggggtgttacacttaaaacaaggtaagtgttacatctag--taa-tgcagtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgat 35353184  T
Q  599 gccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 662  Q
     ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35353183 tccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcacca 35353120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Original strand, 31578853 - 31579256
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31578853 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 31578952  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  31578953 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttat 31579052  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31579053 agggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtc 31579152  T
Q  602 accgta-----caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 696  Q
    |  |||      |||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| | ||||| ||||||| || || ||||||    
T  31579153 attgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattt 31579252  T
Q  697 tcct 700  Q
    ||||    
T  31579253 tcct 31579256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 37347393 - 37347013
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37347393 tgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgctt 37347294  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  37347293 gcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgt 37347194  T
Q  512 ---------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
             ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37347193 ggagtttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 37347094  T
Q  603 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    | ||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  37347093 ctgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgactt 37347013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 8861657 - 8861260
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  8861657 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcat 8861558  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||           
T  8861557 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgc 8861458  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              |||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8861457 ggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgcc 8861358  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    || |||||||||||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  8861357 actgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8861260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 21991999 - 21991610
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||    |||||||| ||||||||||     |||||    
T  21991999 tgacttttttgaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----tgctt 21991909  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt--- 515  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  21991908 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 21991809  T
Q  516 --------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
                  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21991808 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgac 21991709  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    || |||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  21991708 actgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccctagaattttcct 21991610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 315 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 37110250 - 37109847
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37110250 aaattgatttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37110151  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  37110150 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 37110051  T
Q  513 ---------------cttaaaacaagg--tagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 595  Q
                   |||| |||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  37110050 ttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaactttt 37109951  T
Q  596 gatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatt 695  Q
    |||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || |||||    
T  37109950 gatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaatt 37109851  T
Q  696 ttcc 699  Q
    ||||    
T  37109850 ttcc 37109847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 360 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165753
Alignment:
Q  360 tcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcat 459  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  460 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||    |||      |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattc 12165875  T
Q  552 ttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  12165874 ttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgt 12165775  T
Q  652 cgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  12165774 taacttcaccagaaaagtcatt 12165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 315 - 702
Target Start/End: Original strand, 17842369 - 17842775
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17842369 aaattgacttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataat 17842468  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  17842469 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 17842568  T
Q  513 ---------------cttaaaacaagg--tagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 595  Q
                   |||| |||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  17842569 ttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagctttt 17842668  T
Q  596 gatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatt 695  Q
    |||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || |||||    
T  17842669 gatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaatt 17842768  T
Q  696 ttcctta 702  Q
    |||||||    
T  17842769 ttcctta 17842775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Original strand, 15612548 - 15612944
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15612548 tgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgctt 15612647  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                  
T  15612648 gcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 15612747  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15612748 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgcc 15612847  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||  |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||    
T  15612848 actctacaaacactggggtgttactcataacac-tttgatgttatagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattttcc 15612944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 315 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 27284122 - 27283719
Alignment:
Q  315 aaattgactttttt-gaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttc-atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagta 412  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27284122 aaattgactttttttgaaaagattaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagta 27284023  T
Q  413 atgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac- 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  27284022 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttaca 27283923  T
Q  512 ----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 595  Q
                    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27283922 ctttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaactttt 27283823  T
Q  596 gatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatt 695  Q
    |||  ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||| || || |||||    
T  27283822 gatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaatt 27283723  T
Q  696 ttcc 699  Q
    ||||    
T  27283722 ttcc 27283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 6546891 - 6546494
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6546891 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 6546792  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    ||   ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||                  
T  6546791 gcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgt 6546692  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||      
T  6546691 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgtt 6546592  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    || ||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  6546591 actgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcc 6546494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7335169 - 7334785
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7335169 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaat 7335070  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 504  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||              
T  7335069 gcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacact 7334971  T
Q  505 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
           |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7334970 ctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttga 7334871  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || ||  |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| ||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  7334870 tgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgactt 7334785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 321 - 699
Target Start/End: Original strand, 10359005 - 10359400
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  10359005 acttttttgaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgc 10359104  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------------- 504  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||                    
T  10359105 aaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgg 10359204  T
Q  505 -gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattaga-ttaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  10359205 ggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtca 10359303  T
Q  603 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    | ||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||| |||||   |  | || ||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  10359304 ctgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 10359400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22687599 - 22687230
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22687599 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaa 22687500  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt------- 515  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||        | ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||           
T  22687499 catcttggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaac--------agagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtgggg 22687408  T
Q  516 ----------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
              ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  22687407 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactg 22687308  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
     ||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22687307 cacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgactt 22687230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 312 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23111571 - 23111181
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  23111571 agaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagt 23111472  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111471 aatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 23111372  T
Q  512 a-----------------cttaaaacaaggtagg--gtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 592  Q
    |                 |||||||||| ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||    
T  23111371 actttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaact 23111272  T
Q  593 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| |||  |||||| | | |||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23111271 tttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgactt 23111181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 32432824 - 32432431
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32432824 tgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgctt 32432725  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt---------- 508  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||              
T  32432724 gcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt 32432625  T
Q  509 -------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
           ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  32432624 ggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtc 32432525  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |  ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||     |||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  32432524 attgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttg-----atagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 32432431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 37703283 - 37703483
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37703283 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37703382  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37703383 gtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacact 37703482  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  37703483 t 37703483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 435 - 704
Target Start/End: Original strand, 48928469 - 48928754
Alignment:
Q  435 acatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag-----------------tgttacacttaa 517  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                 ||||||||||||    
T  48928469 acatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaa 48928568  T
Q  518 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 617  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48928569 aataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtgg 48928667  T
Q  618 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 704  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  48928668 ggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattttctttaat 48928754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 312 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 10481984 - 10481660
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10481984 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagt 10481885  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481884 aatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 10481785  T
Q  512 -----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 594  Q
                     ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  10481784 actttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttt 10481685  T
Q  595 tgatgccaccgtacaaacagtgggg 619  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||    
T  10481684 tgatgtcattgtacaaacagtgggg 10481660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 336 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 11071558 - 11071263
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11071558 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggactta 11071459  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-----------------ttacacttaaa 518  Q
    ||  || ||||| |||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||                 |||||||||||    
T  11071458 caggtattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaa 11071362  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 617  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11071361 acaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 11071263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Original strand, 25691337 - 25691715
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25691337 ttttttaaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaa 25691436  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 505  Q
     || ||| |||||||| |  ||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                 |    
T  25691437 cattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtgggg 25691536  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |    
T  25691537 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactg 25691636  T
Q  606 tacaaacagtggggt-gccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||| |||    |||||| | |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25691637 tacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgactt 25691715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 46480918 - 46481114
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  46480918 tgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 46481017  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46481018 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 46481114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 321 - 499
Target Start/End: Original strand, 44411331 - 44411509
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411331 acttttttggaaaggttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgc 44411430  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 499  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44411431 aacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 401 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686015
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  501 ttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 583  Q
    |||||||||||||||                 ||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagg 43686131  T
Q  584 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  43686130 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgactt 43686032  T
Q  684 gacaatggaattttcct 700  Q
     || || ||||||||||    
T  43686031 caccatagaattttcct 43686015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 319 - 581
Target Start/End: Original strand, 15672548 - 15672830
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15672548 tgacttttttgaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 15672647  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatac---tatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta------------ 503  Q
    |||| || |||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||                
T  15672648 gcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 15672747  T
Q  504 -----agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 581  Q
         ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15672748 tgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 424 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 38258812 - 38258536
Alignment:
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-------- 515  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  38258812 atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 38258713  T
Q  516 ---------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 606  Q
             | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||    
T  38258712 gttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgt 38258613  T
Q  607 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||| ||| ||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | |||||||    
T  38258612 acaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgactt 38258536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 385 - 683
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688431
Alignment:
Q  385 ttaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatg 484  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  485 atattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaa 567  Q
    |||| || |||||||||| |                 |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 33688316  T
Q  568 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 667  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||  |||||  |||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||    
T  33688317 ttgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaa 33688415  T
Q  668 gtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||| ||||    
T  33688416 gtcattctcataactt 33688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 26587881 - 26588069
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26587881 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcct 26587980  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26587981 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactt 26588069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 315 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37704558 - 37704387
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37704558 aaattgacttttttggaaaaactaatcttgattttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaat 37704459  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 486  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704458 gcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 401 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053540
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  501 ttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  38053651 ttaagtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgt 38053560  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggt 620  Q
    ||  ||||||||||| ||||    
T  38053559 cattgtacaaacagtagggt 38053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 327 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 43925459 - 43925177
Alignment:
Q  327 ttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatc 426  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  43925459 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 43925360  T
Q  427 ttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgtt 509  Q
    ||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||                 |||||    
T  43925359 ttggac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgtt 43925266  T
Q  510 acacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 599  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43925265 gcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatg 43925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 323 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 44599034 - 44598737
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgct---gattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttg 419  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| | | | |||||||| ||||||||||||  |   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  44599034 ttttttgaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttg 44598938  T
Q  420 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-------- 511  Q
     || ||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||            
T  44598937 taacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtg 44598838  T
Q  512 ---------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
             ||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  44598837 gggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatgcca 44598738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 697
Target Start/End: Original strand, 27421373 - 27421563
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |    
T  27421373 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattg 27421471  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||| ||||| || || |||||||    
T  27421472 tacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaatttt 27421563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 321 - 475
Target Start/End: Original strand, 34361967 - 34362123
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttga-tctt-aatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  34361967 acttttttgaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgttt 34362066  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaaca 475  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  34362067 gcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 550 - 703
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524517
Alignment:
Q  550 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagt 649  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||  | |||| ||| |||||||  ||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  650 gtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 703  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaa 26524517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 505 - 697
Target Start/End: Original strand, 44413371 - 44413564
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||  ||      
T  44413371 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagt 44413470  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||  ||||||   | |||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  44413471 gtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactttaccatagaatttt 44413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 505 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 37704326 - 37704241
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37704326 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38258980 - 38258867
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38258980 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 38258881  T
Q  390 gatcaatattaatt 403  Q
    |||||||| |||||    
T  38258880 gatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 569 - 699
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362334
Alignment:
Q  569 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 668  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  | |||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  669 tcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||||||||| | || || || |||||||||    
T  34362304 tcattctcataatttcaccatagaattttcc 34362334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Original strand, 41756651 - 41756757
Alignment:
Q  40 taaggataaccgtcaaagactacatcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatga 139  Q
    |||||| |||| ||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41756651 taaggaaaaccatcacagattatatcaatgtggtttccgaaaaatatcccttttggaaccgaagccttggagctgatcatttcatgctttcttgccatga 41756750  T
Q  140 ttgggta 146  Q
    |||||||    
T  41756751 ttgggta 41756757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704333
Alignment:
Q  461 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 37704333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 555
Target Start/End: Original strand, 26588076 - 26588126
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 555  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26588076 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421282
Alignment:
Q  384 attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactattt 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactattt 27421282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 635 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 8299254 - 8299192
Alignment:
Q  635 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || |||||||    
T  8299254 ttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 8299192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 560 - 602
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362191
Alignment:
Q  560 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgcca 34362191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 566
Target Start/End: Original strand, 46481122 - 46481182
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 566  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  46481122 tgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 40381985 - 40381934
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||    
T  40381985 acttcaccagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttccttaatt 40381934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 654 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 3953776 - 3953747
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953776 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 3953747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 654 - 683
Target Start/End: Original strand, 23402374 - 23402403
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402374 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 23402403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14758425 - 14758053
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14758425 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 14758326  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------gtgtta 510  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||    
T  14758325 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaatttctggggtgtta 14758226  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 610  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758225 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaa 14758126  T
Q  611 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758125 acagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 14758053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 308 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 15168500 - 15168083
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15168500 agttaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatc 15168401  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15168400 taataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtg 15168301  T
Q  508 ttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
    ||||                 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15168300 ttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaa 15168201  T
Q  591 cttttgatgccac-------cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  15168200 cttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcactt 15168101  T
Q  684 gacaatggaattttcctt 701  Q
     || || |||||||||||    
T  15168100 cacgatagaattttcctt 15168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 323 - 701
Target Start/End: Original strand, 11742155 - 11742532
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11742155 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 11742254  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaa 522  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11742255 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttacacttaaaacaa 11742354  T
Q  523 ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgc 622  Q
    |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  11742355 ggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgt 11742453  T
Q  623 cactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
     ||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||    
T  11742454 tacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcacgataaaattttcctt 11742532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 323 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 2960137 - 2959743
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2960137 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 2960038  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-------------- 508  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  2960037 catcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtggga 2959938  T
Q  509 ---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
       ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2959937 tgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactg 2959838  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  2959837 tacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 2959743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 336 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 16416022 - 16415639
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16416022 ttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggactta 16415923  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaa 518  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 || |||||||||||    
T  16415922 catgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaa 16415823  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaaca-gtgg 617  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  | |    
T  16415822 acaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttag 16415723  T
Q  618 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  16415722 ggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccttagaattttcctt 16415639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 47279578 - 47279201
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  47279578 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaa 47279479  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac--------- 513  Q
     |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||             
T  47279478 catcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggga 47279379  T
Q  514 --------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  47279378 tgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactg 47279279  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47279278 tacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgactt 47279201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Original strand, 31621331 - 31621717
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcattttt-aaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  31621331 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgct 31621430  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaac-----atgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  31621431 tgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcaca 31621530  T
Q  513 ct----------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
    ||                |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31621531 cttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttg 31621630  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31621631 atgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgactt 31621717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 310 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40885216 - 40884841
Alignment:
Q  310 ttagaaaattgacttttttgaaaaggttaa-ttttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatct 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40885216 ttagaaaattgacttttttaaaaatgttaacttttaaccttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatct 40885117  T
Q  409 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 508  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40885116 agtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgt 40885017  T
Q  509 tac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 591  Q
    |||                 |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  40885016 tacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaac 40884917  T
Q  592 ttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  40884916 ttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttcaccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 289 - 701
Target Start/End: Original strand, 34012135 - 34012559
Alignment:
Q  289 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    ||||||||||| ||  || ||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34012135 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 34012234  T
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34012235 tgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 34012334  T
Q  489 tatgtgata--gtctta----------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 576  Q
    |||||||||  || |||           ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34012335 tatgtgatagtgtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgata 34012434  T
Q  577 ctatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc 676  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  |||||| || ||| |||||| ||    
T  34012435 gtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttc 34012534  T
Q  677 atgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||||| || || |||||||||||    
T  34012535 atgacttcaccatagaattttcctt 34012559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 4330670 - 4330291
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4330670 ttttttggaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaa 4330571  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-------------- 508  Q
     || |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  4330570 catattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgggg 4330471  T
Q  509 ---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  4330470 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactg 4330371  T
Q  606 tacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcga-cttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4330370 tacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataactt 4330291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 283 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15752458 - 15752027
Alignment:
Q  283 taattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgct 382  Q
    ||||| ||||||||||| ||  || ||| |||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  15752458 taatttatgggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattact 15752359  T
Q  383 gattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttga 482  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||| |    
T  15752358 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaa 15752259  T
Q  483 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatg 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||                 ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15752258 tgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatg 15752159  T
Q  566 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaa 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||| | |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||    
T  15752158 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaa 15752059  T
Q  666 aagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15752058 aagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 15752027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 324 - 621
Target Start/End: Original strand, 27227273 - 27227587
Alignment:
Q  324 tttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa 423  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27227273 tttttggaaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 27227372  T
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gt 506  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                 ||    
T  27227373 atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggt 27227472  T
Q  507 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 606  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27227473 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgt 27227572  T
Q  607 acaaacagtggggtg 621  Q
    |||||||||| ||||    
T  27227573 acaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 291 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 32216476 - 32216088
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32216476 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 32216377  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32216376 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatatta 32216277  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  32216276 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatg 32216177  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 662  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  32216176 atactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 32216088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 286 - 683
Target Start/End: Original strand, 27532732 - 27533144
Alignment:
Q  286 ttaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat 385  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| |  ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27532732 ttaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgat 27532830  T
Q  386 taatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||    
T  27532831 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctga 27532930  T
Q  486 tattatgtgatagtctt-----------------aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaat 568  Q
    ||| |||||||||||||                 | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27532931 tatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaat 27533029  T
Q  569 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 668  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  || ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  27533030 tgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaag 27533129  T
Q  669 tcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||| ||||    
T  27533130 tcattctcataactt 27533144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 38823607 - 38823210
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38823607 tgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 38823508  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  38823507 gcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 38823408  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  38823407 tgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgac 38823308  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    || ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  38823307 actgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38823210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 315 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 15383331 - 15382927
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15383331 aaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaa 15383232  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 512  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15383231 tgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacac 15383132  T
Q  513 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
                    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15383131 tttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttg 15383032  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 696  Q
    ||| ||  |||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||| | || |||| || || ||||||    
T  15383031 atgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattt 15382932  T
Q  697 tcctt 701  Q
    |||||    
T  15382931 tcctt 15382927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Original strand, 27266984 - 27267361
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27266984 tgactttttggaaaag-ttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgctt 27267082  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                  
T  27267083 gcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgt 27267182  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  27267183 ggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgcc 27267281  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27267282 actgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgactt 27267361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 312 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 10923127 - 10922742
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10923127 agaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 10923028  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10923027 aatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttac 10922928  T
Q  512 a-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 594  Q
    |                 |||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10922927 actttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttt 10922828  T
Q  595 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 680  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||   ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10922827 tgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatga 10922742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 289 - 700
Target Start/End: Original strand, 19899521 - 19899950
Alignment:
Q  289 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19899521 atgggagcttctacagtgcagttaggaaactgacttttttggaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 19899620  T
Q  389 tgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 487  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  19899621 tgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgata 19899720  T
Q  488 ttatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattg 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||                 |||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19899721 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattg 19899820  T
Q  571 atgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc 670  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||    
T  19899821 atgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatc 19899920  T
Q  671 attctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    ||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  19899921 attattatgacttcaccatagaattttcct 19899950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 323 - 697
Target Start/End: Original strand, 33725398 - 33725778
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcattttta-aattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgca 421  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||    
T  33725398 ttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatgatcaata------------gtaatgtttgca 33725485  T
Q  422 aaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa----------------- 504  Q
    | || |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                     
T  33725486 acattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggg 33725585  T
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725586 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 33725685  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
      | ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |||||||    
T  33725686 aaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccatagaatttt 33725778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Original strand, 7078850 - 7079238
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7078850 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaa 7078949  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 505  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                 |    
T  7078950 tatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtgggg 7079049  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  7079050 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattg 7079149  T
Q  606 tacaaac-----------agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||           |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7079150 tacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactt 7079238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 37451682 - 37451298
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37451682 aaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37451583  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 511  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  37451582 gtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 37451483  T
Q  512 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                  ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37451482 ttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttga 37451384  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || ||  |||||||| || |||||  ||| | |||| |||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  37451383 tgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgactt 37451298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 312 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 8222528 - 8222123
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 410  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8222528 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatat-aattcatctag 8222430  T
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8222429 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 8222330  T
Q  511 ca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 593  Q
    ||                 |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8222329 cactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaactt 8222230  T
Q  594 ttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaa 693  Q
    |||||||||  ||   ||| ||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||| | ||| |||||| | ||||||| ||  | |||    
T  8222229 ttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaa 8222133  T
Q  694 ttttccttaa 703  Q
    ||||||||||    
T  8222132 ttttccttaa 8222123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 318 - 680
Target Start/End: Original strand, 9902836 - 9903215
Alignment:
Q  318 ttgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9902836 ttgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgct 9902935  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------- 504  Q
    ||||  |||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||                 
T  9902936 tgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttg 9903035  T
Q  505 ----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
        ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  9903036 tggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgt 9903135  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 680  Q
    ||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  9903136 cactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 315 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 32267431 - 32267028
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32267431 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaat 32267332  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  32267331 gcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacact 32267232  T
Q  513 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32267231 ttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttga 32267132  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    || ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||| |||  ||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||  ||||||    
T  32267131 tgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttcaccataaaatttt 32267032  T
Q  698 cctt 701  Q
    ||||    
T  32267031 cctt 32267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 321 - 700
Target Start/End: Original strand, 10181792 - 10182189
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10181792 acttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 10181891  T
Q  421 aaaatcttggacttac-atatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------------- 504  Q
    || || |||||||||| |  |||||||  || |||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||                   
T  10181892 aacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 10181991  T
Q  505 --gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10181992 gggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgcca 10182091  T
Q  603 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    | ||||||||||||| |||  || ||||| | |||| ||  || ||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  10182092 ctgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 10182189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 323 - 697
Target Start/End: Original strand, 238300 - 238690
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  238300 ttttttgaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 238399  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 505  Q
     |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  238400 catcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 238499  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |    
T  238500 tgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattg 238599  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| || |||||| || || |||||||    
T  238600 tacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaatttt 238690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Original strand, 28564562 - 28564945
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28564562 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 28564661  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    | |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      
T  28564662 gtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacact 28564759  T
Q  513 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                   |||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28564760 ttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 28564859  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || ||  |||||||||||  ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||| ||||| |||| ||||    
T  28564860 tgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataactt 28564945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 30254816 - 30254419
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30254816 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgctt 30254717  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 512  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||          
T  30254716 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttat 30254617  T
Q  513 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
               |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  30254616 agggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtc 30254517  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |  ||||||||||| | ||   ||||| |||| |||||||  |||| |||  |||||| || |||||||||||| || |||| || || ||||||||||    
T  30254516 attgtacaaacagt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcct 30254419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 330 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 25161015 - 25160710
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatctt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25161015 aaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 25160916  T
Q  429 ggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttac 511  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||                 |||||||    
T  25160915 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttac 25160816  T
Q  512 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 611  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25160815 acttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaa 25160716  T
Q  612 cagtgg 617  Q
    | ||||    
T  25160715 cggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 323 - 631
Target Start/End: Original strand, 27563692 - 27564017
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27563692 ttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaa 27563791  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg--------------- 507  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||                   
T  27563792 catcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtgggg 27563891  T
Q  508 --ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
      ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||||| |||      
T  27563892 tattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcacta 27563991  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcacta 631  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||    
T  27563992 tacaaacagtggagtgttactcacta 27564017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 328 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 3309538 - 3309144
Alignment:
Q  328 tgaaaaggttaattttga-tcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatc 426  Q
    |||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3309538 tgaaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatc 3309439  T
Q  427 ttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac------------- 513  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||                 
T  3309438 ttggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgag 3309339  T
Q  514 ---------ttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 603  Q
             ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  3309338 gtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccac 3309239  T
Q  604 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
     ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  3309238 tgtacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcc 3309144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 323 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 3535312 - 3534926
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3535312 tttttttaaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 3535213  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat----tatgtgatagtctt----aagtgttacact 514  Q
     |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    || ||| ||  |||      ||||||||||    
T  3535212 catcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaagtgttacactttgtggggtgttacact 3535113  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 614  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  3535112 taaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacag 3535013  T
Q  615 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |  ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  3535012 taaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaattaattctaatgacttcataatagaattttcctt 3534926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Original strand, 47682277 - 47682657
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47682277 tgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctt 47682376  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                  
T  47682377 gcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgt 47682476  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  47682477 gaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgatacc 47682576  T
Q  602 accgtacaaacagtggg-gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || |||||| ||||||| |||  |||||| ||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47682577 actgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgactt 47682657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 288 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 46931834 - 46931446
Alignment:
Q  288 aatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 387  Q
    |||||||||||| ||  || ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46931834 aatgggagcttctacggtgcagtaaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 46931735  T
Q  388 atgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 486  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  46931734 atgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 46931635  T
Q  487 attatgtgatagtcttaagtgttacactt---------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46931634 attatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgctgaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattga 46931535  T
Q  572 tgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 660  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||    |||||||||||||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  46931534 tgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 312 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 42721435 - 42721035
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42721435 agaaaattga-ttttttaaaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagt 42721337  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg---- 507  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||        
T  42721336 aataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttat 42721240  T
Q  508 -------------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 594  Q
                 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  42721239 actttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttt 42721140  T
Q  595 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaat 694  Q
    |||||  || |||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  ||||| |   ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || || ||||    
T  42721139 tgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaat 42721040  T
Q  695 tttcc 699  Q
    |||||    
T  42721039 tttcc 42721035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 359 - 699
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30327132
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaa 30326874  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                 |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  30326875 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagatt 30326974  T
Q  542 aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 641  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||   ||||| |||| |||||||    
T  30326975 aagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgat 30327074  T
Q  642 actatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
      ||||||||  | ||||| | |||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  30327075 gttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 30327132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 315 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 51129254 - 51128884
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51129254 aaattgacttttttgaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 51129157  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 504  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||              
T  51129156 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacact 51129057  T
Q  505 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
           |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  51129056 ttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttga 51128957  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc 670  Q
    || ||  |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  51128956 tgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23999745 - 23999359
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23999745 aaattgacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 23999646  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23999645 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 23999546  T
Q  513 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
                    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23999545 tttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttg 23999446  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||| ||   |||||| |||||||||  ||||  || | |||| ||  | ||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  23999445 atgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 23999359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 315 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 39393781 - 39393377
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39393781 aaattgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 39393682  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 511  Q
    | |||||| |||||||| ||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| || |||||||||||||||||||       
T  39393681 gtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacact 39393582  T
Q  512 --------------acttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
                  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  39393581 ttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttg 39393482  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||    
T  39393481 atgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattt 39393382  T
Q  697 tcctt 701  Q
    |||||    
T  39393381 tcctt 39393377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 315 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 28770050 - 28769651
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28770050 aaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaat 28769951  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac- 513  Q
    | |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  28769950 gtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacact 28769851  T
Q  514 -----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
                     ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28769850 ttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttg 28769751  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 696  Q
    ||||||  |||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||   |||||||  ||||||| | |||||| ||| | ||||||| || || ||||||    
T  28769750 atgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaattt 28769652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 377 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 18422986 - 18422646
Alignment:
Q  377 attgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacat 476  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||      
T  18422986 attgttgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacgg 18422887  T
Q  477 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact-----------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaat 559  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||                 || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18422886 aggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 18422787  T
Q  560 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 659  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||  || | |||||||  ||||||||  ||||||    
T  18422786 ctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttca 18422687  T
Q  660 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    ||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  18422686 ccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcct 18422646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 315 - 599
Target Start/End: Original strand, 27763089 - 27763391
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  27763089 aaattgacatttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaa 27763188  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------- 504  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||             
T  27763189 tgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacac 27763288  T
Q  505 --------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
            ||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27763289 tttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttg 27763388  T
Q  597 atg 599  Q
    |||    
T  27763389 atg 27763391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 1547664 - 1547281
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1547664 tgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 1547565  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag------------- 505  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||                 
T  1547564 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt 1547473  T
Q  506 ----tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
        ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1547472 ggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatc--------tgatgatactatgagaactgaacttttgatgcc 1547381  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    || | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  1547380 actgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 1547281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 336 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 41926532 - 41926161
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||| ||||||||  ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41926532 ttaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggactta 41926434  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata-gtctta----------agtgttacacttaaaacaagg 524  Q
    ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||          ||||||||||||||||||| |    
T  41926433 caagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaataagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaag 41926334  T
Q  525 tagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgcca 624  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |   |    
T  41926333 taggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatatta 41926234  T
Q  625 ctcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| |  |||||| || |||| ||||| |||| |||| || || |||||||    
T  41926233 ctcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaatttt 41926161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 48353931 - 48353740
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48353931 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaa 48353832  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48353831 tatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactt 48353740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 364 - 701
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37619078
Alignment:
Q  364 ttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatcttt 463  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  464 aacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtcttaa----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 555  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    ||| ||  ||| |     |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattatatgagtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgt 37618928  T
Q  556 taatctgatgaattgatg--atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg--ccactcactacacttttgatactatagtgt 651  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    ||||| || | |||||||  ||||||||    
T  37618929 taatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgt 37619028  T
Q  652 cgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
      ||||||||| |||||||||||| || |||| || || |||||||||||    
T  37619029 taacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcctt 37619078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 288 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 22171135 - 22170807
Alignment:
Q  288 aatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 387  Q
    |||||||||||| ||  || | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||    
T  22171135 aatgggagcttctacggtgcaattagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaatta 22171036  T
Q  388 atgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 487  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22171035 atgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgata 22170936  T
Q  488 ttatgtgatagtcttaagtgttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattg 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||                 || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  22170935 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattg 22170836  T
Q  571 atgatactatgaggactgaacttttgatg 599  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22170835 atgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Original strand, 1359740 - 1359914
Alignment:
Q  341 tttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatat 440  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||  |    
T  1359740 tttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggt 1359839  T
Q  441 actatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1359840 actattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactt 1359914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 440 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 48620900 - 48620631
Alignment:
Q  440 tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgttacacttaaaacaaggtagggta 531  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||    |||      |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48620900 tactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggata 48620801  T
Q  532 aaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcacta 631  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |    
T  48620800 aaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaa 48620701  T
Q  632 cacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||||||||  |||| |||  ||||||| |||||||||||| | || |||| |  || |||||||||||    
T  48620700 cacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttcaacatagaattttcctt 48620631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 308 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21290004 - 21289817
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21290004 agttaaaaaactgacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatc 21289905  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 498  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  21289904 tagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 31963010 - 31962851
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaa-ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  31963010 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgct 31962911  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacata 477  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  31962910 tgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaacata 31962851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 551 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289661
Alignment:
Q  551 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactt-------ttgatac 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||       || ||      
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  644 tatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacaatagatttttcc 21289661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38759847 - 38759730
Alignment:
Q  398 ttaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata 497  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38759847 ttaattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgata 38759748  T
Q  498 gtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38759747 gtctcaagtgttacactt 38759730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1065 - 1139
Target Start/End: Complemental strand, 26973235 - 26973161
Alignment:
Q  1065 ttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttactatgatatgttgagaaaaagcaagttctgtctttgtcccagtg 1139  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26973235 ttcaaaagtatcttccaaagggtgtttcttactatgaaatgctgagaaagagcaagttctgtctctgtcctagtg 26973161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48620982 - 48620922
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgatt 379  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  48620982 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgatt 48620922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26973889 - 26973807
Alignment:
Q  63 atcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggt 145  Q
    ||||||||| || | | ||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  26973889 atcaatgtcattgctggaaaatatccatattggaatagaagccttggagctgatcatttcatgctagcttgccatgactgggt 26973807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 653 - 701
Target Start/End: Original strand, 4150489 - 4150537
Alignment:
Q  653 gacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  4150489 gacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 4150537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 319 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38759883 - 38759847
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgtt 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38759883 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtt 38759847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 654 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 43579287 - 43579242
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  43579287 acttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 43579242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Original strand, 11357169 - 11357534
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11357169 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 11357268  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357269 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 11357368  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-gg 617  Q
    | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  11357369 ataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtggg 11357468  T
Q  618 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357469 ggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 11357534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 325 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 22451350 - 22450954
Alignment:
Q  325 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 424  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22451350 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaaca 22451251  T
Q  425 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtg 507  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||                 |||    
T  22451250 tcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtg 22451151  T
Q  508 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 607  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22451150 ttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccata 22451051  T
Q  608 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 704  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22451050 caaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccttaat 22450954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 290 - 701
Target Start/End: Original strand, 33378544 - 33378969
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| || ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  33378544 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaat 33378643  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33378644 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagatt 33378743  T
Q  490 atgtgatagtcttaagt-----------------gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 572  Q
    ||| |||||||||||||                 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378744 atgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 33378843  T
Q  573 gatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 672  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  33378844 aatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttcac---aaaagtcat 33378940  T
Q  673 tctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||||| ||||  | || |||||||||||    
T  33378941 tctcataactttgccatagaattttcctt 33378969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 308 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 48355340 - 48354930
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  48355340 agttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatc 48355241  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355240 tagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 48355141  T
Q  508 ttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
    ||||||                 ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48355140 ttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaa 48355041  T
Q  591 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatg 690  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||     
T  48355040 cttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccata 48354941  T
Q  691 gaattttcctt 701  Q
    |||||||||||    
T  48354940 gaattttcctt 48354930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 312 - 683
Target Start/End: Original strand, 43975673 - 43976054
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43975673 agaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 43975772  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgca---aacatagttgatgatattatgtgatagtctta----- 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||| |||         
T  43975773 aatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagtgttacactt 43975872  T
Q  504 -----agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 598  Q
          ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  43975873 tctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgat 43975972  T
Q  599 gccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    | || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||    
T  43975973 gtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgactt---caaaaaagtcattctcatgactt 43976054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Original strand, 52040710 - 52041092
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  52040710 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgttt 52040809  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg----------- 507  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||               
T  52040810 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgt 52040909  T
Q  508 ------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52040910 ggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcc 52041009  T
Q  602 accgtacaaaca-gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||  ||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52041010 actatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 52041092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 315 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 40936365 - 40935993
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40936365 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 40936266  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40936265 gcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 40936166  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 614  Q
    ||||| || || || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||     
T  40936165 taaaa-aaagttggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaa 40936067  T
Q  615 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaa 688  Q
    || ||||  |||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40936066 tgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcacaa 40935993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 314 - 697
Target Start/End: Original strand, 46297545 - 46297945
Alignment:
Q  314 aaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46297545 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 46297644  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------- 504  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||             
T  46297645 tgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 46297744  T
Q  505 --------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
            |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  46297745 tttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttg 46297844  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 696  Q
    | ||||  ||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  46297845 acgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 46297944  T
Q  697 t 697  Q
    |    
T  46297945 t 46297945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 291 - 700
Target Start/End: Original strand, 26941020 - 26941446
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26941020 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 26941119  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26941120 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 26941219  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    | ||||||| ||||||||||||                 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  26941220 tatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatg 26941319  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  26941320 ataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 26941419  T
Q  674 ctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    || ||||||| || || ||||||||||    
T  26941420 cttatgacttcaccatagaattttcct 26941446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 4015847 - 4015451
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4015847 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 4015748  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||                  
T  4015747 gcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgt 4015649  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4015648 ggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 4015549  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||  |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  4015548 actctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 4015451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 315 - 676
Target Start/End: Original strand, 44186301 - 44186663
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44186301 aaattgattttttcgaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 44186400  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag-tcttaagtgttacac 513  Q
    |||||||| ||||| |||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |   ||||||||     
T  44186401 gcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagttgtggggtgttacat 44186500  T
Q  514 ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaaca 613  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  44186501 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaaca 44186600  T
Q  614 gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc 676  Q
    | ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  44186601 gcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 44186663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 37203456 - 37203058
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37203456 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 37203357  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-- 515  Q
    || | || |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  37203356 gcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 37203257  T
Q  516 ---------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
                   |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37203256 tggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 37203157  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||| ||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  37203156 cactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37203058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Original strand, 53228944 - 53229322
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53228944 ttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaa 53229043  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt---------------- 506  Q
     |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||                    
T  53229044 catcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 53229143  T
Q  507 -gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  53229144 agttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactg 53229243  T
Q  606 tacaaacagtg-gggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||| || |||||   ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | ||| |||||||||    
T  53229244 tacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgactt 53229322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Original strand, 40552047 - 40552445
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40552047 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgctt 40552146  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 512  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||          
T  40552147 gcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgt 40552246  T
Q  513 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
               |||| |||||| || | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  40552247 gggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtc 40552346  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |  |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  40552347 attgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 40552445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 319 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 39283040 - 39282641
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39283040 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgctt 39282941  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  39282940 gcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 39282841  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39282840 ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgcc 39282741  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    || ||| ||||||||||||   |||||| ||| |||||||  ||||||||  | || | ||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  39282740 actgtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 39282642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 37158096 - 37157699
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37158096 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 37157997  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------- 504  Q
    || | || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||                 
T  37157996 gcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 37157897  T
Q  505 ----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
        ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37157896 tggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgc 37157797  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || ||||| |||| ||||||||| || || |||||||||    
T  37157796 cactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattttcc 37157699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 315 - 651
Target Start/End: Original strand, 42505859 - 42506212
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42505859 aaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 42505958  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  42505959 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 42506058  T
Q  513 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                   |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506059 ttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 42506158  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 651  Q
    || ||  ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  42506159 tgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgt 42506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 319 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 21193995 - 21193594
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  21193995 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggtt 21193896  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| |||||| ||||||   |||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |                  
T  21193895 gcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatccttta 21193796  T
Q  505 ----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  21193795 tggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgt 21193696  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  21193695 cactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcct 21193596  T
Q  701 ta 702  Q
    ||    
T  21193595 ta 21193594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 29099730 - 29099362
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29099730 ttttttgaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaa 29099631  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt----ctt----aagtgttacact 514  Q
     |||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||    |||      ||||||||||    
T  29099630 catcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaagttacactttgtggggtgttacact 29099531  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 614  Q
    ||||| |||| | | |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  29099530 taaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacag 29099431  T
Q  615 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29099430 tggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgactt 29099362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 319 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 2008327 - 2007972
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattg-------ctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2008327 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagt 2008228  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2008227 aatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttac 2008128  T
Q  512 ----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 595  Q
                    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  2008127 actttgtggagtgtacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaactttt 2008028  T
Q  596 gatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 651  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||||||    
T  2008027 gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgt 2007972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 359 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 34133283 - 34132924
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  34133283 ttcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggca 34133184  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagatt 541  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  34133183 tctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatatt 34133084  T
Q  542 aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 641  Q
    ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  34133083 aagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgat 34132984  T
Q  642 actatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  34132983 actatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctt 34132924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 315 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3362647 - 3362276
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3362647 aaattgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaat 3362548  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--- 511  Q
    |||||||| || ||||||||  |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  3362547 gcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacact 3362448  T
Q  512 --------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagatta--agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 595  Q
                  |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3362447 ttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaactttt 3362348  T
Q  596 gatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 667  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||| | || |||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  3362347 gatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 3362276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 282 - 652
Target Start/End: Original strand, 21009552 - 21009940
Alignment:
Q  282 ttaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgc 381  Q
    |||||||||||||| ||| ||  || ||| || ||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  21009552 ttaattaatgggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac 21009651  T
Q  382 tgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 480  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  21009652 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgtt 21009751  T
Q  481 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||| |||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  21009752 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctga 21009851  T
Q  564 tgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 652  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  21009852 tgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtc 21009940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 323 - 700
Target Start/End: Original strand, 7327274 - 7327669
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7327274 ttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 7327373  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt------- 515  Q
     ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||           
T  7327374 catcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 7327473  T
Q  516 ----------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
               ||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  7327474 tgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactg 7327573  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtg-tcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |||||| | ||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  7327574 tacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcct 7327669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 321 - 701
Target Start/End: Original strand, 4761438 - 4761838
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  4761438 actttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgc 4761537  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------------- 504  Q
    || || ||||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                    
T  4761538 aacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgg 4761637  T
Q  505 --gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
      |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4761638 gggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 4761737  T
Q  603 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc--agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
      ||||||||||||  |||  ||||| |||| |||||||| |||||| |  ||||||||  | |||||||| |||||||| || || || ||||||||||    
T  4761738 ttgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattttcct 4761837  T
Q  701 t 701  Q
    |    
T  4761838 t 4761838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 312 - 641
Target Start/End: Original strand, 24707896 - 24708242
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| |    
T  24707896 agaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaat 24707995  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa------- 504  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||           
T  24707996 aatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttac 24708095  T
Q  505 ----------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagat--taagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 592  Q
              ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24708096 actttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaact 24708195  T
Q  593 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 641  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||| ||||  ||||||| || |||||||    
T  24708196 tttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcactgcagttttgat 24708242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Original strand, 22445853 - 22446234
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  22445853 tgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatactt 22445952  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtct----------------t 502  Q
    |||| || ||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||                |    
T  22445953 gcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt 22446052  T
Q  503 aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-ggactgaacttttgatgcc 601  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22446053 gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgcc 22446152  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || ||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||  |||| |||  |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  22446153 actgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgactt 22446234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 25580131 - 25579746
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25580131 aaattgacttttttaaaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 25580032  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||| || ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25580031 gcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacact 25579932  T
Q  515 t-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
    |                 ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25579931 ttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttga 25579832  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || ||| ||| ||| ||| |  ||  | |||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25579831 tgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataactt 25579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 44891885 - 44891514
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44891885 tgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgctt 44891786  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||| |||||  |  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  44891785 gcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 44891686  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44891685 ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc 44891586  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
             |||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44891585 ---------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaagtcattttcatgactt 44891514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 319 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 33698541 - 33698265
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698541 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 33698442  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||           
T  33698441 gcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgt 33698342  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 578  Q
              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698341 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 315 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 47481915 - 47481511
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47481915 aaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 47481816  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 512  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||  |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47481815 tgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 47481716  T
Q  513 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
                    |||| || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  47481715 tttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttg 47481616  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 696  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||  ||||||  ||||||| || ||  |||||    
T  47481615 atgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaacatcattcctatgacttcaccataaaattt 47481516  T
Q  697 tcctt 701  Q
    |||||    
T  47481515 tcctt 47481511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 323 - 576
Target Start/End: Original strand, 22622510 - 22622780
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22622510 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 22622609  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 505  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  22622610 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtgggg 22622709  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 576  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22622710 tgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 32373853 - 32373479
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || |   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32373853 ttttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaa 32373755  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag----------------- 505  Q
     ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||                     
T  32373754 catcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtggga 32373655  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||| |    
T  32373654 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactg 32373555  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||||| ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |   |||||||||||||||||||||    
T  32373554 tacaaacagtggagt--tactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttattggaaaagtcattctcatgactt 32373479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 312 - 700
Target Start/End: Original strand, 3654980 - 3655388
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttc-atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcat--ct 408  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||    
T  3654980 agaaaactgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatct 3655079  T
Q  409 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 508  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3655080 agtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgt 3655179  T
Q  509 taca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 591  Q
    ||||                 |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3655180 tacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 3655279  T
Q  592 ttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatgg 691  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  |||| | || |||||||||| | ||||||| || ||      
T  3655280 ttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgacttcaccataa 3655379  T
Q  692 aattttcct 700  Q
    |||||||||    
T  3655380 aattttcct 3655388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 319 - 640
Target Start/End: Original strand, 14586468 - 14586796
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14586468 tgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgctt 14586567  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtctt----aagtgtta 510  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    ||| ||  |||      ||||||    
T  14586568 gcaacatcttggacttac-cgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacgagtgttacactttgtggggtgtta 14586666  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 610  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  ||| ||| ||    
T  14586667 cacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataa 14586766  T
Q  611 acagtggggtgccactcactacacttttga 640  Q
    | |||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  14586767 atagtgaggtgttactcacaacacttttga 14586796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 315 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 54506200 - 54505823
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  54506200 aaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 54506101  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 512  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54506100 tgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 54506001  T
Q  513 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
                    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  54506000 tttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttg 54505902  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 675  Q
    ||| ||   || ||| | |||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  54505901 atgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattct 54505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1090081 - 1089886
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1090081 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 1089982  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089981 gcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactt 1089886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 599
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994746
Alignment:
Q  360 tcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcat 459  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || ||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  460 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt-----------------gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagatta 542  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatta 46994689  T
Q  543 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 599  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46994690 agtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 46994746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 11467198 - 11466814
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||       ||    
T  11467198 tgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatcta-------tt 11467113  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt--- 515  Q
    |||| ||||| ||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  11467112 gcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 11467013  T
Q  516 --------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
                  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11467012 ggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgcc 11466913  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    || |||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||  |||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  11466912 actgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctcaagacttcaccatagaattttcct 11466814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Original strand, 24488745 - 24489131
Alignment:
Q  315 aaattgactttt-ttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24488745 aaattgacttttatttaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaa 24488844  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------- 504  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||             
T  24488845 tgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacac 24488944  T
Q  505 --------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
            |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24488945 cttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttg 24489044  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||| ||  || ||||||||||  ||  |||||| ||| |||| |||||||||| |  ||||||| | |||| ||||| || ||||||    
T  24489045 atgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcattttcgtgactt 24489131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 319 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 29164190 - 29163912
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29164190 tgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 29164098  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgtta 510  Q
    | || ||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||    |||      ||||||    
T  29164097 gtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 29163998  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29163997 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 27480142 - 27480350
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||| |||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27480142 aaattgattttttttaaaaatataattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 27480241  T
Q  415 gcttgcaaa----atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac----atagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 506  Q
    | ||| ||     || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27480242 gtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagt 27480341  T
Q  507 gttacactt 515  Q
    |||||||||    
T  27480342 gttacactt 27480350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 505 - 683
Target Start/End: Original strand, 27480370 - 27480548
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27480370 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcacc 27480469  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||  |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||    
T  27480470 gtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgactt 27480548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 392 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174516
Alignment:
Q  392 tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  492 gtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
     | |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||| ||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg 45174622  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccact--cactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtca 671  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||  |||  ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  45174621 atactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtta 45174522  T
Q  672 ttctca 677  Q
    ||||||    
T  45174521 ttctca 45174516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 359 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 38592046 - 38591786
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  38592046 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtca 38591947  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-----------------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagatt 541  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  38591946 tctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagatt 38591847  T
Q  542 aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  38591846 aagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgcca 38591786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 312 - 503
Target Start/End: Original strand, 51212558 - 51212743
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51212558 agaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagt 51212651  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta 503  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51212652 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagcctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 505 - 699
Target Start/End: Original strand, 51212972 - 51213166
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  51212972 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccatt 51213071  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||  || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  51213072 gtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 51213166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 505 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 35844512 - 35844315
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 603  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  35844512 gtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcac 35844413  T
Q  604 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
     |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35844412 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 35844315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 11356946 - 11357134
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||        |||||||    
T  11356946 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaatt--------aatgctt 11357037  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11357038 gcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactt 11357134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 376 - 599
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828786
Alignment:
Q  376 gattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaaca 475  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  476 tagttgatgatattatgtgatagtcttaag-----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaa 558  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||                 ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttca 54828745  T
Q  559 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 599  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  54828746 tatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatg 54828786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 36012528 - 36012333
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaa-ttttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36012528 tgacttttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 36012429  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||  || |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36012428 tgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca 36012333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 401 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348327
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  501 ttaagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 583  Q
    ||||||||                 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaa 43348365  T
Q  584 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 621  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  43348364 gactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtg 43348327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 20373051 - 20373228
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||              
T  20373051 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatct---------- 20373140  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
             |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20373141 ---------tggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 20373228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 518 - 683
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373465
Alignment:
Q  518 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 617  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  618 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||  ||||  |||| |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 20373465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 326 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 50475199 - 50475021
Alignment:
Q  326 tttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgat-------caatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50475199 tttgaaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgctt 50475100  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata 497  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  50475099 gcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 504 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 53176240 - 53176127
Alignment:
Q  504 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 603  Q
    ||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  53176240 agtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttat 53176141  T
Q  604 cgtacaaacagtgg 617  Q
     |||||||||||||    
T  53176140 tgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 588
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835702
Alignment:
Q  392 tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 491  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||      ||||||| | |||||||||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  492 gtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaa-attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    ||||||||||||| ||||||||||                 ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatg 11835687  T
Q  574 atactatgaggactg 588  Q
    |||||||| ||||||    
T  11835688 atactatggggactg 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  394 aatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 493  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgt 53811692  T
Q  494 gatagtctt 502  Q
    |||||||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 613
Target Start/End: Original strand, 53811696 - 53811767
Alignment:
Q  548 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg------actgaacttttgatgccaccgtacaaaca 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53811696 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggttatatactgaacttttgatgccactgtacaaaca 53811767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35844639 - 35844577
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttga 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35844639 aaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 516 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 36012312 - 36012244
Alignment:
Q  516 aaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 583  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36012312 aaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 654 - 701
Target Start/End: Original strand, 40640637 - 40640684
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  40640637 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 40640684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 146
Target Start/End: Original strand, 36806094 - 36806159
Alignment:
Q  81 aaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggta 146  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36806094 aaatatgcatattggaatagaagttatggagctgatcatttcatgctttcttgtcatgattgggta 36806159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 147
Target Start/End: Original strand, 49301577 - 49301631
Alignment:
Q  93 tggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggtaa 147  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49301577 tggaacagaactcatggtgctgaccacttcatgcttgcttgccatgattgggtaa 49301631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176246
Alignment:
Q  477 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 53176246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 635 - 701
Target Start/End: Original strand, 55343405 - 55343471
Alignment:
Q  635 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||    
T  55343405 ttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctt 55343471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 698
Target Start/End: Original strand, 11835702 - 11835790
Alignment:
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 698  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||     ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  11835702 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgata-----gtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttc 11835790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13498731 - 13498678
Alignment:
Q  293 gagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgat 346  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13498731 gagcttctacagtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgat 13498678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34133357 - 34133312
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatg 353  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34133357 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatg 34133312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36515132 - 36515067
Alignment:
Q  81 aaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggta 146  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36515132 aaatatgcttattggaatagaagttatggagctgaccatttcatgctttcttgtcatgattgggta 36515067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 291 - 699
Target Start/End: Original strand, 28002772 - 28003197
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28002772 gggagcttctacactgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatg 28002871  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28002872 atcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 28002971  T
Q  491 tgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    ||||||||| ||||                 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28002972 tgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatg 28003071  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28003072 atactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcatt 28003171  T
Q  674 ctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||||||||| || || |||||||||    
T  28003172 ctcatgacttcaccatagaattttcc 28003197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 308 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 32579854 - 32579466
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32579854 agttagaaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatc 32579755  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--- 504  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||       
T  32579754 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagag 32579655  T
Q  505 --------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
                  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  32579654 ttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaa 32579556  T
Q  591 cttttgatgccaccgt---acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctca 677  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32579555 cttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtgctactcactgcacttttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctca 32579466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 320 - 683
Target Start/End: Original strand, 5047781 - 5048160
Alignment:
Q  320 gacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttg 419  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||    
T  5047781 gacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttg 5047880  T
Q  420 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg------------ 507  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||                
T  5047881 caacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcg 5047980  T
Q  508 ----ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 603  Q
        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||     
T  5047981 ggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcat 5048080  T
Q  604 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5048081 cgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataactt 5048160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 291 - 701
Target Start/End: Original strand, 35020817 - 35021248
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35020817 gggagcttctacggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatg 35020916  T
Q  391 atcaatat----taattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 486  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35020917 atcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 35021016  T
Q  487 attatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  35021017 attatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaatt 35021116  T
Q  570 gatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagt 669  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||||||||||||    
T  35021117 gatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagt 35021216  T
Q  670 cattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35021217 cattttcatgacttcaccatagaattttcctt 35021248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 289 - 699
Target Start/End: Original strand, 19089237 - 19089664
Alignment:
Q  289 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    ||||||||||| ||  || ||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19089237 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaa 19089336  T
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19089337 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatat 19089436  T
Q  489 tatgtgatagtcttaagtgttacact-----------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||                 || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19089437 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 19089536  T
Q  572 tgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtca 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| || |||||| |    
T  19089537 tgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagtta 19089636  T
Q  672 ttctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||| ||||||| || || |||||||||    
T  19089637 ttcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 315 - 697
Target Start/End: Original strand, 36493499 - 36493897
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36493499 aaattgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaat 36493598  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg------- 507  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||           
T  36493599 gcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 36493698  T
Q  508 ---------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 598  Q
             ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36493699 ttgtggagtttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgat 36493798  T
Q  599 gccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    | ||| ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| || || |||||||    
T  36493799 gtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttt 36493897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 308 - 701
Target Start/End: Original strand, 25700859 - 25701270
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  25700859 agttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatc 25700958  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag-- 505  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||      
T  25700959 taacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtg 25701058  T
Q  506 ----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 589  Q
                    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701059 ttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 25701158  T
Q  590 acttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaat 689  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||| |||  |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  25701159 acttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgacttcaccat 25701258  T
Q  690 ggaattttcctt 701  Q
      ||||||||||    
T  25701259 aaaattttcctt 25701270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 312 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 25184517 - 25184112
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25184517 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 25184418  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25184417 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttac 25184318  T
Q  512 a-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 594  Q
    |                 |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  25184317 actttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaacttt 25184218  T
Q  595 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaat 694  Q
     |||| ||  ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  25184217 ggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaat 25184118  T
Q  695 tttcct 700  Q
    ||||||    
T  25184117 tttcct 25184112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 49376364 - 49375982
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49376364 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctt 49376265  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||           
T  49376264 tcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgt 49376165  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49376164 ggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgcc 49376065  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccag-aaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49376064 actgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgactt 49375982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 335 - 683
Target Start/End: Original strand, 34947925 - 34948292
Alignment:
Q  335 gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34947925 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 34948024  T
Q  435 acatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------------gtgttacactt 515  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                   ||||| |||||    
T  34948025 acatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactt 34948124  T
Q  516 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt 615  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34948125 taaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagt 34948224  T
Q  616 ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34948225 ggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgactt 34948292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Original strand, 55240919 - 55241315
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  55240919 tgacttttttgaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgttt 55241018  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||                  
T  55241019 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 55241118  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55241119 gaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctt-atctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcc 55241217  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    || |||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  55241218 actgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 55241315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7703906 - 7703533
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7703906 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgctt 7703807  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                  
T  7703806 gcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgt 7703707  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  7703706 ggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactatggggactgaacttttgatgtc 7703615  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703614 accgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 7703533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 315 - 700
Target Start/End: Original strand, 37663551 - 37663951
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37663551 aaattgacttttttaataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37663650  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  37663651 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 37663750  T
Q  513 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                   |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663751 ttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 37663850  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    || ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||    ||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||||    
T  37663851 tgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaatttt 37663948  T
Q  698 cct 700  Q
    |||    
T  37663949 cct 37663951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 336 - 702
Target Start/End: Original strand, 55477722 - 55478109
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55477722 ttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 55477821  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaa 518  Q
     || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |                 |||||||||||| |    
T  55477822 aatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttata 55477921  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt----acaaacag 614  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    ||||||||    
T  55477922 acaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacag 55478021  T
Q  615 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 702  Q
    ||| |||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  55478022 tggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctta 55478109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 289 - 683
Target Start/End: Original strand, 19440432 - 19440843
Alignment:
Q  289 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    ||||||||||| ||  || ||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19440432 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaa 19440531  T
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19440532 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 19440631  T
Q  489 tatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 571  Q
    ||||| |||  |||||                 ||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19440632 tatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 19440731  T
Q  572 tgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtca 671  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||  | ||| |||| |||||||  ||||||||  || |||||| ||||||||    
T  19440732 tgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtca 19440831  T
Q  672 ttctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||    
T  19440832 ttctcatgactt 19440843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 319 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 33341795 - 33341397
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33341795 tgacttttttaaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 33341696  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  33341695 acaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 33341596  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33341595 gaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgcc 33341497  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcacta----cacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    || |||||||||||||||||   ||| | |    || |||||||  ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  33341496 actgtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaatttt 33341397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 319 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 23761468 - 23761089
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23761468 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgctt 23761369  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| |||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||                  
T  23761368 gcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttat 23761269  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23761268 gaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtc 23761170  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgact 682  Q
    ||  ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23761169 actatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttacaagaatagtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 37776059 - 37775685
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37776059 aaattgacttttttaaaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37775960  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 506  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||    
T  37775959 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggt 37775860  T
Q  507 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 606  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||| ||    
T  37775859 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgt 37775762  T
Q  607 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||| |||||||   ||||||||| |||| ||||| | |||||||    
T  37775761 acaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgactt 37775685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 315 - 701
Target Start/End: Original strand, 29584010 - 29584411
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29584010 aaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 29584109  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 504  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||              
T  29584110 gcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 29584209  T
Q  505 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
           |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29584210 tcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttga 29584309  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||||  |||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  29584310 tgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaatttt 29584407  T
Q  698 cctt 701  Q
    ||||    
T  29584408 cctt 29584411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 319 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 47254137 - 47253751
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47254137 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 47254038  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  47254037 gcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 47253938  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47253937 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 47253846  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    || ||| ||||| | |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  47253845 actgtataaacaat-gggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 47253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 321 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 50765115 - 50764748
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50765115 acttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 50765016  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact------ 514  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||| ||||          
T  50765015 aacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtgg 50764916  T
Q  515 --taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 612  Q
      |   || | ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50764915 ggtgttac-acgtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaac 50764817  T
Q  613 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||    ||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  50764816 agtggggtgttactcacaacacttttgat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgactt 50764748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 312 - 683
Target Start/End: Original strand, 879355 - 879743
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  879355 agaaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagt 879454  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa------- 504  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           
T  879455 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttac 879554  T
Q  505 ----------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 594  Q
              ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||    
T  879555 actttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttt 879654  T
Q  595 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||| ||  ||||||||| || ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  879655 tgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgactt 879743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 290 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 6864461 - 6864053
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6864461 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 6864362  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6864361 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatatt 6864262  T
Q  490 atgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 572  Q
    |||||||||||||||                 ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  6864261 atgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgat 6864162  T
Q  573 gatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 672  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||| || ||  | ||| || | |||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  6864161 gatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcat 6864062  T
Q  673 tctcatgac 681  Q
    |||||||||    
T  6864061 tctcatgac 6864053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 282 - 701
Target Start/End: Original strand, 30002418 - 30002837
Alignment:
Q  282 ttaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgc 381  Q
    |||||| ||||||||||| ||  || |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  30002418 ttaatttatgggagcttctacggtgcagttatgaaattgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattac 30002517  T
Q  382 tgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttg 481  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30002518 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttg 30002617  T
Q  482 atgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
     |||||| ||||||    ||  |||      ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||        |||||    
T  30002618 ctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatg 30002709  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| |||||    
T  30002710 atactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 30002809  T
Q  674 ctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
     | ||||||| || || || ||||||||    
T  30002810 ttaatgacttcaccatagagttttcctt 30002837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 401 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011852
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  501 ttaag-----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 583  Q
    |||||                 |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggg 38011970  T
Q  584 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38011969 gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgattt 38011870  T
Q  684 gacaatggaattttcctt 701  Q
     || || |||||||||||    
T  38011869 caccatagaattttcctt 38011852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 33816330 - 33816526
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33816330 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 33816429  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33816430 gcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 33816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Original strand, 46887972 - 46888352
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46887972 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 46888071  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta--------------- 503  Q
    | || |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |                   
T  46888072 gtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtctaagtgttacgttttgtg 46888171  T
Q  504 -agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
      ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||     
T  46888172 gggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccg 46888271  T
Q  603 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    | ||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||  |||||| |  |||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  46888272 ctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaaagttattttcttgactt 46888352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 4598379 - 4598009
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4598379 tgactttttgtaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgctt 4598280  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 510  Q
    |||| |||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||||||    
T  4598279 gcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 4598180  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 610  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4598179 cacttaaaacaa-gcaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaa 4598081  T
Q  611 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598080 acagtggggtgttactcacaacac-tttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgactt 4598009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 314 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 32592486 - 32592103
Alignment:
Q  314 aaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  32592486 aaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaa 32592387  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtctt----aag 505  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||    ||| ||  |||      |    
T  32592386 tgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatgagtgttacactttgtgggg 32592287  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||      
T  32592286 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcacta 32592187  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaat 689  Q
    |||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    
T  32592186 tacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttcacaat 32592103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 319 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 17168110 - 17167739
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  17168110 tgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgctt 17168011  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  17168010 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 17167911  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  17167910 ggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtc 17167811  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    |  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  17167810 attgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17167739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 319 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 17173687 - 17173316
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  17173687 tgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgctt 17173588  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  17173587 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 17173488  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  17173487 ggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtc 17173388  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    |  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  17173387 attgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17173316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 312 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 1815704 - 1815409
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1815704 agaaaattgactttttaaaaaag-ttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagt 1815606  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815605 aatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 1815506  T
Q  512 a-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 591  Q
    |                 |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815505 actttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Original strand, 34361305 - 34361704
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34361305 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgct 34361404  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca----- 512  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||         
T  34361405 tgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttg 34361504  T
Q  513 ------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
                |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||     
T  34361505 tagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgt 34361603  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  34361604 cattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcct 34361703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Original strand, 32912393 - 32912793
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgct 417  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32912393 tgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgct 32912492  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca----- 512  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  32912493 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 32912592  T
Q  513 ------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
                |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||      
T  32912593 tagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatat 32912692  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    ||   |||||| | | |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  32912693 cattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcct 32912792  T
Q  701 t 701  Q
    |    
T  32912793 t 32912793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 330 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 27397000 - 27396613
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 429  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  27397000 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 27396903  T
Q  430 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-----------------taca 512  Q
    |||||| |  ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| |||||||||||                 ||||    
T  27396902 gacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttaca 27396803  T
Q  513 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 612  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||    
T  27396802 cttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaac 27396703  T
Q  613 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 702  Q
    ||| |||||  |||||  |||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  27396702 agtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttctta 27396613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 319 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 9139624 - 9139241
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9139624 tgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgctt 9139527  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt----aagtgttacact 514  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||   | || ||| ||| ||  |||      |||||||| |    
T  9139526 gcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagt---ttatcttaagtgttacactttgtagggtgttacagt 9139430  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 614  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||| |    
T  9139429 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacgg 9139330  T
Q  615 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 705  Q
    |||||||  |||||||  | |||| || |||||  ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||    
T  9139329 tggggtgttactcact--attttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattttccttaatt 9139241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3043020 - 3042820
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3043020 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaat 3042921  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042920 gcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 3042821  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  3042820 t 3042820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 37288126 - 37287732
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttga-tcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  37288126 tgacttttttgaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgct 37288027  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt--------- 508  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||             
T  37288026 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttg 37287927  T
Q  509 ---------tacacttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 598  Q
             |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||        | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37287926 tgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------ttatgatattatgaggattgaacttttgat 37287835  T
Q  599 gccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  37287834 gccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctcattacttcaccatagaatttt 37287735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 319 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 50697639 - 50697320
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50697639 tgacttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 50697540  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca-tgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------- 504  Q
     ||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 
T  50697539 acaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttg 50697440  T
Q  505 ----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
        ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||     
T  50697439 tgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgt 50697341  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggtg 621  Q
    ||  |||||||| || |||||    
T  50697340 cattgtacaaacggtagggtg 50697320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 7152011 - 7152214
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7152011 agaaaactgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaat 7152110  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  7152111 aatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttat 7152210  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  7152211 actt 7152214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 505 - 683
Target Start/End: Original strand, 33816550 - 33816728
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33816550 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccacc 33816649  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33816650 gtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 33816728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 315 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 42200131 - 42199723
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  42200131 aaattgacctttttgaaaaagttaattt-gattttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaa 42200033  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacata-tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42200032 tgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 42199933  T
Q  513 -----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 595  Q
                     |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42199932 ctttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttt 42199833  T
Q  596 gatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatt 695  Q
     ||| ||   |||||| | ||||||   ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||| |||| || || || || ||    
T  42199832 tatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgatttcaccatagattt 42199733  T
Q  696 ttccttaatt 705  Q
    ||||| ||||    
T  42199732 ttcctaaatt 42199723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 315 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 17272365 - 17272068
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17272365 aaattgacttatttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 17272266  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 504  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||              
T  17272265 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 17272166  T
Q  505 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
           |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  17272165 tcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta----gactgaacttttga 17272070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 440 - 700
Target Start/End: Original strand, 35025531 - 35025800
Alignment:
Q  440 tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaa 522  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||                 |||||||    
T  35025531 tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaa 35025630  T
Q  523 ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgc 622  Q
    | |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  35025631 gataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgat--------gatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgc 35025722  T
Q  623 cactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  35025723 tactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcagcatagaattttcct 35025800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 319 - 645
Target Start/End: Original strand, 4934026 - 4934360
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaa-ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||     
T  4934026 tgacttttttgaacaagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcg 4934125  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-- 515  Q
    ||||| ||           |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  4934126 tgcaacat-----------aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttg 4934214  T
Q  516 ---------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
                   ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4934215 tgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgc 4934314  T
Q  601 caccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatacta 645  Q
    ||  ||||||||| | ||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  4934315 cagtgtacaaacaatgggggtgttactcactacattttttatacta 4934360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 319 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 39400405 - 39400236
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39400405 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgctt 39400306  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    |||| |||||| ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400305 gcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26896489 - 26896288
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26896489 aaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 26896390  T
Q  414 tgcttgcaaaatctt-ggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    || |||||| || || |||||||||  |||||||| |||||||  || ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26896389 tgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttaca 26896291  T
Q  513 ctt 515  Q
    |||    
T  26896290 ctt 26896288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 319 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4205381 - 4205216
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  4205381 tgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgctt 4205282  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatg 484  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205281 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 319 - 454
Target Start/End: Original strand, 35025381 - 35025515
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35025381 tgacttttatgaaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 35025479  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgtt 454  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35025480 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 323 - 512
Target Start/End: Original strand, 46883932 - 46884116
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46883932 ttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 46884031  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
     |||  ||||||||  ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46884032 catc--ggacttac--atactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-ttaagtgttaca 46884116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 505 - 674
Target Start/End: Original strand, 54499254 - 54499425
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 603  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||     
T  54499254 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcat 54499353  T
Q  604 c-gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 674  Q
      |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  54499354 tagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 319 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23431952 - 23431834
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23431952 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgctt 23431853  T
Q  419 gcaaaatcttggacttaca 437  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  23431852 gcaacatcttggacttaca 23431834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 323 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38012655 - 38012568
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38012655 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 505 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 39398103 - 39397918
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||         ||||||||||  || |||||||||||||||| |||     
T  39398103 gtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaacttttgatgtcact 39398013  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  39398012 gtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 39397918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 654 - 703
Target Start/End: Original strand, 38812263 - 38812312
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  38812263 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaa 38812312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 605 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 4205210 - 4205114
Alignment:
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||||||||||||||||  | |||  ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||    
T  4205210 gtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttcctt 4205114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaaca 475  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 633 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 17272077 - 17272008
Alignment:
Q  633 acttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 702  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  17272077 acttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctta 17272008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 521 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 3042797 - 3042741
Alignment:
Q  521 aaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 577  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3042797 aaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatac 3042741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 697
Target Start/End: Original strand, 20097494 - 20097537
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  20097494 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 20097537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 654 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 2704557 - 2704508
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 703  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  2704557 acttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttccttaa 2704508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 624 - 701
Target Start/End: Original strand, 7152242 - 7152319
Alignment:
Q  624 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||||||| |||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||    
T  7152242 actcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaattttcctt 7152319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 654 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 38811858 - 38811813
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  38811858 acttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38811813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 308 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 33908640 - 33908249
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  33908640 agttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atc 33908542  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33908541 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtg 33908442  T
Q  508 ttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
    ||||||                 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33908441 ttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaa 33908342  T
Q  591 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33908341 cttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgactt 33908249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 323 - 699
Target Start/End: Original strand, 14409123 - 14409501
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  14409123 ttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaa 14409222  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag---tgttacacttaaaa 519  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||    
T  14409223 catcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagtagttacacttaaaa 14409322  T
Q  520 caaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgggg 619  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  14409323 caaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgccaccgtattaagagtgggg 14409421  T
Q  620 tgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  14409422 tgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 14409501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 24886484 - 24886100
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24886484 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 24886385  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24886384 gcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttata 24886285  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 618  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  24886284 ataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggg 24886185  T
Q  619 gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc--agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||    
T  24886184 gtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatgatttcaccataaaattttcctt 24886100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 699547 - 699166
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  699547 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgctt 699448  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta--------------- 503  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  699447 gcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgt 699348  T
Q  504 --agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
      |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  699347 ggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtc 699248  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  699247 actgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataactt 699166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22981190 - 22980809
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22981190 tgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgatt 22981091  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt---------- 508  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  22981090 gcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt 22980991  T
Q  509 -------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22980990 gaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtc 22980891  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |  |  |||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22980890 attgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 22980809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Original strand, 31786424 - 31786821
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31786424 tgacttttttgaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgctt 31786523  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||                  
T  31786524 gcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt 31786623  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31786624 agggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgcc 31786723  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    || |||||||||||||||     ||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||||||    
T  31786724 actgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttcc 31786821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 365 - 700
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429321
Alignment:
Q  365 tttaaattgttga---ttgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatct 461  Q
    |||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  462 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 561  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  1429083 ttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaattt 1429182  T
Q  562 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 661  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  1429183 gatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcacc 1429282  T
Q  662 agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    | || ||||||| ||||||||| || || || |||||||    
T  1429283 aaaagagtcattttcatgacttcaccatagatttttcct 1429321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 291 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 40133810 - 40133385
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  40133810 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 40133711  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40133710 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatta 40133611  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    ||||||||| |||||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||    
T  40133610 tgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttg 40133511  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  40133510 atattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcatt 40133411  T
Q  674 ctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
     || |||||| || || |||||||||    
T  40133410 ttcgtgacttcaccatagaattttcc 40133385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 19120256 - 19119857
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19120256 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 19120157  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||| |||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  19120156 gcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 19120057  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  19120056 ggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtc 19119957  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    || |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  19119956 actgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 19119857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 323 - 701
Target Start/End: Original strand, 38528019 - 38528413
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38528019 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 38528118  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 505  Q
     ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  38528119 catcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 38528218  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  38528219 tgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgtcactg 38528317  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    || ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| |||||||  |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  38528318 tataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcctt 38528413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 291 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 36867187 - 36866762
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  36867187 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 36867088  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36867087 attaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatta 36866988  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    ||||||||| |||||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||    
T  36866987 tgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttg 36866888  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| | | |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  36866887 atactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 36866788  T
Q  674 ctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
     || |||||| || || |||||||||    
T  36866787 ttcgtgacttcaccatagaattttcc 36866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 320 - 701
Target Start/End: Original strand, 8741664 - 8742064
Alignment:
Q  320 gacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttg 419  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  8741664 gacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttg 8741763  T
Q  420 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat-attatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||||||||||                  
T  8741764 caacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 8741863  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8741864 agggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgcc 8741963  T
Q  602 accgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |  ||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8741964 attgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 8742063  T
Q  701 t 701  Q
    |    
T  8742064 t 8742064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 12910752 - 12910348
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12910752 tgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgctt 12910653  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||           
T  12910652 gcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgt 12910553  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12910552 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtc 12910453  T
Q  602 -----accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 696  Q
         || |||||||||||||||||  || ||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  12910452 actgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 12910353  T
Q  697 tcctt 701  Q
    |||||    
T  12910352 tcctt 12910348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Original strand, 35511260 - 35511636
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35511260 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgctt 35511359  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata--gtctta----------agt 506  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||           ||    
T  35511360 gcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtgtgttacattttgtggggt 35511459  T
Q  507 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 606  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  35511460 gttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcacttt 35511559  T
Q  607 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  |||| |||  |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35511560 acaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgactt 35511636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 312 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 36860828 - 36860420
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  36860828 agaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagt 36860729  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36860728 aatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttac 36860629  T
Q  512 actt------------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 593  Q
    ||||                  |||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36860628 actttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaactt 36860529  T
Q  594 ttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaa 693  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| || || |||    
T  36860528 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaa 36860429  T
Q  694 ttttcctta 702  Q
    |||||||||    
T  36860428 ttttcctta 36860420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 315 - 698
Target Start/End: Original strand, 31705386 - 31705785
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31705386 aaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 31705485  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  31705486 gcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacatt 31705585  T
Q  513 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                   |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31705586 ttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttga 31705684  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    || ||  |||||||| || |||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || |||||||    
T  31705685 tgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaatttt 31705784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 319 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 5837952 - 5837574
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5837952 tgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgctt 5837853  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  5837852 gcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 5837753  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  5837752 ggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtc 5837653  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 680  Q
    || |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  5837652 actgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatga 5837574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 315 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 27330705 - 27330299
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27330705 aaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 27330606  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 504  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||              
T  27330605 gcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 27330506  T
Q  505 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
           |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27330505 tcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttga 27330406  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||||  |||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  27330405 tgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaatttt 27330308  T
Q  698 ccttaatta 706  Q
    |||||||||    
T  27330307 ccttaatta 27330299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 319 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 32563537 - 32563150
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  32563537 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattctt 32563438  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 510  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||       |||||    
T  32563437 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgggctgtta 32563338  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||     
T  32563337 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacag 32563238  T
Q  611 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 698  Q
    ||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||| || || ||||||||    
T  32563237 acagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 323 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 9200617 - 9200232
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||||||||  |||||||| || ||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9200617 ttttttgaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 9200518  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacact 514  Q
     ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||     | |||||||||    
T  9200517 catcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggaatgttacact 9200418  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 614  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  9200417 taaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactg 9200318  T
Q  615 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||  |||||||||    
T  9200317 tggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttcaccataaaattttcct 9200232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 323 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 8467119 - 8466739
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| |||||||||  | |||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8467119 tttttttaaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 8467020  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaa 522  Q
     || ||||||||||| ||| ||||| ||||||  || |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8467019 cattttggacttacaaataatattttatcgtta-cacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacatttaaaacaa 8466921  T
Q  523 ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgc 622  Q
    |||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||     
T  8466920 ggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagag-ggggtgt 8466822  T
Q  623 cactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 705  Q
     | |||| |||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||||||    
T  8466821 tattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacctcatcatagaattttccttaatt 8466739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 319 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 22020020 - 22019656
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22020020 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 22019921  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta--------agtgtta 510  Q
     ||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  ||  ||         ||||||    
T  22019920 acaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgagtgttatactttgtggggtgtta 22019821  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 610  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||  |||||    
T  22019820 cacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaa 22019721  T
Q  611 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 675  Q
    ||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  22019720 acaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattct 22019656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 7693618 - 7693230
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7693618 tgacttttctaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgctt 7693519  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgtta 510  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||  ||    |||      ||||||    
T  7693518 gcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 7693419  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 610  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7693418 cacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaa 7693319  T
Q  611 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  7693318 acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattttcc 7693230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22255579 - 22255197
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22255579 tgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggctt 22255480  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 512  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||          
T  22255479 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgt 22255380  T
Q  513 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
               |||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22255379 gtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgcc 22255280  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactaca-cttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |  |||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  22255279 attgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaagttatttttatgactt 22255197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 39573208 - 39572818
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39573208 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 39573109  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag------------- 505  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||                 
T  39573108 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgt 39573017  T
Q  506 ----tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  39573016 gggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtc 39572917  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    || | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||| |||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  39572916 actgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 39572818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 312 - 701
Target Start/End: Original strand, 22973853 - 22974259
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22973853 agaaaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 22973952  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22973953 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttac 22974052  T
Q  512 a-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 594  Q
    |                 |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  22974053 attttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttt 22974152  T
Q  595 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaat 694  Q
    |||||  |  |||||||||||||| ||  ||||| |||  |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||| || || ||||    
T  22974153 tgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaat 22974252  T
Q  695 tttcctt 701  Q
    |||||||    
T  22974253 tttcctt 22974259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Original strand, 30969106 - 30969483
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||     
T  30969106 ttttttaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcag 30969205  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-------------- 508  Q
     |||||| ||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||                  
T  30969206 catcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgagg 30969305  T
Q  509 ---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
       |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  30969306 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattg 30969405  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || ||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30969406 tataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgactt 30969483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Original strand, 23116008 - 23116397
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |        |||||||||    
T  23116008 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgctt 23116099  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt---------- 508  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||              
T  23116100 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 23116199  T
Q  509 -------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
           ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  23116200 ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattcc 23116299  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||  | |||||||||| ||||||| | || || |||||||||    
T  23116300 actgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttcc 23116397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 319 - 621
Target Start/End: Original strand, 7208642 - 7208960
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7208642 tgactttttttaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatactt 7208741  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac----- 513  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||         
T  7208742 gcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 7208841  T
Q  514 ------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
                ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7208842 gaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtc 7208940  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtg 621  Q
    |  |||||||| || |||||    
T  7208941 aatgtacaaacggtagggtg 7208960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 319 - 620
Target Start/End: Original strand, 15992318 - 15992636
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15992318 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 15992417  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt--- 515  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||       
T  15992418 gcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgt 15992517  T
Q  516 --------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
                  ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15992518 ggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtc 15992617  T
Q  602 accgtacaaacagtggggt 620  Q
    || ||||||||||||||||    
T  15992618 actgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 312 - 683
Target Start/End: Original strand, 27318259 - 27318646
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaa-ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 410  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27318259 agaaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatag 27318358  T
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318359 taatgtttgcaacatcttaaactta--tgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 27318456  T
Q  511 ca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 593  Q
    ||                 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  27318457 cactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaactt 27318556  T
Q  594 ttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||  | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27318557 ttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 27318646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 8437362 - 8436965
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8437362 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 8437263  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||           
T  8437262 tcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgt 8437163  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| |||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  8437162 ggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtc 8437064  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    || ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  8437063 actgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcacattagaattgtcct 8436965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 309 - 701
Target Start/End: Original strand, 35826254 - 35826660
Alignment:
Q  309 gttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatct 408  Q
    ||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35826254 gttagaaaactggttttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatct 35826353  T
Q  409 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta----- 503  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||         
T  35826354 agtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggt 35826451  T
Q  504 ------------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 591  Q
                |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35826452 tacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaac 35826550  T
Q  592 ttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatgg 691  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||  |||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||| || || |    
T  35826551 ttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgacttcaccatag 35826650  T
Q  692 aattttcctt 701  Q
    ||||||||||    
T  35826651 aattttcctt 35826660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 323 - 697
Target Start/End: Original strand, 25500708 - 25501099
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  25500708 ttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaa 25500807  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-------------- 508  Q
     ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||||||                  
T  25500808 catcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtgggg 25500907  T
Q  509 ---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
       |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||  |    
T  25500908 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtg 25501007  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    ||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25501008 tacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25501099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 2888216 - 2888419
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2888216 agaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 2888315  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2888316 aatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttac 2888415  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  2888416 actt 2888419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 315 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 35504766 - 35504443
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35504766 aaattgacttttttgaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 35504667  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  35504666 acttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacact 35504567  T
Q  513 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                   |||| || | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  35504566 ttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttga 35504467  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtg 621  Q
    || || | ||||||| ||| ||||    
T  35504466 tgtcatcatacaaacggtgaggtg 35504443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5830296 - 5830093
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 410  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5830296 agaaaattgacattttggaaaag-ttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctag 5830198  T
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5830197 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 5830098  T
Q  511 cactt 515  Q
    |||||    
T  5830097 cactt 5830093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 323 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 35934289 - 35933901
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35934289 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaa 35934190  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac----------- 511  Q
     |||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||               
T  35934189 catcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtaggg 35934090  T
Q  512 ------acttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
          ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||     
T  35934089 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccac- 35933991  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
     ||     |||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || |||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  35933990 -ta-----agtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgacttcaccatacaattttcct 35933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 319 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 42343118 - 42342851
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42343118 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 42343019  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 510  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    ||  |||      || |||    
T  42343018 gcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtgagtgttacactttgtggtgtatta 42342919  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 579  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342918 cacttaaaacaa-gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 42342851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 308 - 618
Target Start/End: Original strand, 43308427 - 43308746
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43308427 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatc 43308526  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata-----ttatgtgatagtctt 502  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||  | |||||||||||     ||| ||| ||  |||    
T  43308527 tagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatatagtcttaagtgttacactt 43308626  T
Q  503 ----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 598  Q
          |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43308627 ttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgat 43308726  T
Q  599 gccaccgtacaaacagtggg 618  Q
    ||||  |||| |||||||||    
T  43308727 gccattgtacgaacagtggg 43308746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 323 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 15724881 - 15724490
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15724881 ttttttgaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaa 15724782  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 505  Q
     || |||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||                 |    
T  15724781 tattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcg 15724682  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    ||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||  |    
T  15724681 tgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattg 15724584  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    || |||||||||||||  |||||| | |||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  15724583 tataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 15724490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 17157805 - 17158005
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17157805 aaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaat 17157904  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17157905 gcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacact 17158004  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  17158005 t 17158005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 323 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 25669969 - 25669739
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25669969 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 25669870  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt---aagtgttacactt 515  Q
     || || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    ||  |||    ||||||||||||    
T  25669869 cattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtgagtgttacacttgtggagtgttacactt 25669770  T
Q  516 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25669769 aaaacaaagtaggataaaattagattaagtg 25669739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 281 - 631
Target Start/End: Original strand, 23954542 - 23954897
Alignment:
Q  281 attaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattg 380  Q
    ||||||||| ||||||||| |   || ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  23954542 attaattaaagggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatt- 23954640  T
Q  381 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 480  Q
          ||||||||||| ||||||||| ||||||| |      |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23954641 ------aatgatcaatagtaattcatcaagtaatgttc-----atcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagtt 23954728  T
Q  481 gatgatattatgtgatagtcttaagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23954729 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatga 23954828  T
Q  564 tgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac-cgtacaaacagtggggtgccactcacta 631  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23954829 tgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcacta 23954897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 308 - 645
Target Start/End: Original strand, 21088535 - 21088887
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaagg-ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcat 406  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||   |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||    ||| ||||| |||| ||||||||    
T  21088535 agttagaaaactgactttttaaaaaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgattattt---attcatgattaatagtaattcat 21088631  T
Q  407 ctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag- 505  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21088632 ctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagt 21088731  T
Q  506 ----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 589  Q
                    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21088732 gttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactga 21088831  T
Q  590 acttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatacta 645  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  21088832 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatacta 21088887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 457 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 26268333 - 26268090
Alignment:
Q  457 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattaga 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| | ||||||| ||    
T  26268333 catctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttga 26268234  T
Q  540 ttaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttg 639  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  26268233 ttaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttg 26268134  T
Q  640 atactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    || |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26268133 atgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 26268090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Original strand, 14919317 - 14919706
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||      | ||    
T  14919317 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaatgt-aattcatct------gatt 14919409  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt------------ 506  Q
    |||| ||||||||||||    ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                
T  14919410 gcaatatcttggactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgt 14919505  T
Q  507 -----gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
         |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14919506 gaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 14919605  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |   || |||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  |||| |||  |||||| | | |||| | ||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  14919606 attatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttcct 14919705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 281 - 511
Target Start/End: Original strand, 13956104 - 13956332
Alignment:
Q  281 attaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattg 380  Q
    ||||||||| | ||||||| ||  || ||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    | ||  ||||||||||||     
T  13956104 attaattaaagagagcttctacggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgatta 13956201  T
Q  381 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13956202 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaattt 13956301  T
Q  481 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13956302 gatgatattatatgatagtcttaagtgttac 13956332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 319 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25889767 - 25889584
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25889767 tgacttttctggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 25889668  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 502  Q
     ||| |||||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25889667 tcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 508 - 701
Target Start/End: Original strand, 5112297 - 5112490
Alignment:
Q  508 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 607  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5112297 ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgta 5112396  T
Q  608 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||    
T  5112397 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcctt 5112490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 319 - 460
Target Start/End: Original strand, 28416329 - 28416470
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28416329 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgctt 28416428  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatc 460  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  28416429 gcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttggcatc 28416470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 389 - 641
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824598
Alignment:
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  489 tatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 571  Q
      |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattga 6824526  T
Q  572 tgatactatgaggactga--acttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 641  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  6824527 tgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgat 6824598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43254256 - 43254154
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43254256 aaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 43254157  T
Q  415 gct 417  Q
    |||    
T  43254156 gct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 505 - 660
Target Start/End: Original strand, 28416508 - 28416663
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||| ||||     
T  28416508 gtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccact 28416607  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 660  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  28416608 gtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttcac 28416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 319 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26269206 - 26269069
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  26269206 tgacttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgctt 26269107  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttgg 456  Q
     ||| |||||  |||||||  |||||||| ||| ||||    
T  26269106 acaacatcttaaacttacaggtactattttatccttgg 26269069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 550 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 25668798 - 25668707
Alignment:
Q  550 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 641  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  25668798 tcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 25668707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 562 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898018
Alignment:
Q  562 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| |||||  ||||| | |||||||||| ||||| | |  |||| |||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  662 agaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgactt 11898018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 605 - 706
Target Start/End: Original strand, 13956426 - 13956527
Alignment:
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 704  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  13956426 gtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttccttaat 13956525  T
Q  705 ta 706  Q
    ||    
T  13956526 ta 13956527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 577
Target Start/End: Original strand, 13956368 - 13956415
Alignment:
Q  530 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 577  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13956368 taaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 521 - 660
Target Start/End: Original strand, 17158028 - 17158166
Alignment:
Q  521 aaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggt 620  Q
    |||||| | || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||  |||||||| |||| ||    
T  17158028 aaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagt 17158126  T
Q  621 gccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 660  Q
    |  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  |||||||    
T  17158127 gttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 518 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 5830073 - 5829962
Alignment:
Q  518 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 617  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| || |    
T  5830073 aacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat---------tgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtag 5829983  T
Q  618 ggtgccactcactacactttt 638  Q
    ||||  ||||| |||| ||||    
T  5829982 ggtgttactcattacattttt 5829962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 624 - 699
Target Start/End: Original strand, 16004476 - 16004552
Alignment:
Q  624 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc-attctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||||| ||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||    
T  16004476 actcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttcc 16004552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 22616539 - 22616492
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  22616539 acttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 22616492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 283 - 706
Target Start/End: Original strand, 7234783 - 7235225
Alignment:
Q  283 taattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgct 382  Q
    ||||||||||||||||  ||  || ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  7234783 taattaatgggagcttttacggtgtagtcaggaaaatgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgtt 7234882  T
Q  383 g---attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagt 479  Q
    |   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7234883 gttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagt 7234982  T
Q  480 tgatgatattatgtgatagtcttaag-----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctg 562  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7234983 tgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctg 7235082  T
Q  563 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 662  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||     
T  7235083 atgaattgataatactatgag-actgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccg 7235181  T
Q  663 gaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatta 706  Q
    |||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||    
T  7235182 gaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccataatta 7235225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 33619234 - 33618850
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat---taatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  33619234 aaattgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagt 33619135  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctt-----taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 506  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33619134 aatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagt 33619035  T
Q  507 gttacacttaaa-------aca-aggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 598  Q
    || ||||||  |       |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33619034 gtcacacttctagggtgttacactggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgat 33618935  T
Q  599 gccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  33618934 gccaccgtacaaataatgggttgctactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagtatttcccatgactt 33618850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 287 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 20768511 - 20768087
Alignment:
Q  287 taatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatt 386  Q
    ||||||||||||| ||  || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20768511 taatgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgatt 20768412  T
Q  387 aatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20768411 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgat 20768312  T
Q  487 attatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 569  Q
    |||||| |||  |||||||||||||                 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  20768311 attatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagt--aatcttgttaatctgatgaatt 20768214  T
Q  570 gatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagt 669  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| | || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20768213 aatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-ctaacaaacaat-ggatgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagt 20768116  T
Q  670 cattctcatgacttgacaatggaattttc 698  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||    
T  20768115 cattctcatgacttcaccatagaattttc 20768087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 323 - 700
Target Start/End: Original strand, 3879730 - 3880124
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3879730 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 3879829  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac--------- 513  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  3879830 catcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 3879929  T
Q  514 --------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
            ||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |    
T  3879930 tgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattg 3880029  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  3880030 tacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattttcct 3880124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 8513618 - 8513232
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8513618 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 8513526  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt--- 515  Q
    |||| || ||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  8513525 gcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 8513426  T
Q  516 --------aaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 606  Q
            ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  8513425 agggtgttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgt 8513326  T
Q  607 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8513325 acaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 8513232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 336 - 701
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4319009
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaa 518  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                 ||||||||||||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaa 4318825  T
Q  519 acaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 617  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4318826 acaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 4318925  T
Q  618 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  4318926 ggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 4319009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 319 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 1946233 - 1945830
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaag-gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgc 416  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  1946233 tgacttttttgaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgc 1946134  T
Q  417 ttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca---- 512  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  1946133 ttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 1946034  T
Q  513 -------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 599  Q
                 |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1946033 gtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatg 1945934  T
Q  600 ccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 698  Q
     ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||    
T  1945933 tcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttc 1945834  T
Q  699 ctta 702  Q
    ||||    
T  1945833 ctta 1945830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 291 - 638
Target Start/End: Original strand, 6090941 - 6091306
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6090941 gggagcttctacggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 6091040  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6091041 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatatta 6091140  T
Q  491 tgtgatagtc-ttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 572  Q
    |||||||||| ||||||||||||                 |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6091141 tgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgat 6091240  T
Q  573 gatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactttt 638  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  6091241 gatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttt 6091306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 326 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6089286 - 6088910
Alignment:
Q  326 tttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaat 425  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6089286 tttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacat 6089194  T
Q  426 cttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac-----------t 514  Q
     ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||           |    
T  6089193 tttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgt 6089094  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaaca 613  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6089093 taaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaaca 6088994  T
Q  614 gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  6088993 gtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 6088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Original strand, 33892799 - 33893186
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  33892799 tgacttttttgaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgttt 33892898  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 510  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||||||    
T  33892899 gcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 33892998  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 610  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||  ||||||    
T  33892999 tacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaa 33893097  T
Q  611 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    | |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| | |||| | ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  33893098 atagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattttcc 33893186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 321 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 29182556 - 29182157
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||    
T  29182556 acttttttgaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcagta---attcatctagtaatacttgc 29182460  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac--------- 511  Q
    || ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||             
T  29182459 aacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgg 29182360  T
Q  512 ---------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
             |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||    
T  29182359 gggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgaca 29182260  T
Q  603 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 702  Q
    | ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||  ||| ||||||||||||||| || ||  |||||| ||||    
T  29182259 ctgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgacttcaccataaaatttttctta 29182160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 323 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 5627785 - 5627389
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgca 421  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  5627785 ttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgca 5627686  T
Q  422 aaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca--------- 512  Q
    | ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  5627685 acatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagg 5627586  T
Q  513 --------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
            |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  5627585 gtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcatt 5627486  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
     |||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||    
T  5627485 ctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcctt 5627389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 683
Target Start/End: Original strand, 21016916 - 21017280
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 429  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21016916 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 21017015  T
Q  430 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-----------------taca 512  Q
    ||| |||      ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||    
T  21017016 gacgtac------tattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 21017109  T
Q  513 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 612  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||     
T  21017110 cttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaat 21017209  T
Q  613 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    | |||||||  |||||| ||| |||| |||||| | |||  ||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  21017210 aatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcattttcgtgactt 21017280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 505 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15491809 - 15491631
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15491809 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccact 15491710  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  || | |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15491709 gtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 430 - 697
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353540
Alignment:
Q  430 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt-----------------aca 512  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||                 |||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  513 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 612  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  613 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||| | |   |||| | |||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  30353456 agtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 30353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 319 - 463
Target Start/End: Original strand, 7054559 - 7054704
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |    
T  7054559 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtt 7054658  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatcttt 463  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  7054659 tgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 505 - 700
Target Start/End: Original strand, 7055205 - 7055400
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  7055205 gtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcatt 7055304  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
     |||||| |||| ||||  ||| | || | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  7055305 ctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcct 7055400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 568 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498431
Alignment:
Q  568 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaa 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  667 agtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcactatagatttttcctt 18498431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 457 - 515
Target Start/End: Original strand, 7055140 - 7055198
Alignment:
Q  457 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7055140 catctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 7055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 390
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  335 gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 19631794 - 19631747
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  19631794 acttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 19631747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 323 - 700
Target Start/End: Original strand, 27082636 - 27083030
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27082636 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaa 27082735  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac----------- 511  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               
T  27082736 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcgggg 27082835  T
Q  512 ------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
          |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27082836 tgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactg 27082935  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||    
T  27082936 cacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcct 27083030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 291 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 33906634 - 33906223
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33906634 gggagcttctacagtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatg 33906537  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906536 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 33906437  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    || |||||||||||||||||||                 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906436 tgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 33906337  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    ||||||||| ||||||||||            || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33906336 atactatgaagactgaactt------------tataaacagtggggtgctactcactacacttttaatactatagtgttgacttcaccagaaaagtcatt 33906249  T
Q  674 ctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||||| | || || || |||||||||    
T  33906248 ctcataatttcaccatagaattttcc 33906223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 291 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 34895386 - 34894964
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34895386 gggagcttctacggtgcagttaggaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 34895287  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34895286 atcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 34895187  T
Q  491 tgtgata--gtctta----------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 578  Q
    |||||||  || |||           ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34895186 tgtgatagtgtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagt 34895087  T
Q  579 atgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcat 678  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  34895086 atgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcat 34894987  T
Q  679 gacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||| || || |||||||||||    
T  34894986 gacttcaccatagaattttcctt 34894964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Original strand, 16446669 - 16447067
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16446669 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 16446768  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||                  
T  16446769 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgt 16446868  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  16446869 ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgcc 16446968  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |   ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  16446969 attatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 16447067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 319 - 683
Target Start/End: Original strand, 37970313 - 37970694
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37970313 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgctt 37970412  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                  
T  37970413 gcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 37970512  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37970513 ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggc 37970612  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37970613 attgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 37970694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Original strand, 5299740 - 5300137
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5299740 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgctt 5299839  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 504  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||| ||||||                  
T  5299840 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgt 5299939  T
Q  505 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
       ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5299940 ggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgcc 5300039  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    || ||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  5300040 actgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 38644374 - 38643975
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38644374 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 38644275  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||           
T  38644274 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttat 38644175  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38644174 ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgcc 38644075  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||   |||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  38644074 actagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctt 38643975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 312 - 701
Target Start/End: Original strand, 43643382 - 43643788
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43643382 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 43643481  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43643482 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttac 43643581  T
Q  512 a-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 594  Q
    |                 |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  43643582 actttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaacttt 43643681  T
Q  595 tgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaat 694  Q
     |||| ||  ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  43643682 ggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaat 43643781  T
Q  695 tttcctt 701  Q
    |||||||    
T  43643782 tttcctt 43643788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 290 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1205352 - 1204942
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  1205352 tgggagcttctacggtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaat 1205253  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1205252 gatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatt 1205153  T
Q  490 atgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 572  Q
    ||| |||||||||||||||||||                 |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||    
T  1205152 atgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgat 1205053  T
Q  573 gatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||  |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1205052 gatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcat 1204953  T
Q  673 tctcatgactt 683  Q
    |||||||||||    
T  1204952 tctcatgactt 1204942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 323 - 705
Target Start/End: Original strand, 36694764 - 36695163
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||||||| | || ||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36694764 ttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaa 36694863  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 505  Q
     |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  36694864 catcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 36694963  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |    
T  36694964 tgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattg 36695063  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 705  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||||||    
T  36695064 tacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttccttaatt 36695163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 11727425 - 11727039
Alignment:
Q  315 aaattgac-ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11727425 aaattgacattttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 11727326  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt----- 508  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||         
T  11727325 tgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacat 11727226  T
Q  509 ------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
                ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11727225 tttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttg 11727126  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||  |||||| |||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11727125 atgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataactt 11727039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 336 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 16223242 - 16222860
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16223242 ttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactta 16223143  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac-----------------ttaaa 518  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                 |||||    
T  16223142 catgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaa 16223043  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 618  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  16223042 acaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggg 16222943  T
Q  619 gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |  | |||||||| | |||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  16222942 gaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccgtagaattttcctt 16222860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 319 - 700
Target Start/End: Original strand, 34951851 - 34952223
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||    
T  34951851 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagactt 34951950  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |         |||||||||||||||    
T  34951951 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcg---------agtgttacacttaaa 34952041  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 618  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34952042 acaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggg 34952141  T
Q  619 gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
     ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  34952142 ctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactttactatagaattttcct 34952223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 343 - 699
Target Start/End: Original strand, 6098331 - 6098709
Alignment:
Q  343 tgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatac 442  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  6098331 tgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtac 6098430  T
Q  443 tatttcat-----cgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-----------------tacacttaaaac 520  Q
    ||||  ||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||    
T  6098431 tattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 6098530  T
Q  521 aaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggt 620  Q
    ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6098531 aagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 6098630  T
Q  621 gccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |  |||||||| | ||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| || || |||||||||    
T  6098631 gttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttcc 6098709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 315 - 618
Target Start/End: Original strand, 1149422 - 1149742
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1149422 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 1149521  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  1149522 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacact 1149621  T
Q  513 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                   |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1149622 ttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttga 1149721  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggg 618  Q
    || ||  ||||||||||||||    
T  1149722 tgtcattgtacaaacagtggg 1149742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 466224 - 465857
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  466224 ttttttgaataagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 466125  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacact 514  Q
     ||||| ||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    ||  |||      ||||||||||    
T  466124 catcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgata-tatgtgagtgttacactttgtggggtgttacact 466026  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 614  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  466025 taaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacag 465926  T
Q  615 tggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  465925 tggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgactt 465857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 323 - 683
Target Start/End: Original strand, 23854229 - 23854606
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23854229 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 23854328  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 505  Q
     ||||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||                 |    
T  23854329 catcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcgg 23854428  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  23854429 tgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattg 23854528  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
     ||||||||| |||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23854529 cacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 23854606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 312 - 683
Target Start/End: Original strand, 10554991 - 10555377
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaagg-ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatt--aattcatct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| |  |||||||||    
T  10554991 agaaaattgacttttttgaaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatct 10555087  T
Q  409 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-------- 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  10555088 agtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcaagtgtta 10555187  T
Q  501 -------ttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 593  Q
           | | ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10555188 cgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaactt 10555287  T
Q  594 ttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10555288 ttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 10555377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 315 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 40862820 - 40862416
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcattttt-aaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  40862820 aaattgacttttttgaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaa 40862721  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-- 511  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  40862720 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacac 40862621  T
Q  512 ---------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
                   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||| | |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40862620 tttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaacttttg 40862522  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactaca-cttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatt 695  Q
    ||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||| || || |||||    
T  40862521 atgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgacttcactatagaatt 40862422  T
Q  696 ttcctt 701  Q
    ||||||    
T  40862421 ttcctt 40862416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 319 - 617
Target Start/End: Original strand, 7890751 - 7891066
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7890751 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 7890850  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 512  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          
T  7890851 gcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgt 7890950  T
Q  513 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
               |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7890951 ggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgcc 7891050  T
Q  602 accgtacaaacagtgg 617  Q
    |  |||||||| ||||    
T  7891051 attgtacaaacggtgg 7891066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 319 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 12876506 - 12876108
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| || |||||||| | || ||||| ||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  12876506 tgacttttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcct 12876407  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttaca----- 512  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         
T  12876406 gtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttg 12876307  T
Q  513 ------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
                ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12876306 tggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgt 12876207  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||  ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  12876206 cattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattttcc 12876108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 359 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 9864504 - 9864145
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  9864504 ttcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttggca 9864405  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagatt 541  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9864404 tctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatatt 9864305  T
Q  542 aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 641  Q
    ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  9864304 aagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgat 9864205  T
Q  642 actatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  9864204 actatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctt 9864145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 308 - 616
Target Start/End: Original strand, 35459494 - 35459819
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35459494 agttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatc 35459593  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag-- 505  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| || || |  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||      
T  35459594 tagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtg 35459693  T
Q  506 ---------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
                   ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35459694 ttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaa 35459793  T
Q  591 cttttgatgccaccgtacaaacagtg 616  Q
    ||||| ||| ||  |||||| |||||    
T  35459794 cttttaatgtcattgtacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 319 - 704
Target Start/End: Original strand, 31933680 - 31934082
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  31933680 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtct 31933779  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 512  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||          
T  31933780 gcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgt 31933879  T
Q  513 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
               |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  31933880 gcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtc 31933979  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    |  ||| ||| |||||||||  ||||| || | ||||||||  |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  | |||||||| ||    
T  31933980 attgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcacgttagaattttcttt 31934079  T
Q  702 aat 704  Q
    |||    
T  31934080 aat 31934082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 323 - 621
Target Start/End: Original strand, 1953786 - 1954103
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1953786 ttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaa 1953885  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag----------------- 505  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||                     
T  1953886 aatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 1953985  T
Q  506 -tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat-gatactatgaggactgaacttttgatgccac 603  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1953986 atgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgccac 1954085  T
Q  604 cgtacaaacagtggggtg 621  Q
     || |||| ||| |||||    
T  1954086 tgtccaaatagtagggtg 1954103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 319 - 573
Target Start/End: Original strand, 4132480 - 4132750
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4132480 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 4132579  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact---- 514  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        
T  4132580 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgt 4132679  T
Q  515 ------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
                | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4132680 ggggtgttacacttaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 8803606 - 8803974
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  8803606 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaa 8803705  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8803706 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacac 8803805  T
Q  514 tt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
    ||                 | ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||       | |||||||||||    
T  8803806 tttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttg 8803898  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 672  Q
    ||| ||   |||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8803899 atgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat 8803974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 319 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 44869893 - 44869576
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44869893 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 44869794  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt--------- 509  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||             
T  44869793 gcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgt 44869694  T
Q  510 -------acacttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
           ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  44869693 ggggacaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtc 44869594  T
Q  602 accgtacaaacagtgggg 619  Q
    |  || ||||||||||||    
T  44869593 attgtgcaaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 323 - 700
Target Start/End: Original strand, 30654381 - 30654775
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgca 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  30654381 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgca 30654479  T
Q  422 aaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca--------- 512  Q
    | ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||             
T  30654480 acatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagg 30654579  T
Q  513 --------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
            |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||      
T  30654580 gtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcatt 30654679  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
      |||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  30654680 caacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgacttcaccataaaattttcct 30654775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 323 - 621
Target Start/End: Original strand, 39098917 - 39099232
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||||||| | | |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39098917 ttttttaaaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 39099016  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag----------------- 505  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||                     
T  39099017 cattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtggga 39099116  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  39099117 tgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtg 39099216  T
Q  606 tacaaacagtggggtg 621  Q
    |||||| |||||||||    
T  39099217 tacaaagagtggggtg 39099232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 319 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 35859330 - 35859160
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35859330 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 35859231  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||| |||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859230 gcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307622
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  501 ttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 583  Q
    |||||||||||||||                 |||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggg 13307738  T
Q  584 gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13307737 gactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 13307638  T
Q  684 gacaatggaattttcc 699  Q
     || || |||||||||    
T  13307637 caccatagaattttcc 13307622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 308 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12587989 - 12587812
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12587989 agttagagaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatc 12587890  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 485  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587889 tagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 361 - 515
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149906
Alignment:
Q  361 catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatc 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  461 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactt 1149906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 505 - 710
Target Start/End: Original strand, 1150102 - 1150306
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |       
T  1150102 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgtt 1150201  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 704  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||    
T  1150202 gtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc-taat 1150300  T
Q  705 tattaa 710  Q
    ||||||    
T  1150301 tattaa 1150306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18259479 - 18259321
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  18259479 aaattgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaat 18259380  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaa 473  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18259379 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaa 18259321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 325 - 467
Target Start/End: Original strand, 24823194 - 24823336
Alignment:
Q  325 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 424  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24823194 ttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 24823293  T
Q  425 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca 467  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24823294 tcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 440 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 7998553 - 7998401
Alignment:
Q  440 tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggt-aaaattag 538  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7998553 tactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattag 7998454  T
Q  539 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 591  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  7998453 attaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggggaccgaac 7998401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 33198202 - 33198057
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  33198202 aaattgacttttttgaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgat 33198103  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatc 460  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33198102 gcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggcatc 33198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 506 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362517
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||      
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||| || || |||||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcactaca-tttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 41362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 505 - 672
Target Start/End: Original strand, 41910985 - 41911153
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||     
T  41910985 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctact 41911084  T
Q  605 gtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 672  Q
    ||   || ||| ||||||  |||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||    
T  41911085 gttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttcaccaaaaaaatcat 41911153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 319 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41362818 - 41362723
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41362818 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 449 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 43025968 - 43025753
Alignment:
Q  449 atcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggta 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||                 |||| |||||||| ||    
T  43025968 atcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggata 43025869  T
Q  532 aaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcacta 631  Q
    |||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||   | |||| |    
T  43025868 aaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatcacaa 43025769  T
Q  632 cacttttgatactata 647  Q
    ||||||||||||||||    
T  43025768 cacttttgatactata 43025753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 43026099 - 43025974
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaag-gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    ||||||||| | ||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  43026099 gggagcttctaaactgcggttaggaaattgatttttttgaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcat 43026000  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatg 415  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43025999 gatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 515
Target Start/End: Original strand, 41910907 - 41910978
Alignment:
Q  443 tatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41910907 tattttatcgttg-catctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactt 41910978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 699
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133199
Alignment:
Q  575 tactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||   ||||||||   |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattc 4133174  T
Q  675 tcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    | |||||||||| ||  ||||||||    
T  4133175 tgatgacttgaccataaaattttcc 4133199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 550 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 33197997 - 33197947
Alignment:
Q  550 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33197997 tcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  394 aatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 485  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 631 - 702
Target Start/End: Original strand, 24823395 - 24823466
Alignment:
Q  631 acacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 702  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||    
T  24823395 acacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactttaccatagtattttcctta 24823466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 7998402 - 7998361
Alignment:
Q  659 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  7998402 accagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 7998361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9864578 - 9864533
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatg 353  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9864578 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatg 9864533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 308 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 41465909 - 41465509
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  41465909 agttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcata 41465810  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41465809 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtg 41465710  T
Q  508 ttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
    ||||                 ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||    
T  41465709 ttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaa 41465610  T
Q  591 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatg 690  Q
    |||||||| ||| |||        | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  41465609 cttttgataccagcgt--------tagggtgctactcactacacctttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccata 41465518  T
Q  691 gaattttcc 699  Q
    |||||||||    
T  41465517 gaattttcc 41465509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 291 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4167347 - 4166919
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4167347 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 4167248  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4167247 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatta 4167148  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    ||||||||| |||||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||    
T  4167147 tgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttg 4167048  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  4167047 atactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcatt 4166948  T
Q  674 ctcatgacttgacaatggaattttcctta 702  Q
     || |||||| || || ||||||||||||    
T  4166947 ttcgtgacttcaccatagaattttcctta 4166919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 319 - 618
Target Start/End: Original strand, 7006744 - 7007043
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7006744 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgctt 7006843  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7006844 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaagtgttacacttaaa 7006943  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 618  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7006944 acaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtggg 7007043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 291 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 26358002 - 26357593
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26358002 gggagcttctacattgcagttagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 26357903  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26357902 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatatta 26357803  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    ||||||||| ||||||||                 ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||     
T  26357802 tgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgata 26357703  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    |  |||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  26357702 actctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcatt 26357603  T
Q  674 ctcatgactt 683  Q
     |||||||||    
T  26357602 ttcatgactt 26357593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 319 - 697
Target Start/End: Original strand, 33660183 - 33660569
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33660183 tgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 33660282  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtctt----aagtgtta 510  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    ||| ||  |||      ||||||    
T  33660283 gcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgggtgttacactttgtggggtgtta 33660382  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33660383 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaa 33660482  T
Q  611 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    ||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||| | ||||||| || || |||||||    
T  33660483 acagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaatttt 33660569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 319 - 697
Target Start/End: Original strand, 43770654 - 43771039
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43770654 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgctt 43770753  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 510  Q
    |||| |||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||    | ||||||    
T  43770754 gcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgaggtgtta 43770853  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 610  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43770854 cacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataa 43770953  T
Q  611 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || || |||||||    
T  43770954 acagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcattctaatgacttcaccatagaatttt 43771039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 319 - 701
Target Start/End: Original strand, 18494087 - 18494473
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18494087 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgctt 18494186  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg----------- 507  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||               
T  18494187 acaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgt 18494286  T
Q  508 -----ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 602  Q
         |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18494287 gaggtttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc- 18494385  T
Q  603 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
               ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||    
T  18494386 -----------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccacagaattttcctt 18494473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 315 - 662
Target Start/End: Original strand, 43648047 - 43648411
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43648047 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 43648146  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 504  Q
    | |||| | ||||||||||||||  | |||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||              
T  43648147 gtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatact 43648246  T
Q  505 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
           |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43648247 ttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttga 43648346  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 662  Q
    || ||   ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  43648347 tgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 43648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 330 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 4764017 - 4763644
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 429  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4764017 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttg 4763918  T
Q  430 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------a 512  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  4763917 gacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctaca 4763818  T
Q  513 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 612  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4763817 cttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaac 4763718  T
Q  613 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcg---acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| |  |||||||| |   |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4763717 agtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgactt 4763644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 291 - 701
Target Start/End: Original strand, 2325156 - 2325575
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||     
T  2325156 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaata 2325255  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2325256 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatatta 2325355  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||                 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||    
T  2325356 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatg 2325447  T
Q  574 atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||| || ||||  |||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  2325448 atactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcatt 2325547  T
Q  674 ctcatgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    | ||| |||| || || |||||||||||    
T  2325548 cacataacttcaccatagaattttcctt 2325575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 290 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 41961266 - 41960940
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41961266 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 41961167  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  41961166 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatatt 41961067  T
Q  490 atgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 572  Q
    |||||||| |||||||||||||                 |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41961066 atgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 41960967  T
Q  573 gatactatgaggactgaacttttgatg 599  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41960966 gatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 364 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478368
Alignment:
Q  364 ttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatcttt 463  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  464 aacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------------acttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||            ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtatt 4478518  T
Q  551 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtg 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||  |||||||    
T  4478517 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtg 4478418  T
Q  651 tcgacttcaccagaaaagtcattctc-atgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |  ||||||||| |||  ||||| || ||||||| || || |||||||||    
T  4478417 ttaacttcaccaaaaatatcattttctatgacttcactatagaattttcc 4478368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 319 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 3177336 - 3176965
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3177336 tgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgctt 3177237  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 511  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  3177236 gtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 3177137  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
              ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3177136 ggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 3177037  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    |  ||||||||||| | |||  |||||  ||| |||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  3177036 attgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcatt 3176965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 330 - 705
Target Start/End: Original strand, 33550800 - 33551195
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatga----tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaat 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  33550800 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacat 33550899  T
Q  426 cttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt---------- 515  Q
     |||||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||              
T  33550900 attggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgt 33550998  T
Q  516 -------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac 608  Q
           ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||    
T  33550999 tacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtac 33551098  T
Q  609 aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 705  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||    
T  33551099 aaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccataatt 33551195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 312 - 700
Target Start/End: Original strand, 11366179 - 11366585
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctag 410  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11366179 agaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctag 11366278  T
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366279 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 11366378  T
Q  511 cac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 593  Q
    |||                 ||| |||||| || | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11366379 cactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaactt 11366478  T
Q  594 ttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaa 693  Q
    |||||| ||   |||||| |||| | ||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| || || || |||    
T  11366479 ttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaa 11366578  T
Q  694 ttttcct 700  Q
    |||||||    
T  11366579 ttttcct 11366585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 308 - 673
Target Start/End: Original strand, 19289118 - 19289500
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19289118 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatc 19289217  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| || || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289218 tagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 19289317  T
Q  508 ttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
    ||||||                 ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||    
T  19289318 ttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaa 19289417  T
Q  591 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 673  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  19289418 cttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 19289500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 312 - 701
Target Start/End: Original strand, 39167168 - 39167568
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||||    
T  39167168 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagt 39167267  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa------- 504  Q
    |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | |           
T  39167268 aatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagttgttacactttg 39167367  T
Q  505 ----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
         |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39167368 tgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgt 39167467  T
Q  601 caccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    ||  |||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||  |||  |||||| || |||| |||||||| |||||| || ||  |||||||||    
T  39167468 cattgtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttcaccataaaattttcct 39167567  T
Q  701 t 701  Q
    |    
T  39167568 t 39167568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 363 - 700
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264281
Alignment:
Q  363 tttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctt 462  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  463 taacatgcaaacatagttgatgatattatgt-gatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaag 544  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 4264125  T
Q  545 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatact 644  Q
    || | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||    
T  4264126 tgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgct 4264225  T
Q  645 atagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  4264226 atagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcct 4264281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 381 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 19314182 - 19313852
Alignment:
Q  381 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta---catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacata 477  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  19314182 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacata 19314083  T
Q  478 gttgatgatattatgtgatagtcttaa----------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaa 567  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19314082 gttgctgatatcatgtgatagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 19313983  T
Q  568 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 667  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||  ||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  19313982 ttgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaa 19313884  T
Q  668 gtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  19313883 gtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 19313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 324 - 703
Target Start/End: Original strand, 29241956 - 29242345
Alignment:
Q  324 tttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa 423  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |           
T  29241956 tttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaattc------- 29242048  T
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt--------------- 508  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||                   
T  29242049 atcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggt 29242148  T
Q  509 --tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 606  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  29242149 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgt 29242248  T
Q  607 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 703  Q
    |||||||||||||||  || ||||| | |||| ||  |||||| |  ||||||||| ||||  |||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  29242249 acaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttccttaa 29242345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 286 - 700
Target Start/End: Original strand, 19424415 - 19424832
Alignment:
Q  286 ttaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat 385  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19424415 ttaatgggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgat 19424514  T
Q  386 taatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||              |||||||||||||||| ||||| |||    
T  19424515 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat--------------ctttaacatgcaaacagagttgctga 19424600  T
Q  486 tattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaat 568  Q
    ||| |||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  19424601 tatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaat 19424700  T
Q  569 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 668  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  19424701 tgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaag 19424800  T
Q  669 tcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
     |||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  19424801 ccattctcatgacttcaccataaaattttcct 19424832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 359 - 667
Target Start/End: Original strand, 27349794 - 27350109
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  27349794 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaa 27349893  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||  ||    |||      ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |    
T  27349894 tctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtatt 27349993  T
Q  551 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtg 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  27349994 cttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtg 27350092  T
Q  651 tcgacttcaccagaaaa 667  Q
    |  ||||||||| ||||    
T  27350093 ttaacttcaccaaaaaa 27350109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 311 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 37906116 - 37905740
Alignment:
Q  311 tagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatcta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37906116 tagaaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatcca 37906017  T
Q  410 gtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 509  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37906016 gtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgtt 37905917  T
Q  510 aca-------------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
    |||                   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37905916 acactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 37905817  T
Q  591 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 667  Q
    ||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||  |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  37905816 cttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 37905740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 293 - 701
Target Start/End: Original strand, 31570514 - 31570939
Alignment:
Q  293 gagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgat 392  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  31570514 gagcttctacactgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgat 31570613  T
Q  393 caatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg 492  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  31570614 caatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatg 31570713  T
Q  493 tgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 575  Q
    ||| ||||||||                 |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  31570714 tgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgat 31570813  T
Q  576 actatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 675  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  31570814 actatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattct 31570913  T
Q  676 catgacttgacaatggaattttcctt 701  Q
    ||| |||| || || |||||||||||    
T  31570914 cataacttcaccatagaattttcctt 31570939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Original strand, 33709042 - 33709403
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33709042 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 33709141  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 505  Q
     |||||||| |||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||                 |    
T  33709142 catcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtaggg 33709241  T
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  33709242 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactg 33709341  T
Q  606 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 667  Q
    ||| |||||||| |||  |||| | |||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  33709342 tactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccataaaa 33709403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 323 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 5881922 - 5881533
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5881922 ttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 5881823  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacact 514  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    ||  |||    | || |||||||    
T  5881822 catcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtgagtgttacactttgtgaggtattacact 5881723  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacag 614  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5881722 taaaacaaggtatgat-aaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacag 5881624  T
Q  615 tggggtgccactcactacac-----ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |||||||  |||||| ||||     |||||||  |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||    
T  5881623 tggggtgttactcacaacacttttgttttgatgttataatatcaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcacaataaaattttcct 5881533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 323 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 44914060 - 44913662
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcat---ctagtaatgcttg 419  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||   ||| |||||||||    
T  44914060 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttg 44913961  T
Q  420 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-------- 511  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  44913960 caacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 44913861  T
Q  512 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gaggactgaacttttgatgc 600  Q
              ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||     
T  44913860 ggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgt 44913761  T
Q  601 caccgtacaaac-agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 699  Q
    ||   ||||||| |||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  44913760 cattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttca-cataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 44913662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 308 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 13711867 - 13711465
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| || | |||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13711867 agttataaaattgtcttttttgaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatc 13711768  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--- 504  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||       
T  13711767 tagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaacta 13711668  T
Q  505 --------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 590  Q
                  ||||||||||||||||     | | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  13711667 ttatactttatggggtgttacacttaaaac-----atgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaa 13711573  T
Q  591 cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatg 690  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||     
T  13711572 cttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccata 13711473  T
Q  691 gaattttc 698  Q
    ||||||||    
T  13711472 gaattttc 13711465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 314 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35959294 - 35959097
Alignment:
Q  314 aaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35959294 aaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 35959195  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| |||||||    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35959194 tgcttgcaacatcttgg----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacac 35959099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 411 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36641980
Alignment:
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  511 cactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaa--ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 591  Q
    |||||                 ||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 36642094  T
Q  592 ttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatgg 691  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  36642093 ttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatag 36641994  T
Q  692 aattttccttaatt 705  Q
    |||||| |||||||    
T  36641993 aatttttcttaatt 36641980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 31862249 - 31861953
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  31862249 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtct 31862150  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 512  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||| || || || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||          
T  31862149 acaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgt 31862050  T
Q  513 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 598  Q
               |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  31862049 ggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgat 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 411 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327801
Alignment:
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  511 cactt-----------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 593  Q
    |||||                 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaactt 45327826  T
Q  594 ttgatgccaccgtacaaacagtggg 618  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  45327825 ttgatgtcaccgtataaacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 381 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 44286284 - 44285965
Alignment:
Q  381 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  44286284 ctgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagtt 44286185  T
Q  481 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 563  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  44286184 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctga 44286085  T
Q  564 tgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccag 663  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |    ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| |||    
T  44286084 tgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcag 44285985  T
Q  664 aaaagtcattctcatgactt 683  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  44285984 aaaaatcattcgcatgactt 44285965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 512
Target Start/End: Original strand, 19500739 - 19500914
Alignment:
Q  337 taattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttac 436  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  19500739 taattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattac 19500838  T
Q  437 atatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    || |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500839 atgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 19500914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 424 - 700
Target Start/End: Original strand, 17071648 - 17071941
Alignment:
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-------- 515  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  17071648 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 17071747  T
Q  516 ---------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 606  Q
             |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||  ||    
T  17071748 gttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgt 17071847  T
Q  607 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    ||||| | || | ||  ||| |||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  17071848 acaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17071941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 442 - 697
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41464051
Alignment:
Q  442 ctatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaagg 524  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                 |||||||| ||||||||| |    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaag 41463878  T
Q  525 tagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgcca 624  Q
    || | |||||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |    
T  41463879 tatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgtta 41463978  T
Q  625 ctcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| ||| |||||||||| ||||| || || |||||||    
T  41463979 ctcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaatttt 41464051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 424 - 700
Target Start/End: Original strand, 17054007 - 17054300
Alignment:
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-------- 515  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  17054007 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggt 17054106  T
Q  516 ---------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 606  Q
             |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||| ||  ||    
T  17054107 gttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgt 17054206  T
Q  607 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    ||||||| || | ||  ||| |||||| |||||||  |||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  17054207 acaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17054300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 513 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 33902252 - 33902092
Alignment:
Q  513 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 612  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  33902252 cttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaac 33902153  T
Q  613 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 675  Q
    ||||||||   |||||||||| ||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33902152 agtggggtattactcactacattttt--tatgttagtgttaacttcaccagaaaagtcattct 33902092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 325 - 474
Target Start/End: Original strand, 41051112 - 41051260
Alignment:
Q  325 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 424  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  41051112 ttttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaaca 41051211  T
Q  425 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac 474  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41051212 tcttgaacttacaggtactattttatccttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 323 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33902407 - 33902317
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33902407 ttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 515
Target Start/End: Original strand, 18258197 - 18258289
Alignment:
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18258197 aatcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 18258289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 554 - 672
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  554 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac-cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||  |  ||| ||||||||||| ||||||| |     
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  653 gacttcaccagaaaagtcat 672  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 428
Target Start/End: Original strand, 18257344 - 18257453
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || |||||  |   |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18257344 tgacttttgtgaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgctt 18257443  T
Q  419 gcaaaatctt 428  Q
    |||| |||||    
T  18257444 gcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 319 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45328087 - 45328028
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgat 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45328087 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 41463400 - 41463512
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||    
T  41463400 tttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaa 41463499  T
Q  423 aatcttggactta 435  Q
     ||||| ||||||    
T  41463500 catcttagactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 596
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  516 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 518 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 35959077 - 35958925
Alignment:
Q  518 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 617  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  35959077 aacaaggtaggataaa-ttatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg------------ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtgg 35958991  T
Q  618 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||   |||| |||| |||| ||  ||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  35958990 ggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgactt 35958925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 463 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902267
Alignment:
Q  463 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactt 33902267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 654 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 6177820 - 6177791
Alignment:
Q  654 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177820 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 6177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 387
Target Start/End: Original strand, 17053960 - 17054005
Alignment:
Q  342 ttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 387  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17053960 ttgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 387
Target Start/End: Original strand, 17071601 - 17071646
Alignment:
Q  342 ttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 387  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17071601 ttgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 558
Target Start/End: Original strand, 18258296 - 18258349
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaa 558  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18258296 gtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 315 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 8288 - 7889
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8288 aaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 8189  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8188 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 8089  T
Q  513 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 597  Q
                   |||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8088 ttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 7989  T
Q  598 tgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    || ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||||| || |||| || || |||||||    
T  7988 tgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaatttt 7889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 172; Significance: 8e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 327 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 133
Alignment:
Q  327 ttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatc 426  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  517 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 418  T
Q  427 ttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt----------- 515  Q
    |||||| |||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  417 ttggacgtac------tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgtt 324  T
Q  516 ------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtaca 609  Q
          |||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  323 acacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtaca 224  T
Q  610 aacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  223 aacagtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 325 - 598
Target Start/End: Original strand, 408223 - 408512
Alignment:
Q  325 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 424  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  408223 ttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 408322  T
Q  425 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtg 507  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||                 |||    
T  408323 tcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtg 408422  T
Q  508 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 598  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  408423 ttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgat 408512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 324 - 487
Target Start/End: Original strand, 93894 - 94056
Alignment:
Q  324 tttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa 423  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  93894 tttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaac 93992  T
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 487  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  93993 atcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 505 - 678
Target Start/End: Original strand, 94374 - 94547
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 604  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  94374 gtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccact 94473  T
Q  605 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcat 678  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  94474 gtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcat 94547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 165; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 321 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 12303 - 11908
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12303 acttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 12205  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------------- 504  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||                    
T  12204 aacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtgg 12105  T
Q  505 -gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 603  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12104 ggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccac 12005  T
Q  604 cg-tacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtca-ttctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
     | |||||||| | ||||||  |||||| |||||||| ||  ||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  12004 tgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaatttt 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 152; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 319 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 44353 - 43959
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  44353 tgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgctt 44254  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 512  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||          
T  44253 gcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgt 44155  T
Q  513 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
               |||| |||||| || | |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44154 ggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgcc 44055  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |  |||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||    
T  44054 attgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 43959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 152; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 319 - 697
Target Start/End: Original strand, 154434 - 154828
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  154434 tgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgctt 154533  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 512  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||          
T  154534 gcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgt 154632  T
Q  513 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 601  Q
               |||| |||||| || | |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  154633 ggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgcc 154732  T
Q  602 accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 697  Q
    |  |||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||    
T  154733 attgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 154828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 139; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 315 - 683
Target Start/End: Original strand, 145799 - 146185
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  145799 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaa 145898  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  145899 tgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 145998  T
Q  513 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 596  Q
                    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  145999 tttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttg 146098  T
Q  597 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 683  Q
    ||| ||   |||||| | |||||||  ||||| |||| |||| ||  |||| |||  |||| |||| |||| ||||||| |||||||    
T  146099 atgtcattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgactt 146185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 120; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 267673 - 267331
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||  |         |||||||||||||||| |||    
T  267673 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taattcatctagtaattctt 267583  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacac---- 513  Q
    |||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        
T  267582 gcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttg 267483  T
Q  514 -------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 600  Q
                 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||     
T  267482 tgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatga 267383  T
Q  601 caccgtac-aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 651  Q
    ||| |||| ||||||| || ||  |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  267382 cactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 55; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100894
Alignment:
Q  371 ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgc 470  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||            |||||| |||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacat------------cgttggaatctttaacatgc 100973  T
Q  471 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac--ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 555  Q
    ||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  100972 aaacagagttgatgatattatgtg--------aagtgttacacagttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 608 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42347
Alignment:
Q  608 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 700  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttcaccataaaattttcct 42347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University