View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12751_low_6 (Length: 564)

Name: NF12751_low_6
Description: NF12751
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12751_low_6
NF12751_low_6
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (19-515)||(41764572-41765063)
chr7 (291-546)||(29173668-29173922)
chr7 (308-546)||(31520519-31520757)
chr7 (319-550)||(32592996-32593226)
chr7 (319-512)||(35353287-35353480)
chr7 (290-515)||(48928057-48928282)
chr7 (315-515)||(37703283-37703483)
chr7 (319-515)||(9355615-9355811)
chr7 (312-515)||(18797503-18797706)
chr7 (319-546)||(26980451-26980678)
chr7 (290-546)||(12390409-12390663)
chr7 (315-515)||(17842369-17842569)
chr7 (315-515)||(37110050-37110250)
chr7 (319-515)||(37347197-37347393)
chr7 (315-515)||(30055703-30055903)
chr7 (319-515)||(31578853-31579049)
chr7 (319-515)||(46480918-46481114)
chr7 (286-515)||(24211917-24212147)
chr7 (321-499)||(44411331-44411509)
chr7 (323-515)||(32820846-32821038)
chr7 (312-515)||(4583095-4583298)
chr7 (312-515)||(23111368-23111571)
chr7 (321-515)||(10359005-10359199)
chr7 (315-515)||(27283920-27284122)
chr7 (319-515)||(15612548-15612744)
chr7 (319-512)||(32432631-32432824)
chr7 (312-515)||(10481781-10481984)
chr7 (290-515)||(5657240-5657466)
chr7 (319-515)||(8861461-8861657)
chr7 (315-514)||(7334971-7335169)
chr7 (319-515)||(6546695-6546891)
chr7 (319-515)||(15672548-15672747)
chr7 (319-515)||(21991812-21991999)
chr7 (319-515)||(26587881-26588069)
chr7 (336-515)||(11071382-11071558)
chr7 (360-546)||(12165880-12166074)
chr7 (323-515)||(25691337-25691529)
chr7 (315-486)||(37704387-37704558)
chr7 (323-467)||(22687455-22687599)
chr7 (327-506)||(43925286-43925459)
chr7 (401-515)||(43686216-43686330)
chr7 (401-546)||(38053606-38053751)
chr7 (323-515)||(44598842-44599034)
chr7 (321-475)||(34361967-34362123)
chr7 (385-515)||(33688117-33688247)
chr7 (424-515)||(38258721-38258812)
chr7 (290-403)||(38258867-38258980)
chr7 (40-146)||(41756651-41756757)
chr7 (435-515)||(48928469-48928549)
chr7 (461-515)||(37704333-37704387)
chr7 (505-550)||(41765070-41765115)
chr7 (504-546)||(15672753-15672795)
chr7 (505-546)||(26588076-26588117)
chr7 (384-447)||(27421219-27421282)
chr7 (505-548)||(48928289-48928332)
chr7 (505-543)||(6546650-6546688)
chr7 (505-546)||(9355818-9355859)
chr7 (505-546)||(15612751-15612792)
chr7 (505-546)||(37704285-37704326)
chr7 (505-546)||(44413371-44413412)
chr7 (463-515)||(27421313-27421365)
chr7 (506-546)||(27421373-27421413)
chr7 (505-548)||(48928556-48928599)
chr7 (505-543)||(25691536-25691574)
chr7 (504-546)||(33688253-33688295)
chr7 (506-546)||(5657474-5657514)
chr7 (505-541)||(10359206-10359242)
chr7 (289-365)||(12166215-12166291)
chr7 (518-550)||(38258669-38258701)
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (319-550)||(14758186-14758425)
chr1 (323-546)||(11742155-11742378)
chr1 (308-515)||(15168293-15168500)
chr1 (323-512)||(2959948-2960137)
chr1 (315-515)||(37451482-37451682)
chr1 (291-515)||(32216252-32216476)
chr1 (289-515)||(19899521-19899748)
chr1 (312-515)||(8222325-8222528)
chr1 (336-512)||(16415846-16416022)
chr1 (288-515)||(46931606-46931834)
chr1 (312-515)||(10922924-10923127)
chr1 (315-515)||(15383130-15383331)
chr1 (323-515)||(238300-238492)
chr1 (323-515)||(47279386-47279578)
chr1 (323-515)||(48353740-48353931)
chr1 (324-515)||(27227273-27227464)
chr1 (323-509)||(27563692-27563878)
chr1 (289-499)||(34012135-34012345)
chr1 (310-515)||(40885010-40885216)
chr1 (315-515)||(23999544-23999745)
chr1 (315-515)||(28564562-28564760)
chr1 (319-515)||(30254620-30254816)
chr1 (315-515)||(32267231-32267431)
chr1 (318-512)||(9902836-9903030)
chr1 (330-515)||(25160829-25161015)
chr1 (286-515)||(27532732-27532960)
chr1 (315-515)||(27763089-27763290)
chr1 (315-515)||(51129056-51129254)
chr1 (323-515)||(7078850-7079042)
chr1 (319-515)||(27266984-27267179)
chr1 (319-515)||(47682277-47682473)
chr1 (319-515)||(38823411-38823607)
chr1 (319-515)||(31621331-31621533)
chr1 (323-512)||(4330481-4330670)
chr1 (315-515)||(28769850-28770050)
chr1 (359-515)||(30326775-30326931)
chr1 (288-515)||(22170908-22171135)
chr1 (341-515)||(1359740-1359914)
chr1 (328-516)||(3309349-3309538)
chr1 (283-515)||(15752226-15752458)
chr1 (321-515)||(10181792-10181987)
chr1 (315-515)||(39393581-39393781)
chr1 (323-493)||(3535142-3535312)
chr1 (319-467)||(1547516-1547664)
chr1 (312-515)||(42721236-42721435)
chr1 (308-498)||(21289817-21290004)
chr1 (323-550)||(33725398-33725631)
chr1 (377-515)||(18422848-18422986)
chr1 (364-491)||(37618729-37618856)
chr1 (336-546)||(41926312-41926532)
chr1 (319-477)||(31962851-31963010)
chr1 (398-515)||(38759730-38759847)
chr1 (505-550)||(4330426-4330471)
chr1 (505-546)||(7079049-7079090)
chr1 (505-546)||(10181994-10182035)
chr1 (505-546)||(27227471-27227512)
chr1 (440-546)||(48620786-48620900)
chr1 (319-379)||(48620922-48620982)
chr1 (511-550)||(31621545-31621584)
chr1 (508-546)||(16415795-16415833)
chr1 (63-145)||(26973807-26973889)
chr1 (508-546)||(42721188-42721226)
chr1 (505-546)||(238499-238540)
chr1 (319-355)||(38759847-38759883)
chr1 (505-543)||(3535084-3535122)
chr1 (512-546)||(27563898-27563932)
chr1 (505-546)||(27532967-27533007)
chr1 (505-546)||(34012363-34012404)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (319-546)||(24886257-24886484)
chr5 (308-515)||(33908434-33908640)
chr5 (319-515)||(699351-699547)
chr5 (319-512)||(22980997-22981190)
chr5 (323-550)||(14409123-14409353)
chr5 (312-515)||(2888216-2888419)
chr5 (315-512)||(31705386-31705583)
chr5 (312-515)||(5830093-5830296)
chr5 (319-515)||(31786424-31786620)
chr5 (291-515)||(40133586-40133810)
chr5 (319-515)||(22255383-22255579)
chr5 (315-515)||(35504566-35504766)
chr5 (319-515)||(7208642-7208838)
chr5 (319-515)||(12910556-12910752)
chr5 (291-515)||(36866963-36867187)
chr5 (323-515)||(38528019-38528211)
chr5 (365-543)||(1428983-1429164)
chr5 (312-515)||(36860625-36860828)
chr5 (319-515)||(15992318-15992514)
chr5 (315-515)||(17157805-17158005)
chr5 (312-512)||(22973853-22974053)
chr5 (319-499)||(35511260-35511440)
chr5 (309-515)||(35826254-35826458)
chr5 (319-513)||(8437168-8437362)
chr5 (320-515)||(8741664-8741860)
chr5 (319-515)||(19120060-19120256)
chr5 (323-546)||(25669739-25669969)
chr5 (319-515)||(5837756-5837952)
chr5 (315-515)||(27330505-27330705)
chr5 (323-515)||(35934097-35934289)
chr5 (319-495)||(42342942-42343118)
chr5 (319-515)||(23116008-23116196)
chr5 (312-515)||(27318259-27318461)
chr5 (319-546)||(32563302-32563537)
chr5 (319-467)||(39573060-39573208)
chr5 (281-511)||(13956104-13956332)
chr5 (319-502)||(25889584-25889767)
chr5 (319-546)||(22019785-22020020)
chr5 (323-546)||(8466897-8467119)
chr5 (323-543)||(9200389-9200617)
chr5 (323-515)||(30969106-30969298)
chr5 (323-515)||(25500708-25500900)
chr5 (319-495)||(7693442-7693618)
chr5 (323-515)||(15724689-15724881)
chr5 (308-488)||(43308427-43308607)
chr5 (308-515)||(21088535-21088740)
chr5 (319-460)||(28416329-28416470)
chr5 (281-512)||(23954542-23954760)
chr5 (319-512)||(14919317-14919499)
chr5 (315-417)||(43254154-43254256)
chr5 (319-456)||(26269069-26269206)
chr5 (389-515)||(6824329-6824453)
chr5 (457-515)||(26268275-26268333)
chr5 (505-546)||(22980946-22980987)
chr5 (505-546)||(23954770-23954811)
chr5 (505-550)||(31786627-31786672)
chr5 (505-546)||(27330457-27330498)
chr5 (505-546)||(30969305-30969346)
chr5 (505-545)||(25500907-25500947)
chr5 (505-544)||(7693385-7693424)
chr5 (505-546)||(14919509-14919550)
chr5 (506-543)||(21088748-21088785)
chr5 (505-546)||(35511458-35511499)
chr5 (477-509)||(5112250-5112282)
chr5 (505-545)||(43308633-43308673)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (319-543)||(11357169-11357393)
chr3 (314-515)||(46297545-46297746)
chr3 (308-515)||(48355133-48355340)
chr3 (291-515)||(26941020-26941244)
chr3 (325-516)||(22451159-22451350)
chr3 (319-514)||(52040710-52040905)
chr3 (312-548)||(43975673-43975922)
chr3 (323-515)||(53228944-53229136)
chr3 (319-513)||(40552047-40552241)
chr3 (319-515)||(1089886-1090081)
chr3 (323-511)||(22622510-22622698)
chr3 (319-515)||(39282844-39283040)
chr3 (315-515)||(42505859-42506059)
chr3 (282-515)||(21009552-21009786)
chr3 (315-515)||(54505999-54506200)
chr3 (319-515)||(4015652-4015847)
chr3 (319-515)||(33698345-33698541)
chr3 (312-515)||(24707896-24708099)
chr3 (290-515)||(33378544-33378769)
chr3 (319-515)||(37157899-37158096)
chr3 (315-515)||(3362447-3362647)
chr3 (315-546)||(44186301-44186533)
chr3 (315-546)||(40936135-40936365)
chr3 (319-515)||(2008124-2008327)
chr3 (315-515)||(47481714-47481915)
chr3 (319-515)||(37203259-37203456)
chr3 (323-515)||(7327274-7327466)
chr3 (315-515)||(25579931-25580131)
chr3 (319-515)||(44891689-44891885)
chr3 (323-495)||(29099558-29099730)
chr3 (359-515)||(34133127-34133283)
chr3 (360-512)||(46994490-46994642)
chr3 (319-510)||(22445853-22446044)
chr3 (321-515)||(4761438-4761632)
chr3 (315-515)||(27480142-27480350)
chr3 (312-503)||(51212558-51212743)
chr3 (319-546)||(14586468-14586702)
chr3 (323-515)||(32373662-32373853)
chr3 (319-515)||(11356946-11357134)
chr3 (315-513)||(24488745-24488944)
chr3 (312-512)||(3654980-3655183)
chr3 (319-510)||(21193803-21193995)
chr3 (319-512)||(36012333-36012528)
chr3 (376-515)||(54828546-54828685)
chr3 (319-515)||(20373051-20373228)
chr3 (359-508)||(38591897-38592046)
chr3 (319-546)||(29163962-29164190)
chr3 (326-497)||(50475021-50475199)
chr3 (392-515)||(45174698-45174821)
chr3 (319-515)||(11467016-11467198)
chr3 (401-515)||(43348449-43348563)
chr3 (392-515)||(11835494-11835611)
chr3 (394-502)||(53811597-53811701)
chr3 (505-550)||(22451108-22451153)
chr3 (505-550)||(33378776-33378821)
chr3 (315-377)||(35844577-35844639)
chr3 (505-550)||(27480370-27480415)
chr3 (506-546)||(32373614-32373654)
chr3 (506-546)||(43348401-43348441)
chr3 (504-543)||(21193753-21193792)
chr3 (504-546)||(22446054-22446096)
chr3 (508-546)||(52040916-52040954)
chr3 (81-146)||(36806094-36806159)
chr3 (452-515)||(35844519-35844581)
chr3 (507-546)||(46994654-46994693)
chr3 (93-147)||(49301577-49301631)
chr3 (477-515)||(53176246-53176284)
chr3 (506-546)||(11835619-11835660)
chr3 (293-346)||(13498678-13498731)
chr3 (505-546)||(22622709-22622750)
chr3 (505-546)||(24488953-24488994)
chr3 (308-353)||(34133312-34133357)
chr3 (81-146)||(36515067-36515132)
chr3 (505-546)||(46297753-46297794)
chr3 (505-546)||(51212972-51213013)
chr3 (507-543)||(53229145-53229181)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (291-515)||(28002772-28002996)
chr4 (319-515)||(33816330-33816526)
chr4 (308-515)||(32579647-32579854)
chr4 (315-515)||(3042820-3043020)
chr4 (315-515)||(36493499-36493699)
chr4 (312-515)||(25184314-25184517)
chr4 (290-515)||(6864236-6864461)
chr4 (291-515)||(35020817-35021045)
chr4 (319-515)||(33341599-33341795)
chr4 (319-515)||(47253941-47254137)
chr4 (312-515)||(1815502-1815704)
chr4 (289-515)||(19089237-19089463)
chr4 (319-515)||(7703710-7703906)
chr4 (315-515)||(37663551-37663751)
chr4 (312-515)||(879355-879558)
chr4 (312-515)||(7152011-7152214)
chr4 (319-513)||(49376170-49376364)
chr4 (319-515)||(34361305-34361502)
chr4 (336-513)||(55477722-55477899)
chr4 (320-512)||(5047781-5047973)
chr4 (289-513)||(19440432-19440656)
chr4 (319-515)||(55240919-55241115)
chr4 (308-515)||(25700859-25701066)
chr4 (319-515)||(32912393-32912590)
chr4 (319-515)||(17167914-17168110)
chr4 (319-515)||(17173491-17173687)
chr4 (282-546)||(30002418-30002690)
chr4 (319-512)||(37287932-37288126)
chr4 (321-515)||(50764921-50765115)
chr4 (315-546)||(37775820-37776059)
chr4 (319-515)||(50697442-50697639)
chr4 (319-511)||(46887972-46888163)
chr4 (335-506)||(34947925-34948096)
chr4 (319-515)||(23761272-23761468)
chr4 (315-515)||(29584010-29584210)
chr4 (319-488)||(39400236-39400405)
chr4 (315-515)||(17272165-17272365)
chr4 (315-515)||(26896288-26896489)
chr4 (319-495)||(4598203-4598379)
chr4 (319-484)||(4205216-4205381)
chr4 (314-481)||(32592319-32592486)
chr4 (319-454)||(35025381-35025515)
chr4 (315-515)||(42199930-42200131)
chr4 (323-512)||(46883932-46884116)
chr4 (319-480)||(9139465-9139624)
chr4 (330-515)||(27396817-27397000)
chr4 (401-515)||(38012055-38012169)
chr4 (319-515)||(4934026-4934212)
chr4 (319-437)||(23431834-23431952)
chr4 (323-410)||(38012568-38012655)
chr4 (440-515)||(35025531-35025606)
chr4 (505-550)||(28003003-28003048)
chr4 (505-548)||(33816550-33816593)
chr4 (412-475)||(56050171-56050234)
chr4 (508-550)||(5047985-5048027)
chr4 (504-546)||(7703662-7703704)
chr4 (505-546)||(9139398-9139439)
chr4 (505-546)||(17272117-17272158)
chr4 (505-546)||(46888174-46888215)
chr4 (505-546)||(55241122-55241163)
chr4 (506-546)||(25701075-25701115)
chr4 (505-543)||(32592249-32592287)
chr4 (505-546)||(23761225-23761265)
chr4 (513-546)||(35021060-35021093)
chr4 (505-546)||(39398062-39398103)
chr4 (505-546)||(55477908-55477949)
chr4 (510-546)||(29584222-29584258)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (308-515)||(41465702-41465909)
chr2 (319-546)||(7006744-7006971)
chr2 (291-512)||(26357781-26358002)
chr2 (291-515)||(4167123-4167347)
chr2 (314-515)||(35959097-35959294)
chr2 (291-515)||(2325156-2325380)
chr2 (312-515)||(11366179-11366383)
chr2 (308-515)||(19289118-19289325)
chr2 (319-508)||(18494087-18494276)
chr2 (290-515)||(41961041-41961266)
chr2 (323-515)||(44913865-44914060)
chr2 (315-515)||(43648047-43648247)
chr2 (330-515)||(4763832-4764017)
chr2 (319-515)||(3177140-3177336)
chr2 (311-515)||(37905911-37906116)
chr2 (323-515)||(33709042-33709234)
chr2 (337-512)||(19500739-19500914)
chr2 (319-546)||(33660183-33660418)
chr2 (319-515)||(31862053-31862249)
chr2 (319-545)||(43770654-43770888)
chr2 (312-499)||(39167168-39167355)
chr2 (293-512)||(31570514-31570733)
chr2 (323-495)||(5881750-5881922)
chr2 (364-515)||(4478566-4478717)
chr2 (363-515)||(4263926-4264079)
chr2 (324-515)||(29241956-29242140)
chr2 (308-504)||(13711671-13711867)
chr2 (330-515)||(33550800-33550988)
chr2 (359-546)||(27349794-27349989)
chr2 (286-515)||(19424415-19424630)
chr2 (381-515)||(44286150-44286284)
chr2 (381-546)||(19314004-19314182)
chr2 (411-515)||(45327921-45328025)
chr2 (325-474)||(41051112-41051260)
chr2 (424-515)||(17071648-17071739)
chr2 (411-515)||(36642189-36642293)
chr2 (424-515)||(17054007-17054098)
chr2 (323-413)||(33902317-33902407)
chr2 (423-515)||(18258197-18258289)
chr2 (319-428)||(18257344-18257453)
chr2 (319-378)||(45328028-45328087)
chr2 (442-512)||(41463779-41463849)
chr2 (323-435)||(41463400-41463512)
chr2 (505-550)||(45327869-45327914)
chr2 (505-546)||(29242147-29242188)
chr2 (505-544)||(33709241-33709280)
chr2 (463-515)||(33902267-33902319)
chr2 (505-544)||(19424637-19424676)
chr2 (512-546)||(4264093-4264127)
chr2 (342-387)||(17053960-17054005)
chr2 (342-387)||(17071601-17071646)
chr2 (505-546)||(31570743-31570784)
chr2 (505-545)||(18258296-18258336)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (291-515)||(33906412-33906634)
chr8 (315-515)||(1149422-1149622)
chr8 (319-511)||(16446669-16446861)
chr8 (312-515)||(43643382-43643585)
chr8 (319-515)||(4132480-4132676)
chr8 (323-515)||(27082636-27082828)
chr8 (319-515)||(37970313-37970509)
chr8 (319-513)||(7890751-7890945)
chr8 (315-515)||(8803606-8803807)
chr8 (323-515)||(23854229-23854421)
chr8 (291-499)||(34895178-34895386)
chr8 (315-512)||(11727227-11727425)
chr8 (308-510)||(35459494-35459696)
chr8 (290-515)||(1205127-1205352)
chr8 (315-515)||(40862619-40862820)
chr8 (323-515)||(1953786-1953978)
chr8 (336-515)||(16223063-16223242)
chr8 (319-515)||(5299740-5299936)
chr8 (319-515)||(38644178-38644374)
chr8 (319-489)||(35859160-35859330)
chr8 (323-515)||(36694764-36694956)
chr8 (319-515)||(44869697-44869893)
chr8 (343-515)||(6098331-6098508)
chr8 (308-485)||(12587812-12587989)
chr8 (319-546)||(34951851-34952069)
chr8 (319-515)||(31933680-31933876)
chr8 (323-488)||(466059-466224)
chr8 (361-515)||(1149756-1149906)
chr8 (319-515)||(12876309-12876506)
chr8 (323-515)||(30654381-30654573)
chr8 (359-515)||(9864348-9864504)
chr8 (312-500)||(10554991-10555179)
chr8 (323-508)||(39098917-39099102)
chr8 (315-473)||(18259321-18259479)
chr8 (325-467)||(24823194-24823336)
chr8 (315-460)||(33198057-33198202)
chr8 (440-546)||(7998446-7998553)
chr8 (319-414)||(41362723-41362818)
chr8 (401-515)||(13307823-13307936)
chr8 (291-415)||(43025974-43026099)
chr8 (449-512)||(43025905-43025968)
chr8 (443-515)||(41910907-41910978)
chr8 (394-485)||(34463704-34463792)
chr8 (505-543)||(41910985-41911023)
chr8 (505-546)||(5299943-5299984)
chr8 (505-546)||(36694963-36695004)
chr8 (505-543)||(6098515-6098553)
chr8 (505-546)||(465994-466035)
chr8 (505-546)||(1150102-1150143)
chr8 (308-353)||(9864533-9864578)
chr8 (505-546)||(16446872-16446913)
chr8 (505-546)||(34895119-34895160)
chr8 (506-546)||(1953987-1954027)
chr8 (315-355)||(13307939-13307979)
chr8 (506-546)||(39099117-39099157)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (287-515)||(20768283-20768511)
chr6 (323-515)||(3879730-3879922)
chr6 (283-515)||(7234783-7235018)
chr6 (291-515)||(6090941-6091166)
chr6 (319-515)||(1946035-1946233)
chr6 (315-515)||(33619026-33619234)
chr6 (323-515)||(5627592-5627785)
chr6 (336-515)||(4318626-4318805)
chr6 (321-515)||(29182365-29182556)
chr6 (319-495)||(33892799-33892975)
chr6 (319-515)||(8513429-8513618)
chr6 (330-515)||(21016916-21017095)
chr6 (326-510)||(6089109-6089286)
chr6 (319-463)||(7054559-7054704)
chr6 (430-515)||(30353256-30353341)
chr6 (457-515)||(7055140-7055198)
chr6 (505-550)||(7235025-7235070)
chr6 (505-548)||(15491766-15491809)
chr6 (335-390)||(33724062-33724117)
chr6 (449-512)||(15491819-15491882)
chr6 (505-546)||(4318812-4318854)
chr6 (505-546)||(33892993-33893034)
chr6 (505-545)||(21017102-21017142)
chr6 (506-546)||(30353349-30353389)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (315-515)||(8088-8288)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (325-515)||(408223-408413)
scaffold0002 (327-515)||(335-517)
scaffold0002 (324-487)||(93894-94056)
scaffold0002 (479-515)||(94331-94367)
[»] scaffold0318 (2 HSPs)
scaffold0318 (321-515)||(12110-12303)
scaffold0318 (505-546)||(12062-12103)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (315-515)||(145799-146000)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (319-515)||(44158-44353)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (319-515)||(154434-154629)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (319-515)||(267485-267673)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (371-546)||(100903-101058)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 515
Target Start/End: Original strand, 41764572 - 41765063
Alignment:
Q  19 actctcgtgcttatgacctcttaaggataaccgtcaaagactacatcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41764572 actctcgtgcttatgacctcttaaggataaccgtcaaagactacatcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatca 41764671  T
Q  119 tttcatacttgcttgccatgattgggtaaatctatcactagccnnnnnnncttaaaaatcttagtacatgcattctagtctagagtaagtgaacacttct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  41764672 tttcatacttgcttgccatgattgggtaaatctatcactagcatttttttcttaaaaatcttagtacatgcattctag-----agtaagtgaacacttct 41764766  T
Q  219 tagcattttcctaaaagatatcatacatacatttattgtagtcaannnnnnnnattctatccattaattaatgggagcttccacactggagttagaaaat 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||  | ||||    
T  41764767 tagcattttcttaaaagatatcatacatacatttattgtagtcaattttttttattctatcaattaattaatgggagtttctacggtggagtcgggaaat 41764866  T
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41764867 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgctt 41764966  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41764967 gcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 41765063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 291 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29173922 - 29173668
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  29173922 gggagcttctacgatgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatg 29173823  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29173822 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatatta 29173724  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29173723 tgtgatagtcttaagtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 29173668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 308 - 546
Target Start/End: Original strand, 31520519 - 31520757
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  31520519 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatc 31520618  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520619 gagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 31520718  T
Q  508 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31520719 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtg 31520757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 319 - 550
Target Start/End: Original strand, 32592996 - 32593226
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||    
T  32592996 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatattt 32593094  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32593095 gtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttaaa 32593194  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  32593195 acaaggtatgataaaattagattaaatgcagt 32593226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 35353480 - 35353287
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35353480 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgctt 35353381  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35353380 gcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttaca 35353287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 290 - 515
Target Start/End: Original strand, 48928057 - 48928282
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48928057 tgggagcttctacggtgcagttagaaaattgacttttttaaaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaat 48928156  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928157 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatatt 48928256  T
Q  490 atgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  48928257 atgcgatagtcttaagcattacactt 48928282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 37703283 - 37703483
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37703283 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37703382  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37703383 gtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacact 37703482  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  37703483 t 37703483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 9355615 - 9355811
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9355615 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgctt 9355714  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9355715 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 9355811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18797706 - 18797503
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18797706 agaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 18797607  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797606 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 18797507  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  18797506 actt 18797503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 319 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26980678 - 26980451
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  26980678 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatactt 26980579  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26980578 gcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 26980479  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  26980478 acaaggtagaataaaattagattaagtg 26980451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 290 - 546
Target Start/End: Original strand, 12390409 - 12390663
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  12390409 tgggagcttctacggtgaagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaat 12390508  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12390509 gataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatatt 12390608  T
Q  490 atgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  12390609 atgtg--agtcttaagtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtg 12390663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 17842369 - 17842569
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17842369 aaattgacttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataat 17842468  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17842469 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 17842568  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  17842569 t 17842569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37110250 - 37110050
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37110250 aaattgatttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37110151  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37110150 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 37110051  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  37110050 t 37110050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37347393 - 37347197
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37347393 tgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgctt 37347294  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37347293 gcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactt 37347197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30055903 - 30055703
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30055903 aaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 30055804  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055803 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 30055704  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  30055703 t 30055703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 31578853 - 31579049
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31578853 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 31578952  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31578953 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 31579049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 46480918 - 46481114
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  46480918 tgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 46481017  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46481018 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 46481114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 286 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24212147 - 24211917
Alignment:
Q  286 ttaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat 385  Q
    |||||| ||||||| ||  || ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24212147 ttaatgagagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 24212048  T
Q  386 taatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatg 484  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  24212047 taatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatg 24211948  T
Q  485 atattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24211947 atattatgtgatagtcttaggtgttacactt 24211917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 321 - 499
Target Start/End: Original strand, 44411331 - 44411509
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411331 acttttttggaaaggttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgc 44411430  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 499  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44411431 aacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 32820846 - 32821038
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32820846 tttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 32820945  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32820946 catcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 32821038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4583298 - 4583095
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  4583298 agaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagt 4583199  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4583198 aatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttac 4583099  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  4583098 actt 4583095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23111571 - 23111368
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  23111571 agaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagt 23111472  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111471 aatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 23111372  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  23111371 actt 23111368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 321 - 515
Target Start/End: Original strand, 10359005 - 10359199
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  10359005 acttttttgaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgc 10359104  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359105 aaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactt 10359199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27284122 - 27283920
Alignment:
Q  315 aaattgactttttt-gaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttc-atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagta 412  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27284122 aaattgactttttttgaaaagattaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagta 27284023  T
Q  413 atgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27284022 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttaca 27283923  T
Q  513 ctt 515  Q
    |||    
T  27283922 ctt 27283920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 15612548 - 15612744
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15612548 tgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgctt 15612647  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15612648 gcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 15612744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32432824 - 32432631
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32432824 tgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgctt 32432725  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32432724 gcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 32432631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10481984 - 10481781
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10481984 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagt 10481885  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481884 aatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 10481785  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  10481784 actt 10481781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 290 - 515
Target Start/End: Original strand, 5657240 - 5657466
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatctt-aatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    |||||||||| ||| || |||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |   |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  5657240 tgggagcttctacaatgcagttatgaaactgacatttttgaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaa 5657339  T
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5657340 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatat 5657439  T
Q  489 tatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5657440 catgcgatagtcttaagtattacactt 5657466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8861657 - 8861461
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  8861657 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcat 8861558  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8861557 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactt 8861461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 315 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 7335169 - 7334971
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7335169 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaat 7335070  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7335069 gcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacact 7334971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6546891 - 6546695
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6546891 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 6546792  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||   ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||    
T  6546791 gcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactt 6546695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 15672548 - 15672747
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15672548 tgacttttttgaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 15672647  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatac---tatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| || |||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15672648 gcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 15672747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21991999 - 21991812
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    | | |||||||||| ||||||||||     |||||    
T  21991999 tgacttttttgaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt----aatgatgatcaatagtaattcatct-----tgctt 21991909  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21991908 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 21991812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 26587881 - 26588069
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26587881 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcct 26587980  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26587981 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactt 26588069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 336 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11071558 - 11071382
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11071558 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggactta 11071459  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||  || ||||| |||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11071458 caggtattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactt 11071382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 360 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165880
Alignment:
Q  360 tcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcat 459  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  460 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||  |||      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtg 12165880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 25691337 - 25691529
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25691337 ttttttaaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaa 25691436  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     || ||| |||||||| |  ||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25691437 cattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactt 25691529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 315 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37704558 - 37704387
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37704558 aaattgacttttttggaaaaactaatcttgattttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaat 37704459  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 486  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704458 gcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 323 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 22687599 - 22687455
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22687599 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaa 22687500  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca 467  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22687499 catcttggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaaca 22687455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 43925459 - 43925286
Alignment:
Q  327 ttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatc 426  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  43925459 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 43925360  T
Q  427 ttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 506  Q
    ||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  43925359 ttggac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagt 43925286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686216
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  501 ttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||    
T  43686230 ttaagtgttacactt 43686216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 401 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053606
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  501 ttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  38053651 ttaagtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtg 38053606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44599034 - 44598842
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgct---gattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttg 419  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| | | | |||||||| ||||||||||||  |   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  44599034 ttttttgaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttg 44598938  T
Q  420 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     || ||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44598937 taacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactt 44598842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 321 - 475
Target Start/End: Original strand, 34361967 - 34362123
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttga-tctt-aatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  34361967 acttttttgaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgttt 34362066  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaaca 475  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  34362067 gcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 385 - 515
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688247
Alignment:
Q  385 ttaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatg 484  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  485 atattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| || |||||||||| | ||||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactt 33688247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38258812 - 38258721
Alignment:
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258812 atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 38258721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38258980 - 38258867
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38258980 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 38258881  T
Q  390 gatcaatattaatt 403  Q
    |||||||| |||||    
T  38258880 gatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Original strand, 41756651 - 41756757
Alignment:
Q  40 taaggataaccgtcaaagactacatcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatga 139  Q
    |||||| |||| ||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41756651 taaggaaaaccatcacagattatatcaatgtggtttccgaaaaatatcccttttggaaccgaagccttggagctgatcatttcatgctttcttgccatga 41756750  T
Q  140 ttgggta 146  Q
    |||||||    
T  41756751 ttgggta 41756757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 435 - 515
Target Start/End: Original strand, 48928469 - 48928549
Alignment:
Q  435 acatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  48928469 acatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactt 48928549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704333
Alignment:
Q  461 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 37704333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 550
Target Start/End: Original strand, 41765070 - 41765115
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41765070 gtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagt 41765115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 504 - 546
Target Start/End: Original strand, 15672753 - 15672795
Alignment:
Q  504 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15672753 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 15672795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 26588076 - 26588117
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26588076 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 26588117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421282
Alignment:
Q  384 attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactattt 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactattt 27421282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 548
Target Start/End: Original strand, 48928289 - 48928332
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgca 548  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48928289 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgca 48928332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6546688 - 6546650
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6546688 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 6546650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 9355818 - 9355859
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9355818 gtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtg 9355859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 15612751 - 15612792
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15612751 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtg 15612792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 37704326 - 37704285
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37704326 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtg 37704285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 44413371 - 44413412
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44413371 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtg 44413412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 515
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421365
Alignment:
Q  463 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactt 27421365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Original strand, 27421373 - 27421413
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27421373 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtg 27421413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 548
Target Start/End: Original strand, 48928556 - 48928599
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgca 548  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  48928556 gtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgca 48928599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 543
Target Start/End: Original strand, 25691536 - 25691574
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25691536 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaa 25691574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 504 - 546
Target Start/End: Original strand, 33688253 - 33688295
Alignment:
Q  504 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33688253 agtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtg 33688295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Original strand, 5657474 - 5657514
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  5657474 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtg 5657514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 541
Target Start/End: Original strand, 10359206 - 10359242
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagatt 541  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10359206 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatt 10359242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12166291 - 12166215
Alignment:
Q  289 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcattt 365  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  12166291 atgggagcttctacactgcagtcatgaaactgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 518 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 38258701 - 38258669
Alignment:
Q  518 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38258701 aacaaggtaggataaaattagattaagtgcagt 38258669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 319 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 14758425 - 14758186
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14758425 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 14758326  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------gtgtta 510  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||    
T  14758325 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaatttctggggtgtta 14758226  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14758225 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagt 14758186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 323 - 546
Target Start/End: Original strand, 11742155 - 11742378
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11742155 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 11742254  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaa 522  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11742255 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttacacttaaaacaa 11742354  T
Q  523 ggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||| | |||||||||||||||||    
T  11742355 ggtaagataaaattagattaagtg 11742378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 308 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15168500 - 15168293
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15168500 agttaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatc 15168401  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15168400 taataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtg 15168301  T
Q  508 ttacactt 515  Q
    ||||||||    
T  15168300 ttacactt 15168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 323 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2960137 - 2959948
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2960137 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 2960038  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960037 catcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 2959948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37451682 - 37451482
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37451682 aaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37451583  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451582 gtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 37451483  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  37451482 t 37451482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32216476 - 32216252
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32216476 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 32216377  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32216376 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatatta 32216277  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32216276 tgtgatagtcttaagtgttacactt 32216252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 289 - 515
Target Start/End: Original strand, 19899521 - 19899748
Alignment:
Q  289 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19899521 atgggagcttctacagtgcagttaggaaactgacttttttggaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 19899620  T
Q  389 tgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 487  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  19899621 tgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgata 19899720  T
Q  488 ttatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899721 ttatgtgatagtcttaagtgttacactt 19899748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8222528 - 8222325
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 410  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8222528 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatat-aattcatctag 8222430  T
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8222429 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 8222330  T
Q  511 cactt 515  Q
    |||||    
T  8222329 cactt 8222325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 336 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16416022 - 16415846
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16416022 ttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggactta 16415923  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16415922 catgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattaca 16415846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 288 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 46931834 - 46931606
Alignment:
Q  288 aatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 387  Q
    |||||||||||| ||  || ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46931834 aatgggagcttctacggtgcagtaaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 46931735  T
Q  388 atgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 486  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  46931734 atgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 46931635  T
Q  487 attatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931634 attatgtgatagtcttaagtgttacactt 46931606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10923127 - 10922924
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10923127 agaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 10923028  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10923027 aatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttac 10922928  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  10922927 actt 10922924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15383331 - 15383130
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15383331 aaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaa 15383232  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15383231 tgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacac 15383132  T
Q  514 tt 515  Q
    ||    
T  15383131 tt 15383130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 238300 - 238492
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  238300 ttttttgaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 238399  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238400 catcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 238492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47279578 - 47279386
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  47279578 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaa 47279479  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47279478 catcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 47279386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 48353931 - 48353740
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48353931 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaa 48353832  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48353831 tatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactt 48353740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 324 - 515
Target Start/End: Original strand, 27227273 - 27227464
Alignment:
Q  324 tttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa 423  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27227273 tttttggaaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 27227372  T
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27227373 atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactt 27227464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 323 - 509
Target Start/End: Original strand, 27563692 - 27563878
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27563692 ttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaa 27563791  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 509  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27563792 catcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgtt 27563878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 289 - 499
Target Start/End: Original strand, 34012135 - 34012345
Alignment:
Q  289 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    ||||||||||| ||  || ||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34012135 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 34012234  T
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34012235 tgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 34012334  T
Q  489 tatgtgatagt 499  Q
    |||||||||||    
T  34012335 tatgtgatagt 34012345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 310 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40885216 - 40885010
Alignment:
Q  310 ttagaaaattgacttttttgaaaaggttaa-ttttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatct 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40885216 ttagaaaattgacttttttaaaaatgttaacttttaaccttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatct 40885117  T
Q  409 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 508  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40885116 agtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgt 40885017  T
Q  509 tacactt 515  Q
    |||||||    
T  40885016 tacactt 40885010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23999745 - 23999544
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23999745 aaattgacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 23999646  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999645 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 23999546  T
Q  514 tt 515  Q
    ||    
T  23999545 tt 23999544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 28564562 - 28564760
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28564562 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 28564661  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    | |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28564662 gtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacact 28564759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30254816 - 30254620
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30254816 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgctt 30254717  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30254716 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactt 30254620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32267431 - 32267231
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32267431 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaat 32267332  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32267331 gcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacact 32267232  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  32267231 t 32267231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 318 - 512
Target Start/End: Original strand, 9902836 - 9903030
Alignment:
Q  318 ttgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9902836 ttgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgct 9902935  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||  |||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9902936 tgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 9903030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25161015 - 25160829
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatctt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25161015 aaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 25160916  T
Q  429 ggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25160915 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactt 25160829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 286 - 515
Target Start/End: Original strand, 27532732 - 27532960
Alignment:
Q  286 ttaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat 385  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| |  ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27532732 ttaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgat 27532830  T
Q  386 taatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||    
T  27532831 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctga 27532930  T
Q  486 tattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27532931 tatcatgtgatagtcttgagtgttacactt 27532960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 27763089 - 27763290
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  27763089 aaattgacatttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaa 27763188  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27763189 tgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacac 27763288  T
Q  514 tt 515  Q
    ||    
T  27763289 tt 27763290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 51129254 - 51129056
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51129254 aaattgacttttttgaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 51129157  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51129156 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacact 51129057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 7078850 - 7079042
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7078850 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaa 7078949  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7078950 tatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactt 7079042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 27266984 - 27267179
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27266984 tgactttttggaaaag-ttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgctt 27267082  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27267083 gcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactt 27267179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 47682277 - 47682473
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47682277 tgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctt 47682376  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47682377 gcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 47682473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38823607 - 38823411
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38823607 tgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 38823508  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38823507 gcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 38823411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 31621331 - 31621533
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttt-taaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  31621331 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgct 31621430  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatct-----ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  31621431 tgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcaca 31621530  T
Q  513 ctt 515  Q
    |||    
T  31621531 ctt 31621533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 323 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4330670 - 4330481
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4330670 ttttttggaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaa 4330571  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
     || |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4330570 catattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 4330481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28770050 - 28769850
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28770050 aaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaat 28769951  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    | |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28769950 gtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacact 28769851  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  28769850 t 28769850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30326931
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaa 30326874  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30326875 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 30326931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 288 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22171135 - 22170908
Alignment:
Q  288 aatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 387  Q
    |||||||||||| ||  || | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||    
T  22171135 aatgggagcttctacggtgcaattagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaatta 22171036  T
Q  388 atgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 487  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22171035 atgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgata 22170936  T
Q  488 ttatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22170935 ttatgtgatagtcttaagtgttacactt 22170908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Original strand, 1359740 - 1359914
Alignment:
Q  341 tttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatat 440  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||  |    
T  1359740 tttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggt 1359839  T
Q  441 actatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1359840 actattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactt 1359914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 328 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 3309538 - 3309349
Alignment:
Q  328 tgaaaaggttaattttga-tcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatc 426  Q
    |||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3309538 tgaaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatc 3309439  T
Q  427 ttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactta 516  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3309438 ttggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactta 3309349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 283 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15752458 - 15752226
Alignment:
Q  283 taattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgct 382  Q
    ||||| ||||||||||| ||  || ||| |||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  15752458 taatttatgggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattact 15752359  T
Q  383 gattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttga 482  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||| |    
T  15752358 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaa 15752259  T
Q  483 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15752258 tgatattatgtgatactcttaagtgttacactt 15752226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 321 - 515
Target Start/End: Original strand, 10181792 - 10181987
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10181792 acttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 10181891  T
Q  421 aaaatcttggacttac-atatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    || || |||||||||| |  |||||||  || |||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10181892 aacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 10181987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39393781 - 39393581
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39393781 aaattgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 39393682  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    | |||||| |||||||| ||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39393681 gtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacact 39393582  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  39393581 t 39393581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 323 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 3535312 - 3535142
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3535312 tttttttaaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 3535213  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 493  Q
     |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  3535212 catcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgt 3535142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 319 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1547664 - 1547516
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1547664 tgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 1547565  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca 467  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1547564 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca 1547516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42721435 - 42721236
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42721435 agaaaattga-ttttttaaaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagt 42721337  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  42721336 aataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttat 42721240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 308 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21290004 - 21289817
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21290004 agttaaaaaactgacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatc 21289905  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 498  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  21289904 tagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 550
Target Start/End: Original strand, 33725398 - 33725631
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcattttta-aattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgca 421  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||    
T  33725398 ttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatgatcaata------------gtaatgtttgca 33725485  T
Q  422 aaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa----------------- 504  Q
    | || |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                     
T  33725486 acattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggg 33725585  T
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725586 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 33725631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 377 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18422986 - 18422848
Alignment:
Q  377 attgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacat 476  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||      
T  18422986 attgttgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacgg 18422887  T
Q  477 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422886 aggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 18422848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 491
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618856
Alignment:
Q  364 ttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatcttt 463  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  464 aacatgcaaacatagttgatgatattat 491  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattat 37618856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 336 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 41926532 - 41926312
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||| ||||||||  ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41926532 ttaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggactta 41926434  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgat-agtctta----------agtgttacacttaaaacaagg 524  Q
    ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||          ||||||||||||||||||| |    
T  41926433 caagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaataagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaag 41926334  T
Q  525 tagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  41926333 taggataaaattagattaagtg 41926312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 31963010 - 31962851
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaa-ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  31963010 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgct 31962911  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacata 477  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  31962910 tgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaacata 31962851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38759847 - 38759730
Alignment:
Q  398 ttaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata 497  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38759847 ttaattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgata 38759748  T
Q  498 gtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38759747 gtctcaagtgttacactt 38759730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 4330471 - 4330426
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4330471 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagt 4330426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 7079049 - 7079090
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7079049 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 7079090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 10181994 - 10182035
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10181994 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 10182035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 27227471 - 27227512
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27227471 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 27227512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 48620900 - 48620786
Alignment:
Q  440 tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggta 531  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48620900 tactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggata 48620801  T
Q  532 aaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||    
T  48620800 aaattagattaagtg 48620786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48620982 - 48620922
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgatt 379  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  48620982 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgatt 48620922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 550
Target Start/End: Original strand, 31621545 - 31621584
Alignment:
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31621545 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagt 31621584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16415833 - 16415795
Alignment:
Q  508 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16415833 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 16415795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26973889 - 26973807
Alignment:
Q  63 atcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggt 145  Q
    ||||||||| || | | ||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  26973889 atcaatgtcattgctggaaaatatccatattggaatagaagccttggagctgatcatttcatgctagcttgccatgactgggt 26973807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 42721226 - 42721188
Alignment:
Q  508 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42721226 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 42721188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 238499 - 238540
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  238499 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtg 238540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38759883 - 38759847
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgtt 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38759883 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtt 38759847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3535122 - 3535084
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3535122 gtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaa 3535084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 546
Target Start/End: Original strand, 27563898 - 27563932
Alignment:
Q  512 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27563898 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 27563932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 27532967 - 27533007
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27532967 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtg 27533007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 34012363 - 34012404
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34012363 gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtg 34012404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 319 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 24886484 - 24886257
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24886484 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 24886385  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24886384 gcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttata 24886285  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  24886284 ataaggtaggataaaattagattaagtg 24886257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 308 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33908640 - 33908434
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  33908640 agttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atc 33908542  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33908541 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtg 33908442  T
Q  508 ttacactt 515  Q
    ||||||||    
T  33908441 ttacactt 33908434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 699547 - 699351
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  699547 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgctt 699448  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  699447 gcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactt 699351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22981190 - 22980997
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22981190 tgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgatt 22981091  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981090 gcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 22980997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 323 - 550
Target Start/End: Original strand, 14409123 - 14409353
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  14409123 ttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaa 14409222  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag---tgttacacttaaaa 519  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||    
T  14409223 catcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagtagttacacttaaaa 14409322  T
Q  520 caaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14409323 caaggtagaataaaattagattaagtgcagt 14409353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 2888216 - 2888419
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2888216 agaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 2888315  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2888316 aatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttac 2888415  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  2888416 actt 2888419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 315 - 512
Target Start/End: Original strand, 31705386 - 31705583
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31705386 aaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 31705485  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31705486 gcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttaca 31705583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5830296 - 5830093
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 410  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5830296 agaaaattgacattttggaaaag-ttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctag 5830198  T
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5830197 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 5830098  T
Q  511 cactt 515  Q
    |||||    
T  5830097 cactt 5830093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 31786424 - 31786620
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31786424 tgacttttttgaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgctt 31786523  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31786524 gcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 31786620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40133810 - 40133586
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  40133810 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 40133711  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40133710 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatta 40133611  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  40133610 tgtgatagttttaagtgttacactt 40133586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22255579 - 22255383
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22255579 tgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggctt 22255480  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22255479 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactt 22255383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35504766 - 35504566
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35504766 aaattgacttttttgaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 35504667  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504666 acttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacact 35504567  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  35504566 t 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 7208642 - 7208838
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7208642 tgactttttttaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatactt 7208741  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7208742 gcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 7208838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12910752 - 12910556
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12910752 tgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgctt 12910653  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12910652 gcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactt 12910556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36867187 - 36866963
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  36867187 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 36867088  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36867087 attaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatta 36866988  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  36866987 tgtgatagttttaagtgttacactt 36866963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 38528019 - 38528211
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38528019 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 38528118  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528119 catcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 38528211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 365 - 543
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429164
Alignment:
Q  365 tttaaattgttga---ttgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatct 461  Q
    |||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  462 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1429083 ttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 1429164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36860828 - 36860625
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  36860828 agaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagt 36860729  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36860728 aatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttac 36860629  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  36860628 actt 36860625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 15992318 - 15992514
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15992318 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 15992417  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15992418 gcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactt 15992514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 17157805 - 17158005
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17157805 aaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaat 17157904  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17157905 gcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacact 17158004  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  17158005 t 17158005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 312 - 512
Target Start/End: Original strand, 22973853 - 22974053
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22973853 agaaaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 22973952  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22973953 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttac 22974052  T
Q  512 a 512  Q
    |    
T  22974053 a 22974053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 319 - 499
Target Start/End: Original strand, 35511260 - 35511440
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35511260 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgctt 35511359  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 499  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35511360 gcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 35511440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 309 - 515
Target Start/End: Original strand, 35826254 - 35826458
Alignment:
Q  309 gttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatct 408  Q
    ||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35826254 gttagaaaactggttttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatct 35826353  T
Q  409 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 508  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||    
T  35826354 agtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggt 35826451  T
Q  509 tacactt 515  Q
    |||||||    
T  35826452 tacactt 35826458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 319 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8437362 - 8437168
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8437362 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 8437263  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8437262 tcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacac 8437168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 320 - 515
Target Start/End: Original strand, 8741664 - 8741860
Alignment:
Q  320 gacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttg 419  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  8741664 gacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttg 8741763  T
Q  420 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat-attatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8741764 caacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 8741860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19120256 - 19120060
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19120256 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 19120157  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| |||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19120156 gcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 19120060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 323 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 25669969 - 25669739
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25669969 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 25669870  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt---aagtgttacactt 515  Q
     || || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    ||  |||    ||||||||||||    
T  25669869 cattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtgagtgttacacttgtggagtgttacactt 25669770  T
Q  516 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25669769 aaaacaaagtaggataaaattagattaagtg 25669739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5837952 - 5837756
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5837952 tgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgctt 5837853  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5837852 gcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 5837756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27330705 - 27330505
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27330705 aaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 27330606  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  27330605 gcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 27330506  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  27330505 t 27330505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35934289 - 35934097
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35934289 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaa 35934190  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35934189 catcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 35934097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 319 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 42343118 - 42342942
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42343118 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 42343019  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 495  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42343018 gcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 42342942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 23116008 - 23116196
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |        |||||||||    
T  23116008 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgctt 23116099  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116100 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 23116196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 27318259 - 27318461
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaa-ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 410  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27318259 agaaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatag 27318358  T
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318359 taatgtttgcaacatcttaaactta--tgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 27318456  T
Q  511 cactt 515  Q
    |||||    
T  27318457 cactt 27318461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 319 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 32563537 - 32563302
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  32563537 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattctt 32563438  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 510  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||       |||||    
T  32563437 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgggctgtta 32563338  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32563337 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 32563302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 39573208 - 39573060
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39573208 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 39573109  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca 467  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39573108 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca 39573060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 281 - 511
Target Start/End: Original strand, 13956104 - 13956332
Alignment:
Q  281 attaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattg 380  Q
    ||||||||| | ||||||| ||  || ||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    | ||  ||||||||||||     
T  13956104 attaattaaagagagcttctacggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgatta 13956201  T
Q  381 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13956202 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaattt 13956301  T
Q  481 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13956302 gatgatattatatgatagtcttaagtgttac 13956332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25889767 - 25889584
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25889767 tgacttttctggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 25889668  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 502  Q
     ||| |||||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25889667 tcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 319 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 22020020 - 22019785
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22020020 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 22019921  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta--------agtgtta 510  Q
     ||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  ||  ||         ||||||    
T  22019920 acaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgagtgttatactttgtggggtgtta 22019821  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22019820 cacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtg 22019785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 323 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8467119 - 8466897
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| |||||||||  | |||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8467119 tttttttaaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 8467020  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaa 522  Q
     || ||||||||||| ||| ||||| ||||||  || |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8467019 cattttggacttacaaataatattttatcgtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacatttaaaacaa 8466921  T
Q  523 ggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||  |||||||| ||||||||    
T  8466920 ggtagaataaaattaaattaagtg 8466897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 323 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9200617 - 9200389
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||||||||  |||||||| || ||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9200617 ttttttgaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 9200518  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacact 514  Q
     ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||     | |||||||||    
T  9200517 catcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggaatgttacact 9200418  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9200417 taaaacaaggtaggataaaattagattaa 9200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 30969106 - 30969298
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||     
T  30969106 ttttttaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcag 30969205  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||| ||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30969206 catcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 30969298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 25500708 - 25500900
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  25500708 ttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaa 25500807  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  25500808 catcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactt 25500900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 319 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 7693618 - 7693442
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7693618 tgacttttctaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgctt 7693519  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 495  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  7693518 gcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtga 7693442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15724881 - 15724689
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15724881 ttttttgaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaa 15724782  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     || |||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  15724781 tattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactt 15724689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 308 - 488
Target Start/End: Original strand, 43308427 - 43308607
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43308427 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatc 43308526  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  43308527 tagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatat 43308607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 308 - 515
Target Start/End: Original strand, 21088535 - 21088740
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaagg-ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcat 406  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||   |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||    ||| ||||| |||| ||||||||    
T  21088535 agttagaaaactgactttttaaaaaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgattattt---attcatgattaatagtaattcat 21088631  T
Q  407 ctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 506  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21088632 ctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagt 21088731  T
Q  507 gttacactt 515  Q
    |||||||||    
T  21088732 gttacactt 21088740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 319 - 460
Target Start/End: Original strand, 28416329 - 28416470
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28416329 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgctt 28416428  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatc 460  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  28416429 gcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttggcatc 28416470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 512
Target Start/End: Original strand, 23954542 - 23954760
Alignment:
Q  281 attaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattg 380  Q
    ||||||||| ||||||||| |   || ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  23954542 attaattaaagggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatt- 23954640  T
Q  381 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 480  Q
          ||||||||||| ||||||||| ||||||| |      |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23954641 ------aatgatcaatagtaattcatcaagtaatgttc-----atcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagtt 23954728  T
Q  481 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954729 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 23954760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Original strand, 14919317 - 14919499
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||      | ||    
T  14919317 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaatgt-aattcatct------gatt 14919409  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    |||| ||||||||||||    ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14919410 gcaatatcttggactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattaca 14919499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43254256 - 43254154
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43254256 aaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 43254157  T
Q  415 gct 417  Q
    |||    
T  43254156 gct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 319 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26269206 - 26269069
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  26269206 tgacttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgctt 26269107  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttgg 456  Q
     ||| |||||  |||||||  |||||||| ||| ||||    
T  26269106 acaacatcttaaacttacaggtactattttatccttgg 26269069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 389 - 515
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824453
Alignment:
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  489 tatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactt 6824453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 457 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26268333 - 26268275
Alignment:
Q  457 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26268333 catctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 26268275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 22980987 - 22980946
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22980987 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 22980946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 23954770 - 23954811
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23954770 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 23954811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 550
Target Start/End: Original strand, 31786627 - 31786672
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31786627 gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagt 31786672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 27330498 - 27330457
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27330498 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtg 27330457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 30969305 - 30969346
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30969305 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtg 30969346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 545
Target Start/End: Original strand, 25500907 - 25500947
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagt 545  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25500907 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagt 25500947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 7693424 - 7693385
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaag 544  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7693424 gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaag 7693385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 14919509 - 14919550
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  14919509 gtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtg 14919550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 543
Target Start/End: Original strand, 21088748 - 21088785
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21088748 tgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaa 21088785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 35511458 - 35511499
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35511458 gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtg 35511499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112282
Alignment:
Q  477 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 509  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgtt 5112282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 545
Target Start/End: Original strand, 43308633 - 43308673
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagt 545  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43308633 gtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagt 43308673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 319 - 543
Target Start/End: Original strand, 11357169 - 11357393
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11357169 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 11357268  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357269 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 11357368  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    | |||||||| ||||||||||||||    
T  11357369 ataaggtaggataaaattagattaa 11357393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 314 - 515
Target Start/End: Original strand, 46297545 - 46297746
Alignment:
Q  314 aaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46297545 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 46297644  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297645 tgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 46297744  T
Q  514 tt 515  Q
    ||    
T  46297745 tt 46297746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 308 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 48355340 - 48355133
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  48355340 agttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatc 48355241  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355240 tagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 48355141  T
Q  508 ttacactt 515  Q
    ||||||||    
T  48355140 ttacactt 48355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Original strand, 26941020 - 26941244
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26941020 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 26941119  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26941120 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 26941219  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  26941220 tatgatagttttaagtgttacactt 26941244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 325 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 22451350 - 22451159
Alignment:
Q  325 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 424  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22451350 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaaca 22451251  T
Q  425 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactta 516  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  22451250 tcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacactta 22451159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 319 - 514
Target Start/End: Original strand, 52040710 - 52040905
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  52040710 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgttt 52040809  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52040810 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 52040905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 312 - 548
Target Start/End: Original strand, 43975673 - 43975922
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43975673 agaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 43975772  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgca---aacatagttgatgatattatgtgatagtctta----- 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||| |||         
T  43975773 aatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagtgttacactt 43975872  T
Q  504 -----agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgca 548  Q
          ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  43975873 tctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgca 43975922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 53228944 - 53229136
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53228944 ttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaa 53229043  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53229044 catcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactt 53229136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 319 - 513
Target Start/End: Original strand, 40552047 - 40552241
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40552047 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgctt 40552146  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  40552147 gcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacac 40552241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1090081 - 1089886
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1090081 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 1089982  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089981 gcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactt 1089886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 323 - 511
Target Start/End: Original strand, 22622510 - 22622698
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22622510 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 22622609  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622610 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 22622698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39283040 - 39282844
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39283040 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgctt 39282941  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39282940 gcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 39282844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 42505859 - 42506059
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42505859 aaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 42505958  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505959 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 42506058  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  42506059 t 42506059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 282 - 515
Target Start/End: Original strand, 21009552 - 21009786
Alignment:
Q  282 ttaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgc 381  Q
    |||||||||||||| ||| ||  || ||| || ||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  21009552 ttaattaatgggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac 21009651  T
Q  382 tgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 480  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  21009652 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgtt 21009751  T
Q  481 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009752 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 21009786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 54506200 - 54505999
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  54506200 aaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 54506101  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54506100 tgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 54506001  T
Q  514 tt 515  Q
    ||    
T  54506000 tt 54505999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4015847 - 4015652
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4015847 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 4015748  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4015747 gcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactt 4015652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33698541 - 33698345
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698541 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 33698442  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33698441 gcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactt 33698345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 24707896 - 24708099
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| |    
T  24707896 agaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaat 24707995  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24707996 aatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttac 24708095  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  24708096 actt 24708099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 290 - 515
Target Start/End: Original strand, 33378544 - 33378769
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| || ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  33378544 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaat 33378643  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33378644 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagatt 33378743  T
Q  490 atgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33378744 atgcgatagtcttaagtattacactt 33378769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37158096 - 37157899
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37158096 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 37157997  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    || | || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37157996 gcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 37157899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3362647 - 3362447
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3362647 aaattgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaat 3362548  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| || ||||||||  |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3362547 gcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacact 3362448  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  3362447 t 3362447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 315 - 546
Target Start/End: Original strand, 44186301 - 44186533
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44186301 aaattgattttttcgaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 44186400  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag-tcttaagtgttacac 513  Q
    |||||||| ||||| |||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |   ||||||||     
T  44186401 gcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagttgtggggtgttacat 44186500  T
Q  514 ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44186501 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 44186533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 315 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40936365 - 40936135
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40936365 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 40936266  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40936265 gcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 40936166  T
Q  515 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  40936165 taaaa-aaagttggataaaattatattaagtg 40936135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2008327 - 2008124
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattg-------ctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2008327 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagt 2008228  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2008227 aatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttac 2008128  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  2008127 actt 2008124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47481915 - 47481714
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47481915 aaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 47481816  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||  |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481815 tgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 47481716  T
Q  514 tt 515  Q
    ||    
T  47481715 tt 47481714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37203456 - 37203259
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37203456 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 37203357  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    || | || |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37203356 gcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 37203259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 7327274 - 7327466
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7327274 ttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 7327373  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7327374 catcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 7327466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25580131 - 25579931
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25580131 aaattgacttttttaaaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 25580032  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||| || ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25580031 gcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacact 25579932  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  25579931 t 25579931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44891885 - 44891689
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44891885 tgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgctt 44891786  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| |||||  |  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44891785 gcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 44891689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 323 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 29099730 - 29099558
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29099730 ttttttgaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaa 29099631  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 495  Q
     |||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29099630 catcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 29099558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34133283 - 34133127
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  34133283 ttcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggca 34133184  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133183 tctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 34133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 360 - 512
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994642
Alignment:
Q  360 tcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcat 459  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || ||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  460 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 46994642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 510
Target Start/End: Original strand, 22445853 - 22446044
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  22445853 tgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatactt 22445952  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||| || ||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22445953 gcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgtta 22446044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 321 - 515
Target Start/End: Original strand, 4761438 - 4761632
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  4761438 actttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgc 4761537  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    || || ||||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4761538 aacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactt 4761632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 27480142 - 27480350
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||| |||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27480142 aaattgattttttttaaaaatataattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 27480241  T
Q  415 gcttgcaaa----atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac----atagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 506  Q
    | ||| ||     || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27480242 gtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagt 27480341  T
Q  507 gttacactt 515  Q
    |||||||||    
T  27480342 gttacactt 27480350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 312 - 503
Target Start/End: Original strand, 51212558 - 51212743
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51212558 agaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagt 51212651  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta 503  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51212652 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagcctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 319 - 546
Target Start/End: Original strand, 14586468 - 14586702
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14586468 tgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgctt 14586567  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtcttaa----gtgtta 510  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    ||| ||  |||      ||||||    
T  14586568 gcaacatcttggacttaccg-tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacgagtgttacactttgtggggtgtta 14586666  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14586667 cacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtg 14586702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32373853 - 32373662
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || |   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32373853 ttttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaa 32373755  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32373754 catcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactt 32373662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 11356946 - 11357134
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||        |||||||    
T  11356946 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaatt--------aatgctt 11357037  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11357038 gcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactt 11357134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 315 - 513
Target Start/End: Original strand, 24488745 - 24488944
Alignment:
Q  315 aaattgactttt-ttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24488745 aaattgacttttatttaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaa 24488844  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24488845 tgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacac 24488944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 312 - 512
Target Start/End: Original strand, 3654980 - 3655183
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttc-atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcat--ct 408  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||    
T  3654980 agaaaactgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatct 3655079  T
Q  409 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 508  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3655080 agtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgt 3655179  T
Q  509 taca 512  Q
    ||||    
T  3655180 taca 3655183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 319 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21193995 - 21193803
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  21193995 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggtt 21193896  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgtta 510  Q
    |||| |||||| ||||||   |||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||    
T  21193895 gcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgtta 21193803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 36012528 - 36012333
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaa-ttttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36012528 tgacttttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 36012429  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||  || |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36012428 tgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca 36012333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 376 - 515
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828685
Alignment:
Q  376 gattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaaca 475  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  476 tagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactt 54828685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 20373051 - 20373228
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||              
T  20373051 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatct---------- 20373140  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
             |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20373141 ---------tggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 20373228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 359 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 38592046 - 38591897
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  38592046 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtca 38591947  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 508  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591946 tctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 38591897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 319 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29164190 - 29163962
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29164190 tgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 29164098  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 510  Q
    | || ||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||||||    
T  29164097 gtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 29163998  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29163997 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 29163962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 326 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 50475199 - 50475021
Alignment:
Q  326 tttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgat-------caatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50475199 tttgaaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgctt 50475100  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata 497  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  50475099 gcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 392 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174698
Alignment:
Q  392 tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  492 gtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     | |||||||||||||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactt 45174698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11467198 - 11467016
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||       ||    
T  11467198 tgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatcta-------tt 11467113  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11467112 gcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 11467016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348449
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  501 ttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||| ||||||    
T  43348463 ttaagtgtcacactt 43348449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 392 - 515
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835611
Alignment:
Q  392 tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 491  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||      |||||||| | |||||||||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacat------catgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  492 gtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactt 11835611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  394 aatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 493  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgt 53811692  T
Q  494 gatagtctt 502  Q
    |||||||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 22451153 - 22451108
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22451153 gtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagt 22451108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 550
Target Start/End: Original strand, 33378776 - 33378821
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33378776 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagt 33378821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35844639 - 35844577
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttga 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35844639 aaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 550
Target Start/End: Original strand, 27480370 - 27480415
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27480370 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagt 27480415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 32373654 - 32373614
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32373654 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 32373614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 43348441 - 43348401
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43348441 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 43348401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 504 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21193792 - 21193753
Alignment:
Q  504 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21193792 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 21193753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 546
Target Start/End: Original strand, 22446054 - 22446096
Alignment:
Q  504 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22446054 agtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtg 22446096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 546
Target Start/End: Original strand, 52040916 - 52040954
Alignment:
Q  508 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52040916 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 52040954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 146
Target Start/End: Original strand, 36806094 - 36806159
Alignment:
Q  81 aaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggta 146  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36806094 aaatatgcatattggaatagaagttatggagctgatcatttcatgctttcttgtcatgattgggta 36806159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35844581 - 35844519
Alignment:
Q  452 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35844581 gttgacatctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactt 35844519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 546
Target Start/End: Original strand, 46994654 - 46994693
Alignment:
Q  507 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46994654 gttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtg 46994693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 147
Target Start/End: Original strand, 49301577 - 49301631
Alignment:
Q  93 tggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggtaa 147  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49301577 tggaacagaactcatggtgctgaccacttcatgcttgcttgccatgattgggtaa 49301631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176246
Alignment:
Q  477 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 53176246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Original strand, 11835619 - 11835660
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaa-attagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11835619 tgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtg 11835660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13498731 - 13498678
Alignment:
Q  293 gagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgat 346  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13498731 gagcttctacagtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgat 13498678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 22622709 - 22622750
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22622709 gtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtg 22622750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 24488953 - 24488994
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24488953 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtg 24488994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34133357 - 34133312
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatg 353  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34133357 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatg 34133312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36515132 - 36515067
Alignment:
Q  81 aaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggta 146  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36515132 aaatatgcttattggaatagaagttatggagctgaccatttcatgctttcttgtcatgattgggta 36515067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 46297753 - 46297794
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  46297753 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtg 46297794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 51212972 - 51213013
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  51212972 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtg 51213013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 507 - 543
Target Start/End: Original strand, 53229145 - 53229181
Alignment:
Q  507 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  53229145 gttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaa 53229181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Original strand, 28002772 - 28002996
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28002772 gggagcttctacactgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatg 28002871  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28002872 atcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 28002971  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  28002972 tgtgatagttttaagtgttacactt 28002996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 33816330 - 33816526
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33816330 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 33816429  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33816430 gcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 33816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 308 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32579854 - 32579647
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32579854 agttagaaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatc 32579755  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  32579754 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagag 32579655  T
Q  508 ttacactt 515  Q
    ||||||||    
T  32579654 ttacactt 32579647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3043020 - 3042820
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3043020 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaat 3042921  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042920 gcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 3042821  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  3042820 t 3042820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 36493499 - 36493699
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36493499 aaattgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaat 36493598  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36493599 gcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 36493698  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  36493699 t 36493699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25184517 - 25184314
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25184517 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 25184418  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25184417 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttac 25184318  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  25184317 actt 25184314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 290 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6864461 - 6864236
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6864461 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 6864362  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6864361 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatatt 6864262  T
Q  490 atgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6864261 atgtgatagtcttaagtattacactt 6864236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Original strand, 35020817 - 35021045
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35020817 gggagcttctacggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatg 35020916  T
Q  391 atcaatat----taattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 486  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35020917 atcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 35021016  T
Q  487 attatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35021017 attatgtgatagtcttaagtgttacactt 35021045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33341795 - 33341599
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33341795 tgacttttttaaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 33341696  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33341695 acaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 33341599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47254137 - 47253941
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47254137 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 47254038  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47254037 gcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 47253941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1815704 - 1815502
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1815704 agaaaattgactttttaaaaaag-ttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagt 1815606  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815605 aatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 1815506  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  1815505 actt 1815502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 289 - 515
Target Start/End: Original strand, 19089237 - 19089463
Alignment:
Q  289 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    ||||||||||| ||  || ||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19089237 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaa 19089336  T
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19089337 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatat 19089436  T
Q  489 tatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19089437 tatgtgatagtcttaagtgttacactt 19089463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 7703906 - 7703710
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7703906 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgctt 7703807  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7703806 gcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactt 7703710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 37663551 - 37663751
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37663551 aaattgacttttttaataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37663650  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663651 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 37663750  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  37663751 t 37663751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 879355 - 879558
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  879355 agaaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagt 879454  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  879455 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttac 879554  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  879555 actt 879558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 7152011 - 7152214
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7152011 agaaaactgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaat 7152110  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  7152111 aatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttat 7152210  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  7152211 actt 7152214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 319 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 49376364 - 49376170
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49376364 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctt 49376265  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49376264 tcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 49376170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 34361305 - 34361502
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34361305 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgct 34361404  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34361405 tgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactt 34361502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 336 - 513
Target Start/End: Original strand, 55477722 - 55477899
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55477722 ttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 55477821  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
     || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55477822 aatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacac 55477899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 320 - 512
Target Start/End: Original strand, 5047781 - 5047973
Alignment:
Q  320 gacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttg 419  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||    
T  5047781 gacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttg 5047880  T
Q  420 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5047881 caacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 5047973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 289 - 513
Target Start/End: Original strand, 19440432 - 19440656
Alignment:
Q  289 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 388  Q
    ||||||||||| ||  || ||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19440432 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaa 19440531  T
Q  389 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19440532 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 19440631  T
Q  489 tatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||| |||  |||||| |||||||    
T  19440632 tatgttataaacttaagggttacac 19440656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 55240919 - 55241115
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  55240919 tgacttttttgaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgttt 55241018  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  55241019 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 55241115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 308 - 515
Target Start/End: Original strand, 25700859 - 25701066
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  25700859 agttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatc 25700958  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25700959 taacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtg 25701058  T
Q  508 ttacactt 515  Q
    ||||||||    
T  25701059 ttacactt 25701066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 32912393 - 32912590
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgct 417  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32912393 tgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgct 32912492  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912493 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 32912590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17168110 - 17167914
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  17168110 tgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgctt 17168011  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17168010 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 17167914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17173687 - 17173491
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  17173687 tgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgctt 17173588  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17173587 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 17173491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 282 - 546
Target Start/End: Original strand, 30002418 - 30002690
Alignment:
Q  282 ttaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgc 381  Q
    |||||| ||||||||||| ||  || |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  30002418 ttaatttatgggagcttctacggtgcagttatgaaattgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattac 30002517  T
Q  382 tgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttg 481  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30002518 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttg 30002617  T
Q  482 atgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
     |||||| ||||||    ||  |||      ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30002618 ctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtg 30002690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 37288126 - 37287932
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttga-tcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  37288126 tgacttttttgaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgct 37288027  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37288026 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttaca 37287932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 321 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 50765115 - 50764921
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50765115 acttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 50765016  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||| |||||    
T  50765015 aacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactt 50764921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 315 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 37776059 - 37775820
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37776059 aaattgacttttttaaaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37775960  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 506  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||    
T  37775959 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggt 37775860  T
Q  507 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37775859 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtg 37775820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 50697639 - 50697442
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50697639 tgacttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 50697540  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca-tgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50697539 acaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactt 50697442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 319 - 511
Target Start/End: Original strand, 46887972 - 46888163
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46887972 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 46888071  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    | || |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46888072 gtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtc-taagtgttac 46888163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 335 - 506
Target Start/End: Original strand, 34947925 - 34948096
Alignment:
Q  335 gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34947925 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 34948024  T
Q  435 acatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 506  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34948025 acatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagt 34948096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23761468 - 23761272
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23761468 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgctt 23761369  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| |||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  23761368 gcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactt 23761272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 29584010 - 29584210
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29584010 aaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 29584109  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  29584110 gcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 29584209  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  29584210 t 29584210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 319 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 39400405 - 39400236
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39400405 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgctt 39400306  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
    |||| |||||| ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400305 gcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17272365 - 17272165
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17272365 aaattgacttatttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 17272266  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  17272265 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 17272166  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  17272165 t 17272165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26896489 - 26896288
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26896489 aaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 26896390  T
Q  414 tgcttgcaaaatctt-ggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    || |||||| || || |||||||||  |||||||| |||||||  || ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26896389 tgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttaca 26896291  T
Q  513 ctt 515  Q
    |||    
T  26896290 ctt 26896288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 319 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4598379 - 4598203
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4598379 tgactttttgtaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgctt 4598280  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 495  Q
    |||| |||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4598279 gcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtga 4598203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 319 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4205381 - 4205216
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  4205381 tgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgctt 4205282  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatg 484  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205281 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 314 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 32592486 - 32592319
Alignment:
Q  314 aaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  32592486 aaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaa 32592387  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttg 481  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  32592386 tgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttg 32592319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 319 - 454
Target Start/End: Original strand, 35025381 - 35025515
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35025381 tgacttttatgaaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 35025479  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgtt 454  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35025480 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42200131 - 42199930
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  42200131 aaattgacctttttgaaaaagttaattt-gattttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaa 42200033  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacata-tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42200032 tgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 42199933  T
Q  513 ctt 515  Q
    |||    
T  42199932 ctt 42199930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 323 - 512
Target Start/End: Original strand, 46883932 - 46884116
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46883932 ttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 46884031  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
     |||  ||||||||  ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46884032 catc--ggacttac--atactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-ttaagtgttaca 46884116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 319 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 9139624 - 9139465
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9139624 tgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgctt 9139527  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 480  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9139526 gcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 9139465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27397000 - 27396817
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 429  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  27397000 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 27396903  T
Q  430 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||| |  ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  27396902 gacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactt 27396817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38012055
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  501 ttaagtgttacactt 515  Q
    ||||| |||||||||    
T  38012069 ttaagcgttacactt 38012055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 4934026 - 4934212
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaa-ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||     
T  4934026 tgacttttttgaacaagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcg 4934125  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||| ||           |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4934126 tgcaacat-----------aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 4934212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 319 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23431952 - 23431834
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23431952 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgctt 23431853  T
Q  419 gcaaaatcttggacttaca 437  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  23431852 gcaacatcttggacttaca 23431834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 323 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38012655 - 38012568
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38012655 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 440 - 515
Target Start/End: Original strand, 35025531 - 35025606
Alignment:
Q  440 tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35025531 tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 35025606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 550
Target Start/End: Original strand, 28003003 - 28003048
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28003003 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagt 28003048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 548
Target Start/End: Original strand, 33816550 - 33816593
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgca 548  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33816550 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgca 33816593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaaca 475  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 550
Target Start/End: Original strand, 5047985 - 5048027
Alignment:
Q  508 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5047985 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagt 5048027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 7703704 - 7703662
Alignment:
Q  504 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7703704 agtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtg 7703662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9139439 - 9139398
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9139439 gtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 9139398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 17272158 - 17272117
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17272158 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtg 17272117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 46888174 - 46888215
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46888174 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 46888215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 55241122 - 55241163
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  55241122 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtg 55241163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Original strand, 25701075 - 25701115
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25701075 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtg 25701115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 32592287 - 32592249
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32592287 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaa 32592249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23761265 - 23761225
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23761265 gtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtg 23761225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 546
Target Start/End: Original strand, 35021060 - 35021093
Alignment:
Q  513 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35021060 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 35021093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 39398103 - 39398062
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  39398103 gtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtg 39398062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 55477908 - 55477949
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  55477908 gtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtg 55477949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 546
Target Start/End: Original strand, 29584222 - 29584258
Alignment:
Q  510 acacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29584222 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtg 29584258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 308 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 41465909 - 41465702
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  41465909 agttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcata 41465810  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41465809 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtg 41465710  T
Q  508 ttacactt 515  Q
    ||||||||    
T  41465709 ttacactt 41465702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 319 - 546
Target Start/End: Original strand, 7006744 - 7006971
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7006744 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgctt 7006843  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7006844 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaagtgttacacttaaa 7006943  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||    
T  7006944 acaaggtatgataaaattagattaagtg 7006971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 291 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26358002 - 26357781
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26358002 gggagcttctacattgcagttagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 26357903  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26357902 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatatta 26357803  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  26357802 tgtgatagttttaagtgttaca 26357781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4167347 - 4167123
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4167347 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 4167248  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4167247 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatta 4167148  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  4167147 tgtgatagttttaagtgttacactt 4167123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 314 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35959294 - 35959097
Alignment:
Q  314 aaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35959294 aaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 35959195  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| |||||||    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35959194 tgcttgcaacatcttgg----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacac 35959099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Original strand, 2325156 - 2325380
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||     
T  2325156 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaata 2325255  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2325256 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatatta 2325355  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2325356 tgtgatagtcttaagtgttacactt 2325380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 11366179 - 11366383
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctag 410  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11366179 agaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctag 11366278  T
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366279 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 11366378  T
Q  511 cactt 515  Q
    |||||    
T  11366379 cactt 11366383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 308 - 515
Target Start/End: Original strand, 19289118 - 19289325
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19289118 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatc 19289217  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| || || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289218 tagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 19289317  T
Q  508 ttacactt 515  Q
    ||||||||    
T  19289318 ttacactt 19289325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 319 - 508
Target Start/End: Original strand, 18494087 - 18494276
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18494087 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgctt 18494186  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 508  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  18494187 acaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgt 18494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 290 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 41961266 - 41961041
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41961266 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 41961167  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  41961166 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatatt 41961067  T
Q  490 atgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  41961066 atgtgataatcttaagtgttacactt 41961041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44914060 - 44913865
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcat---ctagtaatgcttg 419  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||   ||| |||||||||    
T  44914060 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttg 44913961  T
Q  420 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44913960 caacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 44913865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 43648047 - 43648247
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43648047 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 43648146  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    | |||| | ||||||||||||||  | |||||| |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43648147 gtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatact 43648246  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  43648247 t 43648247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4764017 - 4763832
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 429  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4764017 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttg 4763918  T
Q  430 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763917 gacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 4763832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3177336 - 3177140
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3177336 tgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgctt 3177237  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177236 gtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 3177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 311 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37906116 - 37905911
Alignment:
Q  311 tagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatcta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37906116 tagaaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatcca 37906017  T
Q  410 gtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 509  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37906016 gtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgtt 37905917  T
Q  510 acactt 515  Q
    ||||||    
T  37905916 acactt 37905911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 33709042 - 33709234
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33709042 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 33709141  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||||| |||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33709142 catcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactt 33709234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 512
Target Start/End: Original strand, 19500739 - 19500914
Alignment:
Q  337 taattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttac 436  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  19500739 taattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattac 19500838  T
Q  437 atatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    || |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500839 atgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 19500914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 319 - 546
Target Start/End: Original strand, 33660183 - 33660418
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33660183 tgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 33660282  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtctt----aagtgtta 510  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    ||| ||  |||      ||||||    
T  33660283 gcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgggtgttacactttgtggggtgtta 33660382  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33660383 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 33660418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31862249 - 31862053
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  31862249 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtct 31862150  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||| || || || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31862149 acaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactt 31862053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 545
Target Start/End: Original strand, 43770654 - 43770888
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43770654 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgctt 43770753  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt----ctt----aagtgtta 510  Q
    |||| |||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||    |||    | ||||||    
T  43770754 gcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgaggtgtta 43770853  T
Q  511 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagt 545  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  43770854 cacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagt 43770888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 312 - 499
Target Start/End: Original strand, 39167168 - 39167355
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||||    
T  39167168 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagt 39167267  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 499  Q
    |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39167268 aatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt 39167355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 293 - 512
Target Start/End: Original strand, 31570514 - 31570733
Alignment:
Q  293 gagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgat 392  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  31570514 gagcttctacactgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgat 31570613  T
Q  393 caatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg 492  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  31570614 caatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatg 31570713  T
Q  493 tgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  31570714 tgacagtcttaagtgttaca 31570733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 323 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5881922 - 5881750
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5881922 ttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 5881823  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 495  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  5881822 catcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtga 5881750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 364 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478566
Alignment:
Q  364 ttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatcttt 463  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  464 aacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactt 4478566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 363 - 515
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264079
Alignment:
Q  363 tttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctt 462  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  463 taacatgcaaacatagttgatgatattatg-tgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactt 4264079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 324 - 515
Target Start/End: Original strand, 29241956 - 29242140
Alignment:
Q  324 tttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa 423  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |           
T  29241956 tttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaattc------- 29242048  T
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29242049 atcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactt 29242140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 308 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 13711867 - 13711671
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| || | |||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13711867 agttataaaattgtcttttttgaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatc 13711768  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 504  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  13711767 tagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaa 13711671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 515
Target Start/End: Original strand, 33550800 - 33550988
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatga----tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaat 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  33550800 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacat 33550899  T
Q  426 cttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  33550900 attggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactt 33550988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 359 - 546
Target Start/End: Original strand, 27349794 - 27349989
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  27349794 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaa 27349893  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||    ||  |||      ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27349894 tctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtg 27349989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 286 - 515
Target Start/End: Original strand, 19424415 - 19424630
Alignment:
Q  286 ttaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat 385  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19424415 ttaatgggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgat 19424514  T
Q  386 taatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||              |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19424515 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtact--------------atctttaacatgcaaacagagttgctga 19424600  T
Q  486 tattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19424601 tatcatgtgatagtcttaaatgttacactt 19424630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 381 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44286284 - 44286150
Alignment:
Q  381 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  44286284 ctgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagtt 44286185  T
Q  481 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44286184 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 44286150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19314182 - 19314004
Alignment:
Q  381 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactt---acatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacata 477  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  19314182 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacata 19314083  T
Q  478 gttgatgatattatgtgatagtctta----------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19314082 gttgctgatatcatgtgatagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtg 19314004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327921
Alignment:
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  511 cactt 515  Q
    |||||    
T  45327925 cactt 45327921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 325 - 474
Target Start/End: Original strand, 41051112 - 41051260
Alignment:
Q  325 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 424  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  41051112 ttttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaaca 41051211  T
Q  425 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac 474  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41051212 tcttgaacttacaggtactattttatccttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 515
Target Start/End: Original strand, 17071648 - 17071739
Alignment:
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17071648 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 17071739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642189
Alignment:
Q  411 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  511 cactt 515  Q
    |||||    
T  36642193 cactt 36642189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 424 - 515
Target Start/End: Original strand, 17054007 - 17054098
Alignment:
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17054007 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactt 17054098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 323 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33902407 - 33902317
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33902407 ttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 515
Target Start/End: Original strand, 18258197 - 18258289
Alignment:
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18258197 aatcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 18258289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 428
Target Start/End: Original strand, 18257344 - 18257453
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || |||||  |   |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18257344 tgacttttgtgaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgctt 18257443  T
Q  419 gcaaaatctt 428  Q
    |||| |||||    
T  18257444 gcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 319 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45328087 - 45328028
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgat 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45328087 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 512
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463849
Alignment:
Q  442 ctatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttaca 41463849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 435
Target Start/End: Original strand, 41463400 - 41463512
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||    
T  41463400 tttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaa 41463499  T
Q  423 aatcttggactta 435  Q
     ||||| ||||||    
T  41463500 catcttagactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 45327914 - 45327869
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45327914 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagt 45327869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 29242147 - 29242188
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29242147 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 29242188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 544
Target Start/End: Original strand, 33709241 - 33709280
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaag 544  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33709241 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 33709280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902267
Alignment:
Q  463 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactt 33902267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 544
Target Start/End: Original strand, 19424637 - 19424676
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaag 544  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19424637 gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaag 19424676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 546
Target Start/End: Original strand, 4264093 - 4264127
Alignment:
Q  512 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4264093 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 4264127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 387
Target Start/End: Original strand, 17053960 - 17054005
Alignment:
Q  342 ttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 387  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17053960 ttgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 387
Target Start/End: Original strand, 17071601 - 17071646
Alignment:
Q  342 ttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 387  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17071601 ttgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 31570743 - 31570784
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31570743 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtg 31570784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 545
Target Start/End: Original strand, 18258296 - 18258336
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagt 545  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  18258296 gtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagt 18258336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33906634 - 33906412
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33906634 gggagcttctacagtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatg 33906537  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906536 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 33906437  T
Q  491 tgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  33906436 tgcgatagtcttaagtgttacactt 33906412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 1149422 - 1149622
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1149422 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 1149521  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149522 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacact 1149621  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  1149622 t 1149622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 319 - 511
Target Start/End: Original strand, 16446669 - 16446861
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16446669 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 16446768  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446769 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 16446861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 43643382 - 43643585
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43643382 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 43643481  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43643482 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttac 43643581  T
Q  512 actt 515  Q
    ||||    
T  43643582 actt 43643585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 4132480 - 4132676
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4132480 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 4132579  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4132580 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactt 4132676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 27082636 - 27082828
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27082636 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaa 27082735  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27082736 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 27082828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 37970313 - 37970509
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37970313 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgctt 37970412  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| || ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970413 gcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 37970509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 319 - 513
Target Start/End: Original strand, 7890751 - 7890945
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7890751 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 7890850  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7890851 gcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 7890945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 8803606 - 8803807
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  8803606 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaa 8803705  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8803706 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacac 8803805  T
Q  514 tt 515  Q
    ||    
T  8803806 tt 8803807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 23854229 - 23854421
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23854229 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 23854328  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23854329 catcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactt 23854421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 291 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 34895386 - 34895178
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34895386 gggagcttctacggtgcagttaggaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 34895287  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34895286 atcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 34895187  T
Q  491 tgtgatagt 499  Q
    |||||||||    
T  34895186 tgtgatagt 34895178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 315 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11727425 - 11727227
Alignment:
Q  315 aaattgac-ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11727425 aaattgacattttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 11727326  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11727325 tgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 11727227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 308 - 510
Target Start/End: Original strand, 35459494 - 35459696
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35459494 agttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatc 35459593  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 507  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| || || |  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35459594 tagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtg 35459693  T
Q  508 tta 510  Q
    |||    
T  35459694 tta 35459696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 290 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1205352 - 1205127
Alignment:
Q  290 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    |||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  1205352 tgggagcttctacggtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaat 1205253  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1205252 gatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatt 1205153  T
Q  490 atgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1205152 atgcgatagtcttaagtgttacactt 1205127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40862820 - 40862619
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcattttt-aaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  40862820 aaattgacttttttgaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaa 40862721  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40862720 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacac 40862621  T
Q  514 tt 515  Q
    ||    
T  40862620 tt 40862619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 1953786 - 1953978
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1953786 ttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaa 1953885  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953886 aatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactt 1953978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 336 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16223242 - 16223063
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16223242 ttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactta 16223143  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223142 catgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactt 16223063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 5299740 - 5299936
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5299740 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgctt 5299839  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  5299840 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactt 5299936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38644374 - 38644178
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38644374 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 38644275  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  38644274 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactt 38644178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 319 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 35859330 - 35859160
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35859330 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 35859231  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 489  Q
    |||| |||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859230 gcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 36694764 - 36694956
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||||||| | || ||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36694764 ttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaa 36694863  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36694864 catcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 36694956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44869893 - 44869697
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44869893 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 44869794  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44869793 gcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactt 44869697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 515
Target Start/End: Original strand, 6098331 - 6098508
Alignment:
Q  343 tgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttaca----- 437  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         
T  6098331 tgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtac 6098430  T
Q  438 tatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098431 tattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 6098508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 308 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12587989 - 12587812
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 407  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12587989 agttagagaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatc 12587890  T
Q  408 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 485  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587889 tagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 319 - 546
Target Start/End: Original strand, 34951851 - 34952069
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||    
T  34951851 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagactt 34951950  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 518  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |         |||||||||||||||    
T  34951951 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcg---------agtgttacacttaaa 34952041  T
Q  519 acaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34952042 acaaagtaggataaaattagattaagtg 34952069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 31933680 - 31933876
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  31933680 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtct 31933779  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31933780 gcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactt 31933876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 323 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 466224 - 466059
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  466224 ttttttgaataagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 466125  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 488  Q
     ||||| ||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  466124 catcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 466059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 361 - 515
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149906
Alignment:
Q  361 catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatc 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  461 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactt 1149906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12876506 - 12876309
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| || |||||||| | || ||||| ||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  12876506 tgacttttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcct 12876407  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactt 515  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12876406 gtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 12876309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 30654381 - 30654573
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgca 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  30654381 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgca 30654479  T
Q  422 aaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    | ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30654480 acatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 30654573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9864504 - 9864348
Alignment:
Q  359 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 458  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  9864504 ttcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttggca 9864405  T
Q  459 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864404 tctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 9864348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 312 - 500
Target Start/End: Original strand, 10554991 - 10555179
Alignment:
Q  312 agaaaattgacttttttgaaaagg-ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatt--aattcatct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| |  |||||||||    
T  10554991 agaaaattgacttttttgaaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatct 10555087  T
Q  409 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10555088 agtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 10555179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 323 - 508
Target Start/End: Original strand, 39098917 - 39099102
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||||||| | | |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39098917 ttttttaaaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 39099016  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 508  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  39099017 cattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 39099102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18259479 - 18259321
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  18259479 aaattgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaat 18259380  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaa 473  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18259379 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaa 18259321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 325 - 467
Target Start/End: Original strand, 24823194 - 24823336
Alignment:
Q  325 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 424  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24823194 ttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 24823293  T
Q  425 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca 467  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24823294 tcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 33198202 - 33198057
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  33198202 aaattgacttttttgaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgat 33198103  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatc 460  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33198102 gcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggcatc 33198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 440 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 7998553 - 7998446
Alignment:
Q  440 tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggt-aaaattag 538  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7998553 tactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattag 7998454  T
Q  539 attaagtg 546  Q
    ||||||||    
T  7998453 attaagtg 7998446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 319 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41362818 - 41362723
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41362818 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307823
Alignment:
Q  401 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 500  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  501 ttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||||    
T  13307837 ttaagtgttacactt 13307823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 43026099 - 43025974
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaag-gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 389  Q
    ||||||||| | ||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  43026099 gggagcttctaaactgcggttaggaaattgatttttttgaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcat 43026000  T
Q  390 gatcaatattaattcatctagtaatg 415  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43025999 gatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 449 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 43025968 - 43025905
Alignment:
Q  449 atcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43025968 atcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 43025905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 515
Target Start/End: Original strand, 41910907 - 41910978
Alignment:
Q  443 tatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41910907 tattttatcgttg-catctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactt 41910978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  394 aatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 485  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 543
Target Start/End: Original strand, 41910985 - 41911023
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910985 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 41911023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 5299943 - 5299984
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5299943 gtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtg 5299984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 36694963 - 36695004
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36694963 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtg 36695004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 543
Target Start/End: Original strand, 6098515 - 6098553
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6098515 gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaa 6098553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 466035 - 465994
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  466035 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtg 465994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 1150102 - 1150143
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1150102 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtg 1150143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9864578 - 9864533
Alignment:
Q  308 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatg 353  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9864578 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatg 9864533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 16446872 - 16446913
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16446872 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtg 16446913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 34895160 - 34895119
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34895160 gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtg 34895119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Original strand, 1953987 - 1954027
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  1953987 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtg 1954027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13307979 - 13307939
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgtt 355  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13307979 aaattgactattttgaaaaagttaattttaatcttaatgtt 13307939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Original strand, 39099117 - 39099157
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  39099117 tgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtg 39099157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 287 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20768511 - 20768283
Alignment:
Q  287 taatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatt 386  Q
    ||||||||||||| ||  || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20768511 taatgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgatt 20768412  T
Q  387 aatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20768411 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgat 20768312  T
Q  487 attatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  20768311 attatgcgatgatcttaagtgttacactt 20768283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Original strand, 3879730 - 3879922
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3879730 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 3879829  T
Q  423 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879830 catcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 3879922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 283 - 515
Target Start/End: Original strand, 7234783 - 7235018
Alignment:
Q  283 taattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgct 382  Q
    ||||||||||||||||  ||  || ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  7234783 taattaatgggagcttttacggtgtagtcaggaaaatgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgtt 7234882  T
Q  383 g---attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagt 479  Q
    |   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7234883 gttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagt 7234982  T
Q  480 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7234983 tgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactt 7235018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 291 - 515
Target Start/End: Original strand, 6090941 - 6091166
Alignment:
Q  291 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6090941 gggagcttctacggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 6091040  T
Q  391 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6091041 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatatta 6091140  T
Q  491 tgtgatagtc-ttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  6091141 tgtgatagtctttaagtgttacactt 6091166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1946233 - 1946035
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaag-gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgc 416  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  1946233 tgacttttttgaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgc 1946134  T
Q  417 ttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1946133 ttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 1946035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33619234 - 33619026
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat---taatgatcaatattaattcatctagt 411  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  33619234 aaattgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagt 33619135  T
Q  412 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctt-----taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 506  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33619134 aatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagt 33619035  T
Q  507 gttacactt 515  Q
    || ||||||    
T  33619034 gtcacactt 33619026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 323 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5627785 - 5627592
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgca 421  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  5627785 ttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgca 5627686  T
Q  422 aaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    | ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5627685 acatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactt 5627592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 336 - 515
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318805
Alignment:
Q  336 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 435  Q
    |||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  436 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 4318805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 321 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29182556 - 29182365
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||    
T  29182556 acttttttgaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcagta---attcatctagtaatacttgc 29182460  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    || ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29182459 aacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 29182365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 319 - 495
Target Start/End: Original strand, 33892799 - 33892975
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  33892799 tgacttttttgaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgttt 33892898  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 495  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  33892899 gcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga 33892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8513618 - 8513429
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8513618 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 8513526  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| || ||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8513525 gcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 8513429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 515
Target Start/End: Original strand, 21016916 - 21017095
Alignment:
Q  330 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 429  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21016916 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 21017015  T
Q  430 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||| |||      ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017016 gacgtac------tattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 21017095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 326 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 6089286 - 6089109
Alignment:
Q  326 tttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaat 425  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6089286 tttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacat 6089194  T
Q  426 cttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 510  Q
     ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6089193 tttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtta 6089109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 319 - 463
Target Start/End: Original strand, 7054559 - 7054704
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgct 417  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |    
T  7054559 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtt 7054658  T
Q  418 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatcttt 463  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  7054659 tgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 430 - 515
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353341
Alignment:
Q  430 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 30353341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 515
Target Start/End: Original strand, 7055140 - 7055198
Alignment:
Q  457 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7055140 catctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 7055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 550
Target Start/End: Original strand, 7235025 - 7235070
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7235025 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagt 7235070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15491809 - 15491766
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgca 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15491809 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgca 15491766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 390
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  335 gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15491882 - 15491819
Alignment:
Q  449 atcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 512  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  15491882 atcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttaca 15491819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 4318812 - 4318854
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4318812 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtg 4318854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Original strand, 33892993 - 33893034
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33892993 gtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 33893034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 545
Target Start/End: Original strand, 21017102 - 21017142
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagt 545  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21017102 gtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagt 21017142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Original strand, 30353349 - 30353389
Alignment:
Q  506 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  30353349 tgttacacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtg 30353389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8288 - 8088
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 414  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8288 aaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 8189  T
Q  415 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8188 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 8089  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  8088 t 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 325 - 515
Target Start/End: Original strand, 408223 - 408413
Alignment:
Q  325 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 424  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  408223 ttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 408322  T
Q  425 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  408323 tcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactt 408413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 327 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 335
Alignment:
Q  327 ttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatc 426  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  517 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 418  T
Q  427 ttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417 ttggac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 324 - 487
Target Start/End: Original strand, 93894 - 94056
Alignment:
Q  324 tttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa 423  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  93894 tttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaac 93992  T
Q  424 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 487  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  93993 atcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 479 - 515
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94367
Alignment:
Q  479 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactt 94367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 321 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12303 - 12110
Alignment:
Q  321 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 420  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12303 acttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 12205  T
Q  421 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12204 aacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactt 12110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12103 - 12062
Alignment:
Q  505 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12103 gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtg 12062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 315 - 515
Target Start/End: Original strand, 145799 - 146000
Alignment:
Q  315 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  145799 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaa 145898  T
Q  414 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145899 tgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 145998  T
Q  514 tt 515  Q
    ||    
T  145999 tt 146000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44353 - 44158
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  44353 tgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgctt 44254  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44253 gcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactt 44158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Original strand, 154434 - 154629
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  154434 tgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgctt 154533  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 515  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  154534 gcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactt 154629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 319 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 267673 - 267485
Alignment:
Q  319 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 418  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||  |         |||||||||||||||| |||    
T  267673 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taattcatctagtaattctt 267583  T
Q  419 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactt 515  Q
    |||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  267582 gcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 267485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100903
Alignment:
Q  371 ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgc 470  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||            |||||| |||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacat------------cgttggaatctttaacatgc 100973  T
Q  471 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac--ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 546  Q
    ||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  100972 aaacagagttgatgatattatgtg--------aagtgttacacagttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtg 100903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University