View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12821_high_7 (Length: 308)

Name: NF12821_high_7
Description: NF12821
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12821_high_7
NF12821_high_7
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-308)||(27434381-27434688)
chr2 (1-308)||(23128503-23128810)
chr2 (1-308)||(28882211-28882518)
chr2 (1-308)||(20837915-20838222)
chr2 (1-308)||(12655539-12655846)
chr2 (3-308)||(34286351-34286656)
chr2 (3-308)||(34291411-34291716)
chr2 (1-308)||(11635123-11635430)
chr2 (1-308)||(34861677-34861984)
chr2 (1-308)||(11641312-11641619)
chr2 (1-308)||(21677119-21677426)
chr2 (1-308)||(37685846-37686153)
chr2 (1-308)||(37701111-37701418)
chr2 (1-308)||(37925490-37925797)
chr2 (1-308)||(32049795-32050102)
chr2 (56-308)||(34279446-34279698)
chr2 (6-308)||(22925970-22926272)
chr2 (1-303)||(37375163-37375465)
chr2 (3-308)||(16829277-16829582)
chr2 (3-308)||(16891899-16892204)
chr2 (1-308)||(31876278-31876585)
chr2 (1-301)||(40233515-40233815)
chr2 (1-308)||(13936481-13936788)
chr2 (1-295)||(260690-260984)
chr2 (1-304)||(39890075-39890378)
chr2 (1-308)||(19416436-19416743)
chr2 (6-307)||(21703106-21703407)
chr2 (1-301)||(27777226-27777526)
chr2 (1-301)||(27816984-27817284)
chr2 (1-301)||(27803711-27804011)
chr2 (1-301)||(39051759-39052059)
chr2 (1-301)||(12716539-12716839)
chr2 (1-301)||(12586814-12587114)
chr2 (6-307)||(27118686-27118987)
chr2 (6-307)||(31891270-31891571)
chr2 (24-307)||(19456381-19456664)
chr2 (6-301)||(9349924-9350219)
chr2 (6-307)||(34303245-34303546)
chr2 (6-304)||(3784655-3784953)
chr2 (6-304)||(16163600-16163898)
chr2 (6-304)||(34157012-34157309)
chr2 (3-301)||(27392973-27393271)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-308)||(10916702-10917009)
chr7 (1-308)||(16503214-16503521)
chr7 (1-308)||(16518250-16518557)
chr7 (1-308)||(11424610-11424917)
chr7 (1-308)||(2154575-2154882)
chr7 (1-308)||(5127994-5128301)
chr7 (1-307)||(5147174-5147480)
chr7 (1-308)||(4144957-4145264)
chr7 (1-308)||(26319703-26320010)
chr7 (1-308)||(45387345-45387652)
chr7 (3-308)||(26274930-26275235)
chr7 (1-308)||(9618653-9618960)
chr7 (1-308)||(26669748-26670055)
chr7 (1-308)||(16736294-16736601)
chr7 (1-308)||(16751348-16751655)
chr7 (1-308)||(17523534-17523841)
chr7 (1-308)||(17529374-17529681)
chr7 (1-308)||(26435259-26435566)
chr7 (1-303)||(31564224-31564526)
chr7 (1-301)||(26537704-26538004)
chr7 (1-301)||(3445315-3445615)
chr7 (1-249)||(11441633-11441881)
chr7 (1-292)||(24592375-24592666)
chr7 (1-303)||(31124927-31125229)
chr7 (6-307)||(16041326-16041627)
chr7 (6-307)||(2108844-2109145)
chr7 (6-307)||(26484697-26484998)
chr7 (6-307)||(16449837-16450138)
chr7 (6-307)||(39210862-39211163)
chr7 (6-304)||(2775365-2775663)
chr7 (6-304)||(31088303-31088601)
chr7 (6-239)||(45733531-45733764)
chr7 (6-178)||(4200679-4200851)
chr7 (6-180)||(26682839-26683013)
chr7 (6-307)||(18540802-18541103)
chr7 (21-304)||(5159525-5159808)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-308)||(22934771-22935078)
chr6 (1-308)||(23857216-23857523)
chr6 (1-308)||(24863715-24864022)
chr6 (1-308)||(26988999-26989306)
chr6 (5-308)||(15424212-15424515)
chr6 (1-308)||(27000071-27000378)
chr6 (1-308)||(24304509-24304816)
chr6 (1-308)||(26918378-26918685)
chr6 (1-308)||(16749852-16750159)
chr6 (1-308)||(13298842-13299149)
chr6 (1-301)||(27272471-27272771)
chr6 (2-301)||(3696086-3696385)
chr6 (1-304)||(29549477-29549780)
chr6 (1-303)||(4757767-4758069)
chr6 (1-308)||(29573011-29573318)
chr6 (1-303)||(4773009-4773311)
chr6 (3-308)||(30557909-30558214)
chr6 (1-301)||(34463237-34463537)
chr6 (1-304)||(26777506-26777809)
chr6 (1-303)||(27044390-27044693)
chr6 (1-303)||(26116301-26116603)
chr6 (1-303)||(27359883-27360185)
chr6 (1-303)||(27450226-27450528)
chr6 (1-301)||(16674144-16674444)
chr6 (1-303)||(4525289-4525591)
chr6 (1-295)||(4545666-4545960)
chr6 (1-295)||(4724025-4724319)
chr6 (1-295)||(28207465-28207759)
chr6 (1-292)||(16943918-16944209)
chr6 (1-303)||(27007730-27008032)
chr6 (1-303)||(29501418-29501720)
chr6 (1-303)||(27485132-27485434)
chr6 (6-306)||(27290266-27290566)
chr6 (6-307)||(14143181-14143482)
chr6 (6-307)||(26787943-26788244)
chr6 (6-307)||(27196316-27196617)
chr6 (6-307)||(27252623-27252924)
chr6 (1-303)||(17025280-17025582)
chr6 (1-303)||(20160704-20161006)
chr6 (1-303)||(22171825-22172127)
chr6 (15-307)||(22456839-22457131)
chr6 (6-304)||(13521969-13522267)
chr6 (6-304)||(33374152-33374450)
chr6 (1-304)||(8892202-8892504)
chr6 (1-304)||(8903437-8903739)
chr6 (6-307)||(28162656-28162957)
chr6 (77-307)||(22477240-22477470)
chr6 (27-97)||(17092357-17092427)
chr6 (1-304)||(27629591-27629894)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-308)||(24688002-24688309)
chr5 (1-308)||(11549364-11549671)
chr5 (1-308)||(30934643-30934950)
chr5 (5-307)||(24970029-24970331)
chr5 (1-308)||(23717833-23718140)
chr5 (1-308)||(33777497-33777804)
chr5 (1-308)||(23752295-23752602)
chr5 (1-308)||(22998959-22999266)
chr5 (2-308)||(15658606-15658912)
chr5 (1-308)||(9548388-9548695)
chr5 (1-308)||(9317461-9317768)
chr5 (1-308)||(12132165-12132472)
chr5 (1-308)||(26480402-26480709)
chr5 (1-308)||(30152028-30152335)
chr5 (1-308)||(8665320-8665627)
chr5 (1-303)||(18500575-18500877)
chr5 (1-303)||(28649250-28649552)
chr5 (1-308)||(2511061-2511368)
chr5 (1-308)||(15758702-15759009)
chr5 (1-308)||(5637920-5638227)
chr5 (1-308)||(30168479-30168786)
chr5 (1-308)||(6874315-6874622)
chr5 (1-304)||(34616532-34616835)
chr5 (1-295)||(31431463-31431757)
chr5 (1-303)||(37671328-37671630)
chr5 (1-308)||(18375257-18375564)
chr5 (1-303)||(37754995-37755297)
chr5 (1-303)||(37770832-37771134)
chr5 (3-308)||(33516366-33516671)
chr5 (6-308)||(41674719-41675021)
chr5 (15-307)||(23892217-23892509)
chr5 (1-301)||(31826252-31826552)
chr5 (1-301)||(43078269-43078569)
chr5 (1-304)||(28959631-28959934)
chr5 (1-292)||(29966911-29967202)
chr5 (1-292)||(30029441-30029732)
chr5 (6-307)||(22888481-22888782)
chr5 (1-304)||(32599317-32599620)
chr5 (1-303)||(37358488-37358790)
chr5 (6-307)||(29888932-29889233)
chr5 (1-303)||(3789556-3789858)
chr5 (1-301)||(40473394-40473694)
chr5 (1-301)||(24681457-24681757)
chr5 (1-301)||(24723984-24724284)
chr5 (6-307)||(25199040-25199341)
chr5 (1-303)||(13324674-13324976)
chr5 (6-304)||(11325808-11326106)
chr5 (6-304)||(33877261-33877559)
chr5 (6-304)||(13184498-13184796)
chr5 (6-239)||(13440344-13440577)
chr5 (22-304)||(33292539-33292821)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-308)||(8301256-8301563)
chr3 (1-307)||(15892695-15893001)
chr3 (1-308)||(4796642-4796949)
chr3 (1-308)||(18051224-18051531)
chr3 (1-308)||(8295934-8296241)
chr3 (1-308)||(15741083-15741390)
chr3 (1-308)||(18330631-18330938)
chr3 (1-308)||(6192278-6192585)
chr3 (1-308)||(29148744-29149051)
chr3 (1-308)||(35880728-35881035)
chr3 (1-308)||(4721593-4721900)
chr3 (1-304)||(22387567-22387870)
chr3 (1-308)||(4416881-4417188)
chr3 (1-308)||(18277041-18277348)
chr3 (1-308)||(18292342-18292649)
chr3 (1-308)||(18307643-18307950)
chr3 (1-308)||(28115943-28116250)
chr3 (1-308)||(7073174-7073481)
chr3 (1-308)||(31964462-31964769)
chr3 (1-308)||(50134060-50134367)
chr3 (1-308)||(10396095-10396402)
chr3 (1-308)||(47023415-47023722)
chr3 (1-308)||(5609311-5609618)
chr3 (1-308)||(7996524-7996831)
chr3 (1-308)||(10643032-10643339)
chr3 (1-308)||(28339264-28339571)
chr3 (6-308)||(5713189-5713491)
chr3 (6-308)||(5724099-5724401)
chr3 (6-308)||(5757076-5757378)
chr3 (6-308)||(5767967-5768269)
chr3 (1-308)||(21674655-21674962)
chr3 (1-308)||(17984945-17985252)
chr3 (1-304)||(22870845-22871148)
chr3 (1-304)||(22885904-22886207)
chr3 (1-304)||(28021241-28021544)
chr3 (1-303)||(6542451-6542753)
chr3 (1-295)||(8211713-8212007)
chr3 (1-302)||(5466953-5467254)
chr3 (1-301)||(36997066-36997366)
chr3 (1-301)||(48465896-48466196)
chr3 (1-304)||(4346676-4346979)
chr3 (1-259)||(51782034-51782292)
chr3 (1-303)||(5596346-5596648)
chr3 (1-307)||(18225154-18225460)
chr3 (1-303)||(18242706-18243008)
chr3 (1-301)||(11110338-11110638)
chr3 (1-259)||(51797123-51797382)
chr3 (1-249)||(5013733-5013981)
chr3 (1-292)||(24328137-24328428)
chr3 (1-301)||(20576836-20577136)
chr3 (6-307)||(18530351-18530652)
chr3 (1-301)||(29664959-29665259)
chr3 (24-307)||(16626518-16626801)
chr3 (6-307)||(32292715-32293016)
chr3 (6-304)||(31034111-31034409)
chr3 (6-304)||(5652353-5652651)
chr3 (6-304)||(17993778-17994076)
chr3 (6-304)||(4625910-4626208)
chr3 (6-304)||(32439120-32439418)
chr3 (6-303)||(20066010-20066307)
chr3 (93-304)||(4893176-4893387)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-308)||(40017-40324)
scaffold0089 (1-307)||(29765-30071)
scaffold0089 (1-308)||(46933-47240)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-308)||(2137166-2137473)
chr8 (1-308)||(19688099-19688406)
chr8 (1-308)||(27608812-27609119)
chr8 (1-308)||(16277555-16277862)
chr8 (1-307)||(16283451-16283757)
chr8 (1-308)||(14557625-14557932)
chr8 (1-308)||(31489657-31489964)
chr8 (1-308)||(19208267-19208574)
chr8 (1-308)||(28361862-28362169)
chr8 (1-308)||(19674442-19674749)
chr8 (1-308)||(31354525-31354832)
chr8 (6-304)||(18710591-18710889)
chr8 (1-303)||(19286468-19286770)
chr8 (1-303)||(12092631-12092933)
chr8 (1-303)||(29829328-29829630)
chr8 (1-292)||(33258740-33259031)
chr8 (1-303)||(3329414-3329716)
chr8 (1-145)||(189258-189402)
chr8 (1-304)||(9354627-9354931)
chr8 (13-307)||(44563103-44563396)
chr8 (6-304)||(33244670-33244968)
chr8 (6-229)||(19658952-19659174)
chr8 (3-239)||(22080787-22081023)
chr8 (237-301)||(19518280-19518344)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-308)||(17014016-17014323)
chr4 (1-308)||(14665034-14665341)
chr4 (1-308)||(24592262-24592569)
chr4 (1-308)||(14763252-14763559)
chr4 (1-308)||(5005889-5006196)
chr4 (1-308)||(27163265-27163572)
chr4 (1-303)||(18800561-18800863)
chr4 (1-308)||(40105586-40105893)
chr4 (1-308)||(6569869-6570176)
chr4 (1-308)||(14098557-14098864)
chr4 (3-308)||(31126468-31126773)
chr4 (1-303)||(36344463-36344765)
chr4 (1-303)||(54833408-54833710)
chr4 (1-301)||(33673746-33674046)
chr4 (1-301)||(30753777-30754077)
chr4 (24-307)||(15284899-15285182)
chr4 (6-308)||(21969717-21970019)
chr4 (1-301)||(39850661-39850961)
chr4 (6-307)||(1900274-1900575)
chr4 (6-307)||(15227887-15228188)
chr4 (6-307)||(14235478-14235779)
chr4 (1-304)||(24460553-24460856)
chr4 (3-301)||(15391288-15391586)
chr4 (6-304)||(24112682-24112980)
chr4 (6-304)||(34188913-34189211)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-308)||(27293-27600)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-308)||(77-385)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (2-308)||(10962670-10962976)
chr1 (1-308)||(28584981-28585288)
chr1 (1-308)||(41793256-41793563)
chr1 (1-308)||(51638218-51638525)
chr1 (6-307)||(16207984-16208285)
chr1 (6-307)||(28151863-28152164)
chr1 (6-229)||(20340288-20340511)
chr1 (24-307)||(20461082-20461365)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-308)||(7187-7494)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-308)||(9014-9321)
scaffold0159 (1-308)||(20016-20323)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-308)||(14878-15185)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (2-308)||(26150-26457)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-308)||(30454-30760)
scaffold0124 (6-307)||(20390-20690)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-304)||(9571-9874)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (1-303)||(6015-6322)
scaffold0415 (6-239)||(1871-2103)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-295)||(7963-8257)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (7-307)||(46756-47072)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (6-229)||(2611-2834)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (30-307)||(5-282)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (3-229)||(21641-21867)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (3-163)||(568-728)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (1-304)||(94-397)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 27434381 - 27434688
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27434381 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 27434480  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27434481 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacgga 27434580  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27434581 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 27434680  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  27434681 tagcttgc 27434688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 23128503 - 23128810
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23128503 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 23128602  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23128603 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 23128702  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23128703 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 23128802  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  23128803 tagcttgc 23128810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28882518 - 28882211
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28882518 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 28882419  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28882418 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacgga 28882319  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28882318 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 28882219  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  28882218 tagcttgc 28882211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20838222 - 20837915
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20838222 cttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 20838123  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20838122 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacaga 20838023  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20838022 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 20837923  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  20837922 tagcttgc 20837915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12655846 - 12655539
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12655846 cttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 12655747  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12655746 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 12655647  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12655646 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 12655547  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  12655546 tagcttgc 12655539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34286656 - 34286351
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34286656 tcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttca 34286557  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34286556 cgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 34286457  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 302  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286456 aggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtcta 34286357  T
Q  303 gcttgc 308  Q
    ||||||    
T  34286356 gcttgc 34286351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34291716 - 34291411
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34291716 tcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttca 34291617  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34291616 cgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 34291517  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 302  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291516 aggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtcta 34291417  T
Q  303 gcttgc 308  Q
    ||||||    
T  34291416 gcttgc 34291411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 11635123 - 11635430
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  11635123 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttctt 11635222  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11635223 cacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 11635322  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11635323 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 11635422  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  11635423 tagcttgc 11635430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34861984 - 34861677
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  34861984 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 34861885  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  34861884 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 34861785  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34861784 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 34861685  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  34861684 tagcttgc 34861677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 11641312 - 11641619
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  11641312 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttctt 11641411  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11641412 cacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 11641511  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11641512 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtc 11641611  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  11641612 tagcttgc 11641619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 21677119 - 21677426
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  21677119 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 21677218  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  21677219 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 21677318  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21677319 tcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 21677418  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  21677419 tagcttgc 21677426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 37685846 - 37686153
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  37685846 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 37685945  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  37685946 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 37686045  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37686046 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 37686145  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  37686146 tagcttgc 37686153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 37701111 - 37701418
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  37701111 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 37701210  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  37701211 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 37701310  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37701311 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 37701410  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  37701411 tagcttgc 37701418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37925797 - 37925490
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  37925797 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 37925698  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||     
T  37925697 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggg 37925598  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  37925597 tcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcc 37925498  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  37925497 tagcttgc 37925490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32050102 - 32049795
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32050102 cttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 32050003  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||     
T  32050002 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggg 32049903  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32049902 tccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 32049803  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  32049802 tagcttgc 32049795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 56 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34279698 - 34279446
Alignment:
Q  56 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttga 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34279698 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttga 34279599  T
Q  156 tggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtca 255  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||      
T  34279598 tgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttg 34279499  T
Q  256 gaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgc 308  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34279498 gaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgc 34279446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Original strand, 22925970 - 22926272
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  22925970 atcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacga 22926069  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22926070 tatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 22926169  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22926170 tggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagct 22926269  T
Q  306 tgc 308  Q
    |||    
T  22926270 tgc 22926272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37375465 - 37375163
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  37375465 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttctt 37375366  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  37375365 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 37375266  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  37375265 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtc 37375166  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  37375165 tag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Original strand, 16829277 - 16829582
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  16829277 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttca 16829376  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16829377 cgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 16829476  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 302  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16829477 aggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggccta 16829576  T
Q  303 gcttgc 308  Q
    ||||||    
T  16829577 gcttgc 16829582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16892204 - 16891899
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  16892204 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttca 16892105  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16892104 cgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 16892005  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 302  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16892004 aggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggccta 16891905  T
Q  303 gcttgc 308  Q
    ||||||    
T  16891904 gcttgc 16891899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31876585 - 31876278
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  31876585 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 31876486  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  31876485 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 31876386  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  31876385 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtaggcc 31876286  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  31876285 tagcttgc 31876278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40233815 - 40233515
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40233815 cttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 40233716  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  40233715 cacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacgga 40233616  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  40233615 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 40233516  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  40233515 t 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 13936481 - 13936788
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13936481 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 13936580  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  13936581 cacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 13936680  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13936681 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 13936780  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    | ||||||    
T  13936781 tggcttgc 13936788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 260690 - 260984
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  260690 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 260789  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||    
T  260790 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacaga 260889  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 295  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  260890 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39890378 - 39890075
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  39890378 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 39890279  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||    
T  39890278 cacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacgga 39890179  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  39890178 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 39890079  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  39890078 tagc 39890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 19416436 - 19416743
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  19416436 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttctt 19416535  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  19416536 cacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 19416635  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  19416636 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaagttggcc 19416735  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    | ||||||    
T  19416736 tggcttgc 19416743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 21703106 - 21703407
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || || |    
T  21703106 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaa 21703205  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  21703206 tgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 21703305  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21703306 tggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagct 21703405  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  21703406 tg 21703407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27777526 - 27777226
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27777526 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 27777427  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  27777426 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 27777327  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27777326 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 27777227  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  27777226 t 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27817284 - 27816984
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27817284 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 27817185  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  27817184 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 27817085  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27817084 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 27816985  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  27816984 t 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27804011 - 27803711
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27804011 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 27803912  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  27803911 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 27803812  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27803811 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 27803712  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  27803711 t 27803711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 39051759 - 39052059
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  39051759 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 39051858  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  39051859 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 39051958  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  39051959 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 39052058  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  39052059 t 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 12716539 - 12716839
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12716539 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 12716638  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  12716639 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 12716738  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12716739 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 12716838  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  12716839 t 12716839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12587114 - 12586814
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12587114 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 12587015  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  12587014 cacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 12586915  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12586914 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 12586815  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  12586814 t 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27118987 - 27118686
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  27118987 atcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 27118888  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || ||||||||||    
T  27118887 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 27118788  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27118787 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagct 27118688  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  27118687 tg 27118686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 31891270 - 31891571
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  31891270 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31891369  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31891370 tgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcagg 31891469  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  31891470 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 31891569  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  31891570 tg 31891571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 307
Target Start/End: Original strand, 19456381 - 19456664
Alignment:
Q  24 tgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagc 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19456381 tgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc 19456480  T
Q  124 acccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgcactgtct 223  Q
    |  | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19456481 attcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 19456580  T
Q  224 ggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 307  Q
    |||||| || |||||| |  | |||| |||| | || |||||  |||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  19456581 ggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 19456664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 301
Target Start/End: Original strand, 9349924 - 9350219
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  9349924 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 9350023  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||    
T  9350024 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 9350123  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 301  Q
    ||| |||||||  || || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9350124 tggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 34303245 - 34303546
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  34303245 atcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 34303344  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || ||||||||||    
T  34303345 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 34303444  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  34303445 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 34303544  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  34303545 tg 34303546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3784953 - 3784655
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  3784953 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 3784854  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  3784853 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 3784754  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  3784753 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 3784655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16163898 - 16163600
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  16163898 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 16163799  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  16163798 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 16163699  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  16163698 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 16163600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34157309 - 34157012
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  34157309 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 34157211  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  34157210 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 34157111  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  34157110 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34157012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27393271 - 27392973
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    |||||||| || ||| | || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  27393271 tcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttta 27393172  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    | |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||   |||||||||| ||||||| |     
T  27393171 caatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggtt 27393072  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 301  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||| |  | || |||||| | |||| |||  |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  27393071 aggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtct 27392973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 10916702 - 10917009
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10916702 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 10916801  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10916802 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 10916901  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10916902 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 10917001  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  10917002 tagcttgc 10917009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 16503214 - 16503521
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16503214 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 16503313  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16503314 cacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 16503413  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16503414 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 16503513  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  16503514 tagcttgc 16503521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 16518250 - 16518557
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16518250 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttctt 16518349  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16518350 cacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 16518449  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16518450 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 16518549  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  16518550 tagcttgc 16518557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 11424610 - 11424917
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11424610 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 11424709  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11424710 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 11424809  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11424810 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 11424909  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  11424910 tagcttgc 11424917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2154882 - 2154575
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2154882 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 2154783  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2154782 cacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 2154683  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2154682 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtc 2154583  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  2154582 tagcttgc 2154575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5128301 - 5127994
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5128301 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 5128202  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5128201 cacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 5128102  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5128101 ttaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtc 5128002  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  5128001 tagcttgc 5127994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 5147174 - 5147480
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5147174 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 5147273  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5147274 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 5147373  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5147374 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtc 5147473  T
Q  301 tagcttg 307  Q
    |||||||    
T  5147474 tagcttg 5147480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 4144957 - 4145264
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  4144957 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 4145056  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4145057 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 4145156  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4145157 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 4145256  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  4145257 tagcttgc 4145264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 26319703 - 26320010
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  26319703 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 26319802  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26319803 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 26319902  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26319903 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 26320002  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  26320003 tagcttgc 26320010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45387652 - 45387345
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  45387652 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 45387553  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  45387552 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 45387453  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  45387452 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 45387353  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  45387352 tagcttgc 45387345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Original strand, 26274930 - 26275235
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  26274930 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttca 26275029  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26275030 cgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 26275129  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 302  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26275130 aggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggccta 26275229  T
Q  303 gcttgc 308  Q
    ||||||    
T  26275230 gcttgc 26275235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9618960 - 9618653
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  9618960 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 9618861  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  9618860 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 9618761  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9618760 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 9618661  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  9618660 tagcttgc 9618653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 26669748 - 26670055
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  26669748 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 26669847  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||    
T  26669848 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacgga 26669947  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26669948 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 26670047  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  26670048 tagcttgc 26670055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 16736294 - 16736601
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16736294 cttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 16736393  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||    
T  16736394 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacgga 16736493  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16736494 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 16736593  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  16736594 tagcttgc 16736601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 16751348 - 16751655
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16751348 cttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 16751447  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||    
T  16751448 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacgga 16751547  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16751548 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 16751647  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  16751648 tagcttgc 16751655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17523841 - 17523534
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17523841 cttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 17523742  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||    
T  17523741 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacgga 17523642  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17523641 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 17523542  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  17523541 tagcttgc 17523534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 17529374 - 17529681
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17529374 cttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 17529473  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||    
T  17529474 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacgga 17529573  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17529574 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 17529673  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  17529674 tagcttgc 17529681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26435566 - 26435259
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26435566 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 26435467  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26435466 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 26435367  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  26435366 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 26435267  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  26435266 tagcttgc 26435259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 31564224 - 31564526
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31564224 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 31564323  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  31564324 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 31564423  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  31564424 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 31564523  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  31564524 tag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 26537704 - 26538004
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26537704 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 26537803  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26537804 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 26537903  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26537904 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 26538003  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  26538004 t 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3445615 - 3445315
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3445615 cttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 3445516  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  3445515 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 3445416  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  3445415 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 3445316  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  3445315 t 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11441881 - 11441633
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  11441881 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 11441782  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11441781 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 11441682  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagta 249  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11441681 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagta 11441633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 24592375 - 24592666
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  24592375 cttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 24592474  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  24592475 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 24592574  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaa 292  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24592575 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaa 24592666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31125229 - 31124927
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  31125229 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttctt 31125130  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  31125129 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 31125030  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  31125029 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 31124930  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  31124929 tag 31124927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16041627 - 16041326
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || |    
T  16041627 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcacaa 16041528  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  16041527 tgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 16041428  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16041427 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagct 16041328  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  16041327 tg 16041326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 2108844 - 2109145
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  2108844 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 2108943  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  2108944 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 2109043  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  2109044 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 2109143  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  2109144 tg 2109145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26484998 - 26484697
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  26484998 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 26484899  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  26484898 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 26484799  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  26484798 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 26484699  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  26484698 tg 26484697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 16449837 - 16450138
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || || |    
T  16449837 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaa 16449936  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||| |||| ||||||||    
T  16449937 tgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcagg 16450036  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16450037 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 16450136  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  16450137 tg 16450138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 39210862 - 39211163
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  39210862 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 39210961  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  39210962 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 39211061  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    |||  |||| | ||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  39211062 tggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 39211161  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  39211162 tg 39211163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2775663 - 2775365
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  2775663 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 2775564  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  2775563 tgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 2775464  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||| ||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  2775463 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 31088303 - 31088601
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  31088303 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31088402  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  31088403 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 31088502  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  31088503 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31088601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45733764 - 45733531
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  45733764 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 45733665  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  45733664 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 45733565  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccct 239  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  45733564 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 45733531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4200851 - 4200679
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  4200851 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 4200752  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcgga 178  Q
    |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200751 tgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgga 4200679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 26682839 - 26683013
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||  |    
T  26682839 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaa 26682938  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacc 180  Q
    |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682939 tgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggacc 26683013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18541103 - 18540802
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  18541103 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 18541004  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| | || || || ||    
T  18541003 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 18540904  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| |||||||||||||||    
T  18540903 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagct 18540804  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  18540803 tg 18540802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5159808 - 5159525
Alignment:
Q  21 gcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcat 120  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||    
T  5159808 gcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcat 5159709  T
Q  121 agcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgcactg 220  Q
    |||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||| |||    
T  5159708 agcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctg 5159609  T
Q  221 tctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
     || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5159608 cctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 5159525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 22934771 - 22935078
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22934771 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttctt 22934870  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22934871 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacgga 22934970  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22934971 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 22935070  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  22935071 tagcttgc 22935078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 23857216 - 23857523
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23857216 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttctt 23857315  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23857316 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacgga 23857415  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23857416 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 23857515  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  23857516 tagcttgc 23857523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24864022 - 24863715
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24864022 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 24863923  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24863922 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 24863823  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24863822 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 24863723  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  24863722 tagcttgc 24863715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26989306 - 26988999
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26989306 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 26989207  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26989206 tacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 26989107  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26989106 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 26989007  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  26989006 tagcttgc 26988999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 308
Target Start/End: Original strand, 15424212 - 15424515
Alignment:
Q  5 gatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15424212 gatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacg 15424311  T
Q  105 atgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcag 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15424312 atatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcag 15424411  T
Q  205 gtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15424412 gtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 15424511  T
Q  305 ttgc 308  Q
    ||||    
T  15424512 ttgc 15424515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27000378 - 27000071
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000378 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 27000279  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27000278 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 27000179  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27000178 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 27000079  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  27000078 tagcttgc 27000071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 24304509 - 24304816
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24304509 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 24304608  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24304609 cacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 24304708  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24304709 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 24304808  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  24304809 tagcttgc 24304816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26918685 - 26918378
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26918685 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttttt 26918586  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26918585 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 26918486  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26918485 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 26918386  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  26918385 tagcttgc 26918378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16750159 - 16749852
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16750159 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 16750060  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  16750059 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 16749960  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16749959 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 16749860  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  16749859 tagcttgc 16749852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 13298842 - 13299149
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13298842 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 13298941  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13298942 cacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 13299041  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13299042 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 13299141  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  13299142 tagcttgc 13299149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 27272471 - 27272771
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27272471 cttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagcttttt 27272570  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27272571 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacgga 27272670  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27272671 tcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 27272770  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  27272771 t 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3696385 - 3696086
Alignment:
Q  2 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttt 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  3696385 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 3696286  T
Q  102 acgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggat 201  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  3696285 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 3696186  T
Q  202 caggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 301  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  3696185 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29549780 - 29549477
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29549780 cttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 29549681  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  29549680 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 29549581  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  29549580 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 29549481  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  29549480 tagc 29549477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4758069 - 4757767
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4758069 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 4757970  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4757969 cacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 4757870  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  4757869 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 4757770  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  4757769 tag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29573318 - 29573011
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  29573318 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 29573219  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  29573218 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 29573119  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  29573118 tcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 29573019  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  29573018 tagcttgc 29573011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4773311 - 4773009
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4773311 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 4773212  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4773211 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 4773112  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  4773111 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 4773012  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  4773011 tag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Original strand, 30557909 - 30558214
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  30557909 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttca 30558008  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30558009 cgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 30558108  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 302  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  30558109 aggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggccta 30558208  T
Q  303 gcttgc 308  Q
    ||||||    
T  30558209 gcttgc 30558214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 34463237 - 34463537
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34463237 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 34463336  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  34463337 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 34463436  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| |  ||||| || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  34463437 tcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 34463536  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  34463537 t 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 26777506 - 26777809
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  26777506 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 26777605  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26777606 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 26777705  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  26777706 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggttggtc 26777805  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  26777806 tagc 26777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27044693 - 27044390
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27044693 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 27044594  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagc-acccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgg 199  Q
     ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  27044593 cacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgg 27044494  T
Q  200 atcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggt 299  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  27044493 gtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggt 27044394  T
Q  300 ctag 303  Q
    ||||    
T  27044393 ctag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 26116301 - 26116603
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26116301 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 26116400  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26116401 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 26116500  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26116501 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtc 26116600  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  26116601 tag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 27359883 - 27360185
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27359883 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 27359982  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27359983 cacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 27360082  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27360083 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtc 27360182  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  27360183 tag 27360185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 27450226 - 27450528
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27450226 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 27450325  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27450326 cacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 27450425  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27450426 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtc 27450525  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  27450526 tag 27450528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16674444 - 16674144
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16674444 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 16674345  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  16674344 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 16674245  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  16674244 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 16674145  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  16674144 t 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4525591 - 4525289
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4525591 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 4525492  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4525491 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacgga 4525392  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  4525391 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 4525292  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  4525291 tag 4525289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 4545666 - 4545960
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4545666 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 4545765  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4545766 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 4545865  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 295  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4545866 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 4724025 - 4724319
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  4724025 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagtttctt 4724124  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4724125 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 4724224  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 295  Q
    |||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4724225 tcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28207759 - 28207465
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  28207759 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 28207660  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28207659 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 28207560  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 295  Q
    |||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28207559 tcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 16943918 - 16944209
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  16943918 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 16944017  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  16944018 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 16944117  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaa 292  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  16944118 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaa 16944209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27008032 - 27007730
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  27008032 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttctt 27007933  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27007932 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 27007833  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  27007832 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 27007733  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  27007732 tag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29501720 - 29501418
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  29501720 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 29501621  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  29501620 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 29501521  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  29501520 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtc 29501421  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  29501420 tag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27485434 - 27485132
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27485434 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 27485335  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27485334 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 27485235  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  27485234 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 27485135  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  27485134 tag 27485132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 27290266 - 27290566
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |    
T  27290266 atcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 27290365  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| | |||||||||||    
T  27290366 tgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcagg 27290465  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  27290466 tggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 27290565  T
Q  306 t 306  Q
    |    
T  27290566 t 27290566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 14143181 - 14143482
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  14143181 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 14143280  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  14143281 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 14143380  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||  || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  14143381 tggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 14143480  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  14143481 tg 14143482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26788244 - 26787943
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  26788244 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 26788145  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  26788144 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 26788045  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||  || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  26788044 tggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 26787945  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  26787944 tg 26787943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27196617 - 27196316
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  27196617 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 27196518  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  27196517 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 27196418  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||  || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  27196417 tggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 27196318  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  27196317 tg 27196316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 27252623 - 27252924
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  27252623 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 27252722  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  27252723 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 27252822  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||  || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  27252823 tggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 27252922  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  27252923 tg 27252924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17025582 - 17025280
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17025582 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 17025483  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  17025482 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 17025383  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  17025382 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 17025283  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  17025282 tag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20161006 - 20160704
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
T  20161006 cttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagcttttt 20160907  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||||||    
T  20160906 cacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacgga 20160807  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20160806 tcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtc 20160707  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  20160706 tag 20160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 22171825 - 22172127
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
T  22171825 cttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagcttttt 22171924  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||||||    
T  22171925 cacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacgga 22172024  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22172025 tcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtc 22172124  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  22172125 tag 22172127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 22456839 - 22457131
Alignment:
Q  15 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttca 114  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |    
T  22456839 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtacttta 22456938  T
Q  115 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggctt 214  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22456939 aagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggctt 22457038  T
Q  215 gcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 307  Q
    || |||||||||||| || |||| | |  | |||| |||| | || |||||  |||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  22457039 gccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 22457131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 13521969 - 13522267
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  13521969 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 13522068  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  13522069 tgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13522168  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  13522169 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13522267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 33374152 - 33374450
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  33374152 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33374251  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  33374252 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 33374351  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  33374352 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 8892202 - 8892504
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||    
T  8892202 cttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttt 8892300  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
    ||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | |||    
T  8892301 tacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatgga 8892400  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||    
T  8892401 tcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtc 8892500  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  8892501 tagc 8892504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 8903437 - 8903739
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||    
T  8903437 cttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttt 8903535  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
    ||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | |||    
T  8903536 tacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatgga 8903635  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||    
T  8903636 tcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtc 8903735  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  8903736 tagc 8903739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28162957 - 28162656
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  28162957 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 28162858  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| ||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | |||||| |    
T  28162857 tgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaag 28162758  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  28162757 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 28162658  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  28162657 tg 28162656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 307
Target Start/End: Original strand, 22477240 - 22477470
Alignment:
Q  77 ctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcg 176  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||      
T  22477240 ctttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtta 22477339  T
Q  177 gacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaaca 276  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| | |  | |||| |||| | || |||||  |||||| ||    
T  22477340 gaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatca 22477439  T
Q  277 tcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 307  Q
    | |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  22477440 ttggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 22477470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 17092357 - 17092427
Alignment:
Q  27 tttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 97  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  17092357 tttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27629591 - 27629894
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |     
T  27629591 cttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggtcaataagcctctg 27629690  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || ||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||| || |  |  ||||| ||  | || |||    
T  27629691 gacaatatactttaaagcataacacctctcaacgtcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatgga 27629790  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || || || ||| | | ||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  27629791 tctggcggaggcctaccctgcctagtcgtacaatgacctctctgaagtaatgttggaagtaaatcagcatacaacatcgggattggaggaaaagtaggcc 27629890  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  27629891 tagc 27629894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 24688002 - 24688309
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688002 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 24688101  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24688102 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacgga 24688201  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24688202 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtc 24688301  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  24688302 tagcttgc 24688309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11549671 - 11549364
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11549671 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 11549572  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11549571 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 11549472  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11549471 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 11549372  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  11549371 tagcttgc 11549364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30934950 - 30934643
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30934950 cttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 30934851  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30934850 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacgga 30934751  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30934750 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 30934651  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  30934650 tagcttgc 30934643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24970331 - 24970029
Alignment:
Q  5 gatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  24970331 gatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacg 24970232  T
Q  105 atgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcag 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24970231 atatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcag 24970132  T
Q  205 gtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24970131 gtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24970032  T
Q  305 ttg 307  Q
    |||    
T  24970031 ttg 24970029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 23717833 - 23718140
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23717833 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 23717932  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23717933 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 23718032  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23718033 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 23718132  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  23718133 tagcttgc 23718140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33777804 - 33777497
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777804 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 33777705  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33777704 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacgga 33777605  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33777604 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 33777505  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  33777504 tagcttgc 33777497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 23752295 - 23752602
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23752295 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 23752394  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23752395 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacgga 23752494  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23752495 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 23752594  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  23752595 tagcttgc 23752602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 22998959 - 22999266
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22998959 cttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 22999058  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22999059 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 22999158  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22999159 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 22999258  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  22999259 tagcttgc 22999266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 308
Target Start/End: Original strand, 15658606 - 15658912
Alignment:
Q  2 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttt 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  15658606 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15658705  T
Q  102 acgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggat 201  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  15658706 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15658805  T
Q  202 caggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 301  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658806 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 15658905  T
Q  302 agcttgc 308  Q
    |||||||    
T  15658906 agcttgc 15658912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 9548388 - 9548695
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9548388 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 9548487  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  9548488 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 9548587  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9548588 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 9548687  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  9548688 tagcttgc 9548695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9317768 - 9317461
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  9317768 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 9317669  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  9317668 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 9317569  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9317568 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 9317469  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  9317468 tagcttgc 9317461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12132472 - 12132165
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  12132472 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 12132373  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12132372 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 12132273  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12132272 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 12132173  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  12132172 tagcttgc 12132165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26480709 - 26480402
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  26480709 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 26480610  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26480609 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 26480510  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26480509 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 26480410  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  26480409 tagcttgc 26480402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30152335 - 30152028
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  30152335 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 30152236  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  30152235 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 30152136  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  30152135 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 30152036  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  30152035 tagcttgc 30152028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 8665320 - 8665627
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  8665320 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 8665419  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  8665420 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 8665519  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8665520 tcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 8665619  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  8665620 tagcttgc 8665627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18500575 - 18500877
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18500575 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 18500674  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  18500675 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 18500774  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  18500775 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 18500874  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  18500875 tag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28649552 - 28649250
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28649552 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 28649453  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28649452 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 28649353  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  28649352 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 28649253  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  28649252 tag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2511368 - 2511061
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  2511368 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 2511269  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  2511268 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 2511169  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2511168 tcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 2511069  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  2511068 tagcttgc 2511061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 15758702 - 15759009
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  15758702 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 15758801  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  15758802 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 15758901  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15758902 tcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 15759001  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  15759002 tagcttgc 15759009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5638227 - 5637920
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  5638227 cttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 5638128  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5638127 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 5638028  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5638027 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 5637928  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  5637927 tagcttgc 5637920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30168786 - 30168479
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30168786 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttctt 30168687  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  30168686 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 30168587  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  30168586 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 30168487  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  30168486 tagcttgc 30168479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6874622 - 6874315
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  6874622 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttctt 6874523  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  6874522 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 6874423  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6874422 tcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 6874323  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  6874322 tagcttgc 6874315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34616835 - 34616532
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  34616835 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 34616736  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  34616735 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 34616636  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  34616635 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 34616536  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  34616535 tagc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31431757 - 31431463
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31431757 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 31431658  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  31431657 cacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 31431558  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 295  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  31431557 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 31431463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 37671328 - 37671630
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  37671328 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 37671427  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  37671428 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 37671527  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  37671528 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 37671627  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  37671628 tag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 18375257 - 18375564
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  18375257 cttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 18375356  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  18375357 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 18375456  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  18375457 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtc 18375556  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  18375557 tagcttgc 18375564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37755297 - 37754995
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  37755297 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 37755198  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  37755197 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 37755098  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  37755097 tcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 37754998  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  37754997 tag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 37770832 - 37771134
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  37770832 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 37770931  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  37770932 catgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 37771031  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  37771032 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 37771131  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  37771132 tag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33516671 - 33516366
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  33516671 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttca 33516572  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33516571 cgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 33516472  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 302  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  33516471 aggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggccta 33516372  T
Q  303 gcttgc 308  Q
    ||||||    
T  33516371 gcttgc 33516366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41675021 - 41674719
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  41675021 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgacga 41674922  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  41674921 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcagg 41674822  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41674821 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagct 41674722  T
Q  306 tgc 308  Q
    |||    
T  41674721 tgc 41674719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23892509 - 23892217
Alignment:
Q  15 acagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttca 114  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23892509 acagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttca 23892410  T
Q  115 aagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggctt 214  Q
     ||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23892409 gagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggctt 23892310  T
Q  215 gcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 307  Q
    || |||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| ||||||||||  ||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23892309 gccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 23892217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 31826252 - 31826552
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31826252 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 31826351  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  31826352 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 31826451  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  31826452 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 31826551  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  31826552 t 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43078569 - 43078269
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  43078569 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttctt 43078470  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  43078469 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 43078370  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  43078369 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 43078270  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  43078269 t 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 28959631 - 28959934
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  28959631 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 28959730  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28959731 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 28959830  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  28959831 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 28959930  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  28959931 tagc 28959934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 29966911 - 29967202
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  29966911 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 29967010  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  29967011 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 29967110  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaa 292  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  29967111 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaa 29967202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30029732 - 30029441
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  30029732 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 30029633  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  30029632 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 30029533  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaa 292  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  30029532 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaa 30029441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22888782 - 22888481
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |    
T  22888782 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 22888683  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  22888682 tgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 22888583  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||  | | || |||| | || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22888582 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagct 22888483  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  22888482 tg 22888481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 32599317 - 32599620
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32599317 cttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 32599416  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  32599417 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 32599516  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  32599517 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 32599616  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  32599617 tagc 32599620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 37358488 - 37358790
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  37358488 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 37358587  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  37358588 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 37358687  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  37358688 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 37358787  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  37358788 tag 37358790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 29888932 - 29889233
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29888932 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacga 29889031  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29889032 tgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcagg 29889131  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||  | |||| |||  | || | |||| |||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  29889132 tggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 29889231  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  29889232 tg 29889233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3789858 - 3789556
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  3789858 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 3789759  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  3789758 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 3789659  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  3789658 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 3789559  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  3789558 tag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 40473394 - 40473694
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  40473394 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 40473493  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  40473494 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 40473593  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  40473594 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 40473693  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  40473694 t 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24681757 - 24681457
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24681757 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 24681658  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  24681657 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 24681558  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24681557 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 24681458  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  24681457 t 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24724284 - 24723984
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24724284 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 24724185  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  24724184 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 24724085  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24724084 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 24723985  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  24723984 t 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25199341 - 25199040
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |    
T  25199341 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 25199242  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||| | |||||||||||    
T  25199241 tgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcagg 25199142  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||    
T  25199141 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagct 25199042  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  25199041 tg 25199040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 13324674 - 13324976
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  13324674 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 13324773  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||||| || || | |||||| ||| | || ||     
T  13324774 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 13324873  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  13324874 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 13324973  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  13324974 tag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11326106 - 11325808
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  11326106 atcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 11326007  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  11326006 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 11325907  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  11325906 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 11325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33877559 - 33877261
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  33877559 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 33877460  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  33877459 tgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 33877360  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  33877359 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33877261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 13184498 - 13184796
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  13184498 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13184597  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  13184598 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13184697  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  13184698 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13184796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 13440344 - 13440577
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  13440344 atcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13440443  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  13440444 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13440543  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccct 239  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13440544 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 13440577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33292821 - 33292539
Alignment:
Q  22 catgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcata 121  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  33292821 catgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcata 33292722  T
Q  122 gcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgcactgt 221  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||| |||     
T  33292721 gcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgc 33292622  T
Q  222 ctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  33292621 ctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 33292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 8301256 - 8301563
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8301256 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 8301355  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8301356 cacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 8301455  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8301456 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 8301555  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  8301556 tagcttgc 8301563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 15892695 - 15893001
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15892695 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 15892794  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  15892795 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaagga 15892894  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15892895 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtc 15892994  T
Q  301 tagcttg 307  Q
    |||||||    
T  15892995 tagcttg 15893001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 4796642 - 4796949
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796642 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 4796741  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4796742 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 4796841  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4796842 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 4796941  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  4796942 tagcttgc 4796949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18051531 - 18051224
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18051531 cttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 18051432  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18051431 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagcgga 18051332  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18051331 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 18051232  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  18051231 tagcttgc 18051224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8296241 - 8295934
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8296241 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttctt 8296142  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8296141 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacaga 8296042  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8296041 tcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 8295942  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  8295941 tagcttgc 8295934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 15741083 - 15741390
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15741083 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 15741182  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |    
T  15741183 cacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaa 15741282  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15741283 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 15741382  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  15741383 tagcttgc 15741390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18330938 - 18330631
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18330938 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 18330839  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18330838 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 18330739  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18330738 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 18330639  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  18330638 tagcttgc 18330631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6192585 - 6192278
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6192585 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 6192486  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||    
T  6192485 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcaga 6192386  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6192385 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 6192286  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  6192285 tagcttgc 6192278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 29148744 - 29149051
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29148744 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 29148843  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  29148844 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 29148943  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29148944 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 29149043  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  29149044 tagcttgc 29149051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35881035 - 35880728
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35881035 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 35880936  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  35880935 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcgga 35880836  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35880835 tcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 35880736  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  35880735 tagcttgc 35880728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4721900 - 4721593
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4721900 cttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagattttt 4721801  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  4721800 cacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcgga 4721701  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4721700 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 4721601  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  4721600 tagcttgc 4721593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 22387567 - 22387870
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22387567 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 22387666  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  22387667 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 22387766  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  22387767 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtc 22387866  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  22387867 tagc 22387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4417188 - 4416881
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4417188 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 4417089  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4417088 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 4416989  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4416988 tcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 4416889  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  4416888 tagcttgc 4416881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 18277041 - 18277348
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18277041 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 18277140  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||    
T  18277141 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactga 18277240  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18277241 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 18277340  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  18277341 tagcttgc 18277348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 18292342 - 18292649
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18292342 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 18292441  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||    
T  18292442 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactga 18292541  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18292542 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 18292641  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  18292642 tagcttgc 18292649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 18307643 - 18307950
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18307643 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 18307742  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||    
T  18307743 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactga 18307842  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18307843 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 18307942  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  18307943 tagcttgc 18307950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 28115943 - 28116250
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28115943 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttctt 28116042  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28116043 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 28116142  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28116143 tcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 28116242  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  28116243 tagcttgc 28116250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7073481 - 7073174
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  7073481 cttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttctt 7073382  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  7073381 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 7073282  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7073281 tcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtc 7073182  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  7073181 tagcttgc 7073174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 31964462 - 31964769
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  31964462 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 31964561  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  31964562 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 31964661  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31964662 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 31964761  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  31964762 tagcttgc 31964769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 50134060 - 50134367
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  50134060 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 50134159  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  50134160 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 50134259  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  50134260 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 50134359  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  50134360 tagcttgc 50134367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10396402 - 10396095
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10396402 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 10396303  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  10396302 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 10396203  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10396202 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtc 10396103  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  10396102 tagcttgc 10396095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47023722 - 47023415
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  47023722 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 47023623  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  47023622 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 47023523  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  47023522 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 47023423  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  47023422 tagcttgc 47023415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 5609311 - 5609618
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  5609311 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 5609410  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5609411 cacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 5609510  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5609511 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 5609610  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  5609611 tagcttgc 5609618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7996831 - 7996524
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  7996831 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 7996732  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  7996731 cacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 7996632  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  7996631 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 7996532  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  7996531 tagcttgc 7996524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10643339 - 10643032
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  10643339 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 10643240  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  10643239 cacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 10643140  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10643139 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 10643040  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  10643039 tagcttgc 10643032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28339571 - 28339264
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  28339571 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 28339472  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28339471 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 28339372  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28339371 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 28339272  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  28339271 tagcttgc 28339264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5713491 - 5713189
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  5713491 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5713392  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5713391 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5713292  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5713291 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5713192  T
Q  306 tgc 308  Q
    |||    
T  5713191 tgc 5713189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5724401 - 5724099
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  5724401 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5724302  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5724301 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5724202  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5724201 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5724102  T
Q  306 tgc 308  Q
    |||    
T  5724101 tgc 5724099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Original strand, 5757076 - 5757378
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  5757076 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5757175  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5757176 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5757275  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5757276 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5757375  T
Q  306 tgc 308  Q
    |||    
T  5757376 tgc 5757378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Original strand, 5767967 - 5768269
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  5767967 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5768066  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5768067 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5768166  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5768167 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5768266  T
Q  306 tgc 308  Q
    |||    
T  5768267 tgc 5768269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21674962 - 21674655
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21674962 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 21674863  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  21674862 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 21674763  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21674762 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 21674663  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  21674662 tagcttgc 21674655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 17984945 - 17985252
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  17984945 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 17985044  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  17985045 cacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 17985144  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17985145 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtc 17985244  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  17985245 tagcttgc 17985252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 22870845 - 22871148
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22870845 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 22870944  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  22870945 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 22871044  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  22871045 tcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 22871144  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  22871145 tagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 22885904 - 22886207
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22885904 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 22886003  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  22886004 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 22886103  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  22886104 tcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 22886203  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  22886204 tagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28021544 - 28021241
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28021544 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 28021445  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | || |||    
T  28021444 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatgga 28021345  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  28021344 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 28021245  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  28021244 tagc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 6542451 - 6542753
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6542451 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 6542550  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  6542551 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 6542650  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  6542651 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 6542750  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  6542751 tag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8212007 - 8211713
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8212007 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 8211908  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  8211907 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 8211808  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 295  Q
    |||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8211807 tcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 8211713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5467254 - 5466953
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  5467254 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttctt 5467155  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5467154 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 5467055  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||    
T  5467054 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttggtc 5466955  T
Q  301 ta 302  Q
    ||    
T  5466954 ta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 36997066 - 36997366
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  36997066 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 36997165  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  36997166 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 36997265  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  36997266 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 36997365  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  36997366 t 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 48466196 - 48465896
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48466196 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 48466097  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  48466096 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 48465997  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  48465996 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 48465897  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  48465896 t 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 4346676 - 4346979
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4346676 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 4346775  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4346776 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 4346875  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  4346876 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 4346975  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  4346976 tagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 51782292 - 51782034
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  51782292 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttctt 51782193  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  51782192 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 51782093  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaag 259  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  51782092 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttagaag 51782034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 5596346 - 5596648
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  5596346 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 5596445  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5596446 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 5596545  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  5596546 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtc 5596645  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  5596646 tag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18225460 - 18225154
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  18225460 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 18225361  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  18225360 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 18225261  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  18225260 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggtaggcc 18225161  T
Q  301 tagcttg 307  Q
    |||||||    
T  18225160 tagcttg 18225154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18243008 - 18242706
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  18243008 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 18242909  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  18242908 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 18242809  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18242808 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 18242709  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  18242708 tag 18242706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 11110338 - 11110638
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11110338 cttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 11110437  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11110438 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 11110537  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  11110538 tcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 11110637  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  11110638 t 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 51797382 - 51797123
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  51797382 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttctt 51797283  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacc-tgggaagcaacgg 199  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| || || |||||||    
T  51797282 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacgg 51797183  T
Q  200 atcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaag 259  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  51797182 atcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttagaag 51797123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5013981 - 5013733
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  5013981 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 5013882  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5013881 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 5013782  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagta 249  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5013781 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagta 5013733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24328428 - 24328137
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  24328428 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 24328329  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  24328328 cacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 24328229  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaa 292  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24328228 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaa 24328137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 20576836 - 20577136
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20576836 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 20576935  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  20576936 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 20577035  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20577036 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 20577135  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  20577136 t 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18530652 - 18530351
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| |    
T  18530652 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaa 18530553  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  18530552 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 18530453  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  18530452 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 18530353  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  18530352 tg 18530351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 29664959 - 29665259
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29664959 cttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 29665058  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  29665059 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 29665158  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  29665159 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 29665258  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  29665259 t 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 307
Target Start/End: Original strand, 16626518 - 16626801
Alignment:
Q  24 tgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagc 123  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16626518 tgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc 16626617  T
Q  124 acccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgcactgtct 223  Q
    | || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16626618 atccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 16626717  T
Q  224 ggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 307  Q
    |||||| || ||||||||| | |||| |||  | || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16626718 ggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 16626801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32293016 - 32292715
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  32293016 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 32292917  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  32292916 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 32292817  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| | ||| | ||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  32292816 tggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 32292717  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  32292716 tg 32292715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 31034111 - 31034409
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  31034111 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 31034210  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  31034211 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcagg 31034310  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  31034311 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5652651 - 5652353
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  5652651 atcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 5652552  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || |||| |||||    
T  5652551 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 5652452  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||  ||||||| |||||||||||| || |||||| |  |||||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  5652451 tgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 5652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 17993778 - 17994076
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  17993778 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 17993877  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  17993878 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 17993977  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  17993978 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 17994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4626208 - 4625910
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  4626208 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 4626109  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||    
T  4626108 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 4626009  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  4626008 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 4625910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32439418 - 32439120
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  32439418 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 32439319  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| | || || || ||    
T  32439318 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 32439219  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32439218 tggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 32439120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20066307 - 20066010
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  20066307 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 20066208  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| | || ||  | ||    
T  20066207 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccgg 20066108  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 303  Q
    ||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20066107 tggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4893387 - 4893176
Alignment:
Q  93 agcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaa 192  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || ||   |||||| |||     
T  4893387 agcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggag 4893288  T
Q  193 gcaacggatcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaa 292  Q
    | || || || ||||| || |||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  4893287 gtaaagggtccggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaa 4893188  T
Q  293 agtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||||    
T  4893187 agttggtctagc 4893176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 40017 - 40324
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40017 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctcctt 40116  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  40117 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacgga 40216  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40217 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 40316  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  40317 tagcttgc 40324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30071 - 29765
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30071 cttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 29972  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29971 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 29872  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29871 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 29772  T
Q  301 tagcttg 307  Q
    |||||||    
T  29771 tagcttg 29765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 46933 - 47240
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46933 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 47032  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47033 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 47132  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47133 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 47232  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  47233 tagcttgc 47240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 2137166 - 2137473
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137166 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 2137265  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2137266 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 2137365  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2137366 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 2137465  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  2137466 tagcttgc 2137473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19688406 - 19688099
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19688406 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttttt 19688307  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19688306 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 19688207  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19688206 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 19688107  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  19688106 tagcttgc 19688099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 27608812 - 27609119
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27608812 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 27608911  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27608912 cacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 27609011  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27609012 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 27609111  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  27609112 tagcttgc 27609119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16277862 - 16277555
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16277862 cttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 16277763  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16277762 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacgga 16277663  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16277662 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 16277563  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  16277562 tagcttgc 16277555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16283757 - 16283451
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16283757 cttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 16283658  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16283657 cacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacgga 16283558  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16283557 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtc 16283458  T
Q  301 tagcttg 307  Q
    |||||||    
T  16283457 tagcttg 16283451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14557932 - 14557625
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14557932 cttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 14557833  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14557832 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 14557733  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14557732 tcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtc 14557633  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  14557632 tagcttgc 14557625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 31489657 - 31489964
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31489657 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 31489756  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  31489757 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 31489856  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31489857 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 31489956  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  31489957 tagcttgc 31489964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 19208267 - 19208574
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  19208267 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 19208366  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  19208367 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 19208466  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19208467 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 19208566  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  19208567 tagcttgc 19208574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 28361862 - 28362169
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  28361862 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 28361961  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28361962 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 28362061  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28362062 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 28362161  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  28362162 tagcttgc 28362169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19674749 - 19674442
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19674749 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 19674650  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  19674649 cacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 19674550  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19674549 tcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 19674450  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  19674449 tagcttgc 19674442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31354832 - 31354525
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  31354832 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 31354733  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||    
T  31354732 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaagga 31354633  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31354632 tcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 31354533  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  31354532 tagcttgc 31354525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18710889 - 18710591
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18710889 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 18710790  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  18710789 tatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcagg 18710690  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    || |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  18710689 tgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 18710591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19286770 - 19286468
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  19286770 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 19286671  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||     
T  19286670 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggg 19286571  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  19286570 tcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtc 19286471  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  19286470 tag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 12092631 - 12092933
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12092631 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 12092730  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12092731 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 12092830  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  12092831 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 12092930  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  12092931 tag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29829630 - 29829328
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29829630 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 29829531  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| ||||||||    
T  29829530 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacgga 29829431  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  29829430 tcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggtc 29829331  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  29829330 tag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33259031 - 33258740
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  33259031 cttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 33258932  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  33258931 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 33258832  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaa 292  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  33258831 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaa 33258740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 3329414 - 3329716
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  3329414 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttctt 3329513  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  3329514 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 3329613  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  3329614 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 3329713  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  3329714 tag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 189402 - 189258
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  189402 cttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttttt 189303  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccag 145  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  189302 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccag 189258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9354931 - 9354627
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||    
T  9354931 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttt 9354832  T
Q  101 t-acgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgg 199  Q
    | || |||||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||    
T  9354831 ttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatgg 9354732  T
Q  200 atcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggt 299  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  |||||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || ||||||    
T  9354731 atcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggt 9354632  T
Q  300 ctagc 304  Q
    |||||    
T  9354631 ctagc 9354627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44563396 - 44563103
Alignment:
Q  13 ttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtactt 112  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |    
T  44563396 ttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacct 44563298  T
Q  113 caaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggc 212  Q
    ||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||    
T  44563297 caacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggc 44563198  T
Q  213 ttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 307  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  44563197 ttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 44563103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33244968 - 33244670
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  33244968 atcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33244869  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| | ||| || |||| |||||    
T  33244868 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcagg 33244769  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||| |  | |||| |||| | || || |||||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  33244768 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33244670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 19658952 - 19659174
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  19658952 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 19659050  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || |||| |||||    
T  19659051 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 19659150  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgt 229  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||    
T  19659151 tggaggcttgccctgtctggttgt 19659174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 239
Target Start/End: Original strand, 22080787 - 22081023
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||    
T  22080787 tcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttcttta 22080886  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    | |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||||| |     
T  22080887 caatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggtt 22080986  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccct 239  Q
    |||||| ||||| | ||| |||||||| || ||||||    
T  22080987 aggtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccct 22081023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 301
Target Start/End: Original strand, 19518280 - 19518344
Alignment:
Q  237 cctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 301  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19518280 cctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 19518344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17014323 - 17014016
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17014323 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 17014224  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17014223 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacgga 17014124  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17014123 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 17014024  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  17014023 tagcttgc 17014016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14665341 - 14665034
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14665341 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 14665242  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14665241 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 14665142  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665141 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 14665042  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  14665041 tagcttgc 14665034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 24592262 - 24592569
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24592262 cttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 24592361  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24592362 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 24592461  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24592462 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 24592561  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  24592562 tagcttgc 24592569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 14763252 - 14763559
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14763252 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 14763351  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  14763352 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 14763451  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14763452 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 14763551  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  14763552 tagcttgc 14763559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5006196 - 5005889
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||    
T  5006196 cttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgagcttctt 5006097  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5006096 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 5005997  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5005996 tcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 5005897  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  5005896 tagcttgc 5005889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 27163265 - 27163572
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27163265 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 27163364  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27163365 cacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 27163464  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27163465 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 27163564  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  27163565 tagcttgc 27163572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18800561 - 18800863
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18800561 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 18800660  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  18800661 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 18800760  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18800761 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 18800860  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  18800861 tag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 40105586 - 40105893
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  40105586 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 40105685  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  40105686 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 40105785  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40105786 tcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 40105885  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  40105886 tagcttgc 40105893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6570176 - 6569869
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6570176 cttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 6570077  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  6570076 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 6569977  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6569976 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtc 6569877  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  6569876 tagcttgc 6569869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14098864 - 14098557
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14098864 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 14098765  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||    
T  14098764 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacgga 14098665  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14098664 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtc 14098565  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  14098564 tagcttgc 14098557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Original strand, 31126468 - 31126773
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  31126468 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttca 31126567  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  31126568 cgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtc 31126667  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 302  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  31126668 aggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggccta 31126767  T
Q  303 gcttgc 308  Q
    ||||||    
T  31126768 gcttgc 31126773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 36344463 - 36344765
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  36344463 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttctt 36344562  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  36344563 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacgga 36344662  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  36344663 tcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtc 36344762  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  36344763 tag 36344765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54833710 - 54833408
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  54833710 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 54833611  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||     
T  54833610 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggg 54833511  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  54833510 tcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtc 54833411  T
Q  301 tag 303  Q
    |||    
T  54833410 tag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 33673746 - 33674046
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  33673746 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 33673845  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||     
T  33673846 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggg 33673945  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  33673946 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 33674045  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  33674046 t 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30754077 - 30753777
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  30754077 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 30753978  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  30753977 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 30753878  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  30753877 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtc 30753778  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  30753777 t 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 307
Target Start/End: Original strand, 15284899 - 15285182
Alignment:
Q  24 tgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagc 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15284899 tgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc 15284998  T
Q  124 acccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgcactgtct 223  Q
    | || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15284999 atccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 15285098  T
Q  224 ggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 307  Q
    |||||| || ||||||||  | |||| |||| | || ||||| | ||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15285099 ggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 15285182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21970019 - 21969717
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  21970019 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacga 21969920  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||    
T  21969919 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 21969820  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| |||||||  || || || |||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21969819 tggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagct 21969720  T
Q  306 tgc 308  Q
    |||    
T  21969719 tgc 21969717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 39850961 - 39850661
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  39850961 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttctt 39850862  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || ||     
T  39850861 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaaggg 39850762  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || ||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  39850761 tccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtc 39850662  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  39850661 t 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1900575 - 1900274
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |    
T  1900575 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 1900476  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||    
T  1900475 tgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcagg 1900376  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1900375 tggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 1900276  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  1900275 tg 1900274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15228188 - 15227887
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| || || |    
T  15228188 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaa 15228089  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||| ||||||||    
T  15228088 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcagg 15227989  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  15227988 tggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 15227889  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  15227888 tg 15227887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 14235478 - 14235779
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || || |||||||| ||||| |    
T  14235478 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttctttacaa 14235577  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    || |||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||| || | |||    
T  14235578 tgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttagg 14235677  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || | || | |||| | |||| |||  |||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  14235678 tggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 14235777  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  14235778 tg 14235779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 24460553 - 24460856
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||    
T  24460553 cttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttt 24460652  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
    ||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | |||    
T  24460653 tacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatgga 24460752  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||    
T  24460753 tcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtc 24460852  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  24460853 tagc 24460856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 15391288 - 15391586
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    |||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||| ||||    
T  15391288 tcgatcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttcttta 15391387  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    | |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||||| |     
T  15391388 caatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggtt 15391487  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 301  Q
    |||||| ||||| | ||| |||||||| || |||||| |  | || |||||| | ||||||||  | |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  15391488 aggtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 15391586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24112980 - 24112682
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  24112980 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 24112881  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| | || || || ||    
T  24112880 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 24112781  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24112780 tggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 24112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 34188913 - 34189211
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  34188913 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 34189012  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| | || || || ||    
T  34189013 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 34189112  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 304  Q
    ||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34189113 tggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34189211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27600 - 27293
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27600 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttctt 27501  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27500 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 27401  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27400 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 27301  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  27300 tagcttgc 27293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 77 - 385
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  77 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 176  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  177 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacgga 276  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaa-catacaacatcggtattggagggaaagtaggt 299  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  277 tccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggt 376  T
Q  300 ctagcttgc 308  Q
    |||||||||    
T  377 ctagcttgc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10962976 - 10962670
Alignment:
Q  2 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttt 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  10962976 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 10962877  T
Q  102 acgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggat 201  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  10962876 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10962777  T
Q  202 caggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 301  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10962776 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 10962677  T
Q  302 agcttgc 308  Q
    |||||||    
T  10962676 agcttgc 10962670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28585288 - 28584981
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  28585288 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 28585189  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28585188 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 28585089  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28585088 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 28584989  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  28584988 tagcttgc 28584981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 41793256 - 41793563
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  41793256 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttctt 41793355  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  41793356 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 41793455  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  41793456 tcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 41793555  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  41793556 tagcttgc 41793563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51638525 - 51638218
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  51638525 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 51638426  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||     
T  51638425 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggg 51638326  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| | |||||||||||| |    
T  51638325 tcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcc 51638226  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  51638225 tagcttgc 51638218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 16207984 - 16208285
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |    
T  16207984 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 16208083  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  16208084 tgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 16208183  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| || || | |||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||   ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16208184 tggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 16208283  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  16208284 tg 16208285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28152164 - 28151863
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  28152164 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 28152065  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||| |||||||    
T  28152064 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcagg 28151965  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  28151964 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 28151865  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  28151864 tg 28151863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 20340288 - 20340511
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  20340288 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 20340387  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||||||    
T  20340388 tgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcagg 20340487  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgt 229  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20340488 tggaggcttgccctgtctggttgt 20340511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20461365 - 20461082
Alignment:
Q  24 tgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagc 123  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20461365 tgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc 20461266  T
Q  124 acccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgcactgtct 223  Q
    | || |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20461265 atccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtct 20461166  T
Q  224 ggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 307  Q
    |||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||| | |||  |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20461165 ggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 20461082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 7187 - 7494
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  7187 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 7286  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  7287 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 7386  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  7387 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 7486  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  7487 tagcttgc 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 9014 - 9321
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  9014 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 9113  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  9114 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 9213  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9214 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 9313  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  9314 tagcttgc 9321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20323 - 20016
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  20323 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 20224  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  20223 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 20124  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20123 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcc 20024  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  20023 tagcttgc 20016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 14878 - 15185
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14878 cttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttctt 14977  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  14978 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 15077  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15078 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtc 15177  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  15178 tagcttgc 15185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 308
Target Start/End: Original strand, 26150 - 26457
Alignment:
Q  2 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttt 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  26150 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26249  T
Q  102 acgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacc-tgggaagcaacgga 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||    
T  26250 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacgga 26349  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  26350 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcc 26449  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  26450 tagcttgc 26457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30760 - 30454
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30760 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 30661  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  30660 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 30561  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  30560 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtatagga-ggaaagtaggtc 30462  T
Q  301 tagcttgc 308  Q
    ||||||||    
T  30461 tagcttgc 30454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20690 - 20390
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |    
T  20690 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaa 20592  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  20591 tgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 20492  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||| |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  20491 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagct 20392  T
Q  306 tg 307  Q
    ||    
T  20391 tg 20390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9874 - 9571
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9874 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttctt 9775  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  9774 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacgga 9675  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  9674 tcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtc 9575  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  9574 tagc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6322 - 6015
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6322 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 6223  T
Q  101 tacgatgtacttc-aaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg-gaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacg 198  Q
     ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  6222 cacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 6123  T
Q  199 gatcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagt-aaagtcagaagcaactcaacata-caacatcggtattggagggaaag-t 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| |    
T  6122 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaaagttggaagcaactcagcatataaacatcggtataggaggaaaagtt 6023  T
Q  296 aggtctag 303  Q
    ||||||||    
T  6022 aggtctag 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2103
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |    
T  1871 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaa 1969  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  1970 tgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 2069  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccct 239  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  2070 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 7963
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  8257 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttctt 8158  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  8157 cacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 8058  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 295  Q
    |||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8057 tcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Original strand, 46756 - 47072
Alignment:
Q  7 tcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctc-aaaagtcagc-tttccttgatcaatgagcttttttacg 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||    
T  46756 tcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacg 46855  T
Q  105 atgtacttcaaagcata-gcacccctcgacat-cat--gacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacc-tgaacctgggaagcaacgg 199  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  46856 atatacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacgg 46955  T
Q  200 atcaggtgggggc--ttgcactgtct-ggttgtacaatg-ccctctatggagtaaa---gtcagaagcaactcaacatacaacatc-ggtattggaggg- 290  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   |   ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  46956 atcaggtgggggcgtttgccctgtctaggttgtacaatgtccctctatggagtaaatcggggggaagcaactcagcatacaacatcgggtatcggaggga 47055  T
Q  291 aaagtaggtctagcttg 307  Q
    |||||||||||||||||    
T  47056 aaagtaggtctagcttg 47072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 2611 - 2834
Alignment:
Q  6 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacga 105  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| || || |    
T  2611 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 2710  T
Q  106 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||||||    
T  2711 tgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcagg 2810  T
Q  206 tgggggcttgcactgtctggttgt 229  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||    
T  2811 tggaggcttgccctgtctggttgt 2834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 307
Target Start/End: Original strand, 5 - 282
Alignment:
Q  30 ggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccct 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || | |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  5 ggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctt 104  T
Q  130 cgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgcactgtctggttgt 229  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||     
T  105 caacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttga 204  T
Q  230 acaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 307  Q
     || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  205 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21867 - 21641
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| || ||||||||||| ||||    
T  21867 tcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttcttta 21768  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 202  Q
    | || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||| | |     
T  21767 caatctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggtt 21668  T
Q  203 aggtgggggcttgcactgtctggttgt 229  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  21667 aggtggaggcttgccctgcctggttgt 21641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 568 - 728
Alignment:
Q  3 tcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttta 102  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  568 tcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttta 667  T
Q  103 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatc 163  Q
    | |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  668 caatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 397 - 94
Alignment:
Q  1 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 100  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |     
T  397 cttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggtcaataagcctctg 298  T
Q  101 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 200  Q
     || || ||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||| || |  |  ||||| ||  | || |||    
T  297 gacaatatactttaaagcataacacctctcaacgtcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatgga 198  T
Q  201 tcaggtgggggcttgcactgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 300  Q
    || || || ||||| | ||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  197 tctggcggaggcttaccctgcctagtcgtacaatgacctctctgaagtaatgttggaagtaaatcagcatacaacatcgggattggaggaaaagtaggcc 98  T
Q  301 tagc 304  Q
    ||||    
T  97 tagc 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University