View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12760_low_5 (Length: 462)

Name: NF12760_low_5
Description: NF12760
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12760_low_5
NF12760_low_5
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (17-449)||(19773029-19773461)
chr5 (17-449)||(14996624-14997056)
chr5 (17-449)||(22329772-22330204)
chr5 (17-449)||(16359571-16360003)
chr5 (17-449)||(34569563-34569995)
chr5 (17-449)||(41773911-41774343)
chr5 (17-449)||(27521475-27521907)
chr5 (17-449)||(27682285-27682717)
chr5 (17-449)||(27613425-27613857)
chr5 (17-449)||(40711849-40712281)
chr5 (17-449)||(29472958-29473390)
chr5 (17-449)||(37288381-37288813)
chr5 (17-441)||(27665388-27665799)
chr5 (17-449)||(22350988-22351420)
chr5 (17-449)||(22137737-22138169)
chr5 (17-432)||(18782200-18782618)
chr5 (51-441)||(20803674-20804067)
chr5 (86-438)||(23461051-23461406)
chr5 (17-232)||(23537097-23537312)
chr5 (77-279)||(25429659-25429864)
chr5 (77-438)||(23526131-23526495)
chr5 (80-441)||(21882851-21883218)
chr5 (74-279)||(23077844-23078052)
chr5 (17-276)||(25851296-25851558)
chr5 (77-192)||(21331931-21332046)
chr5 (73-180)||(21870216-21870323)
chr5 (73-180)||(21874496-21874603)
chr5 (65-279)||(22505900-22506117)
chr5 (17-285)||(14883873-14884144)
chr5 (74-183)||(23474532-23474641)
chr5 (17-276)||(20345506-20345768)
chr5 (77-192)||(26735670-26735785)
chr5 (77-192)||(21631341-21631456)
chr5 (355-419)||(25851153-25851217)
chr5 (17-111)||(16257918-16258012)
chr5 (356-406)||(22505773-22505823)
chr5 (17-111)||(22591637-22591731)
chr5 (17-111)||(22595192-22595286)
chr5 (365-438)||(25429501-25429574)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (17-449)||(33387804-33388236)
chr1 (17-449)||(21833454-21833886)
chr1 (17-449)||(51330267-51330699)
chr1 (17-449)||(21842364-21842796)
chr1 (17-449)||(16347369-16347802)
chr1 (17-449)||(41350444-41350875)
chr1 (17-443)||(22400478-22400904)
chr1 (17-441)||(19109528-19109953)
chr1 (55-441)||(24784667-24785056)
chr1 (17-426)||(21228328-21228740)
chr1 (17-198)||(16354018-16354199)
chr1 (17-432)||(17041788-17042205)
chr1 (23-441)||(22435521-22435932)
chr1 (23-279)||(21176689-21176948)
chr1 (92-438)||(20081223-20081572)
chr1 (73-438)||(22401755-22402123)
chr1 (77-438)||(22496088-22496452)
chr1 (77-194)||(16379504-16379621)
chr1 (65-276)||(48426229-48426443)
chr1 (77-183)||(21044986-21045092)
chr1 (86-279)||(20074550-20074746)
chr1 (77-194)||(21752457-21752574)
chr1 (95-192)||(22117126-22117223)
chr1 (65-198)||(37680486-37680619)
chr1 (86-279)||(21961380-21961576)
chr1 (124-279)||(52989094-52989252)
chr1 (73-171)||(21742380-21742478)
chr1 (65-276)||(20297739-20297953)
chr1 (82-180)||(19857729-19857827)
chr1 (74-180)||(22015574-22015680)
chr1 (86-279)||(31536838-31537034)
chr1 (73-162)||(21738864-21738953)
chr1 (74-159)||(20832730-20832815)
chr1 (146-183)||(20921860-20921897)
chr1 (359-432)||(21176597-21176670)
chr1 (236-276)||(24096609-24096649)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (17-449)||(13689167-13689599)
chr7 (17-449)||(15157769-15158201)
chr7 (17-449)||(18180869-18181300)
chr7 (17-449)||(8710731-8711163)
chr7 (17-449)||(14335522-14335954)
chr7 (17-449)||(11233925-11234357)
chr7 (17-449)||(18586883-18587315)
chr7 (17-449)||(44788063-44788495)
chr7 (17-385)||(10873652-10874019)
chr7 (17-441)||(11549814-11550238)
chr7 (17-441)||(12690635-12691059)
chr7 (17-431)||(14957652-14958066)
chr7 (17-432)||(11984135-11984553)
chr7 (23-432)||(9591507-9591919)
chr7 (17-399)||(17703164-17703549)
chr7 (17-399)||(16726150-16726535)
chr7 (65-276)||(26091533-26091747)
chr7 (73-180)||(16947215-16947322)
chr7 (73-179)||(13004865-13004971)
chr7 (20-279)||(12459925-12460187)
chr7 (77-272)||(15145692-15145890)
chr7 (65-276)||(26115325-26115539)
chr7 (17-180)||(14145060-14145223)
chr7 (73-180)||(14260989-14261096)
chr7 (73-180)||(19150410-19150517)
chr7 (73-180)||(20749809-20749916)
chr7 (65-276)||(40924552-40924766)
chr7 (73-171)||(12712406-12712504)
chr7 (74-180)||(12798248-12798354)
chr7 (81-192)||(15627910-15628021)
chr7 (74-180)||(11385173-11385279)
chr7 (74-279)||(13024641-13024849)
chr7 (356-419)||(12459785-12459848)
chr7 (16-198)||(13965354-13965536)
chr7 (77-183)||(14283121-14283227)
chr7 (68-186)||(49155694-49155812)
chr7 (371-419)||(13965712-13965760)
chr7 (104-180)||(15099377-15099453)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (17-449)||(10008356-10008788)
chr3 (17-449)||(12889465-12889897)
chr3 (17-449)||(15345187-15345619)
chr3 (17-441)||(5421872-5422296)
chr3 (17-449)||(10908966-10909398)
chr3 (17-449)||(20058996-20059428)
chr3 (17-449)||(26790355-26790787)
chr3 (17-449)||(43165431-43165863)
chr3 (17-449)||(16638529-16638961)
chr3 (17-449)||(48428203-48428635)
chr3 (17-441)||(6603499-6603923)
chr3 (17-441)||(16753643-16754067)
chr3 (17-449)||(15712998-15713430)
chr3 (17-449)||(53381961-53382392)
chr3 (17-449)||(13255446-13255878)
chr3 (17-449)||(3688699-3689131)
chr3 (17-449)||(15399460-15399891)
chr3 (17-449)||(15586334-15586766)
chr3 (17-441)||(24185954-24186378)
chr3 (17-350)||(5110351-5110684)
chr3 (17-291)||(6596969-6597243)
chr3 (17-265)||(15358992-15359240)
chr3 (51-432)||(16803920-16804304)
chr3 (17-432)||(16694937-16695355)
chr3 (51-437)||(11861121-11861510)
chr3 (17-432)||(23414729-23415147)
chr3 (296-449)||(15358839-15358992)
chr3 (51-330)||(12501808-12502090)
chr3 (65-441)||(15065835-15066214)
chr3 (23-438)||(23078962-23079380)
chr3 (77-276)||(17497620-17497822)
chr3 (17-276)||(10408907-10409169)
chr3 (77-279)||(14873584-14873789)
chr3 (65-276)||(28757258-28757472)
chr3 (77-276)||(12843102-12843304)
chr3 (77-331)||(14578420-14578677)
chr3 (77-186)||(16326695-16326804)
chr3 (74-194)||(11958166-11958286)
chr3 (74-174)||(16825264-16825364)
chr3 (62-192)||(12857469-12857599)
chr3 (77-183)||(16831516-16831622)
chr3 (73-171)||(17189421-17189519)
chr3 (65-276)||(47126883-47127097)
chr3 (77-192)||(19727776-19727890)
chr3 (83-194)||(14290526-14290637)
chr3 (17-180)||(16384300-16384463)
chr3 (62-180)||(12357500-12357618)
chr3 (77-183)||(12508553-12508659)
chr3 (62-180)||(24190342-24190459)
chr3 (17-78)||(5108481-5108542)
chr3 (135-196)||(31692231-31692292)
chr3 (83-194)||(35983205-35983316)
chr3 (17-111)||(2036840-2036934)
chr3 (17-111)||(2040581-2040675)
chr3 (17-111)||(14039853-14039947)
chr3 (73-194)||(18131331-18131452)
chr3 (135-196)||(31941925-31941986)
chr3 (77-169)||(13028345-13028437)
chr3 (371-419)||(28757115-28757163)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (17-449)||(24712802-24713234)
chr2 (17-449)||(9338350-9338782)
chr2 (17-449)||(9486984-9487416)
chr2 (17-449)||(24265138-24265570)
chr2 (17-449)||(22322585-22323017)
chr2 (17-449)||(16984008-16984440)
chr2 (17-449)||(44382813-44383245)
chr2 (17-449)||(10871618-10872050)
chr2 (17-449)||(27374037-27374469)
chr2 (17-449)||(17001768-17002200)
chr2 (17-449)||(24873993-24874425)
chr2 (185-449)||(21139392-21139656)
chr2 (17-433)||(23116299-23116718)
chr2 (53-441)||(24704758-24705149)
chr2 (17-431)||(22462721-22463138)
chr2 (17-330)||(24656898-24657214)
chr2 (77-438)||(24678266-24678630)
chr2 (86-438)||(23028771-23029125)
chr2 (201-432)||(23205099-23205333)
chr2 (201-432)||(23676703-23676937)
chr2 (77-437)||(22742266-22742629)
chr2 (74-174)||(16931598-16931698)
chr2 (231-441)||(11351168-11351378)
chr2 (77-438)||(23105027-23105392)
chr2 (77-426)||(23039877-23040229)
chr2 (66-279)||(21320292-21320508)
chr2 (77-276)||(22733074-22733276)
chr2 (20-166)||(23029815-23029961)
chr2 (74-180)||(23274633-23274739)
chr2 (17-198)||(20848608-20848789)
chr2 (365-435)||(23065195-23065265)
chr2 (208-277)||(23065353-23065425)
chr2 (365-435)||(23074645-23074715)
chr2 (208-277)||(23074803-23074875)
chr2 (74-173)||(19716314-19716413)
chr2 (74-173)||(19720877-19720976)
chr2 (73-180)||(23097314-23097421)
chr2 (384-438)||(21322876-21322930)
chr2 (365-438)||(22733365-22733438)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (17-449)||(24292630-24293062)
chr6 (17-449)||(29589287-29589719)
chr6 (17-449)||(2871650-2872082)
chr6 (17-449)||(16574891-16575323)
chr6 (17-449)||(16620057-16620489)
chr6 (17-449)||(27205623-27206055)
chr6 (17-449)||(27243173-27243605)
chr6 (17-449)||(28312631-28313063)
chr6 (17-441)||(28260045-28260469)
chr6 (17-441)||(28285447-28285871)
chr6 (17-441)||(28338794-28339218)
chr6 (23-443)||(25115559-25115981)
chr6 (17-449)||(22829234-22829666)
chr6 (17-438)||(5836076-5836497)
chr6 (52-432)||(25756495-25756878)
chr6 (77-438)||(22436881-22437245)
chr6 (17-432)||(27558814-27559232)
chr6 (51-279)||(21764983-21765214)
chr6 (74-180)||(19438275-19438381)
chr6 (77-276)||(23081597-23081799)
chr6 (20-279)||(10465696-10465958)
chr6 (208-438)||(18404980-18405213)
chr6 (359-438)||(19867699-19867778)
chr6 (65-276)||(24367574-24367788)
chr6 (77-192)||(18182293-18182408)
chr6 (73-180)||(18797963-18798070)
chr6 (77-183)||(18660189-18660295)
chr6 (74-192)||(19456284-19456402)
chr6 (74-192)||(19466429-19466547)
chr6 (73-179)||(19881670-19881776)
chr6 (73-171)||(34642486-34642584)
chr6 (65-194)||(14376809-14376938)
chr6 (396-438)||(16924867-16924909)
chr6 (74-180)||(21566893-21566999)
chr6 (356-419)||(10466035-10466098)
chr6 (92-194)||(19867915-19868017)
chr6 (77-171)||(25958658-25958752)
chr6 (236-276)||(21474774-21474814)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (17-449)||(12479737-12480169)
chr4 (17-441)||(19775236-19775660)
chr4 (17-449)||(8050066-8050498)
chr4 (17-449)||(14300422-14300854)
chr4 (17-449)||(17091592-17092024)
chr4 (17-449)||(23958884-23959316)
chr4 (17-449)||(27714473-27714905)
chr4 (17-449)||(19635273-19635705)
chr4 (17-449)||(8389549-8389981)
chr4 (17-449)||(16233435-16233867)
chr4 (17-449)||(40476177-40476609)
chr4 (17-441)||(14683712-14684136)
chr4 (23-436)||(13513500-13513916)
chr4 (17-375)||(18604259-18604620)
chr4 (52-337)||(18223948-18224236)
chr4 (51-276)||(16248150-16248378)
chr4 (51-232)||(16350216-16350397)
chr4 (17-279)||(7357574-7357839)
chr4 (65-276)||(3261542-3261756)
chr4 (77-194)||(14162865-14162982)
chr4 (293-390)||(16250569-16250666)
chr4 (23-279)||(20893338-20893597)
chr4 (91-183)||(14697507-14697599)
chr4 (77-194)||(8431-8548)
chr4 (62-194)||(15073754-15073886)
chr4 (359-441)||(15144677-15144759)
chr4 (77-194)||(15536-15653)
chr4 (77-194)||(15144448-15144565)
chr4 (17-276)||(29450237-29450499)
chr4 (73-180)||(18259850-18259957)
chr4 (360-438)||(14162618-14162696)
chr4 (62-180)||(14993112-14993230)
chr4 (74-192)||(16219585-16219703)
chr4 (74-192)||(16222905-16223023)
chr4 (65-198)||(44658614-44658747)
chr4 (73-180)||(15267185-15267292)
chr4 (86-279)||(11204001-11204197)
chr4 (355-419)||(7357434-7357498)
chr4 (236-276)||(15073669-15073709)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (17-449)||(17671168-17671600)
chr8 (17-449)||(20015409-20015841)
chr8 (17-449)||(18859780-18860212)
chr8 (17-449)||(19115603-19116035)
chr8 (17-449)||(22126105-22126537)
chr8 (17-449)||(22117321-22117753)
chr8 (17-449)||(19481219-19481650)
chr8 (17-432)||(22043047-22043465)
chr8 (17-432)||(30310287-30310705)
chr8 (17-432)||(15536603-15537021)
chr8 (17-432)||(32603365-32603783)
chr8 (203-432)||(22031323-22031554)
chr8 (77-438)||(19981181-19981545)
chr8 (77-438)||(18880860-18881224)
chr8 (77-449)||(21391064-21391439)
chr8 (77-449)||(21780390-21780765)
chr8 (77-438)||(21163733-21164105)
chr8 (74-198)||(29300626-29300750)
chr8 (77-232)||(22421096-22421251)
chr8 (77-192)||(22523973-22524088)
chr8 (17-276)||(16268367-16268629)
chr8 (17-180)||(22027423-22027586)
chr8 (77-194)||(21671976-21672093)
chr8 (74-194)||(21928889-21929009)
chr8 (77-183)||(22054335-22054441)
chr8 (80-276)||(19985556-19985755)
chr8 (17-276)||(28984287-28984549)
chr8 (17-108)||(17830113-17830204)
chr8 (62-192)||(22374332-22374462)
chr8 (74-171)||(3274589-3274686)
chr8 (359-419)||(16268712-16268772)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (17-449)||(22413-22845)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (17-449)||(7402-7834)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (17-449)||(3590-4022)
scaffold0044 (51-432)||(17343-17727)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (17-443)||(10540-10965)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (17-449)||(41321-41753)
scaffold0109 (62-431)||(12872-13244)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (17-441)||(8432-8856)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (17-449)||(21163-21578)
scaffold0028 (17-449)||(11635-12050)
scaffold0028 (17-449)||(55170-55602)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (18-449)||(104-524)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (17-441)||(424482-424909)
scaffold0003 (20-180)||(203819-203979)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (17-443)||(48837-49263)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (23-432)||(189-601)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (17-230)||(107480-107693)
scaffold0029 (77-279)||(8550-8755)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (51-432)||(229589-229973)
scaffold0009 (74-273)||(251961-252163)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (23-421)||(14750-15151)
scaffold0177 (23-421)||(11065-11466)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (17-432)||(5181-5599)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (17-432)||(33-450)
scaffold0008 (17-338)||(139313-139637)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (17-432)||(13733-14153)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (18-432)||(473-890)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (23-399)||(4-383)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (51-438)||(36675-37065)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (17-432)||(14607-15025)
scaffold0010 (77-192)||(5341-5456)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (62-431)||(9987-10358)
scaffold0080 (62-431)||(12642-13013)
scaffold0080 (77-441)||(32053-32420)
scaffold0080 (245-441)||(37519-37715)
scaffold0080 (77-438)||(54814-55178)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (51-438)||(15316-15706)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (62-432)||(171301-171674)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (62-431)||(63-435)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (20-441)||(7363-7787)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (80-432)||(7545-7900)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (50-348)||(3-304)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (77-438)||(21781-22145)
scaffold0081 (77-438)||(37205-37569)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (65-438)||(291-667)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (201-438)||(10045-10285)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (77-438)||(17112-17476)
scaffold0114 (77-180)||(40496-40599)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (77-438)||(217-581)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (20-438)||(36526-36947)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (77-276)||(141-343)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (17-432)||(3047-3465)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (51-277)||(121913-122142)
scaffold0034 (17-186)||(11609-11778)
scaffold0034 (17-194)||(1655-1832)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (79-438)||(30464-30826)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (77-276)||(11602-11804)
scaffold0120 (92-276)||(14423-14610)
scaffold0120 (368-438)||(14261-14331)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (77-438)||(8587-8952)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (52-438)||(16804-17193)
scaffold0017 (356-438)||(194883-194965)
scaffold0017 (137-230)||(194691-194784)
scaffold0017 (52-132)||(21326-21406)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (77-437)||(69-432)
scaffold0490 (76-180)||(3303-3407)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (79-438)||(101-463)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (77-438)||(10643-11007)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (77-438)||(8400-8764)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (89-438)||(30349-30701)
scaffold0023 (73-194)||(164160-164281)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (51-331)||(829-1112)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (77-449)||(15077-15452)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (80-438)||(9124-9485)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (77-435)||(50108-50469)
scaffold0102 (82-194)||(43122-43234)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (74-279)||(1247-1455)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (91-276)||(9220-9408)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (17-330)||(28631-28947)
[»] scaffold0621 (4 HSPs)
scaffold0621 (77-276)||(356-558)
scaffold0621 (77-276)||(4773-4975)
scaffold0621 (359-438)||(194-273)
scaffold0621 (359-438)||(4611-4690)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (77-276)||(23708-23910)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (77-192)||(11454-11569)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (77-232)||(6886-7041)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (92-438)||(3728-4077)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (77-407)||(4318-4651)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (77-438)||(2166-2530)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (93-183)||(216199-216289)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (77-194)||(19822-19939)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (77-194)||(42056-42173)
scaffold0022 (77-194)||(75776-75893)
scaffold0022 (359-441)||(34763-34845)
scaffold0022 (77-194)||(34534-34651)
scaffold0022 (359-438)||(41809-41888)
scaffold0022 (359-438)||(75529-75608)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (17-180)||(17187-17350)
scaffold0348 (83-174)||(4618-4709)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (77-192)||(14028-14143)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (77-192)||(15836-15951)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (65-279)||(797-1014)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (73-180)||(62531-62638)
scaffold0053 (73-183)||(65081-65191)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (356-438)||(1159-1241)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (65-426)||(330-694)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (74-279)||(30086-30294)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (74-194)||(1071-1191)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (74-194)||(8168-8288)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (77-279)||(1067-1272)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (77-183)||(7308-7414)
scaffold0270 (77-183)||(14438-14544)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (77-183)||(9550-9656)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (74-180)||(50543-50649)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (65-195)||(30333-30463)
scaffold0088 (237-282)||(30267-30312)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (86-279)||(514125-514321)
scaffold0001 (123-192)||(496446-496515)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (73-194)||(21238-21359)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (77-194)||(40270-40387)
scaffold0122 (368-438)||(40564-40634)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (77-194)||(48154-48271)
scaffold0075 (77-194)||(55234-55351)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (62-171)||(66856-66965)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (77-194)||(110670-110787)
scaffold0040 (77-183)||(18280-18386)
scaffold0040 (365-438)||(110961-111034)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (74-171)||(98343-98440)
scaffold0020 (62-171)||(176434-176543)
scaffold0020 (234-276)||(176326-176368)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (83-183)||(53-152)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (65-276)||(23674-23888)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (62-186)||(29959-30083)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (65-276)||(42074-42288)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (77-276)||(104565-104767)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (17-180)||(64305-64468)
scaffold0067 (17-180)||(48883-49046)
scaffold0067 (17-180)||(57917-58080)
scaffold0067 (74-180)||(30062-30168)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (74-180)||(1608-1714)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (74-180)||(5662-5768)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (62-180)||(34775-34893)
scaffold0106 (239-285)||(34667-34713)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (255-441)||(69366-69551)
scaffold0064 (86-194)||(66302-66410)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (77-174)||(2275-2372)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (65-276)||(1358-1572)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (74-186)||(621-732)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (77-276)||(9958-10160)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (74-281)||(33132-33342)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (20-180)||(263664-263824)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (176-438)||(2125-2390)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (77-192)||(23296-23411)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (32-198)||(11461-11627)
scaffold0523 (73-165)||(5890-5982)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (74-180)||(305-411)
scaffold0476 (359-407)||(10994-11042)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (77-183)||(17740-17846)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (80-194)||(4070-4184)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (65-186)||(13805-13926)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (86-171)||(17084-17169)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (74-171)||(37386-37483)
[»] scaffold1600 (1 HSPs)
scaffold1600 (84-192)||(492-600)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (74-194)||(52075-52195)
scaffold0026 (236-276)||(51990-52030)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (17-180)||(942-1105)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (137-180)||(6080-6123)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (77-438)||(18827-19190)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (77-171)||(17686-17780)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (74-180)||(116062-116168)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (62-171)||(1020-1129)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (135-196)||(9036-9097)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (65-186)||(11409-11530)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (86-183)||(13246-13343)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (73-194)||(5477-5598)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (62-171)||(28033-28142)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (77-186)||(16372-16481)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (74-171)||(6251-6348)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (75-183)||(991-1099)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (74-194)||(70532-70652)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (73-152)||(63298-63377)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (77-171)||(2199-2292)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (77-183)||(1185-1291)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (74-180)||(12174-12280)
scaffold0261 (74-180)||(20354-20460)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (73-174)||(5624-5725)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (77-170)||(5536-5629)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (365-438)||(24766-24839)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (86-194)||(6026-6134)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (133-165)||(103-135)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19773461 - 19773029
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19773461 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 19773362  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19773361 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 19773262  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19773261 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 19773162  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773161 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 19773062  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19773061 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 19773029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 14996624 - 14997056
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14996624 gacatcaagagggcgattgggtatcaacagttgagagtttttccagacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgagg 14996723  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||    
T  14996724 tagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggttgatgttaggcgacc 14996823  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14996824 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 14996923  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996924 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 14997023  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14997024 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 14997056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 22329772 - 22330204
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22329772 gacatcaagagggcaattgggtaccaacagctgagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 22329871  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22329872 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 22329971  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22329972 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 22330071  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22330072 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcgcattagttcacagtgtactcagccta 22330171  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22330172 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 22330204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16360003 - 16359571
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16360003 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 16359904  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16359903 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 16359804  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16359803 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 16359704  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359703 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 16359604  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16359603 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 16359571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34569995 - 34569563
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34569995 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 34569896  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34569895 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 34569796  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34569795 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 34569696  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569695 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 34569596  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34569595 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 34569563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41774343 - 41773911
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41774343 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 41774244  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41774243 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 41774144  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41774143 taagaagaagaatgctgctgagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 41774044  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41774043 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 41773944  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41773943 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 41773911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27521907 - 27521475
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27521907 gacattaagagggcgattggataccaacagttgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggacacgaaggctcactacaagg 27521808  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  27521807 tagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggtc 27521708  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27521707 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 27521608  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521607 ggcaagaaagatcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 27521508  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27521507 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 27521475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 27682285 - 27682717
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27682285 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctacaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 27682384  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  27682385 tagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcgtcc 27682484  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27682485 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 27682584  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27682585 ggcaagaaaggtcatgctgtagctgattgcaatcgtacggacgttgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcatccta 27682684  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27682685 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 27682717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27613857 - 27613425
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27613857 gacatcaagagggcgattggataccaacaactgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 27613758  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||    
T  27613757 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaaggtggtcgatgtgagacggcc 27613658  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27613657 taagaagagggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaagggccacaagagcaatgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgt 27613558  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613557 ggcaagaaaggtcatgtggtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagaggctcacattagttcacagtgtactcagccta 27613458  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27613457 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 27613425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 40712281 - 40711849
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40712281 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 40712182  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40712181 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 40712082  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40712081 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgcgtccggtgt 40711982  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711981 ggtaagaagggtcgtgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 40711882  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40711881 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 40711849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 29472958 - 29473390
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29472958 gacatcaagagggcgattgggtaccaacagctaagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaatgctcactacaagg 29473057  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  29473058 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgtccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 29473157  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  29473158 taagaagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcgatgt 29473257  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473258 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 29473357  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29473358 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 29473390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 37288381 - 37288813
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37288381 gacatcaagagggcgattggataccaacaactgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 37288480  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  37288481 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgctcccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 37288580  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37288581 taagaagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgt 37288680  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37288681 ggcaagaaagttcacattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 37288780  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37288781 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 37288813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 27665388 - 27665799
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27665388 gacatcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 27665487  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27665488 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 27665587  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27665588 taagaagaaggatgctgcagag-------------attgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 27665674  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665675 ggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcatacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 27665774  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27665775 agagggcgccgactactggtagggt 27665799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22351420 - 22350988
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22351420 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactacaaga 22351321  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22351320 tagtgaacgagaggaagggcaaggggcagcagagtcgtcataagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcc 22351221  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  22351220 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaactgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccccgaagaaatgaagaagtgtgtccggtgt 22351121  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| | | ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22351120 ggcaagaaaggtcatattgtagcttaatgcaagcgtacgaacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcatccta 22351021  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22351020 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 22350988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22138169 - 22137737
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||     
T  22138169 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaagatactaaggctcactataaga 22138070  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  22138069 ttgtgaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 22137970  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22137969 taagaagaaggatgctattgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 22137870  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137869 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 22137770  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  22137769 agagggcgccgaatactggtagagtctttgctt 22137737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18782618 - 18782200
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |  ||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| | |||||||    
T  18782618 gacatcaagagggcgattggataccaacagatccgagttttccctaatttagtgaatagctgcagaatctacgaggaagatactaaggctaattacaagg 18782519  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||| || |    
T  18782518 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccaacagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggtggtc 18782419  T
Q  217 taagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || |||||||||    
T  18782418 taagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaaaaaatgtgtccgg 18782319  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  || || || ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| |||| || || |  ||||    
T  18782318 tgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatatcgtatgcttcaattgtaatgaagaggttcatattggttcccaatgcaagcagc 18782219  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  18782218 cgaagagggcgcctactac 18782200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20804067 - 20803674
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||  |||    ||||| || || ||    
T  20804067 gagtttttcctgagttggtaaatagctgcagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtggatgagcagaagactaagggccaacaaag 20803968  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgt 247  Q
    ||  |||||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||    
T  20803967 tctccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaatagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgt 20803868  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgca 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||  | ||| ||| ||||    
T  20803867 ttcaattatggtgagaaaggccacaagagaaatgtttgccctgaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggcaagaagggtcatactttagctgactgca 20803768  T
Q  348 atcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    | | ||  || ||||||||||| ||| |||| | |||| |||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  20803767 agcatagtgatattgtgtgcttcaatggcaaggaagagagtcatattggttctcagtgcaagcagcctaagagggtgctgactactggaagggt 20803674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23461406 - 23461051
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 185  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  23461406 tatgaagaggacaccaaagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagg 23461307  T
Q  186 ggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgt 282  Q
    | ||| |||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23461306 gaaaatagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggaaattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgt 23461207  T
Q  283 ctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatgga 382  Q
     || || |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  | ||| ||| ||||| | |   || |||||||| ||  ||||||| | |    
T  23461206 ttgtccagaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggcaagaagagtcatactttagctgaatgcaagcatggtgatattgtgtgtttcgattgcaaggaa 23461107  T
Q  383 gagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||| | ||| |||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23461106 gagggtaatattggttcccagtgcaaacaacctaagaaggcgccgactactggtag 23461051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Original strand, 23537097 - 23537312
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  23537097 gacattaagagggcgatcggataccaacagatctgagtttttcctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaagg 23537196  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||  ||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  23537197 ttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctatgccctatagtgcccctcctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 23537296  T
Q  217 taagaagaaggatgct 232  Q
    ||||||||||||||||    
T  23537297 taagaagaaggatgct 23537312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25429864 - 25429659
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  25429864 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccttaagccttacagtgcccctg 25429765  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    || |||| || ||| ||| |||  | || | |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25429764 ctaataagggcaaatagaggatggttgaagataggcggcctaagaagaaggatactcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 25429665  T
Q  274 gagcaa 279  Q
    ||||||    
T  25429664 gagcaa 25429659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23526495 - 23526131
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| |  |    
T  23526495 tgcaggatttatgaggaggacacaaaggctcattacaagattgtgaatgagtggaagactaagggccagcagagtcgcactaagccctatagtgctcttg 23526396  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    |||| || || ||| ||| |||  |||| | ||| ||||| | |||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23526395 ctgacaagggcaaatagaggatggtcgaggatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaa 23526296  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    |||||| |  || |||   ||| | || |  ||| || | ||||| ||||| |||||||   |||   ||||||| ||||  || ||||||||||| |||    
T  23526295 gagcaatgcttgtcctagagaggtaaaaagatgtttcagatgtggtaagaagggtcatgcattagccaattgcaaccgtaatgatattgtgtgcttcaat 23526196  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23526195 tgcaatgaagagggtcatattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 23526131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21883218 - 21882851
Alignment:
Q  80 aggatctatgaagaggatacaaag--gctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgc 177  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  21883218 aggatctatgaggaggatactaagaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgc 21883119  T
Q  178 tgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaag 274  Q
    |||||| || |||||||  ||  |||| | ||| ||||| | |||||| ||||   |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21883118 tgataagggcaaacagagaatggtcgaggatagacggccgaggaagaaagatgtttctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccacaag 21883019  T
Q  275 agcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtg-tgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||||| |  || || |  ||| | ||||  || | || | ||||| ||||| |||||||   ||| ||| |  || | ||  |||||||||||||| |||    
T  21883018 agcaatgcttgtccgggagaggtaaagagatgttttcagatgtggtaagaagggtcatgcaatagctgagtagaaacataatgacattgtgtgcttcaat 21882919  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    || |||| ||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21882918 tgtaatgaagaaggtcacattggttctcagtgtaagcagcctaagaaggtgccgactactggtagggt 21882851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 23077844 - 23078052
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  23077844 agctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtaatgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagtgctc 23077943  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggcca 270  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  23077944 ctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtatgtttcaagtgtggtgaaaaaggcca 23078043  T
Q  271 caagagcaa 279  Q
    ||| |||||    
T  23078044 caaaagcaa 23078052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25851558 - 25851296
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||  | || ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||     
T  25851558 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagttttctctgagttggttaataggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 25851459  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| ||||    
T  25851458 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 25851359  T
Q  217 taagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
     |||| ||  |||||   ||  |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25851358 caagaggagagatgctcttgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 25851296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Original strand, 21331931 - 21332046
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  21331931 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaggattgtgaatgagaggaaaggcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 21332030  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||| || |||||    
T  21332031 ctgataagggaaaaca 21332046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Original strand, 21870216 - 21870323
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21870216 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcc 21870315  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  21870316 cctgctga 21870323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Original strand, 21874496 - 21874603
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21874496 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcc 21874595  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  21874596 cctgctga 21874603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22506117 - 22505900
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| || ||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22506117 ttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 22506018  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| ||||||||| ||  ||||   || | |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  22506017 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtga 22505918  T
Q  262 gaaaggccacaagagcaa 279  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22505917 gaaaggccacaagagcaa 22505900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 285
Target Start/End: Original strand, 14883873 - 14884144
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || |||     
T  14883873 gacatcaaaagggctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataaga 14883972  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |  ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || |||| |||    |||| |||| ||||    
T  14883973 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcc 14884072  T
Q  217 taagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctg 285  Q
     |||| ||  ||||||   || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14884073 caagaggagagatgctccagctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctg 14884144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23474641 - 23474532
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    |||||||| ||  |||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||| |    
T  23474641 agctgcagaatacatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacattgctc 23474542  T
Q  174 ccgctgataa 183  Q
    | ||||||||    
T  23474541 ctgctgataa 23474532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20345768 - 20345506
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||||||     
T  20345768 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaataggtgcagaatttatgaggaagacaccaaagctcattacaaga 20345669  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    || ||| ||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| ||||    
T  20345668 taatgagtgagaggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 20345569  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
     |||| ||  ||||   |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20345568 caagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaagcccacaagag 20345506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Original strand, 26735670 - 26735785
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | || |||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||      
T  26735670 tgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtaaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctccta 26735769  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    |||||||||| |||||    
T  26735770 ctgataaaggaaaaca 26735785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Original strand, 21631341 - 21631456
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || | | | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  21631341 tgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggttgtgaatgagaggaagggtaggagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 21631440  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||| || |||||    
T  21631441 ctgataagggtaaaca 21631456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25851217 - 25851153
Alignment:
Q  355 agacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||    
T  25851217 agacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaaga 25851153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Original strand, 16257918 - 16258012
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcacta 111  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  16257918 gacattaagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcacta 16258012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22505823 - 22505773
Alignment:
Q  356 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgt 406  Q
    |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22505823 gacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcacatcagttcacagtgt 22505773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Original strand, 22591637 - 22591731
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcacta 111  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22591637 gacattaagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcacta 22591731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Original strand, 22595192 - 22595286
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcacta 111  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22595192 gacattaagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcacta 22595286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25429574 - 25429501
Alignment:
Q  365 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |   ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25429574 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacaatgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtag 25429501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 33387804 - 33388236
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33387804 gacatcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttccgaatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 33387903  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33387904 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 33388003  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33388004 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtttgcccggaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 33388103  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388104 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 33388203  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33388204 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 33388236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21833886 - 21833454
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21833886 gacattaagagggcgattggataccaacagctaagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatggagaggatacgaaggctcactacaagg 21833787  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  21833786 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaatagaagatggtcgatgttaggcggcc 21833687  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21833686 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 21833587  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833586 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 21833487  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21833486 agagggcgccgactactcgtagggtctttgctt 21833454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 51330267 - 51330699
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51330267 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 51330366  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  51330367 tagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgtcaggcggcc 51330466  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51330467 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggagagagaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 51330566  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330567 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 51330666  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51330667 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 51330699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21842796 - 21842364
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21842796 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaaga 21842697  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  21842696 tagtgaacgagaggaagggcaagggacatcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgatagacggcc 21842597  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21842596 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccgatgt 21842497  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21842496 ggcaagaaaggtcatattgtagccgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcatagtgtactcagccta 21842397  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21842396 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 21842364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 16347369 - 16347802
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagattt-ggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaag 115  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16347369 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggattttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaag 16347468  T
Q  116 gtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggc 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  16347469 gtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgacgttaggcggc 16347568  T
Q  216 ctaagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtg 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16347569 ctaagaagaaggatgctgctgagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtg 16347668  T
Q  316 tggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcct 415  Q
    ||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16347669 tggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgtaatcgtgcagacattgtgtgctttaactgcaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagcct 16347768  T
Q  416 aagagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16347769 aagagggcgccgactactggtagggtctttgctt 16347802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 41350444 - 41350875
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41350444 gacatcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttcatagctgcagg-tctatgaagaggatacgaaggcttactacaagg 41350542  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41350543 tagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 41350642  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41350643 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 41350742  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41350743 ggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgcaatcgtgcagacattgtgtgctttaattgtaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagccta 41350842  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  41350843 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 41350875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22400904 - 22400478
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  22400904 gacatcaaaagggcgattggatgccaacagcttagagtttttctggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactataaga 22400805  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  22400804 ttgtgaacgagaggaagggcaagggagagcagagtcgtcctaagctgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 22400705  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22400704 taagaagatggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggagggaaaggccataaaagtaatgtctgccctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgt 22400605  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22400604 ggcaagaagggtcatattgtagcggattgcaagcgtacggacatcgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 22400505  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22400504 agagggcgccgactactggtagggtct 22400478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19109953 - 19109528
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||     
T  19109953 gacattaagagggcgattggataccaacagattagagtttt-ccggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactgtaaga 19109855  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||| |||||||||    
T  19109854 ttgtcaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggttgatgataggcggcc 19109755  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgttt--caattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggt 314  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19109754 taagaagaaggatgctaccgagattgtgtgtttttcaattgttgtgtgaaaggtcactaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggt 19109655  T
Q  315 gtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcc 414  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109654 gtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacattagttcacagtgtactcagcc 19109555  T
Q  415 taagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19109554 taagagggcgccgactactggtagggt 19109528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 441
Target Start/End: Original strand, 24784667 - 24785056
Alignment:
Q  55 ttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgt 154  Q
    |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| || |||||||      
T  24784667 ttttcctgatttggtgaacagctgtagaatctatgaggaggataacaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccaacagagtctc 24784766  T
Q  155 cctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttca 251  Q
    |||||||| || |||||| | |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||    
T  24784767 cctaagccctatagtgcctctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttca 24784866  T
Q  252 attgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcg 351  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||| ||    
T  24784867 attatggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggagataaagaaatgtgcccggtgtggcaagaagggtcatacggtagctgactgcaagcg 24784966  T
Q  352 tacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    ||  || |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24784967 taatgatattgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtagggt 24785056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Original strand, 21228328 - 21228740
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  21228328 gacattaagagggcgatcggataccaacagatctgagttttccctgatttagttaatagctgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaagg 21228427  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | |||||||||  |||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  21228428 ttgtgaatgagcagaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggtaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 21228527  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || | ||  ||||||||||| |||||| ||    
T  21228528 taagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcttgtagagatcaagaaatgtgtcagg 21228627  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  21228628 tgtggcaagaagggtcaaattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 21228727  T
Q  414 ctaagagggcgcc 426  Q
    |||||||||||||    
T  21228728 ctaagagggcgcc 21228740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 16354018 - 16354199
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16354018 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 16354117  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagat 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16354118 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagat 16354199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Original strand, 17041788 - 17042205
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  17041788 gacatcaagagggcgatcggataccaacaactccgagttttccctgatttggtgaacagctgtaggatctacgaagaggataccagagctcattacaagg 17041887  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||  ||  |||||| |||||||||    
T  17041888 ttgttaatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcc 17041987  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    ||||||||||||||   || | |||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17041988 taagaagaaggatgctccttcggagatt-tttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttatcctgaagagatcaagaaatgtgtccgg 17042086  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  17042087 tgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagagaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatataagttcccagtgcaagcagc 17042186  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  17042187 cgaagaggacgcctactac 17042205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 441
Target Start/End: Original strand, 22435521 - 22435932
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    |||||||||||||| || |||||  |   ||||||||| || ||||| || | ||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22435521 aagagggcgattggataccaacagatccaagtttttcccgagttggtgaacaactgtagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 22435620  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
    ||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| || |||||||  ||  || ||| ||||       ||||    
T  22435621 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctactgataagggaaaacagagaatggtcaatgatagg-------agaa 22435713  T
Q  223 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 322  Q
    | | | | ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| | ||||| ||| |||| |||||||||    
T  22435714 ggatgctcctgcgaagattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtaaagaaatgtttccgatgtggcaag 22435813  T
Q  323 aaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagaggg 422  Q
    || ||||||    ||| ||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |  || ||||||||||    
T  22435814 aagggtcatacattagctgattgcaagcatagtgatattgtgtgcttcaattgcaaggaagagggtcacattggttctcagtgcaagcaacctaagaggg 22435913  T
Q  423 cgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22435914 cgccgactactggtagggt 22435932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21176948 - 21176689
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  | |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21176948 aagagggcaattaggtatcaacaaatccgtgtttttcctgatttggtgaatagttgtagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 21176849  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
    ||||| ||||    ||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||    
T  21176848 atgagcggaagactaagggccagcagagtagccctaagacatatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 21176749  T
Q  223 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    ||||||||   |||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21176748 gaaggatgctcctgtggagattgtctgtattaattgtggtgagaaagtccacaagagcaa 21176689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 438
Target Start/End: Original strand, 20081223 - 20081572
Alignment:
Q  92 gaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaac 191  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    || || ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20081223 gaggataccaaggctcattacaagatcgtgaatgagcggaagactaacggccagcagagtcgccttaagccttatagcgcccctgctgataagggcaaac 20081322  T
Q  192 agaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccc 288  Q
    |||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||    
T  20081323 agagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgttcatgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcc 20081422  T
Q  289 tgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggt 388  Q
     |  ||| | ||||  ||| | || ||||| ||||| ||||||    ||  ||| || || ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  20081423 gggagaggtaaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatacactatctgagtgtaagcgtaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggt 20081522  T
Q  389 cacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20081523 cacattggttcgcagtgtacgcggcctaagaaggcgccgactactggtag 20081572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22402123 - 22401755
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | || |||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22402123 tagctgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtaaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgcc 22402024  T
Q  173 cccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggcc 269  Q
    || |||||||| || |||||||  ||  |||| | ||| || ||||||||||||||||   ||||||| ||| | ||||| | |||||||||||||||||    
T  22402023 cctgctgataagggcaaacagagaatggtcgaagatagacgacctaagaagaaggatgctcctgcagaaattttctgttttacttgtggtgagaaaggcc 22401924  T
Q  270 acaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctt 369  Q
    ||||||| || |  || |||| ||| | |||||  ||| | || ||||| ||||| | |||||   ||| ||| ||||| | |   || || || |||||    
T  22401923 acaagagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgttttcgctgtggaaagaaggatcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgctt 22401824  T
Q  370 taattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
     ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22401823 caattgtaatgaagagggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtag 22401755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 22496088 - 22496452
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| || |||||||  |||||||| || || ||||| |    
T  22496088 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagcggaagacgaagggccaccagagtctccctaagccttatagcgcccctg 22496187  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  ||||   ||| ||||| | |||||||||||   |||  |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  22496188 ctgataagggaaaacagagaatggtcgagtatagacggccaaggaagaaggatgttcctgttgagattgtctgctttaattatggtgagaaaggccacaa 22496287  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    |||| | |  || || |  ||| | ||||  ||| | || ||||| ||||| ||||| |   ||| ||| ||||| | ||  || ||||||||||| |||    
T  22496288 gagcgatgcttgtccgggagaggtaaagagatgttttcgatgtggtaagaagggtcacgcactagctgagtgcaaacataatgatattgtgtgcttcaat 22496387  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22496388 tgcaatgaagagggtcacattagttcgcagtgtaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 22496452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16379621 - 16379504
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  16379621 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaaaggcaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcctctg 16379522  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  16379521 ctgataagggcaaacaga 16379504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48426443 - 48426229
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |    
T  48426443 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 48426344  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  48426343 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 48426244  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  48426243 gaaaggccacaagag 48426229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 21044986 - 21045092
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  21044986 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaataagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 21045085  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  21045086 ctgataa 21045092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 279
Target Start/End: Original strand, 20074550 - 20074746
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 185  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||    
T  20074550 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgcttctgctgacaaag 20074649  T
Q  186 ggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    | || ||||||||    ||||  ||| ||| ||||| ||  ||||||    | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20074650 gaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcttaagaggagagatgctcccactgagattgtgtgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaa 20074746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21752574 - 21752457
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  21752574 tgcaggatttatgaggaagataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagctaagggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgccactg 21752475  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  21752474 ctgataagggaaaacaga 21752457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22117223 - 22117126
Alignment:
Q  95 gatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  22117223 gatactaaggctcattacaaggttttgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgttcctgctgataagggaaaaca 22117126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37680619 - 37680486
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |    
T  37680619 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 37680520  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagat 198  Q
    ||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||    
T  37680519 acagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagat 37680486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21961576 - 21961380
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 185  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||    
T  21961576 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggagaggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctccttctgacaaag 21961477  T
Q  186 ggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    | || ||||||||    |||| |||| | || |||| ||  ||||   || | |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21961476 gaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaa 21961380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52989252 - 52989094
Alignment:
Q  124 tgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaag 223  Q
    ||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| ||||||||| |    
T  52989252 tgagaggaggggtaagggacagcaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagagg 52989153  T
Q  224 aaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    |  ||||   || | |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  52989152 agagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaa 52989094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 171
Target Start/End: Original strand, 21742380 - 21742478
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | ||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  21742380 tagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgc 21742478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20297953 - 20297739
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |    
T  20297953 ttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacatcagaatcgtcctaagcctt 20297854  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| ||  |||| || || |||||||||||    ||||  ||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20297853 acagtgctcctactgacaagggaaaacagaagatgggtgatgacaggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtga 20297754  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||| ||||||||||    
T  20297753 gaaatgccacaagag 20297739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19857827 - 19857729
Alignment:
Q  82 gatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||  | | ||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||    
T  19857827 gatctatgaagaggatactaaggctcattacaaggtgatgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctga 19857729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 22015574 - 22015680
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  22015574 agctgtaggatctatgaagaagttacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtaggggaaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctc 22015673  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  22015674 ctgctga 22015680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 279
Target Start/End: Original strand, 31536838 - 31537034
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 185  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  31536838 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaag 31536937  T
Q  186 ggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    | || |||| |||    |||| |||| | || |||| ||  ||||   || | |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31536938 gaaagcagaggatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaa 31537034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 162
Target Start/End: Original strand, 21738864 - 21738953
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagcc 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21738864 tagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagcc 21738953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Original strand, 20832730 - 20832815
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaa 159  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20832730 agctgtagaatctatgaataagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgtagaggcaagggacagcagagtcgtcctaa 20832815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20921897 - 20921860
Alignment:
Q  146 cagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataa 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20921897 cagagtcgtcctaagccttacagtgctcccgctgataa 20921860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21176670 - 21176597
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| || || |  |||||||||||| |||| |||||    
T  21176670 attgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagaggacgcctactac 21176597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Original strand, 24096609 - 24096649
Alignment:
Q  236 gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24096609 gagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 24096649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13689599 - 13689167
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13689599 gacatcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttccagacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 13689500  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13689499 tagtgaatgagagaaagggcaagggacaccagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctactgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 13689400  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13689399 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 13689300  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689299 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggatagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 13689200  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13689199 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 13689167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 15157769 - 15158201
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15157769 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 15157868  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15157869 tagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 15157968  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15157969 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 15158068  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158069 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 15158168  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15158169 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 15158201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18181300 - 18180869
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18181300 gacatcaagagggcgattggg-attaacaactgagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 18181202  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  18181201 tagtgaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcttcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgaggttaggcggcc 18181102  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18181101 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggcgagaaaggccacgaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 18181002  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18181001 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 18180902  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18180901 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 18180869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8711163 - 8710731
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8711163 gacattaagagggcgatcggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 8711064  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8711063 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 8710964  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8710963 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 8710864  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710863 ggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggaaagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 8710764  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8710763 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 8710731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14335954 - 14335522
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14335954 gacattaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 14335855  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14335854 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacaatgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 14335755  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14335754 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 14335655  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335654 ggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 14335555  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14335554 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 14335522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 11233925 - 11234357
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11233925 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 11234024  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  11234025 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 11234124  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  11234125 taagaagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgt 11234224  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234225 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 11234324  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11234325 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 11234357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 18586883 - 18587315
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18586883 gacattaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 18586982  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18586983 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacaatgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 18587082  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18587083 taagaagaaggatgctacagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 18587182  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587183 ggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacggacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 18587282  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18587283 agagggcgccgactactagtagggtctttgctt 18587315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 44788063 - 44788495
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44788063 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 44788162  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44788163 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctactgataaaggaaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 44788262  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44788263 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 44788362  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44788363 ggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtacttagccta 44788462  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44788463 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 44788495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10874019 - 10873652
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10874019 gacatcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 10873920  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10873919 tagtgaatgagaggaagggcaggggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 10873820  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10873819 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaagaccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 10873720  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagag 385  Q
    || ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10873719 ggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattg-aatggagag 10873652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 11549814 - 11550238
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  11549814 gacattaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataaga 11549913  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  11549914 ttgtgaacgagaggaaggggaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 11550013  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11550014 taagaagaaggatgctaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtctggtgt 11550113  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  11550114 ggcaagaagggtcatattgtagttgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggacatattagttcatagtgtactcagccta 11550213  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11550214 agagggcgccgactactggtagggt 11550238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12691059 - 12690635
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  12691059 gacattaagagggcgattggataccaacagattagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataaga 12690960  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  12690959 ttgtgaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 12690860  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12690859 taagaagaaggatgctaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgtgaaagtccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgt 12690760  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12690759 ggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtattttaactgcaatgaagagggacatattagttcacagtgtactcagccta 12690660  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12690659 agagggcgccgactactggtagggt 12690635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14958066 - 14957652
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  14958066 gacattaagagggtgattggataccaacagattagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataaga 14957967  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  14957966 ttgtgaacgagaggaagggcaagggacagtagggtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 14957867  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14957866 taagaagaaggatactaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgt 14957767  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14957766 ggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggacatattagttcacagtgtactcagccta 14957667  T
Q  417 agagggcgccgacta 431  Q
    |||||||||||||||    
T  14957666 agagggcgccgacta 14957652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11984553 - 11984135
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||| |  |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  11984553 gacattaagagggcgatcggataccaacaaatccgagtttttcctgatttggttaacagttgtaggatctacgaagaagataccaaggctcattacaagg 11984454  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| ||| |||||    
T  11984453 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggcc 11984354  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  11984353 taagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtactgaagagatcaagaaatgtgtccgg 11984254  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  11984253 tgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaatttcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 11984154  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  11984153 ctaagagggcgcctactac 11984135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9591919 - 9591507
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    ||||||||||| || || |||||  |  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| || |    
T  9591919 aagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttcctgatttggtgaatagctgcagaatctatgaggaggataccagagctcattacaaggttgtta 9591820  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || || ||||  ||  | |||| |||||||||||||||    
T  9591819 atgagaggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaa 9591720  T
Q  223 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggc 319  Q
    ||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9591719 gaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggc 9591620  T
Q  320 aagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||| ||||    
T  9591619 aagaagggtcatattatagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaaga 9591520  T
Q  420 gggcgccgactac 432  Q
    ||| ||| |||||    
T  9591519 gggagcctactac 9591507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 399
Target Start/End: Original strand, 17703164 - 17703549
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||  |  |||||||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  17703164 gacatcaagagggcgatcggataccaacagatccgagttttcgcctatttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaagg 17703263  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  17703264 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttatagtgcccctactgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 17703363  T
Q  217 taagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
     |||||||||||||||   || || ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||     
T  17703364 aaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccga 17703463  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttc 399  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||    
T  17703464 tgtggcaaaaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttc 17703549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 399
Target Start/End: Original strand, 16726150 - 16726535
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||  |  |||||||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  16726150 gacatcaagagggcgatcggataccaacagatccgagttttcgcctatttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaagg 16726249  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| | ||   |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  16726250 ttgtgaatgagcgaaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttaaagtgcccctactgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 16726349  T
Q  217 taagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
     |||||||||||||||   || || ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||     
T  16726350 aaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccga 16726449  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttc 399  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||    
T  16726450 tgtggcaaaaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttc 16726535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 26091533 - 26091747
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26091533 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 26091632  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  26091633 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 26091732  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  26091733 gaaaggccacaagag 26091747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Original strand, 16947215 - 16947322
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16947215 tagctgcagaatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcc 16947314  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  16947315 cctgctga 16947322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13004971 - 13004865
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||| |||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13004971 tagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgatgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagcgcc 13004872  T
Q  173 cccgctg 179  Q
    || ||||    
T  13004871 cctgctg 13004865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12460187 - 12459925
Alignment:
Q  20 atcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtag 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |  ||||||||||  | || ||||| |  ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||      
T  12460187 atcaagagggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtga 12460088  T
Q  120 tgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaa 219  Q
    ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| || || || ||||| ||    |||| |||| |||| ||    
T  12460087 tgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaa 12459988  T
Q  220 gaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    || ||  ||||   |||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12459987 gaggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaa 12459925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 15145692 - 15145890
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |    
T  15145692 tgcaggatctttgaggaagataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaggccaagggtcaacagagtcgtcctaagccttatagtccccctg 15145791  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccaca 272  Q
    ||||||| || |||||||   |  | |||| |||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||| |  || | ||||||||||||||||||||    
T  15145792 ctgataagggcaaacagagagtagttgatgataggcgccctaagaagaaggatgctcctgctgagattgtcttctttacttgtggtgagaaaggccaca 15145890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 26115325 - 26115539
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || |||||| | |||| |||||||||||| |    
T  26115325 ttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaagcctt 26115424  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||||   || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  26115425 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcccaagaggagagatgctccggctgagattgtttgttacaagtgtggtga 26115524  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  26115525 gaaaggccacaagag 26115539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14145223 - 14145060
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || || || || |||||  ||||| |||| || |||||||| | | | |||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||    
T  14145223 gacatcaagagagccataggataccaacagattagaattttccctgatttggtgagtcgttgcaggatctatgaggagggcaccaaagctcattataagg 14145124  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14145123 tgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 14145060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Original strand, 14260989 - 14261096
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  | | |||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  14260989 tagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatcagtgagcgcaaaggtaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcc 14261088  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  14261089 cctgctga 14261096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19150517 - 19150410
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  19150517 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcc 19150418  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  19150417 cctgctga 19150410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20749916 - 20749809
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  20749916 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcc 20749817  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  20749816 cctgctga 20749809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 40924552 - 40924766
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |    
T  40924552 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 40924651  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  40924652 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 40924751  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  40924752 gaaaggccacaagag 40924766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 171
Target Start/End: Original strand, 12712406 - 12712504
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| | ||||||  ||| |||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12712406 tagctgcagaatctatgaggaagattcaaaggctcattccaaggtgatgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgc 12712504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 12798248 - 12798354
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  12798248 agctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctctttacaaggtgatgagtgagcgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctc 12798347  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  12798348 ctgctga 12798354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15628021 - 15627910
Alignment:
Q  81 ggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||| | || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  15628021 ggatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggttatgaatgagaggaaaagtaagagtcaacaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctga 15627922  T
Q  181 taaagggaaaca 192  Q
    ||| || |||||    
T  15627921 taagggtaaaca 15627910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 11385173 - 11385279
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |||||| |  ||| |||| |||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11385173 agctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaagatgatgagtgagcggaggggtaagggacaacagagtcatcctaagccgtacagtgccc 11385272  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  11385273 ctgctga 11385279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13024849 - 13024641
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||  ||| ||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| |    
T  13024849 agctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgagaggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaaaccttacagtgctc 13024750  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggcca 270  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| || ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  13024749 ctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggcca 13024650  T
Q  271 caagagcaa 279  Q
    ||| |||||    
T  13024649 caaaagcaa 13024641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12459848 - 12459785
Alignment:
Q  356 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12459848 gacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaaga 12459785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 13965354 - 13965536
Alignment:
Q  16 ggacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaag 115  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | || |||||||| || ||  |||| |||||||| || || || ||||| ||| ||    
T  13965354 ggacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgttggatttatgaagaagacaccaaagctcattaccag 13965453  T
Q  116 gtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagat 198  Q
     || ||| ||||||||  || |||||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  13965454 ataatgagtgagaggaggggtaagggacaacataatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagat 13965536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 14283121 - 14283227
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||  ||| |||||| |     ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  14283121 tgcaggatctatgaggaggacactaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaaggaataagggacagcagagtcgcccgaagccgtatagtgcccctg 14283220  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  14283221 ctgataa 14283227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 49155812 - 49155694
Alignment:
Q  68 gttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtaca 167  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  49155812 gttaatagatgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttaca 49155713  T
Q  168 gtgcccccgctgataaagg 186  Q
    |||| || ||||| |||||    
T  49155712 gtgctcctgctgacaaagg 49155694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 371 - 419
Target Start/End: Original strand, 13965712 - 13965760
Alignment:
Q  371 aattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||| ||||    
T  13965712 aattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaaga 13965760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 180
Target Start/End: Original strand, 15099377 - 15099453
Alignment:
Q  104 gctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||    
T  15099377 gctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgacgccgtatagtgctcctgctga 15099453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10008788 - 10008356
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10008788 gacatcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttagttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 10008689  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10008688 tagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 10008589  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10008588 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 10008489  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008488 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 10008389  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10008388 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 10008356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12889897 - 12889465
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12889897 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 12889798  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12889797 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 12889698  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12889697 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 12889598  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889597 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 12889498  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12889497 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 12889465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 15345187 - 15345619
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15345187 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 15345286  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15345287 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcctcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 15345386  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15345387 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 15345486  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345487 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 15345586  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15345587 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 15345619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 5421872 - 5422296
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5421872 gacatcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 5421971  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5421972 tagtgaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 5422071  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5422072 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 5422171  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5422172 ggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcatagtgtactcagccta 5422271  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5422272 agagggcgccgactactggtagggt 5422296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10909398 - 10908966
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10909398 gacatcaagagggcgattgggtaccaacagcttagagtttttcaggacttagttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 10909299  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10909298 tagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 10909199  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10909198 taagaagaaggatgttgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 10909099  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10909098 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcccagtgtactcagccta 10908999  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10908998 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 10908966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 20058996 - 20059428
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20058996 gacattaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 20059095  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20059096 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 20059195  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20059196 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 20059295  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059296 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 20059395  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20059396 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 20059428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 26790355 - 26790787
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26790355 gacattaagagggcgattgggtaccaacaactgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 26790454  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26790455 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccaatgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 26790554  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26790555 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctaccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 26790654  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790655 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacgttgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 26790754  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26790755 agacggcgccgactactggtagggtctttgctt 26790787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 43165863 - 43165431
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43165863 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 43165764  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43165763 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 43165664  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43165663 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 43165564  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165563 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 43165464  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43165463 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 43165431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16638961 - 16638529
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16638961 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 16638862  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16638861 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 16638762  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  16638761 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgcccggtgt 16638662  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638661 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagaaggtcacattagttcacagtgtactcagccta 16638562  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16638561 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 16638529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 48428635 - 48428203
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  48428635 gacatcaagagggcgattggataccagcagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 48428536  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  48428535 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 48428436  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48428435 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 48428336  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428335 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 48428236  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48428235 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 48428203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6603923 - 6603499
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6603923 gacatcaagagggcgatcgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgtaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 6603824  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6603823 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 6603724  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6603723 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaactgtgtccggtgt 6603624  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6603623 ggtaagaaggatcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagctctcagtgtactcagccta 6603524  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6603523 agagggcgccgactactggtagggt 6603499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 16753643 - 16754067
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16753643 gacatcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttctagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 16753742  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  16753743 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcatagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacaaaagatggtcgatgttaggcggcc 16753842  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16753843 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtctggtgt 16753942  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16753943 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttctcaatgtactcagccta 16754042  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16754043 agagggcgccgactactggtagggt 16754067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 15712998 - 15713430
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15712998 gacatcaagagggcgattgggtaccaacaactgagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 15713097  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||||    
T  15713098 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaagcagaggatggtcgatgataggcggcc 15713197  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  15713198 taagaagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgt 15713297  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15713298 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtacttagccta 15713397  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15713398 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 15713430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 53381961 - 53382392
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  53381961 gacattaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgagaaggataccaaggctcactacaagg 53382060  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53382061 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccccc-ctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 53382159  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53382160 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaacgtctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 53382259  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53382260 ggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacactgtgtgctttaattgcaatgcagagggtcacattagttctcagtgtactcagccta 53382359  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53382360 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 53382392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13255878 - 13255446
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13255878 gacatcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctacgaagaggacacgaaggctcactacaagg 13255779  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13255778 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 13255679  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13255678 taagaggaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcttgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 13255579  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13255578 ggtaagaagggtcatgtggtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagtgtactcagccta 13255479  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13255478 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 13255446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3689131 - 3688699
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3689131 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 3689032  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  3689031 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgacgttaggcggcc 3688932  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3688931 taagaagaaggatgctgctgagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 3688832  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3688831 ggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgtaatcgtgcagacattgtgtgctttaactgcaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagccta 3688732  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3688731 agagggtgccgactactggtagggtctttgctt 3688699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 15399460 - 15399891
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||     
T  15399460 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcagaatttggtcaatagctgcaggatctaggaagaggataccaaggttcactacaaga 15399559  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  15399560 tagtgaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcc 15399659  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15399660 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 15399759  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15399760 ggcaagaaaggtcatattgtagccgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcaca-tagttcacagtgtactcagccta 15399858  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15399859 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 15399891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 15586334 - 15586766
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15586334 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacaaagaggatacgaaggctcactacaagg 15586433  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15586434 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacaacaaagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 15586533  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15586534 taagaggaaggatgctgcggagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 15586633  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586634 ggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 15586733  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15586734 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 15586766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24186378 - 24185954
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  24186378 gacattaagagggcgattggataccaacagattagagtttttccagaattggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataaga 24186279  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  24186278 ttgtgaacgagtggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccacgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 24186179  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24186178 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgt 24186079  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24186078 ggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggacatattagttcacagtgtactcagccta 24185979  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24185978 agagggcgccgactactggtagggt 24185954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Original strand, 5110351 - 5110684
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5110351 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 5110450  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  5110451 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacaatagagtcgtcctaagccgtacagtgtccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcagcc 5110550  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5110551 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaattaagaagtgtgtccggtgt 5110650  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatc 350  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5110651 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatc 5110684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6597243 - 6596969
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6597243 gacatcaagagggcgatcgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 6597144  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6597143 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 6597044  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctga 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6597043 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctga 6596969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15359240 - 15358992
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15359240 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaaga 15359141  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  15359140 tagtgaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgccctaagccgtacagtgcccccgctgataaagtgaaacagaagatggtcgatgataggcggcc 15359041  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaa 265  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15359040 taagaagaaggatgctattgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaa 15358992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 51 - 432
Target Start/End: Original strand, 16803920 - 16804304
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||||||    
T  16803920 gagtttttcctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagag 16804019  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgt 247  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||   |||    
T  16804020 tcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgt 16804119  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgca 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16804120 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgattgca 16804219  T
Q  348 atcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
    | || |  || ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||| |||| || || |  |||||||||| | |||| |||||    
T  16804220 agcgaaatgatattgtgtgcttcaattttaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagaagtcgcctactac 16804304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16695355 - 16694937
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||  |  ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  16695355 gacatcaagagggcgatcggataccaacagatccgagttttccctgatttagtgaatagctgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaagg 16695256  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || |||||| ||||   |||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||  | |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  16695255 ttgtaaatgagtggaagaccaagggccatcagagtcgcccgaagccttatagtgcccctgctgataagtgcaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 16695156  T
Q  217 taagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || || || | |||||||||||| |||||||||    
T  16695155 taagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggcgagaaaggccgcaagagtaatgtttgtccggtggagatcaagaaatgtgtccgg 16695056  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |  |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  16695055 tgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgacattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 16694956  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  16694955 cgaagagggcgcctactac 16694937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11861510 - 11861121
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||  | ||||| || |||||    
T  11861510 gagtttttcctgagttggtgaatagctgtagaatctatgaggaagacaccaaggctcattacaaggttgtgaatgagtggaagagtaagggccaccagag 11861411  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgt 247  Q
    ||  |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| | |    
T  11861410 tcaccctaagccctatagtgcccctgctgataaaggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctat 11861311  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgca 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| | ||||| ||| || ||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||    
T  11861310 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggtaagaagggtcatactttagctgattgca 11861211  T
Q  348 atcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggta 437  Q
    | | ||  || ||||||||||| |||| ||| | ||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11861210 agcatagtgatattgtgtgcttcaattccaaggaagagggtcatattggttctcagtgcaagcagcctaagagggcgccgactactggta 11861121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Original strand, 23414729 - 23415147
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| ||  ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||    
T  23414729 gacatcaagagggcaatcggataccaacagctccgagttttccctgatttagtgaatacctgcagaatctacgaggaggatactaaggctcatgacaagg 23414828  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  23414829 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccaatagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 23414928  T
Q  217 taagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  23414929 taagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaactatggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctaaagagatcaagaaatgtgtccgg 23415028  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| || |  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  23415029 tgtgacaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 23415128  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  23415129 ctaagagggtgcctactac 23415147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 296 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15358992 - 15358839
Alignment:
Q  296 atcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacatta 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15358992 atcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagccgaatgcaagcgtacagacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacatta 15358893  T
Q  396 gttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15358892 gttcatagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctt 15358839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12502090 - 12501808
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| ||| ||||    
T  12502090 gagttttttcagatttggtgaatagctgtagaatctatgaggaggataccagggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagtagag 12501991  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgt 247  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||  |||| |  || |||||||||||||||||||   |||| ||||||   |||    
T  12501990 tcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggaaaacagaggatggtcgaggaaagacggcctaagaagaaggatgttcctgctgagattacctgt 12501891  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtca 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  12501890 ttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtca 12501808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15066214 - 15065835
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  15066214 ttggtgaacagctgtagaatttatgaggaagataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccct 15066115  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    | ||| |||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| ||| ||||| | |||||||||||||   || | |||||| ||||| |||||||||||    
T  15066114 atagttcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgcgattgtctgttttaattgtggtga 15066015  T
Q  262 gaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacatt 361  Q
    |||||||||||||||||| || || || || ||| | || |  ||| |||||||||| ||||| |||||||   ||  ||||||||| | ||  || |||    
T  15066014 gaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagaggtaaaaagatgtttccggtgtggtaagaagggtcatgcattaactgattgcaagcataatgatatt 15065915  T
Q  362 gtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15065914 gtgttcttcaattgcaaagaagagggtcatattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactacaggtagggt 15065835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 23078962 - 23079380
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    |||||||| ||| |||| |||||  || |||||||  | || ||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  23078962 aagagggcaattaggtaccaacagattcgagttttctccgagttggtgaacagttgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaagattgtga 23079061  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
    ||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| ||||| | |||    
T  23079062 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggaaaacagaggatggtcgaggatagacggccaaggaa 23079161  T
Q  223 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggc 319  Q
    ||||||||   |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || | |||| | ||||  ||| | || | |||     
T  23079162 gaaggatgctcctgctgtgattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccgggggaggtaaagagatgttttcgctatggt 23079261  T
Q  320 aagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    ||||| | |||||   ||| ||| || || | ||  ||||||||||| |||| ||  || | | | ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  23079262 aagaaggttcatgcactagctgagtgtaagcataaggacattgtgtgttttagttctaaagaacaaggtcatattggttcacagtgtacaaagcctaaga 23079361  T
Q  420 gggcgccgactactggtag 438  Q
     ||||||||||||||||||    
T  23079362 aggcgccgactactggtag 23079380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17497822 - 17497620
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||  |    
T  17497822 tgcaggatctaggaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtacccttg 17497723  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||||||  |||| | |||   |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17497722 ctgataagggcaaacagaagatggtcgaagatagatagcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 17497623  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  17497622 gag 17497620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10409169 - 10408907
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| ||  | ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||     
T  10409169 gacatcaaaagagctattggatatcagcagatcagagttttttctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 10409070  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    || ||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||    |||| |||| ||||    
T  10409069 taatgagtgagaggaggggtaagggacaccagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaagatgggtgatgataggaggcc 10408970  T
Q  217 taagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
     |||| ||  ||||||   || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10408969 caagaggagagatgctccagctgagattgtttgttacaaatgtggtgagaaaggccacaagag 10408907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 14873584 - 14873789
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||| | ||||    ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||  |    
T  14873584 tgcaggatatatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgtgcggaagactaagggccaacagagtcgccctaagccctataatgcccttg 14873683  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| ||||| | |||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14873684 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaggatagacggccgaggaagaaggatgctcatgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccataa 14873783  T
Q  274 gagcaa 279  Q
    ||||||    
T  14873784 gagcaa 14873789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28757472 - 28757258
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |    
T  28757472 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 28757373  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  28757372 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 28757273  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  28757272 gaaaggccacaagag 28757258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Original strand, 12843102 - 12843304
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| || |    
T  12843102 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagctttatagtgctcctg 12843201  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  | ||||  |||||||||| |||||| ||||   |||  |||||||| || |  | |||||||||||||||||||||    
T  12843202 ctgataagggcaaacagagaatgattgatgagaggcggcctaggaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 12843301  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  12843302 gag 12843304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 331
Target Start/End: Original strand, 14578420 - 14578677
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| || |    
T  14578420 tgcaggatttatgaggatgataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaggccaagggtcagcagagccgtcctaagccttacaatgctcctg 14578519  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    | ||||| || |||||||  ||  | |||| |||||| ||||  ||||| ||||   |||  ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  14578520 ccgataagggtaaacagagaatggttgatgataggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtgtgctatgcttgtggtgagaaaggccacaa 14578619  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcat 331  Q
    ||| || |  || |||| |||  | |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  14578620 gagtaatgcttgtcctggggatgtgaagaggtgtttccgttgtggtaagaaaggtcat 14578677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 16326695 - 16326804
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |    
T  16326695 tgcaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagcctgacagtgctcctg 16326794  T
Q  177 ctgataaagg 186  Q
    |||| |||||    
T  16326795 ctgacaaagg 16326804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 194
Target Start/End: Original strand, 11958166 - 11958286
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    |||||| |||| ||||| || || ||||| | ||| ||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |    
T  11958166 agctgcgggatttatgaggaagacacaaaagttcattacaaggtgatgagtgagaggagaggtaagggacagcagaatcgtcctaaaccttacagtgctc 11958265  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  11958266 ctgctgacaaagggaaacaga 11958286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Original strand, 16825264 - 16825364
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  16825264 agctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggcaagggacagctgagtcgtccgaagccgtatagtgccc 16825363  T
Q  174 c 174  Q
    |    
T  16825364 c 16825364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 192
Target Start/End: Original strand, 12857469 - 12857599
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||| |||| | | ||||||||||||| |||||||||| || |    
T  12857469 gatttggtgagtagctgtagaatctatgaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagtagagtcgtccaaaac 12857568  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctgataaagggaaaca 192  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  12857569 cgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaaca 12857599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 16831516 - 16831622
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  16831516 tgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcatcctaagccgtatagtgcccctg 16831615  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  16831616 ctgataa 16831622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17189519 - 17189421
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||  | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17189519 tagctgtagaatctatgaagaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgcagaggcaagggccagcagagtcgtccgaagccgtacagtgc 17189421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 47127097 - 47126883
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |    
T  47127097 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 47126998  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||| |||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  47126997 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 47126898  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  47126897 gaaaggccacaagag 47126883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19727890 - 19727776
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |    
T  19727890 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagagaaaaggcaa-ggtcagcaaagtcttccaaagccttacagtgctcctg 19727792  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||| || |||||    
T  19727791 ctgataagggcaaaca 19727776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 194
Target Start/End: Original strand, 14290526 - 14290637
Alignment:
Q  83 atctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgata 182  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |    
T  14290526 atctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgaca 14290625  T
Q  183 aagggaaacaga 194  Q
    |||| |||||||    
T  14290626 aaggtaaacaga 14290637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 16384300 - 16384463
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || || || || |||||  ||||| ||||  | |||||||| | | |||| ||||||||||| ||||| |  || ||||| || ||||    
T  16384300 gacatcaagagagccataggataccaacagattagaattttctctgatttggtaagttgctgtaggatctatgaggaggacagcaaagctcattataagg 16384399  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |  ||| |||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16384400 tgatgagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtcctaagccatacagtgcccctgctga 16384463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Original strand, 12357500 - 12357618
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  12357500 gatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacatcagagtcgtcctaaac 12357599  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctga 180  Q
    | || ||||| || |||||    
T  12357600 catatagtgctcctgctga 12357618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 12508553 - 12508659
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||   ||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  12508553 tgcagaatctatgagaaggatacgaaagctcattacaaggctatgagtgagaggaaaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctccgg 12508652  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  12508653 ctgataa 12508659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24190459 - 24190342
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | |||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||  ||| |||  | | ||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  24190459 gatttggtaagtagctgtagaatctatgaagaggacacgaaagctcattacaaggtgatgactgaccgcagaggcaaggc-cagcagagtcgtccgaagc 24190361  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |||||||||| || |||||    
T  24190360 cgtacagtgctcctgctga 24190342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 5108481 - 5108542
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctg 78  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5108481 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctg 5108542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 196
Target Start/End: Original strand, 31692231 - 31692292
Alignment:
Q  135 gcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaag 196  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  31692231 gcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaag 31692292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35983316 - 35983205
Alignment:
Q  83 atctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgata 182  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||  ||| |||| | | ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| |    
T  35983316 atctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtgagtgcagaggtaagggacagcagagttgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgaca 35983217  T
Q  183 aagggaaacaga 194  Q
    |||| |||||||    
T  35983216 aaggtaaacaga 35983205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Original strand, 2036840 - 2036934
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcacta 111  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  2036840 gacattaagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcacta 2036934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Original strand, 2040581 - 2040675
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcacta 111  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  2040581 gacattaagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcacta 2040675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14039947 - 14039853
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcacta 111  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  14039947 gacattaagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcacta 14039853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 194
Target Start/End: Original strand, 18131331 - 18131452
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||  ||| |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||| || || |||||     
T  18131331 tagctgtaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaaagtgatgagtgaacggagaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgct 18131430  T
Q  173 cccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  18131431 cctgctgacaaaggaaaacaga 18131452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31941986 - 31941925
Alignment:
Q  135 gcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaag 196  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  31941986 gcaaaggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaag 31941925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 169
Target Start/End: Original strand, 13028345 - 13028437
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagt 169  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| | |||| |||||||||||| ||   | || || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13028345 tgcaggatctaggaggaggataccaaagctcatttcaagatagtgaatgagaagaggagtaaaggccagcagagtcgtccaaagccttacagt 13028437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 371 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28757163 - 28757115
Alignment:
Q  371 aattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||    
T  28757163 aattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaaga 28757115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24713234 - 24712802
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24713234 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 24713135  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24713134 tagtgaatgaaagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 24713035  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24713034 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 24712935  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712934 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 24712835  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24712834 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 24712802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9338782 - 9338350
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9338782 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 9338683  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9338682 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 9338583  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9338582 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 9338483  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338482 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 9338383  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9338382 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 9338350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9487416 - 9486984
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9487416 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 9487317  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9487316 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 9487217  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9487216 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 9487117  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487116 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 9487017  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9487016 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 9486984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24265570 - 24265138
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24265570 gacattaagagggcgattgggtatcaacagctgagagttttttcagacttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 24265471  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  24265470 tagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaatagaagatggtcgatgttaggcggcc 24265371  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24265370 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 24265271  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265270 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacgttgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 24265171  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24265170 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 24265138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 22322585 - 22323017
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22322585 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 22322684  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22322685 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 22322784  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22322785 taagaagaaggatgctgcggagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 22322884  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322885 ggcaagaaaggtcatgttatagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 22322984  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22322985 agagggcgccgactactggtaggatctttgctt 22323017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16984440 - 16984008
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16984440 gacatcaagagggcgattggataccagcagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 16984341  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16984340 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 16984241  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16984240 taagaagaagaatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 16984141  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984140 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 16984041  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16984040 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 16984008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 44382813 - 44383245
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44382813 gacatcaagagggcgattgggtatcaacggctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 44382912  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44382913 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaggggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 44383012  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44383013 taagaagaaggatgttgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 44383112  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383113 ggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacgttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 44383212  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  44383213 agagggcgctgactacgggtagggtctttgctt 44383245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10872050 - 10871618
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10872050 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggataccaaggctcactacaagg 10871951  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10871950 tagtgaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 10871851  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10871850 taagaagaaggatgctgcagagcttgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 10871751  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10871750 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgcacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagtgtacccagccta 10871651  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10871650 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 10871618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27374469 - 27374037
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27374469 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactataagg 27374370  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27374369 tagtgaatgaaaggaagggcaagggactgcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 27374270  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27374269 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 27374170  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374169 ggtaagaaaggtcatgtggtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 27374070  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27374069 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 27374037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17002200 - 17001768
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17002200 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 17002101  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17002100 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaaggaaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 17002001  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17002000 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 17001901  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17001900 ggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagtgtactcagccta 17001801  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17001800 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 17001768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 24873993 - 24874425
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24873993 gacatcaaaagggcgattgggtatcaacagcttagagtttttccagatttggtaaatagttgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaga 24874092  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  24874093 tagtgaacgagaggaagggcaagggacggcagagtcgttctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 24874192  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||    
T  24874193 taagaagaaggatgttactgagattgtgtgtttcaactgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccatgaagaaattaagaaatgtgtccggtgt 24874292  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24874293 ggcaagaaaggtcatattgtagctgattgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcaaattagttcacagtgtactcagccta 24874392  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24874393 agagggcgctgactactggtagggtctttgctt 24874425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 185 - 449
Target Start/End: Original strand, 21139392 - 21139656
Alignment:
Q  185 gggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtct 284  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  21139392 gggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtggaaaaggccacaaaagcaatgtct 21139491  T
Q  285 gccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggaga 384  Q
    | | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21139492 gtcgtgaagagatcaagaaccgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtgaagacattgtgtgttttaactgcaatggaga 21139591  T
Q  385 gggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21139592 gggtcacattagttcacagtgtactcagcctaatagggcgccgactactggtagggtctttgctt 21139656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Original strand, 23116299 - 23116718
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  23116299 gacatcaagagggcgatcggataccaacaactccgagttttccctgatttagtgaacagctgtaggatctacgaagaggataccagagctcattacaagg 23116398  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || |||||||||||    |||||  |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||  ||  |||||| |||||||||    
T  23116399 ttgttaatgagaggaagactaagggcaagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcc 23116498  T
Q  217 taagaagaaggatgctgc---agagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23116499 taagaagaaggatgctccttcagagattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccgg 23116598  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||| ||||||  |||||| | |||| ||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116599 tgtagcaagaggggtcatatcgtagctgattgcaagcataaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 23116698  T
Q  414 ctaagagggcgccgactact 433  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23116699 ctaagagggcgccgactact 23116718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 441
Target Start/End: Original strand, 24704758 - 24705149
Alignment:
Q  53 gtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||  |||    ||||| ||||||||||    
T  24704758 gtttttccagatttggtgaatagctgtagaatctatgaggaggataccagggctcattacaaggttgtgaatgagcagaagactaagggccagcagagtc 24704857  T
Q  153 gtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgttt 249  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| | |||  |||| |  || || ||||||||||||||||   |||| |||||| | |||||    
T  24704858 gccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacataggatggtcgaggaaagacgacctaagaagaaggatgttcctgctgagattatctgttt 24704957  T
Q  250 caattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaat 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||   | ||| |||||||||     
T  24704958 caattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtaaagaaatgtttccagtgtggcaagaagggtcacactttagctgattgcaag 24705057  T
Q  350 cgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24705058 cgtaatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacataggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactagtagggt 24705149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 431
Target Start/End: Original strand, 22462721 - 22463138
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||| |  |||||||  | ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  22462721 gacatcaagagggcgatcagataccaacaaatccgagttttcgctgatttagtgaatagctgcagaatctacgaggaagatacaaaggctcattacaagg 22462820  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || |||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  || |||| ||  ||||||  ||  |||||| |||| ||||    
T  22462821 ttgtaaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgccccttctaataagggcgaacagagaatggtcgatgataggtggcc 22462920  T
Q  217 taagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  22462921 taagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccag 22463020  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  22463021 tgtggcaagaagggtcatatcgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 22463120  T
Q  414 ctaagagggcgccgacta 431  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  22463121 cgaagagggcgcctacta 22463138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 330
Target Start/End: Original strand, 24656898 - 24657214
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |  ||||| |||||||    
T  24656898 gacattaagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttccagatttgatgaatagctgcagaatctatgaggaggacaccagagctcattacaagg 24656997  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || |||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| || ||||||| |||  |||| |  || |||||    
T  24656998 ttgttaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctactgataagggcaaacagaggatggtcgaggagagacggcc 24657097  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||| |||||||   |||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24657098 taagaaaaaggatgttcctgctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgtcctgaggaggtgaagaagtgtttccgg 24657197  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtca 330  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24657198 tgtggcaagaagggtca 24657214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24678630 - 24678266
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  24678630 tgcagaatttatgacgaggataccaaggctcattacaagatcgtgaatgagcggaagactaagggccaatagagtcgccctaagccctatagcgcccctg 24678531  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  24678530 ctgataagggcaaacagaggatggtcgatgatagacggcctaagaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaa 24678431  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    |||||| |  || || |  ||| | ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  24678430 gagcaatgcttgtccgggagaggttaagagatgtttccgttgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaagcgtaatgacattgtgtgcttcaat 24678331  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||| || |||| |||||||  |||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24678330 tgcattgaagagagtcacataggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 24678266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 438
Target Start/End: Original strand, 23028771 - 23029125
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  23028771 tatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaatactaaaggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagg 23028870  T
Q  186 ggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgt 282  Q
    | ||||||| |||  |||| | ||| ||||| | |||||||||||||   || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  23028871 gcaaacagaggatggtcgaggatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgtttta-ttgtggtgagaaaggccacaagagcaatgc 23028969  T
Q  283 ctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatgga 382  Q
     || ||||  ||| | ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||||| |    
T  23028970 ttgtcctggagaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgattgcaaacataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaa 23029069  T
Q  383 gagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23029070 gagggtcacattggttctcagtgcaagcaacctaagaaggcgccgactactggtag 23029125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 201 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23205333 - 23205099
Alignment:
Q  201 tcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagat 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  23205333 tcgatgataggcggcctaagaagaagaatgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagat 23205234  T
Q  298 caagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagt 397  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  23205233 caagaaatgtgtccagtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagagaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggt 23205134  T
Q  398 tcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| |||||    
T  23205133 tcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactac 23205099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 201 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23676937 - 23676703
Alignment:
Q  201 tcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagat 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  23676937 tcgatgataggcggcctaagaagaagaatgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagat 23676838  T
Q  298 caagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagt 397  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  23676837 caagaaatgtgtccagtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagagaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggt 23676738  T
Q  398 tcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| |||||    
T  23676737 tcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactac 23676703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 437
Target Start/End: Original strand, 22742266 - 22742629
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  22742266 tgcaggatttacgaagaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctg 22742365  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  | || | ||| ||||| | ||||||||||| ||| |   ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  22742366 ctgataagggcaaacagagaatggttgaggatagacggccgaggaagaaggatgttgctggtgagattgtctgctttaattgtggtgagaaatgccacaa 22742465  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    |||||| |  || || |  ||| | || |  ||| |||| || || ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | ||  |||||||||||||| |||    
T  22742466 gagcaatgcttgtccgggagaggtaaatagatgtttccgatgcggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacataatgacattgtgtgcttcaat 22742565  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggta 437  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22742566 tgcaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaagcagcctaagaaggcgccgactactggta 22742629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16931698 - 16931598
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931698 agctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 16931599  T
Q  174 c 174  Q
    |    
T  16931598 c 16931598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 441
Target Start/End: Original strand, 11351168 - 11351378
Alignment:
Q  231 ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtca 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||| |  |||| ||| || ||||||||||||| |||||    
T  11351168 ctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccaaaggaggtagagaaatgtttctggtgtggcaagaagggtca 11351267  T
Q  331 tgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgact 430  Q
    |    ||| ||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  11351268 tacattagctgattgcaagcatagtgatattgtgtgcttcaattgcaaggaagagggtcacattggttctcagtccaagcagcctaagagggtgccgact 11351367  T
Q  431 actggtagggt 441  Q
    |||||||||||    
T  11351368 actggtagggt 11351378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 23105027 - 23105392
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||  |||    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  23105027 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcagaagactaagggccagcagagccgccctaagccttacagtgcacctg 23105126  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  |||| | ||| ||||| | |||||||||||||   || |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  23105127 ctgataagggcaaacagagaatggtcgaagatagacggccgaggaagaaggatgctcctgctgagattatttgtttctcttgtggtgagaagggccacaa 23105226  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || ||| | ||  ||||||  ||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || ||||||||||| |||    
T  23105227 gagtaatgcttgtccttaagacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaat 23105326  T
Q  374 tgcaatggagag-ggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23105327 tgcaatgaagagaggtcacattggttcacagtgtaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 23105392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 426
Target Start/End: Original strand, 23039877 - 23040229
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  23039877 tgcaggatctacgaggaggatattaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtctccctaagccttacagtgcccctg 23039976  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| |||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||    
T  23039977 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaaggtagacggcctaagaagaaggatgctcctacagagattgtctgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 23040076  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||| ||| | |||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || || || || |||||     
T  23040077 gagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgttttaac 23040176  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgcc 426  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||    
T  23040177 tgcaatgaagagcgtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgcc 23040229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 279
Target Start/End: Original strand, 21320292 - 21320508
Alignment:
Q  66 tggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgta 165  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    | ||| ||||||||| | |||||||| ||    
T  21320292 tggtgaatagctgcagaatttatgaggatgataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaggggccagcagagttgccctaagcctta 21320391  T
Q  166 cagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgag 262  Q
     ||  |||| |||||||| || ||||| |  ||  |||| | |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  21320392 tagcacccctgctgataagggcaaacaaagaatggtcgaggataggcggcctaagaagaaggatgtccctgctgagattgtctgttttaattgtggcgag 21320491  T
Q  263 aaaggccacaagagcaa 279  Q
    |||||||||||||||||    
T  21320492 aaaggccacaagagcaa 21320508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Original strand, 22733074 - 22733276
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |    
T  22733074 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagctttacagtgcccctg 22733173  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||| |||  ||  |||| | ||| | |||||||||||||||||   || |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22733174 ctgataagggcaaagagagaatggtcgaagatagacagcctaagaagaaggatgctcctccagaaattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 22733273  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  22733274 gag 22733276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23029961 - 23029815
Alignment:
Q  20 atcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtag 119  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| |  || |||||||  | || ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |    
T  23029961 atcaaaagggcgattggttaccaaaagattcgagttttctccgagttggtgagtagttgcaggatttatgaggaggacactaaggctcattacaagattg 23029862  T
Q  120 tgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtac 166  Q
    |||||||| ||||   || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23029861 tgaatgagcggaagaccaggggacaacagagtcgtcctaagccgtac 23029815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23274739 - 23274633
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||  | |  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |    
T  23274739 agctgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtgatgagtgaacgtaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagcagtatagtgctc 23274640  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  23274639 ctgctga 23274633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20848789 - 20848608
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||| | ||| | || |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| || |||     
T  20848789 gacatcaagagagctattggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataaga 20848690  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagat 198  Q
    |  ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  20848689 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagat 20848608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23065265 - 23065195
Alignment:
Q  365 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactgg 435  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||    
T  23065265 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaaaaagcctaagaaggcgccgactactgg 23065195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23065425 - 23065353
Alignment:
Q  208 taggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| | || ||||||||| ||||||||||||    
T  23065425 taggcggcctaagaagaaggatggtcctgcagagattgtctattttacttatggtgagaagggccacaagagc 23065353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23074715 - 23074645
Alignment:
Q  365 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactgg 435  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||    
T  23074715 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaaaaagcctaagaaggcgccgactactgg 23074645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23074875 - 23074803
Alignment:
Q  208 taggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| | || ||||||||| ||||||||||||    
T  23074875 taggcggcctaagaagaaggatggtcctgcagagattgtctattttacttatggtgagaagggccacaagagc 23074803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 173
Target Start/End: Original strand, 19716314 - 19716413
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19716314 agctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgccc 19716413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 173
Target Start/End: Original strand, 19720877 - 19720976
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19720877 agctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgccc 19720976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Original strand, 23097314 - 23097421
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    ||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||| ||| ||| || | ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  23097314 tagctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcggagaggtaaagcacatcagagtctccctaagccgtacagtgcc 23097413  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  23097414 cctgctga 23097421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 21322876 - 21322930
Alignment:
Q  384 agggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||    
T  21322876 agggtcacattggttcacaatgtacgcaacctaagaaggcgccaactactggtag 21322930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 438
Target Start/End: Original strand, 22733365 - 22733438
Alignment:
Q  365 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |   | ||||||| || |||||||||||||||    
T  22733365 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaaacctaagaaggtgccgactactggtag 22733438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 24292630 - 24293062
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24292630 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 24292729  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  24292730 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgaggttaggcggcc 24292829  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24292830 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 24292929  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24292930 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 24293029  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24293030 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 24293062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 29589287 - 29589719
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29589287 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 29589386  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29589387 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccactgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 29589486  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29589487 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 29589586  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589587 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 29589686  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29589687 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 29589719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 2871650 - 2872082
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  2871650 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaaga 2871749  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2871750 tagtgaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagctgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 2871849  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2871850 taagaagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 2871949  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2871950 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgactgcaattgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 2872049  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2872050 agagggcaccgactactggtagagtctttgctt 2872082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16575323 - 16574891
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16575323 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 16575224  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16575223 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 16575124  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16575123 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 16575024  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575023 ggtaagaaaggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 16574924  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16574923 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 16574891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 16620057 - 16620489
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16620057 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 16620156  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16620157 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 16620256  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16620257 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 16620356  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620357 ggtaagaaaggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 16620456  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16620457 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 16620489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27206055 - 27205623
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27206055 gacatcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaagacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 27205956  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  27205955 tagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgctcccgccgataaagggaaacaaaagatggtcgatgttaggcggcc 27205856  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27205855 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 27205756  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27205755 ggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgttcggacattgtgtgcttcaattgcaatggagagggtcatattagttctcagtgtactcagccta 27205656  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27205655 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 27205623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 27243173 - 27243605
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27243173 gacatcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaagacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 27243272  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  27243273 tagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgctcccgccgataaagggaaacaaaagatggtcgatgttaggcggcc 27243372  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27243373 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 27243472  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27243473 ggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgttcggacattgtgtgcttcaattgcaatggagagggtcatattagttctcagtgtactcagccta 27243572  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27243573 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 27243605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28313063 - 28312631
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28313063 gacatcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 28312964  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28312963 tagtgaatgaaaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 28312864  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28312863 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttccgaggaaatcaagaagtgtgcccggtgt 28312764  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28312763 ggcaagaaaggtcatgtagtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagccga 28312664  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28312663 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 28312631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 28260045 - 28260469
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28260045 gacatcaagagggcgcttgggtatcaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 28260144  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28260145 tagtgaacgaaaggaagggtaaggggcagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 28260244  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  28260245 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgggaaaggccacaagagcaacgcctgtcccgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgt 28260344  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28260345 ggtaagagaggtcatgttgtagctgattgcaatcgcacggacattgtgtgctttaactgcaatggagagggtcacattagttctcagtgtactcagccga 28260444  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28260445 agagggcgccgactactggtagggt 28260469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28285871 - 28285447
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28285871 gacatcaagagggcgcttgggtatcaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 28285772  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28285771 tagtgaacgaaaggaagggtaaggggcagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 28285672  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  28285671 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgggaaaggccacaagagcaacgcctgtcccgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgt 28285572  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28285571 ggtaagagaggtcatgttgtagctgattgcaatcgcacggacattgtgtgctttaactgcaatggagagggtcacattagttctcagtgtactcagccga 28285472  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28285471 agagggcgccgactactggtagggt 28285447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 28338794 - 28339218
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28338794 gacatcaagagggcgcttgggtatcaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 28338893  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28338894 tagtgaacgaaaggaagggtaaggggcagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 28338993  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  28338994 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgggaaaggccacaagagcaacgcctgtcccgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgt 28339093  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28339094 ggtaagagaggtcatgttgtagctgattgcaatcgcacggacattgtgtgctttaactgcaatggagagggtcacattagttctcagtgtactcagccga 28339193  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28339194 agagggcgccgactactggtagggt 28339218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25115981 - 25115559
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaactt-agagtttttccag-atttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagt 120  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25115981 aagagggcaattggataccaacaactggagagtttttcccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagt 25115882  T
Q  121 gaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaag 220  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||| |||||||    
T  25115881 gaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcagcctaag 25115782  T
Q  221 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggca 320  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25115781 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgttcggtgtggca 25115682  T
Q  321 agaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagag 420  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115681 agaaaggtcatattgtagctgattgcaatcgtacggatattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagag 25115582  T
Q  421 ggcgccgactactggtagggtct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25115581 ggcgccgactactggtagggtct 25115559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 22829234 - 22829666
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  22829234 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactataaga 22829333  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||  |||||| |||||||||    
T  22829334 ttgtgaacgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaatagagaatggtcgatgataggcggcc 22829433  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22829434 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtggaaaaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtctggtgt 22829533  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22829534 ggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcaccgtgtactcagccta 22829633  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22829634 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 22829666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 438
Target Start/End: Original strand, 5836076 - 5836497
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||     
T  5836076 gacattaagagggcgattgggtaccaatagattagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatttacgaagaggataccaaagctcactacaaga 5836175  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
      ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||    
T  5836176 ctgtgaatgagcggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcgacc 5836275  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  5836276 caagaagaaggatgctgctgagattgtgtgtttcaactgtggtgggaaaggccacgaaagcaatgtttgtccagaagagatcaagaaatgtgtccggtgt 5836375  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836376 ggcaagaagggtcatattgtagccgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaacgaagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 5836475  T
Q  417 agagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5836476 agagggcgccgactactggtag 5836497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 25756495 - 25756878
Alignment:
Q  52 agtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagt 151  Q
    ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||    ||||| |||||||| || |||||  ||||    ||||| |||||||||    
T  25756495 agtttttcaggatttagtgaatagctgcaggatctatgaggaggacacccgagctcattacaaggtggttaatgaccggaagactaagggccagcagagt 25756594  T
Q  152 cgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtt 248  Q
    || |||||||| || |||||||  | |||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||    
T  25756595 cgccctaagccctatagtgccctagttgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtt 25756694  T
Q  249 tcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaa 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| || |  || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  25756695 ttaattgtggtgagaaaggccacaagtgcaatgtttttccagaagagataaagaaatgtgtccggtgcggcaagaagggtcatatagtagctgattgcaa 25756794  T
Q  349 tcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
     ||||  || ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| || || |  ||||||||||||||||| |||||    
T  25756795 gcgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaggagggtcatattggttcccaatgcaaacagcctaagagggcgcctactac 25756878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22437245 - 22436881
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggc-aagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccccc 175  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||     
T  22437245 tgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcg-aaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccct 22437147  T
Q  176 gctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccaca 272  Q
    |||||||| |  ||| ||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  22437146 gctgataaggccaaatagaggatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccaca 22437047  T
Q  273 agagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaa 372  Q
    ||||||| |  || || |  ||| | ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||    
T  22437046 agagcaatgcttgtccgggtgaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacgtaatgacattgtgtgcttcaa 22436947  T
Q  373 ttgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22436946 ttgtaatgaagatggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 22436881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Original strand, 27558814 - 27559232
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |  ||||| |||||||    
T  27558814 gacattaagagggcgatcggataccaacaaatccgagtttttccagatttggagaatagctgcagaatttatgaggaggacaccagagctcattacaagg 27558913  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || |||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||  |||| |  || |||||    
T  27558914 ttgttaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagaggatggtcgaggaaagacggcc 27559013  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||| ||| |||   |||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  27559014 taagaaaaagcatgttcctgctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgtcctgaggaggtgaagaagtgtttccgg 27559113  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||     ||| ||| ||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  27559114 tgtggcaagaagggtcacacattagctgactgcaagcatgctgacatcgtgtgctttaattgcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 27559213  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  27559214 ctaagagggcgcctactac 27559232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21765214 - 21764983
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||| | |||||||| || ||||| |  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| ||||     |||| ||||||||    
T  21765214 gagtttttgctgatttggtgaacagctgtaaaatctatgaggaggacaccaaagctcattacaaggttgtgaatgagtggaacactgagggccagcagag 21765115  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgt 247  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||  |||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||    
T  21765114 tcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaattagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgt 21765015  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21765014 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 21764983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19438381 - 19438275
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19438381 agctgtaggatctatgaagaggatacgaaggcttattacaaggtagtgagtgaaaggagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctc 19438282  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  19438281 ctgctga 19438275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23081799 - 23081597
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |    
T  23081799 tgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctgctg 23081700  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaaga-ttttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccaca 272  Q
    |||||||||| || || |||| ||   ||||  |||||||||| |||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23081699 ctgataaaggaaagca-aagagttaatgatgagaggcggcctaggaagaaagatgctcctgttgagattgtttgttatacttgtggtgagaaaggccaca 23081601  T
Q  273 agag 276  Q
    ||||    
T  23081600 agag 23081597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Original strand, 10465696 - 10465958
Alignment:
Q  20 atcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtag 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |  ||||||||||  | || ||||| |  ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||      
T  10465696 atcaagagggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtga 10465795  T
Q  120 tgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaa 219  Q
    ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| || || || ||||| ||    |||| |||| |||| ||    
T  10465796 tgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaa 10465895  T
Q  220 gaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    || ||  ||||   |||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10465896 gaggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaa 10465958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 438
Target Start/End: Original strand, 18404980 - 18405213
Alignment:
Q  208 taggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaag 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  || |||| |||  | |||| |    
T  18404980 taggcggcctaacaagaaggatgctcctgcaaagattgtctgtttcacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggatgttaagagg 18405079  T
Q  305 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 404  Q
    ||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || || || ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  18405080 tgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgaggatatagtatgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttctcagt 18405179  T
Q  405 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    | |   ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18405180 gcaagaagcctaagaaggcgtcgactactggtag 18405213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19867778 - 19867699
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19867778 attgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaagcagcctaagaaggcgccgactactagtag 19867699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24367788 - 24367574
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    |||||||| || || || |||||| |||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24367788 ttggttaacaggtgtagaatctatcaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 24367689  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  |||||   ||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  24367688 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcatgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 24367589  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  24367588 gaaaggccacaagag 24367574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Original strand, 18182293 - 18182408
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  18182293 tgcagaatttatgaggcggatactaaggctcattagaaggttgtgaatgagaggaaaggtaaaggtcagcagagtcatcctaagccttaccgtgctcctg 18182392  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||| | ||||||    
T  18182393 ctgataaggagaaaca 18182408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18798070 - 18797963
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  18798070 tagctgcagaatctatgaagaggacacagaagctcattacaaggtgatgagtgaccgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgct 18797971  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  18797970 cctgctga 18797963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18660295 - 18660189
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  18660295 tgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggctgtgagtgagaggaaaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 18660196  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  18660195 ctgataa 18660189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19456402 - 19456284
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||  | | ||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  19456402 agctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggtgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctc 19456303  T
Q  174 ccgctgataaagggaaaca 192  Q
    | ||||| ||||| |||||    
T  19456302 ctgctgacaaaggaaaaca 19456284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19466547 - 19466429
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||  | | ||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  19466547 agctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggtgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctc 19466448  T
Q  174 ccgctgataaagggaaaca 192  Q
    | ||||| ||||| |||||    
T  19466447 ctgctgacaaaggaaaaca 19466429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19881776 - 19881670
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||| |||  |||  ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  19881776 tagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgatgagtgaacggaggggcaaggaacaacaaagtcgtcctaagccgtacagcgcc 19881677  T
Q  173 cccgctg 179  Q
    || ||||    
T  19881676 cctgctg 19881670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 171
Target Start/End: Original strand, 34642486 - 34642584
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||  ||| |||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34642486 tagctgcagaatctatgaagaagattcaagggctcattacaaggtgatgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgc 34642584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 14376809 - 14376938
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||  ||| |||  | |   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14376809 ttggttagtagctgcaggatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggagcaagggacagcagagtcgtccgaagccgt 14376908  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    | ||||| || ||||| || || |||||||    
T  14376909 atagtgctcctgctgacaagggaaaacaga 14376938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Original strand, 16924867 - 16924909
Alignment:
Q  396 gttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16924867 gttcacagtgtactcagcctaagaaggcgccgactactggtag 16924909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 21566893 - 21566999
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||| |||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21566893 agctgtagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcggaggagtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 21566992  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  21566993 ctgctga 21566999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 419
Target Start/End: Original strand, 10466035 - 10466098
Alignment:
Q  356 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10466035 gacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaaga 10466098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19868017 - 19867915
Alignment:
Q  92 gaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaac 191  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || |    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||    
T  19868017 gaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagtggcagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagagcccctgctgataagggcaaac 19867918  T
Q  192 aga 194  Q
    |||    
T  19867917 aga 19867915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Original strand, 25958658 - 25958752
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||| || ||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  25958658 tgcaggatttatgaggaggatactagagctcactacaagatagtgaaagagaagagaggaaaagggcagcaaagtcgtccaaagccttatagtgc 25958752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21474814 - 21474774
Alignment:
Q  236 gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21474814 gagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 21474774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12480169 - 12479737
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12480169 gacattaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 12480070  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12480069 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 12479970  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12479969 taagaggaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccataagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 12479870  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479869 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 12479770  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12479769 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 12479737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 19775236 - 19775660
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19775236 gacatcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 19775335  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19775336 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 19775435  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19775436 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgattcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 19775535  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775536 ggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 19775635  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19775636 agagggcgccgactactggtagggt 19775660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 8050066 - 8050498
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8050066 gacatcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 8050165  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  8050166 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgtgagacggcc 8050265  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8050266 taagaagagggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaagggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgttcggtgt 8050365  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050366 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 8050465  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8050466 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 8050498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 14300422 - 14300854
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14300422 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 14300521  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14300522 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 14300621  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14300622 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccttgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 14300721  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14300722 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagtgtactcagccta 14300821  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  14300822 agagggcgccgactacaggtagagtctttgctt 14300854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 17091592 - 17092024
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17091592 gacatcaagagggcgattggataccagcagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 17091691  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17091692 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 17091791  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17091792 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 17091891  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091892 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 17091991  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17091992 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 17092024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23959316 - 23958884
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23959316 gacattaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 23959217  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23959216 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 23959117  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23959116 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 23959017  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959016 ggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagatattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 23958917  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23958916 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 23958884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27714905 - 27714473
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27714905 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaagg 27714806  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27714805 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 27714706  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27714705 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 27714606  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27714605 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagtcta 27714506  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27714505 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 27714473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19635705 - 19635273
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19635705 gacatcaagagggcgattgggtaccaacaactgagagtttttccggatttggttaatagttgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 19635606  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  19635605 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagttgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 19635506  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  19635505 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtatgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgt 19635406  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635405 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 19635306  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19635305 agaaggcgccgactactggtagagtctttgctt 19635273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8389981 - 8389549
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8389981 gacatcaagagggcgattggataccagcagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 8389882  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  8389881 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgatgttaggcgacc 8389782  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8389781 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 8389682  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8389681 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtacccagccta 8389582  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8389581 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 8389549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 16233435 - 16233867
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16233435 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaagatacgaaggctcactacaagg 16233534  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  16233535 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacaaaagatggtcgatgttaggcggcc 16233634  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16233635 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtacttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 16233734  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233735 ggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 16233834  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16233835 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 16233867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 40476609 - 40476177
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  40476609 gacatcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaaga 40476510  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  40476509 tagtgaacgagaggaagggcaagggacagcggagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcc 40476410  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||    
T  40476409 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcagtgt 40476310  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40476309 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcggccta 40476210  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40476209 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 40476177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14684136 - 14683712
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  14684136 gacattaagagggcgattggataccaacagattagagtttttccagatttggtcaatagttgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataaga 14684037  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  14684036 ttgtgaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccatacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 14683937  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14683936 taagaagaaggatgctaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagctatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgt 14683837  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  14683836 ggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggacatattagttcatagtgtactcagccta 14683737  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14683736 agagggcgccgactactggtagggt 14683712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13513916 - 13513500
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    ||||||||||| || || |||||  |  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| || |    
T  13513916 aagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttcctgatttggtgaatagctgcagaatctatgaggaggataccagagctcattacaaggttgtta 13513817  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || || ||||  ||  | |||| |||||||||||||||    
T  13513816 atgagaggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaa 13513717  T
Q  223 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggc 319  Q
    ||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13513716 gaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggc 13513617  T
Q  320 aagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||||||||    
T  13513616 aagaagggtcatattatagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaaga 13513517  T
Q  420 gggcgccgactactggt 436  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  13513516 gggtgcctactactggt 13513500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 18604259 - 18604620
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  18604259 gacatcaagagggcgatcggataccaacaactccgagttttccctgatttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccatagctcattacaagg 18604358  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||| || || ||||  ||  |||||| |||||||||    
T  18604359 ttgttaatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttataatgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcc 18604458  T
Q  217 taagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||||||||||||| |    |||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18604459 taagaagaaggatgctccttcggagattatttgttttaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccgg 18604558  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattg 375  Q
    |||||||| || |||| | |||||| ||||||||| || |  || ||||||||||| |||||    
T  18604559 tgtggcaaaaagggtcttattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattg 18604620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 337
Target Start/End: Original strand, 18223948 - 18224236
Alignment:
Q  52 agtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagt 151  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| |||||||||    
T  18223948 agttttccctgatttagtgaatagctgcagaatctacgaggaagataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagt 18224047  T
Q  152 cgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtt 248  Q
    || |||||||| || |||||||| | |||||| || |||||||  ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||    
T  18224048 cgccctaagccttatagtgcccctgttgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtt 18224147  T
Q  249 tcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgta 337  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18224148 tcaactgtggcgagaaaggccacaagtgtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgta 18224236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 276
Target Start/End: Original strand, 16248150 - 16248378
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||    ||||| ||||||||    
T  16248150 gagttttccctgatttggttaatagctgcaggatctataaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcagaagactaagggccagcagag 16248249  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgt 247  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||   |||    
T  16248250 tcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggccaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccaactgagattacatgt 16248349  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16248350 ttcaattatggtgagaaaggccacaagag 16248378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Original strand, 16350216 - 16350397
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||| ||||    ||||| ||||||||    
T  16350216 gagtttttcctgatttggtgaacaactgtagaatctatgaggaggacaccaaagctcattacaaggttgtaaatgagcggaagactaagggccagcagag 16350315  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct 232  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16350316 tcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgct 16350397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7357839 - 7357574
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||     
T  7357839 gacatcaaaagagctattgggtatcaacagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaggctcattacaaga 7357740  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    || ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| ||||    
T  7357739 taatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacattgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 7357640  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
     |||| ||  ||||   |||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7357639 caagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagagtggtgagaaaggccacaagagcaa 7357574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 3261542 - 3261756
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3261542 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 3261641  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  3261642 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 3261741  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  3261742 gaaaggccacaagag 3261756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14162982 - 14162865
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  14162982 tgcaggatttatgaaaaggatactaaggctcactacaaggttgtgaacgaacagaaagttaagggacaacagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 14162883  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  14162882 ctgataagggtaaacaga 14162865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 293 - 390
Target Start/End: Original strand, 16250569 - 16250666
Alignment:
Q  293 gagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtca 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  16250569 gagatcaagaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagttgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtca 16250666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20893597 - 20893338
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | || ||||| || || |||||||| ||  |||| || || || ||||| |||||| || |||    
T  20893597 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggtaaacagttgcaggatttacaaagaagacaccaaagctcattacaagataatga 20893498  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||||||||     
T  20893497 gtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagag 20893398  T
Q  223 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    ||  ||||   || | |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  20893397 gagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggcaacaagagcaa 20893338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14697599 - 14697507
Alignment:
Q  91 agaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataa 183  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  14697599 agaggataccaaagctcattacaaagttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataa 14697507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8548 - 8431
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  8548 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 8449  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  8448 ctgataagggtaaacaga 8431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15073886 - 15073754
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| |||||||||| ||||||||| || |    
T  15073886 gatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggacagctgagtcgtccgaaac 15073787  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||  |||||||    
T  15073786 cgtatagtgctcctgctgacaaagttaaacaga 15073754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 441
Target Start/End: Original strand, 15144677 - 15144759
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15144677 attgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaagctgcctaagaaggcgccgactactggtagggt 15144759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 15536 - 15653
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| || |    
T  15536 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtcctaagacttacagtgctcctg 15635  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  15636 ctgataagggtaaacaga 15653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 15144448 - 15144565
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  15144448 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccctg 15144547  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  15144548 ctgataagggcaaacaga 15144565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 29450237 - 29450499
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||| | ||| | || ||||||||||| ||||  || |||||||| || || || ||||| || |||     
T  29450237 gacatcaaaagggctattggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaataggtgcaaaatttatgaagaagacaccaaagctcattataaga 29450336  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |  ||| ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| ||||    
T  29450337 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 29450436  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    ||||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29450437 taagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 29450499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18259957 - 18259850
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||     
T  18259957 tagctacaggatctatgaagaagatacaaaatctcattacaaggtgatgagtgagcgtaggggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgct 18259858  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  18259857 cctgctga 18259850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14162696 - 14162618
Alignment:
Q  360 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14162696 ttgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaaacagcctaagaaggcgcagactactggtag 14162618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Original strand, 14993112 - 14993230
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  14993112 gatttggtaagtagttgcagaatttatgaagaggatatgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtctgaagc 14993211  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  14993212 cgtatagtgcccctgctga 14993230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16219703 - 16219585
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    |||||||| |||||||  || ||||| |||| ||| || ||| | ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16219703 agctgcagaatctatgtggaagatacgaaggatcattataagattgtgaatgagaggaaaagcaaaggtcagccgagtcgtccaaagccttacagtgctc 16219604  T
Q  174 ccgctgataaagggaaaca 192  Q
    | |||||||| || |||||    
T  16219603 ctgctgataagggaaaaca 16219585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16223023 - 16222905
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    |||||||| |||||||  || ||||| |||| ||| || ||| | ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16223023 agctgcagaatctatgtggaagatacgaaggatcattataagattgtgaatgagaggaaaagcaaaggtcagccgagtcgtccaaagccttacagtgctc 16222924  T
Q  174 ccgctgataaagggaaaca 192  Q
    | |||||||| || |||||    
T  16222923 ctgctgataagggaaaaca 16222905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Original strand, 44658614 - 44658747
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |    
T  44658614 ttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 44658713  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagat 198  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  44658714 acagtgctcctgcggacaaaggaaagcagaagat 44658747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15267292 - 15267185
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  15267292 tagctgcaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgcagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgct 15267193  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  15267192 cctgctga 15267185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 279
Target Start/End: Original strand, 11204001 - 11204197
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 185  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  11204001 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaag 11204100  T
Q  186 ggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    | ||  |||||||    |||| |||| | || |||| ||  ||||   || | |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11204101 gaaagtagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaa 11204197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7357498 - 7357434
Alignment:
Q  355 agacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||    
T  7357498 agacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaaga 7357434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15073709 - 15073669
Alignment:
Q  236 gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15073709 gagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 15073669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 17671168 - 17671600
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17671168 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 17671267  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17671268 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 17671367  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17671368 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaatgtctgcccggaggaaatcaagaagtgtgtctggtgt 17671467  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671468 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 17671567  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17671568 agagggcgccaactactggtagggtctttgctt 17671600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 20015409 - 20015841
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20015409 gacatcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctacgaagaggataccaaggctcactacaagg 20015508  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  20015509 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgtgagacggcc 20015608  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20015609 taagaagagggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaagggccacaagagtaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgttcggtgt 20015708  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015709 ggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 20015808  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015809 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 20015841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18860212 - 18859780
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18860212 gacatcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttccggatttggttaatagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 18860113  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||    
T  18860112 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacaggggatggtcgatgataggcggcc 18860013  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18860012 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtatgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgt 18859913  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859912 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacagacattgtgtgttttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 18859813  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18859812 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 18859780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19116035 - 19115603
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19116035 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaagg 19115936  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19115935 tagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 19115836  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19115835 taagaagaaggatgctgcagaggttgtgtgcttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgcgtccggtgt 19115736  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19115735 ggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccaa 19115636  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19115635 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 19115603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 22126105 - 22126537
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22126105 gacattaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 22126204  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  22126205 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 22126304  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  22126305 taagaagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtcttccttgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgt 22126404  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126405 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacagacattgtgtgttttaactgcaatggagaaagtcacattagttcacagtgtactcagccta 22126504  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22126505 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 22126537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 22117321 - 22117753
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22117321 gacattaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 22117420  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  22117421 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcaaagtcgtcctaagccgtacagtgcccccactgataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 22117520  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  22117521 taagaataaggatgctatagagattgtgtgtttcaatcgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgt 22117620  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117621 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 22117720  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22117721 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 22117753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Original strand, 19481219 - 19481650
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19481219 gacatcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttcatagctgcagg-tctatgaagaggatacgaaggcttactacaagg 19481317  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19481318 tagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 19481417  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19481418 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 19481517  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19481518 ggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgcaatcgtgcagacattgtgtgctttaattgtaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagccta 19481617  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19481618 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 19481650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22043465 - 22043047
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  22043465 gacattaagagggcgatcggataccaacagatccgagttttccctgatttggttaatagatgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagg 22043366  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||  |||| || || |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  22043365 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcaccctaagccttatagtgcccctactgacaagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 22043266  T
Q  217 taagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |||    
T  22043265 taagaagaaggatgctccaactgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtccagaagagatcaagaaatgtgttcgg 22043166  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  22043165 tgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 22043066  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22043065 ctaagagggcgcctactac 22043047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Original strand, 30310287 - 30310705
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||  | || ||||||||  ||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  30310287 gacatcaagagggcgatcagataccaacaactccgagttttccctgatttagtgaatagttgcagaatctacgaggaggatactaaggctcattacaagg 30310386  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  30310387 ttgtgaatgagcggaagaccaagggtcagcagagtcgccctaaaccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 30310486  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
     |||||||||||||   |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  30310487 aaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtctgg 30310586  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| || ||||  ||||    
T  30310587 tgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaatgtaagcagc 30310686  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    | |||| |||||| |||||    
T  30310687 cgaagaaggcgcctactac 30310705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15537021 - 15536603
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||  |||||||| |||||||    
T  15537021 gacatcaagagggcgatcggataccaacaacttcgagttttccctgatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaagatagtaaggctcattacaagg 15536922  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || || ||||  ||  |||||| |||||||||    
T  15536921 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgccgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcc 15536822  T
Q  217 taagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||||||||||||| |    |||||| | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15536821 taagaagaaggatgctccttcggagattatttgttttaattgtggcgaagaaggccacaagagtaatgtttgtcctaaagagatcaagaaatgtgtccgg 15536722  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| || |  || | ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  15536721 tgtggcaaaaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatactgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 15536622  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  15536621 cgaagagggcgcctactac 15536603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32603783 - 32603365
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  32603783 gacatcaagagggcgatcggatatcaacaactccgagttttccctgatttggtgaacagctgtaggatctacgaagaggataccagagctcattacaagg 32603684  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||  ||  |||||| |||||| ||    
T  32603683 ttgttaatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcgacc 32603584  T
Q  217 taagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||||||||||||| |    || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || || | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  32603583 taagaagaaggatgctccttcggaaattgtttgtttcaactgtggtgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcttgaagagatcaagaaatgtgtccgg 32603484  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | |  || ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||  |||| ||||| |  ||||    
T  32603483 tgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagagaaatgatattctgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatataggttcccagtgcaagcagc 32603384  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  32603383 cgaagaggacgcctactac 32603365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 203 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22031554 - 22031323
Alignment:
Q  203 gatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatca 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||| | ||||| |    
T  22031554 gatgataggcggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtga-aaaggccataagagcaatgtttgtcctaaagagataa 22031456  T
Q  300 agaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttc 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||    
T  22031455 agaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagaaggtcatattggttc 22031356  T
Q  400 acagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
     || || |  ||||||||||||||||| |||||    
T  22031355 ccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactac 22031323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19981545 - 19981181
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  19981545 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagtggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccctg 19981446  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||| ||| |||  |||| | |||||| || | |||||||||||   |||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  19981445 ctgataagggcaaatagaggatggtcgaagataggcgaccaaggaagaaggatgttcctgctgagattgtcttctttaattgtggtgagaaaggccacaa 19981346  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgag-gagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaa 372  Q
    |||||| |  || || ||| ||| | || |  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | ||  |||||||||||||| ||    
T  19981345 gagcaatgcttgtcc-gagagaggtgaaaagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacataatgacattgtgtgcttcaa 19981247  T
Q  373 ttgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19981246 ttgtaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 19981181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 18880860 - 18881224
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||      
T  18880860 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagatagtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgccccta 18880959  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  |||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18880960 ctgataagggcaaacagagaatggtcgaagatagacggcctaagaagaaggatgctcctgcaaaaattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 18881059  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||| ||| | |||||  ||| | |  ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || || || ||||| |||    
T  18881060 gagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgttttcactgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgcttcaat 18881159  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18881160 tgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtag 18881224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 449
Target Start/End: Original strand, 21391064 - 21391439
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |    
T  21391064 tgcaggatttacgaggaggatactaaggctcattacaagatcgtgaatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccttg 21391163  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
     |||||| || ||| |||  ||  |||| | ||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||    
T  21391164 ttgataagggcaaatagagaatggtcgaagatagacggccgaggaagaaggatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaa 21391263  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||| |||  ||||||  ||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || || || ||||| |||    
T  21391264 gagtaatgcttgtcctggggacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgcttcaat 21391363  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21391364 tgtaatgaagagggtcacattggttcatagtgcaagaagcctaagaaggcgccgactactggtagggtctttgctt 21391439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 449
Target Start/End: Original strand, 21780390 - 21780765
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |    
T  21780390 tgcaggatttacgaggaggatactaaggctcattacaagatcgtgaatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccttg 21780489  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
     |||||| || ||| |||  ||  |||| | ||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||    
T  21780490 ttgataagggcaaatagagaatggtcgaagatagacggccgaggaagaaggatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaa 21780589  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||| |||  ||||||  ||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || || || ||||| |||    
T  21780590 gagtaatgcttgtcctggggacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgcttcaat 21780689  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21780690 tgtaatgaagagggtcacattggttcatagtgcaagaagcctaagaaggcgccgactactggtagggtctttgctt 21780765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 21163733 - 21164105
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  21163733 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggccaacaaagtcgccctaagccctatagtgcccctg 21163832  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| || || | |||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  21163833 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaggatagacgaccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaagaccacaa 21163932  T
Q  274 gagcaacgtctgccctg--------aggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgt 365  Q
    |||||| |  || | ||        | ||||| ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   | | |||||||||  |||  ||||||||||    
T  21163933 gagcaatgcttgtcatggagagataaagagataaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcactggctgattgcaactgtaatgacattgtgt 21164032  T
Q  366 gctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || || |  || ||||||| |||||| |||||||||||    
T  21164033 gcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcaatgcaagcaacctaagaaggcgccaactactggtag 21164105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 198
Target Start/End: Original strand, 29300626 - 29300750
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |    
T  29300626 agctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtaatgagtgagaggaggggtaagggacattagagtcgtcctaaaccttacagtgctc 29300725  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacagaagat 198  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||    
T  29300726 ctgctgacaaagggaagcagaagat 29300750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 232
Target Start/End: Original strand, 22421096 - 22421251
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  22421096 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 22421195  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct 232  Q
    || |||| || |||||||  ||  | ||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  22421196 ctaataagggcaaacagagaatggttgatgagaggcggcctaggaagaaagatgct 22421251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22524088 - 22523973
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  22524088 tgcaggatttataaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaaaggcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgcccctg 22523989  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||| || |||||    
T  22523988 ctgataagggaaaaca 22523973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 16268367 - 16268629
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||  | || ||||||||||| || || || |||||||| || || || ||||| |||||      
T  16268367 gacatcaaaagggctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaatagttgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaata 16268466  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    || ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||    ||||  ||| ||||    
T  16268467 taatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcc 16268566  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    ||||||||  ||||   || | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16268567 taagaagagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 16268629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 22027423 - 22027586
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||  ||||| ||||  | |||||||| | | | |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||    
T  22027423 gacatcaagagagccatagggtatcaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagatcattataagg 22027522  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |  ||| |||| | |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22027523 tgatgagtgagcgaagtggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctga 22027586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21672093 - 21671976
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  21672093 tgcaggatttatgaggaggatgccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaggccaagggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 21671994  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  21671993 ctgataagggtaaacaga 21671976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21929009 - 21928889
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  21929009 agctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccgtatagtgctc 21928910  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  21928909 ctgctgacaaaggaaaacaga 21928889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22054441 - 22054335
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22054441 tgcaggatctgtgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacggcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctg 22054342  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  22054341 ctgataa 22054335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19985755 - 19985556
Alignment:
Q  80 aggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 179  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  19985755 aggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagtggcaagggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgcgg 19985656  T
Q  180 ataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    | || || ||||||| |||  | ||||  ||| ||||||||| ||  ||||   || | |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  19985655 acaagggtaaacagaggatgattgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagattgtttgtttcaagtgtggcgaaaaaagccacaagag 19985556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28984549 - 28984287
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||     
T  28984549 gacatcaaaagagccattggatatcaacagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 28984450  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |  ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || || || || || || |||| |||    |||| |||| ||||    
T  28984449 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgcggacaagggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcc 28984350  T
Q  217 taagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
     |||| ||  |||||| ||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28984349 caagaggagagatgctccagttgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 28984287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 17830113 - 17830204
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctca 108  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  17830113 gacatcaagagtgcgatcggatatcaacagctccgagttttccctgatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaagatacaaaggctca 17830204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22374462 - 22374332
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| ||||||||| |||||||||| || |    
T  22374462 gatttggtgagtagctgtaggatctatcaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaac 22374363  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctgataaagggaaaca 192  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||    
T  22374362 cgtatagtgcccctgctgtcaaaggtaaaca 22374332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3274686 - 3274589
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||| || ||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  3274686 agctgcagaatctatgaggaggatacaagagctcattacaaaatagtgaatgagaagagaggtaaaggccagcaaagtcgtccaaagccttacagtgc 3274589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 419
Target Start/End: Original strand, 16268712 - 16268772
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||| ||||    
T  16268712 attgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaaga 16268772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22845 - 22413
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22845 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgatggctcactacaagg 22746  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22745 tagtgaatgaaaggaagggcaagagacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 22646  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22645 taagaagaaggatactgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccccgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 22546  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22545 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 22446  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22445 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 22413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7834 - 7402
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7834 gacattaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgatggctcactacaagg 7735  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7734 tagtgaatgaaaggaagggcaagagacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcc 7635  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7634 taagaagaaggatactgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccccgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 7535  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7534 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 7435  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7434 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 7402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4022 - 3590
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4022 gacatcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttccggatttggttaatagctgcaggacctatgaagaggatacgaaggctcactacaagg 3923  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  3922 tagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 3823  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  3822 taagaagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgt 3723  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || |||||||||| | |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3722 ggtaagaaaggtcctattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 3623  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3622 agagggcgccgactactggtagagtctttgctt 3590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17727 - 17343
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||    
T  17727 gagtttttcctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacacggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagag 17628  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgt 247  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||    
T  17627 tcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacatagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgt 17528  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgca 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||| |||||       
T  17527 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggcaataagggtcatatagtagctgattttt 17428  T
Q  348 atcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
    | ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| || || |  || |||||||||||||| |||||    
T  17427 agcgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaaacaacctaagagggcgcctactac 17343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10965 - 10540
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  10965 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttt-ccggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaaga 10867  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  10866 tagtgaacgaggggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcc 10767  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10766 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 10667  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10666 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattatgtgttttaactgcaatggaaagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 10567  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10566 agagggcgccgactactggtagggtct 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41753 - 41321
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||     
T  41753 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccgaatttggtcaatagctgcaggatctatgaagagaataccaaggctcactataaga 41654  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  41653 ttgtgaacgagaggaagggcaatggacagcagagttgtcctaagccgtacattgcccctgctaataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 41554  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  41553 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtttgtcctgaagagagcaagaagtgtgtctggtgt 41454  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41453 ggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 41354  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41353 agagggcgccgactactggtagggtctttgctt 41321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 431
Target Start/End: Original strand, 12872 - 13244
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | || ||||||| |||   |||| | ||||||||||| ||||| |    
T  12872 gatttagtgaatagctgcaggatctatgaagaggatatcaaagctcattacaagattgttaatgagaagaagaccaagagccagcagagtcgccctaaac 12971  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtgg 258  Q
    | || |||||||| || ||||| || || ||||  ||  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||    
T  12972 cttatagtgcccctgcagataagggcaagcagagaatggtcgatgataggaagccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtgg 13071  T
Q  259 tgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagac 358  Q
     | ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||     
T  13072 cgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtctggtgtggtaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgat 13171  T
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgacta 431  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| || || || ||||||||||||||||| ||||    
T  13172 attgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcaatgcacgcagcctaagagggcgcctacta 13244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8856 - 8432
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||     
T  8856 gacattaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaagatactaaggctcactataaga 8757  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  8756 ttgtgaacgagaggaagggcaagggacatcagagtcgtcctaagccgtacagtgccccaactgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcc 8657  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8656 taagaagaaggatgctaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgggagaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccagtgt 8557  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| | |||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8556 ggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactacaatgatgagggacatattagttcacagtgtactcagccta 8457  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8456 agagggcgccgactactggtagggt 8432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21578 - 21163
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21578 gacatcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaaga 21479  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                 |||||  |||||| |||||||||    
T  21478 tagtgaacgagaggaagagcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctg-----------------aagatggtcgatgataggcggcc 21396  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21395 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 21296  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295 ggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 21196  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21195 agaggacgccgactactagtagggtctttgctt 21163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12050 - 11635
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12050 gacatcaagagggcgattggataccaacagattagagtttttccggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaaga 11951  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                 |||||  |||||| |||||||||    
T  11950 tagtgaacgagaggaagagcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctg-----------------aagatggtcgatgataggcggcc 11868  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11867 taagaagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 11768  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
     |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11767 cgcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 11668  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11667 agagggtgccgactactggtagggtctttgctt 11635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 55602 - 55170
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||     
T  55602 gacattaagagggcgattgggcatcgacagattaggatttttccggatttggttaatagctgcagaatctacgaggaagatactaaggctcattacaaga 55503  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  55502 tggtgaatgagaagaagggcaaaggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 55403  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||| | | || |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  55402 taagaagaaggatgtttctgaaattgtgtgcttcaactgtggtggaaaaggccacaagagcaatggttgtcctgaagaaattaagaagtgtgtccggtgt 55303  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| | |||  ||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  55302 ggcaagaagggtcatatagtatctgattgcaagcgtcaggacattgtatgttttaactgcaatgaagagggacatattagttctcagtgtactcagccta 55203  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  55202 agagggcgccaactactggtagggtctttgctt 55170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 524 - 104
Alignment:
Q  18 acatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggt 117  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  524 acattaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggtcaatatctgtaggatctatgaagaggatactaaggctcactacaagat 425  T
Q  118 agtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcct 217  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||           |||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  424 agtgaacgagaggaagggcaaggggcagcagagtcgtcctaagccgt-----------gctgatgaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcct 336  T
Q  218 aagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtg 317  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  335 aagaagaaggatgctactgaaattgtgtgtttcaattatggtgggaaaggccacaaaagcaatgtttgtcctgaagagattaagaaatgtgtccggtgtg 236  T
Q  318 gcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaa 417  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  235 gcaagaagggtcattttgtagctgattgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaa 136  T
Q  418 gagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  135 gagggcgccgactactggtagagtctttgctt 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 424909 - 424482
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||     
T  424909 gacattaagagggcgattggatatcaacagattagagtttttctggatttggttaatagctgcagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaaga 424810  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||    
T  424809 tggtgaatgagcggaagggcaagggacagcatagtcgtcctaagccgtacaatgcccctgctgataaagggaaacaaaatatggtcgatgataggcggcc 424710  T
Q  217 taagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    || |||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  424709 tacgaagaagggtgctcctactgagattgtgtgcttcaactgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtttgtcctgaagagattaagaaatgtgtccga 424610  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  424609 tgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtgaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacatcagttcacagtgtactcagc 424510  T
Q  414 ctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  424509 ctaagagggcgccgactactggtagggt 424482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 203979 - 203819
Alignment:
Q  20 atcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtag 119  Q
    |||||||| || || ||||| |||||  ||||| ||||  | |||||||| | | | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||      
T  203979 atcaagagagccatagggtaccaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtga 203880  T
Q  120 tgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  203879 tgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 203819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 49263 - 48837
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||     
T  49263 gacattaagagggcgattgggcatcgacagattaggatttttacggatttggttaatagctgcagaatctacgaggaagatactaaggctcattacaaga 49164  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  ||   ||||| |||||||||    
T  49163 tggtgaatgagaagaagggcaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacaatgcccctactgataaagggaaacagagaatggccgatgataggcggcc 49064  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||| || || |||||||||||||  |||    
T  49063 taagaagaaggatgcttctgaaattttgtgtttcaactatggtgggaaaggccacaagagcaatggttgtcctgaagaaattaagaagtgtgtccaatgt 48964  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||  ||||||||| || ||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  48963 ggcaagaagggtcatatagtagctgattgcaagcgtcaagacattgtatgttttaactgcaatgaagagggacaaattagttctcagtgtactcagccta 48864  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggtct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  48863 agagggcgccgactactggtagggtct 48837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 432
Target Start/End: Original strand, 189 - 601
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  189 aagagggcaattgggtatcaacaaatccgagtttttcctgatttggtgaatagttgtagaatctatgaagaggataccaaggctcattacaaggttgtga 288  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
    ||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||| || ||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||    
T  289 atgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatattgcccctgctgataagggcaaacaaagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 388  T
Q  223 gaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggc 319  Q
    |||||||||| |    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  389 gaaggatgctcctacggagattgtttgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggagatcaagaaatgtgtccggtgtggc 488  T
Q  320 aagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||| ||||    
T  489 aagaagggtcatattgtagatgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattttaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccaaaga 588  T
Q  420 gggcgccgactac 432  Q
    ||||||| |||||    
T  589 gggcgcctactac 601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 107480 - 107693
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  107480 gacatcaagagggagattgggtaccaacagctgagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgaga 107579  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  107580 tagtgaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcc 107679  T
Q  217 taagaagaaggatg 230  Q
    ||||||||| ||||    
T  107680 taagaagaaagatg 107693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8755 - 8550
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  8755 tgcagaatttatgaggatgataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggccaacagagtcgccctaagccctatagtgcccctg 8656  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||   ||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8655 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaggatagacggccaaagaagaaggacgctcttgctgagattatctgttttaattgtggcgagaaaggccacaa 8556  T
Q  274 gagcaa 279  Q
    ||||||    
T  8555 gagcaa 8550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 432
Target Start/End: Original strand, 229589 - 229973
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    ||||  ||||||||    
T  229589 gagtttttcctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaagactaaggaccagcagag 229688  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgt 247  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||   || |||||||| |||    
T  229689 tcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaataagaaggatgctcctgcggagattgtttgt 229788  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgca 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||    
T  229789 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtcatataatagctgattgca 229888  T
Q  348 atcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
    | | ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| || || |  ||||| ||||||||||| |||||    
T  229889 agcttaatgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactac 229973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 252163 - 251961
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||  ||| ||||||||  || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |    
T  252163 agctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgagaggaggggtaagggacaacataatcgtcctaaaccttacagtgctc 252064  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggcca 270  Q
    | ||||  | ||| ||||| |||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||||   |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  252063 ctgctgccacaggaaaacataagatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcttgttgagattgtgtgtttcaagtgtggtgaaaaaggcca 251964  T
Q  271 caa 273  Q
    |||    
T  251963 caa 251961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 421
Target Start/End: Original strand, 14750 - 15151
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||| || || |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14750 aagagggcaattgggtatcaacaaatccgagtttttcctgatttggtgaatagttgtagaatctattaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 14849  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
    ||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| ||||| |||||||||    
T  14850 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcagcctaagaa 14949  T
Q  223 gaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggc 319  Q
    |||||||||| |    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14950 gaaggatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggc 15049  T
Q  320 aagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||  || |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||||||||    
T  15050 aagaagggtcatatagtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgattcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaaga 15149  T
Q  420 gg 421  Q
    ||    
T  15150 gg 15151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 421
Target Start/End: Original strand, 11065 - 11466
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||| || || |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11065 aagagggcaattgggtatcaacaaatccgagtttttcctgatttggtgaatagttgtagaatctattaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 11164  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
    ||||| ||||    ||||| || || |||   |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| ||||| |||||||||    
T  11165 atgagcggaagactaagggccaacaaagttaccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcagcctaagaa 11264  T
Q  223 gaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggc 319  Q
    |||||||||| |    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11265 gaaggatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggc 11364  T
Q  320 aagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 419  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||  || |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||||||||    
T  11365 aagaagggtcatatagtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgattcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaaga 11464  T
Q  420 gg 421  Q
    ||    
T  11465 gg 11466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5599 - 5181
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  5599 gacattaagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttcctgatttggtgaatagctgcagaatctatgatgaggatactaaggctcattacaagg 5500  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  5499 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccttgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 5400  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  5399 taagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaagggccataagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtctgg 5300  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |  || |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  5299 tgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtggttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 5200  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    | |||||||| || |||||    
T  5199 cgaagagggcacctactac 5181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 450 - 33
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||     
T  450 gacatcaagagggcgatcggataccaacagctccgagttttccctgatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaagaaacaaaggctcattacaaga 351  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||| ||    
T  350 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgtc-taagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcgccc 252  T
Q  217 taagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||||| ||||||| |||   |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  251 taagaagagggatgctccagttgagattacttgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgtagagatcaagaaatgtgtccgg 152  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  151 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 52  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  51 ctaagagggcgcctactac 33  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 338
Target Start/End: Original strand, 139313 - 139637
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||  || |||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  139313 gacatcaagagggcgatcggatatcaacagctccgaattttccctgatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaagatacaaaggctcattacaagg 139412  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  139413 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcc 139512  T
Q  217 taagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||||| |||| ||   || ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  139513 taagaagagggatactccagctgagattacttgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgtagagatcaagaaatgtgtccgg 139612  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtag 338  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||    
T  139613 tgtggcaagaagggtcatattgtag 139637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Original strand, 13733 - 14153
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatc--aacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaa 114  Q
    ||||| |||||||||||||| || |  ||||  || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |  ||||| |||||    
T  13733 gacattaagagggcgattggataccgcaacagattcgagtttttccagatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaggacaccagagctcattacaa 13832  T
Q  115 ggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcgg 214  Q
    ||| || |||||| ||||    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||    
T  13833 ggttgttaatgagcggaagactaagggccaacagagtcgccctaagccctatagtgcccctgatgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcgg 13932  T
Q  215 cctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtcc 311  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||     
T  13933 cctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtca 14032  T
Q  312 ggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 411  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||    
T  14033 ggtgtggcaagaagggtcgtatagtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagca 14132  T
Q  412 gcctaagagggcgccgactac 432  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  14133 gcctaagagggcgcctactac 14153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 432
Target Start/End: Original strand, 473 - 890
Alignment:
Q  18 acatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggt 117  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  473 acatcaagagggcgatcggataccaacaactccgagttttcccttatttagtgaataactgcaggatctacgaggaagatactaaggctcattacaaggt 572  T
Q  118 agtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcct 217  Q
     ||||||||| ||||   |||||   |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| ||||||||||    
T  573 tgtgaatgagcggaagaccaaggacaagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcct 672  T
Q  218 aagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggt 314  Q
    ||||||| ||||||| |||   |||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  673 aagaagagggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtcctgtagagatcaagaaatgtgtccggt 772  T
Q  315 gtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcc 414  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||| |||| || || |  |||||    
T  773 gtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaacgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcc 872  T
Q  415 taagagggcgccgactac 432  Q
     ||||||||||| |||||    
T  873 gaagagggcgcctactac 890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 4
Alignment:
Q  23 aagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtga 122  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |  ||||||||||  ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  383 aagagggcaattggatatcaacagatccgagtttttcctaatttggtgaacagctgtagaatctatgaggaggacaccaaagctcattacaaggttgtga 284  T
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaa 222  Q
    ||||| ||||    ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||    
T  283 atgagcggaagactaagggccggcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggaaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 184  T
Q  223 gaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggc 319  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | |||||  || | ||| |||||    
T  183 gaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtgaagaaaagttttcggcgtggc 84  T
Q  320 aagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttc 399  Q
    ||||||||||||    ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  83 aagaaaggtcatacattagttgattgcaagcgtaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaggagggtcatattggttc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 37065 - 36675
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||| ||||    ||||| ||||||||    
T  37065 gagtttttcctgatttggtgaacaactgtagaatctatgaggaggacaccaaagctcattacaaggttgtaaatgagcggaagactaagggccagcagag 36966  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgt 247  Q
    ||  |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||| || |||    
T  36965 tctccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagatcgtctgt 36866  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgca 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    ||| ||||||||    
T  36865 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcatacgttagctgattgca 36766  T
Q  348 atcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || || |  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36765 agcgtagtgatattgtgtgctttaattgcaaggaagagggtcatattggttctcaatgcaagcagtttaagagggcgccgactactggtag 36675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15025 - 14607
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |  |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  15025 gacattaagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttcctgatttagtgaatagctgcagaatctacgaggaagataccaaggctcattactagg 14926  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| || ||||||    
T  14925 ttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatatgcggcc 14826  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  14825 taagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgtcttgaagagatcaagaaatgtgtccgg 14726  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||  || || || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  14725 tgtggcaagaagagtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatatcgtatgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 14626  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  14625 cgaagagggcgcctactac 14607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5456 - 5341
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |    
T  5456 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacggtgctcctg 5357  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||| || |||||    
T  5356 ctgataagggcaaaca 5341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 431
Target Start/End: Original strand, 9987 - 10358
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| | || ||||||| | |   |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  9987 gatttagtgaatagctgcaggatctatgaagaggataccagagctcattacaagattgttaatgagaagtagaccaagggtcagcagagtcgccctaaac 10086  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtgg 258  Q
    | || |||||||  |||||||| || || ||||  ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||   || || ||||| |||||||| | |||    
T  10087 cttatagtgcccttgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatgg 10186  T
Q  259 tgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagac 358  Q
     | ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||  ||     
T  10187 cgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggtaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcataatgat 10286  T
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgacta 431  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  10287 attgtgtgcttcaattgtaatgaaga-ggtcacattggttcacaatgcacgcagcctaagagggcgcctacta 10358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 431
Target Start/End: Original strand, 12642 - 13013
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| | || ||||||| | |   |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  12642 gatttagtgaatagctgcaggatctatgaagaggataccagagctcattacaagattgttaatgagaagtagaccaagggtcagcagagtcgccctaaac 12741  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtgg 258  Q
    | || |||||||  |||||||| || || ||||  ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||   || || ||||| |||||||| | |||    
T  12742 cttatagtgcccttgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatgg 12841  T
Q  259 tgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagac 358  Q
     | ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||  ||     
T  12842 cgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggtaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcataatgat 12941  T
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgacta 431  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  12942 attgtgtgcttcaattgtaatgaaga-ggtcacattggttcacaatgcacgcagcctaagagggcgcctacta 13013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32420 - 32053
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||  |    
T  32420 tgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagcgcccttg 32321  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32320 ctgataagggcaaacaaagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccacaa 32221  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    |||||| |  || ||||  ||| | || |  ||| |||||||||| |||||  ||||||   ||| ||||||||| | ||  || |||||||| ||  ||    
T  32220 gagcaatgcttgtcctggagaggtaaaaagatgtttccggtgtggtaagaagagtcatgcattagctgattgcaaacataatgatattgtgtgtttcgat 32121  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
     |||| | ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32120 cgcaacgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtagggt 32053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 37715 - 37519
Alignment:
Q  245 tgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgatt 344  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||  ||| | || |  ||| |||||||||| |||||  ||||||   ||| |||||    
T  37715 tgttttaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcctggagaggtaaaaagatgtttccggtgtggtaagaagagtcatgcattagctgatt 37616  T
Q  345 gcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    |||| | ||  || |||||||| ||  || |||| | ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37615 gcaaacataatgatattgtgtgtttcgatcgcaacgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtagggt 37519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 55178 - 54814
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||| | || || ||||| | |||||| || |||||||| |    
T  55178 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagactaagtgccaacaaagtcgccataagccttatagtgcccctg 55079  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    |||||||  | ||||||| |||  |||| | ||| ||||| ||||||||||||||| | |   ||||||| |||||   || | ||||||| ||||||||    
T  55078 ctgataagagcaaacagaggatggtcgaagatagacggccgaagaagaaggatgctcctgctaagattgtttgtttttcttattgtgagaagggccacaa 54979  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||  |||  ||||||  ||| | || ||||| |||||||||||||    || ||| ||||| | |   || |||||||| ||||||    
T  54978 gagtaatggttgtcctagggacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaaaggtcatgcacgagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgttttaat 54879  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||   ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  54878 tgcaatgaagagggtcacattggttcgtagtgtaagaagcctaagaaggcgccggctactagtag 54814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 438
Target Start/End: Original strand, 15316 - 15706
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||||| ||||    ||| | ||||||||    
T  15316 gagtttttcctgatttggtgaacagctgtagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaatgttgtaaatgagtggaagactaagcgccagcagag 15415  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgt 247  Q
    | | |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||  | |||    
T  15416 ttgccctaagccctatagtgccccagctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagatcatctgt 15515  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgca 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||| ||||||||    
T  15516 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatttttgtccagaggaggcaaagaagtgtttccggtgtggcaagaagggtcatacattagctgattgca 15615  T
Q  348 atcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    | |  |  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15616 agcacaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgatgagggtcatatcggttctcagtgcaagcagcctaagagggcgccaactactggtag 15706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 171674 - 171301
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||    
T  171674 gatttagtgaatagctatagaatctacgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagc 171575  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgtttcaattgtgg 258  Q
    | || || ||||| |||||||| || |||||||  ||  ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||   |||| |||||||||    
T  171574 cctatagcgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgttgataggcggccaaagaagaaggatgctccagttgagattacttgttacaattgtgg 171475  T
Q  259 tgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagac 358  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||     
T  171474 tgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgtagagatcaagaaatgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgat 171375  T
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
    |||| |||||| || || |||| ||||||||| ||  |||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  171374 attgcgtgcttcaactgtaatgaagagggtcatatcggttcccaatgcacgcagccgaagagggcgcctactac 171301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 435 - 63
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | || ||||||| |||   |||| | ||||||||||| ||||| |    
T  435 gatttagtgaatagctgcaggatctatgaagaggatatcaaagctcattacaagattgttaatgagaagaagaccaagagccagcagagtcgccctaaac 336  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtgg 258  Q
    | || |||||||| || ||||| || || ||||  ||  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||    
T  335 cttatagtgcccctgcagataagggcaagcagagaatggtcgatgataggaagccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtgg 236  T
Q  259 tgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagac 358  Q
     | ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||     
T  235 cgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtctggtgtggtaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgat 136  T
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgacta 431  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| || || || ||||||||||||||||| ||||    
T  135 attgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcaatgcacgcagcctaagagggcgcctacta 63  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 7363 - 7787
Alignment:
Q  20 atcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtag 119  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||  |  |||||||  | || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| | |    
T  7363 atcaagagggcaattggttaccaacagatccgagttttctccgagttggtgaacagttgcaggatttatgaggaagataccaaggctcattacaagattg 7462  T
Q  120 tgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaa 219  Q
    |||||||| ||||    || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||| | ||||||||||||    
T  7463 tgaatgagcggaagactaaaggccagcagagtcgccctaagccttacagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgaagataggcggcctaa 7562  T
Q  220 gaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  | || || || ||| | ||||  | | |||| |||    
T  7563 gaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatatttgtccggaagaggtaaagagatatttccgatgt 7662  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||   ||||||| ||||| | ||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||    
T  7663 ggtaagaagggtcatgcactagatgagtgcaaacttaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcggtgcaagcagccta 7762  T
Q  417 agagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  7763 agaaggcgccgactactggtagggt 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 80 - 432
Target Start/End: Original strand, 7545 - 7900
Alignment:
Q  80 aggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 179  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  7545 aggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttatagtgcccctgctg 7644  T
Q  180 ataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    ||||||| ||| |||  ||  |||| | ||||||||| ||||| |||| | ||   || || ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  7645 ataaaggcaaatagagaatggtcgacgataggcggccaaagaataaggctactcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagag 7744  T
Q  277 caacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgc 376  Q
     || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||  |||  || ||||||||||| || ||     
T  7745 taatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattatagctgattgcaaaagtaatgatattgtgtgcttcaactgt 7844  T
Q  377 aatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactac 432  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || || |  ||||| ||||||||||| |||||    
T  7845 aatgaagagggtcacattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactac 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 304 - 3
Alignment:
Q  50 agagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcaga 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||  ||||||| ||||||||| ||||    ||||| |||||||    
T  304 agagtttttcctgatttggtgaacagctgtaggatttatgaggaagacaccaaagctcatcacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcaga 205  T
Q  150 gtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtg 246  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||    
T  204 gtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaatagagtattgtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcttgcggagattgtctg 105  T
Q  247 tttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgc 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||  ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  | ||| |||||||    
T  104 tttcatttgtggtgagaaaggccacaaaagcaatgtttgtccaaaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcatactttagctgattgc 5  T
Q  347 aa 348  Q
    ||    
T  4 aa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22145 - 21781
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| |||| |||||||| |||||| || |||||||| |    
T  22145 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggccagctgagtcgtcttaagccctatagtgcccctg 22046  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||  ||| || ||||||| |||  |||||| ||| ||||| | |||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22045 cttttaagggcaaacagaggatggtcgatgatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaa 21946  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    || ||| |  || |||   ||||| ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||| | ||  || ||||||||||| |||    
T  21945 gatcaatgcttgtcctcgagagataaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgattgcaaccataatgatattgtgtgcttcaat 21846  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21845 tgcaatgaagagggtcacattggttcttagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 21781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 37569 - 37205
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| |||| |||||||| |||||| || |||||||| |    
T  37569 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggccagctgagtcgtcttaagccctatagtgcccctg 37470  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||  ||| || ||||||| |||  |||||| ||| ||||| | |||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37469 cttttaagggcaaacagaggatggtcgatgatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaa 37370  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    || ||| |  || |||   ||||| ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||| | ||  || ||||||||||| |||    
T  37369 gatcaatgcttgtcctcgagagataaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgattgcaaccataatgatattgtgtgcttcaat 37270  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37269 tgcaatgaagagggtcacattggttcttagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 37205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 667 - 291
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  667 ttggtgaacagctgtagaatttatgacgaagataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccct 568  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    | ||||| || |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||   || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  567 atagtgctcctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcgacctaagaagaagaatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtga 468  T
Q  262 gaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacatt 361  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||  | ||| | || |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||| | ||  || |||    
T  467 gaaaggccacaagagcaatgtttttccgaaagaggtaaaaagatgtttccagtgtggtaagaagggtcatgcattagctgattgcaagcataatgatatt 368  T
Q  362 gtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  367 gtgtgcttcaattgcaaagaagagggtcatattagttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 201 - 438
Target Start/End: Original strand, 10045 - 10285
Alignment:
Q  201 tcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagat 297  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||| |    
T  10045 tcgatgatagacggcctaagaagaaggatgctcctacggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtctagaggaggt 10144  T
Q  298 caagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagt 397  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    ||| |||||| || | ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||    
T  10145 aaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcatacattagctgattgtaagcatagtgatattgtgtgcttcaattgcaaggaagagggtcacattggt 10244  T
Q  398 tcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10245 tctcagtgcaagcagcctaagagggcgccgactactggtag 10285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 17112 - 17476
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||| | ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  17112 tgcaggatctatgaggaggataccaagacttattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaacagagtcgccctaagccttatagtgcccctg 17211  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| || ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||    
T  17212 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagatagacgacctaagaagaaggatgctcctacagagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 17311  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||| ||| | |||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || ||||| ||||||||     
T  17312 gagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtgggaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaac 17411  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17412 tgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagcaggcgccgactactggtag 17476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40599 - 40496
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40599 tgcagaatctataaagaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtatgggacaacagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctg 40500  T
Q  177 ctga 180  Q
    ||||    
T  40499 ctga 40496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 581 - 217
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  581 tgcaggatttatgaggaggacactaaggctcattacaaggttgtgtatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccctg 482  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||||||||| | |||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  481 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagataggcggccaaggaagaaggatgttcctgctgagattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaa 382  T
Q  274 gagcaacgtctg-ccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaa 372  Q
    |||||| |  || || ||| ||| | || |  ||| |||| | ||| ||||| ||||||    ||| ||| ||||| | ||  |||||||||||||| ||    
T  381 gagcaatgcttgtccgtga-gaggttaaaagatgtttccgatttggtaagaagggtcattcactagctgagtgcaaacataatgacattgtgtgcttcaa 283  T
Q  373 ttgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  282 ttgtaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtag 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 438
Target Start/End: Original strand, 36526 - 36947
Alignment:
Q  20 atcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtag 119  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||  |  |||||||  | || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | |    
T  36526 atcaagagggcaattggataccaacagatctgagttttctccgagttggtgaacagttgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattg 36625  T
Q  120 tgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaa 219  Q
    ||||| || ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| | |||  |||| | ||| ||||| |     
T  36626 tgaattagcggaagagtaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacaaaggatggtcgaggatagacggccaag 36725  T
Q  220 gaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgt 316  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||   |||||  |||  ||| |||| |||    
T  36726 gaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccataagagcaatgcttgtcctagagagatacagagatgtttccgatgt 36825  T
Q  317 ggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 416  Q
    || ||||| |||||||   | |  |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |  || ||||    
T  36826 ggtaagaagggtcatgcactggccgattgcaaccgtaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcttagtgcaagcaaccta 36925  T
Q  417 agagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  36926 agaaggcgccgactactggtag 36947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Original strand, 141 - 343
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  141 tgcaggatttatgatgaggatactaaggctcattacaagatcgtgaatgagcggaagactaagggtcagaagagtcgccctaagccttacagtgcccctg 240  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  241 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagatagacggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 340  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  341 gag 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3465 - 3047
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |  ||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||| | ||||| || |  ||||| |||||||    
T  3465 gacattaagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttccagatttggtgaataactacagaatttataaggaggacaccagagctcattacaagg 3366  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || |||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||  |||| |  || |||||    
T  3365 ttgttaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagaggatggtcgaggagagacggcc 3266  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    |||||| |||||||   |||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |  || ||||||||| |  |||||||| |||||    
T  3265 taagaaaaaggatgttcctgctgagattacttctttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgcttgtcctgaggaggtggagaagtgtttccgg 3166  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 413  Q
    ||||||||||| |||||     ||| ||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| || || |  ||||    
T  3165 tgtggcaagaagggtcacacattagctgattgcaaacatgctgacatcgtgtgctttaattgcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaagcagc 3066  T
Q  414 ctaagagggcgccgactac 432  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  3065 ctaatagggcgcctactac 3047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 277
Target Start/End: Original strand, 121913 - 122142
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||     ||||| ||  ||||    
T  121913 gagtttttcctgagttggtgaatagctgcagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtaaatgagcggacgactaagggccaatagag 122012  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgt 247  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||   |||    
T  122013 tcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgt 122112  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagc 277  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  122113 ttcaattgtggtgaaaaaggccacaagagc 122142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 186
Target Start/End: Original strand, 11609 - 11778
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |  ||| | ||||  | |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  11609 gacatcaagagagccatagggtatcaaaagattaaaattttctctgatttggtaagcagctgcaggatatatgaagaggacactaaggctcattataagg 11708  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagg 186  Q
    |  ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||    
T  11709 tgatgagtgagagaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaagg 11778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 194
Target Start/End: Original strand, 1655 - 1832
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||  |  | ||| ||||  | |||||||| | |||| ||| ||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  1655 gacatcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagcagcatgatatatgaagaagatactaaagctcattacaagg 1754  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    |  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  1755 tgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcatcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaga 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30826 - 30464
Alignment:
Q  79 caggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgct 178  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||| | ||||||||| ||||   || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30826 caggatttatgaggaggacactaaggttcattacaagattgtgaatgagcggaagaccaggggacaacagagtcatcctaagccgtacagtgcccctgct 30727  T
Q  179 gataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaga 275  Q
    |||||||| |||||||  ||  |||| | ||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||    
T  30726 gataaaggcaaacagagaatggtcgaggataggcggtctaagaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaagaccacaaga 30627  T
Q  276 gcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattg 375  Q
    |||| |  || || |  ||| | ||||  ||| | || ||||| ||||| ||||||    ||| ||| || || | ||  ||||||||||| ||||| ||    
T  30626 gcaatgcttgtccgggagaggtaaagagatgttttcgctgtggtaagaagggtcatacactagctgagtgtaagcataaggacattgtgtgttttaactg 30527  T
Q  376 caatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    | | |  || ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30526 cgaagaggaaggtcatattggttcacagtgtacggagcctaagaaggcgccgactactggtag 30464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11804 - 11602
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||| | ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||      
T  11804 tgcagaatttatgaggaggataccaaggctcatttcaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgctccta 11705  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11704 ctgataagggcaaacagagaatggtcgaagataggcggcctaagaagaaggatgctcatgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 11605  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  11604 gag 11602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14610 - 14423
Alignment:
Q  92 gaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaac 191  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||| || ||||    
T  14610 gaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcaacagagtcgccctaagccttatagtgcctctgctgataagggcaaac 14511  T
Q  192 agaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    |||  ||  || ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||    
T  14510 agagaatggtcaatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgttttacttgtggcgagaaaggccataagag 14423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14331 - 14261
Alignment:
Q  368 tttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14331 tttaattgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtag 14261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8952 - 8587
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  8952 tgcaggatctatgagaaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaacagagtcgccctaagccttacagtgcccctg 8853  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| || ||||||||||||||   | || | |||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||    
T  8852 ctgataagggaaaacagaggatggtcgaagatagacgacctaagaagaaggatactcctactgagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 8753  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||  ||| | |||||  ||| | || ||||| ||||| ||||||| | ||| ||| ||||| | |   || ||||| ||||||||     
T  8752 gagtaatgcttgtcctagggataccaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgctctagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaac 8653  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtg-tactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8652 tgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaaagcctaagaaggcgccgactactggtag 8587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 438
Target Start/End: Original strand, 16804 - 17193
Alignment:
Q  52 agtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagt 151  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||||| || |||||| ||||    ||||| |||||||||    
T  16804 agtttttccagatttggtgaacagctgtaggatctatgaggaggacaccagagctcattacaaggttgttaatgagcggaagactaagggccagcagagt 16903  T
Q  152 cgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtt 248  Q
     | |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||  |||| |  |  || |||||||| |||||||   |||| ||||||   ||||    
T  16904 agccctaagccatatagtgcccctgctgataagggcaaacagaggatggtcgaggagaaacgacctaagaaaaaggatgttcctgctgagattacttgtt 17003  T
Q  249 tcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || || || |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||| |||||     ||| ||| |||||    
T  17004 tcaattgtggtgagaaaggccacaagagcactgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggcaagaagggtcacacattagctgactgcaa 17103  T
Q  349 tcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
     | |   || || ||||| || || ||||| | ||||||||| ||| | || |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17104 gcatggtgatatcgtgtgtttcaactgcaaagaagagggtcatattgggtcccagtgtaagcagcctaagagggcgccgactacgggtag 17193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Original strand, 194883 - 194965
Alignment:
Q  356 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  194883 gacattgtgtgctttaattgcaataaggagggtcacattggttcgtagtgtacgcagcctaagaaggcgccgactactggtag 194965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 194691 - 194784
Alignment:
Q  137 aagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg 230  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  194691 aagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaataaggatg 194784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 132
Target Start/End: Original strand, 21326 - 21406
Alignment:
Q  52 agtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaa 132  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  21326 agtttttccagatttggtgaacagctgtaggatctatgaggaggacaccagagctcattacaaggttgttaatgagcggaa 21406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 69
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  432 tgcaggatctatgaggaagataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcagcagagtctccctaagccttacagtgcccctg 333  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||    
T  332 ctgataagggaaaacagaggatggtcgaagatagacggccaaagaagaaggatgctcctgcagagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 233  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||| |||  ||||||  ||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || || || ||||| |||    
T  232 gagtaatgcttgtcctggggatgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgcttcaat 133  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggta 437  Q
    || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| | |||||||||||||||    
T  132 tgtaatgaagatggtcacattggttcccagtgcaagaagcctaagaagacgccgactactggta 69  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3303
Alignment:
Q  76 ctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccccc 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||  ||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  3407 ctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgcccct 3308  T
Q  176 gctga 180  Q
    |||||    
T  3307 gctga 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 463 - 101
Alignment:
Q  79 caggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgct 178  Q
    |||||| ||||| || || || |||| ||| |||||| | ||||||||| ||||   || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  463 caggatttatgaggatgacactaaggttcattacaagattgtgaatgagcggaagaccaggggacaatagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 364  T
Q  179 gataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaga 275  Q
    ||||| || |||||||  ||  |||| | ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  363 gataagggcaaacagagaatggtcgaggatagacggcctaagaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaaga 264  T
Q  276 gcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattg 375  Q
    |||| |  || |  |  ||| | ||||  ||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| || || | || ||||||||||||  |||| ||    
T  263 gcaatgcttgtctgggagaggtaaagagatgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgtaagcataaagacattgtgtgtcttaactg 164  T
Q  376 caatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    | | |  || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  163 cgaagaggaaggtcatattagttcacagtgtacgaagcctaagaaggtgccgactactggtag 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 10643 - 11007
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||  ||| |||||| | ||||||||| ||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  10643 tgcaagatctatgaggaggataccaagattcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaaaagagtcgccctaagccttacagtgcccctg 10742  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| |  || |||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||    
T  10743 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagacagacggcctaagaagaaggatgctcctacagagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 10842  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||  ||| | ||| |  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || ||||| ||||||||     
T  10843 gagtaatgcttgtcctagggataccaacagatgtttccgatgtgggaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaac 10942  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10943 tacaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtag 11007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8764 - 8400
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  |    
T  8764 tgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgctcttg 8665  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    | ||||| || |||||||  ||  |||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| || || | ||||||| |||||||||||||    
T  8664 ccgataagggcaaacagagaatggtcgataataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcaaagattgtctgctttacttgtggtcagaaaggccacaa 8565  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||  |||  | |||| |||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || || || |||||||||    
T  8564 gagtaatgcttgtcctagggatgttaagaggtgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgctttaat 8465  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8464 tgcgatgaagaaggtcacattggttcacagtggaagaagcctaagaaggcgccggctactggtag 8400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 438
Target Start/End: Original strand, 30349 - 30701
Alignment:
Q  89 gaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaaggga 188  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    || || ||||||||||| |||| ||| || ||| |||| |||||||| || |    
T  30349 gaagaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaaaggccagcagagtcgccctaggccctatagtacccctgctgataagggaa 30448  T
Q  189 aacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctg 285  Q
    |||||| |||  |||| | ||  ||||| | |||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  30449 aacagaggatggtcgaggataaacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttg 30548  T
Q  286 ccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagag 385  Q
     || |  ||| | ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||| | ||  ||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  30549 tccaggagaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgattgcaaacataatgaccttgtgtgcttcaattgcaatgaagag 30648  T
Q  386 ggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||| ||||| |||| ||||| |  ||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  30649 ggttacattggttctcagtgcaagcaatctaagaaggcgccgactactagtag 30701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 194
Target Start/End: Original strand, 164160 - 164281
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||||||  ||| |||  | | ||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  164160 tagctgcaggatatatgaggagaacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaagaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaatcatacagtgcc 164259  T
Q  173 cccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    || ||||| || || |||||||    
T  164260 cctgctgacaagggaaaacaga 164281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 331
Target Start/End: Original strand, 829 - 1112
Alignment:
Q  51 gagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagag 150  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| || |||||    
T  829 gagtttttccatatttggtgaatagctgtagaatctatgatgaggataccagggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccaacagag 928  T
Q  151 tcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgt 247  Q
    | | |||||||| || |||||||| ||||||||  | | ||||| |||  | || |  || |||||||||||||||||||   || | ||||||   |||    
T  929 ttgccctaagccctatagtgcccctgctgataagcgcacacagaggatggtagaggaaagacggcctaagaagaaggatgttcctactgagattacctgt 1028  T
Q  248 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  || || || |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1029 ttcaattgtggcgagaaaggccgcaagagcattgtttgtccagaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcat 1112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15452 - 15077
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  15452 tgcaggatctatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaacagagtcgccctaagccttatagtgcccctg 15353  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| |||||||||||||||||||   || |||||||||| | |||   |||||||||||| ||||||||    
T  15352 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagatagacggcctaagaagaaggatgctcctacagagattgtttttttttcttgtggtgagaagggccacaa 15253  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    | | || |  || |||  ||| | ||| |  ||| |||| ||||| ||||| ||| |||   ||| ||| ||||| | |    | ||||| ||||||||     
T  15252 gggtaatgcttgtcctagggataccaatagatgtttccgatgtgggaagaagggttatgcactagctgagtgcaaacatgataatattgtatgctttaac 15153  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctctgctt 449  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| |||| || |||||||||| |||| |||||    
T  15152 tgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgtcggctactggtagagtctttgctt 15077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9485 - 9124
Alignment:
Q  80 aggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| || | ||||| ||| ||||||  ||||| || ||||||||  |||| || || |||||||| | ||    
T  9485 aggatctatgaggaggataccaagactcattactagattgtgaaggagcggaaagctaagggtcaacagagtcgcgctaatccttatagtgcccctggtg 9386  T
Q  180 ataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    |||| || ||||||| |||  |||| | |||    ||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  9385 ataagggcaaacagaggatggtcgaagatagataacctaagaagaaggatgctcctgcaaagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaagag 9286  T
Q  277 caacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgc 376  Q
     || |  || |||| ||| | |||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || |||||  ||||||| |||    
T  9285 taatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtgggaagaagggtcatgcactagttgagtgcaaacatgatgatattgtacgctttaactgc 9186  T
Q  377 aatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9185 aatgaagagggtcacattggttcacagtgtaagcagcctaagaaggcgccggctactggtag 9124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 435
Target Start/End: Original strand, 50108 - 50469
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||| |  | |||  |||||||||  |||||||| || || ||||| |    
T  50108 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaagatcgtgaatgagcggaaggctatgggctagcagagtctccctaagccttatagcgcccctg 50207  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  50208 ctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaa 50307  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
     ||||| |  || || |  |||   ||||  ||| | || ||||| ||||| || ||     ||| ||| || || ||||  |||||||||||||| |||    
T  50308 aagcaatgcttgtccgggagagggaaagagatgttttcgctgtgggaagaagggacacacactagctgagtgtaagcgtaatgacattgtgtgcttcaat 50407  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactgg 435  Q
    || |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  50408 tgtaatgaagagggtcatattggttcacaatgtacgaagcctaaaaaggcgccgactactgg 50469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 43234 - 43122
Alignment:
Q  82 gatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgat 181  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||| | || |   ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  43234 gatctatgatgaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtaagcgccgaggcaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgac 43135  T
Q  182 aaagggaaacaga 194  Q
    || || |||||||    
T  43134 aagggtaaacaga 43122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 1247 - 1455
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1247 agctgtaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagaggagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctc 1346  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggcca 270  Q
    | ||||| || || |||||||| ||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  1347 ctgctgacaagggaaaacagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggcca 1446  T
Q  271 caagagcaa 279  Q
    |||||||||    
T  1447 caagagcaa 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 276
Target Start/End: Original strand, 9220 - 9408
Alignment:
Q  91 agaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaa 190  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||  |||    ||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  9220 agaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagccgaagactaagggtcagcagagtcgccttaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaa 9319  T
Q  191 cagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    | ||  ||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9320 ccgagaatggtcgaagataggcggccttagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagag 9408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 330
Target Start/End: Original strand, 28631 - 28947
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |  || ||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| |||||||    
T  28631 gacattaagagggcgatcggataccaacagatccgaatttttccagatttagtgaacagctgcagaatctacgaggaggacaccagagctcattacaagg 28730  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcc 216  Q
    | || ||||||  |||    ||||| |||||| || | |||||||| || |||||||| | |||||| || |||||||  ||  |||| |  || |||||    
T  28731 ttgttaatgagcagaagactaagggccagcagtgttgccctaagccatatagtgcccctgttgataagggcaaacagagaatggtcgaggagagacggcc 28830  T
Q  217 taagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccgg 313  Q
    ||||||||||||||   ||||  |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||| ||||| | ||||| ||| |||||    
T  28831 taagaagaaggatgttcctgctaagattacctgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctaaggaggtaaagaaatgtttccgg 28930  T
Q  314 tgtggcaagaaaggtca 330  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28931 tgtggcaagaagggtca 28947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 356
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| | |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  558 tgcaggatatatgaggaggataccaaggctcattataagattgtgaatgagcagaaagccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 459  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||| ||  ||  | |||| |||| ||||||||||||| |||||   ||  |||||||| || |  | |||||||||||||||||||||    
T  458 ctgataagggtaaaccgagaatggttgatgataggtggcctaagaagaaagatgctcttgtggagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 359  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  358 gag 356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4975 - 4773
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| | |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  4975 tgcaggatatatgaggaggataccaaggctcattataagattgtgaatgagcagaaagccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 4876  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||| ||  ||  | |||| |||| ||||||||||||| |||||   ||  |||||||| || |  | |||||||||||||||||||||    
T  4875 ctgataagggtaaaccgagaatggttgatgataggtggcctaagaagaaagatgctcttgtggagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 4776  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  4775 gag 4773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 194
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  273 attgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgtaagaagcctaagaaggcgcaggctactggtag 194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4611
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  4690 attgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgtaagaagcctaagaaggcgcaggctactggtag 4611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Original strand, 23708 - 23910
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| | |||||||||  |||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  23708 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattataagattgtgaatgagcagaaagctaaaggtcagcagagtcgtcctaagccatacagtgctcctg 23807  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  | |||| |||| ||||||||||||| ||| |   ||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  23808 ctgataagggcaaacagagaatggttgatgataggtggcctaagaagaaagatactcatgttgagattgtctgttatacttgtggtgagaaaggccacaa 23907  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  23908 gag 23910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11569 - 11454
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  11569 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtcccaagccttatagtgcccctg 11470  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||| || |||||    
T  11469 ctgataagggcaaaca 11454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7041 - 6886
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  7041 tgcaggatctacgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgcccctg 6942  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct 232  Q
    |||||||  | ||||||| |||  |||| | ||| || ||||||||||||||||||    
T  6941 ctgataagtgcaaacagaggatggtcgaagatagacgacctaagaagaaggatgct 6886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4077 - 3728
Alignment:
Q  92 gaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaac 191  Q
    ||||||||  || |||| |||||| | || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||    
T  4077 gaggatacctagactcattacaagattgtaaatgagaggaaaaccaaaggtcagcagagtcgtcctaagtcttacagtgctcctgctgataagggtaaac 3978  T
Q  192 agaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccc 288  Q
    |||  ||  | |||| |||||||||||||||||| ||||   |||| || ||||| || |  | || ||||| ||||| ||||||||| || |  || ||    
T  3977 agagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaagatgctcctgctgaaattgtctgctatacttatggtgtgaaagaccacaagagtaatgcttgtcc 3878  T
Q  289 tgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggt 388  Q
    || |||  | |||| |||| | || ||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||   |   || ||||||||||||||||||||||  || |||    
T  3877 tggggatgtgaagaggtgttttcgttgtggtaagaaaggtcatgcactagctgagtgcaaaaatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggt 3778  T
Q  389 cacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3777 cacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtag 3728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 407
Target Start/End: Original strand, 4318 - 4651
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| || | |||||| | ||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  4318 tgcaggatatatgaggaggataccaagacttattacaagattgtgaatgagcggaaaaccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 4417  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| |  |||||||  ||  | |||| |||||||||||||||||| ||||   |||  |||||||| || |  | ||||||||| |||||||||||    
T  4418 ctgataaggataaacagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaagatgctcctgtggagattgtctgctatacttgtggtgaaaaaggccacaa 4517  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || |||| |||  | ||||  ||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || |||||||||||||||    
T  4518 gagtaatgcttgtcctggggatgtgaagagatgttttcgttgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaat 4617  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgta 407  Q
    |||||||  || ||||||||| |||| |||||||    
T  4618 tgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgta 4651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2530 - 2166
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  2530 tgcaggatttacgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaggccaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcccttg 2431  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || ||| |||  ||  | |||| ||| || ||||||||||| ||||   || | ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  2430 ctgataagggaaaatagagaatggttgatgatagacgccctaagaagaaagatgttcctactgagattgtgtgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 2331  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    |||||| |  || | || |||  | || | |||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || |||||||| ||||||    
T  2330 gagcaatgcttgtcatggggatgttaataggtgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgaggatattgtgtgttttaat 2231  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||||  || ||||||||| |||||||||| |   |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  2230 tgcaatgaggaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaatgcgcagactactggtag 2166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 183
Target Start/End: Original strand, 216199 - 216289
Alignment:
Q  93 aggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataa 183  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  216199 aggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataa 216289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19939 - 19822
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  19939 tgcaggatctatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctg 19840  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  19839 ctgataagggaaaacaga 19822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42173 - 42056
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  | |    
T  42173 tgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgcttctg 42074  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  42073 ctgataagggtaaacaga 42056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 75893 - 75776
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  | |    
T  75893 tgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgcttctg 75794  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  75793 ctgataagggtaaacaga 75776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 441
Target Start/End: Original strand, 34763 - 34845
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34763 attgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaagctgcctaagaaggcgccgactactggtagggt 34845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 34534 - 34651
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  34534 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccctg 34633  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  34634 ctgataagggcaaacaga 34651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41888 - 41809
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41888 attgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtag 41809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 75608 - 75529
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  75608 attgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtag 75529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 17187 - 17350
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||  ||||| | ||  | |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  17187 gacatcaagagagccatagggtagcaacagattagaatcttctctgatttggtaaatcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagctcattataagg 17286  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |  ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17287 tgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctga 17350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Original strand, 4618 - 4709
Alignment:
Q  83 atctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 174  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||| || |||||  ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4618 atctatgaggaggacacaaaacctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccc 4709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Original strand, 14028 - 14143
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  14028 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 14127  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
     |||||| || |||||    
T  14128 atgataagggaaaaca 14143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15951 - 15836
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  15951 tgcagaatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagtttccgcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 15852  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||| || |||||    
T  15851 ctgataagggcaaaca 15836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1014 - 797
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1014 ttggttaacagatgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 915  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |  | |||| |||| ||||||||| ||  ||||   || | |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  914 acagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagttgattgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtga 815  T
Q  262 gaaaggccacaagagcaa 279  Q
     |||||||||||||||||    
T  814 aaaaggccacaagagcaa 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Original strand, 62531 - 62638
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  62531 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaaggggcagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcc 62630  T
Q  173 cccgctga 180  Q
    || |||||    
T  62631 cctgctga 62638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 183
Target Start/End: Original strand, 65081 - 65191
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||| |     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||    
T  65081 tagctgcagaatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaaggaataatggacaacagagtcgcccgaagccatatagtgcc 65180  T
Q  173 cccgctgataa 183  Q
    || ||||||||    
T  65181 cctgctgataa 65191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1241 - 1159
Alignment:
Q  356 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1241 gacattgtgtgctttaattgcaattaggagggtcacattggttcacagtgtaagaagcctaagaaggcgccgactactggtag 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 694 - 330
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |  ||||| |||||||| || |||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  694 ttggtgaatagttgcagaatttatgaggaggacaccagagctcattacaaggttgttaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagcctt 595  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    | ||| |||| | |||||| || ||||||| |||  |||| |  || || || ||||| |||||||   |||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  594 atagttcccctgttgataagggcaaacagaggatggtcgaggagagacgacccaagaaaaaggatgttcctgttgagattacttgtttcaattgtggtga 495  T
Q  262 gaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacatt 361  Q
    ||||||||||||||| |  |  || | ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||     ||| ||||||||| | | | |||||     
T  494 gaaaggccacaagagtactgcttgtcgtgaggaggtgaaggagtgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagttgattgcaagcatgctgacatc 395  T
Q  362 gtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgcc 426  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| || || |  |||||||||| ||||||    
T  394 gtgtgctttaattgcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagaaggcgcc 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 30086 - 30294
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| || || ||| ||||||||  || |||||| | |||| ||||||||| || |||||||| |    
T  30086 agctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattactagataatgagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaaaccttacagtgctc 30185  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggcca 270  Q
    | ||||| |||||||||||||||||    ||||  ||| |||| |||| ||| ||||   |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  30186 ctgctgacaaagggaaacagaagatgaatgatgacaggaggcccaagaggaaagatgctcctgctgagattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggcca 30285  T
Q  271 caagagcaa 279  Q
    |||||||||    
T  30286 caagagcaa 30294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 194
Target Start/End: Original strand, 1071 - 1191
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  1071 agctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctc 1170  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    | ||||| || || |||||||    
T  1171 ctgctgacaagggtaaacaga 1191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8288 - 8168
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  8288 agctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctc 8189  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    | ||||| || || |||||||    
T  8188 ctgctgacaagggtaaacaga 8168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 1067 - 1272
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |    
T  1067 tgcaggatttacgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggaaagggacagaagaatcgtcctaagccttacagtgctcctg 1166  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    |||| ||||| || ||||||||    |||| |||| | || |||| ||  ||||   |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1167 ctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaa 1266  T
Q  274 gagcaa 279  Q
    ||||||    
T  1267 gagcaa 1272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7414 - 7308
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |    
T  7414 tgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaaaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctg 7315  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  7314 ctgataa 7308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14544 - 14438
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |    
T  14544 tgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaaaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctg 14445  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  14444 ctgataa 14438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 9550 - 9656
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9550 tgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctg 9649  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  9650 ctgataa 9656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 50649 - 50543
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  50649 agctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtggtccgaagccgtatagtgccc 50550  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  50549 ctgctga 50543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30463 - 30333
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||  | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30463 ttggttaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagacaatgagtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagcctt 30364  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaa 195  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  30363 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaa 30333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30312 - 30267
Alignment:
Q  237 agattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgt 282  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30312 agattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgt 30267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 279
Target Start/End: Original strand, 514125 - 514321
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 185  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  514125 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaag 514224  T
Q  186 ggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 279  Q
    | ||  |||||||    |||| |||| ||||||||| ||  ||||   || | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  514225 gaaagaagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaa 514321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 496515 - 496446
Alignment:
Q  123 atgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || | |||||| || |||||    
T  496515 atgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctgttgataagggcaaaca 496446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21359 - 21238
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21359 tagctgcagaatatatgaggaagataggaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtaaaggcaagggacagtagagtcgtcctaaaccgtatagtgcc 21260  T
Q  173 cccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  21259 cctgctgacaaaggaaaacaga 21238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 40270 - 40387
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40270 tgcaggatttacgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaggccaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcccctg 40369  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  40370 ctgataagggaaaacaga 40387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 438
Target Start/End: Original strand, 40564 - 40634
Alignment:
Q  368 tttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| || | || ||||||||||    
T  40564 tttaattgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggtgtcggctactggtag 40634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 48271 - 48154
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  48271 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 48172  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  48171 ctgataagggtaaacaga 48154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 55234 - 55351
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| || |    
T  55234 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagacaaaggtcagcagagtcgtcctaagacttacagtgctcctg 55333  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    ||||||| || |||||||    
T  55334 ctgataagggtaaacaga 55351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Original strand, 66856 - 66965
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  66856 gatttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggcaagggacagcagaatcgtcctaagc 66955  T
Q  162 cgtacagtgc 171  Q
    | ||||||||    
T  66956 cttacagtgc 66965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 110670 - 110787
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |    
T  110670 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagccgtcctaagcctcacagtgctcctg 110769  T
Q  177 ctgataaagggaaacaga 194  Q
    | ||||| ||||| ||||    
T  110770 ccgataaggggaagcaga 110787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18386 - 18280
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| ||||| |||| ||| || |    
T  18386 tgcagaatttatgaagaagataccaaagctcattacaaggctgtgaatgagaggaaaggtaaaggtcagaaaagtcgtccaaagccttacaatgctcctg 18287  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  18286 ctgataa 18280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 438
Target Start/End: Original strand, 110961 - 111034
Alignment:
Q  365 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  110961 tgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtag 111034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Original strand, 98343 - 98440
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  98343 agctgtaggatcaatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtaatgagtgaaaggagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtgc 98440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 176543 - 176434
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  176543 gatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaac 176444  T
Q  162 cgtacagtgc 171  Q
    |||| |||||    
T  176443 cgtatagtgc 176434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 176368 - 176326
Alignment:
Q  234 cagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  176368 cagagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 176326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 152 - 53
Alignment:
Q  83 atctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgata 182  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  152 atctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaa-ggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgata 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 23674 - 23888
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||| || ||| |  ||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23674 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaaactcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagcctt 23773  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  23774 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgatacaagtgtggtga 23873  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  23874 gaaaggccacaagag 23888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30083 - 29959
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| || |    
T  30083 gatttggtgagtagttgtagaatctatgaagaggatacaaaggctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaaac 29984  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctgataaagg 186  Q
    |||  ||||| || ||||| |||||    
T  29983 cgtctagtgctcctgctgacaaagg 29959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42288 - 42074
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| |    
T  42288 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 42189  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  42188 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 42089  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||||||||||||    
T  42088 gaaaggccacaagag 42074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 104767 - 104565
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |    
T  104767 tgcaggatttatgaggaggatactaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttatagtgctcctg 104668  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  | ||||  ||||||||||  ||||| ||||   |||  |||||||| || |  | |||||||||||||||||||||    
T  104667 ctgataagggaaaacagagaatgattgatgagaggcggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 104568  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  104567 gag 104565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 64305 - 64468
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||  ||||| ||||  | |||||||| | | | |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||    
T  64305 gacatcaagagagccatagggtatcaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataagg 64404  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |  ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  64405 tgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctga 64468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 48883 - 49046
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||  ||||| ||||  | |||||||| | | | |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||    
T  48883 gacatcaagagagccatagggtatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataagg 48982  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |  ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  48983 tgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctga 49046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 57917 - 58080
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||  ||||| ||||  | |||||||| | | | |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||    
T  57917 gacatcaagagagccatagggtatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataagg 58016  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |  ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  58017 tgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctga 58080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30168 - 30062
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  30168 agctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctc 30069  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  30068 ctgctga 30062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 1608 - 1714
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||| |||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608 agctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcggaggggtaagggaaaacagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 1707  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  1708 ctgctga 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 5662 - 5768
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  5662 agctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctc 5761  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  5762 ctgctga 5768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34893 - 34775
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34893 gatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagc 34794  T
Q  162 cgtacagtgcccccgctga 180  Q
     ||| ||||| || |||||    
T  34793 tgtatagtgctcctgctga 34775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34713 - 34667
Alignment:
Q  239 attgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctg 285  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34713 attgtttgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctg 34667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 441
Target Start/End: Original strand, 69366 - 69551
Alignment:
Q  255 gtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtac 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || || || ||| | || |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||| | ||     
T  69366 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccggaagaggtaaaaagatgtttccagtgtggtaagaagggtcatgcattagctgattgcaagcata- 69464  T
Q  355 agacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggt 441  Q
    | | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  69465 atatattgtgtgcttcaattgcaaagaagagggtcacattggttctcagtgcaagtagcctaagaaggtgccgactactggtagggt 69551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 66302 - 66410
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 185  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  66302 tatgaggaagataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagg 66401  T
Q  186 ggaaacaga 194  Q
    | |||||||    
T  66402 gcaaacaga 66410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2372 - 2275
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 174  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2372 tgcaagatctatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccc 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 1358 - 1572
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || ||||| |||||  || ||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  1358 ttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaacataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcataagcctt 1457  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtga 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||| |||| ||||||||| ||  ||||   || | |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1458 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtga 1557  T
Q  262 gaaaggccacaagag 276  Q
    |||||| ||||||||    
T  1558 gaaaggacacaagag 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 186
Target Start/End: Original strand, 621 - 732
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  621 agctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcac-ataaggtgatgagtgagtgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtacagtgctc 719  T
Q  174 ccgctgataaagg 186  Q
    | ||||| |||||    
T  720 ctgctgacaaagg 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10160 - 9958
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| |||||| ||  || |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  10160 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagatcgtgaatgagcggaaagccacaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 10061  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    || |||| || ||||| |  ||  | ||||  ||||| |||| |||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||    
T  10060 ctaataagggtaaacaaagaatggttgatgagaggcgccctaggaagaaagatgctcctgtcgagattgtatgttgtacttgtggtgagaaaggccataa 9961  T
Q  274 gag 276  Q
    |||    
T  9960 gag 9958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 281
Target Start/End: Original strand, 33132 - 33342
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  33132 agctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgctc 33231  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggcca 270  Q
    | ||||| ||||| ||||||| |||    ||||  ||| |||| |||| ||  ||||   |||  || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  33232 ctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggcca 33331  T
Q  271 caagagcaacg 281  Q
    |||||||||||    
T  33332 caagagcaacg 33342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 263824 - 263664
Alignment:
Q  20 atcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtag 119  Q
    |||||||| || || ||||| |||||  ||||| ||||  | |||||||| | | | |||||||||||||| ||||| || || | ||| || |||||      
T  263824 atcaagagagccatagggtaccaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagttcattataaggtga 263725  T
Q  120 tgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  263724 tgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcttaagccgtacagtgcccctgctga 263664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 438
Target Start/End: Original strand, 2125 - 2390
Alignment:
Q  176 gctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgc---agagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccaca 272  Q
    |||||||| || ||||||| |||  |||| | ||| ||||| ||||||||||||||| |   ||||||||| |||||   ||||||||| || |||||||    
T  2125 gctgataagggcaaacagaggatggtcgaagatagacggccgaagaagaaggatgctcctgtagagattgtttgtttttcttgtggtgacaagggccaca 2224  T
Q  273 agagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaa 372  Q
    |||| || |  || |||| ||| | |||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || ||||| ||||||||    
T  2225 agagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtgggaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaa 2324  T
Q  373 ttgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
     | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  2325 ctacaatgaagagggtcacattggttcatagtgtaagtagcctaagaaggtgccggctactggtag 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Original strand, 23296 - 23411
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | | |||||| ||||| |||||||| || |    
T  23296 tgcagaatatatgaggaagatactaagggtcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaaaggtcagtaaactcgtccaaagccttacagtgctcctg 23395  T
Q  177 ctgataaagggaaaca 192  Q
    ||||||| || |||||    
T  23396 ctgataagggaaaaca 23411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Original strand, 11461 - 11627
Alignment:
Q  32 attgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagagga 131  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  11461 attgggtatcaacagatcagagtcttttcggagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagga 11560  T
Q  132 aaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagat 198  Q
      || |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  11561 ggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacattgctcttgctgacaaaggaaagcagaagat 11627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5890
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgta 165  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||  ||| |||| | | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  5982 tagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagcttattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacaacatagtcgtccgaagccgta 5890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 305 - 411
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    |||||||| ||||| || || ||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||| |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  305 agctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtcccc 404  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  405 ctgctga 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11042 - 10994
Alignment:
Q  359 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgta 407  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||    
T  11042 attgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgta 10994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 17740 - 17846
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  17740 tgcagaatttatgaggaggatactaagactcattacaagatcgtgaatgagcgaaaagccaaaggttagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 17839  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  17840 ctgataa 17846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 194
Target Start/End: Original strand, 4070 - 4184
Alignment:
Q  80 aggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||  ||| |||| | | ||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| || ||||    
T  4070 aggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaagtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctg 4169  T
Q  180 ataaagggaaacaga 194  Q
    | ||||| |||||||    
T  4170 acaaaggtaaacaga 4184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Original strand, 13805 - 13926
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| || ||| || ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13805 ttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattaaaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 13904  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagg 186  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  13905 acagtgctcctgctgacaaagg 13926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17169 - 17084
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17169 tatgaagagaataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcaaaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgc 17084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 37483 - 37386
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37483 agctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgc 37386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 600 - 492
Alignment:
Q  84 tctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataa 183  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  600 tctatgaggaggatactaaagctcattacaaggctgtgagtgagaggaaaggtaagggtcagcaaagtcgcccaaagccttacagcgctcctgctgataa 501  T
Q  184 agggaaaca 192  Q
     || |||||    
T  500 gggtaaaca 492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52195 - 52075
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| |    
T  52195 agctgtaggatttatgaagaggatacaaaggctcattataaagtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagccgtccgaaactgtatagtgctc 52096  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  52095 ctgctgacaaaggtaaacaga 52075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 52030 - 51990
Alignment:
Q  236 gagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 276  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52030 gagattatctgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagag 51990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1105 - 942
Alignment:
Q  17 gacatcaagagggcgattgggtatcaacaacttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaagg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||  |  ||||| ||||  | || ||||| | ||||||||| || ||||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  1105 gacatcaagagagccattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggataataaggctcattacaagg 1006  T
Q  117 tagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |  ||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||    
T  1005 tgatgagtgagcgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctga 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 180
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6123
Alignment:
Q  137 aagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 180  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6080 aagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19190 - 18827
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | ||||  || || | ||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  19190 tgcaggatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagctaaaggtc-gcaaagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 19092  T
Q  177 ctgataaagggaaacagaagattttcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaa 273  Q
    ||||||| || |||||||  ||  | |||| |||||| || || ||||| ||   | |||  || ||||| || |  | |||||||||||||||||||||    
T  19091 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgataggcgccccaaaaagaaagaagctcctgttgaaattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 18992  T
Q  274 gagcaacgtctgccctgaggagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagatgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaat 373  Q
    ||| || |  || || | |||  | |||| |||| | || ||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||| | |   || |||||||||||||||    
T  18991 gagtaatgcttgtcccggggatgtgaagaggtgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaat 18892  T
Q  374 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||||  || ||||||||| |||| | |||||   ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18891 tgcaatgaggaaggtcacattggttcgctgtgtaagaagcctaagaaggcgcagactattggtag 18827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17780 - 17686
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    ||||| || |||||||| || || || ||||| || ||| || ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17780 tgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgc 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 116168 - 116062
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||   || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  116168 agctgtaggatctgtgaagaagatttgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctc 116069  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  116068 ctgctga 116062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Original strand, 1020 - 1129
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | ||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  1020 gatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaac 1119  T
Q  162 cgtacagtgc 171  Q
    |||| |||||    
T  1120 cgtatagtgc 1129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9097 - 9036
Alignment:
Q  135 gcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaag 196  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  9097 gcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaag 9036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11530 - 11409
Alignment:
Q  65 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 164  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  11530 ttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggtcagcagattcgtcctaagcctt 11431  T
Q  165 acagtgcccccgctgataaagg 186  Q
    | ||||| || ||||| |||||    
T  11430 atagtgctcctgctgacaaagg 11409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 183
Target Start/End: Original strand, 13246 - 13343
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataa 183  Q
    ||||| || ||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| | | |||||| || ||||||||    
T  13246 tatgaggaagatactaaggctcgttacgaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagttgtccaaagtcttgcagtgctcctgctgataa 13343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5598 - 5477
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||  | | ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||     
T  5598 tagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaagaggtaaaggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgct 5499  T
Q  173 cccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  5498 cctgctgataagggaaaacaga 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Original strand, 28033 - 28142
Alignment:
Q  62 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 161  Q
    |||||||| | ||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  28033 gatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaac 28132  T
Q  162 cgtacagtgc 171  Q
    |||| |||||    
T  28133 cgtatagtgc 28142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 16372 - 16481
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| |||  || ||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || |    
T  16372 tgcaggatctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttatgagtgagcggaggggtaagagtcagcagagtcgtccaaagccttatagtgctcctg 16471  T
Q  177 ctgataaagg 186  Q
    ||||||||||    
T  16472 ctgataaagg 16481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6348 - 6251
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6348 agctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgc 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Original strand, 991 - 1099
Alignment:
Q  75 gctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 174  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||   || |||| | | ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  991 gctgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgaagagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgcccc 1090  T
Q  175 cgctgataa 183  Q
     ||||||||    
T  1091 ggctgataa 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 70652 - 70532
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||  ||| |||| | | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  70652 agctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaaaccgtatagtgctc 70553  T
Q  174 ccgctgataaagggaaacaga 194  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  70552 ctgctgacaaaggtaaacaga 70532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 152
Target Start/End: Original strand, 63298 - 63377
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtc 152  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | | |||||||| |||||||||||    
T  63298 tagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaaggtacagcagagtc 63377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2292 - 2199
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 171  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  2292 tgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggttttgaaggagaggaaaggtaatagtcagcaaagtcgt-ctaagccttacagtgc 2199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 1185 - 1291
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 176  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| | || |||| |||||| ||||| |||||| | || |    
T  1185 tgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcatcacaaggctgtgagtgagaggaaaggtaagagtcaacagaatcgtccaaagccttacagtactcctg 1284  T
Q  177 ctgataa 183  Q
    |||||||    
T  1285 ctgataa 1291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 12174 - 12280
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||||||  ||| |||  | | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  12174 agctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtgatgagtgatcgtagaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctc 12273  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  12274 ctgctga 12280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 20354 - 20460
Alignment:
Q  74 agctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 173  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||||||  ||| |||  | | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  20354 agctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtgatgagtgatcgtagaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctc 20453  T
Q  174 ccgctga 180  Q
    | |||||    
T  20454 ctgctga 20460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5725 - 5624
Alignment:
Q  73 tagctgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 172  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||  ||| ||||   | || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  5725 tagctacaagatttatgaagaggataccaaagctcattacaaagtgatgagtgagcatagagtcaagggacagcagagtcatcggaagccgtacagtgcc 5626  T
Q  173 cc 174  Q
    ||    
T  5625 cc 5624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5629 - 5536
Alignment:
Q  77 tgcaggatctatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtg 170  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || | | | ||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  5629 tgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggttgtgaatgagaggaagggtaggagtcagcaaagtcgtctaaagccttacagtg 5536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 438
Target Start/End: Original strand, 24766 - 24839
Alignment:
Q  365 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtag 438  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24766 tgctttaactgcaatgaggagcgtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccgactacttgtag 24839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6134 - 6026
Alignment:
Q  86 tatgaagaggatacaaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaaggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 185  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||  ||| |||| | | ||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  6134 tatgaagaggatacgaaagctcattataaagtgatgagtgagcgcagaggtaagggtcagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaag 6035  T
Q  186 ggaaacaga 194  Q
    | |||||||    
T  6034 gaaaacaga 6026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Original strand, 103 - 135
Alignment:
Q  133 aggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgta 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  103 aggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgta 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University