View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12821_high_10 (Length: 270)

Name: NF12821_high_10
Description: NF12821
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12821_high_10
NF12821_high_10
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (11-253)||(27434295-27434537)
chr2 (11-253)||(28882362-28882604)
chr2 (11-253)||(20838066-20838308)
chr2 (11-253)||(12655690-12655932)
chr2 (11-253)||(23128417-23128659)
chr2 (11-253)||(13936395-13936637)
chr2 (11-253)||(27777370-27777612)
chr2 (11-253)||(27817128-27817370)
chr2 (11-253)||(37375309-37375551)
chr2 (11-238)||(11635037-11635264)
chr2 (11-238)||(11641226-11641453)
chr2 (11-253)||(12586958-12587200)
chr2 (11-253)||(12716453-12716695)
chr2 (11-253)||(27803855-27804097)
chr2 (11-253)||(39051673-39051915)
chr2 (11-253)||(260604-260846)
chr2 (11-253)||(21677033-21677275)
chr2 (11-253)||(31876429-31876671)
chr2 (11-253)||(32049946-32050188)
chr2 (11-253)||(16829189-16829431)
chr2 (11-253)||(16892050-16892292)
chr2 (11-253)||(34861828-34862070)
chr2 (11-253)||(37685760-37686002)
chr2 (11-253)||(37701025-37701267)
chr2 (11-253)||(37925641-37925883)
chr2 (11-253)||(39890222-39890464)
chr2 (11-253)||(40233659-40233901)
chr2 (11-253)||(19416350-19416592)
chr2 (11-253)||(34286502-34286744)
chr2 (11-253)||(34291562-34291804)
chr2 (11-253)||(9349833-9350075)
chr2 (23-253)||(21703027-21703257)
chr2 (23-253)||(22925891-22926121)
chr2 (23-253)||(19456284-19456514)
chr2 (23-253)||(34303166-34303396)
chr2 (152-253)||(34279597-34279698)
chr2 (23-253)||(27118836-27119066)
chr2 (43-253)||(31891211-31891421)
chr2 (23-253)||(3784802-3785032)
chr2 (23-253)||(16163747-16163977)
chr2 (23-253)||(34157159-34157388)
chr2 (99-253)||(27393117-27393271)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (11-253)||(10916616-10916858)
chr7 (14-253)||(16503131-16503370)
chr7 (11-253)||(11424524-11424766)
chr7 (14-253)||(16518167-16518406)
chr7 (11-253)||(2154726-2154968)
chr7 (11-253)||(26537618-26537860)
chr7 (11-253)||(26435410-26435652)
chr7 (11-253)||(5128145-5128387)
chr7 (11-253)||(11441725-11441967)
chr7 (11-253)||(4144871-4145113)
chr7 (11-253)||(5147088-5147330)
chr7 (11-253)||(26669662-26669904)
chr7 (11-253)||(3445459-3445701)
chr7 (11-253)||(26319617-26319859)
chr7 (11-253)||(24592289-24592531)
chr7 (11-253)||(26274842-26275084)
chr7 (11-253)||(45387496-45387738)
chr7 (11-238)||(31564138-31564365)
chr7 (11-253)||(9618804-9619046)
chr7 (11-238)||(16736208-16736435)
chr7 (11-238)||(16751262-16751489)
chr7 (11-238)||(17523700-17523927)
chr7 (11-238)||(17529288-17529515)
chr7 (11-253)||(31125073-31125315)
chr7 (23-253)||(16449758-16449988)
chr7 (24-253)||(16041476-16041705)
chr7 (23-253)||(4200700-4200930)
chr7 (23-253)||(26484847-26485077)
chr7 (23-253)||(2775512-2775742)
chr7 (23-253)||(39210783-39211013)
chr7 (30-253)||(2108772-2108995)
chr7 (23-253)||(26682760-26682990)
chr7 (43-253)||(18540952-18541162)
chr7 (23-253)||(31088224-31088454)
chr7 (23-253)||(45733613-45733843)
chr7 (43-253)||(5159672-5159882)
chr7 (11-57)||(26513130-26513176)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (11-253)||(14665185-14665427)
chr4 (11-253)||(17014167-17014409)
chr4 (11-253)||(24592176-24592418)
chr4 (11-253)||(36344377-36344619)
chr4 (11-253)||(18800475-18800717)
chr4 (11-253)||(14763166-14763408)
chr4 (11-238)||(39850820-39851047)
chr4 (11-238)||(6570035-6570262)
chr4 (11-253)||(14098708-14098950)
chr4 (11-253)||(33673660-33673902)
chr4 (11-253)||(40105500-40105742)
chr4 (11-253)||(30753921-30754163)
chr4 (11-253)||(31126380-31126622)
chr4 (11-253)||(21969868-21970110)
chr4 (11-253)||(54833554-54833796)
chr4 (19-253)||(5006040-5006274)
chr4 (11-253)||(27163179-27163421)
chr4 (23-253)||(1900424-1900654)
chr4 (23-253)||(15284802-15285032)
chr4 (23-253)||(15228037-15228267)
chr4 (43-253)||(24112829-24113039)
chr4 (43-235)||(34188854-34189046)
chr4 (23-253)||(24460479-24460709)
chr4 (23-253)||(14235399-14235629)
chr4 (23-253)||(15391212-15391442)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (11-253)||(15892609-15892851)
chr3 (11-253)||(4796556-4796798)
chr3 (11-253)||(8301170-8301412)
chr3 (11-253)||(6192429-6192671)
chr3 (11-253)||(8296085-8296327)
chr3 (11-253)||(15740997-15741239)
chr3 (11-253)||(22387481-22387723)
chr3 (11-253)||(18330782-18331024)
chr3 (11-253)||(29148658-29148900)
chr3 (11-253)||(35880879-35881121)
chr3 (11-252)||(18051376-18051617)
chr3 (11-253)||(4721744-4721986)
chr3 (11-253)||(4346590-4346832)
chr3 (11-253)||(7073325-7073567)
chr3 (11-253)||(20576750-20576992)
chr3 (11-253)||(28021388-28021630)
chr3 (11-253)||(8211851-8212093)
chr3 (11-253)||(18276955-18277197)
chr3 (11-253)||(18307557-18307799)
chr3 (11-253)||(48466040-48466282)
chr3 (19-238)||(4417047-4417266)
chr3 (11-238)||(28115857-28116084)
chr3 (11-238)||(29664873-29665100)
chr3 (11-253)||(5467098-5467340)
chr3 (11-253)||(18292256-18292498)
chr3 (19-253)||(10396246-10396480)
chr3 (11-253)||(11110252-11110494)
chr3 (11-253)||(21674806-21675048)
chr3 (11-253)||(22870759-22871001)
chr3 (11-253)||(22885818-22886060)
chr3 (11-253)||(36996980-36997222)
chr3 (11-253)||(51782136-51782378)
chr3 (19-253)||(51797226-51797460)
chr3 (11-253)||(5013825-5014067)
chr3 (19-253)||(31964384-31964618)
chr3 (11-253)||(6542365-6542607)
chr3 (11-253)||(18242852-18243094)
chr3 (11-253)||(24328272-24328514)
chr3 (11-253)||(47023566-47023808)
chr3 (27-253)||(50133990-50134216)
chr3 (11-253)||(5596260-5596502)
chr3 (11-253)||(5609225-5609467)
chr3 (11-253)||(18225304-18225546)
chr3 (11-238)||(28339430-28339657)
chr3 (11-253)||(7996675-7996917)
chr3 (11-253)||(10643183-10643425)
chr3 (11-253)||(17984859-17985101)
chr3 (23-253)||(5713340-5713570)
chr3 (23-253)||(5724250-5724480)
chr3 (23-253)||(5756997-5757227)
chr3 (23-253)||(5767888-5768118)
chr3 (23-253)||(18530501-18530731)
chr3 (23-253)||(31034032-31034262)
chr3 (23-253)||(32292865-32293095)
chr3 (23-253)||(16626421-16626651)
chr3 (23-253)||(5652500-5652730)
chr3 (11-253)||(17993687-17993929)
chr3 (43-253)||(32439267-32439477)
chr3 (102-253)||(20066156-20066307)
chr3 (23-253)||(4626057-4626287)
chr3 (189-253)||(4893323-4893387)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (11-253)||(2137080-2137322)
chr8 (11-253)||(14557776-14558018)
chr8 (11-253)||(19688250-19688492)
chr8 (11-253)||(16277706-16277948)
chr8 (19-253)||(27608734-27608968)
chr8 (11-241)||(189258-189488)
chr8 (11-253)||(16283601-16283843)
chr8 (11-253)||(31489571-31489813)
chr8 (11-238)||(19674608-19674835)
chr8 (11-253)||(19208181-19208423)
chr8 (11-253)||(19286614-19286856)
chr8 (11-253)||(28361776-28362018)
chr8 (11-253)||(29829474-29829716)
chr8 (11-253)||(33258875-33259117)
chr8 (11-238)||(3329328-3329555)
chr8 (19-253)||(31354676-31354910)
chr8 (11-238)||(12092545-12092772)
chr8 (11-253)||(9354774-9355017)
chr8 (23-253)||(18710738-18710968)
chr8 (23-253)||(19658873-19659102)
chr8 (30-253)||(33244817-33245040)
chr8 (23-253)||(44563253-44563481)
chr8 (23-253)||(22080711-22080941)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (11-253)||(15424122-15424364)
chr6 (11-253)||(22934685-22934927)
chr6 (11-253)||(23857130-23857372)
chr6 (11-253)||(16750003-16750245)
chr6 (11-253)||(26989150-26989392)
chr6 (20-253)||(24863866-24864099)
chr6 (11-253)||(26918529-26918771)
chr6 (11-253)||(13298756-13298998)
chr6 (11-253)||(24304423-24304665)
chr6 (11-253)||(27272385-27272627)
chr6 (11-253)||(29549624-29549866)
chr6 (11-253)||(34463151-34463393)
chr6 (11-253)||(3696230-3696472)
chr6 (11-253)||(29573162-29573404)
chr6 (12-253)||(16674288-16674529)
chr6 (11-253)||(29501564-29501806)
chr6 (11-253)||(30557821-30558063)
chr6 (21-253)||(17025426-17025658)
chr6 (11-253)||(16943832-16944074)
chr6 (11-253)||(27485278-27485520)
chr6 (11-253)||(4723939-4724181)
chr6 (73-253)||(27000222-27000402)
chr6 (11-238)||(4545580-4545807)
chr6 (11-253)||(26116215-26116457)
chr6 (11-253)||(27007876-27008118)
chr6 (11-253)||(27044536-27044779)
chr6 (11-253)||(4525435-4525677)
chr6 (11-253)||(4757913-4758155)
chr6 (19-253)||(27359805-27360039)
chr6 (19-253)||(27450148-27450382)
chr6 (19-238)||(4773170-4773389)
chr6 (11-253)||(28207603-28207845)
chr6 (11-253)||(27290175-27290417)
chr6 (43-253)||(26777452-26777662)
chr6 (23-253)||(14143102-14143332)
chr6 (23-253)||(26788093-26788323)
chr6 (23-253)||(27196466-27196696)
chr6 (23-253)||(27252544-27252774)
chr6 (23-253)||(13521890-13522120)
chr6 (47-253)||(22456775-22456981)
chr6 (62-238)||(20160865-20161041)
chr6 (62-238)||(22171790-22171966)
chr6 (24-193)||(17092258-17092427)
chr6 (32-253)||(33374082-33374303)
chr6 (23-253)||(8892128-8892357)
chr6 (23-253)||(8903363-8903592)
chr6 (32-253)||(28162806-28163027)
chr6 (11-77)||(27019461-27019527)
chr6 (173-253)||(22477240-22477320)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (11-253)||(11549515-11549757)
chr5 (11-253)||(23717747-23717989)
chr5 (11-253)||(24687916-24688158)
chr5 (11-253)||(22998873-22999115)
chr5 (11-253)||(30934794-30935036)
chr5 (12-253)||(33777648-33777889)
chr5 (11-253)||(23752209-23752451)
chr5 (23-253)||(9548314-9548544)
chr5 (11-253)||(15658519-15658761)
chr5 (11-253)||(24970179-24970421)
chr5 (11-253)||(28649396-28649638)
chr5 (11-253)||(43078413-43078655)
chr5 (11-253)||(24681601-24681843)
chr5 (11-253)||(24724128-24724370)
chr5 (11-253)||(40473308-40473550)
chr5 (19-253)||(8665242-8665476)
chr5 (11-253)||(9317612-9317854)
chr5 (11-253)||(12132316-12132558)
chr5 (11-253)||(18500489-18500731)
chr5 (11-253)||(37755141-37755383)
chr5 (11-238)||(13324588-13324815)
chr5 (11-253)||(3789702-3789944)
chr5 (19-253)||(15758624-15758858)
chr5 (11-253)||(18375171-18375413)
chr5 (11-253)||(29966825-29967067)
chr5 (11-253)||(30029576-30029818)
chr5 (11-253)||(30152179-30152421)
chr5 (11-253)||(31826166-31826408)
chr5 (11-253)||(33516517-33516759)
chr5 (11-253)||(34616679-34616921)
chr5 (11-253)||(2511212-2511454)
chr5 (11-253)||(6874466-6874708)
chr5 (11-253)||(30168630-30168872)
chr5 (11-253)||(31431601-31431843)
chr5 (11-253)||(5638071-5638313)
chr5 (11-253)||(26480553-26480794)
chr5 (14-253)||(37770749-37770988)
chr5 (11-253)||(37358402-37358644)
chr5 (11-253)||(37671242-37671484)
chr5 (19-238)||(32599239-32599458)
chr5 (19-253)||(28959553-28959787)
chr5 (11-253)||(23892367-23892609)
chr5 (11-253)||(29888841-29889083)
chr5 (23-253)||(22888631-22888861)
chr5 (23-253)||(25199190-25199420)
chr5 (11-253)||(41674870-41675112)
chr5 (23-253)||(33877408-33877638)
chr5 (23-253)||(11325955-11326185)
chr5 (23-253)||(13184419-13184649)
chr5 (43-253)||(33292686-33292896)
chr5 (23-253)||(13440265-13440495)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (11-253)||(39931-40173)
scaffold0089 (11-253)||(46847-47089)
scaffold0089 (11-250)||(29918-30157)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (12-253)||(27444-27685)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (21-253)||(1-233)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (11-253)||(30604-30846)
scaffold0124 (69-253)||(20540-20723)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-253)||(14792-15034)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (11-253)||(8928-9170)
scaffold0159 (11-253)||(20167-20409)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (11-253)||(10962821-10963063)
chr1 (11-253)||(41793170-41793412)
chr1 (11-253)||(28585132-28585374)
chr1 (11-253)||(51638369-51638611)
chr1 (23-253)||(16207905-16208135)
chr1 (23-253)||(20340209-20340439)
chr1 (23-253)||(28152013-28152243)
chr1 (24-253)||(20461232-20461461)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (11-253)||(7101-7343)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (11-253)||(6165-6408)
scaffold0415 (69-253)||(1838-2021)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (19-253)||(9718-9952)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (11-253)||(26063-26305)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-253)||(8101-8343)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (11-253)||(46661-46912)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (23-253)||(2532-2762)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (18-241)||(487-710)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (126-253)||(5-132)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (23-253)||(21713-21943)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 27434295 - 27434537
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27434295 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 27434394  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  27434395 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 27434494  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434495 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 27434537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28882604 - 28882362
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28882604 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 28882505  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28882504 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 28882405  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882404 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 28882362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20838308 - 20838066
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  20838308 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaattt 20838209  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  20838208 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 20838109  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838108 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 20838066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12655932 - 12655690
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12655932 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 12655833  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  12655832 acggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 12655733  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655732 aagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 12655690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 23128417 - 23128659
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23128417 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 23128516  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  23128517 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 23128616  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23128617 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatg 23128659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 13936395 - 13936637
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  13936395 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 13936494  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13936495 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttca 13936594  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  13936595 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 13936637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27777612 - 27777370
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  27777612 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 27777513  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  27777512 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 27777413  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  27777412 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 27777370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27817370 - 27817128
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  27817370 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 27817271  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  27817270 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 27817171  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  27817170 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 27817128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37375551 - 37375309
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||     
T  37375551 cagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattc 37375452  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37375451 acagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttca 37375352  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37375351 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 37375309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 11635037 - 11635264
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||     
T  11635037 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattc 11635136  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11635137 acagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttca 11635236  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11635237 aagcataacacccctcaacatcatgacc 11635264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 11641226 - 11641453
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||     
T  11641226 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattc 11641325  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11641326 acagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttca 11641425  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11641426 aagcataacacccctcaacatcatgacc 11641453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12587200 - 12586958
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  12587200 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 12587101  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  12587100 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 12587001  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  12587000 aagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 12586958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 12716453 - 12716695
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  12716453 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 12716552  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  12716553 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 12716652  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  12716653 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 12716695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27804097 - 27803855
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  27804097 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 27803998  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  27803997 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 27803898  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  27803897 aagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatg 27803855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 39051673 - 39051915
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  39051673 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 39051772  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  39051773 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 39051872  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  39051873 aagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatg 39051915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 260604 - 260846
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||||     
T  260604 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattc 260703  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  260704 acagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 260803  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  260804 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 260846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 21677033 - 21677275
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||     
T  21677033 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattc 21677132  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  21677133 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 21677232  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21677233 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 21677275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31876671 - 31876429
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  31876671 cagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 31876572  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  31876571 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 31876472  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  31876471 aagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatg 31876429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32050188 - 32049946
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||     
T  32050188 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattc 32050089  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  32050088 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 32049989  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32049988 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 32049946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 16829189 - 16829431
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||     
T  16829189 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattc 16829288  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16829289 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 16829388  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  16829389 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 16829431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16892292 - 16892050
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||     
T  16892292 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattc 16892193  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16892192 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 16892093  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  16892092 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 16892050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34862070 - 34861828
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  34862070 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 34861971  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  34861970 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 34861871  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34861870 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 34861828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 37685760 - 37686002
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  37685760 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 37685859  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  37685860 acagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 37685959  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37685960 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 37686002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 37701025 - 37701267
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  37701025 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 37701124  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  37701125 acagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 37701224  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37701225 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 37701267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37925883 - 37925641
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  37925883 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 37925784  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  37925783 acagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 37925684  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37925683 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 37925641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39890464 - 39890222
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  39890464 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 39890365  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  39890364 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 39890265  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  39890264 gagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 39890222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40233901 - 40233659
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||     
T  40233901 cagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttc 40233802  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  40233801 acagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 40233702  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40233701 aagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 40233659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 19416350 - 19416592
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  19416350 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 19416449  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  19416450 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttca 19416549  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19416550 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 19416592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34286744 - 34286502
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||   |||||||||||     
T  34286744 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcgatcatattc 34286645  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  34286644 acggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 34286545  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34286544 aagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatg 34286502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34291804 - 34291562
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||   |||||||||||     
T  34291804 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcgatcatattc 34291705  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  34291704 acggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 34291605  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34291604 aagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatg 34291562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 9349833 - 9350075
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  || || ||||| ||||| |  |||||| ||||| || | || ||||| ||     
T  9349833 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttc 9349932  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  9349933 acagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 9350032  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  9350033 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 9350075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 21703027 - 21703257
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  21703027 gcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 21703126  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  21703127 ttcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatc 21703226  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21703227 ctttgacatcatgacccagagcaccttgatg 21703257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 22925891 - 22926121
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  22925891 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 22925990  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22925991 tttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacc 22926090  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  22926091 cctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 22926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 19456284 - 19456514
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||| |||||||| | || ||||| || ||| | || |||    
T  19456284 gcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtga 19456383  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| |||||      
T  19456384 ttcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatt 19456483  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||    
T  19456484 cttcaacatcatgacccagagcaccttgatg 19456514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 34303166 - 34303396
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||| || | || ||||| |||| ||| |||||     
T  34303166 gcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgt 34303265  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  34303266 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 34303365  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  34303366 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 34303396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34279698 - 34279597
Alignment:
Q  152 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34279698 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttga 34279599  T
Q  252 tg 253  Q
    ||    
T  34279598 tg 34279597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27119066 - 27118836
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| |  || ||  |||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||| | || |||    
T  27119066 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtga 27118967  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  27118966 ttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 27118867  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27118866 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 27118836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 253
Target Start/End: Original strand, 31891211 - 31891421
Alignment:
Q  43 gcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgag 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||     
T  31891211 gcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgac 31891310  T
Q  143 gacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagg 242  Q
    ||| || ||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31891311 gacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagg 31891410  T
Q  243 gcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||    
T  31891411 gcgccttgatg 31891421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3785032 - 3784802
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  3785032 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 3784933  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  3784932 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 3784833  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  3784832 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 3784802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16163977 - 16163747
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  16163977 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 16163878  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  16163877 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 16163778  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  16163777 cttcgccatcatgacccatagcaccttgatg 16163747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34157388 - 34157159
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  34157388 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 34157289  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  34157288 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 34157190  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  34157189 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 34157159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27393271 - 27393117
Alignment:
Q  99 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttca 198  Q
    |||||||| || ||| | || ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |    
T  27393271 tcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttta 27393172  T
Q  199 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  27393171 caatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatg 27393117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 10916616 - 10916858
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10916616 cagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 10916715  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  10916716 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 10916815  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916816 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 10916858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 16503131 - 16503370
Alignment:
Q  14 agaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttaca 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16503131 agaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttaca 16503230  T
Q  114 gcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaag 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||     
T  16503231 gcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaa 16503330  T
Q  214 catagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503331 catagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 16503370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 11424524 - 11424766
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||     
T  11424524 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattc 11424623  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  11424624 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 11424723  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424724 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 11424766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 16518167 - 16518406
Alignment:
Q  14 agaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttaca 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16518167 agaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttaca 16518266  T
Q  114 gcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaag 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||     
T  16518267 gcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaa 16518366  T
Q  214 catagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518367 catagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 16518406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2154968 - 2154726
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2154968 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 2154869  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  2154868 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 2154769  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2154768 aagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatg 2154726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 26537618 - 26537860
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  26537618 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 26537717  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  26537718 acagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 26537817  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  26537818 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 26537860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26435652 - 26435410
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  26435652 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 26435553  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  26435552 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 26435453  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  26435452 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 26435410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5128387 - 5128145
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  5128387 cagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 5128288  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  5128287 acagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 5128188  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5128187 aagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 5128145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11441967 - 11441725
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  11441967 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 11441868  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  11441867 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 11441768  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  11441767 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 11441725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 4144871 - 4145113
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  4144871 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 4144970  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  4144971 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 4145070  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4145071 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 4145113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 5147088 - 5147330
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||     
T  5147088 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattc 5147187  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  5147188 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 5147287  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5147288 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 5147330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 26669662 - 26669904
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  26669662 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 26669761  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  26669762 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 26669861  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26669862 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 26669904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3445701 - 3445459
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||     
T  3445701 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattc 3445602  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  3445601 acagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttca 3445502  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  3445501 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 3445459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 26319617 - 26319859
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  26319617 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 26319716  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  26319717 acagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 26319816  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26319817 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 26319859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 24592289 - 24592531
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  24592289 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 24592388  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  24592389 acagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 24592488  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  24592489 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 24592531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 26274842 - 26275084
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||     
T  26274842 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattc 26274941  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  26274942 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 26275041  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26275042 aagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 26275084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 45387738 - 45387496
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  45387738 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 45387639  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  45387638 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 45387539  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45387538 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 45387496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 31564138 - 31564365
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  31564138 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 31564237  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  31564238 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 31564337  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31564338 aagcataacacccctcgacatcatgacc 31564365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9619046 - 9618804
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  9619046 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 9618947  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  9618946 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 9618847  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  9618846 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 9618804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 16736208 - 16736435
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  16736208 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 16736307  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16736308 acggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 16736407  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16736408 aagcataacacccctcgacatcatgacc 16736435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 16751262 - 16751489
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  16751262 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 16751361  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16751362 acggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 16751461  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16751462 aagcataacacccctcgacatcatgacc 16751489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17523927 - 17523700
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  17523927 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 17523828  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  17523827 acggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 17523728  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17523727 aagcataacacccctcgacatcatgacc 17523700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 17529288 - 17529515
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  17529288 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 17529387  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  17529388 acggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 17529487  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17529488 aagcataacacccctcgacatcatgacc 17529515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31125315 - 31125073
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  31125315 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 31125216  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||| |||||||    
T  31125215 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttca 31125116  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  31125115 aagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatg 31125073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 16449758 - 16449988
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  16449758 gcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 16449857  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16449858 ttcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatc 16449957  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16449958 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 16449988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16041705 - 16041476
Alignment:
Q  24 catagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgat 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||| |||||| ||||  || | || ||||| || ||||| || ||||    
T  16041705 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 16041606  T
Q  124 ttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcaccc 223  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  16041605 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 16041506  T
Q  224 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
     || |||||||||||||| || ||||||||    
T  16041505 ttctacatcatgacccagagcaccttgatg 16041476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4200930 - 4200700
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  4200930 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 4200831  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  4200830 tttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatc 4200731  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4200730 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 4200700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26485077 - 26484847
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  26485077 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 26484978  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  26484977 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 26484878  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26484877 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 26484847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2775742 - 2775512
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  2775742 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 2775643  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  2775642 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatc 2775543  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2775542 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 2775512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 39210783 - 39211013
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  39210783 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 39210882  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  39210883 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 39210982  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  39210983 cttcgacatcatgacccaaagcaccttgatg 39211013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 2108772 - 2108995
Alignment:
Q  30 ttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaa 129  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| || ||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || ||||||||||    
T  2108772 ttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaa 2108871  T
Q  130 gtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgac 229  Q
    | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2108872 gagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgac 2108971  T
Q  230 atcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  2108972 atcatgacccagagcaccttgatg 2108995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 26682760 - 26682990
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  26682760 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 26682859  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| |  ||||  |||||||||||||| |    
T  26682860 tttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatc 26682959  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26682960 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 26682990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18541162 - 18540952
Alignment:
Q  43 gcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgag 142  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||   || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  18541162 gcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgag 18541063  T
Q  143 gacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagg 242  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |      
T  18541062 gacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaa 18540963  T
Q  243 gcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||    
T  18540962 gcgccttgatg 18540952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 31088224 - 31088454
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  31088224 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 31088323  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  31088324 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 31088423  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  31088424 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 31088454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 45733843 - 45733613
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  45733843 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 45733744  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  45733743 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 45733644  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  45733643 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 45733613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5159882 - 5159672
Alignment:
Q  43 gcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgag 142  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||   || || ||||| || || |||| |||||| || |||||||||||    
T  5159882 gcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgag 5159783  T
Q  143 gacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagg 242  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| || |      
T  5159782 gacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaa 5159683  T
Q  243 gcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||    
T  5159682 gcgccttgatg 5159672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26513176 - 26513130
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttg 57  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26513176 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14665427 - 14665185
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14665427 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 14665328  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  14665327 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 14665228  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665227 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 14665185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17014409 - 17014167
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17014409 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 17014310  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  17014309 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 17014210  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014209 aagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 17014167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 24592176 - 24592418
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24592176 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 24592275  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  24592276 acagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 24592375  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592376 aagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 24592418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 36344377 - 36344619
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  36344377 cagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 36344476  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36344477 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttca 36344576  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36344577 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 36344619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 18800475 - 18800717
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  18800475 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 18800574  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18800575 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 18800674  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  18800675 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 18800717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 14763166 - 14763408
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  14763166 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 14763265  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  14763266 acagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 14763365  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  14763366 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 14763408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39851047 - 39850820
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  39851047 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 39850948  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39850947 acagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttca 39850848  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39850847 aagcataacacccctcgacatcatgacc 39850820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6570262 - 6570035
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  6570262 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 6570163  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  6570162 acagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 6570063  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6570062 aagcataacacccctcgacatcatgacc 6570035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14098950 - 14098708
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  14098950 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 14098851  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  14098850 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 14098751  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  14098750 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 14098708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 33673660 - 33673902
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||     
T  33673660 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattc 33673759  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  33673760 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 33673859  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  33673860 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 33673902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 40105500 - 40105742
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  40105500 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 40105599  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  40105600 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 40105699  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40105700 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 40105742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30754163 - 30753921
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  30754163 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 30754064  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  30754063 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 30753964  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  30753963 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 30753921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 31126380 - 31126622
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||     
T  31126380 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattc 31126479  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  31126480 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 31126579  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  31126580 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 31126622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21970110 - 21969868
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||| ||||||||     
T  21970110 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattc 21970011  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  21970010 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 21969911  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  21969910 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 21969868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 54833796 - 54833554
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  54833796 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 54833697  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  54833696 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 54833597  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  54833596 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 54833554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5006274 - 5006040
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5006274 ctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 5006175  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  5006174 atgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 5006075  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5006074 cacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 5006040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 27163179 - 27163421
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  27163179 cagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 27163278  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||    
T  27163279 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttca 27163378  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27163379 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 27163421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1900654 - 1900424
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  | ||||| ||||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  1900654 gcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 1900555  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |    
T  1900554 ttcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatc 1900455  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||    
T  1900454 cttcaacatcatgacccagagcaccttgatg 1900424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 15284802 - 15285032
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||| |||||||| | || ||||| || |||||  | |||    
T  15284802 gcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtga 15284901  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  15284902 ttcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatc 15285001  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||    
T  15285002 cttcaacatcatgacccagagcaccttgatg 15285032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15228267 - 15228037
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||  |||| || |  | ||||| || ||||| || |||    
T  15228267 gcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtga 15228168  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  15228167 ttcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatc 15228068  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||||||    
T  15228067 cttcaacatcgtgacccagagcaccttgatg 15228037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24113039 - 24112829
Alignment:
Q  43 gcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgag 142  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||   || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  24113039 gcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgag 24112940  T
Q  143 gacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagg 242  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |      
T  24112939 gacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaa 24112840  T
Q  243 gcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||    
T  24112839 gcgccttgatg 24112829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 34188854 - 34189046
Alignment:
Q  43 gcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgag 142  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||   || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  34188854 gcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgag 34188953  T
Q  143 gacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatg 235  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  34188954 gacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatg 34189046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 24460479 - 24460709
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || |||| ||||| |||||||| || |||    
T  24460479 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtga 24460578  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  24460579 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 24460678  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  24460679 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 24460709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 14235399 - 14235629
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||| | ||| |    || ||||| || ||||| || |||    
T  14235399 gcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtga 14235498  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || || | |||||| || || ||| |||||||||| || || |    
T  14235499 ttcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatc 14235598  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  14235599 cctcaacatcatggcccagagcaccttgatg 14235629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 15391212 - 15391442
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcac-attcttcgatcatatttacagcggcatg 121  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||  ||||| || ||| || | |||  | ||| ||||||| || ||||| || ||    
T  15391212 gcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactct-cgatcatgttcacagcagcgtg 15391310  T
Q  122 atttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcac 221  Q
    |||  |||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |  |||| |||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  15391311 attcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacat 15391410  T
Q  222 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    || || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  15391411 ccttcaacatcatggcccagagcaccttgatg 15391442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 15892609 - 15892851
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15892609 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 15892708  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  15892709 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 15892808  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892809 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 15892851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 4796556 - 4796798
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  4796556 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 4796655  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4796656 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttca 4796755  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796756 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 4796798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 8301170 - 8301412
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8301170 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattt 8301269  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  8301270 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 8301369  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8301370 aagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatg 8301412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6192671 - 6192429
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6192671 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 6192572  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  6192571 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 6192472  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6192471 aagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 6192429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8296327 - 8296085
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8296327 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 8296228  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  8296227 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 8296128  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8296127 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatg 8296085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 15740997 - 15741239
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15740997 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 15741096  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  15741097 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 15741196  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15741197 aagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatg 15741239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 22387481 - 22387723
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  22387481 cagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 22387580  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22387581 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 22387680  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387681 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 22387723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18331024 - 18330782
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  18331024 cagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 18330925  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18330924 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 18330825  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330824 aagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 18330782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 29148658 - 29148900
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29148658 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 29148757  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  29148758 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 29148857  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29148858 aagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 29148900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35881121 - 35880879
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||     
T  35881121 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattc 35881022  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35881021 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttca 35880922  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35880921 aagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatg 35880879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18051617 - 18051376
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||     
T  18051617 cagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttc 18051518  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18051517 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 18051418  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051417 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgat 18051376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4721986 - 4721744
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  4721986 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 4721887  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  4721886 acaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttca 4721787  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721786 aagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 4721744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 4346590 - 4346832
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  4346590 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 4346689  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  4346690 acagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 4346789  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  4346790 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 4346832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7073567 - 7073325
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||     
T  7073567 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttc 7073468  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  7073467 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 7073368  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7073367 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 7073325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 20576750 - 20576992
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  20576750 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 20576849  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  20576850 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 20576949  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  20576950 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 20576992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28021630 - 28021388
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  28021630 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 28021531  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28021530 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 28021431  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  28021430 aagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatg 28021388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8212093 - 8211851
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  8212093 cagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 8211994  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  8211993 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 8211894  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  8211893 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 8211851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 18276955 - 18277197
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  18276955 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 18277054  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18277055 acagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 18277154  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  18277155 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 18277197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 18307557 - 18307799
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  18307557 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 18307656  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18307657 acagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 18307756  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  18307757 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 18307799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48466282 - 48466040
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  48466282 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 48466183  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  48466182 acagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 48466083  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  48466082 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 48466040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4417266 - 4417047
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4417266 ctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 4417167  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  4417166 atgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataa 4417067  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4417066 cacccctcgacatcatgacc 4417047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 28115857 - 28116084
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||     
T  28115857 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattc 28115956  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28115957 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 28116056  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28116057 aagcataacacccctcgacatcatgacc 28116084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 29664873 - 29665100
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  29664873 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 29664972  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  29664973 acagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 29665072  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29665073 aagcataacacccctcgacatcatgacc 29665100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5467340 - 5467098
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  5467340 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 5467241  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  5467240 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 5467141  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5467140 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 5467098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 18292256 - 18292498
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  18292256 cagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 18292355  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18292356 acagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 18292455  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  18292456 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 18292498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10396480 - 10396246
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10396480 ctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 10396381  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  10396380 atgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 10396281  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10396280 cacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 10396246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 11110252 - 11110494
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||     
T  11110252 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattc 11110351  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  11110352 acagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 11110451  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  11110452 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 11110494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21675048 - 21674806
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  21675048 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 21674949  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  21674948 acagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 21674849  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  21674848 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 21674806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 22870759 - 22871001
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||     
T  22870759 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattc 22870858  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22870859 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 22870958  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  22870959 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 22871001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 22885818 - 22886060
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||     
T  22885818 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattc 22885917  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22885918 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 22886017  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  22886018 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 22886060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 36996980 - 36997222
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||     
T  36996980 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattc 36997079  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  36997080 acagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttca 36997179  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  36997180 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 36997222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51782378 - 51782136
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  51782378 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 51782279  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  51782278 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 51782179  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  51782178 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 51782136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51797460 - 51797226
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  51797460 ctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 51797361  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  51797360 atgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 51797261  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  51797260 cacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 51797226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5014067 - 5013825
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  5014067 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 5013968  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  5013967 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 5013868  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5013867 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 5013825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 31964384 - 31964618
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  31964384 ctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 31964483  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  31964484 atgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 31964583  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  31964584 cacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 31964618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 6542365 - 6542607
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||     
T  6542365 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattc 6542464  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  6542465 acagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 6542564  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  6542565 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 6542607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18243094 - 18242852
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  18243094 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 18242995  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  18242994 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 18242895  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  18242894 aagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatg 18242852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24328514 - 24328272
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  24328514 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 24328415  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| || ||||    
T  24328414 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttca 24328315  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24328314 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 24328272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47023808 - 47023566
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  47023808 cagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 47023709  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  47023708 acagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 47023609  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47023608 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 47023566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 50133990 - 50134216
Alignment:
Q  27 agcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttg 126  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50133990 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 50134089  T
Q  127 gaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctc 226  Q
    | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50134090 gtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctc 50134189  T
Q  227 gacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  50134190 gacgtcatgacctaaggcaccttgatg 50134216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 5596260 - 5596502
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  5596260 cagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 5596359  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  5596360 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 5596459  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5596460 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 5596502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 5609225 - 5609467
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  5609225 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 5609324  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  5609325 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 5609424  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  5609425 aagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 5609467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18225546 - 18225304
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||     
T  18225546 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattc 18225447  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  18225446 acagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 18225347  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  18225346 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 18225304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28339657 - 28339430
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  28339657 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 28339558  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  28339557 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 28339458  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28339457 aagcataacacccctcgacgtcatgacc 28339430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7996917 - 7996675
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  7996917 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 7996818  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| || ||||    
T  7996817 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttca 7996718  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7996717 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 7996675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10643425 - 10643183
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  10643425 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 10643326  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| || ||||    
T  10643325 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttca 10643226  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10643225 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 10643183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 17984859 - 17985101
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| |||| || |||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||     
T  17984859 cagagaagctttacacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattc 17984958  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  17984959 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 17985058  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  17985059 aagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 17985101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5713570 - 5713340
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  5713570 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 5713471  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5713470 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacc 5713371  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5713370 cctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 5713340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5724480 - 5724250
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  5724480 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 5724381  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5724380 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacc 5724281  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5724280 cctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 5724250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 5756997 - 5757227
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  5756997 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 5757096  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5757097 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacc 5757196  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5757197 cctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 5757227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 5767888 - 5768118
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  5767888 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 5767987  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5767988 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacc 5768087  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5768088 cctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 5768118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18530731 - 18530501
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||| |||||| |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  18530731 gcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 18530632  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  18530631 ttcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatc 18530532  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||    
T  18530531 cttcaacatcatgacccagagcaccttgatg 18530501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 31034032 - 31034262
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  31034032 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 31034131  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  31034132 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 31034231  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31034232 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 31034262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32293095 - 32292865
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  32293095 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 32292996  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  32292995 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 32292896  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32292895 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 32292865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 16626421 - 16626651
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| |  |||    
T  16626421 gcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtga 16626520  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16626521 ttcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatc 16626620  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||    
T  16626621 cttcaacatcatgacccagagcaccttgatg 16626651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5652730 - 5652500
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||| |||||||| | || ||||| || ||||| ||||||    
T  5652730 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatga 5652631  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  5652630 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 5652531  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5652530 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 5652500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 17993687 - 17993929
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||    
T  17993687 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttt 17993786  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||    
T  17993787 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctca 17993886  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  17993887 acgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 17993929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32439477 - 32439267
Alignment:
Q  43 gcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgag 142  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||   || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  32439477 gcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgag 32439378  T
Q  143 gacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagg 242  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |      
T  32439377 gacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaa 32439278  T
Q  243 gcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||    
T  32439277 gcgccttgatg 32439267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20066307 - 20066156
Alignment:
Q  102 atcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacga 201  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || ||||    
T  20066307 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 20066208  T
Q  202 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  20066207 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatg 20066156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4626287 - 4626057
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| ||||||  |||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  4626287 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 4626188  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  4626187 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 4626088  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  4626087 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 4626057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4893387 - 4893323
Alignment:
Q  189 agctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4893387 agcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatg 4893323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 2137080 - 2137322
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2137080 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatattt 2137179  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2137180 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttca 2137279  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2137280 aagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatg 2137322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14558018 - 14557776
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  14558018 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacattt 14557919  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  14557918 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 14557819  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557818 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 14557776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19688492 - 19688250
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19688492 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatattt 19688393  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19688392 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttca 19688293  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19688292 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatg 19688250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16277948 - 16277706
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16277948 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 16277849  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16277848 acggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 16277749  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277748 aagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 16277706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 27608734 - 27608968
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27608734 ctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggc 27608833  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27608834 atgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatag 27608933  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608934 catccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 27608968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 189488 - 189258
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  189488 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatta 189389  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  189388 acagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttca 189289  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccag 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  189288 aagcgtagcacccctcgacatcatgacccag 189258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16283843 - 16283601
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||     
T  16283843 cagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttc 16283744  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16283743 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 16283644  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16283643 aagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatg 16283601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 31489571 - 31489813
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  31489571 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 31489670  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  31489671 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 31489770  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  31489771 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 31489813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19674835 - 19674608
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  19674835 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 19674736  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  19674735 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttca 19674636  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19674635 aagcataacacctctcgacatcatgacc 19674608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 19208181 - 19208423
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  19208181 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 19208280  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  19208281 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 19208380  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  19208381 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 19208423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19286856 - 19286614
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  19286856 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 19286757  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  19286756 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 19286657  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  19286656 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 19286614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 28361776 - 28362018
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  28361776 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 28361875  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  28361876 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 28361975  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  28361976 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 28362018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29829716 - 29829474
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  29829716 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 29829617  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  29829616 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 29829517  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29829516 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 29829474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33259117 - 33258875
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  33259117 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 33259018  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  33259017 acaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 33258918  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  33258917 aagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatg 33258875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 3329328 - 3329555
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  3329328 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 3329427  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3329428 acagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttca 3329527  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3329528 aagcataacacccctcgacatcatgacc 3329555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31354910 - 31354676
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  31354910 ctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 31354811  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  31354810 atgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 31354711  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  31354710 cacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 31354676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 12092545 - 12092772
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  12092545 cagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 12092644  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  12092645 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 12092744  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12092745 aagcataacacccctcgacatcatgacc 12092772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9355017 - 9354774
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||     
T  9355017 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattc 9354918  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgag-ctttttcacgatgtacttc 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||| || | |||  ||||| || |||||| ||    
T  9354917 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctc 9354818  T
Q  210 aaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  9354817 aacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatg 9354774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18710968 - 18710738
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  18710968 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 18710869  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  18710868 tttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatc 18710769  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  18710768 cctcgacatcatgacctagggcaccctgatg 18710738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 19658873 - 19659102
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  19658873 gcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 19658972  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  19658973 ttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 19659071  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  19659072 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 19659102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33245040 - 33244817
Alignment:
Q  30 ttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaa 129  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |  || ||  ||||  ||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || || || ||||    
T  33245040 ttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaa 33244941  T
Q  130 gtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgac 229  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| || |||||    
T  33244940 gaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgac 33244841  T
Q  230 atcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  33244840 atcatgacccagcgcaccttgatg 33244817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44563481 - 44563253
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  44563481 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtga 44563383  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  44563382 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 44563284  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  44563283 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 44563253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 22080711 - 22080941
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcac-attcttcgatcatatttacagcggcatg 121  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || || || ||||| || ||| || | |||  | ||| ||||||| || ||||| || ||    
T  22080711 gcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtct-cgatcatgttcacagcagcgtg 22080809  T
Q  122 atttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcac 221  Q
    ||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || |||| |||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  22080810 attcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacat 22080909  T
Q  222 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    || || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  22080910 ccttcaacatcatggcccagagcaccttgatg 22080941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 15424122 - 15424364
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15424122 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatattt 15424221  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15424222 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttca 15424321  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15424322 aagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatg 15424364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 22934685 - 22934927
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22934685 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 22934784  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22934785 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 22934884  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934885 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 22934927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 23857130 - 23857372
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23857130 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 23857229  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  23857230 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 23857329  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857330 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 23857372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16750245 - 16750003
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  16750245 cagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 16750146  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16750145 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 16750046  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750045 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 16750003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26989392 - 26989150
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26989392 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 26989293  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  26989292 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttca 26989193  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989192 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 26989150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24864099 - 24863866
Alignment:
Q  20 tttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggca 119  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24864099 tttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggca 24864000  T
Q  120 tgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagc 219  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24863999 tgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagc 24863900  T
Q  220 acccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863899 acccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 24863866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26918771 - 26918529
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  26918771 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 26918672  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  26918671 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttca 26918572  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918571 aagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 26918529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 13298756 - 13298998
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13298756 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 13298855  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  13298856 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 13298955  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13298956 aagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatg 13298998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 24304423 - 24304665
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24304423 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 24304522  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  24304523 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 24304622  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24304623 aatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatg 24304665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 27272385 - 27272627
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  27272385 cagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattc 27272484  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  27272485 acagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttca 27272584  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27272585 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatg 27272627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29549866 - 29549624
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||     
T  29549866 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttc 29549767  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  29549766 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 29549667  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29549666 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 29549624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 34463151 - 34463393
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  34463151 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 34463250  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  34463251 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 34463350  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  34463351 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 34463393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3696472 - 3696230
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  3696472 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattc 3696373  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  3696372 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 3696273  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  3696272 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 3696230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29573404 - 29573162
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  29573404 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 29573305  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  29573304 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 29573205  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29573204 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 29573162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16674529 - 16674288
Alignment:
Q  12 agagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattta 111  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  16674529 agagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattca 16674430  T
Q  112 cagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaa 211  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  16674429 cagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaa 16674330  T
Q  212 agcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  16674329 agcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 16674288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29501806 - 29501564
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  29501806 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 29501707  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  29501706 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 29501607  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29501606 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 29501564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 30557821 - 30558063
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||     
T  30557821 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattc 30557920  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  30557921 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 30558020  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  30558021 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 30558063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17025658 - 17025426
Alignment:
Q  21 ttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcat 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  17025658 ttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcat 17025559  T
Q  121 gatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagca 220  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  17025558 gatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataaca 17025459  T
Q  221 cccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  17025458 cccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatg 17025426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 16943832 - 16944074
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  16943832 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 16943931  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  16943932 acagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 16944031  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  16944032 aagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatg 16944074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27485520 - 27485278
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  27485520 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 27485421  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  27485420 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 27485321  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  27485320 aagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatg 27485278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 4723939 - 4724181
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  4723939 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 4724038  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  4724039 acagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 4724138  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  4724139 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 4724181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27000402 - 27000222
Alignment:
Q  73 caagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcag 172  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27000402 caagtgtaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcag 27000303  T
Q  173 ctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000302 ctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 27000222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 4545580 - 4545807
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  4545580 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 4545679  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  4545680 acagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 4545779  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4545780 aagcataacacccctcgacatcatgacc 4545807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 26116215 - 26116457
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  26116215 cagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 26116314  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  26116315 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 26116414  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  26116415 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 26116457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27008118 - 27007876
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||     
T  27008118 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattc 27008019  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  27008018 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttca 27007919  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  27007918 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 27007876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27044779 - 27044536
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  27044779 cagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 27044680  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  27044679 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 27044580  T
Q  211 aagcat-agcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  27044579 aagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 27044536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4525677 - 4525435
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  4525677 cagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 4525578  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  4525577 acagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttca 4525478  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  4525477 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 4525435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4758155 - 4757913
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  4758155 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 4758056  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  4758055 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 4757956  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  4757955 aagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 4757913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 27359805 - 27360039
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27359805 ctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 27359904  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  27359905 atgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 27360004  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  27360005 catccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 27360039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 27450148 - 27450382
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27450148 ctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 27450247  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  27450248 atgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 27450347  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  27450348 catccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 27450382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4773389 - 4773170
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4773389 ctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 4773290  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  4773289 atgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 4773190  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4773189 cacccctcgacatcatgacc 4773170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28207845 - 28207603
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  28207845 cagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 28207746  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||||    
T  28207745 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttca 28207646  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  28207645 aagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatg 28207603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 27290175 - 27290417
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||    
T  27290175 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatattt 27290274  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||  |||||||| |||||  |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  27290275 acagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttca 27290374  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27290375 acgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 27290417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 253
Target Start/End: Original strand, 26777452 - 26777662
Alignment:
Q  43 gcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgag 142  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  26777452 gcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgag 26777551  T
Q  143 gacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagg 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  26777552 gacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaag 26777651  T
Q  243 gcgccttgatg 253  Q
    || ||||||||    
T  26777652 gcaccttgatg 26777662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 14143102 - 14143332
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  14143102 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 14143201  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  14143202 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 14143301  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14143302 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 14143332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26788323 - 26788093
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  26788323 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 26788224  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  26788223 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 26788124  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26788123 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 26788093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27196696 - 27196466
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  27196696 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 27196597  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27196596 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 27196497  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27196496 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 27196466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 27252544 - 27252774
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  27252544 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 27252643  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27252644 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 27252743  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27252744 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 27252774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 13521890 - 13522120
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||  |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  13521890 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 13521989  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  13521990 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatc 13522089  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13522090 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 13522120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 253
Target Start/End: Original strand, 22456775 - 22456981
Alignment:
Q  47 cagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgaggaca 146  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||| || | || ||||  || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  22456775 cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggaca 22456874  T
Q  147 tgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgc 246  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |    
T  22456875 tgagggaaattattctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcac 22456974  T
Q  247 cttgatg 253  Q
    |||||||    
T  22456975 cttgatg 22456981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20161041 - 20160865
Alignment:
Q  62 gttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattc 161  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| | ||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||    
T  20161041 gttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattc 20160942  T
Q  162 tcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    || ||||||||||| | ||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20160941 tcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacc 20160865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 238
Target Start/End: Original strand, 22171790 - 22171966
Alignment:
Q  62 gttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattc 161  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| | ||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||    
T  22171790 gttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattc 22171889  T
Q  162 tcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    || ||||||||||| | ||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22171890 tcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacc 22171966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 17092258 - 17092427
Alignment:
Q  24 catagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgat 123  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | | |||| |||||||| | ||  |||| || ||||| || || |    
T  17092258 catagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggt 17092357  T
Q  124 ttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctt 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  17092358 ttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Original strand, 33374082 - 33374303
Alignment:
Q  32 gatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagt 131  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||||||||||     
T  33374082 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaaga 33374181  T
Q  132 ggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacat 231  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| || |||||||    
T  33374182 gggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacat 33374281  T
Q  232 catgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||  || ||||||||    
T  33374282 catgacccatagcaccttgatg 33374303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 8892128 - 8892357
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || |||| ||||| |||||||| || |||    
T  8892128 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtga 8892227  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  8892228 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 8892326  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8892327 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 8892357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 8903363 - 8903592
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || |||| ||||| |||||||| || |||    
T  8903363 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtga 8903462  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  8903463 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 8903561  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8903562 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 8903592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28163027 - 28162806
Alignment:
Q  32 gatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagt 131  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || ||||| |||||     
T  28163027 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 28162928  T
Q  132 ggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacat 231  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| ||  ||||||    
T  28162927 ggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacat 28162828  T
Q  232 catgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||  || ||||||||    
T  28162827 catgacccatagcaccttgatg 28162806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27019527 - 27019461
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagt 77  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27019527 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Original strand, 22477240 - 22477320
Alignment:
Q  173 ctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22477240 ctttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 22477320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11549757 - 11549515
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  11549757 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatattt 11549658  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  11549657 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 11549558  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549557 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 11549515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 23717747 - 23717989
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23717747 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 23717846  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  23717847 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 23717946  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717947 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 23717989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 24687916 - 24688158
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24687916 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 24688015  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24688016 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttca 24688115  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24688116 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatg 24688158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 22998873 - 22999115
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22998873 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 22998972  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22998973 acagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 22999072  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22999073 aagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 22999115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30935036 - 30934794
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  30935036 cagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatat 30934937  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  30934936 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 30934837  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934836 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 30934794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33777889 - 33777648
Alignment:
Q  12 agagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattta 111  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  33777889 agagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattca 33777790  T
Q  112 cagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaa 211  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33777789 cagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaa 33777690  T
Q  212 agcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777689 agcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 33777648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 23752209 - 23752451
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  23752209 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 23752308  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  23752309 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 23752408  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23752409 aagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 23752451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 9548314 - 9548544
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9548314 gcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatga 9548413  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9548414 tttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacc 9548513  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9548514 cctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 9548544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 15658519 - 15658761
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||     
T  15658519 cagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattc 15658618  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  15658619 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 15658718  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15658719 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 15658761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24970421 - 24970179
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  24970421 cagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatattt 24970322  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  24970321 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 24970222  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970221 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 24970179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28649638 - 28649396
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  28649638 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 28649539  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28649538 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 28649439  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  28649438 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 28649396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 43078655 - 43078413
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  43078655 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 43078556  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43078555 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttca 43078456  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  43078455 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 43078413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24681843 - 24681601
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  24681843 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 24681744  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  24681743 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 24681644  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  24681643 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 24681601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24724370 - 24724128
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  24724370 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattc 24724271  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  24724270 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 24724171  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  24724170 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 24724128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 40473308 - 40473550
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  40473308 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 40473407  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  40473408 acagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 40473507  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  40473508 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 40473550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 8665242 - 8665476
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  8665242 ctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 8665341  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  8665342 atgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 8665441  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8665442 cacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 8665476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9317854 - 9317612
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  9317854 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 9317755  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  9317754 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 9317655  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9317654 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 9317612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12132558 - 12132316
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  12132558 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 12132459  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  12132458 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 12132359  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12132358 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 12132316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 18500489 - 18500731
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  18500489 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 18500588  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18500589 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 18500688  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  18500689 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 18500731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37755383 - 37755141
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  37755383 cagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 37755284  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  37755283 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 37755184  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  37755183 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 37755141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 13324588 - 13324815
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  13324588 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 13324687  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  13324688 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 13324787  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13324788 aagcataacacccctcgacatcatgacc 13324815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3789944 - 3789702
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  3789944 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 3789845  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  3789844 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 3789745  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  3789744 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 3789702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 15758624 - 15758858
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15758624 ctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 15758723  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  15758724 atgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 15758823  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15758824 cacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 15758858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 18375171 - 18375413
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||     
T  18375171 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattc 18375270  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  18375271 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 18375370  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  18375371 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 18375413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 29966825 - 29967067
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  29966825 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 29966924  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  29966925 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 29967024  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  29967025 aagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatg 29967067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30029818 - 30029576
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  30029818 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 30029719  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  30029718 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 30029619  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  30029618 aagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatg 30029576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30152421 - 30152179
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  30152421 cagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 30152322  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  30152321 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 30152222  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30152221 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 30152179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 31826166 - 31826408
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||     
T  31826166 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattc 31826265  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  31826266 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttca 31826365  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  31826366 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 31826408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33516759 - 33516517
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||     
T  33516759 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattc 33516660  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  33516659 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 33516560  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  33516559 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 33516517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34616921 - 34616679
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||     
T  34616921 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattc 34616822  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  34616821 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttca 34616722  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  34616721 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 34616679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2511454 - 2511212
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  2511454 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 2511355  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  2511354 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 2511255  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2511254 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 2511212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6874708 - 6874466
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  6874708 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 6874609  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||    
T  6874608 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttca 6874509  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  6874508 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 6874466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30168872 - 30168630
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||     
T  30168872 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattc 30168773  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  30168772 acagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 30168673  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  30168672 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 30168630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31431843 - 31431601
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  31431843 cagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 31431744  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  31431743 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 31431644  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  31431643 aagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 31431601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5638313 - 5638071
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  5638313 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 5638214  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  5638213 acaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 5638114  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  5638113 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 5638071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26480794 - 26480553
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  26480794 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagag-agttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 26480696  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  26480695 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 26480596  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  26480595 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 26480553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 37770749 - 37770988
Alignment:
Q  14 agaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttaca 113  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||    
T  37770749 agaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcaca 37770848  T
Q  114 gcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaag 213  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  37770849 gcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaag 37770948  T
Q  214 catagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  37770949 cataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 37770988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 37358402 - 37358644
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  37358402 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 37358501  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||||    
T  37358502 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttca 37358601  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  37358602 aagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatg 37358644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 37671242 - 37671484
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |   | || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  37671242 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 37671341  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  37671342 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 37671441  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  37671442 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 37671484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 32599239 - 32599458
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  32599239 ctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 32599338  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  32599339 atgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataa 32599438  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  32599439 cacccctcgacgtcatgacc 32599458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 28959553 - 28959787
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28959553 ctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggc 28959652  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  28959653 atgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataa 28959752  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  28959753 cacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 28959787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23892609 - 23892367
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||| || | || ||||  ||     
T  23892609 cagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttc 23892510  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23892509 acagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttca 23892410  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
     ||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23892409 gagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 23892367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 29888841 - 29889083
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||| |  | || ||||| ||     
T  29888841 cagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttc 29888940  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29888941 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttca 29889040  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29889041 aagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 29889083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22888861 - 22888631
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  22888861 gcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 22888762  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  22888761 ttcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatc 22888662  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22888661 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 22888631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25199420 - 25199190
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||  |||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  25199420 gcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 25199321  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  25199320 ttcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatc 25199221  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25199220 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 25199190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41675112 - 41674870
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||   || ||||||||     
T  41675112 cagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattc 41675013  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| |    
T  41675012 acggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgacgatgtacttta 41674913  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
     ||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  41674912 gagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatg 41674870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33877638 - 33877408
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||  |||||||  |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  33877638 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 33877539  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  33877538 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatc 33877439  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33877438 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 33877408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11326185 - 11325955
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| ||||||||  | |||    
T  11326185 gcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtga 11326086  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  11326085 ttcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 11325986  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11325985 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 11325955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 13184419 - 13184649
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  13184419 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 13184518  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  13184519 ttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 13184618  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  13184619 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 13184649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33292896 - 33292686
Alignment:
Q  43 gcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgag 142  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||   || |||||||| || ||  |||||||||| || |||||||||||    
T  33292896 gcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgag 33292797  T
Q  143 gacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagg 242  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |      
T  33292796 gacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaa 33292697  T
Q  243 gcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||    
T  33292696 gcgccttgatg 33292686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 13440265 - 13440495
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  || ||   ||| |||||| ||||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  13440265 gcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 13440364  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    ||  |||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||| || ||||| |    
T  13440365 ttcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatc 13440464  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  13440465 cttcgacatcatgacccatagcaccttgatg 13440495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 39931 - 40173
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  39931 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 40030  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||    
T  40031 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttca 40130  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 40173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 46847 - 47089
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  46847 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 46946  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  46947 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 47046  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47047 aagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 47089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30157 - 29918
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30157 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatattt 30058  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  30057 acagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 29958  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttg 250  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29957 aagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttg 29918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27685 - 27444
Alignment:
Q  12 agagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattta 111  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27685 agagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattta 27586  T
Q  112 cagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  27585 cagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaa 27486  T
Q  212 agcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27485 agcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 27444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 1 - 233
Alignment:
Q  21 ttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcat 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1 ttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcat 100  T
Q  121 gatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagca 220  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  101 gatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagca 200  T
Q  221 cccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  201 cccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatg 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30846 - 30604
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30846 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattt 30747  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  30746 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 30647  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  30646 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 30604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20540
Alignment:
Q  69 acatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaag 168  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||| || | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  169 tcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | |  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20623 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 20540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 14792 - 15034
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||     
T  14792 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattc 14891  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  14892 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 14991  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  14992 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 15034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 8928 - 9170
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  8928 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 9027  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  9028 acagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 9127  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9128 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 9170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20409 - 20167
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  20409 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 20310  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  20309 acagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 20210  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20209 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 20167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10963063 - 10962821
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||   ||||||||||||     
T  10963063 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattc 10962964  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  10962963 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 10962864  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10962863 aagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatg 10962821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 41793170 - 41793412
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  41793170 cagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 41793269  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  41793270 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttca 41793369  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  41793370 aagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatg 41793412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28585374 - 28585132
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  28585374 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 28585275  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  28585274 acagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 28585175  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  28585174 aagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatg 28585132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51638611 - 51638369
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  51638611 cagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 51638512  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  51638511 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttca 51638412  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  51638411 aagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 51638369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 16207905 - 16208135
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || || || ||||||||||| ||||||  |||| || | || ||||| |||||||| || |||    
T  16207905 gcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtga 16208004  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16208005 ttcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatc 16208104  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16208105 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 16208135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 20340209 - 20340439
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  20340209 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 20340308  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  20340309 ttcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatc 20340408  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20340409 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 20340439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28152243 - 28152013
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||  |||||| ||||| ||   || ||||| || ||||| || |||    
T  28152243 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtga 28152144  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  28152143 tttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatc 28152044  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28152043 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 28152013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20461461 - 20461232
Alignment:
Q  24 catagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgat 123  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||  |||||  |||| || | || ||||| || ||| | || ||||    
T  20461461 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgat 20461362  T
Q  124 ttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcaccc 223  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||  |||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  20461361 tcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 20461262  T
Q  224 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||    
T  20461261 ttcgacatcatgacctagagcaccttgatg 20461232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 7101 - 7343
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||     
T  7101 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattc 7200  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  7201 acagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 7300  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7301 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 7343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6408 - 6165
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  6408 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 6309  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttc- 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||     
T  6308 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttca 6209  T
Q  210 aaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  6208 aaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 6165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 253
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2021
Alignment:
Q  69 acatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaag 168  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||| || | || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  169 tcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | |  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1938 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 2021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9952 - 9718
Alignment:
Q  19 ctttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9952 ctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 9853  T
Q  119 atgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatag 218  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  9852 atgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataa 9753  T
Q  219 cacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  9752 cacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatg 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 26063 - 26305
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||   ||||||||||||     
T  26063 cagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattc 26162  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  26163 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttca 26262  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26263 aagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatg 26305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8343 - 8101
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatattt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  8343 cagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattc 8244  T
Q  111 acagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||||    
T  8243 acagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttca 8144  T
Q  211 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  8143 aagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatg 8101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 46661 - 46912
Alignment:
Q  11 cagagaaactttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtct-aggagctgcc-tcacattcttcgat-cata 107  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||| ||| ||||    
T  46661 cagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgattcata 46760  T
Q  108 tttacagcggcatgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctc-aaaagtcagc-tttccttgatcaacgagctttttcacgatgta 205  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  46761 tttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatata 46860  T
Q  206 cttcaaagcata-gcacccctcgacat-cat--gacccagggcgccttgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  46861 cttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatg 46912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 2532 - 2762
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||| ||||| || | || ||||| || ||||| || |||    
T  2532 gcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtga 2631  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  2632 ttcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatc 2731  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2732 cttcgacatcatgacccagagcaccttgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 487 - 710
Alignment:
Q  18 actttgcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcgg 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||| || | ||| |    |||||||| || ||||| |    
T  487 acttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcag 586  T
Q  118 catgatttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcata 217  Q
    | ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||    
T  587 cgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgta 686  T
Q  218 gcacccctcgacatcatgacccag 241  Q
     || || || |||||||| |||||    
T  687 acatccttcaacatcatggcccag 710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 253
Target Start/End: Original strand, 5 - 132
Alignment:
Q  126 ggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacccct 225  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || | |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  5 ggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctt 104  T
Q  226 cgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||    
T  105 caacatcatgacccagagcaccttgatg 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21943 - 21713
Alignment:
Q  23 gcatagcttgatgtgtagatgcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgatcatatttacagcggcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||| ||   ||| |    |||||||| || ||||| || |||    
T  21943 gcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtga 21844  T
Q  123 tttggaagtggattatcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaacgagctttttcacgatgtacttcaaagcatagcacc 222  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||| || || |    
T  21843 ttcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatctacttcaaagcgtaacatc 21744  T
Q  223 cctcgacatcatgacccagggcgccttgatg 253  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||||||    
T  21743 cttcaacatcttggcccagagccccttgatg 21713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University