View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12819_low_6 (Length: 372)

Name: NF12819_low_6
Description: NF12819
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12819_low_6
NF12819_low_6
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (6-369)||(34287734-34288097)
chr2 (6-369)||(34292794-34293157)
chr2 (6-369)||(40234891-40235254)
chr2 (6-369)||(259251-259614)
chr2 (6-369)||(12715100-12715463)
chr2 (6-369)||(37949820-37950183)
chr2 (6-369)||(39050320-39050683)
chr2 (6-369)||(27778602-27778965)
chr2 (6-369)||(11633683-11634046)
chr2 (6-369)||(12588190-12588553)
chr2 (6-369)||(27805087-27805450)
chr2 (6-360)||(9348489-9348843)
chr2 (6-369)||(21675680-21676043)
chr2 (6-369)||(27818360-27818723)
chr2 (6-369)||(34863060-34863423)
chr2 (6-360)||(13935051-13935405)
chr2 (6-369)||(37684407-37684770)
chr2 (6-369)||(37699672-37700035)
chr2 (6-369)||(39891454-39891817)
chr2 (6-369)||(16827836-16828199)
chr2 (6-369)||(16893282-16893645)
chr2 (6-369)||(31877661-31878024)
chr2 (6-369)||(32051178-32051541)
chr2 (6-369)||(19414997-19415360)
chr2 (184-369)||(37926928-37927113)
chr2 (6-369)||(37376541-37376904)
chr2 (7-360)||(21701671-21702024)
chr2 (7-360)||(19454929-19455281)
chr2 (6-101)||(11640141-11640236)
chr2 (111-369)||(20839386-20839644)
chr2 (6-62)||(37926873-37926929)
chr2 (43-369)||(28883631-28883957)
chr2 (111-359)||(27432952-27433200)
chr2 (43-359)||(12656959-12657275)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (6-369)||(27045769-27046132)
chr6 (6-360)||(3697462-3697816)
chr6 (6-369)||(29502796-29503159)
chr6 (6-369)||(4759145-4759508)
chr6 (6-369)||(16675520-16675883)
chr6 (6-369)||(30556468-30556831)
chr6 (6-369)||(4526667-4527030)
chr6 (6-369)||(27009111-27009474)
chr6 (6-360)||(4544236-4544590)
chr6 (6-369)||(16942479-16942842)
chr6 (6-369)||(26114862-26115225)
chr6 (6-369)||(26776062-26776425)
chr6 (6-369)||(28208835-28209198)
chr6 (6-369)||(29574394-29574757)
chr6 (6-369)||(27486510-27486873)
chr6 (6-350)||(4722605-4722949)
chr6 (40-369)||(27628158-27628487)
chr6 (7-369)||(27271032-27271394)
chr6 (31-360)||(17090907-17091236)
chr6 (184-369)||(4774442-4774627)
chr6 (6-369)||(29550856-29551219)
chr6 (43-369)||(27288822-27289148)
chr6 (43-359)||(22933342-22933658)
chr6 (43-359)||(23855787-23856103)
chr6 (43-369)||(16751272-16751598)
chr6 (190-369)||(20162181-20162360)
chr6 (190-369)||(22170471-22170650)
chr6 (43-369)||(27020556-27020883)
chr6 (43-369)||(24303070-24303396)
chr6 (49-359)||(26919804-26920114)
chr6 (6-62)||(4774387-4774443)
chr6 (7-114)||(20162073-20162180)
chr6 (7-114)||(22170651-22170758)
chr6 (111-359)||(13297413-13297661)
chr6 (43-359)||(15422779-15423095)
chr6 (111-284)||(34913626-34913799)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (6-369)||(54834786-54835149)
chr4 (6-369)||(40104147-40104510)
chr4 (6-369)||(30755153-30755516)
chr4 (6-369)||(33672307-33672670)
chr4 (6-369)||(39852037-39852400)
chr4 (6-369)||(5007272-5007635)
chr4 (6-369)||(6571252-6571615)
chr4 (6-360)||(18799131-18799485)
chr4 (6-369)||(27161825-27162188)
chr4 (6-369)||(14099940-14100303)
chr4 (6-369)||(21971100-21971463)
chr4 (6-369)||(31125027-31125390)
chr4 (7-360)||(15229269-15229622)
chr4 (6-369)||(34187469-34187832)
chr4 (6-369)||(36343024-36343387)
chr4 (6-369)||(14761813-14762176)
chr4 (7-360)||(1901657-1902010)
chr4 (7-360)||(15283446-15283799)
chr4 (7-321)||(15389935-15390249)
chr4 (43-369)||(14666454-14666780)
chr4 (7-369)||(24114062-24114424)
chr4 (7-369)||(24590864-24591226)
chr4 (111-369)||(17014547-17014805)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (6-369)||(26436642-26437005)
chr7 (6-360)||(26536274-26536628)
chr7 (6-369)||(31126305-31126668)
chr7 (6-369)||(11442264-11442627)
chr7 (6-369)||(26514166-26514529)
chr7 (6-369)||(31562785-31563148)
chr7 (6-369)||(3446691-3447054)
chr7 (6-369)||(9620036-9620399)
chr7 (6-369)||(16734855-16735218)
chr7 (6-369)||(16749909-16750272)
chr7 (6-369)||(17524917-17525280)
chr7 (6-369)||(17527935-17528298)
chr7 (6-369)||(26318264-26318627)
chr7 (6-369)||(5145735-5146098)
chr7 (6-369)||(26273489-26273852)
chr7 (6-369)||(24590936-24591299)
chr7 (6-369)||(26668309-26668672)
chr7 (184-369)||(4143641-4143826)
chr7 (7-360)||(16042709-16043062)
chr7 (184-369)||(45388783-45388968)
chr7 (7-360)||(16448402-16448755)
chr7 (6-114)||(18542184-18542292)
chr7 (43-369)||(5129414-5129740)
chr7 (7-359)||(5160905-5161257)
chr7 (43-369)||(10915263-10915589)
chr7 (6-62)||(4143825-4143881)
chr7 (43-369)||(16501796-16502122)
chr7 (43-215)||(11423326-11423498)
chr7 (6-62)||(45388728-45388784)
chr7 (43-359)||(2155995-2156311)
chr7 (6-113)||(800165-800272)
chr7 (43-369)||(16516832-16517158)
chr7 (6-113)||(16289028-16289135)
chr7 (313-369)||(4201081-4201137)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (6-369)||(28958192-28958555)
chr5 (6-369)||(24682833-24683196)
chr5 (6-369)||(24725360-24725723)
chr5 (6-369)||(28650628-28650991)
chr5 (6-369)||(43079645-43080008)
chr5 (6-369)||(12133548-12133911)
chr5 (6-369)||(13323235-13323598)
chr5 (6-369)||(37357049-37357412)
chr5 (6-369)||(9318844-9319207)
chr5 (6-369)||(30153411-30153774)
chr5 (6-369)||(34617911-34618274)
chr5 (6-369)||(37756373-37756736)
chr5 (6-369)||(6875698-6876061)
chr5 (6-369)||(31824813-31825176)
chr5 (6-369)||(37669889-37670252)
chr5 (6-369)||(15757263-15757626)
chr5 (6-369)||(30030808-30031171)
chr5 (6-369)||(30169862-30170225)
chr5 (6-369)||(2512444-2512807)
chr5 (6-369)||(3790934-3791297)
chr5 (6-369)||(8663881-8664244)
chr5 (6-369)||(26481784-26482147)
chr5 (6-369)||(40471955-40472318)
chr5 (7-369)||(31432834-31433196)
chr5 (7-369)||(37769393-37769755)
chr5 (6-358)||(33517749-33518101)
chr5 (6-369)||(18499136-18499499)
chr5 (184-360)||(32594689-32594865)
chr5 (184-369)||(5639358-5639543)
chr5 (184-369)||(18373941-18374126)
chr5 (6-359)||(41676102-41676455)
chr5 (11-360)||(25200427-25200776)
chr5 (7-360)||(22889863-22890216)
chr5 (6-359)||(33293918-33294271)
chr5 (6-359)||(15657176-15657529)
chr5 (6-359)||(18125811-18126164)
chr5 (121-360)||(25264692-25264931)
chr5 (7-359)||(23893600-23893952)
chr5 (43-369)||(23716394-23716720)
chr5 (43-369)||(33778917-33779243)
chr5 (43-359)||(11550784-11551100)
chr5 (43-359)||(30936063-30936379)
chr5 (6-62)||(32594864-32594920)
chr5 (43-369)||(23750856-23751182)
chr5 (6-62)||(5639303-5639359)
chr5 (6-62)||(18374125-18374181)
chr5 (7-359)||(24686573-24686925)
chr5 (43-359)||(24971448-24971764)
chr5 (43-369)||(22997520-22997846)
chr5 (6-113)||(34467009-34467116)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (7-369)||(19206828-19207190)
chr8 (6-369)||(19675825-19676188)
chr8 (6-369)||(9356007-9356370)
chr8 (6-369)||(31355909-31356272)
chr8 (6-369)||(3327975-3328338)
chr8 (7-369)||(29830707-29831069)
chr8 (6-369)||(28360423-28360786)
chr8 (6-369)||(12091192-12091555)
chr8 (6-369)||(33260107-33260470)
chr8 (184-369)||(31488341-31488526)
chr8 (7-286)||(22079453-22079732)
chr8 (40-359)||(16284867-16285186)
chr8 (7-369)||(2135727-2136089)
chr8 (43-369)||(27607373-27607699)
chr8 (43-369)||(14559045-14559371)
chr8 (43-369)||(18792128-18792454)
chr8 (43-369)||(19689519-19689845)
chr8 (43-359)||(16278975-16279290)
chr8 (6-62)||(31488525-31488581)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (6-369)||(949-1312)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (6-369)||(10950-11313)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (6-360)||(11108908-11109262)
chr3 (6-369)||(28114504-28114867)
chr3 (6-360)||(5594916-5595270)
chr3 (6-369)||(10397478-10397841)
chr3 (6-369)||(4345237-4345600)
chr3 (6-369)||(20575397-20575760)
chr3 (7-369)||(22869406-22869768)
chr3 (7-369)||(22884465-22884827)
chr3 (6-369)||(17983506-17983869)
chr3 (6-369)||(18244084-18244447)
chr3 (6-369)||(24329504-24329867)
chr3 (6-369)||(29663520-29663883)
chr3 (6-369)||(31963023-31963386)
chr3 (6-369)||(48467272-48467635)
chr3 (6-369)||(51783368-51783731)
chr3 (6-360)||(5607881-5608235)
chr3 (6-360)||(5468330-5468684)
chr3 (6-360)||(8213083-8213437)
chr3 (6-369)||(4418264-4418627)
chr3 (6-369)||(6541012-6541375)
chr3 (6-369)||(10644415-10644778)
chr3 (6-369)||(21676038-21676401)
chr3 (7-360)||(28022621-28022974)
chr3 (6-369)||(7997907-7998270)
chr3 (6-369)||(5015057-5015420)
chr3 (6-369)||(18226536-18226899)
chr3 (6-369)||(47024798-47025161)
chr3 (184-369)||(36995750-36995935)
chr3 (184-369)||(28340702-28340887)
chr3 (6-369)||(7074557-7074920)
chr3 (6-369)||(18290903-18291266)
chr3 (6-369)||(18306204-18306567)
chr3 (6-359)||(20067388-20067741)
chr3 (7-360)||(18531734-18532087)
chr3 (6-369)||(18275602-18275965)
chr3 (7-360)||(16625160-16625513)
chr3 (6-359)||(32440499-32440852)
chr3 (7-369)||(8297318-8297680)
chr3 (7-369)||(15739644-15740006)
chr3 (25-369)||(18052626-18052970)
chr3 (7-215)||(6193661-6193869)
chr3 (43-359)||(15891266-15891582)
chr3 (43-359)||(4723013-4723329)
chr3 (6-62)||(28340647-28340703)
chr3 (6-62)||(36995934-36995990)
chr3 (43-369)||(8288021-8288347)
chr3 (6-113)||(20441462-20441569)
chr3 (6-113)||(41438588-41438695)
chr3 (43-369)||(22386128-22386454)
chr3 (43-369)||(35882148-35882474)
chr3 (43-369)||(18332010-18332336)
chr3 (7-369)||(29147305-29147667)
chr3 (43-284)||(4795288-4795529)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (6-369)||(13439-13802)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (6-369)||(10964053-10964416)
chr1 (6-369)||(41791817-41792180)
chr1 (6-369)||(51639601-51639964)
chr1 (6-369)||(10946462-10946825)
chr1 (6-369)||(28586364-28586727)
chr1 (7-360)||(16206549-16206902)
chr1 (7-185)||(20462469-20462647)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (6-369)||(7399-7762)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (6-369)||(24710-25073)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (7-369)||(5746-6108)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (6-369)||(9333-9696)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (125-369)||(27708-27952)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (184-360)||(7707-7883)
scaffold0159 (184-360)||(21260-21436)
scaffold0159 (6-62)||(7882-7938)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (7-359)||(31838-32190)
scaffold0124 (262-360)||(46134-46232)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (43-359)||(31178-31494)
scaffold0089 (43-359)||(38588-38904)
scaffold0089 (43-359)||(45504-45820)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (43-359)||(28714-29030)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 34287734 - 34288097
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34287734 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34287833  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34287834 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34287933  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34287934 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34288033  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34288034 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34288097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 34292794 - 34293157
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34292794 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34292893  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34292894 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34292993  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34292994 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34293093  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34293094 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34293157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 40234891 - 40235254
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40234891 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 40234990  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40234991 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40235090  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40235091 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40235190  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40235191 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40235254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 259614 - 259251
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  259614 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 259515  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  259514 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 259415  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  259414 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 259315  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  259314 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 259251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12715463 - 12715100
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12715463 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12715364  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12715363 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12715264  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  12715263 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 12715164  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12715163 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12715100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37950183 - 37949820
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37950183 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 37950084  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37950083 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37949984  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||    
T  37949983 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagccggggctgctgtggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaggagggtcagac 37949884  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37949883 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37949820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39050683 - 39050320
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |     
T  39050683 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39050584  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39050583 aggaatgaaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 39050484  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39050483 ctttccaaggtttgactattgaaggtgcagaacctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39050384  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39050383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39050320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 27778602 - 27778965
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  27778602 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27778701  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27778702 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27778801  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27778802 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27778901  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27778902 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27778965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11634046 - 11633683
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |     
T  11634046 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcata 11633947  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11633946 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11633847  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11633846 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaaaaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 11633747  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11633746 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 11633683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 12588190 - 12588553
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  12588190 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 12588289  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12588290 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagtcagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12588389  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12588390 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12588489  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12588490 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12588553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 27805087 - 27805450
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |     
T  27805087 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccctacatcagaagttgaagttcata 27805186  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27805187 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27805286  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27805287 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27805386  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27805387 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27805450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9348843 - 9348489
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  9348843 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 9348744  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||| ||||| || |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9348743 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9348644  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9348643 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9348544  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9348543 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9348489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21676043 - 21675680
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21676043 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 21675944  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21675943 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21675844  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  21675843 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaagaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 21675744  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21675743 cgccggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21675680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 27818360 - 27818723
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  27818360 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27818459  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27818460 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctcacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27818559  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27818560 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27818659  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  27818660 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtatagaaggtctcgggttctcc 27818723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 34863060 - 34863423
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34863060 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 34863159  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34863160 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 34863259  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  34863260 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 34863359  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34863360 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34863423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13935405 - 13935051
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  13935405 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 13935306  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13935305 aggaatggaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13935206  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || || ||||||||    
T  13935205 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 13935106  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13935105 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 13935051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37684770 - 37684407
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37684770 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37684671  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37684670 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 37684571  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  || || |||||||||||    
T  37684570 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagac 37684471  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37684470 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37684407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37700035 - 37699672
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37700035 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37699936  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37699935 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 37699836  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  || || |||||||||||    
T  37699835 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagac 37699736  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37699735 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37699672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 39891454 - 39891817
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39891454 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 39891553  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39891554 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 39891653  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  39891654 ctttccaaggtttgatcattgaaagtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 39891753  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39891754 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39891817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16828199 - 16827836
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |     
T  16828199 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16828100  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16828099 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16828000  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16827999 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16827900  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16827899 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16827836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 16893282 - 16893645
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |     
T  16893282 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16893381  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16893382 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16893481  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16893482 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16893581  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16893582 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16893645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 31877661 - 31878024
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31877661 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31877760  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31877761 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 31877860  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  31877861 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 31877960  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31877961 tgtcggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31878024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 32051178 - 32051541
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |     
T  32051178 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 32051277  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32051278 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 32051377  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32051378 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 32051477  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32051478 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 32051541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19415360 - 19414997
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19415360 gatggacattaacgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 19415261  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19415260 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 19415161  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  19415160 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 19415061  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19415060 tgccggctggggcaaggtaatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19414997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Original strand, 37926928 - 37927113
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37926928 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 37927027  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37927028 aggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37927113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 37376541 - 37376904
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  37376541 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 37376640  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  37376641 aaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 37376740  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  37376741 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 37376840  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |  |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  37376841 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 37376904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21702024 - 21701671
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| | |||||||| || |||||||| |    
T  21702024 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaattttaagtttgtaa 21701925  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  21701924 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagttgtcgtctttctcttgtattgaagctggatctgctgaaggaactgc 21701825  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| |||||||||   ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||| ||||| ||| ||    
T  21701824 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 21701725  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||  |||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  21701724 gccggccggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 21701671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19455281 - 19454929
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||  || || || ||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |    
T  19455281 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgttggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 19455182  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19455181 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatcttt-tcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 19455083  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| || | | || ||||| ||| ||    
T  19455082 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgcttagaaggctgtccaagaaggacaggct 19454983  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  19454982 gccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 19454929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 11640236 - 11640141
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11640236 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagtt 11640141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 369
Target Start/End: Original strand, 20839386 - 20839644
Alignment:
Q  111 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 210  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||     
T  20839386 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 20839485  T
Q  211 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccg 310  Q
    ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||    
T  20839486 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 20839585  T
Q  311 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  20839586 gctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 20839644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 37926873 - 37926929
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37926873 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 37926929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 28883631 - 28883957
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  28883631 agaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 28883730  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | |  |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  28883731 catacctggctagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 28883830  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  28883831 gagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 28883930  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  28883931 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 28883957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27433200 - 27432952
Alignment:
Q  111 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 210  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||     
T  27433200 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 27433101  T
Q  211 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccg 310  Q
    ||||| || ||  | |||||| | |||||||| |  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||    
T  27433100 caaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 27433001  T
Q  311 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    | ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  27433000 gctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27432952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Original strand, 12656959 - 12657275
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  12656959 agaccgtggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 12657058  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || || ||||| || ||  | |||||| | ||||||||    
T  12657059 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctacagaggggaccgcctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 12657158  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
     |  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  12657159 aagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 12657258  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  12657259 aagcataaggaaggtct 12657275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 27045769 - 27046132
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27045769 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27045868  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27045869 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27045968  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27045969 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 27046068  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27046069 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27046132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 3697462 - 3697816
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3697462 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacaccagaagttgaaatttgtg 3697561  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697562 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3697661  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3697662 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 3697761  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697762 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3697816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 29502796 - 29503159
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29502796 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 29502895  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29502896 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29502995  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  29502996 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 29503095  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29503096 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29503159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 4759145 - 4759508
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4759145 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4759244  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4759245 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4759344  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  4759345 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4759444  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4759445 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4759508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 16675520 - 16675883
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  16675520 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 16675619  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16675620 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16675719  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16675720 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 16675819  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16675820 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16675883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30556831 - 30556468
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30556831 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30556732  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30556731 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 30556632  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  30556631 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 30556532  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30556531 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30556468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 4526667 - 4527030
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4526667 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4526766  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4526767 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4526866  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  4526867 ctttccaaggtttgaccattgaaggcgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4526966  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4526967 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4527030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 27009111 - 27009474
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27009111 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 27009210  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009211 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27009310  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  27009311 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 27009410  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27009411 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27009474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4544590 - 4544236
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4544590 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4544491  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4544490 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4544391  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  4544390 ctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4544291  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4544290 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4544236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16942842 - 16942479
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16942842 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16942743  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16942742 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16942643  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  16942642 ctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16942543  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16942542 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16942479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26115225 - 26114862
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26115225 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26115126  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26115125 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcaggatctgctgaagggactg 26115026  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  26115025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 26114926  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  26114925 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgaaaggaaggtctcgggttctcc 26114862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26776425 - 26776062
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  26776425 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26776326  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26776325 aggaatgaaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26776226  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26776225 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26776126  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26776125 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26776062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 28208835 - 28209198
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28208835 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28208934  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28208935 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 28209034  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  28209035 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28209134  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  28209135 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgaaaggaaggtctcgggttctcc 28209198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 29574394 - 29574757
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29574394 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 29574493  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29574494 aagaatggaaaactcgttacaattcacggtgaagaggcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29574593  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  29574594 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 29574693  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29574694 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29574757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 27486510 - 27486873
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27486510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctactgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27486609  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27486610 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgccgaagggactg 27486709  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  27486710 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 27486809  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  27486810 tgccggctggggcaaggtgatacaggtctgtgagaacaagcgtaaaaaaggtctcgggttctcc 27486873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4722949 - 4722605
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4722949 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4722850  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4722849 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4722750  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  4722749 ctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4722650  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaa 350  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4722649 tgccggctggggcaaggcgctacagctctgtgagaacaagcgtaa 4722605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 40 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27628487 - 27628158
Alignment:
Q  40 ggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaag 139  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27628487 ggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacagtccatggtgaag 27628388  T
Q  140 aagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27628387 aagcatatttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggcgcggagcc 27628288  T
Q  240 taagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  27628287 taagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagcttcatgag 27628188  T
Q  340 aacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27628187 aacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27628158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27271394 - 27271032
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| ||  | ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27271394 atggatattaatgcttcatacagttgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaaattaaagtttgtga 27271295  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27271294 agaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 27271195  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27271194 tttccagggtttgaccattgaaggtgtagagcctaagagggatggagctgccatggcttcattaaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 27271095  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| || |||||| | ||||||    
T  27271094 gccggttggggcaagttgatacagcttcatgagaacaagcataaggagggtctcgggttctcc 27271032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17091236 - 17090907
Alignment:
Q  31 tgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 130  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||    
T  17091236 tgtcttctgggaaggccgtggatacatgacgcgggcgcagtaacctccaccctgcaccagaagttaaagtttgtgaggaatggaaagctcgtcacagtcc 17091137  T
Q  131 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17091136 atggtgaagaagcatacttagttagccaactgtcatccttctcctgtattgaagcaggatctgctgaagggactgcttttcaaggattgaccattgaagg 17091037  T
Q  231 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 330  Q
    | | ||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||| || ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||     
T  17091036 tacggagcccaagaaggttagggctgctatggcttctttgaaggacgctcagaaggctattcaagaaggacaggctgccggttggggtaagttgatacaa 17090937  T
Q  331 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||| |||||| || |  ||||||||||||    
T  17090936 ctctatgagaataaacacaaagaaggtctc 17090907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Original strand, 4774442 - 4774627
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4774442 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 4774541  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | |  || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4774542 gagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcataaagaaggtctcgggttctcc 4774627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 29550856 - 29551219
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  29550856 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29550955  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  29550956 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 29551055  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  29551056 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 29551155  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |  |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  29551156 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29551219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27289148 - 27288822
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  27289148 agaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 27289049  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || ||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||    
T  27289048 catacctggttagccaactatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacagagcctaa 27288949  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
     |  | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   | || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27288948 aagggatggagctgccatggcttctttgaaagatgcgcagagagccgtccaagagggtcagactgctgggtggggcaaggtgatacagctccgtgagaac 27288849  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  27288848 aagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27288822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22933658 - 22933342
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  22933658 agaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 22933559  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  22933558 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 22933459  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  22933458 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 22933359  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  22933358 aagcataaggaaggtct 22933342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23856103 - 23855787
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  23856103 agaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 23856004  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  23856003 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 23855904  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  23855903 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 23855804  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  23855803 aagcataaggaaggtct 23855787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 16751272 - 16751598
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  16751272 agaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 16751371  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | ||||||   || |||||    
T  16751372 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtatggaacctaa 16751471  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | | | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  16751472 gagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagctgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 16751571  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  16751572 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 16751598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 369
Target Start/End: Original strand, 20162181 - 20162360
Alignment:
Q  190 tctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggtta 289  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| || || |||| || |     
T  20162181 tctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaaggctg 20162280  T
Q  290 ttcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||| || ||| ||||||  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||    
T  20162281 ttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 20162360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22170650 - 22170471
Alignment:
Q  190 tctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggtta 289  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| || || |||| || |     
T  22170650 tctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaaggctg 22170551  T
Q  290 ttcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||| || ||| ||||||  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||    
T  22170550 ttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 22170471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 27020556 - 27020883
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  27020556 agaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 27020655  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||||||    
T  27020656 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 27020755  T
Q  243 -gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaa 341  Q
     ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  27020756 ggagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaa 27020855  T
Q  342 caagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  27020856 caagcataaggaaggtcttggcttctcc 27020883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24303396 - 24303070
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  24303396 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 24303297  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  24303296 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 24303197  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| |||||  |||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  24303196 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 24303097  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  24303096 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 24303070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 26919804 - 26920114
Alignment:
Q  49 tggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatact 148  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||     
T  26919804 tggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacc 26919903  T
Q  149 tagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagc 248  Q
    | || || ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  |     
T  26919904 tggttagtcagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagaggga 26920003  T
Q  249 tggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgt 348  Q
    |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| |    
T  26920004 tggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcat 26920103  T
Q  349 aaagaaggtct 359  Q
    || ||||||||    
T  26920104 aaggaaggtct 26920114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 4774387 - 4774443
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4774387 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 4774443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Original strand, 20162073 - 20162180
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  20162073 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 20162172  T
Q  107 agaatgga 114  Q
    ||||||||    
T  20162173 agaatgga 20162180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22170758 - 22170651
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  22170758 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 22170659  T
Q  107 agaatgga 114  Q
    ||||||||    
T  22170658 agaatgga 22170651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13297661 - 13297413
Alignment:
Q  111 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 210  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||     
T  13297661 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgctttt 13297562  T
Q  211 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccg 310  Q
    ||||| || ||  | |||||| | |||||||| |  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   |||| || |||||  ||||||    
T  13297561 caaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagctgccg 13297462  T
Q  311 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    | ||||||| | | ||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||    
T  13297461 gctggggcaggttaatacagcttcgcgagaacaagcataaggaaggtct 13297413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15423095 - 15422779
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  15423095 agaccatggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggagg 15422996  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  15422995 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 15422896  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||| |||| |||||||| ||||| |||||  |||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  15422895 gagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 15422796  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  15422795 aagcataaggaaggtct 15422779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34913799 - 34913626
Alignment:
Q  111 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 210  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| |  | |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||     
T  34913799 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 34913700  T
Q  211 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagag 284  Q
    ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  34913699 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagag 34913626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 54834786 - 54835149
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54834786 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 54834885  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54834886 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 54834985  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54834986 ctttccaaggtttgatcattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 54835085  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  54835086 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 54835149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40104510 - 40104147
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40104510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 40104411  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40104410 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40104311  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40104310 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40104211  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  40104210 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaggaaggtctcgggttctcc 40104147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 30755153 - 30755516
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30755153 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30755252  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30755253 aagaatggaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30755352  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30755353 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 30755452  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30755453 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33672670 - 33672307
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33672670 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33672571  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33672570 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33672471  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  33672470 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 33672371  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33672370 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33672307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 39852037 - 39852400
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |     
T  39852037 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39852136  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39852137 aggaatggaaagcttgttaccgttcacggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 39852236  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39852237 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39852336  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39852337 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39852400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 5007272 - 5007635
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  5007272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5007371  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5007372 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggggaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 5007471  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5007472 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggaaggtcagac 5007571  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5007572 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5007635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 6571252 - 6571615
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  6571252 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 6571351  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6571352 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 6571451  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6571452 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 6571551  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6571552 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6571615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18799485 - 18799131
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18799485 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18799386  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18799385 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgttgtccttttcttgtattgaagcggggtctgctgaagggactg 18799286  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || || ||||||||    
T  18799285 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 18799186  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18799185 tgccggctggggcaaggtgatacggctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 18799131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27162188 - 27161825
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27162188 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27162089  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27162088 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27161989  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  27161988 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 27161889  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27161888 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27161825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 14099940 - 14100303
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14099940 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 14100039  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14100040 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 14100139  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  14100140 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 14100239  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14100240 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 14100303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 21971100 - 21971463
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21971100 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 21971199  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21971200 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21971299  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  21971300 cgttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 21971399  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21971400 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21971463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31125390 - 31125027
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |     
T  31125390 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 31125291  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31125290 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31125191  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31125190 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 31125091  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31125090 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31125027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 15229269 - 15229622
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  15229269 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 15229368  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  15229369 agaatggaaaacttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15229468  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||| ||||| ||| ||    
T  15229469 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 15229568  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  15229569 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 15229622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34187832 - 34187469
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  34187832 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 34187733  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||| | || |||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || |||||||    
T  34187732 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagaggggactg 34187633  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||| ||||| |||||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  34187632 cttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 34187533  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  34187532 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 34187469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36343387 - 36343024
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  36343387 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcat- 36343289  T
Q  106 aagaa-tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggact 204  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || |||||     
T  36343288 aagaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggacc 36343189  T
Q  205 gctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcaga 304  Q
    ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||      
T  36343188 gcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaag 36343089  T
Q  305 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||    
T  36343088 ctgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtcttggcttctcc 36343024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14762176 - 14761813
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  14762176 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcat- 14762078  T
Q  106 aagaa-tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggact 204  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || |||||     
T  14762077 aagaagtggaaagcttgttaccattcatggagagaaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggacc 14761978  T
Q  205 gctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcaga 304  Q
    ||||| ||||| || ||  |||||||  | || |||||||| | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||      
T  14761977 gcttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaag 14761878  T
Q  305 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  14761877 ctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 14761813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 1901657 - 1902010
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||| |||| ||||||||||| |    
T  1901657 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcataagaaattgaagtttgtaa 1901756  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  1901757 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgccgaaggaactgc 1901856  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||| ||||| ||| ||    
T  1901857 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 1901956  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||||    
T  1901957 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 1902010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15283799 - 15283446
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||| ||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |    
T  15283799 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggacacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 15283700  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  15283699 agaatgggaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15283600  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||| ||    
T  15283599 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 15283500  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    | ||| | ||||||| | ||||| ||| | | ||| ||||  ||||||||||||    
T  15283499 gtcggctagggcaagttaatacaactccgcgggaataagcacaaagaaggtctc 15283446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15390249 - 15389935
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| |||| ||||||||||||||| || || || || || ||||| ||| | || |||||||| |||||||| |    
T  15390249 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcctagaaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgtaa 15390150  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  15390149 agaatggaaagctcgttacaatccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 15390050  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| || |||||||| || |||||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | | || ||||||||  ||    
T  15390049 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtccaagaaggtcaagct 15389950  T
Q  307 gccggttggggcaag 321  Q
     |||| |||||||||    
T  15389949 accggctggggcaag 15389935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 14666454 - 14666780
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  14666454 agaccatggatacatgacgcgggagcggtaacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 14666553  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  14666554 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 14666653  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    || || |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  14666654 gagagatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggatggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 14666753  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  14666754 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 14666780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Original strand, 24114062 - 24114424
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  |    
T  24114062 atggatattaatgcctcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24114161  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || || |||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||    
T  24114162 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgc 24114261  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| || |  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||    
T  24114262 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24114361  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  24114362 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24114424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24591226 - 24590864
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  |    
T  24591226 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24591127  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  24591126 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24591027  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||    
T  24591026 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24590927  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||    
T  24590926 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtcttggcttctcc 24590864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 369
Target Start/End: Original strand, 17014547 - 17014805
Alignment:
Q  111 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 210  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||     
T  17014547 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgctttt 17014646  T
Q  211 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccg 310  Q
    ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||    
T  17014647 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 17014746  T
Q  311 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  17014747 gctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 17014805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 26436642 - 26437005
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26436642 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 26436741  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26436742 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26436841  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26436842 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26436941  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  26436942 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagtgtaaagaaggtctcgggttctcc 26437005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26536628 - 26536274
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26536628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26536529  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26536528 aagaatggaaaactcgttacaatccatggcgaagaagcatacttagtcagccagctgtcgtccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26536429  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || || ||||||||    
T  26536428 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 26536329  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26536328 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26536274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 31126305 - 31126668
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31126305 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 31126404  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31126405 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31126504  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  31126505 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31126604  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31126605 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31126668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 11442264 - 11442627
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11442264 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11442363  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11442364 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11442463  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  11442464 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagccggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 11442563  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11442564 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 11442627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 26514166 - 26514529
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26514166 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26514265  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26514266 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26514365  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  26514366 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 26514465  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26514466 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26514529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31563148 - 31562785
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31563148 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31563049  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31563048 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 31562949  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  31562948 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31562849  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31562848 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31562785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 3446691 - 3447054
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3446691 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3446790  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3446791 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3446890  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  3446891 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 3446990  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3446991 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3447054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 9620036 - 9620399
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9620036 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9620135  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9620136 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9620235  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  9620236 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 9620335  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9620336 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9620399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16735218 - 16734855
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16735218 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16735119  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16735118 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16735019  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  16735018 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16734919  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16734918 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16734855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16750272 - 16749909
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16750272 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16750173  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750172 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16750073  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  16750072 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16749973  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16749972 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16749909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 17524917 - 17525280
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17524917 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17525016  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17525017 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17525116  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  17525117 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17525216  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17525217 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17525280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17528298 - 17527935
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17528298 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17528199  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17528198 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17528099  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  17528098 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17527999  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17527998 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17527935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26318627 - 26318264
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  26318627 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26318528  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26318527 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26318428  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26318427 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26318328  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26318327 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcggtttctcc 26318264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5146098 - 5145735
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  5146098 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5145999  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5145998 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5145899  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5145898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctttggcttcgttgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 5145799  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5145798 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5145735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26273852 - 26273489
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26273852 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26273753  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26273752 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26273653  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  26273652 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 26273553  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26273552 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26273489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24591299 - 24590936
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24591299 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24591200  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24591199 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24591100  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  24591099 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24591000  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24590999 cgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24590936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26668672 - 26668309
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26668672 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26668573  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26668572 aaaaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26668473  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  || || |||||||||||    
T  26668472 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagac 26668373  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26668372 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26668309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4143826 - 4143641
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4143826 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 4143727  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | |  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4143726 gagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4143641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 16042709 - 16043062
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||  | ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  16042709 atggacatcaacgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcaataacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16042808  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16042809 agaatggaaagctcgttacggtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16042908  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||    
T  16042909 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactggggctactatggcttcttttaaagatgctcagaaggttgttcaagaaggacaggct 16043008  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16043009 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16043062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Original strand, 45388783 - 45388968
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45388783 gcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 45388882  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45388883 gagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 45388968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16448755 - 16448402
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  16448755 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 16448656  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||| | |||||| | || ||||||||||  ||| |    
T  16448655 agaatggaaagcttgttacggtccatggagaagaagcatatttggttagccagctgtcatctttctctagcattgaatctggatctgctgaagaaactac 16448556  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| || | |||| ||||| ||| ||    
T  16448555 cttccaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaagctggggctgctatggtttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 16448456  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16448455 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 16448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Original strand, 18542184 - 18542292
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  18542184 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18542283  T
Q  106 aagaatgga 114  Q
    |||||||||    
T  18542284 aagaatgga 18542292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 5129414 - 5129740
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  5129414 agaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggagg 5129513  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  5129514 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 5129613  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  5129614 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 5129713  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  5129714 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 5129740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 5160905 - 5161257
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  |    
T  5160905 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 5161004  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| |  | |||||||| || || |||||||| || | |||||||||||| || ||||| ||    
T  5161005 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagtagcagggtctgcagaggggaccgc 5161104  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| ||||| |||||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || || || || ||  ||    
T  5161105 ttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccatccaagagggccaagct 5161204  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  5161205 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 5161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10915589 - 10915263
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |  ||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  10915589 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaag 10915490  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  10915489 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggttctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 10915390  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| |||||||   | ||||||||  ||||||||    
T  10915389 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagattaatacagcttcgtgagaac 10915290  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||  ||| ||||||||  ||||||||    
T  10915289 aagtataaggaaggtcttggcttctcc 10915263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 4143881 - 4143825
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4143881 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 4143825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16502122 - 16501796
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  16502122 agaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 16502023  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  16502022 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 16501923  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  16501922 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 16501823  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  16501822 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 16501796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11423498 - 11423326
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  11423498 agaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 11423399  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaagg 215  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  11423398 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 11423326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 45388728 - 45388784
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45388728 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgc 45388784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Original strand, 2155995 - 2156311
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  2155995 agaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 2156094  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | || |||||    
T  2156095 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggtagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacctaa 2156194  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| |   |||| || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  2156195 gagggatggaactgacatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 2156294  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    || | ||| ||||||||    
T  2156295 aaacataaggaaggtct 2156311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 800272 - 800165
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||  |||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  800272 gatggacatccaagcatcctacagctgtttactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 800173  T
Q  106 aagaatgg 113  Q
    ||||||||    
T  800172 aagaatgg 800165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16517158 - 16516832
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  16517158 agaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 16517059  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  16517058 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 16516959  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||| | ||||||| | | ||| ||||  ||||||||    
T  16516958 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccagctggggcaggttaataaagcttcgtgagaac 16516859  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  16516858 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 16516832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16289135 - 16289028
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||  |||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16289135 gatggacatccaagcatcctacagctgtttactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttgaagttcgtg 16289036  T
Q  106 aagaatgg 113  Q
    | ||||||    
T  16289035 aggaatgg 16289028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 369
Target Start/End: Original strand, 4201081 - 4201137
Alignment:
Q  313 tggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4201081 tggggcaagttaatacaactccttgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4201137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28958555 - 28958192
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28958555 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28958456  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28958455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactg 28958356  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28958355 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 28958256  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28958255 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28958192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 24682833 - 24683196
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24682833 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24682932  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24682933 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24683032  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  24683033 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24683132  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24683133 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24683196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 24725360 - 24725723
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24725360 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24725459  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24725460 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24725559  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  24725560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24725659  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24725660 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24725723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 28650628 - 28650991
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28650628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28650727  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28650728 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 28650827  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  28650828 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28650927  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28650928 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28650991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 43079645 - 43080008
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43079645 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 43079744  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43079745 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 43079844  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  43079845 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 43079944  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43079945 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 43080008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 12133548 - 12133911
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  12133548 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 12133647  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12133648 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12133747  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12133748 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12133847  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12133848 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12133911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13323598 - 13323235
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13323598 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 13323499  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13323498 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13323399  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  13323398 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 13323299  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13323298 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 13323235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37357412 - 37357049
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37357412 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37357313  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37357312 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37357213  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  37357212 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37357113  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37357112 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37357049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 9318844 - 9319207
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  9318844 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 9318943  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9318944 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9319043  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9319044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9319143  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9319144 tgccggttggggcaaggtggtacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9319207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 30153411 - 30153774
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30153411 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30153510  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153511 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30153610  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  30153611 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 30153710  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30153711 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30153774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 34617911 - 34618274
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34617911 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 34618010  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34618011 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 34618110  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  34618111 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 34618210  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34618211 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34618274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 37756373 - 37756736
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37756373 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37756472  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37756473 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37756572  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  37756573 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37756672  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37756673 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37756736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 6875698 - 6876061
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6875698 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6875797  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6875798 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 6875897  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  6875898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 6875997  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6875998 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6876061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31825176 - 31824813
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31825176 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31825077  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31825076 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31824977  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  31824976 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31824877  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31824876 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31824813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37670252 - 37669889
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37670252 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37670153  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37670152 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 37670053  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  37670052 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37669953  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  37669952 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgaaaggaaggtctcgggttctcc 37669889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15757626 - 15757263
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15757626 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 15757527  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15757526 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 15757427  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  15757426 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 15757327  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15757326 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 15757263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 30030808 - 30031171
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30030808 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30030907  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30030908 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30031007  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  30031008 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 30031107  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30031108 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30031171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 30169862 - 30170225
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30169862 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30169961  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30169962 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30170061  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  30170062 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 30170161  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  30170162 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgcaaagaaggtctcgggttctcc 30170225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 2512444 - 2512807
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2512444 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 2512543  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2512544 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcacacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 2512643  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  2512644 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 2512743  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2512744 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 2512807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 3790934 - 3791297
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  3790934 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 3791033  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3791034 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3791133  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  3791134 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggttgctatgacttcattgaaagatgctcggaaggttatccaggaaggtcagac 3791233  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3791234 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3791297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8664244 - 8663881
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8664244 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8664145  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8664144 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8664045  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  8664044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagttggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 8663945  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8663944 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 8663881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 26481784 - 26482147
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |     
T  26481784 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 26481883  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26481884 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26481983  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26481984 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26482083  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26482084 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26482147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40472318 - 40471955
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  40472318 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 40472219  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||| ||||| || |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40472218 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40472119  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40472118 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggccgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40472019  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40472018 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40471955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Original strand, 31432834 - 31433196
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31432834 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 31432933  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31432934 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttatcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 31433033  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  31433034 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagact 31433133  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31433134 gccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31433196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37769755 - 37769393
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37769755 atggatattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 37769656  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37769655 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgc 37769556  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || || ||||||||||||    
T  37769555 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcggagagccatccaagaaggtcagact 37769456  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  37769455 gccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaggaaggtctcgggttctcc 37769393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 358
Target Start/End: Original strand, 33517749 - 33518101
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |     
T  33517749 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 33517848  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33517849 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33517948  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33517949 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 33518048  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33518049 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtc 33518101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18499499 - 18499136
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |     
T  18499499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 18499400  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18499399 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18499300  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |   | || || |||||  |    
T  18499299 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaagatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 18499200  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18499199 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32594865 - 32594689
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594865 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 32594766  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    | |  || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594765 gagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 32594689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Original strand, 5639358 - 5639543
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5639358 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 5639457  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5639458 gagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5639543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18374126 - 18373941
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18374126 gcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 18374027  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18374026 gagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18373941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 41676102 - 41676455
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  41676102 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 41676201  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  41676202 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatacttggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 41676301  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||| ||||| || ||  ||||| || | ||| | ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  41676302 cttttcaaggattaactgttgaatgtacggagtccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 41676401  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  41676402 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 41676455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 25200427 - 25200776
Alignment:
Q  11 acatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaa 110  Q
    |||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  25200427 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 25200526  T
Q  111 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 210  Q
    |||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||     
T  25200527 tggaaagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 25200626  T
Q  211 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||    
T  25200627 caaggtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccg 25200726  T
Q  311 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    | ||||||||| | || || ||| ||||||| ||||  || |||||||||    
T  25200727 gctggggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25200776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 22889863 - 22890216
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  22889863 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggtgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 22889962  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  22889963 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagcaggatctgctgaaggaactac 22890062  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||| ||||| ||  ||    
T  22890063 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaagct 22890162  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    | ||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  22890163 gtcggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 22890216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 33293918 - 33294271
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  33293918 gatggacgttaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 33294017  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  33294018 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 33294117  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  33294118 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33294217  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  33294218 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 33294271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15657529 - 15657176
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  15657529 gatggacattaatgcatcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcat- 15657431  T
Q  106 aagaa-tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggact 204  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || |||||     
T  15657430 aagaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggacc 15657331  T
Q  205 gctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcaga 304  Q
    ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||      
T  15657330 gcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaag 15657231  T
Q  305 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  15657230 ctgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 15657176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18126164 - 18125811
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  18126164 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18126065  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || |||||  |||| |||||| | ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||| || || ||||| |    
T  18126064 aggaatggaaagcttgttaccattcatggaaaagaggcatacctggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccg 18125965  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||| || || || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  18125964 cttttcagggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaaccgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18125865  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  18125864 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18125811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 360
Target Start/End: Original strand, 25264692 - 25264931
Alignment:
Q  121 gttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttga 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  25264692 gttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaaggtttga 25264791  T
Q  221 ccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaa 320  Q
    | ||||||||| | || ||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  25264792 ctattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccggctggggcaa 25264891  T
Q  321 ggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    | | || || ||| ||||||| ||||  || |||||||||    
T  25264892 gttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25264931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 23893600 - 23893952
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| | || |||||||| |||||||  |    
T  23893600 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcttaggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgcaa 23893699  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||    
T  23893700 agagtggaaagctcgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaaggaaccgc 23893799  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| |||||||| ||  | |||||| | ||||| || |  | | | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||   | || ||||||||  |     
T  23893800 ttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggattgagctgctatggcttctttgaaggatgcacatagggccgtccaagaaggtcaagcc 23893899  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    ||||| |||||||   | ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  23893900 gccggctggggcagattaatacaactccgtgagaacaagcataaggaaggtct 23893952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23716720 - 23716394
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  23716720 agaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggagg 23716621  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||  |  | |||||| | ||||||||    
T  23716620 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattagctgtcgaaggtacggagcctaa 23716521  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
     |  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  23716520 aagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 23716421  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  23716420 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 23716394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 33778917 - 33779243
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  33778917 agaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttactattcatggagaggaag 33779016  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  33779017 catacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 33779116  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  33779117 gagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 33779216  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  33779217 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 33779243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Original strand, 11550784 - 11551100
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||||||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  11550784 agaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaagtttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 11550883  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  11550884 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 11550983  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  11550984 gagggatggaactgccatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 11551083  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  11551084 aagcataaggaaggtct 11551100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Original strand, 30936063 - 30936379
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  30936063 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 30936162  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  30936163 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 30936262  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  30936263 gagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 30936362  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  30936363 aagcataaggaaggtct 30936379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 32594920 - 32594864
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32594920 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 32594864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23751182 - 23750856
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  23751182 agaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggagg 23751083  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  23751082 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 23750983  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  23750982 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 23750883  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  23750882 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 23750856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 5639303 - 5639359
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5639303 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 5639359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18374181 - 18374125
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18374181 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 18374125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24686925 - 24686573
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  |    
T  24686925 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24686826  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||    
T  24686825 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatataagcagggtctgcagaggggaccgc 24686726  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| ||||| || ||  | |||||| | || || ||||  | |||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   | || || |||||  ||    
T  24686725 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24686626  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  24686625 gtcggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24686573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Original strand, 24971448 - 24971764
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  24971448 agaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 24971547  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  24971548 catacctggttagccagctatcatctttttcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 24971647  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  24971648 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 24971747  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  24971748 aagcataaggaaggtct 24971764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22997846 - 22997520
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  22997846 agaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggagg 22997747  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||    |||||| | ||||| ||    
T  22997746 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgccgaaggtacggagcccaa 22997647  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  22997646 gagggatggaactgcaatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 22997547  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  22997546 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 22997520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 34467009 - 34467116
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||  |||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34467009 gatggacatccaagcatcctacagctgtttactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 34467108  T
Q  106 aagaatgg 113  Q
    ||||||||    
T  34467109 aagaatgg 34467116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19207190 - 19206828
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19207190 atggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 19207091  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19207090 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 19206991  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19206990 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagact 19206891  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19206890 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19206828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 19675825 - 19676188
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19675825 gatggacattaatgcctcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgctggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 19675924  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19675925 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagtagggtctgctgaagggactg 19676024  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  19676025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 19676124  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19676125 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19676188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 9356007 - 9356370
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9356007 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgta 9356106  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9356107 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9356206  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  9356207 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 9356306  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9356307 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9356370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 31355909 - 31356272
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31355909 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31356008  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31356009 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31356108  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  31356109 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31356208  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31356209 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31356272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3328338 - 3327975
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3328338 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3328239  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3328238 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 3328139  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  3328138 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 3328039  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3328038 tgccggctggggcaagatgatacaactctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3327975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Original strand, 29830707 - 29831069
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29830707 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 29830806  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29830807 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggcctgctgaagggactgc 29830906  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  29830907 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagact 29831006  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29831007 gccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29831069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28360786 - 28360423
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28360786 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28360687  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360686 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 28360587  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  28360586 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagaggctaaggaagctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28360487  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  28360486 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaggaaggtctcgggttctcc 28360423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12091555 - 12091192
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12091555 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12091456  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12091455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 12091356  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  12091355 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 12091256  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  12091255 taccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgaaaggaaggtctcgggttctcc 12091192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 33260107 - 33260470
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33260107 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33260206  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  33260207 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 33260306  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  33260307 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33260406  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33260407 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33260470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31488526 - 31488341
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31488526 gcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 31488427  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31488426 gagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31488341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22079732 - 22079453
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||| | || || ||||| |||||||| |    
T  22079732 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctaggaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccaaaagttaaagtttgtaa 22079633  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  22079632 agaatggaaagctcgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 22079533  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaggg 286  Q
    ||| || |||||||| || |||||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22079532 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagaggg 22079453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 359
Target Start/End: Original strand, 16284867 - 16285186
Alignment:
Q  40 ggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaag 139  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||  || |  ||||| || |||||||| ||||| || |    
T  16284867 ggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccttgcaccagaagttgaagtttgcaaaaagcggaaagcttgttacaattcatggagagg 16284966  T
Q  140 aagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcc 239  Q
    |||||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||  | |||||| | |||||    
T  16284967 aagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgcttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcc 16285066  T
Q  240 taagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgag 339  Q
     || |  | |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |   |  | ||||||||  ||||||| ||||||| | | ||||| ||  |||||    
T  16285067 caaaagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtctaagaaggtcaagctgccggctggggcaggttaatacaacttcgtgag 16285166  T
Q  340 aacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  16285167 aacaagcataaggaaggtct 16285186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2136089 - 2135727
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||  | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  |    
T  2136089 atggatattaatgcctcttacagttgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 2135990  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || |||||||||   || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  2135989 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacccggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 2135890  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| ||||| || ||  | |||||| | ||||||||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||    
T  2135889 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 2135790  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  2135789 gccggttggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 2135727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27607699 - 27607373
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| ||||  || |||||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  27607699 agaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaaaaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 27607600  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||  | |||||| | ||||| ||    
T  27607599 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggactaactgtcgaaggtacggagcccaa 27607500  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  27607499 gagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 27607400  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  27607399 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 27607373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 14559045 - 14559371
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |  ||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  14559045 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgccaaaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaag 14559144  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || | |||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  14559145 catacctggttaaccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 14559244  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  |  ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  14559245 gagggagggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 14559344  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||  ||| ||||||||  ||||||||    
T  14559345 aagtataaggaaggtcttagcttctcc 14559371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 18792128 - 18792454
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  18792128 agaccatggatacatgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 18792227  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||||||    
T  18792228 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 18792327  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  18792328 gagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaac 18792427  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  18792428 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 18792454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 19689519 - 19689845
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  19689519 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 19689618  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||  | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | || |||||    
T  19689619 catatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacctaa 19689718  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  19689719 gagggatggaactgcgatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 19689818  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  19689819 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 19689845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Original strand, 16278975 - 16279290
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  16278975 agaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggagg 16279074  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  16279075 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttt-caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 16279173  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    || || |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  16279174 gagagatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 16279273  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  16279274 aagcataaggaaggtct 16279290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 31488581 - 31488525
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31488581 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 31488525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1312 - 949
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1312 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggtgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 1213  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1212 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatatttggtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 1113  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1112 ctttccaaggtttgacctttgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaagttattcaggaaggtcagac 1013  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1012 tgccggttggggcaaggtgatacagcttcgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 10950 - 11313
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10950 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgtgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11049  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11050 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagctagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11149  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  11150 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 11249  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  11250 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaggaaggtctcggattctcc 11313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11109262 - 11108908
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11109262 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11109163  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11109162 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11109063  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || || ||||||||    
T  11109062 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 11108963  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11108962 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28114867 - 28114504
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28114867 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgag 28114768  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28114767 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 28114668  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28114667 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 28114568  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28114567 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28114504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5595270 - 5594916
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5595270 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5595171  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5595170 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5595071  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  5595070 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 5594971  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5594970 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5594916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 10397478 - 10397841
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10397478 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 10397577  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10397578 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10397677  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  10397678 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 10397777  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10397778 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10397841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4345600 - 4345237
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4345600 gatggacatcaacgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4345501  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4345500 aagcatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4345401  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || || |||||||||||    
T  4345400 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagacgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4345301  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4345300 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4345237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20575760 - 20575397
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  20575760 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 20575661  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20575660 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 20575561  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20575560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 20575461  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20575460 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 20575397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22869768 - 22869406
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22869768 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22869669  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22869668 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22869569  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  22869568 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagact 22869469  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22869468 gccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22869406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22884827 - 22884465
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22884827 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22884728  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22884727 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22884628  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  22884627 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagact 22884528  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22884527 gccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22884465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17983869 - 17983506
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17983869 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17983770  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983769 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17983670  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  17983669 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 17983570  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17983569 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17983506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 18244084 - 18244447
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18244084 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18244183  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18244184 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgctgaagggactg 18244283  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  18244284 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 18244383  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  18244384 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaggaaggtctcgggttctcc 18244447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 24329504 - 24329867
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24329504 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24329603  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24329604 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24329703  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  24329704 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24329803  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24329804 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24329867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29663883 - 29663520
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  29663883 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29663784  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||| ||| || |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29663783 aggaatgaaaagcttgttaccgttcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29663684  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29663683 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 29663584  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29663583 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29663520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31963386 - 31963023
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31963386 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31963287  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31963286 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 31963187  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  31963186 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 31963087  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31963086 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31963023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 48467272 - 48467635
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48467272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 48467371  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48467372 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 48467471  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  48467472 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctgggactgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 48467571  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  48467572 tgccggttggggcaaggtgatacagctctatgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 48467635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 51783368 - 51783731
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51783368 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 51783467  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51783468 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51783567  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  51783568 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 51783667  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51783668 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51783731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5608235 - 5607881
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5608235 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5608136  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5608135 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5608036  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  5608035 ctttccaaggtctgaccattgaaggtgcagagtctaaagaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 5607936  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5607935 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5607881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 5468330 - 5468684
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5468330 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgta 5468429  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5468430 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5468529  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  5468530 ctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 5468629  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5468630 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5468684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 8213083 - 8213437
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8213083 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8213182  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213183 acgaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8213282  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |   | || || |||||  |    
T  8213283 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagcctaagaaagctggagctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 8213382  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 8213437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 4418264 - 4418627
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |     
T  4418264 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 4418363  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4418364 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4418463  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4418464 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 4418563  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4418564 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4418627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6541375 - 6541012
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6541375 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6541276  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6541275 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 6541176  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || || |||||||||||    
T  6541175 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgttcagagagccatccaagaaggtcagac 6541076  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6541075 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6541012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 10644415 - 10644778
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10644415 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagatcgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10644514  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644515 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10644614  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  10644615 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 10644714  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10644715 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10644778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 21676038 - 21676401
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676038 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 21676137  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676138 aagaatggaaaaatcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21676237  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |   | || || |||||  |    
T  21676238 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 21676337  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21676338 tgccggttggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21676401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 28022621 - 28022974
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28022621 atggacattaatgcgtcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 28022720  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28022721 agaatggaaaactcgttacaatccgtggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactgc 28022820  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || || ||||||||     
T  28022821 tttccaaggtttgaccattgaagatgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagacc 28022920  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28022921 gccggctggggcaaagtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 28022974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 7997907 - 7998270
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7997907 gatggacattaacgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 7998006  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7998007 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 7998106  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  7998107 cgttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 7998206  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7998207 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 7998270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 5015057 - 5015420
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5015057 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5015156  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  5015157 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 5015256  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  5015257 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 5015356  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5015357 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 18226536 - 18226899
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |     
T  18226536 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 18226635  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18226636 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18226735  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18226736 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 18226835  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18226836 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18226899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 47024798 - 47025161
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47024798 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcaaaagttgaaatttgtg 47024897  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  47024898 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaaggaactg 47024997  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  47024998 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 47025097  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  47025098 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 47025161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36995935 - 36995750
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36995935 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 36995836  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36995835 gagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 36995750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 369
Target Start/End: Original strand, 28340702 - 28340887
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28340702 gcagggtctgctgaaggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 28340801  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28340802 gagccattcaagaaggtcagactgccggctgggggaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28340887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 7074557 - 7074920
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  7074557 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 7074656  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  7074657 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctgtcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 7074756  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |    
T  7074757 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 7074856  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  7074857 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 7074920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18291266 - 18290903
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  18291266 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcat- 18291168  T
Q  106 aagaa-tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggact 204  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || |||||     
T  18291167 aagaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggacc 18291068  T
Q  205 gctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcaga 304  Q
    ||||| ||||| || ||  |||||||  | || |||||||| | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||      
T  18291067 gcttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaag 18290968  T
Q  305 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  18290967 ctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18290903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18306567 - 18306204
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  18306567 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcat- 18306469  T
Q  106 aagaa-tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggact 204  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || |||||     
T  18306468 aagaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggacc 18306369  T
Q  205 gctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcaga 304  Q
    ||||| ||||| || ||  |||||||  | || |||||||| | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||      
T  18306368 gcttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaag 18306269  T
Q  305 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  18306268 ctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18306204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 20067388 - 20067741
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  20067388 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcat- 20067486  T
Q  106 aagaa-tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggact 204  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || |||||     
T  20067487 aagaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggacc 20067586  T
Q  205 gctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcaga 304  Q
    ||||| |||||||| ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||      
T  20067587 gcttttcaaggtttaactctcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaag 20067686  T
Q  305 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||||||  |||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20067687 ctgccggccggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 20067741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 18531734 - 18532087
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  18531734 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 18531833  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||| | ||||| |||||    
T  18531834 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctaccgaaggaactgc 18531933  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| |||||||||   |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||| ||||||| || | |||| ||||| ||| ||    
T  18531934 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagcctaagaagactggggctgccatggcatctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 18532033  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  18532034 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 18532087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18275965 - 18275602
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  18275965 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcat- 18275867  T
Q  106 aagaa-tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggact 204  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || |||||     
T  18275866 aagaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggacc 18275767  T
Q  205 gctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcaga 304  Q
    ||||| ||||| || ||  |||||||  | || |||||||| | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||      
T  18275766 gcttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaag 18275667  T
Q  305 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||| ||| ||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  18275666 ctgccggctggagcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttagcttctcc 18275602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16625513 - 16625160
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| || || || ||| | || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |    
T  16625513 atggacatcaatgcttcttatagctgtatcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 16625414  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    ||||||| || || |||| | |||||||  |||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16625413 agaatgggaagcttgttatagtccatggataagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16625314  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||| ||    
T  16625313 ctttcaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaggctggggctgctgtggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 16625214  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16625213 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16625160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 32440499 - 32440852
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  32440499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgtggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcat- 32440597  T
Q  106 aagaa-tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggact 204  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | || |||||||| || || |||||||| || || |||||||| || || |||||     
T  32440598 aagaagtggaaagcttgttaccattcatggagaagaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggacc 32440697  T
Q  205 gctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcaga 304  Q
    ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||      
T  32440698 gcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaag 32440797  T
Q  305 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  32440798 ctgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 32440852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Original strand, 8297318 - 8297680
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||  | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  8297318 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 8297417  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  8297418 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 8297517  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| |||| || |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||    
T  8297518 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagagatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 8297617  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  8297618 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 8297680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15740006 - 15739644
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  15740006 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttagggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 15739907  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || || |||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  15739906 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 15739807  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| ||||| || ||  | |||||| | || || ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| |||||  |||| |   | || || |||||  ||    
T  15739806 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 15739707  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  15739706 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 15739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 18052626 - 18052970
Alignment:
Q  25 tacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgtta 124  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||    
T  18052626 tacagctgtctcctggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgtta 18052725  T
Q  125 caatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccat 224  Q
    | || ||||| || ||||||||  | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  |    
T  18052726 ccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgt 18052825  T
Q  225 tgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtg 324  Q
     |||||| | ||||| ||||  | |||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | |     
T  18052826 cgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggtta 18052925  T
Q  325 atacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  18052926 atacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18052970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Original strand, 6193661 - 6193869
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  |    
T  6193661 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 6193760  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  6193761 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 6193860  T
Q  207 tttccaagg 215  Q
    ||| |||||    
T  6193861 ttttcaagg 6193869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15891582 - 15891266
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  15891582 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 15891483  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||  | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||||||    
T  15891482 catatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 15891383  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
     || | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  15891382 aaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 15891283  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  15891282 aagcataaggaaggtct 15891266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Original strand, 4723013 - 4723329
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  4723013 agaccgtggatacatgatgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggagg 4723112  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  4723113 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 4723212  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  4723213 gagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 4723312  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  4723313 aagcataaggaaggtct 4723329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 28340647 - 28340703
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28340647 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 28340703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 36995990 - 36995934
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36995990 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 36995934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8288347 - 8288021
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  8288347 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 8288248  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||||||    
T  8288247 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtcggcggaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 8288148  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
     |  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  |||| || ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  8288147 aagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgctggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 8288048  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  8288047 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 8288021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 20441462 - 20441569
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20441462 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 20441561  T
Q  106 aagaatgg 113  Q
    ||||||||    
T  20441562 aagaatgg 20441569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 41438588 - 41438695
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41438588 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 41438687  T
Q  106 aagaatgg 113  Q
    ||||||||    
T  41438688 aagaatgg 41438695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22386454 - 22386128
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  22386454 agaccatggatacacgatgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggagg 22386355  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  22386354 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 22386255  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| || || ||| | ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  22386254 gagggatggaactgcgatggcttctttaaaggatacacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 22386155  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  22386154 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 22386128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 35882148 - 35882474
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  35882148 agaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggagg 35882247  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  35882248 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 35882347  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||| |||| |||||||| ||||| ||||| || || |   | |  || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  35882348 gagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacatagagccgtccgagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 35882447  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  35882448 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 35882474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 18332010 - 18332336
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || | ||| || ||||    
T  18332010 agaccatggatacacgacgcgggaacagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcgtggagaggaag 18332109  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  18332110 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 18332209  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||   |||||||    
T  18332210 gagggatggaactgcaatgacttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcttgagaac 18332309  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  18332310 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 18332336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29147667 - 29147305
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  |    
T  29147667 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 29147568  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || || |||||| | || ||||| || || || |||||||| || || || |||||||| || ||||| ||    
T  29147567 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccaactatcatctttctcttgcatagaggcggggtctgcagaggggaccgc 29147468  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| ||||| || ||  | |||||| | ||| | ||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||   |    
T  29147467 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagtccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagtt 29147368  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  29147367 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29147305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4795529 - 4795288
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  4795529 agaccttggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 4795430  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  4795429 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 4795330  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagag 284  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4795329 gagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagag 4795288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13802 - 13439
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13802 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 13703  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13702 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13603  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  13602 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 13503  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13502 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 13439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 10964053 - 10964416
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10964053 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10964152  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10964153 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10964252  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  10964253 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 10964352  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10964353 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10964416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41792180 - 41791817
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41792180 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 41792081  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41792080 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 41791981  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  41791980 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 41791881  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41791880 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 41791817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 51639601 - 51639964
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  51639601 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 51639700  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51639701 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51639800  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  51639801 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 51639900  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51639901 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51639964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 10946462 - 10946825
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10946462 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10946561  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10946562 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10946661  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  || || |||||||||||    
T  10946662 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagac 10946761  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10946762 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10946825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 28586364 - 28586727
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28586364 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28586463  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  28586464 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 28586563  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  28586564 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 28586663  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28586664 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28586727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16206902 - 16206549
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||||||||| |  || || |||||  | |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  16206902 atggacatcaatgcctattatagctgtctcttgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16206803  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16206802 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagccggatctgctgaaggaactgc 16206703  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
     || ||||||||||| ||||||||| | ||||  || ||  |||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| || | |||||||||| ||| ||    
T  16206702 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaaaaagactggggctactatggcttcttttaaagacgctcagaaggctgttcaggaaggacaggct 16206603  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  16206602 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcataaggaaggtctc 16206549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Original strand, 20462469 - 20462647
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||  | ||||||||||| |    
T  20462469 atggatatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccaacaattgaagtttgtaa 20462568  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagc 185  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20462569 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagc 20462647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 7399 - 7762
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7399 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 7498  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7499 aagaatggaaagctcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 7598  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||| |||||||||||    
T  7599 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccattcaagaaggtcagac 7698  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7699 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 7762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25073 - 24710
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25073 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24974  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24973 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 24874  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  24873 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24774  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24773 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6108 - 5746
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  6108 atggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataa 6009  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
     |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6008 ggaatggaaaacttgttaccattcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 5909  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||    
T  5908 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaagagggtcagact 5809  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5808 gccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 9333 - 9696
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9333 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9432  T
Q  106 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9433 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 9532  T
Q  206 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagac 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||    
T  9533 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 9632  T
Q  306 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  9633 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgaaaggaaggtctcgggttctcc 9696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 125 - 369
Target Start/End: Original strand, 27708 - 27952
Alignment:
Q  125 caatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27708 caatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcaggatttgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgt 27807  T
Q  225 tgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtg 324  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27808 tgaaggtgcagagtctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtg 27907  T
Q  325 atacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctctgcttctcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  27908 atacagctctgtgagaacaagcgtaaggaaggtctcgggttctcc 27952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7883 - 7707
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7883 gcagggtctactgaagggactgctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagtctaaagaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 7784  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7783 gagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 7707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21436 - 21260
Alignment:
Q  184 gcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcaga 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21436 gcagggtctactgaagggactgctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagtctaaagaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcaga 21337  T
Q  284 gggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21336 gagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 21260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7938 - 7882
Alignment:
Q  6 gatggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgc 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7938 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgc 7882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 31838 - 32190
Alignment:
Q  7 atggacatcaatgcatcctacagttgtctgctaggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtga 106  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| ||||  |    
T  31838 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 31937  T
Q  107 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 206  Q
    | | |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||    
T  31938 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 32037  T
Q  207 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 306  Q
    ||| ||||| || ||  | |||||| | ||||||||||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || ||||||||  ||    
T  32038 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagaaggtcaagct 32137  T
Q  307 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtct 359  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  32138 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagagcaagcataaggaaggtct 32190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 46232 - 46134
Alignment:
Q  262 gcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 360  Q
    ||||| || ||||| ||||||| || | |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  46232 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 46134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Original strand, 31178 - 31494
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  31178 agaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccagaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 31277  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||||||    
T  31278 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 31377  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
     |  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  31378 aagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 31477  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  31478 aagcataaggaaggtct 31494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38904 - 38588
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  38904 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 38805  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||||||    
T  38804 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 38705  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  38704 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 38605  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| | | ||||||||    
T  38604 aagcatgaggaaggtct 38588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45820 - 45504
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||  || | ||| || || ||||| || ||||| || ||||    
T  45820 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtgggaagcttgttaccattcatggagaggaag 45721  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||||||    
T  45720 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 45621  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
     |  | |||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  45620 aagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 45521  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  45520 aagcataaggaaggtct 45504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Original strand, 28714 - 29030
Alignment:
Q  43 agaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaag 142  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | || || || || |||||||| ||||  || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  28714 agaccttggatacatgacgcgggggcggtgacccctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 28813  T
Q  143 catacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaa 242  Q
    ||||| | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| | ||||| ||    
T  28814 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 28913  T
Q  243 gaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaac 342  Q
    ||  | |||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   | || || |||||  ||||||| ||||||| | | ||| ||||  ||||||||    
T  28914 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatatagcttcgtgagaac 29013  T
Q  343 aagcgtaaagaaggtct 359  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  29014 aagcataaggaaggtct 29030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University