View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12801_low_2 (Length: 379)

Name: NF12801_low_2
Description: NF12801
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12801_low_2
NF12801_low_2
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (14-367)||(16625160-16625513)
chr3 (14-367)||(18531734-18532087)
chr3 (13-376)||(7074557-7074920)
chr3 (14-376)||(8297318-8297680)
chr3 (13-376)||(10397478-10397841)
chr3 (29-376)||(18052623-18052970)
chr3 (13-376)||(18290903-18291266)
chr3 (13-376)||(18306204-18306567)
chr3 (14-376)||(15739644-15740006)
chr3 (13-366)||(20067388-20067741)
chr3 (14-366)||(15891266-15891618)
chr3 (13-376)||(18275602-18275965)
chr3 (14-336)||(6193661-6193983)
chr3 (14-376)||(22386128-22386490)
chr3 (14-376)||(35882112-35882474)
chr3 (13-376)||(20575397-20575760)
chr3 (13-376)||(48467272-48467635)
chr3 (13-376)||(21676038-21676401)
chr3 (50-376)||(18332010-18332336)
chr3 (14-366)||(4722977-4723329)
chr3 (13-376)||(4345237-4345600)
chr3 (13-376)||(18226536-18226899)
chr3 (14-376)||(8288021-8288383)
chr3 (13-367)||(11108908-11109262)
chr3 (14-376)||(29147305-29147667)
chr3 (13-376)||(29663520-29663883)
chr3 (13-367)||(8213083-8213437)
chr3 (13-366)||(32440499-32440852)
chr3 (13-336)||(18244084-18244407)
chr3 (13-376)||(28114504-28114867)
chr3 (29-279)||(4795300-4795550)
chr3 (13-367)||(5468330-5468684)
chr3 (13-367)||(5594916-5595270)
chr3 (14-376)||(22869406-22869768)
chr3 (14-376)||(22884465-22884827)
chr3 (13-376)||(5015057-5015420)
chr3 (13-376)||(6541012-6541375)
chr3 (13-376)||(24329504-24329867)
chr3 (13-376)||(31963023-31963386)
chr3 (13-376)||(51783368-51783731)
chr3 (297-367)||(5652858-5652928)
chr3 (297-367)||(4626415-4626485)
chr3 (297-367)||(5713698-5713768)
chr3 (297-367)||(5724608-5724678)
chr3 (297-367)||(5767690-5767760)
chr3 (297-367)||(17993501-17993571)
chr3 (13-376)||(4418264-4418627)
chr3 (296-366)||(4795192-4795262)
chr3 (13-126)||(20441462-20441575)
chr3 (13-126)||(41438588-41438701)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (14-367)||(1901657-1902010)
chr4 (14-367)||(15229269-15229622)
chr4 (14-367)||(15283446-15283799)
chr4 (14-367)||(15389896-15390249)
chr4 (13-376)||(34187469-34187832)
chr4 (13-336)||(36343064-36343387)
chr4 (14-336)||(24590904-24591226)
chr4 (13-376)||(14761813-14762176)
chr4 (29-376)||(14666433-14666780)
chr4 (13-376)||(6571252-6571615)
chr4 (13-376)||(30755153-30755516)
chr4 (13-376)||(31125027-31125390)
chr4 (122-376)||(17014551-17014805)
chr4 (14-376)||(24114062-24114424)
chr4 (13-376)||(33672307-33672670)
chr4 (13-376)||(39852037-39852400)
chr4 (13-376)||(14099940-14100303)
chr4 (13-376)||(54834786-54835149)
chr4 (13-376)||(5007272-5007635)
chr4 (13-336)||(40104187-40104510)
chr4 (13-335)||(18799163-18799485)
chr4 (13-213)||(21971100-21971300)
chr4 (13-376)||(27161825-27162188)
chr4 (297-367)||(24460281-24460351)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (14-367)||(19454929-19455281)
chr2 (14-367)||(21701671-21702024)
chr2 (13-376)||(37376541-37376904)
chr2 (13-376)||(27805087-27805450)
chr2 (29-376)||(28883610-28883957)
chr2 (122-376)||(20839390-20839644)
chr2 (13-376)||(27778602-27778965)
chr2 (13-367)||(13935051-13935405)
chr2 (14-336)||(23127104-23127426)
chr2 (13-376)||(12588190-12588553)
chr2 (13-376)||(12715100-12715463)
chr2 (13-376)||(16827836-16828199)
chr2 (13-376)||(16893282-16893645)
chr2 (13-376)||(32051178-32051541)
chr2 (13-376)||(34287734-34288097)
chr2 (13-376)||(34292794-34293157)
chr2 (13-376)||(39050320-39050683)
chr2 (13-376)||(40234891-40235254)
chr2 (13-367)||(9348489-9348843)
chr2 (14-366)||(27432952-27433304)
chr2 (13-376)||(259251-259614)
chr2 (13-336)||(27818360-27818683)
chr2 (14-366)||(12656923-12657275)
chr2 (13-279)||(19415094-19415360)
chr2 (13-279)||(31877661-31877927)
chr2 (13-376)||(11633683-11634046)
chr2 (13-376)||(37949820-37950183)
chr2 (297-367)||(3785160-3785230)
chr2 (297-367)||(27119194-27119264)
chr2 (297-367)||(31890993-31891063)
chr2 (297-367)||(34157516-34157586)
chr2 (13-376)||(34863060-34863423)
chr2 (297-367)||(34302968-34303038)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (14-367)||(16448402-16448755)
chr7 (14-367)||(16042709-16043062)
chr7 (14-376)||(5129378-5129740)
chr7 (14-366)||(5160905-5161257)
chr7 (14-326)||(10915313-10915625)
chr7 (29-376)||(16501796-16502143)
chr7 (14-376)||(11423172-11423534)
chr7 (13-376)||(5145735-5146098)
chr7 (13-367)||(26536274-26536628)
chr7 (29-376)||(16516832-16517179)
chr7 (13-336)||(26436642-26436965)
chr7 (13-376)||(26514166-26514529)
chr7 (13-376)||(31126305-31126668)
chr7 (13-376)||(26318264-26318627)
chr7 (13-376)||(31562785-31563148)
chr7 (14-336)||(2155959-2156281)
chr7 (13-376)||(26273489-26273852)
chr7 (297-367)||(2108567-2108637)
chr7 (13-376)||(3446691-3447054)
chr7 (13-376)||(9620036-9620399)
chr7 (13-376)||(16734855-16735218)
chr7 (13-376)||(16749909-16750272)
chr7 (13-376)||(17524917-17525280)
chr7 (13-376)||(17527935-17528298)
chr7 (13-279)||(24591033-24591299)
chr7 (297-367)||(45733971-45734041)
chr7 (297-376)||(4201058-4201137)
chr7 (297-360)||(31088033-31088096)
chr7 (13-126)||(800159-800272)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (14-367)||(22889863-22890216)
chr5 (18-367)||(25200427-25200776)
chr5 (122-367)||(25264686-25264931)
chr5 (14-366)||(23893600-23893952)
chr5 (13-366)||(15657176-15657529)
chr5 (13-376)||(18499136-18499499)
chr5 (13-366)||(33293918-33294271)
chr5 (13-366)||(41676102-41676455)
chr5 (14-366)||(11550748-11551100)
chr5 (14-366)||(30936027-30936379)
chr5 (14-376)||(33778881-33779243)
chr5 (14-366)||(24686573-24686925)
chr5 (14-366)||(24971412-24971764)
chr5 (14-376)||(23750856-23751218)
chr5 (14-376)||(22997520-22997882)
chr5 (14-376)||(23716394-23716756)
chr5 (13-376)||(24682833-24683196)
chr5 (13-376)||(24725360-24725723)
chr5 (13-282)||(33517749-33518018)
chr5 (13-376)||(12133548-12133911)
chr5 (13-376)||(40471955-40472318)
chr5 (13-376)||(9318844-9319207)
chr5 (13-376)||(13323235-13323598)
chr5 (13-376)||(28650628-28650991)
chr5 (13-376)||(37357049-37357412)
chr5 (13-336)||(37669929-37670252)
chr5 (13-376)||(43079645-43080008)
chr5 (13-366)||(18125811-18126164)
chr5 (13-376)||(3790934-3791297)
chr5 (13-376)||(15757263-15757626)
chr5 (13-376)||(26481784-26482147)
chr5 (13-376)||(28958192-28958555)
chr5 (13-376)||(34617911-34618274)
chr5 (13-376)||(37756373-37756736)
chr5 (13-273)||(8663984-8664244)
chr5 (13-376)||(30169862-30170225)
chr5 (13-376)||(31824813-31825176)
chr5 (297-367)||(13440067-13440137)
chr5 (13-376)||(30153411-30153774)
chr5 (297-367)||(9548116-9548186)
chr5 (297-367)||(11326313-11326383)
chr5 (297-367)||(13184222-13184292)
chr5 (14-376)||(31432834-31433196)
chr5 (14-282)||(37769487-37769755)
chr5 (13-376)||(6875698-6876061)
chr5 (13-126)||(34467009-34467122)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (14-367)||(16206549-16206902)
chr1 (14-200)||(20462469-20462655)
chr1 (13-376)||(10964053-10964416)
chr1 (13-376)||(51639601-51639964)
chr1 (13-376)||(28586364-28586727)
chr1 (13-376)||(41791817-41792180)
chr1 (311-376)||(20462662-20462727)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (14-367)||(22079379-22079732)
chr8 (14-366)||(16284834-16285186)
chr8 (14-376)||(18792092-18792454)
chr8 (14-376)||(27607373-27607735)
chr8 (29-376)||(19689498-19689845)
chr8 (13-376)||(33260107-33260470)
chr8 (14-336)||(14559009-14559331)
chr8 (13-376)||(19675825-19676188)
chr8 (50-376)||(2135727-2136053)
chr8 (14-366)||(16278939-16279290)
chr8 (13-376)||(3327975-3328338)
chr8 (13-376)||(9356007-9356370)
chr8 (14-376)||(19206828-19207190)
chr8 (14-376)||(29830707-29831069)
chr8 (13-282)||(12091286-12091555)
chr8 (297-367)||(33245175-33245245)
chr8 (13-376)||(31355909-31356272)
chr8 (297-367)||(19658675-19658745)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (14-367)||(17090907-17091260)
chr6 (13-376)||(29550856-29551219)
chr6 (14-376)||(27628158-27628520)
chr6 (14-376)||(24303070-24303432)
chr6 (14-366)||(22933342-22933694)
chr6 (14-366)||(23855787-23856139)
chr6 (14-366)||(26919762-26920114)
chr6 (14-366)||(15422779-15423131)
chr6 (13-376)||(16675520-16675883)
chr6 (14-376)||(24865099-24865461)
chr6 (14-376)||(27020520-27020883)
chr6 (13-367)||(3697462-3697816)
chr6 (14-376)||(16751236-16751598)
chr6 (14-376)||(27288822-27289184)
chr6 (13-376)||(4759145-4759508)
chr6 (13-336)||(26114902-26115225)
chr6 (13-376)||(26776062-26776425)
chr6 (13-376)||(27045769-27046132)
chr6 (13-376)||(29502796-29503159)
chr6 (194-376)||(20162178-20162360)
chr6 (194-376)||(22170471-22170653)
chr6 (122-336)||(34913581-34913795)
chr6 (13-376)||(4526667-4527030)
chr6 (13-376)||(27009111-27009474)
chr6 (14-213)||(27271195-27271394)
chr6 (13-336)||(27486510-27486833)
chr6 (13-336)||(28208835-28209158)
chr6 (14-336)||(13297443-13297765)
chr6 (14-120)||(20162073-20162179)
chr6 (14-120)||(22170652-22170758)
chr6 (14-366)||(26990271-26990624)
chr6 (297-367)||(8891930-8892000)
chr6 (297-367)||(8903165-8903235)
chr6 (297-367)||(28163164-28163234)
chr6 (297-367)||(33373875-33373945)
chr6 (312-376)||(4774563-4774627)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (14-366)||(31142-31494)
scaffold0089 (14-336)||(38618-38940)
scaffold0089 (29-366)||(45504-45841)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (14-376)||(5746-6108)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (14-336)||(31838-32160)
scaffold0124 (269-367)||(46134-46232)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (13-282)||(1043-1312)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (101-326)||(28765-28990)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (13-336)||(10950-11273)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (13-336)||(9333-9656)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (297-367)||(22071-22141)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (297-367)||(119574-119644)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16625513 - 16625160
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16625513 atggacatcaatgcttcttatagctgtatcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 16625414  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  16625413 agaatgggaagcttgttatagtccatggataagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16625314  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || || |||    
T  16625313 ctttcaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaggctggggctgctgtggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 16625214  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16625213 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16625160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Original strand, 18531734 - 18532087
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18531734 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 18531833  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| | || ||||||||    
T  18531834 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctaccgaaggaactgc 18531933  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| | |||||| ||||||  |||| |||| ||||| ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || || |||    
T  18531934 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagcctaagaagactggggctgccatggcatctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 18532033  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18532034 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 18532087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 7074557 - 7074920
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  7074557 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 7074656  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  7074657 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctgtcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 7074756  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  7074757 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 7074856  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  7074857 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 7074920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 8297318 - 8297680
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||    
T  8297318 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 8297417  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  8297418 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 8297517  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||||||||  | |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  8297518 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagagatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 8297617  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  8297618 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 8297680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 10397478 - 10397841
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |  | ||||| |||||||||||     
T  10397478 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 10397577  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  10397578 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10397677  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| |||   | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  10397678 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 10397777  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10397778 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10397841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Original strand, 18052623 - 18052970
Alignment:
Q  29 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 128  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  18052623 tcttacagctgtctcctggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 18052722  T
Q  129 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgac 228  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||    
T  18052723 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 18052822  T
Q  229 tattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaag 328  Q
    | |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||    || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18052823 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 18052922  T
Q  329 ttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    || ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18052923 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18052970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18291266 - 18290903
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  18291266 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18291167  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  18291166 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18291067  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| || |||||||||| || ||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  18291066 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18290967  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18290966 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18290903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18306567 - 18306204
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  18306567 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18306468  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  18306467 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18306368  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| || |||||||||| || ||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  18306367 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18306268  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18306267 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18306204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15740006 - 15739644
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||    
T  15740006 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttagggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 15739907  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  15739906 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 15739807  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcata-ag-gctgtccaagaggggcaag 311  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||| ||||||| || |||  |||| |||||||||||||| |  || |||| || || ||||||||||| ||||    
T  15739806 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgccatggcttctttgaagg--atgcatagagagccgtccaagagggtcaag 15739709  T
Q  312 ctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  15739708 ctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 15739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 20067388 - 20067741
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  20067388 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 20067487  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  20067488 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 20067587  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | |||||||  || ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  20067588 cttttcaaggtttaactctcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 20067687  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |  | |||||||||||| || ||||||||    
T  20067688 tgccggccggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 20067741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15891618 - 15891266
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  15891618 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 15891519  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  15891518 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 15891419  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| || |||| |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  15891418 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 15891319  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  15891318 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15891266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18275965 - 18275602
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  18275965 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18275866  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  18275865 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18275766  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| || |||||||||| || ||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  18275765 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18275666  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18275665 tgccggctggagcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttagcttctcc 18275602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Original strand, 6193661 - 6193983
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  6193661 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 6193760  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  6193761 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 6193860  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| |||    |||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||    || || || ||||||||||| ||||||    
T  6193861 ttttcaaggattaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagct 6193960  T
Q  314 gccggctggggcaagttgataca 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  6193961 gccggctggggcaggttaataca 6193983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22386490 - 22386128
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  22386490 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgatgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 22386391  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| || || ||||| || ||    
T  22386390 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgc 22386291  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| || || |  || |  || ||||||||||| ||||||    
T  22386290 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcgatggcttctttaaaggatacacagagagccgtccaagagggtcaagct 22386191  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  22386190 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 22386128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 35882112 - 35882474
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  35882112 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 35882211  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||    
T  35882212 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 35882311  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||    ||||  || |||| |||||| ||||||    
T  35882312 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacatagagccgtccgagagggtcaagct 35882411  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  35882412 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 35882474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20575760 - 20575397
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  20575760 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 20575661  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  20575660 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 20575561  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| | || | |||| || || ||  |    
T  20575560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 20575461  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  20575460 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 20575397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 48467272 - 48467635
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| |||||||||||     
T  48467272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 48467371  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  48467372 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 48467471  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  48467472 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctgggactgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 48467571  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  48467572 tgccggttggggcaaggtgatacagctctatgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 48467635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 21676038 - 21676401
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| |||||||||||     
T  21676038 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 21676137  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| ||  | || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  21676138 aagaatggaaaaatcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21676237  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| |||   | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||    || || || ||||||||||| |||||    
T  21676238 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 21676337  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21676338 tgccggttggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21676401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Original strand, 18332010 - 18332336
Alignment:
Q  50 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaag 149  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  | | |||||||||||    
T  18332010 agaccatggatacacgacgcgggaacagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcgtggagaggaag 18332109  T
Q  150 catatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaa 249  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||||||    
T  18332110 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 18332209  T
Q  250 gaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaat 349  Q
    || || |||  |||| ||| |||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||     
T  18332210 gagggatggaactgcaatgacttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcttgagaac 18332309  T
Q  350 aagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18332310 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 18332336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 4722977 - 4723329
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  4722977 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacatgatgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 4723076  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||  ||||| || ||    
T  4723077 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgc 4723176  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  4723177 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 4723276  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  4723277 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 4723329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4345600 - 4345237
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  4345600 gatggacatcaacgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4345501  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    ||| |||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  4345500 aagcatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4345401  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  || || ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||  ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  4345400 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagacgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4345301  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4345300 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4345237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 18226536 - 18226899
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||    
T  18226536 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 18226635  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  18226636 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18226735  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || |||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | | || || || ||  |    
T  18226736 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 18226835  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18226836 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18226899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8288383 - 8288021
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  8288383 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 8288284  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| || || ||||| || ||    
T  8288283 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtcggcggaggggaccgc 8288184  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| || | || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  8288183 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 8288084  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    || |||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  8288083 gctggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 8288021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11109262 - 11108908
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  11109262 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11109163  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  11109162 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11109063  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  |||||||||| ||  |    
T  11109062 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 11108963  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  11108962 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29147667 - 29147305
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  29147667 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 29147568  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| |||| |||||| ||  | || ||||| ||||| || ||    
T  29147567 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccaactatcatctttctcttgcatagaggcggggtctgcagaggggaccgc 29147468  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||| |||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||| |    
T  29147467 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagtccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagtt 29147368  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  29147367 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29147305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29663883 - 29663520
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||  | || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  29663883 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29663784  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||  ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  29663783 aggaatgaaaagcttgttaccgttcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29663684  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  29663683 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 29663584  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29663583 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29663520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 8213083 - 8213437
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  8213083 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8213182  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  8213183 acgaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8213282  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| || |  | ||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||    || || || ||||||||||| |||||    
T  8213283 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagcctaagaaagctggagctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 8213382  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  8213383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 8213437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 32440499 - 32440852
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || |  ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  32440499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgtggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 32440598  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| || || ||||| || |    
T  32440599 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaagaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccg 32440698  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  32440699 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 32440798  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  32440799 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 32440852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 18244084 - 18244407
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  18244084 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18244183  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  18244184 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgctgaagggactg 18244283  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  18244284 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 18244383  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  18244384 tgccggctggggcaaggtgataca 18244407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28114867 - 28114504
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||||      
T  28114867 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgag 28114768  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| |||||||| || ||||    
T  28114767 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 28114668  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| | ||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | | || || || ||  |    
T  28114667 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 28114568  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28114567 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28114504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4795550 - 4795300
Alignment:
Q  29 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 128  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  4795550 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 4795451  T
Q  129 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgac 228  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||    
T  4795450 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 4795351  T
Q  229 tattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaa 279  Q
    | |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||    
T  4795350 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaa 4795300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 5468330 - 5468684
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||||    
T  5468330 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgta 5468429  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  5468430 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5468529  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  |||||  || ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  5468530 ctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 5468629  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  5468630 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5468684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5595270 - 5594916
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  5595270 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5595171  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  5595170 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5595071  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  5595070 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 5594971  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  5594970 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5594916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22869768 - 22869406
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |    
T  22869768 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22869669  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  22869668 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22869569  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  ||    
T  22869568 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagact 22869469  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  22869468 gccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22869406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22884827 - 22884465
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |    
T  22884827 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22884728  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  22884727 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22884628  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  ||    
T  22884627 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagact 22884528  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  22884527 gccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22884465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 5015057 - 5015420
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  5015057 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5015156  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5015157 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 5015256  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  5015257 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 5015356  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5015357 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6541375 - 6541012
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  6541375 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6541276  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  6541275 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 6541176  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| || |  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  6541175 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgttcagagagccatccaagaaggtcagac 6541076  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6541075 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6541012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 24329504 - 24329867
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  24329504 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24329603  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  24329604 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24329703  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  24329704 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24329803  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24329804 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24329867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31963386 - 31963023
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  31963386 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31963287  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| |||||||    
T  31963286 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 31963187  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  31963186 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 31963087  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31963086 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31963023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 51783368 - 51783731
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  51783368 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 51783467  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  51783468 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51783567  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  51783568 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 51783667  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  51783668 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51783731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 5652858 - 5652928
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5652858 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 5652928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 4626415 - 4626485
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4626415 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 4626485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 5713698 - 5713768
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5713698 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5713768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 5724608 - 5724678
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5724608 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5724678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5767760 - 5767690
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5767760 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5767690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17993571 - 17993501
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17993571 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 17993501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 4418264 - 4418627
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||    
T  4418264 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 4418363  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  4418364 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4418463  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || || |  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | | || || || ||  |    
T  4418464 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 4418563  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4418564 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4418627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4795262 - 4795192
Alignment:
Q  296 gtccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| |||||||||||    
T  4795262 gtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaagaaggtct 4795192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 20441462 - 20441575
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    |||||||||| | || || |||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| || | ||||| || ||||||||     
T  20441462 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 20441561  T
Q  113 aagaatgggaagct 126  Q
    ||||||||||||||    
T  20441562 aagaatgggaagct 20441575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 41438588 - 41438701
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    |||||||||| | || || |||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| || | ||||| || ||||||||     
T  41438588 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 41438687  T
Q  113 aagaatgggaagct 126  Q
    ||||||||||||||    
T  41438688 aagaatgggaagct 41438701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Original strand, 1901657 - 1902010
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  1901657 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcataagaaattgaagtttgtaa 1901756  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  1901757 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgccgaaggaactgc 1901856  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || || |||    
T  1901857 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 1901956  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  1901957 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 1902010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Original strand, 15229269 - 15229622
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15229269 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 15229368  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  15229369 agaatggaaaacttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15229468  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || || |||    
T  15229469 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 15229568  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15229569 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 15229622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15283799 - 15283446
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15283799 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggacacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 15283700  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  15283699 agaatgggaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15283600  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || || |||    
T  15283599 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 15283500  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15283499 gtcggctagggcaagttaatacaactccgcgggaataagcacaaagaaggtctc 15283446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15390249 - 15389896
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  15390249 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcctagaaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgtaa 15390150  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  15390149 agaatggaaagctcgttacaatccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 15390050  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||| |  ||||||||  |||| ||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||| ||   ||| | |||||||||||| || ||||||    
T  15390049 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtccaagaaggtcaagct 15389950  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  15389949 accggctggggcaagttaatacaactccttaagaataagcacagagagggtctc 15389896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34187832 - 34187469
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  34187832 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 34187733  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||    
T  34187732 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagaggggactg 34187633  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  34187632 cttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 34187533  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  34187532 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 34187469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36343387 - 36343064
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  36343387 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 36343288  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  36343287 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 36343188  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  36343187 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 36343088  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  36343087 tgccggctggggcaagttaataca 36343064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24591226 - 24590904
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  24591226 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24591127  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  24591126 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24591027  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  24591026 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24590927  T
Q  314 gccggctggggcaagttgataca 336  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  24590926 gccggctggggcaagttaataca 24590904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14762176 - 14761813
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  14762176 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 14762077  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  14762076 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagagaaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 14761977  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| || |||||||||| || ||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  14761976 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 14761877  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  14761876 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 14761813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Original strand, 14666433 - 14666780
Alignment:
Q  29 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 128  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  14666433 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtaacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 14666532  T
Q  129 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgac 228  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||    
T  14666533 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 14666632  T
Q  229 tattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaag 328  Q
    | |  |||| |||||||||||||  | |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  14666633 tgtcgaaggtacggagcccaagagagatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggatggggcagg 14666732  T
Q  329 ttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    || ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  14666733 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 14666780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 6571252 - 6571615
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  6571252 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 6571351  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  6571352 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 6571451  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  6571452 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 6571551  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6571552 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6571615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 30755153 - 30755516
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  30755153 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30755252  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  30755253 aagaatggaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30755352  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || |||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  30755353 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 30755452  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30755453 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31125390 - 31125027
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||    
T  31125390 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 31125291  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  31125290 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31125191  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || |||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | | || || || ||  |    
T  31125190 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 31125091  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31125090 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31125027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Original strand, 17014551 - 17014805
Alignment:
Q  122 aagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaag 221  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| || || ||||| || || |||||||    
T  17014551 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaag 17014650  T
Q  222 tattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctg 321  Q
     ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17014651 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 17014750  T
Q  322 gggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  17014751 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 17014805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 24114062 - 24114424
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  24114062 atggatattaatgcctcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24114161  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||  ||||| || ||    
T  24114162 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgc 24114261  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||| | || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  24114262 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24114361  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24114362 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24114424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33672670 - 33672307
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  33672670 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33672571  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  33672570 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33672471  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  33672470 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 33672371  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33672370 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33672307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 39852037 - 39852400
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  39852037 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39852136  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  39852137 aggaatggaaagcttgttaccgttcacggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 39852236  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  39852237 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39852336  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39852337 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39852400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 14099940 - 14100303
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  14099940 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 14100039  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  14100040 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 14100139  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  14100140 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 14100239  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  14100240 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 14100303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 54834786 - 54835149
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  54834786 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 54834885  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  54834886 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 54834985  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||  ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| | || | |||| || || ||  |    
T  54834986 ctttccaaggtttgatcattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 54835085  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  54835086 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 54835149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 5007272 - 5007635
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  5007272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5007371  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| |||||||| || ||||    
T  5007372 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggggaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 5007471  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| | ||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | | || || || ||  |    
T  5007472 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggaaggtcagac 5007571  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5007572 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5007635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 40104510 - 40104187
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  40104510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 40104411  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  40104410 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40104311  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  40104310 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40104211  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    
T  40104210 tgccggttggggcaaggtgataca 40104187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18799485 - 18799163
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  18799485 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18799386  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||  || || | ||| |||||| | || |||||||| || ||||    
T  18799385 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgttgtccttttcttgtattgaagcggggtctgctgaagggactg 18799286  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  |||||||||| ||  |    
T  18799285 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 18799186  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatac 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  18799185 tgccggctggggcaaggtgatac 18799163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 21971100 - 21971300
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  21971100 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 21971199  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  21971200 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21971299  T
Q  213 c 213  Q
    |    
T  21971300 c 21971300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27162188 - 27161825
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  27162188 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27162089  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  27162088 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27161989  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  27161988 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 27161889  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27161888 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27161825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24460351 - 24460281
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24460351 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 24460281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19455281 - 19454929
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19455281 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgttggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 19455182  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  19455181 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatc-ttttcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 19455083  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||| || || |||    
T  19455082 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgcttagaaggctgtccaagaaggacaggct 19454983  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19454982 gccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 19454929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21702024 - 21701671
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  21702024 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaattttaagtttgtaa 21701925  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  21701924 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagttgtcgtctttctcttgtattgaagctggatctgctgaaggaactgc 21701825  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| | ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || || |||    
T  21701824 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 21701725  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21701724 gccggccggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 21701671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 37376541 - 37376904
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  37376541 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 37376640  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    || | ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  37376641 aaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 37376740  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  37376741 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 37376840  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  37376841 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 37376904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 27805087 - 27805450
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||  | || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||  | ||||| ||||||||  ||    
T  27805087 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccctacatcagaagttgaagttcata 27805186  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  27805187 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27805286  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  27805287 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27805386  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27805387 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27805450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Original strand, 28883610 - 28883957
Alignment:
Q  29 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 128  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28883610 tcttacagctgtctcttgggtagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28883709  T
Q  129 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgac 228  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| ||    
T  28883710 ttaccattcatggagaggaagcatacctggctagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcctttcaaggattaac 28883809  T
Q  229 tattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaag 328  Q
    | |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28883810 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28883909  T
Q  329 ttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    || ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  28883910 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 28883957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Original strand, 20839390 - 20839644
Alignment:
Q  122 aagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaag 221  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  20839390 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 20839489  T
Q  222 tattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctg 321  Q
     ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20839490 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 20839589  T
Q  322 gggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  20839590 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 20839644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 27778602 - 27778965
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  27778602 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27778701  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  27778702 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27778801  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| |||  |||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  27778802 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27778901  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27778902 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27778965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13935405 - 13935051
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||  | || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  13935405 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 13935306  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  13935305 aggaatggaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13935206  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  |||||||||| ||  |    
T  13935205 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 13935106  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  13935105 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 13935051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23127426 - 23127104
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  23127426 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 23127327  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |   |||||||||| ||||| || ||    
T  23127326 aaagtggaaagcttgttaccatacatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcataggggcaggatctgcagaggggaccgc 23127227  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  23127226 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23127127  T
Q  314 gccggctggggcaagttgataca 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  23127126 gccggctggggcaggttaataca 23127104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 12588190 - 12588553
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||  | || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  12588190 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 12588289  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  12588290 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagtcagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12588389  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  12588390 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12588489  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12588490 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12588553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12715463 - 12715100
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  12715463 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12715364  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  12715363 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12715264  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  12715263 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 12715164  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12715163 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12715100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16828199 - 16827836
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||    
T  16828199 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16828100  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  16828099 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16828000  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || |||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | | || || || ||  |    
T  16827999 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16827900  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16827899 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16827836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 16893282 - 16893645
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||    
T  16893282 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16893381  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  16893382 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16893481  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || |||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | | || || || ||  |    
T  16893482 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16893581  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16893582 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16893645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 32051178 - 32051541
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||    
T  32051178 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 32051277  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  32051278 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 32051377  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || |||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | | || || || ||  |    
T  32051378 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 32051477  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  32051478 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 32051541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 34287734 - 34288097
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| |||||||||||     
T  34287734 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34287833  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || |||     
T  34287834 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34287933  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| | || | |||| || || ||  |    
T  34287934 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34288033  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34288034 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34288097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 34292794 - 34293157
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| |||||||||||     
T  34292794 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34292893  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || |||     
T  34292894 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34292993  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| | || | |||| || || ||  |    
T  34292994 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34293093  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34293094 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34293157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39050683 - 39050320
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  39050683 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39050584  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||  |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || || |    
T  39050583 aggaatgaaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 39050484  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||||||| ||||  | || || ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  39050483 ctttccaaggtttgactattgaaggtgcagaacctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39050384  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39050383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39050320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 40234891 - 40235254
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| |||||||||||     
T  40234891 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 40234990  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| || | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  40234991 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40235090  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  40235091 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40235190  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  40235191 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40235254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9348843 - 9348489
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||  | || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  9348843 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 9348744  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  9348743 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9348644  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  9348643 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9348544  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  9348543 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9348489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27433304 - 27432952
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||  | || || || | |||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  27433304 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcggtgacctttactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27433205  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  27433204 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 27433105  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| || | || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  27433104 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 27433005  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  27433004 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27432952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 259614 - 259251
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  259614 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 259515  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  259514 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 259415  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  259414 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 259315  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  259314 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 259251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 27818360 - 27818683
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  27818360 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27818459  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||  | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  27818460 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctcacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27818559  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| |||  |||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  27818560 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27818659  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    
T  27818660 tgccggttggggcaaggtgataca 27818683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 12656923 - 12657275
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||| | || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  12656923 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 12657022  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||| | ||||| || ||    
T  12657023 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctacagaggggaccgc 12657122  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    |||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| || | || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  12657123 ctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 12657222  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  12657223 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 12657275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19415360 - 19415094
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  19415360 gatggacattaacgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 19415261  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19415260 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 19415161  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaa 279  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| |||||||||||||||||||    
T  19415160 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttctttgaa 19415094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 279
Target Start/End: Original strand, 31877661 - 31877927
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  31877661 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31877760  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31877761 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 31877860  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaa 279  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| |||||    
T  31877861 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaa 31877927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11634046 - 11633683
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||  |  | ||||| ||||||||  ||    
T  11634046 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcata 11633947  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  11633946 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11633847  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  ||||||| || || | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | | || || || ||  |    
T  11633846 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaaaaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 11633747  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  11633746 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 11633683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37950183 - 37949820
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| |||||||||||     
T  37950183 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 37950084  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  37950083 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37949984  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| |||   | ||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||||||   ||| |  ||  |||| ||||| ||  |    
T  37949983 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagccggggctgctgtggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaggagggtcagac 37949884  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37949883 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37949820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 3785160 - 3785230
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3785160 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 3785230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 27119194 - 27119264
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27119194 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 27119264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31891063 - 31890993
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31891063 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 31890993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 34157516 - 34157586
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34157516 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 34157586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 34863060 - 34863423
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  34863060 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 34863159  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  34863160 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 34863259  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  34863260 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 34863359  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34863360 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34863423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34303038 - 34302968
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  34303038 tccaagaaggacaggctgccggctggggtaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagagggtctc 34302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16448755 - 16448402
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16448755 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 16448656  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||| | |||| |    
T  16448655 agaatggaaagcttgttacggtccatggagaagaagcatatttggttagccagctgtcatctttctctagcattgaatctggatctgctgaagaaactac 16448556  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||| ||||  ||||||||| |||| || ||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || || |||    
T  16448555 cttccaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaagctggggctgctatggtttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 16448456  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16448455 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 16448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Original strand, 16042709 - 16043062
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16042709 atggacatcaacgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcaataacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16042808  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  16042809 agaatggaaagctcgttacggtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16042908  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||| |||||   ||| |||| ||| ||||| || || |||    
T  16042909 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactggggctactatggcttcttttaaagatgctcagaaggttgttcaagaaggacaggct 16043008  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16043009 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16043062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 5129378 - 5129740
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||    
T  5129378 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 5129477  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  5129478 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 5129577  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  5129578 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 5129677  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  5129678 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 5129740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 5160905 - 5161257
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  5160905 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 5161004  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||| |||||| | | |||| ||||| ||||| || ||    
T  5161005 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagtagcagggtctgcagaggggaccgc 5161104  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  ||  |||||||||| ||||||    
T  5161105 ttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccatccaagagggccaagct 5161204  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  5161205 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 5161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10915625 - 10915313
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||    
T  10915625 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 10915526  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||    
T  10915525 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggttctgcagaggggaccgc 10915426  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  10915425 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 10915326  T
Q  314 gccggctggggca 326  Q
    |||||||||||||    
T  10915325 gccggctggggca 10915313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16502143 - 16501796
Alignment:
Q  29 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 128  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |  || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16502143 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16502044  T
Q  129 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgac 228  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||    
T  16502043 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16501944  T
Q  229 tattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaag 328  Q
    | |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16501943 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 16501844  T
Q  329 ttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    || ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16501843 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16501796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11423534 - 11423172
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  11423534 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 11423435  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  11423434 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 11423335  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||| ||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||     
T  11423334 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacgaagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagcc 11423235  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    || |||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  11423234 gctggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 11423172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5146098 - 5145735
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  5146098 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5145999  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  5145998 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5145899  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  5145898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctttggcttcgttgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 5145799  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5145798 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5145735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26536628 - 26536274
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  26536628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26536529  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  26536528 aagaatggaaaactcgttacaatccatggcgaagaagcatacttagtcagccagctgtcgtccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26536429  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  |||||||||| ||  |    
T  26536428 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 26536329  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  26536328 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26536274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16517179 - 16516832
Alignment:
Q  29 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 128  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |  || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16517179 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16517080  T
Q  129 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgac 228  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||    
T  16517079 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16516980  T
Q  229 tattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaag 328  Q
    | |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  16516979 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccagctggggcagg 16516880  T
Q  329 ttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    || ||| | |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16516879 ttaataaagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16516832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 26436642 - 26436965
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| |||||||||||     
T  26436642 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 26436741  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  26436742 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26436841  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  26436842 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26436941  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    
T  26436942 tgccggttggggcaaggtgataca 26436965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 26514166 - 26514529
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  26514166 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26514265  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  26514266 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26514365  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  26514366 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 26514465  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26514466 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26514529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 31126305 - 31126668
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||| |     
T  31126305 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 31126404  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  31126405 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31126504  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  31126505 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31126604  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31126605 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31126668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26318627 - 26318264
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| || |||    
T  26318627 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26318528  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  26318527 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26318428  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  26318427 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26318328  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26318327 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcggtttctcc 26318264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31563148 - 31562785
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  31563148 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31563049  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  31563048 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 31562949  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  31562948 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31562849  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31562848 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31562785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Original strand, 2155959 - 2156281
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  2155959 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 2156058  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||   ||| ||||| ||||| || ||    
T  2156059 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggtagggtctgcagaggggaccgc 2156158  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||| || |||| || |||  |||  |||||||||||||| ||    || |  || || |||||||| ||||||    
T  2156159 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgacatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagct 2156258  T
Q  314 gccggctggggcaagttgataca 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  2156259 gccggctggggcaggttaataca 2156281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26273852 - 26273489
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  26273852 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26273753  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  26273752 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26273653  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  26273652 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 26273553  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26273552 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26273489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2108637 - 2108567
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2108637 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 2108567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 3446691 - 3447054
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  3446691 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3446790  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  3446791 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3446890  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  3446891 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 3446990  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3446991 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3447054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 9620036 - 9620399
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  9620036 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9620135  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  9620136 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9620235  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  9620236 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 9620335  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9620336 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9620399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16735218 - 16734855
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  16735218 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16735119  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  16735118 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16735019  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  16735018 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16734919  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16734918 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16734855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16750272 - 16749909
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  16750272 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16750173  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  16750172 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16750073  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  16750072 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16749973  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16749972 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16749909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 17524917 - 17525280
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  17524917 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17525016  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  17525017 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17525116  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  17525117 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17525216  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17525217 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17525280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17528298 - 17527935
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  17528298 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17528199  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  17528198 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17528099  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  17528098 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17527999  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17527998 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17527935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24591299 - 24591033
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  24591299 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24591200  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  24591199 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24591100  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaa 279  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| |||||    
T  24591099 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaa 24591033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 45733971 - 45734041
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45733971 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 45734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 376
Target Start/End: Original strand, 4201058 - 4201137
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4201058 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4201137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31088096 - 31088033
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaaga 360  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31088096 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaaga 31088033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 800272 - 800159
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    |||||||||| | || || ||||||||  | |||||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| || | ||||| || ||||||||     
T  800272 gatggacatccaagcatcctacagctgtttactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 800173  T
Q  113 aagaatgggaagct 126  Q
    ||||||||||||||    
T  800172 aagaatgggaagct 800159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Original strand, 22889863 - 22890216
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22889863 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggtgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 22889962  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  22889963 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagcaggatctgctgaaggaactac 22890062  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  22890063 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaagct 22890162  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22890163 gtcggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 22890216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 25200427 - 25200776
Alignment:
Q  18 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 117  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25200427 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 25200526  T
Q  118 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgccttt 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  25200527 tggaaagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 25200626  T
Q  218 caagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccg 317  Q
    ||||  ||||||||| |||| ||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | || || || || |||||||    
T  25200627 caaggtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccg 25200726  T
Q  318 gctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  25200727 gctggggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25200776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 25264686 - 25264931
Alignment:
Q  122 aagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25264686 aagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaag 25264785  T
Q  222 tattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctg 321  Q
      ||||||||| |||| ||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | || || || || |||||||||||    
T  25264786 gtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccggctg 25264885  T
Q  322 gggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  25264886 gggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25264931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 23893600 - 23893952
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||| || ||||||| ||    
T  23893600 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcttaggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgcaa 23893699  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  23893700 agagtggaaagctcgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaaggaaccgc 23893799  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     |||||||  || ||| |  |||| ||||||||||| | || | |  ||||||||||||||||||| ||    |||| ||| |||||||| || |||||     
T  23893800 ttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggattgagctgctatggcttctttgaaggatgcacatagggccgtccaagaaggtcaagcc 23893899  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    |||||||||||||  || ||||||| || |||||| ||||| || ||||||||    
T  23893900 gccggctggggcagattaatacaactccgtgagaacaagcataaggaaggtct 23893952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15657529 - 15657176
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  15657529 gatggacattaatgcatcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 15657430  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  15657429 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 15657330  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  15657329 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 15657230  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||| || ||||||||    
T  15657229 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 15657176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18499499 - 18499136
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  18499499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 18499400  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  18499399 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18499300  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| |||   | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    || || || ||||||||||| |||||    
T  18499299 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaagatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 18499200  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18499199 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 33293918 - 33294271
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||| | ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  33293918 gatggacgttaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 33294017  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  33294018 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 33294117  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  33294118 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33294217  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  33294218 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 33294271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 41676102 - 41676455
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  41676102 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 41676201  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  41676202 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatacttggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 41676301  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| || || | |||||| |||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  41676302 cttttcaaggattaactgttgaatgtacggagtccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 41676401  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  41676402 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 41676455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 11550748 - 11551100
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || |||||||||| ||    
T  11550748 atggatattaatgcctcttacagctgtctcgtggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaagtttgcaa 11550847  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  11550848 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 11550947  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| ||||| |||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  11550948 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 11551047  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  11551048 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 11551100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 30936027 - 30936379
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  30936027 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 30936126  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  30936127 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 30936226  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  30936227 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 30936326  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  30936327 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 30936379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 33778881 - 33779243
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  33778881 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 33778980  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  33778981 aaagtggaaagcttgttactattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 33779080  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  33779081 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 33779180  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  33779181 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 33779243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24686925 - 24686573
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  24686925 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24686826  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||  || |||| ||||| ||||| || ||    
T  24686825 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatataagcagggtctgcagaggggaccgc 24686726  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||| ||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  24686725 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24686626  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  24686625 gtcggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24686573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 24971412 - 24971764
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  24971412 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24971511  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || | |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  24971512 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttttcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24971611  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  24971612 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24971711  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  24971712 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24971764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23751218 - 23750856
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  23751218 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 23751119  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  23751118 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 23751019  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  23751018 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23750919  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  23750918 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 23750856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22997882 - 22997520
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  22997882 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 22997783  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  22997782 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 22997683  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| |||    |||| ||||||||||||| || |||  |||| ||||| |||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  22997682 ttttcaaggattaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 22997583  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  22997582 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 22997520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23716756 - 23716394
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||    
T  23716756 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 23716657  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  23716656 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 23716557  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| |||  || |  |||| |||||||| || | || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  23716556 ttttcaaggattagctgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23716457  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  23716456 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 23716394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 24682833 - 24683196
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  24682833 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24682932  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  24682933 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24683032  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  24683033 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24683132  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24683133 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24683196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 24725360 - 24725723
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  24725360 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24725459  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  24725460 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24725559  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  24725560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24725659  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24725660 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24725723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Original strand, 33517749 - 33518018
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||    
T  33517749 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 33517848  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  33517849 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33517948  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaaga 282  Q
    | || |||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33517949 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaaga 33518018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 12133548 - 12133911
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| || |||    
T  12133548 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 12133647  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  12133648 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12133747  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  12133748 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12133847  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12133848 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12133911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40472318 - 40471955
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||  | || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  40472318 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 40472219  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  40472218 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40472119  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  40472118 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggccgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40472019  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  40472018 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40471955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 9318844 - 9319207
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| || |||    
T  9318844 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 9318943  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  9318944 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9319043  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  9319044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9319143  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| || |||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9319144 tgccggttggggcaaggtggtacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9319207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13323598 - 13323235
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||| |     
T  13323598 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 13323499  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  13323498 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13323399  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  13323398 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 13323299  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  13323298 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 13323235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 28650628 - 28650991
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  28650628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28650727  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || || |    
T  28650728 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 28650827  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  28650828 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28650927  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28650928 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28650991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37357412 - 37357049
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  37357412 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37357313  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  37357312 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37357213  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  37357212 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37357113  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37357112 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37357049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37670252 - 37669929
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  37670252 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37670153  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  37670152 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 37670053  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  37670052 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37669953  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  37669952 tgccggctggggcaagatgataca 37669929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 43079645 - 43080008
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  43079645 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 43079744  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || || |    
T  43079745 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 43079844  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  43079845 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 43079944  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  43079945 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 43080008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18126164 - 18125811
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  18126164 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18126065  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||| | || |||||  |||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| || || ||||| || |    
T  18126064 aggaatggaaagcttgttaccattcatggaaaagaggcatacctggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccg 18125965  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||| | ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  | || |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  18125964 cttttcagggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaaccgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18125865  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  18125864 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18125811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 3790934 - 3791297
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  3790934 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 3791033  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  3791034 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3791133  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| | ||  | ||||| ||||| | ||||  ||||||| |||| ||||||||   ||  |||| | |||| || || ||  |    
T  3791134 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggttgctatgacttcattgaaagatgctcggaaggttatccaggaaggtcagac 3791233  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3791234 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3791297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15757626 - 15757263
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  15757626 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 15757527  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| |||||||    
T  15757526 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 15757427  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  15757426 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 15757327  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  15757326 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 15757263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 26481784 - 26482147
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||    
T  26481784 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 26481883  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || || |||||||| || || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  26481884 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26481983  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  ||||||  ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  26481984 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26482083  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26482084 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26482147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28958555 - 28958192
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  28958555 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28958456  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| |||  ||||  |||| |||||||| || ||||    
T  28958455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactg 28958356  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| |||   | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  28958355 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 28958256  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28958255 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28958192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 34617911 - 34618274
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  34617911 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 34618010  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  34618011 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 34618110  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  34618111 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 34618210  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34618211 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34618274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 37756373 - 37756736
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  37756373 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37756472  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  37756473 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37756572  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  37756573 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37756672  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37756673 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37756736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8664244 - 8663984
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  8664244 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8664145  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  8664144 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8664045  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttc 273  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | |||||| |||||||||||||    
T  8664044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagttggggctgctatggcttc 8663984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 30169862 - 30170225
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  30169862 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30169961  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  30169962 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30170061  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  30170062 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 30170161  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30170162 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgcaaagaaggtctcgggttctcc 30170225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31825176 - 31824813
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  31825176 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31825077  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  31825076 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31824977  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  31824976 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31824877  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31824876 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31824813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13440137 - 13440067
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13440137 tccaagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13440067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 30153411 - 30153774
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  30153411 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30153510  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  30153511 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30153610  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  30153611 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 30153710  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30153711 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30153774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9548186 - 9548116
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9548186 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 9548116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 11326313 - 11326383
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11326313 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 11326383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13184292 - 13184222
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13184292 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13184222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 31432834 - 31433196
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |    
T  31432834 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 31432933  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| | || || || | ||| |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  31432934 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttatcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 31433033  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  ||    
T  31433034 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagact 31433133  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31433134 gccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31433196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37769755 - 37769487
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |    
T  37769755 atggatattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 37769656  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || |||||    
T  37769655 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgc 37769556  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaaga 282  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37769555 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaaga 37769487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 6875698 - 6876061
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  6875698 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6875797  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| ||| |||| || ||||    
T  6875798 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 6875897  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  6875898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 6875997  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6875998 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6876061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 34467009 - 34467122
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    |||||||||| | || || ||||||||  | |||||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| || | ||||| || ||||||||     
T  34467009 gatggacatccaagcatcctacagctgtttactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 34467108  T
Q  113 aagaatgggaagct 126  Q
    ||||||||||||||    
T  34467109 aagaatgggaagct 34467122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16206902 - 16206549
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16206902 atggacatcaatgcctattatagctgtctcttgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16206803  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  16206802 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagccggatctgctgaaggaactgc 16206703  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||| |||  |||| || ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| || || || || |||    
T  16206702 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaaaaagactggggctactatggcttcttttaaagacgctcagaaggctgttcaggaaggacaggct 16206603  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||    
T  16206602 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcataaggaaggtctc 16206549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Original strand, 20462469 - 20462655
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  20462469 atggatatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccaacaattgaagtttgtaa 20462568  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  20462569 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctg 20462655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 10964053 - 10964416
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  10964053 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10964152  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  10964153 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10964252  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  10964253 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 10964352  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10964353 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10964416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 51639601 - 51639964
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||  |  | ||||| ||||| |||||     
T  51639601 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 51639700  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  51639701 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51639800  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  51639801 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 51639900  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  51639901 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51639964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 28586364 - 28586727
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  28586364 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28586463  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28586464 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 28586563  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  28586564 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 28586663  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28586664 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28586727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41792180 - 41791817
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  41792180 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 41792081  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| ||| |||| || ||||    
T  41792080 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 41791981  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  | ||||| || ||  |    
T  41791980 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 41791881  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  41791880 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 41791817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 376
Target Start/End: Original strand, 20462662 - 20462727
Alignment:
Q  311 gctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20462662 gctgccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctcgggttctcc 20462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22079732 - 22079379
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  22079732 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctaggaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccaaaagttaaagtttgtaa 22079633  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  22079632 agaatggaaagctcgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 22079533  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||| |  ||||||||  |||| ||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||| ||   ||| | |||||||| ||| || ||||||    
T  22079532 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtcctagaaggtcaagct 22079433  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22079432 accggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacagagagggtctc 22079379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 16284834 - 16285186
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  16284834 atggatatcaatgcctcttatatctgtctcttgggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccttgcaccagaagttgaagtttgcaa 16284933  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||    
T  16284934 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgc 16285033  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     |||||||  || ||| |  |||| ||||||||||| | || |||  ||||||||||||||||||| ||    || |  || ||| |||| || ||||||    
T  16285034 ttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtctaagaaggtcaagct 16285133  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  16285134 gccggctggggcaggttaatacaacttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16285186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 18792092 - 18792454
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  18792092 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 18792191  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||    
T  18792192 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 18792291  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| |||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  18792292 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 18792391  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18792392 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18792454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27607735 - 27607373
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  |  |||| || ||||| |||| ||    
T  27607735 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 27607636  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  27607635 aaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 27607536  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| | | ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  27607535 ttttcaaggactaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 27607436  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  27607435 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 27607373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Original strand, 19689498 - 19689845
Alignment:
Q  29 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 128  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  19689498 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 19689597  T
Q  129 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgac 228  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||    
T  19689598 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 19689697  T
Q  229 tattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaag 328  Q
    | |  |||| ||||| || |||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19689698 tgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgcgatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 19689797  T
Q  329 ttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    || ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  19689798 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 19689845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 33260107 - 33260470
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  33260107 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33260206  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33260207 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 33260306  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  || || ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  33260307 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33260406  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33260407 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33260470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Original strand, 14559009 - 14559331
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| ||||  |    
T  14559009 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcca 14559108  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  14559109 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttaaccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 14559208  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| ||  ||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  14559209 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggagggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 14559308  T
Q  314 gccggctggggcaagttgataca 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  14559309 gccggctggggcaggttaataca 14559331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 19675825 - 19676188
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  19675825 gatggacattaatgcctcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgctggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 19675924  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| ||||||  ||| |||||||| || ||||    
T  19675925 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagtagggtctgctgaagggactg 19676024  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  19676025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 19676124  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19676125 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19676188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2136053 - 2135727
Alignment:
Q  50 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaag 149  Q
    ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  2136053 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 2135954  T
Q  150 catatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaa 249  Q
    ||||   |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| ||    
T  2135953 catacccggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 2135854  T
Q  250 gaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaat 349  Q
    || || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |  | ||||||     
T  2135853 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggttggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 2135754  T
Q  350 aagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  2135753 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 2135727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 16278939 - 16279290
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  16278939 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 16279038  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |     
T  16279039 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg- 16279137  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
    |||||||| ||| ||| |  |||| |||||||||||||  | |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  16279138 ctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagagatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 16279237  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  16279238 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16279290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3328338 - 3327975
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  3328338 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3328239  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  3328238 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 3328139  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  3328138 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 3328039  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3328038 tgccggctggggcaagatgatacaactctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3327975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 9356007 - 9356370
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||||    
T  9356007 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgta 9356106  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  9356107 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9356206  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  9356207 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 9356306  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9356307 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9356370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19207190 - 19206828
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |    
T  19207190 atggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 19207091  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| || || ||||| || || |||||||| || || || | ||| |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  19207090 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 19206991  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||  ||||||  ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  ||    
T  19206990 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagact 19206891  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19206890 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19206828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 29830707 - 29831069
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |    
T  29830707 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 29830806  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| ||||  ||||||| || |||||    
T  29830807 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggcctgctgaagggactgc 29830906  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  ||    
T  29830907 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagact 29831006  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29831007 gccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29831069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12091555 - 12091286
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  12091555 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12091456  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  12091455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 12091356  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaaga 282  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12091355 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaaga 12091286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 33245175 - 33245245
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33245175 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 33245245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 31355909 - 31356272
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  31355909 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31356008  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  31356009 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31356108  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  31356109 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31356208  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31356209 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31356272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19658745 - 19658675
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19658745 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagataatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 19658675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17091260 - 17090907
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| |    
T  17091260 atggatatcaacgcttcttatagctgtcttctgggaaggccgtggatacatgacgcgggcgcagtaacctccaccctgcaccagaagttaaagtttgtga 17091161  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  17091160 ggaatggaaagctcgtcacagtccatggtgaagaagcatacttagttagccaactgtcatccttctcctgtattgaagcaggatctgctgaagggactgc 17091061  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| | ||||| || || |||    
T  17091060 ttttcaaggattgaccattgaaggtacggagcccaagaaggttagggctgctatggcttctttgaaggacgctcagaaggctattcaagaaggacaggct 17090961  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  17090960 gccggttggggtaagttgatacaactctatgagaataaacacaaagaaggtctc 17090907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 29550856 - 29551219
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  29550856 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29550955  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || |    
T  29550956 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 29551055  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  29551056 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 29551155  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  29551156 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29551219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27628520 - 27628158
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| || | ||||| || |||||||| |    
T  27628520 atggatattaatgcttcatacagctgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtga 27628421  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  27628420 agaatggaaaactcgttacagtccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 27628321  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||  ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| | || | | ||||| || ||  ||    
T  27628320 tttccaaggtttgaccattgaaggcgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaagaaggtcagact 27628221  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  | |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27628220 gccggctggggcaaggtgatacagcttcatgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27628158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24303432 - 24303070
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  24303432 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24303333  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  24303332 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24303233  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcata-ag-gctgtccaagaggggcaag 311  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| |  || |||| || || ||||||||||| ||||    
T  24303232 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaagg--atgcatagagagccgtccaagagggtcaag 24303135  T
Q  312 ctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24303134 ctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24303070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22933694 - 22933342
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  |  |||| || ||||| |||| ||    
T  22933694 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 22933595  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| |||| |||||| || ||    
T  22933594 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgc 22933495  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  22933494 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 22933395  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  22933394 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22933342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23856139 - 23855787
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  |  |||| || ||||| |||| ||    
T  23856139 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 23856040  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| |||| |||||| || ||    
T  23856039 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgc 23855940  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  23855939 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23855840  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  23855839 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23855787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 26919762 - 26920114
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||  | || | |||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  26919762 atggatattaatgcctcttacagttgcctcttggggaaaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 26919861  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  26919862 aaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 26919961  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  26919962 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 26920061  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  26920062 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 26920114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15423131 - 15422779
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  15423131 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 15423032  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||    
T  15423031 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 15422932  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcata-ag-gctgtccaagaggggcaag 311  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| |  || |||| || || ||||||||||| ||||    
T  15422931 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaagg--atgcatagagagccgtccaagagggtcaag 15422834  T
Q  312 ctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  15422833 ctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15422779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 16675520 - 16675883
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||    
T  16675520 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 16675619  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  16675620 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16675719  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  16675720 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 16675819  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16675820 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16675883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 24865099 - 24865461
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  24865099 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24865198  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | || ||||| ||||| || ||    
T  24865199 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagccgggtctgcagaggggaccgc 24865298  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  ||||||||||||| |||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  24865299 ttttcaaggattaactgtcgaaggaacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24865398  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    | ||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24865399 gtcggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24865461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 27020520 - 27020883
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  27020520 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27020619  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||    
T  27020620 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 27020719  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaa-gaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| || || || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| |||||    
T  27020720 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaggagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 27020819  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  27020820 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 27020883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 3697462 - 3697816
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  ||||||| ||||| |||||     
T  3697462 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacaccagaagttgaaatttgtg 3697561  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  3697562 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3697661  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  3697662 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 3697761  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  3697762 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3697816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 16751236 - 16751598
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  16751236 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 16751335  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||    
T  16751336 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 16751435  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| | ||| || |||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  |||||||||||||| ||||||    
T  16751436 ttttcaaggattaactgtcgaaggtatggaacctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagctgtccaagagggtcaagct 16751535  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16751536 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16751598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27289184 - 27288822
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  27289184 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27289085  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||  ||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||    
T  27289084 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccaactatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgc 27288985  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| || ||||| || | || |||  |||| |||||||||||||||||    || |  || ||||||||||| ||  ||    
T  27288984 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacagagcctaaaagggatggagctgccatggcttctttgaaagatgcgcagagagccgtccaagagggtcagact 27288885  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    || || ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27288884 gctgggtggggcaaggtgatacagctccgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27288822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 4759145 - 4759508
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  | ||||| ||||| |||||     
T  4759145 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4759244  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  4759245 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4759344  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  4759345 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4759444  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4759445 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4759508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26115225 - 26114902
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  26115225 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26115126  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  26115125 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcaggatctgctgaagggactg 26115026  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  26115025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 26114926  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  26114925 tgccggctggggcaagatgataca 26114902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26776425 - 26776062
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| || |||    
T  26776425 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26776326  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    | |||||  ||||| |||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  26776325 aggaatgaaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26776226  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  ||||||  ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||| || || ||  |    
T  26776225 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26776126  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26776125 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26776062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 27045769 - 27046132
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  27045769 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27045868  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  27045869 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27045968  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| |||   | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| | || | |||| || || ||  |    
T  27045969 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 27046068  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27046069 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27046132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 29502796 - 29503159
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  29502796 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 29502895  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  29502896 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29502995  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  29502996 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 29503095  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29503096 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29503159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 20162178 - 20162360
Alignment:
Q  194 ggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataagg 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||  ||||  | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||   || ||||    
T  20162178 ggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaagg 20162277  T
Q  294 ctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||| || ||||| || ||||||| |||||||||||| || |||| |  |||||||||||  || ||||||||| | ||||||    
T  20162278 ctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 20162360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22170653 - 22170471
Alignment:
Q  194 ggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataagg 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||  ||||  | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||   || ||||    
T  22170653 ggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaagg 22170554  T
Q  294 ctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||| || ||||| || ||||||| |||||||||||| || |||| |  |||||||||||  || ||||||||| | ||||||    
T  22170553 ctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 22170471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 34913795 - 34913581
Alignment:
Q  122 aagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaag 221  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  34913795 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 34913696  T
Q  222 tattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctg 321  Q
     ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  34913695 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagagtcaagctgccggctg 34913596  T
Q  322 gggcaagttgataca 336  Q
    ||||| ||| |||||    
T  34913595 gggcaggttaataca 34913581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 4526667 - 4527030
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  | ||||| ||||| |||||     
T  4526667 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4526766  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  4526767 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4526866  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  4526867 ctttccaaggtttgaccattgaaggcgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4526966  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4526967 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4527030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 27009111 - 27009474
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||| |     
T  27009111 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 27009210  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  27009211 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27009310  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  27009311 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 27009410  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27009411 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27009474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27271394 - 27271195
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| || | |||||||| |||||||| |    
T  27271394 atggatattaatgcttcatacagttgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaaattaaagtttgtga 27271295  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    ||||||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  27271294 agaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 27271195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 27486510 - 27486833
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  27486510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctactgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27486609  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||||||||| || || ||||    
T  27486610 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgccgaagggactg 27486709  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  27486710 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 27486809  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  27486810 tgccggctggggcaaggtgataca 27486833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 28208835 - 28209158
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  28208835 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28208934  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  28208935 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 28209034  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  28209035 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28209134  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  28209135 tgccggctggggcaagatgataca 28209158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13297765 - 13297443
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||  | ||  | || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  13297765 atggacattaacgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcgatgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 13297666  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| || || ||||| || ||    
T  13297665 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgc 13297566  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| || | || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || || |||||||| ||||||    
T  13297565 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagct 13297466  T
Q  314 gccggctggggcaagttgataca 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  13297465 gccggctggggcaggttaataca 13297443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 20162073 - 20162179
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |    
T  20162073 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 20162172  T
Q  114 agaatgg 120  Q
    |||||||    
T  20162173 agaatgg 20162179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22170758 - 22170652
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |    
T  22170758 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 22170659  T
Q  114 agaatgg 120  Q
    |||||||    
T  22170658 agaatgg 22170652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 26990271 - 26990624
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  26990271 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 26990370  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||||||||| ||||| || ||    
T  26990371 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggatctgcagaggggaccgc 26990470  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctg-ctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
     ||||||| ||| |||    |||| |||||| ||||||  | |||  ||| | |||||||||||||| ||    || |  || ||||| ||||| |||||    
T  26990471 ttttcaaggattaactgccgaaggtacggagtccaagagagatggaactgccaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaggagggtcaagc 26990570  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  26990571 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 26990624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8892000 - 8891930
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8892000 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8903235 - 8903165
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8903235 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8903165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 28163164 - 28163234
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28163164 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 28163234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33373945 - 33373875
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33373945 tccaagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 33373875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 376
Target Start/End: Original strand, 4774563 - 4774627
Alignment:
Q  312 ctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  4774563 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcataaagaaggtctcgggttctcc 4774627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 31142 - 31494
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || ||||||| ||||| |||| ||    
T  31142 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccagaagttgaaatttgcaa 31241  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  31242 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 31341  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| || | || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  31342 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 31441  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  31442 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 31494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38940 - 38618
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  38940 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 38841  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||    
T  38840 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 38741  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| |||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||    
T  38740 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 38641  T
Q  314 gccggctggggcaagttgataca 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  38640 gccggctggggcaggttaataca 38618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45841 - 45504
Alignment:
Q  29 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 128  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  45841 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtgggaagcttg 45742  T
Q  129 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgcctttcaagtattgac 228  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| || || ||||| || || ||||||| ||| ||    
T  45741 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 45642  T
Q  229 tattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaag 328  Q
    | |  |||| |||||||| || | || |||| |||| |||||||||||||| ||    || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45641 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 45542  T
Q  329 ttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtct 366  Q
    || ||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  45541 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 45504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6108 - 5746
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||    
T  6108 atggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataa 6009  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
     |||||| || ||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  6008 ggaatggaaaacttgttaccattcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 5909  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | |||||||||| ||  ||    
T  5908 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaagagggtcagact 5809  T
Q  314 gccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5808 gccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Original strand, 31838 - 32160
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaa 113  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||    
T  31838 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 31937  T
Q  114 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactgc 213  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||    
T  31938 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 32037  T
Q  214 ctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagct 313  Q
     ||||||| ||| ||| |  |||| |||||||| |||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || |||||||| || ||||||    
T  32038 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagaaggtcaagct 32137  T
Q  314 gccggctggggcaagttgataca 336  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  32138 gccggctggggcaagttaataca 32160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 269 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46232 - 46134
Alignment:
Q  269 gcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  46232 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 46134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1312 - 1043
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| || || || || ||||| || ||| || | ||||| || ||||||||     
T  1312 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggtgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 1213  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  1212 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatatttggtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 1113  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaaga 282  Q
    | || ||||  |||||  || | ||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1112 ctttccaaggtttgacctttgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaaga 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 326
Target Start/End: Original strand, 28765 - 28990
Alignment:
Q  101 ttgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctg 200  Q
    ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||    
T  28765 ttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctg 28864  T
Q  201 ctgagggaactgcctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtcca 300  Q
    | ||||| || || ||||||| ||| ||| |  |||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||    || |  || |||||    
T  28865 cagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtcca 28964  T
Q  301 agaggggcaagctgccggctggggca 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  28965 agagggtcaagctgccggctggggca 28990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 10950 - 11273
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||  || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  10950 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgtgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11049  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||| ||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||    
T  11050 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagctagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11149  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  11150 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 11249  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  11250 tgccggctggggcaaggtgataca 11273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 9333 - 9656
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgta 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||     
T  9333 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9432  T
Q  113 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatcgttctattgcattgaaccaggatctgctgagggaactg 212  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || | |||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  9433 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 9532  T
Q  213 cctttcaagtattgactattaaaggaacggagcccaagaaggttgggcctgctatggcttctttgaaagacattcataaggctgtccaagaggggcaagc 312  Q
    | || ||||  ||||| ||| ||||  | ||||| ||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |  ||  ||||||| || ||  |    
T  9533 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 9632  T
Q  313 tgccggctggggcaagttgataca 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  9633 tgccggctggggcaagatgataca 9656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 22071 - 22141
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22071 tccaagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 22141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 119644 - 119574
Alignment:
Q  297 tccaagaggggcaagctgccggctggggcaagttgatacaacgccttgagaataagcacaaagaaggtctc 367  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  119644 tccaagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 119574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University