View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12819_high_1 (Length: 922)

Name: NF12819_high_1
Description: NF12819
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12819_high_1
NF12819_high_1
[»] chr4 (187 HSPs)
chr4 (241-922)||(49063998-49064678)
chr4 (387-922)||(51427845-51428380)
chr4 (398-922)||(21711549-21712073)
chr4 (241-922)||(14330203-14330882)
chr4 (398-921)||(39588949-39589471)
chr4 (398-922)||(37866425-37866950)
chr4 (402-921)||(46816192-46816710)
chr4 (398-922)||(28082257-28082779)
chr4 (398-890)||(27759378-27759871)
chr4 (398-921)||(1042769-1043291)
chr4 (398-922)||(25762617-25763142)
chr4 (407-922)||(51027439-51027955)
chr4 (418-922)||(31824312-31824817)
chr4 (398-922)||(20901339-20901856)
chr4 (497-922)||(33163307-33163732)
chr4 (398-920)||(45939546-45940069)
chr4 (398-922)||(21016842-21017365)
chr4 (385-922)||(242088-242604)
chr4 (398-922)||(56138929-56139452)
chr4 (398-922)||(6176980-6177503)
chr4 (394-922)||(41794223-41794750)
chr4 (398-922)||(55796762-55797285)
chr4 (398-922)||(40353438-40353961)
chr4 (398-922)||(49094764-49095287)
chr4 (558-920)||(1226180-1226541)
chr4 (551-921)||(9489699-9490067)
chr4 (387-922)||(34529449-34529984)
chr4 (387-922)||(22436930-22437465)
chr4 (316-922)||(4785006-4785610)
chr4 (663-922)||(32937833-32938090)
chr4 (387-921)||(957108-957642)
chr4 (664-922)||(20778800-20779057)
chr4 (387-920)||(21169472-21170005)
chr4 (387-922)||(34152939-34153474)
chr4 (497-922)||(17211285-17211708)
chr4 (387-922)||(49423410-49423946)
chr4 (370-920)||(42886284-42886837)
chr4 (387-922)||(49791589-49792124)
chr4 (661-922)||(47657281-47657543)
chr4 (663-922)||(43889427-43889687)
chr4 (371-921)||(49817280-49817831)
chr4 (390-922)||(36776175-36776707)
chr4 (497-922)||(18412614-18413034)
chr4 (732-922)||(6282321-6282511)
chr4 (387-920)||(2773030-2773563)
chr4 (663-920)||(24606773-24607028)
chr4 (661-921)||(44560106-44560367)
chr4 (735-920)||(26591686-26591871)
chr4 (663-921)||(31324194-31324451)
chr4 (695-920)||(3393325-3393549)
chr4 (673-921)||(11288315-11288559)
chr4 (695-922)||(10312291-10312517)
chr4 (393-724)||(1042966-1043296)
chr4 (398-724)||(39589151-39589476)
chr4 (687-922)||(13866282-13866516)
chr4 (401-504)||(38132786-38132889)
chr4 (694-922)||(13850768-13850995)
chr4 (427-724)||(45939778-45940074)
chr4 (398-724)||(21711752-21712078)
chr4 (395-617)||(24607051-24607274)
chr4 (398-724)||(28082460-28082784)
chr4 (398-518)||(9489900-9490021)
chr4 (401-724)||(27759552-27759876)
chr4 (241-338)||(21170140-21170237)
chr4 (385-451)||(43889152-43889218)
chr4 (241-338)||(51427612-51427709)
chr4 (497-818)||(49816964-49817281)
chr4 (241-338)||(22437601-22437698)
chr4 (487-723)||(20901335-20901570)
chr4 (398-724)||(46816183-46816510)
chr4 (398-719)||(49064201-49064523)
chr4 (398-717)||(51427858-51428177)
chr4 (241-338)||(2773699-2773796)
chr4 (241-338)||(6281925-6282022)
chr4 (241-348)||(241847-241954)
chr4 (516-618)||(10312589-10312692)
chr4 (255-338)||(37867195-37867278)
chr4 (387-463)||(49571587-49571663)
chr4 (398-719)||(14330358-14330679)
chr4 (241-328)||(42886969-42887056)
chr4 (255-338)||(45940227-45940310)
chr4 (389-451)||(26591570-26591632)
chr4 (261-338)||(1043455-1043532)
chr4 (241-338)||(4784791-4784888)
chr4 (241-338)||(6176739-6176836)
chr4 (688-797)||(17292106-17292214)
chr4 (241-338)||(21016601-21016698)
chr4 (398-724)||(25762820-25763147)
chr4 (392-469)||(34152702-34152779)
chr4 (241-338)||(34152707-34152804)
chr4 (241-338)||(49791356-49791453)
chr4 (392-618)||(24607375-24607602)
chr4 (255-338)||(9490182-9490265)
chr4 (255-338)||(40353197-40353280)
chr4 (241-328)||(46815957-46816044)
chr4 (255-338)||(49095445-49095528)
chr4 (418-472)||(1226547-1226601)
chr4 (497-626)||(3393613-3393743)
chr4 (270-338)||(956875-956943)
chr4 (395-470)||(17211760-17211836)
chr4 (140-208)||(31823316-31823384)
chr4 (398-539)||(33163387-33163529)
chr4 (270-338)||(36775939-36776007)
chr4 (398-539)||(37866629-37866771)
chr4 (246-338)||(49423177-49423269)
chr4 (255-346)||(6176893-6176982)
chr4 (255-346)||(21016755-21016844)
chr4 (262-369)||(21169644-21169749)
chr4 (275-338)||(27760049-27760112)
chr4 (255-338)||(28082937-28083020)
chr4 (398-706)||(31824305-31824614)
chr4 (255-338)||(34529216-34529299)
chr4 (255-338)||(56139610-56139693)
chr4 (252-334)||(44559752-44559834)
chr4 (261-338)||(885514-885591)
chr4 (398-545)||(1226381-1226527)
chr4 (392-469)||(21170165-21170242)
chr4 (694-839)||(23124486-23124630)
chr4 (600-724)||(37866833-37866955)
chr4 (261-310)||(47870801-47870850)
chr4 (392-465)||(51027235-51027307)
chr4 (399-549)||(51027601-51027751)
chr4 (392-469)||(51427607-51427684)
chr4 (489-596)||(32937356-32937464)
chr4 (282-338)||(49817306-49817362)
chr4 (689-724)||(885320-885355)
chr4 (421-539)||(6177161-6177278)
chr4 (392-463)||(14289858-14289929)
chr4 (140-208)||(21712817-21712887)
chr4 (263-338)||(25763280-25763355)
chr4 (497-576)||(32937688-32937767)
chr4 (392-463)||(37867212-37867283)
chr4 (613-724)||(38132778-38132887)
chr4 (314-369)||(43889458-43889513)
chr4 (246-301)||(49064726-49064781)
chr4 (241-336)||(49423317-49423410)
chr4 (421-539)||(56139154-56139271)
chr4 (241-299)||(21170039-21170097)
chr4 (270-344)||(21712246-21712320)
chr4 (284-334)||(31824114-31824164)
chr4 (398-472)||(55796965-55797037)
chr4 (392-469)||(6281920-6281997)
chr4 (241-338)||(14330063-14330160)
chr4 (556-616)||(20778714-20778775)
chr4 (140-225)||(27760778-27760863)
chr4 (241-338)||(43888921-43889018)
chr4 (562-618)||(44560008-44560065)
chr4 (261-346)||(49095285-49095368)
chr4 (392-469)||(49423172-49423249)
chr4 (241-338)||(49571799-49571896)
chr4 (392-469)||(49791351-49791428)
chr4 (392-448)||(1043481-1043537)
chr4 (392-448)||(9490214-9490270)
chr4 (140-208)||(32936058-32936126)
chr4 (314-370)||(36776478-36776534)
chr4 (613-712)||(51027437-51027535)
chr4 (261-337)||(55797292-55797366)
chr4 (392-463)||(956870-956941)
chr4 (314-369)||(957414-957469)
chr4 (392-447)||(4784786-4784841)
chr4 (392-463)||(14330058-14330129)
chr4 (392-463)||(36775934-36776005)
chr4 (421-472)||(41794475-41794525)
chr4 (392-447)||(43888916-43888971)
chr4 (314-369)||(44560139-44560194)
chr4 (421-472)||(49094989-49095039)
chr4 (689-724)||(56139422-56139457)
chr4 (394-457)||(56139633-56139696)
chr4 (398-472)||(21017090-21017162)
chr4 (395-453)||(21169673-21169729)
chr4 (179-225)||(28797186-28797232)
chr4 (399-457)||(32937590-32937648)
chr4 (666-719)||(34152950-34153003)
chr4 (179-225)||(38131840-38131886)
chr4 (241-299)||(42886868-42886926)
chr4 (179-225)||(47043458-47043504)
chr4 (395-453)||(49423686-49423743)
chr4 (680-717)||(2773514-2773550)
chr4 (686-715)||(3393807-3393836)
chr4 (241-338)||(14289863-14289960)
chr4 (241-338)||(20901128-20901224)
chr4 (262-335)||(26591581-26591654)
chr4 (392-465)||(27760044-27760117)
chr4 (261-346)||(40353357-40353440)
chr4 (269-338)||(42886741-42886810)
chr4 (418-463)||(42887000-42887045)
chr4 (392-469)||(44559743-44559820)
[»] chr5 (134 HSPs)
chr5 (241-824)||(7082337-7082918)
chr5 (387-922)||(11346727-11347260)
chr5 (398-922)||(3601359-3601884)
chr5 (398-922)||(30709616-30710138)
chr5 (398-922)||(1971383-1971908)
chr5 (398-922)||(19400381-19400906)
chr5 (398-922)||(8537972-8538494)
chr5 (398-922)||(38854176-38854697)
chr5 (398-922)||(6895-7418)
chr5 (398-922)||(8575807-8576330)
chr5 (398-922)||(19036340-19036863)
chr5 (398-922)||(28881009-28881531)
chr5 (398-921)||(27661043-27661565)
chr5 (402-790)||(3458940-3459329)
chr5 (398-709)||(3169766-3170076)
chr5 (398-727)||(40011830-40012159)
chr5 (407-807)||(22283704-22284102)
chr5 (387-922)||(1399959-1400491)
chr5 (695-922)||(11027795-11028022)
chr5 (696-922)||(541598-541824)
chr5 (387-922)||(35565290-35565824)
chr5 (390-922)||(18308278-18308809)
chr5 (387-922)||(4723728-4724263)
chr5 (387-870)||(1694859-1695343)
chr5 (722-922)||(40009546-40009746)
chr5 (735-922)||(6793388-6793575)
chr5 (729-920)||(33370674-33370865)
chr5 (735-922)||(36350316-36350494)
chr5 (241-471)||(1171616-1171833)
chr5 (766-920)||(35927470-35927624)
chr5 (783-922)||(3169622-3169760)
chr5 (387-618)||(36349979-36350211)
chr5 (400-624)||(10398105-10398330)
chr5 (398-724)||(19400584-19400911)
chr5 (732-920)||(17366735-17366923)
chr5 (398-724)||(1971586-1971913)
chr5 (398-717)||(11346930-11347247)
chr5 (241-338)||(7082961-7083058)
chr5 (398-724)||(40011838-40012164)
chr5 (241-338)||(25498771-25498868)
chr5 (398-724)||(8538175-8538499)
chr5 (398-724)||(30709819-30710143)
chr5 (395-618)||(12743007-12743232)
chr5 (395-618)||(12805825-12806050)
chr5 (400-626)||(17366398-17366625)
chr5 (398-618)||(33370950-33371171)
chr5 (241-338)||(1171876-1171973)
chr5 (398-727)||(3601562-3601892)
chr5 (395-612)||(12806168-12806386)
chr5 (140-223)||(6427646-6427729)
chr5 (687-797)||(17195314-17195423)
chr5 (421-539)||(38854400-38854518)
chr5 (772-922)||(2599237-2599387)
chr5 (687-839)||(18920835-18920986)
chr5 (244-338)||(1399726-1399820)
chr5 (427-724)||(3169786-3170081)
chr5 (241-338)||(4723495-4723592)
chr5 (241-338)||(35565960-35566057)
chr5 (387-451)||(6793130-6793194)
chr5 (387-451)||(20196567-20196631)
chr5 (835-922)||(3458854-3458941)
chr5 (255-338)||(38854856-38854939)
chr5 (394-626)||(33371267-33371500)
chr5 (241-338)||(1695479-1695576)
chr5 (398-724)||(3459011-3459338)
chr5 (241-338)||(11028135-11028232)
chr5 (729-794)||(12742818-12742883)
chr5 (255-340)||(27660800-27660885)
chr5 (398-652)||(7082442-7082697)
chr5 (282-345)||(10398277-10398340)
chr5 (255-346)||(30710136-30710225)
chr5 (385-451)||(34683577-34683644)
chr5 (244-338)||(3602035-3602129)
chr5 (241-346)||(1972052-1972156)
chr5 (140-225)||(7083607-7083691)
chr5 (516-612)||(12743349-12743445)
chr5 (241-346)||(19036239-19036342)
chr5 (261-334)||(22284275-22284348)
chr5 (249-338)||(28881683-28881772)
chr5 (241-338)||(34683346-34683443)
chr5 (392-469)||(36349739-36349816)
chr5 (262-369)||(4723984-4724089)
chr5 (392-463)||(6792892-6792963)
chr5 (255-338)||(8575566-8575649)
chr5 (255-338)||(11347410-11347493)
chr5 (255-346)||(28881529-28881618)
chr5 (392-463)||(35565991-35566062)
chr5 (261-344)||(40012323-40012406)
chr5 (687-797)||(36311900-36312009)
chr5 (244-338)||(36349744-36349838)
chr5 (392-469)||(1399721-1399798)
chr5 (241-338)||(3459477-3459574)
chr5 (241-338)||(6792897-6792994)
chr5 (729-794)||(12805636-12805701)
chr5 (392-469)||(25498796-25498873)
chr5 (261-346)||(38854695-38854779)
chr5 (866-922)||(1693399-1693455)
chr5 (244-336)||(4723638-4723728)
chr5 (664-727)||(33371116-33371179)
chr5 (241-336)||(1399866-1399959)
chr5 (392-463)||(1695510-1695581)
chr5 (255-346)||(8575720-8575809)
chr5 (421-539)||(19036521-19036638)
chr5 (241-336)||(25498635-25498728)
chr5 (259-346)||(27660960-27661045)
chr5 (255-338)||(30710296-30710379)
chr5 (394-461)||(30710315-30710382)
chr5 (241-336)||(35565824-35565917)
chr5 (598-724)||(38854578-38854702)
chr5 (398-472)||(7143-7215)
chr5 (398-472)||(8576055-8576127)
chr5 (284-338)||(18308991-18309045)
chr5 (398-472)||(22283792-22283864)
chr5 (398-472)||(27661291-27661363)
chr5 (422-539)||(28881235-28881351)
chr5 (392-454)||(34683341-34683403)
chr5 (392-453)||(7083002-7083063)
chr5 (265-338)||(8538608-8538681)
chr5 (255-336)||(11347260-11347339)
chr5 (666-719)||(18308749-18308801)
chr5 (394-451)||(28881718-28881775)
chr5 (140-225)||(40016821-40016906)
chr5 (140-225)||(22706237-22706324)
chr5 (140-213)||(39223269-39223341)
chr5 (314-369)||(1694981-1695036)
chr5 (282-345)||(17366388-17366451)
chr5 (744-839)||(19748169-19748263)
chr5 (252-338)||(6654-6740)
chr5 (392-462)||(4723490-4723560)
chr5 (316-346)||(12805718-12805748)
chr5 (284-338)||(20196810-20196863)
chr5 (179-208)||(4846428-4846457)
chr5 (529-578)||(20196726-20196775)
chr5 (421-462)||(35565517-35565557)
[»] chr3 (190 HSPs)
chr3 (398-922)||(24701934-24702457)
chr3 (398-922)||(13895532-13896056)
chr3 (398-922)||(44927496-44928020)
chr3 (398-921)||(34692952-34693475)
chr3 (398-922)||(39416609-39417134)
chr3 (398-920)||(44835149-44835671)
chr3 (398-921)||(42383085-42383608)
chr3 (314-922)||(37281485-37282094)
chr3 (398-922)||(25576253-25576777)
chr3 (479-922)||(48087295-48087738)
chr3 (472-920)||(19452965-19453413)
chr3 (398-921)||(47065721-47066243)
chr3 (398-922)||(49218398-49218922)
chr3 (454-922)||(43477090-43477557)
chr3 (255-922)||(36720909-36721575)
chr3 (398-922)||(2646539-2647062)
chr3 (398-922)||(49139717-49140240)
chr3 (398-922)||(4003750-4004273)
chr3 (398-922)||(54390475-54390998)
chr3 (398-920)||(3494692-3495213)
chr3 (398-922)||(2268157-2268680)
chr3 (398-922)||(34049760-34050283)
chr3 (398-922)||(36135041-36135563)
chr3 (398-922)||(46403036-46403559)
chr3 (398-890)||(50997453-50997944)
chr3 (524-922)||(42949808-42950206)
chr3 (435-920)||(774041-774522)
chr3 (642-922)||(53826602-53826882)
chr3 (387-922)||(34471727-34472262)
chr3 (387-922)||(51015310-51015845)
chr3 (370-922)||(46413968-46414520)
chr3 (387-922)||(30192571-30193106)
chr3 (389-922)||(55206537-55207070)
chr3 (389-922)||(41577939-41578471)
chr3 (696-920)||(49610524-49610748)
chr3 (395-922)||(6464005-6464531)
chr3 (395-922)||(8633024-8633545)
chr3 (387-922)||(2428520-2429055)
chr3 (697-921)||(42382305-42382529)
chr3 (387-912)||(42323041-42323565)
chr3 (395-922)||(6754237-6754763)
chr3 (387-922)||(7246127-7246662)
chr3 (553-922)||(51013095-51013464)
chr3 (398-593)||(11378639-11378835)
chr3 (529-922)||(43569943-43570336)
chr3 (735-922)||(45100464-45100651)
chr3 (241-617)||(34646773-34647149)
chr3 (696-922)||(51695566-51695792)
chr3 (387-922)||(52569060-52569594)
chr3 (387-856)||(46346263-46346732)
chr3 (735-921)||(34647266-34647452)
chr3 (395-922)||(41803935-41804462)
chr3 (425-919)||(7954239-7954734)
chr3 (735-922)||(14631478-14631665)
chr3 (735-922)||(10053274-10053457)
chr3 (497-922)||(20375646-20376068)
chr3 (735-921)||(47759890-47760076)
chr3 (735-922)||(49273432-49273619)
chr3 (497-920)||(33448916-33449323)
chr3 (735-913)||(50458690-50458868)
chr3 (497-824)||(18440876-18441200)
chr3 (497-824)||(19485950-19486274)
chr3 (729-921)||(27186982-27187174)
chr3 (398-724)||(24701929-24702255)
chr3 (398-724)||(44835144-44835470)
chr3 (396-922)||(25887271-25887796)
chr3 (398-724)||(13895527-13895853)
chr3 (398-724)||(42383287-42383613)
chr3 (398-721)||(49218396-49218719)
chr3 (387-473)||(19452798-19452884)
chr3 (398-652)||(43477293-43477547)
chr3 (398-724)||(25576248-25576575)
chr3 (392-721)||(27187550-27187876)
chr3 (398-724)||(34692947-34693273)
chr3 (245-338)||(45099893-45099986)
chr3 (427-724)||(44927729-44928025)
chr3 (694-922)||(14265441-14265665)
chr3 (389-451)||(49273907-49273969)
chr3 (243-345)||(51012698-51012800)
chr3 (241-338)||(34646633-34646730)
chr3 (255-338)||(13895304-13895387)
chr3 (474-719)||(37281764-37282010)
chr3 (387-451)||(14631949-14632013)
chr3 (398-539)||(19453070-19453212)
chr3 (387-451)||(45100126-45100190)
chr3 (598-724)||(11378634-11378759)
chr3 (241-344)||(42383752-42383855)
chr3 (255-338)||(51695355-51695438)
chr3 (398-639)||(48087293-48087535)
chr3 (241-338)||(34471494-34471591)
chr3 (241-334)||(43570564-43570657)
chr3 (241-334)||(46413743-46413836)
chr3 (241-334)||(51015973-51016066)
chr3 (241-338)||(54391142-54391239)
chr3 (241-337)||(14632149-14632245)
chr3 (255-338)||(2646298-2646381)
chr3 (487-724)||(39416604-39416839)
chr3 (255-338)||(44928178-44928261)
chr3 (241-336)||(45100033-45100126)
chr3 (606-724)||(47066133-47066248)
chr3 (244-338)||(2429194-2429288)
chr3 (599-716)||(36721053-36721169)
chr3 (252-338)||(53826441-53826527)
chr3 (255-337)||(55206303-55206385)
chr3 (261-338)||(11378398-11378475)
chr3 (241-338)||(34050427-34050524)
chr3 (244-337)||(36720756-36720849)
chr3 (140-225)||(39415710-39415795)
chr3 (261-338)||(46405725-46405802)
chr3 (241-338)||(49139476-49139573)
chr3 (241-338)||(50998088-50998185)
chr3 (387-448)||(51012938-51012999)
chr3 (392-469)||(51015998-51016075)
chr3 (241-338)||(52568831-52568928)
chr3 (387-451)||(10053037-10053101)
chr3 (858-922)||(15637057-15637121)
chr3 (288-344)||(42949656-42949712)
chr3 (284-344)||(44834902-44834962)
chr3 (255-338)||(2267916-2267999)
chr3 (255-346)||(2646452-2646541)
chr3 (259-346)||(3494609-3494694)
chr3 (255-346)||(34050281-34050370)
chr3 (241-336)||(43477739-43477834)
chr3 (255-346)||(46403557-46403646)
chr3 (255-346)||(49139630-49139719)
chr3 (255-346)||(54390996-54391085)
chr3 (275-338)||(55268479-55268542)
chr3 (398-539)||(4003931-4004070)
chr3 (244-338)||(30193237-30193331)
chr3 (398-539)||(34049963-34050102)
chr3 (241-347)||(42322807-42322913)
chr3 (398-539)||(49139898-49140037)
chr3 (398-539)||(54390678-54390817)
chr3 (282-336)||(55268660-55268713)
chr3 (249-338)||(3494451-3494540)
chr3 (663-719)||(25887273-25887330)
chr3 (287-344)||(47066433-47066490)
chr3 (398-724)||(2268152-2268477)
chr3 (270-338)||(10052804-10052872)
chr3 (598-724)||(50997823-50997949)
chr3 (392-463)||(34471489-34471560)
chr3 (255-338)||(36135721-36135804)
chr3 (421-539)||(46403261-46403378)
chr3 (255-338)||(49218157-49218240)
chr3 (497-618)||(7954988-7955110)
chr3 (642-708)||(11378843-11378909)
chr3 (673-719)||(15637226-15637271)
chr3 (497-626)||(15637316-15637445)
chr3 (398-472)||(36135243-36135315)
chr3 (288-338)||(39416368-39416418)
chr3 (666-719)||(41578409-41578462)
chr3 (284-338)||(41578652-41578706)
chr3 (241-338)||(19452565-19452662)
chr3 (392-469)||(43570589-43570666)
chr3 (392-469)||(45099888-45099965)
chr3 (241-338)||(46346030-46346127)
chr3 (277-338)||(49274143-49274203)
chr3 (262-338)||(7246576-7246652)
chr3 (387-451)||(43570414-43570478)
chr3 (392-448)||(51695350-51695406)
chr3 (394-457)||(2267913-2267976)
chr3 (255-346)||(4003663-4003752)
chr3 (314-369)||(7954411-7954466)
chr3 (504-618)||(8632809-8632924)
chr3 (255-338)||(24701693-24701776)
chr3 (283-338)||(27187816-27187871)
chr3 (314-369)||(34647224-34647279)
chr3 (314-369)||(42323346-42323401)
chr3 (398-539)||(42949861-42950003)
chr3 (314-369)||(51013235-51013290)
chr3 (389-432)||(55268715-55268758)
chr3 (283-346)||(774270-774331)
chr3 (689-719)||(2429014-2429044)
chr3 (398-472)||(3494940-3495012)
chr3 (689-719)||(7246621-7246651)
chr3 (284-338)||(7246841-7246894)
chr3 (666-719)||(14631949-14632002)
chr3 (664-717)||(19452811-19452864)
chr3 (398-472)||(50997624-50997696)
chr3 (394-448)||(50998134-50998188)
chr3 (394-447)||(3494448-3494501)
chr3 (261-338)||(34692711-34692788)
chr3 (392-453)||(36720750-36720811)
chr3 (261-338)||(41578386-41578463)
chr3 (241-338)||(41804606-41804703)
chr3 (392-469)||(42322811-42322888)
chr3 (392-453)||(46413734-46413795)
chr3 (392-469)||(51012700-51012777)
chr3 (316-369)||(51015484-51015537)
chr3 (394-463)||(52568828-52568897)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (407-922)||(40414639-40415152)
chr8 (398-922)||(40415286-40415810)
chr8 (398-922)||(42168620-42169145)
chr8 (401-922)||(28705805-28706327)
chr8 (398-922)||(24861372-24861895)
chr8 (398-922)||(26452354-26452877)
chr8 (398-922)||(38033586-38034110)
chr8 (398-922)||(15031986-15032509)
chr8 (436-922)||(2416944-2417428)
chr8 (398-922)||(484920-485443)
chr8 (398-801)||(22549232-22549631)
chr8 (465-922)||(34614982-34615440)
chr8 (572-922)||(43693166-43693516)
chr8 (609-922)||(43638549-43638862)
chr8 (618-920)||(33799432-33799734)
chr8 (387-922)||(41856622-41857159)
chr8 (698-922)||(41363685-41363909)
chr8 (418-611)||(43637445-43637638)
chr8 (387-922)||(18439945-18440480)
chr8 (488-920)||(44942832-44943264)
chr8 (387-922)||(42603483-42604015)
chr8 (696-922)||(41275423-41275649)
chr8 (387-921)||(40702390-40702925)
chr8 (398-578)||(44050812-44050992)
chr8 (735-922)||(19242160-19242347)
chr8 (735-922)||(19315344-19315531)
chr8 (401-595)||(41017413-41017608)
chr8 (673-922)||(31171753-31172001)
chr8 (398-724)||(24861575-24861900)
chr8 (664-922)||(3589192-3589451)
chr8 (398-724)||(22549311-22549636)
chr8 (772-922)||(26484606-26484756)
chr8 (398-723)||(26452557-26452881)
chr8 (398-724)||(42168615-42168942)
chr8 (398-652)||(2417147-2417400)
chr8 (663-922)||(16575721-16575966)
chr8 (395-616)||(16575990-16576212)
chr8 (241-344)||(43637179-43637282)
chr8 (387-451)||(28167338-28167402)
chr8 (398-716)||(28705805-28706124)
chr8 (398-651)||(34615185-34615440)
chr8 (834-920)||(22548294-22548380)
chr8 (427-724)||(40415519-40415815)
chr8 (398-494)||(2417429-2417525)
chr8 (241-338)||(484679-484776)
chr8 (255-344)||(28705555-28705644)
chr8 (459-711)||(40414902-40415153)
chr8 (606-724)||(38033581-38033698)
chr8 (598-724)||(44050873-44050997)
chr8 (255-334)||(44051150-44051229)
chr8 (255-333)||(40703075-40703153)
chr8 (392-618)||(26487005-26487232)
chr8 (241-338)||(28167482-28167579)
chr8 (261-338)||(41275783-41275860)
chr8 (241-338)||(41856390-41856487)
chr8 (284-344)||(33776051-33776111)
chr8 (398-539)||(43693369-43693511)
chr8 (255-346)||(484833-484922)
chr8 (255-338)||(15031745-15031828)
chr8 (398-539)||(485101-485240)
chr8 (392-469)||(41856385-41856462)
chr8 (282-338)||(42604192-42604248)
chr8 (497-623)||(16576308-16576435)
chr8 (241-344)||(40415954-40416056)
chr8 (392-463)||(41275794-41275865)
chr8 (284-338)||(18439712-18439766)
chr8 (385-588)||(37780506-37780710)
chr8 (252-338)||(42168379-42168465)
chr8 (394-463)||(22549806-22549875)
chr8 (664-719)||(16576154-16576209)
chr8 (661-777)||(26486847-26486964)
chr8 (282-338)||(38033345-38033401)
chr8 (421-472)||(15032234-15032284)
chr8 (666-724)||(18439951-18440009)
chr8 (392-463)||(38033340-38033411)
chr8 (689-724)||(41017405-41017440)
chr8 (398-502)||(43638553-43638659)
chr8 (398-490)||(33799440-33799533)
chr8 (316-369)||(19242120-19242173)
chr8 (316-369)||(19315304-19315357)
chr8 (261-338)||(22549795-22549872)
chr8 (395-448)||(28705559-28705612)
[»] scaffold0192 (5 HSPs)
scaffold0192 (387-922)||(17568-18102)
scaffold0192 (241-338)||(17364-17461)
scaffold0192 (401-654)||(17643-17897)
scaffold0192 (392-454)||(17359-17421)
scaffold0192 (241-299)||(17483-17541)
[»] chr1 (186 HSPs)
chr1 (387-922)||(42571428-42571963)
chr1 (398-922)||(30309495-30310013)
chr1 (398-922)||(39223861-39224384)
chr1 (398-921)||(51269822-51270344)
chr1 (387-922)||(12790925-12791460)
chr1 (398-922)||(47487699-47488224)
chr1 (399-922)||(27486355-27486877)
chr1 (401-922)||(49427406-49427925)
chr1 (398-922)||(27034980-27035505)
chr1 (398-922)||(48568068-48568591)
chr1 (392-922)||(3658492-3659022)
chr1 (401-919)||(46179945-46180465)
chr1 (398-916)||(45689144-45689663)
chr1 (398-922)||(29435992-29436515)
chr1 (398-922)||(41874548-41875071)
chr1 (398-922)||(44336983-44337506)
chr1 (415-922)||(13634979-13635484)
chr1 (398-922)||(50067921-50068446)
chr1 (436-922)||(29761924-29762408)
chr1 (398-815)||(29707201-29707621)
chr1 (398-922)||(49262659-49263175)
chr1 (398-922)||(19160336-19160859)
chr1 (364-922)||(18170044-18170603)
chr1 (418-922)||(49598573-49599061)
chr1 (544-922)||(44597720-44598097)
chr1 (598-922)||(35576358-35576682)
chr1 (387-918)||(36909584-36910114)
chr1 (387-922)||(14173410-14173945)
chr1 (398-768)||(22527680-22528049)
chr1 (389-921)||(13972944-13973476)
chr1 (663-922)||(21484573-21484830)
chr1 (389-911)||(37778109-37778631)
chr1 (402-647)||(48226831-48227076)
chr1 (696-922)||(39856867-39857093)
chr1 (387-922)||(17686010-17686548)
chr1 (558-922)||(17697065-17697426)
chr1 (387-922)||(6435791-6436326)
chr1 (370-922)||(35586567-35587116)
chr1 (387-922)||(24270017-24270550)
chr1 (387-922)||(23342660-23343194)
chr1 (392-922)||(17372746-17373273)
chr1 (663-922)||(49396723-49396983)
chr1 (735-922)||(38046434-38046621)
chr1 (735-922)||(49926380-49926567)
chr1 (497-922)||(5765225-5765645)
chr1 (661-922)||(35184989-35185252)
chr1 (730-922)||(48215217-48215409)
chr1 (392-922)||(13283724-13284250)
chr1 (747-922)||(35526189-35526364)
chr1 (394-922)||(24363471-24363987)
chr1 (421-922)||(41780712-41781213)
chr1 (729-922)||(18842458-18842651)
chr1 (395-536)||(17697424-17697566)
chr1 (398-724)||(51270024-51270349)
chr1 (400-626)||(18842767-18842994)
chr1 (398-724)||(47487694-47488021)
chr1 (398-724)||(29436195-29436520)
chr1 (407-724)||(44336978-44337294)
chr1 (241-457)||(18170669-18170873)
chr1 (398-721)||(3658695-3659018)
chr1 (497-920)||(16531856-16532275)
chr1 (398-718)||(27486355-27486674)
chr1 (398-652)||(29761952-29762205)
chr1 (387-824)||(40532938-40533375)
chr1 (398-724)||(49427609-49427933)
chr1 (387-618)||(35525849-35526081)
chr1 (696-922)||(16081304-16081529)
chr1 (418-508)||(46924963-46925053)
chr1 (246-346)||(18170921-18171021)
chr1 (427-637)||(16097783-16097991)
chr1 (373-576)||(35185336-35185538)
chr1 (244-338)||(14173177-14173271)
chr1 (427-724)||(30309490-30309786)
chr1 (398-539)||(44597923-44598064)
chr1 (398-724)||(27034975-27035302)
chr1 (398-716)||(42571442-42571760)
chr1 (398-724)||(45689341-45689668)
chr1 (387-451)||(49397134-49397198)
chr1 (427-724)||(29707196-29707492)
chr1 (598-724)||(49262654-49262779)
chr1 (398-719)||(12790936-12791257)
chr1 (395-626)||(16081597-16081830)
chr1 (244-338)||(35525616-35525710)
chr1 (241-338)||(23343330-23343427)
chr1 (398-540)||(35576561-35576705)
chr1 (387-451)||(38044844-38044908)
chr1 (240-338)||(17685778-17685876)
chr1 (598-724)||(41874543-41874667)
chr1 (261-334)||(39856660-39856733)
chr1 (241-334)||(42571198-42571291)
chr1 (398-724)||(46179937-46180264)
chr1 (241-338)||(49397334-49397431)
chr1 (599-724)||(50067916-50068040)
chr1 (663-795)||(14772461-14772592)
chr1 (398-494)||(29761827-29761923)
chr1 (398-724)||(39223856-39224181)
chr1 (421-539)||(13635141-13635259)
chr1 (241-348)||(35586328-35586435)
chr1 (810-895)||(13148365-13148450)
chr1 (241-338)||(24269785-24269881)
chr1 (261-338)||(27486128-27486205)
chr1 (288-344)||(30309263-30309319)
chr1 (282-345)||(18842941-18843004)
chr1 (244-338)||(35185676-35185770)
chr1 (241-347)||(36910250-36910356)
chr1 (479-724)||(48226841-48227085)
chr1 (144-225)||(39223071-39223152)
chr1 (261-338)||(48227244-48227321)
chr1 (282-338)||(13284189-13284245)
chr1 (270-338)||(41801723-41801791)
chr1 (284-344)||(46924689-46924749)
chr1 (255-338)||(13634720-13634803)
chr1 (275-338)||(15356235-15356298)
chr1 (255-338)||(19161017-19161100)
chr1 (241-336)||(35586478-35586571)
chr1 (241-336)||(36910114-36910207)
chr1 (282-337)||(41874548-41874603)
chr1 (701-740)||(48226760-48226799)
chr1 (598-724)||(48568063-48568187)
chr1 (241-336)||(49397198-49397291)
chr1 (275-338)||(49428106-49428169)
chr1 (255-338)||(49925800-49925883)
chr1 (292-346)||(27034786-27034840)
chr1 (179-225)||(30308750-30308796)
chr1 (398-724)||(49598545-49598875)
chr1 (392-469)||(14173172-14173249)
chr1 (392-469)||(35525611-35525688)
chr1 (241-338)||(38044611-38044708)
chr1 (291-344)||(39223614-39223667)
chr1 (392-469)||(49397359-49397436)
chr1 (140-225)||(49597556-49597641)
chr1 (387-618)||(49926033-49926264)
chr1 (270-338)||(12790692-12790760)
chr1 (683-727)||(21484432-21484475)
chr1 (270-338)||(46179725-46179792)
chr1 (392-463)||(12790687-12790758)
chr1 (392-463)||(15356230-15356301)
chr1 (255-346)||(19160857-19160946)
chr1 (392-463)||(24269780-24269851)
chr1 (275-338)||(24363474-24363537)
chr1 (392-463)||(35586333-35586404)
chr1 (262-369)||(37778272-37778377)
chr1 (261-344)||(50067674-50067757)
chr1 (270-344)||(3659275-3659349)
chr1 (288-338)||(13973661-13973711)
chr1 (392-454)||(17685773-17685835)
chr1 (598-652)||(17697443-17697497)
chr1 (398-472)||(19160539-19160611)
chr1 (398-472)||(22527729-22527801)
chr1 (255-337)||(22528207-22528289)
chr1 (744-797)||(19262422-19262475)
chr1 (261-338)||(29436679-29436756)
chr1 (261-338)||(29761570-29761647)
chr1 (392-469)||(38044606-38044683)
chr1 (398-516)||(49262852-49262972)
chr1 (261-338)||(51270538-51270615)
chr1 (270-338)||(17373200-17373268)
chr1 (314-374)||(23342829-23342889)
chr1 (392-448)||(27486123-27486179)
chr1 (244-336)||(42571338-42571428)
chr1 (395-463)||(49396926-49396992)
chr1 (314-369)||(6435965-6436020)
chr1 (314-369)||(13973117-13973172)
chr1 (398-457)||(21484440-21484499)
chr1 (689-724)||(22528019-22528054)
chr1 (392-463)||(41801725-41801796)
chr1 (241-344)||(47487452-47487555)
chr1 (282-337)||(50067921-50067976)
chr1 (392-446)||(6436460-6436514)
chr1 (598-652)||(13635028-13635081)
chr1 (892-922)||(16098089-16098119)
chr1 (487-545)||(17697355-17697412)
chr1 (241-299)||(24269924-24269982)
chr1 (241-299)||(35185572-35185630)
chr1 (392-454)||(35185713-35185775)
chr1 (241-299)||(41781256-41781314)
chr1 (179-225)||(46924180-46924226)
chr1 (179-225)||(47485949-47485995)
chr1 (394-448)||(48227270-48227324)
chr1 (462-539)||(48568246-48568323)
chr1 (261-346)||(13634880-13634963)
chr1 (392-469)||(23343355-23343432)
chr1 (241-346)||(37778796-37778900)
chr1 (241-330)||(49598317-49598406)
chr1 (179-208)||(50066010-50066039)
chr1 (394-463)||(51270549-51270618)
[»] chr2 (122 HSPs)
chr2 (398-922)||(16581845-16582371)
chr2 (402-922)||(32734670-32735191)
chr2 (398-922)||(42120035-42120560)
chr2 (509-922)||(42240869-42241282)
chr2 (398-921)||(10359858-10360381)
chr2 (398-922)||(22493294-22493819)
chr2 (398-922)||(17424812-17425335)
chr2 (398-922)||(3936724-3937247)
chr2 (511-922)||(29906605-29907016)
chr2 (398-808)||(18393486-18393897)
chr2 (536-922)||(12968099-12968485)
chr2 (407-922)||(22001857-22002371)
chr2 (491-922)||(43982879-43983307)
chr2 (398-756)||(39799530-39799886)
chr2 (521-922)||(29067752-29068150)
chr2 (387-922)||(10364285-10364820)
chr2 (387-922)||(35491658-35492192)
chr2 (14-372)||(42240523-42240873)
chr2 (392-922)||(33404038-33404564)
chr2 (402-922)||(19471297-19471817)
chr2 (606-922)||(39393914-39394230)
chr2 (387-922)||(6976861-6977394)
chr2 (696-921)||(3941761-3941986)
chr2 (387-922)||(41498742-41499277)
chr2 (696-920)||(5420494-5420718)
chr2 (663-921)||(29111182-29111438)
chr2 (663-921)||(2919288-2919547)
chr2 (387-922)||(37312143-37312678)
chr2 (735-922)||(27130505-27130692)
chr2 (663-921)||(17796033-17796286)
chr2 (662-922)||(34521606-34521867)
chr2 (387-882)||(40677023-40677518)
chr2 (398-613)||(8557385-8557596)
chr2 (729-919)||(6901992-6902182)
chr2 (387-795)||(43491600-43492008)
chr2 (729-922)||(20148141-20148334)
chr2 (792-922)||(39799895-39800025)
chr2 (803-922)||(18392060-18392179)
chr2 (497-797)||(16253603-16253900)
chr2 (827-922)||(34638988-34639083)
chr2 (689-839)||(27650378-27650527)
chr2 (241-338)||(41498509-41498606)
chr2 (421-724)||(39799525-39799827)
chr2 (398-724)||(42120238-42120565)
chr2 (241-336)||(19471184-19471277)
chr2 (241-336)||(40676803-40676898)
chr2 (398-724)||(16582050-16582376)
chr2 (241-338)||(24108217-24108314)
chr2 (255-338)||(5420846-5420929)
chr2 (398-723)||(10359854-10360179)
chr2 (14-105)||(42264131-42264222)
chr2 (497-618)||(6902304-6902426)
chr2 (244-338)||(19471044-19471138)
chr2 (427-724)||(22493527-22493824)
chr2 (687-797)||(31991885-31991994)
chr2 (241-338)||(2918788-2918885)
chr2 (241-338)||(17425479-17425576)
chr2 (241-338)||(17538363-17538460)
chr2 (497-626)||(20148448-20148577)
chr2 (398-509)||(39394117-39394230)
chr2 (255-344)||(42120718-42120807)
chr2 (499-610)||(29111468-29111580)
chr2 (436-715)||(32734911-32735191)
chr2 (241-344)||(8557138-8557241)
chr2 (436-720)||(18393614-18393898)
chr2 (241-347)||(34521152-34521258)
chr2 (241-338)||(35492280-35492377)
chr2 (241-338)||(43983415-43983512)
chr2 (399-516)||(12968162-12968281)
chr2 (241-337)||(23408405-23408501)
chr2 (255-338)||(3942114-3942197)
chr2 (255-346)||(22002378-22002467)
chr2 (255-338)||(22002538-22002621)
chr2 (489-618)||(2919115-2919245)
chr2 (663-797)||(18036087-18036220)
chr2 (140-225)||(2154903-2154988)
chr2 (241-338)||(39799289-39799386)
chr2 (241-338)||(43492144-43492240)
chr2 (241-337)||(29073734-29073830)
chr2 (398-539)||(29906808-29906950)
chr2 (598-724)||(8557380-8557504)
chr2 (827-922)||(16253499-16253594)
chr2 (255-346)||(17425333-17425422)
chr2 (392-463)||(24108212-24108283)
chr2 (255-346)||(39799443-39799532)
chr2 (398-539)||(3936905-3937044)
chr2 (255-337)||(22493977-22494059)
chr2 (398-539)||(43983082-43983221)
chr2 (245-338)||(6977534-6977627)
chr2 (700-797)||(15891609-15891705)
chr2 (392-469)||(19471039-19471116)
chr2 (392-469)||(34521156-34521233)
chr2 (392-469)||(35492305-35492382)
chr2 (392-448)||(3942146-3942202)
chr2 (387-451)||(34521394-34521458)
chr2 (398-539)||(42240937-42241079)
chr2 (314-373)||(2919319-2919378)
chr2 (255-346)||(3936636-3936726)
chr2 (270-369)||(6977033-6977130)
chr2 (421-539)||(17425037-17425154)
chr2 (275-338)||(24936491-24936554)
chr2 (275-338)||(25685147-25685210)
chr2 (421-539)||(29067977-29068094)
chr2 (394-460)||(2918785-2918851)
chr2 (179-225)||(8556646-8556692)
chr2 (179-225)||(12967782-12967828)
chr2 (264-338)||(16582538-16582612)
chr2 (392-469)||(41498504-41498581)
chr2 (790-842)||(17112399-17112451)
chr2 (284-344)||(32736821-32736881)
chr2 (261-369)||(34521587-34521693)
chr2 (314-369)||(19471588-19471643)
chr2 (314-369)||(35491832-35491887)
chr2 (241-299)||(10364192-10364250)
chr2 (689-719)||(10364296-10364326)
chr2 (398-472)||(22002060-22002132)
chr2 (146-208)||(22495560-22495622)
chr2 (260-330)||(28476214-28476284)
chr2 (663-724)||(29111704-29111765)
chr2 (391-448)||(17538357-17538414)
chr2 (683-724)||(29111625-29111665)
chr2 (255-336)||(41498663-41498742)
[»] chr7 (128 HSPs)
chr7 (398-921)||(39476903-39477425)
chr7 (398-910)||(41217647-41218158)
chr7 (398-922)||(17183233-17183761)
chr7 (401-922)||(34140886-34141407)
chr7 (418-922)||(40588570-40589073)
chr7 (398-922)||(18237585-18238110)
chr7 (398-922)||(48220406-48220928)
chr7 (398-922)||(30360538-30361061)
chr7 (398-919)||(17839347-17839854)
chr7 (402-921)||(45362919-45363428)
chr7 (398-922)||(20564780-20565303)
chr7 (398-861)||(9366783-9367245)
chr7 (398-922)||(10523089-10523613)
chr7 (398-797)||(26601440-26601839)
chr7 (398-818)||(13920431-13920850)
chr7 (487-922)||(2356310-2356742)
chr7 (398-651)||(34157097-34157349)
chr7 (387-922)||(48270669-48271204)
chr7 (371-922)||(15337540-15338091)
chr7 (387-922)||(36393476-36394010)
chr7 (663-921)||(47268920-47269178)
chr7 (387-922)||(21186950-21187485)
chr7 (387-922)||(30354466-30355001)
chr7 (391-922)||(46861849-46862380)
chr7 (642-852)||(2205943-2206153)
chr7 (553-922)||(48314997-48315366)
chr7 (387-922)||(28114044-28114579)
chr7 (661-922)||(41048804-41049066)
chr7 (373-920)||(21650547-21651093)
chr7 (698-922)||(20378665-20378889)
chr7 (661-921)||(43351024-43351284)
chr7 (674-920)||(21614700-21614944)
chr7 (497-920)||(1642353-1642771)
chr7 (662-922)||(42735284-42735544)
chr7 (796-922)||(26603265-26603391)
chr7 (774-922)||(28979060-28979208)
chr7 (627-749)||(28978943-28979065)
chr7 (616-777)||(34139332-34139491)
chr7 (673-807)||(17320140-17320272)
chr7 (387-626)||(20877703-20877943)
chr7 (398-724)||(45362910-45363235)
chr7 (398-724)||(40588773-40589098)
chr7 (395-616)||(21614444-21614666)
chr7 (398-724)||(34141089-34141415)
chr7 (459-724)||(41217900-41218163)
chr7 (398-539)||(17839548-17839688)
chr7 (399-724)||(34157032-34157354)
chr7 (387-451)||(10224559-10224623)
chr7 (478-722)||(30360819-30361064)
chr7 (827-922)||(13916854-13916949)
chr7 (398-724)||(17183439-17183766)
chr7 (241-344)||(39476656-39476759)
chr7 (241-338)||(9366541-9366638)
chr7 (436-724)||(48220401-48220689)
chr7 (398-724)||(18237788-18238115)
chr7 (478-724)||(26601435-26601682)
chr7 (241-344)||(30361205-30361308)
chr7 (427-724)||(39476898-39477193)
chr7 (255-338)||(40589239-40589322)
chr7 (252-338)||(17183916-17184002)
chr7 (241-346)||(20565301-20565404)
chr7 (261-338)||(34141574-34141651)
chr7 (392-626)||(21614116-21614351)
chr7 (735-839)||(28066359-28066463)
chr7 (241-337)||(42735668-42735764)
chr7 (255-338)||(17840012-17840095)
chr7 (255-346)||(42683116-42683207)
chr7 (241-338)||(48271340-48271437)
chr7 (598-724)||(17839735-17839859)
chr7 (398-465)||(28978877-28978944)
chr7 (255-338)||(30354233-30354316)
chr7 (847-922)||(42682977-42683052)
chr7 (398-469)||(42735693-42735764)
chr7 (687-789)||(3380626-3380727)
chr7 (398-539)||(9366964-9367103)
chr7 (398-539)||(13920530-13920669)
chr7 (270-344)||(26500364-26500438)
chr7 (270-344)||(26592275-26592349)
chr7 (529-618)||(42735586-42735676)
chr7 (241-338)||(41218302-41218399)
chr7 (140-225)||(41219013-41219097)
chr7 (241-334)||(41622770-41622863)
chr7 (729-797)||(11824839-11824907)
chr7 (261-337)||(13921014-13921090)
chr7 (392-448)||(17183951-17184007)
chr7 (270-338)||(18238283-18238351)
chr7 (270-338)||(28113812-28113880)
chr7 (270-338)||(36393243-36393311)
chr7 (255-346)||(9366695-9366785)
chr7 (421-539)||(20565005-20565122)
chr7 (392-463)||(28113807-28113878)
chr7 (255-338)||(34157506-34157588)
chr7 (314-369)||(41048978-41049033)
chr7 (314-369)||(43351057-43351112)
chr7 (553-618)||(43350917-43350983)
chr7 (284-338)||(46861617-46861671)
chr7 (241-338)||(10224759-10224855)
chr7 (241-338)||(20877470-20877567)
chr7 (398-489)||(28978943-28979035)
chr7 (241-310)||(34353318-34353387)
chr7 (261-338)||(45362674-45362751)
chr7 (140-225)||(48218675-48218760)
chr7 (392-448)||(18238300-18238356)
chr7 (284-344)||(20378446-20378506)
chr7 (664-724)||(28978872-28978932)
chr7 (392-448)||(34141600-34141656)
chr7 (392-448)||(40589271-40589327)
chr7 (262-338)||(46861855-46861931)
chr7 (689-724)||(10523583-10523618)
chr7 (255-338)||(10523771-10523854)
chr7 (255-338)||(20565461-20565544)
chr7 (392-463)||(20877465-20877536)
chr7 (529-576)||(21186806-21186853)
chr7 (392-463)||(34353349-34353420)
chr7 (314-369)||(42735457-42735512)
chr7 (179-225)||(1536714-1536760)
chr7 (282-345)||(2356505-2356566)
chr7 (398-472)||(10523293-10523365)
chr7 (394-448)||(17840044-17840098)
chr7 (741-795)||(18149675-18149729)
chr7 (689-719)||(21186961-21186991)
chr7 (284-338)||(28978623-28978677)
chr7 (398-499)||(34139390-34139491)
chr7 (689-719)||(48271163-48271193)
chr7 (694-839)||(150192-150336)
chr7 (261-346)||(13920848-13920931)
chr7 (394-451)||(20565490-20565547)
chr7 (392-469)||(41622795-41622872)
[»] chr6 (82 HSPs)
chr6 (398-920)||(35058397-35058919)
chr6 (389-922)||(801189-801719)
chr6 (398-922)||(29108163-29108686)
chr6 (398-922)||(29066576-29067099)
chr6 (398-922)||(6205507-6206030)
chr6 (398-922)||(11692474-11692997)
chr6 (398-922)||(27640203-27640725)
chr6 (554-922)||(29075589-29075956)
chr6 (554-922)||(29110561-29110928)
chr6 (407-807)||(24020769-24021168)
chr6 (407-807)||(2192535-2192928)
chr6 (316-885)||(30257159-30257728)
chr6 (385-922)||(32027277-32027814)
chr6 (385-922)||(32037336-32037873)
chr6 (606-815)||(3765657-3765867)
chr6 (497-921)||(13402557-13402981)
chr6 (661-921)||(14115061-14115318)
chr6 (661-922)||(34802820-34803082)
chr6 (389-922)||(12396799-12397332)
chr6 (761-922)||(22305819-22305980)
chr6 (325-618)||(4495230-4495523)
chr6 (398-724)||(29066779-29067104)
chr6 (398-724)||(29108366-29108691)
chr6 (398-539)||(29075792-29075933)
chr6 (398-539)||(29110764-29110905)
chr6 (398-719)||(801391-801710)
chr6 (387-780)||(35020888-35021281)
chr6 (398-626)||(14122919-14123148)
chr6 (497-618)||(23911076-23911197)
chr6 (241-338)||(32027046-32027143)
chr6 (241-338)||(32037105-32037202)
chr6 (436-724)||(35058392-35058680)
chr6 (241-338)||(34802600-34802697)
chr6 (392-469)||(4495600-4495677)
chr6 (241-338)||(6206174-6206271)
chr6 (241-338)||(11693141-11693238)
chr6 (390-447)||(13403313-13403370)
chr6 (687-816)||(17465287-17465415)
chr6 (247-338)||(4495581-4495672)
chr6 (275-338)||(12397504-12397567)
chr6 (255-338)||(35020655-35020738)
chr6 (241-338)||(27640866-27640963)
chr6 (284-344)||(34132108-34132168)
chr6 (275-346)||(14123409-14123479)
chr6 (241-344)||(35058150-35058253)
chr6 (241-338)||(13403509-13403606)
chr6 (261-338)||(29067207-29067284)
chr6 (261-338)||(29108794-29108871)
chr6 (421-539)||(6205732-6205849)
chr6 (255-346)||(6206028-6206117)
chr6 (255-338)||(13617322-13617405)
chr6 (421-539)||(27640428-27640545)
chr6 (532-618)||(34802692-34802779)
chr6 (179-225)||(802553-802599)
chr6 (398-472)||(24021008-24021080)
chr6 (241-299)||(32027186-32027244)
chr6 (241-299)||(32037245-32037303)
chr6 (261-334)||(2193101-2193174)
chr6 (140-225)||(14830940-14831025)
chr6 (664-724)||(27640671-27640730)
chr6 (689-724)||(6206000-6206035)
chr6 (314-373)||(12396969-12397028)
chr6 (314-369)||(13402730-13402785)
chr6 (392-463)||(13617317-13617388)
chr6 (314-369)||(30257536-30257591)
chr6 (392-463)||(32027041-32027112)
chr6 (314-369)||(32027585-32027640)
chr6 (392-463)||(32037100-32037171)
chr6 (392-463)||(35020650-35020721)
chr6 (179-225)||(319628-319674)
chr6 (398-472)||(2192623-2192695)
chr6 (398-509)||(3765657-3765770)
chr6 (421-471)||(11692699-11692748)
chr6 (392-454)||(12397510-12397572)
chr6 (689-719)||(13403332-13403362)
chr6 (179-225)||(14153921-14153967)
chr6 (262-335)||(12397248-12397321)
chr6 (179-208)||(16444828-16444857)
chr6 (261-302)||(24020555-24020596)
chr6 (241-338)||(30257001-30257097)
chr6 (255-336)||(35020809-35020888)
chr6 (179-208)||(35053870-35053899)
[»] scaffold0176 (4 HSPs)
scaffold0176 (401-922)||(1811-2332)
scaffold0176 (398-724)||(2014-2340)
scaffold0176 (261-338)||(2499-2576)
scaffold0176 (392-448)||(2525-2581)
[»] scaffold0589 (5 HSPs)
scaffold0589 (573-922)||(2288-2637)
scaffold0589 (255-337)||(4988-5070)
scaffold0589 (398-539)||(2491-2633)
scaffold0589 (693-724)||(4804-4835)
scaffold0589 (398-447)||(4781-4830)
[»] scaffold0268 (3 HSPs)
scaffold0268 (398-807)||(14604-15012)
scaffold0268 (398-539)||(14692-14831)
scaffold0268 (261-346)||(15010-15095)
[»] scaffold0861 (4 HSPs)
scaffold0861 (398-646)||(2249-2499)
scaffold0861 (598-724)||(2379-2504)
scaffold0861 (140-225)||(3347-3432)
scaffold0861 (270-344)||(2758-2832)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (555-807)||(85462-85711)
scaffold0031 (398-472)||(85550-85622)
[»] scaffold0199 (3 HSPs)
scaffold0199 (398-571)||(11425-11598)
scaffold0199 (598-724)||(11420-11544)
scaffold0199 (255-338)||(11184-11267)
[»] scaffold1700 (3 HSPs)
scaffold1700 (418-539)||(1-123)
scaffold1700 (285-337)||(382-434)
scaffold1700 (598-652)||(23-77)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (663-794)||(64098-64227)
scaffold0004 (826-922)||(63997-64092)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (729-922)||(24926-25118)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (14-105)||(492966-493057)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (269-338)||(4987-5056)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 187)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 241 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 49064678 - 49063998
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |    
T  49064678 taccatcattcaagatgctcatcaaatgctggactcctgtcgtttaacaagtttgaattacctc-attcaaagg-aagacaattgttgcagttggaaggt 49064581  T
Q  341 gcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattc 440  Q
    |||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  49064580 gcattcattccgtacctactaacaatcttttggacatttataccgaacgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagataaattc 49064481  T
Q  441 aaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattc 540  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49064480 aaacttgccaaacaacaggactcaagcgtttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattt 49064381  T
Q  541 aagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaagga-aaaacatgaatgcc 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49064380 aagtgccaacgaaatgaggttcattccttgaaacttaataccatcatctaaaccaacctaataagaatttaatattttcaaaggaaaaaacatgaatgcc 49064281  T
Q  640 gagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaat 739  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49064280 gagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttaagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaat 49064181  T
Q  740 gacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaa 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  49064180 gacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacgtcacccgcatatcgatccacggaaacatgttgtgctccaaaaa 49064081  T
Q  840 catgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  49064080 catgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgacaccctcccctcgtcgagtgttggacgtttatacc 49063998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 51427845 - 51428380
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51427845 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgcccgacattcatg 51427944  T
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttca 586  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51427945 ttttcctttgaaaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttca 51428044  T
Q  587 tctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctc 686  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  51428045 tctaaaccagactaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgatcgaaatgcttgagtcctggccgtttgccaagtttgaattacccc 51428144  T
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgat 786  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  51428145 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttcttgcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgat 51428244  T
Q  787 ctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaatt 886  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||     
T  51428245 ctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaactccacacaagtgaatg 51428344  T
Q  887 ataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  51428345 atactctcccctcgttgagcgttgaacgtttatacc 51428380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 21712073 - 21711549
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21712073 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacgtgccaaacaacagtactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 21711974  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  21711973 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgagattcattccttgacacttaataccttcatctaaatcacc 21711874  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  21711873 ctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggt 21711774  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21711773 aagagaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatctttagttgatctcagcaacgt 21711674  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21711673 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccc 21711574  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  21711573 tcgtcgagcgttagatgtttatacc 21711549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 241 - 922
Target Start/End: Original strand, 14330203 - 14330882
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||| || | | ||||| ||||||||||||  ||| |||||  || |||||||||||| |||||||||| |    
T  14330203 taccattattcaagatgcttatcgaatgctggagtcttaccgtttaacaagtttgaattacctc-attcaaagg-aagacaattgttacagttggaaggt 14330300  T
Q  341 gcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattc 440  Q
    |||||  ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  14330301 gcatttgttccgtacttactgacgattttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggttaattc 14330400  T
Q  441 aaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    ||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14330401 aaactggtcaaacaataggactcaagcatttcgcccgacattcatgtttttcctttgaaaagaatatatttttgttagggttggtttagatgatggtatt 14330500  T
Q  540 caagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgc 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14330501 caagtgccaacgaaatgaggttcattccctgacacttcaatactttcatctaaaccagcctaacaagagtttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatga 14330600  T
Q  639 cgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaa 738  Q
     | ||| ||||| | ||  || | ||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14330601 tgggcg-aatgc-tgaagacttgtcgtttgataagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccttaactaa 14330698  T
Q  739 tgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaa 838  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  14330699 tgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccaaa 14330798  T
Q  839 acatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14330799 acatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagtgttggacgtttatacc 14330882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 39589471 - 39588949
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39589471 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaagactcaaacatttcacacgacattcatgttttcctttga 39589372  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  39589371 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaattatgttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 39589272  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  39589271 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagtgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 39589174  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39589173 taagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccccaactaatgacgatcttctagcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 39589074  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  39589073 tcatccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 39588974  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  39588973 cccgtcgagcgttggacgtttatac 39588949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 37866950 - 37866425
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37866950 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgtcaaacaacaggactcagacatttcacccggcattcatgttttcctttga 37866851  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  37866850 aaagaataaatttttgttgggcttgctttagatgatgacattcaactgccaatgaaattaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 37866751  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  37866750 ctaacaataatttaatattttcacaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggt 37866651  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37866650 aagacgactgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagatattgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 37866551  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctccc-aaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37866550 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccgaaaacatgctcatcacgttttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 37866451  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||||||||||||||| |||||||||    
T  37866450 ctcgtcgagcgttggatgtttatacc 37866425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 402 - 921
Target Start/End: Original strand, 46816192 - 46816710
Alignment:
Q  402 aactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaag 501  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46816192 aactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgcgaaacaacaagactcaagcatttcacccggcaatcatgttttcctttgaaaag 46816291  T
Q  502 aataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaa 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||    
T  46816292 aataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattctttgacacctaataccttcatctaaaccggcctaa 46816391  T
Q  602 caataatttaatcttttcaaag-gaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaag 700  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  46816392 caaaaatttaaccttttcaaagaaaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcttggccgtttggcaagtttgaattaccccatctcagaggtaag 46816491  T
Q  701 acaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcac 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||    
T  46816492 acaattgttgtagttggaatgcaccttgccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctattgatgatatcttca--tgatctcaacaacgttac 46816589  T
Q  801 ccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcg 900  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46816590 ctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccctcg 46816689  T
Q  901 tcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  46816690 tcgagcattggacgtgtatac 46816710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 28082779 - 28082257
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28082779 ttccaactccaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcacccgacattcatgtcttcctttga 28082680  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28082679 aaagaataaatttttgttaggcgtgctttggatgatggtattcaagtgccaacgaaatgatgttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 28082580  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  28082579 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 28082482  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||     
T  28082481 -aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctaagtaact 28082383  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28082382 tcacctgcatattgatccactgaaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 28082283  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     || ||||||||||||||||||||||    
T  28082282 ctcatcgagcgttggacgtttatacc 28082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 27759871 - 27759378
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||    
T  27759871 ttccaactacagcaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcgttcatgtttttcctttg 27759772  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27759771 aaaagaataaatttttattaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 27759672  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  27759671 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatagccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagagg 27759572  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27759571 taagacaattgttgtagttgaaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 27759472  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattatac 890  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27759471 ttactcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatac 27759378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 1043291 - 1042769
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1043291 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagaatttcgctcgacattcatgttttcctttga 1043192  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1043191 aaagaataaatttttgttaggcttgatttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 1043092  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |  |||||||   |||||| ||| |||| ||||||||    
T  1043091 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcat-gttgtttggccgatttgaatttatctca-ttcaaagg 1042994  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1042993 taagacaattgttgcagttggaatgtaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgattatatcttcagttgatctcagcaacg 1042894  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  1042893 tcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 1042794  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  1042793 ctcgtctagcgttggacgtttatac 1042769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 25763142 - 25762617
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  25763142 ttccaactccaacaattgtcttaccttcgaatggggtaaagtcaaacttgtcaaacaacaagactcaagcatttcgccccgcattcatgtttttcctttg 25763043  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25763042 aaaagaataattttttgttagacttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggtttatttcttgacacttaataccttcatctaaaccag 25762943  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||    
T  25762942 cataataagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgcttggcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaattaccccattttagagg 25762843  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25762842 taagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 25762743  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25762742 ttacccgcatatcgatccaccagaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 25762643  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  25762642 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 25762617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 922
Target Start/End: Original strand, 51027439 - 51027955
Alignment:
Q  407 caacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaata 505  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51027439 caacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcaaaacaacaggactcaagcatttcaccccgcattcatatttttcctttgaaaagaata 51027538  T
Q  506 aatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaat 605  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  51027539 acttttttttaggcttgctttagatgatgatattcaagttccaacaaaatgaggttcattctttggcacttaataccttcatctaaaccagcataacaag 51027638  T
Q  606 aatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaat 705  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  51027639 aatttaatctttttaaaggaaaaacatgaatgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgcttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtacgacaat 51027738  T
Q  706 tgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgca 805  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  51027739 tgttgtagttggagtgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgca 51027838  T
Q  806 tatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgag 905  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||    
T  51027839 tatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgag 51027938  T
Q  906 cgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||    
T  51027939 cgttggacgtttatacc 51027955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 418 - 922
Target Start/End: Original strand, 31824312 - 31824817
Alignment:
Q  418 ttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgtta 516  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  31824312 ttacctttgaatgaggtaaattcaaactggccaaataacaggactcaagcatttcgccccgcgttcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttatca 31824411  T
Q  517 ggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatctt 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  31824412 ggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcataacaagattttaatctt 31824511  T
Q  617 ttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttg 716  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| | |  ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31824512 ttcaaaggaaaaacatgaacgttgggcgaaatgcttgagtaatggccgtttggcaagtttaaattaccctatttcaaatgtaagacaattgttgtagttg 31824611  T
Q  717 gaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccac 816  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  31824612 gaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctaagcaacgttacccgcatattgatccac 31824711  T
Q  817 tgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtt 916  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31824712 tagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtt 31824811  T
Q  917 tatacc 922  Q
    ||||||    
T  31824812 tatacc 31824817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 20901339 - 20901856
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||    
T  20901339 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcgtcccgcattcatgtttttcctttg 20901438  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  20901439 aaaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttggcacttactaccttcatctaaaccag 20901538  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |        |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  20901539 cctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctaggcgaaacg--------ctggccgtttggaaagtttgaattacctcatttcagagg 20901630  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  20901631 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttcaggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcagtg 20901730  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||     
T  20901731 ttacccgcatatcgatccactagaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcca 20901830  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
T  20901831 ctcgtcgaacgttggacgtttatacc 20901856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 497 - 922
Target Start/End: Original strand, 33163307 - 33163732
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33163307 aaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtttattccttgacacttaataccttcatctaaatcag 33163406  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||    
T  33163407 cctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgtttgagtcctggccgtttggcaagtttgaaataccccatttaagagg 33163506  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33163507 caagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacg 33163606  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||    
T  33163607 ttacccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgttactctccc 33163706  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  33163707 ctcgttgagcgttggacgtttatacc 33163732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 398 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 45940069 - 45939546
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  45940069 ttccaactacaacaattgtcttaccttcgaatgaggtaaagtcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgtttttcctttg 45939970  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45939969 aaaagaataaatttt-gttagacttgctttagatggtggtattcaagtgccaatgaaatgatgttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 45939871  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  45939870 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgttgggcaaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaagtttgaattaccccatttcagagg 45939771  T
Q  697 taagacaatt-gttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45939770 taagacaattagttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggaagaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 45939671  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  45939670 gttactcgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattatcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgataatctcc 45939571  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
      ||||||||||||| |||||||||    
T  45939570 tctcgtcgagcgttgaacgtttata 45939546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 21016842 - 21017365
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  21016842 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 21016941  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21016942 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 21017041  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  21017042 gcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 21017139  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21017140 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 21017238  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21017239 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 21017338  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  21017339 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 21017365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 385 - 922
Target Start/End: Original strand, 242088 - 242604
Alignment:
Q  385 gaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattca 484  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |    
T  242088 gaacgtttgtacctccgaactacaacaattgtgttacctttgaa-ggggtaatttcaaacttgccaaacaacatgactcaagcattttgtccgacattta 242186  T
Q  485 tgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacacctt 584  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  242187 tgtttttctttgaaaagaataaatttttgttagacttgttttagatgatggtatccaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaatacctt 242286  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||                    ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  242287 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttc--------------------gagcgaaatgcttgagtcctgcccgtttggcaagtttgaattacc 242366  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattg 784  Q
      |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  242367 ctatttcagaggtaagacaattgttatagttggaatgcaccttactttaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttg 242466  T
Q  785 atctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaa 884  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||    
T  242467 atctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttctttaactccacctaagtgaa 242566  T
Q  885 ttataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | || | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  242567 tgatgctctcccctcgtcgagtgttggacgtttatacc 242604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 56139452 - 56138929
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  56139452 ttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 56139353  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56139352 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 56139253  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  56139252 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 56139155  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  56139154 g-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 56139056  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  56139055 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 56138956  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  56138955 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 56138929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 6176980 - 6177503
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  6176980 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 6177079  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6177080 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 6177179  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  6177180 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 6177277  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6177278 g-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 6177376  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  6177377 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 6177476  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  6177477 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 6177503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 394 - 922
Target Start/End: Original strand, 41794223 - 41794750
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc 492  Q
    ||||||||| || |||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  |||||||||||    
T  41794223 taccttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcc 41794322  T
Q  493 -tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaa 591  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41794323 ctttgaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaa 41794422  T
Q  592 accagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttc 691  Q
    |||||  ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  41794423 accagcataaaaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-c 41794520  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcag 791  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  41794521 aaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaag 41794619  T
Q  792 caacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattatacc 891  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||     
T  41794620 caacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatact 41794719  T
Q  892 ctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41794720 ctcccctcgtcgagtgttggacgtttatacc 41794750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 55797285 - 55796762
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  55797285 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 55797186  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  55797185 gaaaataataaatttctgtgaggctagctttggatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaatacattcatctaaacca 55797086  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || |||||||||| | |||| |||||    
T  55797085 gcataacaaaaatttaatactttcaaaggagaaacatgaggcgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattagcccatt-caaag 55796988  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  55796987 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 55796889  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  55796888 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 55796789  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  55796788 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 55796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 40353438 - 40353961
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| | |    || |||||||||||| |||    
T  40353438 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacagggctcaagcattacgctaagcacttcatgttttcccttt 40353537  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40353538 gaaaagaataaatttttgtgaggcttggtttagattatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatcaaaacca 40353637  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  40353638 gcataacaagaatttaatatttttaaaggagaaacatgaggtgctcgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaggtttgaattaccccatt-caaag 40353735  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40353736 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 40353834  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40353835 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 40353934  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  40353935 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 40353961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 49095287 - 49094764
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  49095287 ttccaaccccaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaagactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 49095188  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  49095187 gaaaataataaatttttgtgaggcttggtttagattatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatcaaaacca 49095088  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  49095087 gcataacaagaatttaatatttttaaaggagaaacatgaggtgctcgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 49094990  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  49094989 g-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgacgatatcttcagttgatctaagcaac 49094891  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  49094890 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 49094791  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  49094790 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 49094764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 558 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 1226541 - 1226180
Alignment:
Q  558 ggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaat 656  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||| |       
T  1226541 ggttcattccttgacacttcaataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaagaaaaaacattaatgtcgggcgaa-tgctgagga 1226443  T
Q  657 cctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcgga 756  Q
    | || | |||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226442 cttgtc-gtttggcaagtttgaattaccccatttatgaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcgga 1226344  T
Q  757 atcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacatttt 856  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226343 atcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacatttt 1226244  T
Q  857 cgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1226243 cgtcgttctttaattccacacaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttggacgtttata 1226180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 551 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 9490067 - 9489699
Alignment:
Q  551 gaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgc 650  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9490067 gaaatgaggttcattccttgacactttataccttcatataaaccaacctaacaagaatttaattttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagtgaaatgc 9489968  T
Q  651 ttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttc 749  Q
    || | |||||   |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9489967 ttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcactttaccctaactaatgacgatcttc 9489870  T
Q  750 tggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtc 849  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  9489869 tggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaataacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgctgtgct-ccaaaacatgctcgtc 9489771  T
Q  850 acattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9489770 acattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatac 9489699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 34529449 - 34529984
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||  | | |||||||       
T  34529449 acgtttgtaccttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatc-gacattccca 34529547  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||| |||||| || || |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  34529548 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacggtattgaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaatacc 34529645  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   |||||| |  |||| |  |  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34529646 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgctgttcgaa-tattggagtcctg-ccgtttggcatgtttgaatta 34529743  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| || ||||||||||||| |  ||||  | ||    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34529744 ccccatt-caaagg-aatacaattgttgtagctttaatgtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 34529841  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  34529842 agttgatctcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaaaatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaa 34529941  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34529942 gtgaatgaaactctccccttgtcgagcgttggacgtttatacc 34529984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 22437465 - 22436930
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||  ||| | |||||       
T  22437465 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgg-cattccca 22437367  T
Q  487 tt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    || |||| || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||| ||||||||| || |||     |||||| ||||| ||||||||| || |||||    
T  22437366 ttgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacggtattcaaatgacaaaattctgaggtccattcgttgacacttcaatacctt 22437267  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||| ||   ||||||||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22437266 catttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaagaacaatgggaatgccggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaattacc 22437169  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
     ||||| || |  |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22437168 ccatttgaagg--aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttccggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 22437071  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  22437070 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattccacccaagt 22436971  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22436970 gaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 22436930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 316 - 922
Target Start/End: Original strand, 4785006 - 4785610
Alignment:
Q  316 aagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcg 415  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  4785006 aagacaattgttgcacttggaagatgcattcatttcgtacctactgatgatcttttggacgtttataccgaacatttgtatcttccaactacaacaattg 4785105  T
Q  416 tgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||| |||  | |   ||||||||   || |||| || |||  | ||||||  |||    
T  4785106 tgttacctttgaatggggtaaattcaaatttaccaagcagcaggactccagc-gtacgtacgacattcccattgttccattcaaa--attaaattcctgt 4785202  T
Q  515 taggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaat 613  Q
    |||||| |  ||| |||||||||||||||||  ||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4785203 taggctgggattaaatgatggtattcaagtgttaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaaacctgtctaacatgaatttaat 4785302  T
Q  614 cttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtag 713  Q
     |||| |||| || ||   ||||| ||  ||  |||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||| || |||||||||||||    
T  4785303 attttgaaagaaacaatgggaatgtcggacg-tatgctggagtcct-gccgtttggcaagtttgaattaccccatct-agagg-aacacaattgttgtag 4785398  T
Q  714 ttgga--atgca-ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcg 810  Q
     || |  |||||  | | |  || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  4785399 ctgaaagatgcattcattcggtacctaatgacgatcttgtggcggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatatcagcaacgttccccgcatatcg 4785498  T
Q  811 atccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttg 910  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||| || |||     
T  4785499 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgtttttgtcgttcgttaattccaccaaagtgaatgatgctctcccctcgtcaagggttt 4785598  T
Q  911 gacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||    
T  4785599 gacgtttatacc 4785610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 663 - 922
Target Start/End: Original strand, 32937833 - 32938090
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32937833 cgtttgacaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctatctaatgacgatcttctggcggaatcaaa 32937930  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32937931 tttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccgaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 32938030  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32938031 tcgttaattccacccaactgaatgatattctcccttcgtcgagtgttggacgtttatacc 32938090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 387 - 921
Target Start/End: Original strand, 957108 - 957642
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || || ||||| |  |||  ||| |||||||       
T  957108 acgtttgtacctcccaactacaaaaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgtaaagcagcaggactccaatattcgacc-gacattccca 957206  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| ||||||||||    ||| |||||||| ||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  957207 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaatgatggtgttcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaatacc 957304  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    || || ||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| |||| |||||    
T  957305 tttatttaaactagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttcaatta 957402  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  957403 ccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttt 957500  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  957501 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcctaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 957600  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  957601 gtgaatgatacgctcccctcgtcgagcgttggacatttatac 957642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 664 - 922
Target Start/End: Original strand, 20778800 - 20779057
Alignment:
Q  664 gtttggcatgtttgaatta-cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20778800 gtttggcaagtttgaatttgcctcatt-caaagg-aagacaattgttgtggttggaatgcaccttaccctacctaatgacgatcttttggcggaatcaaa 20778897  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20778898 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgaaacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 20778997  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20778998 tcgttaattccacccaaatgaatgatactctcccctcgtagagcgttggacgtttatacc 20779057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 387 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 21170005 - 21169472
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || || ||||| |  ||   ||| | |||||       
T  21170005 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaatttaaactttccaagcagcaggactccaatatacgaccgg-cattccca 21169907  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||||  |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21169906 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggcggggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaatacc 21169809  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| | | ||| ||   ||||||||  |||| |  |  | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21169808 ttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacatgaacaatgggaatgccggtcgaa-tattggagtcctg-ccgtttggcaagtttgaatta 21169711  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21169710 ccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttc 21169613  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| | | ||| | || | ||||||| ||||||    
T  21169612 agttgatctcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggtacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcgcgtattcatcgtccgttaattcgacccaa 21169513  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21169512 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttata 21169472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 34152939 - 34153474
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||  || |||||||||       
T  34152939 acgtttgtatcttccaacaacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatata-caaccgacattccca 34153037  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| | ||||||||||||| || |||    
T  34153038 atgtt--ccattcaaaagattaaattgttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccgttccttgacacttcaatacc 34153135  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||| ||   ||||| ||  ||||    ||  |  |  ||||||||||| ||||||||||    
T  34153136 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacgggaacaatgggaatgtcggtcgaata--ttggagacatgccgtttggcaagtttgaatta 34153233  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||  | | || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34153234 ccccatt-caaagg-aagacaactgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacataatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttc 34153331  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34153332 agttgatctcaccaacgtcatccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 34153431  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34153432 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 34153474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 497 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 17211708 - 17211285
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  17211708 aaaagatttaattattgttaggcttgatttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctttatctaaacca 17211609  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||| || | ||| || || |   ||| | ||||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  17211608 gcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaataggaatgtcgggtgaa-tgattgagaactg-cagtttaacaagtttgaattacctcatttcagag 17211511  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
     |||||||||||||||||||||||    | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  17211510 -taagacaattgttgtagttggaagatgcatttccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatctttagttgatctcagcaac 17211412  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||| || ||| ||||| |||  || |    
T  17211411 gttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttatcgttcgttaattcgactcaaatgaatgatattcttc 17211312  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||    
T  17211311 cctcgtcgaacgttggacgtttatacc 17211285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 49423410 - 49423946
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattc-- 483  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |  || |||  |||||||||      
T  49423410 acgtttgtaccttcaaactacaacaattgtgttacctttgaatgtggtaaattcaaacttgccaaacggcacgactcca--atgttcgaccgacattccc 49423507  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    ||  |||| ||  |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  49423508 atagtttcattc-aaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 49423606  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaa-tcctggccgtttggcatgtttgaatt 681  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| | | ||| ||   ||||| ||  ||||  | ||  | ||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  49423607 ttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaagaacaatgggaatgtcggtcgaa--gattggagtcctg-ccgtttgacaaatttgaatt 49423703  T
Q  682 acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 778  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  49423704 accccatt-caaaggtaacacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttatggcagaatcaaacttttgatgatttctt 49423802  T
Q  779 caattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccca 878  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||    
T  49423803 cagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccacttgaacatgccgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatcca 49423902  T
Q  879 agtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  49423903 agtgaatgataatctcccctcgtcgagcgctggacatttatacc 49423946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 370 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 42886837 - 42886284
Alignment:
Q  370 ttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42886837 ttggacgtttatactgaacgtttgtaccttccaactccaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaacttgccaaacagcatgactccagcat 42886738  T
Q  470 ttcacccgacattcatgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcct 568  Q
      |  ||| || ||   || |||| || |||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| |||   ||||||||  ||||||    
T  42886737 a-cgtccggcactcccattgttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttagtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtatattcct 42886639  T
Q  569 tgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgttt 667  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    |||| ||  || | ||||  | ||||| ||||||    
T  42886638 tgacacttcaataccttcatctaaacccgcctaacatgaatttaatcttttgaaaggaataatggtaatgtcggacgta-tgctggagtcctg-ccgttt 42886541  T
Q  668 ggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaact 764  Q
    || | |||| ||||||| |||  || ||| || ||||||||||||| ||||| | || |||   |  || ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  42886540 ggtaagtttaaattaccccatc-cagagg-aatacaattgttgtagctggaaggtacattaaatcggtacctaatgatgatcttctggcggaatcagact 42886443  T
Q  765 tttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttc 864  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || || |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||     
T  42886442 gttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcgtatcgatccactagaaaatgttgtgctctcaaagcatgctcgtcatgttttcgtcgttg 42886343  T
Q  865 tttaattccacccaagtgaatta---taccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
     |||||||||||||||||||| |   ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42886342 gttaattccacccaagtgaatgatagtactctcccctcgtcgagcgttggaagtttata 42886284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 49791589 - 49792124
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||  | | | |||||       
T  49791589 acgtttgtacctcccaactacaacaattggcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgatcgg-cattccca 49791687  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||  || |||    
T  49791688 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacactacaatacc 49791785  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  |  |  |||| ||||||| || ||||||||||    
T  49791786 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttgacaagtttgaatta 49791883  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | || || ||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  49791884 ccccattt-aaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgatgatcttttggcggaatcaagttgttgatgatatcttc 49791981  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  49791982 agttgatctcagcaacgttacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaa 49792081  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49792082 gtgaataatactctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 49792124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 661 - 922
Target Start/End: Original strand, 47657281 - 47657543
Alignment:
Q  661 gccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaa 757  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||    |  || |||||||||||||||||| ||||    
T  47657281 gccgtttgacaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaatgtgcattcattcgatacctaatgacgatcttctggtggaa 47657378  T
Q  758 tcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttc 857  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  47657379 tcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaatatgctcgtcacgttttg 47657478  T
Q  858 gttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47657479 gtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccatcgtcgagcgttggatgtttatacc 47657543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 663 - 922
Target Start/End: Original strand, 43889427 - 43889687
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatc 759  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  43889427 cgtttggcaagtttgaattaccccattt-agagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatc 43889524  T
Q  760 aaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgt 859  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43889525 aaacttttgattatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgt 43889624  T
Q  860 tgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43889625 cgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 43889687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 371 - 921
Target Start/End: Original strand, 49817280 - 49817831
Alignment:
Q  371 tggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatt 470  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   ||    
T  49817280 tggacgtttataccgaacttttgtaccttccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgccaaacagcatgactacaatgtt 49817379  T
Q  471 tcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttg 570  Q
      ||| |   |||   | |||| ||  ||||  |||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  49817380 cgaccagtgtttctattgttccattcgaaagtttaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttg 49817479  T
Q  571 acactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaa--tgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgttt 667  Q
    |||||| || ||| || | |||| | | ||| ||| ||||||||||||| ||||||| || || ||  || ||| |||| | ||  | ||||| | ||||    
T  49817480 acacttgaataccatcttttaaatcggccta-caagaatttaatcttttgaaaggaacaatataaaaatgtcgatcgaa-tactggagtcctg-ctgttt 49817576  T
Q  668 ggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaact 764  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || | || ||    || || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49817577 ggcaagtttgaattaccccatt-caaatg-aagacaattgttgtagttgaaaggtacattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcagact 49817674  T
Q  765 tttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttc 864  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  49817675 gttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtaacgttttcgtcgttc 49817774  T
Q  865 tttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
     |||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49817775 gttaattccacccaactgaatgttactctcccctcgtagagcgttggacgtttatac 49817831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 390 - 922
Target Start/End: Original strand, 36776175 - 36776707
Alignment:
Q  390 tttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt- 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  | || ||||| |   ||| ||  | |||||   |      
T  36776175 tttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaatttgtcaattagcaggactctaatgtttgactgg-cattcccatag 36776273  T
Q  489 ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcat 587  Q
    |||| || |||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  36776274 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggttttgtttaaatgacggtattcaagtgtcaaatgaatgaggttcattcattgacacttcaataccttcat 36776373  T
Q  588 ctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctc 686  Q
     |||||| ||||||||| || |||||||||| | | ||| ||   ||||| ||  |||| ||  |  | || || |||||||||| |||||||||||| |    
T  36776374 ttaaaccggtctaacaagaacttaatcttttgacaagaacaatgggaatgtcggtcgaacat--tggagtcatg-ccgtttggcaagtttgaattacccc 36776470  T
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaatt 783  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36776471 att-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctttcagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 36776568  T
Q  784 gatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtga 883  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  36776569 gatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgccgtgctcccaaaccatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattctacccaagtga 36776668  T
Q  884 attataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36776669 ataatactctcccctcgtcgagcgttggacatttatacc 36776707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 497 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 18413034 - 18412614
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||| | |||| || ||||||| |||   |||||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  18413034 aaaagattaaatttttgttag-cttggtttaaa-gatgataatcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgagactgcaataccttcatctaaacca 18412937  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | || || | ||| || ||  |  ||| ||||||  || |||||||||||| ||||||| ||    
T  18412936 agctaacaataatttaatcttttgaaaggaaaaatagaactgtcgggtgaa-tgtttggaaactg-ccgtttaacaagtttgaattaccccatttcagag 18412839  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
     ||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  18412838 -taagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaattgttgataatatattcagttgatctcagcaac 18412741  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||| || ||||| |||  || |    
T  18412740 gttacacgcatatcgatccactgaaacatggtgtgctcccaaaacatgctcctcacgttatcgtcgttcattaattccaccgaactgaatgatattcttc 18412641  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18412640 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 18412614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 732 - 922
Target Start/End: Original strand, 6282321 - 6282511
Alignment:
Q  732 taactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgc 831  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6282321 taactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 6282420  T
Q  832 tcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  6282421 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctctccttgtcgagtgttggacgtttatacc 6282511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 387 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 2773563 - 2773030
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  |||  ||| |   | |       
T  2773563 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaatttaaacttgccaagcatcatgactccaatattcgaccagcactcccaa 2773464  T
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttc 585  Q
    | |||| || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||  ||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||    
T  2773463 tgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatggcggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttc 2773364  T
Q  586 atctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacct 685  Q
    || |||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  |  |   ||| ||||||| || ||||||||||||     
T  2773363 atttaaaccaacctaacaagaatttaatcttttgacaggaataatgggaatgccggtcgaa-tattggagaactg-ccgtttgacaagtttgaattaccc 2773266  T
Q  686 catttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaat 782  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | || || || ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |    
T  2773265 catt-caaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctgatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatggtatcttcagt 2773168  T
Q  783 tgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtg 882  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2773167 tgatctcaataacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtg 2773068  T
Q  883 aattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2773067 aatgatactctcccctcgtagagcgttggacgtttata 2773030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 663 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 24607028 - 24606773
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24607028 cgtttggaaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaatgtacatttacctacctaatcacgatcttctggcggaatcaga 24606931  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  24606930 ctcttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcaatccacgggaacatgatgtgctcccaatacatgctcgtcacgttttcgtcgt 24606831  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||| ||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  24606830 tcgttaattctacccaactgaataatactctccgcttgtcgagcgttggacatttata 24606773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 661 - 921
Target Start/End: Original strand, 44560106 - 44560367
Alignment:
Q  661 gccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaa 757  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || ||||||||||||||  || | ||    
T  44560106 gccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttaaggagaaa 44560203  T
Q  758 tcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttc 857  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44560204 tcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatacactggaacatgctttgctcccaaaacatgcttgtcacgttttc 44560303  T
Q  858 gttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44560304 gtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttatac 44560367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 735 - 920
Target Start/End: Original strand, 26591686 - 26591871
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26591686 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 26591785  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26591786 caaaatatgttcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttata 26591871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 663 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 31324451 - 31324194
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||    
T  31324451 cgtttagcaagtttgaattatctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcatgatcttctagcggaatcaaa 31324353  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
    || ||||  || |||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  | || ||    
T  31324352 ctgttgagaatgtcttcagttgatctcagcaactttacacacatatcgatccacggtaacatgttgtgctccaaaaacatgctcgtcacgtcattgtcgt 31324253  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31324252 tcgttaattccacccaactgaataatattctcccatcgtcgaacgttggacgtttatac 31324194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 695 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 3393549 - 3393325
Alignment:
Q  695 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaa 794  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |  | || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3393549 ggtaatacaaatgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaa 3393451  T
Q  795 cgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctc 894  Q
    ||| ||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||  |||    
T  3393450 cgttacatgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcctcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgataatctc 3393351  T
Q  895 ccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3393350 ccatcctcgagcgttggacgtttata 3393325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 673 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 11288559 - 11288315
Alignment:
Q  673 gtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatga 772  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| |  | || |||||  |||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |    
T  11288559 gtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattatggtagttggaaggtgcatt-ccctacttaatcacgatcttctaacagaatcaaa-ttgtgataa 11288464  T
Q  773 tatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattc 872  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  11288463 tatcttcagttgatctcagcaacgttactcgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattc 11288364  T
Q  873 cacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    ||||||| | ||| |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11288363 cacccaactaaatgatattctcccctcgtcgaccgttggacgtttatac 11288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 695 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 10312517 - 10312291
Alignment:
Q  695 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaa 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    || ||||| ||||| |||||||||  ||||||| | | | ||||| ||||||||| ||||||| | |||    
T  10312517 ggtaagacaattgttgtagttggaaggtgaatt-ccctacctaatcacgatcttccagcggaattagattgttgataatatcttcagttgatcttaacaa 10312419  T
Q  795 cgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctc 894  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||  |||    
T  10312418 cgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctc 10312319  T
Q  895 ccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  10312318 ccatcgtcgagtgttgtatgtttatacc 10312291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 393 - 724
Target Start/End: Original strand, 1042966 - 1043296
Alignment:
Q  393 gtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttc 491  Q
    |||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  1042966 gtacattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaatcggccaaacaacatgactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttc 1043065  T
Q  492 ctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatct 589  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||    
T  1043066 ctttgaaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatct 1043162  T
Q  590 aaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctca 687  Q
    ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |  ||||| || ||||||| ||| ||||    
T  1043163 aaatcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgagcgaaattcttgagtcct-gttgtttgacaggtttgaatttatctca 1043260  T
Q  688 tttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1043261 -ttcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 1043296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 39589151 - 39589476
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  39589151 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcaagcatttcactcggcattcatgtttttcctttg 39589250  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   | | ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  39589251 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacataatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagc 39589347  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | | || |  |||||||| ||||||||| ||| || ||||    
T  39589348 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgtgtgaaatgtttgagt-cttgttgtttggcaagtttgaattgacccca-ttca 39589444  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39589445 aaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 39589476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 687 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 13866516 - 13866282
Alignment:
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgat 786  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  13866516 atttcagaggtatgacaattgttgtagttgaaaggtgcatt-ccctacctaatcacggtcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgat 13866418  T
Q  787 ctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaatt 886  Q
    ||||||||||| ||   |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||  ||||||||| |||| |||||     
T  13866417 ctcagcaacgttacatacatatcaatccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgtcgtcgtcgtttgttaattccatccaactgaatg 13866318  T
Q  887 ataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13866317 atattctcccatcgtcaaatgttggacgtttatacc 13866282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 401 - 504
Target Start/End: Original strand, 38132786 - 38132889
Alignment:
Q  401 caactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaa 500  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38132786 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcaccccgcattcatgttttcctttgaaaa 38132885  T
Q  501 gaat 504  Q
    ||||    
T  38132886 gaat 38132889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 694 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 13850995 - 13850768
Alignment:
Q  694 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagca 793  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  13850995 aggtaagataattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacggtcttctggcggaatcaaactgttgagaatatctttagttgatctcagca 13850897  T
Q  794 acgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccct 893  Q
    | || ||   ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||  |||||| || |||| ||||| |||  ||    
T  13850896 atgttacatacatatcgatccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgtcgtcgtcgtttgttaatttcatccaactgaatgatattct 13850797  T
Q  894 cccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13850796 cccatcgtcaaacgttggacgtttatacc 13850768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 724
Target Start/End: Original strand, 45939778 - 45940074
Alignment:
Q  427 aatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgct 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | |    
T  45939778 aatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgaccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-t 45939875  T
Q  525 ttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaacca-gtctaacaataatttaatcttttcaa 621  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || |||  |||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  45939876 ttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacatcatttcattggcacttgaataccaccatctaaagcaagtctaacaa-aatttattcttttcaa 45939972  T
Q  622 aggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttga-attacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 720  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |  |||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45939973 aggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaagtttgactttacctca-ttcgaaggtaagacaattgttgtagttggaat 45940070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 21711752 - 21712078
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| |||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  21711752 ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctt 21711850  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  21711851 tgaaaagattaaatttttgttagg-gtgatttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaatctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 21711947  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcattt 690  Q
     | || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| | | || |  |||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  21711948 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtact-gttgtttggcacgtttgaatttacctca-tt 21712044  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21712045 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 21712078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 24607274 - 24607051
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcct 493  Q
    |||||||||||  ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| | |  | || || |     
T  24607274 accttccaactaaaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaacaacaactatcaagcatt-cacccgaaagttttattgtttca 24607176  T
Q  494 ttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  24607175 ttcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagagtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatttaaa 24607076  T
Q  593 ccagtctaacaataatttaatcttt 617  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  24607075 ccagcctaacaagaatttaatcttt 24607051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 28082460 - 28082784
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  28082460 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 28082558  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaacc 594  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||| ||| |    
T  28082559 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacatcatttcgttggcacttgaataccatcatccaaagc 28082655  T
Q  595 a-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat-tacctcatttca 692  Q
    | | ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||| | |||| |  ||||| || |||||||| || |||| ||||    
T  28082656 acgcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aagacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtcct-gttgtttgacaggtttgaatctatctca-ttca 28082752  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28082753 aaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 28082784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 398 - 518
Target Start/End: Original strand, 9489900 - 9490021
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9489900 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcaagcatttcactcgacattcatgtttttcctttg 9489999  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttagg 518  Q
    |||| | |||||| ||||||||    
T  9490000 aaaaaattaaattcttgttagg 9490021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 724
Target Start/End: Original strand, 27759552 - 27759876
Alignment:
Q  401 caactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttga 497  Q
    ||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||||    
T  27759552 caactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggctatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctttga 27759650  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||| ||    
T  27759651 aaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagca 27759747  T
Q  596 -gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaa 693  Q
     | |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | |||||   |||||||  ||||||||| ||| |||| |||    
T  27759748 agcctaataaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaacgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggccagtttgaatttaccccatt-caa 27759845  T
Q  694 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27759846 aggtaagacaattgctgtagttggaatgcac 27759876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 21170140 - 21170237
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21170140 taccatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 21170237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 451
Target Start/End: Original strand, 43889152 - 43889218
Alignment:
Q  385 gaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43889152 gaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaa 43889218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 51427709 - 51427612
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  51427709 taccatcatttaaaatgctcatctcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 51427612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 497 - 818
Target Start/End: Original strand, 49816964 - 49817281
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||| | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  49816964 aaaagattaaaatcttgttaggtttggtttgaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatttaaacca 49817063  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    | ||||||  ||||| ||||||| || |||| || |  | | ||| ||  ||||||  |  ||| || ||||  || ||||||||| ||  ||||||  |    
T  49817064 gcctaacatgaattttatcttttgaatggaacaatagaacttccgggccgaatgctagagacctagc-gtttaacaagtttgaatttcc--atttcag-g 49817159  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  49817160 gtaagacaattattgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttttggcagaatcagactgttgataatatcttcatttgatctcatcaac 49817258  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactg 818  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  49817259 gttacacgcatatcgatccactg 49817281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 22437601 - 22437698
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  22437601 taccatcattcaagatgctcatcggaggctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgctccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 22437698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 487 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 20901570 - 20901335
Alignment:
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacacctt 584  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| |    
T  20901570 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctgg-tttagatgaaggtagt-aagtgccaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccat 20901474  T
Q  585 catctaaacca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-a 682  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | || ||   |||||||| ||||||||| |    
T  20901473 catctaaagcaagcctaacaaaaatttattattttcaaaggaaaaacatgaatgcgggacgaaatgcttgagtcatgtt-gtttggcaagtttgaattta 20901375  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 723  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901374 ccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 20901335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 46816510 - 46816183
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttga-atggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgttttc--ct 493  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||    
T  46816510 ttccaactacaacaattgtcttacctctgagatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaagactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttttct 46816412  T
Q  494 ttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaa 591  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| | ||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  46816411 ttgaaaaggttaaatttttgttaggc-cggtttagatgaaggtatt-aggtgtcaaag-aatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaa 46816315  T
Q  592 a-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatt 689  Q
    | | || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| | | || |  |||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  46816314 agcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgattgccgggtgaaatgcttgagt-cttgttgtttcgcaagtttgaatttacctca-t 46816218  T
Q  690 tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46816217 tcaaaggtaagacaattgttgtagttagaatgcac 46816183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 398 - 719
Target Start/End: Original strand, 49064201 - 49064523
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacct-ttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg--ttttcct 493  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | || ||||||||  |||||||    
T  49064201 ttccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgttttttcct 49064299  T
Q  494 ttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaa 591  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  49064300 ttgaaaatattaaattcttattagg-ttggtttagatgatggtatt-aagtttcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttaaataccatcatctaa 49064396  T
Q  592 a-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatt 689  Q
    | | || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||| |||| | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| |    
T  49064397 agcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgggtgaaacgcttgagtcct-gttgtttggcaagtttgaatttatctca-t 49064493  T
Q  690 tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49064494 tcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 49064523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 398 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 51428177 - 51427858
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  | | ||||||||||||||   || |||||||||||| ||||    
T  51428177 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttggcaaacggccaggactcaagcatttcgatcggcattcatgtttttcctt 51428079  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  51428078 tgaaaagattaaattcttgttagtctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 51427982  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || | ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| ||| ||||     
T  51427981 gcaagcctaacaaaaatttattattttcaaaggaaaa-catgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaagtttgaatttaccccatt- 51427885  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttgg 717  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  51427884 caaaggtaacacaattgttgtagttgg 51427858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 2773699 - 2773796
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  2773699 taccaacattcaaaatgttcatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgctccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 2773796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6282022 - 6281925
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  6282022 taccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcttgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 6281925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 241954 - 241847
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||| |    
T  241954 taccatcatttaaaatgttcatcgcatgctggagtcctgcggtttagcaagtttgaatttgccacattcaagggtaagataattattgcagttgaaaggt 241855  T
Q  341 gcattcat 348  Q
     |||||||    
T  241854 acattcat 241847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 516 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 10312692 - 10312589
Alignment:
Q  516 aggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatc 614  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  10312692 aggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaaaccagcctaacataaatttaatc 10312593  T
Q  615 tttt 618  Q
    ||||    
T  10312592 tttt 10312589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 37867195 - 37867278
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  37867195 atgctgatcgaatactggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaatggtaagataattgttgcagttggaag 37867278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 49571663 - 49571587
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  49571663 acgtttgtacctcccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactc 49571587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 398 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 14330679 - 14330358
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| | ||  |||||| | |||  |||||||||||| |||||    
T  14330679 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttatcaaacgacaagtcttcagcatt-cgcccatcattcatgtttttccttt 14330582  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaac 593  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||  ||||| ||||| ||  ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  14330581 gaaaagattaaactcttgttaggctgg-tttagatgaaagtattgaagtgtcagggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaac 14330484  T
Q  594 cagtc-taacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttc 691  Q
    ||  | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||    ||||| |  ||||||||| |||||| |||    
T  14330483 caaccctaacaaaaatatattcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcct-attgtttgaccagtttgaattaacctca-ttc 14330386  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330385 aaaggtaagacaattgttgtagttggaa 14330358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 328
Target Start/End: Original strand, 42886969 - 42887056
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttg 328  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||    
T  42886969 taccatcatttaaaatgccaatcgaatattggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagataattgttg 42887056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 45940227 - 45940310
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  45940227 atgctgatcgaatactagagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 45940310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 389 - 451
Target Start/End: Original strand, 26591570 - 26591632
Alignment:
Q  389 gtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26591570 gtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 26591632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 1043455 - 1043532
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  1043455 atcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 1043532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4784888 - 4784791
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||    
T  4784888 taccatcatttaaaatgttgatcgaatgctggagtcctgcagtttaacaagtttgaatttacctcattcagagataagatgattgttgcagttggaag 4784791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6176836 - 6176739
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  6176836 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 6176739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 688 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 17292214 - 17292106
Alignment:
Q  688 tttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatc 787  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  17292214 tttcagaggtaaaacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacataatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatc 17292116  T
Q  788 tcagcaacgt 797  Q
    || |||||||    
T  17292115 tctgcaacgt 17292106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21016698 - 21016601
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  21016698 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 21016601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 25762820 - 25763147
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| | || |||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  25762820 ttccaactgcaacaattgtcttacctctaaaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcatttcgccaagcattcatgtttttcctt 25762918  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||| | |||||| || ||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| |   ||||| | ||| ||||| || | | |||||||||    
T  25762919 tgaaaatattaaattcttattatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-gaaataaacctcatttcgttggcacttgaatatcatcatctaaa 25763015  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttga-attacctcattt 690  Q
     || ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | || |  ||||| || ||||||  ||||| || ||    
T  25763016 gcaagtctaacaaaaaattattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagt-cttgttgtttgacaagtttgactttacccca-tt 25763113  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25763114 cgaaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 25763147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 34152702 - 34152779
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34152702 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcatgactccagcat 34152779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34152804 - 34152707
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| |||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34152804 taccatcattcaagatgttcatcgcatgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 34152707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49791453 - 49791356
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||    
T  49791453 taccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagtgggaatataattgttggagttagaag 49791356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 392 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24607602 - 24607375
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-tt 490  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||||||||||||| ||||  | || || ||||  |||||||  || ||||||  | || ||    
T  24607602 tgtaccttccaactacaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaagttgctgagcagcaggacttcagcatttgtcc-gacatttctattgtt 24607504  T
Q  491 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacac-ttaacaccttcatct 589  Q
    || || |||||| ||||||  ||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||   |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |    
T  24607503 ccattcaaaagattaaattcatgttaggtttggtttaaataatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccgttccttgacactttaataccttcattt 24607404  T
Q  590 aaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    ||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  24607403 aaaccggccaaacaagaatttaatctttt 24607375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 9490182 - 9490265
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  9490182 atgctgatcgaattctggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 9490265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40353280 - 40353197
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  40353280 atgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 40353197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 46816044 - 46815957
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttg 328  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  46816044 taccgtcattcaagatgcttatcgaatattggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcatgggcaagacaattgttg 46815957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 49095445 - 49095528
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  49095445 atgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 49095528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 418 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 1226601 - 1226547
Alignment:
Q  418 ttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1226601 ttacctttgaatgaggtaaattcaaactggtcaaacaacatgactcaagcatttc 1226547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 3393743 - 3393613
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||   ||| |  | ||||||||||||||| || |||||||||||||  |    
T  3393743 aaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaattaaatgcattccttgacacttcaataccttcatctaaatga 3393644  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
    | ||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  3393643 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaa 3393613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 956943 - 956875
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  956943 tggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcacttggaag 956875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17211836 - 17211760
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatt 470  Q
    |||||| |||| ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17211836 accttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacatgactcaaacatt 17211760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 208
Target Start/End: Original strand, 31823316 - 31823384
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaa 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31823316 tgatcaacccttgggataagtttaaatctgcttttttgtactccataaactttttaccgtgggtaaaaa 31823384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33163529 - 33163387
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacct-ttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  33163529 ttccaactacaacaattgtcttgcctcttaaatggggtat-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaaacatttcgctcgacattcatgtttttcctt 33163431  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  33163430 tgaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttagatgaaggtatt 33163387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36776007 - 36775939
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36776007 tggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 36775939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 37866629 - 37866771
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||| | || |||||||| |||||||     
T  37866629 ttccaactgcaacagtcgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctg 37866727  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  37866728 tgaaaatattaaattattgttaggc-tggtttagatgaaggtatt 37866771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49423269 - 49423177
Alignment:
Q  246 tcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| || |||||||||| || ||||| |||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  49423269 tcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcctgttgtttatcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttacagttggaag 49423177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 6176893 - 6176982
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6176893 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 6176982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 21016755 - 21016844
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21016755 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 21016844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21169749 - 21169644
Alignment:
Q  262 tcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactg 361  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||  | |||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  21169749 tcgaatattggagtcctgccgtttggcaagtttgaattacc-ccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatg 21169652  T
Q  362 acgatctt 369  Q
    ||||||||    
T  21169651 acgatctt 21169644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Original strand, 27760049 - 27760112
Alignment:
Q  275 tcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  27760049 tcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 27760112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 28082937 - 28083020
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||| ||||    
T  28082937 atgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagtttgaag 28083020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 398 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 31824614 - 31824305
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||| |||||| | |||||| || |||||||||||||  | || ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  31824614 ttccaactacaacaattgtcttacatttgaaatagggtaattt-aaacttgccaaacggccattactcaagcatttcgcccaacgttcatgtttttcctt 31824516  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||| | |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  31824515 tgaaaagattaaaatcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 31824419  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcattt 690  Q
     | || || | || |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | |||| |   ||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  31824418 gcaagcctgataaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaacgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggccagtttgaatttacctca-tt 31824321  T
Q  691 caaaggtaagacaatt 706  Q
    ||||||||||||||||    
T  31824320 caaaggtaagacaatt 31824305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34529299 - 34529216
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  34529299 atgctcatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcatttagtggtaagataattgttgcagttggaag 34529216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 56139610 - 56139693
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  56139610 atgctgatcgaatactggagttctgttggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 56139693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44559834 - 44559752
Alignment:
Q  252 aaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  44559834 aaaatgctcatcgcatgctggagtcatgctgtttaacaagtttgaatttgcctcattcaagggtaagataattgttgcagttg 44559752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 885514 - 885591
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||    
T  885514 atcgaatattggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccatttagaggcaaggcaattgttgtagttggaag 885591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 398 - 545
Target Start/End: Original strand, 1226381 - 1226527
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctt-tgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttc-cttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||| | |   |||||| | ||||||||| |||||||  ||||    
T  1226381 ttccaactacaacaattgtcttacctcataaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgacaagtcctcagcatt-cgcccgacattaatgttttttcttt 1226478  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  1226479 gaaaagattaaatttttgttaggc-tggtttagatgaaggtattgaagtg 1226527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21170242 - 21170165
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  21170242 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 21170165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 694 - 839
Target Start/End: Original strand, 23124486 - 23124630
Alignment:
Q  694 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagca 793  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||  ||||||| ||  ||||||||||    
T  23124486 aggtaagacaattgttgtagttgaaaggtgcatt-ccctacctaatcacaatcttctggcgaaatcaaattgttgagaatatctttaagcgatctcagca 23124584  T
Q  794 acgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaa 839  Q
    |||| ||   |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||    
T  23124585 acgtgacaaacatatcgatccacgagaacatgttgtgctaccaaaa 23124630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 600 - 724
Target Start/End: Original strand, 37866833 - 37866955
Alignment:
Q  600 aacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggta 698  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  | | |||||   ||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  37866833 aacaaaaatttattcttttcaaaggaaaa-catgaatgccgggtgaaatgtctgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattgaccccatt-caaaggta 37866929  T
Q  699 agacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  37866930 agacaattgttgcagttggaatgcac 37866955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 310
Target Start/End: Original strand, 47870801 - 47870850
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattca 310  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47870801 atcgaatactggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattca 47870850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 465
Target Start/End: Original strand, 51027235 - 51027307
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaa 465  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51027235 tgtaccttccaactacaacaattgtcttac-tctggatggggcaaattcaaacttgctaaacaacatgactcaa 51027307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 51027751 - 51027601
Alignment:
Q  399 tccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttccttt 495  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  51027751 tccaactacaacaattgtcgtacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaagcggccatgactcaagcatttcgcccagcattcatgtttttccttt 51027653  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaa 549  Q
     |||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  51027652 aaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgccaa 51027601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 51427607 - 51427684
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  51427607 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 51427684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 596
Target Start/End: Original strand, 32937356 - 32937464
Alignment:
Q  489 ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcat 587  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||| | |||| |||| |||||| ||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  32937356 ttcctttcaaaatattaaattcttgttaggctcggtttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttcaatacctccat 32937455  T
Q  588 ctaaaccag 596  Q
    |||||||||    
T  32937456 ctaaaccag 32937464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49817362 - 49817306
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  49817362 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttggaag 49817306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 689 - 724
Target Start/End: Original strand, 885320 - 885355
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  885320 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 885355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 6177278 - 6177161
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  6177278 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgc 6177180  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  6177179 -tggtttagatgaaggtatt 6177161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 14289858 - 14289929
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  14289858 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccctttaatggggtaaattcaaacttcctaaacaacaggactc 14289929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21712887 - 21712817
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgc--nnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21712887 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcttttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaa 21712817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 338
Target Start/End: Original strand, 25763280 - 25763355
Alignment:
Q  263 cgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  25763280 cgaatgctggagtcatgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 25763355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 576
Target Start/End: Original strand, 32937688 - 32937767
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt 576  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  32937688 aaaagattaaattcttgttaggctgggtttaaatgatggtatttaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 32937767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 37867283 - 37867212
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  37867283 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccattgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 37867212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 613 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 38132887 - 38132778
Alignment:
Q  613 tcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgta 712  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| | || ||   |||||||| |||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  38132887 tcttttcaaaggaaaa-catgaatgcggggtgaaatgcttgagtcatgtt-gtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagacaattgttgta 38132790  T
Q  713 gttggaatgcac 724  Q
    |||| |||||||    
T  38132789 gttgaaatgcac 38132778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 43889458 - 43889513
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43889458 ggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctt 43889513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 49064726 - 49064781
Alignment:
Q  246 tcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttg 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49064726 tcatttaaaatgttcatcgaataccagagtcctgcagtttagaaagtttgaatttg 49064781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Original strand, 49423317 - 49423410
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  49423317 taccgtcattcaaaatgctcattgaatgctggattcctgctgtttaacaagtttgaa-ttaccccattca-gaggaagacaattgttgtagttgga 49423410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Original strand, 56139154 - 56139271
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  56139154 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgc 56139252  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  56139253 -tggtttagatgaaggtatt 56139271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21170097 - 21170039
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatt 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  21170097 taccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaagaagtttgaatt 21170039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 344
Target Start/End: Original strand, 21712246 - 21712320
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  21712246 tggagtcctgctgcttaggaagtttgaatttgccccatttaggggcaagacaattgttgtagttgaaaggtgcat 21712320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31824164 - 31824114
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  31824164 ttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttg 31824114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 55796965 - 55797037
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  55796965 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggctaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttc 55797037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 6281920 - 6281997
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  6281920 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaagactccagcat 6281997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14330160 - 14330063
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| | || ||||| | || |||||| |||||| |||||||||||| | ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14330160 taccatcattcaagatgttgatagaatattagagtcctgctgtttaggaagtttgaatttaccccattaaagggtaagataattgttgcagttggaag 14330063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 616
Target Start/End: Original strand, 20778714 - 20778775
Alignment:
Q  556 gaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatctt 616  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20778714 gaggtgcattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatctt 20778775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27760863 - 27760778
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  27760863 tgatcgaccattgggataagtttaaatctgctattttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcttgttggggtat 27760778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43889018 - 43888921
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||  |||| || ||| ||||| ||||||||||||| | ||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  43889018 taccatctttcaagatgctcatcgcatgttggagtcttgctgtttaacaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagttggaag 43888921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 618
Target Start/End: Original strand, 44560008 - 44560065
Alignment:
Q  562 cattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44560008 cattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatctttt 44560065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 49095368 - 49095285
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49095368 atcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt-gccccatccagggt-aagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 49095285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 49423172 - 49423249
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    ||||||||||||||  ||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  49423172 tgtaccttccaactgtaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgataaacaacaggactccagcat 49423249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 49571799 - 49571896
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||  |||| || ||| | ||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49571799 taccatcattaaagatgctgatcggatgttggagtcatgctgcttagcaagtttgaatttgccctatttaagggtaagataattgttgcagttggaag 49571896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 49791351 - 49791428
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  49791351 tgtaccttctaactccaacaattatattcccactgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 49791428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1043537 - 1043481
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  1043537 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 1043481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9490270 - 9490214
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  9490270 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 9490214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 208
Target Start/End: Original strand, 32936058 - 32936126
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaa 208  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32936058 tgatcaacccttggaataagtttaaatgtgcttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaa 32936126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Original strand, 36776478 - 36776534
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatcttt 370  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  36776478 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttt 36776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 613 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 51027535 - 51027437
Alignment:
Q  613 tcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgt 711  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| | |||||   |||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  51027535 tcttttcaaaggaaaaatatgaatgcggggtgaaatgcttgagtcctgtt-gttttgcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgt 51027438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 55797366 - 55797292
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  55797366 atcgaatactggagtcctgccgattagtaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaa 55797292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 956870 - 956941
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  956870 tgtaccttccaagtgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 956941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 957414 - 957469
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  957414 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 957469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 447
Target Start/End: Original strand, 4784786 - 4784841
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 447  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  4784786 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttatctctgaatgaggtaaattcaaacttg 4784841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 14330058 - 14330129
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  14330058 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccctttaatggggtaaattcaaacttcctaaacagcaggactc 14330129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 36775934 - 36776005
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  36775934 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 36776005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 41794525 - 41794475
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41794525 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttc 41794475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 447
Target Start/End: Original strand, 43888916 - 43888971
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 447  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43888916 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctaaatggggtaaattcaaacttg 43888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 44560139 - 44560194
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  44560139 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 44560194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 472
Target Start/End: Original strand, 49094989 - 49095039
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  49094989 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttc 49095039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 724
Target Start/End: Original strand, 56139422 - 56139457
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56139422 ttcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcac 56139457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 56139696 - 56139633
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaaca 457  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  56139696 taccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccaaca 56139633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 21017162 - 21017090
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  21017162 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 21017090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 395 - 453
Target Start/End: Original strand, 21169673 - 21169729
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 453  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21169673 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaac 21169729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 28797186 - 28797232
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  28797186 actccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcatcttggggtat 28797232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 399 - 457
Target Start/End: Original strand, 32937590 - 32937648
Alignment:
Q  399 tccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaaca 457  Q
    ||||||| |||||||  | ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32937590 tccaactacaacaattatcttaccgttgaatgaggcaaattcaaacttgccaaacaaca 32937648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 666 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 34153003 - 34152950
Alignment:
Q  666 ttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34153003 ttggcaagtttgaatttacctcatt-caaaggtaagacaattgttgttgttggaa 34152950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 38131840 - 38131886
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  38131840 actccataaactttttactgtgggtaaaaatattcttgttggggtat 38131886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 42886926 - 42886868
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||  |||||||||||    
T  42886926 taccatcatttaaaatgctcatcgaatgttggagtcatgccgtttaataagtttgaatt 42886868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47043504 - 47043458
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  47043504 actccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcttgttggggtat 47043458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 395 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 49423743 - 49423686
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 453  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  49423743 accttccagctacaacaattgtgttacctttgaatggggt-aattcaaatttgtcaaac 49423686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 680 - 717
Target Start/End: Original strand, 2773514 - 2773550
Alignment:
Q  680 ttacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 717  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2773514 ttacctcatt-caaaggtaagacaattgttgtagttgg 2773550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 715
Target Start/End: Original strand, 3393807 - 3393836
Alignment:
Q  686 catttcaaaggtaagacaattgttgtagtt 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3393807 catttcaaaggtaagacaattgttgtagtt 3393836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14289960 - 14289863
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| | || ||||| | || |||||  |||||| |||||||||||| | ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14289960 taccatcattcaagatgttgatagaatattagagtcctgttgtttaggaagtttgaatttaccccattaaagggtaagataattgttgcagttggaag 14289863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20901224 - 20901128
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| ||||| || ||||| |||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||||| |||||||||    
T  20901224 taccttcattcaagatgctgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccatctagagt-aagacaattgttgtagttggaag 20901128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26591654 - 26591581
Alignment:
Q  262 tcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgg 335  Q
    ||||||| |||| |||||| | || |||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  26591654 tcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 26591581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27760117 - 27760044
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaa 465  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||| || || || |||||||    
T  27760117 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactcaa 27760044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Original strand, 40353357 - 40353440
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  40353357 atcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattt-ccccatcca-gggtaagacaatttttgcagttggaatgtgcattc 40353440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 338
Target Start/End: Original strand, 42886741 - 42886810
Alignment:
Q  269 ctggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| || ||| |||| |||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  42886741 ctggagtcatgctgtttggcaagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttggagttggaag 42886810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 42887045 - 42887000
Alignment:
Q  418 ttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  42887045 ttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 42887000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 44559743 - 44559820
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||| ||||| |||||||  | ||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  44559743 tgtacctttcaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggcaaattcaaacttgttaaacagcatgactccagcat 44559820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 134)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 241 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 7082918 - 7082337
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||  | |  ||||  || ||||||||||||||||||||||| |    
T  7082918 taccatcattcaagatgctcatcgaatgctggagtcctgccgtttaacaagtttgaattaccacg-ttcaaagg-aagacaattgttgcagttggaaggt 7082821  T
Q  341 gcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattc 440  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7082820 gcattcattctgtacctactgacgatcttttggacgtttatgccgaacgtttgtaccttccaactacaaaaattgtgttacctttgaatggggtaaattc 7082721  T
Q  441 aaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattc 540  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082720 aaacttgtcatacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattc 7082621  T
Q  541 aagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccg 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082620 aagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaatcagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccg 7082521  T
Q  641 agcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 740  Q
    |||||||||||| | | ||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7082520 agcgaaatgcttgagttctatccgtttggcaagtttgaattaccccttttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcaccttaccataactaatg 7082421  T
Q  741 acgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacat 824  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7082420 acgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 7082337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 11347260 - 11346727
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347260 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaatttaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcacccgacattcatg 11347161  T
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttca 586  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11347160 ttttcctttgaaaagattaaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttca 11347061  T
Q  587 tctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacct 685  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||| ||||||| ||| ||    
T  11347060 tctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatct 11346962  T
Q  686 catttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattga 785  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11346961 ca-ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 11346864  T
Q  786 tctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaat 885  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  11346863 tctaagcaacttcactcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattaatttcacccaagtgaat 11346764  T
Q  886 tataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11346763 gatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 11346727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 3601884 - 3601359
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||    
T  3601884 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaatttgccaaacaatatgactcaagcattttgccccgcattcatgtttttcctttg 3601785  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3601784 aaaagaataaatttttattaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 3601685  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| || | || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  3601684 catagcaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgtttgagtcatggccatttggcaagtttgaattaccccatttcagagg 3601585  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3601584 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttactctaactaatgacgatcttctgacggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 3601485  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3601484 tcacccgcatatcgaaacactggaacatgttgtgctcttaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 3601385  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  3601384 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 3601359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 30710138 - 30709616
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30710138 ttccaactccaacaattatgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttga 30710039  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  30710038 aaagaataaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaatcagc 30709939  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  30709938 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaaaatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcct-gttgtttggcaggtttgaattgatctca-ttcaaagg 30709841  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||     
T  30709840 -aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttccggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaact 30709742  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30709741 tcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 30709642  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  30709641 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 30709616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 1971908 - 1971383
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |  |||||||||||| ||||||    
T  1971908 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcattttgcaccgcattcatgtttttcctttg 1971809  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1971808 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttggcacttaataccttcatctaaaccag 1971709  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  1971708 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaaagctgggcgaaatgcttgagtcatggccatttggcaagtttgaattaccccatttcagagg 1971609  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1971608 caagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccataactaatgatgattttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 1971509  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  1971508 ttacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaccgaagtgaatgatactctccc 1971409  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  1971408 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 1971383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 19400906 - 19400381
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  19400906 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaacaacaagactcaagcatttcgcccctcattcatgtttttcctttg 19400807  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19400806 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaaatgccaaggaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 19400707  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| | || ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||    
T  19400706 cataacaagaatttaatattttcaaaggaaaatcatgaatgttgggcgaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaaatttgaattaccccatttcagagg 19400607  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19400606 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatattctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaccaacg 19400507  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  19400506 tcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgacactctccc 19400407  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     || ||||||||||||||||||||||    
T  19400406 ctcatcgagcgttggacgtttatacc 19400381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 8538494 - 8537972
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | | || |||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538494 ttccaactccaacaattgtcttacctttgaacgagatagattcaaacctgtcaaacaataggactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 8538395  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||      
T  8538394 aaagaataaatttttgttaggtgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcatttcttgacacttaataccttcatctaaaccaac 8538295  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  8538294 ccaacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 8538197  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  8538196 -aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaact 8538098  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8538097 tcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 8537998  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  8537997 ctcgtcgagcgttgaacgtttatacc 8537972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 38854697 - 38854176
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38854697 ttccaaccgcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttga 38854598  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||     
T  38854597 aaagaataaatttttgttaggtgtgctttagacgctggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttcacacctaataccttcatctaaaccagc 38854498  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | |  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  38854497 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcat-gttgtttggcaggtttgaattgatctca-ttcaaagg 38854400  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||     
T  38854399 -aagacaattgttgtggttggaatgcacctta-cctaactaatgacggtcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaact 38854302  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  38854301 tcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctccc 38854202  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  38854201 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 38854176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 6895 - 7418
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||   || |||||||||||| |||    
T  6895 ttccaactgcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaagcaattcatgttttcccttt 6994  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6995 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 7094  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
       |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | || ||   ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||    
T  7095 ccataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgctcgagtcatgtt-gtttgacaaatttgaattaccccatt-caaag 7192  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7193 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 7291  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7292 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 7391  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  7392 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 7418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 8575807 - 8576330
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||   || |||||||||||| |||    
T  8575807 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccgagcacttcatgttttcccttt 8575906  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8575907 gaaaagaataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 8576006  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | || ||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  8576007 gcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgctcgcgaaatgctcgagtcttgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaag 8576104  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8576105 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 8576203  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8576204 ttcacccgcatatcgatccaccggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcttcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 8576303  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  8576304 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 8576330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 19036340 - 19036863
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  19036340 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 19036439  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19036440 aaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 19036539  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  19036540 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 19036637  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19036638 g-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 19036736  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  19036737 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 19036836  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  19036837 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 19036863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 28881531 - 28881009
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcaccc-gacattcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||   ||||||||||| |||    
T  28881531 ttccaaccacaacaattgtgttacctt-gaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaagaacctcatgttttcccttt 28881433  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28881432 gaaaagaataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 28881333  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  28881332 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacacgaggttcttgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaag 28881235  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28881234 a-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 28881136  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  28881135 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 28881036  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||    
T  28881035 cctcgtcgagcgttggacgtttgtacc 28881009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 398 - 921
Target Start/End: Original strand, 27661043 - 27661565
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||   || |||||||||||| |||    
T  27661043 ttccaaccgcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccgagcacttcatgttttcccttt 27661142  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27661143 caaaagaataaatttttgtgagacttgctttagatgatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 27661242  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  27661243 gcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgctcgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaag 27661340  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  27661341 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctaagcaac 27661439  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27661440 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtaaatgatactctcc 27661539  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    | |||||||||  |||| ||||||||    
T  27661540 cctcgtcgagcaatggaagtttatac 27661565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 402 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 3459329 - 3458940
Alignment:
Q  402 aactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttc-ctttgaaaa 500  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||  |||||||||    
T  3459329 aactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaatttaaactggccaaacaacatgactcaagcatttcgccccgcgttcatgttttttctttgaaaa 3459230  T
Q  501 gaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtcta 600  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  3459229 taataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcattgacacttaataccttcatctaaaccagcata 3459130  T
Q  601 acaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaag 700  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||  ||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3459129 acaagaatttaatcttttcaaaggaaaaatatgaacgctgggcttaatacttgagtcatggtcgtttggcaagtttgaattacctcatttcagaggtaag 3459030  T
Q  701 acaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctca 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3459029 acaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagctgttgatgatatcttcaattgatctca 3458940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 398 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 3170076 - 3169766
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3170076 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 3169977  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||      
T  3169976 aaagaataaatttttgctacgcttgttttagatgatgatattcaagtgccaac-aaataaggttcattcattgacacttaatacattcatctaaatcaac 3169878  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  3169877 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcttggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggt 3169778  T
Q  698 aagacaattgtt 709  Q
    ||||||||||||    
T  3169777 aagacaattgtt 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 398 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 40012159 - 40011830
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  40012159 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgcccg-cattcatgtttttcctttg 40012061  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40012060 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttatacgatggtattcaagtgccaacgaaatgatgttcattctttgacacttaataccttcatctaaaccag 40011961  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| | |  |||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  40011960 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgttgggcgaaatgcttgagttatggccgtttgacaagtttgaattaccccatttcagagg 40011861  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcacctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011860 taagacaattgttgtagttggaatgcacctt 40011830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 407 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 22284102 - 22283704
Alignment:
Q  407 caacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-tttgaaaagaat 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||   || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22284102 caacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacttga-aaacaacaggactcaagcattttgccaagcacttcatgttttccctttgaaaagaat 22284004  T
Q  505 aaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaa 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  22284003 aaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacaattaataccttcatctaaaccagcataacaa 22283904  T
Q  605 taatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaa 704  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||| |  ||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  22283903 gaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtacttgcgaaatgctcgagtcct-gttgtttgacaagtttgaattacccca-ttcaaagg-aagacaa 22283807  T
Q  705 ttgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgc 804  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  22283806 ttgttgtagttggaatgcaccttatcctaactaaggacgattttatggtggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgc 22283707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 1399959 - 1400491
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||| |  |||  ||| |||||||       
T  1399959 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttaactttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagca---tgactccaatattcgacc-gacattccca 1400054  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1400055 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaatacc 1400152  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||   ||||| ||  ||||    ||| |  |    ||||||||| ||||||||||    
T  1400153 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcctttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaata--ttagagacctatcgtttggcaagtttgaatta 1400250  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || ||||  ||| | |||||||||||||||| ||||| |  | ||    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400251 ccccatt--aaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcactccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 1400348  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1400349 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatggatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 1400448  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1400449 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 1400491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 695 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 11028022 - 11027795
Alignment:
Q  695 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaa 794  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||    
T  11028022 ggtaagacaattgttgtggttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactttcgatgatatcttcagttgatctaaccaa 11027923  T
Q  795 cgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctc 894  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  11027922 cttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctc 11027823  T
Q  895 ccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  11027822 ccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 11027795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 696 - 922
Target Start/End: Original strand, 541598 - 541824
Alignment:
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  541598 gtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaagttgttgatgatatctccagttgatctcagcaac 541697  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  541698 gtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcccgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 541797  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  541798 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 541824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 35565824 - 35565290
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatt--tcacccgacattca 484  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||   ||||  ||   ||||||||     
T  35565824 acgtttataccttccaactacaataattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactc---cattgttcgatcgacattcc 35565728  T
Q  485 tgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
      |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  35565727 catagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaatacc 35565628  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt 681  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| ||  | || || || | |||||||| |||||||||    
T  35565627 ttcatttaaaccggtctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaacat--tgaagtcatgtc-gtttggcaagtttgaatt 35565531  T
Q  682 acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 778  Q
    ||| |||| |||||| |||| ||||||||||| || ||  ||||  | | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35565530 accccatt-caaagg-aagataattgttgtagctgaaaggtgcattcattccgcacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttctgatgatatctt 35565433  T
Q  779 caattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccca 878  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||| |||||||||||||    
T  35565432 tagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcac-gtttcatcgttcgttaattccaccca 35565334  T
Q  879 agtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35565333 agtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttagacgtttatacc 35565290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 390 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 18308809 - 18308278
Alignment:
Q  390 tttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-tt 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||  ||| |||||||    ||    
T  18308809 tttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggg-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaatattcgacc-gacattcccaatt 18308712  T
Q  489 ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcat 587  Q
    || | || |||| | |||||| |||||||||| |  ||| ||||| |||||||| || |||   |||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  18308711 tttcattcaaaatattaaattcttgttaggctgggattaaatgatagtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgaaacttcaataccttcat 18308612  T
Q  588 ctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctca 687  Q
     ||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |  |  |||  |||||||||| |||||||||||| ||    
T  18308611 ttaaaccagcttaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacccca 18308514  T
Q  688 tttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattg 784  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18308513 tt-caaagg-aagacaattgttgtaggtggaaggtgcattcattccatacctaatgtcaatctactggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttg 18308416  T
Q  785 atctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaa 884  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18308415 atctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaa 18308316  T
Q  885 ttataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18308315 tgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 18308278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 4723728 - 4724263
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||| |  ||   ||| |   | |       
T  4723728 acgtttgtacctcgcaactacaacaattgtgttacctttgaatggagtaaattcaaacttgccaagcagtaagactccaatatacgaccggcgttcccaa 4723827  T
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttc 585  Q
    | |||| || |||||| |||||| |||||||| | |  ||| || ||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  4723828 tgttccattcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaataatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 4723927  T
Q  586 atctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacct 685  Q
    || |||||  | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |  | ||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  4723928 atttaaactggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagtcctg-ccgtttggcaagtttgaattaccc 4724025  T
Q  686 catttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaat 782  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| || ||  ||||  | |    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4724026 catt-cagagg-aagacaattgttgtagctgcaaggtgcattcatttggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 4724123  T
Q  783 tgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||    
T  4724124 tgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtg 4724223  T
Q  883 aattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4724224 aatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttatacc 4724263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 387 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 1695343 - 1694859
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | ||  ||| |||||||       
T  1695343 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcatagcagcatgactcgaacgttcgacc-gacattccca 1695245  T
Q  487 tt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||    
T  1695244 tagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaatacctt 1695145  T
Q  585 catctaaaccagtc-taacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaa--tgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt 681  Q
    ||| |||||||  | |||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||| ||||   || |   ||    ||||||||| | |||||||||    
T  1695144 catttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccgatcgaacattggtgtcat----gccgtttggaaagtttgaatt 1695049  T
Q  682 acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 778  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1695048 acc-caattcagagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 1694951  T
Q  779 caattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaat 870  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1694950 cagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgttccagtgaaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaat 1694859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 722 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 40009746 - 40009546
Alignment:
Q  722 caccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaa 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  40009746 caccttaccctaactaatgacgatcttcttgtggaatcaagctgttgatgatgtcttcagttgatctcaacaacgttacccacatatcgatccactgtaa 40009647  T
Q  822 catcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40009646 catgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatac 40009547  T
Q  922 c 922  Q
    |    
T  40009546 c 40009546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Original strand, 6793388 - 6793575
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  6793388 ctaatgacgatcttctggctgaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacctcatccgcatatcgattcactagaacatgttgtgctcc 6793487  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| | | | |||||||||||| | ||||||||||    
T  6793488 caaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactcactcctcgtcgagcgttaggcgtttatacc 6793575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 729 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 33370865 - 33370674
Alignment:
Q  729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttg 828  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  33370865 ccctacctaatcatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 33370766  T
Q  829 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33370765 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctcgtcgagcgttgaacgtttata 33370674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Original strand, 36350316 - 36350494
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||        
T  36350316 ctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctacatatcgatccactggaacatgttgtg---- 36350411  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
         |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36350412 -----catgctcgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttatacc 36350494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 241 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1171833 - 1171616
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||||||||  | |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |    
T  1171833 taccatcattcaagatgctcatcgaatgctggagttctgccgtttaacaagtttgaattacc-ccattcaaagg-aagacaattgttgcagttggaaggt 1171736  T
Q  341 gcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattc 440  Q
    |||||||||     |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  1171735 gcattcatt-----cctt-----gatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttacaactacaacaatt-tgttacctctgaatggggtaaattc 1171647  T
Q  441 aaacttgccaaacaacatgactcaagcattt 471  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1171646 aaactggccaaacaacaggactcaagcattt 1171616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 766 - 920
Target Start/End: Original strand, 35927470 - 35927624
Alignment:
Q  766 ttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttct 865  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  35927470 ttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaagatgatgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcg 35927569  T
Q  866 ttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||    
T  35927570 ttaattccacccaactaaatgatactcttccctcgtcgagcattggacgtttata 35927624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 783 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 3169760 - 3169622
Alignment:
Q  783 tgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtg 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3169760 tgatctcagcaacgtcacccgcataccgatccactggaacatgttgtgctcttaaaatatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtg 3169661  T
Q  883 aattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3169660 aatgatactctccc-tcgtcgagcgttagacgtttatacc 3169622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Original strand, 36349979 - 36350211
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattcat 485  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||  |||||||||      
T  36349979 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactcca--atgttcgaccgacattccc 36350076  T
Q  486 gt-tttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacct 583  Q
     |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || ||||    
T  36350077 atagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaatacct 36350176  T
Q  584 tcatctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  36350177 tcatttaaaccggcctaacaagaatttaatctttt 36350211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 400 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 10398330 - 10398105
Alignment:
Q  400 ccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcctttgaa 498  Q
    |||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||  | || |||| || ||    
T  10398330 ccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacatctctcaagca-ttcacccgacatttctattgttccattcaa 10398232  T
Q  499 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    || | |||||| |||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  10398231 aacattaaattcttgttaggcttggtttaaataatggcattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcattgacacttcaataccttcatctaaaccaat 10398132  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaagg 624  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10398131 ctaacaagaatttaatcttttgaaagg 10398105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 19400584 - 19400911
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  19400584 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaatttgccaaacgaccatgactcaagcatttcgcccaacattcatgattttcctt 19400682  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||| | |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||||||| || || || | | |||||||||    
T  19400683 tgaaaatattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttccttggcatttgaatatcatcatctaaa 19400779  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcattt 690  Q
     | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | | || |  |||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  19400780 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgaggggcgaaatgcttgagt-cttgttgtttggcaagtttgaatttacctca-tt 19400877  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19400878 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 19400911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 732 - 920
Target Start/End: Original strand, 17366735 - 17366923
Alignment:
Q  732 taactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgc 831  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  17366735 taactaatcacgatattctggcagaatcagactcttgataatatctttagttgatctcaacaacggtacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgc 17366834  T
Q  832 tcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||  || || || ||||| ||||||||||||||    
T  17366835 tcccaaaacatgtttgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattcttccctcatcgagggttggacgtttata 17366923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 1971586 - 1971913
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| |||| |||||||| |||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||    
T  1971586 ttccaactacaacaattgtcttgcctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaatggccatgactcaagcatttcgcccagctttcatgtttttcctt 1971684  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || | | |||||||||    
T  1971685 tgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgccaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaatatcatcatctaaa 1971781  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| ||| ||||     
T  1971782 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggtgcaaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaagtttgaatttaccccatt- 1971879  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971880 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 1971913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 717
Target Start/End: Original strand, 11346930 - 11347247
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  11346930 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 11347028  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaacc 594  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  11347029 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagc 11347125  T
Q  595 a-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| | |||| |  ||||| || |||| || ||||| || ||||    
T  11347126 acgcctaacaaaaatttaatcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtcct-gttgtttgacaggtttaaatttacccca-ttca 11347222  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttgg 717  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  11347223 aaggtaacacaattgttgtagttgg 11347247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 7082961 - 7083058
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7082961 taccgtcatttaaaatgctcatcgaatattggagtcctgcagtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 7083058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 40011838 - 40012164
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  | || ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  40011838 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacggccataactcaagcatttcgcccaacgttcatgtttttcctt 40011936  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| || | ||||    
T  40011937 tgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaagaa-tgaacatcatttcgttggcacttgaataccatcgtataaa 40012033  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| ||| ||||     
T  40012034 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcgg-gcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaagtttgaatttaccccatt- 40012130  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40012131 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 40012164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 25498771 - 25498868
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25498771 taccatcatttaaaatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttggaag 25498868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 8538175 - 8538499
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  8538175 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 8538273  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaacc 594  Q
    |||| | |||||| ||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  8538274 aaaatattaaattcttgtt-gggttggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-gaaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagc 8538370  T
Q  595 a-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat-tacctcatttca 692  Q
    |   ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| | ||||    ||||| || |||||||| || |||  ||||    
T  8538371 acacctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtcct-attgtttgacaggtttgaatctatctc-gttca 8538467  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8538468 aaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 8538499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 30709819 - 30710143
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattca-tgttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||| | ||||||||||    
T  30709819 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatttttttcctttg 30709917  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaacc 594  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  30709918 aaaagattaaattcttgttaggc-tgatttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagc 30710014  T
Q  595 a-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
    | | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||| |  |||| ||| ||||||| ||| | || ||||    
T  30710015 acgcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagtcct-gttgttttgcaggtttgaatttatccca-ttca 30710111  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  30710112 aaggtaacataattgttggagttggaatgcac 30710143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 12743232 - 12743007
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcc 492  Q
    |||||| |||| ||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||    |||  | || ||||    
T  12743232 accttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatgtggtaaattcaaacttgctaaacaacaactctcaagcatt-cacctttaatttttattattcc 12743134  T
Q  493 tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaa 591  Q
     || |||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||   ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12743133 attcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgacgtgcattccttgacacttcaataccttcatctaa 12743034  T
Q  592 accagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12743033 accagcctaacaagaatttaatctttt 12743007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 12806050 - 12805825
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcc 492  Q
    |||||| |||| ||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||    |||  | || ||||    
T  12806050 accttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatgtggtaaattcaaacttgctaaacaacagctctcaagcatt-cacctttaatttttattattcc 12805952  T
Q  493 tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaa 591  Q
     || |||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||   ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12805951 attcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgacgtgcattccttgacacttcaataccttcatctaa 12805852  T
Q  592 accagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12805851 accagcctaacaagaatttaatctttt 12805825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 400 - 626
Target Start/End: Original strand, 17366398 - 17366625
Alignment:
Q  400 ccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcctttgaa 498  Q
    |||||| |||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||| |||||||||||  | || |||| || ||    
T  17366398 ccaactacaacaattatcttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaacatcagctctcaagcatt-cacccgacatttctattgttccattcaa 17366496  T
Q  499 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    || | |||||| ||| |||| ||| |||| || |||||||||||||| | |   |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||     
T  17366497 aacattaaattcttgctaggtttggtttaaataatggtattcaagtgtctaaagaatgaggtgcattccttgacaattcaataccttcatctaaaccagc 17366596  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17366597 ttaacaagaatttaatcttttgaaaggaa 17366625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 398 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 33371171 - 33370950
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcctttg 496  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||| ||  | |  | || || | ||     
T  33371171 ttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaaacaacagctctcaagcatt-cactcggaagttttattgtttcattc 33371073  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  33371072 aaaagattaaattattgttagccttggtttaaatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacactttaataccttcatttaaacca 33370973  T
Q  596 gtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  33370972 gcctaacaagaatttaatctttt 33370950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 1171876 - 1171973
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  1171876 taccgtcatttaaaatgctcatcgaatcctggagtcatgcagtttaacaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcggttggaag 1171973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 398 - 727
Target Start/End: Original strand, 3601562 - 3601892
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||   | ||||||||| |||||| |||  | |||||||||| ||||    
T  3601562 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaatggccatgactcaaacatttcgcccagcgttcatgtttttcctt 3601660  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| ||| || ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  3601661 tgaaaagattaaattcttgctatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 3601757  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || | |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | || |    ||||||||  |||||||| ||| ||||     
T  3601758 gcaagcctaataaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcaaaatgcttgagtcatatt-gtttggcaaatttgaatttaccccatt- 3601855  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3601856 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctt 3601892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 395 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 12806386 - 12806168
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcc 492  Q
    |||||| |||| ||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||   |||||||||| |||| || | |  |||| ||||    
T  12806386 accttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtgaattcaaacttgctaaatagcagctctcaagcatt-cacctgaaagttttgttattcc 12806288  T
Q  493 tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaa 591  Q
     ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12806287 attctaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtc-acagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaa 12806189  T
Q  592 accagtctaacaataatttaa 612  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  12806188 accagcctaacaagaatttaa 12806168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 223
Target Start/End: Original strand, 6427646 - 6427729
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6427646 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgtcttggggt 6427729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 687 - 797
Target Start/End: Original strand, 17195314 - 17195423
Alignment:
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattg 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||    
T  17195314 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaagatgca---ttccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgataatatctttagttg 17195410  T
Q  785 atctcagcaacgt 797  Q
    |||||||||||||    
T  17195411 atctcagcaacgt 17195423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Original strand, 38854400 - 38854518
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38854400 cctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaacatgactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggc 38854499  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  38854500 -tggtttagatgaaggtatt 38854518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 772 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 2599387 - 2599237
Alignment:
Q  772 atatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaatt 871  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||  |   ||||||||  |||||    
T  2599387 atatcatcagttaatctcagcaacgttacacacatatcgatccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcttcatgtcgccgttgttcgctaatt 2599288  T
Q  872 ccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  2599287 ccacccaactgaatgatattctctcatcgtcgaatgttggacgtttatacc 2599237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 687 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 18920986 - 18920835
Alignment:
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgat 786  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  18920986 atttcacaagtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgat 18920888  T
Q  787 ctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaa 839  Q
    ||| ||||||| ||   ||||||||||  | ||| ||| ||||||| ||||||    
T  18920887 ctctgcaacgtgacaaacatatcgatcatcggaaccatgttgtgctgccaaaa 18920835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1399820 - 1399726
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || |||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1399820 catcattcaagatgctcatcgcatgctagagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttggaag 1399726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 724
Target Start/End: Original strand, 3169786 - 3170081
Alignment:
Q  427 aatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgct 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  3169786 aatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaagactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagg-ttgat 3169883  T
Q  525 ttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatct-aaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaa 622  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||   | |||  ||| ||||| || | | |||||| |||| ||  || ||| |||||| ||||||||||    
T  3169884 ttagatgaatgtatt-aagtgtcaatg-aatgaaccttatttgttggcacttgaatatcatcatctaaaacaagcgtagcaaaaatttattcttttcaaa 3169981  T
Q  623 ggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 721  Q
    || |||||||||||| || | ||||||||| | || | |  |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3169982 gg-aaaacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtcat-gttgtttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 3170078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4723592 - 4723495
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||| |||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4723592 taccatcatttaaaatgctcatcgcatgctgcagtcatgctgtttagaaagtttgaatttgccctattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 4723495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 35565960 - 35566057
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||| || ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  35565960 taccatcatttaaaatgctcatcacatgttggagtcgtgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagataattgttgcagttggaag 35566057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Original strand, 6793130 - 6793194
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6793130 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttaccaa 6793194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 20196631 - 20196567
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20196631 acgtttgtaccttccaactacaaaaaccgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 20196567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 835 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 3458941 - 3458854
Alignment:
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  3458941 caaaacatactcgtcacgttttcgtcgttctttaactcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttggacatttatacc 3458854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 38854856 - 38854939
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  38854856 atgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 38854939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 394 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 33371500 - 33371267
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcc 492  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | |||| |  | ||||||  | || ||||    
T  33371500 taccttccaactacaacaattattttacctctgaatgaggtaaattcaagcttgctaaacaccaagactccaacatt-cgtctgacatttctattgttcc 33371402  T
Q  493 tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaa 591  Q
     || |||||| ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||   |||||| | ||||| ||||||||| || |||||||| |||    
T  33371401 attcaaaagattaaattcatgttaggcttggtttaaataatggtattcaagtgtcaaaataatgagttgcattcattgacacttcaataccttcatttaa 33371302  T
Q  592 accagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
    ||  | ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  33371301 actggcctaacatgaatttaatcttttgaaaggaa 33371267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 1695479 - 1695576
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  1695479 taccatcattcaagatgctcatcgcatgatggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagaaaattgttgcagttggaag 1695576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 3459011 - 3459338
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||   |||  | ||||| |||| ||||    
T  3459011 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaa-ttcaaacttgccaaacgaccatgactcaagtattaagcccagcgttcatatttttcctt 3459109  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  3459110 tgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaatgaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 3459206  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || | ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| | || ||   |||||||  |||| |||| ||||||||     
T  3459207 gcaagcctaacaaaaatttattattttcaaagaaaaaacatgaacgcggggcgaaatgcttgagtcatgtt-gtttggccagtttaaatttacctcatt- 3459304  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3459305 caaaggtaagacaattgttgtagttagaatgcac 3459338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 11028135 - 11028232
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  11028135 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 11028232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 729 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12742883 - 12742818
Alignment:
Q  729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaa 794  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12742883 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 12742818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27660885 - 27660800
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||    
T  27660885 atgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaagat 27660800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 652
Target Start/End: Original strand, 7082442 - 7082697
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaca-acatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||| |||||||  | |||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||    
T  7082442 ttccaactacaacaattctcttacctctgaaaaggggtaattcaaacttgccaaacggatagaactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttccttt 7082541  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa- 592  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||     
T  7082542 gaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaag 7082638  T
Q  593 ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctt 652  Q
    | || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||    
T  7082639 caagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgggtgaaatgctt 7082697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 345
Target Start/End: Original strand, 10398277 - 10398340
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcatt 345  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10398277 gtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttggtagatgcatt 10398340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30710225 - 30710136
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30710225 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattagcaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 30710136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 451
Target Start/End: Original strand, 34683577 - 34683644
Alignment:
Q  385 gaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatgggg-taaattcaaacttgccaa 451  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34683577 gaacgtttgtacctcccaactacaccaattgtgttacctttgaatggggataaattcaaacttgccaa 34683644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Original strand, 3602035 - 3602129
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  3602035 catcattcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctatttaacaattttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 3602129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 346
Target Start/End: Original strand, 1972052 - 1972156
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||||||| |||||||||||    
T  1972052 taccatcattcaagatgctgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccatcca-gagtaagacaattgttgtagttggaagat 1972150  T
Q  341 gcattc 346  Q
     |||||    
T  1972151 acattc 1972156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7083691 - 7083607
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7083691 tgatcaacccttgagataagtttaaatctg-ttttttttactccataaacattttaacgtgggtaaaaatatttgtcttggggtat 7083607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 12743445 - 12743349
Alignment:
Q  516 aggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaa 612  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12743445 aggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtc-acagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacctccatctaaaccagcctaacaagaatttaa 12743349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 346
Target Start/End: Original strand, 19036239 - 19036342
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  19036239 taccattattcaagatgctcatcgaatactggagtcctgcaaattggcaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgt 19036336  T
Q  341 gcattc 346  Q
    ||||||    
T  19036337 gcattc 19036342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 334
Target Start/End: Original strand, 22284275 - 22284348
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  22284275 atcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttg 22284348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 338
Target Start/End: Original strand, 28881683 - 28881772
Alignment:
Q  249 tttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  28881683 tttaagatgctaatcgaatactggtgtcctgctgcttggcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 28881772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34683443 - 34683346
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| |||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  34683443 taccatcattcaagatgttcatcgcatgctggagtgctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagagtaagataattgttgcagttggaag 34683346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 36349739 - 36349816
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  36349739 tgtaccttccaactacaacaatcatcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 36349816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 369
Target Start/End: Original strand, 4723984 - 4724089
Alignment:
Q  262 tcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactg 361  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  4723984 tcgaatattggagtcctgccgtttggcaagtttgaattacc-ccattcagagg-aagacaattgttgtagctgcaaggtgcattcatttggtacctaatg 4724081  T
Q  362 acgatctt 369  Q
    ||||||||    
T  4724082 acgatctt 4724089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 6792892 - 6792963
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6792892 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaatttgctaaacaacatgactc 6792963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8575649 - 8575566
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  8575649 atgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 8575566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 11347410 - 11347493
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| ||  |||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  11347410 atgctcatcggatgttggagttctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 11347493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28881618 - 28881529
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28881618 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattggcaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 28881529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 35566062 - 35565991
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  35566062 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcacgactc 35565991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 344
Target Start/End: Original strand, 40012323 - 40012406
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40012323 atcgaatattggagtcctactgcttagcaagtttgaatttgcccaatttaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 40012406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 797
Target Start/End: Original strand, 36311900 - 36312009
Alignment:
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgat 786  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||  | |||||||   |||    
T  36311900 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcagaattaaactattgagaagatcttcaggcgat 36311998  T
Q  787 ctcagcaacgt 797  Q
    |||||||||||    
T  36311999 ctcagcaacgt 36312009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36349838 - 36349744
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||  ||||||| |||||||||    
T  36349838 catcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagatgattgttgtagttggaag 36349744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 1399721 - 1399798
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  1399721 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactctagcat 1399798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 3459477 - 3459574
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| | |||| ||| |||| |||||| | |||||||  |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  3459477 taccatcattcaagatgttgatcgtatattggagtcctgctgcttagcaaaattgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 3459574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6792994 - 6792897
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||  |||| || ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6792994 taccatcattcaagatgctgatcggatgttggagtcatgttgtttagcaaatttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 6792897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 729 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12805701 - 12805636
Alignment:
Q  729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaa 794  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12805701 ccctacctaatcacgatcttctggcataatcagactgttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 12805636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25498873 - 25498796
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  25498873 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 25498796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38854779 - 38854695
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38854779 atcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt-gccccatccaagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 38854695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 866 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 1693455 - 1693399
Alignment:
Q  866 ttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1693455 ttaattccacccaagtgagtgatactctcctctcgtcgagcgttggacgtttatacc 1693399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 336
Target Start/End: Original strand, 4723638 - 4723728
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| || | |||||||   ||||||||||||||| |||||||    
T  4723638 catcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaa-ttaccccattca-aaggaagacaattgttgtagttgga 4723728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 664 - 727
Target Start/End: Original strand, 33371116 - 33371179
Alignment:
Q  664 gtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctt 727  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33371116 gtttgacaagtttgaatttacctcatt-caaaggtaagataattgttgtagttggaatgcacctt 33371179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Original strand, 1399866 - 1399959
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||| ||||| |||||||||| || | ||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  1399866 taccatcattcaaaatgctcatcgaatgttggcttcctgccgtttaacaagtttgaa-ttaccccattca-gaggaagaaaattgttgcagttgga 1399959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1695581 - 1695510
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  1695581 tgtaccttccaactgcaacaattttcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 1695510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 8575720 - 8575809
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8575720 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt-gccccatccagagt-aagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 8575809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19036638 - 19036521
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  19036638 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgc 19036540  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  19036539 -tggtttagatgaaggtatt 19036521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25498728 - 25498635
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25498728 taccatcattcaagatgctcatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaa-ttaccccattca-aaggaagacaattgttgcagttgga 25498635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 346
Target Start/End: Original strand, 27660960 - 27661045
Alignment:
Q  259 tcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27660960 tcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 27661045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 30710296 - 30710379
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  || ||| | || |||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  30710296 atgctaatcgaatactggtgtcatgctgcttggcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 30710379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 394 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 30710382 - 30710315
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgac 461  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  30710382 taccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgccaagcagcatgac 30710315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35565917 - 35565824
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  35565917 taccatcattcaaaatgcttatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattacct-cattca-aaggaagacaattgttgcagttgga 35565824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Original strand, 38854578 - 38854702
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||| |  |||| ||| ||||||| ||| | || ||||||||    
T  38854578 ctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagtcct-gttgttttgcaggtttgaatttatccca-ttcaaagg 38854674  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  38854675 taacacaattgttgcggttggaatgcac 38854702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 7215 - 7143
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7215 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaatttgtcaaacaacatgactcgagcatttc 7143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 8576127 - 8576055
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  8576127 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaagactcgagcatttc 8576055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Original strand, 18308991 - 18309045
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  18308991 ttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 18309045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 22283792 - 22283864
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  22283792 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 22283864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 27661363 - 27661291
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  27661363 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 27661291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 539
Target Start/End: Original strand, 28881235 - 28881351
Alignment:
Q  422 ctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggct 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||   || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||     
T  28881235 ctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttcgcaagaacctcgtgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgc- 28881332  T
Q  521 tgctttagatgatggtatt 539  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  28881333 tggtttagatgaaggtatt 28881351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 454
Target Start/End: Original strand, 34683341 - 34683403
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaca 454  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34683341 tgtaccttccaactgcaacaattatcttactcttgaatggggtaaattcaaacttgctaaaca 34683403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7083063 - 7083002
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 453  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7083063 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaac 7083002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Original strand, 8538608 - 8538681
Alignment:
Q  265 aatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||| ||||    
T  8538608 aatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagtttgaag 8538681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11347339 - 11347260
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  11347339 atgctcatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaa-ttgccccattca-gaggaagacaatttttgcagttgga 11347260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 666 - 719
Target Start/End: Original strand, 18308749 - 18308801
Alignment:
Q  666 ttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18308749 ttggcatgtttgaatttacccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaa 18308801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28881775 - 28881718
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28881775 taccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgccaa 28881718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40016906 - 40016821
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  40016906 tgatcgacccttgggataagtttaaatttgcttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcttcttggggtat 40016821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22706324 - 22706237
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnn--actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||          || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  22706324 tgatcaacccttgggataagtttaaatctgcttttttttttaccccataaactttttaccgtgggtaaaaagatttgtctaggggtat 22706237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 39223269 - 39223341
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatattt 213  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39223269 tgatcaaccctagggataagtttaaatctgcttttttt-actccataaactttttaccgtgggtaaaaagattt 39223341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1695036 - 1694981
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  1695036 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctt 1694981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17366451 - 17366388
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcatt 345  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  17366451 gtttagcaagtttgaatttacctcattcagaggtaagataattgttgtagttggtagatgcatt 17366388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 744 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 19748263 - 19748169
Alignment:
Q  744 atcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaa 839  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||   |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  19748263 atcttatggcggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatctcagcaacgt-acaaacatatcgatccacggaaacatgttgtgctgccaaaa 19748169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6740 - 6654
Alignment:
Q  252 aaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||| |||||||||    
T  6740 aaaatgttgatcgaatactggggtcctgctgcttaacaagtttgaatttgccctattcagtggtaagatgattgttgaagttggaag 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 392 - 462
Target Start/End: Original strand, 4723490 - 4723560
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgact 462  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  4723490 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatagggcaaattcaaactttctaaacagcatgact 4723560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12805748 - 12805718
Alignment:
Q  316 aagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12805748 aagacaattgttgcagttggaagatgcattc 12805718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Original strand, 20196810 - 20196863
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  20196810 ttagcaagtttgaatttcc-ccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 20196863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4846457 - 4846428
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4846457 actccataaactttttaccgtgggtaaaaa 4846428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20196775 - 20196726
Alignment:
Q  529 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaa 578  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  20196775 atgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttaa 20196726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 462
Target Start/End: Original strand, 35565517 - 35565557
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgact 462  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35565517 cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgacatgact 35565557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 190)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 24701934 - 24702457
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24701934 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacctgactcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttga 24702033  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24702034 aaagaataaatttttgttaggtgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 24702133  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  24702134 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggt 24702233  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24702234 aagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgt 24702333  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  24702334 cacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgttc-gtaattccacccaagtgaatgatattctcccc 24702432  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24702433 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 24702457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 13895532 - 13896056
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13895532 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaggactcaaacatttcacccggcattcatgttttcctttga 13895631  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13895632 aaaaaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaagttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 13895731  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  13895732 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaattaccccatttcagaggt 13895831  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13895832 aagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccttaactaatgacgatcttctagcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 13895931  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  13895932 cacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccc 13896031  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13896032 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 13896056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 44928020 - 44927496
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44928020 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaagcaacaggactcaaacatttcacccggcattcatgttttcctttga 44927921  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||      
T  44927920 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaatacattcatctaaaccatc 44927821  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||   ||||    
T  44927820 ctaacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgaccgtttggcaagtttgaattaccccattttttaggt 44927721  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44927720 aagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgt 44927621  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  44927620 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccc 44927521  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44927520 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 44927496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 921
Target Start/End: Original strand, 34692952 - 34693475
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34692952 ttccaactccaacaattgtcttacctgtgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaggactcaaacatttcacccggcattcatgttttcctttga 34693051  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34693052 aaagaataaatttttgttaagcgtgctttagatgatggtattcaagtaccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatataaaccagt 34693151  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  34693152 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgcgcgaaatgcttgagtcttggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggt 34693251  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34693252 aagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaagttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 34693351  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| |  ||     
T  34693352 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgatactcaaccc 34693451  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34693452 tcgtcgagcgttggacgtttatac 34693475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 39416609 - 39417134
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39416609 ttccaactacaacaattatcttacctttgaatggggcaaattcaaacttcccaaacaacatgactcaaacatttcaccccgcattcatgttttcctttga 39416708  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  39416709 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 39416808  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaa-tgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||    
T  39416809 ctagcaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacattaatgctgagcgaaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattatcccattttagagg 39416908  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39416909 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaagctattgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 39417008  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  39417009 ttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccc 39417108  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  39417109 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 39417134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 920
Target Start/End: Original strand, 44835149 - 44835671
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44835149 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaaacaacaggactcaaacatttcgcccggcattcatgttttcctttga 44835248  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44835249 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 44835348  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  44835349 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaagtgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaattaccccatttcaaaggt 44835448  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  44835449 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatattttcagttgatctcaacaacct 44835548  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||     
T  44835549 tacccgcatatccatccactggaacattctatgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaaatgaatgatactctcccc 44835648  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    ||||||| ||||| | |||||||    
T  44835649 tcgtcgaacgttgaatgtttata 44835671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 42383608 - 42383085
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42383608 ttccaactacaacaattgtcttatctttgaattggataaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttga 42383509  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  42383508 aaagaataaatttgtgttacgcttgctttaaatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaacaagc 42383409  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||    
T  42383408 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagtgaaatgtttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccattttagaggt 42383309  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42383308 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttgtcccaactaatgacgatcttctggcggaatcaacttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 42383209  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
     |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||     
T  42383208 tacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccc 42383109  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  42383108 tcgtcgagtgttggaagtttatac 42383085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 314 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 37282094 - 37281485
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaat 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37282094 ggaaaacaattgttgcagttggaaggtgcattcattccgtacctactaacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactacaacaat 37281995  T
Q  414 cgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaattttt 512  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37281994 tgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactcaagcatttcgcccggcattcatgtttttcctttgaaaataataaattttt 37281895  T
Q  513 gttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataattta 611  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  37281894 gttatgcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacaaaatgaggttcatttcttgacatttcaataccttcatctaaatcagcttaacaataattta 37281795  T
Q  612 atcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgt 711  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| | |   || | |||||| || ||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||    
T  37281794 atcttttcaaaggaaaaatatgaatgtcgggcg-aatgc-tgatgacttgtcgtttgacaagtttgaattacctca-tccatagg-aacacaattgttgt 37281699  T
Q  712 agttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatat 808  Q
    |||| |||  ||||  | | |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37281698 agtttgaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaattaaacttttgatgatatcttccgttgatctcagcaacgtcacccgcatat 37281599  T
Q  809 cgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgt 908  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||    
T  37281598 cgatccactgaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctaccctcgtcgagtgt 37281499  T
Q  909 tggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||    
T  37281498 tggacgtttatacc 37281485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 25576253 - 25576777
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||||||| |||||     
T  25576253 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgtgttcatgtttttcctttt 25576352  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25576353 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 25576452  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  25576453 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagagg 25576552  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25576553 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaaataatgacgatcttctgacggaatcaagctattgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 25576652  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||    
T  25576653 ttacccgcatatcgatcca-tggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgataatctccc 25576751  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||||||||||||||| |||||||||    
T  25576752 ctcgtcgagcgttggatgtttatacc 25576777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 479 - 922
Target Start/End: Original strand, 48087295 - 48087738
Alignment:
Q  479 cattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaa 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48087295 cattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacacttaa 48087394  T
Q  579 caccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttga 678  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  48087395 taccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttattcttttcaaagaaaaaacatgaatgctgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttga 48087494  T
Q  679 attacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 778  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  48087495 attaccccattttagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaattaatgacgatcttctggtggaatcaagctgttgatgatatctt 48087594  T
Q  779 caattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccca 878  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  48087595 cagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaatatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccaccca 48087694  T
Q  879 agtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48087695 ggtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 48087738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 472 - 920
Target Start/End: Original strand, 19452965 - 19453413
Alignment:
Q  472 cacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttga 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19452965 cacccgacattcatgttttcctttgaaaaaaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattgaagtgccaacgaaatgaggttcattctttga 19453064  T
Q  572 cacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggca 671  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||    
T  19453065 cacttaataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgcttgagtcatggccgtttgaca 19453164  T
Q  672 tgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatg 771  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19453165 agtttgaattaccccatttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgatgatcttctggtggaatcaaacttttgatg 19453264  T
Q  772 atatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaatt 871  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  19453265 atatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccataacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaatt 19453364  T
Q  872 ccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  19453365 ccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcattggacgtttata 19453413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 47066243 - 47065721
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||    
T  47066243 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggg-taaatttaaacatgccaa-caacaggactcaagcatttcgtcccgcattcatgcttttcctttg 47066146  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47066145 aaaagaataaatttttggtaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaacgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 47066046  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||  | |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47066045 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaatatgaacgctggacgaaatgctcgagttatggccgtttggcaagtttgaattacctcatttcagagg 47065946  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  47065945 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttaatgatatcttcagttgatctcagcaacg 47065846  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  47065845 ttacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcctcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccc 47065746  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  47065745 ctcgtcaagcgttggacgtttatac 47065721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 49218398 - 49218922
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaca-acatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttg 496  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  49218398 ttccaactccaacaattatcttacatttgaatgtgataaattcaaacctaccaaacatactggactcaagcatttcgctcgacattcatgttttcctttg 49218497  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49218498 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 49218597  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaag 695  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |  ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  49218598 cctaacaagaatttaatcttttcaaaagaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcct-gttgtttgacatgtttgaatttatctca-ttcaaag 49218695  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  49218696 gtaagacaattgttgcagttggaatgcactttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgataatatcttcagttgatctcagcaac 49218795  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  49218796 gtcactcgcatatcgatccactggaacatgttgcgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgccgtttgttaattccacccaagtgaatgatattctcc 49218895  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  49218896 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 49218922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 454 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 43477557 - 43477090
Alignment:
Q  454 aacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43477557 aacatgactcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgacaacgaa 43477458  T
Q  554 atgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctta 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  43477457 atgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaagaaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttg 43477358  T
Q  654 aatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctgg 752  Q
    | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43477357 actcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacagttgttgaagttggaatgcacattaccctaattaatgacgatcttctgg 43477260  T
Q  753 cggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcaca 852  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  43477259 cggaatcaagttgttgatgatatcttcggttgatctcatcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgttcgtcacg 43477160  T
Q  853 ttttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43477159 ttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 43477090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 255 - 922
Target Start/End: Original strand, 36720909 - 36721575
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgta 354  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||    
T  36720909 atgcttatcgaatgttggagtcctgccgtttaacaagtttgaattacctc-attcaaagg-aagacaattgttgcagttgaaaggtgaattcatttcgta 36721006  T
Q  355 cctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaca 454  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||    
T  36721007 cctactgacaatcttttcgacgtttataccgaacgtttgtacctttcaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaatctgcccaaaca 36721106  T
Q  455 acatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaa 553  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36721107 acaggactcaagcatttcgcccgacattcatgttttttctttgaaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtattcaagtgccgacgaa 36721206  T
Q  554 atgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctt 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |    
T  36721207 atgaggttcattccttgacacttcaataccttcatctaaaccagcttaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgatgggcg-aatgc-t 36721304  T
Q  653 aaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgatcttc 749  Q
     |   || | ||||||||  ||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || | |||||||||||||    
T  36721305 gaggacttgtcgtttggctagtttgaattacctca-tccagagg-aacacaattgttgtaggtggaaggtgcattcattcgataccaaatgacgatcttc 36721402  T
Q  750 tggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtc 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  36721403 tggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccagcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaacattgctcgtc 36721502  T
Q  850 acattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || ||||||| |||| || ||||||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  36721503 acgttttcgtcgttcgtttattccaatcaagtgaatgatactctcctctcgtcgagcgttggacatttatacc 36721575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 2646539 - 2647062
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||   || |||||||||||| |||    
T  2646539 ttccaaccccaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacatgactcacgcatttcgccgagcacttcatgttttcccttt 2646638  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2646639 gaaaagaataaatttttatgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 2646738  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| ||||     
T  2646739 gcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgctcgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaggtttgaattaccccatt-caaat 2646836  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2646837 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 2646935  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2646936 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 2647035  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2647036 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 2647062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 49139717 - 49140240
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||    
T  49139717 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacttcatgttttcccttt 49139816  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49139817 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 49139916  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  49139917 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 49140014  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49140015 g-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 49140113  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  49140114 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 49140213  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  49140214 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 49140240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 4003750 - 4004273
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||    
T  4003750 ttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacatgactcaagcatttcgccaaacacttcatgttttcccttt 4003849  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4003850 gaaaagaataaatttttgttagacttgctttaggtgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 4003949  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||   |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  4003950 gcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaagtgcttgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaag 4004047  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4004048 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttactctaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 4004146  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4004147 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccacgtgaatgatactctcc 4004246  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||    
T  4004247 cctcgtcgagcgttgaatgtttatacc 4004273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 54390998 - 54390475
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  54390998 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 54390899  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54390898 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 54390799  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  54390798 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 54390701  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  54390700 g-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 54390602  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  54390601 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 54390502  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  54390501 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 54390475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 398 - 920
Target Start/End: Original strand, 3494692 - 3495213
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||| |||||    
T  3494692 ttccaacaacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgcaaaacaacatgactcaagcatttcgccgagcacttcatgtttttccttt 3494791  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3494792 gaaaagaataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccgccgaattgaggttcaatccttaacacttaataccttcatctaaacca 3494891  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   |||||  | |||||||||||| |||| |||||    
T  3494892 gcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgctcgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgaaaagtttgaattaccccatt-caaag 3494989  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  3494990 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaaacaac 3495088  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3495089 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 3495188  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  3495189 cctcgtcgagcgttggacgtttata 3495213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 2268157 - 2268680
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||   || |||||||||||| |||    
T  2268157 ttccaactacgacaattgtcttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaaacatttcgccaagcacttcatgttttcccttt 2268256  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2268257 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 2268356  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
       |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  2268357 acataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaag 2268454  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2268455 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 2268553  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  2268554 ttcacccgcatatcgatctactggaacatgatgtgctcccaaaacatgcccgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcc 2268653  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  2268654 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 2268680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 34050283 - 34049760
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  34050283 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 34050184  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34050183 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtactcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 34050084  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  34050083 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggcgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 34049986  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34049985 g-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 34049887  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  34049886 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 34049787  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||    
T  34049786 cctcgtcgagtgttgaacgtttatacc 34049760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 36135563 - 36135041
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  |  ||| |||||||||||| |||    
T  36135563 ttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaagactcaaacatttcgtcaaacacttcatgttttcccttt 36135464  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36135463 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttcacacttaataccttcatctaaacca 36135364  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||   |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  36135363 gcataacaagagtttaatattttcaaaggagaaacatgaagtgcttgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaag 36135266  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36135265 g-aagacaattgttgtagttggaatgcatcttactctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 36135167  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  36135166 ttcacccgcatatcgatctactgaaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgata-cttcc 36135068  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  36135067 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 36135041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 46403559 - 46403036
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  46403559 ttccaacctcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaataacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 46403460  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46403459 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 46403360  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  46403359 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 46403262  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46403261 g-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 46403163  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  46403162 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 46403063  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  46403062 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 46403036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 398 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 50997944 - 50997453
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||   || |||||||||||| |||    
T  50997944 ttccaactccaacaattgtcttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaagcacttcatgttttcccttt 50997845  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50997844 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatcattgacacttaataccttcatctaaacca 50997745  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| ||||  ||||    
T  50997744 gcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaag 50997646  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  50997645 --aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 50997548  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattatac 890  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  50997547 ttcacccgcatatcgatcaactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatac 50997453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 524 - 922
Target Start/End: Original strand, 42949808 - 42950206
Alignment:
Q  524 tttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaag 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42949808 tttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcctagcaagaatttaatcttttcaaag 42949907  T
Q  624 gaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 723  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42949908 gaaaaatataaatgctgagcgaaatgcttgagtcctaggcgtttggcaagtttgaattatcccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 42950007  T
Q  724 ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaaca 823  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  42950008 ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtaaaccgcatatcgatccactggaaca 42950107  T
Q  824 tcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||| || || |||||||||||||||| ||||||||    
T  42950108 tgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattctttaactccatccaagtgaatgatactcttccctcgtcgagcgttggacatttatacc 42950206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 435 - 920
Target Start/End: Original strand, 774041 - 774522
Alignment:
Q  435 aaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttc-ctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgat 533  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| | ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  774041 aaattcaaacttgctaaacaccaggactccagcatt-cgcccaacactcatgttttttctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgat 774139  T
Q  534 ggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacat 632  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  774140 gttattcaagtgccaacgaaacgaggttcattccttgacacttcaataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaagaaaaacat 774239  T
Q  633 gaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccct 732  Q
    |||||  | ||| |||| |     ||||| | ||| ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||    
T  774240 gaatgttgggcg-aatgttggggacctgg-catttagcaagtttgaatttc--catttcagaggtaagacaattgttgcagttggaaggtgcatt-ccct 774334  T
Q  733 aactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgct 832  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||    
T  774335 acctaatcacgatcttctggtggaatcagactcttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgcagtgct 774434  T
Q  833 cccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    || |||||||| || |||| ||||| | |||| ||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  774435 ccgaaaacatgttcttcacgttttcatcgttcgttaattccatccaactgaatgatattctcccgtcgtcgagcgttggacgtttata 774522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 642 - 922
Target Start/End: Original strand, 53826602 - 53826882
Alignment:
Q  642 gcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatga 741  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53826602 gcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatga 53826701  T
Q  742 cgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaaca 841  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  53826702 cgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacatgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccaaaaca 53826801  T
Q  842 tgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  53826802 tgctcatcacattttcgtcgttctttaactctacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttatacc 53826882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 34471727 - 34472262
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattcat 485  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  || |||  |||||||||      
T  34471727 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgtttcctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactcca--atgttcgaccgacattctc 34471824  T
Q  486 gtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacct 583  Q
     |  |||| ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || || |    
T  34471825 atagttccattgaaaagattaaattcttgttaggttttgtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaatacat 34471924  T
Q  584 tcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    |||| |||||| | ||||||| || |||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| ||  |  | || || |||||||||| ||||||||||    
T  34471925 tcatttaaaccggcctaacaagaacttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaacat--tggagtcatg-ccgtttggcaagtttgaatta 34472021  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| | || ||    |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34472022 ccccatt-caaagg-aagacaatttttgtagctggaaggaacattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaataaaacttttgatgatatcttc 34472119  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34472120 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 34472219  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34472220 gtgaatgatactctcccctcgtagagcgttggacgtttatacc 34472262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 51015845 - 51015310
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  ||   ||| | |||||       
T  51015845 acgtttgtacctcccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaatttgccaagcagcaggactccaatatacgaccgg-cattccca 51015747  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||| |||||  ||   |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  51015746 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtatttaagtgtgaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaatacc 51015649  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||| | ||   |||||| |  |||| |  |  | ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  51015648 ttcatttaaaccggactaacaagaatttaatcttttgacagggacaatgggaatgcgggtcgaa-tattggagtcctg-ccgtttggcaagttcgaatta 51015551  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||  |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015550 ccccatt-caaaga-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 51015453  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  51015452 agttgatctcagcaacgtttcccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 51015353  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51015352 gtgaatgatacactcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 51015310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 370 - 922
Target Start/End: Original strand, 46413968 - 46414520
Alignment:
Q  370 ttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||  |||  |  ||    
T  46413968 ttggacgtttataccgaacgtttgtaccttacaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgcaaagcagcagaacttca--at 46414065  T
Q  470 -ttcacccgacattcatgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc 567  Q
     |||  |||||||||   |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| || |||   |||||||| |||||     
T  46414066 gttcgaccgacattcccatagttccatttaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattca 46414165  T
Q  568 ttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgt 665  Q
    | ||||||| || |||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| ||  |  | || || ||||    
T  46414166 tcgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaacttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaacat--tggagtcatg-ccgt 46414262  T
Q  666 ttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||  | | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46414263 ttggcaagtttgaactaccacatt-caaagg-aagacaattgttgtagctagaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaa 46414360  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  46414361 cttttgatgatatcttaagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 46414460  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  46414461 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctccactcgtcgagcgttggatgtttatacc 46414520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 30193106 - 30192571
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||   ||| |||||||       
T  30193106 acgtttgtacctcccaactccaacaattgtgttacatttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcaacaggactccaatatacgacc-gacattccca 30193008  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| ||||||||||    ||| |||||| |||| || || |||   ||| |||| ||||||||||||||| || |||    
T  30193007 atgtt--ccattcaaaagattaaattattgttaggctgtgattaaatgatgatatttaaatgtcaaacgaataaggtccattccttgacacttcaatacc 30192910  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||   ||||| ||  | | ||  |  | ||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  30192909 ttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcctttgataggaacaatgagaatgtcggtc-agatattggactcctg-ccgtttggcaagtttgaaata 30192812  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30192811 cctcatt-caaagg-aagaaaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 30192714  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30192713 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgatgtactcccaaaacatgctagacacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 30192614  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30192613 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 30192571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 389 - 922
Target Start/End: Original strand, 55206537 - 55207070
Alignment:
Q  389 gtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc---at 485  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |  |||  ||  | |||||   ||    
T  55206537 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttaccttttaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcagaactccaatattcgact-gccattcccaat 55206635  T
Q  486 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    |||  || || ||| || |||||| |||||||| | |  ||| |||| ||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||    
T  55206636 gtt--ccattcaaatgattaaattcttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaatacctt 55206733  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  ||||    ||| |  |  |||||||| || ||||| ||||||    
T  55206734 catttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgccggtcgaata--ttagagacctgccgtttgacaagtttgtattacc 55206831  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55206832 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 55206929  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  55206930 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagt 55207029  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  55207030 gaatgatactctcacctcgtcgagcattggacgtttatacc 55207070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 389 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 41578471 - 41577939
Alignment:
Q  389 gtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt 488  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||  | | |   |||   |     
T  41578471 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatcggcatttccaatg 41578372  T
Q  489 ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcat 587  Q
    |||| || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  41578371 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattctttgacacttcaataccttcat 41578272  T
Q  588 ctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatga-atgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctc 686  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||| ||  ||| |||  |  |||| |  |  |  |||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  41578271 ttaaaccagcctaacaagaatttaatattttgacaggaataa--tgagatgttggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaattaccac 41578176  T
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaatt 783  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| || ||  ||||  | | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41578175 att-caaagg-aagacaattgttgtagctgaaaggtgcattcattccgtacctaatgatgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 41578078  T
Q  784 gatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtga 883  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41578077 gatctcagcaacgtcactcgcatattgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtga 41577978  T
Q  884 attataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41577977 atgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 41577939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 696 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 49610748 - 49610524
Alignment:
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49610748 gtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 49610649  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || ||||    
T  49610648 gtcacccgcatatcgacccactggaacatactgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 49610549  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  49610548 cctcgtcgagcgttggacgtttata 49610524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 395 - 922
Target Start/End: Original strand, 6464005 - 6464531
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcc 492  Q
    |||||| |||| ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| || |||||||   | || ||||    
T  6464005 accttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaaattcaaactttctaaacgacatgactcaaacatt-catccgacatctctattgttcc 6464103  T
Q  493 tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaa 591  Q
     || |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  6464104 attcaaaagattaaattattgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgacaaaagaatgaggttcattccttaacactttaataccttcatctaa 6464203  T
Q  592 accagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttc 691  Q
    || || |||| || ||||||||||||| ||||||| || |  |||| ||   ||| || |  ||  ||| | ||||  || |||||||||||| ||||||    
T  6464204 actagcctaaaaagaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaatgtcggatgaa-tgttagaaaactg-ctgtttaacaagtttgaattaccccatttc 6464301  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcag 791  Q
    | || ||||| | ||||||||||||||| |  | || |||||  |||| |||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6464302 agag-taagagagttgttgtagttggaaggtgcatttccctatataatcacgatcttcttgcagaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcag 6464400  T
Q  792 caacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattatacc 891  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||      
T  6464401 caacgttacccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgattgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaactgaatgatatt 6464500  T
Q  892 ctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6464501 ctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 6464531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 395 - 922
Target Start/End: Original strand, 8633024 - 8633545
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctt 494  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| | ||||  | | |   |||   | |||| |    
T  8633024 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaacattcgatcggcatttccattgttccat 8633123  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaac 593  Q
    | |||||  |||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || || ||||||||| || ||||| || |||||    
T  8633124 tcaaaagtttaaattcttgttaggtttggattaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcaatcattgacacttcaatacctttatttaaac 8633223  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaa 693  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||| ||||  | ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  8633224 tggtctaacaaaaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaatgccgatcgaa-tgctggagtcctg-ccgtttgacaagtttgaattacctcatt-caa 8633320  T
Q  694 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagca 793  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||   | |  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||| || ||    
T  8633321 agg-aagacaattgttgtagttggggtgca---ttcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagatgatcgcaaca 8633416  T
Q  794 acgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccct 893  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  8633417 acgttacccgcatatcgatccactggaacacgttgtcatcccaaaaaatattcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactct 8633516  T
Q  894 cccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8633517 cccctcgtcgagcgttggatgtttatacc 8633545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 2429055 - 2428520
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  | ||||| |  |||  ||| | |||||       
T  2429055 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaatttaccaagcagtaggactccaatattcgaccgg-cattccca 2428957  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  2428956 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 2428859  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||| ||   ||||| ||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  2428858 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacatgaacaatgggaatgtcggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaatta 2428761  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgca--ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 778  Q
    || |||| |||||| || ||||||||||||| || ||  ||||  | |||   || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2428760 ccccatt-caaagg-aacacaattgttgtagctgaaaggtgcattcattatg-tacctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatctt 2428664  T
Q  779 caattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccca 878  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  2428663 cagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaaaatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaccca 2428564  T
Q  879 agtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2428563 agtgaatgatattatcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 2428520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 697 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 42382529 - 42382305
Alignment:
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42382529 taagacaattgttgtagttggaatgcacattgtcccaactaatgacgatcttctggcggaatcaacttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 42382430  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  42382429 ttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccc 42382330  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  42382329 ctcgtcgagtgttggacgtttatac 42382305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 387 - 912
Target Start/End: Original strand, 42323041 - 42323565
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattcat 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||  ||| |||||      
T  42323041 acgtttgtaccttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggagtaaattcaaacttgccaagcagcatgactcca--atgttcgaccggcattccc 42323138  T
Q  486 gtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacct 583  Q
     |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || ||||    
T  42323139 atagttccattcaaaagattaaattattgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattcattgacacttcaatacct 42323238  T
Q  584 tcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||||||| |||| | || || ||   ||||||||  |||| ||  |  | || || | ||||| || ||||||||||    
T  42323239 tcatttaaaccggcctaacaaaaatttaat-ttttgacagtaacaatgggaatgccggtcgaacat--tggagtcatgtc-gtttgccaagtttgaatta 42323334  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| || ||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42323335 ccccatt-cagagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcagtacctaatgacgatcttccagtggaatcaaacttttgatgatatcttc 42323432  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42323433 agttgatctcagcaacgtcaccagcatatcgatccactgaaacattttgagctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 42323532  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttgga 912  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  42323533 gtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttgga 42323565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 395 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 6754763 - 6754237
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcc 492  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||||||  ||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||| || |||||||   | || ||||    
T  6754763 accttcaaactacaacaattgtcttacctccgaaatgtggtaaattcaatcttgctaaacagcaggactcaaacatt-catccgacatctctattgttcc 6754665  T
Q  493 tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaa 591  Q
     || |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||    
T  6754664 attcaaaagattaaattattgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattccttaacacttcaatacattcatctaa 6754565  T
Q  592 accagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttc 691  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || | | ||| |  | ||| || || ||  ||| | ||||  || |||||||||||| ||||||    
T  6754564 accagcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaataggcatgtctggtgaa-tgtttgaaaactgtc-gtttaacaagtttgaattaccccatttc 6754467  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcag 791  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||| |  | || |||||  |||| |||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6754466 agag-taagacagttgttgtagttggaaggtgcatttccctacataatcacgatcttctagcagaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcag 6754368  T
Q  792 caacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattatacc 891  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||      
T  6754367 caacgttacccgcatatcgatcaactagaacatgttgtactcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaacttaatgatatt 6754268  T
Q  892 ctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6754267 ctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 6754237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 7246662 - 7246127
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |  |||  ||| | |||||       
T  7246662 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcgaagcagcaggactccaatattcgaccgg-cattccca 7246564  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||| | |||||| |||||||| | |  ||| |||||| ||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||| || |||    
T  7246563 atgtt--ccattcaaaaaattaaattcttgttagggtgggattaaatgatgatattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttaacacttcaatacc 7246466  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  |  |  |||| || ||||||| ||||||||||    
T  7246465 ttcatttaaatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaa-tattggagacctg-ccatttggcaagtttgaatta 7246368  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcacct-taccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7246367 ccccatt-caaagg-aagacaatcgttgtagctggaaggtgcatttattccatacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 7246270  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7246269 agttgatctaagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacatgttataatcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 7246170  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7246169 gtcaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 7246127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 553 - 922
Target Start/End: Original strand, 51013095 - 51013464
Alignment:
Q  553 aatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 651  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | ||| || | ||||||||  |||| |  |    
T  51013095 aatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcatttaaatcagcctaacaaaaatttaatcttttgacaagaacaataggaatgccggtcgaa-tatt 51013193  T
Q  652 taaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatctt 748  Q
      |  |||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || ||||||||||||||    
T  51013194 ggagacctg-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 51013290  T
Q  749 ctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgt 848  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51013291 ctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacatgttgtgttcccaaaacatgctcgt 51013390  T
Q  849 cacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  51013391 cacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgttggacgtttatacc 51013464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 398 - 593
Target Start/End: Original strand, 11378639 - 11378835
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||    
T  11378639 ttccaactccaacaattgtcttgcctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcattttgcctcgcattcatgtttttcctttg 11378738  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaac 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11378739 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaac 11378835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 529 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 43570336 - 43569943
Alignment:
Q  529 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaa 627  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| | |||||     
T  43570336 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaatactttcatttaaacaagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 43570237  T
Q  628 aacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac- 724  Q
    ||   |||||||   ||||    ||  |  |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||      
T  43570236 aatgggaatgccagtcgaata--ttggagacgtgccgtttggcaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcagt 43570141  T
Q  725 cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacat 824  Q
    | | || ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43570140 cattccgtacataaagacgatcttctggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 43570041  T
Q  825 cttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43570040 gctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttagttccacccaagtaaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 43569943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Original strand, 45100464 - 45100651
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45100464 ctaatgacgatattatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 45100563  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45100564 caaaacatgctcgtcacatttttgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccttcgtcgagcgttggacgtttatacc 45100651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 241 - 617
Target Start/End: Original strand, 34646773 - 34647149
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||| |  ||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  34646773 taccatcattcaagatgtttttcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattacccccatttagagg-aagacaattgttgcagttggaaggt 34646871  T
Q  341 gcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattc 440  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34646872 gcattcattctgcacctactgaggatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattc 34646971  T
Q  441 aaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgt-tttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |   ||| | |||||||||   |  |||  || |||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  34646972 aaacttgtcaaacaacatgactccaatgttt-aaccgacattcccatagttctattcaaaagattaaatttttgttaggtttggtttaaatgacggtatt 34647070  T
Q  540 caagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttt 617  Q
    |||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  34647071 caagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaataccttcatttaaaccgccctaacaagaatttaatcttt 34647149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 696 - 922
Target Start/End: Original strand, 51695566 - 51695792
Alignment:
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51695566 gtaagacaattattgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgatgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 51695665  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||  | |    
T  51695666 gtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtattcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaacttttc 51695765  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  51695766 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 51695792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 52569060 - 52569594
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||| |   || |||||       
T  52569060 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctgtgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatt-cgttcggcattccca 52569158  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| ||||  |||||||| || |||   || ||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  52569159 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgactgtattcaaatgtcaaaagaacgaggtccattcgttgacacttcaatacc 52569256  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||| |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  52569257 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccgatcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaatta 52569354  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52569355 ccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgcacctaatgacgatcttctggcggaatcaaactcttgatgatatcttc 52569452  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52569453 agttgatctcagcaatgtcacccgcatatcgattcaccggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcac-ttttcgtcgttcgttaattccacccaa 52569551  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52569552 gcgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 52569594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 387 - 856
Target Start/End: Original strand, 46346263 - 46346732
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| |  |||| | | | |||||       
T  46346263 acgtttgtaccttccaactccaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttaccaagcagcatgactccaatatttgatcgg-cattccca 46346361  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  46346362 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaacgaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 46346459  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  46346460 ttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcgtttgacaggaacaatgagaatgccggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaatta 46346557  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46346558 cc-caattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacataatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 46346655  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacatttt 856  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  46346656 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccagaacatgctcgtcacgtttt 46346732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 735 - 921
Target Start/End: Original strand, 34647266 - 34647452
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  34647266 ctaatgacgatcttctagcgtaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttgtgctcc 34647365  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34647366 cgaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatac 34647452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 395 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 41804462 - 41803935
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc---atgttttc 491  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||| |  |||  ||| | |||||   |||||  |    
T  41804462 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagtaggactccaatattcgaccgg-cattcccaatgtt--c 41804366  T
Q  492 ctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatcta 590  Q
    | || |||||| |||||| |||||| | | |  ||| |||| ||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||    
T  41804365 cattcaaaagattaaattcttgttaagttggggttaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcattta 41804266  T
Q  591 aaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcattt 690  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || || ||   ||||| ||  |||| |  |  |  |||  |||||||||| |||||||||||| ||||     
T  41804265 aaccagcctaacaagaatttaatcttttaacagaaacaatgggaatgtcggtcgaa-tattggagacctt-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt- 41804169  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatc 787  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41804168 caaagg-aagacaattgttgtagctaaaaagtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgattatatcttcatttgatc 41804070  T
Q  788 tcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaatta 887  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  41804069 tcatcaacgtcactctcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatga 41803970  T
Q  888 taccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41803969 tactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttatacc 41803935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 425 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 7954734 - 7954239
Alignment:
Q  425 tgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgct 524  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||  | |||   |||   | |||| || |||||  |||||| ||||||||||        
T  7954734 tgaatagggtaaattcaaacttgccaaacagcaagactccaacattcgatccgcgtttctattgttccattcaaaagtttaaattcttgttaggctgaga 7954635  T
Q  525 ttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaac-accttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaag 623  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7954634 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgattaccatcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgaaag 7954535  T
Q  624 gaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tg 721  Q
    ||| || |  |||| ||| |||| || |  | || || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  ||    
T  7954534 gaacaatagaaatgtcgatcgaa-tgttggagtcttg-ccgtttggcaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagttagaaggtg 7954439  T
Q  722 cac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaa 820  Q
    ||  | | || || |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  7954438 cattcattccgtacctaatgacgatcttctagcggaatcagattgttgataatatcttcagttgatcttagcaactttacccgcatatcgatccactgga 7954339  T
Q  821 acatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccct-cccatcgtcgagcgttggacgtttat 919  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  7954338 acatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaactaaatgataccctccccctcatcgagtgttggacgtttat 7954239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 14631665 - 14631478
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  14631665 ctaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttttgctcc 14631566  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  14631565 caaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctttactcgtcgagcgttggacgtttatacc 14631478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Original strand, 10053274 - 10053457
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||    
T  10053274 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatat-ttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat---gtgctcc 10053369  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10053370 caaaacatgctcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacatttatacc 10053457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 497 - 922
Target Start/End: Original strand, 20375646 - 20376068
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||  |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20375646 aaaagattaaattattgttagacttgatttaaatgataatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaaacca 20375745  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    | |||||||  |||||||||||| ||||||| || |  ||||||| | |||| ||||     ||| ||||||  || |||||||||| | ||||||| ||    
T  20375746 gcctaacaagtatttaatcttttgaaaggaacaataaaaatgccgggtgaaa-gcttgggaactg-ccgtttaacaagtttgaattaacccatttcagag 20375843  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
     |||||||||| |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  20375844 -taagacaatttttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatattttggcggaatcaaacagttgttattatcttaaattgatctcagcaac 20375941  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    || || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||    
T  20375942 gttacacgcatatcgatctacttgaacatgttgtgctctcaaaacatactcctcacgttatcgtcgttctttaattccacccaactgaatgatattctcc 20376041  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  20376042 catcgtcgagcattagacgtttatacc 20376068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 735 - 921
Target Start/End: Original strand, 47759890 - 47760076
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  |||| |||    
T  47759890 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgtacatcgatccactggaacatgctgtgttcc 47759989  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47759990 caaaacatgtttgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatac 47760076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 49273619 - 49273432
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  49273619 ctaatgacgatattctggaagaatcaaacttttgatgatatattcagttgatctcagcaacgtcacccacatattgatcaactggaacatgttgtgctcc 49273520  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  49273519 cagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaagtgaatgatactctgccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 49273432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 497 - 920
Target Start/End: Original strand, 33448916 - 33449323
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||||  ||||||||| || ||  ||||||||| ||    
T  33448916 aaaagattaaattgttgttaggattggtttagatgatggtattcaagtgtcaaaagaataaggtccatttattgacacttcaatactgtcatctaaatca 33449015  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
      ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    |||| |   |||| || || | ||||| ||||||| || |||||||||||| |||  || ||    
T  33449016 acctaacaacaatttaatcttttgaaaggaacaatggaaatgtctgacgaa-tgtttgagtcctg-ccgtttgacaagtttgaattaccccatc-cagag 33449112  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || ||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||      
T  33449113 gaaa-acaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaattacgatcttctggcggaatcaaactttggatgatatcttcagttgatctcagca-- 33449208  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
              ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33449209 ----------tatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 33449298  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  33449299 cctcgtcgagcgtttgacgtttata 33449323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 735 - 913
Target Start/End: Original strand, 50458690 - 50458868
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  50458690 ctaatgacgatcttcaggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtttatctcaacaacgtcacccgcatatctatccactggaacatgttgtgctcc 50458789  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggac 913  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||| |  ||||||||||| | ||  |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50458790 caaaacatgctcgtcaagttttcgtcgttcgtagattccacccaattaaacgatactctcccctcgtcgagcgttggac 50458868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 497 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 18441200 - 18440876
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18441200 aaaagattaaactcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcatcccttgacacttcaataccttcatctaaacca 18441101  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
      ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |  |   ||| | | || ||||     | ||||||||  || | ||||||||||  |||||| |     
T  18441100 acctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaccaccgggtg-aaggcttgggaac-ggccgtttaacaagcttgaattacccaatttcaga- 18441004  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18441003 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ctctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctcagcaac 18440905  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacat 824  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||    
T  18440904 gttacacacatatcgatccactggaacat 18440876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 497 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 19486274 - 19485950
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19486274 aaaagattaaactcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcatcccttgacacttcaataccttcatctaaacca 19486175  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
      ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |  |   ||| | | || ||||     | ||||||||  || | ||||||||||  |||||| |     
T  19486174 acctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaccaccgggtg-aaggcttgggaac-ggccgtttaacaagcttgaattacccaatttcaga- 19486078  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19486077 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ctctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctcagcaac 19485979  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacat 824  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||    
T  19485978 gttacacacatatcgatccactggaacat 19485950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 729 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 27187174 - 27186982
Alignment:
Q  729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttg 828  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| | | ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  27187174 ccctacctaatcacgatattatggcggaatcagattgttgataatatctttagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaatggaacatgttg 27187075  T
Q  829 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||  ||||| ||  ||||| |||||| |||||||    
T  27187074 tgctcccaaaacatgttcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctctacgagcattggacatttatac 27186982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 24702255 - 24701929
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  24702255 ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctt 24702157  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  24702156 tgaaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 24702060  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcattt 690  Q
     ||   ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | | | ||  |||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  24702059 gcacacctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagt-caggttgtttggcaagtttgaatttacccca-tt 24701963  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701962 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 24701929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 44835470 - 44835144
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  | | |||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
T  44835470 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacggccaggactcaagcacttcgctcggcattcatgtttttcctt 44835372  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  44835371 tgaaaagattaaattcttgttaggctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 44835275  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcattt 690  Q
     || | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | |||| |  |||||| | ||||||| ||||| || ||    
T  44835274 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggcgaaatgtttgagtcct-gttgtttggtaagtttgaatttacccca-tt 44835178  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44835177 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 44835144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 396 - 922
Target Start/End: Original strand, 25887271 - 25887796
Alignment:
Q  396 ccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcct 493  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||   ||||| |||| ||||||  | |  | || ||||     
T  25887271 ccttccaactacaacaattatcttacctttgaaatgaggtaaattcaaacttgctaaacgacaactctcaaacatt-cacccggaagttctattgttcca 25887369  T
Q  494 ttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    || |||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |||| |||||||||| || || ||||| ||||    
T  25887370 ttcaaaagattaaattcttgttagt-ttggtttagatgatggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcatttcttgacacttcaatactttcatataaa 25887468  T
Q  593 ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttca 692  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |  | | ||| | ||| |||||    |   | | | | ||| |||||||||| | |||||||    
T  25887469 ccaaactaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaataaaacttccgggtgaa-tgcttgggact--gtcatatagcaagtttgaattatcccatttca 25887565  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgca--ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatct 788  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||    
T  25887566 taggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattccctacc-taa-taatcacgatattctagcggaatcaaactgtggagaatatcttcagttgatct 25887663  T
Q  789 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattat 888  Q
    || ||||||  | | ||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||  |||||||||||||| ||| | ||    
T  25887664 caacaacgttccacacatat-gatccacgagaacatgttgtgctcccaaaacatggtcctcacatcctcgtcgtttgttaattccacccaactgagtgat 25887762  T
Q  889 accctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25887763 attctcccatcgtcgaacgttggacgtttatacc 25887796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 13895853 - 13895527
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  | | |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  13895853 ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctt 13895755  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||  |||||| | ||| || || || ||| |||||||||    
T  13895754 tgaaaagattaaattcttgttaggctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacttcatttcgttggcaattgaataccatcatctaaa 13895658  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || | ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || | |||||   |||||||| ||||||||| ||| ||||     
T  13895657 gcaagcctaacaaaaatttatttttttcaaaggaaaa-catgaatgccgggtgaaatgtttgagtcctgtt-gtttggcaagtttgaattgaccccatt- 13895561  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13895560 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 13895527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 42383287 - 42383613
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||    
T  42383287 ttccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaaacatttcactcggcattcatgtttttcctt 42383385  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||| ||||    
T  42383386 tgaaaagattaaattcttgttaggcttg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatttaaa 42383482  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttc 691  Q
     | ||  |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||| |  |||||||| |||||||||    || |||    
T  42383483 gcaagcgtaacacaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaagtttgaatttatccaattc 42383580  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42383581 aaagataagacaattgttgtagttggaatgcac 42383613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 398 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 49218719 - 49218396
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  49218719 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacatgtcaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcttttg 49218620  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| || || || ||| ||||||||| |    
T  49218619 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcaattgaataccatcatctaaagc 49218523  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |   |||||| | ||||||| ||| | || ||||    
T  49218522 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgagcgaaatgcttgagtccagtatgtttggtaggtttgaatttatcaca-ttca 49218425  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatg 721  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  49218424 aatgtaagataattgttggagttggaatg 49218396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 387 - 473
Target Start/End: Original strand, 19452798 - 19452884
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttca 473  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19452798 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttca 19452884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 398 - 652
Target Start/End: Original strand, 43477293 - 43477547
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | || |||||||| |||| |||||    
T  43477293 ttccaacttcaacaactgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggagtcaagcatttcgctcggcattcatgttttttctttg 43477392  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  43477393 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttgtcacttgaataccatcatctaaagc 43477489  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctt 652  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  43477490 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgctt 43477547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 25576575 - 25576248
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||    
T  25576575 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctt 25576477  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| || || || ||| |||||||||    
T  25576476 tgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcaattgaataccatcatctaaa 25576380  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||| | |||||   |||||||  ||||||||| ||| ||||     
T  25576379 gcaagcctaacaaaaatttattcttttaaaaggaaaaacatgaacacggggcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggccagtttgaatttaccccatt- 25576282  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25576281 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 25576248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27187876 - 27187550
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-tt 490  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||  |||   || ||||||  | || ||    
T  27187876 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaatagcaggactcaaatattagtcc-gacatttctattgtt 27187778  T
Q  491 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatct 589  Q
    || ||  ||||| |||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |    
T  27187777 ccattccaaagattaaattcttgttaggcttggtataaataatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcattt 27187678  T
Q  590 aaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatt 689  Q
    ||| | | ||||||| ||||||||||||  ||| ||| || |  |||| || ||| |||| || | |||| |||||||  || ||||||||||||||| |    
T  27187677 aaatcggcctaacaagaatttaatctttagaaatgaacaatagaaatgtcgggcg-aatgtttgagtcct-gccgtttaacaagtttgaattacctca-t 27187581  T
Q  690 tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 721  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27187580 tcaaagg-aagacaattgttgtagttgcaatg 27187550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 34693273 - 34692947
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  34693273 ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaagactcaagcatttcgcgcgacattcatgtttttcctt 34693175  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | || |||| |||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| |||  |||| || ||| |||||||||    
T  34693174 tgaaaagattaaattcttgttagac-tggtttatatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggtacttgaataccatcatctaaa 34693078  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || |  |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || | |||| |  |||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  34693077 gcacgcttaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgtttgagtcct-gttgtttggcaagtttgaattgacccca-tt 34692981  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34692980 cacaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 34692947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45099986 - 45099893
Alignment:
Q  245 atcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45099986 atcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttatcccattcaggggtaagataattgttgcagttggaag 45099893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 427 - 724
Target Start/End: Original strand, 44927729 - 44928025
Alignment:
Q  427 aatggggtaaattcaaacttgccaaacaa-catgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgct 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| | | |    
T  44927729 aatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggtcaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttgttaggatgg-t 44927826  T
Q  525 ttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaacca-gtctaacaataatttaatcttttcaa 621  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||||    
T  44927827 ttagatgaatgtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaa 44927924  T
Q  622 aggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 720  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| || | |||||   | |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927925 aggaaaa-catgaatgccgggtgaaatgtttgagtcctgtt-gcttggcaagtttgaattgaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaat 44928021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 694 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 14265665 - 14265441
Alignment:
Q  694 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagca 793  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |  | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||| | || ||||||| |    
T  14265665 aggtaagacaattgatgtagttggaaagtgcaat-ccctacctaatcacgatcttcaggcggaatcaaactctggagaatatctttagttaatctcagta 14265567  T
Q  794 acgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccct 893  Q
    |||| || | || |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||| || |||| ||||| |||  |     
T  14265566 acgttacacacaaatcgatccacggtaacatgttgtggtcccaaaacatgttcgtcac---gtcgtcgttccttaatttcatccaactgaatgatattca 14265470  T
Q  894 cccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14265469 cccatcgtcgaacgttggatgtttatacc 14265441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 389 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 49273969 - 49273907
Alignment:
Q  389 gtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49273969 gtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 49273907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 51012800 - 51012698
Alignment:
Q  243 ccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgc 342  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  51012800 ccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaagatac 51012701  T
Q  343 att 345  Q
    |||    
T  51012700 att 51012698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34646730 - 34646633
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || || |||| |||||||||  |||||||    
T  34646730 taccatcatttaaaatgcgcatcgaatactggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgctattggaag 34646633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13895387 - 13895304
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  13895387 atgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 13895304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 474 - 719
Target Start/End: Original strand, 37281764 - 37282010
Alignment:
Q  474 cccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttga 571  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| || || ||| |||||||   |||||   |||     
T  37281764 cccgacattcatatttttcctttgaaaagattaaattattgttaagct-gatttagatgaaggtattgaaatgtcaa-gaaatgaacctcattttgttgg 37281861  T
Q  572 cactt-aacaccttcatctaaaccagtc-taacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttgg 669  Q
    ||||| || ||| ||||||||| ||  | |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |  ||||||    
T  37281862 cacttgaataccatcatctaaagcaagcataacaaaaatttattattttcaaaggaaaaacatgaatgccgggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttgg 37281960  T
Q  670 catgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |  ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37281961 ccagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 37282010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14632013 - 14631949
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14632013 acgtttataccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacatgccaa 14631949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19453212 - 19453070
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| |||||||  | |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  19453212 ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcatttcgctcgacattcatgtttttcctt 19453114  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  19453113 tgaaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt 19453070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Original strand, 45100126 - 45100190
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45100126 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaa 45100190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 11378759 - 11378634
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| | |||| |  |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  11378759 ctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcgaggcaaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaagg 11378662  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11378661 caagacaattgttggagttggaatgcac 11378634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 344
Target Start/End: Original strand, 42383752 - 42383855
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |    
T  42383752 taccatcattcaagatgctgatcgaatattggagtcctgcggcttagcatgtttgaatttgccctattcaggggcaagacaattcttgtagttggaaggt 42383851  T
Q  341 gcat 344  Q
    ||||    
T  42383852 gcat 42383855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 51695438 - 51695355
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  51695438 atgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 51695355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 48087535 - 48087293
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgttttc-ctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | |  ||||||||||||  |||    
T  48087535 ttccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcagcattcatgttttttctt 48087437  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaa- 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| |||  ||  |   ||| ||| ||||| || ||| |||||||||     
T  48087436 tgaaaagaataaatttttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatggacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaag 48087339  T
Q  593 ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgcc 639  Q
    | || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  48087338 caagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgcc 48087293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34471591 - 34471494
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| | |||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34471591 taccatcattcaagatgttgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 34471494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 334
Target Start/End: Original strand, 43570564 - 43570657
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  43570564 taccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttgcccaattcaagggtaagataattgttgcagttg 43570657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46413836 - 46413743
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    |||||||||| || ||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  46413836 taccatcattgaagatattcatcgcatgctggagtcctgcggtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttg 46413743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 334
Target Start/End: Original strand, 51015973 - 51016066
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  51015973 taccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagatgattgttgcagttg 51016066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 54391142 - 54391239
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  54391142 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 54391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 337
Target Start/End: Original strand, 14632149 - 14632245
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    |||||||||| || |||||||||| |   |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  14632149 taccatcattcaagatgctcatcgcaagttggagtcctgctatttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaa 14632245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2646381 - 2646298
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  2646381 atgcttatcgaatactggattcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 2646298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 39416839 - 39416604
Alignment:
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttc 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| |||  ||  |   ||| ||| ||||| || ||| ||    
T  39416839 ttttcctttgaaaagaataaatttttgctaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatggacctcatttcgttggcacttgaataccatc 39416742  T
Q  586 atctaaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || | || | |  |||||| | |||||||||  |    
T  39416741 atctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgcggggtgaaatgtttgagtcat-gttgtttgggaagtttgaatttgc 39416644  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
     |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39416643 cccattcaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcac 39416604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 44928178 - 44928261
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  44928178 atgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttaaagttgccccattcagaggcaagacaattattgcagttggaag 44928261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Original strand, 45100033 - 45100126
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  45100033 taccatcattaaaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaa-ttaccccattca-aaggaagacaattgttgcagttgga 45100126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 724
Target Start/End: Original strand, 47066133 - 47066248
Alignment:
Q  606 aatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaat 705  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| | |||||     ||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||    
T  47066133 aatttattcttttcaaaggaaaagcatgaatgcgggacgaaatgcttgagtcctgttg--ttggcatgtttaaatttacccatt-caaaggtaagacaat 47066229  T
Q  706 tgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47066230 tgttgtagttggaatgcac 47066248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Original strand, 2429194 - 2429288
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || |||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | || |||| ||||||||||||||||||    
T  2429194 catcattcaagatgctcatcggacgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcattctgtggtaagagaattgttgcagttggaag 2429288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 599 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 36721169 - 36721053
Alignment:
Q  599 taacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggt 697  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |  ||||||   | ||||| |||||||| |||||||||    
T  36721169 taacaaaaatttattcttttcaaagaaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttgggcagattgaatttacctca-ttcaaaggt 36721072  T
Q  698 aagacaattgttgtagttg 716  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36721071 aagacaattgttgtagttg 36721053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 53826527 - 53826441
Alignment:
Q  252 aaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||| |||||||| |||| || ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  53826527 aaaatgctgatcgaatattggagtcttgctgcttagcaagtttgagtttgccccattcatgggtaagacaattgttgtagttggaag 53826441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 55206385 - 55206303
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  55206385 atgctcatcggatgcaggagtcctgctgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaa 55206303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11378475 - 11378398
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  11378475 atcgaatactagagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagagacaagacaattgttgtagttggaag 11378398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 34050427 - 34050524
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||| || ||||||    
T  34050427 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgaagctggaag 34050524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36720849 - 36720756
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    ||||||| || ||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  36720849 catcattcaagatgttgatcgaatattggagtcctacagtttagcaagtttgaatttacctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaa 36720756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Original strand, 39415710 - 39415795
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  39415710 tgatcaacccttgggataagtttaaatctgcttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcttgttggggtat 39415795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 46405725 - 46405802
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  46405725 atcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 46405802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49139573 - 49139476
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  49139573 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccctattcagtggtaagaagattgttgcagctggaag 49139476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 50998088 - 50998185
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||    
T  50998088 taccaacattcaagatgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaaaatgattgttgcagttggaag 50998185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 448
Target Start/End: Original strand, 51012938 - 51012999
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51012938 acgtttgtacgtcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgc 51012999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 51016075 - 51015998
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  51016075 tgtaccttacaactgcaacaatcatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 51015998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 52568928 - 52568831
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||| || ||  ||||||||||||||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  52568928 taccatcattcaagatgctcatcgaatgttggagtcatgttgtttagcaagtttgaatttgtcacattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 52568831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Original strand, 10053037 - 10053101
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  10053037 acgtttgtaccttccaactacaacaattttgttacctttcaataggataaattcaaacttgccaa 10053101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 858 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 15637121 - 15637057
Alignment:
Q  858 gttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15637121 gttgttcattaattccacccaactgaatgatattctcccatcgtcgagtgttggacgtttatacc 15637057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42949712 - 42949656
Alignment:
Q  288 caagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42949712 caagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 42949656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 44834962 - 44834902
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44834962 ttagcaagtttgaatttgccccattcaggagcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 44834902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2267999 - 2267916
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  2267999 atgctgatcgaatactggtgtcctgttgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 2267916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 2646452 - 2646541
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2646452 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggcaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 2646541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 346
Target Start/End: Original strand, 3494609 - 3494694
Alignment:
Q  259 tcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3494609 tcatcgaatactggagtcctgccgattagcaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 3494694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34050370 - 34050281
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34050370 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 34050281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Original strand, 43477739 - 43477834
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||||||    
T  43477739 taccagcattcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaaatttgaatttgccccattcagttgtaagatgattgttgcagttgga 43477834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46403646 - 46403557
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  46403646 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 46403557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 49139630 - 49139719
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49139630 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 49139719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 54391085 - 54390996
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54391085 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 54390996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 55268542 - 55268479
Alignment:
Q  275 tcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  55268542 tcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtatgataattgttgcagttggaag 55268479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4004070 - 4003931
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  |   ||||||||| |||||||    
T  4004070 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttcgcaagcacttcatgtttctcctttg 4003973  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  4003972 aaaatattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 4003931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Original strand, 30193237 - 30193331
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  30193237 catcattcaaaattctcatcacatgttggagtcctgctgtttagcacgtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttagaag 30193331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 34049963 - 34050102
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| |||||||    
T  34049963 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcgcctcatgtttctcctttg 34050060  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  34050061 aaaatattaaatttttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 34050102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42322913 - 42322807
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| | ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| |    
T  42322913 taccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcgtgctgtttaacaagtttgaatttaccccatttagaggtaagaaaattgttgcagtaggaaggt 42322814  T
Q  341 gcattca 347  Q
     ||||||    
T  42322813 acattca 42322807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 49140037 - 49139898
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| |||||||    
T  49140037 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttg 49139940  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  49139939 aaaatattaaatttttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 49139898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 54390678 - 54390817
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| |||||||    
T  54390678 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttg 54390775  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  54390776 aaaatattaaatttttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 54390817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 336
Target Start/End: Original strand, 55268660 - 55268713
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  55268660 gtttagcaagtttgaatttgccccattca-gaggaagacaattgttgcagttgga 55268713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3494540 - 3494451
Alignment:
Q  249 tttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  3494540 tttaagatgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttgacaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 3494451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 663 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 25887330 - 25887273
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25887330 cgtttagcaagtttgaatttacctcatttcaaaggtaagataattgttgtagttggaa 25887273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 344
Target Start/End: Original strand, 47066433 - 47066490
Alignment:
Q  287 gcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  47066433 gcaagtttgaatttgccctattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 47066490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 2268477 - 2268152
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  |    |||||||| |||||||    
T  2268477 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttg 2268380  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttc-attccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||| | |||||| |||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | | |||   || ||||  || ||||| || ||| ||||||||| |    
T  2268379 aaaatattaaattcttgttatg-ttggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggattgaacctcaattcggtggcacttgaataccatcatctaaagc 2268283  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaa-tgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttc 691  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||   |||||||| || | |||| |  |||| ||| ||||||| ||| | || |||    
T  2268282 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgcttggcgaaatgtttgagtcct-gttgttttgcaggtttgaatttatccca-ttc 2268185  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2268184 aaaggtaagacaattgtcgtagttggaatgcac 2268152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10052872 - 10052804
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10052872 tggagtcctgctgtttaacaagtttgaatttgcctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 10052804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Original strand, 50997823 - 50997949
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaa-tgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaag 695  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||| | |||||   |||| ||| ||||||||| | | |||| |||||    
T  50997823 ctaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgcttggcgaaatgcttgagtcctgtt-gttttgcaggtttgaatttatcccatt-caaag 50997920  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50997921 gtaagacaattgttggagttggaatgcac 50997949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 34471489 - 34471560
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  34471489 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 34471560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 36135721 - 36135804
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || | ||  |||||||||||||||||    
T  36135721 atgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtacgatgattgttgcagttggaag 36135804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Original strand, 46403261 - 46403378
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  46403261 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgc 46403359  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  46403360 -tggtttagatgaaggtatt 46403378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49218240 - 49218157
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||  ||||||||| |||||||    
T  49218240 atgctgatcgaatactggagtcccgctgtttaacaagtttgaatttgtcccattcagtggtaagatgattgttgcaattggaag 49218157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 7955110 - 7954988
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  7955110 aaaagattaaattagtgttaggcttggtttaaataatagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttcaatacctttatttaaacca 7955011  T
Q  596 gtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    |  |||||  |||||||| ||||    
T  7955010 gcgtaacatgaatttaatatttt 7954988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 642 - 708
Target Start/End: Original strand, 11378843 - 11378909
Alignment:
Q  642 gcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgt 708  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11378843 gcgaaatgcttgagtcatggtcgtttgacaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgt 11378909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 673 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 15637271 - 15637226
Alignment:
Q  673 gtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15637271 gtttgaattacctcatttcagag-taagacaattgttgtagttggaa 15637226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 15637445 - 15637316
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||    
T  15637445 aaaagattaaattcttgttagt-ttggtttagatgatggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacgatcatcaaaacca 15637347  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
      ||||| | || |||||||||| |||||||    
T  15637346 aactaactagaacttaatcttttgaaaggaa 15637316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 36135243 - 36135315
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36135243 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 36135315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39416418 - 39416368
Alignment:
Q  288 caagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  39416418 caagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 39416368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 719
Target Start/End: Original strand, 41578409 - 41578462
Alignment:
Q  666 ttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41578409 ttggcaagtttgaatttacctcatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaa 41578462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Original strand, 41578652 - 41578706
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  41578652 ttagcaagtttgaattttcgccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 41578706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19452662 - 19452565
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||  || | |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  19452662 taccatcattcaagatgctcattggattatgcagtcctgctgtttagcaagtctgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgtagttggaag 19452565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 43570666 - 43570589
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||| ||||| |||||||  | ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  43570666 tgtacctttcaactgcaacaattatcttacccttgaattgggcaaattcaaacttgctaaacagcatgactccagcat 43570589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 45099888 - 45099965
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  45099888 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatgggataaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 45099965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46346127 - 46346030
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| | |||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||     |||| ||||||||||||||||||    
T  46346127 taccatcattcaagatgttgatcggatgctggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcactaataagataattgttgcagttggaag 46346030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 338
Target Start/End: Original strand, 49274143 - 49274203
Alignment:
Q  277 ctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  49274143 ctgctgtttagcaagtttgaatttgc-ccattcatggataagataattgttgcagttggaag 49274203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Original strand, 7246576 - 7246652
Alignment:
Q  262 tcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| |||| |||||| | || |||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  7246576 tcgaatattggagtcctgctgcttcgcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaag 7246652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 43570478 - 43570414
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43570478 acgtttgtatctcccaacagcaacaattgtcttgcctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaa 43570414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Original strand, 51695350 - 51695406
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  51695350 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 51695406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 457
Target Start/End: Original strand, 2267913 - 2267976
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaaca 457  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2267913 taccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcaaca 2267976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 4003663 - 4003752
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4003663 atgctcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt-gccccatccagagt-aagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 4003752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7954466 - 7954411
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  7954466 ggaagacaattgttgtagttagaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 7954411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 618
Target Start/End: Original strand, 8632809 - 8632924
Alignment:
Q  504 taaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaac 602  Q
    |||||| ||||||| |||  |||| |||| |||||| ||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||    
T  8632809 taaattcttgttagactttgtttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttcaatattttcatctaaaccagcctaac 8632908  T
Q  603 aataatttaatctttt 618  Q
       |||||||||||||    
T  8632909 ctgaatttaatctttt 8632924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24701776 - 24701693
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| |||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||||    
T  24701776 atgctgatcgaaaaatggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcccctttcagtgttaagaagattgttgcagttggaag 24701693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 338
Target Start/End: Original strand, 27187816 - 27187871
Alignment:
Q  283 tttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27187816 tttagcaagtttgaatttacctcattcagaggtaagacaattgttgtagttggaag 27187871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 34647224 - 34647279
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  34647224 ggaagacaattgttgcagctagaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctt 34647279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 42323346 - 42323401
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  42323346 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcagtacctaatgacgatctt 42323401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 42950003 - 42949861
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcat-gttttccttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | |  |||| ||  |||||||||    
T  42950003 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaacttgccaaacgcctaggactcaagcatttcgctcagcatttatatttttccttt 42949904  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  42949903 gaaaagattaaattcttgctaggc-tggtttagatgaaggtatt 42949861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 51013235 - 51013290
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  51013235 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 51013290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 432
Target Start/End: Original strand, 55268715 - 55268758
Alignment:
Q  389 gtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggg 432  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  55268715 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggg 55268758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 346
Target Start/End: Original strand, 774270 - 774331
Alignment:
Q  283 tttagcaagtttgaatttgctccatt-cagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  774270 tttagcaagtttgaattt---ccatttcagaggtaagacaattgttgcagttggaaggtgcattc 774331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 719
Target Start/End: Original strand, 2429014 - 2429044
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2429014 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 2429044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3495012 - 3494940
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3495012 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttttcaaacaacaggactcgagcatttc 3494940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 719
Target Start/End: Original strand, 7246621 - 7246651
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7246621 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 7246651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Original strand, 7246841 - 7246894
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  7246841 ttagcaagtttgaatttgc-ccattcagtggtatgataattgttgcagttggaag 7246894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 666 - 719
Target Start/End: Original strand, 14631949 - 14632002
Alignment:
Q  666 ttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14631949 ttggcatgtttgaatttaccccatt-caaaggtaacacaattgttgtagttggaa 14632002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 664 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 19452864 - 19452811
Alignment:
Q  664 gtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 717  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19452864 gtttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttgg 19452811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 50997624 - 50997696
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  50997624 ttccaactacaacaattgtatt-cttttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 50997696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 50998188 - 50998134
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  50998188 taccttccaactgcaacaatcattttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 50998134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 447
Target Start/End: Original strand, 3494448 - 3494501
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 447  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  3494448 taccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttg 3494501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34692788 - 34692711
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||   | |||||  || ||||  |||||||||||||||||    
T  34692788 atcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttttccaattcaatggtaagatgattgttgcagttggaag 34692711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 453
Target Start/End: Original strand, 36720750 - 36720811
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 453  Q
    ||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  36720750 tgtacattccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggtaaattcaaacttgctaaac 36720811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 41578386 - 41578463
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||| |||| |||||| | || |||||||||||||| |  ||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  41578386 atcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaag 41578463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 41804606 - 41804703
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| ||||| || |||||||||| || ||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  41804606 taccgtcattcaagatgctcatcggatgctggagttatgctgtttaacaagtttgaatttgtctcattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 41804703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 42322811 - 42322888
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||| ||| |||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||    
T  42322811 tgtaccttcctactgcaacaattttcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgttaaacagcacgactccagcat 42322888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 453
Target Start/End: Original strand, 46413734 - 46413795
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 453  Q
    |||||||| ||||| |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  46413734 tgtaccttgcaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaac 46413795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 51012700 - 51012777
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||| ||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  51012700 tgtatcttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 51012777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 51015537 - 51015484
Alignment:
Q  316 aagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  51015537 aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctt 51015484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 463
Target Start/End: Original strand, 52568828 - 52568897
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52568828 taccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatgtgacaaattcaaacttgctaaacaacatgactc 52568897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 40415152 - 40414639
Alignment:
Q  407 caacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataa 506  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40415152 caacaattgtcttacctttgaatagggtaaattcaaacctgccaaacaacaggactcaatcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataa 40415053  T
Q  507 atttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaata 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |    
T  40415052 atttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcataacaaga 40414953  T
Q  607 atttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaatt 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  40414952 atttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttgataagtttgaattaccccatttcagaggtaagagaatt 40414853  T
Q  707 gttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcat 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40414852 gttgtagttggaatgcaccttaccct--ctaatgacgatcttctggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcat 40414755  T
Q  807 atcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagc 906  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  40414754 atcaatcaactgaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagt 40414655  T
Q  907 gttggacgtttatacc 922  Q
    ||| ||||||||||||    
T  40414654 gttagacgtttatacc 40414639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 40415810 - 40415286
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  40415810 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatagggtaaattcaaacctgccaaacaacatcactcaaacatttcactcggcattcatgtttttctttga 40415711  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40415710 aaagaataaatttttgtaaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattctttgacacttaataccttcatctaaaccagt 40415611  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  40415610 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaagttatggccgtttggtaagtttgaattaccccatttcataggt 40415511  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  40415510 aagagaattgttgtagttgaaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatatcttaagttgatctcaacaacgt 40415411  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40415410 cacctgcatatcgatccacgggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccc 40415311  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40415310 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 40415286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 42168620 - 42169145
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  42168620 ttccaactacaacaattgtcctaccttcgaatggggtacagtcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgtttttcctttg 42168719  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  42168720 aaaataataaatttttggtaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcattgccacttaataccttcatctaaaccag 42168819  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42168820 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcaaagg 42168919  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42168920 taagacaattgttgtagttggaatgcatcttatcctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctctgcaacg 42169019  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  42169020 ttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaattccacccaagggaatgatactttccc 42169119  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  42169120 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 42169145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 401 - 922
Target Start/End: Original strand, 28705805 - 28706327
Alignment:
Q  401 caactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaa 499  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  28705805 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgccccacattcgtgtttttcctttgaaa 28705904  T
Q  500 agaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtct 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |    
T  28705905 agaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacatttaataccttcatctaaaccagcat 28706004  T
Q  600 aacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaa 699  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  28706005 aaaaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgttgggcgaaatgcttgagtcattgccgtttggcaagtttgaattaccccatttcacaagtaa 28706104  T
Q  700 gacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtca 799  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  28706105 gacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaagcggttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtta 28706204  T
Q  800 cccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatc 899  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  28706205 cacgcatatcgatccactaaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttctttaactccactcaagtgaatgatattctcccctc 28706304  T
Q  900 gtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28706305 gtcgagcgttggacgtttatacc 28706327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 24861895 - 24861372
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  24861895 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaaccttccaaacaacaggactcaagcatttcgctcgccattcatgttttcctttga 24861796  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24861795 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 24861696  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  24861695 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcat-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 24861598  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  24861597 taagacaattgttgcagatggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaaca 24861498  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24861497 tcacccgcatatcaatccaattgaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 24861398  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  24861397 cccgtcgagcgttggacgtttatacc 24861372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 26452877 - 26452354
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  26452877 ttccaactgcaacaattgtcttaccttttaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacatgactcaagcatttcgcttgacattcatgttttcctttga 26452778  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  26452777 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggtccatttcttgacacttaataccttcatctaaactagc 26452678  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  26452677 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacataaatgtcgagcgaaatgtttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 26452580  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26452579 tatgacaattgttgcagttggaatacaccttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 26452480  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  26452479 tcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 26452380  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  26452379 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 26452354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 38033586 - 38034110
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |   |||||||||||| ||||||    
T  38033586 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgtagtaaattcaaacttaccaaacaacaggactcaaacatttcgtctcgcattcatgtttttcctttg 38033685  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38033686 aaaagaataaatttt-gttaggcttactttaaatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 38033784  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || |||||||||  || ||||||||||||  |||||| |||    
T  38033785 cataataagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttatcaagtttgaattacccaatttcagagg 38033884  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38033885 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttccggcggaatcaagctattgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 38033984  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  38033985 ttacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggtgaatgatactctccc 38034084  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||| |||||||| |||||||||||    
T  38034085 ctcgtagagcgttgaacgtttatacc 38034110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 15031986 - 15032509
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||| |||    
T  15031986 ttccaactgcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacacgactcaagcatttcaccaagcacttcatgttttcccttt 15032085  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15032086 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 15032185  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
       |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  15032186 acataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggcgcttgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaag 15032283  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15032284 g-aagacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 15032382  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15032383 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 15032482  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  15032483 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 15032509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 436 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 2417428 - 2416944
Alignment:
Q  436 aattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgg 535  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2417428 aattcaagcctgccaaacaacaggactcaagcatttcgctcgacattcatattttcctttgaaaagaataaatttttgttagacttactttagatgatgg 2417329  T
Q  536 tattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaa 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2417328 tattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaa 2417229  T
Q  636 tgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaac 735  Q
    ||||||||||||||||| | ||||    |||||||| |||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2417228 tgccgagcgaaatgcttgagtcct-attgtttggcaggtttaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaac 2417131  T
Q  736 taatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctccc 835  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  2417130 taatgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcggttgatctcatcaacgtcacctgcatatcgatcaactggaacatgttgtgctccc 2417031  T
Q  836 aaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  2417030 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctccccttgtcgaatgttggacgtttatacc 2416944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 484920 - 485443
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  484920 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 485019  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  485020 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 485119  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  485120 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 485217  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  485218 g-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 485316  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  485317 ttcatccgcatatcgatccactagaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 485416  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  485417 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 485443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 398 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 22549631 - 22549232
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22549631 ttccaactgcaacaattgtcttacctttaaatggggtcaattcaaacttgccaaacagcaggactcaaacatttcacccggcattcatgttttcctttga 22549532  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22549531 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 22549432  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  22549431 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgctgagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 22549334  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22549333 taagacaattgttgaagttggaatacaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaa---gttgatgatatcttcagttgatgtcagcaacg 22549237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 465 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 34615440 - 34614982
Alignment:
Q  465 agcatttcacccgacattcatgttttccttt-gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca 563  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34615440 agcatttcgccccgcattcatgtttttcttttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca 34615341  T
Q  564 ttccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggcc 663  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| | || ||| |    
T  34615340 ttcctttacacttaataccttcatctaaatcagcataacaagaatttaatcttttcaaatgaaaaacatgaacgttgggcgaaatgcttgagtcatggtc 34615241  T
Q  664 gtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaac 763  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||      
T  34615240 gtttgtcaagtttgaattaccccatttaagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaattactatcttctggtggaatcaagt 34615141  T
Q  764 ttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgtt 863  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  34615140 tgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcaatccactggatcatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgtt 34615041  T
Q  864 ctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34615040 cgttaatttcacccaagtgaatgatactttcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 34614982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 572 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 43693516 - 43693166
Alignment:
Q  572 cacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggca 671  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  43693516 cacttaataccttcatctaaaccagcctagcaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtccttgccgtttggca 43693417  T
Q  672 tgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatg 771  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||    
T  43693416 agtttgaattaccccatttcagaggtaagaaaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggaggaatcaagttgttgatg 43693317  T
Q  772 atatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaatt 871  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43693316 atatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaatt 43693217  T
Q  872 ccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43693216 ccacccaaatgaatgatatcctcccctcgccgagcgttggacgtttatacc 43693166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 609 - 922
Target Start/End: Original strand, 43638549 - 43638862
Alignment:
Q  609 ttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgt 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  43638549 ttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggctatttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattat 43638648  T
Q  709 tgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatat 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  43638649 tgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacgcgcatat 43638748  T
Q  809 cgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgt 908  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  43638749 cgatgcactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccacccaagtgaaggatactctcccctcgtcgagcgt 43638848  T
Q  909 tggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||    
T  43638849 tggacgtttatacc 43638862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 618 - 920
Target Start/End: Original strand, 33799432 - 33799734
Alignment:
Q  618 tcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 717  Q
    |||| ||||||||||||| || | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33799432 tcaatggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttgg 33799531  T
Q  718 aatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccact 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33799532 aatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttatccgcatatcgatccact 33799631  T
Q  818 gaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgttt 917  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33799632 ggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgttt 33799731  T
Q  918 ata 920  Q
    |||    
T  33799732 ata 33799734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 41856622 - 41857159
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |  ||| || ||| |||||       
T  41856622 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaagcagcaggactctaatatt-caaccggcattccca 41856720  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt---aaca 580  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||| | |  ||| |||| ||||||||| || |||   |||||||| ||||| |||||||||   || |    
T  41856721 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaaaata 41856818  T
Q  581 ccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat 680  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||    
T  41856819 ccttcatttaaatcagcctaacaataatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaat 41856916  T
Q  681 tacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatct 777  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41856917 taccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcatttcgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatct 41857014  T
Q  778 tcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccc 877  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41857015 tcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaatatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccaccc 41857114  T
Q  878 aagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41857115 aagttaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 41857159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 698 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 41363909 - 41363685
Alignment:
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41363909 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggaggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 41363810  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  41363809 aacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccc 41363710  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  41363709 tcgtcgagcgttagacgtgtatacc 41363685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 418 - 611
Target Start/End: Original strand, 43637445 - 43637638
Alignment:
Q  418 ttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttag 517  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43637445 ttacctttgaatgcggtaaattcaaacctgccaaacaacaagactcaaacatttcacccggcattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttag 43637544  T
Q  518 gcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataattta 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43637545 gcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcattgacacttaataccttcatctaaaccagcctaacaagaattta 43637638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 18439945 - 18440480
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||  ||| ||||||||      
T  18439945 acgtttgtgccttccaactacaacaattgtcttatctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactctaatattcgacc-gacattcaca 18440043  T
Q  487 tt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
     | |||| || |||||| |||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  18440044 atgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 18440143  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |  |  |||| |||||||| |  |||||||||||    
T  18440144 catttaaactagcctaacaataatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggaaaatttgaattacc 18440241  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
     |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  18440242 ccatt-caaagg-aagataattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctcgcgtaatcaaacttttgatgatatcttcag 18440339  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  18440340 tttatctcagcaacgtcaccctcatatcgatccactggaacatgttgtgctcctaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattctacccaagt 18440439  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18440440 gaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 18440480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 488 - 920
Target Start/End: Original strand, 44942832 - 44943264
Alignment:
Q  488 tttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttca 586  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  44942832 tttccattcaaaagattaaattgttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 44942931  T
Q  587 tctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctc 686  Q
    | |||| ||| | ||||| ||||||||||||| | ||||  ||   ||||||||   ||| |  |  |  |||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  44942932 tttaaaacagccgaacaagaatttaatcttttgacaggagcaatgggaatgccgtctgaa-tattggagacctgtc-gtttggcaagtttgaattatctc 44943029  T
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaatt 783  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44943030 att-caaacg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcatacattccgtacctaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 44943127  T
Q  784 gatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtga 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44943128 gatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtga 44943227  T
Q  884 attataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44943228 atgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttata 44943264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 42604015 - 42603483
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacatt-cat 485  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||| || |||||||| |      
T  42604015 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatt-caaccgacatttcca 42603917  T
Q  486 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
     | |||| || |||||| |||||| |||||||| | |  ||| |||| ||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||  ||| || |||||    
T  42603916 atgttccgttcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgatccttcaatacctt 42603817  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |    ||||||||  |||| |  |  |  ||||    ||||||| ||||||||||||    
T  42603816 catttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacagtgggaatgccggtcgaa-tattggagacctg----tttggcaagtttgaattacc 42603722  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||      
T  42603721 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttttggcggaatcaaacttttgatgatatattcgg 42603624  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42603623 ttgatttcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagt 42603524  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42603523 gaatgataccctcccctcgtcgagcattggacgtttatacc 42603483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 696 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 41275649 - 41275423
Alignment:
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41275649 gtaagacaattattgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 41275550  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || ||||    
T  41275549 gtcacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctctcaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 41275450  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||    
T  41275449 cctcgtcgagcgtttgacgtttatacc 41275423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 387 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 40702925 - 40702390
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||  ||| | |||||       
T  40702925 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactttccaagcaacatgactccaatattcgaccgg-cattccca 40702827  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||   | || ||| || |||||| |  ||||||| |  ||| |||| ||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  40702826 atgtta--cattcaaaggattaaattctctttaggctgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaatacc 40702729  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  40702728 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaatta 40702631  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgac-gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 778  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||  | ||    || || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40702630 ccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctaaaatgtgcattcattccgtacctaatgaccgatcttttggcggaatcaaacttttgatgatatatt 40702533  T
Q  779 caattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccca 878  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  40702532 cagttgatctcagcaacgtcatccgcatatcgatccactggaacatgttttgttcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaccca 40702433  T
Q  879 agtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40702432 agtgaatgatattctcccttcgtcgaacgttggacgtttatac 40702390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 398 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 44050992 - 44050812
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44050992 ttccaactgccacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaagactcaagcatttcgctcgacattcatgttttcctttga 44050893  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaa 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44050892 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaa 44050812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Original strand, 19242160 - 19242347
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  19242160 ctaatgacaatcttctcgtagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtattcc 19242259  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19242260 caaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttccttaattacacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 19242347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Original strand, 19315344 - 19315531
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  19315344 ctaatgacaatcttctcgtagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtattcc 19315443  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19315444 caaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttccttaattacacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 19315531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 401 - 595
Target Start/End: Original strand, 41017413 - 41017608
Alignment:
Q  401 caactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaa 500  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  41017413 caactacaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaatcctgtcaaacaacaggactcgagcatttcacccagtattcatgttttccattgaaaa 41017512  T
Q  501 gaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtg-ccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41017513 gaataaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgtctaacgaaatgaggttcattccttgatacttaataccttcatctaaacca 41017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 673 - 922
Target Start/End: Original strand, 31171753 - 31172001
Alignment:
Q  673 gtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatga 772  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31171753 gtttgaattatctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccatacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgataa 31171851  T
Q  773 tatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattc 872  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  |||||| |  ||| ||| | ||||  |  |||| |||| |||||||    
T  31171852 tattttcagttgatctcagcaacgtcacccacatatcgatccacggtaacatgctgtgcttctgaaaaatgtttgtcatgtcgtcgtcgttcattaattc 31171951  T
Q  873 cacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31171952 cacccaactgaatgatattctcccatcgtcgaacgttggacgtttatacc 31172001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 24861575 - 24861900
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  24861575 ttccatctgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 24861674  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| || || || ||| ||||||||| |    
T  24861675 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcaattgaataccatcatctaaagc 24861771  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |  |||||| | ||||||| ||| |||| ||||    
T  24861772 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatggcgagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggaaggtttgaatttatctca-ttca 24861868  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24861869 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 24861900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 664 - 922
Target Start/End: Original strand, 3589192 - 3589451
Alignment:
Q  664 gtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag--gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaa 761  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3589192 gtttagcaagtttgaattatctcatttcagagaggtaagacaattgttgtagtttgaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaa 3589290  T
Q  762 acttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttg 861  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||| |    
T  3589291 actgttgataatgtcttcagttgatctcaacaatgttacacgcatatcgatccactggaacatcctgtgctcccaaaacatgcccatcacgttatcgtcg 3589390  T
Q  862 ttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||| | | | |||| ||||||||||||    
T  3589391 ttcattaattccacccaactgaatgatattctcccatagacaatcgtttgacgtttatacc 3589451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 22549311 - 22549636
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||    
T  22549311 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcaagcatttcgctcagcattcatgtttttcctttg 22549410  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  22549411 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagc 22549507  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || | |||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||| |    
T  22549508 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgtttgagtcct-gctgtttggcaagtttgaattgaccccattt-a 22549604  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22549605 aaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 22549636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 772 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 26484756 - 26484606
Alignment:
Q  772 atatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaatt 871  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  26484756 atatcttcagttgatctcagcaatgttatgcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaatt 26484657  T
Q  872 ccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26484656 ccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 26484606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 398 - 723
Target Start/End: Original strand, 26452557 - 26452881
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  26452557 ttccaactgcaacaattgtcatacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcaaacatttcgctcgacatttatgtttttcctttg 26452656  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||    ||| ||| ||| ||||| || | | ||||||||| |    
T  26452657 aaaagattaaattcttgttaggctag-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-gaaatggacctcatttcgttggcacttgaatatcatcatctaaagc 26452753  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | || | |  ||||| || ||||||| ||| |||| || |    
T  26452754 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcaagcgaaatgcttgagtcat-gttgtttgacaggtttgaatttatctca-ttaa 26452850  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 723  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26452851 aaggtaagacaattgttgcagttggaatgca 26452881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 42168942 - 42168615
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||    
T  42168942 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctt 42168844  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  42168843 tgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtggcaatg-aatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 42168747  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat-tacctcattt 690  Q
     | || ||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |  |||||||| |||||| | |||| || ||    
T  42168746 gcaagcctaccaaaaatttattattttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaagtttgactgtacccca-tt 42168649  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42168648 cgaaggtaggacaattgttgtagttggaatgcac 42168615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 398 - 652
Target Start/End: Original strand, 2417147 - 2417400
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  2417147 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaatt-aaacctgccaaacaataggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 2417245  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||      
T  2417246 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagt 2417342  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctt 652  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2417343 aagtctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaatatgaatgtcgagcgaaatgctt 2417400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 663 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 16575966 - 16575721
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16575966 cgtttggcaagtatgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatttccctgcctaatcacgaacttctggcggaatcaaa 16575869  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
    ||| ||  || ||            ||| |||| | || ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16575868 cttctggcgaaat------------tcaacaacattacgcgcgtatcgatgcactggaacatgttgtggtcccaaaacatgctcatcccgttttcgttgt 16575781  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||||||||||||| ||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16575780 tcgttaattccacccaactgaatgaaactctcctctcgtcgagcgttggacgtttatacc 16575721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 16576212 - 16575990
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcct 493  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    ||||| ||| ||||||| | |  | || || |     
T  16576212 accttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaacaatagctatcaagtatt-cacccgaaagttttattgtttca 16576114  T
Q  494 ttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    || |||||  |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  16576113 ttcaaaagtttaaattcttgttaggcttggtttaaatggtggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatttaaa 16576014  T
Q  593 ccagtctaacaataatttaatctt 616  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  16576013 ccagcctaacaagaatttaatctt 16575990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43637282 - 43637179
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  43637282 taccgtcattcaagatgctcatcgaatattggagtcctgcagtttagcaagtttgaatttgccactttcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 43637183  T
Q  341 gcat 344  Q
    ||||    
T  43637182 gcat 43637179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28167402 - 28167338
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28167402 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 28167338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 398 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 28706124 - 28705805
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaaca-tgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  28706124 ttccaactacaacaattgtcttacttgtgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggcaatgactcaagcatttcgcccaacgttcatgtttttcctt 28706026  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| || ||| || || ||||||||| |||||| || || ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  28706025 tgaaaagattaaattatttttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aaatgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 28705929  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttc 691  Q
     | || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| | |||| |  ||||| || |||||||||  | |  |||    
T  28705928 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacacgaatgtggggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttgacaagtttgaattttccccattc 28705830  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttg 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28705829 aaaggtaagacaattgttgtagttg 28705805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 398 - 651
Target Start/End: Original strand, 34615185 - 34615440
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacct-ttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||    
T  34615185 ttccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaa-ttcaaacttgacaaacgaccatgactcaagcatttcgcccaacgttcatgtttttcatt 34615283  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| |||||  || | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  34615284 tgaaaagattaaattcttgttatgc-tgatttagatgaaggtatt-aagtg-taaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 34615380  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 651  Q
     | || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34615381 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaagaaaaacatgaatgcggggcgaaatgct 34615440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 834 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 22548380 - 22548294
Alignment:
Q  834 ccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22548380 ccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcatttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttata 22548294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 724
Target Start/End: Original strand, 40415519 - 40415815
Alignment:
Q  427 aatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgct 524  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  | || ||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || | |    
T  40415519 aatggggtaa-ttcaaacttaccaaacggccataacttaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagactgg-t 40415616  T
Q  525 ttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaacca-gtctaacaataatttaatcttttcaa 621  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||| || | || |||| |||||| |||||||||    
T  40415617 ttagatgaaggtatt-aagtgtcaaagaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagccttacaaaaatttattcttttcaa 40415714  T
Q  622 aggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 721  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| || | |  ||   |||||||| |||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40415715 ag-aaaaacatgaatgccgagtgaaatgtttgagtgatgtt-gtttggcaggtttgaatttaccctattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 40415812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 398 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 2417525 - 2417429
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctt 494  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  2417525 ttccaactgccacaattgtcttacctttgaatgagataaattaaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgctcgacattcatattttcctt 2417429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 484776 - 484679
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  484776 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagttctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaggggtaagatgattgttgcagctggaag 484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28705644 - 28705555
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    ||||| |||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28705644 atgctgatcgaatattggagtcttgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaagggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 28705555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 459 - 711
Target Start/End: Original strand, 40414902 - 40415153
Alignment:
Q  459 gactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatga 557  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||    
T  40414902 gactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatga 40414998  T
Q  558 ggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaa 654  Q
       ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || |    
T  40414999 acctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgggtgaaatgattga 40415097  T
Q  655 atcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgt 711  Q
     |||| |  |||||||| |||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||    
T  40415098 gtcct-gttgtttggcaggtttgaatttaccctattcaaaggtaagacaattgttgt 40415153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 38033698 - 38033581
Alignment:
Q  606 aatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgag-cgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaa 704  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||   |||||| | |||||||||  ||   ||||||||||||||||    
T  38033698 aatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgc-gagacgaaatgtttgagtcctgtt-gtttggtaagtttgaatttactacattcaaaggtaagacaa 38033601  T
Q  705 ttgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38033600 ttgttgtagttggaatgcac 38033581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Original strand, 44050873 - 44050997
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | || |  ||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  44050873 ctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgagcgaaatgcttgagt-cttgttgtttgacaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 44050969  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  44050970 taagacaattgtggcagttggaatgcac 44050997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 334
Target Start/End: Original strand, 44051150 - 44051229
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  44051150 atgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttg 44051229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 333
Target Start/End: Original strand, 40703075 - 40703153
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagtt 333  Q
    |||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  40703075 atgctcattggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagtt 40703153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26487232 - 26487005
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc---atgtt 488  Q
    |||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||  ||  | |||||   |||||    
T  26487232 tgtaccttccaactgcaacatttatcttacctttgaattgggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgacagg-cattcccaatgtt 26487134  T
Q  489 ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcat 587  Q
      || || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||| ||||||||| || |||   |||||||| ||||| |||| |||| || ||||||||    
T  26487133 --ccattcaaaagattaaattattgttaggctaggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaataatgaggtccattctttgaaacttcaataccttcat 26487036  T
Q  588 ctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26487035 ttaaaccagcctaacaagaatttaatctttt 26487005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 28167482 - 28167579
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||||| |||| |  |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  28167482 taccatcatttaaaatgttcatcacatgctggagtcctactatttaacaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttagaag 28167579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 41275783 - 41275860
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  41275783 atcgaatactggagtcctgttggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 41275860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41856487 - 41856390
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || || ||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  41856487 taccatcattcaatatactcatcagatgctggagtcctgttgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 41856390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33776111 - 33776051
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33776111 ttagcaagtttaaatttgcaccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 33776051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 43693369 - 43693511
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatg-actcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| |||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  43693369 ttccaactacaacaattttcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggcaaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctt 43693467  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  43693468 tgaaaagattaaattcttgctaggc-tggtttagatgaaggtatt 43693511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 484833 - 484922
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  484833 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 484922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15031828 - 15031745
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  15031828 atgctgatcgaatactggggtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccacattcagtggtaagataattgttgcagctggaag 15031745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 485240 - 485101
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| |||||||    
T  485240 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttg 485143  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  485142 aaaatattaaatttttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 485101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 41856385 - 41856462
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  41856385 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaaattcaaacttgctaaacaacaggactccagcat 41856462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 338
Target Start/End: Original strand, 42604192 - 42604248
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  42604192 gtttagcaagtttgaatttgccccatttagtggtaagataattgttgcagttggaag 42604248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 16576435 - 16576308
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||  |||||||||||||| || |||||||| |||| |     
T  16576435 aaaagattaaattcttgttaggcttggtttatataatggtattcaagtgtcaaaagaacgaggtgaattccttgacacttgaataccttcatttaaatcg 16576336  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaag 623  Q
    | |||| || ||||||| ||||| ||||    
T  16576335 gcctaagaagaatttaaccttttaaaag 16576308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 344
Target Start/End: Original strand, 40415954 - 40416056
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||| | |||| ||  |||| |||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  40415954 taccatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttcc-caattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 40416052  T
Q  341 gcat 344  Q
    ||||    
T  40416053 gcat 40416056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 41275865 - 41275794
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41275865 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccaacaggactc 41275794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18439766 - 18439712
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  18439766 ttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgtagttggaag 18439712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 37780710 - 37780506
Alignment:
Q  385 gaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc- 483  Q
    |||||||| ||| | | |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||  ||| | |||||     
T  37780710 gaacgtttctacttcctaactacaaaaattgtgttacatttgaatggggtaaattcaaatttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgg-cattct 37780612  T
Q  484 --atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacac-ttaaca 580  Q
      |||||  || || ||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  37780611 caatgtt--ccattcaaaagaataaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacactttaata 37780514  T
Q  581 ccttcatc 588  Q
    ||||||||    
T  37780513 ccttcatc 37780506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42168465 - 42168379
Alignment:
Q  252 aaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||| |||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||  ||||| | || || | ||||||||||||||||||    
T  42168465 aaaatgctgatcgaatactagagtcttgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcggtggtaaaataattgttgcagttggaag 42168379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 22549875 - 22549806
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  22549875 taccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggaaagttcaaacttgctaaccaacatgactc 22549806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 664 - 719
Target Start/End: Original strand, 16576154 - 16576209
Alignment:
Q  664 gtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16576154 gtttggcaagtttgaatttacctcatt-caaaggtaagataattgttgtagttggaa 16576209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 661 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 26486964 - 26486847
Alignment:
Q  661 gccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagtt--ggaatgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaa 757  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |  |||||  | | || || ||||||||||||||||| |||||    
T  26486964 gccgtttgacaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagctaagagatgcattcattccgtacctaatgacgatcttctgacggaa 26486867  T
Q  758 tcaaacttttgatgatatct 777  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  26486866 tcaagctgttgatgatatct 26486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38033401 - 38033345
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38033401 gtttagcaagtttgaatttgcctccttcaagggtaagataattgttgcagttggaag 38033345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 15032284 - 15032234
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  15032284 cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 15032234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 18440009 - 18439951
Alignment:
Q  666 ttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18440009 ttggcaagtttgaatttacctcatt-caaagataagacaattgttgtagttggaaggcac 18439951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 38033340 - 38033411
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  38033340 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaaggaggcaaattcaaacttgctaaacaacaagactc 38033411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 41017440 - 41017405
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41017440 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 41017405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 43638659 - 43638553
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | | | |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  43638659 ttccaactacaataattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaatagccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctt 43638561  T
Q  495 tgaaaaga 502  Q
    ||||||||    
T  43638560 tgaaaaga 43638553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33799533 - 33799440
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt 490  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  33799533 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttt 33799440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 369
Target Start/End: Original strand, 19242120 - 19242173
Alignment:
Q  316 aagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  19242120 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattcggtacctaatgacaatctt 19242173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 369
Target Start/End: Original strand, 19315304 - 19315357
Alignment:
Q  316 aagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  19315304 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattcggtacctaatgacaatctt 19315357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 22549795 - 22549872
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || | |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  22549795 atcgaatactggagtcatgttggttagcaagtttgaactttccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 22549872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 28705559 - 28705612
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    ||||||||||| ||||||| || || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  28705559 accttccaactacaacaattgtcttgcccttgaatggggcaaattcaaacttgc 28705612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 17568 - 18102
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  17568 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacttttgaatggggtaaatttaaactttccaaacaacatgacttaagcatttcgcccggcattcatg 17667  T
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttca 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17668 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttca 17767  T
Q  587 tctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctc 686  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||| | |    
T  17768 tctaaaccagcctaacaagaatttaatttttccaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctaaccgtttggcaagtttgaattatccc 17867  T
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgat 786  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  17868 atttcagaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgat 17967  T
Q  787 ctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaatt 886  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  17968 ctcagcaacgttacccgcatatcgatccactataacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatg 18067  T
Q  887 ataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18068 atactctccc-tcgtcgagtgttggacgtttatacc 18102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17461 - 17364
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||    
T  17461 taccatcatttaaaatgctcatcgcatgctgcagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgtacttggaag 17364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 401 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 17897 - 17643
Alignment:
Q  401 caactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaa 498  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||    | |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||| |    
T  17897 caactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaacttgccaaacggttaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgga 17798  T
Q  499 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaacca- 595  Q
    || | |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||| ||     
T  17797 aaaattaaattcttgttaggctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaa 17701  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaa 654  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17700 gcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaa-catgaatgccgggcgaaatgcttaa 17643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 392 - 454
Target Start/End: Original strand, 17359 - 17421
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaca 454  Q
    |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17359 tgtaccttccaagtacaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaaca 17421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Original strand, 17483 - 17541
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatt 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  17483 taccatcattcaaaatgctcattgaatgctagattcctgccgtttaacaagtttgaatt 17541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 186)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 42571428 - 42571963
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  42571428 acgtttgtacctctcaactacaacaattgtgttacctttgaattgggtaaattcaaacttgccaaacaatatgactcaaacatttcgtccggcattcatg 42571527  T
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttca 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42571528 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttca 42571627  T
Q  587 tctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctc 686  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  42571628 tctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaatgaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgtttgagtcttggccgtttggcaagtttgaattacccc 42571727  T
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgat 786  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  42571728 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccttaagtaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgat 42571827  T
Q  787 ctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaatt 886  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  42571828 ctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatg 42571927  T
Q  887 ataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42571928 atactctcccctcgtcgagcattggacgtttatacc 42571963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 30309495 - 30310013
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30309495 ttccaactacaacaattgtcttacctgtgaatggggtaaattcaaacctgccaaacaacatgactcaagcatttcacccatcattcatgttttcctttga 30309594  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30309595 aaagaataaattattgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaataaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagt 30309694  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||    
T  30309695 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagtgaaatgcttgagtcctggccatttggcaagtttgaattaccccatttcggaggt 30309794  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||      |||    
T  30309795 aagataattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatattcagttgatct------cgt 30309888  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  30309889 cacccgcatatcgatccactgaaacgtcctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccc 30309988  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  30309989 ccgtcgagtgttggacgtttatacc 30310013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 39223861 - 39224384
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39223861 ttccaactacaacaattgtcttacatttgaatggg-taaattcaaacctgtcaaacaacatgactcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttga 39223959  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||     
T  39223960 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaaagaggttcattcctcgacacttaatatcttcatctaaaccagc 39224059  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  39224060 ctaacaagaatttaatcttttcaacggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggt 39224159  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  39224160 aagagaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatatttagttgatctcagcaacgt 39224259  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39224260 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattctttaattccacccaagtgaatgataccctcccc 39224359  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  39224360 tcgttgagcgttagacgtttatacc 39224384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 51270344 - 51269822
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51270344 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaagactcaaacatttcacccagcattcatgttttcctttga 51270245  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  51270244 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 51270145  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  51270144 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttagcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 51270047  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51270046 taagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatcccagcaacg 51269947  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| | || |||||    
T  51269946 tcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaactgaatgaaactctccc 51269847  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  51269846 ctcgtcgagcgttggacgtttatac 51269822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 12790925 - 12791460
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12790925 acgtttgtaccttccaactccaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaacttaccaaacaacaggactcaagaatttcgcccgacattcatg 12791024  T
Q  487 tttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12791025 tttttcctttgaaaagaataattttttgttaggattgctttagatgatggtatttaagtgccaatgaaatgaggttaattccttgacacttcaatacctt 12791124  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||   || | ||||||||| ||||||||||||    
T  12791125 catctaaaccagcctaaaaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaa-tgct-aaggacttgtcgtttggcaagtttgaattacc 12791222  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattg 784  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12791223 ccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttatcctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 12791322  T
Q  785 atctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaa 884  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12791323 atctcaaaaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccaaaaaaatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaa 12791422  T
Q  885 ttataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12791423 tgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 12791460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 47487699 - 47488224
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  47487699 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgtttttcctttg 47487798  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47487799 aaaagaataaatttttgttaagcttgctttagatgatggtattcaagtgccaatgaaatgaggttcattccttgacacttaataccctcatctaaaccag 47487898  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  47487899 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagagg 47487998  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47487999 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccataactaatgacgatcttctggcgaaatcaagctgttgatgacatcttcagttgatctcagcaacg 47488098  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | ||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||    
T  47488099 ttacccgcatatcgatcaactagaaaatattgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatattctccc 47488198  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  47488199 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 47488224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 399 - 922
Target Start/End: Original strand, 27486355 - 27486877
Alignment:
Q  399 tccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaa 498  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27486355 tccaactccaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacagaactcaagcatttcgctcgacattcatgttttcctttgaa 27486454  T
Q  499 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27486455 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcc 27486554  T
Q  599 taacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggt 697  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || |  |||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||    
T  27486555 tagcaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcggaatgcttgagttct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttaaaaggt 27486652  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27486653 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttcaggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 27486752  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||     
T  27486753 cacccgcatatcgatccaatggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaattaaactctcccc 27486852  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27486853 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 27486877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 401 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 49427925 - 49427406
Alignment:
Q  401 caactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaa 500  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  49427925 caactccaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcccccggcattcatgttttcctttgaaaa 49427826  T
Q  501 gaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtcta 600  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  49427825 taataaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagccta 49427726  T
Q  601 acaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaa 699  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  49427725 acaagaatttaatcttttcaaacgaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg-aa 49427629  T
Q  700 gacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtca 799  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  49427628 gacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttca 49427529  T
Q  800 cccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatc 899  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||    
T  49427528 cccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccgcccaagtgaatgatactctcccctc 49427429  T
Q  900 gtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  49427428 gtcgagcgttggacatttatacc 49427406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 27034980 - 27035505
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27034980 ttccaactacaataattgtcttacctttgaaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttg 27035079  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27035080 aaaagaataaatttttgttaggcttgcattagatgatagtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacacttaatacctttatttaaaccag 27035179  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
     |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  27035180 cctaaaaagaatttaatttgttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgtttgagtcctggctgtttggcaagtttgaattaccccatttcagagg 27035279  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27035280 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttatcctaactaatgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttaagttgatctcagcaacg 27035379  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27035380 ttacccgcatatcgatccactggaatatggtgttctcccaaaacatactcgtcacgttttcgtcattctttaactccacccaagtgaatgatacccttcc 27035479  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  27035480 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 27035505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 48568068 - 48568591
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48568068 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggcaaattcaaacttgtgaaacaacatgaatcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttga 48568167  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  48568168 aaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagttccaacgaaacgaggttcattc-ttgacacttaataccttcagctaaatcagc 48568266  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||| ||||    
T  48568267 caaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgctgagcgaaatgcttgaatcctggccatttggcaagtttgagttacccaatttcagaggt 48568366  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48568367 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacaatcttctggcgaaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 48568466  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||     
T  48568467 tacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcattctttaactccacccaagtgaatgatattctcccc 48568566  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48568567 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 48568591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 392 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 3659022 - 3658492
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt- 490  Q
    ||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  3659022 tgtacattacaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgcccgacattcatgttttt 3658923  T
Q  491 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatct 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3658922 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgccttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttcaataccttcatct 3658823  T
Q  590 aaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatt 689  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || |   || | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3658822 aaaccatcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcg-aatg-ttgaggacttgtcgtttggcaagtttgaattaccccatt 3658725  T
Q  690 tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctc 789  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3658724 tcagaggtaagacgattgttgtagttggaatgcaccttaccctacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 3658625  T
Q  790 agcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattata 889  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3658624 agcaacgttacttgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacacgttcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgata 3658525  T
Q  890 ccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3658524 ctctctcctcgtcgagcgttggacgtttatacc 3658492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 401 - 919
Target Start/End: Original strand, 46179945 - 46180465
Alignment:
Q  401 caactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaa 499  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| ||||| |||||||||    
T  46179945 caactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaactggccaaacaacatgactcaagcatttcgccccgcgttcacgtttttcctttgaaa 46180044  T
Q  500 agaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtct 599  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |    
T  46180045 ataatgaatttttgttaggcttactttagttgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaatactttcatctaaaccagcat 46180144  T
Q  600 aacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaa 699  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46180145 aacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaa 46180244  T
Q  700 gacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtca 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  46180245 gacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaagctgttgatgatatcttcaattgatctcaacaacgtta 46180344  T
Q  800 cccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccca-agtgaattataccctcccat 898  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |    
T  46180345 cccacatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccagagtgaatgatactctcccct 46180444  T
Q  899 cgtcgagcgttggacgtttat 919  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46180445 cgtcgagcgttggacgtttat 46180465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 45689663 - 45689144
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  45689663 ttcctactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgtttttcctttg 45689564  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45689563 aaaaaaataaatttttgttcggtttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 45689464  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||    
T  45689463 cataacaagaatttaatcttttcgaaggaaaaacatgaacgttgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattatccaatttcagagg 45689364  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45689363 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 45689264  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  45689263 tcacccgcatatccatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctccc 45689164  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtt 916  Q
      ||||||||||||||||||    
T  45689163 cccgtcgagcgttggacgtt 45689144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 29436515 - 29435992
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29436515 ttccaactacaacaattgttttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaataacaggactcaagcatttcgctcgacattcatgttttcctttga 29436416  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  29436415 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattcctagacacttaataccttcatctaaaccagc 29436316  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || | |  |||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||    
T  29436315 ctgacaagaatttaatcttttcaatggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcat-gttgtttggcaggtttgaatttatttca-ttcaaagg 29436218  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29436217 taagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcttaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 29436118  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29436117 tcacccgcgtatcgatccactggaacatgctgtactcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 29436018  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29436017 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 29435992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 41874548 - 41875071
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41874548 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggagcaaattcaaacttgctaaacaacatgactcaagcatttcactcggcattcatgttttcctttga 41874647  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||      
T  41874648 aaagaataaatctttgttaggcttgctttagacgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacacttaataccttcgtctaaatcatc 41874747  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  41874748 ctaacaa-aatttattcttttcaaaggaaaaacacgaatgctgagcaaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggt 41874846  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  | |||||||||| | |||||||||||||| |    
T  41874847 aagacaattgttgtagtttgaatgcaccttaccctaactaataacgatcttctggcggaatcaagttgctaatgatatctttagttgatctcagcaacat 41874946  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||     
T  41874947 tacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttatttaactccacccaagtgaatgatactctcccc 41875046  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||||| ||||||||| |||||    
T  41875047 tcttcgagcattggacgttgatacc 41875071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 44336983 - 44337506
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44336983 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgagtcacgcatttcgcccggcattcatgttttcctttga 44337082  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  44337083 aaagaataaatttttgttaggtgtgctttagataatggtattcaattgccaatgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccaac 44337182  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  44337183 ctaacaagaatttagtattttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 44337280  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44337281 taagacaattgttgcatttgaaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcatattgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 44337380  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||| | || |||||    
T  44337381 tcacccgcatatcgatccactgaaacatgttgtgcacccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgtgaattccacccaagtgaatgaaactctccc 44337480  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  44337481 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 44337506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 415 - 922
Target Start/End: Original strand, 13634979 - 13635484
Alignment:
Q  415 gtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgt 514  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13634979 gtgttacctttgaatgagataaattcaaacctgcaaaacaatagggctcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgt 13635078  T
Q  515 taggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatc 614  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13635079 taggcgtgctttagacgttggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttcacgcctaataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatc 13635178  T
Q  615 ttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtag 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||| |||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  13635179 ttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcct-gttgtttggcaggtttaaattgatctca-ttcaaagg-aagacaattgttgtgg 13635275  T
Q  714 ttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatc 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  13635276 ttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatc 13635375  T
Q  814 cactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggac 913  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13635376 cactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggac 13635475  T
Q  914 gtttatacc 922  Q
    |||||||||    
T  13635476 gtttatacc 13635484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 50067921 - 50068446
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcc-tttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||| | ||||    
T  50067921 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcattttgcccctcattcatgtttttcatttg 50068020  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  50068021 aaaagaataaatttttgttaagcttgcattagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatcaaaactag 50068120  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| | || |||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||     
T  50068121 cataacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaacgatgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgcattaccccatttcagagc 50068220  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  50068221 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttactctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgacgatatcttcagttgatctcagcaacg 50068320  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||     
T  50068321 ttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgttcgtcacatttttgtcgttctttaaatccacccaagtgaatgatactctcca 50068420  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||| ||||||| || |||||    
T  50068421 ctcgtcgagtgttggaccttcatacc 50068446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 436 - 922
Target Start/End: Original strand, 29761924 - 29762408
Alignment:
Q  436 aattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgg 535  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29761924 aattcaagcctgccaaacaacaggactcaagcatttcgctcgacattcatattttcctttgaaaataatacatttttgttaggcttgctttagatgatgg 29762023  T
Q  536 tattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaa 635  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29762024 tattcaagtgccaatgaa-tgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaa 29762122  T
Q  636 tgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaa 734  Q
    | ||||||||||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29762123 ttccgagcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaa 29762220  T
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29762221 ctaatgatgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatattttcagttgatctcatcaacgtcacccgtatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 29762320  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29762321 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 29762408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 398 - 815
Target Start/End: Original strand, 29707201 - 29707621
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29707201 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgctaaacaacatgactcaagcatttcacccgccattcatgttttcgtttga 29707300  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29707301 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatttaattgccaacggaatgaagttcattccttgacacttaatacattcatctaaaccagt 29707400  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  29707401 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgaccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggt 29707500  T
Q  698 ---aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaa 794  Q
       ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  29707501 aagaagacaattgttgcagttgtaatgcaccttgccctaacttatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaa 29707600  T
Q  795 cgtcacccgcatatcgatcca 815  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29707601 cgtcacccgcatatcgatcca 29707621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 49262659 - 49263175
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcc-tttg 496  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  49262659 ttccaactacaagaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgttttccctttg 49262758  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||            
T  49262759 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatca------- 49262851  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  49262852 --taacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgctggagtcatggccgtttggcaagtttgaatcaccccatttcagagg 49262949  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49262950 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccataactaatgaagatattctagaggaatcaagatgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacg 49263049  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  49263050 ttaccagcatatagatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcttttgttaattccactcaagtgaatgatactctccc 49263149  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  49263150 ctcgttgagcgttggacgtttatacc 49263175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 19160859 - 19160336
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcct-tt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||   || ||||||||||||  ||    
T  19160859 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccgagcacttcatgttttcccgtt 19160760  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19160759 gaaaagaataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 19160660  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  19160659 gcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgctcgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaag 19160562  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19160561 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctaagcaac 19160463  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19160462 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgttcccaaaacatagtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 19160363  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||    
T  19160362 ccttgtcaagcgttggacgtttatacc 19160336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 364 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 18170603 - 18170044
Alignment:
Q  364 gatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18170603 gatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaagactc 18170504  T
Q  464 aagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttc 562  Q
    || |||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18170503 aaacatttcgcccggcgttcttgcttttcctttgaaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttc 18170404  T
Q  563 attccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctgg 661  Q
    ||| | |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| |||||   |   || |    
T  18170403 atttcatgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcctttcaaagaaaaaacatgaatgttgggcg-aatgc-ggaggacttg 18170306  T
Q  662 ccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 758  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| | || ||| || ||||  ||| |||||||||  ||||  | | |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  18170305 tcgtttggcaagtttgaattacctca-tccagagg-aacacaaaagttttagttggaaggtgcatgcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaat 18170208  T
Q  759 caaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcg 858  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18170207 caaacctttgatgatatcttcagttgagctcagcaatgtcacccgcatatcgatctactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 18170108  T
Q  859 ttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18170107 tcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttatacc 18170044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 418 - 922
Target Start/End: Original strand, 49598573 - 49599061
Alignment:
Q  418 ttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttc-ctttgaaaagaataaatttttgtta 516  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  49598573 ttacctttgaatgaggtaaattcaaactggccaaacaacatgactcaagcatttcgccccgcgtttatgttttttctttgaaaggaataaatttttgtta 49598672  T
Q  517 ggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatctt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  49598673 ggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttaacacttaataccttcatttaaaccagcataacaagaatttaatctt 49598772  T
Q  617 ttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttg 716  Q
    ||||||||||||||||||| |  | || |||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  49598773 ttcaaaggaaaaacatgaacgatgggcaaaatccttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattacccgatttcagaggtaagacgattgttgtagttg 49598872  T
Q  717 gaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccac 816  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49598873 gaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaa---gttg-------------ttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccac 49598956  T
Q  817 tgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtt 916  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  49598957 tggaacatgttgtgctcccaaaacatgcttgtcac-gtttcgtcattctttaactccactcaagtgaatgatactctcccctcgtcgagtgttgaacgtt 49599055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 544 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 44598097 - 44597720
Alignment:
Q  544 tgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagc 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44598097 tgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagc 44597998  T
Q  644 gaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac 742  Q
    |||||||  || |||||   |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44597997 gaaatgcaaaagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcactttaccctaactaatgac 44597900  T
Q  743 gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacat 842  Q
    ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  44597899 gatcttccggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcatcaacgtcacccacatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacat 44597800  T
Q  843 gctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44597799 actcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 44597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 598 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 35576682 - 35576358
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  35576682 ctaacaagaatttaatattttcaaagggaaaacatgaacgctaggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattacctcatttcagaggt 35576583  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35576582 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 35576483  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  35576482 cacccgcatatcgatccaccggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccc 35576383  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  35576382 tcatcgagcgttggacgtttatacc 35576358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 387 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 36910114 - 36909584
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattcat 485  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  || |||   ||||||||      
T  36910114 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaaattgccaagcagcaggactcca--atgttcgatcgacattcca 36910017  T
Q  486 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
       |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  36910016 tagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgacagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 36909917  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctta-aatcctggccgtttggcatgtttgaattac 683  Q
    ||| |||||| | |||| || ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  ||||   |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36909916 catttaaaccggcctaataagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaac--cttggaatcctg-ccgtttggcaagtttgaattac 36909820  T
Q  684 ctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 780  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||  | | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909819 cccatt-caaagg-aagacaactgttgtagctggaaggtgcattcattctgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 36909722  T
Q  781 attgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaag 880  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36909721 gttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaag 36909622  T
Q  881 tgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgttta 918  Q
    ||||| || | || || |||||||||||||||||||||    
T  36909621 tgaatgatgctcttccctcgtcgagcgttggacgttta 36909584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 14173410 - 14173945
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattcat 485  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |  || |||  ||| |||||      
T  14173410 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgcagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactcca--atgttcgaccggcattccc 14173507  T
Q  486 gtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacct 583  Q
     |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  14173508 atagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacct 14173607  T
Q  584 tcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaa-tcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    |||| ||||||   ||||||| ||||||||||||| | | ||| ||    |||||||   |||    ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14173608 tcatttaaaccgacctaacaagaatttaatcttttgacatgaacaatggaaatgccggttgaaca--ttagagtcctg-ccgtttggcaagtttgaatta 14173704  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173705 ccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcataccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 14173802  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14173803 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtcctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 14173902  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14173903 gtgaatgatattctcccctcatcgagcgttggacgtttatacc 14173945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 398 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 22528049 - 22527680
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||| |||    
T  22528049 ttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacctgcaaaacaacaagactcaagaatttcgccaaacacttcatgttttcccttt 22527950  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22527949 gaaaagaataaatttttgttagtcttgctttagttgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 22527850  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||| |  ||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  22527849 gcataacaagaattttatattttcaaaggagaaacatgatgtgcttgcgaaatgctcgagtcct-gttgtttgacaagtttgaattacccca-ttcaaag 22527752  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttg 768  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22527751 g-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgatgatcttctggcgaaatcaaacttttg 22527680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 389 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 13973476 - 13972944
Alignment:
Q  389 gtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc---at 485  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||  ||| |||||||   ||    
T  13973476 gtttgtaccttccaactacaacaattgttttacctttgaatgtagtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgacc-gacattcccaat 13973378  T
Q  486 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    |||  || || |||||| |||||| ||||||| || |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  13973377 gtt--ccattcaaaagattaaattcttgttagtctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 13973280  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13973279 catttaaatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaattacc 13973182  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13973181 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 13973084  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13973083 ttgatctcagcaatgtcacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagt 13972984  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  13972983 gaatgatactctcccctagtcgagtgttggacgtttatac 13972944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 663 - 922
Target Start/End: Original strand, 21484573 - 21484830
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  21484573 cgtttggcaagtttgaattaccatatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctacctaatgacgatcttctggtgaaatcaaa 21484670  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21484671 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccaaaaacatgctcgtcacattttcgtcgt 21484770  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21484771 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 21484830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 389 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 37778631 - 37778109
Alignment:
Q  389 gtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc---at 485  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||   ||| |||||||   ||    
T  37778631 gtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgacc-gacattcccaat 37778533  T
Q  486 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    |||  || || |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37778532 gtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaatacctt 37778435  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
     ||||||||||  ||||||  || |||||||||| || |||| || | ||||| ||  |||| |  |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37778434 aatctaaaccatcctaacatgaacttaatcttttgaatggaacaataggaatgtcggtcgaa-tattggaatcctg-ccgtttggcaagtttgaattacc 37778337  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
     |||| || ||| |||| |||||||||||  ||||  ||||  | | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37778336 ccatt-cagagg-aagaaaattgttgtaggcggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 37778239  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  37778238 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcaactggaacatgttgttctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtcctttaattccacccaagt 37778139  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttgg 911  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  37778138 gaatgatactctcccctcgtcaagcgttgg 37778109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 402 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 48227076 - 48226831
Alignment:
Q  402 aactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaag 501  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48227076 aactccaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactccaacatttcacccggcattcatgttttcctttgaaaag 48226977  T
Q  502 aataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaa 601  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  48226976 aataaatttttgttagacgtgctttaaatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaactagcctaa 48226877  T
Q  602 caataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaa 647  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48226876 caagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaa 48226831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 696 - 922
Target Start/End: Original strand, 39856867 - 39857093
Alignment:
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39856867 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 39856966  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  39856967 gtcacccgcatatcgatccactggaacatgtcgtgctcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtggatgatactctcc 39857066  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||    
T  39857067 cctcgtcgagcattggacgtttatacc 39857093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 17686010 - 17686548
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |  |  |||  ||||  |    
T  17686010 acgtttgcaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcatcaggactccagcgta-cgtccggtattcccg 17686108  T
Q  487 tt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    || |||| || |||||| |||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  17686109 ttgttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggattaaatgatggtattcaagtgtcaaaaaaatgaggtgcattccttgaaacttcaatacctt 17686208  T
Q  585 catctaaacca---gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt 681  Q
    ||||||||  |   | ||||||  |||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||  || | ||||  | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  17686209 catctaaattacacgcctaacatgaatttattcttttaaaaggaacaacgggaatgccggacgta-tgctggagtcctg-ccgtttggcaagtttgaatt 17686306  T
Q  682 acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 778  Q
    |||  ||  || ||| || ||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17686307 accctatc-cagagg-aacacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcgatacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 17686404  T
Q  779 caattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccca 878  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||| |||||    
T  17686405 cagttgatctcagctacgtcacccgcatatcgatccactggaagatgttgtgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcattcgttaattcaaccca 17686504  T
Q  879 agtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17686505 agtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 17686548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 558 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 17697426 - 17697065
Alignment:
Q  558 ggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaat 656  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| || | ||      
T  17697426 ggttcattccttgacacttcaataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaagaaaaaacatgaatcatgagcgaa-tgatgaaga 17697328  T
Q  657 cctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcgga 756  Q
    | || | ||||| || |||||||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||| |  | || || || ||||| ||||||||||||||||    
T  17697327 cttgtc-gtttgacaagtttgaattacccccatttaaagg-aagacaactgttgtagttggaaggtgcatt-ccttacctaatcacgatcttctggcgga 17697231  T
Q  757 atcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacatttt 856  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17697230 atcagactcttgataatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttt 17697131  T
Q  857 cgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| |||||||||||||||    
T  17697130 cgtcgtactttaactccacccaagtgaatgataccctacccttgtcgagcattggacgtttatacc 17697065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 6436326 - 6435791
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||| |  |||  ||| | |||||       
T  6436326 acgtttgtacctcccaactacaacaattgttttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagtaggaggactctaaaattcgaccgg-cattccca 6436228  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    ||||||  | || | |||| |||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||| || | |    
T  6436227 atgttt--cattcataagattaaatttttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgccaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatatc 6436130  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| | |  || ||    | || ||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  6436129 ttcatttaaaccagcctaataagaatttaatcttttgacataaacaatggaattgtcggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaatta 6436032  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436031 cctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 6435934  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6435933 acttgatctcaacaacgtcactcacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacttgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 6435834  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6435833 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 6435791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 370 - 922
Target Start/End: Original strand, 35586567 - 35587116
Alignment:
Q  370 ttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |  || ||||| |  ||    
T  35586567 ttggacgtttatatcaaacgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggagtaaatttaaatttgtcaagctgcaggactcca--at 35586664  T
Q  470 -ttcacccgacattcatgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc 567  Q
     |||  |||||||||   |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||  | |||   |||||||| |||||     
T  35586665 gttcgaccgacattcccatagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaaaagtcaaaagaatgaggtccattca 35586764  T
Q  568 ttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgt 665  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| ||  |  | |  | | |||    
T  35586765 ttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaacttaatcttttgacaggaacaatgagaatgccggtcgaacat--tggagt--ttgtcgt 35586860  T
Q  666 ttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||  ||||  | | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35586861 ttggcaagtttgaattaccccatt-caaaggaaa--caactgttgtagttgaaaggtgcattcattccgta-ctaatgacgatcttctggcggaatcaaa 35586956  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  35586957 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaaggtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgt 35587056  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35587057 ttgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 35587116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 24270017 - 24270550
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||   ||| | |||||       
T  24270017 acgtttgtaccttccaactacaccaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccgg-cattccca 24270115  T
Q  487 tt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  24270116 tagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgactgtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcattgacatttcaatacctt 24270215  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||  | ||    ||  |  |  ||  ||||||| ||||||||||||    
T  24270216 catttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatgggaatgccggtcaaaca--ttgga--cgtgctatttggcaagtttgaattacc 24270311  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
     |||| || ||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24270312 ccatt-cagagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctattgatgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 24270409  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24270410 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcctaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagt 24270509  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24270510 gaatgatactctcccctcatcgagtgttggacgtttatacc 24270550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 23343194 - 23342660
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacatt-cat 485  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||   ||| |||||| |      
T  23343194 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcacgactccaatatacgacc-gacatttcca 23343096  T
Q  486 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
     | |||| || |||| | |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || | |||    
T  23343095 atgttccattaaaaa-attaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaggtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatatctt 23342997  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||| |||| | | ||||||| | ||||||||||| | | ||||||   ||||||||  |||| |  |  | || || |||||||||| ||||||||||||    
T  23342996 catttaaatcggcctaacaagactttaatcttttgacaagaaaaatgggaatgccggtcgaa-tattgtagtcatg-ccgtttggcaagtttgaattacc 23342899  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23342898 -caattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggaggaatcaaacttttgatgatatcttcag 23342801  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  23342800 tttatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactcgaacataatgtgctccaaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattcaacccaagt 23342701  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23342700 gaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 23342660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 392 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 17373273 - 17372746
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt- 490  Q
    |||||||||||||| ||| ||| || | |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||| |  | ||||||  | ||||     
T  17373273 tgtaccttccaactacaataattgtctaacccctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatt-cgtctgacatttctattttt 17373175  T
Q  491 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatct 589  Q
    || ||  ||||| |||||| ||||||| |||  |||| || ||| |||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |    
T  17373174 ccattcgaaagattaaattcttgttagacttcgtttaaataatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacacttcaataccttcattt 17373075  T
Q  590 aaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatt 689  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||    |||| || ||||| || || | ||||| ||||||  || |||||||||||||||||    
T  17373074 aaaccagcctaacaagaatttaatcttgtgaaaggaacaattgaaatgtcgggcgaa-tgtttgagtcctg-ccgtttaacaagtttgaattacctcatt 17372977  T
Q  690 tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctc 789  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |  | || || || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17372976 -caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatttccatacctaatgacgatcttctggcgaaattaaactttcgatgatatcttcagttgatctc 17372879  T
Q  790 agcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattata 889  Q
    | |||||| || || |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  17372878 atcaacgttacacgtatatcgatccactggaatatggtgtgctcccaaaacatgttcttcacattttcgtcgttcgctaattccacctaagtggattata 17372779  T
Q  890 ccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17372778 ttctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 17372746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 663 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 49396983 - 49396723
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatc 759  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||    
T  49396983 cgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccatacctaatgacgatcttctggcggaatc 49396886  T
Q  760 aaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgt 859  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49396885 aaacttttgttgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgt 49396786  T
Q  860 tgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  49396785 tgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtaaatcgttggacgtttatacc 49396723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Original strand, 38046434 - 38046621
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  38046434 ctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccggcatattgatcgactggaacatgttgtgctcc 38046533  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38046534 caaaacatgcttgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 38046621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Original strand, 49926380 - 49926567
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  49926380 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 49926479  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49926480 caaaacatgctcctcacgttttcgtcgttcgttaattccgcacaagtgaatgacactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 49926567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 497 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 5765645 - 5765225
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  5765645 aaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactttaataccttcatctaaatca 5765546  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    | |||| |  ||||||||||||| || |||| || |  | ||||| | ||| || |||    ||||| ||||  || |||||||||   ||||||||  |    
T  5765545 gcctaaaagaaatttaatcttttgaatggaacaatagaactgccgggtgaa-tgtttaggaactggc-gtttaacaagtttgaattt--tcatttcag-g 5765451  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
     ||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5765450 ataagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagacggttgataatatcttcatttgatctcagcaac 5765352  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| |||  |||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||  || |    
T  5765351 gttacccgcatatcgatccactagaacatgttctgctcccaaaacatgctcatcaagtttttgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatattcttc 5765252  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5765251 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 5765225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 661 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 35185252 - 35184989
Alignment:
Q  661 gccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaa 757  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  35185252 gccgtttgacaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgcacctaatgacgatcttctggcggaa 35185155  T
Q  758 tcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgct-cccaaaacatgctcgtcacatttt 856  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  35185154 tcaaacttttgatgatatcttcaattgatttcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgccgtgctccccaaaacatgttcgtcacgtttt 35185055  T
Q  857 cgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| |||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35185054 cgtcgttcgttaattccatcaaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 35184989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 730 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 48215409 - 48215217
Alignment:
Q  730 cctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgt 829  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  48215409 cctaactaatgactatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgt 48215310  T
Q  830 gctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48215309 gctccaaaaatatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 48215217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 392 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 13284250 - 13283724
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-tt 490  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||  |  ||| |||||   || ||    
T  13284250 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcatcactcaaatatc-cgtccggcattctcattgtt 13284152  T
Q  491 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatct 589  Q
    || || |||||| | | || || || |||||| |||| |||||||||||||| || |||   ||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||    
T  13284151 ccattcaaaagattcagttatttttgggcttggtttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcatttccttgacacttcaataccttcatct 13284052  T
Q  590 aaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatt 689  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||   ||||| ||  ||||    ||  |  || ||| |||  || |||||||||||| ||||    
T  13284051 aaaccagtctaacaagaatttaatcgtttgaaaggaacaatgggaatgtcggacgaata--ttcgagtcttgccatttaacaagtttgaattaccccatt 13283954  T
Q  690 tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctc 789  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |  | || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  13283953 -caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ctctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatattcagttgatctc 13283857  T
Q  790 agcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattata 889  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||| ||||||| | ||| |||    
T  13283856 agcaacgttacctgcatatcgatccactagaacatgctgcgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcatcgttcgttaatttcacccaactaaatgata 13283757  T
Q  890 ccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13283756 ctctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 13283724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 747 - 922
Target Start/End: Original strand, 35526189 - 35526364
Alignment:
Q  747 ttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctc 846  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  35526189 ttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgcaacattctgtgctcccaaaacatggtc 35526288  T
Q  847 gtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| | ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  35526289 gtctcgttttcgacgttcgttaattccacccaggtgaatgatactctctcctcgtcgagcgttggacgtttatacc 35526364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 394 - 922
Target Start/End: Original strand, 24363471 - 24363987
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcc 492  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||| |  |||||||||   || || |    
T  24363471 taccttccaactacaacaattgtcttatctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggacacaaatatt-cgtccgacattcccattgtttc 24363569  T
Q  493 tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgcttt-agatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatcta 590  Q
     || |||||| |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  24363570 attcaaaagattaaattattgttaggcttggttttaaatgatggtattgacgtgtcaacagaatgaggtgcattccttaacacttcaataccttcattta 24363669  T
Q  591 aaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcattt 690  Q
     ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| ||   ||||| || ||||| |  || | ||            || |||||||||||||||||     
T  24363670 taccagcctcacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatgggaatgtcgggcgaa-tatttgagtcaa----------caagtttgaattacctcatt- 24363757  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctca 790  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  24363758 caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctaacggaatcaaactcttgataatatcttcagttgctctca 24363855  T
Q  791 gcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattatac 890  Q
     |||||| | |||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| | |||     
T  24363856 acaacgttaaccgcatatcgatccactagaacatactgtgcccccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcattaattctacccaagtgattgatat 24363955  T
Q  891 cctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24363956 tctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 24363987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 421 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 41781213 - 41780712
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc---atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttag 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||   ||| |||||||   |||||  || || |||||| |||||| || |||     
T  41781213 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgacc-gacattcccaatgtt--ccattcaaaagattaaattcttattaa 41781117  T
Q  518 gcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatctt 616  Q
    ||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  41781116 gctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatctt 41781017  T
Q  617 ttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttg 716  Q
    || | | ||| ||   |||||| |   ||| |  |  | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  41781016 ttgacaagaacaatgggaatgctggttgaa-tattggagtcctg-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctg 41780921  T
Q  717 gaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatc 813  Q
     ||  ||||  | | || || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  41780920 caaggtgcattcattccgtacctaatgacgaacttctggcgaaatcaaacttttgatgatatattcagttgatcttagcaacgtcacctgcatatctatc 41780821  T
Q  814 cactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggac 913  Q
     |||| |||||  ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||   |||  ||||||||||||||||    
T  41780820 tactggaacatgctgtgctcccaaaatatattcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattatcctctcgtcgagcgttggac 41780721  T
Q  914 gtttatacc 922  Q
    |||||||||    
T  41780720 gtttatacc 41780712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 729 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 18842651 - 18842458
Alignment:
Q  729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttg 828  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |    
T  18842651 ccctacctaatcccgatcttctggcgggatcagactcttgacaatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgccg 18842552  T
Q  829 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||  || || || ||||||||||||||||||||||    
T  18842551 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattcttccctcatcgagcgttggacgtttatacc 18842458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 395 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 17697566 - 17697424
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcct 493  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  17697566 accttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatgggataaattcaaactcgccaaacaacatgactcaagcatttcgcccgacatttatgtttttcct 17697467  T
Q  494 ttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17697466 ttgaaaagaataaatttttgttagtcttgctttagatgatggt 17697424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 51270024 - 51270349
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  51270024 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgctaaacaacaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 51270123  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  51270124 aaaagattaaattattgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagc 51270220  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || | | || |  |||||||| ||||||||| ||| || ||||    
T  51270221 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgctgggtgaaatgtttgagt-cttgttgtttggcaagtttgaattgacccca-ttca 51270317  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51270318 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 51270349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 400 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 18842994 - 18842767
Alignment:
Q  400 ccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcctttgaa 498  Q
    |||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||  | || |||| || ||    
T  18842994 ccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacatctctcaagca-ttcacccgacatttctattgttccattcaa 18842896  T
Q  499 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    || | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||     
T  18842895 aatattaaattcttgttaggcttggtttagataatggtattcaagtgtcacaagaatgaggtgcattctttgacacttcaatacctttatctaaaccagc 18842796  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18842795 ctaacaagaatttaatcttttgaaaggaa 18842767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 47488021 - 47487694
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||    
T  47488021 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctt 47487923  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  47487922 tgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgagggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcattggcacttgaataccatcatctaaa 47487826  T
Q  593 ccagtct-aacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcattt 690  Q
     ||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |  |||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  47487825 gcaagcttaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaagtttgaatttacccca-tt 47487728  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47487727 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 47487694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 29436195 - 29436520
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| |||||||  | |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||    
T  29436195 ttccaactgcaacaattttcttacctttgaatgaaataaattcaaacctgccaaacaacatgactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttccattg 29436294  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| |||| |||| || ||||||||| |||||| ||||| | | | |||||   ||| ||| ||| || || || ||| ||||||||| |    
T  29436295 aaaagattaaattcttgtcaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcta-ggaatgaacctcatttcgttggcaattgaataccatcatctaaagc 29436391  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |   ||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  29436392 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgagcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaggtttgaatttatctca-ttca 29436488  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29436489 aaggtaaaacaattgttgtagttggaatgcac 29436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 407 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 44337294 - 44336978
Alignment:
Q  407 caacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaata 505  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  44337294 caacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcaagcatttcgctcgacattcatgtttttcctttgaaaatacta 44337195  T
Q  506 aatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaacca-gtctaac 602  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| || || || ||| | ||||||| ||   |||||    
T  44337194 aattcttgttagg-ttggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcattggcaattgaataccattatctaaagcacacctaac 44337098  T
Q  603 aataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaaga 701  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | || | |  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  44337097 aaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggcgaaatgcgtgactcat-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaaga 44337001  T
Q  702 caattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  44337000 caattgttgcagttggaatgcac 44336978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 241 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18170873 - 18170669
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |  |||| ||||||||||||  ||| |||||  |  |||||||||||||| |||||||| |    
T  18170873 taccatcatttaagatgttcatcgaatgctggagtccttccatttaacaagtttgaattacctc-attcaaaga-aagacaattgttgctgttggaaggt 18170776  T
Q  341 gcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattc 440  Q
    |||||||||     |||      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18170775 gcattcatt-----cctt-----gatcttttggacgtttatactgaacgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattc 18170686  T
Q  441 aaacttgccaaacaaca 457  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18170685 aaactggccaaacaaca 18170669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 398 - 721
Target Start/End: Original strand, 3658695 - 3659018
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgac-tcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  3658695 ttccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgacaagtcctcaa-catt-cgcccgacattcatgtttttcctt 3658791  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||||| | | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||     
T  3658792 tgaaaagattaaattcttgttaggatgg-tttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaag 3658889  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcattt 690  Q
     || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |  |||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  3658890 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaagtttgaatttacccca-tt 3658987  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3658988 caaaggtaagacaattgttgtagttgtaatg 3659018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 497 - 920
Target Start/End: Original strand, 16531856 - 16532275
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  16531856 aaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaaacta 16531955  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    | |||| |  ||||||||||||| || |||| || |  | ||| | | |||| | ||     ||||  ||||  || ||||||||| ||  ||||||  |    
T  16531956 gcctaaaatgaatttaatcttttgaatggaacaatagaactgctgggtgaaaagtttgggaactggt-gtttaacaagtttgaatttcc--atttcag-g 16532051  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaa--tgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagca 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||   | || || ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16532052 gtaagacaattgttgtagttggaagatgca---ttccatacctaatcacgatcttctagcgaaatcagactattgataatatcttcagttgatctcagca 16532148  T
Q  794 acgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccct 893  Q
    |||| || |||||||| ||||| |  | |||  | |||||||| || |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||  ||    
T  16532149 acgttacacgcatatcaatccattagagcatgctctgctcccataatatgctcatcacattttcgtcgttcgttaattccacccaacttaatgatattct 16532248  T
Q  894 cccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    | | || |||||||||| |||||||||    
T  16532249 ctcctcatcgagcgttgtacgtttata 16532275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 27486674 - 27486355
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||    
T  27486674 ttccaactacaacaattgtcttaccttttaatgagataaattcaaacctgccaaacaacagaactcaagcattccgctcggcattcatgtttttcctttg 27486575  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| || || || ||| ||||||||| |    
T  27486574 aaaagattaaattcttgctaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcaattgaataccatcatctaaagc 27486478  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | || |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  27486477 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgagcgaaatgcttgagttct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttca 27486381  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttgga 718  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  27486380 aaggtaagacaattgttggagttgga 27486355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 29762205 - 29761952
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||    
T  29762205 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcaagcatttcgctcggaattcatgtttttcctttg 29762106  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaa-cc 594  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   |||||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |     
T  29762105 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcattcattggcacttgaataccatcatctaaagca 29762009  T
Q  595 agtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctt 652  Q
    || ||||||| ||| || | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29762008 agcctaacaaaaatgtattattttcaaagg-aaaatatgaatgtcgagcgaaatgctt 29761952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 387 - 824
Target Start/End: Original strand, 40532938 - 40533375
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |  ||   ||| | |||||       
T  40532938 acgtttgtaccttccaactacaacaatcgtgttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcagcacgactccaatatacgaccgg-cattctca 40533036  T
Q  487 tt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    |  |||| || |||||| |||||| |||||||| |||  ||| || | |||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||    
T  40533037 taattccgttcaaaagattaaattcttgttaggtttggattaaataacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaatacctt 40533136  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattac 683  Q
    ||| |||| | | ||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| ||  |  | || || ||||||| || |||||||||||    
T  40533137 catttaaatcggcctatcaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgccggtcgaacat--tggagtcatg-ccgtttgacaagtttgaattac 40533233  T
Q  684 ctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 780  Q
    | || || | ||| || ||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40533234 cccagtt-agaggaaa-acaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaattaaacttttgatgatatcttca 40533331  T
Q  781 attgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacat 824  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40533332 gttgatctcggcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 40533375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 49427609 - 49427933
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  49427609 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcgtttg 49427707  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaacc 594  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  49427708 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagc 49427804  T
Q  595 a-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat-tacctcatttca 692  Q
    | | ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||| |  ||||| || |||||||| || |||| ||||    
T  49427805 acgcctaacaaaaatttattattttcaaagg-aaaacatgaatgccgggggaaatgcttgagtcct-gttgtttgacaggtttgaatctatctca-ttca 49427901  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49427902 aaggtaagacaattgttggagttgtaatgcac 49427933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Original strand, 35525849 - 35526081
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |   ||| | |||||||||       
T  35525849 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgtttga-ccgacattccca 35525947  T
Q  487 t-tttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||   ||||||||  ||||||||||| || || |||||    
T  35525948 tagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtctattccttgacaattcaatacctt 35526047  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  35526048 catttaaaccggactaacaagaatttaatctttt 35526081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 696 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 16081529 - 16081304
Alignment:
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || |  ||||  ||| |||||  |||||||    
T  16081529 gtaagacaattgttgtagctggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttccggcagaattaaactcttcagtatattctcagttgattgcagcaac 16081431  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    || || |||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  16081430 gttacacgcatatcgatcaactagaacatgttgtgctccaaaaacatgctcctcatgttatcgtcgttcgttaattccacctaactgaatgatatcctcc 16081331  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  16081330 cctcgtcgagcgttgaacgtttatacc 16081304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 418 - 508
Target Start/End: Original strand, 46924963 - 46925053
Alignment:
Q  418 ttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46924963 ttacctttgaatggggtaaattcaaacctgccaaacaacaggactcaaacatttcatccggcattcatgttttcctttgataagaataaat 46925053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 346
Target Start/End: Original strand, 18170921 - 18171021
Alignment:
Q  246 tcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcatt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18170921 tcatttaaaatgctcatcgaatattggagtcttgcagtttaacaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaagatacatt 18171020  T
Q  346 c 346  Q
    |    
T  18171021 c 18171021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 427 - 637
Target Start/End: Original strand, 16097783 - 16097991
Alignment:
Q  427 aatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctt 525  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||| |||   | || |||| || |||||| | |||| |||||||||||| ||    
T  16097783 aatggggtaaattcaaacttgctaaacaacaactctcaagcatt-cacccggcatctctattgttccattcaaaagattgaattattgttaggcttggtt 16097881  T
Q  526 tagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaagg 624  Q
    || ||||||||||   |||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  16097882 taaatgatggtat---agtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatactttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgaaaag 16097978  T
Q  625 aaaaacatgaatg 637  Q
    || ||||||||||    
T  16097979 aacaacatgaatg 16097991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 373 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 35185538 - 35185336
Alignment:
Q  373 gacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| | |  |||    
T  35185538 gacgtttataccga-cgtttgtaccttccaactacaacaattgtgtcacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaac-gttc 35185441  T
Q  473 acccgacattcatgt-tttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttga 571  Q
      || ||||||   |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||| | ||||| ||||    
T  35185440 gaccaacattcccatagttccattcaaaagattaaattattgttaggtttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgagatccattcattga 35185341  T
Q  572 cactt 576  Q
    |||||    
T  35185340 cactt 35185336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14173271 - 14173177
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  14173271 catcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagatgattgttgcagttggaag 14173177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 30309786 - 30309490
Alignment:
Q  427 aatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgct 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   | | |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | || |    
T  30309786 aatggggtaa-ttcaaacttgccaaatggccaggactcaagcatttcactcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattattgttagac-tggt 30309689  T
Q  525 ttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaa 622  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| |||   |  ||  ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  30309688 ttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaaccttatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaataatttattcttttcaaa 30309590  T
Q  623 ggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 721  Q
    || ||||||||||||  | | ||||||||| | || | |  |||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30309589 gg-aaaacatgaatgatgggtgaaatgcttgagtcat-gttgtttggcaggtttgaatttacccca-ttcacaggtaagacaattgttgtagttggaatg 30309493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 44597923 - 44598064
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  44597923 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggacttttgcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 44598022  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  44598023 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt 44598064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 27035302 - 27034975
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  27035302 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacagccaggactcaaacatttcgctcgacattcatgtttttcctt 27035204  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaac 593  Q
    |||| | | |||||| || ||||||| | |||| || | |||||| ||||| ||| |||  ||  |   ||| ||| ||||| || ||  ||||||||      
T  27035203 tgaacaaattaaattctttttaggctgg-tttaaataaaggtatt-aagtgtcaaggaatggacctcatttcgttggcacttgaatactatcatctaatg 27035106  T
Q  594 ca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttc 691  Q
    || | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | || ||   |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  27035105 caagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaa-catgaatgccgggtgaaatgcttgagtcatgtt-gtttggcaagtttgaatttaccccatttc 27035008  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27035007 aaaggtaagacaattattgtagttggaatgcac 27034975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 398 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 42571760 - 42571442
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  42571760 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaagactcaaacatttcgctcgacattcatgtttttcatt 42571662  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  42571661 tgaaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 42571565  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttc 691  Q
     | || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || | || |    |||||||| |||||||||  | || |||    
T  42571564 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccggacgaaatgtttgagtcat-attgtttggcaagtttgaatttacccaattc 42571467  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttg 716  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  42571466 aaaggtaacacaattgttgtagttg 42571442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 45689341 - 45689668
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||     
T  45689341 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaattggataattcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccaacgttcatgtttttccttc 45689440  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaac 593  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || | | |||||||||     
T  45689441 gaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaatatcatcatctaaag 45689537  T
Q  594 cagtct-aacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttc 691  Q
    ||  |  ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |  |||| ||| ||||||| ||||| || |||    
T  45689538 caaaccgaacaaaaatttatttttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttagcaagtttgaatttacccca-ttc 45689635  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45689636 aaaggtaagacaattgttgtagtaggaatgcac 45689668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 49397198 - 49397134
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49397198 acgtttgtatcttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 49397134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 427 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 29707492 - 29707196
Alignment:
Q  427 aatggggtaaattcaaacttgccaaacaa-catgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgct 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| | || |    
T  29707492 aatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggtcaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagac-tggt 29707395  T
Q  525 ttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaa 621  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||  |||||||| ||| || || || ||| ||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||    
T  29707394 ttagatgaatgtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacttcattccgttggcaattaaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaa 29707297  T
Q  622 aggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 720  Q
    | | |||||||||||| || | ||||||||| | || | |  |||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29707296 acg-aaaacatgaatggcgggtgaaatgcttgagtcat-gttgtttagcaagtttgaattgacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 29707200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 49262779 - 49262654
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |  |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  49262779 ctaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaagg 49262682  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49262681 taagacaattcttgtagttggaatgcac 49262654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 398 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 12791257 - 12790936
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |   |||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  12791257 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgacaagtccttagcatt-cgcccgacattcatgtttttccttt 12791160  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaac-accttcatctaaacc 594  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| | |  |   ||| ||| |||||||  ||| ||||||||| |    
T  12791159 gaaaagattaaattctttttaggctgg-tttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaattaacctcatttcattggcacttaaataccatcatctaaagc 12791061  T
Q  595 agtc-taacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
    | || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| |  |||||| | ||||||| ||||| || ||||    
T  12791060 aatcctaacaaaaaattattcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaaattcttgagtcct-gttgtttggtaagtttgaatttacccca-ttca 12790963  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||    
T  12790962 gaggtaacacaattgttggagttggaa 12790936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 395 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 16081830 - 16081597
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcc 492  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||| ||||||  | |  | || ||||    
T  16081830 accttccaactacaacaattatcttacctctaaaatggggtaaattcaaatttgcgaaacaacaactctcaagcatt-cacccggaagtgttattgttcc 16081732  T
Q  493 tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaa 591  Q
     || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  16081731 attcaaaagattaaatttttgttaggattgatttagatgatgacattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaataccttcatctaa 16081632  T
Q  592 accagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
    ||||  |||| || |||||||| |||| |||||||    
T  16081631 accaacctaaaaaaaatttaattttttgaaaggaa 16081597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35525710 - 35525616
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35525710 catcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttggaag 35525616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 23343330 - 23343427
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  23343330 taccatcattcaagatgttcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgctccattcaagggtaagataattgttgcaattggaag 23343427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 398 - 540
Target Start/End: Original strand, 35576561 - 35576705
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcc-tt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||   | |||||||||||| ||    
T  35576561 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcctagcgttcatgttttccctt 35576659  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattc 540  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576660 tgaaaatattaaattcttgttaggcttgctttagatgatggtattc 35576705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Original strand, 38044844 - 38044908
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38044844 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 38044908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17685876 - 17685778
Alignment:
Q  240 ttaccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  17685876 ttaccatcatttaaaatgctcatcgaacattggagttctgctgtttagcaagtttgaatttatcccattcagaggtaagataattgttgtagttggaag 17685778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 41874667 - 41874543
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||   |||| ||| |||||||||  |||  |||||||||    
T  41874667 ctaacaaagatttattcttttcaaaggaaaa-catgaatgccgagtgaaatgcttgagtcatgtt-gtttagcaagtttgaatttgctccattcaaaggt 41874570  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41874569 aagacaattgttgtagttggaatgcac 41874543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39856733 - 39856660
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39856733 atcgaatactggagtcctgctggttagcaaatttgaatttgctccattcagaggcaagacaattgttgcagttg 39856660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42571291 - 42571198
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  42571291 taccatcatttaaaatgctcatcgcatgctagagtcctgctatttagcaagtatgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttg 42571198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 46180264 - 46179937
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||    
T  46180264 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctt 46180166  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| || || |||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||| |||||    
T  46180165 tgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaagtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcaactaaa 46180069  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcattt 690  Q
       || ||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| | || | |  |||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  46180068 gtaagcctaacaaaaattcattattttcaaaggaaaaacgtgaacgcggggcgaaatgcttgagtcat-gttgtttggccagtttgaatttacctca-tt 46179971  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46179970 caaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 46179937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 49397334 - 49397431
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  49397334 taccatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttgacaagtttgaatttaccccattcagagataagataattgttgcagttggaag 49397431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 599 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 50068040 - 50067916
Alignment:
Q  599 taacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggta 698  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | |||||   |||||||| |||||||||  | |  ||||||||||    
T  50068040 taacaaaaatttattcttttcaaatgaaaaacatgaatgaggggcaaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggta 50067942  T
Q  699 agacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  50067941 agacaattgttgtagttggaatgcac 50067916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 663 - 795
Target Start/End: Original strand, 14772461 - 14772592
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14772461 cgtttagcaagtttgaattatctcattttagaggtaacacaattcttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaa 14772559  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    || ||||  | |||||||||||||||| |||||    
T  14772560 ctgttgagaacatcttcaattgatctctgcaac 14772592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 398 - 494
Target Start/End: Original strand, 29761827 - 29761923
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctt 494  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  29761827 ttccaactgccacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaagcctgccaaacaacaggactcaagcatttcgctcgacattcatattttcctt 29761923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 39224181 - 39223856
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctt 494  Q
    |||||||| |||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | || |||||||| |||||| |    
T  39224181 ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttccgt 39224083  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttc-attccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| | |||| ||||| | | | |||||   ||  ||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  39224082 tgaaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaagatatt-aagtgtcga-ggaatgaacctcttttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 39223986  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttc 691  Q
     | || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | || | |  ||||| || |||||||||  | || |||    
T  39223985 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagtcat-gttgtttgacaggtttgaatttaccca-ttc 39223889  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39223888 aaatgtaagacaattgttgtagttggaatgcac 39223856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13635259 - 13635141
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| | | |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13635259 cctttgaatgagatcaatttaaacctgccaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggc 13635160  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  13635159 -tggtttagatgaaggtatt 13635141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35586435 - 35586328
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||  |||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  35586435 taccatcattcaagatgctcatcgcatgttggagtcttgttgtttagcaagtttgaattttctccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggt 35586336  T
Q  341 gcattcat 348  Q
     |||||||    
T  35586335 acattcat 35586328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 810 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 13148450 - 13148365
Alignment:
Q  810 gatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13148450 gatccactggaacatgttgtgctctcaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 13148365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24269881 - 24269785
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  || |||| |||||||| |||||||||    
T  24269881 taccatcatttaaaatgttcatcgcat-ctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcccaattcaaaggtaagataattgttgaagttggaag 24269785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27486205 - 27486128
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  27486205 atcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 27486128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30309319 - 30309263
Alignment:
Q  288 caagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30309319 caagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaagatgcat 30309263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 345
Target Start/End: Original strand, 18842941 - 18843004
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcatt 345  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18842941 gtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttggtagatgcatt 18843004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Original strand, 35185676 - 35185770
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || |||||||||| | | |||| |||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35185676 catcattcaagatgctcatcgcaaaatggagtcctactgtttagcaagtttgaatttgtcccattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 35185770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 347
Target Start/End: Original strand, 36910250 - 36910356
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||  |||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |    
T  36910250 taccatcatttaaaatgtcaatcgcatgttggagtcctgttgtttagcaagtttcaatttactccattcaggggtaagataattgttgcagtttgaaggt 36910349  T
Q  341 gcattca 347  Q
     ||||||    
T  36910350 acattca 36910356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 479 - 724
Target Start/End: Original strand, 48226841 - 48227085
Alignment:
Q  479 cattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt 576  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| |||||    
T  48226841 cattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctag-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcactt 48226937  T
Q  577 -aacaccttcatctaaacca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgt 674  Q
     || ||| |||| |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |  | |||| |  ||||| || ||    
T  48226938 gaataccatcatttaaagcacgtctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgttggagtcct-gttgtttgacaggt 48227035  T
Q  675 ttgaat-tacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  48227036 ttgaatctatctca-ttcaaaggtaagacaattgttggagtttgaatgcac 48227085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 225
Target Start/End: Original strand, 39223071 - 39223152
Alignment:
Q  144 caacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39223071 caacccttgggataagtttaaatctgcttttttttactccataaactttttactgtgggtaaaaagatttgtcttggggtat 39223152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 48227244 - 48227321
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  48227244 atcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 48227321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 282 - 338
Target Start/End: Original strand, 13284189 - 13284245
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13284189 gtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagacaattgttgtagttggaag 13284245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Original strand, 41801723 - 41801791
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  41801723 tggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttagaag 41801791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 46924749 - 46924689
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46924749 ttagcaagtttgaatttgccacattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 46924689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13634803 - 13634720
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  13634803 atgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttaaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 13634720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15356298 - 15356235
Alignment:
Q  275 tcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  15356298 tcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 15356235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 19161017 - 19161100
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  19161017 atgctgatcgaatactggggtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 19161100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Original strand, 35586478 - 35586571
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  35586478 taccattatttaagatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattacct-cattca-aaggaagacaattgttgcagttgga 35586571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36910207 - 36910114
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||| || | ||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  36910207 taccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctaccgtttaacaagtttgaa-ttaccccattca-gaggaagacgattgttgcagttgga 36910114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41874603 - 41874548
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  41874603 gtttagcaagtttgaatttgctccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 41874548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 701 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 48226799 - 48226760
Alignment:
Q  701 acaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48226799 acaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatg 48226760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 48568187 - 48568063
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta-cctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | || ||   ||||  || |||||||||  ||||||| ||||||    
T  48568187 ctaacaaaaatttattattttcaaaggaaaa-catgaatgccgggtgaaatgcttgattcatgtt-gtttcacaagtttgaatttgcctcatt-caaagg 48568091  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48568090 taagacaattgttgtagttggaatgcac 48568063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 49397291 - 49397198
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  49397291 taccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctaccgtttaacaagtttgaa-ttaccccattca-aaggaagacaattgttgcagttgga 49397198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Original strand, 49428106 - 49428169
Alignment:
Q  275 tcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  49428106 tcctgctgcttagcaagtttgaatttgctccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 49428169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49925883 - 49925800
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| ||  ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  49925883 atgctcatcggatgttggagccctgctgtttagcaaatttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 49925800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27034840 - 27034786
Alignment:
Q  292 tttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27034840 tttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 27034786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 30308750 - 30308796
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30308750 actccataaactttttaccgtgggtaaaaagatttgtcttggggtat 30308796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 49598875 - 49598545
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||  |||  | |||||||||| ||||    
T  49598875 ttccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatcgggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaaggattttgcccatcgttcatgtttttcctt 49598777  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| || || |||| |||| |||||| |||||  || | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  49598776 tgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttaaatgaaggtatt-aagtgttaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaa 49598680  T
Q  593 -ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcattt 690  Q
     | || ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| || || | ||||||||||| | || | |  |||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  49598679 gcaagcctaacaaaaatttattcctttcaaagaaaaaacataaacgcggggcgaaatgcttgagtcat-gttgtttggccagtttgaatttacctca-tt 49598582  T
Q  691 caaaggtaag---acaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  49598581 caaaggtaagacaacaattgttgtagttggaatgcac 49598545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 14173172 - 14173249
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  14173172 tgtaacttccaactgcaacaatcatcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 14173249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 35525611 - 35525688
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  35525611 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 35525688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38044708 - 38044611
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||||  || || || |||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  38044708 taccatcattcaagatgctcatcagatgctagagtcctgttgtttagcaagtttgaatttgcccaattcagtggtaagataattgttgtagttggaag 38044611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39223667 - 39223614
Alignment:
Q  291 gtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39223667 gtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 39223614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 49397436 - 49397359
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  49397436 tgtaccttccaactgcaacaattatcttatctctgaatggggtaaattcaaacttgtcaaacagcaggactccagcat 49397359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Original strand, 49597556 - 49597641
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  49597556 tgatcgacccttgggataagtttaaatctgcttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcttgttggggtat 49597641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Original strand, 49926033 - 49926264
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcat 485  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||| |  | |||  |||||| |||      
T  49926033 acgtttgcacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaat-gagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaata-ttcgaccgacatttcca 49926130  T
Q  486 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
     | |||| || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| ||||  |||| ||| || |||   ||||||||  |||| ||||||||| || |||||    
T  49926131 atgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacagtatacaaatgtcaaaagaatgaggtctattcgttgacacttcaatacctt 49926230  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  49926231 catttaaaccagcacaacaataatttaatctttt 49926264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12790760 - 12790692
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  12790760 tggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagttggaag 12790692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 21484475 - 21484432
Alignment:
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctt 727  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21484475 cctcattt-aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctt 21484432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46179792 - 46179725
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  46179792 tggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaa-ataattgttgcagttggaag 46179725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 12790687 - 12790758
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  12790687 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 12790758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 15356230 - 15356301
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15356230 tgtaccttccaactacaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 15356301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19160946 - 19160857
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19160946 atgctcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 19160857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 24269780 - 24269851
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  24269780 tgtaccttccaacttcaacaattatcttacctttgaattgggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 24269851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24363537 - 24363474
Alignment:
Q  275 tcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  24363537 tcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagagataagacaattgttgtagttggaag 24363474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 35586333 - 35586404
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35586333 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggagaaaattcaaacttgctaaacaacaagactc 35586404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37778377 - 37778272
Alignment:
Q  262 tcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactg 361  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||| | |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  37778377 tcgaatattggaatcctgccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattca-gaggaagaaaattgttgtaggcggaaggtgcattcattcggtacctaatg 37778280  T
Q  362 acgatctt 369  Q
    ||||||||    
T  37778279 acgatctt 37778272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 261 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 50067757 - 50067674
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  50067757 atcgaatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaattttccccatttaggggcaagacaattattgtagttggaaggtgcat 50067674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 344
Target Start/End: Original strand, 3659275 - 3659349
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||| |||||| | ||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3659275 tggagtcctgctgcttagcaagtttaaatttgtcccattcaagggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 3659349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Original strand, 13973661 - 13973711
Alignment:
Q  288 caagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  13973661 caagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 13973711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 454
Target Start/End: Original strand, 17685773 - 17685835
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaca 454  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17685773 tgtaccttccaactacaacaattatcttacctctgaatgggataaattcaaacttgctaaaca 17685835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 598 - 652
Target Start/End: Original strand, 17697443 - 17697497
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctt 652  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  17697443 ctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacataaatgtcgggcgaaatgctt 17697497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 19160539 - 19160611
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  19160539 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 19160611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 22527729 - 22527801
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  22527729 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 22527801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 337
Target Start/End: Original strand, 22528207 - 22528289
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  22528207 atgctgatcgaatactggtgttctgctgcttaacaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaa 22528289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 797
Target Start/End: Original strand, 19262422 - 19262475
Alignment:
Q  744 atcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19262422 atcttcaggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagcaacgt 19262475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 29436679 - 29436756
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| || ||||| |||||||||    
T  29436679 atcgaatactggagtcctgctagttagcaagtttgaatttgccccattcagtgataagataactgttgtagttggaag 29436756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29761647 - 29761570
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||   |||||| || ||||  ||||||| |||||||||    
T  29761647 atcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccaaattcagtggtaagatgattgttgtagttggaag 29761570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 38044606 - 38044683
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  38044606 tgtaccttccaactacaacaattatcttaccactgaattgggcaaattcaaacttgctaaacaacaggactctagcat 38044683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 49262972 - 49262852
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||  | |||||||||| ||||    
T  49262972 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtga-ttcaaacttgccaaacggccatgactccagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctt 49262874  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgtta 516  Q
    |||||||| |||||| ||||||    
T  49262873 tgaaaagattaaattcttgtta 49262852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 51270538 - 51270615
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  51270538 atcgaatactagagtcatgctggttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 51270615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Original strand, 17373200 - 17373268
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  17373200 tggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcaggggttagacaattattgtagttggaag 17373268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23342889 - 23342829
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatcttttgga 374  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  23342889 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctgga 23342829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Original strand, 27486123 - 27486179
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  27486123 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 27486179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 336
Target Start/End: Original strand, 42571338 - 42571428
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||| || | ||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  42571338 catcattcaaaatgctcatcgaatgctggtttcctgccgtttaacaagtttgaa-ttaccccactca-aaggaagacaattgttgcagttgga 42571428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 463
Target Start/End: Original strand, 49396926 - 49396992
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||| || ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  49396926 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgacatgactc 49396992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6436020 - 6435965
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6436020 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 6435965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13973172 - 13973117
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  13973172 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 13973117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 457
Target Start/End: Original strand, 21484440 - 21484499
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaaca 457  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  21484440 ttccaactacaacaattgtcttacctttaaatgaggcaaattcaaaattgccaaacaaca 21484499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 724
Target Start/End: Original strand, 22528019 - 22528054
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22528019 ttcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcac 22528054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 41801796 - 41801725
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    ||||||||| |||| |||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  41801796 tgtaccttctaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 41801725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47487555 - 47487452
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||||||   ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |    
T  47487555 taccgtcattcaagatgctgatggaatattggagtcctgcttcttaacaagtttaaatttgccccattcacgggtaagacaattgttgtagttgaaaggt 47487456  T
Q  341 gcat 344  Q
    ||||    
T  47487455 gcat 47487452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 50067976 - 50067921
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  50067976 gtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 50067921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 392 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6436514 - 6436460
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactt 446  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6436514 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccattgaatggggaaaattcaaactt 6436460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 598 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13635081 - 13635028
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctt 652  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  13635081 ctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgctt 13635028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 892 - 922
Target Start/End: Original strand, 16098089 - 16098119
Alignment:
Q  892 ctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16098089 ctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 16098119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 487 - 545
Target Start/End: Original strand, 17697355 - 17697412
Alignment:
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtg 545  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  17697355 tttttctttgaaaagattaaatttttgttaggc-tggtttagatgaaggtattgaagtg 17697412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Original strand, 24269924 - 24269982
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatt 299  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24269924 taccataattcaaaatgctcatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaatt 24269982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35185630 - 35185572
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatt 299  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  35185630 taccattattcaagatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaatt 35185572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 392 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 35185775 - 35185713
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaca 454  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  35185775 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgggacaaattcaaacttgctaaaca 35185713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41781314 - 41781256
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatt 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  41781314 taccatcattcaaaatgctcatcgaatgttggattcgtgccgtttaacaagtttgaatt 41781256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 46924180 - 46924226
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  46924180 actcgataaactttttaccatgggtaaaaagatttgtcttggggtat 46924226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 47485949 - 47485995
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  47485949 actccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcttcttggggtat 47485995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 48227324 - 48227270
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  48227324 taccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 48227270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 48568323 - 48568246
Alignment:
Q  462 tcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||    
T  48568323 tcaagcatttcgctcagcattcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgtttggc-tgatttagctgaaggtatt 48568246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Original strand, 13634880 - 13634963
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13634880 atcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt-gccccatccagagt-aagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 13634963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23343432 - 23343355
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  23343432 tgtaccttccaattgcaacaattatcttacccttgaatggagcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 23343355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 346
Target Start/End: Original strand, 37778796 - 37778900
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||| |||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||| || || |||| ||||||||  |||||||| |    
T  37778796 taccatcattcaagatgatcatcgcatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttac-ctatttagaggtaagataattgttgtggttggaaggt 37778894  T
Q  341 gcattc 346  Q
    ||||||    
T  37778895 gcattc 37778900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 49598406 - 49598317
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgca 330  Q
    |||||||||| || ||| | |||| ||  |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||    
T  49598406 taccatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgca 49598317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 208
Target Start/End: Original strand, 50066010 - 50066039
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50066010 actccataaactttttaccgtgggtaaaaa 50066039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 51270618 - 51270549
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  |||||| || |||||||||||||| || || ||||||||    
T  51270618 taccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatgaggcaaattcaaacttgctaaccagcatgactc 51270549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 122)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 16582371 - 16581845
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16582371 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcagttcaaacttgccaaacaacatgactcaaacatttcactcggcattcatgttttcctttga 16582272  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16582271 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccatt 16582172  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16582171 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatacttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggt 16582072  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16582071 aagccaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgaagatcttctagcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 16581972  T
Q  798 cacccgcata--tcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    ||||||||||  |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16581971 cacccgcatatctcgatccaatggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgacacattttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 16581872  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||    
T  16581871 cctcgtcgagcattggacgtttatacc 16581845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 402 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 32735191 - 32734670
Alignment:
Q  402 aactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaa 500  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32735191 aactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcccccgacattcatgttttcctttgaaaa 32735092  T
Q  501 gaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtcta 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||    
T  32735091 gaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgctaacgaaatgaggtccattccttgacacttaataccttaatctaaaccaaccta 32734992  T
Q  601 acaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaag 700  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||||||    
T  32734991 acaataatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattatcccattttagaggtaag 32734892  T
Q  701 acaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcac 800  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  32734891 actgttgttgtagttggaatgcaccttaccttaactaatgactatcttttggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatatcaacaacgttac 32734792  T
Q  801 ccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcg 900  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32734791 ccgcatatcgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgcttgtcacattttcgtagttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccctcg 32734692  T
Q  901 tcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  32734691 tcgagcgttgaacgtttatacc 32734670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 42120560 - 42120035
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||    
T  42120560 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcattgcaccccgcattcatgtttttcctttg 42120461  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42120460 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 42120361  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| | || ||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  42120360 cataacaagaatttaatcttttcaaagaaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgattcatggtcgtttgacaagtttgaattaccccatttcagagg 42120261  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42120260 taagacaatcgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 42120161  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  42120160 ttacccacatatcaatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccgcccaagtgaatgatactctccc 42120061  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||| ||||||||    
T  42120060 ctcgtcgagcgttggacatttatacc 42120035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 509 - 922
Target Start/End: Original strand, 42240869 - 42241282
Alignment:
Q  509 ttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataat 608  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42240869 ttttgttgggtttgctttagatgatggtattcaagttccaacgaaatgaggttcattccttgtcacttaataccttcatctaaaccagcctaacaagaat 42240968  T
Q  609 ttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgt 708  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42240969 ttaatcttttcaaagaaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaattacctcatttcagaggtaagacaattgt 42241068  T
Q  709 tgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatat 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42241069 tgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggcagaatcaaacttttggtgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatat 42241168  T
Q  809 cgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgt 908  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42241169 cgatcaactgaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgt 42241268  T
Q  909 tggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||    
T  42241269 tggacgtttatacc 42241282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 921
Target Start/End: Original strand, 10359858 - 10360381
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||     
T  10359858 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcattttgccccgcattcatgtttttccttta 10359957  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  10359958 aaaagaataaaaaaaatttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttattaccttcatctaaactag 10360057  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||    
T  10360058 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgttgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccattttga-gg 10360156  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  10360157 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgaaatcttcagttgatctcagcaaca 10360256  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10360257 ttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccc 10360356  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  10360357 ctcgtcgagcgttggacgtttatac 10360381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 22493819 - 22493294
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa-acaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | |||    
T  22493819 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggga-aaattcaaacttgccaacacaacatgactcaagcatttcgccccgcattcatgtttttcattt 22493721  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22493720 gaaaagaataattttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagttccaatgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaacca 22493621  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  22493620 gcataacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcctgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaa 22493521  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  22493520 gtaagacagttgttgtagttggaatgcatcttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatctttagttgatctcaggaac 22493421  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22493420 gttacccgcatatcaatccactggaacattctgtactcccaaaacatgctcgtcacgttttcgccgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcc 22493321  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  22493320 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 22493294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 17425335 - 17424812
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  17425335 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 17425236  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17425235 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 17425136  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  17425135 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 17425038  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17425037 g-aagacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 17424939  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  17424938 ttcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 17424839  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  17424838 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 17424812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 3936724 - 3937247
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  3936724 ttccaaccacaacaattctgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 3936823  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3936824 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 3936923  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  3936924 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 3937021  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3937022 g-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 3937120  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  3937121 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 3937220  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  3937221 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 3937247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 511 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 29907016 - 29906605
Alignment:
Q  511 ttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataattt 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  29907016 ttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcataacaagaattt 29906917  T
Q  611 aatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttg 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  29906916 aatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacagttgttg 29906817  T
Q  711 tagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcg 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29906816 tagttggaatgcaccttaccctaactaatgctgatcttctggcagaatcaagttgttgatgatattttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 29906717  T
Q  811 atccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttg 910  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  29906716 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgtttgtcacgttttcgtcgttctttaacttcacccaagtgaatgatactctccccacgtcgagcgttg 29906617  T
Q  911 gacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||    
T  29906616 gacgtttatacc 29906605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 398 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 18393897 - 18393486
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18393897 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcccccggcattcatgttttcctttga 18393798  T
Q  498 aaagaataaatttttg-ttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    || ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18393797 aa-gaataaattttttattaaccttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 18393699  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctc-atttcaaag 695  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  18393698 cctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatacttgagtcctagtcgtttggcaagtttgaattaccccnatttcagag 18393599  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18393598 gtaagacaatttttgtagttggaatgcaccttaccctcactaatgacgatcttctggcagaatcaagttgtttatgatatcttcagttgatctcagcaac 18393499  T
Q  796 gtcacccgcatat 808  Q
    || || |||||||    
T  18393498 gttacacgcatat 18393486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 536 - 922
Target Start/End: Original strand, 12968099 - 12968485
Alignment:
Q  536 tattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaa 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12968099 tattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaattagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaa 12968198  T
Q  636 tgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaac 735  Q
     || | ||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12968199 cgctgggcgaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggagtgcaccttaccctaac 12968298  T
Q  736 taatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctccc 835  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  12968299 taatgacgatcttctggaggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaatggaacatgttgtgctccc 12968398  T
Q  836 aaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12968399 aaaacatgctcgtaacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttatacc 12968485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 407 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 22002371 - 22001857
Alignment:
Q  407 caacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-tttgaaaagaat 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22002371 caacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacctgcaaaacaacatgactcaagcatttcgccgagcacttcatgttttccctttgaaaagaat 22002272  T
Q  505 aaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaa 604  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  22002271 aaagttttgtaaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatacttgacacttaataccttcatctaaaccagcataacaa 22002172  T
Q  605 taatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaa 704  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22002171 gaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgctcgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaa 22002075  T
Q  705 ttgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgc 804  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  22002074 ttgttgtagttggaatgcaacttacaataactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgc 22001975  T
Q  805 atatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcga 904  Q
    ||||||||||| || |||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  22001974 atatcgatccattggaacatgctgagctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattcctcccaagtgaatgatattctcccctcgtcga 22001875  T
Q  905 gcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22001874 gcgttggacgtttatacc 22001857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 491 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 43983307 - 43982879
Alignment:
Q  491 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatcta 590  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43983307 cctttgaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatcta 43983208  T
Q  591 aaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcattt 690  Q
    ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || |||||||||||||||||     
T  43983207 aaccagcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt- 43983110  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctca 790  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  43983109 caaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaa 43983011  T
Q  791 gcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattatac 890  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  43983010 gcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatac 43982911  T
Q  891 cctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43982910 tctcccctcgtcgagtgttggacgtttatacc 43982879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 398 - 756
Target Start/End: Original strand, 39799530 - 39799886
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39799530 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttga 39799629  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||     
T  39799630 aaagaataaatttttgttaggcgtgctttagacgctggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttcacacttaatacctacatctaaaccagc 39799729  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  39799730 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaagg 39799827  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcgga 756  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39799828 -aagacaattgttgtggttggaatgcacattaccctaactaatgacgatcttctggcgga 39799886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 521 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 29068150 - 29067752
Alignment:
Q  521 tgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttca 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  29068150 tgctttagatgatggtattcaagtgccactgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatattttca 29068051  T
Q  621 aaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 720  Q
    ||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29068050 aaggagaaacatgaggttcttgcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaat 29067954  T
Q  721 gcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaa 820  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  29067953 gcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactgga 29067854  T
Q  821 acatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29067853 acatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacattttcgtcattcgttaattgcacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttata 29067754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 10364285 - 10364820
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |  |||  ||  | |||||       
T  10364285 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgactgg-cattccca 10364383  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  10364384 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaatacc 10364481  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  10364482 ttcatttaaatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgccggtcgaa-tattggagacctgcccgtttggcaagtttgaatta 10364580  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttac--cctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 780  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |  | ||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10364581 ccccattt-aaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcctacgtaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 10364678  T
Q  781 attgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaag 880  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10364679 attgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaag 10364778  T
Q  881 tgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10364779 tgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 10364820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 35492192 - 35491658
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||  |||  | | | |||||       
T  35492192 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactcaaatattcgatcgg-cattccca 35492094  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||||  | || | |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  35492093 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggcgggattaa-atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 35491997  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  35491996 ttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaatta 35491899  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491898 ccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 35491801  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35491800 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 35491701  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35491700 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 35491658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 372
Target Start/End: Original strand, 42240523 - 42240873
Alignment:
Q  14 aataacatggttattaattgcaaatttagacattaataatgttagttgtttaggtgaaattaagatttagttaaaaacaatgggggattagggcag-nnn 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  42240523 aataacatggttattaattgcaaatttagacattaataatgttagttgtttaggtgaaattaagatttagttaaaaa-aatgggggattagggcagaaaa 42240621  T
Q  113 nnnnnntacattttggagtagatagaatgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatt 212  Q
          |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42240622 aaaaaatacattttggagtagataaaatgatcaacccttgagataagtttaaatctgtttttttttactccataaactttttatcgtgggtaaaaatatt 42240721  T
Q  213 tgttttggggtatnnnnnnnnccagatttaccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagg 312  Q
    ||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |    
T  42240722 tgtcttggggtataaaaaaaaccagatttaccatcatttaaaatgctcatcgaa-aatggaatcc-------tagcaagtttgaatttgctccattcaag 42240813  T
Q  313 gggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatcttttg 372  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42240814 gggaagacaattaatgttgttggaaggtgcattcattctgtacctactgacgatcttttg 42240873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 392 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 33404564 - 33404038
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-tt 490  Q
    |||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||  || ||||||  | || ||    
T  33404564 tgtaccttccaaatacaacaattgtcttacctctgaattgggtaaattcaaacttgctaaacatcaggactcaaacatttgtcc-gacatttctattgtt 33404466  T
Q  491 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatct 589  Q
    || || |||||| |||||| ||||||| |||| |||| || ||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |    
T  33404465 ccattcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaataatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcattt 33404366  T
Q  590 aaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatt 689  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |  |||||||  | ||||| || | ||||| ||||||   | |||||||||||||||||    
T  33404365 aaaccggcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaatgccggac-aaatgtttgagtcctg-ccgtttaaaaagtttgaattacctcatt 33404268  T
Q  690 tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctc 789  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  33404267 -caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcgacatcagactgttgataatatcttcagttgatctc 33404171  T
Q  790 agcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattata 889  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||    
T  33404170 agcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacacaactgaatgata 33404071  T
Q  890 ccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  33404070 ctattccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 33404038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 402 - 922
Target Start/End: Original strand, 19471297 - 19471817
Alignment:
Q  402 aactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaag 501  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||  ||| |   |||   | |||| || |||||    
T  19471297 aactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcatttccaatgttccattcaaaag 19471396  T
Q  502 aataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtcta 600  Q
    | |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  19471397 attaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatggcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagccta 19471496  T
Q  601 acaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaag 700  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||| |  ||||    ||  | ||  ||| |||| || |||||||||||| || |||| ||| |||    
T  19471497 acaagaatttaatcttttgaaaggaacaatgggaatgctggtcgaata--ttggagccctgccatttgacaagtttgaattacc-caattcagagg-aag 19471592  T
Q  701 acaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19471593 acaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgt 19471692  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  19471693 cacccgcatatcgatacactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccc 19471792  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19471793 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 19471817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 606 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 39394230 - 39393914
Alignment:
Q  606 aatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaa-tgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagaca 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||   ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  39394230 aatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgctgagcgaaaatgcttgagtcatgtt-gtttgacatgtttgaatttatctcatt-caaaggtaagaca 39394133  T
Q  704 attgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccg 803  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39394132 attgttgcagttggaatgcaccttatcctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagttgttaatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccg 39394033  T
Q  804 catatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcg 903  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  39394032 catatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttgattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcg 39393933  T
Q  904 agcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39393932 agcgttggacgtttatacc 39393914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 6977394 - 6976861
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  || | | | |||||||       
T  6977394 acgtttgtaccttccaactcaaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatatgatc-gacattccca 6977296  T
Q  487 ttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
        ||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  6977295 cagctccatttaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcattgacacttcaatacctt 6977196  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattac 683  Q
    ||| |||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||  ||   |||||||   |||| ||  |  | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6977195 catttaaaccggcctaacaagaatttaatattttgaaaggattaatgggaatgccagtcgaacat--tggagtcctg-ccgtttggcaagtttgaattac 6977099  T
Q  684 ctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 780  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6977098 cccatt-cagagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctcgcggaatcaaacttttgatgatatcttca 6977001  T
Q  781 attgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaag 880  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  6977000 gttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaatttcacccaag 6976901  T
Q  881 tgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6976900 tgaatgatacactcc--tcgtcgagcgttggacgtttatacc 6976861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 696 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 3941986 - 3941761
Alignment:
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3941986 gtaagacaattgttgaagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcatcaac 3941887  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||    
T  3941886 gtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcc 3941787  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  3941786 cctcgtcgagcgttggacgtttatac 3941761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 41498742 - 41499277
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || ||||| |  |||  ||| | |||||       
T  41498742 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgtcaagcagcaagactccaatattcgaccag-cattccca 41498840  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| ||||||||||    ||| || |||||| |||| ||||||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  41498841 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataatggtactcaaatgccaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaatacc 41498938  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |  |  |||| | |||||||| ||||||||||    
T  41498939 ttcatttaaatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaa-tattggagacctgtc-gtttggcaagtttgaatta 41499036  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41499037 cctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 41499134  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  41499135 agttgatctcagcaacgtcaccctcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccag 41499234  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41499235 gttaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 41499277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 696 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 5420718 - 5420494
Alignment:
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5420718 gtaagacaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttcaggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatatcagcaac 5420619  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  5420618 gtcacccgcatatcgatccattggaacatgctgtgctcacaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcc 5420519  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5420518 cctcgtcgagcgttggacgtttata 5420494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 663 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 29111438 - 29111182
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    |||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||| |||    
T  29111438 cgtttgacaagtttgaattaccacatt-caaagg-aagataattgttgtagttggaatgcactttaccctacctagtgacgttattctggcggaattaaa 29111341  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29111340 tttttgatgatatcttcggttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 29111241  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29111240 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatac 29111182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 663 - 921
Target Start/End: Original strand, 2919288 - 2919547
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatc 759  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2919288 cgtttggcaagtttgaattaccacatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttttggcggaatc 2919385  T
Q  760 aaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgt 859  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2919386 aaacttttaatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatctactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgt 2919485  T
Q  860 tgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2919486 cgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttatac 2919547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 37312143 - 37312678
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattcat 485  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| |  || |||  |||||||||      
T  37312143 acgtttgtaccttccaactataacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttttcaagcagcatgactcca--atgttcgaccgacattccc 37312240  T
Q  486 gtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacct 583  Q
     |  |||  || |||||| ||| ||  ||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||| ||||   |||||||| || ||||    
T  37312241 atagttcaattcaaaagattaatttcctgttaggtttagtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccatttactgacacttcaatacct 37312340  T
Q  584 tcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| ||  |  | || || |||||||||| ||||||||||    
T  37312341 tcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgagaggaacaatgggaatgtcggtcgaacattgt--agtcatg-ccgtttggcaagtttgaatta 37312437  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| || ||| ||| |||||||||||| || ||  ||||  | | |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37312438 ccccatt-catagg-aagtcaattgttgtagctgtaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttc 37312535  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37312536 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 37312635  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37312636 ctgaatgataatctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 37312678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 735 - 922
Target Start/End: Original strand, 27130505 - 27130692
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27130505 ctaatgactatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 27130604  T
Q  835 caaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27130605 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcgttgagcgttggacgtttatacc 27130692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 663 - 921
Target Start/End: Original strand, 17796033 - 17796286
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  17796033 cgtttggcaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaagacacatttccctacctaatgacgagcttctgacggaaccaaa 17796130  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  17796131 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaaca---tgtgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgt 17796227  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  17796228 tcgttaattccacccaactgaatgatactctccactcgtcgagcgttggatgtttatac 17796286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 662 - 922
Target Start/End: Original strand, 34521606 - 34521867
Alignment:
Q  662 ccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 758  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || |||||||||||||| ||  |||||    
T  34521606 ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttatgagggaat 34521703  T
Q  759 caaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcg 858  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34521704 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 34521803  T
Q  859 ttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  34521804 tcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgtttgacgtttatacc 34521867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 387 - 882
Target Start/End: Original strand, 40677023 - 40677518
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||   ||| |||||||       
T  40677023 acgtttgtacctctcaactacaacaattgtgttacccttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaatatacgacc-gacattccca 40677121  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  40677122 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 40677219  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt 681  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| ||  |  | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  40677220 ttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaacat--tggagtcctg-ccgtttggcaagtttgaatt 40677316  T
Q  682 acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 778  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||| ||||| || ||  ||||  | | || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40677317 accccatt-caaagg-aatacaattggtgtagctgcaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatctt 40677414  T
Q  779 caattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccca 878  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  40677415 cagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgtcgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaccca 40677514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 398 - 613
Target Start/End: Original strand, 8557385 - 8557596
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  8557385 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggataaattcaaacctgccaaacaacatgactcaaacatttcacccggaattcatgtttttctttga 8557484  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  8557485 aaagaataaatttttgttaggcttgctttaaataatggtattcaagtgccaacgaaatgaag----ttccttgacacttaatacattcatctaaactagc 8557580  T
Q  598 ctaacaataatttaat 613  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8557581 ctaacaagaatttaat 8557596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 729 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 6902182 - 6901992
Alignment:
Q  729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttg 828  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  6902182 ccctacctaatcatgatcttctcgcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcaacaacgttactcgcatatcgattcactggaacatgttg 6902083  T
Q  829 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttat 919  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6902082 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttat 6901992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 387 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 43492008 - 43491600
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||  ||| | |||||       
T  43492008 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgg-cattccca 43491910  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||||| |||||| |||||||| | |  ||| |||||||||||||| ||  ||   |||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  43491909 atgtt--ccattcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaatgatggtattcaaatgtgaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 43491812  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |    |||| |||  | ||||  |  |   ||| |||||||||| ||||||||||    
T  43491811 ttcatttaaatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacagtgggaattccggtc-aaatattggagatctg-ccgtttggcaagtttgaatta 43491714  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491713 ccccatt-caaagg-aaggcaattgttgtagttggaaggtgcattctttccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 43491616  T
Q  780 aattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||    
T  43491615 agttgatctcagcaac 43491600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 729 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 20148334 - 20148141
Alignment:
Q  729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttg 828  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  20148334 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgaaaatatcttcagctaatctcagcaacgttacccgcatatcgatctactggaacatgttg 20148235  T
Q  829 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20148234 tgctcctaaaacatgctagtcatgttttcgtcgttctttaattccccccaactaaatgatattctcccctcgttgagcgttggacgtttatacc 20148141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 792 - 922
Target Start/End: Original strand, 39799895 - 39800025
Alignment:
Q  792 caacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattatacc 891  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  39799895 caacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatact 39799994  T
Q  892 ctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39799995 ctccccttgtcgagcgttggacgtttatacc 39800025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 803 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 18392179 - 18392060
Alignment:
Q  803 gcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtc 902  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  18392179 gcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtaaatgatactctcccctcgtc 18392080  T
Q  903 gagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||    
T  18392079 aagcgttggacgtttatacc 18392060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 497 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 16253900 - 16253603
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  16253900 aaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaagcca 16253801  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || |||| || |  | ||||| | |||| ||||     ||   |||||  || |||||||||||||||||||| |     
T  16253800 gtctaacaagaatttaatattttgaatggaacaatagaactgccgggtgaaa-gcttgggaact-atcgtttaacaagtttgaattacctcatttcaga- 16253704  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||||||||||||||||||| |    || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  16253703 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgtatt-ccctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgtcgataatatctttagttgatctcagcaac 16253605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 827 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 34639083 - 34638988
Alignment:
Q  827 tgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34639083 tgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgttgagcgttggacgtttatacc 34638988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 689 - 839
Target Start/End: Original strand, 27650378 - 27650527
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatct 788  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  27650378 ttcagaggtaagtcaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatct 27650476  T
Q  789 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaa 839  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||    
T  27650477 cagcaacgtgacaaacatatcgatccacggtaacatgttgtgttgccaaaa 27650527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41498606 - 41498509
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  41498606 taccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 41498509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 39799827 - 39799525
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39799827 cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggc 39799728  T
Q  520 ttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaacca-gtctaacaataatttaatctt 616  Q
     || ||||||||  |||||| |||||  || | |||||   ||| ||| ||| ||||| || |||  | |||||| || | ||||||| |||||| ||||    
T  39799727 -tggtttagatgtaggtatt-aagtgtgaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccagcgtctaaagcacgcctaacaaaaatttattctt 39799631  T
Q  617 ttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagtt 715  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||| |  |||| ||| ||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  39799630 ttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagtcct-gttgttttgcaggtttgaatttatccca-ttcaaaggtaacacaattgttgtggtt 39799534  T
Q  716 ggaatgcac 724  Q
    |||||||||    
T  39799533 ggaatgcac 39799525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 42120238 - 42120565
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgttttc-ctt 494  Q
    |||||||| |||| || || |||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||  | ||||||||||  |||    
T  42120238 ttccaactacaacgattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacgaccatgaatcaagcatttcgcccagcgttcatgttttttctt 42120336  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || | | |||||||||    
T  42120337 tgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaatatcatcatctaaa 42120433  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttc 691  Q
     || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| | || ||   |||||||| |||||||||  | |  |||    
T  42120434 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggtgcaatgcttgagtcatgtt-gtttggcaagtttgaattttccccattc 42120532  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42120533 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42120565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Original strand, 19471184 - 19471277
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19471184 taccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggaatcctgccgtttaacaagtttgaa-ttactccattca-gaggaagacaattgttgcagttgga 19471277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 40676898 - 40676803
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  40676898 taccatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagttctgctgtttagcaagtttaaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttgga 40676803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 16582050 - 16582376
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||    
T  16582050 ttccaactgcaacaattggcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaagtatttcgctcggcattcatgtttttcctt 16582148  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| || || || ||| |||||||||    
T  16582149 tgaaaagattaaattcttgttagaatgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcaattgaataccatcatctaaa 16582245  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || | || ||   |||||||| ||||||| | ||| ||||     
T  16582246 gcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaa-catgaatgccgagtgaaatgtttgagtcatgtt-gtttggcaagtttgaactgaccccatt- 16582342  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16582343 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 16582376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24108314 - 24108217
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24108314 taccatcattcaagatgctgatcgagtactggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 24108217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 5420846 - 5420929
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5420846 atgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgcctcattcagaggcaagacaattgttgcagttggaag 5420929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 398 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 10360179 - 10359854
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttccttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||    
T  10360179 ttccaactacaacaattgtcttacctcaaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccaacgttcatgtttttccttt 10360081  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa- 592  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||| | ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || | | |||||||||     
T  10360080 gaaaagattaaattcttgttatgctag-tttagatgaaggtaat-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaatatcatcatctaaag 10359984  T
Q  593 ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttc 691  Q
    | || ||||   |  |||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| | || | |  |||||||| ||||||| ||||| || |||    
T  10359983 caagcctaaattttttttattctttttaaaggaaaaacatgaatgcggggcaaaatgcttgagtcat-gttgtttggcaagtttgaatttacccca-ttc 10359886  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359885 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 10359854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Original strand, 42264131 - 42264222
Alignment:
Q  14 aataacatggttattaattgcaaatttagacattaataatgttagttgtttaggtgaaattaagatttagttaaaaacaatgggggattagg 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42264131 aataatatggttattaattggaggtttagacattaataatgttacttgttttggtgggattaagattgagttataaacaatgggggattagg 42264222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 497 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 6902426 - 6902304
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||| |||||| ||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6902426 aaaagattaaattcttgttaggctcgacttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaaacca 6902327  T
Q  596 gtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  6902326 gactaacaagaatttaatctttt 6902304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19471138 - 19471044
Alignment:
Q  244 catcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || ||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19471138 catcattcaagatgatcatcgcatgctggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttactccattcaggggtaagataattgttgcagttggaag 19471044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 724
Target Start/End: Original strand, 22493527 - 22493824
Alignment:
Q  427 aatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgct 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||  | |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| ||| | |    
T  22493527 aatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaggcatttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttgttatgctgg-t 22493624  T
Q  525 ttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaacca-gtctaacaataatttaatcttttcaa 621  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | |||  |||| || ||| ||||||||| || | ||||||| || ||| |||||||||    
T  22493625 ttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcattggaacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaaattattcttttcaa 22493722  T
Q  622 aggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 721  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||     |||||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22493723 atgaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcatgttgtgttggcaagtttgaattttcccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 22493821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 687 - 797
Target Start/End: Original strand, 31991885 - 31991994
Alignment:
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgat 786  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||    
T  31991885 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgagaatatcttcagttgat 31991983  T
Q  787 ctcagcaacgt 797  Q
    ||| |||||||    
T  31991984 ctctgcaacgt 31991994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2918885 - 2918788
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2918885 taccatcattcaagatgctcatcgcatggtggaatcatgttgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggcaagataattgttgcagttggaag 2918788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 17425479 - 17425576
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  17425479 taccatcattcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 17425576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17538460 - 17538363
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||  || | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17538460 taccatcattcaagatgctgatcgaatgttgaagtcctgctatttagcaagtttgaattcgctccattcaagggtaagacaattgttgcagttggaag 17538363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 497 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 20148577 - 20148448
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |   |||||| ||||| ||    
T  20148577 aaaagattaaattctttttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacttcatttaaacaag 20148478  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
     ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  20148477 cctaacaagaatttaatattttgaaaggaa 20148448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 398 - 509
Target Start/End: Original strand, 39394117 - 39394230
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcattt-cacccgacattcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||| |||||    
T  39394117 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacatgtcaaacaacatgactcaagcattttcgctcagcattcatgtttttccttt 39394216  T
Q  496 gaaaagaataaatt 509  Q
    ||||||| ||||||    
T  39394217 gaaaagattaaatt 39394230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 344
Target Start/End: Original strand, 42120718 - 42120807
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42120718 atgctgatcgaatattggattcctgctgcttagcaagtttgaatttgtcccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 42120807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 499 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 29111580 - 29111468
Alignment:
Q  499 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||||||     
T  29111580 aagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgtattccttgacacttaaataccttcatttaaaccagc 29111481  T
Q  598 ctaacaataattt 610  Q
    ||||||| |||||    
T  29111480 ctaacaagaattt 29111468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 436 - 715
Target Start/End: Original strand, 32734911 - 32735191
Alignment:
Q  436 aattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgat 533  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| ||||||| |     
T  32734911 aattcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaatattaaattattgttagg-ttggtttagattaa 32735009  T
Q  534 ggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaaca 631  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||  |   ||| ||  ||||| || ||| ||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  32735010 ggtatt-aagtgtcaaggaatggacctcatttcgttagcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaaca 32735107  T
Q  632 tgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagtt 715  Q
    |||||| || | ||||||||| | || | |  |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32735108 tgaatgtcgggggaaatgcttgagtcat-gttgtttggcaagtttgaatttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 32735191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8557241 - 8557138
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||| | |||| ||  |||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8557241 taccatcattcaagatgttgatcgtatggtggactcctgctgcttagcaagtttgaatttaccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaagat 8557142  T
Q  341 gcat 344  Q
    ||||    
T  8557141 gcat 8557138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 720
Target Start/End: Original strand, 18393614 - 18393898
Alignment:
Q  436 aattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgat 533  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||     
T  18393614 aattcaaacttgccaaacgactaggactcaagtatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaa 18393712  T
Q  534 ggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaac 630  Q
    |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | ||  ||| || || || ||  ||||||||| |||||    
T  18393713 ggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaaggttaataaaaaatttattctttcaaagg-aaaac 18393809  T
Q  631 atgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 720  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||| |  ||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393810 atgaatgccgggggaaatgcttgagtcct-gttgtttgacaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 18393898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34521258 - 34521152
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || |||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  34521258 taccatcattcaagatgctcatcgcatgctcgagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggt 34521159  T
Q  341 gcattca 347  Q
     ||||||    
T  34521158 acattca 34521152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 35492280 - 35492377
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  35492280 taccatcattcaagatgcttatcggatgctggagtcttgttgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 35492377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 43983415 - 43983512
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  43983415 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 43983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 12968281 - 12968162
Alignment:
Q  399 tccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttccttt 495  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||    
T  12968281 tccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgaccatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttccttt 12968183  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgtta 516  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  12968182 gaaaagattaaattcttgtta 12968162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 337
Target Start/End: Original strand, 23408405 - 23408501
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    |||||||||| || |||||||||| || || || |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  23408405 taccatcattgaagatgctcatcgcatgctagagtcctgctgtttaacaagtttgaattttccccattcatgggtaagataattgttgcagttggaa 23408501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 3942114 - 3942197
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||  |||||||||||||||||    
T  3942114 atgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcaatggtaagatgattgttgcagttggaag 3942197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22002467 - 22002378
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22002467 atgctcatcgaatactggagtcctgcagattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 22002378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 22002538 - 22002621
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  22002538 atgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 22002621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 618
Target Start/End: Original strand, 2919115 - 2919245
Alignment:
Q  489 ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcat 587  Q
    |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | |||   |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  2919115 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagcgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaataccttcat 2919214  T
Q  588 ctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  2919215 ttaaaccggtctaacaagaatttactctttt 2919245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 663 - 797
Target Start/End: Original strand, 18036087 - 18036220
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    ||||| ||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18036087 cgtttagcaagtttaaaatatctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-tcctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaa 18036185  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
     | ||||  |||| || | |||||||| |||||||    
T  18036186 ttgttgagaatatttttagttgatctctgcaacgt 18036220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2154988 - 2154903
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2154988 tgatcaatccttgagataagtttaaatctatttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaagatttgtcttggggtat 2154903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39799386 - 39799289
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  39799386 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 39799289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 43492144 - 43492240
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  43492144 taccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttaaattttc-ccatccaggagtaagataattgttgcagttggaag 43492240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 337
Target Start/End: Original strand, 29073734 - 29073830
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  29073734 taccagcattcaagatgctgatcgaatactagggtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaa 29073830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 29906808 - 29906950
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||  || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||    
T  29906808 ttccaactacaacaactgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctt 29906906  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  29906907 tgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 29906950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 8557504 - 8557380
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| || | || ||   |||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  8557504 ctaacaaaaatttattcttttcaaag-aaaaacatgaattccgggtgaaatgtttgagtcatgtt-gtttggcaggtttgaatttatcccatt-caaagg 8557408  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8557407 taagacaattgttgtagttggaatgcac 8557380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 827 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 16253594 - 16253499
Alignment:
Q  827 tgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  16253594 tgtgctcccaaaacatgctgctcacgttatcgtcgttctttaattccacccaacttaatgatattctcccatcgttaagtgttgggcgtttatacc 16253499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17425422 - 17425333
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17425422 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 17425333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 24108212 - 24108283
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  24108212 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 24108283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 39799443 - 39799532
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39799443 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 39799532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 3937044 - 3936905
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| |||||||    
T  3937044 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttg 3936947  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  3936946 aaaatattaaatttttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 3936905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 337
Target Start/End: Original strand, 22493977 - 22494059
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  22493977 atgctgatcaaatattggagtcctgttgcttagcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaatttttgtagttggaa 22494059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 43983082 - 43983221
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| |||||||    
T  43983082 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttg 43983179  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  43983180 aaaatattaaatttttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 43983221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Original strand, 6977534 - 6977627
Alignment:
Q  245 atcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||  ||||||||||||| |||||||  |||| ||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  6977534 atcatttaaaatgctcatcgcatgttggagtcctgttgtttagcaagtttaaatttgcctcatttagatgtaagataattgttgcagttggaag 6977627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 700 - 797
Target Start/End: Original strand, 15891609 - 15891705
Alignment:
Q  700 gacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||    
T  15891609 gacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatattctagcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctccgcaacgt 15891705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 19471039 - 19471116
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19471039 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggagtaaattcaaacttgctaaacaacaggactccagcat 19471116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 34521156 - 34521233
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  34521156 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactcgagcat 34521233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 35492382 - 35492305
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  35492382 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacaacaagactccagcat 35492305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3942202 - 3942146
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3942202 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccattgaatggggcaaattcaaacttgc 3942146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Original strand, 34521394 - 34521458
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34521394 acgttagtacctcccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattgaaacttgccaa 34521458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 42241079 - 42240937
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgttttc-ctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| || ||||| |||||||||| |||||  | | |||||||||||||| | || ||||||||||||  |||    
T  42241079 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgttttttctt 42240981  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  42240980 tgaaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt 42240937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 373
Target Start/End: Original strand, 2919319 - 2919378
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatcttttgg 373  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2919319 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttttgg 2919378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 3936636 - 3936726
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| || ||||    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3936636 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt-gccccatcgcagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 3936726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6977130 - 6977033
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6977130 tggagtcctgccgtttggcaagtttgaattacc-ccattcagagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctt 6977033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Original strand, 17425037 - 17425154
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  17425037 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgc 17425135  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  17425136 -tggtttagatgaaggtatt 17425154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Original strand, 24936491 - 24936554
Alignment:
Q  275 tcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  24936491 tcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcactggtaagataattgttgcagttggaag 24936554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Original strand, 25685147 - 25685210
Alignment:
Q  275 tcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  25685147 tcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcactggtaagataattgttgcagttggaag 25685210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Original strand, 29067977 - 29068094
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||   |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||    
T  29067977 cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttcgcaagaacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgc 29068075  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  29068076 -tggtttagatgaaggtatt 29068094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 460
Target Start/End: Original strand, 2918785 - 2918851
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatga 460  Q
    |||||||||||| |||||||  | || ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2918785 taccttccaactgcaacaattatcttgcccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacatga 2918851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 8556646 - 8556692
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  8556646 actccataaactttttaccgtgggtaaaaggatttgtcttggggtat 8556692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 12967782 - 12967828
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  12967782 actccataaactttttaccgtgggtaaaaagatttttcttggggtat 12967828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 338
Target Start/End: Original strand, 16582538 - 16582612
Alignment:
Q  264 gaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  16582538 gaatactggagtcatgctggttagcaagtatgaatttgccccgttcagtggtaagataattgttgcagttggaag 16582612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 41498504 - 41498581
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  41498504 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcat 41498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 790 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 17112451 - 17112399
Alignment:
Q  790 agcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacat 842  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  17112451 agcaacgtcacccgcatatcaatccattagaacatattgtgctcccaaaacat 17112399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 32736821 - 32736881
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32736821 ttagccagtttgaatttgccccattcagcagcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 32736881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 34521587 - 34521693
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctact 360  Q
    |||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||  | |||||||  || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| |    
T  34521587 atcgaatattggagtcctaccgtttggcaagtttgaattacc-ccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaat 34521684  T
Q  361 gacgatctt 369  Q
    |||||||||    
T  34521685 gacgatctt 34521693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 19471588 - 19471643
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19471588 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 19471643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35491887 - 35491832
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  35491887 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 35491832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Original strand, 10364192 - 10364250
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatt 299  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  10364192 taccaacattcaaaatgttcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaatt 10364250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 10364326 - 10364296
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10364326 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 10364296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 22002060 - 22002132
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  22002060 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 22002132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22495622 - 22495560
Alignment:
Q  146 acccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22495622 acccttgggataagtttaaatttgcatttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaa 22495560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 330
Target Start/End: Original strand, 28476214 - 28476284
Alignment:
Q  260 catcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgca 330  Q
    ||||||||||| |  | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  28476214 catcgaatactagggttctgctgcttagcaagtttgaatttgctccattcagtggtaagatgattgttgca 28476284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 663 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 29111765 - 29111704
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaatta-cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29111765 cgtttggccagtttgaatttgcctcattt-aaaggtaagataattgttgtagttggaatgcac 29111704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 448
Target Start/End: Original strand, 17538357 - 17538414
Alignment:
Q  391 ttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  17538357 ttgtaccttccaactgcaacaattgtcttacccttgaatggagcgaattcaaacttgc 17538414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 724
Target Start/End: Original strand, 29111625 - 29111665
Alignment:
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29111625 cctcattt-aaaggtaagataattgttgtagttggaatgcac 29111665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Original strand, 41498663 - 41498742
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  41498663 atgcacatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaa-ttgccccattca-gaggaagacaattgttgtagttgga 41498742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 128)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 921
Target Start/End: Original strand, 39476903 - 39477425
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39476903 ttccaactataacaattgtcttacctttgaatgatgtaaattcaaacttgtcaaacagcaggactaaaacatttcacccggctttcatgttttcctttga 39477002  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  39477003 aaaga-taaatttttgttaggtttgctttagatgatggtattcaagtgccaacaaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 39477101  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  39477102 ctaaaaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagcggt 39477201  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39477202 aagataattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttaatgatatctttagttgatctcagcaacgt 39477301  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  39477302 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgatatcctcccc 39477401  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39477402 tcgtcgagcgttggacgtttatac 39477425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 910
Target Start/End: Complemental strand, 41218158 - 41217647
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41218158 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggccaaatttaaacttgccaagcaacatgactcaagcatttcccccgtcattcatgttttcctttga 41218059  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  41218058 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 41217959  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  41217958 ctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaa-catgaatgctgagcgaaatgcttgagtccaggccctttggtaagtttgaattaccccatatcagaggt 41217860  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41217859 aagacaattgctgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 41217760  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||     
T  41217759 tacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcactttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccc 41217660  T
Q  898 tcgtcgagcgttg 910  Q
    |||||||||||||    
T  41217659 tcgtcgagcgttg 41217647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 17183761 - 17183233
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||    
T  17183761 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcattttgcctcgcattcatgtttttcctttg 17183662  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17183661 aaaataataaacttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 17183562  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |  |||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  17183561 cataacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaacactggacgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagagg 17183462  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgac---gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagca 793  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17183461 taagacaattgttgcagttggaatgcacctcaccctaactaatgacgatgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagca 17183362  T
Q  794 acgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccct 893  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  17183361 acatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgcttccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattct 17183262  T
Q  894 cccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||    
T  17183261 tccctcgtcgagtgttggacgtttatacc 17183233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 401 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 34141407 - 34140886
Alignment:
Q  401 caactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaa 499  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||||||||    
T  34141407 caactacaacaattgtcttacctttgaatggagtaaattcaaactggcctaacaacaggactcaagtatttcgccccgcgttcatgtttttcctttgaaa 34141308  T
Q  500 agaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtct 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  34141307 agaataaatttttgttagacttgctttagatgatggtattcaagtgccaacaaaatgaggttcattgcttgacacttaataccttcatctaaaccagcat 34141208  T
Q  600 aacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaa 699  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||| || |||| ||||||    
T  34141207 aacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctg-gcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaattaccccaattcagaggtaa 34141109  T
Q  700 gacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtca 799  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34141108 gagaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtca 34141009  T
Q  800 cccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatc 899  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  34141008 cccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaaatgaatgatactctcccctc 34140909  T
Q  900 gtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  34140908 gtcgagcgttggatgtttatacc 34140886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 418 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 40589073 - 40588570
Alignment:
Q  418 ttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttag 517  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40589073 ttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagtatttcgctcgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttag 40588974  T
Q  518 gcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttt 617  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  40588973 gcttgctttagatgatgatattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcctaacatgaatttaatcttt 40588874  T
Q  618 tcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttg 716  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40588873 tcaaaggaaaaatatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaagacaattgttgcagttg 40588776  T
Q  717 gaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccac 816  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40588775 gaatgcaccttaccctgactaatgacgatcttctggccgaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccac 40588676  T
Q  817 tgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtt 916  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  40588675 tggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagcgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtt 40588576  T
Q  917 tatacc 922  Q
    ||||||    
T  40588575 tatacc 40588570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 18238110 - 18237585
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||||||| ||||||    
T  18238110 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactagccaaacaacaggactcaagcatttcgcctcgcgttcatgtttttcctttg 18238011  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18238010 aaaattataaatttttgttaggctttctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcgttgacacttaataccttcatctaaaccag 18237911  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |  | || |||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||| || |||| |||    
T  18237910 cataacaagaatttaatcttttgaaaggaaaaatatgaacgatgggccaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgagttaccccaattcagagg 18237811  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18237810 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg 18237711  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | |||||    
T  18237710 ttacccgcataccgatccactggaacatgatgtgctcccaaaatatgctcgtcatgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatcctctccc 18237611  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     | |||||||||| ||||||||||||    
T  18237610 cttgtcgagcgttagacgtttatacc 18237585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Original strand, 48220406 - 48220928
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  48220406 ttccaactacaacaattgtctcacctttgaatggggcaaattcaaacttgccaaacaataagactcaagcatttcgccccgcattcatgtttttcctttg 48220505  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccag 596  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48220506 -aaagaataaatttttgttaggcttactttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccag 48220604  T
Q  597 tctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaagg 696  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||| | || |||||||||| || |||||||||| | ||||||| ||     
T  48220605 cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgttggacgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaattagcccatttcagagc 48220704  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  48220705 taagataattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaccg 48220804  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  48220805 tcacctgcatattgatccactggaacatgctgtgctccc--aacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccaccaaagtgaatgatactctccc 48220902  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  48220903 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 48220928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 30361061 - 30360538
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  30361061 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaattgggtaaattcaaattcgccaaacaacaggactcaagcatttcgcccgacattcatgtttttcctatg 30360962  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  30360961 aaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcctttacacttcaataccttcatctaaacca 30360862  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| || |   || | ||||||||| ||||||||||||  |||||| |     
T  30360861 gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgttgggcg-aatg-ttgaggacttgtcgtttggcaagtttgaattacccaatttcagat 30360764  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30360763 gtaagacaatagttatagttggaatgcacattaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactttttatgatatcttcagttgatctcagcaac 30360664  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    | |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30360663 g-cacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgttacgttttcgtcgttttttaattccacccaagtgaatgatactctcc 30360565  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||    
T  30360564 cctcgtcgagcgttgtacatttatacc 30360538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 398 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 17839854 - 17839347
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17839854 ttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcaccccgcattcatgttttcctttga 17839755  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||           |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17839754 aaagaataaatttttgttaggcgtgttttagatgatggtattc---tgct----------ggtttattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 17839668  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||   |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||    
T  17839667 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caaagg 17839570  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttct-ggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17839569 -aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatctttttggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctaagcaac 17839471  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17839470 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 17839371  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttat 919  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  17839370 cctcatcgagcgttggacgtttat 17839347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 402 - 921
Target Start/End: Original strand, 45362919 - 45363428
Alignment:
Q  402 aactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaag 501  Q
    |||| ||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  45362919 aactgcaacaattgtcttacctttaaatgagataaattcaaacttgttaaacaacaggactcaaacatttcgctcgacattcatgttttcctttgaaaag 45363018  T
Q  502 aataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaa 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  45363019 aataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttgattccttgacacttaataccttcttctaaaccagcctaa 45363118  T
Q  602 caataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaaggtaag 700  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  45363119 caagaattcaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttgacaggtttgaatttatctca-ttcaaaggtaag 45363216  T
Q  701 acaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcac 800  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||        
T  45363217 acaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacg---- 45363312  T
Q  801 ccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcg 900  Q
         ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||| | || |||   |||    
T  45363313 -----tatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcatttgttaattccacccaagtgaatgaaactctctgctcg 45363407  T
Q  901 tcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45363408 tcgagcgttggacgtttatac 45363428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 20565303 - 20564780
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  20565303 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 20565204  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20565203 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 20565104  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  20565103 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 20565006  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20565005 g-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 20564907  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  20564906 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 20564807  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  20564806 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 20564780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 398 - 861
Target Start/End: Original strand, 9366783 - 9367245
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  9366783 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 9366882  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9366883 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 9366982  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||| |  ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  9366983 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcct-gttgtttgacaagtttgaattacctca-ttcaaag 9367080  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9367081 g-aatacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 9367179  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttg 861  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9367180 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgttg 9367245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 10523613 - 10523089
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||| |||    
T  10523613 ttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgtgataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcattacaccaagcacttcatgttttcccttt 10523514  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10523513 gaaaataataaatttttgtaagacttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 10523414  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
       ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | ||||    ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  10523413 acataaaaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctttt-gtttgacaagtttgaattaccacatt-caaag 10523316  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||    
T  10523315 g-aagacaattgttgtagttggaatacaccttaccctaactaatgacgattttcaggcggaatcaaacttttgatgatatattcagttgatctaagaaac 10523217  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccac-tgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctc 894  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  10523216 ttcacccgcatatcgatccacaagaaacatgtggtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaacaaagtgaatgatactctc 10523117  T
Q  895 ccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  10523116 ccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 10523089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 398 - 797
Target Start/End: Original strand, 26601440 - 26601839
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttccttt-g 496  Q
    |||||| | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||  |||||||||||| |||| |    
T  26601440 ttccaagtacaacaattgtcttaccttttaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcggttcgccccgcattcatgtttttcttttg 26601539  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  26601540 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgagattcattccttgacacttcaataccttaatataaacca 26601639  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| || |   ||   |||||| || |||||||||||| ||||||| ||    
T  26601640 gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgttgggcg-aatg-ttgaggacttttcgtttgacaagtttgaattaccccatttcagag 26601737  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26601738 gtaagataattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactattgatgatatcttcagttgatctcaacaac 26601837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 398 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 13920850 - 13920431
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcaccc-gacattcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||  |  ||  |||||||||||| |||    
T  13920850 ttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaactacaggactcaagcatttcgtcaagaacttcatgttttcccttt 13920751  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13920750 gaaaagaataaatttttgttaggcctgctttagatgatggtattcaagtgccactgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 13920651  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||| |  ||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  13920650 gcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggttcttgcgaaatgctcgagtcct-gttgtttgacaagtttgaattacccca-ttcaaag 13920553  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13920552 g-aagacaattgttgtagttggaatgcatcttaccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 13920454  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactg 818  Q
     ||||| ||||||||||||||||    
T  13920453 ttcacctgcatatcgatccactg 13920431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 487 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 2356742 - 2356310
Alignment:
Q  487 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttc 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  2356742 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaatgaaatgaggttcattccttgtcactttaatacattc 2356643  T
Q  586 atctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacct 685  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||     |||||| |||| ||| ||||||||| ||     
T  2356642 atctaaaccagcctaacaagaatttaattttttcaaaggaaaaaaatgaatgatgggcgaa-tgctggggacctggc-gtttagcaagtttgaatttcc- 2356546  T
Q  686 catttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattga 785  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||    | || ||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2356545 -atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaagatgcatttccctacctaatcacggtcttatagcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttga 2356447  T
Q  786 tctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaat 885  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2356446 tctcaacaacgttactcgcatatcgatccattggaacatgctgttctcccaaaacatgctcgtcacatttttgtcgttcgttaattccatccaagtgaat 2356347  T
Q  886 tataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  2356346 gatactctcccctcttcgagcgttggatgtttatacc 2356310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 398 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 34157349 - 34157097
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34157349 ttccaactacaacaatt-tgttacctttgaatgagatagattcaaacttgtcaaacaacaagactcaagcatttcacccggcattcatgttttcctttga 34157251  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  34157250 aaagaataaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgtcaacgaaatgaggttcattccttgacatttaataccttcatctaaaccagc 34157151  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 651  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157150 ctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 34157097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 48271204 - 48270669
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||  ||| || ||||       
T  48271204 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactctaatattcgacc-gatattccca 48271106  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||||  || || |||| | |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   ||||| || ||||||||||||||| || |||    
T  48271105 atgtt--ccattcaaaatattaaattcttgttaggctgggattacatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgatgtccattccttgacacttcaatacc 48271008  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   |||||   | |||| |  || |  |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  48271007 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgttcatcgaa-tatttgagacctg-ccgtctggcaagtttgaatta 48270910  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||    || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48270909 ccccatt--aaaagaaagacaattgttgtagttggaatgtgcattcattccgtacctaacgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 48270812  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||    
T  48270811 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaa 48270712  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  48270711 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtctatacc 48270669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 371 - 922
Target Start/End: Original strand, 15337540 - 15338091
Alignment:
Q  371 tggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||     
T  15337540 tggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaatgaggtaaatttaaacttgccaaacagcaggactccaatata 15337639  T
Q  471 tcacccgaca-ttcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcctt 569  Q
     |  | |||  |||  || |||  || |||||  |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  15337640 -cgtctgacgcttctagtgttcaattcaaaagtttaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattcctt 15337738  T
Q  570 gacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttg 668  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| || ||||||| |  |||||||| |||| | ||  |  | || | |||||    
T  15337739 gacacttcaaaaccttcatctaaaccggcctaacatgaatttaatcttttgaatggaaaaatagaaatgccgatcgaa-tactggagacatgtc-gtttg 15337836  T
Q  669 gcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactt 765  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15337837 gcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttttagttagaaggtgcattcattccatacctaatgacgatcttctggcggaatcagactg 15337934  T
Q  766 ttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttct 865  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||      
T  15337935 tttataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactgaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgtttg 15338034  T
Q  866 ttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  15338035 ttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgttgagcgttgaacatttatacc 15338091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 36393476 - 36394010
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcat- 485  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||||| |  |||  ||| |||||||       
T  36393476 acgtttgtaactcccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagatgtaggactccaatattcgacc-gacattccca 36393574  T
Q  486 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    || |||| || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  36393575 gtgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 36393674  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | || || |||  ||||||||  | ||||  |  || |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  36393675 catttaaaccagcctaacaagaatttaatctttg-acagaaacaacgggaatgccggtc-aaatattggaaacctgtc-gtttggcaagtttgaattacc 36393771  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
     |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||  | | |  || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36393772 ccatt-caaagg-aagacaattgtcgtagctggaaggtgcattcattcagtacctaatgaagatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 36393869  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  36393870 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatattgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacacaagt 36393969  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36393970 gaatgatattctcccctcgtcgagtgttggacgtttatacc 36394010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 663 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 47269178 - 47268920
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47269178 cgtttggcaagtttgaattaccccatttcacaggtaagctaattgttgtagttggaatgcatcttaccctaattaatgacgatcttttggcggaatcaaa 47269079  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgt 862  Q
     | |||||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  47269078 ttgttgatgatatttttagttaatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 47268979  T
Q  863 tctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47268978 tctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgctggacgtttatac 47268920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 21186950 - 21187485
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |  |||  ||| | |||||       
T  21186950 acgtttgtaacttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttcccaagcagcaggactccaatattcgaccgg-cattccca 21187048  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    ||| |  || || |||||| |||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||     
T  21187049 atgat--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataca 21187146  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||| ||   ||||||||  |||| |  || |  |||| ||||||| || ||||||||||    
T  21187147 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacgggaacaatgggaatgccggtcgaa-tatttgagacctg-ccgtttgacaagtttgaatta 21187244  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||| || ||  ||||  | | |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21187245 cctcatt-caaagg-aagacaattattgtagctgaaaggtgcattcattcagtacctaatgacgatcttctgacggaatcaaacttttgatgatatcttc 21187342  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||||| ||||||    
T  21187343 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcaatcgttaattctacccaa 21187442  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21187443 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 21187485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 30354466 - 30355001
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||  ||| |||||||       
T  30354466 acgtttgtacctcccaactacaacaactgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgacc-gacattccca 30354564  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    ||||| |   || |||||| ||||||||||||||| | |  ||| |||| ||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  30354565 atgttcta--ttcaaaagattaaatttttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaatacc 30354662  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |     |||||||  |||| |  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  30354663 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacagtggaaatgccggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttggcaagtttgaatta 30354760  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30354761 cctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttttggcagaatcaaacttttgatgatatcttc 30354858  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30354859 agctgatctcagcaacgtcatccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 30354958  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  30354959 gtgaatgatacgctcccctcgtcgaacgttggacgtttatacc 30355001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 391 - 922
Target Start/End: Original strand, 46861849 - 46862380
Alignment:
Q  391 ttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc---atgt 487  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |  |||  ||| |||||||   ||||    
T  46861849 ttgtaccttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactttccaagcagcaggactccaatattcgacc-gacattcccaatgt 46861947  T
Q  488 tttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttca 586  Q
    |  || || |||||| |||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||| |||||||||| || |||||||    
T  46861948 t--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatttcttgacacttcaataccttca 46862045  T
Q  587 tctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctc 686  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||  ||   ||||||||  ||||    ||  |  |  ||||||||||| |||||||||||| |    
T  46862046 tttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggagcaatgagaatgccggtcgaata--ttggagacatgccgtttggcaagtttgaattacccc 46862143  T
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaatt 783  Q
    |||  ||||  |||||||||||||||  |||||  ||||  | | || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  46862144 attcaaaag--aagacaattgttgtatctggaaggtgcattcattccgtaccttatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatcatatcttcagtt 46862241  T
Q  784 gatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtga 883  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  46862242 aatctcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacaagctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtga 46862341  T
Q  884 attataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46862342 atgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 46862380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 642 - 852
Target Start/End: Original strand, 2205943 - 2206153
Alignment:
Q  642 gcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatga 741  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2205943 gcgaaatgcttgagtcatggtcgtttgacaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttatcctaactaatga 2206042  T
Q  742 cgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaaca 841  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2206043 cgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatattgtgctcccaaaaca 2206142  T
Q  842 tgctcgtcaca 852  Q
    |||||||||||    
T  2206143 tgctcgtcaca 2206153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 553 - 922
Target Start/End: Original strand, 48314997 - 48315366
Alignment:
Q  553 aatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 651  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  |    
T  48314997 aatgaggttcattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgataggaacaatgggaatgccggtcgaa-tatt 48315095  T
Q  652 taaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatctt 748  Q
      |  |||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||||  ||||  | | || || ||||||||||||||    
T  48315096 ggagacctg-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaatg-aagacaatcgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 48315192  T
Q  749 ctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgt 848  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48315193 atggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatctactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgt 48315292  T
Q  849 cacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || | ||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  48315293 cacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatgctctcctctcgttgagcgttggacgtttatacc 48315366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 387 - 922
Target Start/End: Original strand, 28114044 - 28114579
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattcat 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||  ||| |||||      
T  28114044 acgtttgtaccttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcaacatgactcca--atgttcgaccggcattctc 28114141  T
Q  486 gtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacct 583  Q
     |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| |||   ||||||||  |||| ||||||||| || || |    
T  28114142 atagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgactgtattcaagtgtcaaaagaatgaggtcaattcattgacacttcaatacat 28114241  T
Q  584 tcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| ||  |  | || || |||||||| | ||||||||||    
T  28114242 tcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaacat--tggagtcgtg-ccgtttggaaagtttgaatta 28114338  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcacct-taccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || |||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  28114339 ccacatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcatttattcggtacctaatgacaatcttttgacagaatcaaatttttgatgatatcttc 28114436  T
Q  780 aattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaa 879  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28114437 agttgatctcagcaacgtcacccacatttcgatccattggaacatgttgtgctcctaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 28114536  T
Q  880 gtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28114537 ctgaatgatactctcccctcgtcgggcgttggacgtttatacc 28114579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 661 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 41049066 - 41048804
Alignment:
Q  661 gccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaa 757  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | |  | || |||||||||||||||||||||||    
T  41049066 gccgttttgcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcatttcgtacctaatgacgatcttctggcggaa 41048969  T
Q  758 tcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttc 857  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  41048968 tcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcgcgttttc 41048869  T
Q  858 gttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41048868 gtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcacctcgtcgagcgttggacgtttatacc 41048804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 373 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 21651093 - 21650547
Alignment:
Q  373 gacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||  |||      
T  21651093 gacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgggataaattcaaacttgccaagcagcaggactcaaatattcg 21650994  T
Q  473 acccgacattcatgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttga 571  Q
    ||| |||||||   || |||| || |||||| |||||| |||||||| | |  ||| || |||||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||    
T  21650993 acc-gacattctcattgttccattcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaattatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattctttga 21650895  T
Q  572 cactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggc 670  Q
    || || || |||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||| || |||| || ||   ||||| ||   ||| |  |  | ||||| | |||||||    
T  21650894 cagttcaataccttcatttaaactggcctaacaaaaattgaatctcttgaaagaaacaatgggaatgtcggttgaa-tattggagtcctg-ctgtttggc 21650797  T
Q  671 atgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactttt 767  Q
    | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | |  | ||    |  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||    
T  21650796 aagtttgaattacc-catt-caaagg-aagacaattgttgtagctggtaggttcattcattcggtaactaatgatgatcttatggcggaatcagactgtt 21650700  T
Q  768 gatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttcttt 867  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21650699 gataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcgatccactggaacatgttgtgatcccataacatgctcgtcacattttcgtcgttcgtt 21650600  T
Q  868 aattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21650599 aattcctcccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttata 21650547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 698 - 922
Target Start/End: Original strand, 20378665 - 20378889
Alignment:
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | || || ||||||||| |||||||||||||| |    
T  20378665 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttactctaactaatgatgatcttctggcggaatcaagttgttaattatatcttcagttgatctcagcaacat 20378764  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  20378765 cacccgcatatctgtccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccc 20378864  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| | || |||||||||||||||    
T  20378865 tcgttgtgcattggacgtttatacc 20378889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 661 - 921
Target Start/End: Original strand, 43351024 - 43351284
Alignment:
Q  661 gccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaa 757  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || |||||||||||||||||| ||||    
T  43351024 gccgtttggcaagtttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattctgtacctaatgacgatcttctggtggaa 43351121  T
Q  758 tcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttc 857  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  43351122 tcagacatttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccc-catatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttc 43351220  T
Q  858 gttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43351221 gtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttatac 43351284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 674 - 920
Target Start/End: Original strand, 21614700 - 21614944
Alignment:
Q  674 tttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgat 773  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |  | || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21614700 tttgaattacctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagttgaaaggtgcatttccctacctaatcacgaacttctggcggaatcaaaattttgatgat 21614797  T
Q  774 atcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattcc 873  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  21614798 atcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcgcgttttcgtcgttcgttaattcc 21614897  T
Q  874 acccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    |||||| ||||| |||| || || ||||||||||||| |||||||||    
T  21614898 acccaaatgaatgatactcttccctcgtcgagcgttgaacgtttata 21614944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 497 - 920
Target Start/End: Original strand, 1642353 - 1642771
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || || || |||||||| |    
T  1642353 aaaagattaaatttttgttaggcttggtttaaatgatggtattcgagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacttttatctaaacga 1642452  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    | ||||||| ||||||||||||| || |||| || |  | || || | |||| ||||     ||| | ||||  || ||||||||| ||  ||||||| |    
T  1642453 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaatagaactgtcgggtgaaa-gcttgggaactgtc-gtttaacaagtttgaattccc--atttcaa-g 1642547  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  1642548 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctcaacaac 1642646  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    || || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||| | ||| |||  ||||    
T  1642647 gttacacgcatatcgatccacttgaacatgttgtgctcccaaaacatgctcctcacgttttcatcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcc 1642746  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    | |||||||| |||| |||||||||    
T  1642747 cctcgtcgagtgttgaacgtttata 1642771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 662 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 42735544 - 42735284
Alignment:
Q  662 ccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 758  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | |  || |||||||||||||||| |||||||    
T  42735544 ccgtttggcaagtttgaattaccacatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttcttgcggaat 42735447  T
Q  759 caaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcg 858  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42735446 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgattcactagaatatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 42735347  T
Q  859 ttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||  || ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  42735346 tcgttcgttaattccacccaagtgaatgataatcttcc-ccatcgagcgttggacgtttatacc 42735284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 796 - 922
Target Start/End: Original strand, 26603265 - 26603391
Alignment:
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26603265 gtcacccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgctctttaattccacccaagtgaatgataccctcc 26603364  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  26603365 cttcgtcgagcgttggacgtttatacc 26603391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 774 - 922
Target Start/End: Original strand, 28979060 - 28979208
Alignment:
Q  774 atcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattcc 873  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || | || |||||| |    
T  28979060 atcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgctcgttaatttc 28979159  T
Q  874 acccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28979160 acccaagtgaatgatactctcctctcgtcgagcgttggacgtttatacc 28979208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 28978943 - 28979065
Alignment:
Q  627 aaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacct 726  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28978943 aaacatgaatgtcgagcgaaatgctttagtcctggctgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcacct 28979042  T
Q  727 taccctaactaatgacgatcttc 749  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28979043 taccctaactaatgacgatcttc 28979065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 616 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 34139491 - 34139332
Alignment:
Q  616 tttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagt 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    | ||| || ||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34139491 tttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctatt-gcttgacaggtttgaatttatctcatt-caaagg-aagacaattgttgtagt 34139395  T
Q  715 tggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatct 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34139394 tggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatct 34139332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 673 - 807
Target Start/End: Original strand, 17320140 - 17320272
Alignment:
Q  673 gtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatga 772  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  17320140 gtttgaattaccccattt-aaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgattttatggcagaatcaaacttttgatga 17320237  T
Q  773 tatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcata 807  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  17320238 tatcttaagttgatctaagcaacttcaaccgcata 17320272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 387 - 626
Target Start/End: Original strand, 20877703 - 20877943
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |  |  ||| |||||       
T  20877703 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgcatggggtaaattcaaacttgccaagcagcacgactccagcgta-cgtccggcattccca 20877801  T
Q  487 tt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    |  |||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  20877802 tagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgatggtattgaagtgtcaaaaaaatgaggtgcattccttgacacttcaatacctt 20877901  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
    |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  20877902 catctaaacctgcctaacatgaatttaatcttttaaaaggaa 20877943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 45363235 - 45362910
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  45363235 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 45363136  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| | |||| ||||||||| || |||||| || |||||| ||||| ||| | ||| |   ||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  45363135 aaaagattgaattcttgttaggc-tggtttagaagaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatcaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagc 45363039  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | |||| |  ||||  || ||||||| ||| ||||||| |    
T  45363038 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgagcgaaatgtttgagtcct-gttgtttaacaagtttgaatttatctcattt-a 45362942  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  45362941 aaggtaagacaattgttgcagttagaatgcac 45362910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 40588773 - 40589098
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcat-gttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||  ||||||||||    
T  40588773 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcaagcatttcgctcggcattcatatttttcctttg 40588872  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| ||||||  |||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| || || || | | ||||||||| |    
T  40588873 aaaagattaaattcatgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcaattgaatatcatcatctaaagc 40588969  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |  ||||| || ||||||| ||| |||| ||||    
T  40588970 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgtcgagcgaaatacttgagtcct-gttgtttgacaggtttgaatttatctca-ttca 40589066  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  40589067 aaggtaagacaaaatttgaagttggaatgcac 40589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 616
Target Start/End: Original strand, 21614444 - 21614666
Alignment:
Q  395 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcct 493  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    ||||||||| || | |  | |  | || || |     
T  21614444 accttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaaacaacagctatcaagcatt-catctggaagttttattgtttca 21614542  T
Q  494 ttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  21614543 ttcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatttaaa 21614642  T
Q  593 ccagtctaacaataatttaatctt 616  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  21614643 ccagcctaacaagaatttaatctt 21614666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 34141089 - 34141415
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||| |||||||  | |||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| || | | |||||||||| |||||    
T  34141089 ttccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcatttcgccag-cgttcatgtttttccttt 34141187  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa- 592  Q
    ||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||  ||| ||||| || ||| |||||||||     
T  34141188 gaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-gcaatgaacctcattttgttggcacttgaataccatcatctaaag 34141284  T
Q  593 ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttca 692  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| | |||| |  ||| |||  |||||||||  |||  ||||    
T  34141285 caagtctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaacgcggggcgaaatacttgagtcct-gttgttaggccagtttgaatttactccattca 34141383  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34141384 aaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 34141415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 459 - 724
Target Start/End: Original strand, 41217900 - 41218163
Alignment:
Q  459 gactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgag 558  Q
    |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| |||  ||     
T  41217900 gactcaagcatttcgctcagcattcatgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatggac 41217997  T
Q  559 gttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaat 656  Q
     |   ||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| | |    
T  41217998 ctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgacgggggaaatgcttgagt 41218096  T
Q  657 cctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    | | |  | |||||| |||| ||||    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41218097 cat-gttgcttggcaagtttaaatttggcccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 41218163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 17839548 - 17839688
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  17839548 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 17839646  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  17839647 aaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt 17839688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 399 - 724
Target Start/End: Original strand, 34157032 - 34157354
Alignment:
Q  399 tccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttga 497  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||| | ||||||||||| || ||| ||| | ||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||    
T  34157032 tccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgtcaagcaataggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttga 34157130  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| || || ||| | |||||   ||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||    
T  34157131 aaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aaatgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttgacacttgaataccatcatctaaagca 34157227  T
Q  596 -gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat-tacctcatttcaa 693  Q
     | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | | || |  ||||| || |||||||| || |||| |||||    
T  34157228 cgcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagt-cttgttgtttgacaagtttgaatctatctca-ttcaa 34157324  T
Q  694 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34157325 aggtaaca-aattgttgtagttggaatgcac 34157354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 10224623 - 10224559
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10224623 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 10224559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 478 - 722
Target Start/End: Original strand, 30360819 - 30361064
Alignment:
Q  478 acattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacact 575  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||  || ||| |||   ||||| | ||| ||||    
T  30360819 acattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctgg-tttagatgaaggtattgaagtgtaaaggaa-tgaacctcatttcgttggcact 30360916  T
Q  576 t-aacaccttcatctaaaccagtc-taacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatg 673  Q
    | || ||| ||||||||| ||  | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |  |||||||       
T  30360917 tgaataccatcatctaaagcaagcataacaaaaatttattcttttcataggaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcct-gttgtttggcgaa 30361015  T
Q  674 tttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgc 722  Q
    ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30361016 tttgaatttacccaattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgc 30361064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 827 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 13916949 - 13916854
Alignment:
Q  827 tgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13916949 tgtgctcccaaaacatggtcatcacatttttgtcattcgttaattcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 13916854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 17183439 - 17183766
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||    |||||||||| ||||    
T  17183439 ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgtccagtgttcatgtttttcctt 17183537  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcct-tgacactt-aacaccttcatctaaa 592  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| |  || ||||| || ||| |||||||||    
T  17183538 tgaaaatattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcggtggcacttgaataccatcatctaaa 17183634  T
Q  593 cca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcattt 690  Q
     || | ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||   || |||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| ||| ||||     
T  17183635 gcaagcctaacaaaagtttattattttcaaaggaaaaacatgaatgcgaggcaaaatgcttgagtcctgtt-gtttggcaagtttgaatttaccccatt- 17183732  T
Q  691 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17183733 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 17183766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39476759 - 39476656
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| ||  |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  39476759 taccatcatttaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 39476660  T
Q  341 gcat 344  Q
    ||||    
T  39476659 gcat 39476656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9366638 - 9366541
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  9366638 taccatcgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 9366541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 436 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 48220689 - 48220401
Alignment:
Q  436 aattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgat 533  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || || |||||||||     
T  48220689 aattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcatttcgtccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaa 48220591  T
Q  534 ggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaac 630  Q
    |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||   || ||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  48220590 ggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagtaagcctaacaaaaatttattc-tttcaaaggaaaaac 48220494  T
Q  631 atgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||| | ||||||||||| | | ||    |||||||| |||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48220493 atgaatgcggggcgaaatgcttgagt-cttattgtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtgagacaattgttgtagttggaatgcac 48220401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 18237788 - 18238115
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||  || |||||||||||||||  | |||||||||||||||  |||  | ||||| |||| |||||    
T  18237788 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaattggggtaactcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttggcccatcgttcatatttttccttt 18237887  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaac 593  Q
     |||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||   ||||| | ||| ||||| || | | |||||||||     
T  18237888 caaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaacgaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaatatcatcatctaaag 18237984  T
Q  594 ca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttc 691  Q
     | | ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | |||||   |||||||  ||||||||| ||| |||| |    
T  18237985 aaagcctaacaaaaatttataattttcaaaggaaaaacatgaacgcgaggcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttggctagtttgaatttaccccatt-c 18238082  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18238083 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 18238115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 478 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 26601682 - 26601435
Alignment:
Q  478 acattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacact 575  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| || | |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||    
T  26601682 acattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctgg-tttatattaaggtattgaagtgtcaaggaa-tgaatctcatttcgttggcact 26601585  T
Q  576 t-aacaccttcatctaaacca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatg 673  Q
    | || ||| ||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||  |||| | |||||   |||||||| |    
T  26601584 tgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaagaaaaacatgaatgcggggcgaaccgcttgagtcctgtt-gtttggcaag 26601486  T
Q  674 tttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26601485 tttgaatttaccccatta-aaaggtaagacaattgttgtacttggaatgcac 26601435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 344
Target Start/End: Original strand, 30361205 - 30361308
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||| | |||| ||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  30361205 taccatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcttgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 30361304  T
Q  341 gcat 344  Q
    ||||    
T  30361305 gcat 30361308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 427 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 39477193 - 39476898
Alignment:
Q  427 aatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgct 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| | |    
T  39477193 aatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattctttttaggctgg-t 39477096  T
Q  525 ttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtc-taacaataatttaatcttttcaa 621  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   |||||   ||| ||||| || ||| ||||||||| ||  | |||||| |||||| |||||||||    
T  39477095 ttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcattttgttggcacttgaataccatcatctaaagcaaacctaacaaaaattta-tcttttcaa 39476999  T
Q  622 aggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 720  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||| || | ||||| | ||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39476998 aggaaaa-catgaaagccgggtgaaatgttttagtcctg-ctgtttgacaagtttgaatttacatcatt-caaaggtaagacaattgttatagttggaat 39476902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 40589239 - 40589322
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  40589239 atgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 40589322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 338
Target Start/End: Original strand, 17183916 - 17184002
Alignment:
Q  252 aaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  17183916 aaaatgatgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcaaaggcaagacaattgttgtagttggaag 17184002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20565404 - 20565301
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  20565404 taccattattcaagatgctcatcgaatactggagtcctgcagattggcaagtttgaa-ttgccccatcca-gggtaagacaattgttgcagttggaatgt 20565307  T
Q  341 gcattc 346  Q
    ||||||    
T  20565306 gcattc 20565301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 34141574 - 34141651
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  34141574 atcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 34141651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 392 - 626
Target Start/End: Original strand, 21614116 - 21614351
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-tt 490  Q
    ||||||||||| || |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | || | |  |||||||||   || ||    
T  21614116 tgtaccttccacctacaacaattatcatacctttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaaca-tgcgtccgacattcccattgtt 21614214  T
Q  491 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatct 589  Q
    || || |||||| |||||| |||||| | ||| || | |||| | |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |    
T  21614215 ccattcaaaagattaaattattgttaagtttggttcaaatgacgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattt 21614314  T
Q  590 aaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
    ||||| |  |||||| ||||| |||| || |||||||    
T  21614315 aaaccggcataacaagaatttgatctcttgaaaggaa 21614351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 735 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 28066463 - 28066359
Alignment:
Q  735 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcc 834  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||| ||   ||||||||||||| | ||||| ||||||| |    
T  28066463 ctaatcacgatgttctggcggaatcaaacttttgagaatatcttcagacgatctcagcaacgtgacaaacatatcgatccacaggaacatgttgtgctgc 28066364  T
Q  835 caaaa 839  Q
    |||||    
T  28066363 caaaa 28066359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 337
Target Start/End: Original strand, 42735668 - 42735764
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||| || ||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  42735668 taccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcatgctgttttgcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaa 42735764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 17840012 - 17840095
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  17840012 atgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 17840095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 42683116 - 42683207
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  42683116 atgctgatagaatactggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttgccccatttagtggtaagataattgttgtagttggaaggtgcattc 42683207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 48271340 - 48271437
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  48271340 taccatcattcaagatgctgatcggatgttggacccctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 48271437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Original strand, 17839735 - 17839859
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat-tacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| | |||||   ||||| || |||||||| || |||||| ||||||    
T  17839735 ctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaa-catgaatgcggggtgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaggtttgaatctatctcatt-caaagg 17839831  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17839832 taacacaattgttggagttggaatgcac 17839859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 398 - 465
Target Start/End: Original strand, 28978877 - 28978944
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaa 465  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  28978877 ttccaactccaacaattgtcttacctttgaattgggtcaattcaaacttgtcaaacaataggactcaa 28978944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30354316 - 30354233
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||   ||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  30354316 atgctcatcgaatgtcggagtcctcctgtttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagaaaattgttgcagttggaag 30354233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 847 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 42683052 - 42682977
Alignment:
Q  847 gtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  42683052 gtcacgttttcgttgttcgttaattccaccaaagtgaatgatattctcccctcgtcgttcgttggacgtttatacc 42682977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 398 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 42735764 - 42735693
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  42735764 ttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgcaaaacagcatgactccagcat 42735693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 789
Target Start/End: Original strand, 3380626 - 3380727
Alignment:
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgat 786  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||  ||||||||| |||||    
T  3380626 atttcagaggtaagacaattgttgtcgttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaattgttgagaatatcttcagttgat 3380724  T
Q  787 ctc 789  Q
    |||    
T  3380725 ctc 3380727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9367103 - 9366964
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| |||||||    
T  9367103 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttg 9367006  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  9367005 aaaatattaaatttttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 9366964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 13920530 - 13920669
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||   |||||||| |||||||    
T  13920530 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttcgcaagaacctcatgtttctcctttg 13920627  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  13920628 aaaatattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 13920669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 344
Target Start/End: Original strand, 26500364 - 26500438
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26500364 tggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcatttaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 26500438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26592349 - 26592275
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26592349 tggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcatttaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 26592275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 42735676 - 42735586
Alignment:
Q  529 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  42735676 atgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattctttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatctttt 42735586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 41218302 - 41218399
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||| | |||| ||  |||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  41218302 taccatcattcaagatgatgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 41218399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41219097 - 41219013
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  41219097 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcttttttttactccataaac-ttttaccgtgggtaaaaagattcttgttggggtat 41219013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 334
Target Start/End: Original strand, 41622770 - 41622863
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    |||||||||| || ||| | |||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  41622770 taccatcattcaagatgttgatcggatgctggagtcttgctgtttagcaagtttgaattttctccattcaagggtaagatcattgttgcagttg 41622863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 729 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 11824907 - 11824839
Alignment:
Q  729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||    
T  11824907 ccctacctaatcacgatcttctagcggaatcaaactgttgaaaatatcttcagttgatctctgcaacgt 11824839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 337
Target Start/End: Original strand, 13921014 - 13921090
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  13921014 atcgaatactggggtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccacattcagtggtaagatgattgttgcagttggaa 13921090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17184007 - 17183951
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17184007 tgtaccttccaactacaacaattgtcttgcctttgaatggggcaaattcaaacttgc 17183951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Original strand, 18238283 - 18238351
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  18238283 tggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaatggtaagataattgttgcagttggaag 18238351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28113880 - 28113812
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  28113880 tggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagttggaag 28113812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36393311 - 36393243
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36393311 tggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgtcccatttaagggtaagataattgttgcagttggaag 36393243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 9366695 - 9366785
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| |||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9366695 atgctcatcgaatactggagtcttgccgattaacaagtttgaa-ttgccccataccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 9366785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Original strand, 20565005 - 20565122
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  20565005 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgc 20565103  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  20565104 -tggtttagatgaaggtatt 20565122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 28113807 - 28113878
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  28113807 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 28113878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 34157506 - 34157588
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  |||||||||||||||||    
T  34157506 atgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgc-ccattaagtggtaagatgattgttgcagttggaag 34157588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41049033 - 41048978
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41049033 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcatttcgtacctaatgacgatctt 41048978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 43351057 - 43351112
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43351057 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattctgtacctaatgacgatctt 43351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 553 - 618
Target Start/End: Original strand, 43350917 - 43350983
Alignment:
Q  553 aatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43350917 aatgaggtccattctttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatctttt 43350983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46861671 - 46861617
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  46861671 ttagcaagtttgaatttgcccaattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 46861617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 10224759 - 10224855
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||||||| || |||||  || ||||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  10224759 taccatcatttaaa-tgatcatcacatgctggagtcttgctgtttagcaagtttgaatttaccccattaaggggtaagatatttgttacagttggaag 10224855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20877567 - 20877470
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || || |||| |||||||| |||||||||    
T  20877567 taccatcattcaagatgctgatcgtatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcatttagaggtaagataattgttgtagttggaag 20877470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28979035 - 28978943
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaaca-acatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt 489  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  28979035 ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacagccaggactaaagcatttcgctcgacattcatgttt 28978943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 34353318 - 34353387
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattca 310  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34353318 taccatcatttaaaatgttgatcgtatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattca 34353387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45362751 - 45362674
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  45362751 atcgaatattggagtcttgctggttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 45362674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Original strand, 48218675 - 48218760
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  48218675 tgatcgacccttgggataagtttaaatctgtttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcttgttggggtat 48218760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18238356 - 18238300
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18238356 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccattgaatggggcaaattcaaacttgc 18238300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20378506 - 20378446
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  20378506 ttagcaagtttgaatttgccccgttaaggggcaagacaaatgttgtagttggaaggtgcat 20378446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 664 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 28978932 - 28978872
Alignment:
Q  664 gtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||| || |||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28978932 gtttgacaagtttgaattgacccaattcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 28978872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34141656 - 34141600
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  34141656 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 34141600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40589327 - 40589271
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  40589327 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 40589271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46861931 - 46861855
Alignment:
Q  262 tcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| |||| |||||| | || | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  46861931 tcgaatattggagtcctgctgcttggaaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaag 46861855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 724
Target Start/End: Original strand, 10523583 - 10523618
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10523583 ttcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcac 10523618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 10523771 - 10523854
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| | || |||| |||||||||||  ||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  10523771 atgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttggcaattttgaatttgccacattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 10523854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Original strand, 20565461 - 20565544
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||| ||||  |||||| | || |||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  20565461 atgctgatcgaatgctggtgtcctgctgcttggcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 20565544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 20877465 - 20877536
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20877465 tgtaccttccaactacaacaattatcttacctctaaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 20877536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 576
Target Start/End: Original strand, 21186806 - 21186853
Alignment:
Q  529 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt 576  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  21186806 atgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattccttgacactt 21186853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34353420 - 34353349
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  34353420 tgtacctttcaactgcaataattatcttacatttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 34353349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42735512 - 42735457
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  42735512 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctt 42735457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1536760 - 1536714
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  1536760 actccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcttgttggggtat 1536714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2356566 - 2356505
Alignment:
Q  282 gtttagcaagtttgaatttgctccatt-cagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcatt 345  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2356566 gtttagcaagtttgaattt---ccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaagatgcatt 2356505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 10523293 - 10523365
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  10523293 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaa-ttcaaacttgtcaaacaaaaggactcaagcatttc 10523365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17840098 - 17840044
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  17840098 taccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 17840044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 741 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 18149729 - 18149675
Alignment:
Q  741 acgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||    
T  18149729 acgatcttctggcgcaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaac 18149675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 21186991 - 21186961
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21186991 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 21186961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28978677 - 28978623
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  28978677 ttagcaaatttgaatttgccccattcaatggtaagataattgttgcagttggaag 28978623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 499
Target Start/End: Original strand, 34139390 - 34139491
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| | ||||||||||| || ||| ||| | ||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  34139390 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgtcaagcaataggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 34139488  T
Q  497 aaa 499  Q
    |||    
T  34139489 aaa 34139491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 719
Target Start/End: Original strand, 48271163 - 48271193
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48271163 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 48271193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 694 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 150336 - 150192
Alignment:
Q  694 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagca 793  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||| || |||||||| | ||||  |||||||||   ||||||| ||    
T  150336 aggtaagccaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctagcagaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatctcaaca 150238  T
Q  794 acgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaa 839  Q
    |||| ||    |||||||||||| | |||||  |||||| ||||||    
T  150237 acgtgacaaatatatcgatccacgggaacatgatgtgctgccaaaa 150192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13920931 - 13920848
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13920931 atcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt-gccccatccagagt-aagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 13920848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 20565547 - 20565490
Alignment:
Q  394 taccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 451  Q
    ||||||||| || |||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20565547 taccttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgccaa 20565490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 41622872 - 41622795
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||| ||||| |||||||  | ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  41622872 tgtacctttcaactgcaacaatgatcttacccttgaatggagaaaattcaaacttgctaaacagcaagactccagcat 41622795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 920
Target Start/End: Original strand, 35058397 - 35058919
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  35058397 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactctccaaacaacaggactcaggcatttcaccccgcattcatgtttttctttga 35058496  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  35058497 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 35058596  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggt 697  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||    
T  35058597 ataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgctagagccctggccgtttggcaagtttgaattacccaatttgagaggt 35058696  T
Q  698 aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgt 797  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35058697 aagacaattgttgtagttggaatgtaccttaccctaactaatgacgatcttcttgtggaattaagatgttgatgatatctttagttgatctcagcaacgt 35058796  T
Q  798 cacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccca 897  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||     
T  35058797 tacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtaacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccc 35058896  T
Q  898 tcgtcgagcgttggacgtttata 920  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35058897 tcgtcgagcgttggacgtttata 35058919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 389 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 801719 - 801189
Alignment:
Q  389 gtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt 488  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  801719 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggcaaaacgacaggactcaagcatttcgcccggcattcatgtt 801620  T
Q  489 ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcat 587  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||   |||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  801619 ttcctttgaaaagaa-aaattcttgttaggcttggtttagataacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctcgacacttcaataccgtcat 801521  T
Q  588 ctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctca 687  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  801520 ctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcttggccgtttcgcaagtttgaattacctca 801421  T
Q  688 tttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatc 787  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  801420 tt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 801323  T
Q  788 tcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaatta 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |    
T  801322 tcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttctttaactctacccaagtgaatga 801223  T
Q  888 taccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     | |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  801222 ca-cctcccctcgtcgagctttggacgtttatacc 801189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 29108686 - 29108163
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  29108686 ttccaactgcaacaattgtcttacatttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcgctcgacgttcatgttttcctttga 29108587  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29108586 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgacaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 29108487  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |     
T  29108486 ctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcat-gttgtttggcaggtttgaatttatctca-ttcaacga 29108389  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29108388 taagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacg 29108289  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  29108288 tcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 29108189  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  29108188 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 29108163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 29067099 - 29066576
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||| ||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  29067099 ttccaactgcaacaattgtcttacatttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcgctcgacgttcatgttttcctttga 29067000  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29066999 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgacaacgaaatgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagc 29066900  T
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |  |||||||| ||||||| |||  ||| |||||||     
T  29066899 ctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcat-gttgtttggcaggtttgaatttatatca-ttcaaaga 29066802  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacg 796  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  29066801 taagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatctactggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaaca 29066702  T
Q  797 tcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctccc 896  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  29066701 tcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccc 29066602  T
Q  897 atcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  29066601 ctcgtcgagcgttggacgtttatacc 29066576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 6206030 - 6205507
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  6206030 ttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 6205931  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6205930 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 6205831  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  6205830 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 6205733  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6205732 g-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 6205634  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  6205633 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 6205534  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  6205533 cctcgtcgagtgttggacgtttatacc 6205507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 11692997 - 11692474
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  11692997 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 11692898  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11692897 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaatatcttcatctaaacca 11692798  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  || |||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  11692797 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgctaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 11692700  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11692699 g-aatacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 11692601  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  11692600 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgcttccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 11692501  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||    
T  11692500 ccttgtcgagtgttggacgtttatacc 11692474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 398 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 27640725 - 27640203
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||  |||  ||||||||||| |||    
T  27640725 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgagataa-ttcaaacctgcaaaacaacaggactcaaacatttcgccaaacacctcatgttttcccttt 27640627  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27640626 gaaaataataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 27640527  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  27640526 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgcttgagtcctgtt-gtttgacaagtttgaattacctcatt-caaag 27640429  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27640428 g-aagacaaatgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaac 27640330  T
Q  796 gtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcc 895  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  27640329 ttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgcttccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcc 27640230  T
Q  896 catcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  27640229 cctcgtcgagcgttggacgtttatacc 27640203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 554 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 29075956 - 29075589
Alignment:
Q  554 atgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctta 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29075956 atgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttg 29075857  T
Q  654 aatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctgg 752  Q
    | || ||   |||||||| ||||||||| | |||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29075856 agtcatgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caacgataagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatctgctgg 29075759  T
Q  753 cggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcaca 852  Q
    |||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  29075758 cggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcttcacg 29075659  T
Q  853 ttttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29075658 ttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 29075589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 554 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 29110928 - 29110561
Alignment:
Q  554 atgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctta 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29110928 atgaggttcattccttgacacttaataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttg 29110829  T
Q  654 aatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctgg 752  Q
    | || ||   |||||||| ||||||||| | |||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29110828 agtcatgtt-gtttggcaggtttgaatttatctcatt-caacgataagaaaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatctgctgg 29110731  T
Q  753 cggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcaca 852  Q
    |||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  29110730 cggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcttcacg 29110631  T
Q  853 ttttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29110630 ttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 29110561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 407 - 807
Target Start/End: Original strand, 24020769 - 24021168
Alignment:
Q  407 caacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-tttgaaaagaat 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||   || |||||||||||| ||||||||||||    
T  24020769 caacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttggaaaacaacaggactcaagcacttcgccaagcacttcatgttttccctttgaaaagaat 24020868  T
Q  505 aaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaa 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  24020869 aaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaaccagcataacaa 24020968  T
Q  605 taatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaa 704  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||| |  ||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  24020969 gaatttgatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgctcgagtcct-gttgtttgacaagtttgaattacccca-ttcaaagg-aagacaa 24021065  T
Q  705 ttgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgc 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  24021066 ttgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgattttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgc 24021165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 407 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 2192928 - 2192535
Alignment:
Q  407 caacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgaca-ttcatgttttcc-tttgaaaagaat 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||| |||||||||||||| ||   || |||||||||||| ||||||||||||    
T  2192928 caacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaa------aaacaacaggactcaagcatttcgccaagcacttcatgttttccctttgaaaagaat 2192835  T
Q  505 aaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaa 604  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  2192834 aaatttttgtcaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaaccagcataacaa 2192735  T
Q  605 taatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaa 704  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||| |  ||| | || |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  2192734 gaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggcgcttgcgaaatgctcgagtcct-gttgttcgacaagtttgaattacccca-ttcaaagg-aagacaa 2192638  T
Q  705 ttgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgc 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  2192637 ttgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgattttatggcggaatcaaaattttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgc 2192538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 316 - 885
Target Start/End: Original strand, 30257159 - 30257728
Alignment:
Q  316 aagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcg 415  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| | || ||||||| |    
T  30257159 aagacaattgttgtagtttgaaggtgcattcattccgtacctaccgacgatcttttggacgtttataccgaatgaatgcaccttctagctacaacaattg 30257258  T
Q  416 tgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattcatgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttg 513  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||   || |||||   |  ||||  | |||||| |||||| |||    
T  30257259 tgttatctttgaatagggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactcca--atgttcgatcggcattcccatagttccactcaaaagattaaattcttg 30257356  T
Q  514 ttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaa 612  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||| |||||||    
T  30257357 ttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaaaaatgaggttcattcattgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaa 30257456  T
Q  613 tcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgt 711  Q
    |||||| ||||||| ||   ||||||||  |||| ||  |  | || || |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  30257457 tcttttgaaaggaacaatgggaatgccggtcgaacat--tggagtcatg-ccgtttggcaagtttgaattaccccattt-agagg-aagacaattgttgt 30257551  T
Q  712 agttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatat 808  Q
    || |||||  ||||  | | |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30257552 agctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccacatat 30257651  T
Q  809 cgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaat 885  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30257652 cgatccactagaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaactgaat 30257728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 385 - 922
Target Start/End: Original strand, 32027277 - 32027814
Alignment:
Q  385 gaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattc 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  || |||  |||||||||    
T  32027277 gaacgtttgtaccttccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactcca--atgttcgaccgacattc 32027374  T
Q  484 atgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacac 581  Q
       |  |||| || |||| | |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  32027375 ccatagttccattcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcattggcacttcaatac 32027474  T
Q  582 cttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat 680  Q
    |||||| | |||  | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| ||  |  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  32027475 cttcattttaactggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaacat--tggagtcctg-ccgtttggcatgtttgaat 32027571  T
Q  681 tacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatct 777  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027572 taccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatct 32027669  T
Q  778 tcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccc 877  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  32027670 tcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccaccc 32027769  T
Q  878 aagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  32027770 aagtgaatgatactctcccctcgtcgaatgttggacgtttatacc 32027814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 385 - 922
Target Start/End: Original strand, 32037336 - 32037873
Alignment:
Q  385 gaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat-ttcacccgacattc 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  || |||  |||||||||    
T  32037336 gaacgtttgtaccttccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactcca--atgttcgaccgacattc 32037433  T
Q  484 atgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacac 581  Q
       |  |||| || |||| | |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  32037434 ccatagttccattcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcattggcacttcaatac 32037533  T
Q  582 cttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa-atgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat 680  Q
    |||||| | |||  | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| ||  |  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  32037534 cttcattttaactggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaacat--tggagtcctg-ccgtttggcatgtttgaat 32037630  T
Q  681 tacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatct 777  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||  | ||    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32037631 taccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagctttaatgtgcatttattccttacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatct 32037728  T
Q  778 tcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccaccc 877  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  32037729 tcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccaccc 32037828  T
Q  878 aagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  32037829 aagtgaatgatactctcccctcgtcgaatgttggacgtttatacc 32037873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 606 - 815
Target Start/End: Original strand, 3765657 - 3765867
Alignment:
Q  606 aatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaat 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  3765657 aatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagccaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttgagaggtaagacaat 3765756  T
Q  706 tgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaa-tcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgc 804  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3765757 tgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgatgatcttctggtggaatttaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgc 3765856  T
Q  805 atatcgatcca 815  Q
    |||||||||||    
T  3765857 atatcgatcca 3765867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 497 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 13402981 - 13402557
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    ||| || ||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||     
T  13402981 aaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataatggtattcaaatgtcaaaataatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccg 13402882  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||||   ||  |  |  | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  13402881 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaaaa--ttggagacctgtcgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaag 13402785  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagc 792  Q
    | |||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13402784 g-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagc 13402686  T
Q  793 aacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccc 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | || |    
T  13402685 aacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgggctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgaaactc 13402586  T
Q  893 tcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13402585 tcccctcgtcgagcgttggacatttatac 13402557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 661 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 14115318 - 14115061
Alignment:
Q  661 gccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatca 760  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||    
T  14115318 gccgcttggcaagtttgaattaccctattt-aaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcactatcttctggcagaatca 14115222  T
Q  761 aacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtt 860  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  14115221 gactcttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtc 14115122  T
Q  861 gttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatac 921  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14115121 gttctttacttccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatac 14115061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 661 - 922
Target Start/End: Original strand, 34802820 - 34803082
Alignment:
Q  661 gccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaa 757  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| | ||| || | ||    || || |||||||||||||| ||||| ||    
T  34802820 gccgtttggcaagtttgaattaccacatt-caaagg-aagacaatttttgtagctcgaaagcgcattcattccttacctaatgacgatcttttggcgaaa 34802917  T
Q  758 tcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttc 857  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  34802918 tcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatttactggaacatgttgtgctccctgaacatgctcatcacgttttc 34803017  T
Q  858 gttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34803018 gtcgttcgttaattccacccaagtcaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 34803082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 12397332 - 12396799
Alignment:
Q  389 gtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc---at 485  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||  ||| | |||||   ||    
T  12397332 gtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgg-cattcccaat 12397234  T
Q  486 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacctt 584  Q
    | |  || || |||||| |||||| |||||||||| |  ||| || | ||||||||| || |||   ||||| || ||||| ||||||||| || |||||    
T  12397233 gat--ccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaataacggtattcaaatgtcaaaagaatgatgtccattcgttgacacttcaatacctt 12397136  T
Q  585 catctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacc 684  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |  |  |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12397135 catttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaa-tattggagacctg-ccgtttgacaagtttgaattacc 12397038  T
Q  685 tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaa 781  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | |  || |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||     
T  12397037 tcatt-caaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattctgtacctaatgacgatcttttggcggaatcaagttgttgatgatatcttcag 12396940  T
Q  782 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagt 881  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  12396939 tagatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaatt 12396840  T
Q  882 gaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  12396839 gaatgatactctcccctcgtcgagtgttagacgtttatacc 12396799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 761 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 22305980 - 22305819
Alignment:
Q  761 aacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtt 860  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||     
T  22305980 aacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtc 22305881  T
Q  861 gttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22305880 gttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacc 22305819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 325 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 4495523 - 4495230
Alignment:
Q  325 gttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctt 424  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||     
T  4495523 gttgcagttggaaggtgcatttatttcgtagttactgacgatcttttggacgtttataccgaacgtttgtaccttcaaactacaacaattgtgttacctc 4495424  T
Q  425 tgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgt-tttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgc 523  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |  || |    || |||||   |  |||| || |||| | |||||| |||||||  |||     
T  4495423 tgaatggggtcaattcaaacttgccaagcagcaggactcca--atatacaacggcattcccatagttccattcaaaatattaaattcttgttagatttgg 4495326  T
Q  524 tttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  4495325 tttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatctttt 4495230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 29066779 - 29067104
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| |||||||  | ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  29066779 ttccaactgcaacaattttcttatctttgaatgatataaattcaaacctgccaaacaacatgactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 29066878  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || | | ||||||||| |    
T  29066879 aaaagattaaatttttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttgtcacttgaatatcatcatctaaagc 29066975  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | |||| |  ||||| || ||||||| ||| |||| ||||    
T  29066976 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaacgtcgagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttgacaggtttgaatttatctca-ttca 29067072  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29067073 aatgtaagacaattgttgcagttggaatgcac 29067104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 29108366 - 29108691
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| |||||||  | ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  29108366 ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 29108465  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa-c 593  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||| ||| ||||| || | | ||||||||| |    
T  29108466 aaaagattaaatttttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaacctcatttcgttgtcacttgaatatcatcatctaaagc 29108562  T
Q  594 cagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttca 692  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | |||| |  ||||| || ||||||| ||| |||| ||||    
T  29108563 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg-aaaacatgaacgtcgagcgaaatgcttgagtcct-gttgtttgacaggtttgaatttatctca-ttca 29108659  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29108660 aatgtaagacaattgttgcagttggaatgcac 29108691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 29075792 - 29075933
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| |||||||  | ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  29075792 ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 29075891  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  29075892 aaaagattaaatttttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt 29075933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 29110764 - 29110905
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttg 496  Q
    |||||||| |||||||  | ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  29110764 ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttg 29110863  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  29110864 aaaagattaaatttttgttaggc-tggtttagatgaaggtatt 29110905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 398 - 719
Target Start/End: Original strand, 801391 - 801710
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  | | |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||    
T  801391 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgcgaaacggccaagactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttccttt 801488  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattc-cttgacactt-aacaccttcatctaaac 593  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| | | | ||||    ||||||  ||||||||| || ||| | ||||||||    
T  801489 gaaaagattaaattcttgttaggc-tggtttagatgacggtattgaagtgtcga-ggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccgttatctaaac 801586  T
Q  594 c-agtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttc 691  Q
    | || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||| ||  ||||||| ||||| || |||    
T  801587 caagcctaacaagaattt-ttcttttcaaagg-aaaacatgaatgccgggcgaaatgcttgagtcct-gtcgttttgccagtttgaatttacccca-ttc 801682  T
Q  692 aaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  801683 aaaggtaagacaattgttgtagttggaa 801710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 780
Target Start/End: Original strand, 35020888 - 35021281
Alignment:
Q  387 acgtttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 483  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |  | |||  ||| |||||       
T  35020888 acgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgacaagcagcaggactccaata-ttcgaccggcattccca 35020986  T
Q  484 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacacc 582  Q
    |||  |||| || |||||| |||||| |||||||| | |  ||| || | ||||||||| || |||   || ||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  35020987 atg--ttccattcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaattacggtattcaaatgtcaaaagaaagaggtccattcgttgacacttcaatacc 35021084  T
Q  583 ttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatta 682  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  || |||  |  |  ||| |||||||| || ||||||||||    
T  35021085 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcg-aatattggagacct-gccgtttgacaagtttgaatta 35021182  T
Q  683 cctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 779  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||  | | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35021183 cccca-ttcaaagg-aagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacttaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 35021280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 398 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 14123148 - 14122919
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtt-ttcctttg 496  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  |  ||| |||||   || |||| ||     
T  14123148 ttccaactacaaaaattgtcttacctttaaatggggtaaattcaaacttggcaagcagcaagactccagtatc-cgtccggcattcccattgttccattc 14123050  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  14123049 aaaagattaaattcatgttaggctttgtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaataaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaacaa 14122950  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaa 626  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14122949 gcctaacaaaaatttaatcttttgaaaggaa 14122919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 497 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 23911197 - 23911076
Alignment:
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23911197 aaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtatt-aagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaaacca 23911099  T
Q  596 gtctaacaataatttaatctttt 618  Q
      ||||||| |||||||||||||    
T  23911098 acctaacaagaatttaatctttt 23911076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32027143 - 32027046
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32027143 taccatcatttaaaattatcatcgcatactggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttaccacattcaggggtaagataattgttgcagttggaag 32027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32037202 - 32037105
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32037202 taccatcatttaaaattatcatcgcatactggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttaccacattcaggggtaagataattgttgcagttggaag 32037105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 436 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 35058680 - 35058392
Alignment:
Q  436 aattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgat 533  Q
    ||||||||||||||||||  | | | ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||     
T  35058680 aattcaaacttgccaaacggccagggctctagcatttcgctcgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaa 35058582  T
Q  534 ggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aacaccttcatctaaacca-gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaac 630  Q
    |||||| ||||| ||| ||| |||   ||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  35058581 ggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-aaaaac 35058485  T
Q  631 atgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaatt-acctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||| | | ||||||| | | |||||   ||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35058484 atgaatgcggggtgaaatgcctgagtcctgtt-gtttggagagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 35058392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34802697 - 34802600
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  34802697 taccattatttaaaatgatcatcgcatgctggaatcctgctgtttagcaagtttaaatttacctcattcaggggtaagataattgttgcaattggaag 34802600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4495677 - 4495600
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcat 469  Q
    |||||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  4495677 tgtaccttccaactgcaataattgtcttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcatgactccagcat 4495600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 6206174 - 6206271
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  6206174 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 6206271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 11693141 - 11693238
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  11693141 taccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 11693238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13403370 - 13403313
Alignment:
Q  390 tttgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403370 tttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 13403313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 687 - 816
Target Start/End: Original strand, 17465287 - 17465415
Alignment:
Q  687 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgat 786  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  17465287 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgtatt-ctctacctaatcacgatcttttggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgat 17465385  T
Q  787 ctcagcaacgtcacccgcatatcgatccac 816  Q
    ||| ||||||| ||   |||||||||||||    
T  17465386 ctctgcaacgtgacaaacatatcgatccac 17465415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 338
Target Start/End: Original strand, 4495581 - 4495672
Alignment:
Q  247 catttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  4495581 cattttaaatgctgatcgcatgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagacaattattgcagttggaag 4495672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Original strand, 12397504 - 12397567
Alignment:
Q  275 tcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  12397504 tcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagcggtaagataattgttgcagttggaag 12397567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35020738 - 35020655
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  35020738 atgctcatcggatgccggagtcctgctgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 35020655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 27640866 - 27640963
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||| || || ||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  27640866 taccatcgttcaagatgctaatcgaacactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaag 27640963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 34132108 - 34132168
Alignment:
Q  284 ttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34132108 ttagcaagttggaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 34132168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 346
Target Start/End: Original strand, 14123409 - 14123479
Alignment:
Q  275 tcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14123409 tcctgctgcttagcaagtttgaatttgc-ccattcagaggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 14123479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 35058253 - 35058150
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagat 340  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||  |||| || ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |    
T  35058253 taccatcattcaagatgctgatcgtatgttggagtcgtgctgcttagcaagtttgaatttgtcccattcaggggcaagaaaattgttgtagttggaaggt 35058154  T
Q  341 gcat 344  Q
    ||||    
T  35058153 gcat 35058150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Original strand, 13403509 - 13403606
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||  |||| |||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  13403509 taccatcattcaagatgctgatcggatgttggagtcctactgcttagcaaatttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 13403606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 29067207 - 29067284
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||| || || ||||  |||||||||||||||||    
T  29067207 atcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgtcccatttagtggtaagatgattgttgcagttggaag 29067284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 29108794 - 29108871
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||| || || ||||  |||||||||||||||||    
T  29108794 atcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgtcccatttagtggtaagatgattgttgcagttggaag 29108871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Original strand, 6205732 - 6205849
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  6205732 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgc 6205830  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  6205831 -tggtttagatgaaggtatt 6205849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6206117 - 6206028
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6206117 atgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt-gccccatccagagt-aagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 6206028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13617405 - 13617322
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| || ||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||    
T  13617405 atgctgatagaatattggagtcatgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaaaggcaagacaatcgttgcagttggaag 13617322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Original strand, 27640428 - 27640545
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttgaaaagaataaatttttgttaggc 519  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  27640428 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgc 27640526  T
Q  520 ttgctttagatgatggtatt 539  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  27640527 -tggtttagatgaaggtatt 27640545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 532 - 618
Target Start/End: Original strand, 34802692 - 34802779
Alignment:
Q  532 atggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatctttt 618  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  34802692 atggtattcaagtgtcaaatgaatgaggtgcattctttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatctttt 34802779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 802599 - 802553
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  802599 actcaataaactttttaccgtgggtaaaaagatttgtcttggggtat 802553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24021080 - 24021008
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  24021080 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 24021008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Original strand, 32027186 - 32027244
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatt 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  32027186 taccatcattcgaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaatt 32027244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Original strand, 32037245 - 32037303
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatt 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  32037245 taccatcattcgaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaatt 32037303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 334
Target Start/End: Original strand, 2193101 - 2193174
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttg 334  Q
    ||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||| || || ||||  |||||||||||||    
T  2193101 atcgaatactggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttgccccatttagtggtaagatgattgttgcagttg 2193174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Original strand, 14830940 - 14831025
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  14830940 tgatcgacccttgggataagtttaaatttgcttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaaaattcttcttggggtat 14831025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 664 - 724
Target Start/End: Original strand, 27640671 - 27640730
Alignment:
Q  664 gtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27640671 gttttgcaggtttgaattatctcatt-caaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcac 27640730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 724
Target Start/End: Original strand, 6206000 - 6206035
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6206000 ttcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcac 6206035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12397028 - 12396969
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatcttttgg 373  Q
    ||||||||||||||| || |  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12397028 ggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattctgtacctaatgacgatcttttgg 12396969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13402785 - 13402730
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  13402785 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 13402730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 13617317 - 13617388
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||| ||||||||| |||| || || || ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  13617317 tgtaacttccaactgcaacgattgtcttgcctttgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcatgactc 13617388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 30257536 - 30257591
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30257536 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctt 30257591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 32027041 - 32027112
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||| ||||||||| |||||||  | |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32027041 tgtaacttccaactgcaacaattatcttacccctgaatgtggtaaattcaaacttgctaaacaacaggactc 32027112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 32027585 - 32027640
Alignment:
Q  314 ggaagacaattgttgcagttggaagatgcattcattttgtacctactgacgatctt 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  32027585 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctt 32027640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 32037100 - 32037171
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||| ||||||||| |||||||  | |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32037100 tgtaacttccaactgcaacaattatcttacccctgaatgtggtaaattcaaacttgctaaacaacaggactc 32037171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Original strand, 35020650 - 35020721
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 463  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  35020650 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaaattcaaacttgctaaacagcaggactc 35020721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 319628 - 319674
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  319628 actccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcttgttggggtat 319674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 2192623 - 2192695
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  2192623 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcgaacaacaggactcgagcatttc 2192695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3765770 - 3765657
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||  | || |||||||||||| ||||    
T  3765770 ttccaactgcaacaattgtcttacctctcaaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttggctcggcattcatgtttttcctt 3765672  T
Q  495 tgaaaagaataaatt 509  Q
    |||||||| ||||||    
T  3765671 tgaaaagattaaatt 3765657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 471
Target Start/End: Original strand, 11692699 - 11692748
Alignment:
Q  421 cctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcattt 471  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11692699 cctttgaatgaggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcaagcattt 11692748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 392 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12397572 - 12397510
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaca 454  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12397572 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccgctgaatggggcaaattcaaacttgctaaaca 12397510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 719
Target Start/End: Original strand, 13403332 - 13403362
Alignment:
Q  689 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403332 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 13403362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 14153921 - 14153967
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  14153921 actccataaactttttaccgtgggtaaaaagattcatgttggggtat 14153967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 335
Target Start/End: Original strand, 12397248 - 12397321
Alignment:
Q  262 tcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgg 335  Q
    ||||||| |||| |||||| | || |||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  12397248 tcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 12397321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 208
Target Start/End: Original strand, 16444828 - 16444857
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444828 actccataaactttttaccgtgggtaaaaa 16444857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24020596 - 24020555
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgc 302  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  24020596 atcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgc 24020555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30257097 - 30257001
Alignment:
Q  241 taccatcatttaaaatgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||  |||| || ||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  30257097 taccatcatttaaaatgttgatcgcatgttggagtc-tgctgtttagcaagtttgaatttaccacatttagaagtaagataattgttgcagttggaag 30257001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Original strand, 35020809 - 35020888
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttgga 336  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  35020809 atgcacatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaatt-gccccattctgagg-aagacaattgttgcagttgga 35020888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 208
Target Start/End: Original strand, 35053870 - 35053899
Alignment:
Q  179 actccataaactttttaccgtgggtaaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35053870 actccataaactttttaccgtgggtaaaaa 35053899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 4)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 401 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 2332 - 1811
Alignment:
Q  401 caactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaa 499  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||||||||    
T  2332 caactacaacaattgtcttacctttgaatggagtaaattcaaactggcctaacaacaggactcaagtatttcgccccgcgttcatgtttttcctttgaaa 2233  T
Q  500 agaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtct 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  2232 agaataaatttttgttagacttgctttagatgatggtattcaagtgccaacaaaatgaggttcattgcttgacacttaataccttcatctaaaccagcat 2133  T
Q  600 aacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaa 699  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||| || |||| ||||||    
T  2132 aacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctg-gcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaattaccccaattcagaggtaa 2034  T
Q  700 gacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtca 799  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2033 gagaattgttgcagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtca 1934  T
Q  800 cccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatc 899  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  1933 cccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaaatgaatgatactctcccctc 1834  T
Q  900 gtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  1833 gtcgagcgttggatgtttatacc 1811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 398 - 724
Target Start/End: Original strand, 2014 - 2340
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-ccttt 495  Q
    |||||||| |||||||  | |||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| || | | |||||||||| |||||    
T  2014 ttccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcatttcgccag-cgttcatgtttttccttt 2112  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aacaccttcatctaaa- 592  Q
    ||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||   ||| ||  ||| ||||| || ||| |||||||||     
T  2113 gaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-gcaatgaacctcattttgttggcacttgaataccatcatctaaag 2209  T
Q  593 ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttca 692  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| | |||| |  ||| |||  |||||||||  |||  ||||    
T  2210 caagtctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaacgcggggcgaaatacttgagtcct-gttgttaggccagtttgaatttactccattca 2308  T
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2309 aaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 2340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 2499 - 2576
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  2499 atcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaag 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2581 - 2525
Alignment:
Q  392 tgtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgc 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  2581 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgc 2525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 5)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 573 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 2637 - 2288
Alignment:
Q  573 acttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcat 672  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||| | || ||||||||||| |     
T  2637 acttaataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacattgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggtaa 2538  T
Q  673 gtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatga 772  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  2537 ttttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttttggcggaatcaagctgttgatga 2438  T
Q  773 tatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattc 872  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  2437 tatcttcaattgatctcatcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattc 2338  T
Q  873 cacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2337 cacccaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgttggacgtttatacc 2288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 337
Target Start/End: Original strand, 4988 - 5070
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  4988 atgctgatcgaatactggagtcttgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaa 5070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2633
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaa-tggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctt 494  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||| || ||||||  | |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||    
T  2491 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa-ttcaaaattaccaaacggccatgactcaagcatttcgcccaatgttcatgtttttcctt 2589  T
Q  495 tgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  2590 tgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 2633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 724
Target Start/End: Original strand, 4804 - 4835
Alignment:
Q  693 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4804 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 4835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4830 - 4781
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 447  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4830 ttccaactacaacaattgtcttaccttagaatggggtaaagtcaaacttg 4781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 180; Significance: 1e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 398 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 15012 - 14604
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacat-tcatgttttcc-ttt 495  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||   ||  ||||||||||| |||    
T  15012 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggttaaattcaaacctgcaaaacaacaggactcgagcatttcgccaagcacctcatgttttcccttt 14913  T
Q  496 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14912 gaaaagaataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaattgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaacca 14813  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaag 695  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  | |||| |  ||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  14812 gcataacaaaaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtgcttgcgaaatgctcgagtcct-gttgtttgacaagtttgaattacccca-ttcaaag 14715  T
Q  696 gtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaac 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  14714 g-aagacaattgttgtagttggaatgcacgttaccctaactaacgacgatcttatggcggtatcatacttttgatgaaatcttaagttgatctaagcaac 14616  T
Q  796 gtcacccgcata 807  Q
     |||||| ||||    
T  14615 ttcacccacata 14604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 539
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14831
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttt-tcctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  |    |||||||| |||||||    
T  14692 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttg 14789  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  14790 aaaatattaaatttttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 14831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15095 - 15010
Alignment:
Q  261 atcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcattc 346  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||| |||||||| || ||||  ||| ||||||||||||  |||||||    
T  15095 atcgaatactggagtcctgctgctttgcaagtttggatttgccccattcagtggtaagatgatttttgcagttggaatgtgcattc 15010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 398 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 2499 - 2249
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttg 496  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  2499 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaaaacaagactcaagcatttcgcccggcattcatgtttttcctttg 2400  T
Q  497 aaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aacaccttcatctaaacca 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||    
T  2399 aaaagaataaatttttgttaggctttctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgatacttcaataccttcatctgaacca 2300  T
Q  596 gtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaa 646  Q
      ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2299 tcctaacaagaatttaatattttcaaacgaaaaacatgaatgtcgggcgaa 2249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Original strand, 2379 - 2504
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaa-ttacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |   ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  2379 ctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgggcgaaatgcttgagt-cttgttttttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaagg 2476  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477 taagacaattgttgtagttggaatgcac 2504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3432 - 3347
Alignment:
Q  140 tgatcaacccttgagataagtttaaatctgcnnnnnnnnactccataaactttttaccgtgggtaaaaatatttgttttggggtat 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  3432 tgatcaacccttgggataagtttaaatctgcttttttttactccataaactttttaccgtgggtaaaaagatttttcttggggtat 3347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 344
Target Start/End: Original strand, 2758 - 2832
Alignment:
Q  270 tggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaagatgcat 344  Q
    |||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||    
T  2758 tggagtcctgctggttagtaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtcgttggaaggtgcat 2832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 555 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 85711 - 85462
Alignment:
Q  555 tgaggttcattccttgacacttaacaccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaa 654  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    |  ||||||||||  |    
T  85711 tgaggttcaatccttgacacttaataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatattttcaaaggagaaacatgaggtacttgcgaaatgctcga 85612  T
Q  655 atcctggccgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcg 754  Q
     |||||   ||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  85611 gtcctgtt-gtttgacaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgattttatggct 85515  T
Q  755 gaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcata 807  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  85514 gaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 85462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 85550 - 85622
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttc 472  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  85550 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgtcaaacaacaggactcgagcatttc 85622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 398 - 571
Target Start/End: Original strand, 11425 - 11598
Alignment:
Q  398 ttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatgttttcctttga 497  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||   | || |||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11425 ttccaactccaacaattgtcttacctttgaacaagatagattcaaacctgtcaaacagcaggactcaagcatttcacccgccattcatgttttcctttga 11524  T
Q  498 aaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttga 571  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11525 aaagaataaatttttgttaggcgtgctttagatgatgggattcaagtgccaacgaaatcaggttcattccttga 11598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 598 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 11544 - 11420
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaaatcctggccgtttggcatgtttgaat-tacctcatttcaaagg 696  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| | ||||| | ||||| || |||||||| || ||  || ||||||    
T  11544 ctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaa-catgaatggcgggtgaaatgcttgagtcctg-ctgtttgacaggtttgaatctatcttgtt-caaagg 11448  T
Q  697 taagacaattgttgtagttggaatgcac 724  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11447 taagacaattgttggagttggaatgcac 11420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11184
Alignment:
Q  255 atgctcatcgaatactggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||| ||||    
T  11267 atgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagttgtaagatgattgttgcagtttgaag 11184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold1700
Description:

Target: scaffold1700; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 418 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 123 - 1
Alignment:
Q  418 ttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgtta 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123 ttacctttgaatggggtaaattcaaactggcgaaacaacaggactcaagcatttcgcccgacattcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgtta 24  T
Q  517 ggcttgctttagatgatggtatt 539  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23 ggcttgctttagatgatggtatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 337
Target Start/End: Original strand, 382 - 434
Alignment:
Q  285 tagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaa 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  382 tagcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaa 434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 652
Target Start/End: Original strand, 23 - 77
Alignment:
Q  598 ctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctt 652  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23 ctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgctt 77  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 663 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 64227 - 64098
Alignment:
Q  663 cgtttggcatgtttgaattacctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 762  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  64227 cgtttggcaagtttgaattacttcatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaatgtaccttaccctacctaatgacgatcttctggtggaatcaaa 64130  T
Q  763 cttttgatgatatcttcaattgatctcagcaa 794  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  64129 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 64098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 826 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 64092 - 63997
Alignment:
Q  826 ttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  64092 ttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattgattccactcaactgaatgatactctccc-ttgtcgagcgttggacatttatacc 63997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 78; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 729 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 25118 - 24926
Alignment:
Q  729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatcttg 828  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| || | ||||| || ||||||||  ||||| |||    
T  25118 ccctacctaatcacgatctattggcgcaatcagactcttg-taatatcttcagttgatcttagcaatgttatccgcaaatagatccactagaacatgttg 25020  T
Q  829 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttctttaattccacccaagtgaattataccctcccatcgtcgagcgttggacgtttatacc 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||    
T  25019 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttcgttaattccacccaactgaatgctactctcccctcctcgagcgttgtacgtctatacc 24926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Original strand, 492966 - 493057
Alignment:
Q  14 aataacatggttattaattgcaaatttagacattaataatgttagttgtttaggtgaaattaagatttagttaaaaacaatgggggattagg 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  492966 aataatatggttattaattggaggtttagacattaataatgttacttgttttggtgggattaagattgagttataaacaatgggggattagg 493057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5056 - 4987
Alignment:
Q  269 ctggaatcctgcagtttagcaagtttgaatttgctccattcagggggaagacaattgttgcagttggaag 338  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||     |||| ||||||||||||||||||    
T  5056 ctggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcactaataagataattgttgcagttggaag 4987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University