View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1280_low_9 (Length: 427)

Name: NF1280_low_9
Description: NF1280
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1280_low_9
NF1280_low_9
[»] chr8 (182 HSPs)
chr8 (53-306)||(8251673-8251926)
chr8 (53-306)||(50835-51088)
chr8 (53-306)||(28191915-28192168)
chr8 (53-299)||(35504320-35504566)
chr8 (57-306)||(8948095-8948344)
chr8 (53-306)||(8951168-8951421)
chr8 (53-306)||(34490561-34490814)
chr8 (53-306)||(1774386-1774639)
chr8 (53-306)||(38183306-38183559)
chr8 (53-306)||(38878765-38879018)
chr8 (53-306)||(41014548-41014801)
chr8 (53-306)||(18754188-18754442)
chr8 (53-306)||(4076216-4076469)
chr8 (53-306)||(18455764-18456017)
chr8 (53-306)||(29598268-29598521)
chr8 (53-306)||(32675497-32675750)
chr8 (53-306)||(42598456-42598708)
chr8 (53-306)||(34568534-34568787)
chr8 (53-350)||(14699452-14699749)
chr8 (63-350)||(36176853-36177140)
chr8 (53-302)||(16999045-16999294)
chr8 (53-306)||(33745637-33745889)
chr8 (53-279)||(16125450-16125676)
chr8 (53-306)||(28579683-28579933)
chr8 (53-301)||(36661666-36661914)
chr8 (57-350)||(18111721-18112012)
chr8 (57-306)||(23687910-23688157)
chr8 (57-351)||(5162303-5162597)
chr8 (57-350)||(23487064-23487355)
chr8 (57-306)||(32522589-32522836)
chr8 (53-306)||(13153972-13154224)
chr8 (57-350)||(5783891-5784185)
chr8 (57-306)||(40784934-40785183)
chr8 (87-279)||(16117225-16117417)
chr8 (57-350)||(5774048-5774342)
chr8 (60-306)||(12255139-12255384)
chr8 (60-306)||(12260682-12260927)
chr8 (53-306)||(4631294-4631546)
chr8 (53-306)||(29279240-29279492)
chr8 (53-306)||(26016613-26016864)
chr8 (53-306)||(11798649-11798901)
chr8 (53-306)||(40741309-40741560)
chr8 (53-299)||(9035281-9035525)
chr8 (95-306)||(26980759-26980969)
chr8 (57-350)||(2151985-2152277)
chr8 (53-306)||(2944014-2944265)
chr8 (53-350)||(43653944-43654240)
chr8 (53-306)||(44250860-44251114)
chr8 (57-306)||(11482864-11483113)
chr8 (53-306)||(17856518-17856770)
chr8 (53-306)||(28864248-28864500)
chr8 (60-306)||(44502663-44502912)
chr8 (88-306)||(8072904-8073122)
chr8 (53-306)||(39029222-39029472)
chr8 (94-306)||(33980508-33980718)
chr8 (57-306)||(44580621-44580872)
chr8 (78-350)||(25058042-25058312)
chr8 (88-306)||(33865318-33865534)
chr8 (57-306)||(38967187-38967436)
chr8 (57-306)||(39406603-39406852)
chr8 (88-299)||(257313-257524)
chr8 (88-299)||(658396-658607)
chr8 (88-299)||(844132-844343)
chr8 (57-293)||(21652226-21652466)
chr8 (65-306)||(36245665-36245906)
chr8 (59-299)||(42985262-42985501)
chr8 (88-298)||(8566255-8566463)
chr8 (57-351)||(44888679-44888973)
chr8 (88-306)||(24992559-24992777)
chr8 (59-301)||(44021055-44021297)
chr8 (57-306)||(45425079-45425325)
chr8 (129-306)||(29806039-29806216)
chr8 (67-303)||(5268016-5268251)
chr8 (57-305)||(38780886-38781133)
chr8 (67-306)||(42218101-42218337)
chr8 (88-300)||(44747098-44747309)
chr8 (107-350)||(44748257-44748500)
chr8 (101-350)||(29321083-29321331)
chr8 (53-306)||(32474973-32475220)
chr8 (88-306)||(7683339-7683556)
chr8 (56-306)||(7758672-7758902)
chr8 (98-306)||(16448538-16448746)
chr8 (57-306)||(8797033-8797290)
chr8 (57-298)||(7682782-7683022)
chr8 (57-294)||(12825003-12825239)
chr8 (97-304)||(18641161-18641368)
chr8 (78-306)||(35143287-35143513)
chr8 (57-306)||(45260267-45260515)
chr8 (88-306)||(4778635-4778851)
chr8 (72-302)||(21136903-21137133)
chr8 (53-300)||(26990568-26990815)
chr8 (62-306)||(14583882-14584124)
chr8 (98-279)||(41615977-41616162)
chr8 (55-204)||(42885315-42885465)
chr8 (88-306)||(45283565-45283783)
chr8 (182-306)||(5951162-5951286)
chr8 (88-279)||(31886742-31886931)
chr8 (57-279)||(40855866-40856089)
chr8 (118-299)||(5593470-5593650)
chr8 (71-306)||(13568668-13568897)
chr8 (57-306)||(14548433-14548681)
chr8 (96-250)||(35202938-35203089)
chr8 (119-299)||(39463036-39463215)
chr8 (119-306)||(17336462-17336647)
chr8 (88-221)||(30140211-30140344)
chr8 (57-306)||(36786512-36786759)
chr8 (119-306)||(11293697-11293883)
chr8 (61-248)||(110172-110361)
chr8 (122-303)||(23894718-23894896)
chr8 (58-350)||(35179600-35179891)
chr8 (177-306)||(40529350-40529478)
chr8 (57-305)||(43292743-43292988)
chr8 (119-306)||(5109925-5110111)
chr8 (204-306)||(17851339-17851441)
chr8 (119-306)||(23497772-23497960)
chr8 (119-303)||(12802657-12802838)
chr8 (53-170)||(28965646-28965763)
chr8 (57-279)||(25056642-25056865)
chr8 (74-272)||(31089692-31089880)
chr8 (213-356)||(42885048-42885191)
chr8 (82-297)||(11113829-11114049)
chr8 (57-243)||(28740961-28741147)
chr8 (136-306)||(5244451-5244620)
chr8 (71-197)||(14625680-14625806)
chr8 (57-306)||(23995621-23995868)
chr8 (119-306)||(44165276-44165462)
chr8 (57-232)||(29738104-29738276)
chr8 (88-239)||(44056845-44056993)
chr8 (177-305)||(44580917-44581045)
chr8 (88-254)||(35203098-35203254)
chr8 (200-306)||(19176180-19176286)
chr8 (135-350)||(26625793-26626007)
chr8 (218-306)||(28965548-28965636)
chr8 (123-300)||(30512817-30512991)
chr8 (57-305)||(36941314-36941560)
chr8 (185-306)||(9615956-9616076)
chr8 (135-351)||(41898317-41898534)
chr8 (71-279)||(39970039-39970247)
chr8 (142-279)||(39970555-39970693)
chr8 (53-159)||(40530336-40530442)
chr8 (70-279)||(2767705-2767910)
chr8 (123-300)||(24260764-24260941)
chr8 (120-305)||(26502524-26502709)
chr8 (136-306)||(13141504-13141670)
chr8 (84-207)||(39112533-39112655)
chr8 (57-262)||(23424897-23425101)
chr8 (177-306)||(31619113-31619241)
chr8 (184-279)||(25635979-25636074)
chr8 (57-168)||(44580498-44580609)
chr8 (99-197)||(42747361-42747459)
chr8 (149-268)||(16893769-16893885)
chr8 (61-138)||(25635897-25635973)
chr8 (200-280)||(42220527-42220606)
chr8 (128-247)||(19700824-19700942)
chr8 (119-244)||(36409702-36409826)
chr8 (178-306)||(13401786-13401913)
chr8 (128-223)||(15021173-15021268)
chr8 (207-306)||(37023177-37023276)
chr8 (147-238)||(45145356-45145446)
chr8 (57-146)||(17851254-17851343)
chr8 (181-234)||(28929365-28929418)
chr8 (61-129)||(37296208-37296276)
chr8 (123-238)||(42486173-42486288)
chr8 (88-151)||(5952482-5952545)
chr8 (177-236)||(29073738-29073797)
chr8 (180-269)||(19260972-19261062)
chr8 (112-198)||(41388545-41388631)
chr8 (123-168)||(16894062-16894107)
chr8 (193-299)||(13335768-13335882)
chr8 (120-197)||(6988961-6989038)
chr8 (204-300)||(24355214-24355310)
chr8 (231-306)||(29739768-29739840)
chr8 (200-282)||(39112881-39112964)
chr8 (178-306)||(4348376-4348504)
chr8 (148-279)||(2786188-2786318)
chr8 (119-165)||(19176874-19176920)
chr8 (128-162)||(19715658-19715692)
chr8 (61-217)||(31846246-31846394)
chr8 (256-298)||(41388726-41388768)
chr8 (200-269)||(5449231-5449300)
chr8 (250-303)||(36408462-36408515)
chr8 (154-306)||(3381875-3382032)
[»] chr7 (187 HSPs)
chr7 (53-306)||(31458041-31458294)
chr7 (53-306)||(41025836-41026089)
chr7 (39-306)||(33858593-33858859)
chr7 (53-350)||(1275473-1275770)
chr7 (53-306)||(25247431-25247684)
chr7 (53-306)||(39871353-39871606)
chr7 (54-306)||(8290947-8291199)
chr7 (53-350)||(34978817-34979114)
chr7 (53-306)||(17491559-17491812)
chr7 (53-306)||(17561402-17561655)
chr7 (53-306)||(8612315-8612568)
chr7 (53-306)||(26255139-26255392)
chr7 (57-306)||(29285781-29286030)
chr7 (53-306)||(32814477-32814730)
chr7 (53-303)||(36697871-36698121)
chr7 (53-306)||(39197762-39198015)
chr7 (57-306)||(40300274-40300523)
chr7 (53-303)||(2006522-2006772)
chr7 (53-303)||(7703561-7703810)
chr7 (53-306)||(6387369-6387622)
chr7 (53-306)||(32872115-32872368)
chr7 (53-306)||(44547470-44547723)
chr7 (53-306)||(31200102-31200357)
chr7 (65-306)||(36646389-36646630)
chr7 (53-306)||(29064195-29064450)
chr7 (54-306)||(29642885-29643136)
chr7 (53-300)||(48521076-48521323)
chr7 (53-306)||(7449313-7449565)
chr7 (53-306)||(41252102-41252354)
chr7 (53-269)||(17326952-17327168)
chr7 (53-306)||(23320695-23320952)
chr7 (53-306)||(18112904-18113160)
chr7 (53-303)||(36711039-36711288)
chr7 (59-306)||(35569400-35569645)
chr7 (57-350)||(27529229-27529519)
chr7 (61-350)||(7400129-7400420)
chr7 (57-350)||(12930318-12930611)
chr7 (53-306)||(21295195-21295447)
chr7 (57-350)||(2289760-2290053)
chr7 (53-350)||(29176993-29177289)
chr7 (53-306)||(32759602-32759853)
chr7 (61-306)||(34012267-34012511)
chr7 (53-302)||(28060766-28061013)
chr7 (59-306)||(43279749-43279993)
chr7 (88-350)||(43081252-43081514)
chr7 (57-306)||(6799290-6799537)
chr7 (57-305)||(1574764-1575010)
chr7 (78-306)||(11647601-11647827)
chr7 (57-306)||(38858342-38858590)
chr7 (88-306)||(9998331-9998549)
chr7 (62-300)||(10475751-10475989)
chr7 (59-304)||(28016292-28016537)
chr7 (57-306)||(9140277-9140526)
chr7 (53-306)||(38428192-38428443)
chr7 (94-306)||(4856850-4857062)
chr7 (57-347)||(9299100-9299393)
chr7 (57-306)||(23919776-23920023)
chr7 (57-306)||(9036674-9036922)
chr7 (57-306)||(9303690-9303942)
chr7 (81-306)||(25950874-25951101)
chr7 (56-306)||(42298171-42298419)
chr7 (88-306)||(21870111-21870329)
chr7 (57-350)||(30895560-30895853)
chr7 (88-306)||(47323304-47323522)
chr7 (71-301)||(41803228-41803460)
chr7 (71-306)||(37913119-37913354)
chr7 (71-306)||(41002913-41003147)
chr7 (88-306)||(787977-788195)
chr7 (53-306)||(19920607-19920857)
chr7 (53-306)||(45907289-45907540)
chr7 (96-304)||(7607417-7607625)
chr7 (58-306)||(23364058-23364306)
chr7 (57-306)||(41444246-41444495)
chr7 (57-306)||(26736524-26736779)
chr7 (88-303)||(38736499-38736711)
chr7 (61-306)||(31581722-31581967)
chr7 (57-306)||(46266120-46266367)
chr7 (88-306)||(47657441-47657657)
chr7 (88-306)||(43093183-43093401)
chr7 (96-306)||(48008978-48009190)
chr7 (88-306)||(3024628-3024843)
chr7 (58-272)||(12130126-12130338)
chr7 (57-279)||(26842835-26843064)
chr7 (62-304)||(7400471-7400712)
chr7 (57-299)||(21119609-21119851)
chr7 (113-306)||(43440910-43441103)
chr7 (57-299)||(27881832-27882074)
chr7 (88-306)||(19619078-19619295)
chr7 (88-301)||(30737787-30738001)
chr7 (57-305)||(44719172-44719415)
chr7 (57-306)||(5524742-5524991)
chr7 (76-306)||(47534667-47534896)
chr7 (61-294)||(10538879-10539116)
chr7 (88-280)||(44780168-44780358)
chr7 (182-306)||(17317485-17317609)
chr7 (57-273)||(23109144-23109360)
chr7 (60-254)||(20950787-20950978)
chr7 (103-299)||(41787302-41787495)
chr7 (88-264)||(24299979-24300155)
chr7 (70-350)||(22991503-22991781)
chr7 (181-306)||(26299359-26299484)
chr7 (81-306)||(34895901-34896126)
chr7 (71-350)||(18751746-18752019)
chr7 (96-306)||(38361195-38361402)
chr7 (144-299)||(46414835-46414991)
chr7 (57-350)||(19845412-19845706)
chr7 (78-256)||(16957729-16957906)
chr7 (181-306)||(9233444-9233569)
chr7 (140-352)||(19292837-19293047)
chr7 (57-306)||(27813544-27813792)
chr7 (119-347)||(42887887-42888114)
chr7 (61-304)||(45777967-45778213)
chr7 (57-353)||(9682599-9682893)
chr7 (57-306)||(29629761-29630007)
chr7 (59-350)||(31802869-31803157)
chr7 (57-306)||(49044865-49045113)
chr7 (119-351)||(30534704-30534933)
chr7 (201-303)||(31769220-31769322)
chr7 (88-217)||(32118000-32118127)
chr7 (61-234)||(21870840-21871013)
chr7 (53-306)||(44510085-44510336)
chr7 (119-303)||(24504731-24504914)
chr7 (57-300)||(40120999-40121245)
chr7 (94-279)||(17878158-17878332)
chr7 (181-306)||(10071242-10071367)
chr7 (203-303)||(12616273-12616373)
chr7 (119-353)||(2345350-2345583)
chr7 (53-192)||(20075005-20075143)
chr7 (135-306)||(32964218-32964388)
chr7 (142-279)||(3796060-3796197)
chr7 (97-221)||(27325952-27326076)
chr7 (119-306)||(32699513-32699697)
chr7 (119-306)||(35888356-35888540)
chr7 (119-306)||(23801990-23802175)
chr7 (90-279)||(49110804-49110993)
chr7 (107-278)||(2470870-2471041)
chr7 (57-188)||(33381363-33381494)
chr7 (62-223)||(21587534-21587695)
chr7 (119-303)||(45722054-45722237)
chr7 (142-272)||(24210980-24211107)
chr7 (119-303)||(12631620-12631807)
chr7 (142-306)||(3881371-3881534)
chr7 (61-299)||(19497292-19497533)
chr7 (131-300)||(20182099-20182265)
chr7 (135-269)||(33683007-33683140)
chr7 (135-306)||(37915187-37915356)
chr7 (135-306)||(8782033-8782206)
chr7 (119-227)||(21135371-21135478)
chr7 (143-306)||(43934635-43934795)
chr7 (177-272)||(3478815-3478910)
chr7 (119-303)||(3775870-3776059)
chr7 (123-242)||(28017051-28017170)
chr7 (62-163)||(10071816-10071917)
chr7 (233-306)||(33381494-33381567)
chr7 (120-279)||(46415103-46415260)
chr7 (122-306)||(33682758-33682938)
chr7 (181-260)||(32811299-32811378)
chr7 (128-238)||(33342249-33342357)
chr7 (125-235)||(25530689-25530799)
chr7 (119-238)||(21295638-21295756)
chr7 (216-306)||(32643658-32643748)
chr7 (130-299)||(32525966-32526134)
chr7 (119-223)||(47648985-47649088)
chr7 (252-350)||(20074889-20074987)
chr7 (70-208)||(43008253-43008388)
chr7 (177-279)||(40299181-40299282)
chr7 (88-165)||(12616186-12616263)
chr7 (123-306)||(2087096-2087282)
chr7 (211-306)||(30866416-30866511)
chr7 (260-306)||(21135321-21135367)
chr7 (142-300)||(18312239-18312393)
chr7 (119-279)||(34693471-34693631)
chr7 (108-165)||(34900775-34900832)
chr7 (61-165)||(30866122-30866226)
chr7 (135-306)||(46148475-46148645)
chr7 (200-275)||(4700530-4700605)
chr7 (259-306)||(12129721-12129768)
chr7 (123-197)||(31137214-31137288)
chr7 (178-223)||(19880727-19880772)
chr7 (250-299)||(23256804-23256853)
chr7 (249-306)||(24282075-24282132)
chr7 (123-223)||(28409849-28409949)
chr7 (118-158)||(34037502-34037542)
chr7 (218-261)||(23109101-23109144)
chr7 (219-306)||(42538560-42538647)
chr7 (119-165)||(6910622-6910668)
chr7 (205-279)||(6910696-6910770)
[»] chr5 (172 HSPs)
chr5 (53-306)||(1265993-1266246)
chr5 (53-306)||(17674398-17674651)
chr5 (53-306)||(28041091-28041344)
chr5 (53-306)||(22527736-22527989)
chr5 (53-306)||(34662248-34662501)
chr5 (53-304)||(31888939-31889190)
chr5 (53-350)||(15190555-15190852)
chr5 (53-306)||(16152995-16153248)
chr5 (53-306)||(41641139-41641396)
chr5 (53-306)||(3686494-3686747)
chr5 (53-306)||(10734261-10734514)
chr5 (53-306)||(6672968-6673221)
chr5 (53-306)||(42561091-42561342)
chr5 (53-306)||(13862735-13862988)
chr5 (53-306)||(15521682-15521935)
chr5 (53-306)||(25600800-25601053)
chr5 (57-306)||(4752962-4753211)
chr5 (69-306)||(4984872-4985109)
chr5 (54-306)||(32478182-32478434)
chr5 (67-306)||(5528018-5528256)
chr5 (57-350)||(7940452-7940743)
chr5 (57-306)||(20186545-20186794)
chr5 (58-306)||(9064951-9065199)
chr5 (57-350)||(20142005-20142296)
chr5 (53-306)||(9020739-9020990)
chr5 (53-306)||(14913693-14913944)
chr5 (61-350)||(43060159-43060448)
chr5 (53-306)||(3497541-3497793)
chr5 (53-306)||(9828437-9828689)
chr5 (71-300)||(14649235-14649464)
chr5 (53-306)||(40004150-40004402)
chr5 (57-303)||(9268037-9268283)
chr5 (88-306)||(27873120-27873338)
chr5 (57-306)||(32964176-32964423)
chr5 (57-350)||(40643094-40643387)
chr5 (57-305)||(20987959-20988205)
chr5 (58-306)||(7951605-7951852)
chr5 (53-299)||(186149-186394)
chr5 (53-306)||(16440975-16441226)
chr5 (71-306)||(23285079-23285316)
chr5 (53-350)||(41383913-41384209)
chr5 (53-306)||(16127303-16127555)
chr5 (57-306)||(4194726-4194971)
chr5 (88-306)||(10511246-10511464)
chr5 (76-300)||(28140683-28140907)
chr5 (57-306)||(33639335-33639583)
chr5 (57-306)||(8283856-8284101)
chr5 (59-306)||(14619293-14619540)
chr5 (61-306)||(38161529-38161773)
chr5 (57-350)||(35547261-35547554)
chr5 (57-306)||(39121434-39121683)
chr5 (99-350)||(22657768-22658019)
chr5 (57-306)||(7734878-7735128)
chr5 (88-306)||(9264017-9264235)
chr5 (53-306)||(13660905-13661155)
chr5 (88-306)||(23285852-23286069)
chr5 (57-350)||(3028013-3028308)
chr5 (101-306)||(19571726-19571931)
chr5 (57-306)||(22581480-22581728)
chr5 (57-302)||(34332266-34332511)
chr5 (53-306)||(18615802-18616059)
chr5 (96-306)||(24307924-24308134)
chr5 (96-306)||(24365189-24365399)
chr5 (79-297)||(31507387-31507605)
chr5 (53-306)||(32147337-32147587)
chr5 (57-350)||(4976033-4976327)
chr5 (57-306)||(40951787-40952036)
chr5 (98-306)||(12743868-12744076)
chr5 (57-306)||(13759193-13759440)
chr5 (78-306)||(21239143-21239371)
chr5 (98-306)||(32617561-32617769)
chr5 (58-306)||(39984813-39985063)
chr5 (65-306)||(26605368-26605616)
chr5 (88-306)||(34889053-34889271)
chr5 (57-306)||(41418354-41418601)
chr5 (77-306)||(3160291-3160520)
chr5 (53-279)||(17592542-17592767)
chr5 (58-306)||(38371719-38371966)
chr5 (57-279)||(39758958-39759180)
chr5 (57-306)||(23092384-23092633)
chr5 (57-265)||(8144464-8144672)
chr5 (57-350)||(23286226-23286511)
chr5 (57-306)||(17714608-17714861)
chr5 (139-306)||(20987791-20987958)
chr5 (81-351)||(40738409-40738678)
chr5 (57-303)||(21749977-21750223)
chr5 (88-306)||(35039041-35039259)
chr5 (88-279)||(15774838-15775029)
chr5 (57-306)||(31158172-31158417)
chr5 (57-303)||(20517892-20518134)
chr5 (140-306)||(12806690-12806856)
chr5 (65-306)||(14570643-14570881)
chr5 (73-299)||(14789604-14789829)
chr5 (88-306)||(11780807-11781016)
chr5 (57-269)||(14435883-14436095)
chr5 (59-350)||(14571287-14571578)
chr5 (61-306)||(8100142-8100386)
chr5 (97-303)||(13703594-13703797)
chr5 (57-259)||(37034238-37034438)
chr5 (177-306)||(39180505-39180634)
chr5 (119-306)||(41686922-41687106)
chr5 (119-306)||(5283092-5283277)
chr5 (145-350)||(24170134-24170338)
chr5 (189-306)||(26674480-26674597)
chr5 (189-306)||(26946086-26946203)
chr5 (120-306)||(16284998-16285183)
chr5 (119-350)||(25837008-25837238)
chr5 (57-233)||(30182958-30183133)
chr5 (119-272)||(3628980-3629132)
chr5 (99-306)||(26076175-26076381)
chr5 (119-306)||(31657728-31657914)
chr5 (181-303)||(26894742-26894863)
chr5 (119-306)||(11432354-11432546)
chr5 (119-350)||(24857556-24857785)
chr5 (119-350)||(39971014-39971244)
chr5 (99-306)||(12098605-12098811)
chr5 (119-350)||(16926452-16926682)
chr5 (120-306)||(21069681-21069866)
chr5 (57-350)||(23259883-23260175)
chr5 (119-306)||(8949859-8950045)
chr5 (57-306)||(18251060-18251312)
chr5 (135-306)||(31642231-31642401)
chr5 (135-306)||(28414507-28414677)
chr5 (135-301)||(6328626-6328791)
chr5 (81-214)||(15674913-15675044)
chr5 (60-306)||(4902851-4903071)
chr5 (57-306)||(15559577-15559829)
chr5 (53-168)||(26889594-26889709)
chr5 (119-306)||(27833988-27834174)
chr5 (99-271)||(9438877-9439051)
chr5 (209-299)||(13735701-13735790)
chr5 (57-207)||(42030344-42030493)
chr5 (131-300)||(37206169-37206338)
chr5 (123-300)||(37700143-37700320)
chr5 (135-306)||(1303400-1303568)
chr5 (182-296)||(20187134-20187248)
chr5 (119-306)||(13235986-13236169)
chr5 (229-306)||(30182127-30182204)
chr5 (120-306)||(35784728-35784910)
chr5 (123-300)||(13335338-13335514)
chr5 (142-306)||(16636828-16636994)
chr5 (59-269)||(39692401-39692608)
chr5 (67-167)||(39181902-39182002)
chr5 (123-242)||(26699424-26699543)
chr5 (123-242)||(26969157-26969276)
chr5 (59-223)||(9727498-9727661)
chr5 (68-165)||(13958607-13958704)
chr5 (131-299)||(16099279-16099448)
chr5 (61-140)||(20988252-20988331)
chr5 (88-227)||(2328398-2328528)
chr5 (57-278)||(8356284-8356508)
chr5 (123-306)||(10116624-10116809)
chr5 (65-169)||(11937170-11937274)
chr5 (200-272)||(21591812-21591884)
chr5 (200-272)||(21595929-21596001)
chr5 (131-226)||(35495089-35495182)
chr5 (178-306)||(30117157-30117287)
chr5 (200-280)||(7956568-7956648)
chr5 (178-238)||(21252218-21252278)
chr5 (188-301)||(35998560-35998671)
chr5 (120-169)||(7408877-7408926)
chr5 (79-140)||(12807132-12807193)
chr5 (119-207)||(7001445-7001532)
chr5 (80-216)||(41470779-41470914)
chr5 (67-106)||(3629421-3629460)
chr5 (94-165)||(10561250-10561321)
chr5 (123-174)||(33818837-33818888)
chr5 (257-299)||(8145086-8145128)
chr5 (143-190)||(32719075-32719124)
chr5 (128-191)||(24875949-24876011)
chr5 (219-299)||(9978034-9978114)
chr5 (171-230)||(40561070-40561127)
[»] chr3 (228 HSPs)
chr3 (53-306)||(22103669-22103922)
chr3 (53-306)||(7181394-7181647)
chr3 (53-306)||(43868147-43868400)
chr3 (53-350)||(7051460-7051757)
chr3 (53-306)||(23700525-23700778)
chr3 (53-306)||(23718980-23719233)
chr3 (53-306)||(23737436-23737689)
chr3 (53-306)||(46878179-46878432)
chr3 (53-306)||(52673231-52673484)
chr3 (53-350)||(26221288-26221585)
chr3 (53-306)||(9499237-9499490)
chr3 (57-306)||(54107397-54107646)
chr3 (53-350)||(31531151-31531448)
chr3 (60-306)||(45252817-45253063)
chr3 (53-306)||(21756530-21756783)
chr3 (53-306)||(30040757-30041010)
chr3 (53-306)||(45745822-45746075)
chr3 (53-306)||(46703071-46703324)
chr3 (53-350)||(20656050-20656347)
chr3 (53-306)||(7251022-7251275)
chr3 (53-306)||(45048762-45049015)
chr3 (53-306)||(54782657-54782910)
chr3 (53-306)||(32467469-32467724)
chr3 (53-306)||(26593505-26593758)
chr3 (53-306)||(43701222-43701475)
chr3 (53-306)||(32962845-32963097)
chr3 (53-306)||(49126936-49127191)
chr3 (53-306)||(25148862-25149115)
chr3 (54-306)||(1641841-1642092)
chr3 (53-306)||(25148503-25148752)
chr3 (53-298)||(54604330-54604573)
chr3 (53-306)||(32569041-32569293)
chr3 (57-350)||(20621430-20621721)
chr3 (53-306)||(26058590-26058835)
chr3 (67-306)||(35165717-35165955)
chr3 (53-306)||(35867823-35868076)
chr3 (57-350)||(10015535-10015826)
chr3 (57-350)||(19897582-19897873)
chr3 (58-306)||(31186802-31187048)
chr3 (57-306)||(50433133-50433382)
chr3 (57-350)||(46845236-46845529)
chr3 (62-350)||(1450242-1450530)
chr3 (57-350)||(28673040-28673331)
chr3 (53-350)||(33868448-33868744)
chr3 (57-306)||(45513381-45513628)
chr3 (53-306)||(4024096-4024347)
chr3 (57-306)||(10656735-10656984)
chr3 (53-306)||(36005547-36005800)
chr3 (53-306)||(53361595-53361848)
chr3 (57-350)||(15996519-15996810)
chr3 (53-306)||(9779980-9780232)
chr3 (53-306)||(16434978-16435230)
chr3 (53-306)||(17591286-17591538)
chr3 (53-306)||(44543826-44544078)
chr3 (58-350)||(49383344-49383635)
chr3 (53-306)||(50647685-50647937)
chr3 (58-306)||(6784507-6784754)
chr3 (58-306)||(17753280-17753528)
chr3 (58-306)||(19054600-19054848)
chr3 (57-304)||(43686547-43686794)
chr3 (53-306)||(14428654-14428905)
chr3 (53-306)||(36099009-36099260)
chr3 (57-306)||(42801526-42801775)
chr3 (57-306)||(47066978-47067227)
chr3 (57-350)||(4759093-4759388)
chr3 (79-351)||(8321924-8322194)
chr3 (57-351)||(21458981-21459275)
chr3 (53-306)||(20862240-20862493)
chr3 (53-306)||(46049728-46049979)
chr3 (70-351)||(48887703-48887984)
chr3 (57-306)||(1084698-1084947)
chr3 (57-306)||(12906156-12906405)
chr3 (61-306)||(36317405-36317648)
chr3 (53-306)||(37728757-37729009)
chr3 (53-306)||(52058986-52059238)
chr3 (96-306)||(43158521-43158729)
chr3 (57-299)||(52044540-52044780)
chr3 (53-306)||(43978204-43978455)
chr3 (53-306)||(50726526-50726777)
chr3 (53-306)||(50786071-50786322)
chr3 (57-306)||(8546948-8547197)
chr3 (57-306)||(53686741-53686990)
chr3 (59-306)||(10044885-10045130)
chr3 (142-304)||(12683011-12683173)
chr3 (57-350)||(33212397-33212689)
chr3 (94-303)||(45323870-45324077)
chr3 (57-350)||(50517266-50517559)
chr3 (103-347)||(46861623-46861867)
chr3 (71-306)||(17698792-17699025)
chr3 (78-301)||(52291194-52291415)
chr3 (79-350)||(53164163-53164434)
chr3 (61-303)||(41824155-41824396)
chr3 (53-306)||(51283803-51284056)
chr3 (59-280)||(40919024-40919245)
chr3 (61-306)||(46862114-46862359)
chr3 (53-299)||(26806116-26806366)
chr3 (61-306)||(12050143-12050386)
chr3 (53-306)||(35711319-35711570)
chr3 (79-304)||(13809575-13809800)
chr3 (57-306)||(39952315-39952563)
chr3 (57-350)||(24087082-24087372)
chr3 (53-299)||(32978533-32978776)
chr3 (88-306)||(48909916-48910132)
chr3 (79-306)||(51489411-51489638)
chr3 (88-306)||(43557228-43557446)
chr3 (57-306)||(48213796-48214043)
chr3 (53-306)||(53271636-53271887)
chr3 (88-350)||(2993259-2993519)
chr3 (79-306)||(27688030-27688254)
chr3 (100-306)||(10220976-10221180)
chr3 (99-306)||(50730369-50730576)
chr3 (99-306)||(50782278-50782485)
chr3 (57-306)||(54849407-54849656)
chr3 (61-350)||(23776245-23776531)
chr3 (48-297)||(41992275-41992509)
chr3 (57-306)||(20877677-20877922)
chr3 (88-306)||(38071239-38071457)
chr3 (79-306)||(14758882-14759105)
chr3 (53-197)||(20848985-20849129)
chr3 (60-300)||(25916450-25916692)
chr3 (57-306)||(36600187-36600435)
chr3 (57-306)||(42390648-42390897)
chr3 (57-306)||(35572202-35572448)
chr3 (53-306)||(26306355-26306600)
chr3 (120-299)||(49383640-49383819)
chr3 (53-175)||(12675163-12675285)
chr3 (65-303)||(22527375-22527611)
chr3 (118-299)||(22832415-22832595)
chr3 (112-306)||(33361500-33361686)
chr3 (142-299)||(44542303-44542460)
chr3 (100-306)||(52177844-52178050)
chr3 (88-306)||(1572375-1572591)
chr3 (57-350)||(47008247-47008539)
chr3 (129-306)||(43408544-43408722)
chr3 (121-351)||(27646115-27646344)
chr3 (99-279)||(33976554-33976730)
chr3 (57-306)||(29383058-29383307)
chr3 (57-302)||(44561441-44561685)
chr3 (59-300)||(46879068-46879309)
chr3 (181-306)||(49543721-49543846)
chr3 (57-238)||(37144230-37144413)
chr3 (57-304)||(41392622-41392871)
chr3 (121-306)||(1111457-1111641)
chr3 (61-279)||(25130721-25130934)
chr3 (200-350)||(9582243-9582393)
chr3 (88-233)||(25879256-25879401)
chr3 (119-299)||(28810928-28811107)
chr3 (181-297)||(46557751-46557867)
chr3 (57-351)||(12918583-12918876)
chr3 (88-223)||(41750962-41751097)
chr3 (119-306)||(48904070-48904256)
chr3 (88-229)||(23308059-23308200)
chr3 (142-303)||(31533414-31533574)
chr3 (57-306)||(42526370-42526618)
chr3 (181-296)||(18658327-18658442)
chr3 (199-299)||(20848612-20848712)
chr3 (135-306)||(38340994-38341162)
chr3 (70-306)||(55287306-55287534)
chr3 (119-306)||(54927897-54928084)
chr3 (88-238)||(19350152-19350302)
chr3 (148-306)||(30819922-30820079)
chr3 (119-350)||(17589683-17589913)
chr3 (57-300)||(29719456-29719698)
chr3 (57-303)||(33290393-33290636)
chr3 (119-306)||(34021802-34021988)
chr3 (57-235)||(54866388-54866565)
chr3 (123-350)||(16776696-16776924)
chr3 (57-305)||(48902454-48902700)
chr3 (119-306)||(8379721-8379907)
chr3 (57-306)||(45404419-45404666)
chr3 (183-306)||(7886932-7887055)
chr3 (119-306)||(15095242-15095428)
chr3 (118-306)||(35938409-35938593)
chr3 (88-207)||(39625232-39625352)
chr3 (135-350)||(42755341-42755555)
chr3 (120-350)||(4564237-4564466)
chr3 (57-306)||(32968971-32969218)
chr3 (120-242)||(23650639-23650761)
chr3 (79-279)||(34265491-34265696)
chr3 (57-170)||(18658173-18658286)
chr3 (119-279)||(24813657-24813814)
chr3 (119-350)||(42044061-42044289)
chr3 (200-306)||(39625681-39625787)
chr3 (144-306)||(48655072-48655233)
chr3 (74-163)||(9582396-9582485)
chr3 (119-279)||(28875059-28875217)
chr3 (119-306)||(34811358-34811543)
chr3 (177-306)||(52693552-52693681)
chr3 (119-306)||(31541071-31541252)
chr3 (135-306)||(40215052-40215222)
chr3 (118-297)||(38364219-38364400)
chr3 (54-133)||(7462842-7462921)
chr3 (119-350)||(36584710-36584935)
chr3 (237-306)||(7462921-7462990)
chr3 (135-269)||(4836516-4836647)
chr3 (243-299)||(20919133-20919189)
chr3 (243-299)||(20928095-20928151)
chr3 (119-238)||(21497618-21497734)
chr3 (227-306)||(7886453-7886532)
chr3 (123-226)||(13702666-13702769)
chr3 (165-267)||(2764254-2764356)
chr3 (200-302)||(40047979-40048081)
chr3 (227-301)||(41751383-41751457)
chr3 (228-306)||(54690581-54690659)
chr3 (58-295)||(49543925-49544161)
chr3 (172-305)||(48136947-48137077)
chr3 (156-236)||(27067501-27067581)
chr3 (182-238)||(51486230-51486286)
chr3 (219-306)||(1330913-1331000)
chr3 (123-194)||(16776557-16776628)
chr3 (123-170)||(20084697-20084744)
chr3 (57-126)||(43408197-43408266)
chr3 (179-272)||(52656730-52656823)
chr3 (179-272)||(52661642-52661735)
chr3 (178-227)||(53589526-53589575)
chr3 (181-229)||(54690389-54690435)
chr3 (219-299)||(16869483-16869563)
chr3 (57-121)||(33360890-33360954)
chr3 (181-216)||(4073370-4073405)
chr3 (219-306)||(10284558-10284644)
chr3 (119-170)||(31397955-31398006)
chr3 (99-133)||(9018089-9018123)
chr3 (202-236)||(36824537-36824571)
chr3 (58-140)||(46557660-46557742)
chr3 (58-116)||(49543866-49543924)
chr3 (123-172)||(36732175-36732224)
chr3 (249-306)||(48921713-48921770)
chr3 (128-168)||(40048144-40048184)
[»] chr2 (179 HSPs)
chr2 (53-306)||(34883588-34883841)
chr2 (53-350)||(13197385-13197682)
chr2 (53-350)||(32120944-32121241)
chr2 (53-306)||(8716632-8716885)
chr2 (53-306)||(36130768-36131021)
chr2 (53-306)||(25624776-25625026)
chr2 (53-296)||(45474369-45474612)
chr2 (53-306)||(15404448-15404700)
chr2 (53-306)||(20727598-20727851)
chr2 (53-306)||(16669670-16669923)
chr2 (53-306)||(34062405-34062658)
chr2 (53-306)||(37229484-37229737)
chr2 (66-306)||(8990248-8990488)
chr2 (55-306)||(1943618-1943869)
chr2 (59-306)||(41450560-41450807)
chr2 (53-299)||(36020990-36021235)
chr2 (74-306)||(20252254-20252486)
chr2 (53-306)||(4711771-4712023)
chr2 (53-306)||(40680771-40681024)
chr2 (57-350)||(12889954-12890245)
chr2 (92-306)||(5664682-5664896)
chr2 (53-306)||(42629416-42629662)
chr2 (59-350)||(40788836-40789125)
chr2 (57-306)||(1143002-1143251)
chr2 (57-306)||(24345461-24345710)
chr2 (53-306)||(7491888-7492140)
chr2 (55-306)||(16456615-16456865)
chr2 (53-350)||(16108216-16108512)
chr2 (53-350)||(22897391-22897687)
chr2 (53-306)||(2438269-2438521)
chr2 (53-306)||(23789013-23789265)
chr2 (53-306)||(39833740-39833992)
chr2 (57-306)||(22182669-22182916)
chr2 (53-306)||(1359835-1360087)
chr2 (53-306)||(8841398-8841650)
chr2 (57-350)||(8912620-8912911)
chr2 (57-350)||(11865031-11865326)
chr2 (71-306)||(40607746-40607981)
chr2 (57-350)||(16805536-16805828)
chr2 (57-306)||(23465179-23465426)
chr2 (57-306)||(2200023-2200272)
chr2 (57-306)||(16844818-16845066)
chr2 (57-350)||(31751069-31751365)
chr2 (57-350)||(26322037-26322330)
chr2 (53-306)||(12360500-12360751)
chr2 (62-353)||(7116050-7116339)
chr2 (79-306)||(38214524-38214749)
chr2 (53-350)||(15227891-15228186)
chr2 (57-298)||(19034465-19034703)
chr2 (88-306)||(19318830-19319048)
chr2 (53-306)||(17408035-17408287)
chr2 (58-271)||(3670223-3670448)
chr2 (71-306)||(25523545-25523778)
chr2 (96-350)||(19353191-19353445)
chr2 (59-306)||(24973844-24974091)
chr2 (57-306)||(7418537-7418787)
chr2 (88-351)||(11851963-11852223)
chr2 (57-306)||(15571230-15571478)
chr2 (53-306)||(34113575-34113822)
chr2 (57-306)||(45628625-45628874)
chr2 (57-303)||(40680409-40680652)
chr2 (57-306)||(2060361-2060609)
chr2 (88-305)||(7666323-7666540)
chr2 (53-306)||(27560250-27560502)
chr2 (53-306)||(29239334-29239586)
chr2 (71-350)||(10399220-10399499)
chr2 (53-301)||(11201732-11201979)
chr2 (78-306)||(18375236-18375464)
chr2 (88-350)||(38121286-38121548)
chr2 (76-306)||(9697905-9698134)
chr2 (57-306)||(11385914-11386161)
chr2 (88-306)||(28840682-28840899)
chr2 (57-306)||(41003987-41004234)
chr2 (57-306)||(1748386-1748635)
chr2 (78-306)||(20643526-20643752)
chr2 (96-279)||(41967987-41968170)
chr2 (78-306)||(32712551-32712777)
chr2 (53-303)||(7531650-7531898)
chr2 (88-306)||(5255578-5255795)
chr2 (57-239)||(44436229-44436411)
chr2 (61-303)||(17665571-17665811)
chr2 (105-306)||(18374495-18374695)
chr2 (78-306)||(1859592-1859819)
chr2 (57-285)||(15353208-15353431)
chr2 (103-306)||(15435667-15435869)
chr2 (57-339)||(19630933-19631215)
chr2 (57-339)||(19827834-19828116)
chr2 (57-306)||(34944163-34944405)
chr2 (57-269)||(1422168-1422378)
chr2 (71-350)||(7933421-7933699)
chr2 (118-306)||(8782510-8782698)
chr2 (62-299)||(43701021-43701246)
chr2 (57-302)||(23083541-23083790)
chr2 (129-306)||(44573702-44573876)
chr2 (99-306)||(5070353-5070557)
chr2 (88-302)||(13336532-13336744)
chr2 (57-306)||(41834450-41834700)
chr2 (88-306)||(6007616-6007834)
chr2 (97-306)||(3060405-3060614)
chr2 (66-306)||(45151792-45152034)
chr2 (68-306)||(29830511-29830749)
chr2 (57-267)||(30779745-30779955)
chr2 (88-306)||(15917855-15918072)
chr2 (69-299)||(16808973-16809201)
chr2 (69-299)||(16848254-16848482)
chr2 (79-301)||(30466153-30466396)
chr2 (57-306)||(40173147-40173390)
chr2 (80-304)||(9040874-9041097)
chr2 (57-306)||(12619851-12620102)
chr2 (139-302)||(13215646-13215808)
chr2 (57-350)||(8295321-8295601)
chr2 (57-306)||(31633592-31633840)
chr2 (66-284)||(7461239-7461457)
chr2 (152-306)||(10757816-10757971)
chr2 (69-279)||(18223656-18223867)
chr2 (57-306)||(32511063-32511293)
chr2 (88-299)||(8030794-8030992)
chr2 (57-306)||(30857982-30858230)
chr2 (57-306)||(9701114-9701362)
chr2 (164-306)||(12873033-12873175)
chr2 (57-306)||(6028386-6028634)
chr2 (57-306)||(36750629-36750877)
chr2 (57-306)||(18970474-18970722)
chr2 (58-350)||(34431947-34432237)
chr2 (119-350)||(28566151-28566381)
chr2 (119-306)||(2788145-2788330)
chr2 (186-350)||(26334717-26334882)
chr2 (181-270)||(7446945-7447034)
chr2 (118-351)||(3095298-3095530)
chr2 (113-272)||(29830846-29831002)
chr2 (135-350)||(41494445-41494659)
chr2 (71-223)||(8867712-8867859)
chr2 (98-299)||(22302572-22302774)
chr2 (137-304)||(43700663-43700833)
chr2 (136-350)||(41422512-41422725)
chr2 (119-306)||(30830150-30830335)
chr2 (124-266)||(40348217-40348356)
chr2 (62-299)||(44017791-44018030)
chr2 (123-299)||(11121034-11121211)
chr2 (120-306)||(40544368-40544555)
chr2 (132-306)||(6650975-6651149)
chr2 (123-306)||(12296238-12296422)
chr2 (123-297)||(26273366-26273540)
chr2 (123-298)||(11083496-11083671)
chr2 (119-303)||(11944445-11944628)
chr2 (349-405)||(8440870-8440926)
chr2 (119-269)||(21838698-21838846)
chr2 (120-305)||(44417444-44417631)
chr2 (98-170)||(16636408-16636480)
chr2 (123-306)||(12969555-12969738)
chr2 (178-300)||(15079298-15079422)
chr2 (191-285)||(7457302-7457396)
chr2 (244-306)||(24300282-24300344)
chr2 (119-272)||(3904524-3904677)
chr2 (119-279)||(4408584-4408744)
chr2 (120-278)||(18294065-18294220)
chr2 (241-306)||(44436749-44436814)
chr2 (128-279)||(14493630-14493779)
chr2 (200-306)||(4897630-4897736)
chr2 (200-306)||(4945024-4945130)
chr2 (135-300)||(12873559-12873719)
chr2 (135-301)||(27725513-27725681)
chr2 (57-150)||(26334629-26334722)
chr2 (142-238)||(40544651-40544746)
chr2 (129-279)||(13598588-13598737)
chr2 (120-305)||(36556204-36556392)
chr2 (131-237)||(8056070-8056175)
chr2 (118-170)||(16807067-16807119)
chr2 (118-170)||(16846348-16846400)
chr2 (144-272)||(25888355-25888483)
chr2 (244-280)||(16636493-16636529)
chr2 (204-272)||(34722214-34722282)
chr2 (57-123)||(15435589-15435655)
chr2 (200-238)||(32979157-32979195)
chr2 (123-191)||(4897464-4897530)
chr2 (123-191)||(4944858-4944924)
chr2 (249-305)||(7016126-7016182)
chr2 (120-184)||(15079608-15079671)
chr2 (199-239)||(23389907-23389947)
[»] scaffold0649 (1 HSPs)
scaffold0649 (53-306)||(4038-4291)
[»] chr4 (233 HSPs)
chr4 (53-306)||(36391898-36392151)
chr4 (53-306)||(53276926-53277179)
chr4 (53-306)||(54676591-54676845)
chr4 (53-306)||(20391178-20391431)
chr4 (53-306)||(32032731-32032984)
chr4 (57-306)||(35675664-35675913)
chr4 (53-350)||(6753525-6753822)
chr4 (53-306)||(9327980-9328233)
chr4 (53-306)||(34272959-34273212)
chr4 (53-306)||(43387733-43387986)
chr4 (53-306)||(47806904-47807157)
chr4 (53-306)||(51536211-51536464)
chr4 (59-297)||(30771575-30771813)
chr4 (53-306)||(1028562-1028815)
chr4 (53-306)||(5375298-5375550)
chr4 (53-306)||(10588118-10588371)
chr4 (53-306)||(33413562-33413815)
chr4 (53-306)||(37352587-37352840)
chr4 (53-306)||(45742546-45742799)
chr4 (57-306)||(50424598-50424847)
chr4 (53-350)||(20285761-20286058)
chr4 (53-350)||(24754078-24754375)
chr4 (53-306)||(44294833-44295086)
chr4 (53-306)||(47228468-47228721)
chr4 (53-306)||(47298978-47299231)
chr4 (60-306)||(49228465-49228711)
chr4 (53-306)||(15241523-15241776)
chr4 (53-306)||(52978026-52978279)
chr4 (53-301)||(50533932-50534180)
chr4 (53-303)||(422669-422918)
chr4 (53-299)||(29427540-29427786)
chr4 (53-306)||(17609762-17610014)
chr4 (53-303)||(4455108-4455359)
chr4 (53-279)||(37364588-37364814)
chr4 (59-306)||(30745546-30745792)
chr4 (53-306)||(8343951-8344202)
chr4 (98-306)||(37357486-37357694)
chr4 (53-306)||(4035869-4036121)
chr4 (57-350)||(4415965-4416257)
chr4 (58-350)||(13620601-13620891)
chr4 (53-306)||(5743400-5743652)
chr4 (57-306)||(55562870-55563119)
chr4 (57-306)||(625713-625960)
chr4 (53-306)||(2615684-2615938)
chr4 (57-350)||(31937076-31937369)
chr4 (53-350)||(53629792-53630088)
chr4 (53-306)||(29014065-29014317)
chr4 (59-351)||(29519911-29520202)
chr4 (57-306)||(38027176-38027425)
chr4 (53-306)||(55632000-55632252)
chr4 (71-350)||(30049842-30050121)
chr4 (118-306)||(50352108-50352296)
chr4 (79-306)||(19281857-19282074)
chr4 (53-306)||(4549630-4549882)
chr4 (94-306)||(14793806-14794016)
chr4 (53-306)||(20747214-20747466)
chr4 (57-305)||(25474861-25475107)
chr4 (59-306)||(20454930-20455175)
chr4 (57-350)||(39114633-39114924)
chr4 (57-306)||(17339122-17339371)
chr4 (71-296)||(52850212-52850437)
chr4 (57-347)||(47683092-47683381)
chr4 (53-350)||(48030313-48030608)
chr4 (53-306)||(26625744-26625995)
chr4 (88-306)||(37173877-37174095)
chr4 (58-350)||(56432518-56432811)
chr4 (57-306)||(20767960-20768209)
chr4 (57-306)||(36990958-36991207)
chr4 (53-306)||(39144448-39144700)
chr4 (57-306)||(50450969-50451218)
chr4 (57-306)||(50602842-50603090)
chr4 (62-306)||(52870688-52870931)
chr4 (79-306)||(375468-375695)
chr4 (57-350)||(6462435-6462727)
chr4 (88-302)||(25124020-25124234)
chr4 (61-306)||(26866610-26866856)
chr4 (57-303)||(29460449-29460695)
chr4 (53-306)||(25708421-25708672)
chr4 (53-226)||(33501669-33501842)
chr4 (57-306)||(23777548-23777794)
chr4 (98-306)||(36129875-36130083)
chr4 (57-350)||(36900856-36901147)
chr4 (71-306)||(37776494-37776727)
chr4 (57-350)||(28298114-28298408)
chr4 (88-306)||(37842219-37842435)
chr4 (71-306)||(48241408-48241643)
chr4 (61-306)||(34948401-34948644)
chr4 (53-306)||(45096907-45097158)
chr4 (88-306)||(47311334-47311551)
chr4 (88-306)||(51717873-51718091)
chr4 (57-306)||(6083328-6083576)
chr4 (59-350)||(49373441-49373730)
chr4 (58-306)||(1859188-1859434)
chr4 (71-306)||(18706402-18706635)
chr4 (71-280)||(18882421-18882632)
chr4 (88-350)||(46949992-46950252)
chr4 (88-306)||(13389687-13389902)
chr4 (78-306)||(33988561-33988785)
chr4 (97-306)||(55014750-55014959)
chr4 (57-273)||(20761569-20761785)
chr4 (57-303)||(39670771-39671018)
chr4 (71-306)||(37518049-37518282)
chr4 (71-306)||(37522265-37522498)
chr4 (134-306)||(41191449-41191621)
chr4 (88-306)||(45921475-45921690)
chr4 (57-306)||(54877760-54878005)
chr4 (65-306)||(39184003-39184242)
chr4 (94-295)||(1173616-1173817)
chr4 (78-299)||(34963435-34963654)
chr4 (97-306)||(51335837-51336046)
chr4 (78-306)||(18003987-18004213)
chr4 (57-259)||(30523769-30523969)
chr4 (88-306)||(38899820-38900036)
chr4 (99-347)||(54623804-54624051)
chr4 (57-299)||(40809607-40809849)
chr4 (77-306)||(20788975-20789204)
chr4 (88-300)||(41620564-41620774)
chr4 (71-299)||(55876431-55876657)
chr4 (99-306)||(4094759-4094965)
chr4 (71-258)||(45850482-45850669)
chr4 (88-306)||(16545759-16545976)
chr4 (58-350)||(49793091-49793381)
chr4 (71-351)||(37639646-37639925)
chr4 (57-249)||(54535926-54536118)
chr4 (53-204)||(6807492-6807643)
chr4 (57-279)||(52966166-52966387)
chr4 (113-306)||(9808398-9808591)
chr4 (88-299)||(15500387-15500598)
chr4 (81-306)||(39184317-39184539)
chr4 (67-306)||(17678273-17678512)
chr4 (97-273)||(18018735-18018911)
chr4 (131-267)||(38405643-38405779)
chr4 (182-351)||(49490036-49490206)
chr4 (61-306)||(36211302-36211546)
chr4 (57-269)||(20180662-20180873)
chr4 (57-306)||(28495428-28495677)
chr4 (57-306)||(32898983-32899212)
chr4 (144-347)||(48149017-48149220)
chr4 (99-299)||(49329541-49329741)
chr4 (57-224)||(41191280-41191447)
chr4 (57-306)||(51329526-51329759)
chr4 (121-350)||(28501196-28501423)
chr4 (57-353)||(13548977-13549271)
chr4 (119-350)||(13498293-13498523)
chr4 (57-233)||(23623753-23623928)
chr4 (98-236)||(46480805-46480943)
chr4 (181-296)||(5734546-5734661)
chr4 (119-302)||(6656552-6656733)
chr4 (129-300)||(8418162-8418333)
chr4 (81-260)||(3168204-3168380)
chr4 (182-306)||(20286094-20286218)
chr4 (59-350)||(53564103-53564393)
chr4 (120-306)||(6629284-6629466)
chr4 (113-299)||(31071749-31071932)
chr4 (191-306)||(42528469-42528584)
chr4 (120-304)||(48801427-48801610)
chr4 (58-306)||(20783232-20783477)
chr4 (119-298)||(26889708-26889884)
chr4 (119-306)||(30868605-30868793)
chr4 (119-306)||(29508849-29509035)
chr4 (119-302)||(41333857-41334039)
chr4 (177-268)||(53906099-53906190)
chr4 (221-306)||(468413-468498)
chr4 (119-299)||(32684648-32684825)
chr4 (135-306)||(52181009-52181177)
chr4 (119-350)||(18872717-18872947)
chr4 (119-279)||(47109627-47109786)
chr4 (123-277)||(10497439-10497593)
chr4 (182-306)||(18879543-18879665)
chr4 (57-170)||(49489885-49489998)
chr4 (135-306)||(17467935-17468102)
chr4 (119-306)||(35909685-35909872)
chr4 (119-306)||(23390155-23390341)
chr4 (200-306)||(39797478-39797584)
chr4 (57-170)||(5734392-5734505)
chr4 (53-121)||(50352484-50352552)
chr4 (122-236)||(706659-706773)
chr4 (122-236)||(729844-729958)
chr4 (201-306)||(36040849-36040955)
chr4 (119-306)||(3085490-3085672)
chr4 (57-170)||(39879917-39880030)
chr4 (119-299)||(13138777-13138956)
chr4 (230-306)||(23621502-23621578)
chr4 (57-165)||(53910317-53910425)
chr4 (135-306)||(6595556-6595726)
chr4 (119-306)||(30010659-30010843)
chr4 (57-277)||(21265291-21265511)
chr4 (88-170)||(55777073-55777155)
chr4 (119-223)||(42598519-42598621)
chr4 (219-306)||(11469142-11469229)
chr4 (219-306)||(11522232-11522319)
chr4 (151-285)||(51787597-51787732)
chr4 (147-301)||(26169788-26169941)
chr4 (88-170)||(55841253-55841335)
chr4 (148-278)||(7325999-7326133)
chr4 (123-240)||(26186510-26186627)
chr4 (228-350)||(46481303-46481426)
chr4 (142-269)||(49613990-49614115)
chr4 (79-170)||(4143567-4143658)
chr4 (119-238)||(19596248-19596366)
chr4 (200-306)||(24073013-24073119)
chr4 (119-306)||(37780022-37780206)
chr4 (86-209)||(5840069-5840189)
chr4 (128-305)||(22130323-22130503)
chr4 (142-299)||(50648972-50649133)
chr4 (98-185)||(27009626-27009715)
chr4 (119-223)||(55968949-55969053)
chr4 (119-268)||(7776751-7776902)
chr4 (112-231)||(2405965-2406081)
chr4 (200-299)||(38613458-38613557)
chr4 (257-350)||(2738786-2738879)
chr4 (226-299)||(38319656-38319729)
chr4 (123-238)||(22294301-22294417)
chr4 (182-306)||(25924501-25924625)
chr4 (120-238)||(38615940-38616058)
chr4 (219-306)||(15496175-15496262)
chr4 (200-279)||(50622480-50622559)
chr4 (119-223)||(54158710-54158822)
chr4 (53-91)||(9374739-9374777)
chr4 (225-295)||(55967928-55967998)
chr4 (120-192)||(36031198-36031269)
chr4 (61-121)||(55969070-55969130)
chr4 (212-303)||(7205194-7205284)
chr4 (219-306)||(17781429-17781516)
chr4 (219-306)||(19839857-19839944)
chr4 (57-136)||(38319726-38319805)
chr4 (59-197)||(50621486-50621624)
chr4 (219-306)||(52575663-52575750)
chr4 (208-298)||(28790153-28790243)
chr4 (57-123)||(42596071-42596137)
chr4 (249-306)||(17261389-17261446)
chr4 (99-152)||(48148710-48148763)
chr4 (120-223)||(20128631-20128732)
[»] chr6 (118 HSPs)
chr6 (53-350)||(25024246-25024543)
chr6 (53-306)||(34301572-34301825)
chr6 (53-303)||(25197199-25197449)
chr6 (57-304)||(6147429-6147676)
chr6 (53-306)||(30248691-30248944)
chr6 (53-306)||(287154-287407)
chr6 (53-306)||(33487875-33488128)
chr6 (53-306)||(12105804-12106057)
chr6 (53-306)||(230847-231099)
chr6 (53-306)||(10195734-10195987)
chr6 (53-301)||(17175205-17175453)
chr6 (57-350)||(9341838-9342131)
chr6 (57-306)||(13866639-13866886)
chr6 (57-306)||(31149992-31150239)
chr6 (53-306)||(5457456-5457709)
chr6 (57-350)||(25045387-25045680)
chr6 (53-306)||(13647869-13648122)
chr6 (53-306)||(1729843-1730095)
chr6 (57-350)||(7772176-7772469)
chr6 (57-306)||(8670179-8670426)
chr6 (61-350)||(34915291-34915580)
chr6 (57-350)||(402367-402658)
chr6 (53-306)||(11847615-11847868)
chr6 (57-306)||(20449925-20450174)
chr6 (57-350)||(15498629-15498920)
chr6 (53-306)||(9388530-9388784)
chr6 (53-306)||(34741510-34741762)
chr6 (57-351)||(31091444-31091736)
chr6 (71-306)||(17227286-17227521)
chr6 (53-306)||(925675-925926)
chr6 (53-306)||(1147009-1147260)
chr6 (53-303)||(23397880-23398129)
chr6 (61-306)||(2090703-2090948)
chr6 (57-306)||(31487115-31487364)
chr6 (60-306)||(8743231-8743476)
chr6 (57-306)||(16272712-16272959)
chr6 (53-306)||(34126185-34126436)
chr6 (57-302)||(16122302-16122546)
chr6 (62-306)||(19418873-19419117)
chr6 (56-306)||(19097546-19097794)
chr6 (53-350)||(1779785-1780081)
chr6 (53-306)||(12143823-12144074)
chr6 (101-299)||(15966950-15967148)
chr6 (57-350)||(13010864-13011157)
chr6 (62-306)||(18105921-18106164)
chr6 (59-303)||(344911-345158)
chr6 (53-299)||(15287190-15287434)
chr6 (88-306)||(23578201-23578419)
chr6 (57-306)||(23604506-23604755)
chr6 (79-350)||(15355321-15355591)
chr6 (97-306)||(13690516-13690725)
chr6 (58-305)||(345492-345738)
chr6 (57-299)||(3177232-3177471)
chr6 (79-306)||(390367-390592)
chr6 (141-306)||(9660505-9660670)
chr6 (88-300)||(31711625-31711835)
chr6 (53-306)||(6417919-6418167)
chr6 (58-299)||(33773628-33773871)
chr6 (57-262)||(20373123-20373326)
chr6 (63-279)||(235830-236043)
chr6 (113-306)||(5576180-5576369)
chr6 (57-299)||(8175712-8175948)
chr6 (65-306)||(15126508-15126748)
chr6 (58-306)||(22852077-22852324)
chr6 (140-306)||(11656172-11656339)
chr6 (57-303)||(32615035-32615279)
chr6 (128-295)||(9299245-9299411)
chr6 (53-165)||(29036259-29036371)
chr6 (57-306)||(6418397-6418645)
chr6 (129-270)||(17952175-17952316)
chr6 (57-306)||(22998790-22999038)
chr6 (57-306)||(23789366-23789614)
chr6 (119-306)||(11161895-11162083)
chr6 (58-305)||(13901684-13901930)
chr6 (57-306)||(8217466-8217712)
chr6 (57-306)||(4175286-4175534)
chr6 (177-306)||(11840415-11840543)
chr6 (135-306)||(22710310-22710478)
chr6 (53-306)||(9038686-9038936)
chr6 (177-350)||(29293663-29293836)
chr6 (120-296)||(4823026-4823198)
chr6 (123-298)||(8646015-8646190)
chr6 (88-306)||(11104616-11104816)
chr6 (60-350)||(13321076-13321363)
chr6 (135-350)||(11200594-11200808)
chr6 (139-306)||(23923536-23923701)
chr6 (119-279)||(27581457-27581616)
chr6 (119-306)||(28980662-28980849)
chr6 (67-207)||(26211040-26211182)
chr6 (217-306)||(29036169-29036258)
chr6 (58-140)||(11655814-11655896)
chr6 (135-303)||(14629950-14630115)
chr6 (119-306)||(28236010-28236194)
chr6 (119-306)||(27310478-27310662)
chr6 (120-238)||(33012473-33012590)
chr6 (186-299)||(8637148-8637261)
chr6 (123-226)||(6840082-6840183)
chr6 (118-217)||(2746349-2746448)
chr6 (177-306)||(13445999-13446127)
chr6 (123-306)||(23282615-23282799)
chr6 (57-140)||(9660138-9660221)
chr6 (177-238)||(8595644-8595705)
chr6 (147-280)||(32982458-32982589)
chr6 (68-165)||(5186251-5186348)
chr6 (177-241)||(17545371-17545431)
chr6 (142-223)||(493510-493590)
chr6 (249-305)||(2614137-2614193)
chr6 (199-279)||(8345311-8345391)
chr6 (123-223)||(2665541-2665641)
chr6 (75-126)||(17950505-17950556)
chr6 (65-138)||(225928-226000)
chr6 (249-306)||(4746064-4746121)
chr6 (149-242)||(7847150-7847242)
chr6 (206-279)||(11211576-11211649)
chr6 (206-279)||(11278457-11278530)
chr6 (218-306)||(2364998-2365086)
chr6 (121-197)||(17213601-17213677)
chr6 (57-161)||(17992177-17992281)
[»] chr1 (214 HSPs)
chr1 (53-306)||(42872074-42872327)
chr1 (53-306)||(52430914-52431167)
chr1 (53-306)||(11741441-11741694)
chr1 (53-306)||(30290309-30290562)
chr1 (59-306)||(45794388-45794635)
chr1 (53-299)||(50246670-50246916)
chr1 (53-306)||(11906968-11907221)
chr1 (53-306)||(46075608-46075860)
chr1 (53-301)||(47300633-47300881)
chr1 (53-306)||(49907065-49907318)
chr1 (53-350)||(16575832-16576129)
chr1 (53-305)||(16456681-16456933)
chr1 (53-306)||(50008223-50008476)
chr1 (53-306)||(943379-943630)
chr1 (78-306)||(2279998-2280225)
chr1 (54-279)||(8104031-8104256)
chr1 (53-306)||(32169695-32169947)
chr1 (57-306)||(6089779-6090026)
chr1 (53-306)||(45335929-45336182)
chr1 (53-275)||(36880363-36880582)
chr1 (61-350)||(9413075-9413362)
chr1 (57-306)||(34931123-34931370)
chr1 (53-306)||(36694898-36695151)
chr1 (53-306)||(36710999-36711252)
chr1 (57-350)||(27037269-27037562)
chr1 (53-306)||(30289603-30289855)
chr1 (53-306)||(39750122-39750374)
chr1 (53-306)||(44646315-44646567)
chr1 (53-306)||(52602035-52602286)
chr1 (53-306)||(15810973-15811225)
chr1 (71-306)||(42275918-42276153)
chr1 (53-299)||(9202246-9202491)
chr1 (57-306)||(23530589-23530838)
chr1 (53-306)||(39362935-39363187)
chr1 (57-350)||(28052189-28052482)
chr1 (53-306)||(23542023-23542275)
chr1 (57-352)||(28888167-28888463)
chr1 (53-306)||(39497477-39497729)
chr1 (53-306)||(44649673-44649925)
chr1 (57-306)||(48067639-48067888)
chr1 (79-306)||(27530369-27530595)
chr1 (53-303)||(1047993-1048242)
chr1 (53-306)||(4102456-4102707)
chr1 (57-306)||(41317638-41317885)
chr1 (53-306)||(41855215-41855466)
chr1 (57-306)||(9715404-9715653)
chr1 (71-288)||(14090010-14090227)
chr1 (57-306)||(28885847-28886096)
chr1 (53-306)||(37951690-37951942)
chr1 (57-306)||(45039456-45039704)
chr1 (69-306)||(8923426-8923661)
chr1 (62-306)||(15892313-15892557)
chr1 (57-296)||(5765735-5765973)
chr1 (57-306)||(24855325-24855574)
chr1 (88-306)||(25509252-25509468)
chr1 (57-306)||(38261384-38261633)
chr1 (88-350)||(21630881-21631144)
chr1 (79-306)||(26549836-26550059)
chr1 (95-306)||(31238763-31238972)
chr1 (79-306)||(229174-229401)
chr1 (88-303)||(27575412-27575627)
chr1 (88-346)||(45285585-45285843)
chr1 (88-306)||(12814563-12814780)
chr1 (57-306)||(40614651-40614898)
chr1 (53-306)||(1039122-1039374)
chr1 (53-306)||(1046028-1046280)
chr1 (57-306)||(38613519-38613768)
chr1 (75-306)||(1767626-1767855)
chr1 (67-350)||(18237094-18237374)
chr1 (102-306)||(50008018-50008221)
chr1 (71-306)||(15100400-15100641)
chr1 (57-306)||(7212303-7212552)
chr1 (57-350)||(7763496-7763786)
chr1 (57-301)||(27974900-27975144)
chr1 (58-306)||(36674043-36674291)
chr1 (57-304)||(48853864-48854109)
chr1 (53-306)||(7784035-7784290)
chr1 (88-306)||(13343817-13344035)
chr1 (88-298)||(14347174-14347384)
chr1 (71-306)||(15111625-15111864)
chr1 (53-306)||(35984403-35984655)
chr1 (88-306)||(15763359-15763577)
chr1 (109-299)||(39324576-39324766)
chr1 (88-350)||(3549032-3549291)
chr1 (79-306)||(37584997-37585222)
chr1 (106-306)||(50937822-50938022)
chr1 (79-306)||(31086689-31086916)
chr1 (79-306)||(37588986-37589211)
chr1 (88-306)||(8472093-8472308)
chr1 (78-303)||(19792629-19792852)
chr1 (53-303)||(47068835-47069084)
chr1 (57-306)||(9700495-9700743)
chr1 (70-306)||(10383799-10384036)
chr1 (57-306)||(22567113-22567361)
chr1 (71-350)||(3934606-3934884)
chr1 (66-306)||(31465709-31465949)
chr1 (88-306)||(2489177-2489393)
chr1 (53-271)||(14171610-14171826)
chr1 (59-305)||(32149057-32149303)
chr1 (88-306)||(9378876-9379096)
chr1 (113-306)||(15289978-15290171)
chr1 (98-306)||(26544548-26544754)
chr1 (88-280)||(43395448-43395638)
chr1 (78-306)||(45038128-45038355)
chr1 (57-306)||(38530896-38531143)
chr1 (88-350)||(51422202-51422465)
chr1 (65-306)||(32153546-32153787)
chr1 (99-280)||(43668188-43668369)
chr1 (76-306)||(47263499-47263731)
chr1 (57-280)||(47296311-47296534)
chr1 (94-261)||(25228285-25228452)
chr1 (68-305)||(15616178-15616417)
chr1 (57-244)||(47754431-47754618)
chr1 (99-269)||(896838-897008)
chr1 (57-306)||(31635875-31636123)
chr1 (108-298)||(46506209-46506398)
chr1 (88-270)||(51810956-51811138)
chr1 (71-303)||(4592625-4592857)
chr1 (98-304)||(34503282-34503488)
chr1 (118-300)||(39873490-39873672)
chr1 (88-280)||(25271261-25271450)
chr1 (57-238)||(25283918-25284099)
chr1 (59-306)||(38174920-38175163)
chr1 (91-306)||(47429166-47429380)
chr1 (88-301)||(10433369-10433583)
chr1 (57-233)||(44529419-44529593)
chr1 (121-305)||(48022951-48023134)
chr1 (142-304)||(43456451-43456612)
chr1 (157-306)||(11352908-11353057)
chr1 (57-301)||(27479647-27479890)
chr1 (123-306)||(26768429-26768611)
chr1 (119-306)||(39425637-39425823)
chr1 (199-306)||(39867542-39867649)
chr1 (119-306)||(49549045-49549231)
chr1 (119-305)||(2636993-2637178)
chr1 (57-225)||(13698736-13698903)
chr1 (119-350)||(15302551-15302781)
chr1 (119-279)||(35945279-35945438)
chr1 (120-306)||(30996788-30996973)
chr1 (88-222)||(44454602-44454736)
chr1 (57-306)||(37850182-37850430)
chr1 (57-306)||(52428932-52429179)
chr1 (203-306)||(27530803-27530905)
chr1 (119-306)||(51467280-51467465)
chr1 (199-306)||(51561764-51561871)
chr1 (57-240)||(1837317-1837506)
chr1 (57-350)||(17483733-17484024)
chr1 (104-301)||(18172377-18172561)
chr1 (213-306)||(32908286-32908379)
chr1 (120-306)||(21290165-21290350)
chr1 (58-306)||(43789698-43789949)
chr1 (119-306)||(4389653-4389839)
chr1 (140-306)||(5854421-5854585)
chr1 (120-279)||(23893505-23893663)
chr1 (57-300)||(35693112-35693357)
chr1 (62-272)||(1197916-1198128)
chr1 (128-279)||(9424838-9424989)
chr1 (136-350)||(29437678-29437891)
chr1 (99-258)||(31154351-31154509)
chr1 (228-306)||(5858299-5858377)
chr1 (61-306)||(39626985-39627229)
chr1 (142-306)||(41619998-41620159)
chr1 (57-170)||(51561075-51561188)
chr1 (185-350)||(39647664-39647830)
chr1 (135-351)||(4279951-4280164)
chr1 (128-306)||(50074454-50074632)
chr1 (88-168)||(32906742-32906822)
chr1 (119-303)||(48363821-48364004)
chr1 (200-303)||(19349254-19349357)
chr1 (119-298)||(27669894-27670071)
chr1 (113-279)||(31338946-31339112)
chr1 (57-174)||(26547681-26547797)
chr1 (53-269)||(38920317-38920530)
chr1 (123-306)||(1427243-1427425)
chr1 (157-272)||(8905490-8905604)
chr1 (219-306)||(44455529-44455616)
chr1 (119-299)||(1867262-1867442)
chr1 (57-170)||(26544393-26544506)
chr1 (120-279)||(4371574-4371730)
chr1 (78-226)||(18114237-18114385)
chr1 (128-240)||(30761007-30761119)
chr1 (119-306)||(46271159-46271343)
chr1 (200-306)||(38505843-38505948)
chr1 (123-279)||(15624703-15624862)
chr1 (120-237)||(2606722-2606842)
chr1 (142-300)||(9411210-9411367)
chr1 (118-266)||(33163202-33163352)
chr1 (67-170)||(8946397-8946500)
chr1 (119-298)||(6402670-6402847)
chr1 (135-223)||(45810116-45810204)
chr1 (57-226)||(22940566-22940733)
chr1 (120-225)||(10332310-10332415)
chr1 (123-350)||(33336801-33337025)
chr1 (250-303)||(47754065-47754118)
chr1 (61-149)||(27530946-27531034)
chr1 (123-238)||(5966685-5966799)
chr1 (251-306)||(44530546-44530601)
chr1 (123-237)||(46083979-46084093)
chr1 (181-238)||(13054800-13054857)
chr1 (205-305)||(15907108-15907208)
chr1 (120-168)||(23932941-23932989)
chr1 (252-306)||(25227351-25227405)
chr1 (72-145)||(43453329-43453402)
chr1 (219-279)||(35160218-35160278)
chr1 (200-267)||(37000735-37000803)
chr1 (147-239)||(10758451-10758545)
chr1 (142-231)||(25968424-25968512)
chr1 (119-162)||(52001530-52001573)
chr1 (161-299)||(43589268-43589405)
chr1 (119-215)||(22177575-22177669)
chr1 (200-300)||(3262958-3263058)
chr1 (203-299)||(6130120-6130216)
chr1 (145-193)||(15330967-15331015)
chr1 (58-106)||(30073975-30074023)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (53-306)||(31427-31680)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (53-306)||(61593-61846)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (53-306)||(6880-7133)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (53-306)||(8262-8514)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (53-306)||(51422-51675)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (63-306)||(258872-259115)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (53-306)||(24372-24623)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (53-273)||(9494-9714)
[»] scaffold0308 (2 HSPs)
scaffold0308 (53-305)||(14089-14340)
scaffold0308 (94-306)||(5067-5279)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (57-306)||(6356-6603)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (57-306)||(18540-18788)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (57-306)||(5194-5441)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (57-306)||(9929-10176)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (53-306)||(47684-47936)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (57-350)||(164214-164505)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (59-306)||(19705-19953)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (57-350)||(9171-9463)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (57-306)||(3481-3730)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (53-306)||(12108-12360)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (94-306)||(45715-45925)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (53-306)||(65379-65631)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (57-350)||(4409-4700)
[»] scaffold0907 (1 HSPs)
scaffold0907 (88-303)||(4352-4565)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (53-306)||(3526-3776)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (53-306)||(355043-355294)
scaffold0002 (119-221)||(92307-92409)
[»] scaffold0883 (1 HSPs)
scaffold0883 (88-306)||(1764-1982)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (88-306)||(45557-45775)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (57-306)||(93829-94078)
scaffold0039 (57-350)||(103808-104098)
scaffold0039 (145-222)||(92568-92647)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (71-350)||(117846-118123)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (57-306)||(48699-48946)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (79-350)||(311-581)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (88-306)||(4806-5021)
scaffold0443 (238-306)||(4724-4792)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (57-299)||(34156-34395)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (96-306)||(24263-24462)
[»] scaffold0280 (3 HSPs)
scaffold0280 (139-306)||(8407-8573)
scaffold0280 (88-199)||(13339-13450)
scaffold0280 (88-140)||(8082-8134)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (181-306)||(1315-1440)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (57-350)||(17464-17756)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (81-298)||(32932-33148)
scaffold0086 (120-212)||(22031-22119)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (88-235)||(40642-40789)
[»] scaffold0172 (2 HSPs)
scaffold0172 (88-223)||(18481-18616)
scaffold0172 (230-287)||(18134-18191)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (57-306)||(246500-246747)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (96-301)||(156185-156391)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (178-303)||(9531-9656)
scaffold0311 (57-165)||(9030-9136)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (57-306)||(11407-11652)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (119-306)||(36172-36356)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (57-192)||(13070-13204)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (131-278)||(5494-5640)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (53-106)||(6-59)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (120-239)||(616-733)
scaffold0407 (120-239)||(7080-7197)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (131-226)||(1953-2050)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (119-221)||(13679-13781)
[»] scaffold2116 (1 HSPs)
scaffold2116 (253-306)||(1-54)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (200-306)||(18484-18590)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (81-189)||(531-640)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (123-279)||(47226-47382)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (123-223)||(56051-56151)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (97-149)||(17502-17554)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 182)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 8251673 - 8251926
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8251673 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 8251772  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8251773 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 8251872  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8251873 aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 8251926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 50835 - 51088
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50835 actccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 50934  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50935 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 51034  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  51035 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 51088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 28191915 - 28192168
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  28191915 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttata 28192014  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28192015 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 28192114  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  28192115 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 28192168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Original strand, 35504320 - 35504566
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35504320 actccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 35504419  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504420 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 35504519  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35504520 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaa 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 8948095 - 8948344
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8948095 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 8948194  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8948195 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 8948294  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  8948295 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 8948344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 8951168 - 8951421
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  8951168 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgagaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttc 8951267  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8951268 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 8951367  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  8951368 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaa 8951421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34490814 - 34490561
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34490814 actccctccgtccctatatataagacccttttgcaaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 34490715  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34490714 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 34490615  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  34490614 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 34490561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1774639 - 1774386
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1774639 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatatgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 1774540  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1774539 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 1774440  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||    
T  1774439 aagaaatcattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaaggacaa 1774386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 38183306 - 38183559
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38183306 actccctccgtctctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 38183405  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38183406 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 38183505  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  38183506 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataataaaggacaa 38183559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38879018 - 38878765
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38879018 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 38878919  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38878918 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 38878819  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  38878818 atgaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 38878765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41014801 - 41014548
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41014801 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 41014702  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41014701 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatattttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 41014602  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  41014601 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaa 41014548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18754442 - 18754188
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18754442 actccatccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 18754343  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18754342 caattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 18754243  T
Q  253 aagaaataattaatgtag-ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18754242 aagaaataattaatgtagtttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 18754188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4076469 - 4076216
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4076469 actccctccgtccctatatataagacatttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 4076370  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4076369 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 4076270  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  4076269 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtattataaaaagggacaa 4076216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18456017 - 18455764
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18456017 actccctccgtccctatatataagacccttttgaaaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 18455918  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18455917 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgta 18455818  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  18455817 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 18455764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29598521 - 29598268
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29598521 actccctccgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 29598422  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29598421 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 29598322  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  29598321 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaatgtcttataaaaagggacaa 29598268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 32675497 - 32675750
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32675497 actccctctgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 32675596  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32675597 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 32675696  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32675697 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 32675750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 42598456 - 42598708
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42598456 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 42598555  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42598556 caattttatcctttaagaaagaacgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 42598655  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  42598656 aagaaataattaatgtagttggaaata-acaaagggtctaataaaaagggacaa 42598708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34568787 - 34568534
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34568787 actccctccgtctctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 34568688  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34568687 caattttatcctttaaaaaagaaggttattttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaacaagggcatgtatgta 34568588  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  34568587 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataagggacaa 34568534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14699749 - 14699452
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14699749 actccatccgtccctatatataagacccttttgtcaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 14699650  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14699649 caattttatcgtttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgta 14699550  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14699549 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggaagta 14699452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 63 - 350
Target Start/End: Original strand, 36176853 - 36177140
Alignment:
Q  63 tccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  36176853 tccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatc 36176952  T
Q  163 ctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 262  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36176953 ctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatctatgtaaagaaataat 36177052  T
Q  263 taatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36177053 taatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 36177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16999294 - 16999045
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  16999294 actctctccgttcctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttta 16999195  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999194 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatcttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 16999095  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  16999094 aaaaaataattaatatagttggaaataacaaaaggatcttataaaaaggg 16999045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 33745637 - 33745889
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33745637 actccatccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcaagggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 33745736  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33745737 caattttatcctttgagaaa-aaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 33745835  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  33745836 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 33745889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 279
Target Start/End: Original strand, 16125450 - 16125676
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16125450 actccctccgtccctatatataagacccttttatcaaaaacacgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 16125549  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16125550 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 16125649  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16125650 aagaaataattaatgtagttggaaata 16125676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28579933 - 28579683
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  28579933 actccctccgtccctatata--agaccattttgccaaagttacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgttt-taatcactattgttttta 28579837  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28579836 caattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 28579737  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  28579736 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 28579683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 53 - 301
Target Start/End: Original strand, 36661666 - 36661914
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36661666 actccctccgtccctatatataagactattttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 36661765  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  36661766 caattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatata 36661865  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  36661866 aagaattaattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagg 36661914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 18111721 - 18112012
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18111721 cctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 18111820  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111821 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 18111918  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||         |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18111919 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 18112012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 23687910 - 23688157
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23687910 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 23688009  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23688010 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 23688107  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23688108 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 23688157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5162597 - 5162303
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5162597 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5162498  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5162497 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 5162398  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5162397 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtag 5162303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23487355 - 23487064
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23487355 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 23487256  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23487255 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaa 23487158  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23487157 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 23487064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 32522589 - 32522836
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32522589 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 32522688  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32522689 tttatcctttaagagaga--gttggcttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 32522786  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32522787 aataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 32522836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13154224 - 13153972
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13154224 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 13154125  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154124 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 13154026  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  13154025 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 13153972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 5783891 - 5784185
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5783891 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5783990  T
Q  157 tttatccttt-aagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||||||| |||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5783991 tttatccttttaagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaag 5784090  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||          |||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5784091 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattagggacggaggtagta 5784185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40785183 - 40784934
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40785183 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaat 40785084  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40785083 tttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttacttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 40784984  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  40784983 aataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaa 40784934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 87 - 279
Target Start/End: Original strand, 16117225 - 16117417
Alignment:
Q  87 caaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttat 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16117225 caaaaacacgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttat 16117324  T
Q  187 gttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117325 gttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 16117417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5774342 - 5774048
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  || ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5774342 cctccgtccctaattacaaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5774243  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5774242 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatggaataggggcatgtatgtaaag 5774143  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5774142 aaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 5774048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 60 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12255384 - 12255139
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  12255384 ccgtccctaattataaaacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatatt 12255285  T
Q  160 atcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12255284 atcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 12255186  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  12255185 aattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 12255139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 60 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12260927 - 12260682
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  12260927 ccgtccctaattataaaacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatatt 12260828  T
Q  160 atcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12260827 atcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 12260729  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  12260728 aattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 12260682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 4631294 - 4631546
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4631294 actccatccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 4631393  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4631394 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatata 4631492  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  4631493 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 4631546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29279492 - 29279240
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  29279492 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaaattttttgtaatcactattgttttta 29279393  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29279392 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 29279294  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  29279293 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 29279240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26016864 - 26016613
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  26016864 actccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 26016765  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26016764 caattttatcctttaagagagaat--tgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 26016667  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  26016666 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagcggtcttataaaaagggacaa 26016613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11798901 - 11798649
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11798901 actccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcatgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 11798802  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11798801 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 11798703  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  11798702 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 11798649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40741560 - 40741309
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40741560 actccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgg-aattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 40741462  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40741461 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 40741363  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  40741362 aagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 40741309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Original strand, 9035281 - 9035525
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9035281 actccctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 9035380  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9035381 caattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 9035478  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9035479 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 9035525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 306
Target Start/End: Original strand, 26980759 - 26980969
Alignment:
Q  95 cgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||    
T  26980759 cgggaattaagatagtggatattt-tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattggtttatgttttcaa 26980857  T
Q  195 catgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttat 294  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26980858 catgttatttattggtgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttat 26980957  T
Q  295 aaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||    
T  26980958 aaaaagggacaa 26980969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 2151985 - 2152277
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  2151985 cctccgtccctatatataagactcttttgttaaaatcacgtgaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 2152084  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| || |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2152085 tttatcgtt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 2152183  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2152184 aataattaatgtagttggaaatagcaaataggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 2152277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 2944014 - 2944265
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  2944014 actccctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 2944113  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||    
T  2944114 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatatataataaataggggcatgcatgta 2944211  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2944212 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 2944265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 43653944 - 43654240
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43653944 actccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 43654043  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43654044 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 43654142  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43654143 aagaaataattaatgtagttggaaataataaagatgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 43654240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 44250860 - 44251114
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  44250860 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattattttta 44250959  T
Q  153 caattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44250960 caattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 44251059  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  44251060 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 44251114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 11482864 - 11483113
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11482864 cctccgtccctaattataagacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 11482963  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11482964 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 11483063  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  11483064 aataattaatgtagttgaaaatagaaaagtggtcttataaaaagggacaa 11483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 17856518 - 17856770
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17856518 actccctccgtccttaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 17856617  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17856618 caattttatcctt-aagagagatagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 17856716  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  17856717 aagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggacaa 17856770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 28864248 - 28864500
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28864248 actccctccatccctaattataagacccttttgttaaaatcagaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 28864347  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28864348 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 28864446  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  28864447 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 28864500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 60 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44502912 - 44502663
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  44502912 ccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatttt 44502813  T
Q  160 atccttta---agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| |   ||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44502812 atccttaagagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaata 44502713  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  44502712 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 44502663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 8072904 - 8073122
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  8072904 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatg 8073003  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  8073004 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacag 8073103  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||    
T  8073104 atcttataaaaagggacaa 8073122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39029472 - 39029222
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  39029472 actccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 39029373  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39029372 caattttatcctttaagagagaa--ttagtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 39029275  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  39029274 aagaaat-attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaa 39029222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33980718 - 33980508
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||    
T  33980718 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttca 33980621  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  33980620 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtctta 33980521  T
Q  294 taaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||    
T  33980520 taaaaagggacaa 33980508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 44580621 - 44580872
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44580621 cctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 44580720  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga--tgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    |||||||||||||| |||    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44580721 tttatcctttaagagagatgaatggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 44580820  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44580821 gaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaa 44580872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25058312 - 25058042
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  25058312 cccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagata--g 25058215  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058214 ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 25058115  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||| |||  ||| ||||||||| ||||||          |||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25058114 tagcaaagaggttttataaaaaaggacaaaaaaaattttcaaaatgatcttataattagggatggaagtagta 25058042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 33865318 - 33865534
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaaga-atgttagtttat 186  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||   ||||    
T  33865318 aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagatagatgtt---ttat 33865414  T
Q  187 gttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaag 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33865415 gttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagg 33865514  T
Q  287 ggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     |||||||||||||||||||    
T  33865515 agtcttataaaaagggacaa 33865534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38967436 - 38967187
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38967436 cctccgttcctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 38967337  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38967336 tttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaaga 38967237  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  38967236 aataattcatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaa 38967187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39406852 - 39406603
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39406852 cctccgtccctaattatagaacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 39406753  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39406752 tttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaaga 39406653  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  39406652 aataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 39406603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 299
Target Start/End: Original strand, 257313 - 257524
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  257313 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatg 257412  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  257413 ttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 257512  T
Q  288 gtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||    
T  257513 gtcttataaaaa 257524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 658607 - 658396
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  658607 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatg 658508  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  658507 ttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 658408  T
Q  288 gtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||    
T  658407 gtcttataaaaa 658396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 844343 - 844132
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  844343 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatg 844244  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  844243 ttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 844144  T
Q  288 gtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||    
T  844143 gtcttataaaaa 844132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 21652226 - 21652466
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  21652226 cctctgtccctatacataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatttttattgtttttaccat 21652325  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtat----aataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  21652326 tttatcctttaaaagagagggttagtttatgttttcaacataatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaatagaggcatgtatgta 21652425  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  21652426 aagaaataattaatgtggttgggaataacaaaagggtctta 21652466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 306
Target Start/End: Original strand, 36245665 - 36245906
Alignment:
Q  65 cctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 164  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  36245665 cctatatataagactcttttgctaaaaatacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttctaatcacaattgtttttacaattttctcct 36245764  T
Q  165 ttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataatt 263  Q
    | |||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36245765 t-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaaataatt 36245863  T
Q  264 aatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  36245864 aatgtagttgaaaatagcaaatggatcttataaaaagggacaa 36245906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 42985262 - 42985501
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42985262 tccgtccctaaatataacacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 42985361  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  42985362 tatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataat-aatatagacatgtatgtaaagaaa 42985460  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  42985461 taattaatgtagttgaaaatagcaaaagagtcttataaaaa 42985501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8566463 - 8566255
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||    
T  8566463 aaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttatgagaga--gttggtttatg 8566366  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  8566365 ttttcaacatgtcatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatga 8566266  T
Q  288 gtcttataaaa 298  Q
    |||||||||||    
T  8566265 gtcttataaaa 8566255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44888973 - 44888679
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  44888973 cctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattatttttacaat 44888874  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  44888873 tttatcctttaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtgtaataaatagggtcatgtatgaaaaga 44888774  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44888773 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtag 44888679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24992777 - 24992559
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  24992777 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatg 24992678  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  24992677 ttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagcatgaatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggg 24992578  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  24992577 gtcttataaaaacggacaa 24992559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44021297 - 44021055
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  || ||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44021297 tccgtccctaattacaaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatacgtttataattactattgtttttacaattt 44021198  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44021197 tatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 44021098  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44021097 taattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagg 44021055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45425325 - 45425079
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45425325 cctccgtccctatatataagaccattttgttaaaattgcggaaattaagaaagttgatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 45425226  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45425225 tttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataaggacatgtatgtaaaga 45425129  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  45425128 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataaaaagggacaa 45425079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 306
Target Start/End: Original strand, 29806039 - 29806216
Alignment:
Q  129 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29806039 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgt 29806138  T
Q  229 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  29806139 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 29806216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5268251 - 5268016
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 166  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||| ||||||||||    
T  5268251 tatatataagacctttttttcaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaaacattattatttt-acaaatttatccttt 5268153  T
Q  167 aagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 266  Q
    | || |||   ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5268152 atgagagagaattaatttatgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 5268053  T
Q  267 gtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  5268052 gtagttgaaagtagcaaaagagtcttatgaaaaggga 5268016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Original strand, 38780886 - 38781133
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  38780886 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttataat 38780985  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    || ||||||||||| |||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38780986 tt-atcctttaagagagaggattgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 38781084  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  38781085 aataattattgtggttggaaataggaaaggggtcttataaagagggaca 38781133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 306
Target Start/End: Original strand, 42218101 - 42218337
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 166  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  42218101 tatatataagactcttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaattttatctttt 42218200  T
Q  167 aagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 266  Q
    | || |||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42218201 a-gagaga--gttagtttatgtcttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcttgtatgtaaaaaaataattaat 42218297  T
Q  267 gtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||| |||||  ||| || ||||||||||| ||||||    
T  42218298 gtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaaaggacaa 42218337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44747309 - 44747098
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||    
T  44747309 aaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagagttggcttatg 44747210  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  44747209 ttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggg 44747111  T
Q  288 gtcttataaaaag 300  Q
    |||||||||||||    
T  44747110 gtcttataaaaag 44747098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 107 - 350
Target Start/End: Original strand, 44748257 - 44748500
Alignment:
Q  107 tagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttat 206  Q
    |||||||||| | |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |||||||    
T  44748257 tagtggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttat 44748356  T
Q  207 tgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  44748357 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaa 44748456  T
Q  307 nnnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
              ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44748457 aaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggaggtagta 44748500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 101 - 350
Target Start/End: Original strand, 29321083 - 29321331
Alignment:
Q  101 ttaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgtt 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| |    
T  29321083 ttaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgct 29321181  T
Q  201 atttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  29321182 atttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 29321281  T
Q  301 ggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29321282 ggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggatggaggtagta 29321331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 32474973 - 32475220
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  | || |||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  32474973 actccctccgtccctaattctaggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 32475072  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||||    
T  32475073 caattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggc----atgta 32475166  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  32475167 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaa 32475220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 7683339 - 7683556
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa-gaaagaatgttagtttat 186  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||    
T  7683339 aaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaagagagaat--tggtttat 7683436  T
Q  187 gttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaag 286  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7683437 gttttcaacatgttatatatcgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatg 7683536  T
Q  287 ggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     |||||||||||||||||||    
T  7683537 agtcttataaaaagggacaa 7683556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 306
Target Start/End: Original strand, 7758672 - 7758902
Alignment:
Q  56 ccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaa 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |    
T  7758672 ccctccgtacctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataatggatagttgtattaaagttgtttgtaatcact-ttgtttttacga 7758770  T
Q  156 ttttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7758771 ttttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttc-------------------attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 7758851  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  7758852 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 7758902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 306
Target Start/End: Original strand, 16448538 - 16448746
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||| ||    
T  16448538 gaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaatat 16448637  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
      ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16448638 tctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaa 16448737  T
Q  298 aagggacaa 306  Q
    |||||||||    
T  16448738 aagggacaa 16448746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 8797033 - 8797290
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaa---gtt-----gtttgtaattagtattgtt 148  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||     |||| |||||| |||||||    
T  8797033 cctccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttatatgtttataattactattgtt 8797132  T
Q  149 tttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 248  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8797133 tttacaattatatcctttaagagagagggttggtttattttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatcggcatgta 8797232  T
Q  249 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  8797233 tgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 8797290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 298
Target Start/End: Original strand, 7682782 - 7683022
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7682782 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 7682881  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||| | |||   || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7682882 tttatcctttaa-agagataattggtttatgttttcaacatgttatttatcgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 7682980  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||    
T  7682981 aataattaatgtagtcgaaaatagcaaaggggtcttataaaa 7683022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12825239 - 12825003
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||   ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12825239 cctccgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaat 12825140  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12825139 tttatcctttaagagagatagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaatatgtat-ataaataggggcatgtatgtaaaga 12825041  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttat 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  12825040 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaatgatcttat 12825003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 304
Target Start/End: Original strand, 18641161 - 18641368
Alignment:
Q  97 ggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 196  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||    
T  18641161 ggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttaaaca 18641260  T
Q  197 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  18641261 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggttatgtatgtaaagaaataattaatttagttgaaaatagaaaaggagtcttataa 18641360  T
Q  297 aaagggac 304  Q
    ||||||||    
T  18641361 aaagggac 18641368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Original strand, 35143287 - 35143513
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||||||  |||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |    
T  35143287 cccttttgaaaaaataaccggaattaagatagtatatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttgtcctttaagagaga--g 35143384  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35143385 ttggtttatgttttcaacatgttttttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaa 35143484  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||  |||   |||||||||||||||||||    
T  35143485 taacaaataagtcttataaaaagggacaa 35143513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45260515 - 45260267
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  45260515 cctccgtccctaattatatgactcttttga-aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttttacaat 45260417  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||| |    
T  45260416 tttatcctttaagagataaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtataataaataaggtcatgtatggaaata 45260317  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  | | ||||||||| ||||||    
T  45260316 aataattaatgtagttgaaaatagcaaatagattttataaaaatggacaa 45260267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4778851 - 4778635
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||  ||| ||||||     
T  4778851 aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacagttttatccattaagagagagggttggtttat- 4778753  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |     
T  4778752 ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatatatgtaaagaattaattaatgtagttggaaatagcaaatga 4778654  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  4778653 gtcttatagaaaggaacaa 4778635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21137133 - 21136903
Alignment:
Q  72 ataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaa 171  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||||     
T  21137133 ataagacccctttggcaaaatcatgggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttccaattttatcatttaagag 21137034  T
Q  172 agaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 271  Q
    | |  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  21137033 atagagttaatttatgttttcaacatgttatttattattcattgaagaaaaaaatgtataataaataggagtatgtaagtaaagaaatagttgatgtaat 21136934  T
Q  272 tggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21136933 tggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggg 21136903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 300
Target Start/End: Original strand, 26990568 - 26990815
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| || | |||| || |||||||||||||||||| | |||| |||||     
T  26990568 actccctccgtccctaattataagacctttttactaaaattacgggaattaagaaagcgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattttttttt 26990667  T
Q  153 c-aattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 251  Q
      |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26990668 ttaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 26990766  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  26990767 aaagaaataattaatgtatttggaaataacaaacgcgtcttataaaaag 26990815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 306
Target Start/End: Original strand, 14583882 - 14584124
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||  |||| ||||||||| | |||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  14583882 gtccctaattataggacccttttactaaaatcacagaaattaagaaagtgaatatttgtattaaaattatttgtaatcacaattgtttttacaattttat 14583981  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    |||| |||| ||||  || |||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14583982 cctt-aagagagaaaatttgtttatgtttttcatatgttatttattggtaattgaagaaaa-gatatataataaacaggggcatgtatataaagaaataa 14584079  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14584080 ttaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggacaa 14584124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41616162 - 41615977
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttag-----tttatgttttc 192  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |     |||||||||||    
T  41616162 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga-tgtttgatttatttatgttttc 41616064  T
Q  193 aacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41616063 aacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagatataattaatgtagttgaaaata 41615977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42885465 - 42885315
Alignment:
Q  55 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttaca 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42885465 tccctccgtcgctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 42885366  T
Q  155 attttatcct-ttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttattt 204  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42885365 attttatcttcttaagaaagaacgttagtttatgttttcaatatgttattt 42885315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 45283565 - 45283783
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||| | || |||| | ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||     
T  45283565 aaaataacgggaattaagacaatgaatatttatatcaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttata 45283664  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||       
T  45283665 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaagataattaatgtagttggaaataacaaagat 45283764  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  45283765 gtcttataaaaaggaacaa 45283783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5951286 - 5951162
Alignment:
Q  182 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  5951286 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagc 5951187  T
Q  282 aaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  5951186 aaaggggtcttataaaaagggacaa 5951162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31886931 - 31886742
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  31886931 aaaataacgggaattaagataataaatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 31886834  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31886833 ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaata 31886742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40856089 - 40855866
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40856089 cctccgtccctatatgtaagacctttttgctaaaatcacggtaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaattattattgtttttacaat 40855990  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg-ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaa 254  Q
    ||||| |||||||| | |  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||| |||    
T  40855989 tttat-ctttaagataaagagttagtttatgttttccatatgtttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataagaatatgtatgtaaaa 40855891  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
     ||||||||||||||||| ||||||    
T  40855890 aaaataattaatgtagttagaaata 40855866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5593650 - 5593470
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||  ||||||||    
T  5593650 tgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgattgaa 5593552  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  5593551 gaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 5593470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Original strand, 13568668 - 13568897
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-ag 169  Q
    |||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13568668 tataagacacttttgttaaaattacgagaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagag 13568767  T
Q  170 aaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    ||||| || |   |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  13568768 aaagagtgat---ttatgttttccatatgctatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag----aattaatgta 13568860  T
Q  270 gttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  13568861 gttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 13568897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 14548433 - 14548681
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  14548433 cctccgttcctatatataagaccattttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgcatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtgtttacaat 14548532  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| || | |||  |||  |||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  14548533 tttatccttaaa-agagatagtttatttatggtttccatatgctatttattgctgattgaagaccaatatgtataataaatagaggcatgtatgtacata 14548631  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||||||||||| ||||||    
T  14548632 aataattaatatagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaaaggacaa 14548681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35203089 - 35202938
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||    
T  35203089 gggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatccttta-gagaga--gttggtttatgttttcaac 35202993  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35202992 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatctataataaataggagcatgtatg 35202938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39463215 - 39463036
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39463215 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctt-aagaaagagactaggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaag 39463117  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  39463116 aaaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaggaaataattaacgtagttggaaatgacaaaggggtcttataaaaa 39463036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17336647 - 17336462
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17336647 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttt-acaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 17336550  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  17336549 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatacaaaaaaggtcttataaaaagggacaa 17336462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30140344 - 30140211
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  30140344 aaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggtttatg 30140245  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30140244 ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaa 30140211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36786759 - 36786512
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  |||| || ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  36786759 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattacggagattatgaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 36786660  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  36786659 tttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaga 36786561  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| || |||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  36786560 aataattaatctacttgg-aatatcaaatgagtcttataaaaagggacaa 36786512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11293883 - 11293697
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11293883 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 11293785  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||   || | |||||||||||||||||||    
T  11293784 aaaaagatgtaaaataagtaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccgaaggagtcttataaaaagggacaa 11293697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 110361 - 110172
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  110361 cgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaagatcgtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatctta 110262  T
Q  161 tccttta--agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 248  Q
    |||||||  ||| |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  110261 tcctttaagagagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattggtgattgaaaaaaaatatgtataataaataagagcatgta 110172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 122 - 303
Target Start/End: Original strand, 23894718 - 23894896
Alignment:
Q  122 ttaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23894718 ttaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaa 23894814  T
Q  222 aagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||| | |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  23894815 aagatgcaaaataaataaggatatgttagtaaagaaataattaatgtatttggaaatactaaatggatcttataaaaaggga 23894896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35179891 - 35179600
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||| |||| ||||| || |||||||||||||| || |  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  35179891 ctccgtgcctaaatataggagccttttgccaaaattactgagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaatt 35179792  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  35179791 ttatcctt-aagaaagagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaagaaaaaggtgcaaaataaataaaggtatgttggtaaagaa 35179693  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35179692 ataattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaaaggacaaattattttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 35179600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40529478 - 40529350
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40529478 gttagtttatgtttccat-atgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 40529380  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  40529379 ataataaaggggtcttataaaaaaggacaa 40529350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Original strand, 43292743 - 43292988
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |     ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  43292743 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattacggagattaagatagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 43292842  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | | ||||  |||||||    
T  43292843 tttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagagtatgttagtaaaga 43292939  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||  | |||||||||||||||||    
T  43292940 aataatgaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaagggaca 43292988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5110111 - 5109925
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  5110111 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttatagttgattgaaa 5110013  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  5110012 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgggtcttataaaaagggacaa 5109925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Original strand, 17851339 - 17851441
Alignment:
Q  204 tattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17851339 tattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatatagttggaaatagtaaaagagtcttataaaaaagga 17851438  T
Q  304 caa 306  Q
    |||    
T  17851439 caa 17851441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23497960 - 23497772
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa- 217  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  23497960 gtattaaatttgtatgcaattattattgtttttccaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaa 23497862  T
Q  218 -gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     |||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  23497861 agaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttataaataccaaaagggtcttataaaaagagacaa 23497772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12802838 - 12802657
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12802838 gtattaaatttgtatttaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 12802742  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  12802741 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatattaataaagaaataattaatgtacttggaaataccataggggtcttataaaaaggga 12802657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28965763 - 28965646
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  28965763 actctctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 28965664  T
Q  153 caattttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28965663 caattttatcctttaaga 28965646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 279
Target Start/End: Original strand, 25056642 - 25056865
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatct---gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttac 153  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||   |||||||||| | | ||||| |   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25056642 cctctgtccctatttataagacgtttttgacaaaatcgttggaattaagaaaattgatatttatagtattaaatttgtttgtaattattattgtttttac 25056741  T
Q  154 aattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata-ggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || || ||    
T  25056742 aattttatcctttaaaagagagagtttgtttatgttttcaacat----actattattgattgaagaaaaaaaatgtataataaatagggggtatataggt 25056837  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25056838 aaagaaataattaatgtagttggaaata 25056865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 272
Target Start/End: Original strand, 31089692 - 31089880
Alignment:
Q  74 aagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaag 173  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31089692 aagacctttttgccaaaataacgggaattatgaaagttgatatttgtattaaagttgtct---------attgtttttacaattttatcctttaagagag 31089782  T
Q  174 aatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa-ataattaatgtagtt 272  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  31089783 a--gttagtttatgttttcaacatgctatttattactgattgaagaaaaatatgtataataaataagagtatgtaggtaaaaaatttaattaatgtagtt 31089880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42885191 - 42885048
Alignment:
Q  213 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnn 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          
T  42885191 ttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttt 42885092  T
Q  313 nnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtagatgac 356  Q
        ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42885091 ttttcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagatgac 42885048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11114049 - 11113829
Alignment:
Q  82 tttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaa--gaatgtt 179  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||  |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||  |||    
T  11114049 tttgacaaaatcacgtgaattaaaaaagttcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttactattttatcctttaagagatagagagtt 11113950  T
Q  180 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa---taattaatgtagttggaa 276  Q
      |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||   |||||||| | ||| |||    
T  11113949 gttttatgtttttaacatgatatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagatgtatgtagataaagaaatagtaattaatatggttagaa 11113850  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  11113849 atagcaaaagagtcttataaa 11113829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28741147 - 28740961
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  28741147 cctccgttcatatatataagacccttttgttaaaattatgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttacaattattattgtttttacaat 28741048  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtat-aataaataggggc 243  Q
    ||||||| ||||||  ||  |||| ||||| ||||| | || |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28741047 tttatcc-ttaagagcgagagttaatttatattttctatatattatttattgctcattgaaaaaaaagatgtataaataaataggggc 28740961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 306
Target Start/End: Original strand, 5244451 - 5244620
Alignment:
Q  136 aattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataa 235  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  5244451 aattactattgtttttagaattttatcctt-aagagagagagttcatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataa 5244549  T
Q  236 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  5244550 ataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaa 5244620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14625806 - 14625680
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14625806 tataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaaga 14625707  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    ||||   || | |||||||||||||||    
T  14625706 aagaggattggcttatgttttcaacat 14625680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23995868 - 23995621
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||   ||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| | |||||||||||||    
T  23995868 cctccgtccctaaatataagagccttttaccaaaattgtggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaat 23995769  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| | || |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  23995768 tttatccttga-gagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 23995671  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23995670 aataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaa 23995621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 44165276 - 44165462
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||     
T  44165276 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaaga--gttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgag 44165373  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||    
T  44165374 gaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaatggacaa 44165462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 29738104 - 29738276
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||    
T  29738104 cctccgtccctatatgtaagacccttttgctaaaattacaggaattaagaaattggatatttgtattaaagttgatggtaatcactattatttttacaat 29738203  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataa 232  Q
    ||| | | |||||| |||  |||  ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29738204 tttgttc-ttaagagaga--gttgatttatgttttccatatgttatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataa 29738276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Original strand, 44056845 - 44056993
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||||||  ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  44056845 aaaatcacaagaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttagtttatg 44056941  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 239  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44056942 tttttcatatgatatttattgttgatttaaaaaaaagatgtataataaatag 44056993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 305
Target Start/End: Original strand, 44580917 - 44581045
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  44580917 gttaatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaa 44581016  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||  |||  ||  |||||||||||||||    
T  44581017 ataacaaagaggcattataaaaagggaca 44581045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35203254 - 35203098
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||           |||  |||  ||||||    
T  35203254 aaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttag----------agagggttgatttatg 35203165  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35203164 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatacggacatgtatgtaaa 35203098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19176286 - 19176180
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19176286 tatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaa 19176187  T
Q  300 gggacaa 306  Q
    |||||||    
T  19176186 gggacaa 19176180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26626007 - 26625793
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  26626007 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaaga--gttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaat 26625910  T
Q  234 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataat 333  Q
    ||||| | | | ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||          |||||   |||||||||    
T  26625909 aaataagagtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaaaggtcttataat 26625810  T
Q  334 tagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||    
T  26625809 tagggatggaggtagta 26625793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28965636 - 28965548
Alignment:
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  28965636 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 28965548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30512991 - 30512817
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||  | |||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  30512991 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt--agagaga--gctagtttgtgttttcaacatagtatttaatgttcattgaagaaaa 30512896  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa-taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||| || |||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  30512895 agatataaaataaataggggtatgttggtaaaaaaattaattaatgtacttgaaaataccaaaggggtcttataaaaag 30512817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36941560 - 36941314
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||  |||  ||||||| ||| |||    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  36941560 cctccgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 36941461  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||   ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  36941460 tttatcctt-aagagagagagtagatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 36941363  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||  | |||||||||||||||||    
T  36941362 aataattaatgtacttgaaaataccaaatagatcttataaaaagggaca 36941314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 306
Target Start/End: Original strand, 9615956 - 9616076
Alignment:
Q  185 atgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaa 284  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  9615956 atgttttacacatgttatatattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtagttaaagaaataattaacgtagtttgaaatag-aaa 9616054  T
Q  285 agggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     | |||||||||||||| ||||    
T  9616055 tgagtcttataaaaaggaacaa 9616076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Original strand, 41898317 - 41898534
Alignment:
Q  135 taattagtattgttttt-acaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgt--tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtata 231  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| |  |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  41898317 taattactattgttttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaa 41898414  T
Q  232 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttata 331  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||          |||||| ||||||||    
T  41898415 ataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaaaggacaaattattttttcaaaaggatcttata 41898514  T
Q  332 attagggatggaggtagtag 351  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  41898515 attagggacggaggtagtag 41898534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39970247 - 39970039
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||||||||||  ||||| | | ||||||||| | | || ||  ||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  39970247 tataagacccttttgaaaaaataaggagaattaagaaaattgaaatgagtaataaatttgtttgtaattgtcattgtttttacaattgtatcctttaaaa 39970148  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  |||||| ||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||  |||||||| |||||||||||     
T  39970147 gagagggttagtgtatgttttcaatataatatttactgctgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtgtgttggtaaagaattaattaatgtat 39970048  T
Q  271 ttggaaata 279  Q
    |||||||||    
T  39970047 ttggaaata 39970039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 279
Target Start/End: Original strand, 39970555 - 39970693
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaa-gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 240  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || || |||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  39970555 tattgtttttacaatttaatacttaaaagagagagagtttgtttatgttttcaacatagtatttattgttgatggaagaaaaatatgtaaaataaataag 39970654  T
Q  241 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  39970655 ggcatgttggtaaagaaataattaatgtaattgaaaata 39970693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40530442 - 40530336
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  40530442 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacggttgttttta 40530343  T
Q  153 caatttt 159  Q
    |||||||    
T  40530342 caatttt 40530336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2767910 - 2767705
Alignment:
Q  70 atataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaag 169  Q
    |||||||| | ||||| ||||||  ||||| | |||| | | ||||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  2767910 atataagaacattttgacaaaattccgggagtaaagaaaattgatatttgtattaaagatctttgtaatcactattgtttttacaatattattatttaag 2767811  T
Q  170 aaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    | | |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| ||| |||||  | ||||||| |||||| ||    
T  2767810 agataat--tattttatgttttcaacatgttatttatttttgattgaagaaaaaaa--cataataaatatgggtatgtagctcaagaaatgattaattta 2767715  T
Q  270 gttggaaata 279  Q
    |||| |||||    
T  2767714 gttgaaaata 2767705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 300
Target Start/End: Original strand, 24260764 - 24260941
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||   ||||| ||||||||||| ||  |||||| |  |||||||||||||    
T  24260764 taaatttgtttgtaattactattgcttttacaattctatcctttaaaagagagaattagtgtatgttttcaagatagtatttaatactgattgaagaaaa 24260863  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||| || |||||||| ||| ||||  ||||| || ||||||||| | |||||||||  ||| || ||||||||||||    
T  24260864 agatataaaataaataagggtatgttggtaaaaaattaattaatgcacttggaaatatcaaagggatcttataaaaag 24260941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26502709 - 26502524
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta---agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattga 216  Q
    ||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| |   ||| |||  |||| ||||| |||||||| |  |||||||||   |||||    
T  26502709 tattaaatttgtatataatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagttaatttatattttcaacgtaatatttattg---attga 26502613  T
Q  217 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  26502612 agaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacatagaaatacaaaaggggtcttataaaaagggaca 26502524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13141670 - 13141504
Alignment:
Q  136 aattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataa 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||    
T  13141670 aattactattgtttttacaattttatc-tttaagagaga--gataatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaa-aaaaagatgcaaaataa 13141575  T
Q  236 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| ||  ||||   ||||||||||||||||| | ||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  13141574 ataaggatatgttgataaagaaataattaatggacttaaaaatatcaaaaaggtcttataaaaagggacaa 13141504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 39112533 - 39112655
Alignment:
Q  84 tgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtt 183  Q
    |||||| || |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||    
T  39112533 tgccaatattacgggaatgaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcatctaagagagaa-attagtt 39112631  T
Q  184 tatgttttcaacatgttatttatt 207  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  39112632 tatgtattcaacatgctatttatt 39112655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23425101 - 23424897
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| ||||||| ||||| || | ||||| |||||| ||||  ||||||| ||| | |   ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  23425101 cctctgtccctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttggttgttgtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 23425002  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| || | |||   ||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |    
T  23425001 tttatccttaaa-agagataattaatttatgttttcaagataatatttatggttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaa 23424903  T
Q  257 aataat 262  Q
    ||||||    
T  23424902 aataat 23424897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 306
Target Start/End: Original strand, 31619113 - 31619241
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| ||||||    
T  31619113 gttagtgtacgttttcaacatattatttaatgttgattgaagaaaaa-atataaaataaataggggtgtgttggtaaagaattagttaatgtacttggaa 31619211  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  31619212 ataccaaaaaggtcttataaaaagagacaa 31619241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 279
Target Start/End: Original strand, 25635979 - 25636074
Alignment:
Q  184 tatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  25635979 tatgttttccacatgctatttattgctgattgaaaataaacatgtataataaatagagacatgtatgtacagaaataattaatatagttgaaaata 25636074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Original strand, 44580498 - 44580609
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| || |||||| |||||||| || | || ||||||||||||    
T  44580498 cctccgtctctatatataagactattttgctaaaatcacgagaattaagaaagttaatatttgcattaaacttgtttgttatcactaatgtttttacaat 44580597  T
Q  157 tttatcctttaa 168  Q
    ||||||||||||    
T  44580598 tttatcctttaa 44580609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42747459 - 42747361
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||    
T  42747459 aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattttttttacaattttattctttaagagagagggttggtttatattttcaacat 42747361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16893885 - 16893769
Alignment:
Q  149 tttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 248  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |   | |||||||| ||| ||||     
T  16893885 tttacaattttatcttttaagagagaaagttagtgtatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaata---aaaataaataagggtatgtt 16893789  T
Q  249 tgtaaagaaataattaatgt 268  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  16893788 tgtaaagaattaattcatgt 16893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 25635897 - 25635973
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25635897 cgtccctatatataagacccttttgttaaaat-acggaaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 25635973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42220606 - 42220527
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42220606 tatttattgttg-ttgaagaaaaatatgtataataaatagaagtatgtatataaagaaataattaatgtaattggaaatag 42220527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 247
Target Start/End: Original strand, 19700824 - 19700942
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  19700824 ttgtttgtaattattactgtttttacaattttatcctttaagagaaagggttagtgtatgttttgaacataatatttaatgttgattgaa-aaaaatata 19700922  T
Q  228 tataataaataggggcatgt 247  Q
    || ||||||| |||| ||||    
T  19700923 taaaataaattggggtatgt 19700942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36409826 - 36409702
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||   ||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  36409826 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttattctt-aagagagagaattaatttatgtttttaatatgatatttattgttgattgaag 36409728  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggca 244  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  36409727 aaaaaaatgcaaaataaataagggca 36409702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 306
Target Start/End: Original strand, 13401786 - 13401913
Alignment:
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||| || ||| |||| ||||| ||||    
T  13401786 ttagtttatattttcaacatgctatttattgct-attgaagaaaaagatgtataataaatagggttatatagggaaaaaagtaactaatatagttagaaa 13401884  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| | |  | ||||||||||| ||||||    
T  13401885 tagcacagagatcttataaaaaaggacaa 13401913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Original strand, 15021173 - 15021268
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  15021173 ttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagagatgattagtgtatgttttgaacataatctttaatgttgattgaagaaaaa 15021268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Original strand, 37023177 - 37023276
Alignment:
Q  207 tgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||    
T  37023177 tgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttgaaaatatcaaagaggttttataaaaagggacaa 37023276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45145446 - 45145356
Alignment:
Q  147 tttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||   ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45145446 tttttacaattttattctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgtacaataaata 45145356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 146
Target Start/End: Original strand, 17851254 - 17851343
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattg 146  Q
    ||||||||||||  |||| | | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  17851254 cctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 17851343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Original strand, 28929365 - 28929418
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28929365 gtttatgttttcaacatgctatttattgtttattggagaaaaagatgtataata 28929418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 37296276 - 37296208
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagtt 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  37296276 cgtccctatatataagatcattttgtcaaaatcacgagaattaagaaagttgatatttgtattaaagtt 37296208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42486288 - 42486173
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat-cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||| |||| || ||  |||||| |||||||||||||||    
T  42486288 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatacttttaagagagataattagtttatatttttaa-atagtatttaatgttgattgaagaaa 42486190  T
Q  222 aagatgtataataaata 238  Q
    ||||  || ||||||||    
T  42486189 aagacataaaataaata 42486173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5952545 - 5952482
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttt 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  5952545 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgatttt 5952482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29073797 - 29073738
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaa 236  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29073797 gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 29073738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19261062 - 19260972
Alignment:
Q  180 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19261062 agtttttgtttttaacataatatttattgttgattgaataaaaagatgtaaaataaaatagggatatgtcggtaaaaaaataattaatgta 19260972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 198
Target Start/End: Original strand, 41388545 - 41388631
Alignment:
Q  112 gatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||| | |  | || |||||||||||||||||    
T  41388545 gatatttgtattaaaattgtttgtgatgactattatttttacaattttatcctttaagagatatagctaatttatgttttcaacatg 41388631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16894107 - 16894062
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 168  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16894107 taaaattgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 16894062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 299
Target Start/End: Original strand, 13335768 - 13335882
Alignment:
Q  193 aacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgta---taataaa--taggggc---atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaa 284  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||  ||||  |   ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||    
T  13335768 aacacgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtagtataataaacataggtactgtatgtaggtaaagaaataattaatgcagttgaaaataacaaa 13335867  T
Q  285 agggtcttataaaaa 299  Q
    || ||||||||||||    
T  13335868 agagtcttataaaaa 13335882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6989038 - 6988961
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    ||||||| || ||| |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  6989038 tattaaatttatttataattattattgttttgaaaattttatactttaagaaacagagtcagtttatgttttcaacat 6988961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24355310 - 24355214
Alignment:
Q  204 tattgttgattgaagaaaaa-gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||  ||| |||| ||||||||||    
T  24355310 tattgttgatttaagaaaaacgatgtataataaata-gggattgtaggtaaataaataattaacgtagttaaaaataacaaaggggtattataaaaag 24355214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Original strand, 29739768 - 29739840
Alignment:
Q  231 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||    
T  29739768 aataaataagggcatctatgtaaagaaataattaat---attggaaatagcaaatggatcttataaaaagtgacaa 29739840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 39112881 - 39112964
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattg--aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagta 282  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |   | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39112881 tatttattgttgattgaaaaaaaaaagatgtataataaacataagtatatatgtaaagaaataa-taatgtagttgaaaatagta 39112964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 306
Target Start/End: Original strand, 4348376 - 4348504
Alignment:
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||  |||||||| || | |||||| ||| |||    
T  4348376 ttagtgtatgttttcaacatagtatttaatactgattgaagaaaaagatataaaataaataaggatatgttggtaaagaattactgaatgtacttgaaaa 4348475  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||  |||   ||||||||||||| |||||    
T  4348476 taccaaatatgtcttataaaaagagacaa 4348504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2786318 - 2786188
Alignment:
Q  148 ttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 247  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||  |||| | ||| ||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||| |  ||||    
T  2786318 ttttacaaatttgtcttttaagaaagagggttactgtat-ttttcaatatagtatttaatgctgattgaagaaaaagatagaaaataaatagagatatgt 2786220  T
Q  248 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
      ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  2786219 tggtaaaaaattaattaatgtacttggaaata 2786188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19176920 - 19176874
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 165  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19176920 gtattaaatttgtatgtaattaatactgtttttacaattttatcctt 19176874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 162
Target Start/End: Original strand, 19715658 - 19715692
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19715658 ttgtttgtaattattattgtttttacaattttatc 19715692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Original strand, 31846246 - 31846394
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||||| || | |||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||    
T  31846246 cgtccctatgtataagactcttttactaaaattacag-aatttagaaagttgatatttatattaaagttgtttgtaattactatt-------caatttta 31846337  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||| |||||  ||  |||| ||||  |||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  31846338 tcctctaagagggatagttaatttaaattttcaacatgttacttattgctcattgaa 31846394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 41388726 - 41388768
Alignment:
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  41388726 aaataattaatgtagttaaaaatattaaaagggtcttataaaa 41388768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5449300 - 5449231
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5449300 tatttattattgattgaagaaaatgatgcaaaataaataaaggtatgttggtaaaaaaataattaatgta 5449231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36408515 - 36408462
Alignment:
Q  250 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  36408515 gtaaagaaataattaatgtactagaaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 36408462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3382032 - 3381875
Alignment:
Q  154 aattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat---- 249  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||| ||| || |||        
T  3382032 aattatatcctttaagaaaga--gttgatttatattttcaacataatatttattgttatttgaagaaaaatatgtcaattaaataagggtatatatgttg 3381935  T
Q  250 gtaaagaaa--taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtc-ttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||||  |||||| || ||||||||||| ||||    
T  3381934 gtaaagaaatgtaattaatttaattggaaataacaaaaggatctttataaaaaggaacaa 3381875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 187)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31458294 - 31458041
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31458294 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatgtctgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 31458195  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31458194 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 31458095  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31458094 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 31458041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 41025836 - 41026089
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41025836 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 41025935  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41025936 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 41026035  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  41026036 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 41026089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Original strand, 33858593 - 33858859
Alignment:
Q  39 gatggacatcatcaactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaat 138  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33858593 gatggaaatcatatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 33858692  T
Q  139 tagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33858693 cactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 33858792  T
Q  239 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  33858793 ggggcatgtatgtaaagaaataatcaatgtagttggaaata-acaaagggtcttataaaaagggacaa 33858859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 1275473 - 1275770
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1275473 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 1275572  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275573 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 1275672  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1275673 aagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaagggtcttataattagggatggagggagta 1275770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 25247431 - 25247684
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25247431 actccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 25247530  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25247531 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 25247630  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25247631 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 25247684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 39871353 - 39871606
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39871353 actccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 39871452  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39871453 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 39871552  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  39871553 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 39871606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 54 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8291199 - 8290947
Alignment:
Q  54 ctccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8291199 ctccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttac 8291100  T
Q  154 aattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8291099 aattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 8291000  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  8290999 agaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 8290947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 34978817 - 34979114
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34978817 actccctccgttcctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 34978916  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34978917 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 34979016  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34979017 aagaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 34979114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17491812 - 17491559
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  17491812 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgttttta 17491713  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491712 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 17491613  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  17491612 aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 17491559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 17561402 - 17561655
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  17561402 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgttttta 17561501  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17561502 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 17561601  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  17561602 aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 17561655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 8612315 - 8612568
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8612315 actccttccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 8612414  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8612415 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtc 8612514  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  8612515 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 8612568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26255392 - 26255139
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  26255392 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactaatgttttta 26255293  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26255292 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgta 26255193  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  26255192 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaatggtcttataaaaagggacaa 26255139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 29285781 - 29286030
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  29285781 cctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttagaat 29285880  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29285881 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 29285980  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29285981 aataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 29286030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32814730 - 32814477
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32814730 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 32814631  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32814630 caattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggtcatgtatgta 32814531  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32814530 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 32814477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Original strand, 36697871 - 36698121
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36697871 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 36697970  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36697971 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 36698070  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  36698071 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagtggtcttataaaaaggga 36698121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39198015 - 39197762
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39198015 actccctccgtccttatatataagaccattttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 39197916  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39197915 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 39197816  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  39197815 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaa 39197762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40300523 - 40300274
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40300523 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 40300424  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40300423 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 40300324  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  40300323 aataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 40300274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2006772 - 2006522
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  2006772 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaaccacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgttttta 2006673  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2006672 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 2006573  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||    
T  2006572 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagccttataaaaaggga 2006522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Original strand, 7703561 - 7703810
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7703561 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 7703660  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703661 caattttatcctttaggaaagaaggttagtt-atgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 7703759  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  7703760 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 7703810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6387622 - 6387369
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6387622 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 6387523  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6387522 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacattttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 6387423  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  6387422 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 6387369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 32872115 - 32872368
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32872115 actccctccatccttatatataagatccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 32872214  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32872215 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 32872314  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  32872315 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 32872368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44547723 - 44547470
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44547723 actccctccgtccctatatataagacctttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 44547624  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44547623 caattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 44547524  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||    
T  44547523 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaagggacaa 44547470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 31200102 - 31200357
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatata--agacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31200102 actccctccgtccctatatatataaggcccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 31200201  T
Q  151 tacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31200202 tacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatg 31200301  T
Q  251 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31200302 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 31200357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 65 - 306
Target Start/End: Original strand, 36646389 - 36646630
Alignment:
Q  65 cctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36646389 cctatatataagacctttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 36646488  T
Q  165 ttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36646489 ttaagaaagaaggttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataatta 36646588  T
Q  265 atgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  36646589 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 36646630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 29064195 - 29064450
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctata--tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttt 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  29064195 actccctccgtccctatatatataagacatttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgaaatcactattgtttt 29064294  T
Q  151 tacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29064295 tacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 29064394  T
Q  251 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  29064395 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 29064450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 306
Target Start/End: Original strand, 29642885 - 29643136
Alignment:
Q  54 ctccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttac 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29642885 ctccctccgttcctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttac 29642984  T
Q  154 aattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29642985 aattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 29643084  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||    
T  29643085 agaaataattaatgtagttgaaaata-acaaggggtcttataaaaagggacaa 29643136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 53 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48521323 - 48521076
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  48521323 actccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttatttgtaatcactattgttttta 48521224  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48521223 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 48521124  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  48521123 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 48521076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7449565 - 7449313
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  7449565 actccctccgtctttatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgatttta 7449466  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7449465 caattttatcctttaagaaa-aatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 7449367  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7449366 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 7449313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 41252102 - 41252354
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41252102 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 41252201  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41252202 caattttatcctttaagaat-aaggttagtttatgttttcaagatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgta 41252300  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  41252301 aagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 41252354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 53 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17327168 - 17326952
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  17327168 actccctccgtccctatatataagaccattttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaggttgtttgtaatcactattgttttta 17327069  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17327068 caattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 17326969  T
Q  253 aagaaataattaatgta 269  Q
    |||||||||||||||||    
T  17326968 aagaaataattaatgta 17326952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23320952 - 23320695
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23320952 actccctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 23320853  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg----aagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23320852 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaaagatgtataataaataaggacatgta 23320753  T
Q  249 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  23320752 tgtaaagaaataattgatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaa 23320695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 18112904 - 18113160
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaat---taagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttt 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18112904 actccctccatccctatatataagatccttttgtcaaaattacaggaatatttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 18113003  T
Q  150 ttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18113004 ttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtat 18113103  T
Q  250 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  18113104 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggttttataaaaagggacaa 18113160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Original strand, 36711039 - 36711288
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36711039 actccctccatccttatatataagacccttttgctaaaatcacggtaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 36711138  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36711139 caattttatcctttaagaaagaaggtcagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 36711237  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  36711238 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 36711288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Original strand, 35569400 - 35569645
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35569400 tccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 35569499  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569500 tatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 35569597  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  35569598 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaa 35569645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27529519 - 27529229
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27529519 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 27529420  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27529419 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 27529322  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27529321 aataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaattttttttt-caaaaggatcttataattagggacggaggtagta 27529229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 61 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7400420 - 7400129
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  7400420 cgtccctatatataagaccattttgccaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttgtttgtaatccttattgtttttacaatttta 7400321  T
Q  161 tcctttaa---gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    ||||||||   || |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7400320 tcctttaattagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaa 7400221  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||         ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7400220 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaa-ttttttttccaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 7400129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12930611 - 12930318
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12930611 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 12930512  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930511 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 12930414  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata-aaaagggacaannnnnnnnnc-caaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||         | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12930413 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagggacaatttttttttctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 12930318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21295447 - 21295195
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21295447 actccctccgtccctaattataagaactttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 21295348  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295347 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 21295249  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  21295248 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 21295195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 2289760 - 2290053
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  2289760 cctccgtccgtaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatatttacaat 2289859  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2289860 tttatcttttaagagagagagttcgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 2289959  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2289960 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttagaaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 2290053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 29176993 - 29177289
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29176993 actccctccgtctctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 29177092  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29177093 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgta 29177191  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29177192 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 29177289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32759853 - 32759602
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32759853 actccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 32759754  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32759753 caattttatcctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 32759656  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32759655 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 32759602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Original strand, 34012267 - 34012511
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34012267 cgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaatttta 34012366  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    ||||| || | |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34012367 tccttaaa-agagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataacaaataggggcttgtatgtaaagaaata 34012465  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34012466 attaatgtacttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggacaa 34012511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28061013 - 28060766
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28061013 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 28060914  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28060913 caattttatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggta 28060815  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  28060814 aagaaataattaatgtagttggaaata-acaaagggtcttataaaaaggg 28060766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43279993 - 43279749
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43279993 tccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 43279894  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43279893 tatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaa 43279797  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43279796 taattaatgtagtaggaaatagtaaaggggtcttataaaaagggacaa 43279749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43081514 - 43081252
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||    
T  43081514 aaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatg 43081415  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  43081414 ttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatga 43081315  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  43081314 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacgaaggtagta 43081252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 6799290 - 6799537
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||| |  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6799290 cctccgtcccaaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 6799389  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6799390 tttatcctttaagagaga--gatagtttatgctttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaaaga 6799487  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  6799488 aataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaaagggacaa 6799537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1575010 - 1574764
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575010 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 1574911  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1574910 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaataatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaaga 1574813  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  1574812 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggaca 1574764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Original strand, 11647601 - 11647827
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  11647601 cccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--g 11647698  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
     |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11647699 atgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 11647798  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11647799 tagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 11647827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38858590 - 38858342
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38858590 cctccgtcccttattataagacccttttgctaaaatcaagggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 38858491  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858490 tttatcctt-aagagagagagttcgtttatgtttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 38858392  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  38858391 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 38858342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9998549 - 9998331
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||  | |   | |||    
T  9998549 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagagggatgaataatg 9998450  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9998449 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 9998350  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  9998349 gtcttgtaaaaagggacaa 9998331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 62 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10475989 - 10475751
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||  ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10475989 gtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 10475890  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  10475889 cctttaagagagagtattggtttatgttttcaacatgtcatttattgctaattgaagaaaaagatgtataatatatagggtcatgtatgtaaataaataa 10475790  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10475789 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 10475751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 59 - 304
Target Start/End: Original strand, 28016292 - 28016537
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28016292 tccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 28016391  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28016392 tatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaaggtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 28016491  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagg-gtcttataaaaagggac 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  28016492 taattaatgtagttggaaata-taaaaggaatcttataaaaagggac 28016537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 9140277 - 9140526
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9140277 cctctgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 9140376  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9140377 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaagaggggcatgtatgtaaaaa 9140476  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  9140477 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaa 9140526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38428443 - 38428192
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38428443 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 38428344  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38428343 caattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgta 38428245  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||||    
T  38428244 aagaaataattaatgtagttagaaata-acaaaggatcttgtaaaaagggacaa 38428192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 94 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4857062 - 4856850
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||    
T  4857062 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatggttggtttaggttttca 4856963  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  4856962 acatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggaatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtctta 4856863  T
Q  294 taaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||    
T  4856862 taaaaagggacaa 4856850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9299393 - 9299100
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  9299393 cctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcatgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 9299294  T
Q  157 tttatccttta-agaaa--gaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    ||||||||| | |||||  ||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9299293 tttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaa 9299194  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggta 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9299193 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggacttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagtatcttataattagggacggaggta 9299100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23920023 - 23919776
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | | ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23920023 cctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 23919924  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| |||||||  ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23919923 tttatcttttaaga--gaaagatggtttatgttttcaacatattatttattgttgatggaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 23919826  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  23919825 aataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaaggaacaa 23919776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 9036674 - 9036922
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9036674 cctccgttcctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 9036773  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9036774 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaca 9036872  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  9036873 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 9036922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9303942 - 9303690
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  9303942 cctccgtccttatatataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 9303843  T
Q  157 tttatccttta-agaaa--gaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    ||||||||| | |||||  ||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9303842 tttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaa 9303743  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  9303742 agaaataattaatgtagttgtaaatagcaaaggggacttataaaaagggacaa 9303690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25951101 - 25950874
Alignment:
Q  81 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgtta 180  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||    
T  25951101 ttttgtcaaaatcacagcaattaagatagtggatatttgtattaacgttatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgatta 25951002  T
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga--aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25951001 gtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggatat 25950902  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  25950901 agcaaaggggtcttataaaaagggacaa 25950874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 306
Target Start/End: Original strand, 42298171 - 42298419
Alignment:
Q  56 ccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaa 155  Q
    |||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  42298171 ccctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattatttttacaa 42298270  T
Q  156 ttttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42298271 ttttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 42298368  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  42298369 aaataattaatatagttggaaatagcaaaggggtcttatgaaaagggacaa 42298419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 21870111 - 21870329
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  21870111 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatcctttaagagagagagttggtttatg 21870210  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21870211 ttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 21870310  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||| || |||||||    
T  21870311 gtcttatagaaggggacaa 21870329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30895853 - 30895560
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||   ||||||||  ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||     
T  30895853 cctccgtccctaattatagcgcccttttgaaaaaataacaggaattaagataatggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaaa 30895754  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| || | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30895753 tttatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 30895654  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||          |||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30895653 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatttcaaaaagatcttataattagggacggaggtagta 30895560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 47323304 - 47323522
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  47323304 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatg 47323403  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  |    
T  47323404 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataagaaagag 47323503  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
     | ||||||||||||||||    
T  47323504 attttataaaaagggacaa 47323522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 301
Target Start/End: Original strand, 41803228 - 41803460
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41803228 tataggaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 41803327  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg--tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 268  Q
     |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  41803328 gagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattat 41803427  T
Q  269 agttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41803428 agttgaaaataataaaggggtcttataaaaagg 41803460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37913354 - 37913119
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||| | ||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37913354 tataaggctcttttgaaaaaataacggtaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaaga 37913255  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    ||||  |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37913254 aagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtag 37913155  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  37913154 ttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagggacaa 37913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Original strand, 41002913 - 41003147
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||||  ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41002913 tataagaccaatttgctaaaattacaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aaga 41003011  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  | |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41003012 gagagagatagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 41003111  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  41003112 ttggaaataacaaatggatcttataaaaagggacaa 41003147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 788195 - 787977
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  |||  ||||||    
T  788195 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaggagagagggttgatttatg 788096  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |     
T  788095 ttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagaagtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaatagcaaatga 787996  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  787995 gtcttataaaaagggacaa 787977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19920857 - 19920607
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  19920857 actccttccgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttta 19920758  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    || ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19920757 ca-ttttatcctttaagagagaat--tgatttatgttttcaacatgatatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatgta 19920661  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  19920660 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaa 19920607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45907540 - 45907289
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  45907540 actccctccgttcctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 45907441  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  45907440 caattttatcctttaagagagaat--tgatttatgtttccaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgta 45907343  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  45907342 aaaaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaa 45907289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 96 - 304
Target Start/End: Original strand, 7607417 - 7607625
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  7607417 gggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagagagagtgttggtttatgttttcaac 7607516  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||| |||    
T  7607517 atattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattcatgcagttggaaatagcaaagaggtctcata 7607616  T
Q  296 aaaagggac 304  Q
    |||||||||    
T  7607617 aaaagggac 7607625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23364306 - 23364058
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||| ||| |||||||||||||| |    
T  23364306 ctccgtccctaattatagggccctttttaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtagttactattgtttttacaaat 23364207  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23364206 ttatcctttaagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgatcgaagaaaaagatgaataataaataagagcatgtatgtaaagaa 23364107  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||    
T  23364106 ataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaagagacaa 23364058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41444495 - 41444246
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||     
T  41444495 cctccgtccctaattataagatccttttgaaaaaataacgggaattgagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaa 41444396  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41444395 tttattattcaagagagagtgttagtttatgttttcaacatgttatttattgctggtataataaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 41444296  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  41444295 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaa 41444246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26736779 - 26736524
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26736779 cctccatccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 26736680  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatg------ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 250  Q
    | ||||||| |||| |||  |      || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26736679 tatatccttgaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 26736580  T
Q  251 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  26736579 taaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaa 26736524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38736711 - 38736499
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  ||||||    
T  38736711 aaaataacaggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattatcattgtttttacaattttattctttaaga--gaaggttgatttatg 38736614  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  38736613 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag-aaaaga 38736515  T
Q  288 gtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||||||    
T  38736514 gtcttataaaaaggga 38736499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31581967 - 31581722
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  31581967 cgtctctatatataagacctttttgttaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttataatttta 31581868  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    || ||||||| |||  |||||||||| ||||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31581867 tc-tttaagagagagagttagtttatattttccatacgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaata 31581769  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaa-gggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  31581768 attaatgtagttggaaatagcaaaaggggtcttataaaaaaggacaa 31581722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 46266120 - 46266367
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  46266120 cctctgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaat 46266219  T
Q  157 tttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    || |||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  46266220 ttaatcctttatatatagagagttagtttatgttttcaacatgatatttatagctgattgaag---aagaagtataataaataggggcttgtatgtaaaa 46266316  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  46266317 aaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaagagggacaa 46266367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 47657441 - 47657657
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |  ||||||    
T  47657441 aaaattacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttataattactattgtttttacaattttatcttttaagacagaat--tgatttatg 47657538  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  47657539 ttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtg 47657638  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47657639 gtcttataaaaagggacaa 47657657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 43093183 - 43093401
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||| ||||||     
T  43093183 aaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattataattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttata 43093282  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |     
T  43093283 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaatagcaaatga 43093382  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||    
T  43093383 gttttataaaaagggacaa 43093401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48009190 - 48008978
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg--ttagtttatgttttca 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||    
T  48009190 gggaattaagatagtggatatttgtatttaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgagttgatttatgctttca 48009091  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||    
T  48009090 atatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaaagggttctta 48008991  T
Q  294 taaaaagggacaa 306  Q
    |||||| ||||||    
T  48008990 taaaaaaggacaa 48008978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3024843 - 3024628
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  3024843 aaaataacgggaattaagatagtgaatgtttgtattaaatatatttgtaattagtattgtttt-acaattttatcctttaagagaga--gatgatttatg 3024747  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||       
T  3024746 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatatatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagaa 3024647  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3024646 gtcttataaaaagggacaa 3024628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 58 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12130338 - 12130126
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||     
T  12130338 ctccgtccctaattatagggccctattgagaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatg 12130239  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
      ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12130238 --atcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 12130141  T
Q  258 ataattaatgtagtt 272  Q
    |||||||||| ||||    
T  12130140 ataattaatgcagtt 12130126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26843064 - 26842835
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26843064 cctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 26842965  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttt-------tcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 249  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26842964 tttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaagtttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtat 26842865  T
Q  250 gtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26842864 ggaaagaaataattaatgtagttgaaaata 26842835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 304
Target Start/End: Original strand, 7400471 - 7400712
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  7400471 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggga-ttaagaaagttgaaatttgtattgaagatgtttgtaatcactattgtttttacaagtttat 7400569  T
Q  162 cctttaa--gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    |||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||    
T  7400570 cctttaaaagaaagaat--taatttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgcaaataaagaaat 7400667  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||    
T  7400668 aattaatgcagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaaaggac 7400712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21119851 - 21119609
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  || | || |||||||  ||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21119851 cctccgtccctaattacaggatccttttgaaaaaataaaggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 21119752  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21119751 tttatcatttaagagagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaacaatgtataataaataggggcatgcatgtaaaga 21119652  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  21119651 aataattaatgtaattggaaataacaaacgagtcttataaaaa 21119609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 113 - 306
Target Start/End: Original strand, 43440910 - 43441103
Alignment:
Q  113 atatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 212  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  43440910 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 43441009  T
Q  213 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  43441010 ttgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagataatgagtcttataaaaagggacaa 43441103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 299
Target Start/End: Original strand, 27881832 - 27882074
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27881832 cctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgtttttacaat 27881931  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |    
T  27881932 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaatagagacatgtatgtaaaaa 27882031  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagg-gtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27882032 aataattaatgtagttagaaata-taaaaggtgtcttataaaaa 27882074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19619295 - 19619078
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||     
T  19619295 aaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaaatactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttata 19619196  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  19619195 tttgcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaattg-caaagg 19619097  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  19619096 gtcttaagaaaagggacaa 19619078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 301
Target Start/End: Original strand, 30737787 - 30738001
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaat-----gttagt 182  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||    
T  30737787 aaaataacgggaactaagatagtagatatttgtattaaatacgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaaagagggttggt 30737886  T
Q  183 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagta 282  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30737887 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaa 30737982  T
Q  283 aaagggtcttataaaaagg 301  Q
    || ||||||||||||||||    
T  30737983 aatgggtcttataaaaagg 30738001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44719415 - 44719172
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| ||  |||| || |||||||  |||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  44719415 cctccgtccataattataggatccttttgttaaaatcactggaatgaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataat 44719316  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||     ||||  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  44719315 tttatcctt-----aagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatttacaataaatatgggcatgtatgtaaaga 44719221  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  44719220 aataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagggaca 44719172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 5524742 - 5524991
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5524742 cctccgtccctatatataagatctttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 5524841  T
Q  157 tttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  5524842 tttatccttaagagagagagagttgatttatgttttccatatg-catttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatgagggcatatatataaag 5524940  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  5524941 aaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaa 5524991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 306
Target Start/End: Original strand, 47534667 - 47534896
Alignment:
Q  76 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaa 175  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  47534667 gaccattttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattgttgtttttacaattttatcc-ttaagagaga- 47534764  T
Q  176 tgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa----taattaatgtagt 271  Q
     |||| ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  47534765 -gttattttatgttttccatatgttatttattgctaattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaattaatgtagt 47534862  T
Q  272 tggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  47534863 tgaaaatag-caaagggttttataaaaagggacaa 47534896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 294
Target Start/End: Original strand, 10538879 - 10539116
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10538879 cgtccctatatataagacccatttgtcaaaatcaccaaaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaatttta 10538978  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa------gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||       ||||| ||||| |||||||| ||| || || |||||    
T  10538979 tcctttaatagaga--gttagtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaaaaaaagaaaaaaaatgtaaaataaataagggtatttaggtaaa 10539076  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10539077 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat 10539116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 88 - 280
Target Start/End: Original strand, 44780168 - 44780358
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||  ||||||    
T  44780168 aaaataacgagaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagagggttgatttatg 44780267  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780268 ttttcaacatgttatttattgctgattga--aaaaaaatctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 44780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 182 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17317609 - 17317485
Alignment:
Q  182 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17317609 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 17317510  T
Q  282 aaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  17317509 aaaggggtcttataaaaagggacaa 17317485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23109360 - 23109144
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||     
T  23109360 cctccgtccctaattataggaccctattgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattttttttacaaa 23109261  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23109260 tttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatgtaaaga 23109161  T
Q  257 aataattaatgtagttg 273  Q
    |||||||||||||||||    
T  23109160 aataattaatgtagttg 23109144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 254
Target Start/End: Original strand, 20950787 - 20950978
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20950787 ccgtccctaattataggacccttttga-aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaatttt 20950885  T
Q  160 atcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20950886 atcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaacatgttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgcatgtaaa 20950978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41787495 - 41787302
Alignment:
Q  103 aagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttat 202  Q
    ||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41787495 aagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaa--aggttggtttatgttttaaacatgttat 41787398  T
Q  203 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  41787397 ttattgccgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaa 41787302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 264
Target Start/End: Original strand, 24299979 - 24300155
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| |||||||    
T  24299979 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaaaagagagggttggtttatg 24300078  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 264  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24300079 ttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggtatgtatgtaaagaaataatta 24300155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 350
Target Start/End: Original strand, 22991503 - 22991781
Alignment:
Q  70 atataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaag 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| |  ||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||    
T  22991503 atataagacccttttactaaaattacgggaattaagaaagttggaattagtattaaatttgtttataattactattgtttttaca-ttttatccta-aag 22991600  T
Q  170 aaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||    |||||||||||||||||||    
T  22991601 agagagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaagaaaaagatgcaaaataaataggggtatggtgataaagaaataattaatgta 22991700  T
Q  270 gttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
     |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22991701 attggaaatagcaaatggatcttataaaaagggacaaaaaaaaaattcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 22991781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 181 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26299484 - 26299359
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26299484 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatag 26299385  T
Q  281 taaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  26299384 taaaggggtcttataaaaagggacaa 26299359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34896126 - 34895901
Alignment:
Q  81 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgtta 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||    
T  34896126 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaaataaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcc-ttaagagagagagtta 34896028  T
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa-agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34896027 gtttatgttttccatatgctatttattgctaattgaagaaaattgatgtataataaataaggatatgtatgtacagaaataattaatgtagttgaaaata 34895928  T
Q  280 gtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | |||  | ||||||||||||||||||    
T  34895927 gcaaagagatcttataaaaagggacaa 34895901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 350
Target Start/End: Original strand, 18751746 - 18752019
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18751746 tataagactcttttgctaaaatcacgtaaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatttaatcactattatttttacaattttattctt-aaga 18751844  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     | |  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18751845 gata--gttggtttatgttttccatatgctatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtag 18751941  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18751942 ttgaaaatagcagagtggtcttataaaaatggacaaaaaattct--caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 18752019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38361402 - 38361195
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || |||  ||| |||||||||||||||    
T  38361402 gggaattaagacagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatt---gagagagagttggtttatgttttcaac 38361306  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||    
T  38361305 atgttatttatagctgattgaagaaaaagatatataataaatattagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctcgaaatagcaaagaagtcttata 38361206  T
Q  296 aaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||    
T  38361205 aaaagggacaa 38361195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Original strand, 46414835 - 46414991
Alignment:
Q  144 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa-agatgtataataaatagggg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  46414835 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattttttgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggag 46414934  T
Q  243 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  46414935 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaa 46414991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 19845412 - 19845706
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||| |||   |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  19845412 cctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattacggagattaagaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 19845511  T
Q  157 tttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||| | ||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||    
T  19845512 tttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaag 19845611  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19845612 aaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 19845706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16957906 - 16957729
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||  |    
T  16957906 cccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcgtttaa-agagatgg 16957808  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16957807 ttgatttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaga 16957729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 306
Target Start/End: Original strand, 9233444 - 9233569
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9233444 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatatacgtaaataaataattaatgtagttggaaatag 9233543  T
Q  281 taaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||| | |||||||||||||||||||    
T  9233544 caaatgagtcttataaaaagggacaa 9233569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19293047 - 19292837
Alignment:
Q  140 agtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  19293047 agtattgtttttacaattttattctt-aagagagatagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataa 19292949  T
Q  240 gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattaggga 339  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||    
T  19292948 gggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttagaaatactaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttct-caaaaggatcttataattaggga 19292850  T
Q  340 tggaggtagtaga 352  Q
     ||||||||||||    
T  19292849 cggaggtagtaga 19292837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27813792 - 27813544
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||  ||||||| |||||||    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  27813792 cctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagtggattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 27813693  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||  |||||||    
T  27813692 tttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgtaaaataaataagggtaggttggtaaaga 27813594  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| || ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27813593 aataattaatatacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaa 27813544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 347
Target Start/End: Original strand, 42887887 - 42888114
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42887887 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 42887985  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||          ||    
T  42887986 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggtaataccaaaggggtcttataaaaagtgacaattttttttttca 42888085  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggta 347  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42888086 aaaggatcttataattagggacggaggta 42888114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 304
Target Start/End: Original strand, 45777967 - 45778213
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||   |||||||||  |||||||| ||| || || |||||||||| |||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  45777967 cgtccttatatataagacatttttaaaaaaatcacgaaaattaagaaagttgaaatttgtattaaagatgtttgtaatcactattatttttataatttta 45778066  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag----gggcatgtatgtaaaga 256  Q
    || ||||||| | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     ||| ||| | |||||||    
T  45778067 tcttttaagagaaagaattagtttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaat-atgtataataaataaataagggtatgcaagtaaaga 45778165  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  45778166 aataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 45778213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9682893 - 9682599
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||   ||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  9682893 cctccgtccctaaatataagagcattttgccaaaattgtggacattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 9682794  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  9682793 tttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggtaaaga 9682696  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtagat 353  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9682695 aataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagat 9682599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29630007 - 29629761
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  29630007 cctccgttcctatatataagaccattttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatgtttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttgcaat 29629908  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttt----tcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||    |||||  |||  |||||||||    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    |||||    
T  29629907 tttatcctt---aaaagagagttgatttatgttttccatccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggac----atgta 29629815  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  | | || ||||||||||||||||||    
T  29629814 aagaaataattattgtagttgaaaataacagagggatcttataaaaagggacaa 29629761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 350
Target Start/End: Original strand, 31802869 - 31803157
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||  |||||| | |||  |||   |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31802869 tccgtccctagttataggatctttttgccaaaatcacgaaaattaaaaaagttaataatagtattaaatttgtttataattactattgtttttacaattt 31802968  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  31802969 tatcctt-aagagaga--gttagtttatgttttcaacataatatttattgtttattaaagaaaaagatgcaaaataaataggggtatggaggtaaagaaa 31803065  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||| || |||||||||| |||   |||||||||||  ||||||          |||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31803066 taattaatataattggaaatagcaaagcagtcttataaaagtggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattagggacggaggtagta 31803157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 49044865 - 49045113
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| ||||| |    |||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  49044865 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagtgggttgtagtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaat 49044964  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| || |  |||||||    
T  49044965 tttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataattaagggtatattggtaaaga 49045063  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  49045064 aataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaa 49045113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30534933 - 30534704
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  30534933 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 30534837  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||          ||    
T  30534836 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaaattattttttca 30534737  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30534736 aaagtgtcttataattagggacggaggtagtag 30534704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 303
Target Start/End: Original strand, 31769220 - 31769322
Alignment:
Q  201 atttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  31769220 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaag 31769319  T
Q  301 gga 303  Q
    |||    
T  31769320 gga 31769322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 217
Target Start/End: Original strand, 32118000 - 32118127
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  32118000 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttattacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatg 32118097  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32118098 ttttcaacatgttatttattgttgattgaa 32118127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Original strand, 21870840 - 21871013
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  21870840 cgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaattta 21870939  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    ||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21870940 tccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataata 21871013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 44510085 - 44510336
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  |||  ||||||| ||||| |    |||||||| | || |  ||||| ||||||||| |    
T  44510085 actccctccgtccctaaatatatgagacttttgccaaaattgcggagattaagaaagtgggttgtagtattaaattggtatacaattactattgtttt-a 44510183  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||  |||    
T  44510184 caattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataagtaagggtatgttggta 44510282  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  44510283 aagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaa 44510336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24504914 - 24504731
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24504914 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagcgagagagttaatttctattttcaacataatatttattgttgattgaag 24504816  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  24504815 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaaggga 24504731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 300
Target Start/End: Original strand, 40120999 - 40121245
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| |||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| | | ||||   ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40120999 cctccgtctctaattatagggcccttttggaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtatttacaat 40121098  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtat--aataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    |||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||  |||||    
T  40121099 tttatcctttaagagagagaaatagtttatgttttcaacatagtatttaatatcgattgaagaaaaagatatataaaataaataggggaatgtcggtaaa 40121198  T
Q  255 ga-aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
     | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  40121199 aataataattaatgtacttggaaatactaaaggggtcttataaaaag 40121245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Original strand, 17878158 - 17878332
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  17878158 acgggaattaagatggtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttca 17878257  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  17878258 ----------tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaaaatataattaatgtagttagaaata 17878332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 306
Target Start/End: Original strand, 10071242 - 10071367
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10071242 gtttatattttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaatag 10071341  T
Q  281 taaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     |||  ||||||||||||||||||||    
T  10071342 caaataggtcttataaaaagggacaa 10071367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 203 - 303
Target Start/End: Original strand, 12616273 - 12616373
Alignment:
Q  203 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12616273 ttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagggatcttataaaaaggg 12616372  T
Q  303 a 303  Q
    |    
T  12616373 a 12616373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 353
Target Start/End: Original strand, 2345350 - 2345583
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2345350 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatcctt-aagaaaaagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaag 2345448  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    |||||| || | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||| |||||||| ||||          ||    
T  2345449 aaaaaggtgcaaaataaataagggtatgtttgtaaataaataattaatgtatttggaaatatcaaatgagtcttttaaaaaggaacaaattattttttca 2345548  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagtagat 353  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2345549 aaagagtcttataattagggacggatgtagtagat 2345583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20075143 - 20075005
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20075143 actccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 20075044  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttc 192  Q
    ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  20075043 caattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttc 20075005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Original strand, 32964218 - 32964388
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  32964218 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 32964316  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |  ||||||||||||||||||    
T  32964317 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaggactcttataaaaagggacaa 32964388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 279
Target Start/End: Original strand, 3796060 - 3796197
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||   ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  3796060 tattgtttttacaattttatcttttaaaagagagaattaatttatgtttttaacatattatttattgctgatggaagaaaaagatgtaaaataaatagag 3796159  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3796160 gtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaata 3796197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 221
Target Start/End: Original strand, 27325952 - 27326076
Alignment:
Q  97 ggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 196  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  27325952 ggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatttctattgtttttataattttatcctttaagatagagagttggtttatgttttcaaca 27326051  T
Q  197 tgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  27326052 tgttatttattgctgattgaagaaa 27326076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 32699513 - 32699697
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||  |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  32699513 gtattaaatttgtataaaattattattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 32699609  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32699610 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaa 32699697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35888540 - 35888356
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  35888540 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 35888444  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  35888443 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgttcttggaaataccaaaatgctcttataaaaagggacaa 35888356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 23801990 - 23802175
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  23801990 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 23802088  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  23802089 aaaaa-atgcaaaataaatatgggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaaggatcttataaaaagggacaa 23802175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 279
Target Start/End: Original strand, 49110804 - 49110993
Alignment:
Q  90 aatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtt 189  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||| ||   | || ||||||||    
T  49110804 aatcacggaaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcacttaagagagtgagctattttatgtt 49110903  T
Q  190 ttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga-aataattaatgtagttggaaata 279  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  49110904 tttaacatgttatttattgccaattgaag-aaaagatgtataataaatagggatatgtaagtaaaaataataattaatgtagttgaaaata 49110993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 2470870 - 2471041
Alignment:
Q  107 tagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttat 206  Q
    |||||||||| |||||||||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  |||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  2470870 tagtggatatttgtattaaatatatttataattactattgtttttataatattatcctttaagagtgagagttgatttctgttttcaacatgttacttat 2470969  T
Q  207 tgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2470970 tgctaattaaagaaaaagatgtataataaataaaggtatatatgaaaagaattaattaatgtagttggaaat 2471041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 33381363 - 33381494
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33381363 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 33381462  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgt 188  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  33381463 tttatcctttaagagagatggttggtttatgt 33381494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21587695 - 21587534
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||  | |||||||| | | ||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21587695 gtccctatttattagactcttttggcaaaatcatagaaattaagaaaattgatatttatattaaatttgtttgcaattactattgtttttacaattttat 21587596  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
      ||||| | |||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21587595 tttttaaaagagagaatttgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 21587534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45722237 - 45722054
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  45722237 gtattaaatttgtatataattaccattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaa 45722139  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||| | |||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||  | |||||||||||||||    
T  45722138 aaaaagatgcaaaataaataagggtgtgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagagatcttataaaaaggga 45722054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 272
Target Start/End: Original strand, 24210980 - 24211107
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  24210980 tattgtttttacaattttatc--ttaaaaaagagagttagtttatattttcaacttgt-atttattgttgattaaaaaaaaagatgtataataaatcggg 24211076  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24211077 gtatgtagataaagaaataattaatgtagtt 24211107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 303
Target Start/End: Original strand, 12631620 - 12631807
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta---agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg 215  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||| || |||| |||||||| |   |||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12631620 gtattaaatttgtttatgattactattgttcttgcaatgttatccttaagagagaaagatagttagtttatattttcaacataatatttattgttgattg 12631719  T
Q  216 aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||| | |||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||  |||||||||||||||||    
T  12631720 aagaaaaagatgcaaaataaataggagtatggtggtaaagaaatgattaatgtaattgaaaataccaaattggtcttataaaaaggga 12631807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 306
Target Start/End: Original strand, 3881371 - 3881534
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  3881371 tattgtttttaaaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaataaaaagatgtaaaataaataagg 3881469  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||||  ||||| |||||||  ||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||| ||||    
T  3881470 gtatgttggtaaaaaaataatctatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaaggaacaa 3881534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19497533 - 19497292
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||| || ||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||| | | | ||   |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  19497533 cgtccttaaatatatgacctttttaccaaaataatgggaattaagaaaattggtagtagtattaaatttgtttataattcctattgtttttacaatttta 19497434  T
Q  161 tccttta---agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    ||||| |   ||| |||| || ||||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||| || |  ||||||||    
T  19497433 tccttaagagagagagaaagtcagtttatgttttcaatatagtacttattgttgatttaagtaaaagatgcaaaacaaataggggtatcttagtaaagaa 19497334  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||    
T  19497333 ataattaatgtaattgaaaatatcaaagggatcttataaaaa 19497292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 300
Target Start/End: Original strand, 20182099 - 20182265
Alignment:
Q  131 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtat 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |  |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||     
T  20182099 tttgtaattactattgtttttacaatcttatccttacagagagatt--tagtgtatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatatag 20182196  T
Q  231 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||||| ||| || |  |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20182197 aataaataagggtatat-ggtaaagaattcattaatgtatttggaaataataaaatggttttataaaaag 20182265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 269
Target Start/End: Original strand, 33683007 - 33683140
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  33683007 taattaatattgcttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacctaatatttattgttgattgaagaaaatgatgcaaaata 33683105  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  33683106 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgta 33683140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37915356 - 37915187
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  37915356 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaaga--gtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaat 37915260  T
Q  234 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||| | ||||||||||| |||||||    
T  37915259 aaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaatgagtcttataaaaggggacaa 37915187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Original strand, 8782033 - 8782206
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatccttta---agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtata 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||| |||  || | |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  8782033 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagtaaatttaagttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaa 8782131  T
Q  232 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  8782132 ataaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaa 8782206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21135478 - 21135371
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21135478 gtattaaatttgtatgtaattaccattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 21135380  T
Q  219 aaaaagatg 227  Q
    |||||||||    
T  21135379 aaaaagatg 21135371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43934795 - 43934635
Alignment:
Q  143 attgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||    
T  43934795 attgtttttacaattttatcctt-aagagagagggtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaa--atgcaaaataaataaggg 43934699  T
Q  243 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||   |||||||||||||||||||    
T  43934698 tatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagatgtcttataaaaagggacaa 43934635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 272
Target Start/End: Original strand, 3478815 - 3478910
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3478815 gttagtttatgtttttaacatagtatttattgttgattgaataaaaagatataaaataaataggggtatgttagtaaagaaataattaatgtagtt 3478910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3776059 - 3775870
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3776059 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatattatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 3775961  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata------attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||  | |||||||| ||| || |  |||||||||||      ||||||||| ||| |||||  |||  |||||||||||||||||    
T  3775960 aaaaagatacaaaataaataagggtatattggtaaagaaataaattatattaatgtacttgaaaataccaaagaggtcttataaaaaggga 3775870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28017170 - 28017051
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  28017170 taaatttgtttgtaattgctattgtttttataattttatccgttaagaaagagggttaatgtatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaa 28017071  T
Q  223 agatgtataataaatagggg 242  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  28017070 agatataaaataaatagggg 28017051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 10071816 - 10071917
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10071816 gtccctgtatataagaccattttactaaaattacgggaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaattattatggtttttacaattttat 10071915  T
Q  162 cc 163  Q
    ||    
T  10071916 cc 10071917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 233 - 306
Target Start/End: Original strand, 33381494 - 33381567
Alignment:
Q  233 taaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33381494 taaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 33381567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 279
Target Start/End: Original strand, 46415103 - 46415260
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||  |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  46415103 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttattctt-aagggagagagttagtttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa-a 46415200  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||| | |||||||| ||| |||   |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  46415201 aaaagatgcaaaataaataagggtatgatggtaaagaaataattgaagtaattggaaata 46415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33682938 - 33682758
Alignment:
Q  122 ttaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  || | ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  33682938 ttaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gtaaatttatgttttcaatataat-tttattgttgattgaagaaa 33682843  T
Q  222 aagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg-gaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||  ||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  33682842 aa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaa 33682758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 260
Target Start/End: Original strand, 32811299 - 32811378
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  32811299 gtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaata 32811378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33342357 - 33342249
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  33342357 ttgtttataattactattgtttttacaattaaatcatttaagagaga--gttagtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatatg 33342260  T
Q  228 tataataaata 238  Q
    |  ||||||||    
T  33342259 tgaaataaata 33342249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25530799 - 25530689
Alignment:
Q  125 aagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaag 224  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||  |||||    
T  25530799 aagttttttgtaattacaattgtttttataattttatcttttaagagagaatgttagtgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaaataaaag 25530700  T
Q  225 atgtataataa 235  Q
    || || |||||    
T  25530699 atataaaataa 25530689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Original strand, 21295638 - 21295756
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |   |  |||||||||||||||||||    
T  21295638 gtattatatttgtttgcaattagtat-gtttttacaattttatcctttaaaaaagaaagatagtttatgtttttagtgtagtatttattgttgattgaag 21295736  T
Q  219 aaaaagatgtataataaata 238  Q
     |||| || || ||||||||    
T  21295737 gaaaaaatataaaataaata 21295756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 306
Target Start/End: Original strand, 32643658 - 32643748
Alignment:
Q  216 aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||    
T  32643658 aagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatatgtcttataaaaagggacaa 32643748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32526134 - 32525966
Alignment:
Q  130 gtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgta 229  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  32526134 gtttgaaattactcttatttttacaattttgtcctttaaaaaaaagggttagtttatattttcaacatagtatttagtgttgacggaagaaaaa-atgta 32526036  T
Q  230 taataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
     ||||||||  |  ||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||  |||||| |||| ||||||    
T  32526035 aaataaataaagatatgttggtaaagaaataattattctagttgcaaatatcaaaaggatcttctaaaaa 32525966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Original strand, 47648985 - 47649088
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  47648985 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 47649083  T
Q  219 aaaaa 223  Q
    |||||    
T  47649084 aaaaa 47649088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20074987 - 20074889
Alignment:
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  20074987 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaacaaatattctcaaaagaatattataattagggacggagggagta 20074889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43008388 - 43008253
Alignment:
Q  70 atataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaag 169  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |  ||||||||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  43008388 atataagatcattttgccaaaattgcaagaattaagaaagttgatatttgtattaaagatatttgtaatcactactgtttttacaa-tttatactttaag 43008290  T
Q  170 aaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattg 208  Q
      |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  43008289 --agaaagttagtttaagttttcaacatgataattattg 43008253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 279
Target Start/End: Original strand, 40299181 - 40299282
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  40299181 gttaatttatgttttcaacataatatttattcttgattgaa-aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatgtacttgaaa 40299279  T
Q  277 ata 279  Q
    |||    
T  40299280 ata 40299282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 165
Target Start/End: Original strand, 12616186 - 12616263
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 165  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  12616186 aaaataacaggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactaatgtttttacaaatttatcctt 12616263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Original strand, 2087096 - 2087282
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat--cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-a 219  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| |    
T  2087096 taaatttgtctgtaattagtattgcttttacatttatatatcctttaagaaagaggattagtgtatgttttcaacatagtatttactgatgaatgaagaa 2087195  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| || || |||||||| |||  |||  ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||   ||||| ||||||| |||||    
T  2087196 aaaaaatataaaataaataagggtgtgttggtaaaaaattaattaatgtacttgaaaatactaaagatgtcttgtaaaaagagacaa 2087282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 30866416 - 30866511
Alignment:
Q  211 gattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  30866416 gattgaagaaaatgatgcaaaataaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgttattgaaaatactaaaaaggtcttataaaaagagacaa 30866511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21135367 - 21135321
Alignment:
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21135367 aattaatgtacttggaaatactaaaagggtcttataaaaagggacaa 21135321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18312393 - 18312239
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |     ||||| |||||||||||||   |||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||      
T  18312393 tattgtttttacaattttatcatttaagagat----ttagtgtatgttttcaacacaatatttaatgctaattgaagaaaaagatataaaataaatagaa 18312298  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
      ||||  ||||| || ||||||||||| ||| |||||  |||||  ||||||||||||    
T  18312297 atatgttggtaaaaaattaattaatgtatttgaaaatatcaaaagtatcttataaaaag 18312239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34693631 - 34693471
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa- 217  Q
    |||||||| |||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |  |||  |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||     
T  34693631 gtattaaatttgtatacaattactattatttttacaattttatcctt-aagagatagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaac 34693533  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
     ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  34693532 aaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaaaaattaatgtacttgaaaata 34693471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 165
Target Start/End: Original strand, 34900775 - 34900832
Alignment:
Q  108 agtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 165  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  34900775 agtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctt 34900832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Original strand, 30866122 - 30866226
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||  || ||||  ||| | |||| | |||||||||||||||||||    
T  30866122 cgtccctaaatataatacccttttgccaaaaccaagggaattgagaaagttgctatcaataataaatatgtatataatcactattgtttttacaatttta 30866221  T
Q  161 tcctt 165  Q
    |||||    
T  30866222 tcctt 30866226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46148645 - 46148475
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||| ||   ||||| |||| |||||||||||| ||  | ||||    
T  46148645 taattactattggttttacaattttatcc-ttaagagatagagttaatttatgttttcaatatagaatttaatgttaattgaagaaaaatatacaaaata 46148547  T
Q  235 aataggggcatgtatg-taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||| ||| ||| | || || ||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  46148546 aataggggtatg-atgatgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataataagagacaa 46148475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 275
Target Start/End: Original strand, 4700530 - 4700605
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 275  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |  ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4700530 tatttattgttgattgaaaaaatatatgtatagtaaatagagttatacacgtaaagaaataattaatgtagttgga 4700605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12129768 - 12129721
Alignment:
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  12129768 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggacaa 12129721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Original strand, 31137214 - 31137288
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||    
T  31137214 taaatttgtttgtaattgttatttcttttacaattttatcctttaagagagagggttggtgtatgttttcaacat 31137288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 223
Target Start/End: Original strand, 19880727 - 19880772
Alignment:
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19880727 ttagtttatgttttaaacatagtatttattgttgattgaagaaaaa 19880772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Original strand, 23256804 - 23256853
Alignment:
Q  250 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  23256804 gtaaagaaataattaatgtactcggaaataccaaaagggtcttataaaaa 23256853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24282132 - 24282075
Alignment:
Q  249 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24282132 tgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagggacaa 24282075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 28409849 - 28409949
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||   ||| | ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  28409849 taaatttgtttgtaaccaatattgcttttacaattttatcatttaagagagatatttaatctatattttcaacataatatttaacgttgattgaagaaaa 28409948  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  28409949 a 28409949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34037542 - 34037502
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34037542 tgtattaaagttgtttgtaattactcttgtttttacaattt 34037502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23109144 - 23109101
Alignment:
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23109144 gaaaaagatgaataataaataaggacatgtatgtaaagaaataa 23109101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 42538647 - 42538560
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||||| | ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  42538647 aaaaatatgtagagtaaataggggtaattttgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagagtcttataaaaagggacaa 42538560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 165
Target Start/End: Original strand, 6910622 - 6910668
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 165  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6910622 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt 6910668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Original strand, 6910696 - 6910770
Alignment:
Q  205 attgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |   ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  6910696 attgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagaatatgttagtaaaaaaataattaatgtatttgaaaata 6910770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 172)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1266246 - 1265993
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1266246 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 1266147  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266146 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 1266047  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  1266046 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 1265993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 17674398 - 17674651
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17674398 actccctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 17674497  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674498 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 17674597  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17674598 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 17674651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 28041091 - 28041344
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  28041091 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattacagttgtttgtaatcactattgttttta 28041190  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28041191 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 28041290  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  28041291 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 28041344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22527989 - 22527736
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22527989 actccctccgtccctatatataagacctttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 22527890  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22527889 caattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 22527790  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  22527789 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 22527736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34662501 - 34662248
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34662501 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 34662402  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34662401 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgta 34662302  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  34662301 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 34662248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 53 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31889190 - 31888939
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31889190 actccctccgttcctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 31889091  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31889090 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 31888991  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  31888990 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 31888939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 15190555 - 15190852
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  15190555 actccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttataatcactattgttttta 15190654  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190655 caattttatcatttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 15190754  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15190755 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 15190852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 16152995 - 16153248
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16152995 actccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 16153094  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16153095 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 16153194  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16153195 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 16153248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41641396 - 41641139
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41641396 actccctccgtccctgtatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgttttta 41641297  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41641296 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 41641197  T
Q  253 aagaaataat----taatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  41641196 aagaaataattaattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 41641139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 3686494 - 3686747
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3686494 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 3686593  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3686594 caattttatcctttaagaaataaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 3686693  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  3686694 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaatggacaa 3686747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 10734261 - 10734514
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  10734261 actccctccgtctctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgttttta 10734360  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10734361 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 10734460  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  10734461 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 10734514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 6672968 - 6673221
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6672968 actccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 6673067  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6673068 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 6673167  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  6673168 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 6673221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 42561091 - 42561342
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42561091 actccctccgtccctatatataa--cccttttgccaaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 42561188  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42561189 caattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 42561288  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  42561289 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 42561342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 13862735 - 13862988
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13862735 actccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 13862834  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13862835 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgacagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 13862934  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||    
T  13862935 aagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagttttataaaaagggacaa 13862988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 15521682 - 15521935
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15521682 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 15521781  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15521782 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 15521881  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||    
T  15521882 aataaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaaggacaa 15521935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 25600800 - 25601053
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25600800 actccctctgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 25600899  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25600900 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 25600999  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  25601000 aagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaaggaacaa 25601053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 4752962 - 4753211
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4752962 cctccgtccctatatataagacccttttatcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 4753061  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4753062 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaa 4753161  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  4753162 aataattaatgtagttgaaattaacaaaaatgtcttataaaaagggacaa 4753211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 4984872 - 4985109
Alignment:
Q  69 tatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 168  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4984872 tatataagactattttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattatagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaa 4984971  T
Q  169 gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 268  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4984972 gaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 4985071  T
Q  269 agttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4985072 agttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 4985109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32478434 - 32478182
Alignment:
Q  54 ctccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttac 153  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32478434 ctcccttcgtctctatatataagaatcttttaccaaaatcacgggaattaatataatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttac 32478335  T
Q  154 aattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32478334 aattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaa 32478235  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32478234 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 32478182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 67 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5528256 - 5528018
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 166  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  5528256 tatatataagactcttttgtcaaaatcacgg-aattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactactgtttttacaattttatccttt 5528158  T
Q  167 aagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 266  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5528157 aagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 5528058  T
Q  267 gtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  5528057 gtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaaggacaa 5528018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7940743 - 7940452
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7940743 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 7940644  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7940643 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 7940546  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7940545 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 7940452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20186794 - 20186545
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20186794 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 20186695  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20186694 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggtatgtatgtaaaga 20186595  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20186594 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 20186545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9065199 - 9064951
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9065199 ctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 9065100  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9065099 ttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaa 9065000  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9064999 ataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaa 9064951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 20142005 - 20142296
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20142005 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 20142104  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20142105 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaaga 20142202  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||         |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20142203 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 20142296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9020990 - 9020739
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9020990 actccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 9020891  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9020890 caattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 9020793  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  9020792 aagaaataattaatgtagatggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaa 9020739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14913944 - 14913693
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14913944 actccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 14913845  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| | |  | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14913844 caattttatcctttaagagata--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 14913747  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14913746 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 14913693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 61 - 350
Target Start/End: Original strand, 43060159 - 43060448
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43060159 cgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 43060258  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    |||||||| | |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43060259 tcctttaaaagagagggatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 43060358  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43060359 attaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 43060448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 3497541 - 3497793
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3497541 actccatccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 3497640  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497641 caatattatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 3497739  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  3497740 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 3497793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9828689 - 9828437
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9828689 actccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 9828590  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9828589 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 9828491  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  9828490 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 9828437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 71 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14649464 - 14649235
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14649464 tataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaaga 14649365  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14649364 gagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 14649265  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14649264 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 14649235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 40004150 - 40004402
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40004150 actccctccgtccctaaatataagatccttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 40004249  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40004250 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgta 40004348  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  40004349 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 40004402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Original strand, 9268037 - 9268283
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9268037 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 9268136  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||| ||| |  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9268137 tttatcctttaaaaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 9268236  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9268237 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 9268283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 27873120 - 27873338
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  27873120 aaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatg 27873219  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27873220 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaagg 27873319  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27873320 gtcttataaaaagggacaa 27873338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32964423 - 32964176
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32964423 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 32964324  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32964323 tttatcctttaagagag--tgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgcataattaatagggacatgtatgtaaaga 32964226  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  32964225 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaa 32964176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40643387 - 40643094
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||| ||  |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40643387 cctccgtccctaattatcagggccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 40643288  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40643287 tttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 40643188  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40643187 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 40643094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Original strand, 20987959 - 20988205
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20987959 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaatagcgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 20988058  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20988059 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 20988156  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20988157 aataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaagggaca 20988205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7951852 - 7951605
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||| ||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7951852 ctccctccctaattataagatcattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 7951753  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7951752 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 7951654  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7951653 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 7951605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 186394 - 186149
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  186394 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgttttta 186295  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186294 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 186196  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  186195 aagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaatggtcttataaaaa 186149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16441226 - 16440975
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16441226 actccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 16441127  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16441126 caattttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggcatgtatgta 16441029  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  16441028 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggacaa 16440975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23285316 - 23285079
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285316 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 23285217  T
Q  171 aagaatg--ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 268  Q
     |||  |  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23285216 gagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgt 23285117  T
Q  269 agttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23285116 agttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 23285079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 41383913 - 41384209
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41383913 actccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 41384012  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384013 caattttgtcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 41384111  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41384112 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaggagacaacaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 41384209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16127555 - 16127303
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16127555 actccatccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 16127456  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16127455 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 16127357  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  16127356 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 16127303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4194971 - 4194726
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4194971 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaa--tgtttgtaattactattatttttacaat 4194874  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4194873 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacattttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 4194776  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||    
T  4194775 aataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttacaaaaagggacaa 4194726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 10511246 - 10511464
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  10511246 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatg 10511345  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |     
T  10511346 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaatga 10511445  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10511446 gtcttataaaaagggacaa 10511464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 300
Target Start/End: Original strand, 28140683 - 28140907
Alignment:
Q  76 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaa 175  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  28140683 gacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagag 28140781  T
Q  176 tgttagtttatgttttcaacatgttatttatt-gttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgg 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28140782 tgttggtttatgttttcaacatgttatttatccgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgg 28140881  T
Q  275 aaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||    
T  28140882 aaatagcaaaggggtcttataaaaag 28140907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33639583 - 33639335
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33639583 cctccatccctatatacaagatccttttgccaaaatcacgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaat 33639484  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| | || |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  33639483 tttatcctt-aagagataaagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtagaaa 33639385  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  33639384 aataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataaaacgggacaa 33639335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 8283856 - 8284101
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| |||||||    |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8283856 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaa----gataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 8283951  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8283952 tttatcctttaagaaagagggttagcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaga 8284051  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8284052 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaa 8284101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14619540 - 14619293
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14619540 tccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 14619441  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14619440 tatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 14619341  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  14619340 taattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagagacaa 14619293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Original strand, 38161529 - 38161773
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |   ||| |||||||||||||    
T  38161529 cgtccctatatataagactcttttgccaaaattacgggaatcaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgcaatcaccgttgattttacaatttta 38161628  T
Q  161 tccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38161629 tcctttagagataga--gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtatagtaagtaggggcatgtatgtaaagaaat 38161726  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  38161727 aattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggacaa 38161773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35547554 - 35547261
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  35547554 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtaattactattatttttacaat 35547455  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35547454 tttatcctttaagaatgagggttggcttatgttttcaacattttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaga 35547355  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||          ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35547354 aataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaaatcttataattagggacggaggtagta 35547261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 39121434 - 39121683
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||   |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39121434 cctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaatagcgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 39121533  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39121534 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgatttaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 39121633  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  39121634 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaa 39121683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22658019 - 22657768
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||     
T  22658019 aattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacatt 22657920  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  22657919 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaa 22657820  T
Q  299 agggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22657819 agggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 22657768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7735128 - 7734878
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaa-tcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaa 155  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7735128 cctccgtccctaattatatggcccttttgaaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa 7735029  T
Q  156 ttttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7735028 ttttatcctttaaaaaatagggttgggttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 7734929  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7734928 aaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaa 7734878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9264235 - 9264017
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  9264235 aaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatg 9264136  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  9264135 ttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatga 9264036  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  9264035 gtcttataaaacgggacaa 9264017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13661155 - 13660905
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||   |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13661155 actccctccgtccctaattataagacctttttattaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 13661056  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13661055 caattttatcctt-aagagaga--gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatatatgta 13660959  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  13660958 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 13660905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 23285852 - 23286069
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  23285852 aaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga-tgattgtttatg 23285950  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||       
T  23285951 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagat 23286050  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  23286051 gtcttataaatagggacaa 23286069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3028308 - 3028013
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||   |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028308 cctccgtcccttattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 3028209  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttag--tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||| |||||||| |||  |  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3028208 tttattctttaagagagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 3028109  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3028108 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 3028013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 101 - 306
Target Start/End: Original strand, 19571726 - 19571931
Alignment:
Q  101 ttaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgtt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |    
T  19571726 ttaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattat 19571825  T
Q  201 atttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19571826 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatatagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaag 19571925  T
Q  301 ggacaa 306  Q
    ||||||    
T  19571926 ggacaa 19571931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 22581480 - 22581728
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  22581480 cctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaataaagtggatatttatattacagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 22581579  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22581580 tttatcc-ttaagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaga 22581678  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||    ||||||||||||||||||    
T  22581679 aataattaatgtagttgaaaatagcaaagaaatcttataaaaagggacaa 22581728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34332511 - 34332266
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34332511 cctccgtccctaattataagaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 34332412  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    | ||| ||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34332411 tatattcttgaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaa 34332312  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  34332311 aataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggg 34332266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 18615802 - 18616059
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| ||||||   |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  |||||    
T  18615802 actccctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaatttta 18615901  T
Q  153 caattttatcctttaagaaaga-at---gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 248  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  18615902 caattttatcctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgta 18616001  T
Q  249 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18616002 tgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 18616059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 24307924 - 24308134
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||  ||||||||||||||    
T  24307924 gggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaac 24308023  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24308024 atgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata 24308123  T
Q  296 aaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||    
T  24308124 aaaagggacaa 24308134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24365399 - 24365189
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||  ||||||||||||||    
T  24365399 gggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaac 24365300  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24365299 atgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata 24365200  T
Q  296 aaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||    
T  24365199 aaaagggacaa 24365189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 79 - 297
Target Start/End: Original strand, 31507387 - 31507605
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||    
T  31507387 ccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaatagagagagt 31507486  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31507487 tggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 31507586  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaa 297  Q
    || |||  |||||||||||    
T  31507587 agcaaagaggtcttataaa 31507605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32147587 - 32147337
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  32147587 actccctccgtctctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagc--atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgctttta 32147490  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32147489 caattttatcctt-aagagtgagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 32147391  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32147390 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 32147337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 4976033 - 4976327
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4976033 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaat 4976132  T
Q  157 tttatccttta--agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    |||||||||||  ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4976133 tttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 4976231  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||| |||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4976232 gaaataattaatgtagctggaaatagcaaagagatcttataaaaggggacaaaaatatttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 4976327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 40951787 - 40952036
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| ||||  |||| || |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||     
T  40951787 cctccgttcctaattatacgatccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaa 40951886  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40951887 tttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 40951986  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  40951987 aataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaaaggacaa 40952036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12744076 - 12743868
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||||||||||||||||    
T  12744076 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacat 12743977  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  12743976 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaa 12743877  T
Q  298 aagggacaa 306  Q
    |||||||||    
T  12743876 aagggacaa 12743868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 13759193 - 13759440
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| ||  |||| | ||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13759193 cctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatggtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 13759292  T
Q  157 tttatcctttaagaaaga-atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13759293 tttatcctttaagagagagatgtt---ttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaa 13759389  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  13759390 aaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagggacaa 13759440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21239371 - 21239143
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |    
T  21239371 cccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagagag 21239272  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21239271 ttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaa 21239172  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  21239171 tagcaaaggggtcttataaaaagagacaa 21239143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 306
Target Start/End: Original strand, 32617561 - 32617769
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||   |||||||||||||||    
T  32617561 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttgtcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 32617660  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32617661 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaa 32617760  T
Q  298 aagggacaa 306  Q
    |||||||||    
T  32617761 aagggacaa 32617769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39985063 - 39984813
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39985063 ctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataacgagaattaagatagcggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 39984964  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaat--aggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  39984963 ttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagaggtatgtatgtaaag 39984864  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  39984863 aaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagagacaa 39984813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 65 - 306
Target Start/End: Original strand, 26605368 - 26605616
Alignment:
Q  65 cctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 164  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  26605368 cctatatataagacccttttactaaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcct 26605467  T
Q  165 tta-------agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    | |       ||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26605468 taagagagagagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaa 26605567  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  26605568 ataattaatgtagttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaa 26605616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 34889053 - 34889271
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||||||    
T  34889053 aaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttgatttatg 34889152  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  34889153 tattcaacatgttatttattgctggttgaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaagat 34889252  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34889253 gtcttataaaaagggacaa 34889271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41418601 - 41418354
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  41418601 cctccgtccctaattatgaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaat 41418502  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  |||   |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  41418501 tttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaatattctatttattgttgattgaagaaaatgatgtataataaata--tgtatgtatgtaaaga 41418404  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41418403 aataattaatgtatttagaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaa 41418354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 306
Target Start/End: Original strand, 3160291 - 3160520
Alignment:
Q  77 acccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaat 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||      
T  3160291 acccttttgccaaaatcacgagaatcaagatagtgaatatttgtgttaaagttttttgtaaacactattgtttttacaaatttatcctttaagagagatg 3160390  T
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  3160391 gttagtttatgttttcaacatactatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaaaaattaatgtaattgaaa 3160490  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  3160491 atagcaaaggaatcttataaaaagggacaa 3160520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 279
Target Start/End: Original strand, 17592542 - 17592767
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||  |||  |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17592542 actccctccgtttctaattataggacacttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 17592641  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17592642 caattttatc-tttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgta 17592740  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17592741 aagaaataattaatgtagttggaaata 17592767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Original strand, 38371719 - 38371966
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || ||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38371719 ctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataatggaaattaagattgtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattaatattatttttacaatt 38371818  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||| |||||| | |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38371819 ttattctttaatagaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 38371916  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaat-agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  38371917 ataattaatgtagttggaaataacaaaaaggatcttataaaaagggacaa 38371966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39759180 - 39758958
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||     
T  39759180 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatgtttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaa 39759081  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  39759080 tttatccttcaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 39758981  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39758980 aataattaatgtagttggaaata 39758958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 23092384 - 23092633
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||    
T  23092384 cctccgtccctaatcatatgacctttttgaaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttgttacaat 23092483  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| | |   || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23092484 tttatcctttaagagacataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtataaaaaataggggcatgcatgtaaaga 23092583  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  23092584 aataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtattataaaaagggacaa 23092633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 265
Target Start/End: Original strand, 8144464 - 8144672
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8144464 cctccgtccctaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 8144563  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8144564 tttatcctttaagaaagatggttggcttatgtttttaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataattaggggcatgtatgtaaaga 8144663  T
Q  257 aataattaa 265  Q
    |||||||||    
T  8144664 aataattaa 8144672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 23286226 - 23286511
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23286226 cctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 23286325  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23286326 tttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgctact-------gattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaga 23286417  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23286418 aataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 23286511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17714861 - 17714608
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  17714861 cctccgtccctaattatagaacctttttgaaaaaattatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttctgattactattgttttgacaat 17714762  T
Q  157 tttatcctttaagaaaga-atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa---gatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||  ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17714761 tttattttttaagagagagatgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 17714662  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  17714661 aagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataagaagggacaa 17714608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20987958 - 20987791
Alignment:
Q  139 tagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20987958 tagtattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 20987859  T
Q  239 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20987858 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaa 20987791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40738678 - 40738409
Alignment:
Q  81 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgtta 180  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||    
T  40738678 ttttgctaaaattacgggaattaaaaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-atgagagagagtta 40738580  T
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40738579 gtttatgttttccatatgttatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatagaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag 40738480  T
Q  281 taaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
     ||| |||||||||||||| | ||||           ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40738479 caaaggggtcttataaaaaagaacaaattttttttttaaaaggatcttataattagggacggaggtagtag 40738409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21750223 - 21749977
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| ||  ||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21750223 cctccgtccttaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataat 21750124  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21750123 tttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 21750024  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  21750023 aataatcaatgtagttgaaaatagaaaatgaatctcataaaaaggga 21749977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35039259 - 35039041
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||  ||| |||||||    
T  35039259 aaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatcattcaagagagagagttggtttatg 35039160  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  35039159 ttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaat 35039060  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||    
T  35039059 atcttataaaaagggacaa 35039041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 88 - 279
Target Start/End: Original strand, 15774838 - 15775029
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||    
T  15774838 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatg 15774937  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15774938 ttttcaacattctatttattgttgattaaagaaaaagatgtacaataaataggggcatatatgtaaaaaaataattaatgtagtcggaaata 15775029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 31158172 - 31158417
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  31158172 cctccgttcttatatataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaagtg-atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttataat 31158270  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31158271 tttatcctt-aagagaga--gttggtttatgttttccatatgctatttattgcttattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 31158367  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  31158368 aataattaatgtaattgaaaatagaaaagtggtcttataaaaagggacaa 31158417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20518134 - 20517892
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20518134 cctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataat 20518035  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20518034 tttatccttta-gagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaagaatgtataataaatgggggcatatatgtaaaga 20517938  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  20517937 aataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatc-tataaaaaggga 20517892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 140 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12806856 - 12806690
Alignment:
Q  140 agtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12806856 agtattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatag 12806757  T
Q  240 gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  12806756 gggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaagggacaa 12806690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 306
Target Start/End: Original strand, 14570643 - 14570881
Alignment:
Q  65 cctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 164  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||| |||| |||||||||||||    
T  14570643 cctatatataagaccattttgttaaaatcacgggaattaagaaggtggatatttgtattaaagttgtttataatcacaattattttaacaattttatcct 14570742  T
Q  165 ttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 264  Q
    | |||| |||  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14570743 t-aagagaga--gttagtttatgttttccatatgctattcattgttgattgaagaaaaatatgtataataagtaggggcatatatgtaaagaaataatta 14570839  T
Q  265 atgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  14570840 atgtaattgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 14570881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14789829 - 14789604
Alignment:
Q  73 taagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaa 172  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  14789829 taagacccttctgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatcattatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagaga 14789731  T
Q  173 gaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    ||  |||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14789730 gagggttaatttatgttttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtaatt 14789631  T
Q  273 ggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    | |||||| | |  |||||||||||||    
T  14789630 gaaaatagcagagaggtcttataaaaa 14789604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11781016 - 11780807
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||     
T  11781016 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttata 11780917  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||        | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11780916 ttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaacaggg--------gaaaagaaataattaatgtagttgaaaatag-aaaagg 11780826  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11780825 gtcttataaaaagggacaa 11780807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14436095 - 14435883
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14436095 cctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 14435996  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||| |    
T  14435995 tttatcttttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtattataaataatgacatgcatgtaaaaa 14435896  T
Q  257 aataattaatgta 269  Q
    |||||||||||||    
T  14435895 aataattaatgta 14435883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14571578 - 14571287
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaa---gatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaa 155  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||   || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  14571578 tccgtccttatatataaaaccattttgttaaaatcaagggatttaattagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttacaa 14571479  T
Q  156 ttttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14571478 ttttatcctt-aagagaga--gttagtttatgttttgcatatgttattcattgttgattgaagaaaaatatgtataataagtaggggtatgtatgtaaag 14571382  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| |||||||||||          |||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14571381 aaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttatgaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaatatcttataattagggacggaggtagta 14571287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Original strand, 8100142 - 8100386
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  8100142 cgtccgtatatataagaccattttgccaaaattacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaatttgtttgtaatccctattggttttacaatttta 8100241  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    || |||| || | |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | | ||||| |||||||| ||    
T  8100242 tcatttaggataaagaattag-ttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaaaatgtatgataaataagagtatgtaagtaaagaagta 8100340  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  8100341 attaatgttgttggaaatagaaaattgatcttataaaaagggacaa 8100386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 303
Target Start/End: Original strand, 13703594 - 13703797
Alignment:
Q  97 ggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 196  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  13703594 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaattttattttttaaaagaga--gttggtttat-ttttcaaca 13703690  T
Q  197 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||  ||||||||    
T  13703691 tgttatttattgttgtttgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttaaaaatagcaaaagaatcttataa 13703790  T
Q  297 aaaggga 303  Q
     ||||||    
T  13703791 caaggga 13703797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37034438 - 37034238
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||  ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||  | |||||||||||||||    
T  37034438 cctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataaccgaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtgtgtaa--actattgtttttacaat 37034341  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37034340 tttatcctttaagaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatttaaaga 37034241  T
Q  257 aat 259  Q
    |||    
T  37034240 aat 37034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39180634 - 39180505
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39180634 gttaatttatgttttcaacatgttatttattgatgatttaagaaaaagatgtataataattagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 39180535  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||  ||||  || ||||||||||||||||    
T  39180534 ataacaaaaatgttttataaaaagggacaa 39180505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 41686922 - 41687106
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41686922 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 41687018  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  41687019 aaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaagggacaa 41687106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5283277 - 5283092
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5283277 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagaaagatagttaatctatgttttcaacatagtatttattgttgattgaag 5283179  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||| | ||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  5283178 aaaaagatgcaaaataaaaaagggta-gttggtaaagaaataattaatgtatttggaaatacaaaaaaagtcttataaaaagggacaa 5283092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24170338 - 24170134
Alignment:
Q  145 tgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 244  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||   ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24170338 tgtttttacaattttatc-ttaaagagagagaattagtttatgttttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagca 24170240  T
Q  245 tgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaag-ggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatgga 343  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||    
T  24170239 tgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagatcttataaaaagggacaaaaaaattct-caaaagagttttataattagggatgga 24170141  T
Q  344 ggtagta 350  Q
    |||||||    
T  24170140 ggtagta 24170134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 306
Target Start/End: Original strand, 26674480 - 26674597
Alignment:
Q  189 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaaggg 288  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  26674480 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgag 26674579  T
Q  289 tcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26674580 tcttataaaaagggacaa 26674597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 306
Target Start/End: Original strand, 26946086 - 26946203
Alignment:
Q  189 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaaggg 288  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  26946086 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgag 26946185  T
Q  289 tcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26946186 tcttataaaaagggacaa 26946203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Original strand, 16284998 - 16285183
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  16284998 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagattgaat--taatttatgttttcaacataatatttattgtttattgaag 16285095  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16285096 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaa 16285183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25837238 - 25837008
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  25837238 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaa-agagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaa 25837140  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||          ||    
T  25837139 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaaggaacaaatttttttctca 25837040  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25837039 aaagggtcttataattagggatggaagtagta 25837008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30183133 - 30182958
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30183133 cctccgtctctaattataagactcttctgaaaaaataacgggaattaagatagatgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 30183034  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat 233  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30183033 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa-atgtataat 30182958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3629132 - 3628980
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3629132 gtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagctaga--gttagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaag 3629035  T
Q  219 aaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    ||||| | | ||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  3629034 aaaaaaattatataataaataagggtgtgcaagtaaagaaataattaatgtagtt 3628980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Original strand, 26076175 - 26076381
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||     
T  26076175 aattaagaaaattgatatctgtattaaatttgtttctaattattattatttttacaattttattctttaagaaagagagttagtttgtgttttcaacata 26076274  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga--aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | ||| |||| | |||| |  |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||    
T  26076275 ttatttattgctgattgaggaaaaag--gtataataaacaagggtatgtctctaaaaaataataattaatttagttggaaatag-caaaggggcttataa 26076371  T
Q  297 aaagggacaa 306  Q
    |||| |||||    
T  26076372 aaagagacaa 26076381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31657914 - 31657728
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  31657914 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 31657816  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||  || | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31657815 aaaaaagtgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaa 31657728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 303
Target Start/End: Original strand, 26894742 - 26894863
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26894742 gtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat-attaatgtagttggaaatag 26894840  T
Q  281 taaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  26894841 caaatgggtcttataaaaaggga 26894863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11432546 - 11432354
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-----agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 213  Q
    |||||||| |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |     ||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11432546 gtattaaatttgtatatatttactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgat 11432447  T
Q  214 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  11432446 tgaagaaaaagatgcagaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagggacaa 11432354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24857785 - 24857556
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  24857785 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 24857687  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    |||||| || | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||          ||    
T  24857686 aaaaag-tgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttca 24857588  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24857587 aaagagtcttataattagggacggaggtagta 24857556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39971244 - 39971014
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  39971244 gtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaag 39971146  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||||||| | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||          ||    
T  39971145 aaaaagatgcaaaataattaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttca 39971046  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39971045 aaagagtcttataattagggacggaggtagta 39971014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12098811 - 12098605
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| |||| |||||     
T  12098811 aattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgta-tcacaattgtttttacaattttatcctttaagagagatagctagtttatatttttaacatt 12098713  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    |||||  || |||||||    
T  12098712 ctatttattgctcattgaagaaaaagatgtttaataaagaggggtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagttgaaaaagacaaaagaatcctataaaa 12098613  T
Q  299 agggacaa 306  Q
    ||||||||    
T  12098612 agggacaa 12098605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16926682 - 16926452
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga-aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  16926682 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgag 16926586  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnc- 316  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||         |     
T  16926585 gaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaagagggacaatttttttttct 16926486  T
Q  317 caaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16926485 caaaagggtcttataattagggatggaggtagta 16926452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21069866 - 21069681
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  21069866 tattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagaggtagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 21069768  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  21069767 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatggtcttataaaaagggacaa 21069681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 23259883 - 23260175
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| |||||  |  ||||||||||||| ||||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  23259883 cctccgtccctaaatatagaagtcttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaat 23259982  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | | || |  |||||||    
T  23259983 tttatcctt-aagagaaagtgttaatttatgttttcaacataatatttattgttggttgaagaaaaagatgcaaaataaataagagtatattagtaaaga 23260081  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| |  ||||||||||| ||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23260082 aataattaatgtacttggaaataccaaaggaatcttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 23260175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8950045 - 8949859
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||     
T  8950045 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaaga--gttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgag 8949948  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  8949947 gaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaa 8949859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18251312 - 18251060
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | ||| | ||    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  18251312 cctccgtccctaaatatatgatccttttgtcaaaatcacgagaattaaaaaagttggtagtaatattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 18251213  T
Q  157 tttatccttta-agaaagaatg--ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    ||||||||| | |||||||  |  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| || |  ||||    
T  18251212 tttatccttaagagaaagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaagaaataagggtatcttggtaa 18251113  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  18251112 aaaaataattaatttaattggaaataccaaaggggtcttttaaaaagagacaa 18251060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31642401 - 31642231
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  31642401 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaaga--gttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaat 31642304  T
Q  234 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31642303 aaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaa 31642231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Original strand, 28414507 - 28414677
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28414507 taattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 28414605  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||| |||||| || || ||||||  |||  ||||||||||||| ||||||    
T  28414606 aataagggtatgttggtaaagaaatgattaatttacttcgaaataccaaagtggtcttataaaaatggacaa 28414677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 301
Target Start/End: Original strand, 6328626 - 6328791
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6328626 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 6328724  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||  |||  | |||||||||||||    
T  6328725 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatatatttggaaatatcaaagagatcttataaaaagg 6328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15675044 - 15674913
Alignment:
Q  81 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgtta 180  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  15675044 ttttgtcaaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatcttttaagagaga--gtta 15674947  T
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15674946 gtttatattttcaacatgttatttattgctgatt 15674913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4903071 - 4902851
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  4903071 ccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacgggaattaaggaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagtttt 4902972  T
Q  160 atcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    |||| ||| || |||  ||||                 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||    
T  4902971 atcc-ttaggagagagagtta-----------------gttatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaataggg--------gtaaaaaaat 4902898  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  4902897 aattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 4902851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15559829 - 15559577
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatct-gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaa 155  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||| ||| | | ||| |||||||| |||  | |||||| ||||||||||||||    
T  15559829 cctccgtccctaaatataagagccttttgtaaaaattacggagattaagaaagttggt-tctagtattaaatttgcatataattactattgtttttacaa 15559731  T
Q  156 ttttatccttta---agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||| ||| |   ||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||   ||    
T  15559730 ttttattcttaagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataactaagggtatgttgata 15559631  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||    
T  15559630 aagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagaggtcttataaaaaaggacaa 15559577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Original strand, 26889594 - 26889709
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  26889594 actccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 26889693  T
Q  153 caattttatcctttaa 168  Q
    ||||||||||||||||    
T  26889694 caattttatcctttaa 26889709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27834174 - 27833988
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27834174 gtattaaatttgtatataattatcattgtttttacaattttatcatt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 27834076  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||  | | ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||    
T  27834075 aaaaagatgaaaaataaatgagagtatgttggtaaagaaataattaatgcatttggaaataccaaaatgatcttataaaaaggaacaa 27833988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 271
Target Start/End: Original strand, 9438877 - 9439051
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaa-ttttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| |||   ||||||| ||||||||||||    
T  9438877 aattaagaaagttgatatttttattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaatttttttcttttaagagagagaattagtttgtgttttcaacat 9438976  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 271  Q
    | ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9438977 gctatttattgctgatcaaagaaaaaaagtgtataataaatagggatatgtaggtaaaaaaataattaatgtagt 9439051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13735790 - 13735701
Alignment:
Q  209 ttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  13735790 ttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 13735701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Original strand, 42030344 - 42030493
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42030344 cctccgtccctagttataaggcc-ttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 42030442  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttatt 207  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  42030443 tttatcctttaagaaggagagttagcttatgttttcaacattctatttatt 42030493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37206338 - 37206169
Alignment:
Q  131 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtat 230  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| || ||     
T  37206338 tttgtaattactattatttttacaattttatcctttaaaaaagcaggttagtgtatgttttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaatatataa 37206239  T
Q  231 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||  || |||||  |||| | ||||||||||||    
T  37206238 aataaacaggggtatgtttgtaaagaatcaattaatgtacatgaaaatatcaaaaagttcttataaaaag 37206169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37700320 - 37700143
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||    
T  37700320 taaatttgtttgtaatcaccattgtttttacaattttatcctttaagagagaaaattagtatatgttttcaatatagtatttaatgctgattgaagaaaa 37700221  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
     ||| || |||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||  ||| | |||||||||||||    
T  37700220 tgatataaaataaatagggatatgttggtaaagaattaattaatgtactcggaaatatcaaaggagtcttataaaaag 37700143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Original strand, 1303400 - 1303568
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  1303400 taattactattatttttacaattttatcctt-aagagaga--gttagtttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaacgatgcaaaata 1303496  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||   || ||||||||||| ||||    
T  1303497 aataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaatactaaagaagttttataaaaaggcacaa 1303568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20187248 - 20187134
Alignment:
Q  182 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagt 281  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  20187248 tttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcataataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaatact 20187149  T
Q  282 aaaagggtcttataa 296  Q
    |||||  ||||||||    
T  20187148 aaaagaatcttataa 20187134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13236169 - 13235986
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13236169 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagaga--gtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 13236073  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| || |||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  13236072 aaaaa-atgcaaaataaataatggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaacatcaaaggggtcttataaaaagggacaa 13235986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30182204 - 30182127
Alignment:
Q  229 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30182204 ataataaatagggccatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagggacaa 30182127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Original strand, 35784728 - 35784910
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  35784728 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa-a 35784823  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||  || | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||   |||||||||||||||||||    
T  35784824 aaaaactgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaagaagtcttataaaaagggacaa 35784910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13335514 - 13335338
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||   ||| | |||| ||| |||||  |||||| || |||||||||||||    
T  13335514 taaatttgtttgtaattaatattgcttttacaattttatcctttacgagagatgattattgtatgctttgaacatagtatttaatgctgattgaagaaaa 13335415  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||| || ||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13335414 agatataaaataaatagcggtatgttggtaaa-aattaattaatatacttggaaataccaaatgggtcttataaaaag 13335338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 306
Target Start/End: Original strand, 16636828 - 16636994
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaatt---ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16636828 tattgtttttacaattattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatgtattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaata 16636926  T
Q  239 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     | | ||||  |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  16636927 agagtatgttggtaatgaaataattaatgtacgtggaaatactaaaatgatcttataaaaagggacaa 16636994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 269
Target Start/End: Original strand, 39692401 - 39692608
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||  |||||| |||| |||||||| ||| | ||    ||||||| |||| | |||||| | |||||||||||||||    
T  39692401 tccgttcctaaatataggaaccttttatcaaaattacggaaattaagaaagttggtagtaatattaaatttgtatataattattgttgtttttacaattt 39692500  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||| ||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  39692501 tattctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaa 39692597  T
Q  259 taattaatgta 269  Q
    ||||| |||||    
T  39692598 taattgatgta 39692608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39182002 - 39181902
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 166  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  39182002 tatatataagatcattttgtcaaaatcatgggaactaagaaagtcgatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcattt 39181903  T
Q  167 a 167  Q
    |    
T  39181902 a 39181902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26699543 - 26699424
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||   ||| | |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26699543 taaatttgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 26699444  T
Q  223 agatgtataataaatagggg 242  Q
    ||||  | ||||||||||||    
T  26699443 agatagaaaataaatagggg 26699424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26969276 - 26969157
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||   ||| | |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26969276 taaatttgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 26969177  T
Q  223 agatgtataataaatagggg 242  Q
    ||||  | ||||||||||||    
T  26969176 agatagaaaataaatagggg 26969157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9727661 - 9727498
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaa-ttaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||| ||| |||||| | | ||||| ||||||||||  || |||||| ||| |||||| |||||||| || ||| |||| | |||| |||||| ||||    
T  9727661 tccgtcactaaatataatatctttttgtcaaaatcacgaaaaattaagaaagttgatatcagtattaaaattatttctaatcactattatttttataatt 9727562  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
     |||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9727561 atatcttttaagagaga--gttagtttatgtttttaacatgctatttattgttgattgaaaaaaaa 9727498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Original strand, 13958607 - 13958704
Alignment:
Q  68 atatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 165  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13958607 atatataagaccattttgataaaatcatgagaattaaaaaagtgaatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 13958704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16099448 - 16099279
Alignment:
Q  131 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttat---tgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||  |||||||   || | |||||||||||  ||     
T  16099448 tttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaag--agagggttagtgtatgttttcaacatagtatttatcaatgctaattgaagaaaataata 16099351  T
Q  228 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    || ||||||||||||  |||  |||||||| |||||||| || ||||| |||  ||| || |||||||||||    
T  16099350 taaaataaataggggtgtgttggtaaagaattaattaatctacttggagatatcaaagggatcttataaaaa 16099279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20988331 - 20988252
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaatta 140  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  20988331 cgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 20988252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 227
Target Start/End: Original strand, 2328398 - 2328528
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||||||  ||||| ||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||    
T  2328398 aaaatcacatgaatttagaaaatggatatttgcattaaagttgttagtaatcactattgattttacaattttatcctttaagagaga--gttaatttatg 2328495  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    ||       ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2328496 tt-------tgttatttattattaattgaagaaaaagatg 2328528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 278
Target Start/End: Original strand, 8356284 - 8356508
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||||  |||||| || |||||||||| ||| ||||    ||||||| || | | |||||| | |||||||||||||    
T  8356284 cctccgtccctaaatataggagcattttatcaaaattactggaattaagaaagttgatagtaatattaaatttatatataattactgttgtttttacaat 8356383  T
Q  157 tttatcctttaa-gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg---aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt- 251  Q
    ||||| ||| || || |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   || ||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||     
T  8356384 tttatacttaaaagataga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggta 8356481  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  8356482 aaaaaaataattaatgtacttgaaaat 8356508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10116809 - 10116624
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttt-caacatgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||| |   ||||||| || |||  ||||||  ||||||||||||||    
T  10116809 taaatttgtttgtaataactattgtttttacaattttatcatttaagagggagggttggcgcatgtttttcagcatagtatttaaagttgattgaagaaa 10116710  T
Q  222 aa-gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| || ||||||||  || |||   |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||| |||||    
T  10116709 aaagatataaaataaataatggtatgatggtaaagaattaattaatgtatttggaaataccaaaagaatcttataaaaagagacaa 10116624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Original strand, 11937170 - 11937274
Alignment:
Q  65 cctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 164  Q
    ||||||||||| || |||||  |||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||| |||| |  |||||||||||||||||||| |    
T  11937170 cctatatataaaactcttttatcaaaatcaaggaaattaagaaagttgatatttgtattaaatttatttataatcacaattgtttttacaattttatcat 11937269  T
Q  165 ttaag 169  Q
    |||||    
T  11937270 ttaag 11937274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 21591812 - 21591884
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  21591812 tatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaaaaaataattaatatagtt 21591884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 21595929 - 21596001
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  21595929 tatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaaaaaataattaatatagtt 21596001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 35495089 - 35495182
Alignment:
Q  131 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagat 226  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | || | ||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35495089 tttgtaattactattgattttacaattttatcctttaag--agaaaggtaatgtatattttcaaaatagtatttaatgttgattgaagaaaaagat 35495182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30117287 - 30117157
Alignment:
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtat--aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 275  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  30117287 ttagtgtatgttttcaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaagatatataaaataaatagaggtttgttggtaaagaattaattaatgtacttaca 30117188  T
Q  276 aatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||| |||||    
T  30117187 aatatcaaaggagtcttataaaaagagacaa 30117157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 280
Target Start/End: Original strand, 7956568 - 7956648
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||   |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  7956568 tatttaatgatgattgaagaaaaagatatacaataaataggggtatggtggtaaagaattaattaatatatttggaaatag 7956648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 21252218 - 21252278
Alignment:
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  21252218 ttagtttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaaaatataaaataaata 21252278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35998671 - 35998560
Alignment:
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  ||||| |||||  | || || ||| ||||| ||||  |    
T  35998671 ttttcaacataatatttattattgattgaagaaaaatatgtaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaata--ttatatatttgaaaataataaagag 35998574  T
Q  288 gtcttataaaaagg 301  Q
    ||||||||||||||    
T  35998573 gtcttataaaaagg 35998560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7408926 - 7408877
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaag 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7408926 tattaaatttgtttgtaattactattgtttatacaattttatcttttaag 7408877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12807193 - 12807132
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaatta 140  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  12807193 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaatta 12807132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7001532 - 7001445
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttatt 207  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  || | ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  7001532 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatt 7001445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41470914 - 41470779
Alignment:
Q  80 cttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgtt 179  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    ||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||   ||    
T  41470914 cttttaccaaaatcatggggattaagaaagttgatagtaatattaaatttgtatataattactattgtttttataattttat-ctttaagagagatgatt 41470816  T
Q  180 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattga 216  Q
    ||||||| |||| || ||  |||||||||||| ||||    
T  41470815 agtttatatttttaaaataatatttattgttgcttga 41470779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3629460 - 3629421
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaaga 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3629460 tatatataagaccattttgccaaaatcacgtgaattaaga 3629421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10561321 - 10561250
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 165  Q
    |||| |||||||| | | ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10561321 acggaaattaagaaaattgatatttctaataaatttgtttgtaattattattgtttttataattttatcctt 10561250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 174
Target Start/End: Original strand, 33818837 - 33818888
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaaga 174  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33818837 taaatttgtttgtaattactattgcttttacaattctattctttaagaaaga 33818888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 299
Target Start/End: Original strand, 8145086 - 8145128
Alignment:
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  8145086 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaa 8145128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32719124 - 32719075
Alignment:
Q  143 attgtttttacaattttatcctttaagaa--agaatgttagtttatgttt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  32719124 attgtttttacaattttatcctttaaaaaagagaatattagtttatgttt 32719075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Original strand, 24875949 - 24876011
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaatt-agtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttt 191  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  24875949 ttgtttgtaattcattattgtttttacaattttatttttta--aaagaaagttagtttatgtttt 24876011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9978114 - 9978034
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  9978114 aaaaatatgtagagtaaataggggtaattttgtaaagaaaaaattaatgcatttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaa 9978034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40561127 - 40561070
Alignment:
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  40561127 aagaatattagtttatgttttcaaca--ttatctatcgttgatggaagaaaaatatgtat 40561070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 228)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 22103669 - 22103922
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22103669 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 22103768  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22103769 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 22103868  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  22103869 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 22103922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7181647 - 7181394
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7181647 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataggggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 7181548  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7181547 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgta 7181448  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7181447 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 7181394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43868400 - 43868147
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43868400 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 43868301  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43868300 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 43868201  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  43868200 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 43868147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 7051460 - 7051757
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7051460 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 7051559  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7051560 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 7051659  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7051660 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 7051757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 23700525 - 23700778
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23700525 actccctccgttcctatatacaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 23700624  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23700625 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 23700724  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23700725 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 23700778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 23718980 - 23719233
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23718980 actccctccgttcctatatacaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 23719079  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23719080 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 23719179  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23719180 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 23719233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 23737436 - 23737689
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23737436 actccctccgttcctatatacaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 23737535  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23737536 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 23737635  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23737636 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 23737689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 46878179 - 46878432
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  46878179 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataaaggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 46878278  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46878279 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 46878378  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  46878379 aagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaa 46878432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52673484 - 52673231
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  52673484 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 52673385  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52673384 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 52673285  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  52673284 aagaaataattaatgtaggtggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 52673231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26221585 - 26221288
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26221585 actccctctgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgttttta 26221486  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26221485 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaataagggcatgtatgta 26221386  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26221385 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 26221288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 9499237 - 9499490
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9499237 actccctctgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 9499336  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9499337 caattttatcctttaagagagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 9499436  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  9499437 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 9499490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 54107646 - 54107397
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54107646 cctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 54107547  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54107546 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaga 54107447  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  54107446 aataattaatgtagttgaaaataataaaggggtcttataaaaagggacaa 54107397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 31531151 - 31531448
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31531151 actccctccgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 31531250  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31531251 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgta 31531350  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||         |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31531351 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaatgtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataattagggacggagggagta 31531448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 60 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45253063 - 45252817
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45253063 ccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttt 45252964  T
Q  160 atcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45252963 atcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaat 45252864  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45252863 aattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 45252817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21756783 - 21756530
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21756783 actccctccgtccctatatataagacccttttgcgaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 21756684  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21756683 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgta 21756584  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21756583 aagaaataattaatgtagttggaaataataaagaggtcttataaaaagggacaa 21756530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 30040757 - 30041010
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30040757 actccctccgtctctatatacaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 30040856  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30040857 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 30040956  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  30040957 aataaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaaaagggacaa 30041010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45746075 - 45745822
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  45746075 actccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 45745976  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45745975 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 45745876  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  45745875 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 45745822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46703324 - 46703071
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  46703324 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 46703225  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46703224 caattttatcctttaagaaaaaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgta 46703125  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  46703124 aagaaataattaatgtagttagaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 46703071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 20656050 - 20656347
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  20656050 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaataactattgctttta 20656149  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20656150 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgtatgta 20656249  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  20656250 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattaggaacggagggagta 20656347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 7251022 - 7251275
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7251022 actccctccgtccctatatataagacccttttgttaaaatcattggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 7251121  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7251122 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 7251221  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  7251222 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaa 7251275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 45048762 - 45049015
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  45048762 actccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattattttta 45048861  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45048862 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 45048961  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  45048962 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 45049015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 54782657 - 54782910
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  54782657 actccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 54782756  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54782757 caattttatcctttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 54782856  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  54782857 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 54782910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32467724 - 32467469
Alignment:
Q  53 actccctccgtccct--atatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttt 150  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  32467724 actccctccgtccctctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 32467625  T
Q  151 tacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32467624 tacaattttatcctttacgaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 32467525  T
Q  251 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32467524 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 32467469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 26593505 - 26593758
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26593505 actctctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataatagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 26593604  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26593605 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgta 26593704  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  26593705 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaa 26593758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43701475 - 43701222
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43701475 actccttccgtccatatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 43701376  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43701375 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtatgta 43701276  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  43701275 aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 43701222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 32962845 - 32963097
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  32962845 actccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt-a 32962943  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32962944 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgta 32963043  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32963044 aagaaataattaatgtagttgcaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 32963097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 49126936 - 49127191
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctata--tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttt 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  49126936 actccctccgtccctatatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 49127035  T
Q  151 tacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49127036 tacaattttatcctttaaaaaagaagattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 49127135  T
Q  251 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  49127136 taaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 49127191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 25148862 - 25149115
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  25148862 actccctccgtttctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgttttta 25148961  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25148962 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgta 25149061  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25149062 aagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 25149115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 306
Target Start/End: Original strand, 1641841 - 1642092
Alignment:
Q  54 ctccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttac 153  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1641841 ctccctccgctcctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttac 1641940  T
Q  154 aattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1641941 aattttatcctttaagaaa-aatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 1642039  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||   |||||||||||||||||||    
T  1642040 agaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaagtcttataaaaagggacaa 1642092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25148752 - 25148503
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25148752 actccttccgtccctagatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 25148653  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  25148652 caattttatcctttaagaaagaaaattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca----tgta 25148557  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25148556 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 25148503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 298
Target Start/End: Original strand, 54604330 - 54604573
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  54604330 actccctccgtccctata--taagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 54604427  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54604428 caattttatcctttaagaatgaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatggatgta 54604527  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  54604528 aagaattaattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaa 54604573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32569293 - 32569041
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  32569293 actccctccgtttctatatataagacccttttgtcaaaatcacggga-ttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattattttta 32569195  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32569194 caattttatcatttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgtcgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 32569095  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32569094 aagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 32569041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 20621430 - 20621721
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20621430 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 20621529  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20621530 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 20621627  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20621628 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 20621721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26058835 - 26058590
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26058835 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgagaattaagatattggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 26058736  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||    
T  26058735 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgt----tattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gtatata 26058644  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26058643 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 26058590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 67 - 306
Target Start/End: Original strand, 35165717 - 35165955
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 166  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  35165717 tatatataagacctttttatcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtagtcactattgtttttacaattttatccttt 35165816  T
Q  167 aagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35165817 aagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaat 35165916  T
Q  267 gtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  35165917 gtagttggaaata-acaaagggtcttataaaaagggacaa 35165955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 35867823 - 35868076
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35867823 actccctccgtccttatatataagatccttttgccaaaattacgggaattaagatagggcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 35867922  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35867923 taattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgta 35868022  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  35868023 aaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 35868076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 10015535 - 10015826
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10015535 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 10015634  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10015635 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 10015732  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10015733 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 10015826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 19897582 - 19897873
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19897582 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 19897681  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19897682 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 19897779  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19897780 aataattaaagtagttggaaatagtaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 19897873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31187048 - 31186802
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31187048 ctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaatt 31186949  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31186948 ttatcctttaaga--gaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaa 31186851  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31186850 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 31186802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 50433133 - 50433382
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  50433133 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 50433232  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50433233 tttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 50433332  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  50433333 aataattaatgtagttggaaatagaataggggtcttataaaaagggacaa 50433382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 46845236 - 46845529
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  46845236 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 46845335  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46845336 tttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 46845435  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46845436 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 46845529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 62 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1450530 - 1450242
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1450530 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttag 1450431  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1450430 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 1450331  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  1450330 ttaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacgaaggtagta 1450242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 28673040 - 28673331
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  28673040 cctccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactgttgtttttacaat 28673139  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28673140 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatattatttattgctggttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 28673237  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28673238 aataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 28673331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33868744 - 33868448
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33868744 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 33868645  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33868644 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 33868546  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33868545 aagaaataattaatgtagttggaaataactaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 33868448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 45513381 - 45513628
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  45513381 cctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactatcgtttttacaat 45513480  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45513481 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 45513578  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45513579 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 45513628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4024347 - 4024096
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4024347 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaat-aagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 4024249  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4024248 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 4024150  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  4024149 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 4024096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10656984 - 10656735
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10656984 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 10656885  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10656884 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 10656785  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10656784 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaa 10656735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36005800 - 36005547
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36005800 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 36005701  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36005700 caattttatcttttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 36005601  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||    
T  36005600 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagagacaa 36005547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 53361595 - 53361848
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  53361595 actccatccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 53361694  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53361695 caattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgta 53361794  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  53361795 aagaaataattaatgtagttagaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaa 53361848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 15996519 - 15996810
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15996519 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 15996618  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15996619 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaaga 15996716  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15996717 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 15996810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 9779980 - 9780232
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9779980 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattattattgttttta 9780079  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9780080 caatattatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 9780178  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  9780179 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 9780232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 16434978 - 16435230
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16434978 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 16435077  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16435078 caattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 16435176  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16435177 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 16435230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 17591286 - 17591538
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17591286 actccctccatccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 17591385  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591386 caattttatc-tttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 17591484  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  17591485 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 17591538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44544078 - 44543826
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||| |||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44544078 actcccttcgtcccttattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 44543979  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44543978 caattttatcctt-aagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 44543880  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  44543879 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 44543826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49383635 - 49383344
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49383635 ctccgtcccttattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 49383536  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49383535 ttatcctttaagaaagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 49383436  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49383435 ataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttt-caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 49383344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 50647685 - 50647937
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50647685 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 50647784  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50647785 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 50647883  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  50647884 aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 50647937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6784754 - 6784507
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6784754 ctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 6784655  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6784654 ttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaa 6784555  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6784554 ataattaatgtagttgaaaatag-aaaagggtcttataaaaagggacaa 6784507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Original strand, 17753280 - 17753528
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17753280 ctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 17753379  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    ||||||||||||| | |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753380 ttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 17753479  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17753480 ataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 17753528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Original strand, 19054600 - 19054848
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19054600 ctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 19054699  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    ||||||||||||| | |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19054700 ttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 19054799  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19054800 ataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 19054848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 57 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43686794 - 43686547
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43686794 cctccgtccctaattataaggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 43686695  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  43686694 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaata 43686595  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43686594 aataattaatgtagttggaaatagaaaaaaggtcttataaaaagggac 43686547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14428905 - 14428654
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14428905 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 14428806  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14428805 caattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgta 14428708  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  14428707 aagaaataattaatgtagttggaaataagaaaggggtcttataaaaagggacaa 14428654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36099260 - 36099009
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36099260 actccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggataattgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 36099161  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36099160 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 36099062  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  36099061 aagaaataattaatgtaattggaaata-acaaagggtcttataaaaagggacaa 36099009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 42801526 - 42801775
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  42801526 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataat 42801625  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42801626 tttatcctttaagaaagagggttagcttatattttcaatattctatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 42801725  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  42801726 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaagggacaa 42801775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47067227 - 47066978
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||     
T  47067227 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaa 47067128  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  47067127 tttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaatgatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 47067028  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  47067027 aataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaa 47066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 4759093 - 4759388
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaa-tcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaa 155  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4759093 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa 4759192  T
Q  156 ttttatcctttaagaaagaatgttagt-ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4759193 ttttatcctttaagaaagagggtttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 4759292  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4759293 aaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 4759388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 79 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8322194 - 8321924
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaaga-atg 177  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  8322194 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagagatg 8322095  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322094 tt---ttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 8321998  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8321997 tagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtag 8321924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21459275 - 21458981
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21459275 cctccttccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaat 21459176  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||| || | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21459175 tttatcctttacgatatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 21459076  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21459075 aataattaatgtagttggaaataacaaaggtgtcctataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtag 21458981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20862493 - 20862240
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  20862493 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgctttta 20862394  T
Q  153 caattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20862393 caattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatt-attgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 20862295  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  20862294 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 20862240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 46049728 - 46049979
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  46049728 actccctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 46049827  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  46049828 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgta 46049925  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  46049926 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaaggacaa 46049979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 351
Target Start/End: Original strand, 48887703 - 48887984
Alignment:
Q  70 atataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaag 169  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48887703 atataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaagtattattgtttttacaattttatcctttaag 48887802  T
Q  170 aaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48887803 agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 48887902  T
Q  270 gttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    |||| |||||| |||   |||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  48887903 gttgaaaatagcaaagcagtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagaatcttataattatggacggaggtagtag 48887984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 1084698 - 1084947
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  1084698 cctccgtccctaactatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatctttgtaattactattgtttttacaat 1084797  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1084798 tttaccctttaagagagagagatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 1084897  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1084898 aataattaatgtagttgaaaatagtaaaaggatcttataaaaagggacaa 1084947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 12906156 - 12906405
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12906156 cctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgtttttacaat 12906255  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906256 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 12906355  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  12906356 aataattaatgtagttggaaatggaaaaggggtcttataagaagggacaa 12906405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Original strand, 36317405 - 36317648
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36317405 cgtccctttatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaga-agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttta 36317503  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||||   ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36317504 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtgaagaaata 36317602  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  36317603 attaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaa 36317648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37729009 - 37728757
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  37729009 actccctctgtccttaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtattta 37728910  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728909 caattttatc-tttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 37728811  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  37728810 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 37728757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 52058986 - 52059238
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  52058986 actccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 52059085  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52059086 caattttatcctt-aagagagagagtttgtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 52059184  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  52059185 aagaagtaattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 52059238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 43158521 - 43158729
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  43158521 gggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaaa--tggtttatgttttcaac 43158618  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  43158619 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttata 43158718  T
Q  296 aaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||    
T  43158719 aaaagggacaa 43158729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52044780 - 52044540
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52044780 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaat 52044681  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  52044680 tttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatatatgtaaaga 52044583  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  52044582 aataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 52044540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43978455 - 43978204
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43978455 actccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 43978356  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43978355 caattttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 43978258  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||    
T  43978257 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaagagacaa 43978204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 50726526 - 50726777
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||| |||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  50726526 actccttccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 50726625  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50726626 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 50726723  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  50726724 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaa 50726777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50786322 - 50786071
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||| |||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  50786322 actccttccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 50786223  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50786222 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 50786125  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  50786124 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaa 50786071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8547197 - 8546948
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8547197 cctccgtccctaagtataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgcgtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaat 8547098  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8547097 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtatagtaaatagggacatgtatgtaaaga 8546998  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  8546997 aataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 8546948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 53686741 - 53686990
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  53686741 cctctgtccctaattataaaacccttttgaaaaaacaacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 53686840  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53686841 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgtaaaga 53686940  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  53686941 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaa 53686990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10045130 - 10044885
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10045130 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattt 10045031  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||  |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10045030 tatcctg-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 10044932  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  10044931 taattaatgtagttggaaata-acaaagggtcttataaaaagggacaa 10044885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Original strand, 12683011 - 12683173
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12683011 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 12683110  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  12683111 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 12683173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33212689 - 33212397
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33212689 cctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 33212590  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33212589 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 33212490  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||    ||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33212489 aataattaatgtagatggaaatagaaaagaaatcttataaaaagggacaaaaaaattct-caaaaggatcttataattagggacggaggtagta 33212397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 303
Target Start/End: Original strand, 45323870 - 45324077
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||    
T  45323870 acggaaattaagatagaagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttca 45323967  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45323968 acatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctta 45324067  T
Q  294 taaaaaggga 303  Q
    ||||||||||    
T  45324068 taaaaaggga 45324077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 50517266 - 50517559
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  50517266 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 50517365  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||   ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50517366 tttatcctttaagggggagggttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaaga 50517465  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  50517466 aataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtattataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 50517559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46861867 - 46861623
Alignment:
Q  103 aagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttat 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  46861867 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttat 46861768  T
Q  203 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  46861767 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 46861668  T
Q  303 acaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggta 347  Q
    ||||          |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  46861667 acaaaaaaaaatctcaaaagaaccttataattagggacggaggta 46861623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Original strand, 17698792 - 17699025
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17698792 tataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 17698891  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17698892 gaga--gatggtttatgttttcaacacgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtttaattaataggggcgtgtatgtaaaaaaataattaatgtag 17698989  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  17698990 ttggaaatagcaaagggatcttataaaaaaggacaa 17699025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 78 - 301
Target Start/End: Original strand, 52291194 - 52291415
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |    
T  52291194 cccttttgaaaaaataaagggaattaagatagtggatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttattctttaagagaga--g 52291291  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52291292 ataatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 52291391  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||    
T  52291392 tagcaaatgagtcttataaaaagg 52291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 79 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 53164434 - 53164163
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  53164434 ccttttgaaaaaataatgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggt 53164335  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53164334 tggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 53164235  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    || |||   |||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  53164234 agaaaagaagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 53164163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41824396 - 41824155
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  41824396 cgtcccaatatataagacccttttgctaaaattacggaaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagtttta 41824297  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824296 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaaagtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 41824198  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  41824197 attaatgtagttggaaatagaaaagatgtcttataaaaaggga 41824155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 51283803 - 51284056
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  51283803 actccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 51283902  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aaataggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51283903 caattttatcc-ttaagagagagagttagtttacgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaaataggggcatgtatgt 51284001  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||    
T  51284002 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggattttataaaaagggacaa 51284056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40919245 - 40919024
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40919245 tccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 40919146  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40919145 tatcctttaagaaagagggttatcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaaaaa 40919046  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatag 280  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40919045 taattaatgtagttggaaatag 40919024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Original strand, 46862114 - 46862359
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  46862114 cgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattactgtttttacaatttta 46862213  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    ||||||||||| ||  |||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46862214 tcctttaagaaggagggttgacttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 46862313  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  46862314 attaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaa 46862359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Original strand, 26806116 - 26806366
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgcc-----aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgt 147  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  26806116 actccctccgtccctaattataagacccttttgctttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgt 26806215  T
Q  148 ttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 247  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26806216 ttttacaattttatcctt-aagagagaaggttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgt 26806314  T
Q  248 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  26806315 atgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 26806366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Original strand, 12050143 - 12050386
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12050143 cgtccctaattataggacctttttgaaaaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 12050242  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    |||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12050243 tcctttgagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaata 12050340  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  12050341 attaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggtacaa 12050386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35711570 - 35711319
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||  |||| |||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  35711570 actccctccgttcctaattataggacccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 35711471  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35711470 caattttatcctttaagagagaat--tcatttgtgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 35711373  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  35711372 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaa 35711319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 79 - 304
Target Start/End: Original strand, 13809575 - 13809800
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||   |    
T  13809575 ccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttattcttcaagagagaggat 13809674  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13809675 tggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaat 13809774  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    || |||| | ||||||||||||||||    
T  13809775 agcaaaatgatcttataaaaagggac 13809800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39952563 - 39952315
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  39952563 cctccgtccctaattataagatccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaat 39952464  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
     |||||||| |||| |||  |||||||||||||||  | ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39952463 attatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaatatgggcatgtatgtaaaga 39952365  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39952364 aataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 39952315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 24087082 - 24087372
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24087082 cctccgtccctaattataagactcctttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 24087181  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  24087182 tttatcctttaagaaagaaggttggcctatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgt---ataaataggggcatgtatgtaaaga 24087278  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24087279 aataattaatatagttgaaaatagaaaacgggtcttataaaacgggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 24087372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32978776 - 32978533
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  32978776 actccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 32978677  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||| |||||    
T  32978676 caattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaatatgatatttattgttgattaaaaaaaattatatataataaataggggcatgcatgta 32978579  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  32978578 aagaaataattaatgtagttggaaata-acaaagggtcttataaaaa 32978533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48910132 - 48909916
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||| |||||||    
T  48910132 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagaga--gttggtttatg 48910035  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |    
T  48910034 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaagtag 48909935  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48909934 gtcttataaaaagggacaa 48909916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 51489638 - 51489411
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |     
T  51489638 ccttttgaaaaaataatgggaattaagataggggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaggga 51489539  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51489538 tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatggaagaaaaagatgtataataaataaatgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 51489439  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||   |||||||||||||||||||    
T  51489438 agcaaacaagtcttataaaaagggacaa 51489411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 43557228 - 43557446
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||    
T  43557228 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttattatttaagagagaaggttggtttatg 43557327  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  43557328 ttttcaacatgttatttattggtaattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaatgattaatgtagttgaaaatagcaaatgg 43557427  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  43557428 atcttataaaaaggaacaa 43557446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48214043 - 48213796
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | | ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||     
T  48214043 cctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaag 48213944  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  48213943 tttatcctttaagagagaaa--tggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatatatgtaaaga 48213846  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  48213845 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcctataaaaaaggacaa 48213796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 53271887 - 53271636
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  53271887 actccctccgtccctaattataagacttttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcac-attgttttta 53271789  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53271788 caattttatcctt-aagagagggagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 53271690  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||| |||||    
T  53271689 aagaaataattaatgtaattggaaataacaaagggatcttataaaaagcgacaa 53271636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2993519 - 2993259
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  2993519 aaaataacgggaactaaggtagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatg 2993422  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |     
T  2993421 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaataacaaatga 2993322  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||          |||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2993321 gtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaatgatcttataattagggacggaggtagta 2993259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27688254 - 27688030
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  27688254 ccttttgaaaaaataacgggaattaagacagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagggt 27688157  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27688156 tggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaatatgtataat-aataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 27688058  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||    
T  27688057 agcaaatgagtcttataaaaagggacaa 27688030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10221180 - 10220976
Alignment:
Q  100 attaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgt 199  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||     
T  10221180 attaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatga 10221083  T
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  10221082 tatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaa 10220983  T
Q  300 gggacaa 306  Q
    |||||||    
T  10220982 gggacaa 10220976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50730576 - 50730369
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||    
T  50730576 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatg 50730477  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  50730476 ttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaa 50730377  T
Q  299 agggacaa 306  Q
    ||||||||    
T  50730376 agggacaa 50730369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Original strand, 50782278 - 50782485
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||    
T  50782278 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatg 50782377  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  50782378 ttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaa 50782477  T
Q  299 agggacaa 306  Q
    ||||||||    
T  50782478 agggacaa 50782485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 54849656 - 54849407
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54849656 cctccgtacttatatataaaacccttttgccaaaattattggaattaagaaagtggatatttacattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 54849557  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga-aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54849556 tttatcatttaagagagatggttactttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaatatgtataataaat-ggggcatgtatgtaaag 54849458  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  54849457 aaatagttaatgtacttgaaaataacaaatggatcttataaaaagggacaa 54849407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 61 - 350
Target Start/End: Original strand, 23776245 - 23776531
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23776245 cgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 23776344  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    | |||||| | |||  ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23776345 ttctttaatagagagggttggattatgttttcaac--gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaaca 23776442  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||||          ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23776443 attaatgtagttgtaaataacaaaggagtcttataacaagggacaaaaaaaatct-caaaaaaatcttataattagggacggaggtagta 23776531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 297
Target Start/End: Original strand, 41992275 - 41992509
Alignment:
Q  48 catcaactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgt 147  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41992275 catctactacctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 41992374  T
Q  148 ttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 247  Q
    |||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41992375 ttttacaattttatcctg---------------gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatat 41992459  T
Q  248 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  41992460 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 41992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20877922 - 20877677
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||  | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  20877922 cctccgtcgctatatataagacc-ttttgttaaaattgcagaaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattacttttacaat 20877824  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||| ||| |||| |||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20877823 tttattctt-aagagaga--gttagtttacgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaga 20877727  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  20877726 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaaagatcttataaaaagggacaa 20877677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38071457 - 38071239
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||    
T  38071457 aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagaggattggtttatg 38071358  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |     
T  38071357 ctttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatatagttagaaatagcaaatga 38071258  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  38071257 gtcttataaaaaaggacaa 38071239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14759105 - 14758882
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |     
T  14759105 ccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--ga 14759008  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759007 tgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggcaa--atgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 14758910  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  14758909 agcaaatgggtcttataaaaagggacaa 14758882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20849129 - 20848985
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20849129 actccctccatccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaggatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 20849030  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20849029 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 20848985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25916692 - 25916450
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25916692 ccgtccttgtatataagatccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttt 25916593  T
Q  160 atccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatg---tatgtaaag 255  Q
    |||||| | ||| ||||  ||| ||||| ||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||   |||||||||    
T  25916592 atccttcagagagagaa--ttaatttatatttcccatatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaattgaggcatgcaatatgtaaag 25916495  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25916494 aaataattaatgtagttagaaatagcaaatgggtcttataaaaag 25916450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36600435 - 36600187
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||| | ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |    
T  36600435 cctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaatttggaaaatggatatttatattaaagtcgtttgtaagtaccattgtttttacagt 36600336  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||   ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36600335 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattgccgattcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatataaaga 36600237  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||| ||||||    
T  36600236 agtaattaatgtagttgaaaatagcaaataggtgttataaaaaaggacaa 36600187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 42390648 - 42390897
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42390648 cctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttgcaat 42390747  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  42390748 tttatcatttaagagagagagttagtttatgttttcaacatgtaatttattgcaaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaata 42390847  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||   |||||||||||||||||||    
T  42390848 aataattaatgcagttggagataacaaagatgtcttataaaaagggacaa 42390897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 35572202 - 35572448
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  35572202 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttataattactattgattttacaat 35572301  T
Q  157 tttatcctttaa--gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  35572302 tttatcctttaagggagagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttactgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg-----ttatgtaaa 35572396  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  35572397 gaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaa 35572448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 26306355 - 26306600
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| |||       || |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26306355 actccctctgtccttaattataagacccttttgctaaaatcacgagaa-------agcggatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgttttta 26306447  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||  |||  |||| ||||||||||| | ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26306448 caattttatcctt-aagcgagagagttaatttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 26306546  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||    
T  26306547 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaaggacaa 26306600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 299
Target Start/End: Original strand, 49383640 - 49383819
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49383640 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaatagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaga 49383739  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  49383740 aaaaaatatataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaa 49383819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Original strand, 12675163 - 12675285
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12675163 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgttttta 12675262  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12675263 caattttatcctttaagaaagaa 12675285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 303
Target Start/End: Original strand, 22527375 - 22527611
Alignment:
Q  65 cctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 164  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  22527375 cctatatataagacccttttgttaaaatttcgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgttaggaatcactattgtttt-acaattttatcct 22527473  T
Q  165 ttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc-atgtatgtaaagaaataatt 263  Q
    | |||| | | ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22527474 t-aagagaaagtgttagtttatgtttccat-atgctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagccatgtatgtaaagaaataatt 22527571  T
Q  264 aatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  22527572 aatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaaaggga 22527611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 299
Target Start/End: Original strand, 22832415 - 22832595
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||  ||||||||    
T  22832415 tgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgattgaa 22832513  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  22832514 gaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 22832595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 112 - 306
Target Start/End: Original strand, 33361500 - 33361686
Alignment:
Q  112 gatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttg 211  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33361500 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctg 33361599  T
Q  212 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  33361600 attgaagaaaaagatgtataataagtaggg--------gtaaagaaataattaatgtagttggaaaaagcaaagaggtcttataaaaagggacaa 33361686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 44542303 - 44542460
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  44542303 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaga 44542402  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  44542403 acatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaaaatgtcttataaaaa 44542460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52178050 - 52177844
Alignment:
Q  100 attaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||      
T  52178050 attaagatagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattggtttatgttt-caacattc 52177952  T
Q  200 t--atttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  | | |||||||    
T  52177951 tctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaactag-aaagagatattataaa 52177853  T
Q  298 aagggacaa 306  Q
    |||||||||    
T  52177852 aagggacaa 52177844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1572591 - 1572375
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    |||||||||| |||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||    
T  1572591 aaaatcacggaaattaagaaaattgatatttatattaaagttgtttgtaatcgttattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatg 1572495  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaag 286  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  1572494 ttttccatatgttatttattgttgattggaaaaaaaaaatgtataatgaatatgggcatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 1572395  T
Q  287 ggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  1572394 ggtcttataaaaaaggacaa 1572375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 47008247 - 47008539
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  47008247 cctccgtccctaaatataggacccttttgccaaaattacggagattaaaaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 47008346  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||  |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  47008347 tttatcctt-aagggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattcttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaga 47008445  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47008446 aataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagtgtcttataattagggacggaggtagta 47008539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 306
Target Start/End: Original strand, 43408544 - 43408722
Alignment:
Q  129 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43408544 tgtttataattagtattgtttttacaattttatc-tttaaga--gaaagacgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 43408640  T
Q  229 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat----gtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  43408641 ataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 43408722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 351
Target Start/End: Original strand, 27646115 - 27646344
Alignment:
Q  121 attaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaa 220  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27646115 attaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 27646213  T
Q  221 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaa 320  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||          ||||    
T  27646214 aaagatgcaaaataaataagggtatcttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaagagacaaaaaaatttctcaaa 27646313  T
Q  321 agaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27646314 aggatcttataattagggacggaggtagtag 27646344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33976730 - 33976554
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||    |  |||||||||||||||||    
T  33976730 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgcttttataattttatcctttgagatgga----tgatttatgttttcaacatg 33976635  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33976634 ttatttatggctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 33976554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29383307 - 29383058
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||| | | ||||   ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29383307 cctccgtccctaaatataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgataatagtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaat 29383208  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  29383207 tttatccttgaagagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttaatattgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaaga 29383108  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||| |||||    
T  29383107 attaattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagagacaa 29383058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 302
Target Start/End: Original strand, 44561441 - 44561685
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  44561441 cctccgtccctaaatatagaagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 44561540  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  44561541 tttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 44561639  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  44561640 aataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggg 44561685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 46879309 - 46879068
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46879309 tccgtccctatttatcagaccattttggcaaaatcacgggacttaagaaagttgatatttgtattaaattcgtttgtaattactattgtttttacaattt 46879210  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa--gatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
      |  ||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||   |||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  46879209 att--tttaaaaaagatagttagtgtatgttttcaatatgctatttattgcttattgaaaaaaaaataatgtatcataaacatgggtatgtatgtaaaga 46879112  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  46879111 aataattaatgtagttggaaatagcaaaaaattcttataaaaag 46879068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49543846 - 49543721
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49543846 gtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaaaaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 49543747  T
Q  281 taaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  49543746 caaaagagtcttataaaaagggacaa 49543721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 37144230 - 37144413
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataaga-cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagt-tgtttgtaattagtattgtttttaca 154  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  37144230 cctccgtccctaattataagaacccttttgaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttttattaaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 37144329  T
Q  155 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37144330 attttatcttttaagagagagagttgatttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 37144413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 304
Target Start/End: Original strand, 41392622 - 41392871
Alignment:
Q  57 cctccgtccctata--tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttaca 154  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||| ||| |||    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41392622 cctccgtccctctaattataagagccttttgataaaatcatgagaattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtttgtaattactattgtttttaca 41392721  T
Q  155 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||| |||||||||||| | |  ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||   | |||||| ||| ||||   ||||    
T  41392722 attatatcctttaagagatagagttggtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatatgggaagtaaataagggtatgttgataaa 41392821  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  41392822 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttacaaaaagggac 41392871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 306
Target Start/End: Original strand, 1111457 - 1111641
Alignment:
Q  121 attaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaa 220  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1111457 attaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 1111555  T
Q  221 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  1111556 aaagatgcaaaataaataagggtatcttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagagacaa 1111641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25130934 - 25130721
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25130934 cgtccctatatataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttta 25130835  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt---ataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    ||  |  |||      |||  ||||||||||  | ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25130834 tc--tcgaga------gttgatttatgtttttcatatgctatttattgctgattaaataaaaagatgtataataataaataggggcatgtatgtaaataa 25130743  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  25130742 ataattaatgtaattggaaata 25130721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9582393 - 9582243
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9582393 tatttatttttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatatagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 9582294  T
Q  300 gggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9582293 gggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggatggaggtagta 9582243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25879401 - 25879256
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||    
T  25879401 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattttatcttttaagagatagagttggtttatg 25879302  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25879301 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataat 25879256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Original strand, 28810928 - 28811107
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28810928 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 28811026  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  28811027 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaa 28811107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 297
Target Start/End: Original strand, 46557751 - 46557867
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46557751 gtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 46557850  T
Q  281 taaaagggtcttataaa 297  Q
     ||| || |||||||||    
T  46557851 aaaagggatcttataaa 46557867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 12918583 - 12918876
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  12918583 cctccgtccctaaatatatgagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 12918682  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  12918683 tttatcctt-aagagagatagttaatttatattttcaatataatatttattgttaattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 12918781  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||          ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12918782 aataattaatgtacttgaaaataccaaaaggatcttataaaaagggacaaattattttttcaagagggtcttataattagggatggaggtagtag 12918876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 223
Target Start/End: Original strand, 41750962 - 41751097
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  41750962 aaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttgagagagaaagttggtttatg 41751061  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41751062 ttttcaacatgttatttaatgttgattgaaaaaaaa 41751097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 48904070 - 48904256
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  48904070 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 48904168  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  48904169 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaa 48904256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23308200 - 23308059
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23308200 aaaataacgggaattaagacagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagagggttagtttatg 23308101  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23308100 ttttcaacatgttatttattgctgattaaaaaaaaagatgta 23308059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31533574 - 31533414
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31533574 tattatttttacaattttatcctt-aggagagaaagttagtttatgttttctatatgctatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaatagag 31533476  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  31533475 acatgtatgtaaagaaataattaatatagttagaaatagcaattggatcttataaaaaggga 31533414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 42526370 - 42526618
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| || |  ||||||| ||| |||    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  42526370 cctccgtccttaaatataagagccttttgtcaaaattacagagattaagaaagttgattatagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 42526469  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || || | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  42526470 tttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaagaggtgcaaaataaataagggtatgttagtaaaga 42526568  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  42526569 aataattaatgtacttgaaaatactaaagaggtcttgtaaaaagggacaa 42526618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 296
Target Start/End: Original strand, 18658327 - 18658442
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18658327 gtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagttggaaata 18658426  T
Q  280 gtaaaagggtcttataa 296  Q
    |  ||||||||||||||    
T  18658427 g-caaagggtcttataa 18658442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20848712 - 20848612
Alignment:
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20848712 ttatttattgttgattgatgaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaa 20848613  T
Q  299 a 299  Q
    |    
T  20848612 a 20848612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38341162 - 38340994
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38341162 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaata 38341066  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  38341065 aataagggtatgtttgtaaagaattaattaatatacttcgaaatactaaagaggtcttgtaaaaagggacaa 38340994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 55287534 - 55287306
Alignment:
Q  70 atataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaag 169  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||| | || ||||   |||||| | |||| |||  ||||||||||||||||||||| |    
T  55287534 atataagacccttt-gacaaaatcatgggaattaagaaagttgatttttgcattat--ttgtttttgattattatgatttttacaattttatcctttatg 55287438  T
Q  170 aaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    | |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  55287437 ata----gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataattaatgta 55287342  T
Q  270 gttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  55287341 gtt-gaaatagctaaagtgtcttgtaaaaaaggacaa 55287306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 54927897 - 54928084
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54927897 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttttataattttatcatttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 54927996  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | ||||||||   | ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  54927997 aaaaagatgcaaaataaataaaagtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaatactaaaagagtattataaaaagagacaa 54928084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 19350152 - 19350302
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || | |||  ||| |||||||    
T  19350152 aaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttataaatttatccttcaaaagagagagttggtttatg 19350251  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19350252 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaata 19350302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30820079 - 30819922
Alignment:
Q  148 ttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 247  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  30820079 ttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgt 30819981  T
Q  248 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  30819980 tagtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaa 30819922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Original strand, 17589683 - 17589913
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  17589683 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 17589781  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||          ||    
T  17589782 aaaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggacaaattattttttca 17589881  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17589882 aaagtgtcttataattagggacggaggtagta 17589913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 300
Target Start/End: Original strand, 29719456 - 29719698
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  29719456 cctccgtccttaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 29719555  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | ||| ||||  |||||||    
T  29719556 tttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttgaacatactatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaagaagggtatgttggtaaaga 29719654  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  29719655 aataattaatgtacttggaaataccaaatgggttttataaaaag 29719698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33290636 - 33290393
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| |||  |||| || ||||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||   |||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  33290636 cctccgtctctaattatatgaacctttagtcaaaatcacggaaattaagaaagttgataatagtattaaatttgtttataattactattatttttacaat 33290537  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    | ||| ||| |||| |||  |||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||   |||||||    
T  33290536 tgtattctt-aagagaga--gttaatttatgttctcaacataatatttattattgattgaagaaaaagatgaaaaataaataggggtatggtggtaaaga 33290440  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  33290439 aataattaatgtaattgaaaatagtaaatgaatcttatgaaaaggga 33290393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 34021802 - 34021988
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34021802 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 34021900  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| | ||||||||||||| |||||    
T  34021901 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattgatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaagagacaa 34021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54866565 - 54866388
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| | || ||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  54866565 cctccgtccctaattataagatccttttga-aaaataatggaaattaagatagtgaatatttatattaattatgtttgtaattactattgtttttacaat 54866467  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataa 235  Q
    |||||| ||||| |||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54866466 tttatcttttaataaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 54866388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 350
Target Start/End: Original strand, 16776696 - 16776924
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt-aagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||  |||||| |||||||||||  |  |||||| || ||||||||||||    
T  16776696 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaaatttgtccttttaagagagagggttagtgtatgttttcaatgtagtatttaatgctgattgaagaaa 16776795  T
Q  222 aagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaa 321  Q
    ||||| || |||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||          |||||    
T  16776796 aagatataaaataaataggggtatattggtaaagaattaattaatgtacttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaattttttttctcaaaa 16776895  T
Q  322 gaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16776896 ggatcctataattagggacggaggtagta 16776924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Original strand, 48902454 - 48902700
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||    
T  48902454 cctccgtccctaaatataggagcattttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataactactattgtttttacaat 48902553  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| |    
T  48902554 tttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataaaggtatgttggtaaaaa 48902651  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48902652 aataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggaca 48902700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8379907 - 8379721
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  8379907 gtattaaatttgtatataattactactgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatattgattgttgattgaag 8379809  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  8379808 aaaaaaattcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgggtcttataaaaaaggacaa 8379721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45404666 - 45404419
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| |||   |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  45404666 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagtttgttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 45404567  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  45404566 tttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 45404469  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  45404468 aataattaatgtacttggaaacaccaaatgggtcttataaaaagagacaa 45404419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 306
Target Start/End: Original strand, 7886932 - 7887055
Alignment:
Q  183 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagta 282  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  7886932 ttatgtttttcatatgctatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagca 7887031  T
Q  283 aaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  7887032 aatgagtcttataaaaaaggacaa 7887055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15095428 - 15095242
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15095428 gtattaaatttgtatatatttactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaag 15095330  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |  |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  15095329 aaaaagatgcaaaataaataagggtagtttggtaaacaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaa 15095242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35938593 - 35938409
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  35938593 tgtaataaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtgtatgttttcaacatgataattaatgttgatcgaa 35938494  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||    |||||||||||||| ||| |||||  |||||  |||||||||||| |||||    
T  35938493 gaaaaagatataaaataaataggggtgtgttggt----aaataattaatgtatttgaaaatatcaaaagaatcttataaaaagagacaa 35938409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Original strand, 39625232 - 39625352
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagttta-t 186  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| |    
T  39625232 aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagtttgtttatt 39625331  T
Q  187 gttttcaacatgttatttatt 207  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  39625332 tttttcaacatgttatttatt 39625352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42755555 - 42755341
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  42755555 taattactattgtttttataattttatccttaaa-agagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 42755457  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataatt 334  Q
    ||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||          ||| ||| ||||||||||    
T  42755456 aataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaaaggtcttataaaaagagacaaattattttttcaatagagtcttataatt 42755357  T
Q  335 agggatggaggtagta 350  Q
    ||||| ||||||||||    
T  42755356 agggacggaggtagta 42755341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4564466 - 4564237
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |    
T  4564466 tattaaatttgtatattattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacacaatatttattgttgattgaata 4564368  T
Q  220 aaaa-gatgtataataaataggggcatgtat--gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnc 316  Q
    |||| |||| | |||||||| ||| || | |  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||              
T  4564367 aaaaagatgcaaaataaataagggtatatgttagtaaagaaataatcaatgtacttggaaatactaaagaggtcttataaaaagggacaattttttt--- 4564271  T
Q  317 caaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4564270 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 4564237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 32968971 - 32969218
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  32968971 cctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 32969070  T
Q  157 tttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||| | |||||||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||  |||   |||||    
T  32969071 tttatccttaagagaaaga--gtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtctgttgttaaag 32969167  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||    
T  32969168 aaataattaatgtacttggaaacaccaaagggatcttataaaaagggacaa 32969218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 242
Target Start/End: Original strand, 23650639 - 23650761
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  || ||||| || |||| |||    
T  23650639 tattaaatttgtttgtaattagtaatgtttttacaattttatcctttatgaaaaaaagttagtttatgttttcaacataatacttattattaattggaga 23650738  T
Q  220 aaaagatgtataataaatagggg 242  Q
    |||| | ||| ||||||||||||    
T  23650739 aaaataagtaaaataaatagggg 23650761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 279
Target Start/End: Original strand, 34265491 - 34265696
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaaga-atg 177  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||   |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||    
T  34265491 ccttttgtcaaaattacgggaattaagaaagtcggtagtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattctt-aagagagagatg 34265589  T
Q  178 -----ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
         ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  34265590 aataattagtttatgttttcaacatagtatttattgtcgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaaggtatgttagtaaagaaataattaatgtaatt 34265689  T
Q  273 ggaaata 279  Q
    | |||||    
T  34265690 gaaaata 34265696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 18658173 - 18658286
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18658173 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 18658272  T
Q  157 tttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||||||||    
T  18658273 tttatcctttaaga 18658286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24813814 - 24813657
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  24813814 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aaga--gaaagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 24813718  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24813717 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaatatttaatgtacttggaaata 24813657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Original strand, 42044061 - 42044289
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  42044061 gtattaaatttgtgtataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 42044159  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||  ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |  |||| | |||||||||||| |||||           |    
T  42044160 aaaa--atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaacaccaaaaagatcttataaaaagagacaaattattttttta 42044257  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42044258 aaaggatcttataattagggacggaggtagta 42044289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Original strand, 39625681 - 39625787
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||||||    
T  39625681 tatttattgctaattgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagttttataaaaa 39625780  T
Q  300 gggacaa 306  Q
    |||||||    
T  39625781 gggacaa 39625787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 306
Target Start/End: Original strand, 48655072 - 48655233
Alignment:
Q  144 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  ||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  48655072 ttgtttttacaattttatactt-aagatggagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggt 48655170  T
Q  244 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||| |   |||||  ||| || |||||||||| |||||||    
T  48655171 atgttggtaaagaaataataaatgtactcaaaaataccaaagggatcttataaaacgggacaa 48655233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9582485 - 9582396
Alignment:
Q  74 aagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcc 163  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9582485 aagactcttttgccaaaatcgcgggaattaagaaagtggatatttgtatcaaagttgtttggaattactattgtttttacaattttatcc 9582396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Original strand, 28875059 - 28875217
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||| ||||| |||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  28875059 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc--ttaagagagagagttaatttatatttttaatataatatttattgttgattgaag 28875156  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28875157 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaata 28875217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34811543 - 34811358
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||  |||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  34811543 gtattaaatttgtatataattactattgcttt-acaattttatccttaagagaaaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaa 34811447  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||  ||| | |||||||| | | ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  34811446 gaaaagaatgcaaaataaataagagtatgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaataccaaaaggatcttataaaaagggacaa 34811358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 306
Target Start/End: Original strand, 52693552 - 52693681
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  52693552 gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttgttaaagaaataattaatgtacttggaa 52693651  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  52693652 ataccaaaatggtcttataaaaagggacaa 52693681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31541252 - 31541071
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  || | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  31541252 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaaga--gtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 31541155  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||| ||| |    ||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31541154 gaaaaa-atgca----aaataagggtatgttggtaaagatataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaa 31541071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Original strand, 40215052 - 40215222
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  40215052 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaata 40215150  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||  ||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||  |||||||||| |||||||    
T  40215151 aatcagggtatgttggtaaagaaacaattaatgtacttgaaaataccaaaagaatcttataaaatgggacaa 40215222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38364400 - 38364219
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  | ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||    
T  38364400 tgtaataaatttatttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagagttgttatatgttttcaaaatagtattcactgttgattgaa 38364301  T
Q  218 gaaaaag-atgtataat-aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    ||||||  || || ||| ||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  38364300 gaaaaaacatataaaattaaataagggcatgttggtaaataattaattaatgtatttgaaaatattaaaggggtcttataaa 38364219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 133
Target Start/End: Original strand, 7462842 - 7462921
Alignment:
Q  54 ctccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgttt 133  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7462842 ctccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgttt 7462921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36584935 - 36584710
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||  || | ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  36584935 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcctt-aagagaga--gtaaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 36584839  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||   || | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||   |||||||||||||||||||          ||    
T  36584838 aaaa---tgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaataagtcttataaaaagggacaaattattttttca 36584742  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  36584741 aaagagtcttataattagggacagaggtagta 36584710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 306
Target Start/End: Original strand, 7462921 - 7462990
Alignment:
Q  237 taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  7462921 taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 7462990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 269
Target Start/End: Original strand, 4836516 - 4836647
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  4836516 taattactattgtttttacgattttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaagaaaaagatgcaaaata 4836612  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    ||||  || ||||   |||| ||||||||||||||    
T  4836613 aataaaggtatgttactaaataaataattaatgta 4836647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20919189 - 20919133
Alignment:
Q  243 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20919189 catgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20919133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20928151 - 20928095
Alignment:
Q  243 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20928151 catgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20928095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Original strand, 21497618 - 21497734
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||      
T  21497618 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattga-- 21497714  T
Q  219 aaaaagatgtataataaata 238  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  21497715 aaaaagatgcaaaataaata 21497734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7886532 - 7886453
Alignment:
Q  227 gtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| ||||||    
T  7886532 gtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaatggacaa 7886453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Original strand, 13702666 - 13702769
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  13702666 taaatttgtttgtaattgctattcttttaacaattttatcctttaagagagggggttagtgtatgttttcaacatagtatttaatgctgattgaagaaaa 13702765  T
Q  223 agat 226  Q
    ||||    
T  13702766 agat 13702769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 267
Target Start/End: Original strand, 2764254 - 2764356
Alignment:
Q  165 ttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 264  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||   ||||||||| |||||    
T  2764254 ttaaaaaagaaagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgctggtaaagaaacaatta 2764353  T
Q  265 atg 267  Q
    |||    
T  2764354 atg 2764356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40048081 - 40047979
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||    
T  40048081 tatttattgctgattgaagaaaaatatgtaaaataaataagtgtatgttagtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttgtaaaaa 40047982  T
Q  300 ggg 302  Q
    |||    
T  40047981 ggg 40047979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 301
Target Start/End: Original strand, 41751383 - 41751457
Alignment:
Q  227 gtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  41751383 gtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagg 41751457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 306
Target Start/End: Original strand, 54690581 - 54690659
Alignment:
Q  228 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  54690581 tataataaatagaggcatgcatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaaaggacaa 54690659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 295
Target Start/End: Original strand, 49543925 - 49544161
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| | |||||| |  ||||| ||||||||||||| | | ||||    || |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  49543925 ctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaatt 49544024  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||| |||||| |||  |||| |||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||   || || ||    
T  49544025 ttatcc-ttaagagagagagttaatttatgtttttaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaa 49544123  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
     ||||||||| | ||| |||||  ||| ||||||||||    
T  49544124 ttaattaatgcacttgaaaataacaaaggggtcttata 49544161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 305
Target Start/End: Original strand, 48136947 - 48137077
Alignment:
Q  172 agaatgttagtttatg-ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||     |||||||    
T  48136947 agaaagttagtttattcttttcaacatattatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaatagagctatgtaggtaaaaaaa----aaatgtag 48137042  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||  |||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  48137043 ttaaaaatataaaaaatgtcttataaaaagggaca 48137077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27067581 - 27067501
Alignment:
Q  156 ttttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaa 236  Q
    |||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27067581 ttttattctttaagagagagagtttgtttatgttttcaacatgctatttatggtagattgaataaaaaaatgtataataaa 27067501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 238
Target Start/End: Original strand, 51486230 - 51486286
Alignment:
Q  182 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51486230 tttatattttcaacatgatatttatcgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaata 51486286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Original strand, 1330913 - 1331000
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1330913 aaaaatatgtagagtaaataggggtaattgtgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagggacaa 1331000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 194
Target Start/End: Original strand, 16776557 - 16776628
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaa 194  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||   |||||| |||||||||||    
T  16776557 taaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttgtcctttaagagagggggttagtgtatgttttcaa 16776628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 170
Target Start/End: Original strand, 20084697 - 20084744
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20084697 taaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaaga 20084744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 43408197 - 43408266
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaa 126  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43408197 cctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaa 43408266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 272
Target Start/End: Original strand, 52656730 - 52656823
Alignment:
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    |||||||  ||||||||||  ||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  52656730 tagtttaatttttcaacattgtatatattttttattgaagaaaaatatgtaaaataaatgtgggtatatttgtaaagaaatgattaatgtagtt 52656823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 272
Target Start/End: Original strand, 52661642 - 52661735
Alignment:
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    |||||||  ||||||||||  ||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||| | | || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  52661642 tagtttaatttttcaacatagtatatattttttattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgagtatatttgtaaagaaatgattaatgtagtt 52661735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Original strand, 53589526 - 53589575
Alignment:
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53589526 ttagtttatgttttcaacgtattatttattgttaattgaagacaaagatg 53589575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Original strand, 54690389 - 54690435
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgta 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54690389 gtttatgttttcaacat--tatttattggtgattgaagaaaaagatgta 54690435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 299
Target Start/End: Original strand, 16869483 - 16869563
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | ||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  16869483 aaaaatatgtagagtaaataggggtaattttgtaaagaaataattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaa 16869563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 121
Target Start/End: Original strand, 33360890 - 33360954
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgta 121  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33360890 cctccgtccttaattataagacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgta 33360954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 216
Target Start/End: Original strand, 4073370 - 4073405
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4073370 gtttatgttttcaacatgttatttattattgattga 4073405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Original strand, 10284558 - 10284644
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10284558 aaaaatatgtagagtaaataggggtaattttgtaaagaaa-aattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagggacaa 10284644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31398006 - 31397955
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31398006 gtattaaatttctttataattactattgtttttacaattatatcctttaaga 31397955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 133
Target Start/End: Original strand, 9018089 - 9018123
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgttt 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9018089 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgttt 9018123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36824571 - 36824537
Alignment:
Q  202 tttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36824571 tttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaa 36824537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 140
Target Start/End: Original strand, 46557660 - 46557742
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaatta 140  Q
    |||||||||||  || ||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  46557660 ctccgtccctaattacaagattcttttggaaaaataacgggaattaaaataatggatatatgtattaaatatgtttgtaatta 46557742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 49543924 - 49543866
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatat 116  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49543924 ctccgtccctaattataggccccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatat 49543866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36732224 - 36732175
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaa 172  Q
    |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36732224 taaatttgtttgtaattcctattatttttacaattttattctttaagaaa 36732175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48921770 - 48921713
Alignment:
Q  249 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  48921770 tgtaaagaaataattaatacacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagagacaa 48921713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40048184 - 40048144
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 168  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40048184 ttgtttgaaattactattgtttttacaattatatcctttaa 40048144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 179)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 34883588 - 34883841
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34883588 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 34883687  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34883688 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 34883787  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  34883788 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 34883841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 13197385 - 13197682
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  13197385 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatctcgggaattaagatagtggatatttgtattaaacttgtttgtaatcactattgttttta 13197484  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13197485 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 13197584  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13197585 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggagggagta 13197682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32121241 - 32120944
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32121241 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 32121142  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121141 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 32121042  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32121041 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 32120944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 8716632 - 8716885
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8716632 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 8716731  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8716732 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 8716831  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8716832 aagaattaattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 8716885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 36130768 - 36131021
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36130768 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 36130867  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36130868 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 36130967  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  36130968 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaaggtcttataaaaagggacaa 36131021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25625026 - 25624776
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25625026 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 25624927  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25624926 caattttatcctttaagaaag---gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 25624830  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25624829 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 25624776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 53 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45474612 - 45474369
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  45474612 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 45474513  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45474512 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 45474413  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45474412 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataa 45474369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 15404448 - 15404700
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15404448 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 15404547  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15404548 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat-ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 15404646  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  15404647 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 15404700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 20727598 - 20727851
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20727598 actccctccgttcctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 20727697  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20727698 caattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 20727797  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  20727798 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 20727851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16669923 - 16669670
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16669923 actccctccgtcccaatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 16669824  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16669823 taattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatgggggtatgtatgta 16669724  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16669723 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 16669670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 34062405 - 34062658
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34062405 actccttccgtccctatatataagacctttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 34062504  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34062505 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 34062604  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  34062605 aagaaataactaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 34062658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37229737 - 37229484
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37229737 actctctccgtccctatatataagactcttttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 37229638  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37229637 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgta 37229538  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  37229537 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 37229484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 66 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8990488 - 8990248
Alignment:
Q  66 ctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  8990488 ctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctt 8990389  T
Q  166 taagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8990388 taagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaa 8990289  T
Q  266 tgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  8990288 tgtagttggaaataacaaaagggttttataaaaagggacaa 8990248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 55 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1943869 - 1943618
Alignment:
Q  55 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttaca 154  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1943869 tccctccgtccctatatataaaacccttttgtcaaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 1943770  T
Q  155 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1943769 attttatcctttaagaaagatggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 1943670  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  1943669 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagagacaa 1943618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41450807 - 41450560
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  41450807 tccgtccctttatataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattt 41450708  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41450707 tatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaa 41450608  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  41450607 taattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 41450560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Original strand, 36020990 - 36021235
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36020990 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 36021089  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36021090 caattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcgacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgta 36021188  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  36021189 aagaaataattaatatagttggaaataataaaggagtcttataaaaa 36021235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 74 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20252486 - 20252254
Alignment:
Q  74 aagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaag 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20252486 aagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaag 20252387  T
Q  174 aatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20252386 aaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattg 20252287  T
Q  274 gaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  20252286 gaaataacaaaggggtcttataaaaagtgacaa 20252254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4712023 - 4711771
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4712023 actccctccgtctctatatataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagatactggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 4711924  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4711923 caattttatc-tttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgta 4711825  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  4711824 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggccttataaaaagggacaa 4711771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40681024 - 40680771
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  40681024 actccctccgtccctatatataagacattttttccaaaatcacgggaattaagatggtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgatttta 40680925  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40680924 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgta 40680825  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  40680824 aagaaataattaatatagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 40680771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 12889954 - 12890245
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12889954 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 12890053  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890054 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 12890151  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12890152 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 12890245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 92 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5664896 - 5664682
Alignment:
Q  92 tcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5664896 tcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgtttt 5664797  T
Q  192 caacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtct 291  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  5664796 taacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtct 5664697  T
Q  292 tataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||    
T  5664696 tataaaaagggacaa 5664682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 42629662 - 42629416
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagaccctttt-gccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42629662 actccctccgtccctatatataagacccttttcgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 42629563  T
Q  152 acaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42629562 acaattttatcctttaag--------ttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatatataagggcatgtatgt 42629471  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  42629470 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 42629416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 59 - 350
Target Start/End: Original strand, 40788836 - 40789125
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40788836 tccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattt 40788935  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40788936 tatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 40789033  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40789034 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 40789125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 1143002 - 1143251
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1143002 cctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 1143101  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1143102 tttatcctttaagaaagatggttggtttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 1143201  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1143202 aataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggacaa 1143251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24345710 - 24345461
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  24345710 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgtttttacaat 24345611  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  | |   ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24345610 tttatcctttaagaaagagagctgacttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 24345511  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24345510 aataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaa 24345461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7492140 - 7491888
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7492140 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 7492041  T
Q  153 caattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7492040 caattttatccttaagagaaaga--gttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 7491943  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  7491942 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaa 7491888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 55 - 306
Target Start/End: Original strand, 16456615 - 16456865
Alignment:
Q  55 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttaca 154  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16456615 tccctccgtccctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 16456714  T
Q  155 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16456715 attttatcctt-aagacagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 16456813  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16456814 gaaataattaatgtagttggaaatgacaaaagggtcttataaaaagggacaa 16456865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 16108216 - 16108512
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16108216 actccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 16108315  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108316 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 16108414  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16108415 aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggagggagta 16108512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22897687 - 22897391
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22897687 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 22897588  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22897587 caatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 22897489  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22897488 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 22897391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2438521 - 2438269
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  2438521 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttta 2438422  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2438421 caattttatcctt-aagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 2438323  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  2438322 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 2438269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23789265 - 23789013
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23789265 actccctccgtccctaattataagactattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 23789166  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23789165 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 23789067  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23789066 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 23789013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 39833740 - 39833992
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39833740 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 39833839  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39833840 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 39833938  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  39833939 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 39833992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 22182669 - 22182916
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22182669 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 22182768  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22182769 tttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttagtgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 22182866  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  22182867 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 22182916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1360087 - 1359835
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1360087 actccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 1359988  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359987 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 1359889  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  1359888 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 1359835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 8841398 - 8841650
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8841398 actccctccgtccctaattataagactcttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 8841497  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8841498 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgta 8841596  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  8841597 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 8841650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 8912620 - 8912911
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8912620 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 8912719  T
Q  157 tttatcctttaagaaaga-atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8912720 tttatcctttaagagagagatgtt---ttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaag 8912816  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8912817 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 8912911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 11865031 - 11865326
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11865031 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 11865130  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11865131 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaag 11865230  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnc-caaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||         | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11865231 aaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 11865326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40607981 - 40607746
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40607981 tataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 40607882  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  | | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40607881 gagagaggtggtttatgttttaaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtag 40607782  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  40607781 ttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 40607746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 16805536 - 16805828
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16805536 cctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 16805635  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805636 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 16805734  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16805735 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 16805828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23465426 - 23465179
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23465426 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 23465327  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23465326 tttatcctttaagagagaat--tggttaatattttcaacatgatatttattgatgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 23465229  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  23465228 aataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaa 23465179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2200272 - 2200023
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2200272 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 2200173  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |    
T  2200172 tttatcatttaagagagagtgttggtttctgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtacagtaaatagggtcatgtatgtaaata 2200073  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  2200072 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaa 2200023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 16844818 - 16845066
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16844818 cctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 16844917  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16844918 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 16845016  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16845017 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 16845066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31751365 - 31751069
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31751365 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 31751266  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg---aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31751265 tttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgcatgtaa 31751166  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31751165 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttcacaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 31751069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 26322037 - 26322330
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| ||  |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26322037 cctccgtccttaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 26322136  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  | | | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26322137 tttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaaga 26322236  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26322237 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 26322330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12360751 - 12360500
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  12360751 actccttccgtccctatatataagacccttttgttaaaattaagggaattaagaaagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcattattgttttta 12360652  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12360651 caattttatcc-ttaagagacaaagttagtttctattttccatatattatttattgttgatttaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgta 12360554  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12360553 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaa 12360500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 62 - 353
Target Start/End: Original strand, 7116050 - 7116339
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  7116050 gtccctatatataagatccttttgctaaaatcacgggaaataagaaagtg-atatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttat 7116148  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    |||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7116149 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 7116247  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtagat 353  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7116248 ttaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaattttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtagat 7116339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38214749 - 38214524
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  38214749 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaaa-- 38214652  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38214651 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 38214552  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||    
T  38214551 agaaaagggatcttataaaaagggacaa 38214524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 15227891 - 15228186
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15227891 actccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 15227990  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||  ||| |||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15227991 caattttatccttcgagagagaat--tggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 15228088  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15228089 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 15228186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19034703 - 19034465
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||   ||||||||    
T  19034703 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactatt---tttacaat 19034607  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19034606 tttgtcctttaagagagagtgttgatttatcttttcaacatgttatttattgttgaatgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 19034507  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19034506 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 19034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 19318830 - 19319048
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||     
T  19318830 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttata 19318929  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |     
T  19318930 ttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatga 19319029  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19319030 gtcttataaaaagggacaa 19319048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 17408035 - 17408287
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17408035 actccatccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 17408134  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17408135 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatactacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgta 17408233  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  17408234 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 17408287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 271
Target Start/End: Original strand, 3670223 - 3670448
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtatt------------ 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||                
T  3670223 ctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtaatcactatt 3670322  T
Q  146 gtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670323 gtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 3670422  T
Q  246 gtatgtaaagaaataattaatgtagt 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  3670423 gtatgtaaagaattaattaatgtagt 3670448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25523778 - 25523545
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25523778 tataggacccttttggaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttaatcctttaaga 25523679  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25523678 gagg--gttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaattggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 25523581  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25523580 ttggaaatagtaaatgggtcttataaaaagagacaa 25523545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19353445 - 19353191
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  19353445 gggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagaatgagtgttgacttatgttttcaac 19353346  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||    
T  19353345 attctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagggatcttata 19353246  T
Q  296 aaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||          |||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  19353245 aaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagcgacggaggtagta 19353191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24974091 - 24973844
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24974091 tccgtccctaattacaagactcttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattt 24973992  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973991 tatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 24973892  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  24973891 taattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggacaa 24973844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7418787 - 7418537
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||  |||||  ||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7418787 cctcagtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 7418688  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7418687 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 7418588  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata-aaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  7418587 aataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttttataaaagggacaa 7418537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 351
Target Start/End: Original strand, 11851963 - 11852223
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  11851963 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatg 11852060  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11852061 ttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaataggggcatgcatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 11852160  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
     ||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11852161 atcttataaaaagggacaaaaaaattct-caaaaggatcttataattagggacggaggtagtag 11852223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15571478 - 15571230
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |    
T  15571478 cctccttccctatatataagacccttttgctaaaatcacggaaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttatagt 15571379  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  15571378 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggaacatgtatctaaaga 15571280  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15571279 aataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaa 15571230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34113822 - 34113575
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  34113822 actccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaatt----tagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 34113727  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34113726 caattttatcctttaagagataat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 34113629  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  34113628 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 34113575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 45628625 - 45628874
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45628625 cctccgtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 45628724  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||| ||||||| |||||  ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45628725 tttaccctttaaaaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 45628824  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  45628825 aataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaagggacaa 45628874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Original strand, 40680409 - 40680652
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680409 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 40680508  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40680509 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaaga 40680606  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40680607 aataattaatataattggaaatag-caaagggtcttataaaaaggga 40680652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2060609 - 2060361
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  2060609 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaat 2060510  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2060509 tttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagat-tataataaatatgggaatgtatgtaaaga 2060411  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||    
T  2060410 aataattaatgtagttggaaataacaaatgagtattataaaaagggacaa 2060361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 88 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7666540 - 7666323
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| |||||||||| || |||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||    
T  7666540 aaaataacggaaattaagataatgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagtgaaggttggtatatg 7666441  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  7666440 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgc 7666341  T
Q  288 gtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7666340 gtcttataaaaagggaca 7666323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27560502 - 27560250
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  27560502 actccctccgttcctaattataagaccattttgttaaaatcatgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatgtaatcactattgttttta 27560403  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27560402 caattttatcctt-aagaaagagagttaatttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggagcatgtatgta 27560304  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27560303 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 27560250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 29239334 - 29239586
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29239334 actccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgttataaagttgtttgtaatcactattgttttta 29239433  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
     |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29239434 gaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgta 29239532  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  29239533 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 29239586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 350
Target Start/End: Original strand, 10399220 - 10399499
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10399220 tataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttatttttacaattttatcctttaaga 10399319  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    ||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399320 aagagggttggcttatgttttcaacattctatttattactcattgaagaaaaagatgtatagtaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 10399419  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10399420 ttggaaatagaaaatgagtcttataaaacgggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggatggaggtagta 10399499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11201979 - 11201732
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11201979 actccctctgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgcgaattaaaaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 11201880  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11201879 caattttatcctt-aagagtgagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 11201781  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11201780 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagtgtcttataaaaagg 11201732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18375464 - 18375236
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  18375464 cccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatga 18375365  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18375364 gtgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgtaaa 18375265  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  18375264 tagcaaatgagtcttataaaaagggacaa 18375236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Original strand, 38121286 - 38121548
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  38121286 aaaataacggaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatg 38121385  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |     
T  38121386 ttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggtaatagaaaatga 38121485  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||          ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  38121486 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttattattagggacggaggtagta 38121548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 306
Target Start/End: Original strand, 9697905 - 9698134
Alignment:
Q  76 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  9697905 gacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaatcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagag 9698003  T
Q  176 tgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 275  Q
     |||||||||| ||||  | ||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698004 agttagtttatatttttcatatactacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 9698103  T
Q  276 aatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  9698104 aataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 9698134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 11385914 - 11386161
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11385914 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 11386013  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||  |||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  11386014 tttatcctttaagtgaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaaaatatataattaatagggacatatatgtaaaga 11386111  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  11386112 aataattaatgtagttggaaatagcaaattagtcttataaaaagggacaa 11386161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28840899 - 28840682
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  28840899 aaaataacgggaattaagat-gtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatg 28840801  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||    
T  28840800 ttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggg 28840701  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28840700 gtcttataaaaagggacaa 28840682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41004234 - 41003987
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  41004234 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgtttttataat 41004135  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  41004134 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatccatgtaaaga 41004037  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41004036 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 41003987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 1748386 - 1748635
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||     
T  1748386 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagattatggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattatttttacaaa 1748485  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1748486 tttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggtatgtatgtaaaga 1748585  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1748586 aataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggacaa 1748635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20643752 - 20643526
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaaga-at 176  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||||| | |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  20643752 cccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatcttttaagagagagat 20643653  T
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20643652 gtt---ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 20643556  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  20643555 ataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 20643526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 96 - 279
Target Start/End: Original strand, 41967987 - 41968170
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||    
T  41967987 gggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaac 41968086  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41968087 atgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaata 41968170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Original strand, 32712551 - 32712777
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      
T  32712551 cccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtagttagtattgattttacaattttatcctttaagagataaa- 32712649  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32712650 -tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 32712748  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  32712749 tagcaaaggagtcttataaaaagggacaa 32712777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7531898 - 7531650
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| || |||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  7531898 actccttctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 7531799  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7531798 caattttatcctttaagagaga--tttgttttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 7531701  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7531700 atgaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaaggga 7531650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5255795 - 5255578
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  5255795 aaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatg 5255696  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  |    
T  5255695 ttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa-taatgtagttgaaaatagaaaagag 5255597  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  5255596 gtcttataaaaaggaacaa 5255578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 239
Target Start/End: Original strand, 44436229 - 44436411
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  44436229 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttacaaa 44436328  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 239  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44436329 tttatcttttaagaaagagagttagtttatgttttcaagatactatatattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 44436411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17665811 - 17665571
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17665811 cgtccctaattatatgtcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaatttta 17665712  T
Q  161 tcctttaagaaaga-atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    || ||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17665711 tcttttaagagagagatgata---tatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgcatgtaaagaaat 17665615  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  17665614 aattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 17665571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 105 - 306
Target Start/End: Original strand, 18374495 - 18374695
Alignment:
Q  105 gatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttattt 204  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |||||    
T  18374495 gatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt-atcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattt 18374593  T
Q  205 attgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18374594 attgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggagtcttataaaaagggac 18374693  T
Q  305 aa 306  Q
    ||    
T  18374694 aa 18374695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1859819 - 1859592
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||       
T  1859819 cccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagaa 1859720  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859719 ttggtttatattttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaaaatgaataataaata-aggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaa 1859621  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  1859620 tagcaaatgagtcttataaaaagggacaa 1859592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 285
Target Start/End: Original strand, 15353208 - 15353431
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15353208 cctctgtccctatatataagacatttttgtcaaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 15353307  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| |    |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15353308 tttatcgtttaagaga----gttaatttattttttcaacatactatttattgttgattgaag-aaaagatatataataaataggggcatgtttgtaaaga 15353402  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15353403 aataattaatgtagttggaaatagcaaaa 15353431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 306
Target Start/End: Original strand, 15435667 - 15435869
Alignment:
Q  103 aagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttat 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  15435667 aagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattatatcatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgtttt 15435766  T
Q  203 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15435767 ttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggg 15435865  T
Q  303 acaa 306  Q
    ||||    
T  15435866 acaa 15435869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 339
Target Start/End: Original strand, 19630933 - 19631215
Alignment:
Q  57 cctccgtcccta--tatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttaca 154  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||    
T  19630933 cctccgtccctaattttataagacccttttactaaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttaca 19631032  T
Q  155 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19631033 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 19631131  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattaggga 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||          |||||||||||||||||||||||    
T  19631132 gaaataattaatgtagttggaaata-acaaggggtcttatataaagggataaaaaaaattctcaaaagaatcttataattaggga 19631215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 339
Target Start/End: Original strand, 19827834 - 19828116
Alignment:
Q  57 cctccgtcccta--tatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttaca 154  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||    
T  19827834 cctccgtccctaattttataagacccttttactaaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttaca 19827933  T
Q  155 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19827934 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 19828032  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattaggga 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||          |||||||||||||||||||||||    
T  19828033 gaaataattaatgtagttggaaata-acaaggggtcttatataaagggataaaaaaaattctcaaaagaatcttataattaggga 19828116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 34944163 - 34944405
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34944163 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaat 34944262  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34944263 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttc-----gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaaaga 34944355  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  34944356 aataattaatgtagttggaaacagcaaaatgttcttataaaaagggacaa 34944405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 269
Target Start/End: Original strand, 1422168 - 1422378
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1422168 cctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaat 1422267  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||| | |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1422268 tttatgc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaata-gggcatgcatgtaaaga 1422365  T
Q  257 aataattaatgta 269  Q
    |||||||||||||    
T  1422366 aataattaatgta 1422378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 71 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7933699 - 7933421
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7933699 tataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 7933600  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||    
T  7933599 gagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaacatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaacaataattaatacag 7933500  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||          ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7933499 ttggaaatag-cagatggtcttataaaaagagacaaaaaaaatttacaaaaaaatcttataattaaggacggaggtagta 7933421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8782698 - 8782510
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8782698 tgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 8782599  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  8782598 gaaaaagatgtataataaatatgttcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaatagtcttataaaaaggaacaa 8782510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43701246 - 43701021
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||            ||| ||||||||||||||||||||    
T  43701246 gtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaa------------ttactattgtttttacaattttat 43701159  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43701158 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataa 43701059  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43701058 ttaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 43701021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23083790 - 23083541
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23083790 cctccatccctatatataggaccctttttctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattagagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 23083691  T
Q  157 tttat---ccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    || ||   |||| | ||| |||  ||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23083690 ttaatattccttaagagagagagagttggtttatgttttccatatcttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgta 23083591  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23083590 aaaaaattattaatgtagttcgaaatagcaaatgggtcttataaaaaggg 23083541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 129 - 306
Target Start/End: Original strand, 44573702 - 44573876
Alignment:
Q  129 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44573702 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga--gatggatggtttatgtttt-aacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgt 44573798  T
Q  229 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  44573799 ataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaa 44573876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5070557 - 5070353
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||     
T  5070557 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttataattttattctttaagagagatggttggtttatgttttcaacat- 5070459  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  5070458 -tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatataggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgg-aataacaaaagggttttataaaa 5070361  T
Q  299 agggacaa 306  Q
    ||||||||    
T  5070360 agggacaa 5070353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 302
Target Start/End: Original strand, 13336532 - 13336744
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| |||||||    
T  13336532 aaaataacgggaattaatatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaagaga--gttggtttatg 13336629  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |     
T  13336630 tttttaacatgttatttattgttgattgaataaaatgatgtataataaataggggcatatatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagga 13336729  T
Q  288 gtcttataaaaaggg 302  Q
     ||||||||||||||    
T  13336730 atcttataaaaaggg 13336744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41834700 - 41834450
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41834700 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatactggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaat 41834601  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta---a 253  Q
    |||||||||||||| |||  | |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||   |    
T  41834600 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttctacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgattaataggggcatgcatgtatgta 41834503  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  41834502 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagagacaa 41834450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6007834 - 6007616
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    | |||||||    
T  6007834 aaaataacgggaattaagataatatatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttcaagagagagaaatggtttatg 6007735  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||      
T  6007734 ttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaaat 6007635  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||    
T  6007634 gttttataaaaagggacaa 6007616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 306
Target Start/End: Original strand, 3060405 - 3060614
Alignment:
Q  97 ggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||   ||||||||||||||    
T  3060405 ggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaaca 3060504  T
Q  197 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    |  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||   ||||||||    
T  3060505 ttctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaacagaaaaaaaatcttataa 3060604  T
Q  297 aaagggacaa 306  Q
    ||||||||||    
T  3060605 aaagggacaa 3060614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45152034 - 45151792
Alignment:
Q  66 ctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagta----ttgtttttacaattttat 161  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    || |||||||||||||||    
T  45152034 ctatatataggatccttttgctaaaatcacatgaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactatagtttttttttacaattttat 45151935  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  45151934 cc-ttaagagaga--gttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaagatatataataaataagggcatgtatgtaaaaatata 45151838  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  45151837 attaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaa 45151792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 306
Target Start/End: Original strand, 29830511 - 29830749
Alignment:
Q  68 atatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29830511 atatataagacccttttgtcaaaatcacgaaaagtaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcattta 29830610  T
Q  168 -agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 266  Q
     ||| |||  ||||||||||||||||||  || |||||  || | || ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  29830611 gagagagatagttagtttatgttttcaatttgctatttgatgcttatcgaagaaaaagatgtatagtaaataggggtatgtgtgtaaagaaataattaat 29830710  T
Q  267 gtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  29830711 gtagttggaaatag-caatgagtcttataaaaagggacaa 29830749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 267
Target Start/End: Original strand, 30779745 - 30779955
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||     
T  30779745 cctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaa 30779844  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| || |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30779845 tttatctttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 30779944  T
Q  257 aataattaatg 267  Q
    |||||||||||    
T  30779945 aataattaatg 30779955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 15917855 - 15918072
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||  |||  |||| |    
T  15917855 aaaataacgggaattaagatagtgaatattagtattaaatatgtttgtaattactattatttt-acagttttaccctttaagagagagagttgatttacg 15917953  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  15917954 ttttgaacatgttatttattactgattgaagaaaaaaatgtataataaataaggacaagtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatga 15918053  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15918054 gtcttataaaaagggacaa 15918072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 299
Target Start/End: Original strand, 16808973 - 16809201
Alignment:
Q  69 tatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 168  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16808973 tatataagactcttttaccaaaatcgtgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaa 16809072  T
Q  169 gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 268  Q
     | |||  |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  16809073 -agagagagttagtttatattttcaaaatgtaatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatat 16809170  T
Q  269 agttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  16809171 agttgaaaataggaaaatgatcttataaaaa 16809201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 299
Target Start/End: Original strand, 16848254 - 16848482
Alignment:
Q  69 tatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 168  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16848254 tatataagactcttttaccaaaatcgtgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaa 16848353  T
Q  169 gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 268  Q
     | |||  |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  16848354 -agagagagttagtttatattttcaaaatgtaatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatat 16848451  T
Q  269 agttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  16848452 agttgaaaataggaaaatgatcttataaaaa 16848482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30466396 - 30466153
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||    
T  30466396 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagt 30466297  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt---------------------ataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                     |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30466296 tggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgttgtacccaaaaaaaaaaatgaataataaataagggcatgtatgaaaagaa 30466197  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30466196 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 30466153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 40173147 - 40173390
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||   |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40173147 cctccgtcccttattatatgatccttttgaaaaaataacgggaattaagatcgtgaatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 40173246  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||       |||||||    
T  40173247 tttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataagtagggg------ggtaaaga 40173340  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||    
T  40173341 aataattattgtagttggaaataacaaatgagtcttataattagggacaa 40173390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 304
Target Start/End: Original strand, 9040874 - 9041097
Alignment:
Q  80 cttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgtt 179  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||  | ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||    
T  9040874 cttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtagatacttatattaaagttaattgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagatatagtt 9040972  T
Q  180 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||    
T  9040973 agtttatgtttttcatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaatcattaatatagttgaaaata 9041072  T
Q  280 gtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
      ||| | |||||||||||| ||||    
T  9041073 acaaacgagtcttataaaaaaggac 9041097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12620102 - 12619851
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |||  |||||  ||||| | || |||||||||||||  ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  12620102 cctccgtccctaattatatgacatttttgaaaaaataatggtaattaagatagtgactatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttcacaat 12620003  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgtta--gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||| |||||||||| |||  |  |  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||| ||||    
T  12620002 tttgtcctttaagagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaatatatataataaatatgagcatttatataaa 12619903  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  12619902 gaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagttttataaaaagggacaa 12619851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 13215646 - 13215808
Alignment:
Q  139 tagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13215646 tagtattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaata 13215744  T
Q  239 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
     ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13215745 agggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaagggtcttataaaaaggg 13215808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8295601 - 8295321
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |||  |||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8295601 cctccgtccctaattataggacgtttttgaaaaaataacgggaattatgatagtggatatttgtatgaaatatgtatgtaattactattgtttttacaat 8295502  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||             ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8295501 tttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaaca-------------tgatcaaagaaaaatatgtataataaatatgggtatgtatgtaaaga 8295415  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||          |||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  8295414 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaagagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacgaaggtagta 8295321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 31633592 - 31633840
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||| ||| | |     ||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||    
T  31633592 cctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtacataattactattgtttttacaat 31633691  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||| ||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |    
T  31633692 tttgtcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaata 31633790  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31633791 aataattaatgtacttggaaatacaaaaggggtcttataaaaagggacaa 31633840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 284
Target Start/End: Original strand, 7461239 - 7461457
Alignment:
Q  66 ctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggat---atctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 162  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| | | |||   || ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  7461239 ctatatataagactcttttatcaaaatcatgggaattaagaaaattgatggtatttgtattaaagttgtttgaaatcactatcgtttttacaattttatc 7461338  T
Q  163 ctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 262  Q
     |||| || |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  7461339 tttta-gagaga--gttaatttatgttttcaatatactatttattgttgattgaagaaaaatatatataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataat 7461435  T
Q  263 taatgtagttggaaatagtaaa 284  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  7461436 taatgtagttggatatattaaa 7461457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Original strand, 10757816 - 10757971
Alignment:
Q  152 acaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 250  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  10757816 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagagcatgtatg 10757915  T
Q  251 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  10757916 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 10757971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 279
Target Start/End: Original strand, 18223656 - 18223867
Alignment:
Q  69 tatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 168  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||   |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18223656 tatacaagaccctttcgtcaatatcacaataattaagaaagttaatatttgtattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatcatttaa 18223755  T
Q  169 gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 267  Q
    || ||   ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||     
T  18223756 gagagttagttagtttatgttttcaaagtgatatttattgttgattgaaagaaaaagatgtataataaaaatgggtatataagtaaataaataattaata 18223855  T
Q  268 tagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||    
T  18223856 tagttggaaata 18223867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32511293 - 32511063
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  32511293 cctccgtctctatatataagactcttttgttaaaataacggaaattaagaaagtgaaaatttgtattaaaattgtttgtaattactgttgtttttacgat 32511194  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||                   |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  32511193 tttatcctt-------------------atgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatacgaacatgtatgtaaaga 32511113  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  32511112 aataattaatgtagttgaaaatagcaaataggtcttataaaaagggacaa 32511063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 299
Target Start/End: Original strand, 8030794 - 8030992
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||| ||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||    
T  8030794 aaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattgaatatgtttgtaatttctattatttttacaattttatcgtttaagagaga--gttggtttatg 8030891  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |           ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  8030892 t-----------tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtg 8030980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30858230 - 30857982
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  30858230 cctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 30858131  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  30858130 tttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 30858032  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  30858031 aataattaatgtacatggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaa 30857982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9701362 - 9701114
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  9701362 cctccgttcctaaatataagagccttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 9701263  T
Q  157 tttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||| | ||| |||||  || ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| ||| ||||  ||||||    
T  9701262 tttatccttaagagatagaat--taatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaattgcaaaataaataagggtatgttggtaaag 9701165  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9701164 aaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaa 9701114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12873175 - 12873033
Alignment:
Q  164 tttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 263  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  12873175 tttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagacgtataatagatagtgatatgtatgtaaagaaataatt 12873076  T
Q  264 aatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||    
T  12873075 aatgtagttggaaataacaagggggtcttataaaaaaggacaa 12873033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6028634 - 6028386
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| |||    |||||||| |||| | ||| || ||||||||||| |||    
T  6028634 cctccgtccctaaatataagagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgattatagtattaaatttgtatataactactattgtttttataat 6028535  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||  ||||||     
T  6028534 tttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaagg 6028436  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| | |||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  6028435 aatattaaatgtacttggaaataccaaataggtcttataaaaagggacaa 6028386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 36750629 - 36750877
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| ||||| |    |||||||| |||| |  |||||  ||| ||||||||||    
T  36750629 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagtgggttgtagtattaaatttgtataaaattacaattttttttacaat 36750728  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||  |||||||    
T  36750729 tttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataattaagggtatgttggtaaaga 36750827  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  36750828 aataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaa 36750877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 18970474 - 18970722
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  18970474 cctccgtccctaaatatatgagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 18970573  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| ||| | ||  |||||||    
T  18970574 tttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaaaatgcaaaataaataagggtaggttggtaaaga 18970672  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||| |||||||||||    
T  18970673 aataattaatgtacttggaaatatcaaagggatcttatgaaaagggacaa 18970722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 350
Target Start/End: Original strand, 34431947 - 34432237
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||  ||||||| ||| |||    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  34431947 ctccgtctctaaatataagagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatt 34432046  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||| |||| ||   || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||  || |  ||||||||    
T  34432047 ttatcctt-aagagagggagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataaggatatattggtaaagaa 34432144  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||           |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34432145 ataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttaaaaagggtcttataattagggatggaggtagta 34432237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28566381 - 28566151
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28566381 gtattaaatttgtatataattagtattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcagcataatatttattgttgattgaag 28566283  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||||||  | |||||||| | | ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||| ||||          ||    
T  28566282 aaaaagattcaaaataaataagagtatgttagtaaataaataattaatgtatttgaaaataccaaatgagtcttataaaaaggaacaattttttttctca 28566183  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28566182 aaagggtcttataattagggacggaggtagta 28566151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 2788145 - 2788330
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |    
T  2788145 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgagg 2788243  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  2788244 aaaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggcaaagaaataagtaatgtacttggaaataccaaagtggtcttataaaaagggacaa 2788330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 350
Target Start/End: Original strand, 26334717 - 26334882
Alignment:
Q  186 tgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaa 285  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||     
T  26334717 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaacgaagttagaaataaaaaag 26334816  T
Q  286 gggtctt-ataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26334817 gggtcttaataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 26334882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7447034 - 7446945
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7447034 gtttatgttttcaacatattatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataagtaatgtag 7446945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3095530 - 3095298
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattga 216  Q
    ||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  3095530 tgtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagaaaga--gttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattga 3095433  T
Q  217 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnc 316  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||  ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||  |||  ||||||||||||||||||||              
T  3095432 agaaaaagatgcaaaataattaaggatatgttggtaaagaaataattaatttacttagaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattatttttt 3095333  T
Q  317 caaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3095332 caaaagggtcttataattagggacggaggtagtag 3095298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29831002 - 29830846
Alignment:
Q  113 atatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 212  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29831002 atatttgtattaaatttgtttgtaattattatt--ttttacaattttatcatttaagagaaagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgttga 29830905  T
Q  213 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
      | ||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29830904 cggtagaaaaa-atgtataataaataaaggtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagtt 29830846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 350
Target Start/End: Original strand, 41494445 - 41494659
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  41494445 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 41494543  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataatt 334  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||    
T  41494544 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatt 41494643  T
Q  335 agggatggaggtagta 350  Q
    ||||| ||||||||||    
T  41494644 agggacggaggtagta 41494659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8867859 - 8867712
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8867859 tataatacccttttgacaaaatcacgggaat-aagaaagttgatatttctattaaatttgtttgtaattactattatttttacgattttatcctttaaga 8867761  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
     |||     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8867760 gaga----gagtttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaa 8867712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Original strand, 22302572 - 22302774
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca- 196  Q
    ||||||||| ||| ||||   |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  | |     
T  22302572 gaattaagaaagttgataagagtattaaatttgtttgtaattattattatttttacaattttatcctttaagatag--tgttagtttatgtttttgatat 22302669  T
Q  197 --tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttat 294  Q
      | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||| |||||  | |||| ||||||    
T  22302670 attattatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataatttatgaatttgaaaatatcacaaggatcttat 22302769  T
Q  295 aaaaa 299  Q
    |||||    
T  22302770 aaaaa 22302774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43700833 - 43700663
Alignment:
Q  137 attagtattgtttttacaattttatccttta-agaaaga-atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43700833 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagaggttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaata 43700734  T
Q  235 aataggggcatgtatgt-aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    |||| ||| ||||  || ||| ||| |||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  43700733 aataagggtatgttggtaaaaaaaaaaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 43700663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41422725 - 41422512
Alignment:
Q  136 aattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  41422725 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaat-tta-tttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 41422628  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataatt 334  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||    
T  41422627 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatt 41422528  T
Q  335 agggatggaggtagta 350  Q
    ||||| ||||||||||    
T  41422527 agggacggaggtagta 41422512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 30830150 - 30830335
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  30830150 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 30830248  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||   |||||||||||||||||||    
T  30830249 aaaaa-atgcagaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggacaa 30830335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 266
Target Start/End: Original strand, 40348217 - 40348356
Alignment:
Q  124 aaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40348217 aaagttgattgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagaaagaat--tagtttatgtttttcatatgttatttattattgattgaaaaaaaa 40348313  T
Q  224 gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 266  Q
    |||||||||||||||   | |||||| |||||||| |||||||    
T  40348314 gatgtataataaataaatgaatgtatataaagaaaaaattaat 40348356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44018030 - 44017791
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |  |||  |||| |||||||||    
T  44018030 gtccctaaatataagacctttttgacaaaatcacaggaataaagaaagttgatatttgtatcaaagttatttgtaatcaaaattactttt-caattttat 44017932  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagttta---tgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||| ||| |||  |  ||       ||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  44017931 cctttgagagagagagagagagagagctgttttcaagatgctatttattactaattgaagaagaatatgtataataaataggggtatgtaagtaaataaa 44017832  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44017831 taattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 44017791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11121211 - 11121034
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||  ||| || ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||    
T  11121211 taaatttgtttgtaattactactgtttttacaattttatcatttaagagggagagttggtgtatgttttcaacataacatttaatgttgattgaataaaa 11121112  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta-gttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||| |||||||| | | ||||  |||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11121111 agatgtaaaataaataagtgtatgttggtaaagaattaactaatgtattttggaaatactaaaatggtcttataaaaa 11121034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40544555 - 40544368
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg--aa 217  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||    
T  40544555 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaaa-agagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcggaaa 40544457  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||| | |||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  40544456 aaaaaagatgcaaaataaataagggtatgccggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgagtcttataaaaagggacaa 40544368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 306
Target Start/End: Original strand, 6650975 - 6651149
Alignment:
Q  132 ttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtata 231  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| || || | |||   ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6650975 ttgtaatttttattgtttttacaattttatcattcaaaagagagaattagagtatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaggaaaaaaatgtata 6651074  T
Q  232 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||  |  |||||||||||| ||||    
T  6651075 ataaatagagatatatacgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagagaccttataaaaaggaacaa 6651149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Original strand, 12296238 - 12296422
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg--ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaa 220  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| ||  |||| || |||||||||| ||    
T  12296238 taaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttaccctttaagagagagagagttagtatatgttttcaatatagtattaat-gttgattgaaaaa 12296336  T
Q  221 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||   ||||||||||||| |||||    
T  12296337 aaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttggaaatatcaaagatgtcttataaaaagagacaa 12296422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 297
Target Start/End: Original strand, 26273366 - 26273540
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26273366 taaagttgtttgtaattgctattgttattacaattttatcctttaagagagatgattagtgtatgtttctaacatcatatttaatgttgattgaagaaaa 26273465  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    | || || ||||||||| |   |||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  26273466 aaatataaaataaatagagatgtgttagtaaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaa 26273540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 298
Target Start/End: Original strand, 11083496 - 11083671
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||| |||||| |||  |||||| || |||||||||||||    
T  11083496 taaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttaatgtatattttcagcatagtatttaatgctgattgaagaaaa 11083595  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    |||| || |||||| || ||  ||   |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11083596 agatataaaataaacagtggtgtgctggtaaagaattaattaatgtacttgaaaatattaaagaggtcttataaaa 11083671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 303
Target Start/End: Original strand, 11944445 - 11944628
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||  || || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11944445 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatctttaagagaaagaat--taattcatgttttcaacataatatttatcgttgattgaa 11944542  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||| ||||||||  |  ||||  ||||||||||||| ||| || || ||||||  ||| || |||||||||| ||||    
T  11944543 gaaaaagatgtaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataataaatatacttagaaataccaaagggatcttataaaatggga 11944628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 349 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8440926 - 8440870
Alignment:
Q  349 tagatgactgtctgaaaattgatatatggcagtgtagatatgagacaagatgtatat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8440926 tagatgactgtctgaaaattgatatatggcagtgtagatatgagacaagatgtatat 8440870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21838846 - 21838698
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   | | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  21838846 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 21838748  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  21838747 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttgataaagaaataattaatgta 21838698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44417631 - 44417444
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtatt---gtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattga 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| || | |  ||||   ||||||||||||||  |||||| |||||| |||    
T  44417631 tattaaatttgtttgtaattactattattgtttttacaattttatcccttatgagaaagagttacactatgttttcaacatagtatttactgttgactga 44417532  T
Q  217 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  |||  | |||||| ||||||||||    
T  44417531 agaaaaagatata-aataaataggaatatgttggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataccaaagagatcttatgaaaagggaca 44417444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Original strand, 16636408 - 16636480
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636408 gaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 16636480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12969738 - 12969555
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||  ||| || ||| |||||||     |||||| || |||||||||||||    
T  12969738 taaatttgtgtgtaattactattgtttttataaatttgtcctttaagagagagagttggtgtatattttcaatgcagtatttaatgctgattgaagaaaa 12969639  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | || || |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  12969638 aaatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatatatttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagagacaa 12969555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15079422 - 15079298
Alignment:
Q  178 ttagtttatgttttcaacatg---ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgg 274  Q
    ||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  15079422 ttagtttttgttttcaacatagtattatttattgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataaataggggtatatttgtaaagaaaaaataaatgtagttgg 15079324  T
Q  275 aaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    ||||   ||| | |||||||||||||    
T  15079323 aaatgtcaaatgagtcttataaaaag 15079298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 7457302 - 7457396
Alignment:
Q  191 tcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaa 285  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7457302 tcaatatgctatttattgttgaatgaagaaaaatacgtataataaatatgaacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggatatagcaaaa 7457396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 306
Target Start/End: Original strand, 24300282 - 24300344
Alignment:
Q  244 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  24300282 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 24300344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3904677 - 3904524
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||  |||  ||||| |||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  3904677 gtattaaatttgtttgcaattactattgtttttataattatatcatttaagagagagagttgatttatatttttaacaaagtatttattgctgattgaag 3904578  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||  || ||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3904577 aaaaatatgtaaaataaataatggtatgtcagtacataaataattaatgtagtt 3904524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Original strand, 4408584 - 4408744
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4408584 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagaattaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 4408682  T
Q  219 -aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
     ||||| ||| | ||||||||   | ||||   |||||||||||||||| || |||||||||    
T  4408683 aaaaaatatgcaaaataaataaaagtatgttgataaagaaataattaatctacttggaaata 4408744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18294220 - 18294065
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||  |||||||||| || |   |||||||||||||||||||    
T  18294220 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagaaaga--gttgatttatgtttttaataa--tatttattgttgattgaag 18294125  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    ||||||||| | ||||||||  || || |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18294124 aaaaagatgcaaaataaataaaggtatattcgtaaagaaataattaatgtaattggaaat 18294065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 306
Target Start/End: Original strand, 44436749 - 44436814
Alignment:
Q  241 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  44436749 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaa 44436814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 279
Target Start/End: Original strand, 14493630 - 14493779
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||  ||  |||||| ||| ||||||| ||  |||||| | |||||||||||||| | |     
T  14493630 ttgtttgtaattactattgttttcataattttatcttttaagaggga--gttagtgtatattttcaatataatatttaattttgattgaagaaaaggtta 14493727  T
Q  228 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  14493728 taaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtatttgaaaata 14493779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Original strand, 4897630 - 4897736
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||||||    
T  4897630 tatttaatcttgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaa 4897729  T
Q  300 gggacaa 306  Q
    | |||||    
T  4897730 gagacaa 4897736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Original strand, 4945024 - 4945130
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||||||    
T  4945024 tatttaatcttgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaa 4945123  T
Q  300 gggacaa 306  Q
    | |||||    
T  4945124 gagacaa 4945130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12873719 - 12873559
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||     ||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  12873719 taattactattgtttttacaaatttatcctt-----aagagagttagtttatgtttttaacataatatttattattgattgaagaaaaagatgcaaaata 12873625  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    |||| ||  || |   |||||||||||| |||||| ||| ||||   |||  ||||||||||||||    
T  12873624 aataaggttatattgataaagaaataataaatgtaattgaaaatttcaaagaggtcttataaaaag 12873559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 301
Target Start/End: Original strand, 27725513 - 27725681
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatt---tattgttgattgaagaaaaagatgtata 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | || ||||| ||||||||||  || |   ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27725513 taattattattgtttttacaatttcatc-tttaagaaagagagatactttatattttcaacatcataatacttattgttgattgaggaaaaagatgtaaa 27725611  T
Q  232 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    ||||||| ||| |  |   ||||||||||||||||||| ||  |||||  |||  |||||||||||||||    
T  27725612 ataaataagggtagattgataaagaaataattaatgtacttaaaaatatcaaagaggtcttataaaaagg 27725681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Original strand, 26334629 - 26334722
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttt 150  Q
    ||||||| ||||  |||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  26334629 cctccgtacctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 26334722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40544746 - 40544651
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || | |||  | || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40544746 tattgtttttccaattttatcctt-aatagagatggctaatttatcttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgaaaaataaata 40544651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13598737 - 13598588
Alignment:
Q  129 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 228  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| | |  |||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||      
T  13598737 tgttggtaattactattggttttacaattttattctt-aagagatagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatatcc 13598639  T
Q  229 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    | |||||||||||| |||   || || || ||||||||| | |||||||||    
T  13598638 aaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaata 13598588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 305
Target Start/End: Original strand, 36556204 - 36556392
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc-ctttaagaaa--gaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattga 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |  ||  |||  ||||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  36556204 tattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatctttttaagagagggagagttgatttatattgtcaacataatatttattgttgattga 36556303  T
Q  217 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||| | | ||||| ||||||||  || | ||  ||||| | ||||||||| |||||| |||||  ||| | | |||||||||| |||||    
T  36556304 agacagatatgtaaaataaataaaggtaagttagtaaatatataattaatatagttgaaaataacaaacgagccttataaaaaaggaca 36556392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8056175 - 8056070
Alignment:
Q  131 tttgtaattagtattgttttt-acaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgta 229  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  8056175 tttgtaattgttattgtttttcacaattttatcttttaagagagg--gttagtgtatattttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaagatata 8056078  T
Q  230 taataaat 237  Q
     |||||||    
T  8056077 aaataaat 8056070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Original strand, 16807067 - 16807119
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807067 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaaga 16807119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Original strand, 16846348 - 16846400
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16846348 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaaga 16846400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25888483 - 25888355
Alignment:
Q  144 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||   || || ||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| | |     
T  25888483 ttgtttttataattatatcctttaagagcgagacttggtatatatttccaacatagtatttatttttgattgaagaaaaatgtgtaaaataaataagtgt 25888384  T
Q  244 atgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25888383 atgttggtaaaaaaataattaatgtagtt 25888355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 280
Target Start/End: Original strand, 16636493 - 16636529
Alignment:
Q  244 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16636493 atgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatag 16636529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 272
Target Start/End: Original strand, 34722214 - 34722282
Alignment:
Q  204 tattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 272  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  34722214 tattgttaattgaagatgaagatgtaaaataaatagggatatgttggtaaagaaataataaatgtagtt 34722282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 123
Target Start/End: Original strand, 15435589 - 15435655
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtatt 123  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15435589 cctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtatt 15435655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 32979157 - 32979195
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32979157 tatttattgttggttgaagaaaaagatgtaaaataaata 32979195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 191
Target Start/End: Original strand, 4897464 - 4897530
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttt 191  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  4897464 taaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagaga--gttagtgtatgtttt 4897530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 191
Target Start/End: Original strand, 4944858 - 4944924
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttt 191  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  4944858 taaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagaga--gttagtgtatgtttt 4944924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7016182 - 7016126
Alignment:
Q  249 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  7016182 tgtaaagaaataattaatatacttgaaaatattaaaatgatcttataaaaagagaca 7016126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15079671 - 15079608
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagttt 184  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  15079671 tattaaatttgtttgttattactattgcgtttacaattttat-ctttaagaaagaaaattagttt 15079608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23389947 - 23389907
Alignment:
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 239  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23389947 ttatttattgtttattgatgaaaaagatgtaaaataaatag 23389907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0649 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0649
Description:

Target: scaffold0649; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 4038 - 4291
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4038 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 4137  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4138 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtc 4237  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  4238 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 4291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 233)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36392151 - 36391898
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36392151 actccctccgtccctatatataagacacttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 36392052  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36392051 caattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 36391952  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36391951 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 36391898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 53276926 - 53277179
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  53276926 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 53277025  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53277026 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 53277125  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  53277126 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 53277179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 54676845 - 54676591
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54676845 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgttttta 54676746  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54676745 caattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 54676646  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaa-gggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  54676645 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaagggacaa 54676591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 20391178 - 20391431
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20391178 actccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 20391277  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391278 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 20391377  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  20391378 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 20391431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 32032731 - 32032984
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32032731 actccatccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 32032830  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32032831 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 32032930  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32032931 aagaaataattaatgtagctggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 32032984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 35675664 - 35675913
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35675664 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 35675763  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35675764 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 35675863  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  35675864 aataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 35675913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6753822 - 6753525
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6753822 actccctccgtccctgtatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 6753723  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6753722 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 6753623  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6753622 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 6753525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 9327980 - 9328233
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9327980 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 9328079  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9328080 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 9328179  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  9328180 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 9328233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 34272959 - 34273212
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34272959 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaactaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 34273058  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34273059 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgta 34273158  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  34273159 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 34273212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 43387733 - 43387986
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43387733 actccctccgtccctatatataagacccttttatcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 43387832  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43387833 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 43387932  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  43387933 aagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggacaa 43387986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47807157 - 47806904
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  47807157 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttta 47807058  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47807057 caattttatcctttaagaaagaagattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 47806958  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  47806957 aataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 47806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 51536464 - 51536211
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  51536464 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 51536365  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51536364 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 51536265  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  51536264 aaaaaataattaatgtagttgaaaataataaagaggtcttataaaaagggacaa 51536211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30771813 - 30771575
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30771813 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 30771714  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30771713 tatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 30771614  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  30771613 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 30771575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1028815 - 1028562
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||| ||||||    
T  1028815 actccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatttatttgtaatcactattattttta 1028716  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028715 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 1028616  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1028615 aagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaa 1028562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 5375298 - 5375550
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5375298 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 5375397  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5375398 caattttatccgttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca-gtatgta 5375496  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  5375497 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10588371 - 10588118
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10588371 actccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 10588272  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10588271 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 10588172  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  10588171 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 10588118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33413815 - 33413562
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33413815 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 33413716  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33413715 caattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 33413616  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||    
T  33413615 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaaggacaa 33413562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37352840 - 37352587
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37352840 actccatccgtccttatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 37352741  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352740 caattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 37352641  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  37352640 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaagggacaa 37352587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 45742546 - 45742799
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45742546 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgttttta 45742645  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45742646 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgta 45742745  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45742746 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 45742799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 50424598 - 50424847
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50424598 cctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatgtgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 50424697  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50424698 tttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 50424797  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  50424798 aataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaa 50424847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 20285761 - 20286058
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20285761 actccctccgtccctaattataaagcccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgttttta 20285860  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20285861 caattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 20285960  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20285961 aagaaataattaatgtagttggaaataacaagagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaaggatcttataattagggacggaggaagta 20286058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24754375 - 24754078
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  24754375 actccctccgtccttatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttatta 24754276  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24754275 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 24754176  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24754175 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 24754078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44295086 - 44294833
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44295086 actcccttcgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 44294987  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44294986 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 44294887  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  44294886 aagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggacaa 44294833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 47228468 - 47228721
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47228468 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 47228567  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47228568 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 47228667  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||    
T  47228668 aagaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaatggacaa 47228721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 47298978 - 47299231
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47298978 actcccttcgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtaaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 47299077  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47299078 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 47299177  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  47299178 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 47299231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 60 - 306
Target Start/End: Original strand, 49228465 - 49228711
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  49228465 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttt 49228564  T
Q  160 atcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49228565 atcctttaagaaataaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaat 49228664  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  49228665 aattaatgtagtttgaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 49228711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15241776 - 15241523
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15241776 actccctccgttcctatatataagaccattttgtcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 15241677  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241676 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 15241577  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  15241576 aagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 15241523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52978279 - 52978026
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  52978279 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattattttta 52978180  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52978179 caattttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaggatgtataataaataggggtatgtatgta 52978080  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  52978079 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 52978026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 53 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 50534180 - 50533932
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  50534180 actccctccatccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttta 50534081  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50534080 caattttatcctttaagaaagaagtttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgta 50533981  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  50533980 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 50533932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Original strand, 422669 - 422918
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  422669 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 422768  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  422769 caattttatcctttaagaaa-aatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgta 422867  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  422868 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 422918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29427786 - 29427540
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29427786 actctctccgtccctatatatatgacccttttgttaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 29427687  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29427686 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgta 29427587  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  29427586 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 29427540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 17609762 - 17610014
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  17609762 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgcttgtaatcactattgttttta 17609861  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17609862 caattttattctttaagaaa-aatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 17609960  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  17609961 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 17610014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4455359 - 4455108
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  4455359 actccatccgttcctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgttttta 4455260  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4455259 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 4455160  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  4455159 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 4455108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37364814 - 37364588
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37364814 actccatccgtccttatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 37364715  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37364714 caattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 37364615  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  37364614 aagaaataattaatgtagttggaaata 37364588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Original strand, 30745546 - 30745792
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  30745546 tccgtccctatatataagaccctcttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcatt-ttgtttttacaattt 30745644  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30745645 tatcctttaagaaataatgttagtttatgttttcaacctgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaa 30745744  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  30745745 taattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 30745792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8344202 - 8343951
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8344202 actccctccgtccttatatataagacccttttgtcaaaattacggtaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 8344103  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  8344102 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggca--tatgta 8344005  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  8344004 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagttttataaaaagggacaa 8343951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 98 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37357694 - 37357486
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37357694 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 37357595  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  37357594 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaa 37357495  T
Q  298 aagggacaa 306  Q
    |||||||||    
T  37357494 aagggacaa 37357486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4036121 - 4035869
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4036121 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 4036022  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036021 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 4035923  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  4035922 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 4035869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4416257 - 4415965
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  4416257 cctccgtccctatatataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtattattgtttttacagt 4416158  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4416157 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 4416059  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4416058 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaacattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 4415965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 350
Target Start/End: Original strand, 13620601 - 13620891
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13620601 ctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 13620700  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13620701 ttatcctttaagagaga--gttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaa 13620798  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13620799 ataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 13620891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 5743400 - 5743652
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  5743400 actccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtctgtaatcactattgttttta 5743499  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5743500 caattttatcctt-aagaaagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 5743598  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  5743599 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 5743652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 55562870 - 55563119
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  55562870 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 55562969  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55562970 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaa 55563069  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  55563070 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaa 55563119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 625713 - 625960
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  625713 cctccgtccctaattataggatctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 625812  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  625813 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 625910  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  625911 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 625960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 2615684 - 2615938
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2615684 actccctccgtccctaattataaggcccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 2615783  T
Q  153 caattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2615784 caattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 2615883  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  2615884 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaagggacaa 2615938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31937369 - 31937076
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31937369 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 31937270  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31937269 tttatcatttaagaaagagtgttagattatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaaga 31937170  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31937169 aataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 31937076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 53630088 - 53629792
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  53630088 actccctccgtccctaaatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 53629989  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53629988 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 53629890  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||          ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  53629889 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggatggagggagta 53629792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 29014065 - 29014317
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29014065 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 29014164  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29014165 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 29014263  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  29014264 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaa 29014317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 59 - 351
Target Start/End: Original strand, 29519911 - 29520202
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29519911 tccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggataaa-gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 29520009  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29520010 tatcctttaagaaagaaagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 29520109  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29520110 taattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtag 29520202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38027425 - 38027176
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  38027425 cctccatccctaattatatgacccttttggaaaaataactggaattaagatagtggatatttatattaaatatttttgtaattactattgtttttacaat 38027326  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38027325 tttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 38027226  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  38027225 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaa 38027176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 55632000 - 55632252
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  55632000 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 55632099  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55632100 caattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 55632198  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  55632199 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 55632252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 71 - 350
Target Start/End: Original strand, 30049842 - 30050121
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049842 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 30049941  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30049942 gagagagttgctttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtag 30050041  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30050042 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggaccaaattttttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 30050121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50352296 - 50352108
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50352296 tgtaataaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 50352197  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  50352196 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 50352108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Original strand, 19281857 - 19282074
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19281857 ccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 19281956  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19281957 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaat---------tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 19282046  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19282047 aacaaaagggtcttataaaaagggacaa 19282074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 4549630 - 4549882
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  4549630 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttta 4549729  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4549730 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 4549828  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  4549829 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaaggaacaa 4549882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 306
Target Start/End: Original strand, 14793806 - 14794016
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||    
T  14793806 acgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttca 14793903  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14793904 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctta 14794003  T
Q  294 taaaaagggacaa 306  Q
    |||||| ||||||    
T  14794004 taaaaatggacaa 14794016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20747466 - 20747214
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20747466 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 20747367  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20747366 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 20747268  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  20747267 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 20747214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25475107 - 25474861
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25475107 cctccgtccctgtatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttactttaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 25475008  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  25475007 tttatcctttaagagataat--tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagacgtataataaataggattatgtatgtaaaga 25474910  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  25474909 aataattaatgtacttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggaca 25474861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Original strand, 20454930 - 20455175
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454930 tccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 20455029  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||||||||||| |||  | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20455030 tatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaa 20455127  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20455128 taattaatgtagttggaaatggcaaaggggtcttataaaaagggacaa 20455175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 39114633 - 39114924
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39114633 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaat 39114732  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39114733 tttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagagcatgtatgtaaaga 39114832  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39114833 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaatt--caaaaggatcttataattagggacggaggtagta 39114924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17339371 - 17339122
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17339371 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 17339272  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17339271 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgtaaaga 17339172  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17339171 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 17339122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 296
Target Start/End: Original strand, 52850212 - 52850437
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52850212 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaaga 52850311  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52850312 gagatagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatag 52850411  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||    
T  52850412 ttggaaataacaaaggggtcttataa 52850437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47683381 - 47683092
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  47683381 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatattagtattaaatatgtttgcaattactattatttttacaat 47683282  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47683281 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaggtgtataat-aataggggcatgtatgtaaaga 47683183  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggta 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||          |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47683182 aataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaatggacaaaaaaaattatcaaaaggatcttataattagggacggaggta 47683092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48030608 - 48030313
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  48030608 actctctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 48030509  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  48030508 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 48030411  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48030410 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggatggagggagta 48030313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 26625744 - 26625995
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  26625744 actccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 26625843  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
     ||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26625844 taattttatcctttaagagagaat--tgatttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 26625941  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26625942 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 26625995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37174095 - 37173877
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||   || |||||||    
T  37174095 aaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacagttttatcctttaagagagaggattggtttatg 37173996  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  37173995 ttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 37173896  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37173895 gtcttataaaaagggacaa 37173877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 56432811 - 56432518
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56432811 ctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 56432712  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga-aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  56432711 ttatcctttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtattataaataagggcatgtatgtaaaga 56432612  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56432611 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 56432518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 20767960 - 20768209
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20767960 cctccgtccctaattataagtcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 20768059  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20768060 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 20768159  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  20768160 aataattaatgtagttgaaaatagaaaagagatcttataaaaagggacaa 20768209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36991207 - 36990958
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36991207 cctccgtccctaattataggacccttctgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 36991108  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36991107 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgtaaaga 36991008  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  36991007 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 36990958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39144700 - 39144448
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39144700 actccctccgtctctaattataagacctttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 39144601  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||   ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39144600 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccgtatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 39144502  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||    
T  39144501 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggaacaa 39144448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 50450969 - 50451218
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  50450969 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatctgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 50451068  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||  ||    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50451069 tttatcctttaagagtgaggaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatatatgtaaaga 50451168  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50451169 aataattaatgtagttttaaatagtaaaggggtcttataaaaatggacaa 50451218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 50602842 - 50603090
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  50602842 cctccgtccctaattatataacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 50602941  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||| |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50602942 tttattctttaagagagatagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 50603040  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||    
T  50603041 aataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaagagacaa 50603090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52870931 - 52870688
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52870931 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 52870832  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    |||| |||| |||   ||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52870831 cctt-aagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataa 52870733  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  52870732 ttaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 52870688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 375695 - 375468
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  375695 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 375596  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    | | ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  375595 tggcttatgttttcagcattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 375496  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||    
T  375495 agaaaagggatcttataaaaagggacaa 375468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 6462435 - 6462727
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| ||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6462435 cctccgtccataattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaat 6462534  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6462535 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataat-aataggggcatgtatgtaaaga 6462633  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6462634 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataataagggacagaaaaaaatctcaaaagaatcttataattagggacggaggtagta 6462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 302
Target Start/End: Original strand, 25124020 - 25124234
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||   |||||    
T  25124020 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaataaagagggttgacttatg 25124119  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  25124120 ttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgaagttggaaatagaaaaggg 25124219  T
Q  288 gtcttataaaaaggg 302  Q
    |||||||||||||||    
T  25124220 gtcttataaaaaggg 25124234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Original strand, 26866610 - 26866856
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  26866610 cgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagtttta 26866709  T
Q  161 tccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    ||||| | ||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26866710 tccttaagagagagatagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgatacaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 26866809  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  26866810 aattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaa 26866856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Original strand, 29460449 - 29460695
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29460449 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattagatatgtttgtaattattattgtttttacaat 29460548  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29460549 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 29460648  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  29460649 aataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaaggga 29460695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 25708421 - 25708672
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25708421 actccctccgtccctaattataagacccttt-gctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 25708519  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25708520 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 25708618  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25708619 aacaaaaaatcaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 25708672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Original strand, 33501669 - 33501842
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33501669 actccctccgtccctatatataagaccattttgccaaaatcacaggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 33501768  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33501769 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagat 33501842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 23777548 - 23777794
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||  |||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23777548 cctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgttataaatatgtttgtaattagtatt-tttttacaat 23777646  T
Q  157 tttatcctttaagaaaga-atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23777647 tttatcctttaagagagatatg---gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataaag 23777743  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23777744 aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaa 23777794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 306
Target Start/End: Original strand, 36129875 - 36130083
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  36129875 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgtttccaacat 36129974  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||    
T  36129975 gttatctattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 36130074  T
Q  298 aagggacaa 306  Q
    |||||||||    
T  36130075 aagggacaa 36130083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 36900856 - 36901147
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | || |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36900856 cctccgtccctaattatagggccattttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 36900955  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36900956 tttatcctt-aagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 36901052  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnc-caaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||         | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36901053 aataattaatgtagttggaaatagcaagggagtcttacaaaaagggacaaaaaaaaaatctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 36901147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Original strand, 37776494 - 37776727
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37776494 tataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcctttaaga 37776593  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37776594 gaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 37776691  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  37776692 ttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaa 37776727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 28298114 - 28298408
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28298114 cctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 28298213  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28298214 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgtcgattgaaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaag 28298313  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28298314 aaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 28298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37842435 - 37842219
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||    
T  37842435 aaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatg 37842338  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37842337 tttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 37842238  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37842237 gtcttataaaaagggacaa 37842219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Original strand, 48241408 - 48241643
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48241408 tataggacccttttgaaaaaataacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttatga 48241507  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48241508 gagagggttggtttatgttttcaacatgttatttactggtgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatatag 48241607  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||    
T  48241608 ttggaaatagcaaaaagatcttataagaagggacaa 48241643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Original strand, 34948401 - 34948644
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34948401 cgtccctatatataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaatttta 34948500  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    || ||||||| |||  |||  |||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34948501 tcttttaagagaga--gttgatttatgttttccgtatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaata 34948598  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  34948599 attaatgtagttgaaaatagtaaagtgatcttataaaaagggacaa 34948644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 45096907 - 45097158
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||  |||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  45096907 actccctccgttcctaattataggacccttttataaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 45097006  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  45097007 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatcatgtataataaataagggtatgcatgta 45097104  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  45097105 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaa 45097158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47311551 - 47311334
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||    
T  47311551 aaaataacgggaattaagata-tggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaggaaagagggttggcttatg 47311453  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  47311452 ttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaaa 47311353  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||    
T  47311352 gtgttataaaaagggacaa 47311334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 51717873 - 51718091
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  51717873 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatg 51717972  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  51717973 ttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggg 51718072  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||||||||||||    
T  51718073 gtattataaaaagggacaa 51718091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6083576 - 6083328
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  6083576 cctccgtccttatatataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 6083477  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6083476 tttatc-tttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaatagagctatgtatgtaaaga 6083378  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  6083377 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaa 6083328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 350
Target Start/End: Original strand, 49373441 - 49373730
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49373441 tccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatctgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattt 49373540  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||||||||||| | |  ||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49373541 tatcctttaagagatatggttggtttatgttatcaagatgttatttatagctgattgaagaaaa--atgtacaataaataggggcatgtatgtaaagaaa 49373638  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49373639 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggccaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 49373730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1859434 - 1859188
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1859434 ctccgttcctaattataagactcttttgctaaaatcacaggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 1859335  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859334 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgatacttattgctg-ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 1859237  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  1859236 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 1859188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Original strand, 18706402 - 18706635
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18706402 tataagacccttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattattattatatttacaattttatcctttaaga 18706501  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18706502 gaga--gatcgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaagaaataattaatgtag 18706599  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18706600 ttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggacaa 18706635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18882632 - 18882421
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18882632 tataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 18882533  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc--atgtatgtaaagaaataattaatgt 268  Q
    ||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  18882532 aagagagttggcttatgttttcaacattatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatatgtaaagaaataattaatgt 18882433  T
Q  269 agttggaaatag 280  Q
    ||||||||||||    
T  18882432 agttggaaatag 18882421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46950252 - 46949992
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | | |||||||    
T  46950252 aaaataacggaaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttctaattagtattgttttcacaattttatcctttaagagaga--gatggtttatg 46950155  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  46950154 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 46950055  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||| ||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46950054 gtcttataaaaaggaacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 46949992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 13389687 - 13389902
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||    
T  13389687 aaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtagttagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatggtttatg 13389784  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |     
T  13389785 ttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagga 13389883  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  13389884 gtcttataaaaaaggacaa 13389902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Original strand, 33988561 - 33988785
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  33988561 cccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--g 33988658  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
     |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  33988659 atgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa--aaataattaatatagttggaaa 33988756  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  33988757 tagcaaagaggtcttataaaaagggacaa 33988785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 306
Target Start/End: Original strand, 55014750 - 55014959
Alignment:
Q  97 ggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 196  Q
    |||||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  55014750 ggaattaaaataatgcatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcttttaagagagatggttggtttatgttttcaaca 55014849  T
Q  197 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  55014850 tgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataa 55014949  T
Q  297 aaagggacaa 306  Q
    ||| ||||||    
T  55014950 aaatggacaa 55014959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 273
Target Start/End: Original strand, 20761569 - 20761785
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20761569 cctccgtccctaattataagtcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 20761668  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20761669 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 20761768  T
Q  257 aataattaatgtagttg 273  Q
    |||||||||||||||||    
T  20761769 aataattaatgtagttg 20761785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39671018 - 39670771
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39671018 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 39670919  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  39670918 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtagataaag 39670819  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  39670818 aaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggga 39670771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37518282 - 37518049
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37518282 tataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttacaattttatcctttaaga 37518183  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  | |  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37518182 gaga--gatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaagaaataattaatgtag 37518085  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  37518084 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaa 37518049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37522498 - 37522265
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37522498 tataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttacaattttatcctttaaga 37522399  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  | |  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37522398 gaga--gatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaagaaataattaatgtag 37522301  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  37522300 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaa 37522265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 134 - 306
Target Start/End: Original strand, 41191449 - 41191621
Alignment:
Q  134 gtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41191449 gtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 41191548  T
Q  234 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41191549 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaa 41191621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45921690 - 45921475
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||    
T  45921690 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagagagggttaatttatg 45921591  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |     
T  45921590 ttttca---tgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgcaaataggaaatga 45921494  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45921493 gtcttataaaaagggacaa 45921475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 54877760 - 54878005
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||   ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  54877760 cctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagagagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 54877859  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54877860 tttatcttttaagagag--tgttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaa--tgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 54877955  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  54877956 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaa 54878005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 306
Target Start/End: Original strand, 39184003 - 39184242
Alignment:
Q  65 cctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 164  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  39184003 cctatatataagaccattttgtcaaaattatggaaattaaaaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcct 39184102  T
Q  165 ttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 264  Q
    |||||| |||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39184103 ttaagatagagaattagtttatgttttcaacataatatttactgtcgattgaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaatagtta 39184202  T
Q  265 atgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  39184203 atgtagttggaaatag--caagggtcttatacaaagggacaa 39184242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1173817 - 1173616
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||    
T  1173817 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttca 1173718  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  1173717 acattctatttattgctgattgaagaaaaggatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtctta 1173618  T
Q  294 ta 295  Q
    ||    
T  1173617 ta 1173616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 78 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34963654 - 34963435
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  34963654 cccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattattattggttttacaattttatcctttaagagagagag 34963555  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963554 tt-gtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 34963457  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||  |||| | |||||||||||    
T  34963456 taacaaaatgatcttataaaaa 34963435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 51336046 - 51335837
Alignment:
Q  97 ggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 196  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  51336046 ggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagggagttggtttatgttttcaaca 51335947  T
Q  197 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  51335946 tgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataa 51335847  T
Q  297 aaagggacaa 306  Q
    ||||||||||    
T  51335846 aaagggacaa 51335837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18004213 - 18003987
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaaga-at 176  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||||| | |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  18004213 cccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatcttttaagagagagat 18004114  T
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18004113 gtt---ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaaggtagttgaaa 18004017  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  18004016 ataacaaaaggatcttataaaaagggacaa 18003987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 259
Target Start/End: Original strand, 30523769 - 30523969
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30523769 cctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 30523868  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30523869 tttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatgtatgtaaaga 30523966  T
Q  257 aat 259  Q
    |||    
T  30523967 aat 30523969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 38899820 - 38900036
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  38899820 aaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatatttgtaattaatgttgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatg 38899917  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  38899918 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatataaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaagtg 38900017  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||    
T  38900018 atcttataaaaagggacaa 38900036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54624051 - 54623804
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat- 197  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||||     
T  54624051 aattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga--gaaagatggtttatgttttcaacatt 54623954  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||    
T  54623953 gttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaggtggaaatagcaagtgagtcttataaa 54623854  T
Q  298 aagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggta 347  Q
    |||||||||          |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  54623853 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggta 54623804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40809849 - 40809607
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| ||  |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40809849 cctccgtccataattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 40809750  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  40809749 tttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtattataaatagggacatgtatgtaaata 40809650  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||    
T  40809649 aataattaatgtagttaaaaatagcaaaagaatcttataaaaa 40809607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20789204 - 20788975
Alignment:
Q  77 acccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaat 176  Q
    |||||||||  ||||| | || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||      
T  20789204 acccttttgaaaaaataatggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgtttttacaactttatcctttaagagagata 20789105  T
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20789104 attggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaa 20789005  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  20789004 ataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 20788975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41620774 - 41620564
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||    
T  41620774 aaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagata--gttggtttatg 41620677  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  41620676 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatgaagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaat 41620577  T
Q  288 gtcttataaaaag 300  Q
    |||||||||||||    
T  41620576 gtcttataaaaag 41620564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55876657 - 55876431
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55876657 tataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa 55876558  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  55876557 gagaat--tggtttatgttttcatcatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataagggcatgcatgtaaaaaaataattaatgtag 55876460  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  55876459 ttggaaatagcaaaggaatcttataaaaa 55876431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Original strand, 4094759 - 4094965
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||    
T  4094759 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagggttagtttatgttttccatatg 4094857  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  4094858 ctatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaatagagatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaaa 4094957  T
Q  299 agggacaa 306  Q
    ||| ||||    
T  4094958 aggaacaa 4094965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 71 - 258
Target Start/End: Original strand, 45850482 - 45850669
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45850482 tataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 45850581  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45850582 aagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 45850669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 16545759 - 16545976
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||     
T  16545759 aaaataacgagaattaaaatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcttttaagagagaaggttggtttatc 16545858  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |     
T  16545859 ttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatatcaaatga 16545957  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  16545958 ttcttataaaaaaggacaa 16545976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 58 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49793381 - 49793091
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||| |    
T  49793381 ctccgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttctaattacaattgtttttacaaat 49793282  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  49793281 ttatccttcaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgaataataaataaggaaatgtatgtaaagaa 49793184  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49793183 ataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 49793091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 351
Target Start/End: Original strand, 37639646 - 37639925
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||| || |||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37639646 tataagtcctttttgaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaa 37639745  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    ||||  ||| | |||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37639746 aagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgccgattgaacaaaaatatgtataataaata-ggacatgtatgtaaagaaataattaatgtag 37639844  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||          ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37639845 ttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaagaatctcaaaagagtcttataattagggacggagatagtag 37639925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 249
Target Start/End: Original strand, 54535926 - 54536118
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  54535926 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 54536025  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 249  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54536026 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtat 54536118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6807643 - 6807492
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  6807643 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaaaatagtggatatttgtattaaaaatgtttataattactattgttttta 6807544  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttattt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6807543 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttattt 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52966387 - 52966166
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||    
T  52966387 cctctgtccctatatataagatcattttgctaaaatcacgggaaataagaaagtggatatttgtattaaagttatttgtaatccctattatttttacaat 52966288  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52966287 tttatccttaaaagaggaa-gttagtttatgttttacatatgatatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 52966189  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52966188 aataattaatgtagttggaaata 52966166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 113 - 306
Target Start/End: Original strand, 9808398 - 9808591
Alignment:
Q  113 atatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 212  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9808398 atatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctga 9808497  T
Q  213 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9808498 ttgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 9808591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 299
Target Start/End: Original strand, 15500387 - 15500598
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||   |||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||  | | |||||||    
T  15500387 aaaataacgggaattaagatactagatattcatattaaatatgtttataattactattatttttacaattttatcctttatgagagaggggtggtttatg 15500486  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15500487 ttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaagatgtataataaatcggagcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaga 15500586  T
Q  288 gtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||    
T  15500587 gtcttataaaaa 15500598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39184539 - 39184317
Alignment:
Q  81 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgtta 180  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||   |||  ||||    
T  39184539 ttttgctaaaatcgcgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatccttaaa---agagagtta 39184443  T
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39184442 gtttatgttttccatatattatttattgctagttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag 39184343  T
Q  281 taaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     |||  | ||||||||||||||||||    
T  39184342 caaagagatcttataaaaagggacaa 39184317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 306
Target Start/End: Original strand, 17678273 - 17678512
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 166  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| | || |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||     
T  17678273 tatatataagatcattttgctaaaattatggaaattaagaaagtggatatttatattaatgttgtttgaaatcactattatttttacaattttatcctt- 17678371  T
Q  167 aagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 265  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  17678372 aagagagagtgttagtttatgttttccatattatatttattgctgattgaaggaaaaagatgtataataaatagggacatatatataaagaaataattaa 17678471  T
Q  266 tgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  17678472 tgtaattggaaatagcaaataagtcttataaaaagggacaa 17678512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18018911 - 18018735
Alignment:
Q  97 ggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||   ||||||||||||||    
T  18018911 ggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaaca 18018812  T
Q  197 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 273  Q
    |  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18018811 ttctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 18018735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 131 - 267
Target Start/End: Original strand, 38405643 - 38405779
Alignment:
Q  131 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtat 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38405643 tttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtat 38405742  T
Q  231 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38405743 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 38405779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 351
Target Start/End: Original strand, 49490036 - 49490206
Alignment:
Q  182 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49490036 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagg 49490135  T
Q  282 aaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnc-caaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    ||| |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49490136 aaaggggtcttataaaaagggacaaacaaaaaatctcaaaagaatcttataattagggacggatgtagtag 49490206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36211546 - 36211302
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  36211546 cgtccctgtatataagatcattttaccaaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaaattatttgaaatcactgttgtttttacaatttta 36211447  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    || |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||| | | || || |||||||||||    
T  36211446 tcttttaagatcgagagttagtttatgttttcaacatattattcattgttgattaatgaaaaagatgaataaaaaatatgagtatttaggtaaagaaata 36211347  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  36211346 attattgtagttggaaatag-catagagtcttataaaaagggacaa 36211302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 269
Target Start/End: Original strand, 20180662 - 20180873
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20180662 cctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgagaattaaaaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaattaatattgtttttacaat 20180761  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||| ||||| |||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  20180762 tttatcc-ttaagagagagagttagattatgcttttcacatactatttattgctgatcgaagaaaaaaaattataataaatagtggtatgtatgaaaaga 20180860  T
Q  257 aataattaatgta 269  Q
    |||||||||||||    
T  20180861 aataattaatgta 20180873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28495677 - 28495428
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||  | ||||||||| || ||||||| ||| | ||   |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28495677 cctccgtccctaaatatgagacctttcaggcaaaatcacaggtattaagaaagttggtaagagtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaat 28495578  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |    
T  28495577 tttatcctttaagagagagatttagtttatattttcaacataatatttattgttgattgaataaaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaata 28495478  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||| | |||||||||  | | || ||||||||||||||||||    
T  28495477 aataattaatgaacttggaaataccagatggatcttataaaaagggacaa 28495428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 32898983 - 32899212
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32898983 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 32899082  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||                    ||||||||||    
T  32899083 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagat--------------------tatgtaaaga 32899162  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  32899163 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggaacaa 32899212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 48149017 - 48149220
Alignment:
Q  144 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 243  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  48149017 ttgtttttataattttatcctctaaaatagagagttgatttatgctctcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataatatatagaggc 48149116  T
Q  244 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatgga 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||          ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  48149117 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaaagagacaaaaaaatttctcaaaagagtcttataattagggataga 48149216  T
Q  344 ggta 347  Q
    ||||    
T  48149217 ggta 48149220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49329741 - 49329541
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||   |||||||||||||||     
T  49329741 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttgtttttacaattttatcatttaagaaagtgggttgacttatgttttcaacatt 49329642  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||    
T  49329641 ctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataaaggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataaaaaatgagtcttataaaa 49329542  T
Q  299 a 299  Q
    |    
T  49329541 a 49329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Original strand, 41191280 - 41191447
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41191280 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 41191379  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaag 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  41191380 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaag 41191447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 51329526 - 51329759
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  51329526 cctccgtccctatatataagaccattttgctaaaattatgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 51329625  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||| |||||| |||   ||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||||||               ||| ||||||||||||| |    
T  51329626 tttatcc-ttaagagagataattagtttatatttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaa---------------aggcgcatgtatgtaaaaa 51329709  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  51329710 aataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaa 51329759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 28501196 - 28501423
Alignment:
Q  121 attaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaa 220  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28501196 attaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagcgagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 28501294  T
Q  221 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaa 320  Q
    ||||||| | ||||||||  || || |  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  28501295 aaagatgcaaaataaata-aggtatcttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaa 28501393  T
Q  321 agaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28501394 agggtcttataattagggacggaggtagta 28501423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13549271 - 13548977
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||   ||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  13549271 cctccgtccctaaatataagagcattttgccaaaattgtggacattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 13549172  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  13549171 tttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggtaaaga 13549074  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtagat 353  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13549073 aataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagat 13548977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Original strand, 13498293 - 13498523
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13498293 gtattaaatttgtatataattactattgtatttacaattttatccttaaa-aaagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 13498391  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||          ||    
T  13498392 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggacaaacttttttctca 13498491  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13498492 aaaacatcttataattagggacggaggtagta 13498523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23623928 - 23623753
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23623928 cctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt-acaat 23623830  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat 233  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  23623829 tttatcctttaagaaagataattggtttatatttttaacatgttatttattgctgattgaataaaaatatgtataat 23623753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 236
Target Start/End: Original strand, 46480805 - 46480943
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||    
T  46480805 gaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacat 46480904  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaa 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  46480905 gttatttattgttgattggagaaaaaaatatataataaa 46480943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 296
Target Start/End: Original strand, 5734546 - 5734661
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5734546 gtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagttggaaata 5734645  T
Q  280 gtaaaagggtcttataa 296  Q
    |  ||||||||||||||    
T  5734646 g-caaagggtcttataa 5734661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 302
Target Start/End: Original strand, 6656552 - 6656733
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6656552 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatc--ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 6656649  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  6656650 aaaaagatgcaaaataaataaggacatattgataaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggg 6656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 300
Target Start/End: Original strand, 8418162 - 8418333
Alignment:
Q  129 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| || |    
T  8418162 tgttagtaattagtattgtttttacaattctatcctttaagagagtaagttagtttatattttcaacatactatttaatgttgattgaagaaaaaaatat 8418261  T
Q  229 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||    
T  8418262 aaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaataccaaatggatcttataaaaag 8418333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 260
Target Start/End: Original strand, 3168204 - 3168380
Alignment:
Q  81 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgtta 180  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  3168204 ttttggcaaaatcacgagaattaagaaagttgatatttatattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagaga--gtta 3168301  T
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||    
T  3168302 -tttatgttttcaacatactatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtacgtaggtaaataaata 3168380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20286218 - 20286094
Alignment:
Q  182 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagt 281  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20286218 tttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatatatgtaatgaaataattaatgtagttggaaatagt 20286119  T
Q  282 aaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||   |||||||||||| ||||||    
T  20286118 aaataagtcttataaaaaaggacaa 20286094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 350
Target Start/End: Original strand, 53564103 - 53564393
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| | |    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  53564103 tccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaagttgtgtataattactattgtttttacaattt 53564202  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  53564203 tatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaa 53564301  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||| || |||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  53564302 taattaatctacttggaaatatcaaatgggtcatataaaaaggaacaatcttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 53564393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Original strand, 6629284 - 6629466
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  6629284 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 6629380  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  6629381 aaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagcgtcttataaaaagggacaa 6629466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31071932 - 31071749
Alignment:
Q  113 atatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 212  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| | | ||  ||||| ||||||||||||| ||| | |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31071932 atatttgtattaaa-ttgtttgtaatcactgttacttttataattttatcctttgagagataat--tagtttttgttttcagcatgttatttattgttga 31071836  T
Q  213 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||| ||||    
T  31071835 ttgaagaaaaagatgtataataaataaggatatgtatgtaaaaaaataattaatgtagctgaaaatagcaatggggtcttatgaaaa 31071749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 306
Target Start/End: Original strand, 42528469 - 42528584
Alignment:
Q  191 tcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtc 290  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||    
T  42528469 tcaacatactatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataattaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtc 42528568  T
Q  291 ttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||    
T  42528569 ttataaaaagggacaa 42528584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Original strand, 48801427 - 48801610
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  48801427 tattaaatttgtatataattattatagtttttacaattttatccttaagagaaaga--gttagtttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 48801524  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||  |  ||||||||||||||||    
T  48801525 aaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataactaatgtaattgaaaatatcaattgtatcttataaaaagggac 48801610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20783477 - 20783232
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||| ||| | |  | |||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  20783477 ctccgtccctaaatataagaggcttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgcagtattaaatttgtatataattactattatttttacaatt 20783378  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||  || |||| ||||| |||    
T  20783377 ttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttttttgaagaaaaagatgcaaaataaataatggtatgtttgtaatgaa 20783281  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| || ||| |||||  ||| |  ||||||||||||||||||    
T  20783280 ataattaatatacttgaaaatacgaaatgaatcttataaaaagggacaa 20783232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 298
Target Start/End: Original strand, 26889708 - 26889884
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  26889708 gtattaaatttatatgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagaggga--gttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaag 26889804  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||    
T  26889805 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgtttgtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgtgtcttataaaa 26889884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 30868605 - 30868793
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  30868605 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa 30868704  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  30868705 aaaaaagatgcaaaataaataagggtacgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaagggacaa 30868793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29509035 - 29508849
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  29509035 gtattaaatttgtatatagttactattgtttttacaattttatccttaaa-agagagagttaatttatgttttcaatataatatttattattgattgaag 29508937  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  29508936 aaaaagatgcaaaataaataagggtttgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaatatcaaaatggtcttataaaaagggacaa 29508849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 302
Target Start/End: Original strand, 41333857 - 41334039
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41333857 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatc-tttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 41333955  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||   ||| || || |||||||||||    
T  41333956 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatatacttggaaatgccaaagggatcctataaaaaggg 41334039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53906190 - 53906099
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53906190 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaatagttaatgt 53906099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Original strand, 468413 - 468498
Alignment:
Q  221 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  468413 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttttaaaaagggacaa 468498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32684825 - 32684648
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  32684825 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagaaaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 32684729  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||  |||||||||||||    
T  32684728 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaccggtcttataaaaa 32684648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Original strand, 52181009 - 52181177
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||  |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  52181009 taattactattgtttttacaattttatcctt---gagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaata 52181105  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  52181106 aataagggtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaa 52181177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18872947 - 18872717
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  18872947 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 18872849  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||          ||    
T  18872848 aaaaaaatacaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacctggaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttca 18872749  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18872748 aaagggtcttataattagggacggaggtagta 18872717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Original strand, 47109627 - 47109786
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47109627 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 47109725  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  47109726 aaaaagatgcaaaataaataagggtaagttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaata 47109786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10497593 - 10497439
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  10497593 taaatttgtttataattactattatttttacaattttatcctttaagagagaagactagtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 10497494  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
     ||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10497493 ggatataaaataaataggggtatgttggtaaagaactaattaatgtatttggaaa 10497439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18879665 - 18879543
Alignment:
Q  182 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  18879665 tttatgttttcaacatgttatttattgatgatagaagaaagaaatgtataataaataagagtatgtaggtaaagaaataattaa--tagttggaaatagc 18879568  T
Q  282 aaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||    
T  18879567 aaaggggacttataaaaagggacaa 18879543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 49489885 - 49489998
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  49489885 cctccgtccctaattataggacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 49489984  T
Q  157 tttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||||||||    
T  49489985 tttatcctttaaga 49489998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17468102 - 17467935
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||    
T  17468102 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa-aaaaagattcaaaata 17468007  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  17468006 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagggatcttataaaaagggacaa 17467935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35909872 - 35909685
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  35909872 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttggttgaag 35909774  T
Q  219 aaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| | |  | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  35909773 aaaaaaaatacaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatggacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaa 35909685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 23390155 - 23390341
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||  |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  23390155 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 23390253  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |  ||||||||||||||||    
T  23390254 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagatttataaaaagggacaa 23390341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39797584 - 39797478
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39797584 tatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaa 39797485  T
Q  300 gggacaa 306  Q
    |||||||    
T  39797484 gggacaa 39797478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 5734392 - 5734505
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5734392 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5734491  T
Q  157 tttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||||||||    
T  5734492 tttatcctttaaga 5734505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 50352552 - 50352484
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50352552 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgta 50352484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 706773 - 706659
Alignment:
Q  122 ttaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  706773 ttaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaa 706674  T
Q  222 aagatgtataataaa 236  Q
    || ||||||||||||    
T  706673 aatatgtataataaa 706659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Original strand, 729844 - 729958
Alignment:
Q  122 ttaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  729844 ttaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaa 729943  T
Q  222 aagatgtataataaa 236  Q
    || ||||||||||||    
T  729944 aatatgtataataaa 729958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 201 - 306
Target Start/End: Original strand, 36040849 - 36040955
Alignment:
Q  201 atttattgttgattgaagaaaa-agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||    
T  36040849 atttattgctgattcaagaaaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggaatcttataaaaa 36040948  T
Q  300 gggacaa 306  Q
    |||||||    
T  36040949 gggacaa 36040955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3085672 - 3085490
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||  || | |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  3085672 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---gagagagagtaaatttatgtttttaatataatatttattgttgattgaag 3085576  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||    
T  3085575 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacact-aaagagtcttataaaaatggacaa 3085490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39880030 - 39879917
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39880030 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatacttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 39879931  T
Q  157 tttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||||||||    
T  39879930 tttatcctttaaga 39879917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13138956 - 13138777
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| || | |  ||| |||||| |||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  13138956 gtattaaatatgtttgtaattattattgttttttcaattatatcttttacgagatagagttggtttatatttt-aacataatatttatcgttaattgaag 13138858  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||    
T  13138857 aaaaatatgtaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaa 13138777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23621578 - 23621502
Alignment:
Q  230 taataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  23621578 taataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaa 23621502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 53910425 - 53910317
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||  | ||  |||||||||||||||    
T  53910425 cctctgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgagaattaagaaagttgatatttgcattaaagttgtttcaagtttttattgtttttacaat 53910326  T
Q  157 tttatcctt 165  Q
    |||||||||    
T  53910325 tttatcctt 53910317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Original strand, 6595556 - 6595726
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | | |||     
T  6595556 taattattattgtttttataaatttatc-tttaagaaagagagttagtttatgttttcaacaatttatttatggttgatcgaagaaaaagaagcaaaatt 6595654  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| ||||   |||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| || |||| |||||||||||||    
T  6595655 aataagggtatgttgataaagaaaaaattaatgtaattgaaaataacaaagggatcttctaaaaagggacaa 6595726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 30010659 - 30010843
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  30010659 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttgagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 30010757  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  30010758 aaaaa-atgcaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatatacttagaaataccaaaa-ggtcttataaaaaggaacaa 30010843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21265511 - 21265291
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| ||| |||     ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  21265511 cctccgtccttaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttgattgtaatattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 21265412  T
Q  157 tttatcctttaa---gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    ||||||||| ||   ||||||  || | ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||    
T  21265411 tttatccttaaaagagaaaga--gtaaatttatgttttcagtataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaa 21265315  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  21265314 agaaataattaatgtacttggaaa 21265291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 55777155 - 55777073
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55777155 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaaga 55777073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Original strand, 42598519 - 42598621
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||     
T  42598519 gtattaaatttgtttgtagttactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttagtttatggtttcaatatgctacttattgttgattgaaa 42598616  T
Q  219 aaaaa 223  Q
    |||||    
T  42598617 aaaaa 42598621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Original strand, 11469142 - 11469229
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  11469142 aaaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaa 11469229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11522319 - 11522232
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  11522319 aaaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaa 11522232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51787732 - 51787597
Alignment:
Q  151 tacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 249  Q
    |||||||||||| || | ||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||     
T  51787732 tacaattttatctttaagagaaagagttatagtttatgttttcaacatactatttatcgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggaatgtaa 51787633  T
Q  250 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaa 285  Q
     |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  51787632 ataaaaaaataattaatatagttagaaatagaaaaa 51787597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 301
Target Start/End: Original strand, 26169788 - 26169941
Alignment:
Q  147 tttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatg 246  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||    
T  26169788 tttttacagttttatcctttaaaaaaaagagttagtttatgttttcaacatgata-ttattgttgtttgaagaaaatgatatataataaatatggttatg 26169886  T
Q  247 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
     | ||||| |||||||||||   ||||||||||| |||  |||  ||||||||||    
T  26169887 aaggtaaataaataattaattgtgttggaaatagaaaagaggttctataaaaagg 26169941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 55841335 - 55841253
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55841335 aaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaaga 55841253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 278
Target Start/End: Original strand, 7325999 - 7326133
Alignment:
Q  148 ttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag----aaaaagatgtataataaataggggc 243  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||      
T  7325999 ttttacatatttaccctttatgaaagagaattacttgatgttatcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaaatatgtataataaataaggat 7326098  T
Q  244 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7326099 atgtaggtaaagaaatcattaatgtagttggaaat 7326133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 26186510 - 26186627
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  26186510 taaagttgtttgtaatcacaattatttttacagttttatcatttaagaaaaagagtaagtttatgttttcaacaagatatttattgttgatcgaagaaaa 26186609  T
Q  223 agatgtataataaatagg 240  Q
      || |||||||||||||    
T  26186610 taatatataataaatagg 26186627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 350
Target Start/End: Original strand, 46481303 - 46481426
Alignment:
Q  228 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaa-gggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatc 326  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||          |||||   ||    
T  46481303 tataataaataggggctttcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaagggacaagaaaaattctcaaaaaggtc 46481402  T
Q  327 ttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  46481403 ttataattagggatggaggtagta 46481426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 269
Target Start/End: Original strand, 49613990 - 49614115
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| |||||||  |  |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  49613990 tattgtttttacaattttatccttgaagagaga--gttattttatattttcaatgtagtatttaatgttgagtgaagaaaaagatgtagaataaataggg 49614087  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    | ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  49614088 gtatgttggtaaagaattaatgaatgta 49614115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4143658 - 4143567
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4143658 ccttttgaaaaaataacgagaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcctttaaga 4143567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Original strand, 19596248 - 19596366
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19596248 gtattaaatttgtatataactactattgcttttacaattttatcctt-aagagagatagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 19596346  T
Q  219 aaaaagatgtataataaata 238  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  19596347 aaaaagatgcaaaataaata 19596366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Original strand, 24073013 - 24073119
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| || |||||||||||    
T  24073013 tatttattattgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaagggatcttataaaaa 24073112  T
Q  300 gggacaa 306  Q
    |||||||    
T  24073113 gggacaa 24073119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 37780022 - 37780206
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  37780022 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 37780118  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| | | ||||  || ||| |||||||||||||| ||||||| |  |||   |||||||||||||| ||||    
T  37780119 aaaaa-atgcaaaataaataagagtatgttggtaaaaaaaataattaatgtatttggaaacaccaaagaagtcttataaaaaggaacaa 37780206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Original strand, 5840069 - 5840189
Alignment:
Q  86 ccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagttta 185  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  5840069 ccaaaatcacgggaataaagaaagttgataataatattaaatttgtttataattattattatttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttagttta 5840165  T
Q  186 tgttttcaacatgttatttattgt 209  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  5840166 tgtttttaacatgatatttattgt 5840189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 305
Target Start/End: Original strand, 22130323 - 22130503
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||| |||   ||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||     
T  22130323 ttgtttgtaattataattgtttt-acaattttatctttgaagagagaggattattgtatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagata 22130421  T
Q  228 tataa----taaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    || ||    |||||||||| ||||  ||||| || |||||||| || | ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  22130422 taaaataattaaataggggtatgttagtaaacaactaattaatatactaggaaatactaaagaggtcttataaaaagagaca 22130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50649133 - 50648972
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtt----tatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    |||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  50649133 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttaattagtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaatatataaaataaat 50649034  T
Q  238 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
     ||||  | |  |||||||| ||||||||||| || ||||||  ||| | ||||||||||||    
T  50649033 gggggtgtattggtaaagaattaattaatgtatttagaaataccaaatgagtcttataaaaa 50648972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 185
Target Start/End: Original strand, 27009626 - 27009715
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagt-tgtttgtaatt-agtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagttta 185  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  27009626 gaattaagatagtggatatttatattaaaatatgtttgtaatttactattgtttttacaattttatcctttaagagagaaagttggttta 27009715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 55969053 - 55968949
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga-aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||   | | |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  55969053 gtattaaagttgtttgtaatcactattggttttacaattttatcc-ttaagagggggaagttagtttatgttttccatgtgctatttattgttgattgaa 55968955  T
Q  218 gaaaaa 223  Q
    ||||||    
T  55968954 gaaaaa 55968949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 268
Target Start/End: Original strand, 7776751 - 7776902
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta---agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg 215  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  7776751 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgtcgattg 7776850  T
Q  216 aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 268  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||| ||||   |||||||||| |||||||    
T  7776851 aagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttgctaaagaaatatttaatgt 7776902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2406081 - 2405965
Alignment:
Q  112 gatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttg 211  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| | |||   ||  ||||||||||||    
T  2406081 gatatttgtattatagttgtttgtaat---cactgtttttacaattttatcctttaagagataaagttattttatatcttcgtaatactatttattgttg 2405985  T
Q  212 attgaagaaaaagatgtata 231  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  2405984 attgaaaaaaaagatgtata 2405965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38613557 - 38613458
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| | ||||||||||||    
T  38613557 tatttactgatgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaa 38613458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2738879 - 2738786
Alignment:
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2738879 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtattataaaaagggacaacaaaaattcttaaaagaatcttataattaggaacggaggtagta 2738786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38319729 - 38319656
Alignment:
Q  226 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||||    
T  38319729 tgtacaataaataggactatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagctcttataaaaa 38319656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 238
Target Start/End: Original strand, 22294301 - 22294417
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca-tgt--tatttattgttgattgaaga 219  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||    
T  22294301 taaatttgtttgtatttaatattgtttttactattttgccctttaagagaga--gttagtttatgtttttaaaattgtagtatttattgttgattgaaga 22294398  T
Q  220 aaaagatgtataataaata 238  Q
    | || || || ||||||||    
T  22294399 agaaaatataaaataaata 22294417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 306
Target Start/End: Original strand, 25924501 - 25924625
Alignment:
Q  182 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagt 281  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| || |  ||| || ||||||||||||||| | ||||       
T  25924501 tttatgttctcaacatcatatttattgttgattgtagaaaaaggcgtaaaataaatatgggtatattggtataggaataattaatgtagtggaaaattca 25924600  T
Q  282 aaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||  || ||||||||||||||||||    
T  25924601 aaggggatcttataaaaagggacaa 25924625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38616058 - 38615940
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac---atgttatttattgttgattga 216  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||  ||| ||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||    
T  38616058 tattaaatttgtttataattactattatttttacaattttat-ctttaagggagaa--ttaatttatgttttcaacataataatatttattgttgattga 38615962  T
Q  217 agaaaaagatgtataataaata 238  Q
      ||||||||| | ||||||||    
T  38615961 gaaaaaagatgcaaaataaata 38615940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15496262 - 15496175
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15496262 aaaaacatgtagagtaaataggggtaattttgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagggacaa 15496175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Original strand, 50622480 - 50622559
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  50622480 tatttattgttgattgaagaaaaggatgtaaaataaataatggtatcttggtaaagaaataattaatatatttagaaata 50622559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Original strand, 54158710 - 54158822
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt--------tagtttatgttttcaacatgttatttattgtt 210  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |         |||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  54158710 gtattaaatttgtttgtaattactattatttttacaattttatccttttagagagagagagagagagctagtttatgttttcacgatagtatttattgtt 54158809  T
Q  211 gattgaagaaaaa 223  Q
    |||||||||||||    
T  54158810 gattgaagaaaaa 54158822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 91
Target Start/End: Original strand, 9374739 - 9374777
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9374739 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaa 9374777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 55967998 - 55967928
Alignment:
Q  225 atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
    |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  55967998 atgtataataaatagatacgtgtatataaagaaataattaatgtagttgaaaataataaatgagtcttata 55967928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Original strand, 36031198 - 36031269
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttc 192  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  36031198 tattaaagttgtttgtaagtaccgttgtttttacaagtttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttc 36031269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 55969130 - 55969070
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgta 121  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  55969130 cgtccctatatataagatcattttgctaaaatcaccggaattaagaaagttgatatttgta 55969070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7205284 - 7205194
Alignment:
Q  212 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||| ||||||| |||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| || |||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  7205284 attgtagaaaaatatgtaatataaataggggtatattggtaaagaaataattaatgtactt-gaaatttgaaaggggtcttataaaaaggga 7205194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17781516 - 17781429
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||||| | ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  17781516 aaaaatatgtagagtaaataggggtaattttgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaaggatcttataaaaagggacaa 17781429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Original strand, 19839857 - 19839944
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  19839857 aaaaatatgtagagtaaataggggtaattttgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaaggaacaa 19839944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38319805 - 38319726
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgta 136  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  38319805 cctccgtcactaattataggacccttatgctaaaatcacatgaattaagaaagtgagtatttgtattaaagttgtttgta 38319726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 197
Target Start/End: Original strand, 50621486 - 50621624
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtt-tgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  ||||| | ||| | |    |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  50621486 tccgtccctaaatataggaaccttttgccaaaattacggagattaataaagttggttgtagtattaaatttgtactataattattattgtttttacaatt 50621585  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    |||||| |||| |||||  |||| |||||||||| |||||    
T  50621586 ttatcc-ttaaaaaagagagttaatttatgttttgaacat 50621624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52575750 - 52575663
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  52575750 aaaaatatgtagagtaaataggggtaattttgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaggggacaa 52575663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28790243 - 28790153
Alignment:
Q  208 gttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||| |  || | ||||| |||||||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  28790243 gttgattgaagcaaaagatataaaataaatagagatatatttgtaatgaaataattattgtacttccaaatattaaatgggtcttataaaa 28790153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 123
Target Start/End: Original strand, 42596071 - 42596137
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtatt 123  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  42596071 cctctgtccttatatacaagatccttttaccaaaatcacgagaattaagaaagttgatatttgtatt 42596137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17261446 - 17261389
Alignment:
Q  249 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  17261446 tgtaaagaaataattaatgcacttgaaaatatcaaaagagtcttataaaaagagacaa 17261389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 152
Target Start/End: Original strand, 48148710 - 48148763
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  48148710 aattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttta 48148763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20128732 - 20128631
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||||||||| || | ||| |||| || ||||||| | ||||| |||  |||  |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  20128732 tattaaatttgtttgtaactactcttggtttttcagttttatcttctaagataga--gttcatttatgtttttaacaaaatatttattgttgattgaaga 20128635  T
Q  220 aaaa 223  Q
    ||||    
T  20128634 aaaa 20128631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 118)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 25024246 - 25024543
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25024246 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 25024345  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25024346 catttttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 25024445  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||          ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25024446 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggatcttataaaaaggaacaaatttttttttcaaaagaatcttataattagggacggagggagta 25024543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 34301572 - 34301825
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34301572 actccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 34301671  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34301672 caattttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 34301771  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  34301772 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 34301825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25197449 - 25197199
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25197449 actccctcagtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 25197350  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25197349 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgta 25197250  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25197249 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 25197199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 57 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6147676 - 6147429
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6147676 cctccgtccctatatataagaccattttgccaaaatcaagggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 6147577  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6147576 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 6147477  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  6147476 aataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 6147429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30248944 - 30248691
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30248944 actccctccgtcactatatataagacccttttgccaaaatcccgggaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 30248845  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30248844 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgta 30248745  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  30248744 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 30248691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 287154 - 287407
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  287154 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 287253  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  287254 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 287353  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  287354 aagaaataactgatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 287407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33488128 - 33487875
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33488128 actccctccgtccctatatataagacctttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 33488029  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33488028 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgta 33487929  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  33487928 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagagacaa 33487875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 12105804 - 12106057
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  12105804 actccctccgtctctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattattttta 12105903  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12105904 caattttattctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgta 12106003  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  12106004 aagaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 12106057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 230847 - 231099
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  230847 actccctccgtccctatatttaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 230946  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  230947 caattttatcttttaagaaataaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgactgaagaaaaagatgtataataaatacgggcatgtaggta 231046  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  231047 aagaaataattaatgtagttgaaaata-acaaatggtcttataaaaagggacaa 231099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 10195734 - 10195987
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10195734 actccctccgtccttatatataagacccttttgtcaaaatcacgagaattaacatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 10195833  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  10195834 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataatggcatgtatgta 10195933  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  10195934 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaagagggacaa 10195987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 301
Target Start/End: Original strand, 17175205 - 17175453
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17175205 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 17175304  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17175305 caattttatcttttaagaaagaaagttggtttatgttttgaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatata 17175404  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  17175405 aagaaataattaatgttgttggaaataacaaatggatcttataaaaagg 17175453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9342131 - 9341838
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9342131 cctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaat 9342032  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342031 tttatcctttaagaaagaaggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 9341932  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9341931 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 9341838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13866886 - 13866639
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13866886 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 13866787  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13866786 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacttgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaaga 13866689  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13866688 aataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaa 13866639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 31149992 - 31150239
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31149992 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtttatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 31150091  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150092 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 31150189  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31150190 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 31150239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5457709 - 5457456
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5457709 actccctcagttcctacatacaagacccttttgtcaaaatcatgagaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 5457610  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  5457609 taattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaaacatgtatgta 5457510  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  5457509 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaa 5457456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 25045387 - 25045680
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25045387 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 25045486  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25045487 tttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 25045586  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25045587 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 25045680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 13647869 - 13648122
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  13647869 actccctccgtcccttattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 13647968  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13647969 caattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatttataataaataggggcatgtatgta 13648068  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  13648069 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaa 13648122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 1729843 - 1730095
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaa-tcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttt 151  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1729843 actccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 1729942  T
Q  152 acaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1729943 acaattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 1730040  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1730041 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaa 1730095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7772469 - 7772176
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7772469 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 7772370  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7772369 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 7772270  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7772269 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 7772176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8670426 - 8670179
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8670426 cctccgtccctaattatagtacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 8670327  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8670326 tttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 8670229  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8670228 aataattaatgcagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 8670179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 61 - 350
Target Start/End: Original strand, 34915291 - 34915580
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34915291 cgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattgagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 34915390  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    |||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34915391 tcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaata 34915490  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34915491 attaatgtagttggaaatagcaaaggggacttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 34915580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 402367 - 402658
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  402367 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 402466  T
Q  157 tttatcctttaagaaaga-atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  402467 tttatcctttaagagagagatgtt---ttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaag 402563  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  402564 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 402658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11847868 - 11847615
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  11847868 actccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 11847769  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11847768 caattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgta 11847669  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  11847668 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 11847615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 20449925 - 20450174
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  || | ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20449925 cctccgtccctaattaaaggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaat 20450024  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20450025 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 20450124  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  20450125 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 20450174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15498920 - 15498629
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15498920 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 15498821  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15498820 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 15498723  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15498722 aataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 15498629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 9388530 - 9388784
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9388530 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 9388629  T
Q  153 caattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 251  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9388630 caattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgt 9388729  T
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  9388730 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 9388784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34741762 - 34741510
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  34741762 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtcaatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgttttta 34741663  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  34741662 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtaggta 34741564  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  34741563 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaa 34741510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31091736 - 31091444
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31091736 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 31091637  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  31091636 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaaaa 31091539  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31091538 aataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtag 31091444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Original strand, 17227286 - 17227521
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17227286 tataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattgaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 17227385  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    ||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17227386 aagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 17227485  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  17227486 ttagaaatagaaaataggtcttataaaaagggacaa 17227521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 925675 - 925926
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  925675 actccctccgttcctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 925774  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  925775 caattttatcctttaagagagaattgt--tttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 925872  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  925873 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaa 925926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 1147009 - 1147260
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||| ||  |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  1147009 actccctctgtccttaattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttta 1147108  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1147109 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 1147206  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1147207 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaa 1147260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Original strand, 23397880 - 23398129
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23397880 actccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 23397979  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23397980 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgta 23398078  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  23398079 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 23398129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2090948 - 2090703
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2090948 cgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 2090849  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2090848 tcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaata 2090749  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||    
T  2090748 attaatgtagttggaaatagaaaagggatcttgtaaaaagggacaa 2090703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 31487115 - 31487364
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | || |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31487115 cctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 31487214  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    || ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487215 ttaatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 31487314  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  31487315 aataattaatgtagttggaaattgcaaaggggtcttataaaaaaggacaa 31487364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 60 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8743476 - 8743231
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8743476 ccgtccctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttt 8743377  T
Q  160 atcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||||  | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743376 atcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 8743278  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  8743277 aattaatgtacttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 8743231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 16272712 - 16272959
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16272712 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaat 16272811  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16272812 tttatcctttaacaaaga--gttgatttttgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 16272909  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16272910 aataattgatgtagttggaaatagcaaaggggtcttttaaaaagggacaa 16272959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34126436 - 34126185
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  34126436 actccctccgtccttaaatataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 34126337  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34126336 caattttatcttttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggtatgcatgta 34126239  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  34126238 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagccttataaaaagggacaa 34126185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16122546 - 16122302
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16122546 cctccgtccctaattataagacccttttga-aaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaat 16122448  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16122447 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaaga 16122348  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16122347 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggg 16122302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 306
Target Start/End: Original strand, 19418873 - 19419117
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||  ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19418873 gtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 19418972  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19418973 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaagagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 19419072  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  19419073 ttaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggacaa 19419117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 306
Target Start/End: Original strand, 19097546 - 19097794
Alignment:
Q  56 ccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaa 155  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  19097546 ccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaa 19097645  T
Q  156 ttttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19097646 ttttatcctttaagagagaat--tggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaag 19097743  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  19097744 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaa 19097794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 1779785 - 1780081
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  1779785 actccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaattacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgttttta 1779884  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1779885 caatattatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 1779983  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1779984 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggatagagggagta 1780081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12144074 - 12143823
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  12144074 actccctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgttttta 12143975  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12143974 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattaaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 12143877  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  12143876 aagaaataattaatatagttgaaaatagcaaaggggttttataaaaagggacaa 12143823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 299
Target Start/End: Original strand, 15966950 - 15967148
Alignment:
Q  101 ttaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgtt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |    
T  15966950 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattct 15967049  T
Q  201 atttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15967050 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 15967148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 13010864 - 13011157
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  || ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13010864 cctccgtccctaattacaaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatgactattgtttttacaat 13010963  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13010964 tttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 13011063  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||          |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13011064 aataattaacgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaagcgacaaaaaattttctcaaaaggatcttataattaaggacggaggtagta 13011157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 306
Target Start/End: Original strand, 18105921 - 18106164
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  18105921 gtccctatatataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttat 18106020  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    |||| |||| |||| ||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||    
T  18106021 cctt-aagagagaaagttagttcatattttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacgtgcatgtaaagaaataa 18106119  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  18106120 ttaatgtacttggaaataacaaaagggtcttataaaaagagacaa 18106164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 345158 - 344911
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaatta----gtattgtttttaca 154  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  345158 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactacgtattgtttttaca 345059  T
Q  155 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  345058 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 344960  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  344959 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 344911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15287434 - 15287190
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  15287434 actccttccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatctctattgttttta 15287335  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  15287334 caattttatcc-ttaatatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatatataataaata-ggacatgtatgta 15287237  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  15287236 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggatcttataaaaa 15287190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 23578201 - 23578419
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||    
T  23578201 aaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggtttatg 23578300  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  ||| |     
T  23578301 ttttcaacatgttatttatttttgattaaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttgaaaataacaaatga 23578400  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  23578401 atcttataaaaaggaacaa 23578419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23604755 - 23604506
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| | | |||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23604755 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattagatatgtttgtaattactattgtttttacaat 23604656  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| ||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23604655 tttatcttttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtgtaataaataagggcatatatgtaaaga 23604556  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  23604555 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaa 23604506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 350
Target Start/End: Original strand, 15355321 - 15355591
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  15355321 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtttttacaattttatcctttaagagagagaat 15355420  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15355421 taaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaag-aataattaatgtagttgaaaat 15355519  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    || ||  ||||||||||||||| |||||          ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15355520 agcaatggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaattcacaaaagagtcttataattaaggacggaggtagta 15355591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 306
Target Start/End: Original strand, 13690516 - 13690725
Alignment:
Q  97 ggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 196  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||    
T  13690516 ggaattaagataatgaatatttatattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcatca 13690615  T
Q  197 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||    
T  13690616 ttatatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaataagtcttataa 13690715  T
Q  297 aaagggacaa 306  Q
    ||||||||||    
T  13690716 aaagggacaa 13690725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 58 - 305
Target Start/End: Original strand, 345492 - 345738
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | | | ||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  345492 ctccgtccttatatataagactcttttgctaaaatcatgggaattaaaaaattcgatatttatattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaatt 345591  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  345592 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctggttgaagaaagagatgtataataaataggcgcatgtatgtaaagaa 345690  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||    
T  345691 atagttaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataagaagggaca 345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3177471 - 3177232
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  3177471 cctctgtccctatatataaaactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagttgtttgtaaccactattttttttacaat 3177372  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||| || ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3177371 tttatcctt-aagagaga--gttagttcatattttccatatgatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtacgtaaaga 3177275  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||    
T  3177274 aataattaatgtaattgaaaatagcaaagggatcttataaaaa 3177232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 390592 - 390367
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |     
T  390592 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatt-tttaagagaga--ga 390496  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  390495 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtataattaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaa 390396  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| |||   |||||||||||||||||||    
T  390395 tagcaaagatgtcttataaaaagggacaa 390367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Original strand, 9660505 - 9660670
Alignment:
Q  141 gtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9660505 gtattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaatagg 9660604  T
Q  241 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  9660605 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggacaa 9660670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 300
Target Start/End: Original strand, 31711625 - 31711835
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  | |  |||||     
T  31711625 aaaataacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattagtattgtatttacaattttattctttaagagaga--gatgatttata 31711722  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  31711723 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaaggg 31711822  T
Q  288 gtcttataaaaag 300  Q
     ||||||||||||    
T  31711823 atcttataaaaag 31711835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6418167 - 6417919
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6418167 actccctccgtccctaattataagacctttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattggtttta 6418068  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||  | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    |||||    
T  6418067 caattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggc----atgta 6417973  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  6417972 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaa 6417919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33773871 - 33773628
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33773871 ctccgtctctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaatt 33773772  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatg--ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    ||||| ||||||| |||  |  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  33773771 ttatcatttaagagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtagag 33773672  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  33773671 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtattataaaaa 33773628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20373326 - 20373123
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373326 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 20373227  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  20373226 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgcatataaaga 20373129  T
Q  257 aataat 262  Q
    ||||||    
T  20373128 aataat 20373123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 236043 - 235830
Alignment:
Q  63 tccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 162  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| |||  |||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  236043 tccctatatataaggcccttttgtcaaaatcacgtgagttaagaaagtttatatttgtattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttgtc 235944  T
Q  163 ctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 262  Q
     ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  235943 atttaagaga-aatattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg--gaaaaaaatgtataataaataggggtatgtaggtaaagaaataat 235847  T
Q  263 taatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||| |||||    
T  235846 taatgtagttgaaaata 235830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 306
Target Start/End: Original strand, 5576180 - 5576369
Alignment:
Q  113 atatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 212  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5576180 atatttgtattgaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagtgaga--gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 5576277  T
Q  213 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||| ||||||    
T  5576278 ttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaatag--caagagtcttataaaaatggacaa 5576369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8175948 - 8175712
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8175948 cctctgtccctttatataagacccctttgctaaaattgcgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 8175849  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8175848 tttatccttcaagagagagagttagtttatgttttccatatactatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag- 8175750  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
         ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  8175749 -----ttaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 8175712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15126748 - 15126508
Alignment:
Q  65 cctatatataaga-cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcc 163  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  15126748 cctatatataagatcccttttgtcaaaattacgggaattaagaaagtg-atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttcatcc 15126650  T
Q  164 tttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga--tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    |||| || |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15126649 ttta-gagagaat--tggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgtagaaaaaaaaatctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataa 15126553  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||| |||||| |||   ||||||| |||||||||||    
T  15126552 ttaatatagttgaaaatagcaaagaagtcttatcaaaagggacaa 15126508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Original strand, 22852077 - 22852324
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22852077 ctccgtcggtatatataagacccttttgctaaaattatgggtattaagaaagtggatatttgt-ttaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaatt 22852175  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||| ||||  | ||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  22852176 ttatcctt-aagagagagagttagtttatatttttcatatactatttattgctgattgaaaaaaaaaaatgtataacaaatagggacatgtatgtaaata 22852274  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  22852275 aataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaaagggacaa 22852324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 306
Target Start/End: Original strand, 11656172 - 11656339
Alignment:
Q  140 agtattgtttttacaattttatcctt-taagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11656172 agtattgtttttacaattttatccttatgagagagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgtttattgaagaaaaagatgtataataaata 11656271  T
Q  239 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11656272 aaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 11656339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32615279 - 32615035
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| |||  |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32615279 cctccgtctctaattatatgactcttttgtcaaaatcacggaaattaagaaaattgataataatattaaatttgtttataattactattgtttttacaat 32615180  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||  ||||||||    
T  32615179 tttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataggggtatggttgtaaaga 32615082  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  32615081 aataattaatgtaattggaaataacaaacgggacttataaaaaggga 32615035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 295
Target Start/End: Original strand, 9299245 - 9299411
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9299245 ttgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaacagagatagtttgtttatgttttaaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatg 9299344  T
Q  228 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
    ||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  9299345 tataataaataagggtatg-ctggaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttata 9299411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 53 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29036371 - 29036259
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29036371 actccctccgtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 29036272  T
Q  153 caattttatcctt 165  Q
    |||||||||||||    
T  29036271 caattttatcctt 29036259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 6418397 - 6418645
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||| | |     ||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  6418397 cctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaatcacggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtataaaattactattgtttttacaat 6418496  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  6418497 tttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 6418595  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  6418596 aataattaatgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaa 6418645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 270
Target Start/End: Original strand, 17952175 - 17952316
Alignment:
Q  129 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 228  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17952175 tgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacaatctatttattgctgattgaagaaaaaaatgt 17952274  T
Q  229 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17952275 ataataaatagggacatgtatgtaaaaaaatatttaatgtag 17952316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 22998790 - 22999038
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  22998790 cctccctccctaaatataagagccttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 22998889  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |    
T  22998890 tttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaata 22998988  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  22998989 aataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaa 22999038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23789614 - 23789366
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  23789614 cctccctccctaaatataagagccttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 23789515  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |    
T  23789514 tttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaata 23789416  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  23789415 aataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaa 23789366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11162083 - 11161895
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11162083 gtattaaatttctatgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 11161984  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||| | ||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  11161983 gaaaaaaatgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaataccaaaagggtcttataaaaaaggacaa 11161895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13901930 - 13901684
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||  | |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||||| |||| ||  || | ||||||||||||| ||    
T  13901930 ctccgtccttaaatataggaccctttttaccaaatcacgggaattaaaaaagttggtattactattaaatttgtatgctat-actattgtttttacattt 13901832  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  13901831 ttatcctttaagagaaagagttagtttatgttttcgaaatgatatttcttgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaagaa 13901732  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  13901731 ataattaatataattggaaataccaaaggggtcttgtaaaaagagaca 13901684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 8217466 - 8217712
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  8217466 cctccgtccctaaatatatgaaccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 8217565  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||  ||||  |||||||    
T  8217566 tttatcctt-aagagaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataaggatatgttggtaaaga 8217662  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  8217663 aataattaatgtacttgaaaataccaaaagagtcttataaaaatggacaa 8217712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4175534 - 4175286
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||| | |     ||||||| |||| |  ||||| |||| ||||||||||    
T  4175534 cctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaatcacggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtataaaattactattatttttacaat 4175435  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |    
T  4175434 tttatcctt-aagagagagagttaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaa 4175336  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  4175335 aataattaatgtatttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaa 4175286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 177 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11840543 - 11840415
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||| |||    
T  11840543 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataactaatgtagtt-gaa 11840445  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  11840444 atagctaaagtgtcttataaaaagggacaa 11840415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22710478 - 22710310
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  22710478 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 22710382  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| ||| || |  |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22710381 aataagggtattttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaa 22710310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9038936 - 9038686
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| || | | |||||| |||||||||||    
T  9038936 actccctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttctatataattactattgttttta 9038837  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
     |||||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| ||| ||||  |||    
T  9038836 taattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa--tgcaaaataaataagggtatgttggta 9038740  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  9038739 aagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaa 9038686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 350
Target Start/End: Original strand, 29293663 - 29293836
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 276  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29293663 gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgatgaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaa 29293762  T
Q  277 atagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||         |||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  29293763 ataccaaaagggtcttataaaaatggacaatttttttttccaaaagagtcttgtaattaggaacggaggtagta 29293836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4823198 - 4823026
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4823198 tattaaatttgtatgtaattactattgtttttataattttatcctt-aagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 4823102  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    |||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||    
T  4823101 aaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccttaagggtcttataa 4823026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 298
Target Start/End: Original strand, 8646015 - 8646190
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||    
T  8646015 taaatttgtttgcaattactattgtttttacaaatttgttctttaagaaagagagttagtgtatgttttcaatataatgtttaatgttgattgaagaaaa 8646114  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    |||| || |||||||||||| |||   ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  8646115 agatataaaataaataggggtatggtggtaaaaaattaattaatgtacttggaaatagcaaatgagtcttataaaa 8646190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11104816 - 11104616
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgt---attaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagttt 184  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||   ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||    
T  11104816 aaaataacggaaattaagatagtagatatttgttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagagagagaattggttt 11104717  T
Q  185 atgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaa 284  Q
    ||||||| ||||||||||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11104716 atgttttaaacatgttat---------------------gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 11104638  T
Q  285 agggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  11104637 agagtattataaaaagggacaa 11104616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Original strand, 13321076 - 13321363
Alignment:
Q  60 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 159  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  13321076 ccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatttt 13321175  T
Q  160 atcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    |||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  13321176 atcctt-aagagagatagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttt-ttgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaat 13321272  T
Q  260 aattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13321273 aattaatgtacttggaaacacgaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 13321363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11200808 - 11200594
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  11200808 taattactattgattttacaattgtatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 11200710  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataatt 334  Q
    |||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||  || ||||| ||||||||| ||||||          ||||||  ||||||||||    
T  11200709 aataagggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaataccaacagggttttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaaggctcttataatt 11200610  T
Q  335 agggatggaggtagta 350  Q
    ||||| ||||||||||    
T  11200609 agggacggaggtagta 11200594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23923701 - 23923536
Alignment:
Q  139 tagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| |||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  23923701 tagtattgtttttacaattttatccttaaaggtaga--gttagtatatgtttttaatataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaata 23923604  T
Q  239 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| |||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  23923603 ggggtatggtggtaaagaaatatttaatgtaattgaaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaa 23923536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27581616 - 27581457
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27581616 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 27581518  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||| | ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27581517 aaaaagatgcaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaata 27581457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 28980662 - 28980849
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  || | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  28980662 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 28980761  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||| ||| | |||||||| | | ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  28980762 gaaaaa-atgcaaaataaataagagtatgttggtaaagaaataattaatttacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaa 28980849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26211182 - 26211040
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 166  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||||||||    
T  26211182 tatatataagactcttttggcaaaatcactggaattaagagagttggtatttgtactaaagttgtttataatcactaatatttttacaattttatccttt 26211083  T
Q  167 a--agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttatt 207  Q
    |  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26211082 aagagaaagagatttagtttatgttttcaacatgttatttatt 26211040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 217 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29036258 - 29036169
Alignment:
Q  217 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||    
T  29036258 agaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttataaaaagggacaa 29036169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 140
Target Start/End: Original strand, 11655814 - 11655896
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaatta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11655814 ctccgtccctatatataagacccctttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatta 11655896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14630115 - 14629950
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  14630115 taattattattatttttacaattttatcctt-aagagagaat--taatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatgcaaaata 14630019  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| |||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  14630018 aataagggtatgttagtaaagaaataattaatctacttgaaaataccaaagaggtattataaaaaggga 14629950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 28236010 - 28236194
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   | | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||     
T  28236010 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaac 28236108  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||  ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||   |||||||||||||||||||    
T  28236109 aaaa--atgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggacaa 28236194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27310662 - 27310478
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |  || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27310662 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttataattttatcctt-aagagagatt--taatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 27310566  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | ||||||||  || ||||    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |  ||||||||||| ||||||    
T  27310565 aaaaagatgcaaaataaataaaggtatgttgacaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaggaatcttataaaaaaggacaa 27310478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 238
Target Start/End: Original strand, 33012473 - 33012590
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33012473 tattaaatttgtttataattaatattgtttttacaattttgtc-tttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 33012571  T
Q  220 aaaagatgtataataaata 238  Q
    |||| ||| | ||||||||    
T  33012572 aaaaaatgcaaaataaata 33012590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Original strand, 8637148 - 8637261
Alignment:
Q  186 tgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaa 285  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||| |||     
T  8637148 tgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaatgattaatatacttgaaaatagcaaag 8637247  T
Q  286 gggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||    
T  8637248 gggtcttataaaaa 8637261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Original strand, 6840082 - 6840183
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  6840082 taaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctataag--agagtgttaatgtatgttttcaacatattatttaatgctgattgaagaaaa 6840179  T
Q  223 agat 226  Q
    ||||    
T  6840180 agat 6840183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Original strand, 2746349 - 2746448
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  2746349 tgtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttatcctttaagagagagaattagcttatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaa 2746448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13446127 - 13445999
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgta-taataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 275  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||  |||||  |||||||||||||| |||||    
T  13446127 gttagtttatgttttcaatatagtatttattattgattgaagaaaaagatacagaaataaataggggtatgcttgtaa--aaataattaatgtaattgga 13446030  T
Q  276 aatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  13446029 aatatcaaaatagtcttataaaaagggacaa 13445999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Original strand, 23282615 - 23282799
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaa 221  Q
    |||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  23282615 taaatttgttggtaattaccattggttttacaattttatccttaagagaaagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaa 23282714  T
Q  222 aagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |   | |||||||||||| |||   || || || ||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  23282715 aataaacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataataagagacaa 23282799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 9660138 - 9660221
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaatta 140  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  9660138 cctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 9660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8595705 - 8595644
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8595705 gttagtttatgttttcaacataatattgattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaata 8595644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 280
Target Start/End: Original strand, 32982458 - 32982589
Alignment:
Q  147 tttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatg 246  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  |||  || ||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  32982458 tttttacaattttatcttttgagggaga--gtaagtttatatattcaacgtgttatttatcggtgattgaagaaaaatatgtataataaataaggatatg 32982555  T
Q  247 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    || ||||  ||||||||||| |||| | ||||||    
T  32982556 taggtaattaaataattaatatagtcgaaaatag 32982589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Original strand, 5186251 - 5186348
Alignment:
Q  68 atatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 165  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||| || |||||||||    
T  5186251 atatataagacttttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtaaatatttctattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttagaaatttatcctt 5186348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17545431 - 17545371
Alignment:
Q  177 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||    
T  17545431 gttagtttttgttttcaacatgttatttattgttgattgaag----agatatataataaataggg 17545371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Original strand, 493510 - 493590
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  493510 tattgattttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaaa 493590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 305
Target Start/End: Original strand, 2614137 - 2614193
Alignment:
Q  249 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2614137 tgtaaagaaatcattaatgtagttgacaattgtaaaagagtcttataaaaagggaca 2614193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8345391 - 8345311
Alignment:
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat--gtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8345391 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagg--atgtattgataaagaaataattaatgtatttgaaaata 8345311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 2665541 - 2665641
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| ||  |||||| || |  ||||||||||    
T  2665541 taaatttgtttgtaatcgctattgtttttacacttttattctttaagagagtaggttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctcgttgaagaaaa 2665640  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  2665641 a 2665641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 17950505 - 17950556
Alignment:
Q  75 agacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaa 126  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17950505 agacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaa 17950556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 226000 - 225928
Alignment:
Q  65 cctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaat 138  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  226000 cctaaatataagacatttttgacaaaatcacgggaatgaagaaatttgatatttg-attaaagttgtttgtaat 225928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 4746064 - 4746121
Alignment:
Q  249 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4746064 tgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaaggatcttataaaaagggacaa 4746121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 7847150 - 7847242
Alignment:
Q  149 tttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 242  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  | |||| | ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  7847150 tttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatatagtttttaatattgattgaagaaaaatatacaaaataaatagggg 7847242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Original strand, 11211576 - 11211649
Alignment:
Q  206 ttgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  11211576 ttgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaatagaagtatgttgataaagaaattattaatgtaattagaaata 11211649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Original strand, 11278457 - 11278530
Alignment:
Q  206 ttgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  11278457 ttgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaatagaagtatgttgataaagaaattattaatgtaattagaaata 11278530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 306
Target Start/End: Original strand, 2364998 - 2365086
Alignment:
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||| | ||||||||||||| |||||    
T  2364998 gaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagtgacaa 2365086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17213677 - 17213601
Alignment:
Q  121 attaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||| | | |||  |||| | ||||||||||||||    
T  17213677 attaaatttgtttataattattattgtatttacaattttattctttgatagagatagttaatctatgttttcaacat 17213601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17992281 - 17992177
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||  |||  ||||||| ||| |||    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17992281 cctccgtcactaaatatatgagccttttgctaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 17992182  T
Q  157 tttat 161  Q
    |||||    
T  17992181 tttat 17992177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 214)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 42872074 - 42872327
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42872074 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 42872173  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42872174 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 42872273  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  42872274 aagaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaaaagggacaa 42872327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 52430914 - 52431167
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  52430914 actccctccgtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgttttta 52431013  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52431014 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 52431113  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  52431114 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 52431167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11741694 - 11741441
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11741694 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 11741595  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741594 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 11741495  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  11741494 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 11741441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30290562 - 30290309
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  30290562 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgttttta 30290463  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30290462 caattttatccttttagaaagaatgttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 30290363  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  30290362 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 30290309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45794635 - 45794388
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45794635 tccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 45794536  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45794535 tatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaa 45794436  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  45794435 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 45794388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Original strand, 50246670 - 50246916
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  50246670 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgttttta 50246769  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50246770 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 50246869  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  50246870 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaa 50246916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 11906968 - 11907221
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11906968 actccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgagaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 11907067  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11907068 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 11907167  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  11907168 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 11907221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 46075608 - 46075860
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  46075608 actctctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 46075707  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46075708 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgca 46075806  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46075807 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 46075860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 53 - 301
Target Start/End: Original strand, 47300633 - 47300881
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47300633 actccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 47300732  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47300733 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 47300832  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  47300833 aataaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtctcataaaaagg 47300881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49907318 - 49907065
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  49907318 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcgcgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttaa 49907219  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49907218 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttattttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 49907119  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  49907118 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 49907065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 53 - 350
Target Start/End: Original strand, 16575832 - 16576129
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  16575832 actccctccgtctttatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattcaagttgtttgtaatcactattgttttta 16575931  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16575932 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgta 16576031  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16576032 aagaaataactaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 16576129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 53 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16456933 - 16456681
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16456933 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 16456834  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16456833 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggagcatgcatgta 16456734  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16456733 aagaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggaca 16456681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 50008223 - 50008476
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||     
T  50008223 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttg 50008322  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50008323 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgta 50008422  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||    
T  50008423 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagagacaa 50008476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 943379 - 943630
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  943379 actccctccgtccctata--taagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 943476  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  943477 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 943576  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||    
T  943577 aagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaggagtcttataaaaaaggacaa 943630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2280225 - 2279998
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280225 cccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttctattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 2280126  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2280125 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaa 2280026  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  2280025 taacaaaggggtc-tataaaaagggacaa 2279998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 279
Target Start/End: Original strand, 8104031 - 8104256
Alignment:
Q  54 ctccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttac 153  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8104031 ctccatccgtctctatatataagacccttttgccaaaattatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttac 8104130  T
Q  154 aattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8104131 aattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataa 8104230  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8104231 agaaataattaatgtagttggaaata 8104256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 32169695 - 32169947
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32169695 actccctccgtccttatatataacacccttttgccaaaatcacatgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 32169794  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32169795 caattttattctttaagaaagaaggtta-tttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgta 32169893  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  32169894 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 32169947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6090026 - 6089779
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6090026 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 6089927  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6089926 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 6089829  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6089828 aataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 6089779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45336182 - 45335929
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  45336182 actccctccgtccctatatacaagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttctta 45336083  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  45336082 caattttatcctttaagaaagaaagttagtttatattttcaacatgttatttattgttaattgaaaaaaaaaatgtataataaatggaagcatgtatgta 45335983  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  45335982 aagaaataattaatgtagtaggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggacaa 45335929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 275
Target Start/End: Original strand, 36880363 - 36880582
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  36880363 actccctccgtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtattta 36880462  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36880463 caattttatcctttaagaaa---tgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgta 36880559  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttgga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36880560 aagaaataattaatgtagttgga 36880582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 61 - 350
Target Start/End: Original strand, 9413075 - 9413362
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9413075 cgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 9413174  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9413175 tcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaata 9413272  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9413273 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 9413362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34931370 - 34931123
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34931370 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 34931271  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34931270 tttatcctttaagagaga--gttggttcatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 34931173  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  34931172 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 34931123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36695151 - 36694898
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  36695151 actccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 36695052  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36695051 caattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 36694952  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  36694951 aagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 36694898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36711252 - 36710999
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  36711252 actccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 36711153  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36711152 caattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 36711053  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  36711052 aagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 36710999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27037562 - 27037269
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  27037562 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgtttttacaat 27037463  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  | | | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037462 tttatcctttaagaaagagagctggcttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 27037363  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27037362 aataattaatgtagttgaaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 27037269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 30289603 - 30289855
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30289603 actccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 30289702  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30289703 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 30289801  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30289802 aagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaa 30289855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 39750122 - 39750374
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39750122 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 39750221  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39750222 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 39750320  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  39750321 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaa 39750374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44646567 - 44646315
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44646567 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 44646468  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44646467 caattttatcctt-aagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 44646369  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  44646368 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 44646315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52602286 - 52602035
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52602286 actccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 52602187  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52602186 caattttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 52602089  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52602088 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 52602035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 15810973 - 15811225
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15810973 actccatccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 15811072  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15811073 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 15811171  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  15811172 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 15811225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Original strand, 42275918 - 42276153
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42275918 tataagactcttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 42276017  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    || |  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42276018 aatagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 42276117  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42276118 ttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaa 42276153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Original strand, 9202246 - 9202491
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9202246 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 9202345  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9202346 caattttatcctt-aagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 9202444  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  9202445 aataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 9202491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23530838 - 23530589
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23530838 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 23530739  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23530738 tttatcctttaagaaagagggttggcttatcttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaa 23530639  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  23530638 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggacaa 23530589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 39362935 - 39363187
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39362935 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 39363034  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39363035 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgta 39363133  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  39363134 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 39363187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28052482 - 28052189
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28052482 cctccgtccctaattacaggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataat 28052383  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28052382 tttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattggagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 28052283  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28052282 aataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatttcaaaagaatcttataattaaggacggaggtagta 28052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23542275 - 23542023
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  23542275 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgttttta 23542176  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23542175 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgta 23542077  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23542076 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 23542023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 352
Target Start/End: Original strand, 28888167 - 28888463
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28888167 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 28888266  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28888267 tttttcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 28888366  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa-nnnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagtaga 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||           |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888367 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttacaaaaaaggacaattttttttcttcaaaaggatcttataattagggatggaggtagtaga 28888463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39497729 - 39497477
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39497729 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 39497630  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39497629 caattttatcctt-aagagagatagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgta 39497531  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  39497530 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 39497477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44649925 - 44649673
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44649925 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 44649826  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44649825 caattttatcctt-aagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 44649727  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  44649726 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 44649673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 48067639 - 48067888
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48067639 cctccgtccctaattacaaaacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 48067738  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48067739 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 48067838  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  48067839 aataattaatttagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaa 48067888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Original strand, 27530369 - 27530595
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  27530369 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgcttttacaattttatcctttaagagatagagt 27530468  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530469 tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 27530567  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||    
T  27530568 agcaaagtggtcttataaaaagggacaa 27530595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Original strand, 1047993 - 1048242
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1047993 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 1048092  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048093 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 1048191  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  1048192 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttttaaaaaggga 1048242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 4102456 - 4102707
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4102456 actccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 4102555  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4102556 caattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgta 4102653  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4102654 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 4102707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41317885 - 41317638
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| |||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317885 cctccgtctctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 41317786  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41317785 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaaga 41317688  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41317687 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 41317638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 41855215 - 41855466
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||  |||||  |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  41855215 actccctccaaccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 41855314  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41855315 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 41855412  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41855413 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 41855466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9715653 - 9715404
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9715653 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 9715554  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9715553 tttatcctttaagaaagagggttgccttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgcatgtaaaga 9715454  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  9715453 aataattaatgtagttggaaatagaaaagggcgcttataaaaagggacaa 9715404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 288
Target Start/End: Original strand, 14090010 - 14090227
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14090010 tataagatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 14090109  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14090110 gagagaggtaatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 14090209  T
Q  271 ttggaaatagtaaaaggg 288  Q
    |||||||||  |||||||    
T  14090210 ttggaaataacaaaaggg 14090227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 28885847 - 28886096
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28885847 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 28885946  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  28885947 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtttcataaataggggcatgtatgtaaata 28886046  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||    
T  28886047 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttacaaaaagggacaa 28886096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 37951690 - 37951942
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  37951690 actccctccgtccctaattatatgacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgttttta 37951789  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37951790 caatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 37951888  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  37951889 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 37951942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45039704 - 45039456
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45039704 cctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatattagtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 45039605  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  45039604 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaaga 45039506  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  45039505 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 45039456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 8923426 - 8923661
Alignment:
Q  69 tatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 168  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8923426 tatatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaa 8923525  T
Q  169 gaaaga-atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 267  Q
    || ||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8923526 gagagagatgtt---ttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 8923622  T
Q  268 tagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  8923623 tagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaa 8923661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 62 - 306
Target Start/End: Original strand, 15892313 - 15892557
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15892313 gtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 15892412  T
Q  162 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15892413 cctttaagaaagagtgttggtttatgttttcaacattctatttattactgattgaaaaaaaagatgtataataaataggagcatatatgtaaagaaataa 15892512  T
Q  262 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  15892513 ttaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaa 15892557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 296
Target Start/End: Original strand, 5765735 - 5765973
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5765735 cctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5765834  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765835 tttctcctt-aagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 5765933  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataa 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  5765934 aataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataa 5765973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24855574 - 24855325
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24855574 cctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 24855475  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24855474 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaga 24855375  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  24855374 aataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaa 24855325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25509468 - 25509252
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaaga-atgttagtttat 186  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||   ||||    
T  25509468 aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagagatgtt---ttat 25509372  T
Q  187 gttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaag 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  25509371 gttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaagg 25509272  T
Q  287 ggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25509271 ggtcttataaaaagggacaa 25509252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38261633 - 38261384
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  ||||||   ||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38261633 cctccgtccctaattataaggttcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttctattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 38261534  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38261533 tttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 38261434  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  38261433 aataattaatgtagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggacaa 38261384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Original strand, 21630881 - 21631144
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt-aagaaagaatgttagtttat 186  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||| ||||||    
T  21630881 aaaataacgggaattaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttttaagagagagagttggtttat 21630980  T
Q  187 gttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaag 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21630981 gttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtagagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagg 21631080  T
Q  287 ggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21631081 ggtcttataaaaagggacaatttgtttcttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 21631144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26550059 - 26549836
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  26550059 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgta-ttagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaaatt 26549961  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26549960 --gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaat 26549863  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||    
T  26549862 agcaaatgggtctta-aaaaagggacaa 26549836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 95 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31238972 - 31238763
Alignment:
Q  95 cgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaa 194  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  31238972 cgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaa 31238875  T
Q  195 catgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttat 294  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31238874 catgttatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaaagtagttggaaatagcaaaggggtcttat 31238775  T
Q  295 aaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||    
T  31238774 aaaaagggacaa 31238763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Original strand, 229174 - 229401
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |     
T  229174 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcctttaagagaga--ga 229271  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  229272 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaat 229371  T
Q  279 agtaaaagggtct--tataaaaagggacaa 306  Q
    || ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  229372 agcaaaggggtcttatataaaaagggacaa 229401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 88 - 303
Target Start/End: Original strand, 27575412 - 27575627
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  27575412 aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgaaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatg 27575511  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27575512 ttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagg 27575611  T
Q  288 gtcttataaaaaggga 303  Q
     |||||||||||||||    
T  27575612 atcttataaaaaggga 27575627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 88 - 346
Target Start/End: Original strand, 45285585 - 45285843
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  45285585 aaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatg 45285684  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  45285685 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaataa 45285784  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggt 346  Q
    || ||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45285785 gttttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagagtcttataattagggacggaggt 45285843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 12814563 - 12814780
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  12814563 aaaataacgggaattaagatactggatattagtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttgatttatg 12814662  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12814663 ttttcaacatgttatttactgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagt 12814761  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12814762 gtcttataaaaagggacaa 12814780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 40614651 - 40614898
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40614651 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 40614750  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40614751 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggagcatgtatgtaaaga 40614848  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  40614849 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaatggacaa 40614898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 1039122 - 1039374
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1039122 actccctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 1039221  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1039222 caattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 1039320  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  1039321 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 1039374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 1046028 - 1046280
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1046028 actccctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 1046127  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1046128 caattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 1046226  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  1046227 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 1046280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38613768 - 38613519
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38613768 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaactaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 38613669  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  | | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38613668 tttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 38613569  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  38613568 aataattaatgtagttagaaatataaaaggggtcttataaaaagggacaa 38613519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 75 - 306
Target Start/End: Original strand, 1767626 - 1767855
Alignment:
Q  75 agacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaaga 174  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1767626 agacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgcattatatatgtttgtaattagcattgtttttacaattttatcatttaagagaga 1767725  T
Q  175 atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgg 274  Q
    |   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1767726 aa--tggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttga 1767823  T
Q  275 aaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1767824 aaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 1767855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 67 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18237374 - 18237094
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 166  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||     
T  18237374 tatatataagatcattttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattctatcctt- 18237276  T
Q  167 aagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 266  Q
    |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  18237275 aagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataagtaat 18237176  T
Q  267 gtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18237175 gtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaattct--caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 18237094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 102 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50008221 - 50008018
Alignment:
Q  102 taagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgtta 201  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  50008221 taagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttcataattttatcatttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgtta 50008122  T
Q  202 tttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  50008121 tttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaga 50008023  T
Q  302 gacaa 306  Q
    |||||    
T  50008022 gacaa 50008018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15100641 - 15100400
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15100641 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaaga 15100542  T
Q  171 aagaatg------ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 264  Q
     |||  |      || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15100541 gagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 15100442  T
Q  265 atgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15100441 ttgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 15100400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 7212303 - 7212552
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  7212303 cctccgttcctatatataaaatccttttatcaaaatcacggaaattaatatagtgaatatttgtataaaagttgtttgtaatcattattgtttttataat 7212402  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  7212403 tttatcctttatgaaagatggttagtttatgttttcaacatgatatttattgttcattcaagaaaaatatgtataataaataaaggtatgtatgtaaaga 7212502  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  7212503 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggttttatagaaagggacaa 7212552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 7763496 - 7763786
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7763496 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 7763595  T
Q  157 tttatcctttaagaaaga-atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 255  Q
    |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7763596 tttatcctttaagagagagatgtt---ttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaagat-tataattaataggggcatgtatgtaaag 7763691  T
Q  256 aaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7763692 aaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 7763786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 301
Target Start/End: Original strand, 27974900 - 27975144
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27974900 cctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaattgcaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaat 27974999  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||  ||||||| |||  ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |    
T  27975000 tttattttttaagagagagagtatatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatgtgcatgtatgtaaata 27975099  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||| || |||||||||||    
T  27975100 aataattaatgcagttgaaaataacaaaagagttttataaaaagg 27975144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Original strand, 36674043 - 36674291
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    ||||||| |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36674043 ctccgtctctaattataggacctttttgaaaaaataacgcgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 36674142  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    ||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  36674143 ttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgcatgtaaaaaa 36674242  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36674243 ataattaatgtagttaaaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaa 36674291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48854109 - 48853864
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48854109 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaat 48854010  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48854009 tttatcctttaagagagaaa--tggtttacgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 48853912  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48853911 aagaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 48853864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7784290 - 7784035
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagata-gtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttt 151  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7784290 actccctccgtccctaattataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 7784191  T
Q  152 acaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 250  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7784190 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgtatg 7784091  T
Q  251 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  7784090 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataagggacaa 7784035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13344035 - 13343817
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  13344035 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagtgttggcttatg 13343936  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||       
T  13343935 ttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagaaaataa 13343836  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  13343835 gtcttataaaaaggaacaa 13343817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14347384 - 14347174
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||    
T  14347384 aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagggagggttggtttatg 14347285  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  14347284 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagag 14347185  T
Q  288 gtcttataaaa 298  Q
    || ||||||||    
T  14347184 gttttataaaa 14347174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15111864 - 15111625
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15111864 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttacaattttatcctttaaga 15111765  T
Q  171 aaga-at---gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 266  Q
     ||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  15111764 gagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatgtaaagaaataattatt 15111665  T
Q  267 gtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15111664 gtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 15111625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 35984403 - 35984655
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||   |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35984403 actccttccgtccctaattataagacccttttgcttaaatcacgggaattaaaaaagcatatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 35984502  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35984503 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 35984601  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||| || | ||||||||||||||||    
T  35984602 aagaaataattaatgtagttaaaaataacaaagggattttataaaaagggacaa 35984655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15763577 - 15763359
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  15763577 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaaaaatttatcctttaagagagagagttggtttatg 15763478  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15763477 ttttcaacatattatttattactgactgaagaaaaaaatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaga 15763378  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15763377 gtcttataaaaagggacaa 15763359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 109 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39324766 - 39324576
Alignment:
Q  109 gtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattg 208  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39324766 gtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattg 39324667  T
Q  209 ttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  39324666 ttgattgaagaaaaagatgaataatagataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 39324576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3549291 - 3549032
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||   |  ||||||    
T  3549291 aaaataacgggaattaagatagtgtatatttatattaaatatgtttgtaattagtatt-tttttacaattttatcctttaagagataaa--tgatttatg 3549195  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  3549194 ttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtg 3549095  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||          |||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  3549094 gtcttataaaaagggacaatttattttttcaaaaggatcttataattagagacggaggtagta 3549032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37585222 - 37584997
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||    
T  37585222 ccttttgaaaaaataacaggaattaagataatagatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gt 37585125  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37585124 tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaatt 37585025  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
       ||| |||||||||||||| ||||||    
T  37585024 tacaaaggggtcttataaaaacggacaa 37584997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50938022 - 50937822
Alignment:
Q  106 atagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttattta 205  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||   |||||    
T  50938022 atagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaattta 50937923  T
Q  206 ttgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  50937922 ttgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaaaggaca 50937823  T
Q  306 a 306  Q
    |    
T  50937822 a 50937822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Original strand, 31086689 - 31086916
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  31086689 ccttttgaaaaaataatgggagttaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgat 31086788  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31086789 tgatttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaagaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 31086888  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||||| | |||||||||| |||||    
T  31086889 agcaaaaggattttataaaaagtgacaa 31086916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37589211 - 37588986
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  37589211 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggt 37589112  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37589111 tggtttatgttttcaacattccatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 37589013  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||| | ||| ||||||||||||||    
T  37589012 ag-aaaatgatctaataaaaagggacaa 37588986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8472308 - 8472093
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |  ||||||    
T  8472308 aaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga----tgatttatg 8472213  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaag 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  8472212 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaaatgtatagttaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 8472113  T
Q  287 ggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8472112 ggtcttataaaaagggacaa 8472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 303
Target Start/End: Original strand, 19792629 - 19792852
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  19792629 cccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagataaa--g 19792726  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19792727 atggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaa 19792826  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  19792827 tagaaaaggagtcttataaaaaggga 19792852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47069084 - 47068835
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  47069084 actccatccgtccctaattataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattattttta 47068985  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| || | |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47068984 caattttatccttaaa-agagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 47068886  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  47068885 aagaaataattaatgcagttagaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 47068835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 9700495 - 9700743
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  9700495 cctccgtccctatatacaagacctttttgccaaaatcacaggaattaagaaagtgagtatttgtattaaagttatttgtaatcactattgattttacaat 9700594  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9700595 tttatccttta-gaaagagagatagtttatattttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatatatgtaaaga 9700693  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| || |||||||||  ||   ||||||||||||||| ||||    
T  9700694 aataattaatttaattggaaataacaaggaggtcttataaaaaggaacaa 9700743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 306
Target Start/End: Original strand, 10383799 - 10384036
Alignment:
Q  70 atataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-a 168  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |    
T  10383799 atataagactctttttctaaaatcacggaaattaagaaagtggatatttatattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaaga 10383898  T
Q  169 gaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 268  Q
    || |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10383899 gagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattactaattgaagaaaaagatatataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgt 10383998  T
Q  269 agttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  10383999 agttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 10384036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22567361 - 22567113
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22567361 cctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacggaaattaagaaagtggatatttgtattatttttgtttgtaatcactattgtttttacaat 22567262  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||  || |||| |||  |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||    
T  22567261 tttattatt-aagagagagagttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtattataaatatggacatgtatgtaagga 22567163  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22567162 aataattaatatagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaaaagggacaa 22567113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 71 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3934884 - 3934606
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3934884 tataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgagtatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 3934785  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3934784 aagatggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggaacatgtatctaaacaaataattaatgtag 3934685  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3934684 ttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaaggggcaaaaaaattat-caaaaggatcttataattagggacggaggtagta 3934606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31465949 - 31465709
Alignment:
Q  66 ctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||| || ||||| || | || |||||||||||||||||||||    
T  31465949 ctatatataagactcttttgccaaaatcactggaattaagaaagtgaatatttgcattaaacttatttgttatcactaatgtttttacaattttatcctt 31465850  T
Q  166 taagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 265  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  31465849 taagagagatagttagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattaaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaggaatagttaa 31465750  T
Q  266 tgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| |||||||||  ||| || |||| |||||||| ||||    
T  31465749 tgtacttggaaataacaaagggatcttgtaaaaaggaacaa 31465709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 2489177 - 2489393
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  2489177 aaaataacgggaattaagataatgaacatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatg 2489274  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  2489275 ttttcaacatgttatttattgctgattgtaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataccaaaaag 2489374  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||    
T  2489375 ttcttataaaaagggacaa 2489393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14171826 - 14171610
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  14171826 actccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttta 14171727  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14171726 caattttatcctttaaaagagaa--ttggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 14171629  T
Q  253 aagaaataattaatgtagt 271  Q
    || ||||||||||||||||    
T  14171628 aaaaaataattaatgtagt 14171610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 305
Target Start/End: Original strand, 32149057 - 32149303
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32149057 tccgtctctatatacaagacctttttgtcaaaattacaggaattaagaaagtagatattttcattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattt 32149156  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    |||| ||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32149157 tatcttttaaaatagagagttagtttatgttttgaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtgaaataaatagaggcatgtatgtaaataaa 32149256  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||| |||||  || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  32149257 taataaatgtgcttagaaataacaaaagggtcttataaaaagtgaca 32149303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 9378876 - 9379096
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg--ttagttta 185  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |  |||||    
T  9378876 aaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagagtcggttta 9378975  T
Q  186 tgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaa 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  9378976 tgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataagtagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 9379075  T
Q  286 gggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  9379076 gagtcttataaaaagagacaa 9379096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 113 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15290171 - 15289978
Alignment:
Q  113 atatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 212  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15290171 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatattatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctga 15290072  T
Q  213 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  15290071 ttgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagtgacaa 15289978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26544754 - 26544548
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |  ||||||||||||||||    
T  26544754 gaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttatgagagaaa--tgatttatgttttcaacat 26544657  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||    
T  26544656 gttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataatttataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattgaaaatagaaaagaggtcttataaa 26544557  T
Q  298 aagggacaa 306  Q
    |||||||||    
T  26544556 aagggacaa 26544548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 280
Target Start/End: Original strand, 43395448 - 43395638
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  43395448 aaaataacggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatg 43395545  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43395546 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 43395638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Original strand, 45038128 - 45038355
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  45038128 cccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagaaagagag 45038227  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    || | | |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  45038228 ttggctaatgttttcaacattctatttattgctgattgaa-aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaa 45038326  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  45038327 tagaataggggtcttatagaaagggacaa 45038355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 38530896 - 38531143
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | || |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  38530896 cctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttttataat 38530995  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||  ||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  38530996 tttatcctttaagaggga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggtatgcatgtaaaga 38531093  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  38531094 aataattaatgtagttgaaaatagcaaagcgatcttataaaaagggacaa 38531143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Original strand, 51422202 - 51422465
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||    
T  51422202 aaaataacgcgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatgctttaagagagagggttggtttatg 51422301  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc--atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||     
T  51422302 ttttcaacatgttatttattgccgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaag 51422401  T
Q  286 gggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||| |||||||||||          ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51422402 gggtcttat-aaaagggacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattagggatgaaggtagta 51422465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 306
Target Start/End: Original strand, 32153546 - 32153787
Alignment:
Q  65 cctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 164  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  32153546 cctatatataagacatttttgtcaaaatcacggaaattaagaaagtaggtatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcct 32153645  T
Q  165 ttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 264  Q
    ||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |    
T  32153646 ttaagatggagagttagtttatgttttgaacatgttatttattgttgattgaagaaaataatgtgaaataaataagggtatgtatgtaaataaataataa 32153745  T
Q  265 atgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || || || ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32153746 atctatttagaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaa 32153787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 43668188 - 43668369
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||  |||||||||||||||||    
T  43668188 aattaagatagtggatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagaaaagattgatttatgttttcaacatg 43668287  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43668288 ttatttattgctgattgatgaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatag 43668369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47263731 - 47263499
Alignment:
Q  76 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  47263731 gacccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcc-ttaagattgag 47263633  T
Q  176 tgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaag----atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 271  Q
     |||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47263632 agttagtttatgtttttcatatgtta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 47263534  T
Q  272 tggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||||| ||| |  ||||||||||| ||||||    
T  47263533 tgaaaatagcaaatgaatcttataaaaaaggacaa 47263499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 280
Target Start/End: Original strand, 47296311 - 47296534
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  47296311 cctctgtccctatatctaagacctttttgtcaaaatcacgagaattaagataatcgatattggtattaaagatgtttgtaatcactattgttttcacaat 47296410  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt---gaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 253  Q
    ||| ||||||| || |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47296411 tttgtccttta-gagaga--ggtagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaa 47296507  T
Q  254 agaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  47296508 acaaataattaatgtagttggaaatag 47296534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25228452 - 25228285
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||    
T  25228452 acggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttca 25228353  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 261  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25228352 acattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 25228285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15616417 - 15616178
Alignment:
Q  68 atatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta 167  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |    
T  15616417 atatataagacatttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggataattatattaaagttgtttgtaatcatcattgtttttacaattttatctttaa 15616318  T
Q  168 -agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 265  Q
     ||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15616317 gagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattaaaggaaaaatatgtataaaaaataggggtatgtatgtaaagaaataattaa 15616218  T
Q  266 tgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    |||||||| |||||| |||  | ||||||||||| |||||    
T  15616217 tgtagttgaaaatagcaaattgatcttataaaaatggaca 15616178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47754618 - 47754431
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||   | ||||||||||     
T  47754618 cctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaatttagtgaatatttatattaaagttgtttgtaaataccgtcgtttttacaaa 47754519  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 244  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47754518 tttatcctttaagatagagagtttgtttatgttttcaacatactatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 47754431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 269
Target Start/End: Original strand, 896838 - 897008
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  896838 aattaagataattgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatg 896937  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  896938 ttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgcatgtaaacaaataattaatgta 897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 31635875 - 31636123
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  31635875 cctcggtccctaattataagacttttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaat 31635974  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgt--tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||| ||   |||  |||| ||||||||||| | || |  ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31635975 tttatccttaaa---agagagttaatttatgttttccatatatgctatttatggctaattgaagaaaaagatgtagaataaataggggcatgtatgtaaa 31636071  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  31636072 gaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagagacaa 31636123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 298
Target Start/End: Original strand, 46506209 - 46506398
Alignment:
Q  108 agtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttatt 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  46506209 agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctt-aagaaagagagttgatttatgttttccatatgatgtttatt 46506307  T
Q  208 gttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46506308 gctcattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaattaatatagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaa 46506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 51811138 - 51810956
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    |  ||||||    
T  51811138 aaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaggaatgatttatg 51811039  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51811038 ttttcaacatgttattgattgctgattgaagaaaaagatgtatagtaaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 51810956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4592857 - 4592625
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4592857 tataagatccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtagatatttgcattaatattgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctataaga 4592758  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||     
T  4592757 gatagagttagtttatgttttcaacatattatttattgctagttgaagaaaaagatgtataataaatatggacatgtatgtaaagtaatagttaatgtac 4592658  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||| |||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  4592657 ttgaaaatatcaaaggtgtcttataaaaaggga 4592625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34503488 - 34503282
Alignment:
Q  98 gaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 197  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||  | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||    
T  34503488 gaattaagatggtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgcttttataattttatcttttaagagagagggttggtttatgttttcaacat 34503389  T
Q  198 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaa 297  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |  |||||||||    
T  34503388 gttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaatgaatcttataaa 34503289  T
Q  298 aagggac 304  Q
    || ||||    
T  34503288 aaaggac 34503282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 300
Target Start/End: Original strand, 39873490 - 39873672
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  39873490 tgtattaaatatgtatgtaattattattgtttttccaattttatcctttaagagagagggttggtttatgtttttaacatattatttattgctgattgaa 39873589  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  39873590 gaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatatgtcttataaaaag 39873672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25271450 - 25271261
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||    | |||||||    
T  25271450 aaaataacgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttat--tttaagagagaggaatggtttatg 25271353  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25271352 ttatcaacatgttatt-attgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatag 25271261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25284099 - 25283918
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25284099 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 25284000  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    |||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25283999 tttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaata 25283918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38175163 - 38174920
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaa-gatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||  ||||| | || |||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38175163 tccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataatggaaattaaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttttacaatt 38175064  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 257  Q
    |||| |||| |||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  38175063 ttattctttgagag----tgttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaatgaaaagatgtataataaataagggcgtgtatgtaaa-aa 38174969  T
Q  258 ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38174968 ataattaatgtagttaaaaatagcaaaatagtcttataaaaagggacaa 38174920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 306
Target Start/End: Original strand, 47429166 - 47429380
Alignment:
Q  91 atcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttt 190  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||| || |||  |||||||||| ||     
T  47429166 atcacgagaactaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtagtcactattatttttacaattttattcttta-gagagagagttagtttatattc 47429264  T
Q  191 tcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtc 290  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  | ||    
T  47429265 tcaatatattatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatggggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatc 47429364  T
Q  291 ttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||    
T  47429365 ttataaaaagggacaa 47429380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10433583 - 10433369
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttat 186  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||   ||||| |||    
T  10433583 aaaatcacatgaattaagaaagtagatatttgtattaaatttgtttctaatcactattgtttttacaattttattcttaagagagagagaattagtatat 10433484  T
Q  187 gttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaag 286  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |    
T  10433483 attttcaacatgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataaataatgtagttggcaataacaaatg 10433384  T
Q  287 ggtcttataaaaagg 301  Q
     ||||||||||||||    
T  10433383 agtcttataaaaagg 10433369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 233
Target Start/End: Original strand, 44529419 - 44529593
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44529419 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 44529518  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat 233  Q
    |||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44529519 tttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaagatgtataat 44529593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 48023134 - 48022951
Alignment:
Q  121 attaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaa 220  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  48023134 attaaagttatttgtaattacaattgtttttataattttattctt-aagaaagtgagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgatttaagaa 48023036  T
Q  221 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||    
T  48023035 aaatatatataataaataggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaataccaaaatgatcttataaaaagggaca 48022951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Original strand, 43456451 - 43456612
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43456451 tattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgcaattttttgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 43456549  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||    
T  43456550 gcaggtatgtaaataaataactaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaacgggac 43456612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 306
Target Start/End: Original strand, 11352908 - 11353057
Alignment:
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  11352908 tttatcctttaagagagggagttagtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaat 11353007  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  11353008 aataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 11353057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27479890 - 27479647
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||| ||||  ||||||| ||| |||    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  27479890 cctccgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 27479791  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| ||||  ||   ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |    
T  27479790 tttatcctt-aagagggaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaa 27479692  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  27479691 aataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagg 27479647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26768611 - 26768429
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26768611 taaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagagaaagttagtgtatgttt-caacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 26768513  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||  ||| || |||||||||||| |||||    
T  26768512 agatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttagaaatacaaaagggatcttataaaaagagacaa 26768429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 39425637 - 39425823
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39425637 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 39425735  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||| |||| | |||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  39425736 aaaatgatgcaaaataaataagggtatgttggtaatgaaataatttatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggaacaa 39425823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Original strand, 39867542 - 39867649
Alignment:
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  39867542 ttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaa 39867641  T
Q  299 agggacaa 306  Q
    ||||||||    
T  39867642 agggacaa 39867649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49549231 - 49549045
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||     
T  49549231 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaa 49549133  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49549132 aaaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaa 49549045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 305
Target Start/End: Original strand, 2636993 - 2637178
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2636993 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 2637091  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2637092 aaaaaaatgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaataccaaaggggtcttataaaaagggaca 2637178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13698903 - 13698736
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13698903 cctccgtccctgtatataagacccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 13698804  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga 225  Q
    ||||| | |||||| |||  ||| ||||||||||||   ||  | ||||||| |||||||| |||||||    
T  13698803 tttattc-ttaagagagagagttggtttatgttttccttatactttttattgctgattgaaaaaaaaga 13698736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Original strand, 15302551 - 15302781
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  15302551 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 15302649  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnncca 318  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||          ||    
T  15302650 aaaaaaatacaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaatggtcttataaaaagggacaaattattttttca 15302749  T
Q  319 aaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15302750 aaaggatcttataattagggatggaggtagta 15302781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35945438 - 35945279
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35945438 gtattaaatttgtatgtaattattattgtttttataattttatcctt-aagaaagaaaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 35945340  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||||| | ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35945339 aaaaagatgcaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaata 35945279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30996973 - 30996788
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||   ||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30996973 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcctt-aagagagaggattaatttacgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 30996875  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||| | |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  30996874 aaaagatgcaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatggatcttataaaaagggacaa 30996788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Original strand, 44454602 - 44454736
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  44454602 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgattttacaattttatcctttaagagagatggatgatttatg 44454701  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44454702 ttttcaacatgttatttattgctgatagaagaaaa 44454736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 37850182 - 37850430
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||| ||||    
T  37850182 cctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtgtataattactattgtttttgcaat 37850281  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||  ||||| |    
T  37850282 tttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaaaa 37850380  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  37850381 aataattaatctatttggaaataccaaaagggtcttatgaaaaaggacaa 37850430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52429179 - 52428932
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||  ||||| | ||| | |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  52429179 cctccgtccctaaatataagagctttttgccaaaattgcggagattaataaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 52429080  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  52429079 tttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 52428982  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  52428981 aataattaatgtacttgaaaataccaaaagagccttataaaaagggacaa 52428932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27530905 - 27530803
Alignment:
Q  203 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  27530905 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag-caatgagtcttataaaaaggg 27530807  T
Q  303 acaa 306  Q
    ||||    
T  27530806 acaa 27530803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 51467280 - 51467465
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  51467280 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagggttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 51467378  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  51467379 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaataccaaaagggtgttataaaaagggacaa 51467465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Original strand, 51561764 - 51561871
Alignment:
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| | |||||||||||    
T  51561764 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaatgtgtcttataaaa 51561863  T
Q  299 agggacaa 306  Q
    | ||||||    
T  51561864 atggacaa 51561871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 240
Target Start/End: Original strand, 1837317 - 1837506
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||   ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1837317 cctccgtccctaattatatgactcttttataaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtcttaaatatgtttgtaattactattgcttttacaat 1837416  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatg------ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 240  Q
     |||||||| |||| |||  |      || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1837417 attatccttcaagagagagagagagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagg 1837506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17484024 - 17483733
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| | | | |    |||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  17484024 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatataattactattgattttacaat 17483925  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  17483924 tttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 17483827  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17483826 aataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagagacaaattattttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 17483733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18172561 - 18172377
Alignment:
Q  104 agatagtggatatctgtattaaagt-tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttat 202  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |   | |  |||||||||| ||||||||||    
T  18172561 agatagtggatatttatattaaattatgtttgtaattactgttgtttttacaattttatcctttaaga--gttggatgatttatgtttttaacatgttat 18172464  T
Q  203 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  18172463 ttatagttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg------------gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 18172377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Original strand, 32908286 - 32908379
Alignment:
Q  213 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  32908286 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaagggacaa 32908379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21290350 - 21290165
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||  || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |    
T  21290350 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagacaaagaat--taatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagg 21290253  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  21290252 aaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaa 21290165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43789949 - 43789698
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatt 157  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||   || ||||| |||| | ||| || |||||||||| ||| |    
T  43789949 ctccgtccctaaatataggacccttt-gccaaaatcacgggaattaagtaagttggtactagtgttaaatttgtatataagtactattgtttttccaaat 43789851  T
Q  158 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat-gt----tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||    
T  43789850 ttatcctc-aagagagagagttagtttatgttttcaacatagtacagtatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggta 43789752  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  43789751 atgaaataattaatgtaattggaactaccaaaggggtcttttaaaaagggacaa 43789698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4389839 - 4389653
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |    
T  4389839 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagg 4389741  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||| | |||||||| | | | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||  | |||||||||||| |||||    
T  4389740 aaaaagatgcaaaataaataagagtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaagagacaa 4389653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 306
Target Start/End: Original strand, 5854421 - 5854585
Alignment:
Q  140 agtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  5854421 agtattgtttttgcaattttatcctt--agagataaagttagtttatgttttcaacataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaatag 5854518  T
Q  240 gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||| |||   |||| |||||||| ||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  5854519 gggtatggtggtaacgaaataatcaatctaattggaaataccaaaagggtcttatataaagggacaa 5854585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 279
Target Start/End: Original strand, 23893505 - 23893663
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23893505 tattaaatttgtatataattaccattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 23893603  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23893604 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgcacttggaaata 23893663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35693357 - 35693112
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | | ||||   ||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  35693357 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaatttgataatggtaataaatttgtttgtaaatactattgtttttacaat 35693258  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatg--ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 254  Q
    ||||||||| |||| |||  |  ||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||  |||||    
T  35693257 tttatccttgaagagagagagagttattttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaaaaaaaagatgttgaataactaggggtatgttggtaaa 35693158  T
Q  255 gaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
     || ||||||||||  ||| |||||  ||| || ||||||||||||    
T  35693157 aaattaattaatgtgcttgaaaatatcaaagggatcttataaaaag 35693112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 272
Target Start/End: Original strand, 1197916 - 1198128
Alignment:
Q  62 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 161  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||||   ||||||||| | ||| ||| | |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  1197916 gtccctgtatataagattcttttaccaaaattgtgggaattaaaaaagttgatgtttgtattaaagctgtttataattgctattgtttttaaaattttat 1198015  T
Q  162 cctttaagaa--agaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 259  Q
    | |||||||   |||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   | | ||| ||||||||||    
T  1198016 cttttaagagggagagagttaatttatgtttttaacatgctatttattgttgattgaaaaaaaaaatgtatattaaataatagtacgtaggtaaagaaat 1198115  T
Q  260 aattaatgtagtt 272  Q
    |||||||||||||    
T  1198116 aattaatgtagtt 1198128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9424989 - 9424838
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||     
T  9424989 ttgtttataattaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagaattattttatgttttcaacataatatttaatgttgattgaagaaaaagata 9424890  T
Q  228 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    || ||||||||| || ||||  ||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  9424889 taaaataaatagaggtatgttggtaaaaaaagaattaatgtatttgaaaata 9424838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 350
Target Start/End: Original strand, 29437678 - 29437891
Alignment:
Q  136 aattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataa 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||  |||  |||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||    
T  29437678 aattactattgtttttacaattttatcctt-aatagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgaatgaagaaaaaaatgcaaaataa 29437776  T
Q  236 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataatta 335  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||          ||||||| |||||||||||    
T  29437777 ataagggtatgttggtaaagaaataattgatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataatta 29437876  T
Q  336 gggatggaggtagta 350  Q
    |||| ||||||||||    
T  29437877 gggacggaggtagta 29437891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31154509 - 31154351
Alignment:
Q  99 aattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 198  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||   || |||||||||||  | |||    
T  31154509 aattaagaaaatggatatttatattaaagttgtttttaatcactattgtttttacaattttatccttaaa-agagataattggtttatgtttttcatatg 31154411  T
Q  199 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31154410 ctatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgcaaagaaa 31154351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5858377 - 5858299
Alignment:
Q  228 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  5858377 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 5858299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 306
Target Start/End: Original strand, 39626985 - 39627229
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 160  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| | |    |||||||| || | | |||||| |||||||||||||||||||    
T  39626985 cgtccctaaatataggaaccttttgcaaaaattacggagattaagaaagtaggttgtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaatttta 39627084  T
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    ||||| |||| | |  |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| |  | ||||||||||||    
T  39627085 tcctt-aagagaaatagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtagatttgtaaagaaata 39627183  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||  ||| ||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  39627184 attagcgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaa 39627229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 306
Target Start/End: Original strand, 41619998 - 41620159
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  41619998 tattgtttttacaattttatc-tttaagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgcaaaataaataagg 41620094  T
Q  242 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||  |||    ||||||||||||||||||    
T  41620095 gtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttagaaataccaaataaatcttataaaaagggacaa 41620159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 51561075 - 51561188
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51561075 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 51561174  T
Q  157 tttatcctttaaga 170  Q
    ||||||||||||||    
T  51561175 tttatcctttaaga 51561188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 350
Target Start/End: Original strand, 39647664 - 39647830
Alignment:
Q  185 atgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaa 284  Q
    |||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39647664 atgttttctatatgttattcattgccgattgaagaaaaatatatgtaataaataggagtatgtatgtaaagaaatggttaatgtagttggaaatagtaaa 39647763  T
Q  285 agggtcttataaaaagggacaa-nnnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
     || |||||||||||| |||||          |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39647764 tggatcttataaaaagagacaattttttttctccaaaataatcttataattcgggatggaggtagta 39647830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Original strand, 4279951 - 4280164
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  || | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  4279951 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagcgagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa--tgtaaaata 4280047  T
Q  235 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataatt 334  Q
    |||| ||  | ||  |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||    
T  4280048 aataaggttaagttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaatggatcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatt 4280147  T
Q  335 agggatggaggtagtag 351  Q
    ||||| |||||||||||    
T  4280148 agggacggaggtagtag 4280164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50074632 - 50074454
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||  |||    
T  50074632 ttgtttgtagttgctattgtttttataattttatcctttgagagagagtgttattttatattttcaatatagtatttaatgttgatcgaagaaaacaatg 50074533  T
Q  228 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    || |||||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||   ||||||||||||| |||||    
T  50074532 taaaataaataggagtatgttggtaaagaattaattaatgtacttggaaataccaaagaagtcttataaaaagagacaa 50074454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 168
Target Start/End: Original strand, 32906742 - 32906822
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32906742 aaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 32906822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 303
Target Start/End: Original strand, 48363821 - 48364004
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||   | | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  48363821 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 48363919  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||  ||| |  ||| ||||||| ||||||||||    
T  48363920 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttaaaaacaccaaaggggtcttttaaaaaggga 48364004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19349357 - 19349254
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  19349357 tatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaatgggtcttataaaaa 19349258  T
Q  300 ggga 303  Q
    ||||    
T  19349257 ggga 19349254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27670071 - 27669894
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgttttt-acaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 217  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||   |||  |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  27670071 gtattaaatttgtatataattactattgttttttacaattttatccttaaa---agagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 27669975  T
Q  218 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
    |||||||||| | | ||||||  || ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| || ||||||||||    
T  27669974 gaaaaagatgcaaagtaaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaatatcaaagggatcttataaaa 27669894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 279
Target Start/End: Original strand, 31338946 - 31339112
Alignment:
Q  113 atatctgtattaaagttgtttgtaatt--agtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgtt 210  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  31338946 atatttgtattaaatttgtttgtaattgtattattgtttttacaatttcatcctttaaaagagagagtttgtttctgttttcaacatgctatttcttgtt 31339045  T
Q  211 gattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||  ||  |  | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31339046 gattaaagaaaaaaatttataataaataaagg--ttgaggtaaagaaataattaatgaagttgaaaata 31339112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26547797 - 26547681
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26547797 cctccgtccctaattatagggcccttttga-aaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 26547699  T
Q  157 tttatcctttaagaaaga 174  Q
    |||||| |||||||||||    
T  26547698 tttatcatttaagaaaga 26547681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38920530 - 38920317
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||  ||||||| ||| | |    |||||||| || | | |||||| |||||||||||    
T  38920530 actccctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttttatataattactattgttttta 38920431  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||| |||||| |||  || | ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||| ||| ||||  |||    
T  38920430 caattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaa--atgcaaaataaataagggtatgttggta 38920334  T
Q  253 aagaaataattaatgta 269  Q
    |||||||||||||||||    
T  38920333 aagaaataattaatgta 38920317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1427425 - 1427243
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1427425 taaatttgttggtaattactattggttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaa 1427327  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||  | |||||||||||| |||   || || || ||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  1427326 atatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataataagagacaa 1427243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8905604 - 8905490
Alignment:
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |   ||||||    
T  8905604 tttatcatttaagaaagagagttagtttatgtttttgacatgttatttattgctga-tgaagaaaaagatgtataataaatagggaaatatggataaaga 8905506  T
Q  257 aataattaatgtagtt 272  Q
    |||||||||| |||||    
T  8905505 aataattaatatagtt 8905490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Original strand, 44455529 - 44455616
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||    
T  44455529 aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaagagatcttataaaaaaggacaa 44455616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Original strand, 1867262 - 1867442
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  1867262 gtattaaatttgtatataagtactattggttttacaattttatcctt-aagaaatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaag 1867360  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  ||||   | ||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||| |||||||||    
T  1867361 aaaaaaatgtaaaataaataaggatatgttgataaaaaaaataattaatgtactcagaaatatcaaaagggtgttataaaaa 1867442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26544506 - 26544393
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  26544506 cctccgtctctaattataggacccttttgaaaacataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatatttgtaattattattgtttttacaat 26544407  T
Q  157 tttatcctttaaga 170  Q
    ||||| ||||||||    
T  26544406 tttattctttaaga 26544393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 279
Target Start/End: Original strand, 4371574 - 4371730
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  4371574 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatattttcaacataatacttattgttgattgagga 4371670  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    |||||||| | |||||||| ||  | ||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  4371671 aaaagatgcaaaataaataaggataggttggtaaataaataattaatgtacttgaaaata 4371730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 18114237 - 18114385
Alignment:
Q  78 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 177  Q
    ||||||||  ||||| |||| |||||||| ||| || |   ||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  18114237 cccttttggaaaaataacggaaattaagaaagttgaaaatggtaataaacttgtttgtaatttctattgtttttacaattttatcctttaagagagaggg 18114336  T
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagat 226  Q
    ||| | ||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  18114337 ttaatatatgttttcaatataatatttaatgctgattgaagaaaaagat 18114385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30761119 - 30761007
Alignment:
Q  128 ttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatg 227  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||     
T  30761119 ttgtttgtaattgctattgtttttacaattttattctttaagagaaagagttagtgtatgttttcaacatggtatttaatactgattgaagaaaaaaata 30761020  T
Q  228 tataataaatagg 240  Q
    || ||||||||||    
T  30761019 taaaataaatagg 30761007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 46271159 - 46271343
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||    
T  46271159 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattattgatagaag 46271257  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| ||| | ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||   ||||||||||||||||||    
T  46271258 aaaaa-atgcaaaataaata-agatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatcatcttataaaaagggacaa 46271343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38505948 - 38505843
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  38505948 tatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaatatcaaaggagtcttataaaaa 38505850  T
Q  300 gggacaa 306  Q
    || ||||    
T  38505849 ggaacaa 38505843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 279
Target Start/End: Original strand, 15624703 - 15624862
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg---aaga 219  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||  ||  |||||| |||||||||   || |    
T  15624703 taaatttgtttgtaattactattattttgataattttatcctttaagaaagagagttagtgtatgttgtcattatagtatttaatgttgattgaaaaaaa 15624802  T
Q  220 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  15624803 aaaagatataaaataaatagaggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaata 15624862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Original strand, 2606722 - 2606842
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg----ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |     |  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2606722 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttacgattttatcctttaagagagaaagagatatgctttatattttcaacatagtatttattgttgattg 2606821  T
Q  216 aagaaaaagatgtataataaat 237  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  2606822 aa-aaaaaaatgtaaaataaat 2606842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 300
Target Start/End: Original strand, 9411210 - 9411367
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatc-ctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 240  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| || | ||||| || |    
T  9411210 tattatttttacaattttatctctatgagaaaga--gttagtttatattttcaatatagtgtttattgttgattgaagaaaaagctgcaaaataattaag 9411307  T
Q  241 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaag 300  Q
    || || |  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  9411308 ggtatattggtaaagaaataattaatgtaattggaaatatcaaatgaatcttataaaaag 9411367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 266
Target Start/End: Original strand, 33163202 - 33163352
Alignment:
Q  118 tgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttattta-------ttgtt 210  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||   || |||  |||||||||||||||||||||  ||||||       ||| |    
T  33163202 tgtattaaagttatttgtaatcactattgtttatacaattttatcttt---gagaga--gttagtttatgttttcaacataatatttaatatatattgct 33163296  T
Q  211 gattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 266  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33163297 gattcaagaaaaaaatgtataataaataagggtatgtaggtaaagaaataattaat 33163352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 170
Target Start/End: Original strand, 8946397 - 8946500
Alignment:
Q  67 tatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 166  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  8946397 tatatagaagaatcttttgccaaaatgacggaaattaggaaagctgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttattcttt 8946496  T
Q  167 aaga 170  Q
    ||||    
T  8946497 aaga 8946500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 298
Target Start/End: Original strand, 6402670 - 6402847
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaatta---gtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg 215  Q
    |||||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||   |||||||||||||||||||  | || |||||||||||    
T  6402670 gtattaaattcgtttgtaattaatagtattgtttttacaattttatcatttgaga--gaac--tagtttatgttttcaacataatgttcattgttgattg 6402765  T
Q  216 aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaa 298  Q
     ||||||| ||||| ||||||| |||| || |  ||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||| | ||||||||||    
T  6402766 gagaaaaa-atgtaaaataaatcggggtatcttggtaaaaaaataattaatatagttgaaaatatcaaaatgatcttataaaa 6402847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45810204 - 45810116
Alignment:
Q  135 taattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  45810204 taattactattatttttacaattttatcctttaaaggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaa 45810116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 226
Target Start/End: Original strand, 22940566 - 22940733
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||   ||||||| |||||||||| ||| ||||   |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  22940566 cctccgtctctaattataggacccttttgatcaaatcacaggaattaagaaagttgatagtagtattaat-ttgtttgtaattactattgcttttacagt 22940664  T
Q  157 tttatcct-ttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagat 226  Q
    ||||| || || ||| || ||  |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22940665 tttattctcttcagagagtat--tagtttatgtttccaacataatatttattattgattgaagaaaaagat 22940733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10332415 - 10332310
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||| |    
T  10332415 tattaaatttatttgtaattattattatttttacaattttatcctttaaataagaaaataaatttatgtttttaacgtagtatttatagttgattgaaaa 10332316  T
Q  220 aaaaga 225  Q
    ||||||    
T  10332315 aaaaga 10332310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33337025 - 33336801
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  33337025 taaatttgttggtaattactattggttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatgttttcaatataatatttgatgttgattgaaaaaaa 33336929  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaag 322  Q
    | ||  | |||||||||||| |||   || || || ||||||||| | |||||||||  |||  |||||||||| ||| |||||          ||||||    
T  33336928 atatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaagaggtcttataataagagacaaaaaaaattctcaaaag 33336829  T
Q  323 aatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  33336828 aatcttatatttagagacggaggtagta 33336801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47754118 - 47754065
Alignment:
Q  250 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  47754118 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 47754065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27531034 - 27530946
Alignment:
Q  61 cgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttt 149  Q
    ||||||||||||||| | | ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27531034 cgtccctatatataatatcattttattaaaatcacgggaattaagaaagtagataattgtattaaagttatttgtaattactattgttt 27530946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5966799 - 5966685
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||| | | | ||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||    
T  5966799 taaagttgtttgtaatta-tattgcttttacaattttatcctttaagagagatgcttattgttttttttcaacatagtatttaacggtgatcgaagaaaa 5966701  T
Q  223 agatgtataataaata 238  Q
    |||| || ||||||||    
T  5966700 agatataaaataaata 5966685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 306
Target Start/End: Original strand, 44530546 - 44530601
Alignment:
Q  251 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  44530546 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaatggacaa 44530601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46084093 - 46083979
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||   ||  | ||||||||||||||  |||||| |  | |||||||||||    
T  46084093 taaatttgtttgtaattaatattgcttttacaattttatcttttaagcaagaggattcttgtatgttttcaacatagtatttaattcttattgaagaaaa 46083994  T
Q  223 agatgtataataaat 237  Q
    |||| || |||||||    
T  46083993 agatataaaataaat 46083979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13054857 - 13054800
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 238  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  13054857 gtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgtagaaaaagatgcaaaataaata 13054800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15907208 - 15907108
Alignment:
Q  205 attgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 304  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||  | ||  ||||||||||||||| |||| ||  |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  15907208 attgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataaggataagttggtaaagaaataattagtgtatttaaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 15907109  T
Q  305 a 305  Q
    |    
T  15907108 a 15907108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Original strand, 23932941 - 23932989
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23932941 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttataattttattctttaa 23932989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25227405 - 25227351
Alignment:
Q  252 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25227405 aaagaaataattaatatagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggcacaa 25227351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 43453329 - 43453402
Alignment:
Q  72 ataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtatt 145  Q
    ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43453329 ataagactcttttgctaaaactacgggaattaagaaagtgtgtatttgtattaatgttgtttgtaattactatt 43453402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 279
Target Start/End: Original strand, 35160218 - 35160278
Alignment:
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35160218 aaaaatatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 35160278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37000803 - 37000735
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 267  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37000803 tatttattgttgattgtccaaaaaagatgtaaaataattaggggtatgtttgtaaagaaataattaatg 37000735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 239
Target Start/End: Original strand, 10758451 - 10758545
Alignment:
Q  147 tttttacaattttatcctttaagaaagaatg--ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  10758451 tttttacaattttatcttttaagagagagggcgttaacttatgttttcaacataatatttaatgtcgatcgaagaaaaagatataaaataaatag 10758545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 25968424 - 25968512
Alignment:
Q  142 tattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtata 231  Q
    ||||||||||||||||||||  || | ||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  25968424 tattgtttttacaattttatttttaagagaaagaac--tagtttatgttttcaacgtgctatttattactagttgaagaaaaagatgtata 25968512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 52001573 - 52001530
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 162  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52001573 gtattaaatttgtttgtaattattattgtttttataattttatc 52001530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Original strand, 43589268 - 43589405
Alignment:
Q  161 tcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 260  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||||||||||  |  ||| || | | ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  43589268 tcctttaagagagagggttagtgtatgttttcaatgtagtatataatatagattgaagaaaaa-atataaaataaataggggtatgttagtaaagaatta 43589366  T
Q  261 attaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||| || |||||||||||    
T  43589367 attaatgtactgtgaaatatcaaagggttcttataaaaa 43589405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22177669 - 22177575
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg 215  Q
    |||||||| |||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||||    
T  22177669 gtattaaatttgttgataattgatattgtttttacaagtttatccttcaagagagaa--ttagtttatgttctccttatagtatttattgttgattg 22177575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Original strand, 3262958 - 3263058
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||  |||   ||||||||||||    
T  3262958 tatttaatgctgattgaagaaaaagatataaaataaagaaggatatgttggtaaagaattaattaatgtatttagaaataccaaagaagtcttataaaaa 3263057  T
Q  300 g 300  Q
    |    
T  3263058 g 3263058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6130216 - 6130120
Alignment:
Q  203 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||||| |   | ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  6130216 ttattgttgattgaagagaatgatgcaaaataaagaaatgtatgttggtaaaaaaataattaatgtaattggaaatatcaaaatagtcttataaaaa 6130120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15331015 - 15330967
Alignment:
Q  145 tgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  15331015 tgtttttacaattttatcatttaagagagatagttagtttatattttca 15330967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Original strand, 30073975 - 30074023
Alignment:
Q  58 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaaga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||    
T  30073975 ctccgtccctatatataagacccttttgataaaagcacaagaattaaga 30074023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 31427 - 31680
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31427 actccctccgttcctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 31526  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31527 caattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 31626  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31627 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 61593 - 61846
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  61593 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 61692  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61693 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaatatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 61792  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  61793 aagaaataattaatgtagttggaaataacataggggtcttataaaaagggacaa 61846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 6880 - 7133
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6880 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 6979  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 7079  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||    
T  7080 aagaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaatggacaa 7133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8514 - 8262
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  8514 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtnttta 8415  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8414 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatat-tataataaataggggcatgtatgta 8316  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  8315 aagaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaaaagggacaa 8262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 51422 - 51675
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  51422 actccctccgtccctatatataagacccttttgcgaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaccattgttttta 51521  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  51522 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatata 51621  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  51622 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaa 51675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 63 - 306
Target Start/End: Original strand, 258872 - 259115
Alignment:
Q  63 tccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  258872 tccctatatataagacccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc 258971  T
Q  163 ctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  258972 ctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 259071  T
Q  263 taatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||    
T  259072 taatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaagggacaa 259115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24623
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24372 actccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 24471  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24472 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc--gtatgta 24569  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||| |||||    
T  24570 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagcgacaa 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 273
Target Start/End: Original strand, 9494 - 9714
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9494 actccctccgttcctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 9593  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9594 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 9693  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttg 273  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9694 aagaaataattaatgtagttg 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 305
Target Start/End: Original strand, 14089 - 14340
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  14089 actccctcagttcctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgtaatcactattgttttta 14188  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14189 caattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgta 14288  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggaca 305  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  14289 aagaaataattaatgta-taggaaataacaaaggggtcttataaaaagggaca 14340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 94 - 306
Target Start/End: Original strand, 5067 - 5279
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5067 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttca 5166  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||    
T  5167 acatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtctta 5266  T
Q  294 taaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||    
T  5267 taaaaagggacaa 5279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 6356 - 6603
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6356 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 6455  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6456 tttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 6553  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6554 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18788 - 18540
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18788 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaat 18689  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18688 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgtaaaga 18590  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18589 aataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaa 18540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5441 - 5194
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5441 cctccgtcccta-atataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaat 5343  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5342 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgtaaaga 5244  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5243 aataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaa 5194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 9929 - 10176
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9929 cctccgtcccta-atataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaat 10027  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10028 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgtaaaga 10126  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10127 aataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaa 10176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47936 - 47684
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47936 actccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 47837  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47836 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 47738  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  47737 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaa 47684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 164505 - 164214
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  164505 cctccgtccctaattataggatcgttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 164406  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164405 tttattctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 164308  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||          ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  164307 aataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 164214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Original strand, 19705 - 19953
Alignment:
Q  59 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattt 158  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19705 tccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagaggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 19804  T
Q  159 tatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 258  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19805 tatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 19904  T
Q  259 taattaatgtagttggaaatagtaaaaggg-tcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19905 taattaatgtagttggaaatagaaaaagggatcttataaaaagggacaa 19953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 9171 - 9463
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9171 cctctgtccctaattataacacccttttga-aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 9269  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  |||   |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9270 tttatcctttaagaaagagggttgacttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 9369  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9370 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 9463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3730 - 3481
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3730 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 3631  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3630 tttatcctttaagaaagagggttggattatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatcggggcatgcatgtaaaga 3531  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3530 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 3481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12360 - 12108
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12360 actccctccgtccctaattataaaacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 12261  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12260 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgta 12162  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  12161 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 12108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45925 - 45715
Alignment:
Q  94 acgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttca 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||    
T  45925 acgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttca 45828  T
Q  194 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45827 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctta 45728  T
Q  294 taaaaagggacaa 306  Q
    |||||| ||||||    
T  45727 taaaaatggacaa 45715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 65379 - 65631
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  65379 actccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 65478  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    ||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65479 caattttatcctt-aagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgta 65577  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  65578 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaa 65631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 4409 - 4700
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| ||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4409 cctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattaatattgtttttacaat 4508  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4509 tttatcctttaagagaga--gatggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 4606  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4607 aataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggaggtagta 4700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0907 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0907
Description:

Target: scaffold0907; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 303
Target Start/End: Original strand, 4352 - 4565
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaaga-atgttagtttat 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||   ||||    
T  4352 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagagatgtt---ttat 4448  T
Q  187 gttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaag 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  4449 gttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaagg 4548  T
Q  287 ggtcttataaaaaggga 303  Q
    |||||||||||||||||    
T  4549 ggtcttataaaaaggga 4565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 3526 - 3776
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||    
T  3526 actccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactactgttttta 3625  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3626 caattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 3723  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3724 aagaaat-attaatatagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 3776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Original strand, 355043 - 355294
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttttta 152  Q
    |||||||||||| |||  |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  355043 actccctccgtctctaattataggaccattttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgttattactattgttttta 355142  T
Q  153 caattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  355143 caattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaggaaaattatgtataataaataggggcaagtatgta 355240  T
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  355241 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 355294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 92409 - 92307
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||  |||||||| || || ||||    
T  92409 gtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaagatcgaaagttaattaatgttttcaacataatatttattttttatcgaag 92310  T
Q  219 aaa 221  Q
    |||    
T  92309 aaa 92307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0883 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0883
Description:

Target: scaffold0883; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1982 - 1764
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |||||||    
T  1982 aaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatg 1883  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  1882 ttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggg 1783  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1782 gtcttataaaaagggacaa 1764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45775 - 45557
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |||||||    
T  45775 aaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatg 45676  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  45675 ttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggg 45576  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45575 gtcttataaaaagggacaa 45557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 94078 - 93829
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  94078 cctccatccctaattataaggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttacaat 93979  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  93978 tttaacctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaga 93879  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| | ||  |||||||||||||||    
T  93878 aataattaatgtagttgaaaataaaaaaggagttctataaaaagggacaa 93829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 103808 - 104098
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | | | ||||   |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  103808 cctccatccctaattataggaccattttgccaaaattacgggaattaaaaaaattgataatagtattaaatttgtttataattgctattgtttttacaat 103907  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||| |||| |  ||  |||||| | || ||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||| | | |||||||||| |||   |||||||    
T  103908 tttatcc-ttaaaagggagagttagtgtttggttt-aacataatatatattgttgattaaggaaaaagatgcaaattaaataggggtatggtggtaaaga 104005  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    |||| |||||||| ||| |||||  ||| |  |||||||||||| |||||         | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  104006 aatatttaatgtaattgaaaatatcaaaggtttcttataaaaagagacaaaaaaattctcaaaaag-atcttataattagggacggaggtagta 104098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 92647 - 92568
Alignment:
Q  145 tgtttttacaattttatcctttaagaaaga--atgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||  | ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  92647 tgtttttataattttatcctttaaaagagacaaagttcgtctatgtttttaacatgctatttattgttgattgaaaaaaa 92568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 71 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 118123 - 117846
Alignment:
Q  71 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga 170  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  118123 tataagactcttttgttaaaatcacgg-aattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aaga 118026  T
Q  171 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 270  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  118025 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtag 117926  T
Q  271 ttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  117925 ttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggaagta 117846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48946 - 48699
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48946 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgtttttacaat 48847  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    |||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  48846 tttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgtttgaagaaaaagatgtataattaataggagcatctatgtaaaga 48749  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  48748 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggtacaa 48699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 350
Target Start/End: Original strand, 311 - 581
Alignment:
Q  79 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 178  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  311 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtttttacaattttatcctttaagagagagaat 410  T
Q  179 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  411 taaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaag-aataattaatgtagttgaaaat 509  T
Q  279 agtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    || ||  ||||||||||||||| |||||          ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  510 agcaatggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaattcacaaaagagtcttataattaaggacggaggtagta 581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5021 - 4806
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||| ||    
T  5021 aaaataacgagagttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattt-atcctttaagagagagggttggtttttg 4923  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4922 ttt-caacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataa-taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 4825  T
Q  288 gtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||    
T  4824 atcttataaaaagggacaa 4806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4792 - 4724
Alignment:
Q  238 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4792 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa 4724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34395 - 34156
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  34395 cctccgtccctatatataaaacccttttgataaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaat 34296  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| | |   ||| |  ||||||||||||  | ||   |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34295 tttatccttaagg---gaaagagagtttatgtttttcatatcccatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 34199  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34198 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagaatcttataaaaa 34156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24462 - 24263
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||    
T  24462 gggaattaagttaatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaag-------gttggtttatgttttcaac 24370  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttata 295  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24369 atgttatatattggcgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgt----aaataaataatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata 24274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Original strand, 8407 - 8573
Alignment:
Q  139 tagtattgtttttacaattttatccttt-aagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8407 tagtattgtttttacaattttatccttttaagagaga--gttggtttatgttatcaacatgttacttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaat 8504  T
Q  238 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  8505 aagggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaattgtaaatgagtcttctaaaaaaggacaa 8573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 199
Target Start/End: Original strand, 13339 - 13450
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  13339 aaaataacgtgaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagagagaaggttggtttatg 13438  T
Q  188 ttttcaacatgt 199  Q
    ||||||||||||    
T  13439 ttttcaacatgt 13450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 140
Target Start/End: Original strand, 8082 - 8134
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaatta 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  8082 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 306
Target Start/End: Original strand, 1315 - 1440
Alignment:
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1315 gtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaatag 1414  T
Q  281 taaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
     ||| | |||| ||||||||||||||    
T  1415 caaaggagtctcataaaaagggacaa 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17756 - 17464
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||| || ||||| || | ||||||||||||  |||  ||||||| ||| |||    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17756 cctccgtccttaaatataggagcattttgccaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 17657  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  17656 tttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 17558  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaannnnnnnnnccaaaagaatcttataattagggatggaggtagta 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  17557 aataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaaggatcttataattagggacggagatagta 17464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 298
Target Start/End: Original strand, 32932 - 33148
Alignment:
Q  81 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgtta 180  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| ||| | ||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||  ||||    
T  32932 ttttgtcaaaatcgcggaaattaagaaagttggtatttctattaaagttctttgtaatcagtattgtttttacaattttatcctcaaa-agagatagtta 33030  T
Q  181 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 280  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  33031 gtttatgttttcaacaatatatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaataggggtatggcagtaaagaaataattaatgcagttagaaatac 33130  T
Q  281 taaaagggtcttataaaa 298  Q
     |||| ||||||||||||    
T  33131 caaaatggtcttataaaa 33148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22119 - 22031
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  22119 tattaaatttgtttgtaattattattatgtttacaattttatccttta--aaaga--gttagtttattttttaaacatagtatttattgttga 22031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 235
Target Start/End: Original strand, 40642 - 40789
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||| |||  |||  ||||||    
T  40642 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactcttatttttacaattttattctttaagagagagagttgatttatg 40741  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40742 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataa 40789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18616 - 18481
Alignment:
Q  88 aaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||    
T  18616 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagggggtttgtttatg 18517  T
Q  188 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 223  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18516 ttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaa 18481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18191 - 18134
Alignment:
Q  230 taataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagg 287  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18191 taataaatagtgacatctatataaaaaaataattaatgtagttgaaaatagtaaaagg 18134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 246747 - 246500
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||| |||   |    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  246747 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 246648  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||||||| || | |||  || | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  246647 tttatccttaaa-agagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaa-gcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 246550  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  246549 aataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaa 246500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 301
Target Start/End: Original strand, 156185 - 156391
Alignment:
Q  96 gggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 195  Q
    ||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||   ||||||||| ||||  |     
T  156185 gggaattaaaaaagtagatatttgtactaaagttttttgtaatcactattgtttttacaattttatcctg-aagagagagaattagtttatatttttcat 156283  T
Q  196 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa--ataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtctta 293  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||    
T  156284 atgctatttattactgattgaagaaaaatatgtataatgaatagggtcatctatgtaaagaaatataattaatgtggttgaaaataacaaacgggtctta 156383  T
Q  294 taaaaagg 301  Q
    ||||||||    
T  156384 taaaaagg 156391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 303
Target Start/End: Original strand, 9531 - 9656
Alignment:
Q  178 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 277  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9531 ttagtttatgttttccatatgctatttattgctgatataagaaaaatgtgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 9630  T
Q  278 tagtaaaagggtcttataaaaaggga 303  Q
    ||| |||   ||||||||||||||||    
T  9631 tagcaaagaagtcttataaaaaggga 9656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Original strand, 9030 - 9136
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  9030 cctccgtccctata--taagacccttttactaaaatcatgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 9127  T
Q  157 tttatcctt 165  Q
    |||||||||    
T  9128 tttatcctt 9136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 306
Target Start/End: Original strand, 11407 - 11652
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||||||| ||| ||||| || | ||||| |||||| ||||  ||||||| ||| |||    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  11407 cctccgtctctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 11506  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 256  Q
    ||||| ||| |||| || ||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |    
T  11507 tttatactt-aagagaggat--taatttatgttttcaacataatatttattgtt-attgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttagtaaata 11602  T
Q  257 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||||||||||| ||  |||||  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  11603 aataattaatgtacttaaaaataccaaaggggtcttataaaaagagacaa 11652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 36172 - 36356
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   | | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||     
T  36172 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaac 36270  T
Q  219 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    ||||  ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||   |||||||||||||||||||    
T  36271 aaaa--atgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggacaa 36356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 192
Target Start/End: Original strand, 13070 - 13204
Alignment:
Q  57 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaat 156  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13070 cctctgtctctatatataagacttttttgctaaaatcacggaaattaagaaagtaaatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 13169  T
Q  157 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttc 192  Q
    ||||| |||||||| |||   | |||||||||||||    
T  13170 tttat-ctttaagagagaggataagtttatgttttc 13204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 278
Target Start/End: Original strand, 5494 - 5640
Alignment:
Q  131 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtat 230  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||  |     
T  5494 tttgtaattactattgcttttacaatttcattctttaagagagagagttagtgtatatttttaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaagat-aaa 5592  T
Q  231 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 278  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||  || ||||||||    
T  5593 aataaataggggtatgttggtaaagaattaattaaattacttggaaat 5640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 59 - 6
Alignment:
Q  53 actccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaaga 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  59 actccctccgtccctaaatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaga 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 616
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||  |||||||| |||||| || ||  |||||||||||||| |||||    
T  733 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagaga--gttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaaga 636  T
Q  220 aaaagatgtataataaatag 239  Q
    |||  ||||| |||||||||    
T  635 aaacaatgtaaaataaatag 616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7197 - 7080
Alignment:
Q  120 tattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 219  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||  |||||||| |||||| || ||  |||||||||||||| |||||    
T  7197 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagaga--gttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaaga 7100  T
Q  220 aaaagatgtataataaatag 239  Q
    |||  ||||| |||||||||    
T  7099 aaacaatgtaaaataaatag 7080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 1953 - 2050
Alignment:
Q  131 tttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta--agaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagat 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||  |||||| ||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1953 tttgtaattactattgtttttacaattttattctttaagagagagagagttagtgtatatttttaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagat 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13781 - 13679
Alignment:
Q  119 gtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 218  Q
    |||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||  |||||||| || || ||||    
T  13781 gtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaagaccgaaagttaattaatgttttcaacataatatttattttttatcgaag 13682  T
Q  219 aaa 221  Q
    |||    
T  13681 aaa 13679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2116 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2116
Description:

Target: scaffold2116; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 306
Target Start/End: Original strand, 1 - 54
Alignment:
Q  253 aagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  1 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Original strand, 18484 - 18590
Alignment:
Q  200 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaa 299  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||  |||||   |||||||||||||||||    
T  18484 tatttatagttgattgacgaaaaagatacaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatgtaattcaaaatatcgaaagggtcttataaaaa 18583  T
Q  300 gggacaa 306  Q
     ||||||    
T  18584 aggacaa 18590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Original strand, 531 - 640
Alignment:
Q  81 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agaaagaatgtt 179  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| ||||   |||||||| || | | |||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||    
T  531 ttttgccaaaattaccgaaattaagatagttgatagtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaattttgtccttaagagaaagatagtt 630  T
Q  180 agtttatgtt 189  Q
    ||||||||||    
T  631 agtttatgtt 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47382 - 47226
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||  |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||| ||  |||||| || || ||||||||||    
T  47382 taaatttgtttgtaatcgctattgtttttacccttttattctttaagagagtgagttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctggttgaagaaaa 47283  T
Q  223 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 279  Q
    | ||  | |||||||||| | ||||  |||||||| |||| |||||| ||| |||||    
T  47282 aaataaaaaataaataggagtatgttggtaaagaattaataaatgtacttgaaaata 47226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 56151 - 56051
Alignment:
Q  123 taaagttgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 222  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||| ||  |||||| || || ||||||||||    
T  56151 taaatttgtttgtaatcgctattgtttttacacttttattctttaagagagtgggttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctggttgaagaaaa 56052  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  56051 a 56051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 149
Target Start/End: Original strand, 17502 - 17554
Alignment:
Q  97 ggaattaagatagtggatatctgtattaaagttgtttgtaattagtattgttt 149  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17502 ggaattaagaaaatggatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgttt 17554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University